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Sample records for vph mediante pcr

  1. Procesamiento de muestras fecales en el estudio de Cryptosporidium sp. mediante PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Gregorio Pérez-Cordón

    2013-05-01

    Full Text Available El presente trabajo describe un protocolo aplicado a muestras de heces de ganado bovino para el aislamiento y purificación de ooquistes de Cryptosporidium sp. y el eventual uso de los mismos para estudios genéticos mediante PCR.

  2. Detección de VPH en boca y cérvix de pacientes con diagnóstico citológico sugestivo de infección genital HPV detection in the mouth and cervix of patients with histological diagnosis suggestive of genital infection

    OpenAIRE

    Z. De Guglielmo; Ávila,M; D. Veitía; Fernandes, A; Venegas, C.; M. Correnti de Plata

    2012-01-01

    En este trabajo se evaluó la presencia de VPH en la cavidad bucal (mediante oroscopia y citología oral exfoliativa) y su relación con la infección genital en mujeres con diagnóstico citológico sugestivo de infección por VPH. La muestra consistió en 60 pacientes a quienes se les realizó oroscopia, citología y determinación viral en boca y cérvix por PCR, utilizando los iniciadores genéricos MY09/MY11 y MPCR. Se detectó ADN de VPH en las mucosas oral y genital en 48,33 % y 73,3% de las paciente...

  3. Identificación de Virus Papiloma Humano 16 (vph-16 en carcinoma queratinizante de pulmón IDENTIFICATION OF HUMAN PAPILLOMAVIRUS 16 (HPV 16 IN KERATINIZING LUNG CARCINOMA

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Francisco Aguayo G.

    2002-04-01

    Full Text Available El cáncer pulmonar constituye la primera causa de muerte por cáncer en el mundo y la cuarta causa de muerte por cáncer en Chile. El carcinoma escamoso de pulmón representa entre el 35% a 50% de los casos de cáncer pulmonar. Existe fuerte evidencia, aunque aún controversial, respecto de la asociación entre esta forma histológica y la infección por Virus Papiloma Humano (VPH, siendo los genotipos VPH 16 y 18 los que se han asociado a lesiones malignas y premalignas de diversos tejidos epiteliales. Analizamos casos de carcinoma escamoso de pulmón del tipo queratinizante para evaluar la presencia de genotipos de VPH 16 y 18 en Chile. Quince casos con diagnóstico histológico de carcinoma escamoso moderada y altamente diferenciados en tejido incluido en parafina, fueron tratados con xilol y etanol y resuspendidos en proteinasa K durante 48 horas a 56º C para la extracción de ADN. Este se amplificó mediante la reacción de polimerasa en cadena (PCR usando partidores específicos para VPH genérico, VPH 16, VPH 18 y betaglobina humana como control positivo interno. Los amplificados fueron revelados en geles de polacrilamida y tinción con nitrato de plata. Identificamos la presencia de VPH genérico en 6 (42,2% de 13 casos amplificables. De estos casos todos correspondieron al genotipo VPH 16 y ninguno correspondió al genotipo VPH 18. La presencia de VPH 16 en la serie analizada indicaría que VPH puede tener algún rol en cáncer pulmonar del tipo escamoso - queratinizante. Es interesante la ausencia de VPH 18 en la serie analizada lo cual podría indicar características epidemiológicas propias en nuestra población. En esta serie analizada, una muestra mostró no corresponder a los genotipos estudiados. Es necesario realizar un estudio más amplio con otros genotipos de VPH y un universo mayor de casos para confirmar estos resultadosLung cancer is the first cause of death by cancer in the world and the fourth cause in Chile. The

  4. Curved VPH gratings for novel spectrographs

    Science.gov (United States)

    Clemens, J. Christopher; O'Donoghue, Darragh; Dunlap, Bart H.

    2014-07-01

    The introduction of volume phase holographic (VPH) gratings into astronomy over a decade ago opened new possibilities for instrument designers. In this paper we describe an extension of VPH grating technology that will have applications in astronomy and beyond: curved VPH gratings. These devices can disperse light while simultaneously correcting aberrations. We have designed and manufactured two different kinds of convex VPH grating prototypes for use in off-axis reflecting spectrographs. One type functions in transmission and the other in reflection, enabling Offnerstyle spectrographs with the high-efficiency and low-cost advantages of VPH gratings. We will discuss the design process and the tools required for modelling these gratings along with the recording layout and process steps required to fabricate them. We will present performance data for the first convex VPH grating produced for an astronomical spectrograph.

  5. Detección proviral de HTLV-1 mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR)

    OpenAIRE

    Sevilla, Carlos; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Alarcón, Jorge; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Huiza, Alina; D. A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Centro de Biotecnología, Universidad Iberoamericana de Ciencias y Tecnología; Laboratorio Entomología Médica, Sección Parasitología, Instituto de Salud Pública; Laboratorio de Entomología Médica, Laboratorio de Referencia Regional, Gerencia Regional de Salud La Libertad; Dirección Ejecutiva de Salud Ambiental, Sub Región de Salud “Luciano Castillo Colonna”, DIRESA Piura.; Gutiérrez, César; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Ñavincopa, Marcos; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Cornejo, William; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Cáceres, Abraham; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Tejada, Abelardo; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Romaní, Franco; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Mori, Nicanor; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Wong, Paolo; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Huamán, Víctor; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Vásquez, Rubén; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Tejada, Romina; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Flores, Alitza; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM

    2013-01-01

    Objetivos: Detectar el genoma proviral de HTLV-1 mediante el desarrollo de reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Diseño: Descriptivo. Institución: D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM. Participantes: Personas con y sin sospecha de HTLV-I. Principales medidas de resultados: detección de HTLV-1 mediante PCR. Resultados: El 71,4% de los pacientes con sospecha clínica de HTLV-I fue reactivo por métodos Inmunológico. Elisa HTLV I-II Biokit detectó 5 casos reactivos (X=2,359 ...

  6. Detección proviral de HTLV-1 mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR)

    OpenAIRE

    Sevilla, Carlos; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Alarcón, Jorge; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Huiza, Alina; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Gutiérrez, César; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Ñavincopa, Marcos; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Cornejo, William; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Cáceres, Abraham; D. A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Centro de Biotecnología, Universidad Iberoamericana de Ciencias y Tecnología; Laboratorio Entomología Médica, Sección Parasitología, Instituto de Salud Pública; Laboratorio de Entomología Médica, Laboratorio de Referencia Regional, Gerencia Regional de Salud La Libertad; Dirección Ejecutiva de Salud Ambiental, Sub Región de Salud “Luciano Castillo Colonna”, DIRESA Piura.; Tejada, Abelardo; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Romaní, Franco; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Mori, Nicanor; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Wong, Paolo; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Huamán, Víctor; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Vásquez, Rubén; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Tejada, Romina; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM; Flores, Alitza; D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM

    2013-01-01

    Objetivos: Detectar el genoma proviral de HTLV-1 mediante el desarrollo de reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Diseño: Descriptivo. Institución: D.A. Microbiología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM. Participantes: Personas con y sin sospecha de HTLV-I. Principales medidas de resultados: detección de HTLV-1 mediante PCR. Resultados: El 71,4% de los pacientes con sospecha clínica de HTLV-I fue reactivo por métodos Inmunológico. Elisa HTLV I-II Biokit detectó 5 casos reactivos (X=2,359 ...

  7. Las 47 preguntas sobre el virus del papiloma humano, VPH

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Elena de la Fuente Díez

    2008-09-01

    Full Text Available La prevención del cáncer de cuello uterino ha evolucionado rápidamente a consecuencia de la identificación de su causa, el Virus del Papiloma Humano (VPH. La asociación VPH/Cáncer de Cuello Uterino, es aplicable tanto al carcinoma escamocelular como al adenocarcinoma. Dos de los tipos oncogénicos, los VPHs 16 y 18, son responsables del 70% de los casos de cáncer de cuello uterino a nivel mundial. El VPH es muy prevalente entre personas sexualmente activas, y se puede identificar fácilmente mediante el uso de tecnologías capaces de detectar ADN y otros biomarcadores del VPH. El ADN y los biomarcadores se pueden detectar en todas las fases de la historia natural de la infección y del proceso neoplásico. Dicha trazabilidad unida a la validación clínica de las tecnologías de identificación, han permitido mejorar los protocolos de cribado del cáncer cervical. La proteína principal del virión, ya expresada, produce inmunógenos capaces de inducir fuertes respuestas inmunitarias cuando se administran vía intramuscular, y ésta es la base de la Vacuna frente a VPH.The UCC (Uterine Cervical Cancer prevention has suffered a great evolution because of the knowing of its cause, wich is the HPV (Human Papillomavirus. The association HPV / UCC is available also to Scamocellular Carcinome to Adenocarcinome. Mundially, the oncogenic types, 16 and 18, are responssible of 70% of cases of UCC. HPV is very prevalent in sexually active people, and it’s easy identify by using DNA amplyfiyng technologies and other biomarkers. These ones can be detected in hole virus natural life, including the neoplasic process. The tazability and the clinic validation of this technologies, have improved to get a better screening of the UCC. The main HPV protein, is able to produce a strong inmunitary response, when it’s given by intramuscular punctury; and this is the explanation of the HPC vaccine.

  8. Towards distributed multiscale computing for the VPH

    NARCIS (Netherlands)

    Hoekstra, A.G.; Coveney, P.

    2010-01-01

    Multiscale modeling is fundamental to the Virtual Physiological Human (VPH) initiative. Most detailed three-dimensional multiscale models lead to prohibitive computational demands. As a possible solution we present MAPPER, a computational science infrastructure for Distributed Multiscale Computing o

  9. Vacuna contra el VPH (HPV Vaccine)

    Centers for Disease Control (CDC) Podcasts

    2013-07-25

    Desde el 2006, hay una vacuna que protege contra los tipos de VPH que causan cáncer con mayor frecuencia. Este podcast habla sobre la importancia de que los padres hablen con los proveedores de atención médica de sus hijos sobre ponerles la vacuna contra el VPH.  Created: 7/25/2013 by MMWR.   Date Released: 11/4/2013.

  10. Infecciones genitales por VPH tratadas por microinmunoterapia

    National Research Council Canada - National Science Library

    Jacques Grauwet, Diego

    2011-01-01

    ... genitales por VPH tratadas por microinmunoterapia Diego Jacques Grauwet Médico ginecólogo y homeópata, Madrid, España Recibido el 30 de mayo de 2010; aceptado el 10 de septiembre de 2011 Correo...

  11. Detecciones de la expresion de citoquinas mediante RT-PCR en tiempo real en ganado ovino

    National Research Council Canada - National Science Library

    Perez de Diego Camacho, Ana Cristina; Sanchez Matamoros, Almudena; Sanchez-Vizcaino Rodriguez, Jose Manuel

    2009-01-01

    .... Existen diferentes tecnicas para estudiar la produccion y accion de estas en los individuos. Este estudio consiste en la puesta a punto de una tecnica de Retrotranscripcion- Reaccion en cadena de la polimerasa (RT-PCR...

  12. Localizzazione e valutazione dell’espressione di Chlamydophila pneumoniae mediante RT-PCR in situ

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Stefania Cazzavillan

    2005-12-01

    Full Text Available Chlamydophila pneumoniae, an obligate intracellular gram negative bacterium, is involved in a wide spectrum of symptomatic respiratory tract diseases. However more recently it has been reported to be a pathogenic agent in the mechanism leading to atherosclerosis. In the present study the presence of Chlamydophila pneumoniae was assessed, using nested PCR and in situ PCR, while the viability of the microorganism was investigated using RT in situ PCR.The results obtained demonstrated that Chlamydophila pneumoniae was present and alive in the tissues examined.The global concordance of results in the three techniques used was 100%. RT in situ PCR can be considered a precious tool to detect bacterial mRNA in formalin fixed paraffin embedded samples provided an optimal standardization of the key variables is achieved.

  13. Data Management Services for VPH Applications

    CERN Document Server

    CERN. Geneva

    2014-01-01

    The VPH-Share project [1] develops a cloud platform for the Virtual Physiological Human (VPH) research community. One of the key challenges is to share and access large datasets used by medical applications to transform them into meaningful diagnostic information. VHP researchers need advanced storage capabilities to enable collaboration without introducing additional complexity to the way data are accessed and shared. In the VPH-Share cloud platform [2], the data storage federation [3] is achieved by an aggregation of data resources in a client-centric manner and exposing it via a standardized protocol that can be also mounted and presented as a local storage so a kind of a file system abstraction is provided. There is a common management layer that uses loosely coupled and independent storage resources and with such a layer a variety of storage resources such as simple file servers, storage clouds and data grid may be aggregated exposing all available storage. As a result, distributed applications have ...

  14. Detección rápida de resistencia a drogas en Mycobacterium tuberculosis mediante PCR-SSCP y PCR- Heteroduplex

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Róger Calderón E

    2003-04-01

    Full Text Available Objetivo: Detectar tempranamente la susceptibilidad a las drogas antituberculosas rifampicina e isoniacida mediante PCR y electroforesis conformacional. Materiales y métodos: Se implementaron dos ensayos de amplificación de los genes rpoB y katG y mediante Heteroduplex y SSCP se determinó la susceptibilidad antituberculosa de 31 muestras clínicas procedentes de pacientes con diagnóstico de tuberculosis pulmonar baciloscopía positiva. La caracterización fenotípica de la susceptibilidad, se realizó empleando el método de las proporciones. Resultados: Los ensayos de PCR detectaron hasta 2,5 pg de ADN genómico de M. tuberculosis; no amplificando ADN de otras micobacterias y bacterias comunes de la flora bucal. Se encontró una concordancia general entre la detección molecular y convencional de la susceptibilidad a rifampicina e isoniacida de 96,7% y 83,9% (p<0,05, respectivamente. Sin embargo, sólo en pacientes con antecedente de tratamiento se presentó una concordancia del 100% y 90,9% (p<0,05 para rifampicina e isoniacida, respectivamente. Además, este sistema de detección de resistencia puede emitir resultados 48 horas después de la recepción de la muestra clínica. Conclusiones: Estos sistemas se presentan como una excelente alternativa para la identificación temprana de pacientes infectados con bacilos de M. tuberculosis drogoresistentes. Potencialmente, se podrán dirigir óptimos y oportunos esquemas terapéuticos que contribuirán con el control y prevención de la transmisión de cepas multidrogo-resistentes que afectan en gran medida a la salud pública de nuestro país.

  15. Metrology measurements for large-aperture VPH gratings

    Science.gov (United States)

    Zheng, Jessica R.; Gers, Luke; Heijmans, Jeroen

    2013-09-01

    The High Efficiency and Resolution Multi Element Spectrograph (HERMES) for the Australian Astronomical Observatory (AAO) uses four large aperture, high angle of incidence volume phase holographic gratings (VPHG) for high resolution `Galactic archaeology' spectroscopy. The large clear aperture, the high diffraction efficiency, the line frequency homogeneity, and mosaic alignment made manufacturing and testing challenging. We developed new metrology systems at the AAO to verify the performance of these VPH gratings. The measured diffraction efficiencies and line frequency of the VPH gratings received so far meet the vendor's provided data. The wavefront quality for the Blue VPH grating is good but the Green and Red VPH gratings need to be post polishing.

  16. Evaluación de las técnicas de detección del VPH en los programas de cribado para cáncer de cuello uterino Assessment of hpv detection assays for use in cervical cancer screening programs

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    M Paz Cañadas

    2006-10-01

    Full Text Available OBJETIVO: La identificación de la infección por tipos de alto riesgo del virus del papiloma humano (VPH es una herramienta útil para el cribado de cáncer del cuello uterino. Las distintas técnicas aplicadas para su detección deben contrastarse y validarse para su empleo en la tamización poblacional. MATERIAL Y MÉTODOS: Se evalúan tres técnicas para la detección del VPH en 166 muestras cervicales procedentes de mujeres atendidas en una clínica de dermatología en Oviedo (España: a PCR-EIA mediante consensos MY09/MY011; b PCR con line blot hybridization (PCR-LBH con consensos PGMY; y c hybrid capture 2. RESULTADOS: El ADN-VPH se reconoció en 29.5%, 25.3% y 24.7%, de acuerdo con el ensayo. La concordancia global entre PCR-EIA, PCR-LBH y HC2 fue de 73.5% con los valores de kappa superiores a 0.56 entre los ensayos (pOBJECTIVE: Detection of high-risk human papillomavirus types (HPV infection is an important tool in the screening of cervical cancer and triage of cytological abnormalities. The different techniques for detection of this cancer need to be contrasted and validated for use in population screening. MATERIAL AND METHODS: Cervical cell samples were collected from 166 women attending a dermatology clinic in Oviedo (Spain. We evaluated the performance of three different assays for VPH detection. The methods utilized were 1 In-house PCR-EIA using L1 consensus primers MY09/MY11, 2 A PCR-reverse line blot hybridization (PCR-LBH that uses L1 consensus PGMY primers. 3 Hybrid Capture 2. All assays were performed blinded. The kappa statistic was used to test for global agreement between assay pairs. RESULTS: HPV DNA was detected in 24,7%, 25,3% and 29,5% of the women, respective to the assay. The overall agreement between the in-house PCR, PCR-LBH and HC2 was (73.5% with all kappa values between assay pairs exceeding 0.56 (p<0.001. CONCLUSION: The three HPV assays were equally accurate in estimating high-risk HPV prevalence and HPV

  17. Detección del virus de la leucosis bovina en ganado criollo colombiano mediante PCR-anidado

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Darwin Yovanny Hernández-Herrera

    2011-12-01

    Full Text Available Se evaluó la presencia del virus de la leucosis bovina (VLB en 360 muestras de ADN de ocho razas bovinas criollas: Blanco Orejinegro (BON, Casanareño (CAS, Costeño con Cuernos (CCC, Chino Santandereano (ChS, Caqueteño (CQT, Hartón del Valle (HV, Romosinuano (RS y San Martinero (SM, dos Razas Sintéticas Colombianas: Lucerna (LUC y Velásquez (VEL y dos razas foráneas: Brahmán (B y Holstein (H. Para la detección del pro-virus se amplificó una región del gen env viral, mediante PCR anidada. La presencia del VLB fue mayor en la raza HV seguido por ChS (83.3% y 60% respectivamente, VEL y LUC tuvieron el mismo porcentaje (50%, en CAS, CCC y CQT la presencia del virus fue de 26.7%, 23.3% y 16.7% respectivamente; no se encontró el virus en BON, SM y RS. En las razas foráneas la presencia fue de 83.3% para H y 6.7% para B. Se encontró dependencia altamente significativa entre la presencia del VLB y la raza, el sexo y región de origen de la muestra. El promedio de presencia en las razas criollas fue menor que en las foráneas, menor en los machos que en las hembras y en la región norte que en el suroccidente y el centro del país.

  18. Factores de riesgo para la infección cervical por el VPH en pacientes VIH+, atendidas en el capasits del Hospital General de Puebla, México

    OpenAIRE

    JF Martínez-Herrera; MA Huerta-Orea; EB Pezzat-Said; ID Torres-Escobar; BL González-García

    2010-01-01

    Las tasas de infección cervical por el Virus del Papiloma Humano (VPH) y citología anormales son mayores en mujeres infectadas por el Virus de la Inmunodeficiencia Humana (VIH)1. Es un estudio observacional, descriptivo, retrospectivo y no experimental. Se revisaron 319 expedientes, de los cuales 30 que cumplieron con los criterios de inclusión fueron estudiados. En 23 (76.6%) expedientes se encontraron la prueba de PCR positivo y en 7 (23.33%) PCR negativo para ADN del VPH. Para las paciente...

  19. Toward a VPH/Physiome ToolKit.

    Science.gov (United States)

    Garny, Alan; Cooper, Jonathan; Hunter, Peter J

    2010-01-01

    The Physiome Project was officially launched in 1997 and has since brought together teams from around the world to work on the development of a computational framework for the modeling of the human body. At the European level, this effort is focused around patient-specific solutions and is known as the Virtual Physiological Human (VPH) Initiative.Such modeling is both multiscale (in space and time) and multiphysics. This, therefore, requires careful interaction and collaboration between the teams involved in the VPH/Physiome effort, if we are to produce computer models that are not only quantitative, but also integrative and predictive.In that context, several technologies and solutions are already available, developed both by groups involved in the VPH/Physiome effort, and by others. They address areas such as data handling/fusion, markup languages, model repositories, ontologies, tools (for simulation, imaging, data fitting, etc.), as well as grid, middleware, and workflow.Here, we provide an overview of resources that should be considered for inclusion in the VPH/Physiome ToolKit (i.e., the set of tools that addresses the needs and requirements of the Physiome Project and VPH Initiative) and discuss some of the challenges that we are still facing.

  20. Incidencia, duración y determinantes de la infección por virus de papiloma humano (VPH en una cohorte de mujeres colombianas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Mónica Molano

    2004-03-01

    Full Text Available

    Ciertos tipos de VPH son los agentes etiológicos de cáncer cervical, lesiones tempranas y ulceras genitales (1-4. Las infecciones por VPH tienen alta prevalencia y se transmiten por contacto sexual (5-6. Los datos publicados sobre incidencia son en mujeres jóvenes pero son escasos los datos en mujeres de mediana edad (7-10. Se sugiere que los VPH de alto riesgo tienen mayor duración que los de bajo riesgo (7-11.

    Para examinar estos aspectos se presentan los datos sobre una cohorte de 2,200 mujeres seguidas desde Noviembre de 1993 a julio del 2001 en Bogotá, sexualmente activas, entre 13-85 años de edad. Se realizó detección y tipificación del VPH mediante PCR estándar GP5+/GP6+ e inmunoensayo enzimático (EIA. Para el cálculo de la incidencia se usaron métodos de persona-tiempo, asumiendo que la infección se presentó en la mitad de periodo entre la última visita negativa a VPH y la siguiente positiva.

    Para este análisis se tomaron 1,610 mujeres después de excluir las infecciones prevalentes. La duración media de seguimiento por paciente fue de 4,1 años (Rango intercuartil RIQ 3.2-5.0, la mediana de seguimiento fue de 7 meses (RIQ 6.0-12.0, más del 65% de las mujeres tenían 4 visitas y la edad media fue de 32,3 años (RIQ 26,5-39,2. La incidencia para infección por VPH fue de 6,2 por 100 personas-año, siendo la incidencia mayor para los tipos de alto riesgo que para los de bajo riesgo.

    Los tipos de mayor incidencia fueron los VPH 16, 58, 31 y 18. La curva de incidencia por edad mostró una forma bimodal, con un pico de incidencia de 15-19 años, que decrece hasta alrededor de los 50 años, cuando presenta un pequeño incremento

  1. Support for Taverna workflows in the VPH-Share cloud platform.

    Science.gov (United States)

    Kasztelnik, Marek; Coto, Ernesto; Bubak, Marian; Malawski, Maciej; Nowakowski, Piotr; Arenas, Juan; Saglimbeni, Alfredo; Testi, Debora; Frangi, Alejandro F

    2017-07-01

    To address the increasing need for collaborative endeavours within the Virtual Physiological Human (VPH) community, the VPH-Share collaborative cloud platform allows researchers to expose and share sequences of complex biomedical processing tasks in the form of computational workflows. The Taverna Workflow System is a very popular tool for orchestrating complex biomedical & bioinformatics processing tasks in the VPH community. This paper describes the VPH-Share components that support the building and execution of Taverna workflows, and explains how they interact with other VPH-Share components to improve the capabilities of the VPH-Share platform. Taverna workflow support is delivered by the Atmosphere cloud management platform and the VPH-Share Taverna plugin. These components are explained in detail, along with the two main procedures that were developed to enable this seamless integration: workflow composition and execution. 1) Seamless integration of VPH-Share with other components and systems. 2) Extended range of different tools for workflows. 3) Successful integration of scientific workflows from other VPH projects. 4) Execution speed improvement for medical applications. The presented workflow integration provides VPH-Share users with a wide range of different possibilities to compose and execute workflows, such as desktop or online composition, online batch execution, multithreading, remote execution, etc. The specific advantages of each supported tool are presented, as are the roles of Atmosphere and the VPH-Share plugin within the VPH-Share project. The combination of the VPH-Share plugin and Atmosphere engenders the VPH-Share infrastructure with far more flexible, powerful and usable capabilities for the VPH-Share community. As both components can continue to evolve and improve independently, we acknowledge that further improvements are still to be developed and will be described. Copyright © 2017 Elsevier B.V. All rights reserved.

  2. ESTRUCTURA MOLECULAR Y ANTIGÉNICA DE LA VACUNA CONTRA EL VIRUS DEL PAPILOMA HUMANO 16 (VPH 16

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    VÍCTOR ANDRÉS VANEGAS

    2008-01-01

    Full Text Available La proteína L1 del Virus del Papiloma Humano (VPH constituye el 80% de la cápside viral. Las vacunas profilácticas contra el VPH son sintetizadas a partir de la proteína L1 ensamblada en Partículas similares al Virus (del inglés VLP, las cuales son altamente inmunogénicas generando anticuerpos específicos de tipo y en algunos casos pueden presentar reacción cruzada entre tipos de VPH filogenéticamente próximos. La estructura de la proteína L1 del VPH es importante porque confiere estabilidad a la cápside mediante el establecimiento de interacciones intra e intercapsoméricas lo que asegura la integridad viral y antigénicamente porque contiene los epítopes que inducen la respuesta inmune protectora. En estudios en los que se evaluó la antigenicidad de la proteína L1 se determinó que los epítopes inmunodominantes de la cápside viral se encuentran en los bucles B-C, D-E, F-G, H-I y en el extremo C-terminal. Estos bucles son poco conservados entre los diferentes genotipos y se encuentran en segmentos de la proteína expuestos en la superficie de la cápside. Los aminoácidos situados en los bucles B-C, F-G y H-I son primordiales para el reconocimiento por los anticuerpos neutralizantes. Los diferentes subtipos y variantes presentan cambios en estos aminoácidos o en residuos que conforman otros epítopes. En esta revisión se presentará un estado del arte de la proteína L1 del VPH genotipo 16, la estructura y su importancia en el desarrollo de vacunas contra la infección producida por este virus.

  3. Identificazione rapida di mutazioni associate a farmaco-resistenza in ceppi di citomegalovirus umano mediante nPCR-RFLP

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Maria Cristina Medici

    2007-03-01

    Full Text Available We developed a nested-PCR followed by restriction fragment length polymorphism (RFLP for the detection of human cytomegalovirus (HCMV UL97 M460V/I, H520Q, C592Q,A594V, L595S/F and C603W mutations associated to ganciclovir (GCV resistance.The method uses five primer pairs and seven enzymes already published and newly combined.The detection limit of nPCR was assessed in a single serial dilution assay to be about 0.13 PFU/reaction. Expected restriction fragment patterns were obtained by nPCR-RFLP on either wild-type reference strains or strains and sequences of HCMV containing mutations. Then the nPCR-RFLP was used on 24 sera/plasma belonging to 22 transplant recipients (kidney, bone marrow, or kidney-pancreas: 13 subjects never treated with GCV (control group and 9 subjects treated with GCV oral profilaxis (study group. All codons detected from the control group (six in 8 cases and four in 1 case were identified as wild-type. All codons detected from the study group (six in 6 cases, three in 2 cases, and four in the second sample of 1 case whose first sample was negative by nPCR were wild-type except one, which showed a restriction pattern referring to M460V and/or M460I ATA-codified, definitively proved to be M460V by sequence analysis.This was the case of a renal transplant recipient at the end of profilaxis. In conclusion, the procedure seems to be quite sensitive and specific as well as able to detect mixed population of mutants or mutants and wild-type. It could represent a good tool in monitoring the emergence of HCMV mutants in renal transplant recipients treated with GCV.

  4. Estudio mediante PCR múltiple de serotipos de Listeria monocytogenes aislados en Argentina Study by multiplex PCR of Listeria monocytogenes serotypes isolated in Argentine

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    R. Callejo

    2008-06-01

    Full Text Available Se comparó una PCR múltiple recientemente validada para la caracterización de serotipos de Listeria monocytogenes con el método tradicional de serotipificación. Se estudiaron 342 aislamientos de origen humano, alimentario, veterinario y ambiental obtenidos durante el período 1992-2005. La concordancia entre ambos métodos para los serotipos 1/2a, 1/2b y 1/2c fue del 100%, y para el serotipo 4b fue del 98%. La serotipificación constituye una herramienta importante como primer nivel de diferenciación de cepas de L. monocytogenes para llevar a cabo la vigilancia epidemiológica y, sobre todo, el estudio de brotes. La PCR múltiple es una técnica alternativa rápida, de bajo costo y fácilmente adaptable en laboratorios de bacteriología clínica y bromatología.A multiplex PCR assay, recently validated to characterize the serotypes of Listeria monocytogenes was evaluated in comparison to conventional serotyping. Three hundred forty two L. monocytogenes strains isolated from human, food, animal and environmental sources during the 1992-2005 period were assayed. The concordance between the two methods for serotypes 1/2a, 1/2b and 1/2c was 100%, whereas for serotype 4b it was 98%. Serotyping is a useful tool for first line strain differentiation during epidemiological surveillance and outbreaks. The multiplex PCR assay offers a fast and low-cost alternative, which is easily adaptable to clinical bacteriology and bromatology laboratories.

  5. CARACTERIZACIÓN MOLECULAR MEDIANTE rep-PCR DE AISLADOS NATIVOS DE Bacillus thuringiensis, OBTENIDOS DE MUESTRAS DE SUELO

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Fabi\\u00E1n Galvis

    2014-01-01

    Full Text Available Bacillus thuringiensis es una bacteria Gram-positiva formadora de esporas, que produ - ce cristales parasporales de naturaleza proteica, tóxicos contra diferentes órdenes de insectos y biodegradables e inocuos para otras especies. Esta investigación empleó el modelo experimen - tal, que mediante técnicas de observación permi - tió, la identificación microbiológica y bioquímica de B. thuringiensis a partir de muestras de suelo de los municipios de Cúcuta, El Zulia, Los Patios, San Cayetano y Villa del Rosario, Norte de Santander, Colombia, y su posterior caracteri - zación con los marcadores moleculares Bc-Rep y MB1. Se identificaron microbiológica y bioquí - micamente 10 aislados como B. thuringiensis ; los resultados del análisis filogenético mostraron diferencias significativas en los agrupamientos obtenidos con los marcadores Bc-Rep y MB1. Con Bc-Rep se registró un índice de similaridad bajo (18%, mientras que con el marcador MB1 se obtuvo un índice mayor de similitud, 58%. En este trabajo se evidenció una gran variabilidad genética entre los aislados, que mostraron a los marcadores Bc-Rep y MB1 como altamente efectivos para diferenciar cepas estrechamente relacionadas, convirtiéndose en una herramienta genética de gran valor para estudios de identifi-cación y diversidad en B. thuringiensis.

  6. IDENTIFICACIÓN MEDIANTE PCR DEL SEXO DE LA PAPAYA (Carica papaya L., HÍBRIDO "POCOCÍ"

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ericka Saalau-Rojas

    2009-01-01

    con dos metodologías de extracción, CTAB y lisis alcalina (NaOH. La amplificación por PCR del ADN extraído de muestras foliares de papaya híbrido "Pococí", con ambos métodos de extracción, produjo los fragmentos del tamaño esperado. La determinación del sexo de 1.500 plántulas en almácigo mostró un 46 % de plántulas hermafroditas y un 54 % de plantas femeninas. La proporción observada de plantas femeninas: hemafroditas no varió de la esperada (1:1 según la prueba de chi-cuadrado (p= 0,4237. Las plantas hermafroditas fueron llevadas al campo y al momento de la floración se determinó su sexo. La correspondencia entre el sexado por PCR y la expresión sexual en campo fue de un 98 %.

  7. Tipificación capsular mediante PCR de aislamientos de Haemophilus influenzae no tipificables por aglutinación PCR-based capsular typing of Haemophilus influenzae isolates non-typeable by agglutination

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    G. Weltman

    2005-12-01

    Full Text Available Haemophilus influenzae es reconocido como un agente patógeno responsable de infecciones localizadas y sistémicas. Se han descrito 6 tipos de polisacáridos capsulares antigénicamente distintos (a, b, c, d, e, y f que se pueden identificar por aglutinación en lámina con antisueros específicos. También existen cepas no capsuladas (NC fenotípicamente no tipificables (NT. La introducción de la vacuna conjugada produjo una marcada disminución de las enfermedades invasivas causadas por H. influenzae tipo b. En este contexto, la tipificación capsular mediante PCR es el método más apropiado para distinguir las cepas no capsuladas de las mutantes b deficientes en cápsula (b- y detectar la presencia de cepas pertenecientes a otros serotipos que no puedan ser tipificables por aglutinación. Se determinó el genotipo capsular a 38 aislamientos de Haemophilus influenzae no tipificables por aglutinación, derivados al servicio de Bacteriología Clínica del INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán" en el período 2002-2004. El 78,9% de los aislamientos provenían de hemocultivos y la mayor parte de ellos estaban asociados a foco respiratorio. El 100% de los aislamientos fueron identificados como H. influenzae no capsulados mediante la técnica de PCR.Haemophilus influenzae is recognized as a pathogenic agent responsible of localized and systemic infections. Six antigenically different capsular polysaccharide types have been described (a, b, c, d, e, and f which can be identified by slide agglutination with specific antisera. Besides there are non capsulated strains that cannot be typed by slide agglutination. The introduction of the conjugated vaccine produced an important reduction of invasive diseases caused by H. influenzae type b. Capsular typing by PCR is the most appropriated method for distinguishing non capsulated strains from capsule deficient type b mutants (b- and for detecting strains of other serotypes that cannot be detected by slide

  8. Detección y cuantificación del Potato mop-top virus (PMTV en Colombia mediante qRT-PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Nevar García Bastidas

    2013-04-01

    Full Text Available El Potato mop-top virus (PMTV es uno de los virus re-emergentes en cultivos de papa en Colombia. Es transmitido por Spongospora subterranea, el agente causal de la sarna polvosa. La detección del PMTV presenta dificultades debido a su distribución irregular en las plantas, bajo título y movimiento sistémico como ARN desnudo. Con el fin de ampliar el rango de herramientas disponibles para detectar el PMTV en los programas de certificación de tubérculo-semilla, en este estudio se evaluó la prueba de RT-PCR en tiempo real (qRT-PCR en dos pasos: con los cebadores PMTV-1948F/PMTV-2017R y la sonda Taqman® PMTV-1970, dirigidos al gen CP-RT del ARN2 viral. Se construyó una curva estándar a partir de la transcripción in vitro de un fragmento de 1513 pb de este gen. Posteriormente, se evaluó la utilidad de la técnica a partir de tres tipos de muestras: plantas señuelo de Nicotiana benthamiana y Solanum phureja inoculadas con quistosoros de Sss, raíces de papa con síntomas de sarna polvosa del municipio de La Unión (Antioquia y tubérculos-semilla. Mediante qRT-PCR fue posible detectar el virus en 11 de las 20 muestras de raíz de plantas señuelo, mientras que 14 de las 15 muestras de raíces de papa resultaron positivas, estimándose una concentración entre 4.72 x 10(11 y 7.60 x 10(13 partículas virales/µl. Adicionalmente, en el ensayo de tubérculo-semilla se determinó la presencia del PMTV en una de las 16 muestras. Estos resultados indican la viabilidad de utilizar rutinariamente la técnica de qRT-PCR para la detección de PMTV en Colombia.

  9. Detección de VPH en boca y cérvix de pacientes con diagnóstico citológico sugestivo de infección genital HPV detection in the mouth and cervix of patients with histological diagnosis suggestive of genital infection

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Z. De Guglielmo

    2012-12-01

    Full Text Available En este trabajo se evaluó la presencia de VPH en la cavidad bucal (mediante oroscopia y citología oral exfoliativa y su relación con la infección genital en mujeres con diagnóstico citológico sugestivo de infección por VPH. La muestra consistió en 60 pacientes a quienes se les realizó oroscopia, citología y determinación viral en boca y cérvix por PCR, utilizando los iniciadores genéricos MY09/MY11 y MPCR. Se detectó ADN de VPH en las mucosas oral y genital en 48,33 % y 73,3% de las pacientes, respectivamente, obteniéndose una concordancia de 44,2% (k=0,44 indicando grado de acuerdo moderado. Los tipos virales más frecuentes fueron de bajo riesgo, especialmente el tipo 6, encontrado en 86,2% de las muestras bucales y 65,9% de las muestras cervicales, solo o en combinación con otros tipos de bajo (11 o de alto riesgo oncogénico (16, 18, 33, con una concordancia de 10,45% (k=0,1 indicando grado de acuerdo muy bajo; sin embargo, particularmente en relación al tipo 6, hubo una concordancia de 75,86% (k=0,7 indicando grado de acuerdo alto. La citología de la cavidad bucal tuvo una sensibilidad de 3,5 % y especificidad de 93,6 %. Para la oroscopia, la sensibilidad fue de 27,6 % y la especificidad de 74,2 %. Los resultados señalan que la infección por VPH en cavidad bucal de pacientes con infección genital pudiera ser frecuente. La baja concordancia global entre los tipos virales sugiere que la infección por VPH en boca y cérvix presenta un comportamiento biológico diferente.This work evaluated HPV infection in the oral cavity (using oroscopy and exfoliative oral cytology and its relation to genital infection in women with cytological diagnosis suggestive of HPV infection. The sample consisted of 60 patients who underwent oroscopy, cytology and viral determination in mouth and cervix by PCR using generic primers MY09/MY11 and MPCR. HPV DNA was detected in oral and genital mucosa in 48.33% and 73.3% of patients, respectively

  10. Polimorfismo genético de beta-lactoglobulina y alphalactoalbúmina en el ganado criollo colombiano, mediante PCR-SSCP

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Muñoz Florez Jaime Eduardo

    2011-12-01

    Full Text Available La población de ganado criollo colombiano ha venido presentando una inquietante disminución al pasar de 23.415 ejemplares en 1999 a 20.102 en 2003. A pesar de los esfuerzos por recuperar las razas criollas el panorama para su conservación es incierto, por tanto la búsqueda de caracteres deseables puede contribuir a su valoración y conservación. Los genes relacionados con el mejoramiento de la calidad de la leche producida por estas razas se consideran de gran importancia en la industria láctea, por tal razón y con el objetivo de caracterizar los genes beta-lactoglobulina y alpha-lactoalbúmina se analizaron 30 muestras de sangre de cada una de las razas criollas (Blanco Orejinegro, Caqueteño, Casanareño, Costeño con cuernos, Chino Santandereano, Hartón del Valle, Romosinuano y Sanmartinero, dos razas sintéticas colombianas (Lucerna y Velásquez y dos razas foráneas (Holstein y Brahman. Se amplificaron fragmentos de 262pb para beta-lactoglobulina (b-LG y de 166 pb para alpha-lactoalbúmina (a-LA que se genotipificaron mediante PCR-SSCP. El promedio de la frecuencia para b-LG A y b-LG B fue de 0.46 ± 0.020 y de 0.53 ± 0.020, respectivamente, y de 0.35 ± 0.019 para a-LA A y 0.64 ± 0.019 para a-LA B. El promedio de diversidad genética (He para b-LG fue 0.498 y de 0.455 para a-LA. Los ganados criollos representan una base genética valiosa, como alternativa para mejorar genéticamente los hatos destinados a la producción de leche con mejores características en calidad para la industria láctea.

  11. Frecuencia de microsporidiosis intestinal en pacientes positivos para VIH mediante las técnicas de Gram cromotropo rápido y PCR.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jorge H. Botero

    2004-12-01

    Full Text Available Los microsporidios son protozoos intracelulares obligados, implicados en procesos de diarrea persistente en pacientes con sida, aunque no son exclusivos de este grupo de pacientes. La prevalencia de microsporidios en diferentes países varía entre 8% y 52%. En nuestro medio no se conoce su frecuencia, por lo que este trabajo se propuso determinar la frecuencia de microsporidiosis intestinal en pacientes positivos para VIH, mediante la prueba del Gram cromotropo rápido (quick hot Gram y la PCR; para esto se realizó un estudio prospectivo, descriptivo, con una población intencional de todos los pacientes positivos para VIH remitidos al Laboratorio del Grupo Interdisciplinario para el Estudio de las Parasitosis Intestinales por las diferentes instituciones de atención de pacientes positivos para VIH de Medellín en el periodo comprendido entre agosto de 2001 y septiembre de 2002. Se hizo una encuesta clínico-epidemiológica y se practicaron análisis coprológicos seriados que incluían examen directo, por concentración y tinciones especiales para coccidias y microsporidios intestinales; además, se solicitó recuento de linfocitos TCD4+ y carga viral. Se estudiaron 103 pacientes en edades comprendidas entre 2 y 74 años; el 70% (72/103 presentaba diarrea al ingreso al estudio; la mayoría (83,5% fueron hombres. La frecuencia global de microsporidiosis intestinal fue de 3,9% (4/103; se encontraron tres pacientes positivos para Enterocytozoon bieneusi y uno con Encephalitozoon intestinalis; otras parasitosis intestinales representaron el 39,8%. La frecuencia de microsporidiosis en este estudio fue relativamente baja; además, como era de esperarse, la mayoría de los casos de microsporidios estuvieron asociados con diarrea prolongada y recuentos de LTCD4+ menores de 100 cél/?l y cargas virales superiores a 100.000 copias (3/4.

  12. Polimorfismo genético de beta-lactoglobulina y alphalactoalbúmina en el ganado criollo colombiano, mediante PCR-SSCP

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jaime A Rosero-Alpala

    2011-12-01

    Full Text Available La población de ganado criollo colombiano ha venido presentando una inquietante disminución al pasar de 23.415 ejemplares en 1999 a 20.102 en 2003. A pesar de los esfuerzos por recuperar las razas criollas el panorama para su conservación es incierto, por tanto la búsqueda de caracteres deseables puede contribuir a su valoración y conservación. Los genes relacionados con el mejoramiento de la calidad de la leche producida por estas razas se consideran de gran importancia en la industria láctea, por tal razón y con el objetivo de caracterizar los genes beta-lactoglobulina y alpha-lactoalbúmina se analizaron 30 muestras de sangre de cada una de las razas criollas (Blanco Orejinegro, Caqueteño, Casanareño, Costeño con cuernos, Chino Santandereano, Hartón del Valle, Romosinuano y Sanmartinero, dos razas sintéticas colombianas (Lucerna y Velásquez y dos razas foráneas (Holstein y Brahman. Se amplificaron fragmentos de 262pb para beta-lactoglobulina (b-LG y de 166 pb para alpha-lactoalbúmina (a-LA que se genotipificaron mediante PCR-SSCP. El promedio de la frecuencia para b-LG A y b-LG B fue de 0.46 ± 0.020 y de 0.53 ± 0.020, respectivamente, y de 0.35 ± 0.019 para a-LA A y 0.64 ± 0.019 para a-LA B. El promedio de diversidad genética (He para b-LG fue 0.498 y de 0.455 para a-LA. Los ganados criollos representan una base genética valiosa, como alternativa para mejorar genéticamente los hatos destinados a la producción de leche con mejores características en calidad para la industria láctea.

  13. Translation of vph mRNA in Streptomyces lividans and Escherichia coli after removal of the 5' untranslated leader.

    Science.gov (United States)

    Wu, C J; Janssen, G R

    1996-10-01

    The Streptomyces vinaceus viomycin phosphotransferase (vph) mRNA contains an untranslated leader with a conventional Shine-Dalgarno homology. The vph leader was removed by ligation of the vph coding sequence to the transcriptional start site of a Streptomyces or an Escherichia coli promoter, such that transcription would initiate at the first position of the vph start codon. Analysis of mRNA demonstrated that transcription initiated primarily at the A of the vph AUG translational start codon in both Streptomyces lividans and E. coli; cells expressing the unleadered vph mRNA were resistant to viomycin indicating that the Shine-Dalgarno sequence, or other features contained within the leader, was not necessary for vph translation. Addition of four nucleotides (5'-AUGC-3') onto the 5' end of the unleadered vph mRNA resulted in translation initiation from the vph start codon and the AUG triplet contained within the added sequence. Translational fusions of vph sequence to a Tn5 neo reporter gene indicated that the first 16 codons of vph coding sequence were sufficient to specify the translational start site and reading frame for expression of neomycin resistance in both E. coli and S. lividans.

  14. A feature information based VPH for local path planning with obstacle avoidance of the mobile robot

    Science.gov (United States)

    Oh, Tae-Seok; Shin, Yun-Su; Yun, Sung-Yong; Lee, Wang-Heon; Kim, Il-Hwan

    2007-12-01

    This study shows how a mobile service robot can avoid obstacles, and presents a VPH method using feature information for Local Path Planning. It is not easy to make a mobile service robot automatically move towards the goal. Path Planning lays out the path through which a robot follows to reach the goal. It can be divided into two folds: Global Path Planning (GPP) and Local Path Planning (LPP). Local path planning sets a path in a changing environment with moving obstacles such as in a museum and exhibition hall so that the robot reaches the goal without any collision. This study evaluates the Fusion Map-VPH (FM-VPH) Local path planning method with improved VPH by making use of the combined data drawn up through the ultrasonic sensor and laser sensor and by means of feature information. The results of the simulations and experiments have verified the validity of the methods described.

  15. Detección del virus de la leucosis bovina en ganado criollo colombiano mediante PCR-anidado Bovine leukemia virus detection in Creole Colombian breeds using nested-PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Darwin Yovanny Hernández-Herrera

    2011-12-01

    Full Text Available Se evaluó la presencia del virus de la leucosis bovina (VLB en 360 muestras de ADN de ocho razas bovinas criollas: Blanco Orejinegro (BON, Casanareño (CAS, Costeño con Cuernos (CCC, Chino Santandereano (ChS, Caqueteño (CQT, Hartón del Valle (HV, Romosinuano (RS y San Martinero (SM, dos Razas Sintéticas Colombianas: Lucerna (LUC y Velásquez (VEL y dos razas foráneas: Brahmán (B y Holstein (H. Para la detección del pro-virus se amplificó una región del gen env viral, mediante PCR anidada. La presencia del VLB fue mayor en la raza HV seguido por ChS (83.3% y 60% respectivamente, VEL y LUC tuvieron el mismo porcentaje (50%, en CAS, CCC y CQT la presencia del virus fue de 26.7%, 23.3% y 16.7% respectivamente; no se encontró el virus en BON, SM y RS. En las razas foráneas la presencia fue de 83.3% para H y 6.7% para B. Se encontró dependencia altamente significativa entre la presencia del VLB y la raza, el sexo y región de origen de la muestra. El promedio de presencia en las razas criollas fue menor que en las foráneas, menor en los machos que en las hembras y en la región norte que en el suroccidente y el centro del país.Using 360 DNA samples from eight Creole bovine breeds Blanco Orejinegro (BON, Casanareño (CAS, Costeño con Cuernos (CCC, Chino Santandereano (ChS, Caqueteño (CQT, Hartón del Valle (HV, Romosinuano (RS and San Martinero (SM, two synthetic Colombian breeds: Lucerna (LUC and Velásquez (VEL and two introduced breeds Brahmán (B and Holstein (H; the presence of Bovine Leukemia Virus (BLV was evaluated through the amplification of a viral gene region env (provirus detection - nested-PCR. The percentage of presence and independence test were calculated (X². Presence of BLV was higher in HV breed, followed by ChS (83.3% and 60% respectively; VEL and LUC breeds showed the same percentage (50%. In CAS, CCC and CQT the presence of virus was 26.7%, 23.3% y 16.7% respectively. On the other hand, no virus presence was

  16. Polimorfismo genético de beta-lactoglobulina y alphalactoalbúmina en el ganado criollo colombiano, mediante PCR-SSCP Genetic polymorphism of beta-lactoglobulin and alpha-lactoalbumin in Colombian Creole cattle by PCR-SSCP

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jaime A Rosero-Alpala

    2011-12-01

    Full Text Available La población de ganado criollo colombiano ha venido presentando una inquietante disminución al pasar de 23.415 ejemplares en 1999 a 20.102 en 2003. A pesar de los esfuerzos por recuperar las razas criollas el panorama para su conservación es incierto, por tanto la búsqueda de caracteres deseables puede contribuir a su valoración y conservación. Los genes relacionados con el mejoramiento de la calidad de la leche producida por estas razas se consideran de gran importancia en la industria láctea, por tal razón y con el objetivo de caracterizar los genes beta-lactoglobulina y alpha-lactoalbúmina se analizaron 30 muestras de sangre de cada una de las razas criollas (Blanco Orejinegro, Caqueteño, Casanareño, Costeño con cuernos, Chino Santandereano, Hartón del Valle, Romosinuano y Sanmartinero, dos razas sintéticas colombianas (Lucerna y Velásquez y dos razas foráneas (Holstein y Brahman. Se amplificaron fragmentos de 262pb para beta-lactoglobulina (b-LG y de 166 pb para alpha-lactoalbúmina (a-LA que se genotipificaron mediante PCR-SSCP. El promedio de la frecuencia para b-LG A y b-LG B fue de 0.46 ± 0.020 y de 0.53 ± 0.020, respectivamente, y de 0.35 ± 0.019 para a-LA A y 0.64 ± 0.019 para a-LA B. El promedio de diversidad genética (He para b-LG fue 0.498 y de 0.455 para a-LA. Los ganados criollos representan una base genética valiosa, como alternativa para mejorar genéticamente los hatos destinados a la producción de leche con mejores características en calidad para la industria láctea.The Colombian Creole Cattle has showed a preoccupant population decreasing, from 23,415 individuals in 1999 to 20,102 in 2003. Despite that many efforts to recover the creole breeds have been done, its future conservation is unclear. Searching for economic desirable genes may contribute to its preservation and utilization as a genetic resource. Genes related with the improvement of milk proteins are considered as an economic important

  17. Factores de riesgo para la infección cervical por el VPH en pacientes VIH+, atendidas en el capasits del Hospital General de Puebla, México

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    JF Martínez-Herrera

    2010-01-01

    Full Text Available Las tasas de infección cervical por el Virus del Papiloma Humano (VPH y citología anormales son mayores en mujeres infectadas por el Virus de la Inmunodeficiencia Humana (VIH1. Es un estudio observacional, descriptivo, retrospectivo y no experimental. Se revisaron 319 expedientes, de los cuales 30 que cumplieron con los criterios de inclusión fueron estudiados. En 23 (76.6% expedientes se encontraron la prueba de PCR positivo y en 7 (23.33% PCR negativo para ADN del VPH. Para las pacientes positivas a la PCR el rango de edad fue de 18 a 58a (media de 36a ±9.3a IC 95% 3.824 y no hubo diferencia significativa con las pacientes PCR negativas (p=0.02. Se calculó el Odds Ratio para diferentes variables siendo el vivir en la cuidad (OR 4.8, estar en unión libre (OR 4.6, tener menos de 12 años de educación (OR 8.8, el no usar ningún método anticonceptivo (OR 7.08 y cuentas CD4+ por debajo de 200 cel/ml (OR 3.25 las más sobresalientes. Al utilizar la prueba t de student para el tiempo de diagnóstico, tiempo de estar bajo TARAA y cuenta de células CD4+ no hubo diferencia significativa (p>0.01. El tiempo de diagnóstico por el VIH y el estado inmunológico muestran una relación, aunque entre ambos grupos no se encontraron diferencias significativas (p=0.12. Vivir en la cuidad, estar en unión libre, tener menos de 12 años de educación, el no usar ningún método anticonceptivo y cuentas CD4+ por debajo de 200 cel/ml mostraron una relación con la infección por el VPH. Sin embargo no encontramos todos los factores de riesgo asociados la infección cervical por el VPH.

  18. Características sociodemográficas de mujeres peruanas con virus papiloma humano detectado por PCR-RFLP

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Yasser Sullcahuaman-Allende

    2015-09-01

    Full Text Available Con el objetivo de determinar las características sociodemográficas del virus de pacientes con papiloma humano (VPH referidas al Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN durante los años 2012-2014, se realizó la detección del VPH en células cervicales por reacción en cadena de la polimerasa (PCR. En 465 muestras cervicales se detectaron 151 (32,5% casos de VPH positivas. Los genotipos más frecuentes fueron VPH-16 (23,8% y VPH-6 (11,9%. La presencia de VPH fue mayor en mujeres de 17 a 29 años (OR 2,64, IC 95%:1,14-6,13 y solteras (OR 2,31, IC 95%: 1,37-3,91, la presencia de genotipos de VPH de alto riesgo fue mayor en solteras (OR 2,19, IC 95%: 1,04-4,62. En conclusión, mujeres jóvenes y solteras presentaron mayor frecuencia de casos VPH-positivos a quienes se debe enfatizar la participación en programas de tamizaje con métodos moleculares y citológicos combinados, a fin de detectar oportunamente el riesgo de desarrollar cáncer de cuello uterino

  19. Características sociodemográficas de mujeres peruanas con virus papiloma humano detectado por PCR-RFLP

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Yasser Sullcahuaman-Allende

    Full Text Available Con el objetivo de determinar las características sociodemográficas del virus de pacientes con papiloma humano (VPH referidas al Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN durante los años 2012-2014, se realizó la detección del VPH en células cervicales por reacción en cadena de la polimerasa (PCR. En 465 muestras cervicales se detectaron 151 (32,5% casos de VPH positivas. Los genotipos más frecuentes fueron VPH-16 (23,8% y VPH-6 (11,9%. La presencia de VPH fue mayor en mujeres de 17 a 29 años (OR 2,64, IC 95%:1,14-6,13 y solteras (OR 2,31, IC 95%: 1,37-3,91, la presencia de genotipos de VPH de alto riesgo fue mayor en solteras (OR 2,19, IC 95%: 1,04-4,62. En conclusión, mujeres jóvenes y solteras presentaron mayor frecuencia de casos VPH-positivos a quienes se debe enfatizar la participación en programas de tamizaje con métodos moleculares y citológicos combinados, a fin de detectar oportunamente el riesgo de desarrollar cáncer de cuello uterino

  20. Estudio de la respuesta inmune humoral hacia papilomavirus (VPH en mujeres con citología normal

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Martha Serrano

    2004-03-01

    Full Text Available

    Dentro de las enfermedades de transmisión sexual, las infecciones por VPH son las más frecuentes en adultos sexualmente activos. La mayoría de estas infecciones (70 a 90% son eliminadas en un periodo de 12 a 30 meses. Las infecciones persistentes se asocian con un mayor riesgo de desarrollo de neoplasias cervicales (1. Los factores que influyen en la eliminación o persistencia no son conocidos, sin embargo, el sistema inmune tiene un papel importante el control de estas infecciones (2. La infección por VPH se caracterizada por una respuesta serológica dirigida contra epítopes conformacionales de la cápside. Los anticuerpos IgG contra VLP (virus like particles se asocian con infección persistente. Esta respuesta persiste varios años y en su mayoría es tipo específica. La respuesta de tipo IgA es también tipo específica pero no se mantiene en el tiempo, por lo que se sugiere como marcador de infección reciente o activa (3.

    De un estudio de seguimiento de VPH en 1859 mujeres colombianas (4 se seleccionaron 187 sueros de mujeres con citología normal en la primera y quinta visita, con el fin de analizar la respuesta inmune tipo IgG e IgA mediante ELISA hacia proteínas de la cápside viral del VPH 16, 31 y 58 y establecer si el comportamiento de esta respuesta se asocia con el curso de la infección y su eliminación.

    Las mujeres fueron clasificadas de acuerdo a la presencia viral en tres grupos: grupos control, negativas para VPH durante el seguimiento; grupo eliminación, positivas para VPH al inicio y negativas al final del seguimiento y grupo de persistencia, positiva para VPH durante todo el seguimiento.

    Con respecto a la seroprevalencia

  1. Conocimientos sobre el virus del papiloma humano (VPH) y su vacuna dentro de la comunidad universitaria

    OpenAIRE

    2016-01-01

    Objetivo: Evaluar el nivel de conocimientos sobre el VPH en una muestra de universitarios. Se realizó un estudio observacional descriptivo y analítico de corte transversal con el objetivo principal de evaluar el nivel de conocimientos y actitudes sobre VPH en una muestra de universitarios de la Universidad Pontificia de Salamanca. La muestra cuenta con 194 sujetos, 103 estudiantes del grado de enfermería y 91 estudiantes del grado de psicología que cumplían los criterios de inclusión y ...

  2. Detection of Brucella melitensis DNA in the milk of sheep after abortion by PCR assay Detección de ADN de Brucella melitensis mediante la prueba de PCR en muestras de leche de ovejas postaborto

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Z Ilhan

    2008-01-01

    Full Text Available Laboratory diagnosis of brucellosis is generally performed by microbiological and serological methods. PCR assay is a specific and sensitive choice for the detection of different bacterial agents. An evaluation of this test was carried out for the detection of Brucella melitensis DNA in sheep milk. 102 milk samples from sheep after abortion were taken and studied using bacteriological culture, PCR and milk ring test (MRT. PCR found B. melitensis DNA in 24 (23.5% out of 102 milk samples, while only 8 (7.8% of the samples were positive to B. melitensis through direct culture. MRT found 28 (27.4% positive milk samples. The detection limit for PCR in sheep milk inoculated with B. melitensis strain 16 M was 1.7x10³-1.7x10(4 cfu/ml. PCR and MRT coincidence was 96%. The diagnostic sensitivity and specificity were determined as 100% and 81.3% respectively for PCR assay and 75% and 75% for MRT. PCR is a useful tool for a fast diagnosis of B. melitensis in sheep milk.El diagnóstico de laboratorio de brucelosis es generalmente realizado por métodos microbiológicos y serológicos. La prueba PCR es reconocida como una alternativa específica y sensible para la detección de diferentes agentes bacterianos. Se realizó una evaluación de la prueba PCR para la detección de ADN de Brucella melitensis en leche de oveja. Ciento dos muestras tomadas de ovejas postaborto fueron analizadas por métodos de cultivo bacteriológico, prueba PCR y prueba del anillo en leche (MRT. El PCR detectó ADN de B. melitensis en 24 (23,5% de 102 muestras de leche, mientras que solamente 8 (7,8% muestras de leche fueron positivas a B. melitensis por cultivo directo. El MRT detectó 28 (27,4% muestras positivas de leche. El límite de detección de B. melitensis 16 M por PCR fue de 1,7x10³-1,7x10(4 ufc/ml en leche inoculada. La concordancia entre PCR y MRT fue 96%. La sensibilidad diagnóstica y la precisión fueron determinadas como el 100% y el 81,3% respectivamente para la

  3. Protocolo de extracción de ADN en lotes de 10 mosquitos para la identificación de Plasmodium spp. mediante qPCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    A. Pérez Rico

    Full Text Available Las tropas que despliegan en zonas de operaciones endémicas de malaria, necesitan de una información precisa del riesgo sanitario para la toma de decisiones acerca de las medidas de prevención más adecuadas. El estado de portador de un mosquito se determina clásicamente por la presencia o ausencia de esporozoitos de Plasmodium spp. en las glándulas salivales. Los protocolos basados en la amplificación del ADN en tiempo real (qPCR son muy sensibles, sin embargo existen dificultades en la qPCR debido a inhibidores presentes en los tejidos del mosquito, lo que obliga a trabajar de uno en uno. En este trabajo se diseña una qPCR para amplificar una región conservada entre mosquitos de diferentes especies y otros dípteros, con el objetivo de comparar varios protocolos de extracción de ADN y determinar el más eficiente a la hora de procesar lotes de 10 mosquitos.

  4. DETECCIÓN Y CUANTIFICACIÓN DE Spongospora subterranea f. sp. subterranea EN PLANTAS SEÑUELO Y CULTIVOS DE PAPA EN COLOMBIA MEDIANTE qPCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    NEVAR GARCÍA BASTIDAS

    2013-01-01

    Full Text Available La sarna polvosa de la papa (Solanum tuberosum, S. phureja causada por Spongospora subterranea f. sp. subterranea (Sss, es una de las enfermedades más limitantes de este cultivo. En Colombia, se han empleado diferentes métodos de detección asintomática de Sss, incluyendo bioensayos con plantas señuelo, PCR de ITS y pruebas de ELISA. Sin embargo, sus niveles de sensibilidad son bajos o requieren tiempos extensos. Una alter- nativa para complementar dichas herramientas es la PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR. En este trabajo se evaluó dicha técnica utilizando los juegos de cebadores SsTQF1-SsTQR1; Spon421F-Spon494R y SscolF-SscolR (diseñados en este estudio, bajo la metodología de SYBR Green®; mientras que con Taqman® se evaluaron los ce- badores SponF-SponR y la sonda SponP. Una vez determinada la funcionalidad de los cebadores, se descartó por inespecificidad, el par Spon421F-Spon494R; para los restantes se realizaron curvas estándar basadas en diluciones seriadas de quistosoros. Las pruebas de qPCR detectaron a Sss en las 20 muestras evaluadas de plantas señuelo de Nicotiana benthamiana y papa, utilizando los cebadores SsTQF1-SsTQR1 (Ct: 10,57- 29,34 y SscolF-SscolR (Ct: 14,39-34,08; mientras que 19 de las muestras fueron positivas con SponF-SponR-SponP (Ct: 15,63-38,93. A partir de 20 muestras de raíces de papa de cultivos de La Unión (Antioquia, Colombia, fue posible detectar el pató- geno en 17 de ellas con SscolF-SscolR, estimándose una concentración de 6470 a 1,39 x 1010 quistorosos/mL. Estos resultados indican la ocurrencia de altos niveles de inócu- lo de Sss en esta región y enfatizan en la necesidad de fortalecer los programas de cer- tificación de tubérculo-semilla en Colombia.

  5. ESTRUCTURA MOLECULAR Y ANTIGÉNICA DE LA VACUNA CONTRA EL VIRUS DEL PAPILOMA HUMANO 16 (VPH 16 Antigenic and Molecular Structure of Human Papillomavirus (HPV 16 Vaccine

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    VÍCTOR ANDRÉS VANEGAS

    Full Text Available La proteína L1 del Virus del Papiloma Humano (VPH constituye el 80% de la cápside viral. Las vacunas profilácticas contra el VPH son sintetizadas a partir de la proteína L1 ensamblada en Partículas similares al Virus (del inglés VLP, las cuales son altamente inmunogénicas generando anticuerpos específicos de tipo y en algunos casos pueden presentar reacción cruzada entre tipos de VPH filogenéticamente próximos. La estructura de la proteína L1 del VPH es importante porque confiere estabilidad a la cápside mediante el establecimiento de interacciones intra e intercapsoméricas lo que asegura la integridad viral y antigénicamente porque contiene los epítopes que inducen la respuesta inmune protectora. En estudios en los que se evaluó la antigenicidad de la proteína L1 se determinó que los epítopes inmunodominantes de la cápside viral se encuentran en los bucles B-C, D-E, F-G, H-I y en el extremo C-terminal. Estos bucles son poco conservados entre los diferentes genotipos y se encuentran en segmentos de la proteína expuestos en la superficie de la cápside. Los aminoácidos situados en los bucles B-C, F-G y H-I son primordiales para el reconocimiento por los anticuerpos neutralizantes. Los diferentes subtipos y variantes presentan cambios en estos aminoácidos o en residuos que conforman otros epítopes. En esta revisión se presentará un estado del arte de la proteína L1 del VPH genotipo 16, la estructura y su importancia en el desarrollo de vacunas contra la infección producida por este virus.Human Papillomavirus L1 protein makes up 80% of the viral capsid and self assembles in Virus-like Particles (VLP; these particles are immunogenic, generate type-specific antibodies and can induce very limited cross-reactivity among highly homologous HPV types. In addition to its structural function, it confers the stability to the capsid by establishing disulfide bonds and other intra and intercapsomeric interactions, and also contains

  6. Quantificazione mediante PCR dell’EBV-DNA da biopsie cutanee di pazienti con linfomi cutanei primitivi (micosi fungoide e sindrome di Sèzary

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Chiara Merlino

    2007-06-01

    Full Text Available Mycosis fungoides (MF, the most indolent form of CTCL, originates from a clonal expansion of epidermotropic helper/memory T cells. Sezary syndrome (SS is a rare primay epidermotropic cutaneous T-cell lymphoma in leukemic. The aetiopathogenesis of MF and SS remains obscure despite several investigations. Infectious, environmental and genetic factors have been implicated as potential aetiological agents. The studies investigating the role of EBV in CTCL present conflicting results. The different sensitivities of the technical methods used in the evaluation of the presence of viral DNA or virus-related antigens make comparison of the results difficult. The aim of this study was to retrospectively evaluate the EBV-DNA load in skin biopsies from MF and SS patients by a highly sensitive (1-10 EBV-DNA copies/reaction quantitative-competitive PCR (QC-PCR developed in our lab to better asses the relationship between EBV and CTCL. Skin biopsies were obtained from 21 MF and 10 SS patients; skin biopsies from a 8 patients with inflammatory skin disease were used as controls. EBV-DNA was detected in 70% of biopsies from SS patients vs. 0% of MF patients. No control patients resulted EBV-DNA positive, as expected. In addition, in SS patients, the survival from diagnosis is lesser in EBV-positive patients vs.EBV-negative patients even if not statistically significant.We are going to investigate the presence of EBV-DNA in peripheral blood of a larger number of patients and to evaluate the pattern of viral genes expression, to better assess the aetiopathogenetical role of EB virus in this kind of neoplasies.

