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Variabilidad genética en Prosopis ferox (Mimosaceae)/ Genetic variation in Prosopis ferox (Mimosaceae)

Burghardt, Alicia D.; Espert, Shirley M.; Braun Wilke, Rolando H.
2004-12-01

Resumen en español Prosopis ferox (Mimosaceae) es una especie arbustiva o arbórea espinosa que se distribuye desde el Sur de Bolivia hasta el noroeste de la Argentina. En la provincia de Jujuy se encuentra a grandes alturas (entre los 2400 y los 3700 m s.m.). Existe una gran variabilidad morfológica, especialmente en cuanto a las dimensiones del fruto y la cantidad de semillas por fruto, ambas características importantes debido al uso de esta planta como forraje. Con el objeto de verific (mas) ar si existe además variabilidad genética, se realizó un estudio electroforético de proteínas seminales de árboles procedentes de distintas localidades de la provincia de Jujuy. Los patrones polipeptídicos obtenidos por SDS-PAGE presentaron en total 26 bandas. Cada población se caracterizó por sus patrones de presencia-ausencia de bandas, habiéndose encontrado variabilidad intrapoblacional (polimorfismo) en algunas de ellas, siendo otras genéticamente homogéneas. Los índices polimórficos en poblaciones de P. ferox son comparables a los obtenidos previamente en P. ruscifolia. La variabilidad genética interpoblacional hallada por medio del estudio electroforético de las proteínas seminales hace suponer la existencia de ecotipos. Resumen en inglés Prosopis ferox (Mimosaceae) is a spiny bush or tree, distributed in southern Bolivia and northwestern Argentina. Populations of P. ferox from Jujuy grow at high elevations (2400 to 3700 m). There is in this species a great morphological variability, especially in fruit dimensions and the number of seeds per fruit. These characteristics are important because of its use as forage. With the aim of analyzing the genetic variability among and within populations, a seed protein (mas) electrophoretic study of different accessions from the province of Jujuy was performed. The polipeptidic patterns obtained by SDS-PAGE showed a total of 26 bands. The analyzed populations could be distinguished by their protein profiles, and intrapopulation variability (polymorphism) was found in some of them, while others were monomorphic. The polymorphism indexes found in P. ferox were comparable to those previously found in P. ruscifolia. The genetic variability found among populations of P. ferox, using seed proteins analysis, suggests the existence of ecotypes.

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Variabilidad genética de Hartón del Valle mediante RAM/ Genetic variability of Harton del Valle by RAM

Piedrahíta, Ana M; Posso, Andrés; Muñoz, Jaime E; Álvarez, Luz A
2008-01-01

Resumen en español El Hartón del Valle (HV) hace parte de las siete razas criollas de ganado bovino colombiano y de acuerdo con los criterios de la FAO está considerado como vulnerable. Para estudiar su variabilidad genética fueron muestreados 33 individuos HV y tres animales de la raza Holstein, como control externo. Se extrajo ADN utilizando el método de Salting Out y las muestras fueron analizadas mediante la técnica molecular RAM (Randon amplified microsatellites). Se utilizaron lo (mas) s cebadores CGA, CCA, TG, y CT. El valor promedio de heterocigosidad esperada fue de 0.26 y el F ST fue 0.39 ± 0.03. Con el índice de Dice-Nei Li y agrupando con el método UPGMA se distinguieron dos grupos: uno integrado por dos hatos de conservación y el otro por cuatro fincas que han compartido reproductores. Resumen en inglés Harton del Valle (HV) breed belong to the seven Creole breeds of the Colombian bovine livestock, according to FAO criteria it is considered as vulnerable. To study its genetical variability, 33 HV animals and three and 3 animals of Holstein breed as a external control were sampled. Simples of DNA were isolated using the Salting Out method and RAM (Random amplified microsatellites) technique was used. CGA, CCA, TG and CT primers were used. The mean value of expected hetero (mas) cigozity was 0.26 and F ST fue 0.39 ± 0.03. Using Dice-Nei Li index and UPGMA clustering method, two groups were distinguished: the first one integrated for two conservation herds and other one by tour faros that have been sharing breeding bulls.

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Variabilidad genética de los caballos criollos del Uruguay/ Genetic variability of uruguayan creole horse

KELLY, L.; POSTIGLIONI, A.; DE ANDRES, D. F.; GAGLIARDI, R.; BIAGETTI, R.; FRANCO, J.
2002-01-01

Resumen en español El caballo Criollo del Uruguay (CCU) corresponde al biotipo de caballo de trabajo americano, adaptado y criado en vastas zonas ganaderas. El objetivo de este trabajo es estudiar su variabilidad genética y establecer la diferenciación entre las subpoblaciones que componen la muestra con el fin de analizar la variabilidad entre las mismas. El estudio se realiza mediante 16 marcadores genéticos (7 grupos sanguíneos y 9 polimorfismos bioquímicos), analizándose 145 CCU p (mas) ertenecientes a 4 Departamentos del país. Los sistemas electroforéticos analizados dentro de las 4 subpoblaciones (A, B, C, D) se encontraron en equilibrio génico. La variabilidad genética racial se estimó mediante el Índice de Heterocigosidad media esperada (IH) para los 16 marcadores genéticos (MG), el número total de variantes y el índice de consanguinidad (f). Los resultados fueron: 0.424, 62 y 0,049 respectivamente. La variabilidad de cada una de las subpoblaciones se evaluó mediante el índice F de fijación de Wright (F) y el IH. Todas las subpoblaciones presentaron F negativo, siendo la de menor variabilidad la B (IH= 0.265). Se calculó la distancia genética de Nei entre las 4 subpoblaciones. Esta fue en orden creciente con respecto a la A: C (0.007), D (0.014) y B (0.058). Se realizó un análisis de "cluster" mediante el método de UPGMA, obteniéndose un dendograma en el que se agrupan las subpoblaciones A, C y D. Se puede concluir que el CCU tiene una variabilidad genética de intermedia a alta, conservando el polimorfismos de las razas ancestrales. En cuanto a la variabilidad intrapoblacional se comprueba la presencia de una línea (B) dentro de la raza Resumen en inglés The Uruguayan Creole Horse corresponds to the biotype of American horse for work, adapted and bred in vast cattle areas. The objective of this work is to study its genetic variability and to establish the differentiation among farms included in the sample with the purpose of analyzing the variability among them. The study is carried out using 16 genetic markers (7 blood groups and 9 protein polymorphisms), analyzing 145 CHU that corresponds to 4 farms of different regions (mas) of the country. The electrophoretic systems tested on the 4 farms (A, B, C, D) were in Hardy-Weinberg equilibrium. The genetic variability in each race was estimated through the average expected heterozygosity (HI) for the 16 genetic markers (GM), the total number of alleles (N A) and the inbreeding coeficient (F). The respective results were: HI= -.424, N A = 62 and F=.049. The variability of each farms was evaluated through the F index and the HI. All the farms showed negative f, the lowest variability was found in B (HI= -.265). The Nei distance was calculated among the 4 farms. Increasing order respect to A was: C (.007), D (.014) and B (.058). A cluster analysis was done through the UPGMA method, obtaining a dendogram in which farms A, C and D are clustered. It is concluded that the UCH has a genetic variability from intermediate to high, keeping the polimorphism of its ancestral races. On regards to the variability on the farms, it is verified the presence of a line (B) in the race

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Variabilidad genética de poblaciones de Triatoma flavida (Hemiptera: Reduviidae) en la península de Guanahacabibes/ Genetic variability of Triatoma flavida (Hemiptera: Reduviidae) in Guanahacabibes

Fraga Nodarse, Jorge; Rodríguez Rodriguez, Jinnay; Fuentes González, Omar; Castex Rodriguez, Mayda; Fernández-Calienes Valdés, Aymé
2009-04-01