  7. Presence of a Phytoplasma Associated with Witches’-Broom Disease in Ugni molinae Turcz. and Gaultheria phillyreifolia (Pers. Sleumer Determined by DAPI, PCR, and DNA Sequencing Presencia de un Fitoplasma Asociado a la Enfermedad de "Escoba de Bruja" en Ugni molinae Turcz. y Gaultheria phillyreifolia (Pers. Sleumer Determinado Mediante DAPI, PCR y Secuenciación de ADN

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Nolberto Arismendi S

    2010-03-01

    Full Text Available Murta (Ugni molinae Turcz. and common chaura (Gaultheria phillyreifolia (Pers. Sleumer are native species of Chile. Plants of both species have shown over-branching like witches' broom. The causal agents of these symptoms in many plants are phytoplasma. To verify the presence of these microorganisms, DAPI (4',6-diamidino-2-phenylindole staining analysis and polymerase chain reaction (PCR were performed in symptomatic and asymptomatic plants. Positive PCR samples were sequenced to identify the pathogens involved. In individuals of both species with witches’ broom symptoms, DAPI staining showed fluorescent bodies in the phloem tissues, but not in asymptomatic plants. Verification by nested-PCR, phytoplasmatic DNA was amplified from diseased murta and chaura, but not in apparently healthy plants. Sequencing of amplified products allowed locating phytoplasma within the ash yellows group (16SrVII and related to Candidatus phytoplasma fraxini. This is the first report of phytoplasma in Chilean native species. Considering the diversity of plant species infected by the ash yellows group suggests that G. phillyreifolia and U. molinae could be a phytoplasma reservoir for other economically important agricultural crops.La murta (Ugni molinae Turcz. y la chaura común (Gaultheria phillyreifolia (Pers. Sleumer son especies nativas de Chile. En plantas de ambas especies se ha observado una sobre-ramificación de tipo "escoba de bruja". En muchas plantas los agentes causales de esta sintomatología son fitoplasmas. Para verificar la presencia de estos microorganismos se analizaron plantas con y sin síntomas mediante tinciones DAPI (4’,6-diamidino-2-fenilindol y reacción en cadena de la polimerasa (PCR. Muestras positivas en la PCR fueron secuenciadas para identificar al fitopatógeno implicado. En individuos de ambas especies con síntomas de escoba de bruja, la tinción DAPI permitió observar cuerpos fluorescentes en los tejidos del floema, situaci

  8. Comparing modelling techniques when designing VPH gratings for BigBOSS

    Science.gov (United States)

    Poppett, Claire; Edelstein, Jerry; Lampton, Michael; Jelinsky, Patrick; Arns, James

    2012-09-01

    BigBOSS is a Stage IV Dark Energy instrument based on the Baryon Acoustic Oscillations (BAO) and Red Shift Distortions (RSD) techniques using spectroscopic data of 20 million ELG and LRG galaxies at 0.5VPH) gratings have been identified as a key technology which will enable the efficiency requirement to be met, however it is important to be able to accurately predict their performance. In this paper we quantitatively compare different modelling techniques in order to assess the parameter space over which they are more capable of accurately predicting measured performance. Finally we present baseline parameters for grating designs that are most suitable for the BigBOSS instrument.

  9. Genotipado del VPH como herramienta pronóstica en las lesiones CIN I

    OpenAIRE

    Cortés Alaguero, Caterina

    2014-01-01

    La neoplasia intraepitelial cervical (CIN) y el cáncer cervicouterino constituyen un importante problema de salud para las mujeres en todo el mundo. Los datos obtenidos en las numerosas investigaciones realizadas hasta ahora, ponen de manifiesto la existencia de una estrecha relación entre la aparición de alteraciones de diverso grado de malignidad en el tracto genital femenino y la presencia y persistencia del virus del papiloma humano (VPH) de alto riesgo oncogénico. En los últimos 40...

  10. Development of a large mosaic volume phase holographic (VPH) grating for APOGEE

    Science.gov (United States)

    Arns, James; Wilson, John C.; Skrutskie, Mike; Smee, Steve; Barkhouser, Robert; Eisenstein, Daniel; Gunn, Jim; Hearty, Fred; Harding, Al; Maseman, Paul; Holtzman, Jon; Schiavon, Ricardo; Gillespie, Bruce; Majewski, Steven

    2010-07-01

    Volume phase holographic (VPH) gratings are increasingly being used as diffractive elements in astronomical instruments due to their potential for very high peak diffraction efficiencies and the possibility of a compact instrument design when the gratings are used in transmission. Historically, VPH grating (VPHG) sizes have been limited by the size of manufacturer's holographic recording optics. We report on the design, specification and fabrication of a large, 290 mm × 475 mm elliptically-shaped, mosaic VPHG for the Apache Point Observatory Galactic Evolution Experiment (APOGEE) spectrograph. This high-resolution near-infrared multi-object spectrograph is in construction for the Sloan Digital Sky Survey III (SDSS III). The 1008.6 lines/mm VPHG was designed for optimized performance over a wavelength range from 1.5 to 1.7 μm. A step-and-repeat exposure method was chosen to fabricate a three-segment mosaic on a 305 mm × 508 mm monolithic fused-silica substrate. Specification considerations imposed on the VPHG to assure the mosaic construction will satisfy the end use requirements are discussed. Production issues and test results of the mosaic VPHG are discussed.

  11. Determinación de la actividad de la artritis reumatoidea mediante los niveles séricos de interleucina 6 en correlación con reactantes de fase aguda (vsg/pcr) y escalas clinimétricas (das 28 / sdai) en pacientes del servicio de reumatología del Hospital Carlos Andrade Marín, 2013-2014

    OpenAIRE

    Román Chingal, Juan Pablo

    2014-01-01

    Contexto. Se sabe que la Interleucina-6 (IL-6) desempeña un papel fundamental en la generación de señales hacia el interior de la célula permitiendo la producción de sustancias proinflamatorias responsables del estado inflamatorio persistente, característico de la Artritis Reumatoidea (AR). Objetivo. Determinar la actividad de la AR mediante los niveles séricos de IL-6 en correlación con reactantes de fase aguda: velocidad de sedimentación globular (VSG), Proteína C Reactiva (PCR) y escalas ...

  12. Prevalencia de infección por virus de papiloma humano (VPH) de alto riesgo y factores asociados en embarazadas derechohabientes del IMSS en el estado de Morelos

    OpenAIRE

    Carlos Hernández-Girón; Jennifer S Smith; Attila Lorincz; Emilio Arreola Cháidez; Eduardo Lazcano; Mauricio Hernández-Ávila; Jorge Salmerón

    2005-01-01

    Objetivo. Algunos estudios sugieren la posibilidad de que el proceso fisiológico del embarazo modifique algunas características del hospedero, lo que incrementa el riesgo de infección por VPH; sin embargo, esta asociación no está bien establecida. Pocos estudios se han realizado para determinar la prevalencia de infección por VPH de alto riesgo en mujeres embarazadas, y sus factores relacionados. El presente estudio busca determinar la prevalencia de infección por VPH de alto riesgo, en una m...

  13. AgNOR polymorphism association with squamous intraepithelial lesions and invasive carcinoma with HPV infection Asociación de los polimorfismos AgNORs con lesiones intraepiteliales escamosas, carcinoma cervical e infección por VPH

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Luz del Carmen Alarcón-Romero

    2009-04-01

    Full Text Available OBJECTIVE: Evaluate the relationships between AgNORs polymorphisms and squamous intraepithelial lesions (SIL and squamous cell carcinoma (SCC with HPV infection. MATERIALS AND METHODS: A study was carried out on sixty women from the state of Guerrero, Mexico. HPV detection was performed by PCR. AgNORs were identified by argentic impregnation. One hundred cells per slide were counted and classified according to the polymorphism of AgNORs dots; typical (spherical and atypical (large, kidney-shaped and clustered. RESULTS: A total of 100% of the cases were positive for HPV infection. Nine different high-risk HPV genotypes were found, type16 was the most common (48.6%. The AgNORs showed a significant decrease in spherical shape according to neoplastic development. The three atypical shapes showed a significant increase in SIL and SCC (p-trendOBJETIVO: Evaluar la relación entre los polimorfismos de AgNORs con las lesiones intraepiteliales escamosas (LIE y carcinoma de células escamosas (CCE. MATERIAL Y MÉTODOS: Se estudiaron sesenta mujeres del estado de Guerrero, México. La detección del VPH fue por PCR y los AgNORs por impregnación argéntica; se contaron 100 células y se clasificaron por tipo de polimorfismo de AgNORs: típico (esférico y atípicos (largo, forma de riñón o de racimo. RESULTADOS: El 100% de los casos presentaron infección por VPH, se encontraron nueve genotipos diferentes de VPH de alto riesgo, el 16 fue el más común (48.6%. La forma esférica de los polimorfismos de AgNORs mostró una disminución con el desarrollo neoplásico y las atípicas incrementaron progresivamente con SIL y SCC (p-tendencia<0.001. CONCLUSIONES: Los polimorfismos AgNORs se incrementan progresivamente con el grado de lesión histológica, y pueden ser útiles en el pronóstico de progresión del carcinoma cervical.

  14. Factores predictores de enfermedad residual en pacientes con lesión escamosa intraepitelial de alto grado tratadas mediante conización con asa de diatermia

    OpenAIRE

    Ramos Triviño, María Raquel

    2014-01-01

    Evaluar si las pacientes mayores de 35 años que presentan una pieza de conización con ?8 mm o ? 10mm de profundidad, márgenes positivos y VPH-AR positivo postconización presentan con mayor frecuencia enfermedad residual/recurrente. MATERIAL Y MÉTODOS: Se realizó un estudio observacional, descriptivo y retrospectivo de doscientas sesenta mujeres (edad media 35,2 ±13; rango 28-41) con CIN 2-3 tratadas mediante conización con asa de diatermia, incluyendo el seguimiento después de la cirugía, ent...

  15. Aceptabilidad de la vacuna contra el VPH en estudiantes universitarios españoles durante la etapa pre-vacunal: un estudio transversal

    OpenAIRE

    Caballero Pérez, Pablo; Tuells Hernández, José; Rementería, Joseba; Nolasco Bonmatí, Andreu; NAVARRO-LÓPEZ,VICENTE; Arístegui, Javier

    2015-01-01

    Introducción. El cáncer de cuello de útero (CCU), segunda causa de mortalidad por cáncer en mujeres, está asociado a la infección por virus de papiloma humano (VPH), cuya máxima prevalencia se sitúa entre los 20 y 24 años de edad. Desde 2006 se dispone de una vacuna contra el VPH. El objetivo de este estudio es evaluar los conocimientos sobre CCU, la infección por VPH y su vacuna, valorando su aceptabilidad en población universitaria. Métodos. Estudio transversal sobre 1.750 estudiantes de la...

  16. Diagnóstico de infección congénita por citomegalovirus mediante PCR en gotas de sangre seca en el papel de filtro de la tamización neonatal

    OpenAIRE

    2015-01-01

    Objetivo: Determinar la frecuencia de la infección congénita por citomegalovirus en el grupo de recién nacidos prematuros y/o con restricción de crecimiento intrauterino y establecer asociación entre el diagnóstico de la infección congénita por CMV por PCR en sangre seca y la caracterización de los datos del libro de partos y la base de datos del RUAF. Materiales y Métodos: Es un estudio retrospectivo anónimo no ligado, desarrollado en el hospital la Victoria sede Instituto ...

  17. Aceptabilidad y conocimientos sobre la vacunación contra el virus del papiloma humano (VPH) en médicos ginecólogos de la Argentina

    OpenAIRE

    Alejandro Mazzadi; Melisa Paolino; Silvina Arrossi

    2012-01-01

    OBJETIVO: Evaluar entre los ginecólogos argentinos la aceptabilidad y prescripción de la vacuna contra el virus del papiloma humano (VPH), los conocimientos sobre sus características y uso, y las nociones médico-biológicas sobre infección por VPH y cáncer cervicouterino. MATERIAL Y MÉTODOS: Entre noviembre de 2009 y marzo de 2010 se encuestaron a 686 ginecólogos vía internet. RESULTADOS: Más de 80% de los encuestados prescribe la vacuna, conoce sus características y administración, y consider...

  18. Detección de toxoplasmosis congénita en líquido amniótico humano mediante la técnica de nested-pcr

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ossa H.

    2000-12-01

    Full Text Available

    La toxoplasmosis es provocada por el parasite intracelular obligado Toxoplasma gondii,de la familia Toxoplasmidae (Flores, 1991. Este parasite puede ser asintomático en adultos con un sistema inmune normal, pero puede ser de gran trascendencia en el feto en gestación y en pacientes con SIDA o deficiencia en el sistema inmune (Montoya, 1996. La presencia de anticuerpos antitoxoplasma indica únicamente que la persona se infecto con el microorganismo en un momento dado y no que haya oeste desarrollando la toxoplasmosis necesariamente, pero un resultado positivo indica que el individuo está en riesgo de desarrollar la enfermedad (Perea, 1983. Si la infección se produce durante el embarazo, existe la posibilidad que la toxoplasmosis sea transmitida al feto ocasionando aborto espontaneo, prematuridad o enfermedades severas en el feto, tales como: hidrocefalia y calcificaciones inn-ace- i rebrales (Picazo, 1994. En la mayoría de los casos el diagnóstico biológico de la toxoplasmosis congénita se basa en métodos serológicos indirectos; sin embargo, en los últimos años los diversos estudios realizados en Biología Molecular permitieron utilizar la Técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR para el diagnóstico de la enfermedad (Hohlfeld, 1994. Los primeros estudios en PCR fueron dirigidos a la amplificación de la secuencia repetitiva del gen B1 de Toxoplasma gondii en líquido amniótico de mujeres infectadas (Grover, 1990. La prueba de PCR en liquido amniótico es definitivamente mas sensible que otras técnicas convencionales usadas, ya que estas presentan dificultad en establecer un diagnóstico segura y oportuno, por esto se ha implementando la técnica de PCR en la detección de la toxoplasmosis, aportando un progreso indiscutible en aquellos casos donde los exámenes clínicos y serológicos presentan limitaciones. También disminuye el tiempo de análisis de las muestras arrojando resultados en un período máximo de 24

  19. Detección mediante RT-PCR en tiempo real del virus vacunal en cerdos inmunizados con la vacuna cubana contra la peste porcina clásica

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Tania Campos-Cuello

    2016-08-01

    Full Text Available La peste porcina clásica (PPC es una enfermedad viral infectocontagiosa, producida por un virus ARN del género Pestivirus, familia Flaviviridae. En la actualidad es una de las causas de pérdidas económicas en la industria porcina a nivel mundial. En su prevención se han utilizado vacunas vivas atenuadas, empleando la cepa China lapinizada. La Reacción en Cadena de la Polimerasa Reverso Transcriptasa (RT-PCR ha sido uno de los métodos más sensibles aplicado en Medicina Veterinaria para la detección de virus ARN. En el caso del virus de la PPC es muy útil porque el ácido nucleico se puede detectar desde muy temprano en la infección y en periodos más largos en aquellos animales que se recuperan. El objetivo de este estudio fue aplicar la técnica de RT-PCR en tiempo real para la detección de la cepa China lapinizada de la vacuna cubana contra la PPC. Las tonsilas de los cerdos vacunados fueron el órgano más positivo en la detección del ARN del virus vacunal. Los resultados obtenidos evidenciaron una interferencia del virus vacunal en el diagnóstico, siendo el día 12 posvacunación en el que se obtiene una emisión umbral de fluorescencia más bajo.

  20. Aceptabilidad y conocimientos sobre la vacunación contra el virus del papiloma humano (VPH) en médicos ginecólogos de la Argentina

    National Research Council Canada - National Science Library

    Alejandro Mazzadi; Melisa Paolino; Silvina Arrossi

    2012-01-01

    ...), los conocimientos sobre sus características y uso, y las nociones médico-biológicas sobre infección por VPH y cáncer cervicouterino. MATERIAL Y MÉTODOS: Entre noviembre de 2009 y marzo de 2010 se encuestaron a 686...

  1. OpenCMISS: a multi-physics & multi-scale computational infrastructure for the VPH/Physiome project.

    Science.gov (United States)

    Bradley, Chris; Bowery, Andy; Britten, Randall; Budelmann, Vincent; Camara, Oscar; Christie, Richard; Cookson, Andrew; Frangi, Alejandro F; Gamage, Thiranja Babarenda; Heidlauf, Thomas; Krittian, Sebastian; Ladd, David; Little, Caton; Mithraratne, Kumar; Nash, Martyn; Nickerson, David; Nielsen, Poul; Nordbø, Oyvind; Omholt, Stig; Pashaei, Ali; Paterson, David; Rajagopal, Vijayaraghavan; Reeve, Adam; Röhrle, Oliver; Safaei, Soroush; Sebastián, Rafael; Steghöfer, Martin; Wu, Tim; Yu, Ting; Zhang, Heye; Hunter, Peter

    2011-10-01

    The VPH/Physiome Project is developing the model encoding standards CellML (cellml.org) and FieldML (fieldml.org) as well as web-accessible model repositories based on these standards (models.physiome.org). Freely available open source computational modelling software is also being developed to solve the partial differential equations described by the models and to visualise results. The OpenCMISS code (opencmiss.org), described here, has been developed by the authors over the last six years to replace the CMISS code that has supported a number of organ system Physiome projects. OpenCMISS is designed to encompass multiple sets of physical equations and to link subcellular and tissue-level biophysical processes into organ-level processes. In the Heart Physiome project, for example, the large deformation mechanics of the myocardial wall need to be coupled to both ventricular flow and embedded coronary flow, and the reaction-diffusion equations that govern the propagation of electrical waves through myocardial tissue need to be coupled with equations that describe the ion channel currents that flow through the cardiac cell membranes. In this paper we discuss the design principles and distributed memory architecture behind the OpenCMISS code. We also discuss the design of the interfaces that link the sets of physical equations across common boundaries (such as fluid-structure coupling), or between spatial fields over the same domain (such as coupled electromechanics), and the concepts behind CellML and FieldML that are embodied in the OpenCMISS data structures. We show how all of these provide a flexible infrastructure for combining models developed across the VPH/Physiome community. Copyright © 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  2. Detección y caracterización del virus de bronquitis infecciosa aviaria en Chile mediante RT-PCR y análisis secuencial Detection and characterization of infectious bronchitis virus in Chile by RT-PCR and sequence analysis

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    J C Lopez

    2006-01-01

    Full Text Available Una técnica de reacción en cadena de la polimerasa transcriptasa reversa (RT-PCR junto a una secuenciación fue usada para detectar y caracterizar genéticamente virus diferentes de bronquitis infecciosa aviar (VBIA aislados en Chile. El procedimiento de RT-PCR incluyó el uso de los partidores NT1 y NT2, los cuales se localizaron cerca del término N del gen S1 y cubrieron la región hipervariable. La secuencia amplificada fue alineada y analizada con el programa computacional DNAman, y comparada con secuencias reportadas en GenBank. El nivel de detección de la técnica de RT-PCR fue equivalente al aislamiento viral en huevos cuando se usaron directamente tejidos, pero el ensayo fue más sensitivo cuando fue usado para detectar virus almacenados en fluido alantoideo. Los amplificados de todos los aislados históricos de Chile fueron idénticos en tamaño (193pb y exhibieron entre ellos, al analizar la secuencia una similitud del 71 al 96%. Estos aislados mostraron entre 68 y 97% de similitud con cepas de Estados Unidos, Europa, Asia, Nueva Zelandia y Australia.A reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR assay, coupled with sequencing, was used to detect and genetically characterize different infectious bronchitis virus (IBV isolates in Chile. The RT-PCR procedure included the use of the primers NT1 and NT2 that were located close to the N-terminus of the S1 gene and bracketed the hypervariable region, and the amplified sequences were aligned and analyzed with DNAman software, and compared with sequences from GenBank. The level of detection of the RTPCR assay was equivalent to virus isolation in eggs when testing tissues directly, but the assay was more sensitive when used to detect virus stored in allantoic fluid. The amplimers from all historical Chilean isolates were identical in size (193 bp and exhibited 71-96% similarity on sequence analysis. These isolates showed between 68-97% similarity to strains from North America

  3. Aceptabilidad y conocimientos sobre la vacunación contra el virus del papiloma humano (VPH en médicos ginecólogos de la Argentina

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Alejandro Mazzadi

    2012-10-01

    Full Text Available OBJETIVO: Evaluar entre los ginecólogos argentinos la aceptabilidad y prescripción de la vacuna contra el virus del papiloma humano (VPH, los conocimientos sobre sus características y uso, y las nociones médico-biológicas sobre infección por VPH y cáncer cervicouterino. MATERIAL Y MÉTODOS: Entre noviembre de 2009 y marzo de 2010 se encuestaron a 686 ginecólogos vía internet. RESULTADOS: Más de 80% de los encuestados prescribe la vacuna, conoce sus características y administración, y considera la necesidad de continuar con el tamizaje cervical en mujeres vacunadas. El 37% posee un conocimiento global de la relación entre vacuna y detección/tratamiento de la patología cervical. De los encuestados, 25% subestima la magnitud de la infección, ≈30% no reconoce el rol etiológico del VPH en la enfermedad, y ≈40% posee un conocimiento global del manejo de la infección. CONCLUSIONES: La aceptabilidad de la vacuna contra el VPH es alta. Debe reforzarse la capacitación de los profesionales sobre vacunación y patología cervical, así como las nociones médico-biológicas sobre infección por VPH y cáncer cervicouterino.OBJECTIVE: To evaluate HPV vaccine acceptability and prescription; knowledge about HPV vaccine; and knowledge about HPV infection and cervical cancer among Argentinean gynecologists. MATERIALS AND METHODS: Between November 2009 and March 2010 we carried out an internet survey of 686 gynecologists. RESULTS: More than 80% of gynecologists prescribed HPV vaccine, knew characteristics of HPV vaccines, and knew that women will still need regular cervical cancer screening after HPV vaccination; 37% had global knowledge about relationship between vaccine, detection and treatment of cervical cancer; 25% underestimated the epidemiological extent of HPV infections, ≈30% was not aware of the causative relationship between HPV infection and cervical cancer and ≈40% had global knowledge about management of HPV infection

  4. Prevalencia de infección por virus de papiloma humano (VPH de alto riesgo y factores asociados en embarazadas derechohabientes del IMSS en el estado de Morelos The prevalence of high-risk HPV infection in pregnant women from Morelos, México

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Carlos Hernández-Girón

    2005-12-01

    Full Text Available OBJETIVO: Algunos estudios sugieren la posibilidad de que el proceso fisiológico del embarazo modifique algunas características del hospedero, lo que incrementa el riesgo de infección por VPH; sin embargo, esta asociación no está bien establecida. Pocos estudios se han realizado para determinar la prevalencia de infección por VPH de alto riesgo en mujeres embarazadas, y sus factores relacionados. El presente estudio busca determinar la prevalencia de infección por VPH de alto riesgo, en una muestra de mujeres embarazadas mexicanas, y sus posibles factores de riesgo. MATERIAL Y MÉTODOS: Se realizó un estudio epidemiológico de tipo transversal en una muestra de 274 mujeres embarazadas que acudieron a los servicios de primer nivel de atención del Hospital General del Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS en Cuernavaca, Morelos, durante el año 2000. Se obtuvieron muestras de exudado vaginal mediante autotoma, y se aplicó un cuestionario estructurado sobre características sociodemográficas, ginecoobstétricas y de comportamiento sexual. La detección de infección por VPH de alto riesgo, se realizó empleando un método de captura de híbridos (Hybrid Capture II, HCII, Digene Corp.. RESULTADOS: La prevalencia de infección por VPH fue de 37.2% (102/274. En promedio acudieron a su primera cita prenatal al sexto mes de embarazo; la media de edad fue 25.7 años. Los principales factores de riesgo asociados a infección por VPH fueron: edad, entre 20 y 29 años (RM = 2.82; IC95% 1.02-7.76, 30 o más años (RM ajustada = 6.85; IC95% 1.22-38.2; compañeros sexuales con otras parejas (RM= 2.05; IC95% 1.2-3.7. Mostraron asociación positiva, aunque marginalmente significativas: escolaridad menor de 6 años (RM = 1.67; IC95% 0.67-4.3; más de dos parejas sexuales en su vida (RM = 1.54; IC95% 0.7-3.4; y tabaquismo actual (RM= 1.6; IC95% 0.6-5.0. CONCLUSIONES: Los hallazgos indican una mayor prevalencia de infección por VPH de alto riesgo

  5. Risk factors for cervical cancer among HPV positive women in Mexico Factores de riesgo de cáncer cervical en mujeres VPH positivas en México

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Yvonne N Flores

    2008-02-01

    Full Text Available OBJECTIVE: To identify factors that are associated with an increased risk of developing high-grade cervical intraepithelial neoplasia (CIN or cancer among human papillomavirus (HPV-positive women in Mexico. MATERIAL AND METHODS: A case-control study design was used. A total of 94 cases and 501 controls who met the study inclusion criteria were selected from the 7 732 women who participated in the Morelos HPV Study from May 1999 to June 2000. Risk factor information was obtained from interviews and from HPV viral load results. Odds ratios and 95 percent confidence intervals were estimated using unconditional multivariate regression. RESULTS: Increasing age, high viral load, a young age at first sexual intercourse, and a low socio-economic status are associated with an increased risk of disease among HPV-positive women. CONCLUSIONS: These results could have important implications for future screening activities in Mexico and other low resource countries.OBJETIVO: Identificar factores asociados con un mayor riesgo de desarrollar neoplasia intraepitelial cervical (NIC de alto grado o cáncer en mujeres con virus de papiloma humano (VPH, en México. MATERIAL Y MÉTODOS: Se utilizó un diseño de casos y controles. Un total de 94 casos y 501 controles fueron seleccionados de las 7 732 mujeres que participaron en el Estudio de VPH en Morelos, de mayo de 1999 a junio de 2000. La información sobre factores de riesgo se obtuvo de entrevistas y de los resultados de carga virales de VPH. Se estimaron razones de momios e intervalos de confianza de 95% con modelos multivariados de regresión no condicionada. RESULTADOS: El incremento de edad, la carga viral elevada, la edad temprana al inicio de la vida sexual y el nivel socioeconómico bajo se asocian con un mayor riesgo de enfermedad en mujeres VPH positivas. CONCLUSIONES: Estos resultados podrían tener implicaciones importantes a futuro para las actividades de tamizaje en México y en otros países de

  6. Improving cervical cancer screening in Mexico: results from the Morelos HPV Study Mejorando la detección oportuna del cáncer cervical en México: resultados del Estudio de VPH en Morelos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Yvonne Flores

    2003-01-01

    Full Text Available OBJECTIVE: The purpose of this paper is to describe some of the results of the Morelos HPV Study. The main objective of the Morelos HPV Study is to evaluate the use of human papillomavirus (HPV DNA testing, as compared to the Papanicolaou (Pap test, for cervical cancer (CC screening. MATERIAL AND METHODS: The Morelos HPV Study is currently being conducted in Mexico, to examine the possibility of using HPV testing for CC screening. The HPV testing of self-collected vaginal and clinician-collected cervical specimens was evaluated as part of this study. The acceptability of the HPV testing of self-collected specimens was compared to that of the Pap test. A cost-effectiveness analysis (CEA and cost-benefit analysis (CBA was also performed. RESULTS: The Morelos HPV Study results indicate that HPV testing has a greater sensitivity to detect cervical intraepithelial neoplasia (CIN 2/3 and CC than the Pap test. Our results also indicate an over-all lower acceptability of the Pap test as compared to the self-collected procedure. The results of the CEA and CBA indicate that screening women between the ages of 20-80 for CC using some type of HPV testing is always more cost-effective than screening for CC using the Pap test. CONCLUSIONS: Our results suggest that self- and clinician-collected HPV testing could be used in CC prevention programs, as an effective complement or substitute for the Pap test.OBJETIVO: Describir algunos de los resultados del Estudio de VPH en Morelos. El objetivo principal del Estudio de VPH en Morelos es evaluar el uso de la prueba del virus de papiloma humano (VPH, en relación con la prueba de Papanicolaou, para el tamizaje de cáncer cervical. MATERIAL Y MÉTODOS: El Estudio de VPH en Morelos actualmente se está llevando a cabo en México, para examinar la posibilidad de usar la prueba de VPH para la detección de cáncer cervical. Se evaluó el uso de la prueba de VPH en muestras auto-tomadas vaginales y en muestras cervicales

  7. [Combination of etoposide, cisplatin and ifosfamide (VPH) in the salvage chemotherapy of relapsing or refractory aggressive malignant lymphoma. Study of 51 patients].

    Science.gov (United States)

    Eghbali, H; Catry-Thomas, I; Soubeyran, P; Bonnel, C; Hoerni, B

    1994-09-01

    Fifty-one patients with non-Hodgkin's lymphoma refractory or relapsing after CHOP-like regimen, underwent a salvage chemotherapy by VPH: etoposide 100 mg/m2/d, D1 to D3, cisplatin 20 mg/m2/d, D1 to D5, ifosfamide 1 g/m2/d D1 to D5, mesna 1.2 g/m2/d D1 to D5, every 4 weeks. Among 46 evaluable patients for efficacy, 21 (45.6%) achieved complete or partial response according to WHO criteria and 25 (54.3%) failed, while five cases (9.8% of all patients) were not evaluable (two initial complete remission before VPH, two early toxic deaths and one confusional syndrome). Thirty-five patients (68.6%) died of lymphoma, three (5.8%) of acute toxicity and 13 (25.5%) are alive: five in complete remission. The toxicity is mainly myelo-suppression, digestive and renal but could be managed as usually. Although the follow-up is short, this regimen appears effective in these circumstances after CHOP failure but it should be used early, before overt chemoresistance. It does not hinder a bone marrow transplantation programme.

  8. HPV vaccine introduction at the local level in a developing country: attitudes and criteria among key actors Introducción de la vacuna contra el VPH en niveles locales de un país en vías de desarrollo: actitudes y criterios de actores clave

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Marion Piñeros

    2010-05-01

    Full Text Available In most developing countries, HPV vaccines have been licensed but there are no national policy recommendations, nor is it clear how decisions on the introduction of this new vaccine are made. Decentralization processes in many Latin American countries favor decision-making at the local level. Through a qualitative study we explored knowledge regarding the HPV vaccine and the criteria that influence decision-making among local health actors in four regions of Colombia. We conducted a total of 14 in-depths interviews with different actors; for the analysis we performed content analysis. Results indicate that decision-making on the HPV vaccine at the local level has mainly been driven by pressure from local political actors, in a setting where there is low technical knowledge of the vaccine. This increases the risk of initiatives that may foster inequity. Local decisions and initiatives need to be strengthened technically and supported by national-level decisions, guidelines and follow-up.En gran parte de los países en vías de desarrollo, las vacunas contra el VPH tienen aprobación para su comercialización. Sin embargo, no hay recomendaciones y tampoco hay claridad sobre la forma en la que se toman las decisiones para su introducción. La reforma del sistema de salud en muchos países latinoamericanos permite la toma de decisiones en el nivel local. Mediante un estudio cualitativo con actores claves del sector salud en cuatro regiones de Colombia, exploramos el conocimiento sobre la vacuna del VPH y los criterios que influyen en la toma de decisiones. Se realizaron 14 entrevistas en profundidad y análisis de contenido. Los resultados indican que en el nivel local la toma de decisiones sobre la introducción de la vacuna está determinada en gran parte por la presión ejercida por figuras políticas locales. Esto, sumado a un bajo nivel de conocimiento técnico, incrementa la posibilidad de iniciativas con implicaciones éticas considerables

  9. Ser mulher portadora do HPV: uma abordagem cultural Ser mujer portadora de VPH: enfoque cultural Being a woman with HPV: a cultural approach

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Leilane Barbosa de Sousa

    2008-12-01

    Full Text Available Este trabalho foi realizado com o objetivo de investigar o nível de conhecimento das mulheres sobre o HPV, para, a partir daí, identificar crenças, mitos e tabus sobre a doença e analisar a influência destes elementos culturais no comportamento da mulher. Realizamos um estudo baseado nos pressupostos da teoria do cuidado transcultural. A pesquisa foi desenvolvida a partir do depoimento de quinze mulheres que realizavam tratamento para HPV. Através da investigação, foi possível perceber que, apesar das inúmeras fontes de informação sobre DST, o HPV ainda é uma doença desconhecida e cercada de mistério. Este desconhecimento, interagindo com fatores culturais, favorece o desenvolvimento de conceitos equivocados, tais como crenças e mitos.Este trabajo fue realizado con el objetivo de investigar el nivel de conocimientos de las mujeres sobre el VPH, para así identificar creencias, mitos y tabúes sobre la enfermedad y analizar la influencia de estos elementos culturales en el comportamiento de la mujer. Realizamos un estudio basado en los supuestos de la teoría del cuidado transcultural. La investigación fue realizada en base a los testimonios de quince mujeres en tratamiento para VPH. A través de la investigación fue posible percibir que, a pesar de las innúmeras fuentes de información sobre ETS, el VPH es aún una enfermedad desconocida y rodeada de misterios. Esta falta de conocimiento asociados a los factores culturales, favorecen el desarrollo de conceptos equivocados, tales como creencias y mitos.This study was carried out in order to investigate the level of women's knowledge about HPV, to identify beliefs, myths and taboos about HPV, as well as to analyze the influence of these cultural elements on women's behavior. We performed a study based on the transcultural care theory. The research was developed from the testimonies of 15 women who were undergoing treatment for HPV. Through the investigation, it was possible to

  10. HPV Detection and genotyping in males from the city of Córdoba, Argentina Detección y genotipificación de VPH en varones de la ciudad de Córdoba, Argentina

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    F. Venezuela

    2010-09-01

    Full Text Available A wide range of human papillomavirus (HPV types can infect the anogenital region of males. Although there is a vast knowledge on HPV infections in women as well as on their association with cervical cancer, the study of HPV infections in males is scarce and controversial. The aim of the present work was to detect and typify HPV infections of the anogenital region in males and analyze the associated risk factors in the population studied. Anogenital samples from 37 patients (30 of whom were HIV carriers attending the Infectology Service at the Hospital Nacional de Clínicas in Córdoba, Argentina, were studied. Nine of these patients tested HPV-positive and five out of these nine were found to have mixed infections, being 18 and 61 the most frequent genotypes. There was a significant correlation between the HPV-positive patients and those having an HPV-compatible lesion or AIDS. The present work is the first study in the city of Cordoba which contributes relevant results to the knowledge of HPV infection and to the possible implementation of measures for its prevention.Un amplio espectro de tipos de virus papiloma humano (VPH puede infectar la zona anogenital de los varones. Si bien existe un vasto conocimiento de la infección por VPH en las mujeres y su asociación con el cáncer de cérvix, el estudio de la infección por VPH en los varones ha sido escaso y sus resultados controvertidos. El presente trabajo tuvo como objetivo detectar y tipificar infecciones por VPH en la región anogenital de varones y analizar los factores de riesgo asociados en la población estudiada. Se estudiaron muestras anogenitales de 37 pacientes (30 portadores del VIH que asistieron al Servicio de Infectología del Hospital Nacional de Clínicas de la ciudad de Córdoba. Nueve resultaron positivas para VPH, de las que 5 correspondían a infecciones mixtas. Los genotipos de mayor frecuencia fueron el 18 y el 61. Hubo una correlación significativa entre los

  11. Formative research to shape HPV vaccine introduction strategies in Peru Investigación formativa relacionada con el diseño de estrategias para introducir la vacuna contra el VPH en Perú

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Rosario M Bartolini

    2010-06-01

    Full Text Available OBJECTIVE: To understand the sociocultural environment, health systems' capacities, and policy processes related to cervical cancer and HPV vaccines in order to inform HPV vaccine introduction. MATERIAL AND METHODS: Mixed-method formative research using qualitative and quantitative data collection techniques. Participants included girls, parents, community leaders, health and education officials, and policymakers. RESULTS: Respondents, including policymakers, generally supported HPV vaccine introduction, due partly to appreciation for the benefits of vaccination and the desire to prevent cancer. Community-level concerns regarding safety and quality of services will need to be addressed. The immunization system in Peru is strong and has capacity for including the HPV vaccine. CONCLUSION: Formative research provides key insights to help shape an effective program for HPV vaccine introduction.OBJETIVO: Comprender el contexto sociocultural, las capacidades del sistema de salud y las condiciones políticas vinculadas al cáncer cervical y a la vacuna contra el VPH para diseñar una estrategia apropiada de introducción de la vacuna contra el VPH. MATERIAL Y MÉTODOS: Investigación formativa usando técnicas cualitativas y cuantitativas. Los participantes incluyeron niños, padres, líderes, funcionarios del sector salud y educación, y diseñadores de políticas. RESULTADOS: Generalmente se apoya la introducción de la vacuna contra el VPH, dado que se aprecian los beneficios de la vacunación y se desea prevenir el cáncer. En la comunidad se encontraron preocupaciones sobre seguridad, confianza y calidad de atención. El sistema de inmunizaciones en el Perú es eficiente y tiene la capacidad para incluir la vacuna contra el VPH. CONCLUSIONES: La investigación formativa permite comprender elementos clave que ayudan a diseñar un programa efectivo para la introducción de la vacuna contra el VPH.

  12. Prevalencia de infección por virus de papiloma humano (VPH) de alto riesgo y factores asociados en embarazadas derechohabientes del IMSS en el estado de Morelos The prevalence of high-risk HPV infection in pregnant women from Morelos, México

    OpenAIRE

    Carlos Hernández-Girón; Jennifer S Smith; Attila Lorincz; Emilio Arreola Cháidez; Eduardo Lazcano; Mauricio Hernández-Ávila; Jorge Salmerón

    2005-01-01

    OBJETIVO: Algunos estudios sugieren la posibilidad de que el proceso fisiológico del embarazo modifique algunas características del hospedero, lo que incrementa el riesgo de infección por VPH; sin embargo, esta asociación no está bien establecida. Pocos estudios se han realizado para determinar la prevalencia de infección por VPH de alto riesgo en mujeres embarazadas, y sus factores relacionados. El presente estudio busca determinar la prevalencia de infección por VPH de alto riesgo, en una m...

  13. PCR thermocycler

    Science.gov (United States)

    Benett, William J.; Richards, James B.

    2003-01-01

    A sleeve-type silicon polymerase chain reaction (PCR) chamber or thermocycler having improved thermal performance. The silicon sleeve reaction chamber is improved in thermal performance by etched features therein that reduce thermal mass and increase the surface area of the sleeve for cooling. This improved thermal performance of the thermocycler enables an increase in speed and efficiency of the reaction chamber. The improvement is accomplished by providing grooves in the faces of the sleeve and a series of grooves on the interior surfaces that connect with grooves on the faces of the sleeve. The grooves can be anisotropically etched in the silicon sleeve simultaneously with formation of the chamber.

  14. La perspectiva de los agentes sanitarios sobre la incorporación programática de la autotoma del test de VPH

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Mariana Curotto

    Full Text Available Resumen: El objetivo de este estudio fue analizar la percepción que poseen los agentes sanitarios sobre el ofrecimiento de la autotoma del test de VPH a las mujeres y el grado de acuerdo de los agentes para incorporarla a sus tareas diarias. Para ello, se aplicó una encuesta auto-administrada a 127/191 agentes sanitarios que participaron del Proyecto EMA (Proyecto Evaluación Modalidad Autotoma, llevado a cabo en la provincia de Jujuy (Argentina entre 2012-2013. Los agentes sanitarios que tuvieron y no la experiencia de ofrecer la autotoma manifestaron un alto grado de acuerdo para la adopción de la estrategia (78,7%, dado su potencial para prevenir el cáncer cervicouterino y los aportes que brinda al cuidado de la salud de las mujeres bajo su cobertura. Sin embargo, señalaron la sobrecarga de trabajo y los problemas de articulación con el sistema formal de salud, como los principales obstáculos para ofrecer esta modalidad en el futuro. Este estudio encontró que la autotoma es una práctica que puede ser adoptada por los agentes sanitarios de la provincia de Jujuy, pero debe ir acompañada de acciones de apoyo por parte del sistema de salud formal.

  15. Redes sociales de apoyo y género: vivencia de mujeres con VPH, displasias y cáncer cervicouterino

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    María del Carmen Castro Vásquez

    2014-01-01

    Full Text Available El objetivo del artículo es analizar el funcionamiento y el tipo de redes sociales de apoyo de mujeres diagnosticadas con infección por el virus del papiloma humano ( VPH , displasias y cáncer cervical in situ (Cacu, diferenciando la vivencia por tipo de diagnóstico. Se trata de un estudio cualitativo: se realizaron 34 entrevistas semiestructuradas a mujeres en dos clínicas de displasias en Hermosillo, Sonora. Encontramos que cada diagnóstico tiene connotaciones distintas en la percepción individual y en el imaginario social del grupo de pertenencia, que lleva a las mujeres a una vivencia cargada de incertidumbre y angustia; es en base a estas connotaciones resultantes de las desigualdades de género que las parti- cipantes diseñan sus gestiones de apoyo para resolver la atención médica y organizar su vida familiar y doméstica.

  16. La baja utilidad de la determinación del ADN del VPH en la región distal de la uretra masculina Low usefulness of HPV DNA determination in the distal region of the male urethra

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ahideé G Leyva-López

    2003-01-01

    Full Text Available OBJETIVO: Determinar la prevalencia uretral del ácido desoxirribonucleico del virus de papiloma humano, condilomatosis clínica y subclínica, en hombres cuyas parejas sexuales tuvieron el antecedente de neoplasia intraepitelial cervical. MATERIAL Y MÉTODOS: De octubre de 1997 a agosto de 1998 se hizo un estudio transversal; se incluyeron 200 hombres de entre 17 a 64 años de edad, referidos a la Coordinación de Oncología del Instituto Nacional de Perinatología, de la Ciudad de México, porque sus parejas regulares sexuales tuvieron el antecedente de neoplasia intraepitelial cervical. Se llevó a cabo un examen físico del pene (penoscopía con la aplicación de ácido acético a 3-5%, y con el uso de un colposcopio se localizaron y evaluaron zonas acetoblancas y cambios vasculares, interpretados como anormales, asociados con la infección por el virus del papiloma humano. La determinación del ADN de VPH se verificó por PCR e hibridación en línea reversa. El análisis estadístico exploratorio y univariante se realizó con el paquete Stata V6.0. RESULTADOS: En las 200 muestras recolectadas de células exfoliadas de la uretra el gen de beta-globina estuvo presente en 93.5% (187/200, y el ácido desoxirribonucleico del virus del papiloma humano fue detectable solamente en 2% (4/187 de los sujetos. Por medio de la penoscopía se observó la presencia de zonas acetoblancas en 43% (81/187 de los sujetos. CONCLUSIONES: En este estudio se observa que la presencia del ácido desoxirribonucleico del virus del papiloma humano en la uretra masculina es poco común, como lo reportan estudios internacionales. Es necesario realizar investigaciones que evalúen esta presencia en glande y surco balano prepucial, en comparación con la región distal de la uretra.OBJECTIVE: To assess the prevalence of Human Papillomavirus (HPV Deoxyribonucleic acid (DNA, and of clinical and subclinical condilomatosis in men whose sex partners had been diagnosed with

  17. Tratamiento del hombro doloroso mediante terapia manual

    OpenAIRE

    Gabucio López, Pedro

    2008-01-01

    Introducción: Las disfunciones de hombro son un problema de salud común en las sociedades occidentales. Algunos protocolos de tratamiento han sido desarrollados mediante ensayos clínicos con pacientes que presentan dolor de hombro. Sin embargo, no hay evidencias que sustenten que un protocolo es mejor que otros. El principal objetivo de este trabajo es presentar un caso clínico en el que mediante terapia manual y la prescripción de ejercicios físicos se consigue la resolución del ...

  18. Tratamiento del hombro doloroso mediante terapia manual

    OpenAIRE

    Gabucio López, Pedro

    2008-01-01

    Introducción: Las disfunciones de hombro son un problema de salud común en las sociedades occidentales. Algunos protocolos de tratamiento han sido desarrollados mediante ensayos clínicos con pacientes que presentan dolor de hombro. Sin embargo, no hay evidencias que sustenten que un protocolo es mejor que otros. El principal objetivo de este trabajo es presentar un caso clínico en el que mediante terapia manual y la prescripción de ejercicios físicos se consigue la resolución del ...

  19. Reverse-transcription PCR (RT-PCR).

    Science.gov (United States)

    Bachman, Julia

    2013-01-01

    RT-PCR is commonly used to test for genetic diseases and to characterize gene expression in various tissue types, cell types, and over developmental time courses. This serves as a form of expression profiling, but typically as a candidate approach. RT-PCR is also commonly used to clone cDNAs for further use with other molecular biology techniques (e.g., see Oligo(dT)-primed RT-PCR isolation of polyadenylated RNA degradation intermediates and Circularized RT-PCR (cRT-PCR): analysis of RNA 5' ends, 3' ends, and poly(A) tails).

  20. Sex Determination Using PCR

    Science.gov (United States)

    Kima, Peter E.; Rasche, Madeline E.

    2004-01-01

    PCR has revolutionized many aspects of biochemistry and molecular biology research. In the following exercise, students learn PCR by isolating their own DNA, amplifying specific segments of the X and Y chromosomes, and estimating the sizes of the PCR products using agarose gel electrophoresis. Based on the pattern of PCR products, students can…

  1. Esterificacion quimioselectiva de fitosteroles de madera mediante lipasas

    National Research Council Canada - National Science Library

    Illanes, Andres; Alvarez, Lorena; Alvaro, Gregorio

    2008-01-01

    .... Ambas sustancias son muy similares, lo que impide su separacion por metodos fisicos, siendo la esterificacion selectiva de esta mezcla con esteres de acidos grasos mediante lipasas quimioselectivas...

  2. Acceso a la información de mujeres con VPH, displasia y cáncer cervical in situ Access to information by women with HPV, cervical dysplasia and cancer in situ

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ma del Carmen Castro-Vásquez

    2010-06-01

    Full Text Available OBJETIVO: Presentar un análisis relacional de cómo mujeres diagnosticadas con el virus del papiloma humano (VPH, displasia del cuello del útero o neoplasias del cuello uterino, reciben y/o acceden a la información y cómo la viven en sus relaciones cercanas. MATERIAL Y MÉTODOS: En 2008 se realizaron 34 entrevistas cualitativas a mujeres en dos clínicas de colposcopía de la Secretaría de Salud, en Hermosillo, Sonora. El análisis se basó en la teoría fundamentada. RESULTADOS: Existe una franca analogía entre cáncer cervicouterino (CaCu y muerte, una amplia desinformación sobre VPH y displasias y una práctica persistente entre los médicos de no ofrecer información oportuna y clara a las pacientes. Existe una apreciación estigmatizante hacia la infección por VPH que afecta las relaciones cercanas de las mujeres. CONCLUSIÓN: A pesar de la necesidad de las pacientes de obtener información, no la exigen al médico, lo que contribuye a su desconfianza y angustia.OBJECTIVE: To present a relational analysis of how women who are diagnosed with the human papilloma virus (HPV, cervical dysplasia or cervical neoplasia receive or seek information, and how they experience this process within their immediate relationships. MATERIALS AND METHODS: In 2008, 34 qualitative interviews were carried out with women at two Secretary of Health colposcopy clinics in Hermosillo, Sonora. Analysis was based on grounded theory. RESULTS: There is a patent analogy between cervical cancer and death, much disinformation about HPV and dysplasias, and a persistent lack of timely and clear information given to patients by doctors. There is a stigma attached to HPV infection which affects women's immediate relationships. CONCLUSION: Despite patients' need to obtain information, they do not demand it from their doctor, which contributes to their anguish and distrust.

  3. CODEHOP PCR and CODEHOP PCR primer design.

    Science.gov (United States)

    Staheli, Jeannette P; Boyce, Richard; Kovarik, Dina; Rose, Timothy M

    2011-01-01

    While PCR primer design for the amplification of known sequences is usually quite straightforward, the design, and successful application of primers aimed at the detection of as yet unknown genes is often not. The search for genes that are presumed to be distantly related to a known gene sequence, such as homologous genes in different species, paralogs in the same genome, or novel pathogens in diverse hosts, often turns into the proverbial search for the needle in the haystack. PCR-based methods commonly used to address this issue involve the use of either consensus primers or degenerate primers, both of which have significant shortcomings regarding sensitivity and specificity. We have developed a novel primer design approach that diminishes these shortcomings and instead takes advantage of the strengths of both consensus and degenerate primer designs, by combining the two concepts into a Consensus-Degenerate Hybrid Oligonucleotide Primer (CODEHOP) approach. CODEHOP PCR primers contain a relatively short degenerate 3' core and a 5' nondegenerate clamp. The 3' degenerate core consists of a pool of primers containing all possible codons for a 3-4 aminoacid motif that is highly conserved in multiply aligned sequences from known members of a protein family. Each primer in the pool also contains a single 5' nondegenerate nucleotide sequence derived from a codon consensus across the aligned aminoacid sequences flanking the conserved motif. During the initial PCR amplification cycles, the degenerate core is responsible for specific binding to sequences encoding the conserved aminoacid motif. The longer consensus clamp region serves to stabilize the primer and allows the participation of all primers in the pool in the efficient amplification of products during later PCR cycles. We have developed an interactive web site and algorithm (iCODEHOP) for designing CODEHOP PCR primers from multiply aligned protein sequences, which is freely available online. Here, we describe the

  4. Por qué la vacuna contra el VPH es importante para mi familia: historia de una sobreviviente de cáncer de cuello uterino (Why HPV Vaccine is Important to My Family: The Story of a Cervical Cancer Survivor)

    Centers for Disease Control (CDC) Podcasts

    2013-05-06

    A una mamá joven se le vino el mundo encima cuando le diagnosticaron cáncer de cuello uterino. Entérese de lo que está haciendo para proteger a sus hijos de los cánceres asociados al VPH.  Created: 5/6/2013 by National Center for Immunization and Respiratory Diseases (NCIRD).   Date Released: 10/30/2013.

  5. Cervical cancer and the HPV link: identifying areas for education in Mexico City's public hospitals El cáncer cervicouterino y su relación con el VPH: identificación de temas de actualización en hospitales públicos de la Ciudad de México

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Tess Aldrich

    2006-06-01

    Full Text Available OBJECTIVE:To assess Mexico City physicians' knowledge and practices regarding cervical cancer and human papillomavirus (HPV to compare obstetricians/gynecologists (ob/gyns and general practitioners (GPs on these variables MATERIAL AND METHODS: In April 2003, 187 ob/gyns and GPs working in 15 hospitals affiliated with the Federal District Secretary of Health (SSDF completed a self-administered questionnaire. Pearson's chi-square tests were used to compare ob/ gyns and GPs on outcome variables RESULTS: Nearly all providers (93% identified HPV as the principal cause of cervical cancer. Ob/gyns had more detailed knowledge about HPV than GPs and were more likely to have heard of common oncogenic strains (p=.000. Sixteen percent of all physicians incorrectly stated that Pap tests should be performed every six months regardless of previous results, and 17% recommended hysterectomy as an option for treating mild or moderate dysplasia CONCLUSIONS: While SSDF physicians had basic knowledge about the cervical cancer-HPV link, screening and management norms are priority areas for educational interventions.OBJETIVO: Evaluar el conocimiento y las prácticas de los proveedores de servicios de salud en la Ciudad de México sobre el cáncer cervicouterino y el virus del papiloma humano (VPH; comparar a este respecto a ginecoobstetras (GO y médicos generales (MG MATERIAL Y MÉTODOS: En abril del 2003, 187 GO y MG empleados en 15 hospitales afiliados a la Secretaría de Salud del Distrito Federal (SSDF completaron un cuestionario autoaplicado. Se utilizó la prueba de ji cuadrada de Pearson para evaluar las diferencias entre GO y MG RESULTADOS: Casi todos los participantes (93% identificaron el VPH como la causa principal del cáncer cervicouterino. Los GO mostraron un conocimiento más detallado del VPH que los MG, con más probabilidad de haber escuchado de las cepas oncogénicas comunes del VPH (p= 0.000. Un 16% de los médicos contestó incorrectamente que

  6. Desarrollo comunicación Alfa Arduino mediante Scada

    OpenAIRE

    Trallero Calvo, Jorge

    2015-01-01

    El siguiente proyecto pretende crear un sistema IoT (Internet of Things) girando en torno a Arduino, demostrando de este modo la facilidad de creación de proyectos y fiabilidad que nos aporta Arduino. Mediante una comunicación TCP/IP se procede a crear un sistema el cual es capaz de registrar valores a una cierta distancia mediante protocolos de procesos y comunicación (Telemedida) y de este modo monitorizar la temperatura en un punto determinado, sin estar limitado por la t...

  7. Desarrollo de un sistema de videoconferencia mediante WebRTC

    OpenAIRE

    Ibarrola Lerga, Josu

    2016-01-01

    El objetivo de este proyecto fin de carrera consiste en el desarrollo de un sistema de videoconferencia mediante WebRTC. Para realizar dicho desarrollo crearemos una página mediante el lenguaje de programación HTML5 y la tecnología que nos brinda WebRTC, todo ello dentro del marco de trabajo de Bootstrap, consiguiendo así una página web apta para cualquier dispositivo de visualización que se utilice. Debido a que se trata de una tecnología nueva que el autor desconoce, para pod...

  8. Apta-PCR.

    Science.gov (United States)

    Pinto, Alessandro; Polo, Pedro Nadal; Rubio, Miriam Jauest; Svobodova, Marketa; Lerga, Teresa Mairal; O'Sullivan, Ciara K

    2016-01-01

    Real-time Apta-PCR is a methodology that can be used for a wide variety of applications ranging from food quality control to clinical diagnostics. This method takes advantage of the combination of the sensitivity of nucleic acid amplification with the selectivity of aptamers. Ultra-low detection of target analyte can potentially be achieved, or, improved detection limits can be achieved with aptamers of low-medium affinity. Herein, we describe a generic methodology coined real-time Apta-PCR, using a model target (β-conglutin) and a competitive format, which can be adapted for the detection of any target which an aptamer has been selected for.

  9. Explanatory chapter: PCR primer design.

    Science.gov (United States)

    Álvarez-Fernández, Rubén

    2013-01-01

    This chapter is intended as a guide on polymerase chain reaction (PCR) primer design (for information on PCR, see General PCR and Explanatory Chapter: Troubleshooting PCR). In the next section, general guidelines will be provided, followed by a discussion on primer design for specific applications. A list of recommended software tools is shown at the end. Copyright © 2013 Elsevier Inc. All rights reserved.

  10. Design and methods of the evaluation of an HPV-based cervical cancer screening strategy in Mexico: the Morelos HPV study Diseño y métodos de la evaluación del uso de la prueba de virus de papiloma humano para tamizaje de cáncer cervical en México: el estudio de VPH en Morelos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Yvonne Flores

    2002-07-01

    enrollment activities of the Morelos HPV study are the basis for a prevalent case-control study and a prospective cohort study that will investigate the natural history of HPV infections and determine if an HPV-based screening strategy is a safe and cost-effective alternative to Pap screening.Objetivo. Describir los métodos y el diseño del Estudio de VPH en Morelos. El objetivo principal de este estudio es examinar el uso de dos diferentes técnicas para obtener muestras de ADN de VPH, autotoma vaginal y toma clínica cervical, para detectar lesiones cervicales preinvasoras y cáncer. Material y métodos. Este estudio se realizó en el marco del Programa de Detección Oportuna de Cáncer Cervical (DOC del Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS en Morelos. Un total de 7 868 mujeres aceptaron participar en el estudio durante los meses de mayo a octubre de 1999. Esta muestra es representativa de la población de mujeres que acudieron a los programas de DOC en las 23 clínicas del IMSS en Morelos durante ese año. Se les proporcionó una explicación detallada del estudio a las participantes antes de que firmaran una carta de consentimiento informado. Se obtuvo información básica de todas las participantes y se usó el formato oficial de registro de datos del programa institucional de DOC del IMSS. Además se seleccionó una submuestra aleatoria de 1 069 participantes que fueron entrevistadas durante su visita inicial para obtener información adicional sobre los factores de riesgo de cáncer cervical, aceptabilidad de las pruebas de Papanicolaou (Pap y VPH-autotoma, y los costos de las pacientes. Todas las participantes se tomaron una muestra de exudado vaginal para la prueba de VPH-autotoma. Posteriormente, se les realizó una exploración pélvica para obtener muestras cervicales para las pruebas de VPH-clínica y Pap. Se evaluó la información de 7 732 mujeres con resultados completos de las tres pruebas. A las 1 147 mujeres que recibieron un diagnóstico positivo

  11. PCR in forensic genetics

    DEFF Research Database (Denmark)

    Morling, Niels

    2009-01-01

    Since the introduction in the mid-1980s of analyses of minisatellites for DNA analyses, a revolution has taken place in forensic genetics. The subsequent invention of the PCR made it possible to develop forensic genetics tools that allow both very informative routine investigations and still more...... and more advanced, special investigations in cases concerning crime, paternity, relationship, disaster victim identification etc. The present review gives an update on the use of DNA investigations in forensic genetics....

  12. Evaluation of PCR and multiplex PCR in relation to nested PCR for diagnosing Theileria equi

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Danielle C. Leal

    2011-07-01

    Full Text Available Conventional PCR (PCRTeq for diagnosing Theileria equi and multiplex PCR (M/PCRTeq-Bc for diagnosing T. equi and Babesia caballi were comparatively evaluated with nested PCR (N/PCR-Teq for diagnosing equine piroplasmosis. In DNA sensitivity determinations, in multiple dilutions of equine blood that had tested positive for T. equi, PCR-Teq and N/PCR-Teq detected hemoparasite DNA in the larger dilutions (1:128, but did not differ significantly from the M/PCRTeq-Bc (1:64. In analyses on equine serum tested by ELISA, there was high agreement between this serological test and PCR-Teq (k = 0.780 and moderate agreement with N/PCR-Teq (k = 0.562 and M/PCRTeq-Bc (k = 0.488. PCR-Teq found a higher frequency of T. equi both in extensively and intensively reared horses, but this was not significant in relation to N/PCR-Teq (P>0.05, and both PCRs indicated that there was an endemic situation regarding T. equi in the population of horses of this sample. PCR-Teq was only significantly different from M/PCR-Teq-Bc (P<0.05. PCR-Teq presented high sensitivity and specificity, comparable to N/PCR-Teq, but with the advantage of higher speed in obtaining results and lower costs and risks of laboratory contamination. This accredits PCR-Teq for epidemiological studies and for determinations on affected horses.

  13. Hallazgos en la Citología Vaginal y Colposcopia y su asociación con infección con VPH y otros factores de riesgo para Cáncer de Cérvix en mujeres atendidas en entidades de Manizales (Colombia), 200-2007

    OpenAIRE

    Arias Rentería, Ana Jasbleydys; Botero Baena, Sandra Milena; Castaño Castrillón, José Jaime; Chicué Prado, Jimena; Díaz Ramírez, Daniela; Giraldo González, Germán Camilo; López López, Ana Marcela; Sánchez Cubillos, Sara Melissa; Villegas Arenas, Oscar Alberto; Zamudio Ibarra, Mónica María

    2010-01-01

    Objetivo: Describir los hallazgos microscópicos e histopatológicos de la citología vaginal y de la colposcopia en mujeres asistentes a la clínica ASSBASALUD E.S.E y a la LIGA CONTRA EL CÁNCER, seccional Caldas en la ciudad de Manizales (Colombia), y la relación existente entre los factores de riesgo para el cáncer de cérvix e infección por VPH. Materiales y métodos: Estudio de corte transversal basado en analizar aproximadamente 1500 historias clínicas de mujeres sexualmente activas, revisada...

  14. Epidemiología de la infección y detección de tipos oncogenéticos del VPH por tecnología de captura de híbridos en mujeres sin aparentes factores de riesgo

    OpenAIRE

    Fuente Villarreal, David de la

    2011-01-01

    Introducción: El virus del papiloma humano (VPH) pertenece al grupo de virus con tropismo por los epitelios, infecta predominantemente la piel y las membranas mucosas produciendo proliferaciones epiteliales benignas o papilomas, que bajo ciertas circunstancias (las cuales si bien aún no han sido definidas a satisfacción, se estima que se relacionan con el estado inmunológico de la paciente, su carga genética, la presencia de ciertos receptores, así como la continua infección por diversos tipo...

  15. Cost-effectiveness of conventional cytology and HPV DNA testing for cervical cancer screening in Colombia Costo-efectividad de la citología y la tamización con pruebas de ADN-VPH para cáncer de cuello uterino en Colombia

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Oscar Andrés-Gamboa

    2008-08-01

    Full Text Available OBJECTIVE: To assess cost-effectiveness of conventional cytology and HPV DNA testing for cervical-cancer screening in Colombia. MATERIAL AND METHODS: The National Cancer Institute of Colombia (NCIC in 2007 developed a Markov model on the natural history of cervical cancer; no screening, conventional cytology, and HPV DNA testing were compared. Only direct costs were used. Outcomes comprise cervical cancer mortality, years of life saved, and lifetime costs. Discounted incremental cost-effectiveness ratios were estimated and sensitivity analyses were conducted for key parameters. RESULTS: Depending on the screening strategy a 69-81% mortality reduction might be expected. The HPV DNA testing every five years is a cost-effective strategy (Incremental Cost-Effectiveness Ratio (ICER: USD$44/YLS if the cost per test is under USD$31. The effectiveness was sensitive to coverage and primarily to follow-up. CONCLUSIONS: HPV DNA testing is a cost-effective alternative for screening in Colombia. Not only high coverage but high follow-up rates are critical for successful screening programs.OBJETIVO: evaluar el costo-efectividad de la citología convencional y la prueba de ADN-VPH para tamización de cáncer cervical en Colombia. MATERIAL Y MÉTODOS: el Instituto Nacional de Cancerología de Colombia construyó en 2007 un modelo de Markov de historia natural del cáncer cervical. Se comparó "no tamización", citología convencional y prueba de ADN-VPH. Se utilizaron costos directos. Los desenlaces fueron mortalidad, años de vida ganados y costos. Se calcularon razones de costo-efectividad incremental. Se realizaron análisis de sensibilidad para parámetros clave. RESULTADOS: la mortalidad se redujo 69-81% según la estrategia. La tamización con ADN-VPH cada cinco años es costo-efectiva (ICER (Razón de Costo-Efectividad incremental por sus siglas en inglés: 44 dólares por año de vida saludable si los costos por prueba son menores a 31 dólares. La

  16. PCR, exit stage left ...

    CERN Multimedia

    2004-01-01

    The Prevessin Control Room during LEP's start up in 1989. The Prévessin Control Room (PCR) was recently engulfed in a wave of nostalgia. The PCR, scene of some of the greatest moments in CERN's history, is being dismantled to prepare for a complete overhaul. In February 2006, a new combined control centre for all the accelerators will open its doors on the same site, together with a new building currently under construction (see Bulletin issue 27/2004 of 28 June 2004). This marks the end of an important chapter in CERN's history. The Prévessin Control Room saw its first momentous event 28 years ago when the 400 GeV beam for the SPS was commissioned in the presence of Project Leader John Adams. It was also here that the first proton-antiproton collisions were observed, in 1981. Eight years later, in 1989, operators and directors alike jumped for joy at the announcement of the first electron-positron collisions at the start up of LEP, the biggest accelerator in the world. Today the 80 terminals and PCs have b...

  17. Detección del virus de la leucosis bovina en ganado criollo colombiano mediante PCR-anidado

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Giovambattista Guillermo

    2011-12-01

    Full Text Available

    Se evaluó la presencia del virus de la leucosis bovina (VLB en 360 muestras de ADN de oc%o razas bovinas criollas: Blanco (reinegro  (B(N,  -asanare/o (-AS,  -oste/o con -uernos (---, -%ino Santandereano (-%S, -a4uete/o (-8T, Hartón del Valle (HV, Romosinuano (RS y San Martinero (SM, dos Razas SintBticas -olombianas: Lucerna (LD-  y VelEs4uez (VGL y dos razas HorEneas: Bra%- mEn (B y Holstein (HJ Para la detección del proKvirus se amplificó una región del gen env viral, me- diante P-R  anidadaJ La presencia del VLB Hue mayor en la raza HV seguido por -%S (M3J3O y 60O respectivamente, VGL y LD-  tuvieron el mismo porcentae (Q0O, en -AS,  --- y -8T la presencia del virus fue de 26.7%, 23.3% y 16.7% respectivamente; no se encontró el virus en BON, SM y RS. En las razas foráneas la presencia fue de 83.3% para H y 6.7% para B. Se encontró dependencia altamente significativa entre la presencia del VLB y la raza, el sexo y región de origen de la muestraJ Gl prome- dio de presencia en las razas criollas Hue menor 4ue en las HorEneas, menor en los mac%os 4ue en las síembras y en la región norte 4ue en el suroccidente y el centro del pais

  18. Detección molecular de las translocaciones más comunes en Leucemia aguda mediante RT-PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Guevara G.

    2001-06-01

    Full Text Available Evaluar la incidencia de las translocaciones t(4;11, t(1;19, t(9;22 y t(12;21 en leucemia linfoide aguda (LLA y t(15;17, t(8;21 e Inv.(16 en leucemia mieloide aguda (LMA. Correlacionar los resultados obtenidos con el diagnóstico morfológico y citogenético.

  19. Caracterizacion de aislados de Escherichia coli O157:H7 en canales de bovinos y porcinos mediante PCR

    National Research Council Canada - National Science Library

    Gallegos, Miguel; Morales, Alberto; Alvarez, Genoveva; Vasquez, Jesus; Morales, Lilia; Martinez, Irma; Maldonado, Jesus

    2009-01-01

    ... bovinos (Bos taurusindicus), porcinos (Sus scrofa domestica) y ovinos (Ovis aries) [18], siendo principalmente los rumiantes y sus heces fecales un reservorio natural de este patogeno [17, 20]. Se ha reportado que la transmision de E. coli O157:H7 a los humanos en forma directa o indirecta puede ser por contaminacion de los alimentos a parti...

  20. RECURSOS NO CONVENCIONALES SUSCEPTIBLES DE SER EXPLOTADOS MEDIANTE FRACKING

    OpenAIRE

    Jódar Abellán, Antonio

    2014-01-01

    En el presente trabajo se analizan en detalle los recursos de origen no convencional existentes en el contexto internacional, europeo, nacional y regional, que pueden ser explotados mediante fracking. Así mismo, se mencionará someramente la legislación aplicable a la fracturación hidráulica y los impactos, tanto beneficiosos como perjudiciales, que ésta puede acarrear. El estudio finaliza con una propuesta de posibles lugares en la Península Ibérica donde dicha técnica reporte mayores benefic...

  1. Análisis taxonómico y funcional del microbioma humano mediante aproximaciones clásicas, moleculares y metagenómicas

    OpenAIRE

    Cabrera Rubio, Raúl

    2014-01-01

    La presente tesis muestra distintas aproximaciones para el estudio del microbioma humano. Éstas han ido desde la secuenciación masiva de productos de PCR, la pirosecuenciación directa del ADN ambiental, la elaboración de librerías de fósmidos y por último el aislamiento de especies presentes en el microbioma mediante sembrado de la muestra. Todas estas técnicas tienen sus ventajas y desventajas, pero todas ellas son complementarias para el estudio de un determinado microbioma. Además la elabo...