Resumen en español INTRODUCCIÓN: la enfermedad de Chagas es una enfermedad transmitida por triatomineos. Triatoma flavida es una especie selvática autóctona de Cuba, que presumiblemente es atraída a las casas por la luz, de las especies encontradas en Cuba es la más abundante. OBJETIVO: se investigó la variabilidad genética intrapoblacional e interpoblacional de ejemplares de T. flavida colectados en la región occidental de Cuba, utilizando la técnica del ADN polimórfico amplifica (mas) do al azar, con la determinación además de posibles relaciones genéticas entre las poblaciones. MÉTODOS: un total de 10 cebadores al azar (OPA-1 al 10) fueron usados para evaluar la variabilidad genética dentro de una población y entre 9 poblaciones diferentes de T. flavida, mediante la técnica de ADN polimórfico amplificado al azar. Además, se evaluó la diversidad genética entre individuos salvajes y de la primera generación (F1) obtenidos en el laboratorio, así como entre los diferentes estadios de esta especie. RESULTADOS: no se detectaron diferencias en los patrones de amplificación del ADN entre los individuos silvestres y de la F1; al igual que entre los diferentes estadios de esta especie. Se encontró homogeneidad genética dentro de la población estudiada y una variabilidad genética baja entre las diferentes poblaciones de T. flavida. Se obtuvieron 2 grupos bien definidos según el análisis del ADN polimórfico amplificado al azar, mostrando concordancia con el origen geográfico, en las poblaciones capturadas en áreas del occidente y el oriente de Guanahacabibes, Pinar del Río. Entre estas poblaciones se encontró una pequeña diferenciación genética (Fst 0,030) y tasas de migración (N> 1) que revelan flujo genético y homogeneidad genética. CONCLUSIONES: los resultados presentados en este estudio establecen una aproximación a la estructura genética de T. flavida. La homogeneidad genética encontrada entre los individuos silvestres de T. flavida constituye un aspecto importante para la implementación de las políticas de control de este vector. Resumen en inglés INTRODUCTION: chagas disease is a Triatomineos-borne disease. Triatoma flavida is an indigenous Cuban species, presumably attracted to houses by light and it is the most abundant species in the country. OBJECTIVE: the intrapopulatinal and interpopulational genetic variability of T. flavida collected in the western region, using the Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique, thus determining possible genetic relationships among the populations. METHODS: a total of (mas) ten random primers (OPA-1 at the 10) were used to evaluate the genetic variability in one population and among 9 populations of T. flavida using the RAPD technique. We also evaluate the genetic diversity among wild individuals and their first generation (F1) obtained in the laboratory as well as different stages of this species. RESULTS: differences were not detected in the amplification patterns among the wild individuals and the F1. The same results were achieved among different life cycles of this species. Genetic homogeneity of the studied population and low genetic variability among different T. flavida populations were observed. Two well-defined groups were obtained according to random amplified polymorphic DNA data; they matched with the geographical origin in the populations captured in areas from east and west of Guanahacabibes, Pinar del Río. Among these populations, small genetic differentiation (Fst 0,030) was found as well as migration rates (N> 1), which reveals the gene flow and genetic homogeneity. CONCLUSIONS: The results of this study constitute an approach to the genetic structure of T. flavida. The genetic homogeneity between wild individuals of T. flavida represents an important item for the implementation of the vector control programs.

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Variabilidad genética de las poblaciones de Fusarium oxysporum f. sp. cubense en bananos y plátanos de Cuba/ Genetic Variability of Fusarium oxysporum f. sp. cubense populations in Cuban Plantains and Bananas

Batlle Viera, Alicia; Pérez Vicente, Luis
2009-09-01

Resumen en español El mal de Panamá _causado por Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc)_ es una de las enfermedades más nocivas que atacan las musáceas. La raza 1 causó una epidemia que destruyó la industria de exportación bananera basada en el clon Gros Michel en América, así como la desaparición del cultivo comercial del clon Manzano en Cuba. Con el fin de determinar la variabilidad genética de las poblaciones en el país, se realizaron 52 aislamientos monospóricos del hongo d (mas) e clones naturalmente infectados en 26 localidades de ocho provincias de Cuba. Se determinó la morfología de las colonias en PDA y medio K2, se caracterizaron los compuestos volátiles producidos en un medio a base de arroz, se generaron mutantes nit auxotróficos y se determinaron los grupos de compatibilidad vegetativa con una colección internacional de nit M pertenecientes a todos los GCV de Foc. Se determinó la relación genética entre ellos mediante análisis de AFLP. En medio K2 no se observaron colonias lacinadas en ninguno de los aislamientos pertenecientes a las razas 1 y 2; se observó la producción de compuestos volátiles con independencia de las razas a que pertenecían los aislamientos. Las poblaciones deFoc de Cuba pertenecen a los GCV 01210, 0124, 0124/0125 y 0128. Los aislamientos con mayor similitud genética estuvieron en todos los casos agrupados en el mismo GCV y los aislamientos del GCV 0124, se encontraron distribuidos en todos los grupos genéticos por lo que posiblemente de este se diferenciaron los genotipos pertenecientes los GCV 0124/0125 y 0128. Resumen en inglés Panama disease caused by Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), is one of the most destructive diseases of Musa. The epidemic of race 1 was the cause of banana export industry destruction which was based on Gros Michel in América and its substitution by Cavendish cultivars as well as the commercial cultivation of Manzano cv. in Cuba. In order to determine genetic variability of fungi populations in the country, fifty two monosporic isolates from naturally infected plan (mas) ts from 26 sites in eight provinces of Cuba were obtained. There were determined the colonies morphology in PDA and K2 media, the volatiles compounds produced on a rice based media were identified. Auxotrofic nit mutants were generated to determine the vegetative compatibility groups of each isolate with an international Nit M collection of all VCG of Foc. The genetic relationship between isolates and VCGs were determined by AFLP analysis. In K2 media were not observed lacinated colonies in any of the isolates belonging to race 1 and 2 and volatile compounds were or not were produced in different isolates with independence of the race that they belong. In Cuba the Foc populationswere grouped in the VCGs 01210, 0124, 0124/0125 and 0128. The isolates with a higher genetic similarity were in all the cases grouped in the same VCG and in all the genetic groups were present isolates belonging to the VCG 0124 as well, indicating that it could be the original VCG from which the GCV 0124/0125 and 0128 evolved.

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Variabilidad genética en el pejerrata Caelorinchus fasciatus (Günther, 1878): (Pisces, Gadiformes, Macrouridae)/ Genetic variability in the rat tail fish Caelorinchus fasciatus (Günther, 1878): (Pisces, Gadiformes, Macrouridae)

Oyarzún, Ciro; Monsalves, Javier; Galleguillos, Ricardo; Sandoval, Joel
2000-12-01

Resumen en español El ambiente marino de profundidad plantea interesantes situaciones para el estudio de procesos microevolutivos, permitiendo confrontar hipótesis que ven a esos ambientes como muy estables o bien sujetos a perturbaciones periódicas a las que las especies responderán según su potencial genético y limitantes filogenéticas. En ese contexto se estudió la variabilidad genética en un peje-rata de la costa de Chile: Caelorinchus fasciatus. Mediante electroforesis en gel d (mas) e almidón se evidenciaron los productos enzimáticos de 28 loci presuntivos, de los cuales, sólo tres resultaron polimórficos (PGI-1, PGI-2 y PGM-1). La baja variabilidad genética encontrada (H=0,026) es propia de especies generalistas de hábitat. Comparado con Macrourus holotrachys, la única especie chilena de la familia de la cual se tiene información genética, 12 loci muestran una expresión semejante en ambas especies, incluyendo 5 loci de proteínas totales; la Identidad Génica entre ambas especies alcanzó valores de I=0,409 y la Distancia fue D=0,894. Además, los resultados del presente trabajo, apoyan la Hipótesis de Gauldie, de encontrar baja variabilidad en los sistemas enzimáticos PGI y PGM o sólo en uno de ellos, pero nunca alta en ambos a la vez Resumen en inglés Studies on microevolutionary processes in deep-sea environments, allow testing the contrasting hypotheses about the environmental stability. Some of these consider those environments as stable or suffering periodical disturbances. In those cases the species will answer according to its genetic potential and phylogenetic constrains. In this context, the genetic variability in the rat tail fish Caelorinchus fasciatus was studied. Using starch electrophoresis the enzymatic p (mas) roducts of 28 presumptive loci were screened; only three of them were polymorphic PGI-1, PGI-2 and PGM-1. The low genetic variability found (H=0,026) is seen as typical of habitat generalist species. Compared with Macrourus holotrachys, the single Chilean species that has genetic records, 12 loci show similar electrophoretic expression in both species, including 5 loci of total proteins. The Genetic Identity between both species was I=0,409 and the Genetic Distance was D=0,894. Moreover, our results support the Gauldie's hypothesis that it is possible to find low variability in the enzymatic systems PGI and PGM, or in one of them but never high variability in both of them simultaneously

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Variabilidad genética y estructura poblacional del tunicado Pyura chilensis Molina, 1782, en la costa de Chile/ Genetic variability and population structure in tunicate Pyura chilensis Molina, 1782, in the coast of Chile

ASTORGA, MARCELA P; ORTIZ, JUAN C
2006-12-01

Resumen en español El tunicado Pyura chilensis se ha considerado una especie de importancia ecológica, por concentrar una gran diversidad biológica en sus agregaciones y de importancia económica por ser un recurso de extracción por pescadores artesanales. Sin embargo, se han detectado cambios en la distribución y abundancia de sus poblaciones adjudicados a su sobreexplotación. Para llegar a establecer medidas de conservación de un recurso, es necesario entre otras cosas, conocer su v (mas) ariabilidad genética y su estructura poblacional, estimando los patrones y sus causas. Por lo tanto, en el presente trabajo se determinó el grado de variabilidad genética aloenzimática del piure P. chilensis y su estructura poblacional en base a tres localidades (Antofagasta, Talcahuano y Puerto Montt) en la costa chilena. Los loci polimórficos obtenidos fueron Mdh-1 y Pgi-1. Los valores de Fst mostraron leve estructuración poblacional entre localidades (Fst 0,019) al igual que la prueba exacta de diferenciación genética (P = 0,031). Se observó diferenciación para la localidad de Puerto Montt en relación a las otras dos localidades en algunos de los dos loci. Los niveles de variabilidad observados en esta especie corresponden a lo esperados para otras ascidias. La estructuración genética poblacional puede ser explicada por una combinación de diferentes factores, entre los que destacan: (i) el tiempo del periodo larval de 12 a 24 h, lo cual no facilitaría una amplia dispersión a lo largo de 2.500 km de costa y (ii) las condiciones oceanográficas diferenciales entre localidades, junto a patrones de circulación cerrados que podrían llegar a restringir el flujo génico. Por último, proponemos que un conocimiento adecuado del grado de variabilidad, estructura y dinámica genética de las poblaciones son aspectos esenciales para tomar medidas de conservación de recursos explotados, tanto en ambientes abiertos como en áreas de manejo Resumen en inglés The ascidian Pyura chilensis is an ecologically important species due to its aggregates, providing habitat for other species. In addition, it is an economically important species being commercially exploited along the coast of Chile. Here, changes in distribution and abundance have been observed during the last decade that have been linked to overfishing. Patterns of genetic variation and population structure are important to understand biodiversity, management and conser (mas) vation of species. Thus, the main objective of this study was to determine the genetic variability and population structure of Pyura chilensis in three localities along the Chilean coast (Antofagasta, Talcahuano, Puerto Montt). The polymorphic loci obtained were: Mdh-1 and Gpi-1 for P. chilensis. The Fst values showed slight population structure (Fst = 0.019), and the genetic differentiation showed statistically significant values (P = 0.031). The Puerto Montt locality was significantly different from the other two sites in the pairwise comparison in some loci. The genetic differentiation among localities of P. chilensis could be explained by a combination of different causes: (i) low larval dispersion capacity associated to the larval life time of this species (12 to 24 h), and (ii) differences in oceanographic conditions between localities and a closed circulation pattern that restrict dispersion. We conclude that monitoring of genetic diversity levels are essential to establish conservation and management plans of exploited marine resources

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VARIABILIDAD GENÉTICA DE LOTES DE Brycon orbignyanus UTILIZADOS EN PROGRAMAS DE REPOBLAMIENTO: MANEJO Y CONSERVACIÓN/ Genetic Variability in Brycon orbignyanus Stocks Used in Stocking Programs: Management and Conservation

LOPERA-BARRERO, NELSON M; PEREIRA RIBEIRO, RICARDO; NARDEZ SIROL, RODOLFO; POVH, JAYME A; GOMES, PATRICIA C; VARGAS, LAURO; MANGOLIN, CLAUDETE A
2008-04-01

Resumen en español Alteraciones ambientales causadas por el calentamiento global y principalmente causa-das por la acción del hombre, han reducido poblaciones naturales de peces. Como forma de conservación, programas de repoblamiento han sido utilizados; sin embargo, sin una debida orientación científica, estas medidas pueden generar disturbios genéticos sobre la diversidad genética de poblaciones de peces naturales y sobre el ecosistema. El objetivo de este estudio fue estimar y anal (mas) izar la variabilidad genética de dos lotes y una progenie de Brycon orbignyanus utilizados en programas de repoblamiento, utilizando el marcador molecular RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Cincuenta y ocho reproductores de dos lotes (A y C) y 30 larvas de la progenie del lote A (B) pertenecientes a la Estação de Aqüicultura e Hidrologia da Duke Energy Internacional (Geração Parana-panema; São Paulo, Brasil) fueron analizados. Los resultados de variabilidad genética estimados por el índice de diversidad de Shannon (A: 0,3184; B: 0,3433 y C: 0,3687) y por el porcentaje de fragmentos polimórficos (A: 54,02%; B: 57,47% y C: 58,62%) mostraron que la variabilidad genética fue mantenida en la progenie, debido posiblemente al adecuado manejo reproductivo y al efecto fundador. Por el contrario, la variabilidad encontrada entre los dos lotes de reproductores indica una similaridad genética, a pesar de ser originarios de diferentes pisciculturas. Este resultado es comprobado en el valor moderado de diferenciación genética encontrado (0,0968), en el alto Nm (4,67) y en el dendrograma, que sugieren que los lotes poseen un pool genético similar. Resumen en inglés Environmental alterations caused by the global heating and mainly caused by man's action, have reduced natural fish populations. As a conservation measure, stocking programs have been used; however, without scientific orientation these measures can generate genetic disturbances on the genetic diversity of natural fish populations and the ecosystem. The objective of this study was to estimate and analyze the genetic variability of Brycon orbignyanus stocks and offsprin (mas) g used in stocking programs, using the molecular marker RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Fifty eight broodstocks of two stocks (A and C) and thirty offspring larvae of the stock A (B) belonging to the Estação de Aqüiicultura e Hidrologia da Duke Energy International (Geração Paranapanema; São Paulo, Brazil ) were analyzed. The results of genetic variability estimated by the Shannon Index diversity (A: 0.3184; B: 0.3433 and C: 0.3687) and for the percentage of polymorphic fragments (A: 54.02%; B: 57.47% and C: 58.62%) showed that the genetic variability was maintained in the offspring, due possibly to the appropriate reproductive management and the founder effect. On the contrary, the variability found among the two broodstocks indicates a genetic similarity, in spite of being natives of different fish farming's. This result is verified in the moderate value of genetic differentiation found (0.0968), in the high Nm (4.67) and the dendrogram, which suggests that the stocks hold a similar genetic pool.

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Variabilidad genética del ADN mitocondrial de poblaciones de abejas Apis mellifera (Hymenoptera: Apidae) en Colombia/ Genetic variability in mitochondrial DNA of honeybee populations of Apis mellifera (Hymenoptera: Apidae) in Colombia

Salamanca Grosso, Guillermo
2009-12-01

Resumen en español El ADN mitocondrial de Apis mellifera fue estudiado en 105 colmenas colectadas de 7 zonas geográficas colombianas asociadas a 14 departamentos. Se amplificó mediante PCR un fragmento de la región intergénica ARNtleu y de la citocromo oxidasa II (COII), usando posteriormente la endonucleasa DraI. Tras la digestión con la enzima DraI, se identificaron 13 haplotipos, 8 asociados al linaje africano A (con 90,5% del total para A1, A2, A4, A5, A6, A8, A9 y A13), 4 al linaj (mas) e europeo M (7,6%, M2, M4, M5 y M7) y 1 al C de Europa del Este (C1 con 1,9%). La presencia de los 8 haplotipos A diferentes para las abejas de Colombia, sugiere que ha habido más de un episodio de hibridación, introgresión y expansión del fenómeno de africanización en el territorio colombiano, aspecto que supone existan otros haplotipos en poblaciones no incluidas en el estudio. El gradiente de distribución del linaje africano, esta representado principalmente por el haplotipo A1, desde la Costa Caribe colombiana al centro del país, donde se distinguen además los haplotipos A4 y A6. Los linajes europeos no se ven representados de manera importante en la población estudiada, por ello se demuestra que la actividad apícola colombiana muestra una marcada dependencia de colonias africanizadas Resumen en inglés The mitochondrial DNA of Apis mellifera, sampled in 105 beehives and 7 geographical zones associate to 14 localities in Colombia have been studied. A fragment of the intergenic region between the RNAtleu and the subunit II of the cytochrome oxidase gene was amplified by PCR and digested with the endonuclease DraI. Thirteen haplotypes were identified: eight belonging to the African lineage A (90,5% for A1, A2, A4, A5, A6, A8, A9 and A13), 4 to European lineage M (7,6% M2, (mas) M4, M5 and M7) and 1 to C (C1, 1,9%), of the east European lineage. The presence of eight different A haplotipes, suggests the occurrence of more than one episode of hybridization, introgression and expansion of the africanized phenoma which suggests the presence of other haplotypes in other populations not included in the study. The gradient of distribution of African lineage is represented by the A1 haplotype, to the center of the country from the Caribbean coast with A4 and A6 haplotypes. The european lineages, are not represented significantly on the population studied. Colombia beekeeping activities depend on the africanized honeybee

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Variabilidad genética local del bivalvo dulceacuícola Diplodon chilensis (Gray 1828) proveniente de tres lagos Nahuelbutanos/ Local genetic variability of the freshwater bivalve Diplodon chilensis (Gray 1828) from three Nahuelbuta lakes

Fuentealba, Carmen; Figueroa, Ricardo; González, Fidelina; Palma, Mario
2010-01-01

Resumen en español Se describe la variabilidad genética del bivalvo dulceacuícola Diplodon chilensis proveniente de tres lagos Nahuelbutanos, cada uno de los cuales presenta barreras geográficas y diferencias ambientales reconocibles como consecuencia de diversos eventos geomorfológicos y antrópicos. Nuestros resultados revelaron que sólo Lago Lleu-Lleu se encuentra de equilibrio Hardy- Weinberg (P(mas) e podría explicarse por la complejidad de su ciclo reproductivo. La Posada y Laguna Chica de San Pedro presentan déficit de heterocigotos (Fis). Los valores de Fst global (0.027) y AMOVA para la población total indican que estas poblaciones no están estructuradas lo que sugiere procesos de migración recientes a través de los cursos de agua Resumen en inglés Genetic variability of a freshwater bivalve Diplodon chilensis from three Nahuelbuta lakes was described. Each lake shows geographic barriere and environmental characteristics as a consequence of geomorphologic and antropic events. Our results shows that only Lleu-Lleu lake was in Hardy-Weinberg equilibrium (P(mas) sada and Laguna Chica de San Pedro. Global Fst (0.027) and AMOVA test values for pooling subpopulation show non structured population, as an evidence of recent migration process

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Variabilidad genética para la vida postcosecha y el peso de los frutos en tomate para familias F3 de un híbrido interespecífico/ Genetic variability for the tomato fruit's shelf-life and weight in F3 families derived from an interspecific hybrid