  2. en sistemas modelo de gelatina mediante SPME-DED

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    J. Ruiz Carrascal

    2005-01-01

    Full Text Available Se llevó a cabo la determinación de 16 hidrocarburos aromáticos policíclicos y 9 nitrosaminas en sistemas modelo de gelatina (20% w/v mediante microextración en fase sólida acoplada a un dispositivo de extracción directa y posterior análisis mediante cromatografía-gaseosa-espectrometría de masas. La extracción se llevo a cabo a 25ºC. Se extrajeron la totalidad de las nitrosaminas y 9 de los 16 hidrocarburos aromáticos policíclicos. Se evaluaron la reproducibilidad, linealidad de respuesta y límite de detección de 3 tipos de fibras estacionarias para cada tipo de compuesto. Se seleccionaron las fibras de polidimetilsiloxano 100μm y carboxen/polidimetilsiloxano 85μm, para los hidrocarburos aromáticos policiclicos y nitrosaminas, respectivamente. La microextración en fase sólida acoplada a un dispositivo de extracción directa surge como una técnica interesante para la monitorización preliminar de la presencia de estos compuestos tóxicos en alimentos sólidos, sin necesidad de toma de muestras y sin deteriorar el producto

  3. MEDIANTE LA APLICACIÓN DEL ENSAYO FÉNIX.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Linna Marcela Neme Ardila

    2013-01-01

    Full Text Available Las mezclas asfálticas son el material más utilizado en la fabricación de pavimentos y los ensayos que permiten caracterizarlas son costosos y demorados. Por esta razón, mediante esta investigación se planteó establecer la viabilidad del uso del ensayo Fénix en mezclas asfálticas colombianas con granulometrías del Instituto de Desarrollo Urbano (IDU y del Instituto Nacional de Vías (INVIAS con diferentes características. El estudio inició con la fabricación de probetas Fénix con diferentes materiales (Agregados, asfaltos, asfaltita, pavimento asfalto reciclado (RAP, cal, cemento y su ejecución a 15 °C, una velocidad de 1 mm/min y la medición de los parámetros del ensayo. De los resultados obtenidos de resistencia a tracción, índice de rigidez a tracción e índice de energía, área elástica y área de fluencia, se estableció que el ensayo Fénix es un procedimiento eficaz, eficiente, económico, rápido y sencillo para determinar las propiedades mecánicas y dinámicas de las mezclas asfálticas estudiadas, especialmente mediante el análisis de los parámetros de las curvas carga-desplazamiento, irrelevantemente de la mezcla asfáltica fabricada.

  4. Detección de Mycoplasma genitalium mediante Reacción en Cadena de la Polimerasa en muestras urogenitales de individuos cubanos sexualmente activos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Brian Arturo Mondeja-Rodríguez

    2014-04-01

    Full Text Available El diagnóstico de las infecciones por Mycoplasma genitalium mediante métodos bacteriológicos tradicionales resulta laborioso y poco práctico. Es por ello que los métodos moleculares basados en la amplificación del ADN se utilizan con fines diagnósticos de las infecciones causadas por este microorganismo. En Cuba se han realizado pocos estudios sobre la presencia de M. genitalium en el tracto urogenital. El objetivo de la presente investigación fue detectar M. genitalium en individuos cubanos sexualmente activos mediante la implementación de métodos de PCR simple. Se implementaron dos PCR simples para la detección de fragmentos de 427 pb del gen ARN ribosomal 16S y 281 pb del gen de la adhesina celular MgPa de M. genitalium, que se evaluaron en muestras de exudado endocervical provenientes de 300 mujeres con sintomatología urogenital y muestras de orina de 49 hombres asintomáticos sexualmente activos. Se logró un límite de detección de la PCR del ARNr 16S de aproximadamente 5 copias de genoma por reacción, mientras que para la PCR MgPa se logró la amplificación de solo 50 copias de genoma por reacción. El 3% (10/300 de los exudados endocervicales y el 24,5% (12/49 de las muestras de orina de hombres asintomáticos resultaron positivas mediante ambas PCR. El mayor porcentaje de muestras positivas correspondió a las muestras de orina provenientes de hombres asintomáticos, que resultó superior a lo esperado. El presente trabajo permitirá realizar estudios futuros de caracterización genética y antigénica de las cepas de Mycoplasma genitalium circulantes en Cuba, útiles para conformar un inmunógeno vacunal.

  5. Digital PCR: A brief history

    OpenAIRE

    2014-01-01

    Digital PCR for quantification of a target of interest has been independently developed several times, being described in 1990 and 1991 using the term “limiting dilution PCR” and in 1999 using the term “digital PCR”. It came into use in the decade following its first development but its use was cut short by the description of real-time PCR in 1996. However digital PCR has now had a renaissance due to the recent development of new instruments and chemistry which have made it a much simpler and...

  6. Neurocryptococcosis: diagnosis by PCR method.

    Science.gov (United States)

    Paschoal, Regina Célia; Hirata, Mário Hiroyuki; Hirata, Rosário Crespo; Melhem, Márcia de Souza Carvalho; Dias, Amanda Latercia Tranches; Paula, Claudete Rodrigues

    2004-01-01

    Cryptococcus neoformans detection was optimized using PCR technique with the objective of application in the clinical laboratory diagnosis. The amplification area was ITS and 5,6S which encodes the ribosomal RNA (rRNA). A total of 72 cerebrospinal fluid (CSF) samples were used, obtained from cases with and without AIDS. The patients had cryptococcal meningitis (n = 56) and meningitis caused by other agents (n = 16). The results demonstrated that PCR test had the highest sensitivity rates, superior to culture (85.7%) and to India ink test (76.8%). PCR was found to be sensitive in detecting 1 cell/mL and highly specific since it did not amplify other fungal DNA. The comparative analysis of the methods showed that PCR is more sensitive and specific and is applicable as an important laboratorial resource for neurocryptococcosis diagnosis.

  7. Primer design versus PCR bias in methylation independent PCR amplifications.

    Science.gov (United States)

    Wojdacz, Tomasz K; Borgbo, Tanni; Hansen, Lise Lotte

    2009-05-16

    Many protocols in methylation studies utilize one primer set to generate a PCR product from bisulfite modified template regardless of its methylation status (methylation independent amplification MIP). However, proportional amplification of methylated and unmethylated alleles is hard to achieve due to PCR bias favoring amplification of unmethylated relatively GC poor sequence. Two primer design systems have been proposed to overcome PCR bias in methylation independent amplifications. The first advises against including any CpG dinucleoteides into the primer sequence (CpG-free primers) and the second, recently published by us, is based on inclusion of a limited number of CpG sites into the primer sequence. Here we used the Methylation Sensitive High Resolution Melting (MS-HRM) technology to investigate the ability of primers designed according to both of the above mentioned primer design systems to proportionally amplify methylated and unmethylated templates. Ten "CpG-free" primer pairs and twenty primers containing limited number of CpGs were tested. In reconstruction experiments the "CpG-free" primers showed primer specific sensitivity and allowed us to detect methylation levels in the range from 5 to 50%. Whereas while using primers containing limited number of CpG sites we were able to consistently detect 1-0.1% methylation levels and effectively control PCR amplification bias. In conclusion, the primers with limited number of CpG sites are able to effectively reverse PCR bias and therefore detect methylated templates with significantly higher sensitivity than CpG free primers.

  8. Muestras y representatividad en vigilancia epidemiologica mediante sitios centinelas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Samaja Juan

    1996-01-01

    Full Text Available El artículo sostiene que las exigencias técnicas del muestreo para la vigilancia epidemiológica, exigen una revisión profunda de importantes conceptos de la Teoría de la Salud. En particular, es necesario hacer énfasis en las condiciones de vida, y, más específicamente, en los ambientes o contextos en que se desarrollan los procesos reproductivos de la vida social. Pero ambos campos temáticos exigen potenciar el acceso a datos más ricos que los que aportan las fuentes tradicionales. Este enfoque de la "vigilancia epidemiológica" exige una revisión de los tipos de muestras, y esto implica revisar las interpretaciones dominantes sobre los fundamentos lógicos de las inferencias a partir de muestras. Se torna necesario dejar atrás las muestras estadísticas (aún las estratificadas y promover procedimientos del tipo de los "sitios centinelas". Esta técnica, aplicada originariamente en sociedades con sistemas estadísticos deficitarios, puede desarrollarse para constituirse en un complemento substancial del monitoreo de condiciones de vida incluso en sociedades con buenos sistemas de información. El artículo propone transformar el concepto de "sitio centinela" incorporandole el requisito de la "representatividad cualitativa" mediante muestreos finalísticos sustentados en tipologías previas de las unidades espacio-poblacionales.

  9. Muestras y representatividad en vigilancia epidemiologica mediante sitios centinelas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Juan Samaja

    Full Text Available El artículo sostiene que las exigencias técnicas del muestreo para la vigilancia epidemiológica, exigen una revisión profunda de importantes conceptos de la Teoría de la Salud. En particular, es necesario hacer énfasis en las condiciones de vida, y, más específicamente, en los ambientes o contextos en que se desarrollan los procesos reproductivos de la vida social. Pero ambos campos temáticos exigen potenciar el acceso a datos más ricos que los que aportan las fuentes tradicionales. Este enfoque de la "vigilancia epidemiológica" exige una revisión de los tipos de muestras, y esto implica revisar las interpretaciones dominantes sobre los fundamentos lógicos de las inferencias a partir de muestras. Se torna necesario dejar atrás las muestras estadísticas (aún las estratificadas y promover procedimientos del tipo de los "sitios centinelas". Esta técnica, aplicada originariamente en sociedades con sistemas estadísticos deficitarios, puede desarrollarse para constituirse en un complemento substancial del monitoreo de condiciones de vida incluso en sociedades con buenos sistemas de información. El artículo propone transformar el concepto de "sitio centinela" incorporandole el requisito de la "representatividad cualitativa" mediante muestreos finalísticos sustentados en tipologías previas de las unidades espacio-poblacionales.

  10. CAPTURA DE CO2 MEDIANTE TRANSPORTADORES SÓLIDOS

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Carmen Forero

    2011-01-01

    Full Text Available La evaluación de transportadores de oxígeno (TO, basados en CuO y NiO sobre Al2O3 y preparados por impregnación, se llevó a cabo en una planta piloto de dos lechos fluidizados interconectados de 500 Wte, donde se utilizaron tanto metano como gas de síntesis como gas combustible. Además, se estudió el efecto de diferentes impurezas presentes en el gas combustible como azufre o hidrocarburos ligeros en la eficacia de combustión del proceso y en el comportamiento de los TO. Los resultados obtenidos mostraron que ambos TO son adecuados para la captura de CO2 mediante transportadores sólidos de oxígeno en el proceso de combustión de metano, gas de síntesis o metano con impurezas como hidrocarburos ligeros o azufre en el gas.

  11. Análisis de varistores mediante STM y STS

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Castro, M. S.

    2002-02-01

    Full Text Available ZnO-Varistors have been studied by scanning tunnelling microscopy and spectroscopy. Tunnelling current-voltage characteristics indicate that grains present a rectifying behaviour. Since the prebreakdown zone is controlled by Schottky barriers formed by intergranular states, current density vs. temperature curves were fitted considering the tunnelling current through these barriers. Then, the Schottky barrier heights determined using the model are compared with the barrier heights obtained from the scanning tunnelling spectroscopy analysis in the grain boundary.

    Varistores de ZnO fueron estudiados mediante el empleo de microscopía y espectroscopía de efecto túnel. Las curvas de corriente túnel vs. tensión indican que las muestras presentan una conducta rectificante. Dado que la conducción en la zona de pre-ruptura es controlada por la formación de barreras de Schottky en los bordes de grano debidas a la presencia de estados intergranulares, las curvas de densidad de corriente vs. temperatura fueron ajustadas considerando la corriente túnel que atraviesa dichas barreras. La altura de las barreras de Schottky determinada con el modelo es comparada con las alturas obtenidas a través del análisis de barrido por espectroscopía túnel (STS en la región del borde de grano.

  12. Methylation-Specific PCR Unraveled

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Sarah Derks

    2004-01-01

    Full Text Available Methylation‐specific PCR (MSP is a simple, quick and cost‐effective method to analyze the DNA methylation status of virtually any group of CpG sites within a CpG island. The technique comprises two parts: (1 sodium bisulfite conversion of unmethylated cytosine's to uracil under conditions whereby methylated cytosines remains unchanged and (2 detection of the bisulfite induced sequence differences by PCR using specific primer sets for both unmethylated and methylated DNA. This review discusses the critical parameters of MSP and presents an overview of the available MSP variants and the (clinical applications.

  13. Detección sensible y específica de Mycobacterium tuberculosis a partir de muestras clínicas, mediante la amplificación de un elemento repetitivo de la familia REP13E12

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Christian Baldeviano V

    2007-01-01

    Full Text Available Objetivos: Diseñar e implementar un método de PCR para la detección sensible y específica de M. tuberculosis, orientado al oportuno diagnóstico de la tuberculosis mediante su adecuada aplicación en muestras clínicas. Materiales y métodos: Se diseñaron oligonucleótidos específicos para la amplificación de un fragmento de 318pb luego de una alineación múltiple de secuencias REP13E12 de M. tuberculosis. Se realizó la estandarización del método de PCR y se evaluó la sensibilidad y especificidad diagnóstica utilizando muestras clínicas con diagnóstico baciloscópico y cultivo. Resultados: El REP13E12-PCR detectó hasta 100 fg de ADN genómico, fue específico para la detección del complejo M. tuberculosis y capaz de distinguirlos de micobacterias atípicas. Esta evaluación preliminar proporcionó 100% de sensibilidad y especificidad en muestras clínicas de pacientes con diagnóstico de TB. Conclusiones: La amplificación de REP13E12 mediante PCR es una alternativa para el diagnóstico rápido de pacientes con TB, especialmente en casos cuyo diagnóstico pueda ser dificultoso o poco claro mediante el uso de los métodos convencionales.

  14. Modelado de sistemas complejos mediante simulación basada en agentes y mediante dinámica de sistemas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    LUIS R. IZQUIERDO

    2008-01-01

    Full Text Available Este trabajo compara dos técnicas de modelado de sistemas complejos: la simulación basada en agentes y la dinámica de sistemas. Esta comparación se lleva a cabo dentro del marco general del proceso de modelado científico. Los autores concluyen que la principal diferencia entre las dos metodologías se encuentra en el proceso de abstracción que cada una de ellas realiza para construir el modelo formal a partir del sistema complejo observado. Esta diferencia inicial se extiende a las restantes etapas del proceso de modelado científico. Finalmente, se indican los principales factores y las propiedades generales de un sistema complejo que hacen que una u otra técnica sea más relevante, aunque los autores destacan que, en la mayoría de los casos, modelizar un mismo sistema mediante las dos técnicas es la solución idónea.

  15. PCR

    African Journals Online (AJOL)

    ELO

    2012-01-05

    mail: ... Plates transferred to the laboratory were incubated at 25°C for 48 h for growing the .... Use of a probiotic to control lactococcosis and streptococcosis in ... Streptococcus difficile: two new streptococcal species causing a.

  16. Climático: evaluación mediante modelos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    P. Ruiz-Benito

    2013-01-01

    Full Text Available Los bosques son ecosistemas fundamentales en la generación de servicios ecosistémicos y, por tanto, para el bienestar humano. El cambio global (incluyendo cambio climático y cambios en el uso del suelo puede, sin embargo, alterar la dinámica y el funcionamiento de los ecosistemas, afectando al futuro suministro de servicios ecosistémicos. La vulnerabilidad frente al cambio global depende de la exposición (magnitud del cambio, la sensibilidad (susceptibilidad al cambio, y la capacidad de adaptación (habilidad para ajustarse al cambio de las especies. En el presente trabajo presentamos diversas aproximaciones de modelización que permiten analizar los diferentes componentes de la vulnerabilidad, e incluimos ejemplos desarrollados para bosques de la península Ibérica. A pesar de estos avances, la evidencia empírica y teórica para integrar los impactos potenciales (i.e. incluyendo la exposición y la sensibilidad y la capacidad de adaptación de las especies, es escasa. Por ello, para una adecuada evaluación sería necesario me-jorar el conocimiento existente sobre la sensibilidad y capacidad de adaptación de las especies y su respuesta frente a cambios ambientales extremos (por ejemplo, mediante redes de seguimiento a largo plazo, integrando adecuadamente la información obtenida en modelos que incluyan procesos basados en diferentes niveles de organización biológica, desde procesos fisiológicos a modelos agregados de distribución de especies.

  17. Chirurgia della valvulopatia mitralica mediante Port Access. Esperienza di due centri.

    OpenAIRE

    Iorio, Francesco

    2014-01-01

    La chirurgia mininvasiva della mitrale mediante Port Access, risulta una delle maggiori innovazioni in cardiochirurgia in grado di migliorare gli outcome a breve medio e lungo termine se paragonata alla chirurgia convenzionale. In questo studio sono sono prese in esame le esperienze di due centri di eccellenza che hanno condotto tali interventi mediante approcci tecnici intraoperatori diversi per il clampaggio aortico: l'Endoclamp ed il clampaggio aortico transtoracico. Vengono altresì discus...

  18. Clinical effects study of electrical stimulation of pelvic floor muscles combined with acupuncture treatment on detrusor muscle adynamia after TURP%盆底肌肉生物电刺激结合针刺治疗VPH 患者 TURP 术后逼尿肌无力的效果观察

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    陈海平; 张瑜; 刘玉峰; 吴大力; 王涛

    2015-01-01

    目的:探讨盆底肌肉生物电刺激结合针刺治疗前列腺增生症(VPH)患者经尿道前列腺电切(TURP)术后逼尿肌无力的临床疗效。方法将100例并发 TURP 术后逼尿肌无力的 VPH 患者随机分为研究组和对照组,每组50例。对照组患者采用盆底肌肉生物电刺激治疗,研究组患者在此基础上结合针刺治疗。比较两组患者的临床治疗效果、逼尿肌肌力和尿动力学参数。结果研究组治疗有效率为88.0%,显著高于对照组的68.0%( P <0.05)。研究组患者治疗后的逼尿肌肌力和尿动力学参数显著高于对照组( P <0.05)。结论盆底肌肉生物电刺激结合针刺治疗VPH 患者 TURP 术后逼尿肌无力的治疗效果好,可以有效提高患者的逼尿肌肌力,明显改善尿动力学参数,具有临床应用价值。%Objective To study the clinical effects of electrical stimulation of pelvic floor muscles combined with acupuncture treatment on detrusor muscle adynamia after TURP. Methods A total of 100 VPH patients with detrusor muscle adynamia after TURP were randomly divided into study group and control group,50 patients in each group. Patients in control group were treated by electrical stimulation of pelvic floor muscles and patients in study group were treated by electrical stimulation of pelvic floor muscles combined with acupuncture treatment. The clinical effective rate,detrusor muscle myodynamia and urodynamics were compared between two groups. Results The effective rate in study group was 88. 0% , which was significantly higher than 68. 0% in study group( P < 0. 05). The detrusor muscle myodynamia in study group was significantly higher than that in control group after treatment( P < 0. 01). All urodynamics indexes in study group were significantly better than those in control group after treatment( P < 0. 05). Conclusion The treatment of electrical stimulation of pelvic floor muscles combined with acupuncture has

  19. Desarrollo de la lectura mediante estratégias integradoras

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Solé, Maira

    2005-06-01

    Full Text Available La lectura y la escritura son procesos que cada día ameritan nuevos cambios y transformaciones. La propuesta de un Proyecto Pedagógico Integrador, (Fraca 2003 desarrollado con éxito en algunas instituciones venezolanas, se perfila como una alternativa significativa para el desarrollo de estos elementos. La idea o núcleo central es la integración de las diferentes asignaturas curriculares y lograr una globalización partiendo de sus objetivos y contenidos programáticos. El eje pedagógico integrador le permite al docente, evidenciar con mayor prontitud los resultados mediante actividades prácticas de lectura y escritura. Así mismo combina elementos claves del aprendizaje ausbeliano: información previa, información nueva y construcción de la información definitiva o integrada. La puesta en ejecución de las estrategias integradoras, en esta ocasión por maestros en formación (UNEG, a diferentes niños de escuelas del Estado Bolívar (Venezuela, certificando cómo la lectura y la escritura pueden tener un espacio ideal y significativo en la instrucción actual. Solo se necesita la intención, creatividad, dinamismo e ingenio. The reading and the writing plows processes that every day they require new changes and transformations. The proposal of an Integrative Pedagogic Project, (Fraca 2003 developed with success in some Venezuelan institutions; it is profiled like a significant alternative for the development of these elements. The idea or central nucleus is the integration of the different curricular subjects and to achieve a globalization leaving of its objectives and programmatic contents. The integrative pedagogic axis allows to the educational one, to evidence with more readiness the results by means of practical activities of reading and it notarizes. Likewise it combines key elements of the learning ausbeliano: previous information, new information and construction of the definitive or integrated information. The operation of

  20. de teorías mediante un estudio de caso

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Verónica Alonso Jiménez

    2008-01-01

    Full Text Available La democracia representativa como forma de gobierno, implica que el poder se ejerce por personas, que elegidas por el pueblo, actúan en su nombre y representación. El modo de participación en la elección y la manera como éstas se convierten en cargos públicos, requiere del dise- ño de instituciones que sistematicen dicha participación. La república de tipo presidencial, es una modalidad del gobierno electivo y popular, cuyo titular es el jefe del ejecutivo, electo por el pueblo o sus representantes, en donde el ejercicio del poder es limitado y mantiene un régimen de responsabilidades políticas. El diseño institucional que le corresponde a esta forma de gobierno es la parcelación del poder pú- blico en tres: poder ejecutivo, poder legislativo y poder judicial. Las ventajas políticas de este esquema es que la división de poderes, neutraliza el riesgo de caer en el autoritarismo, al impedir que el poder se concentre. La división de poderes es un dispositivo de restricción de facultades de los órganos estatales, por lo que no existe superioridad jerárquica entre los poderes, al contrario, cada órgano tiene bien delimitadas sus funciones y atribuciones, las que están reguladas por un marco jurídico común llamado Constitución. Y la división de poderes contribuye a mantener el equilibrio entre estos, mediante el llamado sistema de “pesos y contrapesos”. El presente trabajo se centra en el estudio de la Cámara de Diputados, considerada como una de las parcelas en las que está divida la autoridad del Estado, cuyo objetivo es la validación de los modelos teóricos en la tipificación del Congreso y la comprensión de las variables internas y externas que influyen en el comportamiento legislativo.

  1. Identificación por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) de microorganismos presentes en las infecciones orofaciales odontogénicas

    OpenAIRE

    Ghersi Miranda, Hugo Dante Francisco; Facultad de Estomatología, Universidad Peruana Cayetano Heredia. Lima,; Inga Peña, Rocío de María; Facultad de Ciencias y Filosofía. Universidad Peruana Cayetano Heredia. Lima,

    2014-01-01

    El objetivo del presente trabajo fue identificar la presencia de las bacterias, Porphyromonas gingivalis, Tannerella forsythensis y Treponema denticola, denominado complejo rojo; en grupo de tres, en parejas o sola una especie, presentes en las infecciones orofaciales odontogénicas (IOFO), mediante el método de la Reacción de la Polimerasa Reversa (PCR), en las muestras de abscesos de los pacientes que acudieron al Servicio de Odontoestomatologia del Hospital Nacional Cayetano Heredia y a la ...

  2. Diagnóstico rápido y efectivo de brucelosis bovina en sangre, mediante una reacción en cadena de la polimerasa doble

    OpenAIRE

    Víctor Eustorgio Aguirre Arzola; Mónica Alvarado González; José Luís Ibave González; Marisela Leal Hernández; Efrén Díaz Aparicio; Guadalupe Virginia Nevárez Moorillón; Francisco Javier Solís Martínez; Sigifredo Arévalo Gallegos; Blanca Estela Rivera Chavira

    2008-01-01

    La brucelosis es una de las enfermedades infecciosas más importantes del ganado y representa una barrera para la importación y exportación de productos lácteos y cárnicos. En México, el diagnóstico se realiza mediante las pruebas serológicas de tarjeta, rivanol y fijación del complemento. Los métodos moleculares, como la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), son herramientas rápidas y específicas para el diagnóstico de la enfermedad. En el presente trabajo se desarrolló el diagnóstico de...

  3. DIAGNÓSTICO ANTENATAL DE SÍFILIS CONGÉNITA POR PCR EN LÍQUIDO AMNIÓTICO Y SUS POSIBLES APLICACIONES

    OpenAIRE

    Yamamoto C,Masami; Lizama M.,Luis; Valenzuela H.,Patricia; Carrillo T.,Jorge; Insunza F,Alvaro; Prado D.,Priscila

    2005-01-01

    Se presenta un caso clínico de sífilis congénita diagnosticada antenatalmente mediante el uso de la reacción de la polimerasa en cadena (PCR) en líquido amniótico. La PCR permitiría identificar la espiroqueta en diferentes medios, como en sangre, líquido amniótico y líquido céfalo-raquídeo. Deberán desarrollarse nuevos protocolos para poder probar la efectividad de los tratamientos en base a esta técnica diagnóstica

  4. Two-temperature PCR for Microfluidics

    KAUST Repository

    Kodzius, Rimantas

    2010-05-01

    Since its invention in 1983, polymerase chain reaction (PCR) has been the method of choice for DNA amplification. Successful PCR depends on the optimization of several parameters, which is a cumbersome task due to the many variables (conditions and compon

  5. Real-time PCR in Food Science: PCR Diagnostics.

    Science.gov (United States)

    Rodriguez-Lazaro, David; Cook, Nigel; Hernandez, Marta

    2013-01-01

    A principal consumer demand is a guarantee of the safety and quality of food. The presence of foodborne pathogens and their potential hazard, the use of genetically modified organisms (GMOs) in food production, and the correct labelling in foods suitable for vegetarians are among the subjects where society demands total transparency. The application of controls within the quality assessment programmes of the food industry is a way to satisfy these demands, and is necessary to ensure efficient analytical methodologies are possessed and correctly applied by the Food Sector. The use of real-time PCR has become a promising alternative approach in food diagnostics. It possesses a number of advantages over conventional culturing approaches, including rapidity, excellent analytical sensitivity and selectivity, and potential for quantification. However, the use of expensive equipment and reagents, the need for qualified personnel, and the lack of standardized protocols are impairing its practical implementation for food monitoring and control.

  6. DETECCION DE Brucella abortus POR PCR EN MUESTRAS DE SANGRE Y LECHE DE VACUNOS

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Xiomara Mosquera C

    2008-12-01

    Full Text Available Objetivo. Evaluar el uso de la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR para la detección de Brucella abortus en muestras de sangre y leche de vacunos. Materiales y métodos. Este estudio de tipo descriptivo fue realizado durante los años 2004 y 2005. Se analizaron 136 animales de tres fincas localizadas en el municipio de Durania, Norte de Santander, Colombia. Se evaluó la presencia de anticuerpos en la leche mediante la prueba del anillo (PAL. Se amplificó el fragmento de 223pb del gen BCSP31. Se emplearon los cebadores B4 y B5 de la región interna de la secuencia del gen BCSP31 (GenBank, número M20404. Resultados. En aquellos animales positivos se obtuvo una muestra de sangre y leche para el análisis por PCR, la sangre no fue analizada por serología. Se evaluaron diferentes métodos de extracción de ADN. Se encontró que un 13.2% (18/136 de las muestras de leche fueron positivas a la PAL. Se analizaron 33 muestras de leche negativas por PAL de las cuales el 30.3% (10/33 resultaron positivas por PCR. Al analizar las muestras de sangre de los animales positivos por PAL el 94.1% (16/17 fueron positivas por PCR, mientras que el 47% (8/17 de las muestras de leche positivas por PAL, fueron positivas por PCR. Conclusiones. Se demostró la amplificación de un fragmento de ADN de Brucella abortus en muestras de sangre y leche de vacunos. Los resultados preliminares demostraron que es posible usar PCR como prueba diagnóstica de brucelosis en Colombia.

  7. Real-Time PCR (qPCR) Primer Design Using Free Online Software

    Science.gov (United States)

    Thornton, Brenda; Basu, Chhandak

    2011-01-01

    Real-time PCR (quantitative PCR or qPCR) has become the preferred method for validating results obtained from assays which measure gene expression profiles. The process uses reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR), coupled with fluorescent chemistry, to measure variations in transcriptome levels between samples. The four most…

  8. Real-Time PCR (qPCR) Primer Design Using Free Online Software

    Science.gov (United States)

    Thornton, Brenda; Basu, Chhandak

    2011-01-01

    Real-time PCR (quantitative PCR or qPCR) has become the preferred method for validating results obtained from assays which measure gene expression profiles. The process uses reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR), coupled with fluorescent chemistry, to measure variations in transcriptome levels between samples. The four most…

  9. Control de un péndulo invertido mediante nodos CAN

    OpenAIRE

    2004-01-01

    En líneas generales, el propósito de este proyecto, es realizar el control de la maqueta de un péndulo invertido del departamento de ESAII. Esta maqueta está compuesta por una estructura de aluminio, sobre la cual un carro se desliza sobre una superficie plana enganchado a un motor mediante una correa. En este motor se encuentra un encoder óptico, en el extremo de su eje mediante un acoplamiento. En el carro se encuentra el péndulo, el cual es doble, es decir el péndulo cuelga por delante...

  10. Identificación en lazo cerrado mediante algoritmos genéticos

    OpenAIRE

    Alfredo Gómez Infante; Abelardo del Pozo Quintero; Alberto Aguado Behar

    2010-01-01

    La identificación  en lazo cerrado de sistemas continuos es un problema de optimización no lineal que resulta de difícil solución mediante métodos convencionales.  En este trabajo se propone el uso de algoritmos genéticos (AG) para esta tarea y se muestra mediante simulaciones que los modelos obtenidos pueden reproducir fielmente el comportamiento de la planta, aun en el caso de sistemas inestables o que presentan algún tipo de no-linealidad. Estos modelos pueden utilizarse para el ajuste ...

  11. Tratamiento de tumores óseos benignos mediante legrado y relleno con metilmetacrilato

    OpenAIRE

    Orduña Serra, Modesto; Fernández Sabaté, Alfons; Amorós, P.

    1989-01-01

    Se expone la experiencia en ocho lesiones óseas tumorales y paratumorales benignas tratadas mediante legrado de la cavidad y posterior relleno mediante metilmetacrilato con contraste baritado. El seguimiento de los casos entre año y medio y once años permite que nos afirmemos en la bondad de los resultados en cuanto a función articular resistencia de la extremidad y control del tumor. Comentamos las estadísticas publicadas en las que destacan los casos de tumor de células gigantes (66 por 100...

  12. Tratamiento del choque femoroacetabular mediante miniabordaje anterior. Resultados a corto plazo

    OpenAIRE

    Diranzo García, J.; Estrems Díaz, V.; Hernández Ferrando, L.; Castillo Ruiperez, L.; Brú Pomer, Antonio

    2015-01-01

    El tratamiento quirúrgico del choque femoroacetabular (CFA) es un práctica clínica cada vez más frecuente en nuestra especialidad. Objetivo. Analizar los resultados clínicos y radiológicos de una primera serie de pacientes diagnosticados de CFA intervenidos mediante miniabordaje anterior. Material y métodos. Estudio prospectivo de 30 pacientes con una edad media de 36,2 años y un seguimiento mínimo de 12 meses. La valoración clínica se ha realizado mediante las escalas SF-36, WOMAC y NAHS. Ev...

  13. Modulación del crecimiento vertebral mediante electrocoagulación hemicircunferencial vertebral asistida

    OpenAIRE

    2009-01-01

    Nuestro trabajo está basado en la posibilidad de controlar el desarrollo asimétrico de los cartílagos de crecimiento vertebral, mediante la realización de una fisiodesis hemivertebral, con electrocoagulación, videoasistida por toracoscópica. Se realizará en cinco niveles torácicos, con un abordaje anterior mínimamente invasivo. Por lo tanto, planteamos como hipótesis de trabajo que La destrucción de las fisis de crecimiento vertebral mediante electrocoagulación, videoasistida por vía toracosc...

  14. Recuperación de boro mediante extracción y procesos de membrana

    OpenAIRE

    Gallego Latorre, Maria Irene

    2008-01-01

    En este proyecto se ha estudiado la posibilidad de extraer boro en forma de ácido bórico mediante extractantes neutros. En primer lugar se han realizado los experimentos de extracción líquido-líquido y después se han realizado pruebas de extracción mediante membranas planas soportadas. Las pruebas de extracción líquido-líquido han permitido estudiar el comportamiento del boro ante diferentes extractantes neutros (2,2,4-Trimethyl-1,3-pentanodiol , 2- Butyl-2-ethyl-1,3-p...

  15. Control PID de un secador mediante autómatas programables conectados por ethernet

    OpenAIRE

    Carrillo Valencia, Víctor

    2012-01-01

    Este proyecto final de carrera se centra en el control PID de temperatura de un secador convencional mediante autómatas programables conectados por Ethernet. Se busca con ello la configuración de un red de comunicaciones entre dos PLC’s industriales (Programmable Logic Controller en sus siglas en inglés) y el control de temperatura mediante un controlador PID. Los controladores lógicos programables o PLC’s son dispositivos electrónicos muy usados en automatización industrial...

  16. Control PID de un secador mediante autómatas programables conectados por ethernet

    OpenAIRE

    Carrillo Valencia, Víctor

    2012-01-01

    Este proyecto final de carrera se centra en el control PID de temperatura de un secador convencional mediante autómatas programables conectados por Ethernet. Se busca con ello la configuración de un red de comunicaciones entre dos PLC’s industriales (Programmable Logic Controller en sus siglas en inglés) y el control de temperatura mediante un controlador PID. Los controladores lógicos programables o PLC’s son dispositivos electrónicos muy usados en automatización industrial...

  17. Daño muscular inducido mediante ejercicio y sus efectos en el rendimiento

    OpenAIRE

    Valenzuela Tallón, Pedro Luis

    2014-01-01

    El presente trabajo pretende introducir un tema de gran controversia: el daño muscular inducido mediante ejercicio (DMIE). Se ha realizado una revisión bibliográfica de la literatura científica referente al DMIE para exponer la teoría más actual en cuanto al mecanismo que lo provoca y los cambios biológicos y funcionales producidos tras éste. El DMIE comienza como un proceso mecánico mediante el cual se dañan las estructuras de las fibras musculares, lo cual da lugar a un proceso inflamatorio...

  18. Tratamiento de aguas residuales industriales mediante electrocoagulación y coagulación convencional

    OpenAIRE

    Martínez Navarro, Fabiola

    2011-01-01

    Existen numerosos tipos de aguas y aguas residuales (las aguas de abastecimiento, efluentes industriales consistentes en suspensiones coloidales, aguas residuales contaminadas con macromoléculas orgánicas disueltas o las emulsiones de aceite en agua (o/w) susceptibles de ser tratadas mediante coagulación, una operación dirigida a la consecución de la desestabilización de los contaminantes mediante su interacción con un reactivo (generalmente, sales de fe(III) y de al(III)). Esta operación pue...

  19. Anchored PCR (A-PCR):A new method for chromosome walking

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    CHEN Bojun; SUN Chao; WANG Yong; HU Yuanlei; LIN Zhongping

    2004-01-01

    @@ PCR-based techniques are most popular methods for isolation of DNA sequences flanking a known region.Such techniques published to date mainly include three types: inverse PCR (IPCR)[1-3], ligation-mediated PCR (LM-PCR)[4-9] and randomly primed PCR (RP-PCR)[10-12].IPCR was the first method developed for this kind of purpose. However, it is now rarely used because of the difficulty in finding suitable restriction sites in the target region or poor circularization of the template molecule.LM-PCR and RP-PCR are more frequently used nowadays, yet they also have some limitations. For example,LM-PCR depends on restriction sites within a reasonable distance in the flanking regions, while the amplified products of RP-PCR are generally small (<1 kb). Moreover, both methods often result in excessive amplification of non-specific molecules, which greatly reduces their efficiencies in obtaining sequences of interest. To resolve these problems, some new strategies have emerged in the past few years, such as Vectorette-PCR[6], biotin-capture PCR[7], TAIL-PCR[l2] and T-linker PCR[9]. These improved methods are more efficient than their old versions;however, most of them are still limited by restriction digestion or ligation. Although the intervening steps are avoided in TAIL-PCR, the amplified fragments are often small because of the use of random primers.

  20. Detección sensible y específica de Mycobacterium tuberculosis a partir de muestras clínicas, mediante la amplificación de un elemento repetitivo de la familia REP13E12

    OpenAIRE

    Christian Baldeviano V; Carmen Luna C; Tatiana Cáceres N; Roger Calderón E

    2007-01-01

    Objetivos: Diseñar e implementar un método de PCR para la detección sensible y específica de M. tuberculosis, orientado al oportuno diagnóstico de la tuberculosis mediante su adecuada aplicación en muestras clínicas. Materiales y métodos: Se diseñaron oligonucleótidos específicos para la amplificación de un fragmento de 318pb luego de una alineación múltiple de secuencias REP13E12 de M. tuberculosis. Se realizó la estandarización del método de PCR y se evaluó la sensibilidad y especificidad d...

  1. Study of the bacterial diversity of foods: PCR-DGGE versus LH-PCR.

    Science.gov (United States)

    Garofalo, Cristiana; Bancalari, Elena; Milanović, Vesna; Cardinali, Federica; Osimani, Andrea; Sardaro, Maria Luisa Savo; Bottari, Benedetta; Bernini, Valentina; Aquilanti, Lucia; Clementi, Francesca; Neviani, Erasmo; Gatti, Monica

    2017-02-02

    The present study compared two culture-independent methods, polymerase chain reaction denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE) and length-heterogeneity polymerase chain reaction (LH-PCR), for their ability to reveal food bacterial microbiota. Total microbial DNA and RNA were extracted directly from fourteen fermented and unfermented foods, and domain A of the variable regions V1 and V2 of the 16S rRNA gene was analyzed through LH-PCR and PCR-DGGE. Finally, the outline of these analyses was compared with bacterial viable counts obtained after bacterial growth on suitable selective media. For the majority of the samples, RNA-based PCR-DGGE revealed species that the DNA-based PCR-DGGE was not able to highlight. When analyzing either DNA or RNA, LH-PCR identified several lactic acid bacteria (LAB) and coagulase negative cocci (CCN) species that were not identified by PCR-DGGE. This phenomenon was particularly evident in food samples with viable loadsPCR was able to detect a higher number of peaks in the analyzed food matrices relative to species identified by PCR-DGGE. In light of these findings, it may be suggested that LH-PCR shows greater sensitivity than PCR-DGGE. However, PCR-DGGE detected some other species (LAB included) that were not detected by LH-PCR. Therefore, certain LH-PCR peaks not attributed to known species within the LH-PCR database could be solved by comparing them with species identified by PCR-DGGE. Overall, this study also showed that LH-PCR is a promising method for use in the food microbiology field, indicating the necessity to expand the LH-PCR database, which is based, up to now, mainly on LAB isolates from dairy products. Copyright © 2016 Elsevier B.V. All rights reserved.

  2. Método de eliminación de trihalometanos y/o contaminantes emergentes mediante plasma

    OpenAIRE

    Molina, Ricardo; Erra Serrabasa, Pilar; Bertrán, Enric; Jover Comas, Eric; Reyes Contreras, Carolina

    2009-01-01

    Método de eliminación de trihalometanos y/o contaminantes emergentes mediante plasma. Se describe un método de eliminación de trihalometanos y contaminantes refractarios en medios acuosos mediante la aplicación directa de plasma para conseguir la degradación de los compuestos contaminantes presentes en el agua.

  3. Application of Reverse Transcription-PCR and Real-Time PCR in Nanotoxicity Research

    Science.gov (United States)

    Mo, Yiqun; Wan, Rong; Zhang, Qunwei

    2016-01-01

    Reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) is a relatively simple and inexpensive technique to determine the expression level of target genes and is widely used in biomedical science research including nanotoxicology studies for semiquantitative analysis. Real-time PCR allows for the detection of PCR amplification in the exponential growth phase of the reaction and is much more quantitative than traditional RT-PCR. Although a number of kits and reagents for RT-PCR and real-time PCR are commercially available, the basic principles are the same. Here, we describe the procedures for total RNA isolation by using TRI Reagent, for reverse transcription (RT) by M-MLV reverse transcriptase, and for PCR by GoTaq® DNA Polymerase. And real-time PCR will be performed on an iQ5 multicolor real-time PCR detection system by using iQ™ SYBR Green Supermix. PMID:22975959

  4. Conhecimento, atitude e práticas na prevenção do câncer de colo uterino e hpv em adolescentes Conocimientos, actitudes y prácticas en la prevención de cáncer cervicouterino y el VPH en adolescentes Knowledge, attitude and practice in the prevention of cervical cancer and HPV in adolescents

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ferla Maria Simas Bastos Cirino

    2010-03-01

    Full Text Available O início sexual cada vez mais cedo propicia alta vulnerabilidade da adolescente a problemas da esfera sexual/reprodutiva, incluindo o câncer de colo uterino e a infecção pelo HPV. O presente estudo teve como objetivo identificar o conhecimento, atitude e prática na prevenção do câncer de colo uterino e infecção pelo HPV na população adolescente e avaliar as situações que as tornam vulneráveis. Trata-se de estudo transversal realizado em uma escola pública de São Paulo com 134 adolescentes entre 14 e 19 anos. Verificou-se idade de iniciação sexual aos 14,8 anos em média. Grande parte das adolescentes não apresentou conhecimento adequado sobre a prevenção desta neoplasia. A adesão ao Papanicolaou também se mostrou baixa. As estatísticas justificam a inserção da adolescente nos programas de detecção deste câncer. É preciso haver investimentos na educação sexual nas instituições de ensino e associar campanhas de Papanicolaou com atividades educativas, com enfoque adequado e linguagem apropriada.La iniciación sexual cada vez más temprana propicia un nivel alto de vulnerabilidad de los adolescentes a los problemas de la esfera sexual / reproductiva, incluyendo el cáncer del cuello del útero y la infección por VPH. Este estudio tuvo como objetivo identificar los conocimientos, actitudes y prácticas en la prevención de cáncer cervical y la infección por VPH en la población adolescente y evaluar las situaciones que los tornan vulnerables. Este es un estudio transversal realizado en una escuela pública en Sao Paulo con 134 adolescentes entre 14 y 19 años. El promedio de la edad de iniciación sexual fue de 14,8 años. La mayoría de los adolescentes no tienen conocimientos adecuados sobre la prevención de este tipo de cáncer. También presentó bajas tasas de la prueba del Papanicolaou . Las estadísticas justifican la inclusión de estas adolescentes en los programas para la detección de este cáncer. Es

  5. The polymerase chain reaction (PCR): general methods.

    Science.gov (United States)

    Waters, Daniel L E; Shapter, Frances M

    2014-01-01

    The polymerase chain reaction (PCR) converts very low quantities of DNA into very high quantities and is the foundation of many specialized techniques of molecular biology. PCR utilizes components of the cellular machinery of mitotic cell division in vitro which respond predictably to user inputs. This chapter introduces the principles of PCR and discusses practical considerations from target sequence definition through to optimization and application.

  6. Restriction endonucleases digesting DNA in PCR buffer

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    LIU Xue-dong; ZHENG Dong; ZHOU Yan-na; MAO Wei-wei; MA Jian-zhang

    2005-01-01

    Six commonly used restriction endonucleases (Res) (Acc I, Ban II, EcoR I, Hind III, Sac I, Sca I) were tested for their ability to directly digest DNA completely in the Polymerase Chain Reaction (PCR) buffers. The results showed that: with the requirement for additional magnesium supplemented as activator, Res, except EcoR I appeared star activity, completely digested unmethylated lambda DNA after overnight incubation in PCR buffer and functioned as equally well as in recommended Restriction Enzyme Buffer provided with each enzyme; all Res tested completely digested PCR products in PCR buffer, it implied digestion of PCR products may often be performed directly in the PCR tube without the requirement for any precipitation or purification steps; and the concentration of MgCl2 from 2.5 mmol·L-1 to 10 mmol·L-1 did not significantly affect activity of Res in PCR buffer. This simplified method for RE digestion of PCR products could have applications in restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis and single-stranded conformational polymorphism (SSCP) analysis of large PCR products. However, usage of this procedure for cloning applications needs further data.

  7. Real-time PCR in microfluidic devices

    Science.gov (United States)

    Becker, Holger; Hlawatsch, Nadine; Klemm, Richard; Moche, Christian; Hansen-Hagge, Thomas; Gärtner, Claudia

    2014-03-01

    A central method in a standard biochemical laboratory is represented by the polymerase chain reaction (PCR), therefore many attempts have been performed so far to implement this technique in lab-on-a-chip (LOC) devices. PCR is an ideal candidate for miniaturization because of a reduction of assay time and decreased costs for expensive bio-chemicals. In case of the "classical" PCR, detection is done by identification of DNA fragments electrophoretically separated in agarose gels. This method is meanwhile frequently replaced by the so-called Real-Time-PCR because here the exponential increase of amplificates can be observed directly by measurement of DNA interacting fluorescent dyes. Two main methods for on-chip PCRs are available: traditional "batch" PCR in chambers on a chip using thermal cycling, requiring about 30 minutes for a typical PCR protocol and continuous-flow PCR, where the liquid is guided over stationary temperature zones. In the latter case, the PCR protocol can be as fast as 5 minutes. In the presented work, a proof of concept is demonstrated for a real-time-detection of PCR products in microfluidic systems.

  8. Pitfalls in PCR troubleshooting: Expect the unexpected?

    Science.gov (United States)

    Schrick, Livia; Nitsche, Andreas

    2016-01-01

    PCR is a well-understood and established laboratory technique often used in molecular diagnostics. Huge experience has been accumulated over the last years regarding the design of PCR assays and their set-up, including in-depth troubleshooting to obtain the optimal PCR assay for each purpose. Here we report a PCR troubleshooting that came up with a surprising result never observed before. With this report we hope to sensitize the reader to this peculiar problem and to save troubleshooting efforts in similar situations, especially in time-critical and ambitious diagnostic settings.

  9. Detection of Eperythrozoon wenyoni by PCR assay

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    Jian WANG; Yutao ZHU; Jianhua QIN; Fumei ZHANG; Yuelan ZHAO

    2009-01-01

    The objective of this research was to develop a detection method for Eperythrozoon wenyoni infection using polymerase chain reaction (PCR) assay technique. A pair of primers was designed and synthesized according to the conservative sequence 16S rRNA. The PCR assay was performed with the primers. A 985-bp fragment was amplified by using PCR. The amplified fragments with the expected size were identified by EcoR I restriction digestion. The crossing-reaction, specific-reaction and duplicate-reaction indicated that the PCR method is a specific, sensitive, fast and effective method for diagnosing E. Wenyoni infection at group level.

  10. Pitfalls in PCR troubleshooting: Expect the unexpected?

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Livia Schrick

    2016-01-01

    Full Text Available PCR is a well-understood and established laboratory technique often used in molecular diagnostics. Huge experience has been accumulated over the last years regarding the design of PCR assays and their set-up, including in-depth troubleshooting to obtain the optimal PCR assay for each purpose. Here we report a PCR troubleshooting that came up with a surprising result never observed before. With this report we hope to sensitize the reader to this peculiar problem and to save troubleshooting efforts in similar situations, especially in time-critical and ambitious diagnostic settings.

  11. Absolute quantification by droplet digital PCR versus analog real-time PCR

    Science.gov (United States)

    Hindson, Christopher M; Chevillet, John R; Briggs, Hilary A; Gallichotte, Emily N; Ruf, Ingrid K; Hindson, Benjamin J; Vessella, Robert L; Tewari, Muneesh

    2014-01-01

    Nanoliter-sized droplet technology paired with digital PCR (ddPCR) holds promise for highly precise, absolute nucleic acid quantification. Our comparison of microRNA quantification by ddPCR and real-time PCR revealed greater precision (coefficients of variation decreased by 37–86%) and improved day-to-day reproducibility (by a factor of seven) of ddPCR but with comparable sensitivity. When we applied ddPCR to serum microRNA biomarker analysis, this translated to superior diagnostic performance for identifying individuals with cancer. PMID:23995387

  12. Detección por pcr de Anaplasma spp. en caprinos del municipio de Los Santos, Santander‑Colombia

    OpenAIRE

    Jimenez, Angela; Garcia, Alba; Angulo, Carolina; Gómez, Joaquín

    2013-01-01

    Mediante pcr semianidada se amplificó una porción de 347 pb del gen msp5 para determinar la presencia de Anaplasma spp. en caprinos de la Mesa de Los Santos, Santander. A partir de 600 individuos se seleccionó una muestra de 99 animales utilizando una afijación proporcional. A cada uno de los caprinos se les realizó un examen semiológico y la extracción de una muestra sanguínea para pcr semi-anidada, medición de hematocrito, hemoglobina, evaluación de la morfología de los glóbulos rojos y obs...

  13. Derrame pleural tuberculoso: diagnóstico mediante videotoracoscopia Derrame pleural tuberculoso: diagnóstico mediante videotoracoscopia Tuberculous pleural effusion: diagnosis by videothoracoscopy

    OpenAIRE

    Edelberto Fuentes Valdés; Miguel A Martín González

    2006-01-01

    El diagnóstico de la tuberculosis pleural es difícil por la presentación inespecífica y la pobre eficiencia de los métodos diagnósticos tradicionales cuando de esta se trata. Se realizó un estudio retrospectivo de 6 pacientes a quienes se realizó el diagnóstico de tuberculosis pleural mediante videotoracoscopia, ante el fracaso de los métodos tradicionales. El objetivo fue conocer el valor de la videotoracoscopia en el diagnóstico de la tuberculosis pleural. Cinco de los 6 pacientes eran del ...

  14. Evaluation of AMPLICOR Neisseria gonorrhoeae PCR using cppB nested PCR and 16S rRNA PCR.

    Science.gov (United States)

    Farrell, D J

    1999-02-01

    Certain strains of Neisseria subflava and Neisseria cinerea are known to produce false-positive results with the AMPLICOR Neisseria gonorrhoeae PCR (Roche Diagnostic Systems, Branchburg, N.J.). The analytical sensitivity and analytical specificity of three PCR tests were assessed with 3 geographically diverse N. gonorrhoeae strains and 30 non-N. gonorrhoeae Neisseria spp. The sensitivities of the in-house nested cppB gene and the 16S rRNA PCR methods were greater than that of the AMPLICOR N. gonorrhoeae PCR with purified DNA from all 3 N. gonorrhoeae strains. Six of 14 clinical strains of N. subflava (1 from a vaginal swab, 5 from respiratory sites) produced false-positive AMPLICOR N. gonorrhoeae PCR results and were negative by the two other PCR methods. When applied to 207 clinical specimens selected from a population with a high prevalence ( approximately 9%) of infection, the results for 15 of 96 (15.6%) AMPLICOR-positive specimens and 14 of 17 (82.3%) AMPLICOR-equivocal specimens were not confirmed by the more sensitive nested cppB PCR method. Only 2 of 94 (2.1%) of AMPLICOR N. gonorrhoeae PCR-negative specimens from the same population tested positive by the nested cppB method. These results suggest that for this population the AMPLICOR N. gonorrhoeae PCR test is suitable as a screening test only and all positive results should be confirmed by a PCR method that is more specific and at least as sensitive. This study also illustrates that caution should be used when introducing commercially available nucleic acid amplification-based diagnostic tests into the regimens of tests used for populations not previously tested with these products.

  15. Digital PCR dynamic range is approaching that of real-time quantitative PCR.

    Science.gov (United States)

    Jones, Gerwyn M; Busby, Eloise; Garson, Jeremy A; Grant, Paul R; Nastouli, Eleni; Devonshire, Alison S; Whale, Alexandra S

    2016-12-01

    Digital PCR (dPCR) has been reported to be more precise and sensitive than real-time quantitative PCR (qPCR) in a variety of models and applications. However, in the majority of commercially available dPCR platforms, the dynamic range is dependent on the number of partitions analysed and so is typically limited to four orders of magnitude; reduced compared with the typical seven orders achievable by qPCR. Using two different biological models (HIV DNA analysis and KRAS genotyping), we have demonstrated that the RainDrop Digital PCR System (RainDance Technologies) is capable of performing accurate and precise quantification over six orders of magnitude thereby approaching that achievable by qPCR.

  16. Digital PCR for detection of citrus pathogens

    Science.gov (United States)

    Citrus trees are often infected with multiple pathogens of economic importance, especially those with insect or mite vectors. Real-time/quantitative PCR (qPCR) has been used for high-throughput detection and relative quantification of pathogens; however, target reference or standards are required. I...

  17. Testing for Genetically Modified Foods Using PCR

    Science.gov (United States)

    Taylor, Ann; Sajan, Samin

    2005-01-01

    The polymerase chain reaction (PCR) is a Nobel Prize-winning technique that amplifies a specific segment of DNA and is commonly used to test for the presence of genetic modifications. Students use PCR to test corn meal and corn-muffin mixes for the presence of a promoter commonly used in genetically modified foods, the cauliflower mosaic virus 35S…

  18. Validation of RNAi by real time PCR

    DEFF Research Database (Denmark)

    Josefsen, Knud; Lee, Ying Chiu

    2011-01-01

    Real time PCR is the analytic tool of choice for quantification of gene expression, while RNAi is concerned with downregulation of gene expression. Together, they constitute a powerful approach in any loss of function studies of selective genes. We illustrate here the use of real time PCR to veri...

  19. Testing for Genetically Modified Foods Using PCR

    Science.gov (United States)

    Taylor, Ann; Sajan, Samin

    2005-01-01

    The polymerase chain reaction (PCR) is a Nobel Prize-winning technique that amplifies a specific segment of DNA and is commonly used to test for the presence of genetic modifications. Students use PCR to test corn meal and corn-muffin mixes for the presence of a promoter commonly used in genetically modified foods, the cauliflower mosaic virus 35S…

  20. Real-time PCR and PCR-tandem Mass Spectrometry for Biodetection

    Science.gov (United States)

    2005-10-01

    Real - time PCR and PCR- tandem mass spectrometry for biodetection Alvin Fox, University of South Carolina, School of Medicine Report Documentation...TYPE N/A 3. DATES COVERED - 4. TITLE AND SUBTITLE Real - time PCR and PCRtandem mass spectrometry for biodetection 5a. CONTRACT NUMBER 5b...interspace region Bacillus subtilis W23 standard Blank Barn dust House dust Cycle Real - time PCR (16s rRNA) - environmental samples Real - time

  1. Addressing PCR Biases in Environmental Microbiology Studies

    Science.gov (United States)

    Sipos, Rita; Székely, Anna; Révész, Sára; Márialigeti, Károly

    Each step of a molecular environmental microbiology study is prone to errors, though the qualitative and quantitative biases of PCR amplification could result in the most serious biases. One has to be aware of this fact, and well-characterized PCR biases have to be avoided by using target-optimized PCR protocols. The most important tasks are primer and thermal profile optimization. We have shown that primer mismatches, even in the case of universal primers, can cause almost complete missing of common taxa from clone libraries, for example. Similarly high annealing temperatures can drastically distort community composition of the sample in the PCR product. Strategies of primer selection and PCR thermal profile design are discussed in detail.

  2. COLD-PCR: Applications and Advantages.

    Science.gov (United States)

    Zuo, Zhuang; Jabbar, Kausar J

    2016-01-01

    Co-amplification at lower denaturation temperature-based polymerase chain reaction (COLD-PCR) is a single-step amplification method that results in the enhancement of both known and unknown minority alleles during PCR, irrespective of mutation type and position. This method is based on exploitation of the critical temperature, Tc, at which mutation-containing DNA is preferentially melted over wild type. COLD-PCR can be a good strategy for mutation detection in specimens with high nonneoplastic cell content, small specimens in which neoplastic cells are difficult to micro-dissect and therefore enrich, and whenever a mutation is suspected to be present but is undetectable using conventional PCR and sequencing methods. We describe in this chapter our COLD-PCR-based pyrosequencing method for KRAS mutation detection in various clinical samples using DNA extracted from either fresh or fixed paraffin-embedded tissue specimens.

  3. Mathematical analysis of the real time array PCR (RTA PCR) process

    NARCIS (Netherlands)

    Dijksman, Johan Frederik; Pierik, A.

    2012-01-01

    Real time array PCR (RTA PCR) is a recently developed biochemical technique that measures amplification curves (like with quantitative real time Polymerase Chain Reaction (qRT PCR)) of a multitude of different templates in a sample. It combines two different methods in order to profit from the

  4. Pre-PCR processing: strategies to generate PCR-compatible samples.

    Science.gov (United States)

    Rådström, Peter; Knutsson, Rickard; Wolffs, Petra; Lövenklev, Maria; Löfström, Charlotta

    2004-02-01

    Polymerase chain reaction (PCR) is recognized as a rapid, sensitive, and specific molecular diagnostic tool for the analysis of nucleic acids. However, the sensitivity and kinetics of diagnostic PCR may be dramatically reduced when applied directly to biological samples, such as blood and feces, owing to PCR-inhibitory components. As a result, pre-PCR processing procedures have been developed to remove or reduce the effects of PCR inhibitors. Pre-PCR processing comprises all steps prior to the detection of PCR products, that is, sampling, sample preparation, and deoxyribonucleic acid (DNA) amplification. The aim of pre-PCR processing is to convert a complex biological sample with its target nucleic acids/cells into PCR-amplifiable samples by combining sample preparation and amplification conditions. Several different pre-PCR processing strategies are used: (1) optimization of the DNA amplification conditions by the use of alternative DNA polymerases and/or amplification facilitators, (2) optimization of the sample preparation method, (3) optimization of the sampling method, and (4) combinations of the different strategies. This review describes different pre-PCR processing strategies to circumvent PCR inhibition to allow accurate and precise DNA amplification.

  5. Mathematical analysis of the real time array PCR (RTA PCR) process

    NARCIS (Netherlands)

    Dijksman, J.F.; Pierik, A.

    2012-01-01

    Real time array PCR (RTA PCR) is a recently developed biochemical technique that measures amplification curves (like with quantitative real time Polymerase Chain Reaction (qRT PCR)) of a multitude of different templates in a sample. It combines two different methods in order to profit from the adva

  6. ANATOMÍA DE LA PRIMERA PREMOLAR MANDIBULAR OBSERVADA MEDIANTE TOMOGRAFÍA CONE BEAM. ESTUDIO IN VITRO

    OpenAIRE

    Falla Coronel, Maricarmen; Universidad Señor de Sipán; Ibáñez Sevilla, Carmen Teresa; Universidad Nacional de Trujillo

    2016-01-01

    Objetivo: Determinar la anatomía de la primera premolar mandibular observada mediante tomografía Cone Beam mediante el estudio in vitro Material y métodos: Investigación cuantitativa, diseño transversal, se empleó 62 primeras premolares mandibulares extraídos por indicación de ortodoncia, enfermedad periodontal y caries dental. Se determinó la morfología externa de la raíz del primer premolar mandibular, el número de conductos de la primera premolar mandibular observadas mediante la tomografí...

  7. Programación por metas Energía alternativa mediante biomasa.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Guerrero Casas, Flor María

    2003-01-01

    Full Text Available En este trabajo se presenta un modelo multicriterio de localización de centrales de generación de energía eléctrica mediante biomasa. Los objetivos considerados son: (1 minimizar el coste total de la operación, (2 maximizar la producción de electricidad obtenida, (3 maximizar la distancia entre plantas, (4 maximizar la aceptación social y (5 establecer las plantas o ampliaciones en aquellos lugares donde exista una mayor predisposición por parte de las administraciones locales. Finalmente, se concluye con una aplicación práctica mediante programación por metas ponderadas para la región andaluza, considerando los residuos procedentes del olivar como fuente de energía.

  8. Real-Time PCR (RT-PCR) Assays for Burkholderia mallei and B. pseudomallei

    Science.gov (United States)

    2005-10-01

    1 Real - time PCR (RT-PCR) Assays for Burkholderia mallei and B. pseudomallei Vipin K. Rastogi1, Tu-chen Cheng1, Lisa Collins1 and Jennifer Bagley2 1...A 3. DATES COVERED - 4. TITLE AND SUBTITLE Real - time PCR (RT-PCR) Assays for Burkholderia mallei and B.pseudomallei 5a. CONTRACT NUMBER 5b...risk. There is currently no real - time PCR assay for detection of both of these pathogens. Primers and probes corresponding to specific genomic regions

  9. Tamizaje de deleciones en pacientes con distrofia muscular de Duchenne (DMD) o Becker-Kiener (BMD) mediante PCR multiplex en Costa Rica, 1998-2000

    OpenAIRE

    Sancho-Fernández, Vanessa M.; Saborio, Manuel; de Céspedes-Montealegre, Carlos; Azofeifa-Navas, Jorge

    2001-01-01

    Artículo científico -- Universidad de Costa Rica, Instituto de Investigaciones en Salud. 2001 Objetivo: Iniciar los estudios genético moleculares sobre las distrofinopatías en Costa Rica. Materiales y Métodos: Treinta y un pacientes varones, diagnosticados con distrofia muscular, que podrían ser distrofinopáticos fueron reevaluados clínicamente. Veintitrés mostraron un fenotipo de DMD y dos de BMD. Seis no mostraron síntomas definitivos de distrofinopatías. ADN de los pacientes fue analiza...

  10. Materiales conductores mediante funcionalización de polímeros con nanomateriales conductores

    OpenAIRE

    Gutierrez, Manuel; Llobera, Andreu; Fernández Sánchez, César; Jiménez Jorquera, Cecilia; Mendoza Gómez, Ernest

    2010-01-01

    La presente invención se refiere un material conductor que comprende un polímero funcionalizado y a un nanomaterial conductor unidos mediante enlace covalente. La invención también se refiere a un procedimiento de obtención del material conductor sin modificar las propiedades ópticas del polímero y a su uso para la fabricación de sensores o electrodos.

  11. Materiales conductores mediante funcionalización de polímeros con nanomateriales conductores

    OpenAIRE

    Gutierrez, Manuel; Llobera, Andreu; Fernández Sánchez, César; Jiménez Jorquera, Cecilia; Mendoza Gómez, Ernest

    2010-01-01

    La presente invención se refiere un material conductor que comprende un polímero funcionalizado y a un nanomaterial conductor unidos mediante enlace covalente. La invención también se refiere a un procedimiento de obtención del material conductor sin modificar las propiedades ópticas del polímero y a su uso para la fabricación de sensores o electrodos.

  12. Miglioramento del profilo biofarmaceutico dell'albendazolo mediante co-cristallizzazione

    OpenAIRE

    Pranzo, Marco Beniamino

    2010-01-01

    Lo scopo del presente lavoro di tesi è stato quello di studiare il possibile miglioramento del profilo biofarmaceutico dell’ albendazolo attraverso una modificazione delle proprietà chimico-fisiche del farmaco stesso. Tale obiettivo è stato perseguito mediante: - ricristallizzazione del farmaco in solventi differenti al fine di isolare eventuali polimorfi; - studio delle interazioni allo stato solido tra il farmaco e vari CCFs al fine di ottenere un co-cristallo con caratteristiche ...

  13. Material Biocompatibility for PCR Microfluidic Chips

    KAUST Repository

    Kodzius, Rimantas

    2010-04-23

    As part of the current miniaturization trend, biological reactions and processes are being adapted to microfluidics devices. PCR is the primary method employed in DNA amplification, its miniaturization is central to efforts to develop portable devices for diagnostics and testing purposes. A problem is the PCR-inhibitory effect due to interaction between PCR reagents and the surrounding environment, which effect is increased in high-surface-are-to-volume ration microfluidics. In this study, we evaluated the biocompatibility of various common materials employed in the fabrication of microfluidic chips, including silicon, several kinds of silicon oxide, glasses, plastics, wax, and adhesives. Two-temperature PCR was performed with these materials to determine their PCR-inhibitory effect. In most of the cases, addition of bovine serum albumin effectively improved the reaction yield. We also studied the individual PCR components from the standpoint of adsorption. Most of the materials did not inhibit the DNA, whereas they did show noticeable interaction with the DNA polymerase. Our test, instead of using microfluidic devices, can be easily conducted in common PCR tubes using a standard bench thermocycler. Our data supports an overview of the means by which the materials most bio-friendly to microfluidics can be selected.

  14. Quantitative DNA Analysis Using Droplet Digital PCR.

    Science.gov (United States)

    Vossen, Rolf H A M; White, Stefan J

    2017-01-01

    Droplet digital PCR (ddPCR) is based on the isolated amplification of thousands of individual DNA molecules simultaneously, with each molecule compartmentalized in a droplet. The presence of amplified product in each droplet is indicated by a fluorescent signal, and the proportion of positive droplets allows the precise quantification of a given sequence. In this chapter we briefly outline the basis of ddPCR, and describe two different applications using the Bio-Rad QX200 system: genotyping copy number variation and quantification of Illumina sequencing libraries.

  15. Determinación de la estructura poblacional de litopenaeus vannamei mediante issrs a lo largo de la costa ecuatoriana

    OpenAIRE

    Fresneda Rodríguez, Adriana

    2003-01-01

    Determinación de la estructura poblacional de Litopenaeus vannamei mediante ISSRs a lo largo de la costa ecuatoriana Muestras de Litopenaeus vannamei fueron colectadas en siete localidades a lo largo de la costa ecuatoriana desde Esmeraldas hasta Machala.

  16. Real time PCR. Application in dengue studies

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jeanette Prada-Arismendy

    2011-06-01

    Full Text Available PCR (polymerase chain reaction is a routinely used tool in every diagnostic and research laboratory. This technique has been used in detection of mutations and pathogens, forensic investigation, and even is the base tool for human genome sequencing. A modification of PCR technique, real time PCR, allows the quantification of nucleic acids with higher sensibility, specificity and reproducibility. This article is intended to clarify the foundations of real-time PCR, using an application model for virology. In the actual work, it was quantified the viral load of dengue virus serotype 2 produced from infected murine macrophages; the obtained results in this work established that murine strain BALB/c presents a greater susceptibility to dengue virus infection, which establishes BALB/c murine strain as a best model of study for investigation of dengue virus infection physiopathology.