ZORZOLI, ROXANA; PRATTA, GUILLERMO RAÚL; PICARDI, LILIANA AMELIA
2000-12-01

Resumen en español Se evaluó la variabilidad genética para la vida postcosecha y el peso de los frutos en veintiséis familias F3 de un híbrido interespecífico entre la cv. Caimanta de Lycopersicon esculentum Mill. y la línea LA722 de L. pimpinellifolium (Jusl.) Mill. con el objeto de obtener genotipos divergentes para ambos caracteres. Los promedios de días de vida postcosecha fueron 8, 15, 18 y 13 y de peso en gramos fueron 52,17, 0,94, 4,45 y 6,41 para cv. Caimanta, LA722, la F1 y (mas) la generación F3, respectivamente. Ninguna familia fue similar al progenitor `Caimanta' para el carácter días de vida postcosecha y sólo una familia tuvo una vida postcosecha como la F1. Para el peso de los frutos, cuatro familias fueron similares a la F1 y ninguna fue como los progenitores. La familia con peso de los frutos con 20,15 g y vida postcosecha de 21,5 días fue la que presentó mayores valores. El menor peso de los frutos fue en una familia con 2,81 g y el de menor vida postcosecha en una con 9,98 días. La amplia variabilidad genética encontrada para ambos caracteres entre las familias permitirá obtener genotipos divergentes. Resumen en inglés The genetic variability for the fruit's shelf-life and weight was evaluated in twenty-six F3 families derived from an interspecific hybrid between the cv. Caimanta of Lycopersicon esculentum Mill. and the line LA722 of L. pimpinellifolium (Jusl.) Mill. The means for fruit's shelf-life were 8, 15, 18 and 13 days and for fruit weight were 52.17 g; 0.94 g; 4.45 g and 6.41 g in 'Caimanta', LA722, the F1 and in the F3 generations, respectively. No family was similar to the pro (mas) genitor 'Caimanta' for fruit's shelf-life and only one family showed a shelf-life similar to the F1 generation mean. For fruit weight, four families were similar to the F1 generation mean and the F3 families differed from both parent means. The F3 family with the greatest values for fruit weight and shelf-life showed a fruit weight mean of 20.15 g and shelf-life period of 21.55 days. The smaller fruit weight was 2.81 g and the smaller shelf-life period for another family was 9.98 days. The wide genetic variability found for both traits between the families will permit to select divergent genotypes.

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Detección de variabilidad genética en aislamientos de Cercospora kikuchii contaminantes de un mismo sembradío de soja/ Detection of genetic variability in Cercospora kikuchii isolates from a single soybean field

Lurá, M. C.; Di Conza, J. A.; González, A. M.; Latorre Rapela, M. G.; Turino, L.; Ibáñez, M. M.; Iacona, V.
2007-03-01

Resumen en español El conocimiento de la epidemiología y la estructura poblacional de Cercospora kikuchii está poco desarrollado y no se han comunicado estudios al respecto en la Argentina. El objetivo de este trabajo fue seleccionar oligonucleótidos que permitan detectar variabilidad genética en aislamientos de C. kikuchii obtenidos a partir de soja proveniente de un mismo sembradío, mediante la aplicación de RAPD. Se trabajó con 6 aislamientos de C. kikuchii, 5 de ellos se obtuvier (mas) on a partir de trozos de tejido enfermo y el restante provenía de una colección de cultivos. De los 7 oligonucleótidos empleados, 5 resultaron útiles para el estudio poblacional de los aislamientos de C. kikuchii. Resumen en inglés Current knowledge about epidemiology and population structure of Cercospora kikuchii is little developed and no studies regarding this subject have been reported in Argentina. The aim of this work was to select primers to study genetic variability in C. kikuchii isolated from the same soybean field using RAPD (Random Amplified Polymorphism DNA). RAPD was applied to the DNA of 5 C. kikuchii, isolated from diseased tissue of the soybean in the same field, another isolate, f (mas) rom a strain collection. Out of seven primers, five of them proved to be useful to study the population of C. kikuchii isolates.

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Detección de variabilidad genética por microsatélites en el Alano Español Microsatellite variation in Spanish Alano dogs

Barbancho Medina, Manuel; Morera Sanz, L.; Andrés Cara, D.F. de; Barba Capote, C.J.; Garrido Pavón, J.J.

En una muestra de 35 alanos españoles se investigó la utilidad de los microsatélites para detectar variabilidad genética y para el control de paternidad. Los 4 microsatélites utilizados, descritos ya en la bibliografía, resultaron polimórficos, con un número medio de 5 alelos/ locus y una heterocigo...

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Distribución de la variabilidad genética en poblaciones de ponis españoles: resultados preliminares Genetic variability in two spanish horse populations: preliminary results

Vega-Pla, J.L.; Vallejo Vicente, M.; Dunner, S.; García Atance, M.A.; Checa, M.

The genetic variability has been analyzed through the allelic frequencies distribution of ten STR (Short Tandem Repeat) equine loci of three different horse populations, Asturcón, Pottoka and Thoroughbred (PSI), which is considered as an outgroup. The genetic variability found in the pony breeds is ...

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Estructura poblacional y variabilidad genética de Rhodnius prolixus (Hemiptera: Reduviidae) procedente de diferentes áreas geográficas de Colombia/ Population structure and genetic variability of Rhodnius prolixus (Hemiptera: Reduviidae) from different geographic areas of Colombia

López, Diana Carolina; Jaramillo, Carlos; Guhl, Felipe
2007-01-01

Resumen en español Introducción. Rhodnius prolixus es el vector más importante de la enfermedad de Chagas en Colombia. La caracterización genética de esta especie resulta útil para comprender su potencial de dispersión. La distribución del vector y la estructura genética de sus poblaciones, son factores importantes para implementar de manera adecuada las estrategias de control y vigilancia epidemiológica de la enfermedad de Chagas. Objetivo. Establecer relaciones genéticas entre p (mas) oblaciones de R. prolixus capturadas en diferentes hábitat y áreas geográficas de Colombia, para dilucidar la estructura genética y dispersión del vector en el territorio colombiano. Materiales y métodos. Se analizaron tres poblaciones domiciliadas de R. prolixus provenientes de Tolima, Cundinamarca y la Sierra Nevada de Santa Marta; y una población silvestre procedente de Casanare. Se emplearon dos técnicas moleculares para evaluar la estructura genética de las poblaciones: análisis del ITS-2 del ADN ribosomal por PCR/RFLP y RAPDs. Resultados. R. prolixus presenta variabilidad genética moderada (Fst 0,057-0,15), entre las poblaciones domiciliadas se encontraron tasas de migración (Nm>1) que revelan flujo genético. Se encontró diferenciación genética de moderada-alta entre la población silvestre de Casanare y las poblaciones domésticas del centro del país (Tolima y Cundinamarca). Conclusión. Las poblaciones domiciliadas de R. prolixus son homogéneas debido a que existe flujo genético entre éstas; lo cual es favorable para el control químico, mientras que la población silvestre agrupa aparte de las domiciliadas. Se evidencia la necesidad de estudiar la estructura genética de los focos silvestres, sus posibles rutas de dispersión y el riesgo epidemiológico que representan. Resumen en inglés Introduction. Rhodnius prolixus is the most important vector of Chagas disease in Colombia. Genetic characterization of this species is useful to understand its potential of dispersion. The distribution of the vector and the genetic population structure are important factors for the adequate implementation of control programs and epidemiological surveillance of Chagas disease. Objective. Genetic relationships were established for populations of R. prolixus collected from (mas) several habitat types and representative geographic areas of Colombia. A second aim was to assess its population genetic structure and dispersion across Colombia. Materials and methods. Genetic comparisons were made from three domestic populations of R. prolixus from (1) Tolima Province, (2) Cundinamarca Province and (3) the Sierra Nevada of Santa Marta in northern Colombia, and (4) one sylvatic population from Casanare. Two molecular techniques were used to evaluate the genetic structure of these populations-analysis of the ITS-2 of ribosomal DNA by PCR/RFLP and RAPDs. Results. Rhodnius prolixus shows a moderate genetic variability (Fst 0.06-0.15). Among domestic populations, the migration rates found were adequate (Nm>1) to maintain gene flow. A moderate to large degree of genetic differentiation was observed between the sylvatic population from Casanare and the domestic populations from the centre of the country (Tolima and Cundinamarca). Conclusion. The domestic populations of R. prolixus are homogeneous because genetic flow exists between them, and this is favourable to chemical control, while the sylvatic population clusters apart from the domestic populations. Hence the need to study the genetic structure of the sylvatic foci, their possible dispersion routes and the epidemiological risk that they represents.

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Análisis por LSSP-PCR de la variabilidad genética de Trypanosoma cruzi en sangre y órganos de ratones/ Genetic variability of Trypanosoma cruzi in blood and organs of infected mice determined by LSSP-PCR

Mejía, Ana María; Triana, Omar
2005-03-01

Resumen en español Introducción. La enfermedad de Chagas, causada por Trypanosoma cruzi, presenta un curso clínico variable que oscila desde casos asintomáticos a casos crónicos. T. cruzi tiene una estructura clonal y las cepas infectivas son a menudo multiclonales. La variabilidad genética de T. cruzi puede ser un determinante para el tropismo diferencial a tejidos y, consecuentemente, para las formas clínicas de la enfermedad. Objetivo. Caracterizar genéticamente los parásitos de (mas) sangre y órganos de ratones infectados con dos cepas colombianas de T. cruzi. Materiales y métodos. Se infectaron ratones con dos cepas colombianas de T. cruzi con el fin de determinar la infección en sangre y órganos. Para esto, se evaluó la sensibilidad de tres marcadores moleculares diferentes, y se determinó la variabilidad genética de los clones por la técnica de reacción en cadena de la polimerasa de baja astringencia con un único iniciador específico (LSSP-PCR), utilizando el marcador del ADN del cinetoplasto (kADN). Los perfiles de bandas obtenidos con la LSSP-PCR se analizaron por el método de neighbor-joining. Resultados y conclusiones. Nuestros resultados confirmaron la presencia de los dos grupos de T. cruzi en las cepas y el carácter policlonal de éstas. El marcador más sensible fue el kADN y el órgano más afectado, el corazón. Se encontraron diferencias genéticas entre los clones presentes en la sangre y los órganos de los ratones infectados. En conclusión, estos resultados apoyan el uso de la LSSP-PCR para el entendimiento de la epidemiología de la enfermedad de Chagas. Resumen en inglés Introduction: Chagas’ disease, caused by Trypanosoma cruzi, has a variable clinical course, ranging from asymptomatic infection to chronic disease. T. cruzi has a clonal population structure and infecting strains are often multiclonal. Genetic variability of T. cruzi could be one of the determinant factors of differential tissue tropism and consequently of the clinical forms of the disease. Objective: To genetically characterize the parasites of two Colombian Trypanosoma (mas) cruzi strains in blood and organs of experimentally infected mice. Materials and methods: Mice were infected with two Colombian T. cruzi strains to determine the infection in blood and organs. The sensitivity of three different molecular markers was evaluated, and the genetic variability of the clones was determined. The latter was attained by means of low-stringency single specific primer polymerase chain reaction (LSSP-PCR) using kinetoplast DNA (kDNA) marker. The kDNA signatures obtained with the LSSP-PCR were analyzed by neighbor-joining. Results and conclusions: Our results confirmed the presence of the two lineages of T. cruzi and the multiclonal character of the two strains. The most sensitive marker was the kDNA. The most affected organ was the heart, which showed the greatest number of positive results with the three markers. There were genetic differences between the clones found in blood and organs of infected mice. Overall, these results support the use of the LSSP-PCR technique for the study of the molecular epidemiology of Chagas’ disease.

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Study of genetic variability of Albariño (grapevine variety) | Estudio de la variabilidad genética de Albariño

Vidal, J. R.; Masa Vázquez, Antón; Moreno, S.; Ortiz, Jesús María

En: Jornadas Científicas sobre Identificación Molecular en Vid, Alcalá de Henares (España), 16-17 Sep 1998. -- p. 99-111 | De entre las variedades de vid (Vitis vinifera L.) cultivadas en Galicia desde tiempos antiguos, el "Albariño" es sin duda una de las más importantes desde el punto de vista eco...

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Estudio preliminar de la susceptibilidad antimicrobiana y variabilidad genética de Mycobacterium tuberculosis en un área del Caribe colombiano/ Preliminary survey of antimicrobial susceptibility and genetic variability of Mycobacterium tuberculosis isolates from Colombian Caribbean

Miranda, Jorge; Ríos, Rodrigo; Clavijo, Andrea; Chacón, Carlos; Mattar, Salim
2006-12-01

Resumen en español Objetivo: Analizar la susceptibilidad antimicrobiana y la variabilidad genética de algunas cepas de Mycobacterium tuberculosis aisladas en la ciudad de Montería. Métodos: Se incluyeron pacientes con diagnóstico clínico de tuberculosis y se tomaron datos sociodemográficos y epidemiológicos. Las muestras de esputos se cultivaron en el medio de Lowenstein-Jensen. Se llevaron a cabo las pruebas de susceptibilidad antimicrobiana por el método de las proporciones múlti (mas) ples y rifoligotyping de segunda generación. La variabilidad genética se estudió a través del RFLP. Resultados: Mycobacterium tuberculosis se aisló en 67 personas con tuberculosis pulmonar. La baciloscopia fue positiva en 59 (88%) y la edad estuvo entre 14 y 83 años (media 41.5 años). La resistencia fue 29.2% (14/48), y la multirresistencia 6.7% (3/48). La técnica rifoligotyping descubrió 4 cepas con mutación en el gen rpoB, región hot spot codón 531. El número de copias de IS6110 varió entre 3 y 13 y 12 (48%) cepas presentaron entre 8 y 9 copias. El RFLP permitió establecer dos grupos A y B. El grupo A estuvo conformado por 20 (80%) cepas, con un único cluster formado por los pacientes 17, 45, 54. El grupo B, conformado por 5 (20%) cepas, con un único cluster formado por los pacientes 31 y 32. Conclusiones: Se demostró que en Montería, existe una alta tasa de resistencia a los fármacos anti-tuberculosos y una gran variabilidad genética de las cepas de M. tuberculosis. Se sugiere establecer medidas de vigilancia en epidemiología y salud pública para el control de esta enfermedad. Resumen en inglés Objective: The aim of this preliminary study was to investigate the drug susceptibility and genetic variability of Mycobacterium tuberculosis isolated from patients of Montería. Methods: Patients with tuberculosis were included in the study. Socio-demographics and epidemiologic information was collected from each patient. Sputum samples were cultured on Lowenstein-Jensen medium. Antibiotic susceptibility testing was performed using the proportion method and rifoligotypin (mas) g. The study of genetic variability was performed by RFLP. Results: 67 strains of M. tuberculosis isolated from patients with pulmonary tuberculosis were included; fifty-nine patients (88%) were smear positive, the patients ranged from 14 to 83 of age, mean 41.5 years. The initial resistance and multidrug-resistance was 29.2% (14/48) and 6.7% (3/48) respectively. The rifoligotyping detected 4 strains (4, 17, 21 and 45) with the mutation in the rpoB gen, hot spot region codon 531. The number of IS6110-bands varied from 3 to 13, 12 (48%) isolates had among 8 and 9 copies. RFLP revealed genetic diversity of isolates in 2 groups: group A and B. Group A included 20 (80%) strains and only one cluster constituted by the patients 17, 45, 54. Group B, had 5 (20%) strains with only one cluster conformed by two patients 31 and 32. Conclusions: The study demonstrated high levels of drug resistance and variability of strains of M. tuberculosis in Montería. Our results suggest establishing urgent measures of surveillance in epidemiology and public health for the control of the disease.

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VARIABILIDAD FENOTÍPICA Y GENÉTICA EN POBLACIONES DE PASTO MIEL (Paspalum dilatatum Poir.)/ Phenotypic and genetic variability in wild populations of dallis grass (Paspalum dilatatum Poir.)

García, María Victoria; Arturi, Miguel J.; Ansín, Oscar E.
2002-04-01

Resumen en español El pasto miel (Paspalum dilatatum Poir.), es una gramínea perenne de ciclo estival y alto valor forrajero. El objetivo de este trabajo fue obtener estimaciones de la variabilidad fenotípica y genética entre y dentro de poblaciones del biotipo dilatatum. Se tomaron muestras extrayendo plantas completas en tres sitios del sector norte de la Depresión del Salado (La Plata, Magdalena y Pereyra Iraola) en la provincia de Buenos Aires, Argentina. El material, mantenido en e (mas) nvases plásticos, fue utilizado para medir seis caracteres: número de nudos por macolla (NNM), largo y ancho de lámina de la hoja bandera (LLHB y ALHB), largo del raquis de la espiga basal (LREB), número de espigas por panoja (NEP), y número de semillas por espiga basal (NSEB). De las 18 comparaciones entre medias de las tres poblaciones (prueba de t), siete mostraron diferencias significativas al nivel p = 0,01 y seis al nivel p = 0,05. La varianza fenotípica dentro de las poblaciones contuvo, en promedio, 26% de varianza genética, con un rango de grado de determinación genética (GDG) desde 0 a 52%. Se deduce de esos resultados que la variabilidad intrapoblacional no superó la variabilidad entre poblaciones. Si bien los resultados de GDG no son altos, debido al sistema de reproducción apomíctica, la totalidad de la variación genética disponible podría ser utilizada con fines de mejoramiento. El análisis de componentes principales dio resultados coincidentes con la prueba de t, siendo los caracteres NNM, LLHB, LREB, y NSEB los de mayor poder discriminatorio Resumen en inglés Dallis grass (Paspalum dilatatum Poir.) is a warm season perennial grass of high forage value. The objective of this work was to get estimations of phenotypic variability among and within populations of dilatatum biotype of this species. Three places of the Northern Salado Basin (La Plata, Magdalena y Pereyra Iraola), province of Buenos Aires; Argentina, were sampled taking out whole plants. The material, kept in plastic pots, was used to measure six traits: number of nod (mas) es per tiller (NNM), flag leaf length (LLHB), flag leaf width (ALHB), rachis length of base spikelets (LREB), number of spikelets per panicle (NEP), and number of seed per base spikelets (NSEB). From 18 comparisons between population means (t test), 7 showed significant differences at the p = 0.01 level and 6 at the p = 0.05 level. The phenotypic variance within populations contained, in average, 26% of genetic variance. The degree of genetic determination (GDG) fluctuates in a rank from 0 to 52%. It is deduced, from these results, that the within populations variability did not exceed the among populations one. In spite of GDG values were not high, the total amount of available genetic variability is expected to be useful for breeding purposes, because of the apomictic mode of reproduction. The results of the principal component analysis were in agreement with those of the t test. The NNM, LLHB, LREB, and NSEB traits showed the larger discriminative power