  17. Fundamentals of multiplexing with digital PCR.

    Science.gov (United States)

    Whale, Alexandra S; Huggett, Jim F; Tzonev, Svilen

    2016-12-01

    Over the past decade numerous publications have demonstrated how digital PCR (dPCR) enables precise and sensitive quantification of nucleic acids in a wide range of applications in both healthcare and environmental analysis. This has occurred in parallel with the advances in partitioning fluidics that enable a reaction to be subdivided into an increasing number of partitions. As the majority of dPCR systems are based on detection in two discrete optical channels, most research to date has focused on quantification of one or two targets within a single reaction. Here we describe 'higher order multiplexing' that is the unique ability of dPCR to precisely measure more than two targets in the same reaction. Using examples, we describe the different types of duplex and multiplex reactions that can be achieved. We also describe essential experimental considerations to ensure accurate quantification of multiple targets.

  18. The potential advantages of digital PCR for clinical virology diagnostics.

    Science.gov (United States)

    Hall Sedlak, Ruth; Jerome, Keith R

    2014-05-01

    Digital PCR (dPCR), a new nucleic acid amplification technology, offers several potential advantages over real-time or quantitative PCR (qPCR), the current workhorse of clinical molecular virology diagnostics. Several studies have demonstrated dPCR assays for human cytomegalovirus or HIV, which give more precise and reproducible results than qPCR assays without sacrificing sensitivity. Here we review the literature comparing dPCR and qPCR performance in viral molecular diagnostic assays and offer perspective on the future of dPCR in clinical virology diagnostics.

  19. SIMULACIÓN DEL COLAPSO EN TÚNELES DOVELADOS MEDIANTE LA FORMACIÓN DE ARTICULACIONES EN VIGAS

    OpenAIRE

    Enrique Tenorio Montero; Gelacio Juárez Luna

    2013-01-01

    Se estudia el mecanismo de colapso en túneles construidos con dovelas mediante el método los de elementos finitos. Los túneles se discretizaron mediante elementos finitos viga, resortes longitudinales y rotacionales, estos últimos tienen la capacidad de simular el desarrollo de articulaciones y el comportamiento de las juntas longitudinales, considerando un comportamiento constitutivo momento-rotación de las dovelas. En los apoyos se colocaron resortes axiales elásticos que representan la rig...

  20. Transgene detection by digital droplet PCR.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Dirk A Moser

    Full Text Available Somatic gene therapy is a promising tool for the treatment of severe diseases. Because of its abuse potential for performance enhancement in sports, the World Anti-Doping Agency (WADA included the term 'gene doping' in the official list of banned substances and methods in 2004. Several nested PCR or qPCR-based strategies have been proposed that aim at detecting long-term presence of transgene in blood, but these strategies are hampered by technical limitations. We developed a digital droplet PCR (ddPCR protocol for Insulin-Like Growth Factor 1 (IGF1 detection and demonstrated its applicability monitoring 6 mice injected into skeletal muscle with AAV9-IGF1 elements and 2 controls over a 33-day period. A duplex ddPCR protocol for simultaneous detection of Insulin-Like Growth Factor 1 (IGF1 and Erythropoietin (EPO transgenic elements was created. A new DNA extraction procedure with target-orientated usage of restriction enzymes including on-column DNA-digestion was established. In vivo data revealed that IGF1 transgenic elements could be reliably detected for a 33-day period in DNA extracted from whole blood. In vitro data indicated feasibility of IGF1 and EPO detection by duplex ddPCR with high reliability and sensitivity. On-column DNA-digestion allowed for significantly improved target detection in downstream PCR-based approaches. As ddPCR provides absolute quantification, it ensures excellent day-to-day reproducibility. Therefore, we expect this technique to be used in diagnosing and monitoring of viral and bacterial infection, in detecting mutated DNA sequences as well as profiling for the presence of foreign genetic material in elite athletes in the future.

  1. Universally Primed PCR (UP-PCR) and its applications for taxonomy in Trichoderma

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    Mette Lübeck

    2004-01-01

    @@ Universally Primed PCR (UP-PCR) is a PCR fingerprinting method that has demonstrated its applicability in different aspects of mycology. These applications constitute analysis of genome structures, identification of species, analysis of population and species diversity, revealing of genetic relatedness at infra-and inter-species level, and identification of UP-PCR markers at different taxonomic levels (strain, group and/or species) . A further development of the UP-PCR technique is an UP-PCR product cross hybridisation assay that facilitates investigation of sequence similarity (homology) of UP-PCR products and grouping of strains into UP-PCR hybridisation groups. This separates the strains into entities with high genetic similarity (DNA homology) . UP-PCR has been used as an aid in taxonomy and species delineation, and to monitor biocontrol strains following their release into the environment by fingerprint characterisation of pure cultures and through direct detection in soil by amplification of UP-PCR-derived SCAR markers. The technique has been applied to Trichoderma strains in particularly with the aims of strain recognition and classification.

  2. A naked-eye colorimetric "PCR developer"

    Science.gov (United States)

    Valentini, Paola; Pompa, Pier Paolo

    2016-04-01

    Despite several advances in molecular biology and diagnostics, Polymerase Chain Reaction (PCR) is currently the gold standard for nucleic acids amplification and detection, due to its versatility, low-cost and universality, with estimated market of several billion dollars/year. Nevertheless, PCR still relies on the laborious, time-consuming, and multi-step gel electrophoresis-based detection, which includes gel casting, electrophoretic run, gel staining, and gel visualization. In this work, we propose a "PCR developer", namely a universal one-step, one-tube method, based on controlled aggregation of gold nanoparticles (AuNPs), to detect PCR products by naked eye in few minutes, with no need for any instrumentation. We demonstrated the specificity and sensitivity of the PCR developer on different model targets, suitable for a qualitative detection in real-world diagnostics (i.e., gene rearrangements, genetically modified organisms, and pathogens). The PCR developer proved to be highly specific and ultra-sensitive, discriminating down to few copies of HIV viral DNA, diluted in an excess of interfering human genomic DNA, which is a clinically relevant viral load. Hence, it could be a valuable tool for both academic research and clinical applications.

  3. Determination of PCR efficiency in chelex-100 purified clinical samples and comparison of real-time quantitative PCR and conventional PCR for detection of Chlamydia pneumoniae

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jensen Jørgen

    2002-07-01

    Full Text Available Abstract Background Chlamydia pneumoniae infection has been detected by serological methods, but PCR is gaining more interest. A number of different PCR assays have been developed and some are used in combination with serology for diagnosis. Real-time PCR could be an attractive new PCR method; therefore it must be evaluated and compared to conventional PCR methods. Results We compared the performance of a newly developed real-time PCR with a conventional PCR method for detection of C. pneumoniae. The PCR methods were tested on reference samples containing C. pneumoniae DNA and on 136 nasopharyngeal samples from patients with a chronic cough. We found the same detection limit for the two methods and that clinical performance was equal for the real-time PCR and for the conventional PCR method, although only three samples tested positive. To investigate whether the low prevalence of C. pneumoniae among patients with a chronic cough was caused by suboptimal PCR efficiency in the samples, PCR efficiency was determined based on the real-time PCR. Seventeen of twenty randomly selected clinical samples had a similar PCR efficiency to samples containing pure genomic C. pneumoniae DNA. Conclusions These results indicate that the performance of real-time PCR is comparable to that of conventional PCR, but that needs to be confirmed further. Real-time PCR can be used to investigate the PCR efficiency which gives a rough estimate of how well the real-time PCR assay works in a specific sample type. Suboptimal PCR efficiency of PCR is not a likely explanation for the low positivity rate of C. pneumoniae in patients with a chronic cough.

  4. Capacidad discriminatoria y concordancia entre el ELISA-F29 y la PCR en individuos con infección por T. cruzi / Discriminatory Power and Concordance between ELISA-F29 and PCR in Individuals with Infection due to T.cruzi / Capacidade discriminatória e acordo entre o ELISA-F29 e a PCR em indivíduos infectados com T. cruzi

    OpenAIRE

    Edgar David Gómez-Laitón, MD.; Laura Andrea Polo-Ardila, Enf.; Yeny Zulay Castellanos-Domínguez, Bact., Esp., MsC; Víctor Mauricio Herrera-Galindo, MD., MSc., PhD.; Juan Carlos Villar-Centeno, MD., Esp., MSc., PhD

    2015-01-01

    Introducción: El diagnóstico de la infección por Trypanosoma cruzi (T. cruzi) se realiza rutinariamente mediante pruebas serológicas mientras que el empleo de métodos moleculares se encuentra aún en proceso de estandarización. Objetivo: Evaluar la capacidad discriminatoria y concordancia entre una prueba serológica y una molecular para determinar la infección por T. cruzi. Métodos: Se realizó Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) y la prueba de ELISA-F29 en 95 muestras de participantes d...

  5. Cryogenic VPH gratings for the CELT/TMT

    Science.gov (United States)

    Blais-Ouellette, Sebastien; Guzman, Dani; Elgamil, Amal; Rallison, Richard

    2004-09-01

    Characterization of Volume Phase Holographic gratings at cryogenic temperatures have been conducted using a new test facility at Caltech. The new test bench includes a cryostat that allows large angles for incident and diffracted light. Gratings under tests are shielded from thermal background, and precisely and uniformly temperature controlled. Preliminary results are presented and show little temperature dependence of the efficiency function.

  6. New, Efficient High-Resolution Red VPH Grisms in VIMOS

    Science.gov (United States)

    Marconi, Gianni; Bagnulo, Stefano; Lizon, Jean-Louis; Buzzoni, Bernard; Dekker, Hans; D'Odorico, Sandro; Izzo, Carlo; Wolff, Burkhard F.

    2006-06-01

    VIMOS is the visible (360 to 1000 nm) wide-field imager and multi-object spectrograph mounted on the Nasmyth focus B of Melipal (UT3) (Le Fèvre et al. 2003). The instrument is comprised of four identical arms each with a field of view of 7' × 8' with a 0.205' pixel size and a gap between each quadrant of ~ 2'. Each arm is equipped with six grisms providing a spectral resolution range from ~ 200-2500 and with an EEV 44-82, thinned, anti-reflection coated, 4k × 2k pixel CCD. VIMOS operates in three different modes: Imaging (IMG), Multi-Object Spectroscopy (MOS), and with Integral Field Unit (IFU). For a summary of the instrument capability and performance, see http://www.eso.org/instruments/vimos/.

  7. Specific PCR and real-time PCR assays for detection and quantitation of 'Candidatus Phytoplasma phoenicium'.

    Science.gov (United States)

    Jawhari, Maan; Abrahamian, Peter; Sater, Ali Abdel; Sobh, Hana; Tawidian, Patil; Abou-Jawdah, Yusuf

    2015-02-01

    Almond witches' broom (AlmWB) is a fast-spreading lethal disease of almond, peach and nectarine associated with 'Candidatus Phytoplasma phoenicium'. The development of PCR and quantitative real-time PCR (qPCR) assays for the sensitive and specific detection of the phytoplasma is of prime importance for early detection of 'Ca. P. phoenicium' and for epidemiological studies. The developed qPCR assay herein uses a TaqMan(®) probe labeled with Black Hole Quencher Plus. The specificity of the PCR and that of the qPCR detection protocols were tested on 17 phytoplasma isolates belonging to 11 phytoplasma 16S rRNA groups, on samples of almond, peach, nectarine, native plants and insects infected or uninfected with the phytoplasma. The developed assays showed high specificity against 'Ca. P. phoenicium' and no cross-reactivity against any other phytoplasma, plant or insect tested. The sensitivity of the developed PCR and qPCR assays was similar to the conventional nested PCR protocol using universal primers. The qPCR assay was further validated by quantitating AlmWB phytoplasma in different hosts, plant parts and potential insect vectors. The highest titers of 'Ca. P. phoenicium' were detected in the phloem tissues of stems and roots of almond and nectarine trees, where they averaged from 10(5) to 10(6) genomic units per nanogram of host DNA (GU/ng of DNA). The newly developed PCR and qPCR protocols are reliable, specific and sensitive methods that are easily applicable to high-throughput diagnosis of AlmWB in plants and insects and can be used for surveys of potential vectors and alternative hosts.

  8. Signal and noise in bridging PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Thaler David S

    2002-07-01

    Full Text Available Abstract Background In a variant of the standard PCR reaction termed bridging, or jumping, PCR the primer-bound sequences are originally on separate template molecules. Bridging can occur if, and only if, the templates contain a region of sequence similarity. A 3' end of synthesis in one round of synthesis that terminates in this region of similarity can prime on the other. In principle, Bridging PCR (BPCR can detect a subpopulation of one template that terminates synthesis in the region of sequence shared by the other template. This study considers the sensitivity and noise of BPCR as a quantitative assay for backbone interruptions. Bridging synthesis is also important to some methods for computing with DNA. Results In this study, BPCR was tested over a 328 base pair segment of the E. coli lac operon and a signal to noise ratio (S/N of approximately 10 was obtained under normal PCR conditions with Taq polymerase. With special precautions in the case of Taq or by using the Stoffel fragment the S/N was improved to 100, i.e. 1 part of cut input DNA yielded the same output as 100 parts of intact input DNA. Conclusions In the E. coli lac operator region studied here, depending on details of protocol, between 3 and 30% per kilobase of final PCR product resulted from bridging. Other systems are expected to differ in the proportion of product that is bridged consequent to PCR protocol and the sequence analyzed. In many cases physical bridging during PCR will have no informational consequence because the bridged templates are of identical sequence, but in a number of special cases bridging creates, or, destroys, information.

  9. A method for amplification of unknown flanking sequences based on touchdown PCR and suppression-PCR.

    Science.gov (United States)

    Gao, Song; He, Dan; Li, Guangquan; Zhang, Yanhua; Lv, Huiying; Wang, Li

    2016-09-15

    Thermal asymmetric staggered PCR is the most widely used technique to obtain the flanking sequences. However, it has some limitations, including a low rate of positivity, and complex operation. In this study, a improved method of it was made based on suppression-PCR and touchdown PCR. The PCR fragment obtained by the amplification was used directly for sequencing after gel purification. Using this improved method, the positive rate of amplified flanking sequences of the ATMT mutants reached 99%. In addition, the time from DNA extraction to flanking sequence analysis was shortened to 2 days with about 6 dollars each sample.

  10. Evaluation of Altona Diagnostics RealStar Zika Virus Reverse Transcription-PCR Test Kit for Zika Virus PCR Testing.

    Science.gov (United States)

    L'Huillier, Arnaud G; Lombos, Ernesto; Tang, Elaine; Perusini, Stephen; Eshaghi, Alireza; Nagra, Sandeep; Frantz, Christine; Olsha, Romy; Kristjanson, Erik; Dimitrova, Kristina; Safronetz, David; Drebot, Mike; Gubbay, Jonathan B

    2017-05-01

    With the emerging Zika virus (ZIKV) epidemic, accessible real-time reverse transcription-PCR (rRT-PCR) assays are needed to streamline testing. The commercial Altona Diagnostics RealStar ZIKV rRT-PCR test kit (Altona PCR) has been approved for emergency use authorization by the U.S. FDA. Our aim was to verify the Altona PCR by comparing it to the CDC-designed dual-target ZIKV rRT-PCR reference assay (reference PCR) and describe the demographics of patients tested for ZIKV by rRT-PCR in Ontario, Canada. A large set of clinical specimens was tested for ZIKV by the Altona PCR and the reference PCR. Positive or equivocal specimens underwent PCR and Sanger sequencing targeting the ZIKV NS5 gene. A total of 671 serum specimens were tested by the reference PCR: 58 (8.6%) were positive, 193 (28.8%) were equivocal, and 420 (62.6%) were negative. Ninety percent of the reference PCR-positive patients were tested in the first 5 days after symptom onset. The Altona PCR was performed on 284/671 specimens tested by the reference PCR. The Altona PCR was positive for 53/58 (91%) reference PCR-positive specimens and 16/193 (8%) reference PCR-equivocal specimens; the ZIKV NS5 PCR was positive for all 68 Altona PCR-positive specimens and negative for all 181 Altona PCR-negative specimens that underwent the NS5 PCR. The Altona PCR has very good sensitivity (91%) and specificity (97%) compared to the reference PCR. The Altona PCR can be used for ZIKV diagnostic testing and has less extensive verification requirements than a laboratory-developed test. Copyright © 2017 American Society for Microbiology.

  11. PCR+ In Diesel Fuels and Emissions Research

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    McAdams, H.T.

    2002-04-15

    In past work for the U.S. Department of Energy (DOE) and Oak Ridge National Laboratory (ORNL), PCR+ was developed as an alternative methodology for building statistical models. PCR+ is an extension of Principal Components Regression (PCR), in which the eigenvectors resulting from Principal Components Analysis (PCA) are used as predictor variables in regression analysis. The work was motivated by the observation that most heavy-duty diesel (HDD) engine research was conducted with test fuels that had been ''concocted'' in the laboratory to vary selected fuel properties in isolation from each other. This approach departs markedly from the real world, where the reformulation of diesel fuels for almost any purpose leads to changes in a number of interrelated properties. In this work, we present new information regarding the problems encountered in the conventional approach to model-building and how the PCR+ method can be used to improve research on the relationship between fuel characteristics and engine emissions. We also discuss how PCR+ can be applied to a variety of other research problems related to diesel fuels.

  12. PCR+ In Diesel Fuels and Emissions Research

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    McAdams, H.T.

    2002-04-15

    In past work for the U.S. Department of Energy (DOE) and Oak Ridge National Laboratory (ORNL), PCR+ was developed as an alternative methodology for building statistical models. PCR+ is an extension of Principal Components Regression (PCR), in which the eigenvectors resulting from Principal Components Analysis (PCA) are used as predictor variables in regression analysis. The work was motivated by the observation that most heavy-duty diesel (HDD) engine research was conducted with test fuels that had been ''concocted'' in the laboratory to vary selected fuel properties in isolation from each other. This approach departs markedly from the real world, where the reformulation of diesel fuels for almost any purpose leads to changes in a number of interrelated properties. In this work, we present new information regarding the problems encountered in the conventional approach to model-building and how the PCR+ method can be used to improve research on the relationship between fuel characteristics and engine emissions. We also discuss how PCR+ can be applied to a variety of other research problems related to diesel fuels.

  13. Resolución de equivalencias financieras mediante ecuaciones con coeficientes borrosos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Maria Silvia Moriñigo

    2007-01-01

    Full Text Available A menudo sólo se conocen estimaciones de las variables financieras. Es usual que con objeto de utilizar modelos clásicos, apreciaciones como “una tasa de entre el 5% y el 7%”, se conviertan en cantidades exactas, como puede ser el promedio entre los valores extremos. En este trabajo se propone un enfoque más flexible que permite captar la incertidumbre mediante la utilización de algunos elementos de la teoría de los conjuntos borrosos. La imprecisión presente en el capital, interés y/o cantidad de períodos se modela mediante números borrosos triangulares. Al apelar a los enfoques clásicos para evaluar expresiones algebraicas con coeficientes borrosos que hacen uso del principio de extensión y aritmética de -cortes, se definen las extensiones fuzzy de las relaciones financieras elementales. Se obtienen las versiones fuzzy del valor actual y del valor final de un capital borroso y el VAN mediante la resolución de ecuaciones con coeficientes borrosos por el método de α - cortes. Estos desarrollos se aplican a distintos casos de estudio. Por último, se muestra que no siempre es posible hallar un análogo borroso de la TIR utilizando los métodos clásicos de resolución de ecuaciones con coeficientes borrosos. Se calcula valiéndose de un nuevo concepto de solución

  14. Gluteoplastia tridimensional mediante distribución volumétrica precisa

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    R. Alfonso Vallarta-Rodríguez

    Full Text Available Introducción y objetivo. La gluteoplastia mediante lipoinyección debe ser una cirugía segura que partiendo de una planificación adecuada, permita un aumento moderado enfatizando contornos y mejorando la forma natural de la región glútea. Debe permitir obtener resultados predecibles, duraderos y reproducibles, además de ser aplicable en una amplia variedad de pacientes. Presentamos un método de gluteoplastia de aumento sistematizada con lipoinyección que además de ser reproducible, permite obtener resultados consistentes, naturales y permanentes, distribuyendo estratégicamente volúmenes en cuadrantes. Pacientes y Método. Con mínima manipulación del lipoaspirado, infiltramos cantidades controladas en 9 cuadrantes en cada nalga. El cuadrante central representa la zona de máxima proyección y recibe la mitad del volumen. Denominamos zonas primarias a los 4 cuadrantes en los ejes X-Y, zonas que reciben el 40% del volumen infiltrado. Las zonas secundarias o menores corresponden a los cuadrantes situados entre los cuadrantes principales, y reciben el 10% del volumen total. Resultados. Entre 2008 y 2013 intervenimos a 75 pacientes para aumento y remodelación de glúteos con la técnica descrita, todas mujeres de 24 a 52 años. Las pacientes presentaron una convalecencia favorable y una satisfacción del 93%. Nueve pacientes presentaron seromas que se resolvieron mediante aspiración en consultorio. No se presentaron complicaciones mayores. Conclusiones. Presentamos un método de remodelación glútea mediante lipoinyección que, además de ofrecer excelentes resultados, predecibles, consistentes, naturales y permanentes, es lógico y reproducible.

  15. Direct Chromatin PCR (DC-PCR): Hypotonic Conditions Allow Differentiation of Chromatin States during Thermal Cycling

    Science.gov (United States)

    Vatolin, Sergei; Khan, Shahper N.; Reu, Frederic J.

    2012-01-01

    Current methods to study chromatin configuration are not well suited for high throughput drug screening since they require large cell numbers and multiple experimental steps that include centrifugation for isolation of nuclei or DNA. Here we show that site specific chromatin analysis can be achieved in one step by simply performing direct chromatin PCR (DC-PCR) on cells. The basic underlying observation was that standard hypotonic PCR buffers prevent global cellular chromatin solubilization during thermal cycling while more loosely organized chromatin can be amplified. Despite repeated heating to >90°C, 41 of 61 tested 5′ sequences of silenced genes (CDKN2A, PU.1, IRF4, FOSB, CD34) were not amplifiable while 47 could be amplified from expressing cells. Two gene regions (IRF4, FOSB) even required pre-heating of cells in isotonic media to allow this differentiation; otherwise none of 19 assayed sequences yielded PCR products. Cells with baseline expression or epigenetic reactivation gave similar DC-PCR results. Silencing during differentiation of CD34 positive cord blood cells closed respective chromatin while treatment of myeloma cells with an IRF4 transcriptional inhibitor opened a site to DC-PCR that was occupied by RNA polymerase II and NFκB as determined by ChIP. Translation into real-time PCR can not be achieved with commercial real-time PCR buffers which potently open chromatin, but even with simple ethidium bromide addition to standard PCR mastermix we were able to identify hits in small molecules screens that suppressed IRF4 expression or reactivated CDKN2A in myeloma cells using densitometry or visual inspection of PCR plates under UV light. While need in drug development inspired this work, application to genome-wide analysis appears feasible using phi29 for selective amplification of open cellular chromatin followed by library construction from supernatants since such supernatants yielded similar results as gene specific DC-PCR. PMID:22984542

  16. Direct chromatin PCR (DC-PCR: hypotonic conditions allow differentiation of chromatin states during thermal cycling.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Sergei Vatolin

    Full Text Available Current methods to study chromatin configuration are not well suited for high throughput drug screening since they require large cell numbers and multiple experimental steps that include centrifugation for isolation of nuclei or DNA. Here we show that site specific chromatin analysis can be achieved in one step by simply performing direct chromatin PCR (DC-PCR on cells. The basic underlying observation was that standard hypotonic PCR buffers prevent global cellular chromatin solubilization during thermal cycling while more loosely organized chromatin can be amplified. Despite repeated heating to >90 °C, 41 of 61 tested 5' sequences of silenced genes (CDKN2A, PU.1, IRF4, FOSB, CD34 were not amplifiable while 47 could be amplified from expressing cells. Two gene regions (IRF4, FOSB even required pre-heating of cells in isotonic media to allow this differentiation; otherwise none of 19 assayed sequences yielded PCR products. Cells with baseline expression or epigenetic reactivation gave similar DC-PCR results. Silencing during differentiation of CD34 positive cord blood cells closed respective chromatin while treatment of myeloma cells with an IRF4 transcriptional inhibitor opened a site to DC-PCR that was occupied by RNA polymerase II and NFκB as determined by ChIP. Translation into real-time PCR can not be achieved with commercial real-time PCR buffers which potently open chromatin, but even with simple ethidium bromide addition to standard PCR mastermix we were able to identify hits in small molecules screens that suppressed IRF4 expression or reactivated CDKN2A in myeloma cells using densitometry or visual inspection of PCR plates under UV light. While need in drug development inspired this work, application to genome-wide analysis appears feasible using phi29 for selective amplification of open cellular chromatin followed by library construction from supernatants since such supernatants yielded similar results as gene specific DC-PCR.

  17. Clasificación automática mediante la CDU con el procedimiento en cadena

    OpenAIRE

    San Segundo Manuel, Rosa

    2002-01-01

    Actas de las I Jornadas de Tratamiento y Recuperación de Información (JOTRI), Valencia, España, 4-5 julio 2002 Se entiende por clasificación automática el proceso de agrupar según el contenido las referencias de los documentos o bien los propios documentos electróneos. Este proceso se realiza mediante programas capaces de comparar términos empleados utilizados en el documento. E incluso hay otras formas automáticas de clasificación que emplean procedimientos auto...

  18. Aprendizaje de procesos analíticos mediante clases prácticas con laboratorios virtuales

    OpenAIRE

    Sierra Fernández, J.; J. Bosque Sendra; García Campaña, A.; Blanc García, R.; Del Iruela, M.; Gámiz Gracia, L.; Alés Barrero, F.

    2009-01-01

    Este trabajo forma parte de un proyecto de innovación docente financiado por la Universidad de Granada durante el curso 2008-09 y pretende que el alumnado del Departamento de Química Analítica de los primeros cursos de Química, Ingeniería Química, Ciencias Ambientales y Farmacia sea capaz de interrelacionar los aspectos teóricos y prácticos de diversos procesos analíticos mediante el uso de laboratorios virtuales en las sesiones prácticas. Con este fin, las clases prácticas son planificadas y...

  19. Clasificación automática mediante la CDU con el procedimiento en cadena

    OpenAIRE

    San Segundo Manuel, Rosa

    2002-01-01

    Actas de las I Jornadas de Tratamiento y Recuperación de Información (JOTRI), Valencia, España, 4-5 julio 2002 Se entiende por clasificación automática el proceso de agrupar según el contenido las referencias de los documentos o bien los propios documentos electróneos. Este proceso se realiza mediante programas capaces de comparar términos empleados utilizados en el documento. E incluso hay otras formas automáticas de clasificación que emplean procedimientos auto...

  20. DESULFURACIÓN DE RELAVE MEDIANTE LA FLOTACIÓN DE SULFUROS DE HIERRO

    OpenAIRE

    Luis Valderrama Campusano; B. Zazzali; J. Chamorro; Santander, M.

    2015-01-01

    En Chile la minería se desarrolla principalmente en  la concentración de cobre, molibdeno, oro y plata, mediante el proceso de flotación. Este genera grandes tonelajes de relaves que contienen diversas minerales, principalmente pirita. Dado que estos minerales se depositan en los tranques, estos pueden generar aguas ácidas; se propone como alternativa la desulfuración de los súlfuros por flotación. En una primera parte se estudió la flotabilidad de la pirita en un tubo Hallimond, utilizando c...

  1. PREDICCION DE PROPIEDADES DE MEZCLAS GASOLINA-ETANOL MEDIANTE ESPECTROSCOPIA DE INFRARROJO

    OpenAIRE

    Felipe Sánchez-Minero; Edgar Ramirez-Jimenez; Guadalupe Silva-Oliver; Berenice Hernandez-Castillejos

    2013-01-01

    El efecto del etanol en la reformulación de una gasolina fue estudiado mediante espectroscopia de infrarrojo (IR). Para ello, se prepararon seis mezclas gasolina-etanol con diferente contenido de alcohol (0, 20, 40, 60, 80 y 100% volumen). Los espectros IR de estas mezclas fueron obtenidos en la región de 4000 a 850 cm -1. A continuación, se determinó un factor característico del etanol (F CO), el cual relaciona el área bajo la curva de la banda a 1050 cm-1 y el área bajo la curva total del e...

  2. Diseño de una banda transportadora mediante guide de Matlab

    OpenAIRE

    Salinero Gervaso, Mario

    2013-01-01

    El objetivo principal del presente proyecto, es la elaboración de un programa para diseñar una banda transportadora mediante GUIDE de MatLab, conforme a las normas: DIN 22101, ISO 5048 y UNE 58204. Otro objetivo (secundario), por el que se ha desarrollado este software, es ayudar a los estudiantes de Ingeniería Industrial en el cálculo y diseño de una cinta transportador, para así facilitarles el entendimiento de parte del temario de la asignatura de "Transportes en la Ingen...

  3. Caracterización de bacterias aisladas en larvas de p.v. mediante rapds

    OpenAIRE

    Cedeño, Ricardo

    2003-01-01

    Caracterización de bacterias aisladas en larvas de P.V. mediante RAPDs La “Vibriosis luminiscente” reportada por varios laboratorios de larvas del Ecuador es asociada principalmente a la bacteria Vibrio harveyi. Los métodos de identificación bacteriana tradicionales se basan en la observación de características morfológicas y pruebas bioquímicas, sin embargo la identificación de especies bacterianas y en especial de Vibrios ambientales ha presentado ciertas dificultades debido al tiempo qu...

  4. PROMOCIÓN DE LA LECTURA E IDENTIDAD DEPORTIVA MEDIANTE TEXTOS DE HISTORIA DEL DEPORTE

    OpenAIRE

    2016-01-01

    En el artículo se expone una experiencia de promoción de la lectura desarrollada mediante un proyecto conjunto de la Facultad de Cultura Física y la biblioteca de la Universidad de Las Tunas. Se fundamenta en aspectos teóricos de la promoción de la lectura y de la identidad deportiva, ambas variables tienen salida práctica en actividades donde confluyen diversas manifestaciones del arte y la literatura con la actividad física y el deporte. El objetivo del trabajo consiste en reflexionar en to...

  5. Terapia de exposición mediante Realidad Virtual en los trastornos alimentarios: presente y futuro

    OpenAIRE

    Ferran Vilalta Abella; Jana Pla Sanjuanelo; Marta Ferrer García; José Gutiérrez Maldonado

    2015-01-01

    El objetivo de este trabajo fue revisar el uso de la realidad virtual (RV) como técnica de exposición para el tratamiento de los trastornos de la conducta alimentaria (TCA). Para ello se analizó la literatura existente con el fin de responder a dos cuestiones: primero, ¿existe evidencia sobre la capacidad de los entornos y estímulos virtuales para provocar respuestas de ansiedad y craving en pacientes con TCA?; y, segundo, ¿la aplicación de técnicas de exposición mediante RV permite la dismin...

  6. Ensayo no destructivo de soldaduras en pernos conectores mediante inspección acústica

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Aznar, A.

    2012-09-01

    Full Text Available Headed studs are nowadays the standard steel-concrete connectors because of their competitive advantages. Firstly, they provide a high degree of safety thanks to semiautomatic electric arc welding. These welds are not suitable for typical non-destructive tests. The analytical study comprises several models. The first vibration modes have been obtained. The experimental research has developed first the measurement of the natural frequencies of 28 headed-studs in the sonic range. Then they have been tested by non-destructive and destructive tests. Finally theirs tests have been compared with their respective frequency measurements. A clear relationship between the measured frequencies and the lack of penetration of the welds has been established, that confirms the analytical prediction of this effect of the internal weld imperfections. Therefore, the feasibility of simple and absolutely non-destructive tests of welded studs by in site measurement of natural frequencies in the sonic range has been clearly established in this work.

    Los pernos conectores aportan múltiples ventajas de uso, entre las que se encuentra el elevado margen de seguridad que ofrecen sus soldaduras ejecutadas mediante arco eléctrico. Estas soldaduras, aunque ampliamente fiables, son difícilmente comprobadas mediante ensayos no destructivos. El presente estudio plantea la inspección de soldaduras de pernos conectores mediante su espectro acústico. Analíticamente, la investigación se ha centrado en el cálculo de los primeros modos propios de vibración. Experimentalmente se han medido las frecuencias propias de resonancia de 28 pernos, en los que posteriormente se han llevado a cabo ensayos tanto no destructivos como destructivos. Se ha obtenido, tanto teórica como experimentalmente, una relación entre la frecuencia de vibración de los pernos conectores y la calidad de la soldadura. Por ello se verifica la posibilidad de inspección de estas

  7. Tratamiento del tortícolis congénito mediante control estimular y fisioterapia

    OpenAIRE

    MARÍA ASUNCIÓN VÁZQUEZ VILÀ; SUSANA COLLADO VÁZQUEZ

    2004-01-01

    Presentamos un caso clínico de tortícolis congénito y su tratamiento mediante control estimular y fisioterapia, por la alta frecuencia del tortícolis en la práctica clínica y por los buenos resultados que en general presenta el tratamiento conservador en estos casos, principalmente cuando éste se inicia de forma precoz. El caso presentado es de una niña con tortícolis congénito izquierdo, sin patologías asociadas, en tratamiento desde los 15 días hasta los nueve meses de edad, con una buena e...

  8. Determinacion mediante termografía de la reflectancia infrarroja de materiales especulares

    OpenAIRE

    Hongn, Marcos Ezequiel; Flores Larsen, Silvana Elinor

    2017-01-01

    En este trabajo se presenta una metodología experimental destinada a la medición de la reflectancia especular en el rango del IR lejano, mediante la utilización de una cámara termográfica. Las medidas se realizaron para muestras especulares de dos tipos diferentes: con soporte de vidrio y reflectores metálicos. Se estudiaron espejos de distintos espesores y calidad de vidrio, vidrios claros, acrílico y una placa de aluminio. Se determinó la reflectancia infrarroja de estos materiales para dis...

  9. Análisis de corrientes en una red neuronal conectada mediante Gap junctions

    OpenAIRE

    Yustres Díaz, Miguel

    2015-01-01

    La conexión de neuronas mediante sinapsis eléctricas proporciona una mayor velocidad de transmisión sináptica y la capacidad de sincronizar grupos de células para coordinar su actividad. Este tipo de sinapsis permite el intercambio de información continua entre neuronas, no solo cuando se producen potenciales de acción. Dependiendo de la magnitud del acoplamiento, esta sincronización afecta a la actividad sub-umbral y a los potenciales de acción. Un exceso en la sincronización de las neuronas...

  10. Materiales de carbono para desalinización de aguas mediante desionización capacitiva

    OpenAIRE

    Díaz Baizán, Patricia

    2012-01-01

    El presente trabajo muestra los resultados obtenidos al emplear materiales de carbono de elevada área superficial en el proceso de desalinización de aguas mediante desionización capacitiva (CDI). Esta técnica electroquímica, basada en la formación de la doble capa eléctrica en la interfase electrodo/electrolito para retener las sales presentes en el agua tratada, es una alternativa energéticamente menos costosa a las tecnologías comúnmente empleadas como son la ósmosis inversa y la destilació...

  11. Inversion Analytics : Análisis sobre rentabilidad de inversiones mediante VAN y TIR

    OpenAIRE

    Bande Firvida, David

    2010-01-01

    Inversion Analytics es una herramienta para facilitar el análisis en inversiones que se planteen en pequeñas, medianas y grandes empresas, en el que se plasmará toda la información necesaria para determinar los valores que entran en juego en la inversión. La aplicación realiza esta función mediante el cálculo de VAN (Valor Actual Neto) y TIR (Tasa Interna de Rentabilidad) de una inversión determinada, a partir de la información introducida por el usuario y teniendo en cuenta los distintos mét...

  12. Regeneración ósea mediante estímulos mecánicos

    OpenAIRE

    Cocera Castillo, Daniel

    2013-01-01

    RESUMEN: Recientes investigaciones sugieren que la estimulación mecánica del tejido óseo puede provocar la regeneración y el refuerzo del mismo. A partir de esta hipótesis, se han analizado las distintas posibilidades de tratamiento o entrenamiento del hueso mediante técnicas manuales. Entre los resultados más destacables se encuentran como las cargas mecánicas son las responsables de una mejor salud del hueso, siendo capaces de ayudar en la regeneración de fracturas y aumentar la densidad en...

  13. Equipos de trabajo en Contabilidad Financiera para el registro de operaciones mediante documentos reales

    OpenAIRE

    Albelda Pérez, Esther; Florez-Lopez, Raquel

    2012-01-01

    Este trabajo presenta una experiencia de innovación docente mediante la creación de equipos de trabajo para el desarrollo del registro contable de las operaciones más habituales en la práctica empresarial, a través del análisis e interpretación de los documentos reales que justifican dichas operaciones. Esta intervención educativa se puso en práctica durante el segundo cuatrimestre del curso 2008/2009 en la asignatura de Contabilidad Financiera y Analítica del primer curso de la Licenciatura ...

  14. Superación de la dislexia mediante técnicas operantes

    OpenAIRE

    Bernardo Gutiérrez, Inmaculada; Pérez Álvarez, Marino

    1993-01-01

    Numerosos trabajos e investigaciones han tratado de establecer una relación casi causal entre los déficits psicomotrices – lateralidad, orientación, ritmo, etc. – y la dislexia. El presente estudio se dirige a analizar mediante una intervención experimental esta supuesta relación, sobre ta que se sustenta, por otra parte, el tratamiento psicoeducativo tradicional. Se ha aplicado, así, una intervención psicomotriz (paquete terapéutico estándar) y otra conductual (específicamente lectora) a una...

  15. Aprendizaje de procesos analíticos mediante clases prácticas con laboratorios virtuales

    OpenAIRE

    Sierra Fernández, J.

    2009-01-01

    Este trabajo forma parte de un proyecto de innovación docente financiado por la Universidad de Granada durante el curso 2008-09 y pretende que el alumnado del Departamento de Química Analítica de los primeros cursos de Química, Ingeniería Química, Ciencias Ambientales y Farmacia sea capaz de interrelacionar los aspectos teóricos y prácticos de diversos procesos analíticos mediante el uso de laboratorios virtuales en las sesiones prácticas. Con este fin, las clases prácticas son planificadas y...

  16. Conocer el valor de la expresión corporal mediante la danza

    OpenAIRE

    Ochoa Ullate, Garbiñe

    2014-01-01

    Mediante este trabajo se pretende trabajar una serie de actividades y ejercicios para conocer la expresión corporal y la salud a través de de diferentes danzas africanas. Para la realización del trabajo se analizan las principales aportaciones pedagógicas de varios autores relacionados con la enseñanza de estos conceptos. Se trata de un trabajo empírico, con el cual se pretende analizar y estudiar los resultados de la propuesta didáctica para llegar a unas conclusiones acerca de si el ámbi...

  17. Diagnóstico de hiperreactividad bronquial en deportistas mediante el valor del PC20

    OpenAIRE

    Martín-Fernández, M. C.; Melero-Romero, C.; J.R. Alvero-Cruz

    2014-01-01

    En este trabajo se exponen los criterios de positividad del Comité Olímpico Internacional versus a la Sociedad Española de Neumología y Cirugía Torácica. Participaron en este estudio ochenta deportistas de alto rendimiento, realizando una historia clínica, una espirometría de reposo y un test de metacolina. Se analiza la sensibilidad y especificidad del test de metacolina mediante curvas ROC. El comité Internacional antidopaje (WADA) requiere que la disminución sea con un PC20 < a 4mg/ml, ...

  18. Diagnosis of Cutaneous Leishmaniasis by Multiplex PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    M Heiat

    2010-07-01

    Full Text Available Introduction: Annually, more than 14 million people are reported to be infected with Leishmaniasis all over the world. In Iran, this disease is seen in the form of cutaneous and visceral leishmaniasis, of which the cutaneous form is more wide spread. In recent years, cutaneous leishmaniaisis is diagnosed by PCR utilizing specific primers in order to amplify different parasite genes including ribosomal RNA genes, kinetoplast DNA or tandem repeating sequences. The aim of this research was to detect early stage cutaneous leishmaniasis using Multiplex-PCR technique. Methods: In this study, 67 samples were prepared from patients with cutaneous leishmaniasis. DNA was extracted with phenolchloroform. Each specimen was analyzed using two different pairs of PCR primers. The sensitivity of each PCR was optimized on pure Leishmania DNA prior to use for diagnosis. Two standard parasites L. major and L. tropica were used as positive control. Results: DNA amplification fragments were two 115 bp and 683 bp for AB and UL primers, respectively. The sensitivity of two primers was not equal for detection of L. major and L. tropica. The sensivity of PCR with AB primer was 35 cells, while that for UL primer was 40 cells. Conclusion: The results of this study indicate that PCR is a sensitive diagnostic assay for cutaneous leishmaniasis and could be employed as the new standard for routine diagnosis when species identification is not required. However, the ability to identify species is especially important in prognosis of the disease and in deciding appropriate therapy, especially in regions where more than one type of species and disease are seen by clinicians.

  19. pcrEfficiency: a Web tool for PCR amplification efficiency prediction

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Mallona Izaskun

    2011-10-01

    Full Text Available Abstract Background Relative calculation of differential gene expression in quantitative PCR reactions requires comparison between amplification experiments that include reference genes and genes under study. Ignoring the differences between their efficiencies may lead to miscalculation of gene expression even with the same starting amount of template. Although there are several tools performing PCR primer design, there is no tool available that predicts PCR efficiency for a given amplicon and primer pair. Results We have used a statistical approach based on 90 primer pair combinations amplifying templates from bacteria, yeast, plants and humans, ranging in size between 74 and 907 bp to identify the parameters that affect PCR efficiency. We developed a generalized additive model fitting the data and constructed an open source Web interface that allows the obtention of oligonucleotides optimized for PCR with predicted amplification efficiencies starting from a given sequence. Conclusions pcrEfficiency provides an easy-to-use web interface allowing the prediction of PCR efficiencies prior to web lab experiments thus easing quantitative real-time PCR set-up. A web-based service as well the source code are provided freely at http://srvgen.upct.es/efficiency.html under the GPL v2 license.

  20. Molecular Subtyping of Salmonella Typhimurium with Multiplex Oligonucleotide Ligation-PCR (MOL-PCR).

    Science.gov (United States)

    Wuyts, Véronique; Mattheus, Wesley; Roosens, Nancy H C; Marchal, Kathleen; Bertrand, Sophie; De Keersmaecker, Sigrid C J

    2017-01-01

    A multiplex oligonucleotide ligation-PCR (MOL-PCR) assay is a valuable high-throughput technique for the detection of bacteria and viruses, for characterization of pathogens and for diagnosis of genetic diseases, as it allows one to combine different types of molecular markers in a high-throughput multiplex assay. A MOL-PCR assay starts with a multiplex oligonucleotide ligation reaction for detection of the molecular marker, followed by a singleplex PCR for signal amplification and analysis of the MOL-PCR products on a Luminex platform. This last step occurs through a liquid bead suspension array in which the MOL-PCR products are hybridized to MagPlex-TAG beads.In this chapter, we describe the complete procedure for a MOL-PCR assay for subtyping of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium (S. Typhimurium) and its monophasic variant S. 1,4[5],12:i:- from DNA isolation through heat lysis up to data interpretation through a Gödel Prime Product. The subtyping assay consists of 50 discriminative molecular markers and two internal positive control markers divided over three MOL-PCR assays.

  1. Mathematical analysis of the real time array PCR (RTA PCR) process

    NARCIS (Netherlands)

    Dijksman J.F.; Pierik, A.

    2012-01-01

    Real Time Array PCR is a recently developed biochemical technique that measures amplification curves (like quantitative real time Polymerase Chain Reaction (qPCR)) of a multitude of different templates ina sample. It combines two different techniques to profit from theadvantages of both techniques,

  2. Mathematical analysis of the real time array PCR (RTA PCR) process

    NARCIS (Netherlands)

    Dijksman J.F.; Pierik, A.

    2012-01-01

    Real Time Array PCR is a recently developed biochemical technique that measures amplification curves (like quantitative real time Polymerase Chain Reaction (qPCR)) of a multitude of different templates ina sample. It combines two different techniques to profit from theadvantages of both techniques,

  3. Propidium monoazide reverse transcription PCR and RT-qPCR for detecting infectious enterovirus and norovirus

    Science.gov (United States)

    Presently there is no established cell line or small animal model that allows for the detection of infectious human norovirus. Current methods based on RT-PCR and RT-qPCR detect both infectious and non-infectious virus and thus the conclusions that may be drawn regarding the publ...

  4. Ahorro energético mediante estrategias de iluminación natural optimizadas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Puigdomènech Franquesa, Joan

    1986-04-01

    Full Text Available Electrical charges in buildings and specially in those of commercial use, can be diminished by means of natural lighting strategies. Taking the climate features of our country into consideration, it is necessary to prevent the inconveniences caused by an en erg y excess in summer, so solar Controls are needed. The only practical way to achieve the suitable balance between thermal and light needs, so as to get a monthly or annual energetic balance optimization, is to operate with the computer. A programme with such characteristics is described here. Its application gives important sarings in non renouvable energy savings.Mediante estrategias de iluminación natural es posible disminuir las cargas eléctricas de los edificios y en especial los de uso comercial. Dadas las características climáticas de nuestro país es necesario prever los inconvenientes de un exceso de energía en verano, para lo cual es preciso disponer de controles solares. Encontrar el correcto equilibrio entre las necesidades térmicas y lumínicas en base a la optimización del balance energético mensual o anual es únicamente factible mediante el uso del ordenador. Un programa que responde a estas características es descrito en el presente trabajo, obteniéndose con su aplicación importantes ahorros en el consumo de energías no renovables.

  5. Pronósticos de inflación mediante técnicas bayesianas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Juan Diego Chavarría

    2015-11-01

    Full Text Available La efectividad de la política monetaria bajo un esquema de metas de inflación como el propuesto por el Banco Central de Costa Rica se basa en buena medida en el correcto y oportuno pronóstico de la inflación a corto y mediano plazo con el fin de diseñar de mejor forma las acciones de política monetaria. Así, el propósito de este trabajo es desarrollar una herramienta complementaria para elaborar pronósticos de inflación mediante un enfoque bayesiano. Para lo anterior se propone la utilización de la metodología Bayesian Model Averaging y de Weighted Average Least Squares. Los modelos de proyección especificados permitirían ampliar y complementar el análisis que se realiza actualmente con el Modelo Macroeconómico de Proyección Trimestral (MMPT del Banco Central de Costa Rica. Como resultado esta investigación muestra que, para datos de periodicidad mensual y a horizontes de pronóstico de 1 a 12 meses, es posible encontrar proyecciones mediante un proceso bayesiano que poseen una mayor capacidad predictiva en relación con aquellas producidas por un modelo autorregresivo.

  6. Principios básicos y aplicación del aprendizaje mediante tareas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Estaire, Sheila

    2011-04-01

    Full Text Available En los últimos años el aprendizaje mediante tareas ha ido consolidándose como una nueva forma de enseñar y aprender lenguas extranjeras. Sin embargo existen una serie de aspectos prácticos relacionados con su aplicación en los que aún se puede profundizar. En este artículo, después de una introducción breve de algunos principios básicos, se discuten posibles procedimientos para determinar las tareas que constituyen el eje de un programa, así como para organizar el proceso de enseñanza / aprendizaje. A continuación se presentan diferentes modalidades de trabajo sobre los aspectos formales de la lengua, aspectos que es esencial tratar de forma rigurosa, minuciosa y sistemática. Este punto crucial se discute junto con una propuesta de estructura de curso que consta de dos componentes diferenciados. Por otra parte, los elementos innovadores del aprendizaje mediante tareas hacen imprescindible una gestión del aprendizaje también innovadora, aspecto que se trata en el último apartado a través de pautas metodológicas que potencian la eficacia de las tareas como instrumento de aprendizaje.

  7. Graduación mediante funciones Gompertz-Makeham dinámicas.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Montes Suay, Francisco

    2004-01-01

    Full Text Available El objetivo de este trabajo es modelar la influencia del tiempo de calendario y la edad, en las probabilidades de muerte, qx. Para ello, se gradúa los datos de mortalidad de la Comunidad Valenciana correspondientes a los años 1980 a 1999. En primer lugar obtenemos el ajuste de las funciones Gompertz-Makeham con términos correspondientes a las variables edad y tiempo mediante modelos lineales generalizados. La elección del modelo que mejor se ajusta a los datos de cada periodo se lleva a cabo atendiendo a criterios de bondad de ajuste y de complejidad del mismo. Se trata de buscar un equilibrio entre ambos aspectos, para lo cual utilizamos medidas y contrastes implementados en S-plus. Del modelo obtenido para cada sexo hacemos un análisis más detallado mediante los tests no paramétricos habituales y análisis gráfico, para concluir la adecuación de éstos a la experiencia de mortalidad.

  8. PROPUESTA DE CONEXIÓN DE ENTORNOS IPv6 MEDIANTE UN BACKBONE MPLS/IPv4

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Nancy Yaneth Gelvez García

    2013-09-01

    Full Text Available Las redes actuales MPLS/IPv4 presentan las ventajas de poder implementar ingeniería de tráfico, así como realizar diferenciación de flujos mediante clases de servicio (CoS frente a las redes con enrutamiento IP tradicional. En aras de aprovechar cualidades estratégicas durante la etapa de coexistencia entre IPv4 e IPv6 existen 4 métodos para proveer conectividad a islas IPv6 [1] remotas a través de una infraestructura de core MPLS con IPv4 nativo [2], sin embargo una de las formas que permite un rápida y fácil provisión de la misma dados los mínimos requisitos de configuración y de equipos es la de disponer túneles IPv6 en los enrutadores de acceso (CE de la red. No obstante, sus cuatro variantes (manual, GRE, 6to4 e IPv6 compatible IPv4 [3] resultan adecuadas o no según las características inherentes de la red a interconectar; por tanto este artículo presenta las ventajas y desventajas propias de la utilización de cada técnica de entunelamiento como resultado de la interconexión con los cuatro tipos de túneles de una red emulada mediante GNS3+Dynamips.

  9. Introducción de momentos internos de torsión mediante pretensado

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Johannson, J.

    1975-02-01

    Full Text Available In this article the possibility is being studied of transferring bending moments to the ground by means of torsional strength of a beam. This avoids the need to subject columns to high torsional stresses. This system, by prestressing, induces internal moments which compensate the torsional moment. This reduces, or eliminates, under certain loading cases, the angular deflection due to torsion couples. Primarily, a study is carried out on this type torsion — with the example of a simple hollow beam, in corbel,En este artículo se estudia la posibilidad de transferir momentos al firme mediante la resistencia torsional de una viga, evitándose así soluciones de pilas o pilares solicitados fuertemente por torsión y creando, mediante pretensado, momentos internos que contrarresten directamente al momento torsor actuante, con lo cual se reduce e incluso se elimina, para ciertos casos de carga, el giro de la sección debido al par torsor. En primer lugar se lleva a cabo un estudio de este tipo de torsión con el ejemplo sencillo de una viga hueca, en voladizo, solicitada en un extremo por un par torsor.

  10. PCR clonality detection in Hodgkin lymphoma.

    NARCIS (Netherlands)

    Hebeda, K.M.; Altena, M.C. van; Rombout, P.D.M.; Krieken, J.H.J.M. van; Groenen, P.J.T.A.

    2009-01-01

    B-cell clonality detection in whole tissue is considered indicative of B-cell non-Hodgkin lymphoma (NHL). We tested frozen tissue of 24 classical Hodgkin lymphomas (cHL) with a varying tumor cell load with the multiplex polymerase chain reaction (PCR) primer sets for IGH and IGK gene rearrangement (

  11. The Power of Real-Time PCR

    Science.gov (United States)

    Valasek, Mark A.; Repa, Joyce J.

    2005-01-01

    In recent years, real-time polymerase chain reaction (PCR) has emerged as a robust and widely used methodology for biological investigation because it can detect and quantify very small amounts of specific nucleic acid sequences. As a research tool, a major application of this technology is the rapid and accurate assessment of changes in gene…

  12. Aspergillus PCR: one step closer to standardization.

    NARCIS (Netherlands)

    White, P.L.; Bretagne, S.; Klingspor, L.; Melchers, W.J.G.; McCulloch, E.; Schulz, B.; Finnstrom, N.; Mengoli, C.; Barnes, R.A.; Donnelly, J.P.; Loeffler, J.

    2010-01-01

    PCR has been used as an aid in the diagnosis of invasive aspergillosis for almost 2 decades. A lack of standardization has limited both its acceptance as a diagnostic tool and multicenter clinical evaluations, preventing its inclusion in disease-defining criteria. In 2006, the European Aspergillus

  13. Inverse PCR for Point Mutation Introduction.

    Science.gov (United States)

    Silva, Diogo; Santos, Gustavo; Barroca, Mário; Collins, Tony

    2017-01-01

    Inverse PCR is a powerful tool for the rapid introduction of desired mutations at desired positions in a circular double-stranded DNA sequence. Here, custom-designed mutant primers oriented in the inverse direction are used to amplify the entire circular template with incorporation of the required mutation(s). By careful primer design it can be used to perform such diverse modifications as the introduction of point mutations and multiple mutations, the insertion of new sequences, and even sequence deletions. Three primer formats are commonly used; nonoverlapping, partially overlapping and fully overlapping primers, and here we describe the use of nonoverlapping primers for introduction of a point mutation. Use of such a primer setup in the PCR reaction, with one of the primers containing the desired mismatch mutation, results in the amplification of a linear, double-stranded, mutated product. Methylated template DNA is removed from the nonmethylated PCR product by DpnI digestion and the PCR product is then phosphorylated by polynucleotide kinase treatment before being recircularized by ligation, and transformed to E. coli. This relatively simple site-directed mutagenesis procedure is of major importance in biology and biotechnology today where it is commonly employed for the study and engineering of DNA, RNA, and proteins.

  14. Aspergillus PCR: one step closer to standardization.

    NARCIS (Netherlands)

    White, P.L.; Bretagne, S.; Klingspor, L.; Melchers, W.J.G.; McCulloch, E.; Schulz, B.; Finnstrom, N.; Mengoli, C.; Barnes, R.A.; Donnelly, J.P.; Loeffler, J.

    2010-01-01

    PCR has been used as an aid in the diagnosis of invasive aspergillosis for almost 2 decades. A lack of standardization has limited both its acceptance as a diagnostic tool and multicenter clinical evaluations, preventing its inclusion in disease-defining criteria. In 2006, the European Aspergillus P

  15. Real-time PCR: Advanced technologies and applications

    Science.gov (United States)

    This book brings together contributions from 20 experts in the field of PCR, providing a broad perspective of the applications of quantitative real-time PCR (qPCR). The editors state in the preface that the aim is to provide detailed insight into underlying principles and methods of qPCR to provide ...

  16. Real Time PCR: Principles and Application

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Safie Amini

    2005-09-01

    Full Text Available The polymerase chain reaction (PCR has been used as the new golden standard for detecting a wide variety of templates across a range of scientific specialties and also as an essential tool in research laboratories. PCR has completely revolutionized the detection of RNA and DNA viruses(1. Real Time vs. Traditional PCRReal time chemistry allows the detection of PCR amplification during the early phase of the reaction. Measuring the kinetic of the reaction in the early phase of PCR provides a distinct advantage over traditional PCR detection. Traditional methods use agarose gel electrophoresis for detection of PCR amplification at the final phase or end point. End point detection is really time consuming; it takes several hours to have the result. On the other hand, results are based on size discrimination. Also, the result of end point is variable from sample to sample. While gels may not resolve this variability in yield, real time PCR is sensitive enough to detect this change.Some problems with end point detection are: poor precision, low sensitivity, short dynamic range (<2 log, low resolution, non-automated procedure, size-based discrimination only, and post PCR processing (carry-over contamination and results are not expressed as numbers(2.Detection of PCR Products in Real-timeReal-time PCR and RT-PCR allow accurate quantification of starting amounts of DNA, cDNA, and RNA targets. Fluorescence is measured during each cycle, which greatly increases the dynamic range of the reaction since the amount offluorescence is proportional to the amount of PCR product. PCR products can be detected using either fluorescent dyes that bind to double-stranded DNA or fluorescently labeled sequence-specific probes(3.SYBR Green ISYBR® Green I binds all double-stranded DNA molecules, emitting a fluorescent signal of a defined wavelength on binding. The excitation and emission maxima of SYBR Green I are at 494 nm and 521 nm, respectively, and are compatible for

  17. Obtención de electricidad y agua potable mediante energía solar para un centro de salud mozambiqueño

    OpenAIRE

    Antona Díaz, Ana María

    2009-01-01

    El proyecto consiste en cubrir las necesidades de energía eléctrica y agua potable del centro de salud de Minehuene (Mozambique), mediante energía solar fotovoltaica y térmica. La cobertura de la demanda de electricidad del centro se realiza mediante un sistema de energía fotovoltaico. Para la obtención de agua potable se evalúan diferentes alternativas: pasteurización del agua de lluvia mediante paneles solares térmicos, purificación de esta agua mediante lámparas ultravioletas u obtenci...

  18. Clinical Identification of Common Species of Dermatophytes by PCR and PCR-RFLP

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    丁娟; 李家文; 刘志香; 谭志建

    2004-01-01

    To find a fast and efficient way of identifying seven common dermatophytes in clinical practice, we used the techniques of polymerase chain reaction (PCR) and PCR-restriction fragment length polymorphism (RFLP) targeting Topoisomerase Ⅱ gene. The DNA of 7 dermatophytes, along with Candida albicans, Aspergillus terreus and Aspergillus flavus were amplified by consensus primer dPsD1. They were then subjected to a second PCR with primers dPsD2 and species-specific primers PsT and PsME separately. 6 of the products generated by dPsD2 were digested with restriction enzyme Hinc Ⅱ. DNA fragments of 3390 bp and 2380 bp was amplified by using consensus primer dPsD1 and dPsD2 from the genomic DNA of each dermatophyte species separately. By combining the results of the two species-specific primer sets (PsT and PsME), all species of dermatophyte yielded unique sizes-set of PCR products expect for T. mentagrophytes and T. tonsurans.From the restriction profiles of Hinc Ⅱ , 6 of the 7 dermatophytoses were diagnosed to species level including T. mentagrophytes and T. tonsurans. By combining the results of the PCR and PCRRFLP, the 7 common dermatophytes can be identified to species level. It is conclude that the multiplex PCR and PCR-RFLP identification targeting the DNA topoisomerase Ⅱ gene is rapid and efficient.

  19. Quantitative PCR and Digital PCR for Detection of Ascaris lumbricoides Eggs in Reclaimed Water

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Lucrecia Acosta Soto

    2017-01-01

    Full Text Available The reuse of reclaimed water from wastewater depuration is a widespread and necessary practice in many areas around the world and must be accompanied by adequate and continuous quality control. Ascaris lumbricoides is one of the soil-transmitted helminths (STH with risk for humans due to its high infectivity and an important determinant of transmission is the inadequacy of water supplies and sanitation. The World Health Organization (WHO recommends a limit equal to or lower than one parasitic helminth egg per liter, to reuse reclaimed water for unrestricted irrigation. We present two new protocols of DNA extraction from large volumes of reclaimed water. Quantitative PCR (qPCR and digital PCR (dPCR were able to detect low amounts of A. lumbricoides eggs. By using the first extraction protocol, which processes 500 mL of reclaimed water, qPCR can detect DNA concentrations as low as one A. lumbricoides egg equivalent, while dPCR can detect DNA concentrations as low as five A. lumbricoides egg equivalents. By using the second protocol, which processes 10 L of reclaimed water, qPCR was able to detect DNA concentrations equivalent to 20 A. lumbricoides eggs. This fact indicated the importance of developing new methodologies to detect helminth eggs with higher sensitivity and precision avoiding possible human infection risks.

  20. Digital PCR to assess gene-editing frequencies (GEF-dPCR) mediated by designer nucleases.

    Science.gov (United States)

    Mock, Ulrike; Hauber, Ilona; Fehse, Boris

    2016-03-01

    Genome editing using designer nucleases such as transcription activator-like effector nucleases (TALENs) or clustered regularly interspersed short palindromic repeats (CRISPR)-Cas9 nucleases is an emerging technology in basic and applied research. Whereas the application of editing tools, namely CRISPR-Cas9, has recently become very straightforward, quantification of resulting gene knockout rates still remains a bottleneck. This is particularly true if the product of a targeted gene is not easily detectable. To address this problem, we devised a novel gene-editing frequency digital PCR (GEF-dPCR) technique. GEF-dPCR exploits two differently labeled probes that are placed within one amplicon at the gene-editing target site to simultaneously detect wild-type and nonhomologous end-joining (NHEJ)-affected alleles. Taking advantage of the principle of dPCR, this enables concurrent quantification of edited and wild-type alleles in a given sample. We propose that our method is optimal for the monitoring of gene-edited cells in vivo, e.g., in clinical settings. Here we describe preparation, design of primers and probes, and setup and analysis of GEF-dPCR. The setup of GEF-dPCR requires up to 2 weeks (depending on the starting point); once the dPCR has been established, the protocol for sample analysis takes <1 d.

  1. How Many Microorganisms Are Present? Quantitative Reverse Transcription PCR (qRT-PCR)

    Science.gov (United States)

    Price, Andy; Álvarez, Laura Acuña; Whitby, Corinne; Larsen, Jan

    Quantitative reverse transcription PCR (qRT-PCR) is a variation of conventional quantitative or real-time PCR, whereby mRNA is first converted into the complementary DNA (cDNA) by reverse transcription, the cDNA is then subsequently quantified by qPCR. The use of mRNA as the initial template allows the quantification of gene transcripts, rather than gene copy numbers. mRNA is only produced by actively metabolising cells and is produced by its corresponding gene to provide a 'blueprint' in order for a cell to manufacture a specific protein. Conventional qPCR detects not only DNA present in actively metabolising cells but also inactive and dead cells. qRT-PCR has the advantage that only actively metabolising cells are detected, hence provides a more reliable measure of microbial activity in oilfield samples. When qRT-PCR is combined with primers and probes for specific genes, the activity of microbial processes important in the oilfield, such as sulphate reduction, methanogenesis and nitrate reduction can be monitored.

  2. Selección de estaciones termométricas mediante un filtro de comparación de curvas.

    OpenAIRE

    José Antonio Sosa Cardo

    2001-01-01

    A la hora de realizar cualquier estudio climatológico o interpolación espacial es fundamental contar con un conjunto de estaciones fiables, y desechar aquellas que lo único que nos van a aportar es ruido. Se han desarrollado dos métodos para seleccionar estaciones de forma objetiva: 1) Mediante análisis de las formas de las curvas de las series, siendo necesaria otra estación con una curva similar para que se de por válida una estación. 2) Mediante análisis del valor diario. Cuando existe una...

  3. Mapas de Entornos Mediante Navegacion Difusa y Sistema de Teleoperacion de una Plataforma Pioneer P3-DX

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Daniel Granda

    2013-11-01

    Full Text Available El presente proyecto describe el diseno e implementacion de aplicaciones de Teleoperacion, Adquisicion de Datos, Control Difuso de Velocidad y Mapeo de Entornos en 2D, para la plataforma movil Pioneer P3-DX mediante el uso de sonares, odometrıa y software libre GNU/Linux. El proyecto brinda una guıa para utilizar los conceptos de programacion en Python, que permite crear aplicaciones de manera versatil mediante el uso de librerıas como: GTK para el desarrollo del entorno grafico, PYFUZZY para el desarrollo del controlador difuso de velocidad y OPENCV para mostrar los mapas del entorno.

  4. Remoción de Contaminantes Atmosféricos Sox y Nox mediante Nanotubos de Carbono

    OpenAIRE

    Saavedra Labastida, Erika

    2013-01-01

    En el presente proyecto de investigación se realizó la evaluación de la remoción de los contaminantes atmosféricos provenientes de fuentes móviles, mediante nanotubos de carbono (NTC) comerciales. Para conocer las propiedades de los NTC empleados, fueron caracterizados fisicoquímicamente mediante diferentes análisis tales como MEB, MET, Raman, DRX y BET, los resultados que se obtuvieron mostraron óptimas propiedades fisicoquímicas las cuales permiten que sean empleados como ...

  5. Rapid PCR thermocycling using microscale thermal convection.

    Science.gov (United States)

    Muddu, Radha; Hassan, Yassin A; Ugaz, Victor M

    2011-03-05

    Many molecular biology assays depend in some way on the polymerase chain reaction (PCR) to amplify an initially dilute target DNA sample to a detectable concentration level. But the design of conventional PCR thermocycling hardware, predominantly based on massive metal heating blocks whose temperature is regulated by thermoelectric heaters, severely limits the achievable reaction speed(1). Considerable electrical power is also required to repeatedly heat and cool the reagent mixture, limiting the ability to deploy these instruments in a portable format. Thermal convection has emerged as a promising alternative thermocycling approach that has the potential to overcome these limitations(2-9). Convective flows are an everyday occurrence in a diverse array of settings ranging from the Earth's atmosphere, oceans, and interior, to decorative and colorful lava lamps. Fluid motion is initiated in the same way in each case: a buoyancy driven instability arises when a confined volume of fluid is subjected to a spatial temperature gradient. These same phenomena offer an attractive way to perform PCR thermocycling. By applying a static temperature gradient across an appropriately designed reactor geometry, a continuous circulatory flow can be established that will repeatedly transport PCR reagents through temperature zones associated with the denaturing, annealing, and extension stages of the reaction (Figure 1). Thermocycling can therefore be actuated in a pseudo-isothermal manner by simply holding two opposing surfaces at fixed temperatures, completely eliminating the need to repeatedly heat and cool the instrument. One of the main challenges facing design of convective thermocyclers is the need to precisely control the spatial velocity and temperature distributions within the reactor to ensure that the reagents sequentially occupy the correct temperature zones for a sufficient period of time(10,11). Here we describe results of our efforts to probe the full 3-D velocity and

  6. A quadruplex PCR (qxPCR) assay for adulteration in dairy products.

    Science.gov (United States)

    Agrimonti, Caterina; Pirondini, Andrea; Marmiroli, Marta; Marmiroli, Nelson

    2015-11-15

    This study describes the development of a quadruplex quantitative Real Time PCR (qxPCR) based on SYBR®GreenER chemistry, for rapid identification of DNA of cow, goat, sheep and buffalo in dairy products, and for quantification of cow DNA in these products. The platform was applied to: (i) mixes of milks at fixed percentages; (ii) cheeses prepared with the same mixes; (iii) commercial dairy products. The methodology enabled the detection of DNA from cow in mixes of milk and cheeses with a limit of detection (LOD) of 0.1%. When applied to commercial dairy products the qxPCR gave results comparable with each single-plex Real Time PCR. A good correlation (R(2)>0.9) between peaks' area of derivative of melting curves of amplicons and percentages of cow milk in milk mixes and cheeses, allows for an estimation of cow DNA in a dynamic range varying from 0.1-5% to 1-25%.