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Variabilidad y estructura genética en dos poblaciones de Vicugna vicugna (Camelidae) del norte de Chile/ Genetic variability and structure in two populations of Vicugna vicugna (Camelidae) from northern Chile

NORAMBUENA, M. CECILIA; PAREDES, MARCO
2003-03-01

Resumen en español RESUMEN Se estudiaron dos poblaciones de Vicugna vicugna pertenecientes a la Primera y Segunda regiones del país, en base a la determinación electroforética de 28 loci presumtivos. Las diferencias fenotípicas existentes entre las vicuñas de estas poblaciones hace necesario este trabajo con el fin de re-estudiar su posición taxonómica y obtener antecedentes de variabilidad genética y estructura poblacional que podrían resultar útiles en su manejo de conservación (mas) . En la población de vicuñas de la Primera Región se detectó un polimorfismo de 17,8 % y un nivel de heterocigosidad de 0,078. En aquellas de la Segunda Región, el polimorfismo y la heterocigosidad se estimaron en 14,3 % y 0,045, respectivamente. Ambos parámetros revelan un alto grado de variabilidad genética poblacional. Se encontró un nivel de subestructuración démica alto (F ST = 0,344) y un grado de diferenciación génico y genotípico significativo entre las poblaciones. Se infiere que la deriva genética y el sistema social poligámico tendrían un rol importante como promotores de las diferencias genéticas observadas. El valor de distancia génica (D = 0,097) no confirmó el estatus subespecífico atribuido en base a sus diferencias morfológicas Resumen en inglés Two populations of Vicugna vicugna from regions First and Second of Chile were studied on the basis of the electrophoretic determination of 28 presumptive loci. Due to the phenotypic differences between the populations mentioned above, this kind of study is required to determine some parameters like taxonomic status, genetic variability and population structure in order to help in conservation management of the specie. The percentage of polymorphism and the level of heter (mas) ozigosity of vicuñas from the First region were 17.8 % and 0.078, respectively. The corresponding figures of vicuñas from the Second were 14.3 % and 0.045, respectively. These two parameters show that the two populations have a high degree of genetic variability. High level of demic substructuring (F ST = 0,324) and significant degree of genic and genotypic differentiation between populations was found. Genetic drift and polygamy mating system are suggested like promoters of the observed genetic differences. The sub specific status suggested by morphological differences was not confirmed by the genetic distance value (0.097)

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Evaluación de dos generaciones de híbridos y progenitores de sorgo tolerantes al frío. I: variabilidad genética y adaptabilidad/ Evaluation of two generations of cold tolerant sorghum hybrids and parental lines. I: genetic variability and adaptability

León-Velasco, Humberto; Mendoza-Onofre, Leopoldo E; Castillo-González, Fernando; Cervantes-Santana, Tarcicio; Martínez-Garza, Ángel
2009-08-01

Resumen en español En 1990 se evaluó la primera generación de híbridos experimentales de sorgo [Sorghum bicolor (L.) Moench] tolerantes al frío, adaptados a los Valles Altos Centrales de México y en 1995 se formó la segunda generación de híbridos, con líneas nuevas B y R. Con el propósito de evaluar la variabilidad genética y la adaptabilidad de las dos generaciones de híbridos y progenitores para rendimiento de grano y otras características, en 1996 se establecieron cinco expe (mas) rimentos (tres con riego y dos en secano) en ambientes contrastantes, a 2250 m de altitud. Cada experimento incluyó 12 híbridos de 1ª generación, 80 de 2ª, sus progenitores respectivos y cuatro testigos, en un látice cuadrado 11x11 con cuatro repeticiones. La parcela experimental tuvo dos surcos (3 m largo; 0.7 m ancho) con una planta cada 10 cm. Los híbridos de 2ª generación fueron más precoces, de mayor rendimiento y mejores características agronómicas que los de la 1ª y que la variedad VA-110 (el mejor testigo). Las líneas R de 2ª generación fueron más rendidoras y precoces que las de la 1ª; las líneas B de 2ª generación, con rendimientos similares estadísticamente, fueron más precoces que las de la 1ª y que VA110. El rendimiento promedio de los 10 mejores híbridos de 2ª generación fue 7.97 t ha-1 en los experimentos con riego y 2.49 t ha-1 en los de secano. En la 1ª generación las líneas R fueron estables para rendimiento y los híbridos para precocidad; las líneas R y los híbridos de 2ª generación mostraron rendimiento estable y deseable. Resumen en inglés In 1990, the first generation of cold tolerant experimental sorghum [Sorghum bicolor (L.) Moench] hybrids adapted to the Mexican High Central Valleys was evaluated, and in 1995, the second generation of hybrids was developed, with new B-and R- lines. With the purpose of evaluating genetic variability and adaptability of the two generations of hybrids and parental lines for grain yield and other traits, five experiments (three irrigated and two under rain fed conditions) w (mas) ere set up in 1996, in contrasting environments at 2250 m of altitude. Each experiment included 12 hybrids from the 1st generation, 80 from the 2nd, their corresponding parental lines and four testers, in an 11X11 square lattice with four repetitions. The experimental plot had two rows (3 m long, 0.7 wide) with one plant each 10 cm. The 2nd generation hybrids had earlier flowering, greater yield and better agronomic characteristics than those from the 1st generation and the cv. VA-110 (the best tester). The 2nd generation R- lines had earlier flowering and higher yields than those from the 1st; the 2nd generation B- lines, with yields that were statistically similar, had earlier flowering than those of the 1st and VA-110. The average yield of the ten top 2nd generation hybrids was 7.97 t ha-1 in the irrigated experiments and 2.49 t ha-1 under rain fed. In the 1st generation, the R- lines were stable for yield and hybrids were for early flowering; the R-lines and the hybrids of the 2nd generation showed a stable and desirable yield.

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Diversidad genética de piracanjuba usada en programas de repoblación con marcadores microsatélites/ Genetic diversity of piracanjuba used in stock enhancement programs with microsatellite markers

Rodriguez-Rodriguez, Maria del Pilar; Lopera-Barrero, Nelson Mauricio; Ribeiro, Ricardo Pereira; Povh, Jayme Aparecido; Vargas, Lauro; Sirol, Rodolfo Nardez; Jacometo, Carolina Bespalhok
2010-01-01

Resumen en español El objetivo de este trabajo fue estimar la diversidad genética de un lote de Brycon orbignyanus usado en programas de repoblación, a través de marcadores microsatélites. Se analizaron muestras de 44 reproductores, de 70 larvas y de 69 alevinos, con la amplificación de cinco loci descritos para Brycon opalinus. El número de alelos, la heterozigosidad observada (Ho) y esperada (He), el índice de Shannon (IS), la diversidad genética de Nei (DGN), el coeficiente de en (mas) dogamia (Fis), la distancia (DG) e identidad genética (IG), el número efectivo de alelos, el test del equilibrio de Hardy-Weinberg (EHW) y el desequilibrio de ligación fueron calculados. Reproductores y progenie tuvieron un número similar de alelos en los loci evaluados. La Ho media, IS, DGN, DG e IG mostraron que existe menor distancia genética entre parentales y larvas y una disminución de variabilidad genética en los alevinos. Fueron observados desvíos en EHW y desequilibrio de ligación en seis pares de loci. El Fis mostró exceso de heterocigotos en parentales y larvas y déficit de heterocigotos en los alevinos. El lote de reproductores está en proceso de pérdida de alelos y hubo disminución de la variabilidad genética entre la fase de larva y alevino. Resumen en inglés The objective of this work was to estimate the genetic diversity of a Brycon orbignyanus lot used in stock enhancement programs, using microsatellite markers. Samples of 44 broodstocks, 70 larvae and 69 fingerlings, were analyzed with amplification of five loci described for Brycon opalinus. The number of alleles, the observed (Ho) and expected (He) heterozygosity, Shannon index (IS), Nei's genetic diversity (DGN), the inbreeding coefficient (Fis), distance (DG) and genet (mas) ic identity (IG), the effective number of alleles, the test of Hardy-Weinberg equilibrium (EHW) and the linkage disequilibrium were calculated. Broodstocks and offspring had a similar number of alleles at the tested loci. Ho average, IS, DGN, DG and IG showed that there is less genetic distance between parental and larvae and a decrease of genetic variability in the fingerlings. Deviations in the EHW and disequilibrium ligation were observed in six pairs of loci. Inbreeding coefficient showed excess of heterozygotes in parental and larvae and heterozygote deficiencies in fingerlings. The broodstock is in process of allele losses and the genetic variability decreased between larva and fingerling stages.