  7. Real‐time PCR (qPCR) primer design using free online software

    National Research Council Canada - National Science Library

    Thornton, Brenda; Basu, Chhandak

    2011-01-01

    ...‐stranded DNA product, its success depends greatly on proper primer design. Many types of online primer design software are available, which can be used free of charge to design desirable SYBR® Green‐based qPCR primers...

  8. Chicken QTL mapping by multiplex PCR

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    2002-01-01

    To facilitate rapid determination of the chromosomal location of quantitative trait loci, the current approaches to gene mapping are improved using a multiplex PCR technique. The high-throughput linkage analysis method described here allows selection of 178 from 328 microsatellite markers through the multiplex PCR method combined with the semi-automatic fluorescence-labeled DNA analysis technology. Those polymorphism markers are distributed on 23 autosomes and one sex chromosome (chromosome Z), covering 3080cM genetic distance. The average marker density is 18cM, dispersed into 30 different sets. These selected polymorphism microsatellite markers segregate with the family members, following the Mendel's heritage laws, and are very useful for chicken linkage map analysis as well as for the research on some important economic quantitative characters of chicken.

  9. PCR-SSCP检测水稻SNPs

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    李飞; 郭凌; 余潮

    2006-01-01

    本文选择5个水稻SNPs位点为对象,研究凝胶组成和电泳条件等对PCR-SSCP检测SNPs的影响.发现凝胶浓度、交联度、甘油和电泳温度等均可明显影响DNA单链分子迁移率,且对不同DNA单链分子的影响程度不同.因此,可以通过调节凝胶浓度、交联度、甘油和电泳温度等提高PCR-SSCP检测水稻SNPs的分辨率及效果.在一定条件下,较低交联度和4°电泳条件检测SNPs的效果更好.

  10. Representación del Conocimiento en curriculo mediante esquemas preconceptuales

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Carlos Mario Zapata

    2011-09-01

    Full Text Available El concepto de currículo se torna más y más complejo en tanto aparecen nuevos estudios que lo complementan. Como consecuencia, los modelos que, gráfica o formalmente, tratan de representar el conocimiento alrededor del currículo se ocupan cada vez más de aspectos locales, de este modo le restan generalidad de comprensión. Por ello, en este artículo de investigación se realiza una revisión acerca de los diferentes enfoques del currículo a lo largo del siglo XX y de los modelos que representan este concepto. Finalmente, se propone una representación integradora de las diferentes visiones de currículo mediante los denominados esquemas preconceptuales, que consisten en diagramas para la representación del conocimiento cercanos al lenguaje natural

  11. Predictor de Smith modificado mediante un modelo interno, robusto a perturbaciones externas no medibles.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Fernando Castillo García

    2010-11-01

    Full Text Available Normal 0 21 false false false MicrosoftInternetExplorer4 Se propone una modificación de la estructura del predictor de Smith mediante un modelo interno que posibilita aumentar su rechazo al efecto de las per-turbaciones externas no medibles en comparación con la estructura clásica del predictor de Smith. Los resultados obtenidos se aplican en el diseño de un sistema de control del proceso de variación de la temperatura del jugo en los calentadores de una fábrica de azúcar. Los resultados de la simulación del sistema diseñado mostraron su efectividad y robustez en cuanto al rechazo de perturbaciones externas no medibles. Palabras claves: Predictor de Smith, predictor de Smith modificado, rechazo a perturbaciones externas no medibles, robustez de los sistemas de control.

  12. Evaluando impactos externos mediante un modelo de equilibrio general computable con competencia imperfecta: El caso colombiano

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Diana Catalina Gutiérrez

    2008-10-01

    Full Text Available Mediante un modelo de equilibrio general computable, en el que se discrimina un sector informal en la economía, se modela el sector formal como un mercado de competencia monopolística. Además de incluir mercados de trabajo discriminados, este modelo también evalúa el impacto del creciente flujo de inversión extranjera, del aumento de precio de los bienes básicos, y del aumento del volumen de las exportaciones sobre la economía colombiana. Se concluye que algo más de la mitad del crecimiento observado puede explicarse por el efecto de los factores mencionados. No obstante, se señala la importancia de las políticas internas para aprovechar las coyunturas favorables, y para minimizar el efecto de circunstancias negativas sobre el desempeño económico.

  13. Variabilidad genética de Hartón del Valle mediante RAM

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ana M Piedrahíta

    2008-01-01

    Full Text Available El Hartón del Valle (HV hace parte de las siete razas criollas de ganado bovino colombiano y de acuerdo con los criterios de la FAO está considerado como vulnerable. Para estudiar su variabilidad genética fueron muestreados 33 individuos HV y tres animales de la raza Holstein, como control externo. Se extrajo ADN utilizando el método de Salting Out y las muestras fueron analizadas mediante la técnica molecular RAM (Randon amplified microsatellites. Se utilizaron los cebadores CGA, CCA, TG, y CT. El valor promedio de heterocigosidad esperada fue de 0.26 y el F ST fue 0.39 ± 0.03. Con el índice de Dice-Nei Li y agrupando con el método UPGMA se distinguieron dos grupos: uno integrado por dos hatos de conservación y el otro por cuatro fincas que han compartido reproductores.

  14. PROMOCIÓN DE LA LECTURA E IDENTIDAD DEPORTIVA MEDIANTE TEXTOS DE HISTORIA DEL DEPORTE

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    José Guillermo Montero Quesada

    2016-04-01

    Full Text Available En el artículo se expone una experiencia de promoción de la lectura desarrollada mediante un proyecto conjunto de la Facultad de Cultura Física y la biblioteca de la Universidad de Las Tunas. Se fundamenta en aspectos teóricos de la promoción de la lectura y de la identidad deportiva, ambas variables tienen salida práctica en actividades donde confluyen diversas manifestaciones del arte y la literatura con la actividad física y el deporte. El objetivo del trabajo consiste en reflexionar en torno a la necesidad de asumir alternativas de cómo influir en la formación integral de los estudiantes universitarios de la carrera de Cultura Física, con énfasis en los conocimientos históricos y culturales.

  15. Introducción al cálculo mediante resolución de problemas

    OpenAIRE

    Espinoza, Johan; Zumbado, Marianela

    2010-01-01

    Esta investigación presenta la puesta en práctica de una propuesta pedagógica para apoyar la enseñanza del Cálculo mediante la resolución de problemas a nivel preuniversitarioen Costa Rica. El proyecto tiene su origen en las dificultades que presentan los estudiantes en la comprensión de conceptos básicos de Cálculo, específicamente el de límite y derivada. Esta experiencia se fundamentó en la elaboración de una “situación problema” que provocó un conflicto intelectual en los estud...

  16. Herramienta e-learning para la programación de robots mediante entorno web

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Alfredo Rosado Muñoz

    2008-12-01

    Full Text Available Este artículo describe los trabajos realizados para permitir a los estudiantes de diversas titulaciones de ingeniería la realización de prácticas a distancia en un laboratorio remoto desde un navegador web. Este hecho posibilita utilizar aparatos y maquinaria a distancia (inicialmente un robot industrial, pudiendo programarlos y visualizar el resultado de la programación realizada en tiempo real así como interactuar con la máquina. Adicionalmente, se propone al estudiante la realización de un curso de programación mediante diversas prácticas que debe realizar y el sistema web autoevalúa. Este trabajo ha requerido la integración de diversos elementos hardware y software

  17. Application of PCR techniques in toxicology

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Maja Kazubek

    2010-10-01

    Full Text Available Molecular biology techniques have become widely used in toxicology, leading to the creation of a new science – molecular toxicology. The goal of molecular toxicology is to detect and study the changes induced by xenobiotics at the molecular level. The research scope of molecular toxicology includes examination of mutations in genomic DNA, differences in mRNA expression and study of genotype indicating individual sensitivity.The processes of activation and detoxification of xenobiotics, drugs and environmental carcinogens involve several enzymes (xenobiotic-metabolizing enzymes – XMEs. Most of the chemicals entering our bodies, regardless of whether they have medical, pathogenic or carcinogenic properties, require metabolic activation by phase I enzymes (cytochrome P-450. In the next process the phase I products are usually detoxified by phase II enzymes, mainly by epoxide hydrolase, glutathione transferase, N-acetyltransferase or sulfotransferase. PCR techniques allow precise study of the effects of xenobiotics on cells and tissues by examining the level of activation of genes coding for phase I and II enzymes, or by testing the activity of other elements of the transcriptome. Studies of sensitivity of individual cells or tissues based on examination of mutation or gene polymorphism presence are also relevant.This paper presents the possibility of using various PCR techniques in toxicology and especially in the study of genetically determined sensitivity to xenobiotics. It also covers the possibilities of applying qPCR and qRT-PCR methods in the search for exposure biomarkers with particular emphasis on individual cytochrome P450 isoforms. Furthermore, it provides information about the possibility of implementing the differential display technique in the identification of new genes activated by toxic agents.

  18. Miniature PCR based portable bioaerosol monitor development.

    Science.gov (United States)

    Agranovski, I E; Usachev, E V; Agranovski, E; Usacheva, O V

    2017-01-01

    A portable bioaerosol monitor is greatly demanded technology in many areas including air quality control, occupational exposure assessment and health risk evaluation, environmental studies and, especially, in defence and bio-terrorism applications. Our recent groundwork allowed us to formulate the concept of a portable bioaerosol monitor, which needs to be light, user friendly, reliable and capable of detecting airborne pathogens within 1-1·5 h on the spot. Conceptually, the event of a bioaerosol concentration burst is determined by triggers to commence the representative air sampling with sequential real-time polymerase chain reaction (PCR) confirmation of the targeted micro-organism present in the air. To minimize reagent consumption and idle running of the technology, an event of a bioaerosol burst is confirmed by three parameters: aerosol particle size, concentration and composition. Only particle sizes above 200 nm attract interest in the bioaerosol. Only an elevated aerosol concentration above the threshold (background aerosol concentration) is a signal to commence the analytical procedure. The combination of our previously developed personal bioaerosol sampler, aerosol particle counter based trigger and portable real-time PCR device formed the basis of the bioaerosol monitoring technology. The portable real-time PCR device was advanced to provide internally controlled detection, significantly reducing false-positive alarms. The technique is capable of detecting selected airborne micro-organisms on the spot within 30-80 min, depending on the genome organization of the particular strain. Due to recent outbreaks of infectious airborne diseases and the continuing threat of intentionally released bioaerosol attacks, investigations into the possibility of the early and reliable detection of pathogenic micro-organisms in the air is becoming increasingly important. The proposed technology consisting of a bioaerosol sampler, technology trigger and PCR device is

  19. Reproducibility of AMPLICOR enterovirus PCR test results.

    OpenAIRE

    1997-01-01

    The reproducibility of AMPLICOR enterovirus PCR test results was determined with clinical samples of cerebrospinal fluid, serum, urine, and throat and rectal swabs. Among 608 samples from which duplicate aliquots were run simultaneously, only seven pairs gave discordant results. Among 104 samples from which duplicate aliquots were run in separate assays, no discordance was seen. Overall, the reproducibility of test kit results was 99% (705 of 712).

  20. Comparación del gasto energético en reposo determinado mediante calorimetría indirecta y estimado mediante fórmulas predictivas en mujeres con grados de obesidad I a III

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Alicia Parra-Carriedo

    2013-04-01

    Full Text Available Introducción: La determinación del gasto energético en reposo (GER se calcula cotidianamente a partir de fórmulas predictivas aunque el resultado varía dependiendo de la población. Objetivo: Comparar la determinación del GER mediante calorimetría indirecta y mediante las ecuaciones Harris-Benedict (HB, Mifflin (MF, Organización Mundial de la Salud (OMS, "Institute of Medicine" (IOM, Fórmula Rápida (FR y Valencia (VA en mujeres con grados de obesidad I a III. Métodos: Mujeres adultas mestizas mexicanas se incluyeron en el estudio y formaron 3 grupos a partir del índice de masa corporal (IMC. Obesidad grado I (IMC 30,034,9; n = 42, grado II (IMC 35,0-39,9; n = 38 y grado III (IMC > 40; n = 41. Se determinó el GER mediante calorimetría indirecta y mediante las ecuaciones antes señaladas. ANOVA de Kruskal-Wallis y la prueba de Dunn's se emplearon para el análisis estadístico (p 30. En el grado III VA y FR muestran el mejor desempeño.

  1. Uso della chemiluminescenza per la diagnosi della brucellosi bovina e ovina mediante ELISA indiretta e competitiva

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Manuela Tittarelli

    2008-06-01

    Full Text Available I metodi ufficiali previsti dal Piano nazionale di eradicazione della brucellosi bovina ed ovi-caprina sono la sieroagglutinazione rapida (SAR con l’antigene acidificato al Rosa Bengala e la fissazione del complemento (FDC. Nella attuale fase del piano di eradicazione non è infrequente imbattersi in risultati di difficile interpretazione ottenuti con i test ufficiali, pertanto è necessario poter disporre di test aggiuntivi che presentino livelli di specificità e di sensibilità più elevati. A questo scopo sono stati validati due metodi ELISA, indiretto (i-ELISA CL e competitivo (c-ELISA CL, mediante l’utilizzo di un substrato chemiluminescente per la determinazione di anticorpi anti-Brucella in siero bovino ed ovino. I metodi si basano sulla rivelazione degli anticorpi anti-Brucella, contenuti nel siero, mediante la catalisi di un substrato enzimatico chemiluminescente (sistema luminolo/H2O2/ enhancer, da parte della perossidasi coniugata ad anticorpi secondari anti-IgG, nella i-ELISA CL, o al monoclonale anti-LPS, nella c-ELISA CL. Sulla base dei risultati ottenuti, per l'i-ELISA CL è stato stabilito un valore di cut-off, espresso come percentuale di positività (PP, del 60% per i sieri bovini e del 37,5% per quelli ovini; con questo valore di cut-off si ottiene una sensibilità ed una specificità del test del 100% per i sieri bovini, e una sensibilità del 100% e una specificità del 99,8% per quelli ovini. Per la c-ELISA CL è stato scelto un cut-off, espresso come percentuale di inibizione (PI, del 30% per i sieri bovini e del 40% per quelli ovini, che assicura valori di sensibilità e specificità del 100% in entrambi i casi.

  2. Identificación en lazo cerrado mediante algoritmos genéticos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Alfredo Gómez Infante

    2010-11-01

    Full Text Available Normal 0 21 false false false MicrosoftInternetExplorer4 st1:*{behavior:url(#ieooui } /* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:"Tabla normal"; mso-tstyle-rowband-size:0; mso-tstyle-colband-size:0; mso-style-noshow:yes; mso-style-parent:""; mso-padding-alt:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt; mso-para-margin:0cm; mso-para-margin-bottom:.0001pt; mso-pagination:widow-orphan; font-size:10.0pt; font-family:"Times New Roman"; mso-ansi-language:#0400; mso-fareast-language:#0400; mso-bidi-language:#0400;} La identificación  en lazo cerrado de sistemas continuos es un problema de optimización no lineal que resulta de difícil solución mediante métodos convencionales.  En este trabajo se propone el uso de algoritmos genéticos (AG para esta tarea y se muestra mediante simulaciones que los modelos obtenidos pueden reproducir fielmente el comportamiento de la planta, aun en el caso de sistemas inestables o que presentan algún tipo de no-linealidad. Estos modelos pueden utilizarse para el ajuste de los parámetros de reguladores PID utilizando un método también basado en AG, como se muestra en dos ejemplos: un sistema inestable en lazo cerrado y otro de alto orden con retardo.  La metodología propuesta se aplica también  a la identificación del modelo AC5A de la IEEE, que incluye una no-linealidad del tipo saturación,  para unidades de generación eléctrica.

  3. Estabilización de Suelos mediante el empleo de Sales Cuaternarias

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Juan M. Junco del Pino

    2010-01-01

    Full Text Available El Mundo se dirige hacia el aprovechamiento de los Suelos mediante el desarrollo de nuevas técnicas y adaptarse a las condiciones del entorno resulta importante para la Ingeniería. El mejoramiento de los suelos abre nuevas posibilidades de ahorro que pueden llegar de 20 a 45 % respecto a los costos de construcción convencional. La Estabilización Química de Suelos consiste en el empleo de sustancias químicas con el objetivo de modificar las propiedades del suelo para hacerlo más denso o incrementar la vinculación de las partículas del mismo para aumentar su capacidad de soporte sin deformación. Las formas más empleadas en la Estabilización Química de Suelos son con cemento, sales y cal. A partir de estas necesidades se desarrolló una Investigación en Cuba que culminó con la creación de un Sistema de Estabilización e Impermeabilización de Suelos a partir del empleo de Sales Cuaternarias, el cual tiene como efectos : Economía, Resistencia, Simplicidad y beneficios ecológicos. Las Aplicaciones fundamentales de esta Técnica de Estabilización e Impermeabilización son en Subrasantes estabilizadas para pavimentos, Mantenimiento y Construcción de Vías, Terraplenes para ferrocarril y Basureros, entre otros. Nuestro trabajo abarca parte de los Resultados logrados mediante la aplicación de este Sistema de Estabilización e Impermeabilización, mostrando como su efecto sobre las Propiedades Mecánicas y de Impermeabilidad en los Suelos aumentan con el tiempo.

  4. A PCR amplification method without DNA extraction.

    Science.gov (United States)

    Li, Hongwei; Xu, Haiyue; Zhao, Chunjiang; Sulaiman, Yiming; Wu, Changxin

    2011-02-01

    To develop a simple and inexpensive method for direct PCR amplification of animal DNA from tissues, we optimized different components and their concentration in lysis buffer systems. Finally, we acquired the optimized buffer system composed of 10 mmol tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris)-Cl (pH 8.0), 2 mmol ethylene diamine tetraacetic (EDTA) (pH 8.0), 0.2 mol NaCl and 200 μg/mL Proteinase K. Interestingly, the optimized buffer is also very effective when working with common human sample types, including blood, buccal cells and hair. The direct PCR method requires fewer reagents (Tris-Cl, EDTA, Protease K and NaCl) and less incubation time (only 35 min). The cost of treating every sample is less than $0.02, and all steps can be completed on a thermal cycler in a 96-well format. So, the proposed method will significantly improve high-throughput PCR-based molecular assays in animal systems and in common human sample types.

  5. Clostridium perfringens isolate typing by multiplex PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    MR Ahsani

    2010-01-01

    Full Text Available Clostridium perfringens is an important pathogen that provokes numerous different diseases. This bacterium is classified into five different types, each of which capable of causing a different disease. There are various methods for the bacterial identification, many are labor-intensive, time-consuming, expensive and also present low sensitivity and specificity. The aim of this research was to identify the different types of C. perfringens using PCR molecular method. In this study, 130 sheep-dung samples were randomly collected from areas around the city of Kerman, southeastern Iran. After processing and culturing of samples, the produced colonies were morphologically studied, gram stain test was also carried out and the genera of these bacteria were identified through biochemical tests. DNA extracted from isolated bacteria for genotyping was tested by multiplex PCR with specific primers. Based on length of synthesized fragments by PCR, toxin types and bacterial strains were detected. C. perfringens isolated types were divided as follows: 17.39% type A, 21.74% type B, 34.78% type C and 26.09% type D. It should be emphasized that, up to the present moment, C. perfringens type A has not been reported in Iran.

  6. Comparison of Droplet Digital PCR and Quantitative PCR Assays for Quantitative Detection of Xanthomonas citri Subsp. citri.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Yun Zhao

    Full Text Available Droplet digital polymerase chain reaction (ddPCR is a novel molecular biology technique providing absolute quantification of target nucleic acids without the need for an external calibrator. Despite its emerging applications in medical diagnosis, there are few reports of its use for the detection of plant pathogens. This work was designed to assess the diagnosis potential of the ddPCR for absolute quantitative detection of Xanthomonas citri subsp. citri, a quarantine plant pathogenic bacterium that causes citrus bacterial canker in susceptible Citrus species. We transferred an established quantitative PCR (qPCR assay for citrus bacterial canker diagnosis directly to the ddPCR format and compared the performance of the two methods. The qPCR assay has a broader dynamic range compared to the ddPCR assay and the ddPCR assay has a significantly higher degree of sensitivity compared to the qPCR assay. The influence of PCR inhibitors can be reduced considerably in the ddPCR assay because the collection of end-point fluorescent signals and the counting of binomial events (positive or negative droplets are associated with a Poisson algorithm. The ddPCR assay also shows lower coefficient of variation compared to the qPCR assay especially in low target concentration. The linear association of the measurements by ddPCR and qPCR assays is strong (Pearson correlation = 0.8633; P<0.001. Receiver operating characteristic analysis indicates the ddPCR methodology is a more robust approach for diagnosis of citrus bacterial canker. In summary, the results demonstrated that the ddPCR assay has the potential for the quantitative detection of X. citri subsp. citri with high precision and accuracy as compared with the results from qPCR assay. Further studies are required to evaluate and validate the value of ddPCR technology in the diagnosis of plant disease and quarantine applications.

  7. Amp-PCR: combining a random unbiased Phi29-amplification with a specific real-time PCR, performed in one tube to increase PCR sensitivity.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Lena Erlandsson

    Full Text Available In clinical situations where a diagnostic real-time PCR assay is not sensitive enough, leading to low or falsely negative results, or where detection earlier in a disease progression would benefit the patient, an unbiased pre-amplification prior to the real-time PCR could be beneficial. In Amp-PCR, an unbiased random Phi29 pre-amplification is combined with a specific real-time PCR reaction. The two reactions are separated physically by a wax-layer (AmpliWax® and are run in sequel in the same sealed tube. Amp-PCR can increase the specific PCR signal at least 100×10(6-fold and make it possible to detect positive samples normally under the detection limit of the specific real-time PCR. The risk of contamination is eliminated and Amp-PCR could replace nested-PCR in situations where increased sensitivity is needed e.g. in routine PCR diagnostic analysis. We show Amp-PCR to work on clinical samples containing circular and linear viral dsDNA genomes, but can work well on DNA of any origin, both from non-cellular (virus and cellular sources (bacteria, archae, eukaryotes.

  8. 360. Implante de la Prótesis Aórtica Perceval s Mediante Minitoracotomía Derecha

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    2012-04-01

    Conclusiones: en nuestra experiencia la Perceval S® es una prótesis sin sutura que por su hemodinámica y facilidad de implante la convierten en una prótesis indicada para su utilización en raíces aórticas pequeñas mediante acceso miniinvasivo.

  9. Análisis competitivo mediante grupos estratégicos: aplicación al sector hotelero alicantino

    OpenAIRE

    Pereira-Moliner, Jorge

    2004-01-01

    Este documento de trabajo pretende reflejar, de forma resumida, los resultados obtenidos en el proyecto de investigación titulado “Análisis competitivo mediante grupos estratégicos: aplicación al sector hotelero alicantino” que fue realizado en el Departamento de Organización de Empresas de la Universidad de Alicante en 2004.

  10. Superficie específica de una bentonita mediante la adsorción de azul de metileno

    OpenAIRE

    2010-01-01

    Se estudió la determinación de la superficie específica de una bentonita colombiana, procedente del Valle del Cauca, mediante la adsorción de azul de metileno, a 298 K. Este método se comparó con el de la adsorción de nitrógeno a 77 K.

  11. Overcoming inhibition in real-time diagnostic PCR.

    Science.gov (United States)

    Hedman, Johannes; Rådström, Peter

    2013-01-01

    PCR is an important and powerful tool in several fields, including clinical diagnostics, food analysis, and forensic analysis. In theory, PCR enables the detection of one single cell or DNA molecule. However, the presence of PCR inhibitors in the sample affects the amplification efficiency of PCR, thus lowering the detection limit, as well as the precision of sequence-specific nucleic acid quantification in real-time PCR. In order to overcome the problems caused by PCR inhibitors, all the steps leading up to DNA amplification must be optimized for the sample type in question. Sampling and sample treatment are key steps, but most of the methods currently in use were developed for conventional diagnostic methods and not for PCR. Therefore, there is a need for fast, simple, and robust sample preparation methods that take advantage of the accuracy of PCR. In addition, the thermostable DNA polymerases and buffer systems used in PCR are affected differently by inhibitors. During recent years, real-time PCR has developed considerably and is now widely used as a diagnostic tool. This technique has greatly improved the degree of automation and reduced the analysis time, but has also introduced a new set of PCR inhibitors, namely those affecting the fluorescence signal. The purpose of this chapter is to view the complexity of PCR inhibition from different angles, presenting both molecular explanations and practical ways of dealing with the problem. Although diagnostic PCR brings together scientists from different diagnostic fields, end-users have not fully exploited the potential of learning from each other. Here, we have collected knowledge from archeological analysis, clinical diagnostics, environmental analysis, food analysis, and forensic analysis. The concept of integrating sampling, sample treatment, and the chemistry of PCR, i.e., pre-PCR processing, will be addressed as a general approach to overcoming real-time PCR inhibition and producing samples optimal for PCR

  12. Identificación de portadoras de distrofia muscular de Duchenne y Becker (DMD/DMB mediante análisis de dosis génica y polimorfismos de ADN

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Patricia Hernández

    2000-09-01

    Full Text Available Se identificaron 7 mujeres portadoras y 15 no portadoras de deleción en 16 familias con distrofia muscular de Duchenne o de Becker (DMDIDMB mediante PCR multiplex cuantitativa y análisis de dosis génica. Los afectados con DMDIDMB mostraron deleciones en 31.25% de los casos y el estado materno de portadora se estableció por PCR multiplex cuantitativa y análisis de dosis génica. En este estudio no se observó ninguna portadora de duplicación. Tanto las mujeres portadoras de deleción como las no portadoras de 23 familias con DMD/DMB se estudiaron con los polimorfismos intragénicos dinucleotidicos D45 y SK12, para construir haplotipos del cromosoma X; 63% de las mujeres analizadas fueron 'informativas' (heterocigotas en este estudio. Se brindó asesoramiento genético después del análisis molecular descrito, dándoles a conocer los riesgos y los métodos de prevención de la DMD/DMB.

  13. 锚定PCR(Anchored PCR):一种新的染色体步行方法

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    陈柏君; 孙超; 王勇; 胡鸢雷; 林忠平

    2004-01-01

    基于PCR的技术是克隆已知DNA片段侧翼序列的最常用方法.到目前为止,这些方法大致可以分为3种类型:反向PCR(inverse PCR)、连接介导的PCR(1igation-mediated PCR)和随机引物PCR(randomly primed PCR).反向PCR是使用最早的方法,其原理是用限制性内切酶消化基因组总

  14. Detection and Comparison of Pathogen of Virus Disease in Pumpkin by RT-PCR and IC-PCR

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    YANG Guohui; ZHANG Zhongkai; CUI Chongshi

    2006-01-01

    Two kinds of methods RT-PCR and IC-PCR were used to detect pathogen of virus disease of pumpkin and the sensitivity of the two methods was compared. The results showed that PRSV-W and CMV were detected in diseased samples gathered in Yunnan Province, while WMV and CMV were detected in diseased samples gathered in Heilongjiang Province. The sensitivity of RT-PCR is higher than that of IC-PCR, but the effect of IC-PCR in the specialization of bonding reaction and requisition for experiment material is better than that of RT-PCR.

  15. Lab-on-a-chip PCR: real time PCR in miniaturized format for HLA diagnostics

    Science.gov (United States)

    Gaertner, Claudia; Becker, Holger; Hlawatsch, Nadine; Klemm, Richard; Moche, Christian; Sewart, René; Frank, Rainer; Willems, Andreas

    2014-05-01

    In case of transplantation or the identification of special metabolic diseases like coeliac disease, HLA typing has to be done fast and reliably with easy-to-handle devices by using limited amount of sample. Against this background a lab-on-a-chip device was realized enabling a fast HLA typing via miniaturized Real-time PCR. Hereby, two main process steps were combined, namely the extraction of DNA from whole blood and the amplification of the target DNA by Real-time PCR giving rise-to a semi-quantitative analysis. For the implementation of both processes on chip, a sample preparation and a real-time module were used. Sample preparation was carried out by using magnetic beads that were stored directly on chip as dry powder, together with all lysis reagents. After purification of the DNA by applying a special buffer regime, the sample DNA was transferred into the PCR module for amplification and detection. Coping with a massively increased surface-to-volume ratio, which results in a higher amount of unspecific binding on the chip surface, special additives needed to be integrated to compensate for this effect. Finally the overall procedure showed a sensitivity comparable to standard Real-time PCR but reduced the duration of analysis to significantly less than one hour. The presented work demonstrates that the combination of lab-on-a-chip PCR with direct optical read-out in a real-time fashion is an extremely promising tool for molecular diagnostics.

  16. Species identification and quantification in meat and meat products using droplet digital PCR (ddPCR).

    Science.gov (United States)

    Floren, C; Wiedemann, I; Brenig, B; Schütz, E; Beck, J

    2015-04-15

    Species fraud and product mislabelling in processed food, albeit not being a direct health issue, often results in consumer distrust. Therefore methods for quantification of undeclared species are needed. Targeting mitochondrial DNA, e.g. CYTB gene, for species quantification is unsuitable, due to a fivefold inter-tissue variation in mtDNA content per cell resulting in either an under- (-70%) or overestimation (+160%) of species DNA contents. Here, we describe a reliable two-step droplet digital PCR (ddPCR) assay targeting the nuclear F2 gene for precise quantification of cattle, horse, and pig in processed meat products. The ddPCR assay is advantageous over qPCR showing a limit of quantification (LOQ) and detection (LOD) in different meat products of 0.01% and 0.001%, respectively. The specificity was verified in 14 different species. Hence, determining F2 in food by ddPCR can be recommended for quality assurance and control in production systems. Copyright © 2014 The Authors. Published by Elsevier Ltd.. All rights reserved.

  17. Evaluation of PCR and PCR-RFLP protocols for identifying Shiga toxins.

    Science.gov (United States)

    Ziebell, Kim A; Read, Susan C; Johnson, Roger P; Gyles, Carlton L

    2002-06-01

    This study evaluated two generic polymerase chain reaction (PCR) protocols, and nine subtyping protocols and three PCR-restriction fragment length polymorphism (RFLP) protocols for detection of stx genes. The PCR protocols were evaluated by testing 12 reference isolates and 496 field strains of Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC). Both generic methods detected all stx genes. In tests with the reference isolates, all methods detected stx1 and stx2, seven subtyping methods detected stx2v(EH250), seven detected stx2e and only two detected stx2f. Four of the subtyping protocols identified stx genes in all of the field isolates. The PCR-RFLP protocols gave contradictory results for approximately 20% of the strains tested. The observed limitations of the protocols were shown to be due to nucleotide sequence variation in the region of the PCR primers. One subtyping protocol that detected the virulence-related genes, eae and ehxA, and all stx except for the stx2f gene, was modified by newly designed primers so that it identified all stx genes. This modified protocol provides comprehensive characterization of STEC in a single multiplex reaction.

  18. Viral diagnostics in the era of digital PCR

    Science.gov (United States)

    Sedlak, Ruth Hall; Jerome, Keith R.

    2012-01-01

    Unlike quantitative PCR (qPCR), digital PCR (dPCR) achieves sensitive and accurate absolute quantitation of a DNA sample without the need for a standard curve. A single PCR reaction is divided into many separate reactions that each have a positive or negative signal. By applying Poisson statistics, the number of DNA molecules in the original sample is directly calculated from the number of positive and negative reactions. The recent availability of multiple commercial dPCR platforms has led to increased interest in clinical diagnostic applications, such as low viral load detection and low abundance mutant detection, where dPCR could be superior to traditional qPCR.Here we review current literature that demonstrates dPCR’s potential utility in viral diagnostics, particularly through absolute quantification of target DNA sequences and rare mutant allele detection. PMID:23182074

  19. Modification of Cre Gene by PCR Method

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    2010-01-01

    Cre/LoxP site-specified recombination system is mainly used for excision,inversion and integration of target gene.Therefore,this system can be used for plant marker free genetic transformation,site-specific transgene expression and so on.However,the application of this system was limited due to its low expression and excision efficiency.In this study,an intron,which can enhance gene expression in plants,was inserted into Cre by using PCR method.And a modified Cre gene,named Crein,was obtained.This gene was ...

  20. Analysis of extracellular RNA by digital PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Kenji eTakahashi

    2014-06-01

    Full Text Available The transfer of extracellular RNA is emerging as an important mechanism for intracellular communication. The ability for the transfer of functionally active RNA molecules from one cell to another within vesicles such as exosomes enables a cell to modulate cellular signaling and biological processes within recipient cells. The study of extracellular RNA requires sensitive methods for the detection of these molecules. In this methods article, we will describe protocols for the detection of such extracellular RNA using sensitive detection technologies such as digital PCR. These protocols should be valuable to researchers interested in the role and contribution of extracellular RNA to tumor cell biology.

  1. El desarrollo de competencias transversales en dirección de operaciones mediante proyectos de emprendimiento

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Eva Martínez-Caro

    2012-11-01

    Full Text Available Propósito: En este trabajo se propone el desarrollo de proyectos de emprendimiento con el triple objetivo de acercar al alumno a la Dirección de Operaciones (DO mediante un aprendizaje activo, facilitar la adquisición de competencias transversales, y atender a la creciente demanda de la sociedad de fomentar el espíritu emprendedor.Trabajo relacionado: Tradicionalmente, las asignaturas se han orientado al desarrollo y evaluación de las competencias específicas, dejando en un segundo plano las competencias transversales. Sin embargo, en el contexto del Espacio Europeo de Educación Superior (EEES, ambas competencias deben ser desarrolladas. En particular, en el campo de la Dirección de Operaciones es manifiesta la necesidad de emplear nuevos métodos docentes que complementen las presentaciones teóricas, aproximen a los estudiantes a la compleja realidad de la DO de manera más práctica y faciliten la adquisición de competencias transversales por parte de los alumnos. Los proyectos de emprendimiento pueden ser una herramienta para alcanzar esos objetivos a la vez que promueven una cultura emprendedora que es fundamental para el desarrollo y la competitividad de un país.Diseño/Metodología: Se realizó una experiencia piloto que tenía como objetivo integrar en una asignatura de Ingeniería Industrial dedicada tradicionalmente al desarrollo de competencias específicas del campo de DO, competencias transversales mediante el desarrollo de proyectos de emprendimiento empresarial. Los resultados se midieron mediante una encuesta suministrada a los 60 alumnos de la asignatura.Resultados: Los resultados señalan que la elaboración de este tipo de proyectos ha ayudado a los alumnos a desarrollar y a adquirir de manera óptima la mayoría de las competencias transversales. El grado de satisfacción de los alumnos con la experiencia ha sido muy alto.Implicaciones: Este trabajo contribuye a la literatura sobre docencia en DO aportando un m

  2. Recubrimientos de TiN depositados mediante ACPVD sobre aleaciones de magnesio AM60

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Pichel, M.

    2013-06-01

    Full Text Available Magnesium alloys are reaching special interest due to their good specific properties, low cost and good manufacturing properties. However, their low hardness, wear and corrosion resistance limit their applications in certain sectors of industry. These drawbacks can be solved by applying hard ceramic coatings, such as nitrides or metal carbides. TiN is one of the most used coatings due to its high adhesion, hardness, low coefficient of friction and chemical stability. Physical vapor deposition by cathodic arc CAPVD, is a versatile technique, which uses low temperatures and high ionization energies, generating homogeneous coatings. To achieve coatings with high quality, a careful control of the manufacturing parameters is required, such as bias voltage, gas flow or intensity. This paper focuses on magnesium alloys, AM60, coated with TiN using physical vapor deposition cathodic arc technique (CAPVD at different intensity values (40A and 100A and surface preparation (grinding up to 4000 grit and polished to 3μm. It was included a final condition with an intermediate Al film. The samples were characterized by X-ray diffraction, roughness, optical microscopy and scanning electron.Las aleaciones de magnesio están alcanzando especial interés gracias a sus buenas propiedades específicas, bajo coste y buenas propiedades de moldeabilidad. No obstante su baja dureza, resistencia a desgaste y corrosión, limita sus aplicaciones en ciertos campos de la industria. Estos inconvenientes se pueden solucionar aplicando recubrimientos duros cerámicos, como nitruros o carburos metálicos. El TiN es uno de los más utilizados debido a su alta adherencia, dureza, bajo coeficiente de fricción y estabilidad química. La deposición física en fase vapor mediante arco catódico, ACPVD, es una técnica muy versátil, que emplea bajas temperaturas y altas energías de ionización, generando recubrimientos de bajo espesor, homogéneos y de calidad. Para alcanzar

  3. Real-Time PCR for Universal Phytoplasma Detection and Quantification

    DEFF Research Database (Denmark)

    Christensen, Nynne Meyn; Nyskjold, Henriette; Nicolaisen, Mogens

    2013-01-01

    Currently, the most efficient detection and precise quantification of phytoplasmas is by real-time PCR. Compared to nested PCR, this method is less sensitive to contamination and is less work intensive. Therefore, a universal real-time PCR method will be valuable in screening programs and in other...

  4. Evaluation of Aspergillus PCR Protocols for Testing Serum Specimens

    NARCIS (Netherlands)

    White, P.L.; Mengoli, C.; Bretagne, S.; Cuenca-Estrella, M.; Finnstrom, N.; Klingspor, L.; Melchers, W.J.G.; McCulloch, E.; Barnes, R.A.; Donnelly, J.P.; Loeffler, J.

    2011-01-01

    A panel of human serum samples spiked with various amounts of Aspergillus fumigatus genomic DNA was distributed to 23 centers within the European Aspergillus PCR Initiative to determine analytical performance of PCR. Information regarding specific methodological components and PCR performance was

  5. Multiplex polymerase chain reaction (PCR) on a SU-8 chip

    DEFF Research Database (Denmark)

    Christensen, Troels Balmer; Bang, Dang Duong; Wolff, Anders

    2008-01-01

    We present the detection of Campylobacter at species level using multiplex PCR in a micro fabricated PCR chip. The chip is based on the polymer SU-8 that allows integration with different microfluidic components, e.g., sample pre-treatment before PCR, and DNA detection simultaneously with or afte...

  6. Determining Fungi rRNA Copy Number by PCR

    Science.gov (United States)

    The goal of this project is to improve the quantification of indoor fungal pollutants via the specific application of quantitative PCR (qPCR). Improvement will be made in the controls used in current qPCR applications. This work focuses on the use of two separate controls within ...

  7. Evaluation of Aspergillus PCR Protocols for Testing Serum Specimens

    NARCIS (Netherlands)

    White, P.L.; Mengoli, C.; Bretagne, S.; Cuenca-Estrella, M.; Finnstrom, N.; Klingspor, L.; Melchers, W.J.G.; McCulloch, E.; Barnes, R.A.; Donnelly, J.P.; Loeffler, J.

    2011-01-01

    A panel of human serum samples spiked with various amounts of Aspergillus fumigatus genomic DNA was distributed to 23 centers within the European Aspergillus PCR Initiative to determine analytical performance of PCR. Information regarding specific methodological components and PCR performance was re

  8. Determining Fungi rRNA Copy Number by PCR

    Science.gov (United States)

    The goal of this project is to improve the quantification of indoor fungal pollutants via the specific application of quantitative PCR (qPCR). Improvement will be made in the controls used in current qPCR applications. This work focuses on the use of two separate controls within ...

  9. An efficient multistrategy DNA decontamination procedure of PCR reagents for hypersensitive PCR applications.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Sophie Champlot

    Full Text Available BACKGROUND: PCR amplification of minute quantities of degraded DNA for ancient DNA research, forensic analyses, wildlife studies and ultrasensitive diagnostics is often hampered by contamination problems. The extent of these problems is inversely related to DNA concentration and target fragment size and concern (i sample contamination, (ii laboratory surface contamination, (iii carry-over contamination, and (iv contamination of reagents. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Here we performed a quantitative evaluation of current decontamination methods for these last three sources of contamination, and developed a new procedure to eliminate contaminating DNA contained in PCR reagents. We observed that most current decontamination methods are either not efficient enough to degrade short contaminating DNA molecules, rendered inefficient by the reagents themselves, or interfere with the PCR when used at doses high enough to eliminate these molecules. We also show that efficient reagent decontamination can be achieved by using a combination of treatments adapted to different reagent categories. Our procedure involves γ- and UV-irradiation and treatment with a mutant recombinant heat-labile double-strand specific DNase from the Antarctic shrimp Pandalus borealis. Optimal performance of these treatments is achieved in narrow experimental conditions that have been precisely analyzed and defined herein. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: There is not a single decontamination method valid for all possible contamination sources occurring in PCR reagents and in the molecular biology laboratory and most common decontamination methods are not efficient enough to decontaminate short DNA fragments of low concentration. We developed a versatile multistrategy decontamination procedure for PCR reagents. We demonstrate that this procedure allows efficient reagent decontamination while preserving the efficiency of PCR amplification of minute quantities of DNA.

  10. Detección de mutaciones en los genes K-ras, H-ras y EGFR en muestras de plasma sanguíneo y cepillado cervical de pacientes con neoplasia intraepitelial cervical (NIC III y cáncer de cuello uterino

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Dabeiba Adriana García

    2009-03-01

    Full Text Available Introducción: El cáncer cervical es el segundo cáncer más importante en mujeres a nivel mundial y la segunda causa de muerte en mujeres por cáncer. Se ha demostrado que el proceso de carcinogénesis cervical presenta componentes tanto genéticos, epigenéticos y medio ambientales. En la actualidad, muchos estudios se encaminan en la búsqueda de marcadores moleculares como mutaciones en oncogenes y/o genes tumor supresor que se asocien con la progresión de esta entidad. Los genes candidatos más estudiados en cáncer cervical en distintas poblaciones han sido H-ras, K-ras, EGFR entre otros.Objetivos: Se identificó el virus de papiloma humano (VPH genérico y específico en el ADN libre de plasma y de cepillado cervical de pacientes con cáncer cervical invasivo y con neoplasia intraepitelial cervical (NIC III además de evaluar alteraciones genéticas, como mutaciones en los genes H-ras, K-ras y EGFR.Metodología: Para ello se detectó el VPH genérico mediante PCR con los iniciadores GP5+/GP6+, y específico para VPH 16 y 18 en la región E6/E7. Para detectar las mutaciones en el codón 12 de H-ras, codones 12 y 13 de K-Ras y el exón 21 de EGFR se realizó mediante secuenciación directa de los productos de PCR de estos fragmentos génicos.Resultados: Obteniendo una buena correlación entre las muestras de plasma sanguíneo y los cepillados cervicales, tanto para los hallazgos de VPH p=0.0374 como para las mutaciones evaluadas p=0. En general, para EGFR en el exón 21 no se encontraron mutaciones, al igual que para los codones 12 y 13 en K-ras y codón 12 en H-ras.Conclusión: El uso del ADN presente en el plasma puede ser relevante para el análisis de mutaciones y de la presencia de marcadores tumorales cuando no se dispone de otras muestras.

  11. Sviluppo e valutazione preliminare di una real-time PCR per l’identificazione di Culicoides obsoletus sensu strictu, C. scoticus e C. montanus all’interno del complesso Obsoletus in Italia

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Maria Goffredo

    2010-06-01

    Full Text Available Oggetto dello studio è la messa a punto di un metodo PCR real time che utilizza il Power SYBR Green come colorante fluorescente intercalante, seguito dall’analisi delle curve di melting in fase di post-amplificazione. La sequenza target è l’Internal Transcribed Spacer 2 (ITS2 del DNA ribosomiale e rappresenta l’evoluzione della metodica tradizionale PCR gel-based utilizzata per identificare tre differenti specie di Culicoides incluse nel cosiddetto Obsoletus complex. Con il metodo sviluppato sono stati analizzati centoquaranta Culicoides morfologicamente classificati come appartenenti all’Obsoletus complex, e i risultati confrontati con quelli ottenuti combinando l’identificazione morfologica con PCR su gel. Mediante l’analisi del pattern specie-specifico delle curve di dissociazione, è stato possibile identificare tra gli insetti 52 C. scoticus, 82 C. obsoletus sensu strictu e 6 C. montanus. Questi risultati concordano con quelli ottenuti combinando l’identificazione morfologica con la PCR gel-based che rappresenta il metodo impiegato di routine nelle attività diagnostiche del piano di sorveglianza entomologico della Bluetongue. Considerando la flessibilità diagnostica, la rapidità, la possibilità di automazione, il più elevato livello di qualità ed espressione dei risultati, la PCR real time ITS2 ha dimostrato di essere più funzionale ed efficace rispetto alla PCR su gel, soprattutto nell’ambito di un’estesa attività di monitoraggio.

  12. Comparison of a Commercially Available Repetitive-Element PCR System (DiversiLab) with PCR Ribotyping for Typing of Clostridium difficile Strains ▿

    OpenAIRE

    Eckert, C; Van Broeck, J; Spigaglia, P.; Burghoffer, B.; Delmée, M; Mastrantonio, P; Barbut, F

    2011-01-01

    This study compared a repetitive-element PCR (rep-PCR) method (DiversiLab system) to PCR ribotyping. The discriminatory power of rep-PCR was 0.997. Among the PCR ribotype 027 isolates tested, different rep types could be distinguished. rep-PCR showed a higher discriminatory power than PCR ribotyping. Nevertheless, this method requires technical skill, and visual interpretation of rep-PCR fingerprint patterns may be difficult.

  13. Comparison of a Commercially Available Repetitive-Element PCR System (DiversiLab) with PCR Ribotyping for Typing of Clostridium difficile Strains ▿

    OpenAIRE

    Eckert, C.; Van Broeck, J.; Spigaglia, P.; Burghoffer, B; Delmée, M; Mastrantonio, P; Barbut, F

    2011-01-01

    This study compared a repetitive-element PCR (rep-PCR) method (DiversiLab system) to PCR ribotyping. The discriminatory power of rep-PCR was 0.997. Among the PCR ribotype 027 isolates tested, different rep types could be distinguished. rep-PCR showed a higher discriminatory power than PCR ribotyping. Nevertheless, this method requires technical skill, and visual interpretation of rep-PCR fingerprint patterns may be difficult.

  14. Obtención de sales biliares de magnesio mediante secado por aspersión

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jorge E Rodríguez Chanfrau

    Full Text Available Introducción: la industria farmacéutica cubana, desde la década del 60 del siglo XX, tiene entre sus líneas básicas de producción la obtención de ácidos biliares y sus derivados salinos a partir de la bilis bovina. Este proceso consiste en la saponificación de la bilis y la posterior precipitación del ácido cólico, el cual es transformado en la sal de magnesio mediante un proceso de reacción con hidróxido de magnesio. La materia prima activa obtenida es utilizada como ingrediente farmacéutico activo en la elaboración de tabletas para el tratamiento de desordenes gastrointestinales, así como en los síntomas producidos por un mal funcionamiento de la vesícula biliar. Objetivo: modificar el proceso de secado empleado en la actualidad mediante una variante de secado por aspersión. Métodos: se estableció un procedimiento para el secado; se realizaron los estudios a escala de banco. Se compararon los resultados con el proceso tradicional; se realizaron evaluaciones química, física y tecnológicas; entre ellas por microscopia electrónica y espectroscopia infrarroja. Resultados: al aplicar el procedimiento de secado por aspersión se obtuvo una materia prima similar en su composición a la obtenida en el procedimiento tradicional, pero con mejores características físico-químicas, lo que favoreció el proceso posterior de elaboración de la forma terminada. Conclusiones: partiendo de los resultados podemos afirmar que el proceso tecnológico de secado por aspersión desarrollado para la elaboración de las sales biliares de magnesio garantiza la calidad del producto final y mejora las condiciones de trabajo y condiciones ambientales.

  15. Tratamiento paliativo de los derrames pleurales malignos mediante abrasión química

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Juan Antonio Castellanos González

    Full Text Available Introducción: el tratamiento del derrame pleural maligno constituye un reto para los cirujanos. Su erradicación permanente ha constituido un largo bregar, y para ello se ha utilizado un numeroso grupo de sustancias. Objetivo: mostrar los resultados del uso de diferentes sustancias químicas para conseguir la fusión de las pleuras en el derrame pleural maligno. Métodos: fueron estudiados 116 pacientes con derrames malignos de pleura tratados mediante toracocentesis y escleroterapia química en el Hospital Universitario "Comandante Manuel Fajardo" entre enero de 2001 y el 2013. El diagnóstico del 100 % de los pacientes fue clínico e imaginológico, con estudio del líquido pleural. Después de la toma de muestra se evacuó todo el contenido mediante un catéter colector y la instilación de la solución esclerosante. Como agentes irritantes se utilizó bleomicina, tetraciclina, amoxicilina y povidona yodada. Resultados: la causa más frecuente de derrame pleural resultó ser el cáncer de mama, seguido por el de pulmón y el ovario. En el hombre fue más frecuente el cáncer de pulmón y en la mujer el cáncer de mama. Predominó el sexo femenino y, específicamente, la sexta década de la vida. El 52,4 % de los pacientes necesitó dos sesiones terapéuticas y el 15,6 % no presentó recidiva después de la primera sesión. Conclusiones: los resultados fueron similares con todas las sustancias utilizadas. La intervención paliativa logró mejorar la calidad de vida al aliviar los síntomas de los pacientes y disminuir la hospitalización.

  16. Tratamiento del polvo de aluminio mediante disolución acuosa

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    López, F. A.

    2004-10-01

    Full Text Available Aluminium dust from aluminium remelting industry is a hazardous residue because of its high reactivity in the presence of water. In order to apply the new European Directive about landfill of waste, a study of its hydrolysis was carried out. The influence of temperature, time and pH on the hydrolysis of the aluminium dust was studied. The hydrolysed solids were characterized by XRD and AAS; in the aqueous solutions the pH and the ionic conductivity were determined. The evolved gases were analysed by mass spectrometry. The reactivity of the dust, before and after hydrolysis, was investigated by analysing the ammonia, hydrogen sulphide and metallic aluminium. By hydrolysis at 60 °C and 48 h a much lower reactive material was obtained which could be disposed with minimal environmental impact.

    El polvo de aluminio es un residuo generado en la metalurgia secundaria del aluminio y considerado peligroso como consecuencia de su elevada reactividad en presencia de humedad. Con objetivo de buscar un procedimiento de pretratamiento de dicho residuo, de acuerdo con la Directiva Europea sobre vertederos, se ha realizado el estudio del comportamiento del polvo de aluminio en medio acuoso. Para ello, se han analizado la influencia de la temperatura, el tiempo y el pH de reacción en su hidrólisis. Los sólidos hidrolizados se caracterizaron mediante EAA y DRX, mientras que en las soluciones acuosas resultantes se determinaron el pH y la conductividad iónica. Los gases liberados durante el proceso de hidrólisis se analizaron mediante espectrometría de masas. Asimismo, se ha determinado la reactividad del residuo antes y después de la hidrólisis, analizando amoniaco, sulfuro de hidrógeno y aluminio metálico. La hidrólisis, a 60 °C y después de 48 h, permite obtener material de muy baja reactividad que podría ser almacenado en vertedero.

  17. Estudio mediante afm de estructuras de silicalita para la separación de gases

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Prádanos, P.

    2004-02-01

    Full Text Available In this work, we study films of silicalite crystals used in gas separation processes. These crystals were obtained by hydrothermal synthesis during different times and using different gel composition. They were deposited on an alumina support growing in two preferential directions. Finally, the material was placed in a stove at 480ºC during 8 h in order to remove the structurant agent with heating and cooling rates of 0.5 y 2 ºC/min respectively. The resulting surfaces were analysed by atomic force microscopy (AFM in tapping mode in order to notice the deposition of the silicalite crystals in the indicated directions, and also to distinguish the evolution of the nuclei growth. At the same time, the porous structure of silicalite has been determined, leading to results in good agreement with those obtained by other techniques.

    En este trabajo se han estudiado láminas de silicalita con aplicación en los procesos de separación de gases. Dichas láminas se han depositado mediante síntesis hidrotermal durante distintos tiempos y usando varias composiciones en el gel precursor. La deposición se hizo sobre un soporte de alúmina con crecimiento preferencial en dos direcciones. Finalmente las láminas se calcinaron a 753 K durante 8 h para eliminar el agente estructurante, usando velocidades de calentamiento y enfriamiento de 0.5 y 1 K/min respectivamente. Las superficies resultantes se han analizado mediante microscopía de fuerza atómica en modo de contacto-intermitente (tapping con el fin de ver si efectivamente se ha conseguido depositar cristales de silicalita en las direcciones indicadas y seguir la evolución de crecimiento de los núcleos. Por otro lado, se ha determinado la estructura porosa de la silicalita comprobando que los resultados concuerdan con los obtenidos por otras técnicas.

  18. Microestructura y propiedades de capas de tribaloy T-800 depositadas mediante plaqueado láser

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Navas, C.

    2004-04-01

    Full Text Available The present work is based on obtaining Co based coatings (Tribaloy T-800 on plates of 18/8 stainless steel (AISI 304 by laser cladding technique. After the treatment, samples were characterized by optical and scanning electron microscopy with EDS analysis. The elemental composition of the coating was determined with a glow discharge lamp spectrometer (GDL. The study of the interface revealed a good adherence between the substrate and coating without substantial defects. For the laser cladded coatings, the microstructure was dendritic with a high degree of refinement and chemical homogeneity close to the original powder. The grain coarsening was observed in the overlapping zones due to the second heat treatment. Microhardness of the coatings reached 750 HV, a considerably higher value than the substrate hardness (200 HV. Also, the coating corrosion resistance in saline solutions had a great improvement.

    El presente trabajo se centra en la obtención de capas de aleación base Cobalto (Tribaloy T-800 sobre un sustrato de acero inoxidable 18/8 (AISI 304 mediante la técnica de plaqueado láser. Tras los tratamientos, se caracterizaron las probetas mediante microscopía óptica y electrónica de barrido con microanálisis (EDS. La composición elemental del recubrimiento se determinó en un espectrómetro de emisión óptica con fuente de excitación (GDL. El estudio de la interfase reveló una perfecta adherencia entre el recubrimiento y el material base, sin defectos apreciables. La microestructura de las capas depositadas es dendrítica con un alto grado de refinamiento y una homogeneidad química a lo largo del cordón y con valores muy próximos a los del polvo de partida. En las zonas de solape entre cordones, se observó un crecimiento del grano debido al segundo tratamiento térmico recibido. La microdureza de las capas alcanza los 750 HV, valor considerablemente superior al del sustrato (200 HV. Asimismo, se obtuvo una mejora

  19. Identification of periodontopathogen microorganisms by PCR technique

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Milićević Radovan

    2008-01-01

    Full Text Available INTRODUCTION Periodontitis is an inflammatory disease of the supporting tissues of teeth and is a major cause of tooth loss in adults. The onset and progression of periodontal disease is attributed to the presence of elevated levels of a consortium of pathogenic bacteria. Gram negative bacteria, mainly strict anaerobes, play the major role. OBJECTIVE The present study aimed to assess the presence of the main types of microorganisms involved in the aetiopathogenesis of periodontal disease: Porphyromonas gingivalis, Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Eikenella corrodens, Treponema denticola, Tanerella forsythia and Prevotella intermedia in different samples collected from the oral cavity of 90 patients diagnosed with periodontitis. METHOD Bacterial DNA detection was performed in diverse biological materials, namely in dental plaque, gingival tissue and saliva, by means of multiplex PCR, a technique that allows simultaneous identification of two different bacterial genomes. RESULTS In the dental plaque of the periodontitis patients, Treponema denticola dominated. In the gingival tissue, Tannerella forsythia and Treponema denticola were the microbiota most frequently detected, whilst in saliva Treponema denticola and Eikenella corrodens were found with the highest percentage. CONCLUSION The identification of microorganisms by multiplex PCR is specific and sensitive. Rapid and precise assessment of different types of periodontopathogens is extremely important for early detection of the infection and consequently for the prevention and treatment of periodontal disease. In everyday clinical practice, for routine bacterial evaluation in patients with periodontal disease, the dental plaque is the most suitable biological material, because it is the richest in periodontal bacteria.

  20. In silico PCR primer designing and validation.

    Science.gov (United States)

    Kumar, Anil; Chordia, Nikita

    2015-01-01

    Polymerase chain reaction (PCR) is an enzymatic reaction whose efficiency and sensitivity largely depend on the efficiency of the primers that are used for the amplification of a concerned gene/DNA fragment. Selective amplification of nucleic acid molecules initially present in minute quantities provides a powerful tool for analyzing nucleic acids. In silico method helps in designing primers. There are various programs available for PCR primer design. Here we described designing of primers using web-based tools like "Primer3" and "Web Primer". For designing the primer, DNA template sequence is required that can be taken from any of the available sequence databases, e.g., RefSeq database. The in silico validation can be carried out using BLAST tool and Gene Runner software, which check their efficiency and specificity. Thereafter, the primers designed in silico can be validated in the wet lab. After that, these validated primers can be synthesized for use in the amplification of concerned gene/DNA fragment.

  1. A Guide to Using STITCHER for Overlapping Assembly PCR Applications.

    Science.gov (United States)

    O'Halloran, Damien M

    2017-01-01

    Overlapping PCR is commonly used in many molecular applications that include stitching PCR fragments together, generating fluorescent transcriptional and translational fusions, inserting mutations, making deletions, and PCR cloning. Overlapping PCR is also used for genotyping and in detection experiments using techniques such as loop-mediated isothermal amplification (LAMP). STITCHER is a web tool providing a central resource for researchers conducting all types of overlapping assembly PCR experiments with an intuitive interface for automated primer design that's fast, easy to use, and freely available online.

  2. Detección de información oculta mediante potenciales relacionados con eventos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Odette Terol

    2014-01-01

    Full Text Available Existe un interés considerable en hallar métodos que nos ayuden a saber cuándo una persona miente y cuándo dice la verdad desde un punto de vista forense. Actualmente, una de las líneas de investigación se inclina hacia el uso de potenciales relacionados con eventos. Se pretende hacer una revisión de los artículos que estudian estos procedimientos mediante distintos métodos: propiedades, fiabilidad, validez y limitaciones. Los resultados indican tasas de acierto en la discriminación de culpables en un rango de 7 al 100 por ciento, y en la de inocentes de 31 a 100 por ciento. La gran variabilidad y la posibilidad de “falsear” las respuestas llevan a cuestionar la inexactitud utilizada en algunos círculos mediáticos respecto a las cualidades y finalidades de dicha prueba. Se concluye la necesidad de profundizar más la posibilidad de que esta prueba sea utilizada con fines forenses.

  3. Medida de similaridad entre imágenes de marcas de ganado mediante distribuciones de forma

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Germán Sánchez Torres

    2014-12-01

    Full Text Available Este documento reporta los resultados de una investigación orientada hacia el diseño de un método de tratamiento de imágenes digitales para la automatización de los procesos de registro y control de marcas de ganado requeridas por las regulaciones del sector ganadero en Colombia. El método permite automatizar los procesos de búsqueda y de comparación necesarios para garantizar la unicidad de las marcas dentro de un sistema asistido por computadora. Se inicia con la generación de un histograma estimado de la geometría de la marca, lo que permite comparar y detectar similitudes entre las figuras previamente almacenadas, mediante una métrica de similitud basada en la distancia de Minkowski. Los resultados obtenidos indican que el método es adecuado para realizar un proceso de discriminación de dichas imágenes, reducir las ambigüedades y garantizar la unicidad de los registros. Los resultados obtenidos y un análisis de su aplicación son reportados.

  4. DESULFURACIÓN DE RELAVE MEDIANTE LA FLOTACIÓN DE SULFUROS DE HIERRO

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Luis Valderrama Campusano

    2015-12-01

    Full Text Available En Chile la minería se desarrolla principalmente en  la concentración de cobre, molibdeno, oro y plata, mediante el proceso de flotación. Este genera grandes tonelajes de relaves que contienen diversas minerales, principalmente pirita. Dado que estos minerales se depositan en los tranques, estos pueden generar aguas ácidas; se propone como alternativa la desulfuración de los súlfuros por flotación. En una primera parte se estudió la flotabilidad de la pirita en un tubo Hallimond, utilizando como colector AP 404. Luego se realizaron pruebas de flotación a nivel de laboratorio en celda Denver D-12, utilizando pulpa de relave fresco de la etapa rougher de un circuito de flotación de cobre,  determinando el pH óptimo y dosificación de colector y espumantes. Pruebas de cinética de flotación permitieron determinar el tiempo óptimo de flotación tanto para la etapa rougher como  para la etapa scavenger. Se concluye que la flotación de los relaves sea una técnicamente factible su desulfuración,  obteniendo relaves que contienen  0,08% de pirita.

  5. Tratamiento del tortícolis congénito mediante control estimular y fisioterapia

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    MARÍA ASUNCIÓN VÁZQUEZ VILÀ

    2004-01-01

    Full Text Available Presentamos un caso clínico de tortícolis congénito y su tratamiento mediante control estimular y fisioterapia, por la alta frecuencia del tortícolis en la práctica clínica y por los buenos resultados que en general presenta el tratamiento conservador en estos casos, principalmente cuando éste se inicia de forma precoz. El caso presentado es de una niña con tortícolis congénito izquierdo, sin patologías asociadas, en tratamiento desde los 15 días hasta los nueve meses de edad, con una buena evolución. Mostramos los antecedentes, exploración y pruebas complementarias realizadas, el tratamiento, que se ha dividido en varios períodos (15 días- 2 meses; 2-4 meses; 4-9 meses, la orientación a los padres y la evolución de la niña. Como conclusión fundamental destacar la importancia del diagnóstico y tratamiento precoces, y la orientación a los padres para que estimulen al niño adecuadamente y colaboren en el tratamiento.

  6. Fenilcetonúria: estudo clínico e mediante biópsia cerebral

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Aron J. Diament

    1967-03-01

    Full Text Available Foram relatados 6 casos de fenilcetonúria (oligofrenia fenilpirúvica, sendo os pacientes, irmãos dois a dois, pertencentes a três famílias distintas. Foram feitos estudos genealógico, clínico e laboratorial, incluindo a dosagem de fenilalanina sérica. O interesse maior foi o de mostrar a normalidade do estudo histopatológico realizado por meio de biópsias cerebrais em 4 casos, apesar de não ter sido feito estudo histoquímico, atualmente considerado como necessário. Esta normalidade das biópsias não teve qualquer relação com o nível mental, com as alterações eletrencefalográficas cu com atrofias cerebrais assinaladas em alguns casos mediante encefalografia gasosa. Todos os casos foram tratados com dieta especial (tipo Lofenalac complementada com alimentos de baixo teor em fenilalanina. Dosagens de fenilalanina sérica estão sendo feitas antes e depois do uso de tais dietas, sendo ainda muito cedo para qualquer conclusão.

  7. Prácticas educativas. Desarrollo de la lectura mediante estrategias integradoras

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Maira Solé

    2005-01-01

    Full Text Available La lectura y la escritura son procesos que cada día ameritan nuevos cambios y transformaciones. La propuesta de un Proyecto Pedagógico Integrador, (Fraca 2003 desarrollado con éxito en algunas instituciones venezolanas, se perfila como una alternativa significativa para el desarrollo de estos elementos. La idea o núcleo central es la integración de las diferentes asignaturas curriculares y lograr una globalización partiendo de sus objetivos y contenidos programáticos. El eje pedagógico integrador le permite al docente, evidenciar con mayor prontitud los resultados mediante actividades prácticas de lectura y escritura. Así mismo combina elementos claves del aprendizaje ausbeliano: información previa, información nueva y construcción de la información definitiva o integrada. La puesta en ejecución de las estrategias integradoras, en esta ocasión por maestros en formación (UNEG, a diferentes niños de escuelas del Estado Bolívar (Venezuela, certificando cómo la lectura y la escritura pueden tener un espacio ideal y significativo en la instrucción actual. Solo se necesita la intención, creatividad, dinamismo e ingenio.

  8. Operación de un PLC Mediante un PDA Vía ZIGBEE

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Juan Zuluaga-Botero

    2015-07-01

    Full Text Available En este artículo se muestra la parte preliminar de interconexión de un módulo ZigBee con un Asistente Digital Personal (PDA a través de la red del Sistema de telefonía Móvil Global (GSM, para aplicación futura de comunicación con un Controlador Lógico Programable (PLC. Esta aplicación permite realizar monitoreo y control del sistema, de manera remota y con dispositivos móviles siendo el alcance del proyecto de investigación. Para este proyecto inicialmente se realizan comunicaciones que permiten empalmar las tecnologías de las redes de telefonía móvil celular con la red ZigBee, haciendo una interfaz transparente para el usuario, presentando dichos resultados en este artículo. Para esto se trabaja con tramas de datos básicas a través de la red de telefonía móvil celular, mediante mensajería corta recibida por el puerto serial del Zigbee remoto, utilizando microcontroladores para el control de los módulos que conforman esta parte del sistema de comunicación, estableciendo la interfaz con el dispositivo móvil o Smartphone vía Zigbee.

  9. Análisis de una columna desbutanizadora mediante técnica de perfilaje gamma

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Óscar Chaverri

    2007-05-01

    Full Text Available En este trabajo se reportan los resultados de un estudio, realizado mediante la técnica no destructiva de perfilaje por rayos gamma, de una columna desbutanizadora en una refinería de petróleo. Dicho estudio tuvo entre sus objetivos el de resaltar los beneficios que se derivan de la aplicación pacifica de la energía nuclear, en la determinación de problemas que afectan la eficiencia y seguridad de procesos industriales. En este caso particular, se inspeccionó parte de una torre para la destilación de petróleo, y se determinó la presencia de algunas pequeñas anomalías, aunque el funcionamiento de la columna era correcto y seguro. Cabe recalcar que,por tratarse de una técnica no destructiva y con la posibilidad de medir a través de la pared de la columna, el ensayo fue realizado sin necesidad de abrir la torre misma o de introducir personal técnico en su interior.