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Caracterización genética de lotes de peces usados en programas de repoblamiento y su importancia en la conservación genética en la piscicultura/ Genetic characterization of fish stocks used in stocking programas and their importance in the fish farm genetic conservation

Lopera Barrero, Nelson M; Pereira Ribeiro, Ricardo; Povh, Jayme A; Gomes, Patrícia C; Vargas, Lauro; Nogueira de Oliveira, Sheila
2008-12-01

Resumen en español En las últimas décadas se ha verificado la desaparición de varias especies de peces debido principalmente a impactos generados por acciones humanas. Programas de repoblamiento vienen siendo cada vez más usados como métodos de conservación de la ictiofauna. Sin embargo, sin una correcta orientación genética y reproductiva de los lotes utilizados en estos programas, poblaciones naturales de peces y el ecosistema pueden ser afectados. El objetivo del siguiente estudi (mas) o fue determinar la variabilidad genética de seis lotes de peces usados en programas de repoblamiento, mediante el marcador molecular RAPD. Se analizaron 180 alevines de tres especies de peces (Leporinus elongatus, Piaractus mesopotamicus y Prochilodus lineatus) en tres estaciones piscícolas, ubicadas en las ciudades de Rolândia, Andirá y Palotina en el estado de Paraná, Brasil. Los valores de variabilidad genética estimados por el porcentaje de fragmentos polimórficos y por el índice de diversidad de Shannon mostraron una alta variabilidad genética entre los lotes de L. elongatus y P. lineatus, debido posiblemente al efecto fundador y al manejo reproductivo adoptado en cada piscícola. Se determinó que existió baja diferenciación genética entre los lotes de P. mesopotamicus. Los resultados de este estudio posibilitaran el correcto manejo reproductivo y genético de los lotes de cada piscícola y la orientación objetiva de programas de repoblamiento, permitiendo la conservación de la variabilidad genética, factor de gran importancia en ambientes en cautiverio. Resumen en inglés In the last decades it has been verified the decrease and extinction of fish several species mainly to impacts generated by human actions. Stocking programs are being used as conservation methods of the ichthyofauna. However, without a correct genetic and reproductive orientation of the stocks used in these programs, natural fish populations and the ecosystem can be affected. The objective of the following study was to determine the genetic variability of six fish stocks (mas) used in stocking programs, by means of the RAPD molecular marker. There were analyzed 180 juveniles of three fish species (Prochilodus lineatus, Piaractus mesopotamicus, and Leporinus elongatus) from three fish farms, located in the Rolândia, Andirá, and Palotina cities in Paraná state, Brazil. The genetic variability values estimated by the percentage of polymorphic fragments and by the Shannon diversity index showed a high genetic variability between the P. lineatus and L. elongatus stocks, due possibly to the founder effect and the reproductive management adopted in each fish farm. It was determined that low genetic differentiation existed among the P. mesopotamicus stocks. The results of this study facilitated the correct reproductive and genetic management of the stocks of each fish farm and the objective orientation of stocking programs, allowing the conservation of the genetic variability, factor of great importance in captivity environments.

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Diversidad genética de lotes de Piaractus mesopotamicus usados en programas de repoblamiento y sus implicaciones en la conservación/ Genetic diversity in Piaractus mesopotamicus stocks used in stock enhacement programs and implications for conservation

Lopera-Barrero, N. Mauricio; Pereira-Ribeiro, Ricardo; Aparecido Povh, Jayme; Vargas, Lauro; Bespalhok Jacometo, Carolina; Gomes, P. Cristina
2009-05-01

Resumen en español Modificaciones ambientales derivadas principalmente de acciones humanas han causado la disminución y desaparición de varias poblaciones de peces. Para minimizar este impacto se aplican programas de repoblamiento en varios estados brasileños. Sin embargo, sin la adecuada evaluación estos programas pueden producir cambios genéticos en las poblaciones de peces nativos. Por tanto, el objetivo de este estudio fue analizar la diversidad genética de lotes de Piaractus meso (mas) potamicus usados en programas de repoblamiento, mediante el marcador molecular RAPD. Se analizaron 120 reproductores en cuatro estaciones de piscicultura ubicadas en las ciudades de Sapopema (S), Cornélio Procópio (CP), Cambará (C) y Londrina (L), en el estado del Paraná, Brasil. Los resultados de variabilidad genética determinados usando el porcentaje de fragmentos polimórficos (S=74.15 %; CP=78.80 %; C = 77.61 %; L = 92.90 %) y el índice de diversidad genética de Shannon (S=0.381; CP=0.422; C = 0.438; L=0.522), mostraron una alta variabilidad genética en todos los lotes. Sin embargo, se encontró una alta similitud genética entre los lotes S, CP y P debido posiblemente al efecto fundador, ya que los lotes se fundaron con reproductores recolectados en el rio Paraná. Este resultado se corroboró con los valores de Gst y de flujo génico que mostraron una moderada diferenciación genética y un alto flujo génico. El lote de reproductores de L tuvo una mayor distancia genética con los otros lotes, debido a que se fundó con reproductores recolectados en el rio Paranapanema. También se constató que los lotes de reproductores CP y C fueron los más semejantes genéticamente (identidad genética-IG = 0.954) y que los lotes S y L presentaron menos genes en común (IG=0.692). El lote L fue el más distante de todos. Resumen en inglés Environmental changes caused principally by human action have provoked reduction and even disappearance of several populations of fish. To minimize this impact stock enhancement programs are being implemented in several Brazilian states. However, without adequate evaluation, these programs can produce genetic changes in populations of native fish. Therefore the objective of this study was to analyze, with the RAPD molecular marker, the genetic diversity of Piaractus mesop (mas) otamicus stocks used in stock enhancement programs. One hundred twenty broodstocks at four fish farm stations located in the Sapopema (S), Cornélio Procópio (CP), Cambará (C), and Londrina (L) cities, in the Paraná state, Brazil, were analyzed. The results of genetic variability determined using the percentage of polymorphic fragments (S = 74.15 %; CP=78.80 %; C = 77.61 %; L=92.90 %) and the Shannon genetic diversity index (S=0.381, CP=0.422; C = 0.438; l=0.522) showed high genetic variability in all of the broodstocks. However, high genetic similarity was found between the S, CP, and P stocks possibly due to the founder effect since the stocks were founded with broodstocks collected in the Paraná River. The result was corroborated with Gst values and gene flow, which showed moderate genetic differentiation and high gene flow. The broodstock from L had a greater genetic distance from the other stocks because it was founded with broodstocks collected in the Paranapanema River. It was also confirmed that the broodstocks CP and C were the most genetically similar (genetic identity-GI=0.954) and the S and L broodstocks had less genes in common (GI=0.692). The L stock was the most distant of all the broodstocks.

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Variabilidad en el florecimiento de procedencias de Eucalyptus cladocalyx en la Región de Coquimbo

Mora, Freddy; Perret, Sandra; Scapim, Carlos Alberto; Nunes Martins, Elias; Molina, María Paz
2007-08-01

Resumen en español Se analizó la variabilidad en el florecimiento de cinco poblaciones de Eucalyptus cladocalyx establecidos en la Región de Coquimbo. Se consideró al florecimiento como una respuesta binaria medida a los 30 meses de edad. Por lo tanto, se ajustó un modelo linear generalizado para analizar el efecto de procedencias. Posteriormente, se estudió la variabilidad genética dentro de la mejor procedencia, a través de inferencia Bayesiana, vía algoritmo de Gibbs. Inicialment (mas) e, se consideraron dos sitios, Hacienda Caracas y Tunga Norte, sector costero e interior de la Provincia de Choapa, respectivamente. En el sector costero, sólo un 1,33% de los árboles presentaron eventos de florecimiento, mientras que en Tunga Norte, este valor fue de 23,43%. Debido a este resultado, se consideró solo el sitio interior. El efecto de procedencias fue estadísticamente significativo (p Resumen en inglés This work aimed to study the variability in flowering of five populations of Eucalyptus cladocalyx established in the administrative region of Coquimbo, northern Chile. Flowering was recorded as a binary response trait in 30-month-old trees. Then, at first, a generalized linear model was fitted for analyzing provenance effect. Subsequently, genetic variability was studied within the best provenance by Bayesian inference via Gibbs sampling. Initially, two sites were consid (mas) ered: Caracas and Tunga Norte, in the littoral and interior area of the Choapa Province, respectively. In the littoral area, only 1.3% of the trees evidenced flowering events, while in Tunga Norte, this value was 23.43%. For this reason, only interior site was considered. The provenance effect was significant (p

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Amplificación al azar del ADN de 5 poblaciones cubanas de peces larvívoros del género Rivulus

Fernández-Calienes, Aymé; Hernández, Natividad; Fraga, Jorge
2003-12-01

Resumen en español Se amplificó al azar el ADN de 10 individuos de 5 poblaciones de Rivulus colectados en la región occidental de Cuba. De la amplificación, empleando 5 cebadores, no resultó ningún marcador monomórfico, lo que evidenció una alta variabilidad genética entre los peces de las 5 poblaciones. Según la distancia genética entre los individuos, se forman 4 grupos, para cada uno de los cuales aparecen marcadores genéticos de RAPD (ADN polimórfico amplificado al azar) que (mas) son específicos, porque no se evidencian en el resto de los individuos. Estos resultados apoyan la utilización del RAPD como una herramienta eficiente para la caracterización genética de peces cubanos del género Rivulus. Resumen en inglés DNA from 10 individuals from 5 populations of Rivulus collected in the western region of Cuba was amplified at random. No monomorphic marker resulted from the amplification by using 5 primers, which showed the high genetic variability existing among the fishes of the 5 populations. According to the genetic distance among the individuals, they were divided into 4 groups, for which there are specific genetic markers of RAPD, since they are not observed in the rest of the su (mas) bjects. These results support the use of RAPD as an efficient tool for the genetic characterization of Cuban fishes of the Rivulus genus.