  10. Galactosemia: Diagnóstico precoz mediante estudio enzimático

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Úrsula Carrillo Estrada

    2003-09-01

    Full Text Available Se presentan los resultados obtenidos del estudio realizado a un paciente masculino de 45 días de nacido, cuyo motivo de ingreso fue pérdida de peso, decaimiento, retraso psicomotor y crisis de hipoglucemia. Los síntomas comenzaron en el período neonatal y coincidieron con la introducción de la lactancia materna. En estudios realizados se constató en la orina la presencia de lactosa y galactosa. Se confirma el diagnóstico por estudio enzimático. La evolución clínica ha sido satisfactoria. El tratamiento dietético que excluía a los alimentos que contienen galactosa y lactosa fue de mucha importancia. Es el primer caso diagnosticado en Cuba mediante estudio enzimático.This paper presents the results of a study performed on a 45-day old male patient who was admitted to the hospital for weight loss, tiredness, psychomotor retardation and hypoglicemic crisis. The symptoms had begun in the neonatal period and had coincided with the introduction of breast feeding. The studies detected lactose and galactose in urine. The enzymatic study confirmed the diagnosis. The clinical recovery was satisfactory. The dietary treatment that excluded foods containing galactose and lactose was important and successful. He is the first case diagnosed on enzymatic study in Cuba.

  11. BIORREMEDIACIÓN DE UN SUELO CON DIESEL MEDIANTE EL USO DE MICROORGANISMOS AUTÓCTONOS

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    ARRIETA RAMÍREZ OLGA MARIA

    2012-07-01

    Full Text Available En este estudio, se aisló y caracterizó bioquímica y molecularmente un consorcio bacteriano capaz de degradar los diferentes hidrocarburos presentes en un combustible diesel,conformado por los siguientes géneros: Enterobacter sp, Bacillus sp, Staphylococcus aureus, Sanguibacter soli, Arthrobacter sp y Flavobacterium sp, a partir de un suelo contaminado con diesel a escala de laboratorio, y tratado mediante 2 tecnologías de biorremediación: atenuación natural y bioestimulación. Se definió como parámetro de control la concentración de Hidrocarburos Totales del Petróleo (HTP y para el cual, se obtuvo una reducción en la concentración en un periodo de 4 meses de 36,86% para atenuación natural y 50,99% para bioestimulación. La medición de la eficiencia de remoción de hidrocarburos se cuantificó por cromatografía de gases acoplada a masas (GC-MS.

  12. LA EXPERIENCIA DE UNA CLASE INTEGRADA MEDIANTE RESOLUCIÓN DE PROBLEMAS

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Fernanda Ortiz Rivera

    2014-05-01

    Full Text Available Es una experiencia en la Institución educativa Tomas Cipriano de Mosquera con estudiantes del ciclo noveno en una clase de ciencias naturales sobre el sentido de la audición, teniendo en cuenta integrar la biología  y la física  mediante el tema del órgano de la audición con el tema del sonido, en el marco de un enfoque didáctico por resolución de problemas, en el cual la pregunta problema central que se generó a los estudiantes, producto de consultar sus intereses, fue: ¿por qué se produce la sordera? Esta pregunta se realizó al comienzo y al final de la clase, mostrando de esta manera al final buenos resultados de aprendizaje en los estudiantes, ya que fueron construyendo  nociones, ideas y conceptos necesarios sobre el sonido con sus propiedades y cualidades; y la audición con las funciones y partes del oído, para poder resolver la pregunta central gracias a una secuencia didáctica de clase que construimos cuidadosamente en el que incluía experimentos, lecturas, explicaciones, materiales didácticos, entre otros, siendo así una clase muy activa y participativa, ya que el estudiante siempre fue el que llevo el papel principal de la clase.

  13. Aplicación de la técnica de PCR (Reacción en cadena de la polimerasa) en el diagnóstico y epidemiología de la tuberculosis en animales

    OpenAIRE

    Aranaz Martín, Alicia

    2012-01-01

    El trabajo describe el desarrollo de un método de extracción del ADN de micobacterias a partir de muestras clínicas. El ADN obtenido se amplifico mediante pcr con iniciadores específicos de genero y especie o complejo. Respecto al cultivo, la sensibilidad de los protocolos fue del 90,6% (muestras de vacuno, caprino, ciervos y jabalíes) y del 100% (perros, gatos y aves). Esta técnica reduce el tiempo necesario para el diagnostico a 2 o 3 días. Al evaluar la técnica random amplificación polymor...

  14. cDNA amplification by SMART-PCR and suppression subtractive hybridization (SSH)-PCR.

    Science.gov (United States)

    Hillmann, Andrew; Dunne, Eimear; Kenny, Dermot

    2009-01-01

    The comparison of two RNA populations that differ from the effects of a single-independent variable, such as a drug treatment or a specific genetic defect, can identify differences in the abundance of specific transcripts that vary in a population-dependent manner. There are a variety of methods for identifying differentially expressed genes, including microarray, SAGE, qRT-PCR, and DDGE. This protocol describes a potentially less sensitive yet relatively easy and cost-effective alternative that does not require prior knowledge of the transcriptomes under investigation and is particularly applicable when minimal levels of starting material, RNA, are available. RNA input can often be a limiting factor when analyzing RNA from, for example, rigorously purified blood cells. This protocol describes the use of SMART-PCR to amplify cDNA from sub-microgram levels of RNA. The amplified cDNA populations under comparison are then subjected to suppression subtractive hybridization (SSH-PCR), a technique that couples subtractive hybridization with suppression PCR to selectively amplify fragments of differentially expressed genes. The final products are cDNA populations enriched for significantly over-represented transcripts in either of the two input RNA preparations. These cDNA populations may then be cloned to make subtracted cDNA libraries and/or used as probes to screen subtracted cDNA, global cDNA, or genomic DNA libraries.

  15. Simultaneous detection of ricin and abrin DNA by real-time PCR (qPCR).

    Science.gov (United States)

    Felder, Eva; Mossbrugger, Ilona; Lange, Mirko; Wölfel, Roman

    2012-09-01

    Ricin and abrin are two of the most potent plant toxins known and may be easily obtained in high yield from the seeds using rather simple technology. As a result, both toxins are potent and available toxins for criminal or terrorist acts. However, as the production of highly purified ricin or abrin requires sophisticated equipment and knowledge, it may be more likely that crude extracts would be used by non-governmental perpetrators. Remaining plant-specific nucleic acids in these extracts allow the application of a real-time PCR (qPCR) assay for the detection and identification of abrin or ricin genomic material. Therefore, we have developed a duplex real-time PCR assays for simultaneous detection of ricin and abrin DNA based on the OmniMix HS bead PCR reagent mixture. Novel primers and hybridization probes were designed for detection on a SmartCycler instrument by using 5'-nuclease technology. The assay was thoroughly optimized and validated in terms of analytical sensitivity. Evaluation of the assay sensitivity by probit analysis demonstrated a 95% probability of detection at 3 genomes per reaction for ricin DNA and 1.2 genomes per reaction for abrin DNA. The suitability of the assays was exemplified by detection of ricin and abrin contaminations in a food matrix.

  16. A survey of tools for the analysis of quantitative PCR (qPCR data

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Stephan Pabinger

    2014-09-01

    Our comprehensive survey showed that most tools use their own file format and only a fraction of the currently existing tools support the standardized data exchange format RDML. To allow a more streamlined and comparable analysis of qPCR data, more vendors and tools need to adapt the standardized format to encourage the exchange of data between instrument software, analysis tools, and researchers.

  17. Simultaneous Detection of Ricin and Abrin DNA by Real-Time PCR (qPCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Roman Wölfel

    2012-08-01

    Full Text Available Ricin and abrin are two of the most potent plant toxins known and may be easily obtained in high yield from the seeds using rather simple technology. As a result, both toxins are potent and available toxins for criminal or terrorist acts. However, as the production of highly purified ricin or abrin requires sophisticated equipment and knowledge, it may be more likely that crude extracts would be used by non-governmental perpetrators. Remaining plant-specific nucleic acids in these extracts allow the application of a real-time PCR (qPCR assay for the detection and identification of abrin or ricin genomic material. Therefore, we have developed a duplex real-time PCR assays for simultaneous detection of ricin and abrin DNA based on the OmniMix HS bead PCR reagent mixture. Novel primers and hybridization probes were designed for detection on a SmartCycler instrument by using 5′-nuclease technology. The assay was thoroughly optimized and validated in terms of analytical sensitivity. Evaluation of the assay sensitivity by probit analysis demonstrated a 95% probability of detection at 3 genomes per reaction for ricin DNA and 1.2 genomes per reaction for abrin DNA. The suitability of the assays was exemplified by detection of ricin and abrin contaminations in a food matrix.

  18. DNA polymerase preference determines PCR priming efficiency

    Science.gov (United States)

    2014-01-01

    Background Polymerase chain reaction (PCR) is one of the most important developments in modern biotechnology. However, PCR is known to introduce biases, especially during multiplex reactions. Recent studies have implicated the DNA polymerase as the primary source of bias, particularly initiation of polymerization on the template strand. In our study, amplification from a synthetic library containing a 12 nucleotide random portion was used to provide an in-depth characterization of DNA polymerase priming bias. The synthetic library was amplified with three commercially available DNA polymerases using an anchored primer with a random 3’ hexamer end. After normalization, the next generation sequencing (NGS) results of the amplified libraries were directly compared to the unamplified synthetic library. Results Here, high throughput sequencing was used to systematically demonstrate and characterize DNA polymerase priming bias. We demonstrate that certain sequence motifs are preferred over others as primers where the six nucleotide sequences at the 3’ end of the primer, as well as the sequences four base pairs downstream of the priming site, may influence priming efficiencies. DNA polymerases in the same family from two different commercial vendors prefer similar motifs, while another commercially available enzyme from a different DNA polymerase family prefers different motifs. Furthermore, the preferred priming motifs are GC-rich. The DNA polymerase preference for certain sequence motifs was verified by amplification from single-primer templates. We incorporated the observed DNA polymerase preference into a primer-design program that guides the placement of the primer to an optimal location on the template. Conclusions DNA polymerase priming bias was characterized using a synthetic library amplification system and NGS. The characterization of DNA polymerase priming bias was then utilized to guide the primer-design process and demonstrate varying amplification

  19. A RAPID PCR-QUALITY DNA EXTRACTION METHOD IN FISH

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    LI Zhong; LIANG Hong-Wei; ZOU Gui-Wei

    2012-01-01

    PCR has been a general preferred method for biological research in fish, and previous research have enabled us to extract and purify PCR-quality DNA templates in laboratories[1-4]. The same problem among these procedures is waiting for tissue digesting for a long time. The overabundance time spent on PCR-quality DNA extraction restricts the efficiency of PCR assay, especially in large-scale PCR amplification, such as SSR-based genetic-mapping construction [5,6], identification of germ plasm resource[7,8] and evolution research [9,10], etc. In this study, a stable and rapid PCR-quality DNA extraction method was explored, using a modified alkaline lysis protocol. Extracting DNA for PCR only takes approximately 25 minutes. This stable and rapid DNA extraction method could save much laboratory time and promotes.%PCR has been a general preferred method for biological research in fish,and previous research have enabled us to extract and purify PCR-quality DNA templates in laboratories [1-4].The same problem among these procedures is waiting for tissue digesting for a long time.The overabundance time spent on PCR-quality DNA extraction restricts the efficiency of PCR assay,especially in large-scale PCR amplification,such as SSR-based genetic-mapping construction [5,6],identification of germ plasm resource[7,8] and evolution research [9,10],etc.In this study,a stable and rapid PCR-quality DNA extraction method was explored,using a modified alkaline lysis protocol.Extracting DNA for PCR only takes approximately 25 minutes.This stable and rapid DNA extraction method could save much laboratory time and promotes.

  20. Diseño mediante elementos finitos de componentes estructurales de un cuadricóptero para impresión 3D

    OpenAIRE

    PARDO APARISI, IVÁN

    2016-01-01

    El trabajo tiene como objetivo diseñar componentes estructurales, mediante el método de elementos finitos, que serán utilizados en un dron de cuatro rotores (cuadricóptero). Una característica particular de este proyecto es que los componentes estructurales a diseñar serán fabricados mediante impresión 3D. Pardo Aparisi, I. (2016). Diseño mediante elementos finitos de componentes estructurales de un cuadricóptero para impresión 3D. http://hdl.handle.net/10251/75994. TFGM

  1. Grafenos procesables en fase líquida con características optimizadas mediante el control microscópico de su estructura

    OpenAIRE

    Rozada Rodríguez, Rubén

    2014-01-01

    El objetivo principal de la tesis doctoral consiste en desarrollar estrategias que permitan mejorar las características de grafeno producido en fase líquida mediante la ruta del óxido de grafito, de modo que se pueda compatibilizar la relativa simplicidad y alto rendimiento de dicha ruta con la perfección estructural de las láminas de grafeno generadas mediante otros métodos. El desarrollo de dichas estrategias se ha apoyado en el estudio detallado de las láminas mediante diferentes técnicas ...

  2. DEMANDA TRIMESTRAL POR EMISIÓN MONETARIA: ESTIMACIÓN MEDIANTE TRES TÉCNICAS ESTADÍSTICAS

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Carlos Torres G.

    2011-09-01

    Full Text Available Este documento presenta la estimación de la demanda trimestral por emisión monetaria mediante tres técnicas estadísticas, a saber: mínimos cuadrados ordinarios, corrección de errores y vectores autorregresivos. La estimación de la demanda se realizó para el periodo 1987–1997. En general las ecuaciones estimadas presentaron resultados satisfactorios en términos económicos y estadísticos. La capacidad de predicción se verificó con los bajos errores de pronóstico, inferiores al 3% para 1997. Se comprobó la estabilidad de la demanda de corto y largo plazo mediante los estadísticos Cusum y Cusum-Cuadrado, así como con la prueba de cointegración de Johansen.

  3. Extracción de ADN de Trypanosoma cruzi mediante tratamiento con bromuro de hexadecil-trimetil-amonio

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Marcela Escalante

    1997-06-01

    Full Text Available En el presente trabajo se describe un método rápido, sencillo y eficaz para la obtención de ADN genómico de Trypanosoma cruzi, libre de impurezas y fácil de manipular. Dicho procedimiento se basa en la lisis del parásito con SDS y remoción de proteínas mediante la digestión con proteinasa K, seguida de la precipitación selectiva de carbohidratos y proteínas residuales con bromuro de hexadecil-trimetil-amonio (CTAB. Finalmente, el ADN se extrae con cloroformo: alcohol isoamílico y se recupera de la fase acuosa mediante precipitación con isopropanol.

  4. Comparison of droplet digital PCR to real-time PCR for quantification of hepatitis B virus DNA.

    Science.gov (United States)

    Tang, Hui; Cai, Qingchun; Li, Hu; Hu, Peng

    2016-06-16

    Quantitative real-time PCR (qPCR) has been widely implemented for clinical hepatitis B viral load testing, but a lack of standardization and relatively poor precision hinder its usefulness. Droplet digital PCR (ddPCR) is a promising tool that offers high precision and direct quantification. In this study, we compared the ddPCR QX100 platform by Bio-Rad with the CFX384 Touch Real-Time PCR Detection System (Bio-Rad, USA) to detect serial plasmid DNA dilutions of known concentrations as well as HBV DNA extracted from patient serum samples. Both methods showed a high degree of linearity and quantitative correlation. However, ddPCR assays generated more reproducible results and detected lower copy numbers than qPCR assays. Patient sample quantifications by ddPCR and qPCR were highly agreeable based on the Bland-Altman analysis. Collectively, our findings demonstrate that ddPCR offers improved analytical sensitivity and specificity for HBV measurements and is suitable for clinical HBV detection.

  5. Producción de hidrógeno mediante fotocatálisis heterogénea

    OpenAIRE

    Rodríguez López, Cristina

    2015-01-01

    Programa de doctorado: Ingeniería ambiental y desalinización [ES]Se comienza con una revisión bibliográfica y una introducción a las técnicas y metodologías utilizadas en la parte experimental. A continuación se presentan los capítulos donde se exponen los resultados obtenidos en los experimentos realizados mediante fotocatálisis heterogénea.

  6. Superficie específica de una bentonita mediante la adsorción de azul de metileno

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jorge Alejo Pinzón Bello

    2010-07-01

    Full Text Available Se estudió la determinación de la superficie específica de una bentonita colombiana, procedente del Valle del Cauca, mediante la adsorción de azul de metileno, a 298 K. Este método se comparó con el de la adsorción de nitrógeno a 77 K.

  7. Recovery of DNA of Giardia intestinalis cysts from surface water concentrates measured with PCR and real time PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Adamska M.

    2011-11-01

    Full Text Available The most important restriction for the detection in water samples is the low concentration of Giardia intestinalis cysts, additional difficulty is the presence of PCR inhibitors. We have carried out trials in order to assess the sensitivity of semi-nested PCR and TaqMan real time PCR on the basis of DNA extracted from G. intestinalis cysts coming from spiked environmental and distilled water samples, filtrated with the use of Filta-Max® equipment (1623 Method. Removal of inhibitors was carried out with addition of BSA in different concentrations. During the filtration and concentration of water samples, losses of cysts have been recorded. Moreover, addition of BSA to the PCR and real time PCR mix increases the sensitivity of reaction. The optimal concentration of BSA for semi-nested PCR was 15 and 20 ng/μl, whereas for real time PCR 5 ng/μl.

  8. Calibrated user-friendly reverse transcriptase-PCR assay

    DEFF Research Database (Denmark)

    Bor, M V; Sørensen, B S; Rammer, P

    1998-01-01

    We report a competitive reverse transcriptase-PCR (RT-PCR) assay and a calibrated user-friendly RT-PCR assay (CURT-PCR) for epidermal growth factor receptor (EGFR) mRNA. A calibrator was prepared from isolated rat liver RNA, and the amount of EGFR mRNA was determined by competitive RT-PCR. In CUR...... and to accept or reject the results according to existing rules for quality assurance....... and the corresponding RNA internal standard. Competitive RT-PCR and CURT-PCR were used for rat liver samples from 21 different animals. Comparable results were obtained by the two methods. The imprecision of the CURT-PCR method was 8% (n = 20), and the imprecision of the traditional competitive RT-PCR was 16% (n = 17......). We conclude that the CURT-PCR method developed is suitable for routine applications such as quantitation of EGFR expression in tumor biopsies. The imprecision is relatively low. Furthermore, the use of a calibration curve makes it possible to analyze a large number of samples in one analytical run...

  9. False negative results from using common PCR reagents

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Atwood Allison A

    2011-10-01

    Full Text Available Abstract Background The sensitivity of the PCR reaction makes it ideal for use when identifying potentially novel viral infections in human disease. Unfortunately, this same sensitivity also leaves this popular technique open to potential contamination with previously amplified PCR products, or "carry-over" contamination. PCR product carry-over contamination can be prevented with uracil-DNA-glycosylase (UNG, and it is for this reason that it is commonly included in many commercial PCR master-mixes. While testing the sensitivity of PCR assays to detect murine DNA contamination in human tissue samples, we inadvertently discovered that the use of this common PCR reagent may lead to the production of false-negative PCR results. Findings We show here that contamination with minute quantities of UNG-digested PCR product or any negative control PCR reactions containing primer-dimers regardless of UNG presence can completely block amplification from as much as 60 ng of legitimate target DNA. Conclusions These findings could potentially explain discrepant results from laboratories attempting to amplify MLV-related viruses including XMRV from human samples, as none of the published reports used internal-tube controls for amplification. The potential for false negative results needs to be considered and carefully controlled in PCR experiments, especially when the target copy number may be low - just as the potential for false positive results already is.

  10. Detection of Human Papillomavirus DNA in Cervical Samples: Analysis of the New PGMY-PCR Compared To the Hybrid Capture II and MY-PCR Assays and a Two-Step Nested PCR Assay

    OpenAIRE

    Giovannelli, Lucia; Lama, Anna; Capra, Giuseppina; Giordano, Viviana; Aricò, Pietro; Ammatuna, Pietro

    2004-01-01

    The PGMY-PCR for human papillomavirus (HPV) was evaluated, in parallel with nested PCR (nPCR), in samples with noted Hybrid Capture II (HCII) and MY-PCR results. PGMY-PCR detected HPV DNA in 2.5% of HCII-negative-MY-PCR-negative samples and in 71.7% of HCII-positive-MY-PCR-negative samples; also, it detected the MY-PCR-negative-nPCR-negative types HPV-42, HPV-44, HPV-51, HPV-87, and HPV-89.

  11. IDH1 mutation detection by droplet digital PCR in glioma.

    Science.gov (United States)

    Wang, Jing; Zhao, Yi-ying; Li, Jian-feng; Guo, Cheng-cheng; Chen, Fu-rong; Su, Hong-kai; Zhao, Hua-fu; Long, Ya-kang; Shao, Jian-yong; To, Shing shun Tony; Chen, Zhong-ping

    2015-11-24

    Glioma is the most frequent central nervous system tumor in adults. The overall survival of glioma patients is disappointing, mostly due to the poor prognosis of glioblastoma (Grade IV glioma). Isocitrate dehydrogenase (IDH) is a key factor in metabolism and catalyzes the oxidative decarboxylation of isocitrate. Mutations in IDH genes are observed in over 70% of low-grade gliomas and some cases of glioblastoma. As the most frequent mutation, IDH1(R132H) has been served as a predictive marker of glioma patients. The recently developed droplet digital PCR (ddPCR) technique generates a large amount of nanoliter-sized droplets, each of which carries out a PCR reaction on one template. Therefore, ddPCR provides high precision and absolute quantification of the nucleic acid target, with wide applications for both research and clinical diagnosis. In the current study, we collected 62 glioma tissue samples (Grade II to IV) and detected IDH1 mutations by Sanger direct sequencing, ddPCR, and quantitative real-time PCR (qRT-PCR). With the results from Sanger direct sequencing as the standard, the characteristics of ddPCR were compared with qRT-PCR. The data indicated that ddPCR was much more sensitive and much easier to interpret than qRT-PCR. Thus, we demonstrated that ddPCR is a reliable and sensitive method for screening the IDH mutation. Therefore, ddPCR is able to applied clinically in predicting patient prognosis and selecting effective therapeutic strategies. Our data also supported that the prognosis of Grade II and III glioma was better in patients with an IDH mutation than in those without mutation.

  12. Comparison of a commercially available rep-PCR system (Diversilab(R)) with PCR-ribotyping for typing of Clostridium difficile strains.

    OpenAIRE

    Eckert, C.; van Broeck, Johan; Spigaglia, P.; Burghoffer, B; Delmée, Michel; Mastrantonio, P; Barbut, F

    2011-01-01

    This study compared a rep-PCR method (DiversiLab® system) to PCR-ribotyping. The discriminatory power of rep-PCR was 0.997. Among the PCR-ribotype 027, different rep-types could be distinguished. Rep-PCR showed a higher discriminatory power than PCR-ribotyping. Nevertheless, this method requires technical skill and visual interpretation of rep-PCR fingerprint patterns may be difficult.

  13. COMPARISON OF 16S rRNA-PCR-RFLP, LipL32-PCR AND OmpL1-PCR METHODS IN THE DIAGNOSIS OF LEPTOSPIROSIS

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Tülin GÜVEN GÖKMEN

    Full Text Available SUMMARY Leptospirosis is still one of the most important health problems in developing countries located in humid tropical and subtropical regions. Human infections are generally caused by exposure to water, soil or food contaminated with the urine of infected wild and domestic animals such as rodents and dogs. The clinical course of leptospirosis is variable and may be difficult to distinguish from many other infectious diseases. The dark-field microscopy (DFM, serology and nucleic acid amplification techniques are used to diagnose leptospirosis, however, a distinctive standard reference method is still lacking. Therefore, in this study, we aimed to determine the presence of Leptospira spp., to differentiate the pathogenic L. interrogans and the non-pathogenic L. biflexa, and also to determine the sensitivity and specificity values of molecular methods as an alternative to conventional ones. A total of 133 serum samples, from 47 humans and 86 cattle were evaluated by two conventional tests: the Microagglutination Test (MAT and the DFM, as well as three molecular methods, the 16S rRNA-PCR followed by Restriction Fragment Lenght Polymorphism (RFLP of the amplification products 16S rRNA-PCR-RFLP, LipL32-PCR and OmpL1-PCR. In this study, for L. interrogans, the specificity and sensitivity rates of the 16S rRNA-PCR and the LipL32-PCR were considered similar (100% versus 98.25% and 100% versus 98.68%, respectively. The OmpL1-PCR was able to classify L. interrogans into two intergroups, but this PCR was less sensitive (87.01% than the other two PCR methods. The 16S rRNA-PCR-RFLP could detect L. biflexa DNA, but LipL32-PCR and OmpL1-PCR could not. The 16S rRNA-PCR-RFLP provided an early and accurate diagnosis and was able to distinguish pathogenic and non-pathogenic Leptospira species, hence it may be used as an alternative method to the conventional gold standard techniques for the rapid disgnosis of leptospirosis.

  14. COMPARISON OF 16S rRNA-PCR-RFLP, LipL32-PCR AND OmpL1-PCR METHODS IN THE DIAGNOSIS OF LEPTOSPIROSIS

    Science.gov (United States)

    GÖKMEN, Tülin GÜVEN; SOYAL, Ayben; KALAYCI, Yıldız; ÖNLEN, Cansu; KÖKSAL, Fatih

    2016-01-01

    SUMMARY Leptospirosis is still one of the most important health problems in developing countries located in humid tropical and subtropical regions. Human infections are generally caused by exposure to water, soil or food contaminated with the urine of infected wild and domestic animals such as rodents and dogs. The clinical course of leptospirosis is variable and may be difficult to distinguish from many other infectious diseases. The dark-field microscopy (DFM), serology and nucleic acid amplification techniques are used to diagnose leptospirosis, however, a distinctive standard reference method is still lacking. Therefore, in this study, we aimed to determine the presence of Leptospira spp., to differentiate the pathogenic L. interrogans and the non-pathogenic L. biflexa, and also to determine the sensitivity and specificity values of molecular methods as an alternative to conventional ones. A total of 133 serum samples, from 47 humans and 86 cattle were evaluated by two conventional tests: the Microagglutination Test (MAT) and the DFM, as well as three molecular methods, the 16S rRNA-PCR followed by Restriction Fragment Lenght Polymorphism (RFLP) of the amplification products 16S rRNA-PCR-RFLP, LipL32-PCR and OmpL1-PCR. In this study, for L. interrogans, the specificity and sensitivity rates of the 16S rRNA-PCR and the LipL32-PCR were considered similar (100% versus 98.25% and 100% versus 98.68%, respectively). The OmpL1-PCR was able to classify L. interrogans into two intergroups, but this PCR was less sensitive (87.01%) than the other two PCR methods. The 16S rRNA-PCR-RFLP could detect L. biflexa DNA, but LipL32-PCR and OmpL1-PCR could not. The 16S rRNA-PCR-RFLP provided an early and accurate diagnosis and was able to distinguish pathogenic and non-pathogenic Leptospira species, hence it may be used as an alternative method to the conventional gold standard techniques for the rapid disgnosis of leptospirosis. PMID:27680169

  15. Método para el Modelado y Prueba de Diagramas de Actividades Mediante Redes de Petri

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Lionel Baquero Hernández

    2015-11-01

    Full Text Available Las redes de Petri son ideales para describir y estudiar sistemas que procesan información y con características concurrentes, asíncronas, distribuidas, paralelas, no determinísticas y/o estocásticas. . Sin embargo, la teoría clásica de estas redes se enfrenta al desafío de adecuarse a las nuevas necesidades de los sistemas informáticos que los ingenieros diseñan en la actualidad. Un diagrama de actividades representa una secuencia de actividades. Podría aplicarse a cualquier propósito, pero se considera especialmente útil para visualizar los flujos de trabajo y los procesos del negocio, o casos de uso. El presente trabajo se ha desarrollado con el objetivo de diseñar un método para el modelado y prueba de diagramas de actividades mediante redes de Petri. El método propuesto brinda una serie de pasos necesarios para modelar un diagrama de actividades con redes de Petri y a partir de dicha red obtener una representación matemática de la misma. Esta representación matemática se utiliza para con ella realizar una serie de operaciones basadas en el marcaje de la red que permiten realizar pruebas al diagrama. Este método es capaz de identificar errores comunes que se cometen en el modelado de los diagramas de actividades, lo cual se demostró a través del método de experimentación.

  16. Selección de cartera mediante escenarios con dotación inicial indeterminada

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ventura Marco, M.

    1999-01-01

    Full Text Available Los modelos media-varianza de selección de cartera, y en general los basados en el binomio rentabilidad-riesgo, parten de un capital inicial cierto. La consideración de la aversión al riesgo en los mismos es indirecta y siempre referida al valor final de la cartera, así que por lo general lo que se determina en los mismos es la proporción de la inversión total o riqueza inicial que se destina a cada activo considerado. Sin embargo, en muchas situaciones reales la aversión al riesgo debe considerarse ya en el momento de invertir, por lo que la determinación de la cuantía a invertir, coste o dotación inicial forma parte del problema, considerando que será mayor, dentro de unas cotas, si existe la probabilidad de obtener mayor rentabilidad aún soportando mayor riesgo. El problema se presenta mediante un modelo simple, pero general en su planteamiento, en el que además de la composición de la cartera queda determinada la cantidad a invertir. La idea es que el inversor establece dos capitales, uno como mínimo y otro como máximo, que está dispuesto a invertir y se utiliza la optimización por escenarios para decidir qué cantidad, entre las dos anteriores, le conviene invertir según sus expectativas.

  17. Cleaning of contaminated soils with hydrocarbons by biocell; Saneamiento de suelos contaminados con hidrocarburos mediante biopilas

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Iturbe-Arguelles, R.; Flores-Torres, C; Chavez-Lopez, C.; Roldan-Martin, A [Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Mexico, D.F. (Mexico)

    2002-03-01

    In 1990 the Instituto de Ingenieria de la UNAM, initiated an evaluation through the soil and groundwater sampling and a risk health assessment in a Mexican refinery. An extended area was found contaminated with hydrocarbons. This area requires a soil remediation, taking into account that some zones present more than 30 000 mg/kg of Total Petroleum Hydrocarbons (TPH). Biopile system was recommended as the best remediation method to diminish TPG and some poliaromathic hydrocarbons (PAH). Therefore an experimental biopile of 30 m3 was constructed with contaminated soil. After 22 weeks, results show more than 80 % of TPH and PAH remotion. [Spanish] El grupo de saneamiento de suelos y acuiferos del Instituto de Ingenieria de la UNAM, inicio en 1999 la evaluacion de la contaminacion del subsuelo de una refineria en una zona costera del pais, mediante el muestreo de 425 puntos a 1.5 m de profundidad y con el analisis de los siguientes parametros: hidrocarburos totales del petroleo (HTP), hidrocarburo poliaromaticos (HAP), diesel, gasolina, metilterbutileter (MTBE) y los metales hierro, vanadio, zinc, cadmio, cromo y plomo. Asimismo, se lleva a cabo una evaluacion de riesgo a la salud a fin de determinar los niveles de limpieza de las areas contaminadas. Una vez realizado el estudio se propuso probar a nivel piloto dos tecnicas de saneamiento para las areas contaminadas con valores superiores a 30 000 mg/Kg de http, o bien, para las zonas en donde la evaluacion de riesgo a la salud indica la existencia de riesgo para uno o mas compuestos. Las tecnicas propuesta son biopilas y lavado de suelos con surfactantes. En este trabajo se presenta la prueba piloto con biopilas, de la cual se obtuvo una eficiencia de remocion de http del 80 porciento con cinco meses de operacion. Se muestra las partes de una biopila y se dan los resultados de la biopila experimental en la refineria Francisco I. Madero.

  18. Estudio del crecimiento de Prioria copaifera (Caesalpinaceae mediante técnicas dendrocronológicas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jorge Andrés Giraldo Jiménez

    2011-12-01

    Full Text Available El cativo (Prioria copaifera G. forma bosques dominados por la especie llamados cativales. Durante más de 70 años el cativo ha sido la base principal de la industria maderera en el Darién colombiano, siendo, por su alta productividad y dominancia uno de los bosques tropicales más fáciles de ordenar sosteniblemente. El propósito de esta investigación es modelar el crecimiento del diámetro y el volumen del cativo en función de la edad así como las tasas instantáneas, medias y relativas, empleando anillos de crecimiento. La anualidad de los anillos se demostró usando el efecto de las bombas nucleares y mediante cofechado. Con base en los anillos de crecimiento radiales se modelo el crecimiento del diámetro y del volumen. Esta especie alcanza 40cm de diámetro en 90 años y presenta crecimiento medio de 0.31cm/año. El lapso vital de la especie es de aproximadamente 614 años. El incremento corriente anual máximo del volumen a los 90 años es 0.033m3/año, e iguala al incremento medio a los 145 años con 0.018m3/año. La tasa media de crecimiento absoluta es 0.021m3/año. Los resultados aquí obtenidos sirven como base técnica para el manejo sostenible de los cativales.

  19. PoV-GAME: PUNTOS DE VISTA MEDIANTE JUEGOS PoV-GAME: VIEWPOINTS THROUGH GAMES

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Carlos Zapata-Jaramillo

    2012-06-01

    Full Text Available El desarrollo de proyectos de software considera importante la consistencia entre la información entregada por todos los interesados de una aplicación. En otras palabras, se procura llegar a acuerdos entre los diferentes puntos de vista de cada actor y llevarlos a cabo durante todo el proyecto. Con los métodos de enseñanza tradicionales se procura formar habilidades en este campo, pero no se afianzan mediante la práctica que, generalmente, se emplea para el aprendizaje en este campo. Por ello, en este artículo se propone ''PoV-GAME'', una nueva forma de ''jugar aprendiendo'', la cual busca fortalecer algunos conceptos básicos en la ingeniería de software como la consistencia en la información que se maneja a lo largo de un proyecto y afianzar la importancia de los puntos de vista en el desarrollo de un producto de software. Posteriormente, se analizan los resultados obtenidos luego de realizar el juego en diferentes grupos de estudiantes.Information for software applications is delivered by the stakeholders. Software development projects need consistency as an important aspect of such information. In other words, agreement among the different viewpoints must be reached in order to be implemented in the project. Well-known teaching methods try to create capabilities in this field, but they fail in reinforcing them in practice, which is commonly used for teaching in this field. Therefore, in this paper we propose ''PoV GAME'' a new way of ''play-to-learn''. We aim the reinforcement of some basic concepts about software engineering such as consistency in the information handled throughout the project, and the importance of viewpoints in the software product development. Subsequently, we analyze the results obtained after holding the game in several groups of students.

  20. Diagnóstico de Fallos en Sistemas Híbridos Mediante Anidamiento Latente de Fallos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Orestes Llanes Santiago

    2010-09-01

    Full Text Available Normal 0 21 false false false ES-TRAD X-NONE X-NONE MicrosoftInternetExplorer4 /* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:"Tabla normal"; mso-tstyle-rowband-size:0; mso-tstyle-colband-size:0; mso-style-noshow:yes; mso-style-priority:99; mso-style-qformat:yes; mso-style-parent:""; mso-padding-alt:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt; mso-para-margin:0cm; mso-para-margin-bottom:.0001pt; mso-pagination:widow-orphan; font-size:11.0pt; font-family:"Calibri","sans-serif"; mso-ascii-font-family:Calibri; mso-ascii-theme-font:minor-latin; mso-fareast-font-family:"Times New Roman"; mso-fareast-theme-font:minor-fareast; mso-hansi-font-family:Calibri; mso-hansi-theme-font:minor-latin; mso-bidi-font-family:"Times New Roman"; mso-bidi-theme-font:minor-bidi;} Este artículo presenta un nuevo enfoque para la detección y diagnóstico de fallos (SDDF en sistemas híbridos denominado de Anidamiento Latente de Fallos. La misma está basada en el uso de Redes de Petri Coloreadas (RdPCs que aportan su capacidad intrínseca de síntesis y de implementación en modelos realizables. Esta técnica se contrapone al clásico fenómeno de explosión combinacional que se produce mediante la utilización de metodologías basadas en Máquinas de Estados Finitos (MEFs.

  1. Cuantificación de inmunoglobulinas mediante el espectrofotómetro Shimadzu 160-A

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Martha Leonor Paradoa Pérez

    1997-08-01

    Full Text Available Se realizó la adaptación al espectrofotómetro Shimadzu 160-A para cuantificar inmunoglobulinas (IgG, IgA e IgM por el método turbidimétrico Fixed time para sistemas Hitachi. El control de calidad se realizó con productos de referencia nacionales e internacionales para precisión y exactitud. Los resultados de las medias (IgG = 12,31, IgA = 2,13 e IgM = 1,38 y desviaciones estándar (IgG = 0,3885, IgA = 0,155 e IgM = 0,129 muestran una dispersión pequeña, y aseguran la validez de nuestro trabajo. Con este estudio se abre la posibilidad de realizar dicha técnica mediante un método rápido y eficaz en un equipo mucho menos costoso que el Hitachi y ampliamente difundido en Cuba.The fixed time turbidimetric procedure for Hitachi system was adapted to the spectrophotometer Shimadzu 160-A. The quality control was carried out with products of national and international reference to check precision and accuracy. The results of the means (IgG=12.31, IgA=2.13 and IgM = 1.38 and standard deviations (IgG=0.3885, IgA=0.155 and IgM=0.129 show a little dispersion and ensure the validity of our method. With this study, it is possible to put into practice this technique by a fast and efficient method in an equipment that is widely used in Cuba and much cheaper than the Hitachi.

  2. Veneno de abeja: Vigilancia tecnológica mediante el estudio de las citas de patentes

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Beatriz García Delgado

    2008-01-01

    Full Text Available Los productos apícolas, particularmente el veneno de abeja, se encuentran entre los productos que poseen importantes propiedades farmacológicas y que en la actualmente su uso se diversifica, de aquí, la necesidad de realizar de forma sistemática estudios de vigilancia tecnológica relacionadas con este tema. En este trabajo, se realiza un estudio a partir de las 28 patentes que reivindican el "veneno de abeja" (concedidas por la Oficina de Patentes y Marcas de Estados Unidos y las citas correspondientes a estas invenciones. Esta información fue procesada con un sistema automatizado desarrollado para el procesamiento de patentes y sus citaciones, el cual genera un fichero que contiene la información procesada y que posibilita su posterior visualización en forma de red, mediante la utilización del sistema NetDraw, lo que permite, de forma eficaz y con inmediatez, identificar aquellas agrupaciones de interés que están relacionadas directamente con el veneno de abeja. Se determinó que existe una tendencia positiva en el desarrollo tecnológico relacionado con equipos y métodos para la recolección del veneno de abeja, y se comprobó que se continúan patentando procesos y productos relacionados fundamentalmente con el aislamiento, purificación y preparación de proteínas, anticuerpos y juegos de reactivos de diagnóstico que se emplean en la identificación y tratamiento de enfermedades inmunológicas.

  3. Combate del moho gris (Botrytis cinerea de la fresa mediante Gliocladium roseum

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    N\\u00E9stor Chaves

    2004-01-01

    Full Text Available En la zona de Poasito de Alajuela, se evaluó la acción del antagonista Gliocladium roseum, en forma individual y en conjunto con los fungicidas empleados en la finca, para el combate de Botrytis cinerea en fresa; comparándose los resultados contra los obtenidos con el manejo comercial. Se empleó un diseño de bloques completos al azar con 4 repeticiones y se hicieron aplicaciones semanales del antagonista (a una concentración ³ 107 conidios ml-1 durante un período aproximado de 4 meses (julio-octubre del 2000. Se evaluó la incidencia de moho gris en condiciones de campo y poscosecha, así como el efecto de los fungicidas aplicados sobre la germinación de los conidios del antagonista, mediante una prueba in vitro. Se obtuvo un combate más efectivo de la enfermedad en condiciones de campo al emplear el biocontrolador sólo o en conjunto con los fungicidas, con respecto al manejo comercial que se hace de la misma. En poscosecha, el desempeño del antagonista fue estadísticamente igual al del combate químico. Estos resultados muestran que los fungicidas aplicados no afectan considerablemente al antagonista, lo que se corroboró con la prueba in vitro. Al emplear G. roseum para el combate de B. cinerea no sólo se logra combatir efectivamente a este, sino también el resto de los patógenos (Colletotrichum, Phytophthora, Rhizoctonia, Rhizopus,Alternaria, Fusarium, Verticillium y Penicillium, ya que el porcentaje de frutas sanas es mayor al integrar la acción del antagonista al manejo de enfermedades de la finca. Sin embargo, estas diferencias no son estadísticamente significativas. Por lo anterior se concluye que G. roseum constituye una posible alternativa de manejo integrado del moho gris en fresa.

  4. Caracterización microestructural de aleaciones base cobre obtenidas mediante molienda reactiva

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Palma, R.

    2010-06-01

    Full Text Available The micro and nanostructure of Cu-Al, Cu-V and Cu-Ti alloys produced by reactive milling were analyzed using X-ray diffraction (XRD and transmission electron microscopy (TEM. Samples with different milling times (t= 0, 10, 20 and 30 h were considered. The grain size, dislocation density and residual microstrain were evaluated form the XRD data using the Williamson-Hall and Klug-Alexander methods. The evolution of texture as a function of milling time was also studied using XRD. It was found, using TEM, that the grain size and dispersoid size were nanometric in all three alloys considered.

    Se analizó la micro y nano estructura de aleaciones Cu-Al, Cu-V y Cu-Ti obtenidas por molienda reactiva, mediante difracción de rayos X (XRD y microscopía electrónica de transmisión (TEM. Se consideraron muestras con distintos tiempos de molienda (t= 0, 10, 20 y 30 h. A partir de los datos XRD, usando los métodos de Williamson- Hall y Klug-Alexander, se evaluaron el tamaño de grano, la densidad de dislocaciones y la microdeformación residual; también se estudió la evolución de la textura de la matriz de cobre en función del tiempo de molienda. En los polvos molidos durante 30 h, de las tres aleaciones consideradas, se encontró, por TEM, que los tamaños de grano y de los dispersoides desarrollados son nanométricos.

  5. Diagnóstico de distrofia muscular de Duchenne mediante análisis del ácido desoxinucleotico y su aplicación en la prevención

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Mayra Rodríguez Hernández

    1996-04-01

    Full Text Available Se define una estrategia para la prevención en Cuba de la distrofia muscular de Duchenne (DMD, una de las enfermedades hereditarias letales más frecuentes, y se evalúan la factibilidad de su aplicación y los problemas que pudieran dificultar su implantación al nivel nacional. La estrategia se basa fundamentalmente en la necesidad de detectar las familias afectadas, la definición de las mujeres portadoras o en riesgo de serlo y el estudio molecular de los miembros de interés con anterioridad al ofrecimiento de los servicios de diagnóstico prenatal mediante análisis directo -detección de deleciones en el gen DMD mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR o análisis indirecto- empleo de los marcadores denominados polimorfismos en la longitud de los fragmentos de restricción (RFLPs en análisis de ligamento. Se concluye en que la aplicación de esta estrategia es factible y conveniente, pues permite ofrecer el diagnóstico prenatal al 75 % de las mujeres portadoras. Su eficiencia en la prevención del nacimiento de nuevos enfermos DMD se demuestra en 2 diagnósticos prenatales realizados, uno de los cuales detectó un embarazo afectado que fue interrumpido por solicitud de los padres.A strategy is defined for the prevention in Cuba of the Duchenne's muscular dystrophy (DMD, one of the most frequent lethal hereditary diseases, and the feasibility of its application, and the troubles that might difficult its implantation at a national level, are evaluated. This strategy is mainly based on the need of detecting the affected families, the definition of the carrier women, or the women at risk of being carriers, and the molecular study of the members of interest with anteriority to the offering of prenatal diagnosis services by direct analysis -detection of DMD gen deletions by (PCR polymerase chain reaction, or indirect analysis-, use of the markers called polymorphisms in the length of the restriction fragments (RFLPs in ligament

  6. Multiplex enrichment quantitative PCR (ME-qPCR): a high-throughput, highly sensitive detection method for GMO identification.

    Science.gov (United States)

    Fu, Wei; Zhu, Pengyu; Wei, Shuang; Zhixin, Du; Wang, Chenguang; Wu, Xiyang; Li, Feiwu; Zhu, Shuifang

    2017-04-01

    Among all of the high-throughput detection methods, PCR-based methodologies are regarded as the most cost-efficient and feasible methodologies compared with the next-generation sequencing or ChIP-based methods. However, the PCR-based methods can only achieve multiplex detection up to 15-plex due to limitations imposed by the multiplex primer interactions. The detection throughput cannot meet the demands of high-throughput detection, such as SNP or gene expression analysis. Therefore, in our study, we have developed a new high-throughput PCR-based detection method, multiplex enrichment quantitative PCR (ME-qPCR), which is a combination of qPCR and nested PCR. The GMO content detection results in our study showed that ME-qPCR could achieve high-throughput detection up to 26-plex. Compared to the original qPCR, the Ct values of ME-qPCR were lower for the same group, which showed that ME-qPCR sensitivity is higher than the original qPCR. The absolute limit of detection for ME-qPCR could achieve levels as low as a single copy of the plant genome. Moreover, the specificity results showed that no cross-amplification occurred for irrelevant GMO events. After evaluation of all of the parameters, a practical evaluation was performed with different foods. The more stable amplification results, compared to qPCR, showed that ME-qPCR was suitable for GMO detection in foods. In conclusion, ME-qPCR achieved sensitive, high-throughput GMO detection in complex substrates, such as crops or food samples. In the future, ME-qPCR-based GMO content identification may positively impact SNP analysis or multiplex gene expression of food or agricultural samples. Graphical abstract For the first-step amplification, four primers (A, B, C, and D) have been added into the reaction volume. In this manner, four kinds of amplicons have been generated. All of these four amplicons could be regarded as the target of second-step PCR. For the second-step amplification, three parallels have been taken for

  7. Blood grouping based on PCR methods and agarose gel electrophoresis.

    Science.gov (United States)

    Sell, Ana Maria; Visentainer, Jeane Eliete Laguila

    2015-01-01

    The study of erythrocyte antigens continues to be an intense field of research, particularly after the development of molecular testing methods. More than 300 specificities have been described by the International Society for Blood Transfusion as belonging to 33 blood group systems. The polymerase chain reaction (PCR) is a central tool for red blood cells (RBC) genotyping. PCR and agarose gel electrophoresis are low cost, easy, and versatile in vitro methods for amplifying defined target DNA (RBC polymorphic region). Multiplex-PCR, AS-PCR (Specific Allele Polymerase Chain Reaction), and RFLP-PCR (Restriction Fragment Length Polymorphism-Polymerase Chain Reaction) techniques are usually to identify RBC polymorphisms. Furthermore, it is an easy methodology to implement. This chapter describes the PCR methodology and agarose gel electrophoresis to identify the polymorphisms of the Kell, Duffy, Kidd, and MNS blood group systems.

  8. Microfluidics-Based PCR for Fusion Transcript Detection.

    Science.gov (United States)

    Chen, Hui

    2016-01-01

    The microfluidic technology allows the production of network of submillimeter-size fluidic channels and reservoirs in a variety of material systems. The microfluidic-based polymerase chain reaction (PCR) allows automated multiplexing of multiple samples and multiple assays simultaneously within a network of microfluidic channels and chambers that are co-ordinated in controlled fashion by the valves. The individual PCR reaction is performed in nanoliter volume, which allows testing on samples with limited DNA and RNA. The microfluidics devices are used in various types of PCR such as digital PCR and single molecular emulsion PCR for genotyping, gene expression, and miRNA expression. In this chapter, the use of a microfluidics-based PCR for simultaneous screening of 14 known fusion transcripts in patients with leukemia is described.

  9. Optimized MOL-PCR for Characterization of Microbial Pathogens.

    Science.gov (United States)

    Wuyts, Véronique; Roosens, Nancy H C; Bertrand, Sophie; Marchal, Kathleen; De Keersmaecker, Sigrid C J

    2016-01-06

    Characterization of microbial pathogens is necessary for surveillance, outbreak detection, and tracing of outbreak sources. This unit describes a multiplex oligonucleotide ligation-PCR (MOL-PCR) optimized for characterization of microbial pathogens. With MOL-PCR, different types of markers, like unique sequences, single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and indels, can be simultaneously analyzed in one assay. This assay consists of a multiplex ligation for detection of the markers, a singleplex PCR for signal amplification, and hybridization to MagPlex-TAG beads for readout on a Luminex platform after fluorescent staining. The current protocol describes the MOL-PCR, as well as methods for DNA isolation, probe design, and data interpretation and it is based on an optimized MOL-PCR assay for subtyping of Salmonella Typhimurium.

  10. Standardization of diagnostic PCR for the detection of foodborne pathogens

    DEFF Research Database (Denmark)

    Malorny, B.; Tassios, P.T.; Radstrom, P.

    2003-01-01

    In vitro amplification of nucleic acids using the polymerase chain reaction (PCR) has become, since its discovery in the 1980s, a powerful diagnostic tool for the analysis of microbial infections as well as for the analysis of microorganisms in food samples. However, despite its potential, PCR has...... neither gained wide acceptance in routine diagnostics nor been widely incorporated in standardized methods. Lack of validation and standard protocols, as well as variable quality of reagents and equipment, influence the efficient dissemination of PCR methodology from expert research laboratories to end......-user laboratories. Moreover, the food industry understandably requires and expects officially approved standards. Recognizing this, in 1999, the European Commission approved the research project, FOOD-PCR (http://www.PCR.dk), which aims to validate and standardize the use of diagnostic PCR for the detection...

  11. Template-blocking PCR: an advanced PCR technique for genome walking.

    Science.gov (United States)

    Bae, Jung-Hoon; Sohn, Jung-Hoon

    2010-03-01

    This article describes the development of an improved method for the isolation of genomic fragments adjacent to a known DNA sequence based on a cassette ligation-mediated polymerase chain reaction (PCR) technique. To reduce the nonspecific amplification of PCR-based genome walking, the 3' ends of the restriction enzyme-digested genomic DNA fragments were blocked with dideoxynucleoside triphosphate (ddNTP) and ligated with properly designed cassettes. The modified genomic DNA fragments flanked with cassettes were used as a template for the amplification of a target gene with a gene-specific primer (GSP) and a cassette primer (CP). The ddNTP blocking of the genomic DNA ends significantly reduced the nonspecific amplification and resulted in a simple and rapid walking along the genome. The efficiency of the template-blocking PCR method was confirmed by a carefully designed control experiment. The method was successfully applied for the cloning of the PGK1 promoter from Pichia ciferrii and two novel cellulase genes from Penicillium sp.

  12. Instalación eléctrica de una vivienda unifamiliar aislada mediante suministro de energías renovables

    OpenAIRE

    LOZANO VALLADOLID, FERNANDO

    2015-01-01

    [ES] Instalación eléctrica con grado de electrificación elevada de una vivienda unifamiliar aislada mediante suministro de energías renovables (solar, eólica, geotérmicas). Lozano Valladolid, F. (2015). Instalación eléctrica de una vivienda unifamiliar aislada mediante suministro de energías renovables. http://hdl.handle.net/10251/58751. TFGM

  13. Instalación eléctrica de una vivienda unifamiliar aislada mediante suministro de energías renovables

    OpenAIRE

    LOZANO VALLADOLID, FERNANDO

    2015-01-01

    [ES] Instalación eléctrica con grado de electrificación elevada de una vivienda unifamiliar aislada mediante suministro de energías renovables (solar, eólica, geotérmicas). Lozano Valladolid, F. (2015). Instalación eléctrica de una vivienda unifamiliar aislada mediante suministro de energías renovables. http://hdl.handle.net/10251/58751. TFGM

  14. El virus del papiloma humano (VPH: Un problema importante para la salud pública en vías de solución The virus of papiloma human (HPV: an important problem for the public health on the way to solution

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Juan Miguel Martínez-Galiano

    2007-11-01

    Full Text Available El virus del papiloma humano es el causante de numerosos tipos de cáncer como el cáncer de cuello uterino, cáncer de pene y cáncer orofaríngeo entre otros; este virus también es el causante de lesiones como las verrugas genitales y los papilomas. Actualmente en España, la prevención del cáncer de cuello uterino se hace mediante cribado (prevención secundaria. En el año 2006 dos vacunas, una bivalente y otra tetravalente fueron aprobadas por las autoridades; estas vacunas han demostrado su seguridad y eficacia en los estudios realizados. En nuestro país, aún esta pendiente de aprobar por el Ministerio de Sanidad y Consumo pero no es así en muchos países europeos y EEUU donde ya está implantada. Hay colectivos que son resistentes a que se produzca la vacunación, la información proporcionada por los sanitarios pueden vencer esta resistencia.The virus of papiloma human is the cause of numerous types of cancer like the cancer of cervix, cancer of penis and orofaringeo cancer among others; this virus also is the cause of injuries like genital warts and papilomas. At the moment in Spain, the prevention of the cancer of cervix becomes by means of sifting (secondary prevention. In the year 2006 two vaccines, bivalent and a other tetravalente were approved by the authorities; these vaccines have demonstrated to their security and effectiveness in the made studies. In our country, still this slope to approve by the Ministry of Health and Consumption but is not thus in many European countries and the U.S.A. where already this implanted. There are groups that are resistant to that the vaccination takes place, the information provided by the sanitary personnel can overcome this resistance.

  15. Doubling Throughput of a Real-Time PCR

    OpenAIRE

    Christian D. Ahrberg; Pavel Neužil

    2015-01-01

    The invention of polymerase chain reaction (PCR) in 1983 revolutionized many areas of science, due to its ability to multiply a number of copies of DNA sequences (known as amplicons). Here we report on a method to double the throughput of quantitative PCR which could be especially useful for PCR-based mass screening. We concurrently amplified two target genes using only single fluorescent dye. A FAM probe labelled olionucleotide was attached to a quencher for one amplicon while the second one...

  16. THE IMPROVEMENT OF RT-PCR TECHNIQUE ON DETECTING ROTAVIRUS

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    2000-01-01

    Objective To establish a speed and effective method to detect rotavirus. Methods Using ELISA and one step RT-PCR to detect 196 clinic samples from Xi'an area. Results Compared with ELISA method, one step RT PCR was more sensitive and specific (P <0.05). Conclusion One step RT-PCR is a simple, speed, sensitive and spe cific method for clinic and epidemic studies of rotavirus.

  17. A comparison of DNA methylation specific droplet digital PCR (ddPCR) and real time qPCR with flow cytometry in characterizing human T cells in peripheral blood.

    Science.gov (United States)

    Wiencke, John K; Bracci, Paige M; Hsuang, George; Zheng, Shichun; Hansen, Helen; Wrensch, Margaret R; Rice, Terri; Eliot, Melissa; Kelsey, Karl T

    2014-10-01

    Quantitating the copy number of demethylated CpG promoter sites of the CD3Z gene can be used to estimate the numbers and proportions of T cells in human blood and tissue. Quantitative methylation specific PCR (qPCR) is useful for studying T cells but requires extensive calibration and is imprecise at low copy numbers. Here we compared the performance of a new digital PCR platform (droplet digital PCR or ddPCR) to qPCR using bisulfite converted DNA from 157 blood specimens obtained from ambulatory care controls and patients with primary glioma. We compared both ddPCR and qPCR with conventional flow cytometry (FACS) evaluation of CD3 positive T cells. Repeated measures on the same blood sample revealed ddPCR to be less variable than qPCR. Both qPCR and ddPCR correlated significantly with FACS evaluation of peripheral blood CD3 counts and CD3/total leukocyte values. However, statistical measures of agreement showed that linear concordance was stronger for ddPCR than for qPCR and the absolute values were closer to FACS for ddPCR. Both qPCR and ddPCR could distinguish clinically significant differences in T cell proportions and performed similarly to FACS. Given the higher precision, greater accuracy, and technical simplicity of ddPCR, this approach appears to be a superior DNA methylation based method than conventional qPCR for the assessment of T cells.

  18. A comparison of DNA methylation specific droplet digital PCR (ddPCR) and real time qPCR with flow cytometry in characterizing human T cells in peripheral blood

    Science.gov (United States)

    Wiencke, John K; Bracci, Paige M; Hsuang, George; Zheng, Shichun; Hansen, Helen; Wrensch, Margaret R; Rice, Terri; Eliot, Melissa; Kelsey, Karl T

    2014-01-01

    Quantitating the copy number of demethylated CpG promoter sites of the CD3Z gene can be used to estimate the numbers and proportions of T cells in human blood and tissue. Quantitative methylation specific PCR (qPCR) is useful for studying T cells but requires extensive calibration and is imprecise at low copy numbers. Here we compared the performance of a new digital PCR platform (droplet digital PCR or ddPCR) to qPCR using bisulfite converted DNA from 157 blood specimens obtained from ambulatory care controls and patients with primary glioma. We compared both ddPCR and qPCR with conventional flow cytometry (FACS) evaluation of CD3 positive T cells. Repeated measures on the same blood sample revealed ddPCR to be less variable than qPCR. Both qPCR and ddPCR correlated significantly with FACS evaluation of peripheral blood CD3 counts and CD3/total leukocyte values. However, statistical measures of agreement showed that linear concordance was stronger for ddPCR than for qPCR and the absolute values were closer to FACS for ddPCR. Both qPCR and ddPCR could distinguish clinically significant differences in T cell proportions and performed similarly to FACS. Given the higher precision, greater accuracy, and technical simplicity of ddPCR, this approach appears to be a superior DNA methylation based method than conventional qPCR for the assessment of T cells. PMID:25437051

  19. A thermodynamic approach to PCR primer design.

    Science.gov (United States)

    Mann, Tobias; Humbert, Richard; Dorschner, Michael; Stamatoyannopoulos, John; Noble, William Stafford

    2009-07-01

    We developed a primer design method, Pythia, in which state of the art DNA binding affinity computations are directly integrated into the primer design process. We use chemical reaction equilibrium analysis to integrate multiple binding energy calculations into a conservative measure of polymerase chain reaction (PCR) efficiency, and a precomputed index on genomic sequences to evaluate primer specificity. We show that Pythia can design primers with success rates comparable with those of current methods, but yields much higher coverage in difficult genomic regions. For example, in RepeatMasked sequences in the human genome, Pythia achieved a median coverage of 89% as compared with a median coverage of 51% for Primer3. For parameter settings yielding sensitivities of 81%, our method has a recall of 97%, compared with the Primer3 recall of 48%. Because our primer design approach is based on the chemistry of DNA interactions, it has fewer and more physically meaningful parameters than current methods, and is therefore easier to adjust to specific experimental requirements. Our software is freely available at http://pythia.sourceforge.net.

  20. Variation in copy number of the 28S rDNA of Aspergillus fumigatus measured by droplet digital PCR and analog quantitative real-time PCR.

    Science.gov (United States)

    Alanio, Alexandre; Sturny-Leclère, Aude; Benabou, Marion; Guigue, Nicolas; Bretagne, Stéphane

    2016-08-01

    Droplet digital PCR (ddPCR) after DNA digestion yielded a 28S rDNA copy number of 61 to 86 copies/genome when testing 10 unrelated Aspergillus fumigatus isolates, higher than with quantitative PCR. Unfortunately, ddPCR after DNA digestion did not improve the sensitivity of our PCR assay when testing serum patients with invasive aspergillosis.

  1. Comparison of kDNA PCR-hybridization assay with three PCR methods for canines visceral Leishmaniasis diagnosis

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Pilatti, Marcia M.; Andrade, Antero S.R. [Centro de Desenvolvimento da Tecnologia Nuclear (CDTN/CNEN-MG), Belo Horizonte, MG (Brazil)], e-mail: marciapilatti@yahoo.com.br, e-mail: antero@cdtn.br; Ferreira, Sidney A. [Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG), Belo Horizonte, MG (Brazil). Dept. de Parasitologia], e-mail: saninoalmeida@gmail.com

    2009-07-01

    The sensitivity of the kDNA PCR-Hybridization assay, which uses radioactive DNA probes (labeled with {sup 32}P), was compared with three conventional PCR methods used for canine visceral leishmaniasis diagnosis. All PCR methods had two steps: a first amplification followed by hybridization or by a new amplification (nested or semi nested). Two methods (kDNA PCR-Hybridization and kDNA snPCR) used primers addressed to kinetoplast minicircles and the other two methods to the coding (LnPCR) and intergenic noncoding regions (ITS-1 nPCR) of the ribosomal rRNA genes. The comparison was accomplished in two groups of 23 infected dogs using samples collected by the conjunctival swab procedure. In the Group 1 the DNA was extracted from cotton swabs by phenol-chloroform and in Group 2 by boiling. The most efficient PCR methods in the Group 1 were those based on kDNA targets. The kDNA PCR-Hybridization was able to detect parasites in 22/23 dogs (95.6%) and in 40/46 samples (86.9%). The kDNA snPCR was positive for 21/23 dogs (91.3%) and for 40/46 samples (86.9%). The positivities of the kDNA based methods were significantly higher than the positivities verified for the methods based on ribosomal rRNA genes (p<0.05). In the Group 2 the kDNA PCR- Hybridization showed a better performance detecting parasites in 18/23 dogs (78.3%) and in 31/46 samples (67.4%), significantly higher than the other three methods (p<0.05). The higher sensitivity of the minicircle kDNA based assays reported by others was confirmed in this study and kDNA PCR-Hybridization showed the best sensitivity among the assays evaluated. (author)

  2. Monitoring gene expression: quantitative real-time rt-PCR.

    Science.gov (United States)

    Wagner, Elke M

    2013-01-01

    Two-step quantitative real-time RT-PCR (RT-qPCR), also known as real-time RT-PCR, kinetic RT-PCR, or quantitative fluorescent RT-PCR, has become the method of choice for gene expression analysis during the last few years. It is a fast and convenient PCR method that combines traditional RT-PCR with the phenomenon of fluorescence resonance energy transfer (FRET) using fluorogenic primers. The detection of changes in fluorescence intensity during the reaction enables the user to follow the PCR reaction in real time.RT-qPCR comprises several steps: (1) RNA is isolated from target tissue/cells; (2) mRNA is reverse-transcribed to cDNA; (3) modified gene-specific PCR primers are used to amplify a segment of the cDNA of interest, following the reaction in real time; and (4) the initial concentration of the selected transcript in a specific tissue or cell type is calculated from the exponential phase of the reaction. Relative quantification or absolute quantification compared to standards that are run in parallel can be performed.This chapter describes the entire procedure from isolation of total RNA from liver and fatty tissues/cells to the use of RT-qPCR to study gene expression in these tissues. We perform relative quantification of transcripts to calculate the fold-difference of a certain mRNA level between different samples. In addition, tips for choosing primers and performing analyses are provided to help the beginner in understanding the technique.

  3. 高速PCR技术%Rapid PCR Technology

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    赵晓光; 薛燕

    2011-01-01

    PCR technology has been one of the basic and key technologies of Modern Molecular Biology.How to shorten PCR time is a question badly needed to be solved on the premise of PCR amplification effect.In the paper we describe the concept,principle,advantage and application of rapidPCR technology which can highly increase the PCR speed.As addressed in the paper,the Key of rapid PCR is not only to increase the heating and cooling rate of PCR machine,more important,it relays on reducing the temperature difference between the PCR module and sample solution,so that the holding time of denaturation,annealing,elongation could be shorten,and the whole PCR time could be shorten dramatically.While,rapid PCR could also lead to another benefit to improving the specificity of PCR%PCR技术是现代分子生物学最基础的技术之一,在实现扩增效果的同时如何缩短PCR的实验时间成为实验工作者亟待解决的问题。本文从高速PCR的概念入手,阐述了实现高速PCR仪器技术的原理、优势,及可能的应用。指出了高速PCR技术的核心在于,不仅要提高PCR仪器的升降温速率,更重要的是提高PCR样品温度与金属样品槽的一致性,从而达到缩短变性,退火,延伸等停留时间的目的,进而大大的缩短PCR时间。同时也指出,高速PCR对提高反应特异性带来的好处等

  4. Comparison of droplet digital PCR with quantitative real-time PCR for determination of zygosity in transgenic maize.

    Science.gov (United States)

    Xu, Xiaoli; Peng, Cheng; Wang, Xiaofu; Chen, Xiaoyun; Wang, Qiang; Xu, Junfeng

    2016-12-01

    This study evaluated the applicability of droplet digital PCR (ddPCR) as a tool for maize zygosity determination using quantitative real-time PCR (qPCR) as a reference technology. Quantitative real-time PCR is commonly used to determine transgene copy number or GMO zygosity characterization. However, its effectiveness is based on identical reaction efficiencies for the transgene and the endogenous reference gene. Additionally, a calibrator sample should be utilized for accuracy. Droplet digital PCR is a DNA molecule counting technique that directly counts the absolute number of target and reference DNA molecules in a sample, independent of assay efficiency or external calibrators. The zygosity of the transgene can be easily determined using the ratio of the quantity of the target gene to the reference single copy endogenous gene. In this study, both the qPCR and ddPCR methods were used to determine insect-resistant transgenic maize IE034 zygosity. Both methods performed well, but the ddPCR method was more convenient because of its absolute quantification property.

  5. A novel three primers PCR (TP-PCR) method to obtain recombinant DNA molecule independent of restriction enzyme

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    2002-01-01

    In this note, we report a novel and efficient three primers PCR (TP-PCR) method to rapidly generate recombinant DNA molecule at precise junction between two arbitrary DNA fragments. TP-PCR method is characterized by its reaction system with two templates and three primers, which can produce a recombinant DNA molecule in one PCR reaction. The main advantages of this method are the independence of sequences at the recombination site, the rapidness, and the easy establishment of adequate conditions. This method has been successfully applied to constructing a fusion protein gene, sck gene.

  6. Hypervariable spacer regions are good sites for developing specific PCR-RFLP markers and PCR primers for screening actinorhizal symbionts

    Indian Academy of Sciences (India)

    Rajani Varghese; Vineeta S Chauhan; Arvind K Misra

    2003-06-01

    While the ribosomal RNA like highly conserved genes are good molecular chronometers for establishing phylogenetic relationships, they can also be useful in securing the amplification of adjoining hyper-variable regions. These regions can then be used for developing specific PCR primers or PCR-RFL profiles to be used as molecular markers. We report here the use of ITS region of rrn operon of Frankia for developing PCR-RFL profiles capable of discriminating between closely related frankiae. We have also made use of the ITS1 region of the nuclear rrn operon of Alnus nepalensis (D Don) for designing a PCR primer for specific amplification of nuclear DNA of this tree.

  7. 一种高特异性的改良降落PCR%Modified Touchdown PCR as a High Efficient Approach to Improve the Specificity of PCR

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    张贵星; 袁保梅; 许培荣; 王建民; 薛乐勋

    2002-01-01

    To improve the specificity of PCR in detection of genes in genomic DNA, a modified touchdown PCR method was designed by using the common Taq DNA polymerase and the Pfu DNA polymerase with proofreading ability. Genomic DNA was extracted from Dunaliella bardawil, a unicellular and wall-less alga being able to propagate in solution of high concentration of NaCl. Two kinds of PCR using Taq and Pfu DNA polymerases were carried out, utilizing the genomic DNA mentioned above as a template, to amplify the upstream promoter sequence of the cbr (carotene biosynthesis-related) gene. Traditional PCR was used as control. Electrophoresis of the PCRs using Taq DNA polymerase demonstrated that TD-PCR produced a single band of 1 272 bp which was corresponding to the expected cbr promoter, in contrast, however, in the lane of common PCR, two extra nonspecific bands appeared as well as the expected 1 272 bp band. PCRs using the Pfu DNA polymerase displayed that common PCR program generated two bands of 1 272 bp and 500 bp, while the TD-PCR program brought about only the expected 1 272 bp band. PCRs using modified touchdown PCR program with both kinds of polymerase were of higher specificity than common PCR. The modified TD-PCR program can efficiently improve the specificity of PCR. Similar programs are expected to clone gene fragments that are difficult to be cloned by the common PCR method, or to raise the specificity of PCR in which the false positives are difficult to be eliminated.%为提高基因组DNA中的基因PCR检出的特异性,设计了一种改良的降落PCR程序,并分别用TaqDNA聚合酶及高保真Pfu DNA聚合酶进行实验.自盐藻Dunaliella bardawil中提取基因组DNA作为PCR模板,使用Taq DNA聚合酶及Pfu DNA聚合酶,运用普通PCR和降落PCR程序,扩增胡萝卜素生物合成相关基因(cbr)上游启动子序列,并电泳比较PCR扩增产物的特异性.结果显示,使用普通Taq酶PCR,普通PCR程序产生200bp,500bp和1272 bp长的三条

  8. Determinación del umbral de detección de Pseudococcus viburni (Hemiptera: Pseudococcidae por PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Diana VERA

    2012-01-01

    Full Text Available La cochinilla harinosa de los frutales Pseudococcus viburni (Signoret es una plaga cuarentenaria, presente en el Alto Valle de Río Negro y Neuquén, Argentina. Su detección durante la fiscalización aduanera, aun en los estados inmaduros, provoca rechazos de la fruta fresca argentina con destino a los mercados internacionales. Las técnicas actuales de identificación de pseudocóccidos y otros cocoideos implican la realización de preparados microscópicos que requieren varios días. Por esto, la disminución de los tiempos de identificación es importante sobre todo en las tareas de fiscalización. En este trabajo, se determinó el umbral de detección específica de P. viburni mediante PCR, como así también, la implementación de un método rápido de extracción de ADN mediante DNAzolTM. Insectos de diferentes estados de desarrollo (huevo, ninfas (tres estados ninfales y adulto, conservados en etanol pro análisis a -20 oC, provenientes de montes frutales del Alto Valle, Argentina, fueron procesados según el protocolo del fabricante y se logró obtener ADN de buena calidad y concentración. Una alícuota del mismo fue utilizado como templado para una reacción de PCR usando primers específicos para P. viburni, registrados en bibliografía y como control positivo ADN de P. viburni de colección entomológica. Los primers utilizados y sus secuencias son A4 (5’-cccgcggccgttctctcttt-3’ y A5 (5’-atatgttgtgcatagttgtgtgtgcgc-3’, diseñados por Beuning et al. (1999. La amplificación generó una banda de peso molecular esperado de 650 pb. en gel de agarosa al 1.5% en todos los estadios, se determinó como límite de detección el estado de huevo. Esta técnica constituye una detección específica de P. viburni en un lapso máximo de 48 h.

  9. Efecto del argon en películas CNxHy depositadas mediante ECR-CVD

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Albella, J. M.

    2004-04-01

    Full Text Available Carbon nitride films have been deposited by ECR-CVD, from Ar/CH4/N2 gas mixtures with different methane concentrations. Infrared Spectroscopy (IRS and Elastic Recoil Detection Analysis (ERDA have been used for films characterisation and Optical Emission Spectroscopy (OES for plasma analysis. Argon concentration in the gas mixture controls the growth rate as well as the composition of the film. In the proposed model, argon plays a key role in the activation of methane molecules. Also, during the growth of the film, two processes may be considered: i Film formation and ii Etching of the growing surface. Changing the gas mixture composition affects both processes, which results in films with different composition and structure as well as different deposition rates.Se ha estudiado el efecto del argon durante el proceso de CVD asistido por un plasma ECR para la síntesis de películas de nitruro de carbono (CNxHy a partir de mezclas gaseosas Ar/CH4/N2 con diferente contenido de metano. Las películas depositadas han sido analizadas mediante espectroscopía infrarroja (IRS y ERDA (Elastic Recoil Detection Analysis, y el análisis del plasma ha sido realizado utilizando la técnica de espectroscopía de emisión óptica (OES. La velocidad de deposición y la composición de las películas depositadas se encuentran determinadas por la concentración de argon en la mezcla gaseosa. Se propone un modelo, según el cual el argon juega un papel fundamental como activador de las moléculas de metano. El modelo propuesto incluye dos procesos simultáneos durante el crecimiento de las capas : i formación de la capa y ii ataque de la superficie de crecimiento. Según la composición de la mezcla gaseosa se favorece uno u otro proceso, lo que conduce a velocidades de deposición diferentes así como a depósitos con diferente composición y estructura atómica.

  10. Obtención de Si3N4 mediante SHS

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Rodríguez, M. A.

    2003-04-01

    parámetros que definen la propia reacción. Con la información obtenida se propone el mecanismo predominante de la síntesis del Nitruro de Silicio mediante SHS.

  11. Terapia de exposición mediante Realidad Virtual en los trastornos alimentarios: presente y futuro

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ferran Vilalta Abella

    2015-01-01

    Full Text Available El objetivo de este trabajo fue revisar el uso de la realidad virtual (RV como técnica de exposición para el tratamiento de los trastornos de la conducta alimentaria (TCA. Para ello se analizó la literatura existente con el fin de responder a dos cuestiones: primero, ¿existe evidencia sobre la capacidad de los entornos y estímulos virtuales para provocar respuestas de ansiedad y craving en pacientes con TCA?; y, segundo, ¿la aplicación de técnicas de exposición mediante RV permite la disminución de esas respuestas? Se seleccionaron 13 estudios teniendo en cuenta los siguientes criterios de inclusión: muestras de pacientes con TCA, población subclínica y/o población sin TCA; exposición a entornos y estí- mulos de RV; evaluación de la ansiedad y/o craving; estudios empíricos y meta-análisis. Los resultados muestran evidencia sobre la capacidad de la RV para provocar respuestas de ansiedad en los pacientes con TCA y, por tanto, su eficacia potencial para la implementación de la terapia de exposición en el tratamiento de los trastornos alimentarios. En cambio, la evidencia disponible sobre la capacidad de la RV para generar respuestas de craving es limitada. Se detectan dos líneas de investigación emergentes. En primer lugar, el uso de la RV para la exposición con prevención de respuesta de la conducta de atracón en pacientes con bulimia y trastorno de atracón. En segundo lugar, el uso de esta tecnología para la exposición a la comida en pacientes con anorexia que muestran elevados niveles de ansiedad y evitación ante determinados alimentos y situaciones.

  12. Tribología de nuevas capas autolubricantes producidas mediante PVD

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Oñate, J. I.

    2005-12-01

    Full Text Available MoS2 coatings, deposited by PVD show a low friction under vacuum conditions, but degrade easily under atmospheric conditions. This work describes the development of a new type of MoSx, coating, modified with WC. These coatings presented a very low and stable friction coefficient lower than 0.04 when tested under vacuum at 0.75 GPa in a ball on disc tribometer. Durability was higher than 1 million wear cycles, showing a wear rate of 1.3 10-16 m3/Nm. When tested under atmospheric conditions and up to 70 % RH, friction increased to 0.15 and durability reached a lower value of up to 3 x 105 cycles. Surface analyses in these coatings showed S/Mo ratios higher than 1.2 and with oxygen levels lower than 2 %, demonstrating the lubricant character of the coating.

    Las capas de MoS2 depositadas mediante PVD tienen baja fricción en vacío pero se degradan con facilidad al aire, especialmente en presencia de humedad. Este trabajo describe el desarrollo de nuevas capas de MoSx modificadas con WC. En ensayos de "bola sobre disco" a 0,75 GPa, las capas presentaron una fricción muy baja y estable (< 0,04 en vacío. Se obtuvo una durabilidad superior a 1 millón de ciclos, mostrando un desgaste de 1,3 x 10-16 m3/Nm, mejorado respecto a otras capas de MoSx. El coeficiente de fricción aumentó a 0,15 y la durabilidad disminuyó hasta 1 a 3 x 105 ciclos en aire hasta 70 % HR. El análisis superficial mostró ratios de S/Mo superiores a 1,2, con menos del 2 % de oxígeno, demostrando carácter lubricante.

  13. EDUCACIÓN MEDIANTE ENCICLOPEDIAS VISUALES TEMÁTICAS: INTYPEDIA UN CASO DE ÉXITO

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    ALFONSO MUÑOZ MUÑOZ

    2013-01-01

    Full Text Available La presente investigación recoge una experiencia de innovación educativa que demuestra la utilidad de las enciclopedias visuales temáticas para la formación académica a través de Internet. Los objetivos de esta experiencia recaen en verificar si es posible crear enciclopedias visuales temáticas que mediante recursos audiovisuales permitan el aprendizaje de aspectos complejos de una manera asequible. Con el interés de obtener datos que permitan comprobar la idoneidad de este tipo de recursos formativos, se construye una enciclopedia visual temática centrada en aspectos de la seguridad de la información y protección de las comunicaciones digitales. Para el diseño de esta enciclopedia se considera una metodología de diseño basada en la definición de una temática de interés, tipo de aprendizaje, formato y calidad de las unidades temáticas, difusión y coste, etc. Esta enciclopedia visual, el proyecto Intypedia, novedoso a escala mundial, está compuesta por lecciones en vídeo de unos 12 minutos y material docente complementario. El lenguaje utilizado permite el correcto seguimiento de las lecciones tanto a expertos en seguridad como internautas en general. Por tanto, la calidad y claridad de estos contenidos se convierten en un valor añadido del proyecto. Los resultados derivados reflejan la utilidad de Intypedia. En 2 años de vida la enciclopedia recibe miles de visitas al mes y se ha convertido en una enciclopedia de referencia en Iberoamérica y en las redes sociales en las que está presente. Algunos de los resultados más importantes son: 232.786 reproducciones únicas de las lecciones, siendo los consumidores principalmente internautas, profesionales y técnicos de España, Iberoamérica y EE.UU.; más de 176.000 documentos descargados, en torno a los 2.100 seguidores uniendo las redes sociales y una visibilidad en Google con más de 40.000 entradas que enlazan al proyecto.

  14. Standardizzazione isogravitá di un case-mix ospedaliero mediante Charlson index

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    G. Messina

    2003-05-01

    Full Text Available

    Introduzione: la comorbidità è un importante fattore confondente negli studi epidemiologici valutativi dell’assistenza ospedaliera. Diversi strumenti di risk adjustment misurano la complessità della malattia, consentendo di correlarla al consumo di risorse assistenziali, agli esiti, nonchè di confrontare studi eseguiti in tempi e realtà diversi.

    Obiettivi: - Standardizzare per complessità casistica la mortalità dei pazienti assistiti da un grande ospedale; - Identificare le variabili in grado di migliorare la capacità predittiva di mortalità intraospedaliera (IM. Materiali e

    Metodi: sono state analizzate 40.801 schede di dimissione prodotte dal Policlinico Senese nel 2001. Sono stati studiati i tassi di IM specifici per Charlson Index Score (CSI: quest’ultimo considera 19 categorie di patologia e si basa sull’ ICD-IX-CM. Le variabili studiate mediante analisi bivariate e regressione logistica, sono state: CSI (codificato in 5 livelli 0, 1, 2, 3, 4, lunghezza del ricovero (LR, sesso ed età. Risultati: CSI è risultato associato con IM (p‹0.001. Sesso, età e LR sono risultati associati sia con CSI (p‹0.001 che IM (p‹0.001. Confrontando i 4 livelli di CSI con quello di riferimento (0, le seguenti Odds Ratio (OR di IM sono state trovate: Livello 1 verso livello 0 OR: 6.79 (p‹0.001, Livello 2 verso livello 0 OR: 15.8 (p‹0.001, Livello 3 verso livello 0 OR: 9.36 (p‹0.001, Livello 4 verso livello 0 OR: 7.4 (p‹0.001. La variabile sesso non è risultata aver un effetto confondente tra CSI e IM al contrario delle variabili LR ed età.

    Conclusioni: il CSI aiuta a valutare (predire il rischio di mortalità intraospedaliera, sebbene in modo non lineare. Abbiamo sempre rilevato valori più alti di mortalità confrontando i livelli 1, 2, 3, e 4 con quello di riferimento (0. In particolare il valore più alto lo ha raggiunto il secondo livello

  15. Diagnostic multiplex PCR for toxin genotyping of Clostridium perfringens isolates.

    Science.gov (United States)

    Baums, Christoph G; Schotte, Ulrich; Amtsberg, Gunter; Goethe, Ralph

    2004-05-20

    In this study we provide a protocol for genotyping Clostridium perfringens with a new multiplex PCR. This PCR enables reliable and specific detection of the toxin genes cpa, cpb, etx, iap, cpe and cpb2 from heat lysed bacterial suspensions. The efficiency of the protocol was demonstrated by typing C. perfringens reference strains and isolates from veterinary bacteriological routine diagnostic specimens.

  16. Clinical consequences of PCR based diagnosis of intestinal parasitic infections

    NARCIS (Netherlands)

    Rijsman, Lucas H; Monkelbaan, Jan F; Kusters, Johannes G

    The implementation of Polymerase Chain Reaction (PCR) based diagnostics of intestinal protozoa have led to higher sensitivity and (subtype) specificity, more convenient sampling and the possibility for high-throughput screening. An increasing number of clinical laboratories use PCR for routine

  17. Two unusual occurrences of trichomoniasis: rapid species identification by PCR.

    Science.gov (United States)

    Bellanger, A P; Cabaret, O; Costa, J M; Foulet, F; Bretagne, S; Botterel, F

    2008-09-01

    PCR analysis in two unusual occurrences of trichomoniasis, trichomonal empyema due to Trichomonas tenax and Trichomonas vaginalis in an infant urine sample, allowed us to obtain rapid and accurate trichomonad species identification. The weak sensitivity of wet preparations and the low viability of the flagellates can be remedied by the PCR method.

  18. Inhibitory effect of common microfluidic materials on PCR outcome

    KAUST Repository

    Kodzius, Rimantas

    2013-10-10

    In this study, we established a simple method for evaluating the PCR compatibility of various common materials employed when fabricating microfluidic chips, including silicon, several kinds of silicon oxide, glasses, plastics, wax, and adhesives. Two-temperature PCR was performed with these materials to determine their PCR-inhibitory effect. In most cases, adding bovine serum albumin effectively improved the reaction yield. We also studied the individual PCR components from the standpoint of adsorption. Most of the materials did not inhibit the DNA, although they noticeably interacted with the polymerase. We provide a simple method of performing PCR-compatibility testing of materials using inexpensive instrumentation that is common in molecular biology laboratories. Furthermore, our method is direct, being performed under actual PCR conditions with high temperature. Our results provide an overview of materials that are PCR-friendly for fabricating microfluidic devices. The PCR reaction, without any additives, performed best with pyrex glass, and it performed worst with PMMA or acrylic glue materials.

  19. Sexing Bovine Embryos Using PCR Amplification of Bovine SRY Sequence

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    曾溢滔; 张美兰; 陈美珏; 周霞娣; 黄英; 任兆瑞; 黄淑帧; 胡明信; 吴学清; 高建明; 张斌; 徐慧如

    1994-01-01

    This study analyses the bovine SRY DNA sequence by direct sequencing procedure, followed by the designation of the PCR primers specific for bovine SRY. Using PCR amplification of bovine SRY gene, the embryo sex was determined. The results of the embryo sex identification were confirmed after the embryo transfer and pregnancies.

  20. Clinical consequences of PCR based diagnosis of intestinal parasitic infections

    NARCIS (Netherlands)

    Rijsman, Lucas H; Monkelbaan, Jan F; Kusters, Johannes G

    2016-01-01

    The implementation of Polymerase Chain Reaction (PCR) based diagnostics of intestinal protozoa have led to higher sensitivity and (subtype) specificity, more convenient sampling and the possibility for high-throughput screening. An increasing number of clinical laboratories use PCR for routine detec

  1. Evaluation of Aspergillus PCR protocols for testing serum specimens.

    Science.gov (United States)

    White, P Lewis; Mengoli, Carlo; Bretagne, Stéphane; Cuenca-Estrella, Manuel; Finnstrom, Niklas; Klingspor, Lena; Melchers, Willem J G; McCulloch, Elaine; Barnes, Rosemary A; Donnelly, J Peter; Loeffler, Juergen

    2011-11-01

    A panel of human serum samples spiked with various amounts of Aspergillus fumigatus genomic DNA was distributed to 23 centers within the European Aspergillus PCR Initiative to determine analytical performance of PCR. Information regarding specific methodological components and PCR performance was requested. The information provided was made anonymous, and meta-regression analysis was performed to determine any procedural factors that significantly altered PCR performance. Ninety-seven percent of protocols were able to detect a threshold of 10 genomes/ml on at least one occasion, with 83% of protocols reproducibly detecting this concentration. Sensitivity and specificity were 86.1% and 93.6%, respectively. Positive associations between sensitivity and the use of larger sample volumes, an internal control PCR, and PCR targeting the internal transcribed spacer (ITS) region were shown. Negative associations between sensitivity and the use of larger elution volumes (≥100 μl) and PCR targeting the mitochondrial genes were demonstrated. Most Aspergillus PCR protocols used to test serum generate satisfactory analytical performance. Testing serum requires less standardization, and the specific recommendations shown in this article will only improve performance.

  2. Clinical consequences of PCR based diagnosis of intestinal parasitic infections

    NARCIS (Netherlands)

    Rijsman, Lucas H; Monkelbaan, Jan F|info:eu-repo/dai/nl/344499383; Kusters, Johannes G

    2016-01-01

    The implementation of Polymerase Chain Reaction (PCR) based diagnostics of intestinal protozoa have led to higher sensitivity and (subtype) specificity, more convenient sampling and the possibility for high-throughput screening. An increasing number of clinical laboratories use PCR for routine detec

  3. Comparison between ICT and PCR for diagnosis of Chlamydia trachomatis.

    Science.gov (United States)

    Khan, E R; Hossain, M A; Paul, S K; Mahmud, C; Hasan, M M; Rahman, M M; Nahar, K; Kubayashi, N

    2012-04-01

    Chlamydia trachomatis is an obligate intracellular gram-negative bacterium which is the most prevalent cause of bacterial sexually transmitted infections (STI). The present study was carried to diagnose genital Chlamydia trachomatis infection among women of reproductive age, attending Mymensingh Medical College Hospital, during July 2009 to June 2010 by Immunochromatographic test (ICT) and Polymerase chain reaction (PCR). A total of 70 females were included in this study. Out of 70 cases 56 were symptomatic and 14 asymptomatic. Endocervical swabs were collected from each of the cases and examined by Immunochromatographic test (ICT) for antigen detection and Polymerase chain reaction (PCR) for detection of endogenous plasmid-based nucleic acid. A total 29(41.4%) of the cases were found positive for C. trachomatis either by ICT or PCR. Of the 56 symptomatic cases, 19(33.9%) were found ICT positive and 17(30.4%) were PCR positive. Among 14 asymptomatic females, 2(14.3%) were ICT positive and none were PCR positive. Though PCR is highly sensitive but a total of twelve cases were found ICT positive but PCR negative. It may be due to presence of plasmid deficient strain of C trachomatis which could be amplified by ompA based (Chromosomal gene) multiplex PCR.

  4. mRNA and DNA PCR tests in cutaneous tuberculosis

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Chandanmal Suthar

    2013-01-01

    Full Text Available Background: The microbiologic diagnosis of cutaneous tuberculosis is difficult because most lesions harbor only a small number of mycobacteria that cannot usually be detected by staining for the organism or by culture. Nucleic acid amplification tests based on the polymerase chain reaction (PCR are potentially useful in this situation. Aims: To evaluate the utility of mRNA PCR and DNA PCR in the diagnosis of cutaneous tuberculosis. Methods: Biopsies from 28 cases of cutaneous tuberculosis and 19 controls with other diseases were subjected to microbiologic tests including direct smears for mycobacteria, culture and both mRNA PCR and DNA PCR. The laboratory was blinded to the clinical diagnosis. Results: None of the patients or controls showed a positive reaction on mRNA PCR test. Seven of 28 cases and 5 out of 19 controls showed a positive result on DNA PCR test yielding a sensitivity of 25% and a specificity of 73.7%. Conclusion: The results of PCR tests in cutaneous tuberculosis should be interpreted in the light of clinical and histopathological findings.

  5. Multiplex PCR identification of Taenia spp. in rodents and carnivores.

    Science.gov (United States)

    Al-Sabi, Mohammad N S; Kapel, Christian M O

    2011-11-01

    The genus Taenia includes several species of veterinary and public health importance, but diagnosis of the etiological agent in definitive and intermediate hosts often relies on labor intensive and few specific morphometric criteria, especially in immature worms and underdeveloped metacestodes. In the present study, a multiplex PCR, based on five primers targeting the 18S rDNA and ITS2 sequences, produced a species-specific banding patterns for a range of Taenia spp. Species typing by the multiplex PCR was compared to morphological identification and sequencing of cox1 and/or 12S rDNA genes. As compared to sequencing, the multiplex PCR identified 31 of 32 Taenia metacestodes from rodents, whereas only 14 cysts were specifically identified by morphology. Likewise, the multiplex PCR identified 108 of 130 adult worms, while only 57 were identified to species by morphology. The tested multiplex PCR system may potentially be used for studies of Taenia spp. transmitted between rodents and carnivores.

  6. Engineered DNA Polymerase Improves PCR Results for Plastid DNA

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Melanie Schori

    2013-02-01

    Full Text Available Premise of the study: Secondary metabolites often inhibit PCR and sequencing reactions in extractions from plant material, especially from silica-dried and herbarium material. A DNA polymerase that is tolerant to inhibitors improves PCR results. Methods and Results: A novel DNA amplification system, including a DNA polymerase engineered via directed evolution for improved tolerance to common plant-derived PCR inhibitors, was evaluated and PCR parameters optimized for three species. An additional 31 species were then tested with the engineered enzyme and optimized protocol, as well as with regular Taq polymerase. Conclusions: PCR products and high-quality sequence data were obtained for 96% of samples for rbcL and 79% for matK, compared to 29% and 21% with regular Taq polymerase.

  7. RECUBRIMIENTOS DE CARBUROS DE Nb-V-Cr DEPOSITADOS MEDIANTE EL PROCESO DE DIFUSIÓN TERMO-REACTIVA (TRD

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Anyerson Cuervo

    2015-01-01

    Full Text Available En este trabajo se presentan los resultados del proceso de depósito de recubrimientos de carburos de niobio-vanadio-cromo sobre acero AISI/SAE 1045 y AISI/SAE H13, utilizando la técnica de deposición por difusión termorreactiva (TRD. Los recubrimientos fueron obtenidos usando un baño de sales compuesto por bórax fundido, ferro-niobio, ferro-vanadio, ferro-cromo y aluminio, variando el contenido de cromo (8 y 32 % en peso, a una temperatura de 1.020°C durante 4 horas. Mediante la técnica de Difracción de Rayos X se evidenció la presencia de fases binarias de VC, NbC, CrC. Las propiedades químicas superficiales y morfológicas de los recubrimientos se estudiaron mediante la técnica de microscopia electrónica de barrido con acople de una sonda de energía dispersiva (MEB-EDS. La dureza de los recubrimientos se determinó utilizando un microindentador LECO M-400-G2 con una carga máxima de 300 g. El comportamiento electroquímico fue estudiado a través de curvas de polarización potencio- dinámicas para determinar la densidad de corriente de corrosión. El comportamiento tribológico se analizó mediante el ensayo “ Ball-on-disc ”, encontrando un coeficiente de fricción menor en los materiales recubiertos con respecto al sustrato sin recubrir.

  8. Sulla stima di macro, micro e nano-durezza di materiali metallici mediante analisi elasto-plastiche agli elementi finiti

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Luca Susmel

    2012-01-01

    Full Text Available Il lavoro sintetizzato nel presente articolo si pone come obiettivo primario quello di investigare la possibilità di stimare, mediante un approccio elasto-plastico agli elementi finiti, la durezza dei materiali metallici convenzionali, e questo sia a livello macroscopico, che a livello microscopico, che, infine, a livello nanoscopico. Per verificare validità e accuratezza della metodologia FEM sviluppata, sono state condotte una serie di analisi sperimentali su tre materiali metallici aventi caratteristiche metallurgiche estremamente diverse: una lega d’alluminio (Al 7075-T6, un acciaio a basso tenore di carbonio (BS970-En3B e, infine, un acciaio austenitico (AISI 316L. L’indentazione Vickers è stata simulata con analisi elasto–plastiche agli elementi finiti considerando carichi di prova nell’intervallo tra 490 N e 490 µN e calibrando le simulazioni numeriche mediante curve monotone tensione–deformazione ottenute da prove di trazione eseguite utilizzando provini sia di dimensione convenzionale che aventi larghezza della zona calibrata dell’ordine dei 100 µm.La sistematica comparazione tra risultati sperimentali e simulazioni numeriche ha posto in evidenza come l’aumentare del valore della durezza misurata al diminuire della dimensione dell’impronta possa essere imputata al ruolo giocato dalla reale morfologia del materiale, ruolo che diventa predominante sulla plasticità convenzionale quando le dimensioni della superficie indentata diventano comparabili con le dimensioni medie della grana cristallina delle leghe esaminate. Tali fenomeni, pertanto, non hanno consentito di estendere l’utilizzo della meccanica del continuo fino ad un livello nanoscopico per determinare correttamente i valori della durezza. Alla luce di questi risultati è stata, però, proposta una semplice metodologia di correzione delle stime eseguite mediante gli elementi finiti che si è dimostrata un valido strumento da utilizzarsi in situazioni di

  9. Modificación de las propiedades superficiales de aceros inoxidables Dúplex mediante recubrimientos por láser

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Amigo, V.

    2004-12-01

    Full Text Available Laser cladding is one of the most promissing techniques to restore damaged surfaces and achieve properties similar to those of the base metal. In this work, duplex stainless steels have been cladded by a nickel alloy under different processing conditions. The influence of the beam speed and defocusing variables has been evaluated in the microstructure both of the cladding and heat affected zone, HAZ. These results have been correlated to mechanical properties by means of microhardness measurements from cladding area to base metal through the interface. This technique has shown to be very appropriate to obtain controlled mechanical properties as they are determined by the solidification microstructure, originated by the transfer of mass and heat in the system.

    La posibilidad de restaurar superficies y, con ello, las propiedades de las mismas mediante el recubrimiento por láser de polvos constituye uno de los mayores intereses en las investigaciones actuales. En este trabajo se ha obtenido un recubrimiento de una aleación base níquel, mediante el tratamiento láser de polvos elementales para diferentes condiciones de procesado. Se ha evaluado la influencia de las variables de proceso, velocidad del láser y desenfoque del haz láser en la microestructura de los recubrimientos y con ello en las propiedades finales de los mismos, así como en la transición de estas a través de la interfase y la zona afectada por el calor, ZAC, evaluada mediante perfiles de microdureza. La obtención de recubrimientos a partir de polvos resulta muy adecuada, en este caso, al obtener unas propiedades mecánicas que están determinadas por la microestructura de solidificación, originada por la transferencia de masa y calor en el sistema.

  10. Síntesis de nitruro de titanio mediante láser y energía solar concentrada

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    García, I.

    1998-04-01

    Full Text Available The possibility of the employment of solar energy concentrated by Fresnel lens is investigated in order to synthesize materials by gas-solid reaction. These first results are compared by two similar techniques as high power laser and xenon are lamp. The TiN coatings obtained with xenon are lamp and Fresnel lens are homogenous, without pores or defects, with a uniform thickness of about 6 μm for treatments of 2 min. The good quality of the TiN coating for all the testing conditions was confirmed by the x-ray diffraction measurements.

    Se presenta la utilización de la energía solar concentrada mediante lentes de Fresnel para la síntesis de materiales por reacción gas-sólido. Estos primeros resultados sobre nitruración superficial de titanio y aleaciones de titanio se comparan con los obtenidos con técnicas similares como el láser de alta potencia y la lámpara de descarga de xenón. Las capas de nitruro de titanio obtenidas mediante energía solar concentrada por lentes de Fresnel y lámpara de xenón son homogéneas, sin grietas ni defectos, y con un espesor uniforme de 6 μm en tiempos de sólo 2 min. La buena calidad de estas capas se confirma mediante difracción de rayos X.

  11. KRAS mutation analysis by PCR: a comparison of two methods.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Louise Bolton

    Full Text Available KRAS mutation assays are important companion diagnostic tests to guide anti-EGFR antibody treatment of metastatic colorectal cancer. Direct comparison of newer diagnostic methods with existing methods is an important part of validation of any new technique. In this this study, we have compared the Therascreen (Qiagen ARMS assay with Competitive Allele-Specific TaqMan PCR (castPCR, Life Technologies to determine equivalence for KRAS mutation analysis.DNA was extracted by Maxwell (Promega from 99 colorectal cancers. The ARMS-based Therascreen and a customized castPCR assay were performed according to the manufacturer's instructions. All assays were performed on either an Applied Biosystems 7500 Fast Dx or a ViiA7 real-time PCR machine (both from Life Technologies. The data were collected and discrepant results re-tested with newly extracted DNA from the same blocks in both assay types.Of the 99 tumors included, Therascreen showed 62 tumors to be wild-type (WT for KRAS, while 37 had KRAS mutations on initial testing. CastPCR showed 61 tumors to be wild-type (WT for KRAS, while 38 had KRAS mutations. Thirteen tumors showed BRAF mutation in castPCR and in one of these there was also a KRAS mutation. The custom castPCR plate included several other KRAS mutations and BRAF V600E, not included in Therascreen, explaining the higher number of mutations detected by castPCR. Re-testing of discrepant results was required in three tumors, all of which then achieved concordance for KRAS. CastPCR assay Ct values were on average 2 cycles lower than Therascreen.There was excellent correlation between the two methods. Although castPCR assay shows lower Ct values than Therascreen, this is unlikely to be clinically significant.

  12. PCR detection of Babesia ovata from questing ticks in Japan.

    Science.gov (United States)

    Sivakumar, Thillaiampalam; Tattiyapong, Muncharee; Okubo, Kazuhiro; Suganuma, Keisuke; Hayashida, Kyoko; Igarashi, Ikuo; Zakimi, Satoshi; Matsumoto, Kotaro; Inokuma, Hisashi; Yokoyama, Naoaki

    2014-04-01

    Babesia ovata is a tick-transmitted hemoprotozoan parasite of cattle. In the present study, we analyzed tick DNA samples (n=1459) prepared from questing ticks collected from various cattle pastures in Hokkaido (Shibecha, Taiki, Otofuke, Memuro, and Shin-Hidaka districts) and Okinawa (Yonaguni Island) prefectures of Japan for B. ovata. When all the tick DNA samples were screened by a previously described B. ovata-specific apical membrane antigen-1 (AMA-1) gene-based polymerase chain reaction (PCR) assay, none of the DNA samples was positive. Therefore, we developed a PCR assay based on the protozoan beta-tubulin (β-tubulin) gene to detect B. ovata from ticks in Japan. In the specificity test, the PCR assay amplified the expected 444-bp target gene fragment from B. ovata DNA. No PCR products were amplified from DNA samples from other blood pathogens, bovine blood, or ticks. In addition, the PCR assay detected 100 fg of B. ovata-genomic DNA extracted from an in vitro culture of the parasites. Subsequently, when all the tick DNA samples were screened by this new PCR assay, 18 were positive for B. ovata. Positive samples were found only in the Yonaguni and Memuro areas. In Okinawa, where all the ticks were identified as Haemaphysalis longicornis, 9.7% of the samples were PCR-positive, while a single tick (Ixodes ovatus) from Memuro was infected with B. ovata. When the nucleotide sequences of the PCR amplicons were phylogenetically analyzed, they formed a separate clade containing a previously described β-tubulin gene sequence from B. ovata (Miyake strain), confirming that the PCR assay had detected only B. ovata from the tick DNA samples. This is the first report that describes the PCR detection of B. ovata in ticks. The findings warrant transmission experiments to evaluate I. ovatus as a potential vector of B. ovata.

  13. Desarrollo de un sistema alternativo para la implementación de telemedicina mediante internet inalámbrico

    OpenAIRE

    2009-01-01

    En la actualidad las telecomunicaciones desempeñan un papel muy importante en el área médica; los avances tecnológicos y la Internet resultan a menudo herramientas imprescindibles en este campo. Debido a que la accesibilidad a este medio y su uso van en aumento, esta propuesta consiste en desarrollar un sistema que mantenga en constante comunicación al médicoy paciente, mediante la Internet. Al mismo tiempo se brinda un sistema de información médico que contiene datos útiles tanto para...

  14. Optimización de un cuestionario mediante un método Delphi y una prueba piloto

    OpenAIRE

    David Jiménez Hernández; María Tornel Abellán; Juan José González Ortiz

    2015-01-01

    Por medio del presente artículo describimos un Método Delphi y una prueba piloto para la mejora de un cuestionario sobre métodos activos de enseñanza. En el primer instrumento se utilizan las opinión de ocho expertos de diferentes temáticas que a través de cinco rondas fueron presentando propuestas de mejora para el cuestionario. Mediante la prueba piloto, además de comprobar el comportamiento del cuestionario en una parte proporcional de la muestra, también ayudó a la resolución de algunas c...

  15. Propuesta de mejora de habilidades sociales en niños con discapacidad intelectual mediante la terapia asistida por animales

    OpenAIRE

    Bermejo Lorenzo, Julia

    2015-01-01

    Este Trabajo de Fin de Grado se centra en la aplicación práctica de un programa de mejora de la Educación Socioemocional, utilizando como herramienta innovadora la Terapia Asistida con Animales de Compañía, aplicándose a un caso real de un alumno con Parálisis Cerebral y Discapacidad Intelectual asociada. Los objetivos de las actividades están centrados en el desarrollo de la autoconciencia, el autocontrol, la conciencia social y la toma de decisiones responsables. Mediante este proyecto se p...

  16. Interaccion de promastigotes de Leishmania donovani con celulas de exudado peritonial de ratones mediante la influencia de la quimotripsina

    OpenAIRE

    Arcay,Lucila; Bruzual,Elizabeth

    1986-01-01

    Se hace un estudio de la interacción de promastigotes de Leishmania donovani con células de exudado peritoneal de ratón (c e p) mediante la influencia de la quimotripsina. La adhesión de los promastigotes a las c e p fue terminal y marginal, y en observaciones hechas a partir de los 10 minutos de enfrentamiento, esta adhesión fue nula hasta los 30 minutos en el grupo tratado, y sólo a las das horas hubo un pequeño incremento (2.4%) con respecto al control. Se observa marcada disminución en to...

  17. Análisis genotípico en Vochysia guatemalensis Donn Smith (Vochysiaceae) mediante microsatélites

    OpenAIRE

    Rojas, Fabiana; Instituto Tecnológico de Costa Rica, Escuela de Ingeniería Forestal; Cartago, Costa Rica; Murillo-Gamboa, Olman; Instituto Tecnológico de Costa Rica, Escuela de Ingeniería Forestal; Cartago, Costa Rica; Aguilar, Gabriel; Universidad de Costa Rica; Rocha, Oscar; Kent State University, Ohio, USA; Araya-Valverde, Emanuel; Instituto Tecnológico de Costa Rica, Escuela de Ingeniería Forestal; Cartago, Costa Rica

    2012-01-01

    En el presente estudio se muestran los resultados del análisis de una colección de 62 clones de Vochysia guatemalensis ubicados en la zona norte y caribe de Costa Rica mediante el uso microsatélites (SSR), adaptados y validados de un grupo de marcadores existentes para Vochysia ferruginea. El material fueseleccionado de árboles plus procedente de varias poblaciones naturales y de pequeñas plantaciones. Se trabajó en el establecimiento de la huella genética de cada clon y en el agrupamiento de...

  18. Electrohilado de fibras coaxiales constituidas por polibutilenosuccinato (PBS, Bionolle) y polietilenglicol (PEG). Funcionalización mediante carga de drogas

    OpenAIRE

    2013-01-01

    En este proyecto se ha realizado un estudio de la preparación de micro y nanofibras de dos biopolímeros, Bionolle® (PBS) y polietilenglicol (PEG) de hidrofilidad diferente. Las fibras se obtuvieron mediante la técnica de electrospinning coaxial, en el que se han producido fibras posicionando cada uno de los polímeros en el shell y en el core y viceversa, así como la mezcla de ambos. Posteriormente se procedió a la caracterización estructural de las diferentes mezclas preparadas y al análisis ...

  19. Estudio y determinación de la población de bacterias en vino mediante epifluorescencia

    OpenAIRE

    Curiel Llanos, Laura

    2014-01-01

    Se ha procedido a la determinación de la población de bacterias mediante técnicas de epifluorescencia para tener un conocimiento más amplio y preciso de las bacterias viables y no viables en los procesos de elaboración de vinos. Dichas determinaciones son fundamentales a efectos de la calidad en la elaboración del vino. Se realiza la comparación con otras técnicas microbiológicas actualmente utilizadas. Máster en Técnicas Avanzadas en Química

  20. Diseño de un sistema de almacenaje de puros habanos controlando temperatura y humedad mediante termoelectricidad

    OpenAIRE

    2012-01-01

    El objetivo del proyecto es diseñar una cava para puros, controlando tanto temperatura como humedad. La temperatura se controla mediante células termoeléctricas (Peltier) en vez de sistemas por compresión que utilizan gases contaminantes. Para la humedad se utilizará un sistema exterior al habitáculo de la cava. En la actualidad se suele utilizar un humidificador dentro de cava. Incluso se desarrolla un sistema para regular la humedad en el caso de que suba demasiado en el habitáculo cosa ...

  1. Refrigeración de vacunas mediante una máquina frigorífica por efecto Peltier

    OpenAIRE

    2011-01-01

    El proyecto “Refrigeración de vacunas mediante una máquina frigorífica por efecto Peltier” estudia el control de la temperatura dentro de un volumen fijo de aire a fin de conservar vacunas. En este proyecto se describen las nuevas tecnologías refrigeración más demandadas y estudiadas en la actualidad en concreto de la tecnología de la termoelectricidad. La tecnología termoeléctrica en el campo de la refrigeración está basada en el principio del efecto Peltier que permite el bombeo de calor de...

  2. Caracterización estructural mediante elipsometría espectral de multicapas basadas en SiO2

    OpenAIRE

    Alonso, M. I.; Garriga, M.

    2000-01-01

    [ES] Se han caracterizado capas de óxidos subestequiométricos de silicio (SiOx) y estructuras gruesas de guías de onda mediante elipsometría espectral. Para ello ha sido necesario desarrollar un método de ajuste que permita analizar en detalle espectros complicados de elipsometría, como los obtenidos en estructuras multicapa gruesas (~10 μm) típicas de dispositivos modernos de óptica integrada. La elipsometría es la técnica más adecuada para la caracterización detallada de esas estru...

  3. Materiales poliméricos biodegradables preparados mediante procesado termomecánico a partir de mezclas gluten/plastificante

    OpenAIRE

    Zárate Ramírez, Lidia Soledad

    2011-01-01

    El objetivo del presente trabajo consiste en estudiar el efecto de la adición de diferentes agentes en la formulación de bioplásticos obtenidos a partir de gluten mediante mezclado y moldeo por compresión o extrusión, sobre las propiedades viscoelásticas, mecánicas y de absorción de agua de tales bioplásticos. Los resultados aquí obtenidos podrían contribuir a sentar las bases para futuras aplicaciones de estos materiales biodegradables. Para alcanzar este objetivo la investigación abordará l...

  4. Monitorización de la calidad del aire en tiempo real mediante el procesamiento de eventos complejos

    OpenAIRE

    Fernández de la Rosa, Iván

    2015-01-01

    El pilar fundamental de este TFG girará entorno a la monitorización de la calidad del aire en tiempo real, en el que se apoyará el objetivo principal, el cual consiste en la constante información y adecuación de dicha calidad del aire a determinados grupos de riesgo mediante el uso de tecnología aplicada al hogar. Para poder llevar acabo dicho propósito, se ideará una arquitectura que integre tanto Service-Oriented Architecture (SOA) como Complex Event Processing (CEP) cuyas principales fu...

  5. La representación del conocimiento especializado mediante las marcas de especialidad: del DRAE-1992 al DRAE-2001

    OpenAIRE

    Antoni Nomdedeu Rull

    2007-01-01

    En los últimos tiempos se han sucedido los análisis relacionados con la inclusión y la representación de los distintos campos del saber en la lexicografía general. En tal contexto, este estudio analiza la representación de los diferentes campos del saber en las dos últimas ediciones del «Diccionario de la lengua española» (DRAE), de la Real Academia Española, mediante la observación de las acepciones que incorporan marcas de especialidad y el estudio de las informaciones proporcionadas por la...

  6. Innovador tratamiento de heridas abdominales complejas mediante terapia de presión negativa con instilación intermitente

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    A. García-Ruano

    2013-09-01

    Full Text Available Describimos nuestra experiencia en el tratamiento de heridas abdominales postquirúrgicas dehiscentes y contaminadas con exposición de material protésico, mediante terapia de presión negativa con instilación intermitente de soluciones tópicas. Este dispositivo nos permitió el rescate de pacientes pluripatológicos evitando una reintervención compleja de alta morbi-mortalidad y facilitando el cierre de la herida, además con conservación de la malla en la mayor parte de los casos.

  7. La exploración del reflejo vestíbulo-ocular mediante el test de lectura

    OpenAIRE

    1999-01-01

    El test de lectura consiste en pedir al paciente que lea un texto mientras se le mueve la cabeza a uno y otro lado a una frecuencia de al menos 2 Hz. Si el reflejo vestíbulo-ocular (RVO) no tiene fallo alguno, será capaz de estabilizar la mirada y el paciente podrá leer correctamente. Si el RVO es defectuoso, la lectura se volverá imposible. Para demostrarlo, hemos valorado el RVO a una serie de 30 pacientes mediante el VAT, se han clasificado según el test de lectura y comparado los resultad...

  8. Un ambiente para evaluación de sistemas de software mediante métricas clásicas

    OpenAIRE

    Pesado, Patricia Mabel; De Giusti, Armando Eduardo; Zorzano, A.C. J.; Borroni, A. C. C.

    1996-01-01

    Se presenta un ambiente para evaluación de sistemas de software mediante recolección de métricas y estimaciones. El objetivo principal es conformar una línea base a partir de mediciones efectuadas sobre desarrollos ya implementados que sirva de información para futuras estimaciones. Sin duda las mejores estimaciones surgen del análisis de proyectos similares efectuados en la organización. Las experiencias recogidas de desarrollos análogos realizados por otras organizaciones pueden servi...

  9. Nivel de infección de helicobacter pylori mediante la técnica de ELISA

    OpenAIRE

    Moromi Nakata, Hilda; Prof. Asociado a D.E. instituto de Investigación Estomatológica Fac. Odontología UNMSM.; Calle Espinoza, Sonia; Prof. Asociado a D.E. Lab Miciobiología. Fac. Med Vet UNMSM.; Martínez Cadillo, Elba; Prof. Auxiliat a TP D~to. Ciencias Básicas. Lab. Microbiología Fac. Odontol. UNMSM.; Villavícencío Gastelú, Jorge; Prof, Asociado a TC Dpto. Médico Quirúrgico. Fac. Odontol UNMSM.; Zambrano de la Pena, Sonia; Prof. Asociado a TP Dpto. Médico-Quirúrgico. Sccción de Periodoncia. Fac. Odontol. UNMSM.

    2014-01-01

    En base a los resultados obtenidos sobre el hallazgo de Helicobacter pylori en los estudios precedentes, en Placa Dental, y en pacientes con gi. ngivitis y enfermedad periodontal, (Moronn, 1999 y 2000, respectivamente), se considero necesario implementar este proyecto, mediante la determinación de los niveles de infección a través de la presencia de anticuerpos específicos. En este caso el estudio abarcará una población de estudio más amplia, constituida por una muestra poblacional de estudia...

  10. Evaluación de la Escritura Mediante Rúbrica en la Educación Primaria en México

    OpenAIRE

    Luis Ángel Contreras Niño; Manuel González Montesinos; Erick Urías Luzanilla

    2009-01-01

    Se presentan resultados de un estudio evaluativo cuyo objetivo fue caracterizar mediante una rúbrica los escritos producidos por 3,151 niños y niñas mexicanos al egresar de la educación primaria en el estado de Baja California/MX. Se describe la rúbrica utilizada y los procedimientos para capacitar en su uso a 31 jueces especialistas en lenguaje, así como para estimar la confiabilidad de sus juicios sobre los escritos. Se describen también las puntuaciones, por nivel de logro, en cada uno de ...

  11. Desarrollo de un refuerzo Montante/Pilar A para automoción mediante nuevos procesos de conformado en caliente

    OpenAIRE

    Berto, Sébastien

    2009-01-01

    El proyecto tiene como objetivo el estudio de un refuerzo montante A, pieza estructural, fabricado mediante un nuevo proceso de conformado por soplado en caliente, y su posible integración en un coche. Esta pieza debería integrarse al nuevo modelo de Seat Leon, por eso se tendrá que definir conjuntamente con el área de Desarrollo Carrocería del Centro Técnico de SEAT y el proveedor Linde Wiemann una geometría tanto encajable, como fabricable. La elaboración y la evolución de...

  12. Generación de experiencias visuales en ciegos mediante estimulación táctil repetitiva

    OpenAIRE

    Tomás Ortiz; Santos, Juan M.

    2012-01-01

    Estudios recientes de nuestro laboratorio han establecido que se puede generar una activación estable del córtex visual en ciegos mediante entrenamiento táctil pasivo prolongado. Esta neuroplasticidad cortical se acompaña en un 40% de los participantes invidentes de sensaciones visuales, así como de una mayor rapidez en el reconocimiento táctil de información espacial tales como líneas, iconos o imágenes, y es crucial para su correcta interpretación. Estos hallazgos pueden ser útiles para el ...

  13. Optimización de la calidad de mallas de elementos finitos mediante cambios localizados de topología

    OpenAIRE

    2009-01-01

    Se presenta un método que mediante cambios localizados en la topología de una dada malla tridimensional de elementos finitos, logra mejorar la calidad de sus elementos, y en especial la de aquellos con volumen nulo o negativo. Se describirá el algoritmo general y se mencionarán algunos puntos importantes a tener en cuenta cuando la malla presenta estos elementos de volumen negativo. Por último se muestra el comportamiento del método al utilizarlo como optimizador de mallas ya generadas y s...

  14. Valorización de Biomasa de origen vegetal mediante procesos térmicos y termoquímicos.

    OpenAIRE

    López González, Diego

    2013-01-01

    En particular, esta Tesis Doctoral tiene como objetivo la evaluación de los principales procesos de conversión termoquímica de biomasa, principalmente pirólisis, combustión y gasificación, mediante el sistema experimental de termobalanza acoplada a un espectrómetro de masas. Adicionalmente, se estudió la degradación de fluidos de intercambio de calor en su aplicación en plantas termosolares de concentración. Los procesos de conversión termoquímica de biomasa son los procesos más interesan...

  15. Generación de experiencias visuales en ciegos mediante estimulación táctil repetitiva

    OpenAIRE

    Tomás Ortiz; Santos, Juan M

    2012-01-01

    Estudios recientes de nuestro laboratorio han establecido que se puede generar una activación estable del córtex visual en ciegos mediante entrenamiento táctil pasivo prolongado. Esta neuroplasticidad cortical se acompaña en un 40% de los participantes invidentes de sensaciones visuales, así como de una mayor rapidez en el reconocimiento táctil de información espacial tales como líneas, iconos o imágenes, y es crucial para su correcta interpretación. Estos hallazgos pueden ser útiles para el ...

  16. Fractura-luxación posterior de hombro tratada mediante la técnica de McLaughlin

    OpenAIRE

    Cubillo Martin, A.; Vicente Herrera, E.; Riquelme Arias, G.; Álvarez, C.; Rodriguez Álvarez, J.

    1996-01-01

    Se presenta un caso de luxación posterior de hombro, con fractura por impactación de la cabeza humeral, ocasionada por crisis convulsivas. Estas lesiones no son fáciles de reconocer en los primeros momentos, y en nuestro caso se precisó de un estudio radiográfico en distintas proyecciones y una TAC. Se realizó tratamiento quirúrgico mediante la técnica original de McLaughlin. A los 7 meses de la intervención el paciente ha recuperado casi totalmente la movilidad en dicho hombro...

  17. Producción de joyería fabricada mediante impresión 3D

    OpenAIRE

    GUILLÉN FERNÁNDEZ, ANA

    2015-01-01

    [ES] PRODUCCIÓN DE JOYERÍA DISEÑADA PARA SU IMPRESIÓN EN 3D [Es] Este proyecto trata sobre la fabricación directa de joyería mediante la impresión 3D con los materiales plásticos ABS y PLA. Se ha buscado una forma de utilizar el prototipo creado por la impresora como pieza definitiva, y para ello se han explorado diferentes posibilidades en colgantes, collares, pendientes, anillos, pulseras y broches. Las diferentes piezas se han diseñado con métodos digitales, utilizando el modelado 3D, e...

  18. Caracterización térmica del edificio 1C (UPV) mediante termografía infrarroja

    OpenAIRE

    GARCÍA MORATALLA, IRENE

    2014-01-01

    [es] Este Proyecto Fin de Grado pretende impulsar la utilización de la tecnología termográfica y evaluar la capacidad que posee esta técnica, no destructiva, para detectar y reconocer anomalías, defectos y lesiones en edificios. Se ha tratado de caracterizar un edificio dentro la Universidad Politécnica de Valencia mediante unas fichas que recogen distintos datos. Ante unos resultados positivos se ha llegado a la realización de un breve estudio analítico del modo en que varias empresas actual...

  19. Estudio numérico del problema geotérmico de Elder mediante FAHET : influencia del Rayleigh

    OpenAIRE

    Martínez Martínez, Valentín

    2014-01-01

    Los objetivos del presente Trabajo de investigación son los siguientes: 1. Describir los fundamentos teóricos que rigen los procesos de flujo de fluidos con transporte de calor. 2. Describir el estado del arte del problema de Elder. 3. Conocer y diseñar mediante FAHET los modelos de red con los que abordar el problema de Elder. 4. Experimentar las posibilidades del programa FAHET, así como el resto de programas en los que se apoya tanto para hallar la solución numérica del m...

  20. Un estudio acerca del desarrollo de videojuegos mediante el motor gráfico Unity 3D

    OpenAIRE

    Gil Romero, Eva

    2014-01-01

    El objetivo principal de este proyecto se centra en el estudio del desarrollo de videojuegos mediante el motor gráfico Unity 3D. Para ello, el proyecto aborda : i) la descripción de las funcionalidades y capacidades de cada una de las herramientas incluidas en el motor, ii)la descripción del papel que juega cada herramienta en el proceso de desarrollo de un videojuego y iii) el desarrollo de un pequeño prototipo de videojuego con este motor para ilustrar su utilización en este contexto.

  1. Eficacia del tratamiento de la cefalea tensional mediante técnicas neurodinámicas y de tejido blando

    OpenAIRE

    Ferragut Garcías, Alejandro

    2016-01-01

    Contexto. La cefalea tensional (CT) es una patología muy frecuente, cuya sintomatología causa un gran impacto social y económico. Sin embargo, la escasez de estudios de alta calidad hace que el desarrollo y eficacia de tratamientos no sean claros. Objetivos. Analizar la eficacia de un protocolo de tratamiento mediante técnicas de tejido blando y/o de técnicas neurodinámicas en pacientes con cefalea tensional. Material y métodos. Noventa y siete participantes de entre 19 y 60 años, co...

  2. Valorización de Biomasa de origen vegetal mediante procesos térmicos y termoquímicos.

    OpenAIRE

    López González, Diego

    2013-01-01

    En particular, esta Tesis Doctoral tiene como objetivo la evaluación de los principales procesos de conversión termoquímica de biomasa, principalmente pirólisis, combustión y gasificación, mediante el sistema experimental de termobalanza acoplada a un espectrómetro de masas. Adicionalmente, se estudió la degradación de fluidos de intercambio de calor en su aplicación en plantas termosolares de concentración. Los procesos de conversión termoquímica de biomasa son los procesos más interesan...

  3. OXIDACIÓN DE MATERIA ORGÁNICA PERSISTENTE EN AGUAS RESIDUALES INDUSTRIALES MEDIANTE TRATAMIENTOS ELECTROQUÍMICOS

    OpenAIRE

    Ivonne Linares-Hernández; Verónica Martínez-Miranda; Carlos Barrera-Díaz; Sergio Pavón-Romero; Lina Bernal-Martínez; Violeta Lugo-Lugo

    2011-01-01

    El objetivo de esta investigación fue implementar un sistema electroquímico, mediante tratamientos de electrocoagulación, empleando electrodos de hierro y oxidación anódica directa (OAD), empleando electrodos de diamante dopados con boro (DDB), para tratar aguas residuales provenientes de una planta de tratamiento que recibe las descargas de 144 empresas de diferentes giros, de la zona industrial Toluca-Lerma, México. Los resultados de estos tratamientos, indicaron una remoción del 99% de la ...

  4. Modificación superficial de materiales poliméricos mediante fuentes de plasma frío

    OpenAIRE

    Encinas García, Noemí

    2012-01-01

    Esta tesis contiene artículos de investigación en anexo. En la presente Tesis Doctoral se ha desarrollado un procedimiento adecuado para la mejora en las propiedades adhesivas de superficies poliméricas a través del incremento en capacidad de mojado de las mismas, mediante tratamiento con antorcha de plasma atmosférico trabajando con aire. Para ello, se evalúan las condiciones óptimas de tratamiento de las muestras en función de los parámetros de tiempo de exposición y distancia antorcha-m...

  5. Modelización automatica de problemas de redes de distribución mediante tecnología JAVA

    OpenAIRE

    Patricia Gómez García; Angel Cobo Ortega

    2002-01-01

    Esta comunicación presenta un programa informático desarrollado para el tratamiento gráfico de problemas de redes de distribución y su modelización de forma automática en los lenguajes de algunos de los programas de investigación operativa más conocidos y utilizados. El programa ha sido desarrollado utilizando el lenguaje de programación Java, por lo que puede ser utilizado a través de Internet. Mediante una interfase gráfica muy intuitiva, el usuario puede diseñar la red de transporte, ...

  6. Estudio del subsuelo mediante técnicas de prospección geofísica

    OpenAIRE

    PLAMADEALA, ARTIOM

    2016-01-01

    [ES] El presente trabajo consiste en la realización de una prospección geofísica en la Plaza de las Fuentes en el municipio Torrente. Se pretende buscar restos arqueológicos de la antigua muralla. Se requiere una técnica no invasiva, y por lo tanto se ha empleado el georradar. Plamadeala, A. (2016). Estudio del subsuelo mediante técnicas de prospección geofísica. http://hdl.handle.net/10251/70856. TFGM

  7. VGEAR : Sistema de adquisión de datos mediante OBD-II y bus ISO 14230

    OpenAIRE

    Zayas García, Daniel Javier

    2015-01-01

    Este proyecto consiste en la conexión al bus de diagnóstico ODB de una motocicleta Suzuki Intruder M800 mediante los estándares ISO 14230 e ISO 15031 obteniendo diferentes parámetros: velocidad, marcha y RPM del motor. Aquest projecte consisteix en la connexió al bus de diagnòstic ODB d'una motocicleta Suzuki Intruder M800 mitjançant els estàndards ISO 14230 i ISO 15031 obtenint diferents paràmetres: velocitat, marxa i RPM del motor. Bachelor thesis for the Telecommunication Technologie...

  8. Adquisición de una discriminación operante mediante observación en palomas

    OpenAIRE

    Javier Nieto; Rosalba Cabrera

    1993-01-01

    Se reportan los resultados de dos experimentos que fueron diseñados para evaluar si las palomas aprenden respuestas discriminadas mediante la observación de un modelo. En el primer experimento se utilizaron tres grupos de palomas observadoras. El grupo de Discriminación Sin Errores observó a un modelo responder ante el color positivo y recibir reforzamiento, y nunca responder ante el color negativo. El grupo Discriminación Con Errores observó que picar el color positivo era seguido d...

  9. Evaluación de la hipótesis de conectoma mediante pruebas neuropsicológicas

    OpenAIRE

    López Hernández, Beatriz

    2016-01-01

    Objetivos: Evaluar la sensibilidad de las pruebas neuropsicológicas para diferenciar patrones entre pacientes con epilepsia del lóbulo frontal (ELF) y pacientes con epilepsia del lóbulo temporal con esclerosis mesial (ELTM). Metodología: 60 pacientes epilépticos lesionales (30 con ELF y 30 con ELTM) fueron valorados mediante una completa batería neuropsicológica incluyendo pruebas habitualmente relacionadas con la memoria (subtest de la Escala de Memoria Wechsler- Revisada, Test de denominaci...

  10. Mejora de la biodisponibilidad nutricional mediante el proceso biotecnológico de germinación en Vigna unguiculata

    OpenAIRE

    Aguilera, Yolanda; Benitez, Vanesa; Jiménez, Tania; Calvo, Sara; Díaz, María Felicia; Martín-Cabrejas, María A.

    2011-01-01

    Existe gran parte de la población humana y animal que se encuentran en países en vía de desarrollo y sufren malnutrición proteica. La búsqueda de alimentos e ingredientes alternativos tanto para el hombre como para el ganado resulta esencial. El objetivo de este estudio fue evaluar la mejora de la biodisponibilidad nutricional mediante el proceso biotecnológico de germinación en Vigna unguiculata. Los resultados muestran que esta legumbre exhibe importantes niveles de proteínas (>27mg/100g) y...

  11. Tratamiento quirúrgico de las fracturas vertebrales mediante instrumentación segmentaria Cotrel-Dubousset

    OpenAIRE

    Martín Benlloch, Juan Antonio; Segura, F. (Félix); Soler Heredia, A.; Laguia, M.

    1993-01-01

    Los autores presentan su experiencia personal en el tratamiento quirúrgico de las fracturas vertebrales torácicas y lumbares. Han sido incluidos en el estudio 27 pacientes operados entre 1988 y 1991, todos ellos estabilizados mediante la instrumentación Cotrel Dubousset. Excepto tres pacientes, todos fueron intervenidos por vía posterior. Se realiza un estudio de los resultados obtenidos desde el punto de vista radiológico (índice sagital, porcentaje de ocupación de canal), fun...

  12. Estimación de la vulnerabilidad de acuíferos mediante un modelo cuantitativo ­ hydrus 1d

    OpenAIRE

    Ríos Rojas, Liliana; Vélez Otálvaro, María Victoria

    2009-01-01

    En el presente trabajo se efectúa una estimación y zonificación de la vulnerabilidad a la contaminación del agua subterránea del sector sur del acuífero del Valle del Cauca, mediante el modelo HYDRUS­1D que representa los fenómenos de flujo y transporte en la zona no saturada (ZNS). Se comparan los resultados con los obtenidos usando diferentes métodos de índice y superposición. También se simula un evento de contaminación usando el modelo Visual MODFLOW para la zona satura...

  13. Evaluación anatómica del piso de boca mediante resonancia magnética

    OpenAIRE

    Quispe Huarcaya, Magaly; Sovero Gaspar, Abell; Gutiérrez Ventura, Fredy

    2016-01-01

    El presente artículo de revisión fue realizado para reconocer las estructuras anatómicas del piso de boca mediante imágenes de resonancia magnética; esta es una de las regiones más delicadas de la cavidad oral, constituidasolamente por tejidos blandos, muchos de ellos vasculares, glandulares y nerviosos, carece de reparos anatómicos óseos siendo susceptible a patologías que deben ser diagnosticadas por el estomatólogo. Se considera a la resonancia magnética el estudio de elección para los tej...

  14. Catalizadores jerárquicamente organizados mediante nanodispersión por vía seca

    OpenAIRE

    Fernández Lozano, José Francisco; Rubio Marcos, Fernando; Calvino Casilda, Vanesa; Bañares González, Miguel Ángel

    2010-01-01

    La presente invención se refiere a un procedimiento para la obtención de catalizadores mediante nanodispersión y anclaje de nanopartículas o cluster nanoparticulados de tamaño inferior a 100 nm sobre soportes submicrónicos o micrométricos empleando un proceso de dispersión en vía seca de baja energía. Los catalizadores preparados a temperatura ambiente están caracterizados por presentar nuevas intercalas soporte-nanopartícula capaces de generar nuevas superficies react...

  15. Readaptación física en futbolistas mediante vibraciones mecánicas e hipoxia

    OpenAIRE

    Urdampilleta, A.; Álvarez-Herms, J.; Martínez-Sanz, J. M.; Corbi, F.; Roche, E

    2014-01-01

    Las acciones explosivas en el fútbol se triplican respecto a los años 60, llegando a las 200-215 acciones explosivas/partido. Esto supone que la potencia muscular y la capacidad de recuperación sean factores limitantes, pudiendo ser frecuentes las lesiones musculares. Durante la lesión se pierden las cualidades condicionales, menos cuanto más corto sea este periodo. Existen diversos métodos para la mejora de la fuerza y capacidad de recuperación mediante las plataformas vibratorias y la hipox...

  16. Representación de datos en metereología mediante gráficos animados: episodios de lluvia

    OpenAIRE

    Navarro, Jorge Luis

    1987-01-01

    Los campos escalares, bidimensionales y dependientes del tiempo, se representan generalmente en Meteorología mediante una sucesión de imágenes o análisis separados con una interdistancia temporal adecuada. Esta técnica alcanza su máximo desarrollo en lo que se conoce como gráfico animado. En el presente artículo se describen brevemente los procesos que, a partir de los datos, culminan con la generación de un análisis, imagen o fotograma, particularizando al caso de episodios de lluvia. Tra...

  17. Determinación de la conductividad térmica en nanohilos mediante efecto fotoacústico

    OpenAIRE

    Solís Martín, David

    2010-01-01

    El presente proyecto, tiene como objetivo el diseño e implementación de un sistema de instrumentación electrónico, capaz de determinar la conductividad térmica de nuevos materiales, mediante el efecto fotoacústico. La medición fotoacústica se enmarca dentro de los análisis no destructivos y presenta una clara ventaja en la medición de matrices nanoestructuradas dado que no precisa de contacto mecánico con la muestra. La celda fotoacústica desarrollada se ha optimizado acorde al objetivo de ha...

  18. Análisis de la demanda de transporte interinsular mediante modelos avanzados de elección discreta

    OpenAIRE

    Grisolía Santos, José María

    2006-01-01

    Programa de doctorado: Economía aplicada [ES]En esta tesis se analiza el transporte interurbano de pasajeros entre Gran Canaria y Tenerife mediante el diseño y aplicación de una encuesta de preferencias reveladas que permitió la obtención de 1011 observaciones. A partir de estos datos se estimaron diversos modelos de elección discreta que han permitido calcular el valor subjetivo del tiempo de los viajeros y de los diferentes tipos de viaje, así c...

  19. DISTRIBUCIÓN ESPACIAL DE LA TUBERCULOSIS EN ESPAÑA MEDIANTE MÉTODOS GEOESTADÍSTICOS

    OpenAIRE

    2009-01-01

    Fundamentos: La incidencia de tuberculosis (TB) se ha asociado a factores, epidemiológicos y sociales. En España, la TB es una enfermedad de declaración obligatoria e individualizada. Las tasas de TB respiratoria experimentan un descenso constante en los últimos años. El objetivo es valorar la asociación entre la morbilidad por TB respiratoria y variables socioeconómicas y epidemiológicas así como su distribución espacial mediante métodos geoestadísticos. Método: Las tasas de incidencia se...

  20. Simulación de sistemas Multi-Agente mediante un esquema Monte Carlo basado en ecuaciones diferenciales ordinarias

    OpenAIRE

    Zulueta Guerrero, Ekaitz; González González, Asier; Lopez Guede, José Manuel; Calvo Gordillo, Isidro

    2011-01-01

    [ES] En este trabajo se expone una metodología para modelar un sistema Multi-Agente (SMA), para que sea equivalente a un sistema de Ecuaciones Diferenciales Ordinarias (EDO), mediante un esquema basado en el método de Monte Carlo. Se muestra que el SMA puede describir con mayor riqueza modelos de sistemas dinámicos con variables cuantificadas discretas. Estos sistemas son muy acordes con los sistemas biológicos y fisiológicos, como el modelado de poblaciones o el modelado de enfermedades epid...

  1. Localización mediante SIG de zonas potencialmente truferas en la provincia de León

    OpenAIRE

    2008-01-01

    La trufa negra (Tuber melanosporum) es un hongo que forma una asociación mutualista con determinadas especies hospedadoras que determina beneficios para ambos, disponibilizando carbohidratos para el hongo y mejorando la nutrición del hospedador mediante un aumento en la absorción de elementos químicos del suelo. La aptitud del terreno para la producción trufera viene determinada por sus condiciones geológicas, edafológicas (textura y composición química), climáticas (precipitación y...

  2. Estudio nutricional de universitarios cordobeses mediante valoración antropométrica, bioquímica y alimentaria

    OpenAIRE

    León Fernández, María José

    2011-01-01

    Se ha valorado la situación nutricional de 85 universitarios de ambos sexos entre 18 y 35 años mediante el estudio de la ingesta, las medidas antropométricas y los indicadores hematológicos y de bioquímica sanguínea. Con este estudio se pretende conocer la situación del colectivo universitario para diseñar actuaciones en nutrición con la finalidad de mejorar el estado de salud y prevenir futuros problemas. Respecto a la valoración antropométrica destaca que en los varones hay mayores cifra...

  3. Refuerzo de puentes por cambio de esquema estructural: optimización mediante algoritmo genético

    OpenAIRE

    Valenzuela, Matías A.; Casas Rius, Joan Ramon

    2011-01-01

    La presente comunicación entrega un estudio detallado del proceso constructivo y de tesado para el refuerzo de puentes con tipología longitudinal de vigas continuas convirtiéndolos en puentes en arco atirantado (tipo network). Se presentan las etapas básicas propuestas en aspectos de construcción, se establecen las hipótesis del estudio de tesado e implementa el método de tesado a partir de la optimización automatizada mediante algoritmos genéticos, definiendo criterios como: variables de ...

  4. Evaluación del perfil de ácidos grasos de carne de vacuno mediante espectroscopia MIR

    OpenAIRE

    2015-01-01

    El objetivo de este trabajo de fin de carrera es la evaluación del perfil de ácidos grasos de la carne de vacuno, con especial atención a los de interés nutricional (ácido linoleico conjugado, CLA por sus siglas en inglés, y lino) en carne y grasa intramuscular de ternero frisón mediante espectroscopia de infrarrojo medio (MIR por sus siglas en inglés). Para la realización de este trabajo se han empleado muestras de 24 terneros frisones. Estas muestras se encuentras dividida...

  5. Medición de contaminación mediante UAV (Vehículo Aéreo no Tripulado)

    OpenAIRE

    Edwin José Vera-Rozo

    2016-01-01

    Este artículo presenta un procedimiento experimental cuyo objetivo es obtener la medición de contaminación en un relleno sanitario (basurero) mediante un Vehículo Aéreo no Tripulado (UAV); La metodología utilizada consistió en realizar un procedimiento detallado para la instrumentación de UAV, el cual fue equipamiento con un sistema para la captura y almacenamiento de datos referente a las variables medidas en tiempo real, el cual posteriormente se puso en vuelo y luego se realizo el procesam...

  6. Tratamiento de las osteitis diafisarias de tibia mediante sinostosis tibioperonea y resección ósea

    OpenAIRE

    Fernández Sabaté, Alfons; Riu Labrador, R.; Moreta Munujos, D.; Cáceres Palou, Enrique

    1984-01-01

    El tratamiento de las osteítis crónicas de la diáfisis tibial obliga a menudo a practicar una amplia resección para alcanzar el tejido óseo sano y esta exigencia operatoria debilita la diáfisis. Para obviar la fractura operatoria o posterior por fatiga y para facilitar la resección sin temor se ha utilizado una táctica quirúrgica consistente en una solidarización tibioperonea que construye un residente eje en la pierna ya sea mediante injerto intertibioperoneo ya con peroné protibia de Zanoli...

  7. Tratamiento de las osteitis diafisarias de tibia mediante sinostosis tibioperonea y resección ósea

    OpenAIRE

    Fernández Sabaté, Alfons; Riu Labrador, R.; Moreta Munujos, D.; Cáceres Palou, Enrique

    1984-01-01

    El tratamiento de las osteítis crónicas de la diáfisis tibial obliga a menudo a practicar una amplia resección para alcanzar el tejido óseo sano y esta exigencia operatoria debilita la diáfisis. Para obviar la fractura operatoria o posterior por fatiga y para facilitar la resección sin temor se ha utilizado una táctica quirúrgica consistente en una solidarización tibioperonea que construye un residente eje en la pierna ya sea mediante injerto intertibioperoneo ya con peroné protibia de Zanoli...

  8. Reconstrucción dentoalveolar con implantes dentales mediante la técnica de levantamiento de seno maxilar

    OpenAIRE

    Granados Páucar, Luis; Ikeda Artacho, María Cristina; Sueldo Gálvez, Luis

    2015-01-01

    La colocación de implantes en el sector posterosuperior con frecuencia debe enfrentar casos de atrofi a de rebordemaxilar y neumatización del seno maxilar, para los cuales una de las técnicas hoy en día empleada es la elevacióndel piso del seno maxilar mediante el aumento vertical del piso antral. Se reporta el caso de un paciente femeninode 60 años con exodoncias previas, diagnóstico de edentulismo parcial bimaxilar y neumatización del senomaxilar derecho. Se realizó como tratamiento el leva...

  9. Analysis on the Factors Affecting PCR-SSCP%影响PCR-SSCP的因素分析

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    姜运良; 李宁; 赵兴波; 吴常信

    2000-01-01

    PCR-SSCP是一种基于PCR的单链构象多态性(single-stranded conformation polymorphism)分析技术,是DNA已知突变的检测或未知变异分析中十分常用和实用的技术之一.本研究从非变性聚丙烯酰胺凝胶的配制、样品的变性处理、电泳条件、显色方法和结果分析等方面对影响PCR-SSCP实验室操作的因素进行了分析,并结合作者的经验给出了大小在100~200 bp 范围以内的DNA片段进行SSCP分析的操作程序:凝胶浓度为10 %~15 %,98℃变性5~10 min,4℃条件下5 W过夜电泳,银染法染色.

  10. Transient neonatal diabetes mellitus with macroglossia diagnosed by methylation specific PCR (MS-PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Hye Young Jin

    2010-03-01

    Full Text Available Transient neonatal diabetes mellitus (TNDM has been associated with paternal uniparental isodisomy of chromosome 6, paternally inherited duplication of 6q24, or a methylation defect at a CpG island of the ZAC or HYMAI gene. We experienced a case of TNDM in which the patient presented with hyperglycemia, macroglossia, and intrauterine growth retardation, caused by a paternally derived HYMAI. An 18-day-old female infant was admitted to the hospital because of macroglossia and recurrent hyperglycemia. In addition to the macroglossia, she also presented with large fontanelles, micrognathia, and prominent eyes. Serum glucose levels were 200&#8211;300 mg/dL and they improved spontaneously 2 days after admission. To identify the presence of a maternal methylated allele, bisulfite-treated genomic DNA from peripheral blood was prepared and digested with BssHII after polymerase chain reaction (PCR amplification with methylation-specific HYMAI primers. PCR and restriction fragment length polymorphism analysis showed that the patient had only the paternal origin of the HYMA1 gene. TNDM is associated with a methylation defect in chromosome 6, suggesting that an imprinted gene on chromosome 6 is responsible for this phenotype.

  11. How good is a PCR efficiency estimate: Recommendations for precise and robust qPCR efficiency assessments

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    David Svec

    2015-03-01

    Full Text Available We have examined the imprecision in the estimation of PCR efficiency by means of standard curves based on strategic experimental design with large number of technical replicates. In particular, how robust this estimation is in terms of a commonly varying factors: the instrument used, the number of technical replicates performed and the effect of the volume transferred throughout the dilution series. We used six different qPCR instruments, we performed 1–16 qPCR replicates per concentration and we tested 2–10 μl volume of analyte transferred, respectively. We find that the estimated PCR efficiency varies significantly across different instruments. Using a Monte Carlo approach, we find the uncertainty in the PCR efficiency estimation may be as large as 42.5% (95% CI if standard curve with only one qPCR replicate is used in 16 different plates. Based on our investigation we propose recommendations for the precise estimation of PCR efficiency: (1 one robust standard curve with at least 3–4 qPCR replicates at each concentration shall be generated, (2 the efficiency is instrument dependent, but reproducibly stable on one platform, and (3 using a larger volume when constructing serial dilution series reduces sampling error and enables calibration across a wider dynamic range.

  12. RNase H-dependent PCR (rhPCR: improved specificity and single nucleotide polymorphism detection using blocked cleavable primers

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Powers Kristy M

    2011-08-01

    Full Text Available Abstract Background The polymerase chain reaction (PCR is commonly used to detect the presence of nucleic acid sequences both in research and diagnostic settings. While high specificity is often achieved, biological requirements sometimes necessitate that primers are placed in suboptimal locations which lead to problems with the formation of primer dimers and/or misamplification of homologous sequences. Results Pyrococcus abyssi (P.a. RNase H2 was used to enable PCR to be performed using blocked primers containing a single ribonucleotide residue which are activated via cleavage by the enzyme (rhPCR. Cleavage occurs 5'-to the RNA base following primer hybridization to the target DNA. The requirement of the primer to first hybridize with the target sequence to gain activity eliminates the formation of primer-dimers and greatly reduces misamplification of closely related sequences. Mismatches near the scissile linkage decrease the efficiency of cleavage by RNase H2, further increasing the specificity of the assay. When applied to the detection of single nucleotide polymorphisms (SNPs, rhPCR was found to be far more sensitive than standard allele-specific PCR. In general, the best discrimination occurs when the mismatch is placed at the RNA:DNA base pair. Conclusion rhPCR eliminates the formation of primer dimers and markedly improves the specificity of PCR with respect to off-target amplification. These advantages of the assay should find utility in challenging qPCR applications such as genotyping, high level multiplex assays and rare allele detection.

  13. Is real-time polymerase chain reaction (PCR) more useful than a conventional PCR for the clinical management of leishmaniasis?

    Science.gov (United States)

    Antinori, Spinello; Calattini, Sara; Piolini, Roberta; Longhi, Erika; Bestetti, Giovanna; Cascio, Antonio; Parravicini, Carlo; Corbellino, Mario

    2009-07-01

    It is currently unknown if the use of a real-time polymerase chain reaction (PCR) adds value to the diagnosis and follow-up prognosis of patients affected by leishmaniasis. We performed a study using a real-time PCR directed against the alpha-polymerase gene and a semiquantitative PCR that target the SSU ribosomal RNA (rRNA) gene as control for the diagnosis and quantification of parasites in patients with visceral (VL) and cutaneous (CL) leishmaniasis. Our single copy real-time PCR missed one diagnosis of VL compared with the conventional PCR, whereas both PCR methods were able to detect Leishmania parasites in CL. Under anti-leishmania treatment the kinetics of parasitemia were comparable with the two methods. The real-time PCR directed against alpha-polymerase of Leishmania despite being able to make a more accurate quantification of parasites does not add to the decision-making management compared with a semiquantitative PCR, and it is comparatively expensive.

  14. Critical appraisal of quantitative PCR results in colorectal cancer research: Can we rely on published qPCR results?

    NARCIS (Netherlands)

    Dijkstra, J.R.; Kempen, L.C.L.T. van; Nagtegaal, I.D.; Bustin, S.A.

    2014-01-01

    The use of real-time quantitative polymerase chain reaction (qPCR) in cancer research has become ubiquitous. The relative simplicity of qPCR experiments, which deliver fast and cost-effective results, means that each year an increasing number of papers utilizing this technique are being published. B

  15. Determinación del umbral de detección de Pseudococcus viburni (Hemiptera: Pseudococcidae por PCR Determination of the detection threshold of Pseudococcus viburni (Hemiptera: Pseudococcidae by PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Diana Vera

    2012-06-01

    Full Text Available La cochinilla harinosa de los frutales Pseudococcus viburni (Signoret es una plaga cuarentenaria, presente en el Alto Valle de Río Negro y Neuquén, Argentina. Su detección durante la fiscalización aduanera, aun en los estados inmaduros, provoca rechazos de la fruta fresca argentina con destino a los mercados internacionales. Las técnicas actuales de identificación de pseudocóccidos y otros cocoideos implican la realización de preparados microscópicos que requieren varios días. Por esto, la disminución de los tiempos de identificación es importante sobre todo en las tareas de fiscalización. En este trabajo, se determinó el umbral de detección específica de P. viburni mediante PCR, como así también, la implementación de un método rápido de extracción de ADN mediante DNAzolT. Insectos de diferentes estados de desarrollo (huevo, ninfas (tres estados ninfales y adulto, conservados en etanol pro análisis a -20 ºC, provenientes de montes frutales del Alto Valle, Argentina, fueron procesados según el protocolo del fabricante y se logró obtener ADN de buena calidad y concentración. Una alícuota del mismo fue utilizado como templado para una reacción de PCR usando primers específicos para P. viburni, registrados en bibliografía y como control positivo ADN de P. viburni de colección entomológica. Los primers utilizados y sus secuencias son A4 (5'-cccgcggccgttctctcttt-3' y A5 (5'-atatgttgtgcatagttgtgtgtgcgc-3', diseñados por Beuning et al. (1999. La amplificación generó una banda de peso molecular esperado de 650 pb. en gel de agarosa al 1.5% en todos los estadios, se determinó como límite de detección el estado de huevo. Esta técnica constituye una detección específica de P. viburni en un lapso máximo de 48 h.The obscure mealybug Pseudococcus viburni (Signoret is a quarantine pest present in the Upper Valley of Río Negro and Neuquén, Argentina. The detection of any growth stage of the mealybug in quarantine

  16. Comparison of PCR-DGGE and Nested-PCR-DGGE Approach for Ammonia Oxidizers Monitoring in Membrane Bioreactors’ Activated Sludge

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ziembińska-Buczyńska Aleksandra

    2014-12-01

    Full Text Available Nitritation, the first stage of ammonia removal process is known to be limiting for total process performance. Ammonia oxidizing bacteria (AOB which perform this process are obligatory activated sludge habitants, a mixture consisting of Bacteria, Protozoa and Metazoa used for biological wastewater treatment. Due to this fact they are an interesting bacterial group, from both the technological and ecological point of view. AOB changeability and biodiversity analyses both in wastewater treatment plants and lab-scale reactors are performed on the basis of 16S rRNA gene sequences using PCR-DGGE (Polymerase Chain Reaction – Denaturing Gradient Gel Electrophoresis as a molecular biology tool. AOB researches are usually led with nested PCR. Because the application of nested PCR is laborious and time consuming, we have attempted to check the possibility of using only first PCR round to obtain DGGE fingerprinting of microbial communities. In this work we are comparing the nested and non-nested PCR-DGGE monitoring of an AOB community and presenting advantages and disadvantages of both methods used. The experiment revealed that PCR technique is a very sensitive tool for the amplification of even a minute amount of DNA sample. But in the case of nested-PCR, the sensitivity is higher and the template amount could be even smaller. The nested PCR-DGGE seems to be a better tool for AOB community monitoring and complexity research in activated sludge, despite shorter fragments of DNA amplification which seems to be a disadvantage in the case of bacteria identification. It is recommended that the sort of analysis approach should be chosen according to the aim of the study: nested-PCR-DGGE for community complexity analysis, while PCR-DGGE for identification of the dominant bacteria.

  17. Estudio del crecimiento de Prioria copaifera (Caesalpinaceae mediante técnicas dendrocronológicas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jorge Andrés Giraldo Jiménez

    2011-12-01

    Full Text Available El cativo (Prioria copaifera G. forma bosques dominados por la especie llamados cativales. Durante más de 70 años el cativo ha sido la base principal de la industria maderera en el Darién colombiano, siendo, por su alta productividad y dominancia uno de los bosques tropicales más fáciles de ordenar sosteniblemente. El propósito de esta investigación es modelar el crecimiento del diámetro y el volumen del cativo en función de la edad así como las tasas instantáneas, medias y relativas, empleando anillos de crecimiento. La anualidad de los anillos se demostró usando el efecto de las bombas nucleares y mediante cofechado. Con base en los anillos de crecimiento radiales se modelo el crecimiento del diámetro y del volumen. Esta especie alcanza 40cm de diámetro en 90 años y presenta crecimiento medio de 0.31cm/año. El lapso vital de la especie es de aproximadamente 614 años. El incremento corriente anual máximo del volumen a los 90 años es 0.033m3/año, e iguala al incremento medio a los 145 años con 0.018m3/año. La tasa media de crecimiento absoluta es 0.021m3/año. Los resultados aquí obtenidos sirven como base técnica para el manejo sostenible de los cativales.A growth study of Prioria copaifera (Caesalpinaceae using dendrochronological techniques. The Cativo (Prioria copaifera forms very homogeneous forests called cativales in the flooded plains of some rivers from Costa Rica to Colombia. For over 70 years Cativo has been the main base of the timber industry in the Colombian Darien area. Because of high productivity and high-dominance of Cativo trees, they represent one of the most prone tropical forests for sustainable forest management. The objective of this research is to model diameter and timber volume growth and growth rates (absolute, mean and relative of Cativo as a function of age, using tree ring data derived from dendrochronologycal techniques. We evaluated the annual nature of the tree rings by radiocarbon

  18. Corte mediante láser de elementos estructurales de mullita-alúmina

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Quintero, F.

    2006-04-01

    Full Text Available The application of high power lasers for cutting of structural ceramics is a process under development exhibiting great advantages in comparison with conventional machining techniques. However, an in depth analysis of the process is necessary before its industrial implementation in order to avoid eventual drawbacks and to optimize the results. The most relevant results from the study of laser cutting of structural elements composed of a mullite matrix with a dispersed phase of alumina are presented in this work. The results obtained employing a CO2 laser operated in CW mode are compared with those obtained using a free-running Nd:YAG in pulsed mode. In both cases, the effect of the operation parameters with stronger influence on the cut quality is analyzed. At the same time, the application of a conventional cutting head is compared with a new one specifically designed to optimize the cut quality. Several quantifiable parameters were employed to characterize the quality of the cuts with the aim of performing a systematic assessment of the results which allows the optimization of the process. The results obtained show a clear improvement of the cut quality as the new cutting head is employed.

    La aplicación del láser de alta potencia para el corte de cerámicas estructurales es un proceso en desarrollo que ofrece excepcionales ventajas en comparación con las técnicas convencionales de mecanizado. Sin embargo, como paso previo a su implementación industrial se hace necesario realizar un análisis profundo del proceso que permita evitar los eventuales inconvenientes y optimizar los resultados. En este trabajo se presentan los resultados más relevantes del estudio del corte mediante láser de elementos estructurales compuestos de una matriz de mullita con una fase dispersa de alúmina. Se comparan los resultados obtenidos al emplear un láser de CO2 operado en modo continuo con los correspondientes a la utilización de un láser de Nd

  19. Falácia naturalista e naturalismo moral: do é ao deve mediante o quero

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Adriano Naves de Brito

    2010-06-01

    Full Text Available O objetivo deste texto é discutir alguns argumentos contra a aceitação da falácia naturalista. Pretende-se mostrar aspectos que parecem corretos na argumentação dos que recusam aquela falácia, e, a despeito de seus acertos, demonstrar que estão fundamentalmente errados. O eixo para este desfecho é a reformulação da falácia em termos da recusa da implicação entre o ser e o querer. Espera-se, assim, tornar mais claras as relações - e a ausência delas - entre verdade e moral, bem como abrir espaço para a defesa de um naturalismo moral não comprometido com a existência de fatos morais. Este texto está dividido em cinco partes. Na primeira, apresenta-se a falácia naturalista de acordo com Moore; na segunda, distingue-se essa entre as formulações de Moore e de Hume; na terceira, apresentam-se objeções à interdição da passagem do "é" ao "deve" e se formulam respostas a essas objeções; na quarta, reapresenta-se o problema da interdição entre "é" e "deve" e se focaliza uma solução alternativa a ele mediante o querer; e, finalmente, na quinta parte, elaboram-se algumas conclusões acerca do naturalismo e do realismo na moral.This article aims to discuss some arguments against the acceptance of the naturalistic fallacy. It intends to demonstrate that some aspects, which seem to be correct in the argumentation of those who refuse that fallacy, are, despite their pertinence in some points, fundamentally imprecise. In order to reach this outcome, the fallacy is reformulated in terms of the refuse of the implication between "being" and "the will". Therefore, it pretends to clarify the relations - and their absence - between truth and morality as well as enable a defense of a moral naturalism disengaged from the existence of moral facts. This text is divided in five parts. In the first one, I show the naturalistic fallacy according to Moore; in the second part, a distinction between Moore's and Hume's formulations of the

  20. Tribología de recubrimientos Cermet/NiCrBSi depositados mediante HVOF

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Guilemany, J. M.

    2004-04-01

    Full Text Available This work consists on a deep tribological study of the WX system composed by a mechanical blend in different compositions of NiCrBSi and WC-12Co powders: 20% NiCrBSi (W2, 40% NiCrBSi (W4 y 60% NiCrBSi (W6. The coatings have been obtained by high velocity oxy-fuel process (HVOF. The measurements made by Ball-On-Disk test are: the friction coefficient is lower than 0.5 and the exchanged energy between the counterparts is under 10 KJ. To quantify the friction wear rate, the volume loss and the track depth, Scanning White Light Interferometry and SEM have been used. The track depth is proportional to the amount of NiCrBSi. A higher percentage of WC-12Co increases the friction wear resistance and decreases the abrasion wear rate (Rubber Wheel test. In all the coatings studied, no diffusion processes are found between the mixed phases, the adhesion between the coatings and the substrate is excellent, the porosity level is below 2% and an increase of microhardness of the coating due to a strengthening of the matrix produced by impacts of solid particles, takes place.

    El trabajo consta de un completo estudio tribológico del sistema WX que consiste en la mezcla mecánica de WC-12Co y NiCrBSi en diferentes proporciones: 20% NiCrBSi (W2, 40% NiCrBSi (W4 y 60% NiCrBSi (W6. Los recubrimientos se han obtenido por proyección térmica de alta velocidad (HVOF. Para todos los sistemas, el coeficiente de fricción es menor que 0.5 y la energía intercambiada entre el par friccionante y el recubrimiento es inferior a 10 KJ. Para cuantificar el desgaste por fricción se han utilizado la profundidad de la huella y el volumen perdido durante el ensayo, obtenidos mediante Interferometría de Barrido de Luz Blanca (SLWI y SEM. La profundidad de la huella sigue una evolución directamente proporcional al contenido en NiCrBSi. Un mayor contenido en WC-12Co aumenta la resistencia al desgaste por fricción y disminuye la velocidad de desgaste por abrasión (ensayo

  1. RT-PCR Protocols - Methods in Molecular Biology

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Manuela Monti

    2011-03-01

    Full Text Available “The first record I have of it, is when I made a computer file which I usually did whenever I had an idea, that would have been on the Monday when I got back, and I called it Chain Reaction.POL, meaning polymerase. That was the identifier for it and later I called the thing the Polymerase Chain Reaction, which a lot of people thought was a dumb name for it, but it stuck, and it became PCR”. With these words the Nobel prize winner, Kary Mullis, explains how he named the PCR: one of the most important techniques ever invented and currently used in molecular biology. This book “RT-PCR Protocols” covers a wide range of aspects important for the setting of a PCR experiment for both beginners and advanced users. In my opinion the book is very well structured in three different sections. The first one describes the different technologies now available, like competitive RT-PCR, nested RT-PCR or RT-PCR for cloning. An important part regards the usage of PCR in single cell mouse embryos, stressing how important...........

  2. Shape based kinetic outlier detection in real-time PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    D'Atri Mario

    2010-04-01

    Full Text Available Abstract Background Real-time PCR has recently become the technique of choice for absolute and relative nucleic acid quantification. The gold standard quantification method in real-time PCR assumes that the compared samples have similar PCR efficiency. However, many factors present in biological samples affect PCR kinetic, confounding quantification analysis. In this work we propose a new strategy to detect outlier samples, called SOD. Results Richards function was fitted on fluorescence readings to parameterize the amplification curves. There was not a significant correlation between calculated amplification parameters (plateau, slope and y-coordinate of the inflection point and the Log of input DNA demonstrating that this approach can be used to achieve a "fingerprint" for each amplification curve. To identify the outlier runs, the calculated parameters of each unknown sample were compared to those of the standard samples. When a significant underestimation of starting DNA molecules was found, due to the presence of biological inhibitors such as tannic acid, IgG or quercitin, SOD efficiently marked these amplification profiles as outliers. SOD was subsequently compared with KOD, the current approach based on PCR efficiency estimation. The data obtained showed that SOD was more sensitive than KOD, whereas SOD and KOD were equally specific. Conclusion Our results demonstrated, for the first time, that outlier detection can be based on amplification shape instead of PCR efficiency. SOD represents an improvement in real-time PCR analysis because it decreases the variance of data thus increasing the reliability of quantification.

  3. Prenatal toxoplasmosis diagnosis from amniotic fluid by PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Vidigal Paula Vieira Teixeira

    2002-01-01

    Full Text Available Toxoplasmosis is one of the most common infections all over the world. Most cases are asymptomatic, except in immunosuppressed individuals and fetuses, which can be seriously damaged. Prenatal diagnosis should be made as soon as possible since treatment of the mother can minimize fetal sequelae. Our aim in this study was to test the polymerase chain reaction technique (PCR in 86 samples of amniotic fluid from women who seroconverted during pregnancy. DNA was amplified using external primers and, in a second step, internal primers, in a nested PCR system. Samples were also inoculated into mice and the newborn were evaluated by T. gondii serology, skull x-ray, transfontanel ultrasound, fundoscopic examination, lumbar puncture and clinical examination. PCR was positive in seven cases and negative in 79. Among PCR-positive cases, two were negative by inoculation into mice and by clinical evaluation; among PCR-negative ones, three had clinical evidence of toxoplasmosis and one was positive after inoculation into mice. PCR showed values of sensitivity = 62.5% and specificity = 97.4%; the values of inoculation into mice where 42.9% and 100%, respectively. Although PCR should not be used alone for prenatal diagnosis of congenital toxoplasmosis, it is a promising method and deserves more studies to improve its efficacy.

  4. Interaction of quantitative PCR components with polymeric surfaces.

    Science.gov (United States)

    Gonzalez, Asensio; Grimes, Ronan; Walsh, Edmond J; Dalton, Tara; Davies, Mark

    2007-04-01

    This study investigated the effect of exposing a polymerase chain reaction (PCR) mixture to capillary tubing of different materials and lengths, at different contact times and flow rates and the adsorption of major reaction components into the tubing wall. Using 0.5 mm ID tubing, lengths of 40 cm and residence times up to 45 min, none of the tested polymeric materials was found to affect subsequent PCR amplification. However, after exposure of the mixture to tubing lengths of 3 m or reduction of sample volume, PCR inhibition occurred, increasing with the volume to length ratio. Different flow velocities did not affect PCR yield. When the adsorption of individual PCR components was studied, significant DNA adsorption and even more significant adsorption of the fluorescent dye Sybr Green I was found. The results indicate that PCR inhibition in polymeric tubing results from adsorption of reaction components to wall surfaces, increasing substantially with tubing length or sample volume reduction, but not with contact time or flow velocities typical in dynamic PCR amplification. The data also highlight that chemical compatibility of polymeric capillaries with DNA dyes should be carefully considered for the design of quantitative microfluidic devices.

  5. Rapid and simple method of qPCR primer design.

    Science.gov (United States)

    Thornton, Brenda; Basu, Chhandak

    2015-01-01

    Quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) is a powerful tool for analysis and quantification of gene expression. It is advantageous compared to traditional gel-based method of PCR, as gene expression can be visualized "real-time" using a computer. In qPCR, a reporter dye system is used which intercalates with DNA's region of interest and detects DNA amplification. Some of the popular reporter systems used in qPCR are the following: Molecular Beacon(®), SYBR Green(®), and Taqman(®). However, success of qPCR depends on the optimal primers used. Some of the considerations for primer design are the following: GC content, primer self-dimer, or secondary structure formation. Freely available software could be used for ideal qPCR primer design. Here we have shown how to use some freely available web-based software programs (such as Primerquest(®), Unafold(®), and Beacon designer(®)) to design qPCR primers.

  6. Development of a PCR test to diagnose Haemophilus parasuis infections.

    Science.gov (United States)

    Oliveira, S; Galina, L; Pijoan, C

    2001-11-01

    A polymerase chain reaction (PCR) test was developed in order to improve the accuracy and speed of diagnosis of Haemophilus parasuis, an economically important respiratory pathogen that affects swine. The gene sequence of the 16S small subunit ribosomal RNA of H. parasuis (GenBank M75065) was compared with 56 16S sequences of related bacteria, including those frequently isolated from pig tissues. Two species-specific primers were designed: HPS forward and HPS reverse. The predicted size of the amplified PCR product was 821 bp. The PCR test could detect a minimum of 102 bacteria and 0.69 pg of DNA. Thirty-one H. parasuis isolates, including 12 different serovars and 19 field isolates, were positive using the PCR test. No amplification was observed when the test was run using DNA from 15 other bacterial species commonly isolated from swine tissues. A weak band was observed when the PCR test was performed using Actinobacillus indolicus DNA as template. Clinical samples tested by PCR included tissues and swabs from 5 animals naturally infected with H. parasuis and 1 experimentally infected animal. The PCR was positive in 26 of 30 clinical samples. Four samples showed weak bands, and these results were not considered positive. Haemophilus parasuis was isolated from 18 of 30 of these samples. Tissues from specific pathogen-free (SPF) pigs and from unrelated species were negative for H. parasuis isolation and PCR. The developed PCR was successfully used in the diagnosis of H. parasuis infection, especially when compared with traditional microbiology techniques.

  7. A multiplex PCR for detection of six viruses in ducks.

    Science.gov (United States)

    Wang, Yongjuan; Zhu, Shanyuan; Hong, Weiming; Wang, Anping; Zuo, Weiyong

    2017-10-01

    In this study, six pairs of specific primers that can amplify DNA fragments of different sizes were designed and synthesized according to viral protein gene sequences published in GenBank. Then, a multiplex PCR method was established for rapid detection of duck hepatitis virus 1, duck plague virus, duck Tembusu virus, muscovy duck parvovirus, muscovy duck reovirus, and duck H9N2 avian influenza virus, and achieve simple and rapid detection of viral diseases in ducks. Single PCR was used to confirm primer specificity, and PCR conditions were optimized to construct a multiplex PCR system. Specificity and sensitivity assays were also developed. The multiplex PCR was used to detect duck embryos infected with mixed viruses and those with clinically suspected diseases to verify the feasibility of the multiplex PCR. Results show that the primers can specifically amplify target fragments, without any cross-amplification with other viruses. The multiplex PCR system can amplify six DNA fragments from the pooled viral genomes and specifically detect nucleic acids of the six duck susceptible viruses when the template amount is 10(2) copies/μl. In addition, the system can be used to detect viral nucleic acids in duck embryos infected with the six common viruses. The detection results for clinical samples are consistent with those detected by single PCR. Therefore, the established multiplex PCR method can perform specific, sensitive, and high-throughput detection of six duck-infecting viruses and can be applied to clinical identification and diagnosis of viral infection in ducks. Copyright © 2017. Published by Elsevier B.V.

  8. Buoyancy-Driven Polymerase Chain Reaction (PCR) Devices

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Ness, K D; Wheeler, E K; Benett, W; Stratton, P; Christian, A; Chen, A; Ortega, J; Weisgraber, T H; Goodson, K E

    2004-09-28

    Polymerase chain reaction (PCR) facilitates DNA detection by significantly increasing the concentration of specific DNA segments. A new class of PCR instruments uses a buoyancy-driven re-circulating flow to thermally cycle the DNA sample and benefits from reduced cycle times, low sample volumes, a miniaturized format, and low power consumption. This paper analyzes a specific buoyancy PCR device in a micro-channel ''race-track'' geometry to determine key parameters about PCR cycle times and other figures of merit as functions of device dimensions. The 1-D model balances the buoyancy driving force with frictional losses. A hydrostatic pressure imbalance concept is used between the left and right sides of the fluid loop to calculate the buoyancy driving force. Velocity and temperature distributions within the channels are determined from two-dimensional analysis of the channel section, with developing region effects included empirically through scaled values of the local Nusselt number. Good agreement between four independent verification steps validate the 1-D simulation approach: (1) analytical expressions for the thermal entrance length are compared against, (2) comparison with a full 3-D finite element simulation, (3) comparison with an experimental flow field characterization, and (4) calculation of the minimum PCR runtime required to get a positive PCR signal from the buoyancy-driven PCR device. The 1-D approach closely models an actual buoyancy-driven PCR device and can further be used as a rapid design tool to simulate buoyancy PCR flows and perform detailed design optimizations studies.

  9. Development and Validation of a HPV-32 Specific PCR Assay

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Leigh Janet

    2009-06-01

    Full Text Available Abstract Background Human Papillomavirus-32 (HPV-32 has traditionally been associated with focal-epithelial-hyperplasia (FEH. It is also present in 58% of oral warts of HIV-positive individuals whose prevalence is increasing. Current methods for the detection of HPV-32 are labor-intensive and insensitive so the goal of this work was to develop a highly sensitive and easy to use specific polymerase chain reaction (PCR assay. Materials and methods An HPV-32 L1 specific PCR assay was developed and optimized. The sensitivity and specificity was compared to previous assays utilized for detection (PGMY and MY09/11 PCR with dot blot hybridization using cloned HPV-32 L1, the closely related HPV-42 L1 as well as clinical samples (oral swabs and fluids from 89 HIV-positive subjects. Results The HPV-32 specific PCR assay showed improved sensitivity to 5 copies of HPV-32 as compared to the PGMY PCR, MY09/11 PCR and dot blot which had a limit of detection of approximately 3,000 copies. Using the HPV-32 dot blot hybridization assay as the gold standard, the HPV-32 specific PCR assay has a sensitivity of 95.8% and 88.9% by sample and subject, respectively, and specificity was 87.8% and 58.8% by sample and subject, respectively. The low sensitivity is due to the HPV-32 specific PCR assays ability to detect more HPV-32 positive samples and may be the new gold standard. Conclusion Due to the ease, sensitivity, and specificity the HPV-32 specific PCR assay is superior to previous assays and is ideal for detection of HPV-32 in large cohorts. This assay provides an excellent tool to study the natural history of HPV-32 infection and the development of oral warts.

  10. Identification and quantification of ice nucleation active microorganisms by digital droplet PCR (ddPCR)

    Science.gov (United States)

    Linden, Martin; Pöschl, Ulrich; Fröhlich-Nowoisky, Janine

    2015-04-01

    Several bioaerosol types, including bacteria, fungi, pollen and lichen, have been identified as sources of biological ice nucleators (IN) which induce ice formation already at temperatures as high as -10 °C or above. Accordingly, they potentially contribute widely to environmental ice nucleation in the atmosphere and are of great interest in the study of natural heterogenous ice nucleation processes. Ice nucleation active microorganisms have been found and studied among bacteria (Proteobacteria) and fungi (phyla Basidiomycota and Ascomycota). The mechanisms enabling the microorganisms to ice nucleation are subject to ongoing research. While it has been demonstrated that whole cells can act as ice nucleators in the case of bacteria due to the presence of specific membrane proteins, cell-free ice nucleation active particles seem to be responsible for this phenomenon in fungi and lichen. The identification and quantification of these ice nucleation active microorganisms and their IN in atmospheric samples is crucial to understand their contribution to the pool of atmospheric IN. This is not a trivial task since the respective microorganisms are often prevalent in lowest concentrations and a variety of states, be it viable cells, spores or cell debris from dead cells. Molecular biology provides tools to identify and quantify ice nucleation active microorganisms independent of their state by detecting genetic markers specific for the organism of interest. Those methods are not without their drawbacks in terms of sample material concentration required or reliable standardization. Digital Droplet Polymerase Chain Reaction (ddPCR) was chosen for our demands as a more elegant, quick and specific method in the investigation of ice nucleation active microorganisms in atmospheric samples. The advantages of ddPCR lie in the simultaneous detection and quantification of genetic markers and their original copy numbers in a sample. This is facilitated by the fractionation of the

  11. Modificación de la personalidad mediante una terapia cognitivo-conductual de afrontamiento al estrés

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Julia Linares-Ortiz

    2014-01-01

    Full Text Available El objetivo de este estudio ha sido comprobar la posibilidad de modulación de variables de personalidad (tales como algunos de los Cinco Grandes Factores, o la personalidad resistente a través de la aplicación de un programa de afrontamiento del estrés. Para ello, han participado 26 personas del ámbito universitario con alto estrés percibido, distribuidas en dos grupos (grupo de tratamiento y grupo de control. Los instrumentos de evaluación seleccionados se clasificaron en dos grupos: variables psicológicas y emocionales y variables de personalidad. Los resultados encontrados mediantes un ANOVA de medidas repetidas mostraron que existía interacción momento x grupo en las variables optimismo, extraversión y responsabilidad, correspondientes al Modelo de los Cinco Grandes Factores, mostrando un incremento de las puntuaciones en estas variables en el grupo terapia y no encontrándose dicha interacción en el grupo control. Las puntuaciones en los componentes de neuroticismo, amabilidad, apertura a la experiencia y personalidad resistente no se modificaron en ninguno de los dos grupos. Este estudio apoya la idea de que modificando determinados parámetros emocionales relacionados con el estrés mediante terapia cognitivo-conductual se pueden ver modulados algunos factores de personalidad.

  12. Evaluación de la Escritura Mediante Rúbrica en la Educación Primaria en México

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Luis Ángel Contreras Niño

    2009-01-01

    Full Text Available Se presentan resultados de un estudio evaluativo cuyo objetivo fue caracterizar mediante una rúbrica los escritos producidos por 3,151 niños y niñas mexicanos al egresar de la educación primaria en el estado de Baja California/MX. Se describe la rúbrica utilizada y los procedimientos para capacitar en su uso a 31 jueces especialistas en lenguaje, así como para estimar la confiabilidad de sus juicios sobre los escritos. Se describen también las puntuaciones, por nivel de logro, en cada uno de los rasgos de la escritura evaluados mediante la rúbrica. Además, se aportan evidencias relacionadas con la validez del examen que incluyó el ítem de ejecución que capturó las muestras de la escritura. Finalmente, se sugieren estudios cualitativos y cuantitativos que amplíen y profundicen los hallazgos encontrados en esta evaluación a gran escala.

  13. Producción de biodiesel de aceite crudo de palma mediante catálisis heterogénea

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Fernando Cardeño

    2010-01-01

    Full Text Available Se estudió la producción de biodiesel de aceite crudo de palma mediante el uso de catalizadores heterogéneos ácidos y básicos para las etapas de preesterificación y transesterificación respectivamente. La pre-esterificación es necesaria para aceites con una acidez superior al 4% de ácidos grasos libres, ya que se evitan los problemas asociados con la formación de jabones. En ambas reacciones las variables analizadas fueron el tipo de catalizador, la temperatura y el tiempo. Se analizó la conversión del aceite a metilésteres usando cromatografía gaseosa y la estabilidad de los catalizadores mediante su reutilización. En la etapa de pre-esterificación se encontró que catalizadores ácidos del tipo resinas de poliestireno sulfonadas presentan conversiones superiores al 87% estabilidad para la esterificación de los ácidos grasos libres. Para la transesterificación se estudiaron como catalizadores heterogéneos, el carbonato de potasio libre y soportado en una matriz polimérica, obteniéndose con ambos conversiones superiores a 95 % de biodiesel; con el uso del soporte polimérico se disminuyó la velocidad de disolución de carbonato de potasio, permitiendo su reutilización hasta 10 reutilizaciones.

  14. Resistencia a la corrosión de recubrimientos electroquímicos de cromo y zinc mediante EIE

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Magda Marcela Torres Luque

    2011-01-01

    Full Text Available Se ha estudiado el comportamiento frente a la corrosión de recubrimientos electrolíticos industriales de cromo y zinc mediante la técnica de espectroscopia de impedancia electroquímica en electrólito de NaCl al 3% en peso. Con el objetivo de determinar los mecanismos de protección y de falla de estos recubrimientos se ha correlacionado la resistencia a la polarización en el tiempo, con la morfología y la composición química. Para ello, los recubrimientos fueron caracterizados mediante microscopia electrónica de barrido, difracción de rayos X, espectroscopia de fotoelectrones de rayos X y espectroscopia de electrones Auger. Ambos recubrimientos muestran degradación en el tiempo de ensayo debido a los defectos presentes en su microestructura, sin embargo, el mecanismo de protección y, por tanto, de falla es diferente para cada sistema. Estos detalles son discutidos en esta investigación.

  15. Detección Molecular de Toxinas Termoestable y Termolabil de Escherichia coli mediante Hibridación

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Isabel Arias B

    2002-10-01

    Full Text Available Objetivos: Identificar mediante el método de hibridización por colony blot las toxinas de Escherichia coli enterotoxigénica y relacionar los resultados con los serotipos encontrados. Materiales y métodos: se evaluaron todas las cepas de E. Coli recolectadas en el Hospital de Emergencias Pediátricas de Lima durante los meses de diciembre de 1998 - abril 1999. Se usaron dos sendas de ADN que identificaban el gen de la toxina termolábil (LT y el de la toxina termoestable (ST Para la detección de los serotipos se usaron 22 antisueros de diferentes categorías de E. coli. Resultados: se encontraron 233 cepas de E. coli, 27,9% de E. coli poseían el gen LT, 3,0% el gen ST y 1,3% tenían ambos. Conclusiones: los serotipos y la presencia de los genes LT y ST no necesariamente tienen relación, demostrándose que la identificación serológica es importante en el estudio epidemiológico de diarreas causadas por E. coli debiéndose confirmar la identificación de las categorías patogénicas mediante la detección de factores de virulencia.

  16. Manejo sostenible y sustentable de fincas productoras mediante procesos participativos en Sáchica, Boyacá

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ángel Eduardo Ramírez-Amaya

    2013-07-01

    Full Text Available Objetivo. Elaborar un proyecto de desarrollo sostenible y sustentable de fincas productoras mediante procesos participativos en el municipio de Sáchica, Boyacá. Materiales y métodos. La investigación se realizó con familias campesinas de la vereda Arrayán Alto, del municipio de Sáchica, Boyacá, mediante la metodología Investigación Acción Participativa (IAP, que se centra en la participación de las comunidades para elaborar propuestas concertadas con ellas. El trabajo se desarrolló en varias fases, que incluyeron un diagnóstico socioeconómico de las familias, capacitaciones y concientización en temas relacionados con la agricultura ecológica y de granjas integrales. Resultados. Se elaboró un plan de trabajo que permitió la construcción de un documento final que ha servido para el apoyo logístico o económico de las entidades gubernamentales locales para la instalación y plantación técnica del cultivo de gulupa con familias de la vereda Arrayán Alto.

  17. Control estadístico de la calidad de un servicio mediante Gráficas X y R

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Alberto Isaac Pierdant Rodríguez

    2009-01-01

    Full Text Available Las empresas y organismos públicos que proporcionan servicios en México no utilizan frecuentemente técnicas cuantitativas para el control de calidad de dicho servicio, por lo que este trabajo representa una propuesta de control de calidad mediante herramientas simples de control estadístico de calidad. Existen diversas técnicas cualitativas y pocas técnicas cuantitativas como las gráficas, que nos permiten determinar si la prestación de un servicio se encuentra bajo control; es decir, verificar si la calidad está dentro de los estándares establecidos por la empresa o institución, o fuera de ellos. Este documento tiene como objetivo mostrar la mecánica del control de calidad de un servicio mediante dos tipos de gráficas de control para variables: la gráfica de control para medias de un proceso y la gráfica de control para variabilidad de procesos. Su aplicación permitiría identificar áreas de oportunidad e implementar mejoras en la calidad del servicio. El material ha sido elaborado empleando la hoja electrónica de cálculo Excel con la finalidad de proporcionar una herramienta práctica en esta materia.

  18. Sistema de Control mediante LabVIEW para analizar la Contaminación Lumínica Automotriz

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Tatiana Carvajal

    2014-11-01

    Full Text Available Se ha desarrollado un sistema de control mediante LabView para analizar la contaminación lumínica automotriz en el medio ambiente. Algunos de los fenómenos analizados son: la irradiancia, espectros de emisión y potencia óptica. Los focos analizados fueron de tipo halógeno y LED, el estudio se llevó a cabo mediante un circuito electrónico similar al control de luces que poseen los carros. Los resultados obtenidos a través de la plataforma LabView indicaron que los focos halógenos de marca alemana, que son los más vendidos en el territorio ecuatoriano, no poseen una irradiación nociva como es en el caso de los LEDs, incluso así, tienen potencias exageradamente altas ocasionando deslumbramientos en la noche. Por su parte, los LEDs han demostrado tener una potencia baja, pero una alta intensidad de luz en las longitudes de onda de 430nm o 450nm, en los LEDs blanco y azul, respectivamente; siendo estas longitudes de onda las causantes de varios daños al sistema ecológico y a la salud cuando el sujeto es expuesto a largos periodos de tiempo

  19. Coloración Psicodélica de Imágenes Digitales mediante Lógica Difusa

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Linda Sheriyn Rodríguez Castro

    2013-06-01

    Full Text Available En el presente artículo se propone un sistema de inferencia difusa para la manipulación del color en imágenes digitales con el propósito de modificar su estilo artístico. Se genera una combinación de colores diferente a la original de tal forma que produzca una nueva sensación visual. El sistema de lógica difusa propuesto, modela mediante conjuntos y reglas de inferencia difusas, la modificación de color considerando la modalidad artística denominada arte psicodélico, generando como resultado imágenes cuyos colores producen este efecto. En la segunda parte se afina el sistema de inferencia propuesto según datos empíricos determinados junto con expertos en el campo del arte, con el fin de obtener un mejor ajuste a la escala de colores del estilo artístico estudiado. Mediante la presentación de diferentes casos de prueba se evidencian los resultados obtenidos por el sistema antes y después de la optimización.

  20. Quantification of transcript levels with quantitative RT-PCR.

    Science.gov (United States)

    Carleton, Karen L

    2011-01-01

    Differential gene expression is a key factor driving phenotypic divergence. Determining when and where gene expression has diverged between organisms requires a quantitative method. While large-scale approaches such as microarrays or high-throughput mRNA sequencing can identify candidates, quantitative RT-PCR is the definitive method for confirming gene expression differences. Here, we describe the steps for performing qRT-PCR including extracting total RNA, reverse-transcribing it to make a pool of cDNA, and then quantifying relative expression of a few candidate genes using real-time or quantitative PCR.

  1. PCR IN TRAUMATOLOGY AND ORTHOPAEDICS: METHOD DESCRIPTION AND APPLICABILITY

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    E. M. Polyakova

    2014-01-01

    Full Text Available Review brief presents description of polymerase chain reaction method (PCR and its most common variants. Three PCR-based lines of research, carried out in the traumatology and orthopaedics, include identifying a causative agents of the implant-associated infection after orthopaedic surgery; detection of antibiotic resistance genes and biofilm forming genes. It was shown that PCR can be used as additional method for detection of genetic disorders, significant for traumatology and orthopaedics, and for investigation of cartilage and bone regeneration.

  2. Forensic study of sex determination using PCR on teeth samples.

    OpenAIRE

    Murakami H; Yamamoto Y; Yoshitome K; Ono T; Okamoto O; Shigeta Y; Doi Y; Miyaishi S; Ishizu H

    2000-01-01

    In this study, sex determination using polymerase chain reaction (PCR) on tooth material was evaluated from the viewpoint of forensic medicine. The sensitivity of PCR for detection of the Y chromosome-specific alphoid repeat sequence and the X chromosome-specific alphoid repeat sequence was 0.5 pg of genomic DNA. Sex could be determined by PCR of DNA extracted from the pulp of 16 freshly extracted permanent teeth and dentine including the surface of the pulp cavity of 6 freshly extracted milk...

  3. Predicting Gene Structures from Multiple RT-PCR Tests

    Science.gov (United States)

    Kováč, Jakub; Vinař, Tomáš; Brejová, Broňa

    It has been demonstrated that the use of additional information such as ESTs and protein homology can significantly improve accuracy of gene prediction. However, many sources of external information are still being omitted from consideration. Here, we investigate the use of product lengths from RT-PCR experiments in gene finding. We present hardness results and practical algorithms for several variants of the problem and apply our methods to a real RT-PCR data set in the Drosophila genome. We conclude that the use of RT-PCR data can improve the sensitivity of gene prediction and locate novel splicing variants.

  4. Surface effects on PCR reactions in multichip microfluidic platforms.

    Science.gov (United States)

    Panaro, Nicholas J; Lou, Xing Jian; Fortina, Paolo; Kricka, Larry J; Wilding, Peter

    2004-03-01

    We evaluated the compatibility of several common plastics, commercially available plastic tubing and disposable syringes which might be useful in the construction of microfluidic platforms with respect to the polymerase chain reaction (PCR). A simple and inexpensive plastic test module was constructed in order to evaluate some of the construction plastics. We also investigated the effect of addition of PEG 8000 to PCR reaction mixtures on the compatibility of materials. These studies identified several common plastics, plastic tubing, and disposable syringes which were compatible with the PCR reaction.

  5. Droplet digital polymerase chain reaction (PCR) outperforms real-time PCR in the detection of environmental DNA from an invasive fish species.

    Science.gov (United States)

    Doi, Hideyuki; Takahara, Teruhiko; Minamoto, Toshifumi; Matsuhashi, Saeko; Uchii, Kimiko; Yamanaka, Hiroki

    2015-05-01

    Environmental DNA (eDNA) has been used to investigate species distributions in aquatic ecosystems. Most of these studies use real-time polymerase chain reaction (PCR) to detect eDNA in water; however, PCR amplification is often inhibited by the presence of organic and inorganic matter. In droplet digital PCR (ddPCR), the sample is partitioned into thousands of nanoliter droplets, and PCR inhibition may be reduced by the detection of the end-point of PCR amplification in each droplet, independent of the amplification efficiency. In addition, real-time PCR reagents can affect PCR amplification and consequently alter detection rates. We compared the effectiveness of ddPCR and real-time PCR using two different PCR reagents for the detection of the eDNA from invasive bluegill sunfish, Lepomis macrochirus, in ponds. We found that ddPCR had higher detection rates of bluegill eDNA in pond water than real-time PCR with either of the PCR reagents, especially at low DNA concentrations. Limits of DNA detection, which were tested by spiking the bluegill DNA to DNA extracts from the ponds containing natural inhibitors, found that ddPCR had higher detection rate than real-time PCR. Our results suggest that ddPCR is more resistant to the presence of PCR inhibitors in field samples than real-time PCR. Thus, ddPCR outperforms real-time PCR methods for detecting eDNA to document species distributions in natural habitats, especially in habitats with high concentrations of PCR inhibitors.

  6. Detección por PCR de Colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en Antioquia, Colombia

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Leonardo Martínez Pacheco

    2014-12-01

    Full Text Available Colletotrichum lindemuthianum, agente causal de la antracnosis del frijol, es uno de los patógenos más limitantes en la producción de este cultivo. La detección y correcta identificación de este hongo resulta fundamental para el manejo de la enfermedad, siendo las pruebas moleculares alternativas rápidas y sensibles para este fin. Mediante la técnica de PCR se evaluaron cuatro juegos de cebadores (CY1/CY2, CD1/CD2, ClF4/ITS4 y ClF432/ClR533 para la detección de C. lindemuthianum a partir de tejidos foliares, de vainas y de semillas procedentes de cultivos de frijol de Antioquia, Colombia. Los resultados indicaron que el par CD1/CD2, dirigido al pseudogen de permeasa de hierro Ftr1, fue el más efectivo para detectar el hongo en tejidos y semillas de frijol, así como para identificar aislamientos en cultivos microbiológicos. Para los cebadores CY1/CY2, dirigidos a los ITS del rDNA, se recomienda un esquema de PCR-RFLPs con MseI (=Tru1I para la diferenciación con las especies C. orbiculare y C. trifolii. Estos cebadores generaron resultados consistentes cuando se utilizaron en combinación con ITS1 (ITS1/CY2 e ITS4 (CY1/ITS4. Finalmente, los cebadores ClF4/ITS4 resultaron en amplificaciones inespecíficas y ClF432/ClR533 en fragmentos de difícil resolución en electroforesis de agarosa. Este estudio servirá de apoyo para los programas de certificación de semilla y mejoramiento genético de frijol.

  7. Sensitive simultaneous detection of seven sexually transmitted agents in semen by multiplex-PCR and of HPV by single PCR.

    Science.gov (United States)

    Gimenes, Fabrícia; Medina, Fabiana Soares; Abreu, André Luelsdorf Pimenta de; Irie, Mary Mayumi Taguti; Esquiçati, Isis Baroni; Malagutti, Natália; Vasconcellos, Vinícius Rodrigo Bulla; Discacciati, Michele Garcia; Bonini, Marcelo Gialluisi; Maria-Engler, Silvya Stuchi; Consolaro, Marcia Edilaine Lopes

    2014-01-01

    Sexually transmitted diseases (STDs) may impair sperm parameters and functions thereby promoting male infertility. To date limited molecular studies were conducted to evaluate the frequency and type of such infections in semen Thus, we aimed at conceiving and validating a multiplex PCR (M-PCR) assay for the simultaneous detection of the following STD pathogens in semen: Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma genitalium, Trichomonas vaginalis, Herpes virus simplex (HSV) -1 and -2, and Treponema pallidum; We also investigated the potential usefulness of this M-PCR assay in screening programs for semen pathogens. In addition, we aimed: to detect human Papillomavirus (HPV) and genotypes by single PCR (sPCR) in the same semen samples; to determine the prevalence of the seven STDs, HPV and co-infections; to assess the possibility that these infections affect semen parameters and thus fertility. The overall validation parameters of M-PCR were extremely high including agreement (99.2%), sensitivity (100.00%), specificity (99.70%), positive (96.40%) and negative predictive values (100.00%) and accuracy (99.80%). The prevalence of STDs was very high (55.3%). Furthermore, associations were observed between STDs and changes in semen parameters, highlighting the importance of STD detection in semen. Thus, this M-PCR assay has great potential for application in semen screening programs for pathogens in infertility and STD clinics and in sperm banks.

  8. Conventional PCR usage for the detection of Mycobacterium Tuberculosis complex in Cerebrospinal Fluid by MPB64-Target PCR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Sharma Narotam

    2011-12-01

    Full Text Available Tuberculous meningitis is a severe and potentially fatal form of Tuberculosis. Diagnosis of Tuberculous meningitis (TBM is challenging. Thus rapid, accurate and confirmatory diagnosis is necessary to initiate required therapy. The diagnostic workup involves detection of acidfast bacilli (AFB in the cerebrospinal fluid (CSF by microscopy or culture, however, the difficulty in detecting the organism poses a challenge to diagnosis. The use of the polymerase chain reaction (PCR in the diagnostic approach to Mycobacterium tuberculosis (MTB meningitis has been reported as a fast and accurate method using in- house protocols and several commercial kits available. We analysed the performance of PCR for the diagnosis of MTB meningitis in 64 consecutive patients, using MTB culture as gold standard.We used PCR as a tool for detecting mycobacterial mpb64 gene in CSF samples from suspected TB patient. 64 clinical specimens were taken from the patients attending SMI Hospital, Dehradun. 45 were PCR positive, 32 were culture positive and 2 were Zn smear positive.The sensitivity of PCR, culture and microscopy for CSF samples was, thus, 70%, 50% and 3% respectively. Therefore, compared to the conventional culture assay, the PCR can be considered a more useful and advanced technique for the rapid and accurate diagnosis of TBM. Thus PCR is better tool for the diagnosis of Tuberculous meningitis combined with the other concerned tests.

  9. Whole blood Nested PCR and Real-time PCR amplification of Talaromyces marneffei specific DNA for diagnosis.

    Science.gov (United States)

    Lu, Sha; Li, Xiqing; Calderone, Richard; Zhang, Jing; Ma, Jianchi; Cai, Wenying; Xi, Liyan

    2016-02-01

    Talaromyces marneffei is a dimorphic pathogenic fungus, which is a life-threatening invasive mycosis in the immunocompromised host. Prompt diagnosis of T. marneffei infection remains difficult although there has been progress in attempts to expedite the diagnosis of this infection. We previously demonstrated the value of nested polymerase chain reaction (PCR) to detect T. marneffei in paraffin embedded tissue samples with high sensitivity and specificity. In this study, this assay was used to detect the DNA of T. marneffei in whole blood samples. Real-time PCR assay was also evaluated to identify T. marneffei in the same samples. Twenty out of 30 whole blood samples (67%) collected from 23 patients were found positive by using the nested PCR assay, while 23/30 (77%) samples were found positive by using the real-time PCR assay. In order to express accurately the fungal loads, we used a normalized linearized plasmid as an internal control for real-time PCR. The assay results were correlated as the initial quantity (copies/μl) with fungal burden. These data indicate that combination of nested PCR and real-time PCR assay provides an attractive alternative for identification of T. marneffei DNA in whole blood samples of HIV-infected patients.

  10. Sensitive simultaneous detection of seven sexually transmitted agents in semen by multiplex-PCR and of HPV by single PCR.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Fabrícia Gimenes

    Full Text Available Sexually transmitted diseases (STDs may impair sperm parameters and functions thereby promoting male infertility. To date limited molecular studies were conducted to evaluate the frequency and type of such infections in semen Thus, we aimed at conceiving and validating a multiplex PCR (M-PCR assay for the simultaneous detection of the following STD pathogens in semen: Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma genitalium, Trichomonas vaginalis, Herpes virus simplex (HSV -1 and -2, and Treponema pallidum; We also investigated the potential usefulness of this M-PCR assay in screening programs for semen pathogens. In addition, we aimed: to detect human Papillomavirus (HPV and genotypes by single PCR (sPCR in the same semen samples; to determine the prevalence of the seven STDs, HPV and co-infections; to assess the possibility that these infections affect semen parameters and thus fertility. The overall validation parameters of M-PCR were extremely high including agreement (99.2%, sensitivity (100.00%, specificity (99.70%, positive (96.40% and negative predictive values (100.00% and accuracy (99.80%. The prevalence of STDs was very high (55.3%. Furthermore, associations were observed between STDs and changes in semen parameters, highlighting the importance of STD detection in semen. Thus, this M-PCR assay has great potential for application in semen screening programs for pathogens in infertility and STD clinics and in sperm banks.

  11. Clinical Performance of Aspergillus PCR for Testing Serum and Plasma: a Study by the European Aspergillus PCR Initiative.

    Science.gov (United States)

    White, P Lewis; Barnes, Rosemary A; Springer, Jan; Klingspor, Lena; Cuenca-Estrella, Manuel; Morton, C Oliver; Lagrou, Katrien; Bretagne, Stéphane; Melchers, Willem J G; Mengoli, Carlo; Donnelly, J Peter; Heinz, Werner J; Loeffler, Juergen

    2015-09-01

    Aspergillus PCR testing of serum provides technical simplicity but with potentially reduced sensitivity compared to whole-blood testing. With diseases for which screening to exclude disease represents an optimal strategy, sensitivity is paramount. The associated analytical study confirmed that DNA concentrations were greater in plasma than those in serum. The aim of the current investigation was to confirm analytical findings by comparing the performance of Aspergillus PCR testing of plasma and serum in the clinical setting. Standardized Aspergillus PCR was performed on plasma and serum samples concurrently obtained from hematology patients in a multicenter retrospective anonymous case-control study, with cases diagnosed according to European Organization for Research and Treatment of Cancer/Invasive Fungal Infections Cooperative Group and the National Institute of Allergy and Infectious Diseases Mycoses Study Group (EORTC/MSG) consensus definitions (19 proven/probable cases and 42 controls). Clinical performance and clinical utility (time to positivity) were calculated for both kinds of samples. The sensitivity and specificity for Aspergillus PCR when testing serum were 68.4% and 76.2%, respectively, and for plasma, they were 94.7% and 83.3%, respectively. Eighty-five percent of serum and plasma PCR results were concordant. On average, plasma PCR was positive 16.8 days before diagnosis and was the earliest indicator of infection in 13 cases, combined with other biomarkers in five cases. On average, serum PCR was positive 10.8 days before diagnosis and was the earliest indicator of infection in six cases, combined with other biomarkers in three cases. These results confirm the analytical finding that the sensitivity of Aspergillus PCR using plasma is superior to that using serum. PCR positivity occurs earlier when testing plasma and provides sufficient sensitivity for the screening of invasive aspergillosis while maintaining methodological simplicity.

  12. (PCR) for the identification of Mycoplasma capricolum subsp ...

    African Journals Online (AJOL)

    ajl yemi

    2011-10-07

    Oct 7, 2011 ... Ministry of Agriculture, Lanzhou Veterinary Research Institute, ... samples tested by PCR included lung and liquor pleurae from 14 goats artificially infected with Mccp. ... infectious disease of goats caused by Mycoplasma.

  13. Nanodroplet real-time PCR system with laser assisted heating.

    Science.gov (United States)

    Kim, Hanyoup; Dixit, Sanhita; Green, Christopher J; Faris, Gregory W

    2009-01-01

    We report the successful application of low-power (approximately 30 mW) laser radiation as an optical heating source for high-speed real-time polymerase chain reaction (PCR) amplification of DNA in nanoliter droplets dispersed in an oil phase. Light provides the heating, temperature measurement, and Taqman real-time readout in nanoliter droplets on a disposable plastic substrate. A selective heating scheme using an infrared laser appears ideal for driving PCR because it heats only the droplet, not the oil or plastic substrate, providing fast heating and completing the 40 cycles of PCR in 370 seconds. No microheaters or microfluidic circuitry were deposited on the substrate, and PCR was performed in one droplet without affecting neighboring droplets. The assay performance was quantitative and its amplification efficiency was comparable to that of a commercial instrument.

  14. Rapid PCR amplification of DNA utilizing Coriolis effects.

    Science.gov (United States)

    Mårtensson, Gustaf; Skote, Martin; Malmqvist, Mats; Falk, Mats; Asp, Allan; Svanvik, Nicke; Johansson, Arne

    2006-08-01

    A novel polymerase chain reaction (PCR) method is presented that utilizes Coriolis and centrifugal effects, produced by rotation of the sample disc, in order to increase internal circulatory rates, and with them temperature homogenization and mixing speeds. A proof of concept has been presented by testing a rapid 45-cycle PCR DNA amplification protocol. During the repeated heating and cooling that constitutes a PCR process, the 100 microL samples were rotated at a speed equivalent to an effective acceleration of gravity of 7,000 g. A cycle time of 20.5 s gave a total process time of 15 min to complete the 45 cycles. A theoretical and numerical analysis of the resulting flow, which describes the increased mixing and temperature homogenization, is presented. The device gives excellent reaction speed efficiency, which is beneficial for rapid PCR.

  15. Comparison of conventional culture and real-time quantitative PCR ...

    African Journals Online (AJOL)

    2009-10-28

    Oct 28, 2009 ... Results of real-time PCR were compared to con- ventional analysis .... water bath (Selecta 40W power, 40 kHz ultrasound fre- quency). ..... mental distributions of Legionella strains in France are different. J. clin. Microbiol.

  16. Bioinformatic tools and guideline for PCR primer design | Abd ...

    African Journals Online (AJOL)

    Bioinformatic tools and guideline for PCR primer design. ... AFRICAN JOURNALS ONLINE (AJOL) · Journals · Advanced Search · USING AJOL · RESOURCES ... Bioinformatics has become an essential tool not only for basic research but also ...

  17. Single-molecule emulsion PCR in microfluidic droplets.

    Science.gov (United States)

    Zhu, Zhi; Jenkins, Gareth; Zhang, Wenhua; Zhang, Mingxia; Guan, Zhichao; Yang, Chaoyong James

    2012-06-01

    The application of microfluidic droplet PCR for single-molecule amplification and analysis has recently been extensively studied. Microfluidic droplet technology has the advantages of compartmentalizing reactions into discrete volumes, performing highly parallel reactions in monodisperse droplets, reducing cross-contamination between droplets, eliminating PCR bias and nonspecific amplification, as well as enabling fast amplification with rapid thermocycling. Here, we have reviewed the important technical breakthroughs of microfluidic droplet PCR in the past five years and their applications to single-molecule amplification and analysis, such as high-throughput screening, next generation DNA sequencing, and quantitative detection of rare mutations. Although the utilization of microfluidic droplet single-molecule PCR is still in the early stages, its great potential has already been demonstrated and will provide novel solutions to today's biomedical engineering challenges in single-molecule amplification and analysis.

  18. Single base pair mutation analysis by PNA directed PCR clamping

    DEFF Research Database (Denmark)

    Ørum, H.; Nielsen, P.E.; Egholm, M.

    1993-01-01

    A novel method that allows direct analysis of single base mutation by the polymerase chain reaction (PCR) is described. The method utilizes the finding that PNAs (peptide nucleic acids) recognize and bind to their complementary nucleic acid sequences with higher thermal stability and specificity...... than the corresponding deoxyribooligonucleotides and that they cannot function as primers for DNA polymerases. We show that a PNA/DNA complex can effectively block the formation of a PCR product when the PNA is targeted against one of the PCR primer sites. Furthermore, we demonstrate that this blockage...... allows selective amplification/suppression of target sequences that differ by only one base pair. Finally we show that PNAs can be designed in such a way that blockage can be accomplished when the PNA target sequence is located between the PCR primers....

  19. Fluorescence Quantitative PCR Detected Infection of Condyloma Acuminatum

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    刘伟民; 杨华风; 高丽琴; 刁存英

    2002-01-01

    Objective: Infection of human papillomavirus in condylomaacuminatum (CA) was detected by real time fluorescencequantitative PCR (FQ-PCR) technique. Methods: Specimens of CA-DNA quantification from 94cases were examined by real time FQ-PCR technique and 32cases were compared with the same method after 10-daystreatment. Results: CA-DNA was found in all patients, with an averageof 4.0×106 copies/ul. After 10 days of treatment, the averagewas 2.1×105 copies/ul. There was a significant difference inthe average amount of CA-DNA before and after thetreatment. Conclusion: Real time FQ-PCR is a good method forexamining CA-DNA amount and it can direct the treatment of CA.

  20. Conjunctival swab PCR to detect Leishmania spp. in cats

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Trícia Maria Ferreira de Sousa Oliveira

    Full Text Available The relevance of the dog as a source of visceral leishmaniasis infection is known, but the role of cats as reservoir hosts for leishmaniasis is not yet fully clear. This study assessed the efficacy of conjunctival swab PCR (CS-PCR in the detection of cats infected by Leishmania spp. The results were seven (13.5% cats positive for Leishmania spp. in the PCR, in 52 cats tested from Pirassunuga-SP and Ilha Solteira-SP. From the city of Pirassununga – SP 28.6% (2/7 were positive and from the city of Ilha Solteira – SP 11.1% (5/45 were positive. The results showed that CS-PCR was capable of detecting cats infected by this protozoan. Conjunctival swab samples proved easier to perform in cats, which might facilitate studies on the frequency and distribution of feline leishmaniasis.