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Microsatélites amplificados al azar (RAM) en estudios de diversidad genética vegetal/ Random amplified microsatellites (RAM´s) in plant genetic diversity studies

Muñoz Flórez, Jaime Eduardo; Morillo Coronado, Ana Cruz; Morillo Coronado, Yacenia
2008-12-01

Resumen en español Se revisó el uso e importancia, ventajas, desventajas y características de la técnica Microsatélites Amplificados al Azar (RAM) en uchuva Physalis peruviana, mora Rubus spp, guayaba Psidium guajava y heliconias Heliconia spp. En mora se diferenciaron las especies R. glaucus, R. robustus y R. urticifolius, se detectaron duplicados y se encontró alta variabilidad genética en R. glaucus, la especie más importante. En uchuva se encontró alta diversidad y dos accesione (mas) s de fruto rojo que se diferenciaron genéticamente de las amarillas y una región geográfica con alta variabilidad. En guayaba los cebadores fueron altamente polimórficos y se encontró alta variabilidad en el Valle del Cauca. En heliconias y especies relacionadas se diferenciaron las familias del orden Zingiberales, algunos subgéneros y variaciones en la especie. La técnica es de bajo costo, utiliza un cebador, no requiere información previa, es altamente polimórfica y diferencia especies en los taxones evaluados. Resumen en inglés The use and importance, advantages, disadvantages and features of the Random Amplified Microsatellites RAMs technique, were reviewed in Cape gooseberry Physalis peruviana, blackberry Rubus spp, guava Psidium guajava and heliconias Heliconia spp. In blackberry, we differentiated the species R. glaucus, R. robustus y R. urticifolius, detected duplicated accessions and found high genetic diversity in R. glaucus, the most important specie. In cape gooseberry we found high div (mas) ersity and two red fruit accessions genetically differentiated from the yellow fruit ones and a geographical region with high variability. In guava, primers were highly polymorphic and found high variability in Valle del Cauca region. In Heliconia and related species we differentiated families belonging to Zingiberal order, between some sub genera and variation among specie. The technique has low cost of implementation, use a single primer, do not require previous information, is highly polymorphic and can differentiate species is taxa were technique was evaluated.

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Diferenciación genética de tres poblaciones colombianas de Triatoma dimidiata (Latreille, 1811) mediante análisis molecular del gen mitocondrial ND4/ Genetic differentiation of three Colombian populations of Triatoma dimidiata (Heteroptera: Reduviidae) by ND4 mitochondrial gene molecular analysis

Grisales, Nelson; Triana, Omar; Angulo, Víctor; Jaramillo, Nicolás; Parra-Henao, Gabriel; Panzera, Francisco; Gómez-Palacio, Andrés
2010-06-01

Resumen en español Introducción. Triatoma dimidiata es el segundo vector más importante de la enfermedad de Chagas en Colombia, después de Rhodnius prolixus. El conocimiento de la composición genética y la diferenciación de poblaciones es fundamental para el adecuado diseño e implementación de estrategias de control y vigilancia vectorial. Objetivo. Determinar el nivel de variabilidad y diferenciación genética en tres poblaciones colombianas de T. dimidiata provenientes de distint (mas) as localidades y hábitats, mediante el análisis molecular de un fragmento del gen mitocondrial ND4. Materiales y métodos. Se analizó el nivel de polimorfismo y la estructura genética de dos poblaciones silvestres de los departamentos de La Guajira (n=10) y Santander (n=10), y de una población intradomiciliaria (n=15) y peridomiciliaria (n=5) del Cesar. Para tal fin, se analizaron las secuencias de nucleótidos de un fragmento del gen mitocondrial ND4. Resultados. T. dimidiata en Colombia demostró tener gran diversidad genética, tanto a nivel de nucleótidos (π: 0,034) como de haplotipo (Hd: 0,863), además de una significativa estructuración de población (fST: 0,761) con un bajo número de migrantes (Nm: 0,157). Las distancias genéticas y las diferencias en los niveles de variabilidad genética entre las tres poblaciones fueron coherentes con una posible subdivisión de población. Conclusión. Este trabajo demostró diferenciación genética entre las poblaciones de T. dimidiata de La Guajira, Cesar y Santander. Se sugiere una posible relación entre tal subdivisión y algunas características eco-epidemiológicas que posee T. dimidiata en el centro-oriente y en el norte de Colombia. Finalmente, este trabajo describe, por primera vez, la utilidad del ND4 como un marcador molecular para el estudio de poblaciones naturales de T. dimidiata. Resumen en inglés Introduction. Triatoma dimidiata is the second most important vector of Chagas disease in Colombia after Rhodnius prolixus. Population genetic studies are essential for the adequate design and implementation of vector control and surveillance strategies. Objective. The level of genetic variability and population differentiation was surveyed among three Colombian populations of T. dimidiata from different geographic locations and ecotopes, using ND4 mitochondrial gene. Mat (mas) erials and methods. Genetic comparison was made between two wild populations from La Guajira (n=10) and Santander (n=10) provinces, and one intra (n=15) and one peridomiciliary (n=5) population from the Cesar province. The polymorphism frequencies of the ND4 mitochondrial gene sequence were analyzed to deduce population structure based on the 40 samples. Results. Colombian T. dimidiata showed a high nucleotide (π: 0.034) and haplotype diversity (Hd: 0.863), as well as significant population subdivision (fST: 0.761) and a low migration rate (Nm: 0.157). Genetic distances and variability differences among populations indicate distinct population subdivision amongst the three provinces. Conclusion. ND4 proved useful in elucidating the significant genetic differentiation that has occurred among T. dimidiata populations from La Guajira, Cesar and Santander. The analysis suggested a relationship between population subdivision and some eco-epidemiological attributes of this vector from the central eastern and northwestern regions of Colombia.

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Análisis de diversidad genética en tres poblaciones de llamas (Lama glama) del noroeste argentino/ Analisis of genetic diversity in three llama (Lama glama) populations from north-western Argentina

BUSTAMANTE, ANA V; MATÉ, MARÍA L; LAMAS, HUGO E; GIOVAMBATTISTA, GUILLERMO; ZAMBELLI, ANDRÉS; VIDAL-RIOJA, LIDIA
2006-06-01

Resumen en español Este trabajo describe la variabilidad genética actual de tres poblaciones de llamas (Lama glama) del noroeste argentino (NOA), afectadas a la producción de fibra. Originariamente, las tropas fueron una única población la cual fue subdividida hace 10 años. Se estudiaron muestras de ADN de 77 animales mediante amplificación por PCR de 12 loci microsatélite con cebadores específicos de llama. La alta variabilidad genética comprobada se sustenta en el hallazgo total (mas) de 140 alelos diferentes, 9 a 16 alelos por locus y rangos de heterocigosidad observada y esperada por locus de 1 a 0 y 0,9 a 0,47, respectivamente. Diecinueve de treinta y seis pruebas de equilibrio de Hardy-Weinberg mostraron desvíos significativos (P Resumen en inglés The current genetic variability of three llama (Lama glama) management units from the northwestern Argentine (NOA) was analyzed. The troops, originally comprised a unique population that 10 years ago was divided into the current three. The DNA of 77 animals was studied by PCR amplification of 12 loci using microsatellite primers specific of Lama glama. A high level of genetic variability is sustained by the finding of one hundred and forty total alleles, a range of 9 to 1 (mas) 6 allele number per locus and observed and expected hetrozygosities per locus varying from 1 to 0 and 0.9 to 0.47, respectively. Distributed within the three troops 44 private alleles were detected and proposed for uses such as to exchange new allelic variants. Hardy Weinberg Equilibrium test for each locus within each population showed significant deviation (P

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Huella genética de genotipos silvestres y comerciales de Passiflora spp. utilizando patrones RAPD/ Genetic fingerprint of wild and commercial genotypes of Passiflora spp. by using RAPD patterns

Pérez-Almeida, Iris; Vásquez García, Sundry; Pérez, Delis; De La Rosa, Oscar; Salazar, Efraín
2009-12-01

Resumen en español Una colección importante de especies cultivadas y silvestres de Passiflora se encuentra en el Banco de Germoplasma del INIA-CENIAP, en Maracay, Venezuela, y de las cuales es necesario conocer la identidad genética para evitar duplicaciones. Se utilizaron 60 iniciadores de la serie Operon para determinar la huella genética de 17 genotipos e identificar patrones de bandas para cada uno de ellos. Las bandas exhibidas por cada genotipo se numeraron en forma ascendente y se (mas) cuencial creando así un patrón genético característico para cada genotipo en relación con cada iniciador utilizado así como la tipificación del iniciador en relación a cada genotipo estudiado. El análisis genético determinó que los RAPD permitieron generar para cada genotipo estudiado un conjunto de patrones de bandas que le son característicos y que se convierte en su huella genética. Se establecieron 19 iniciadores con un alto potencial discriminatorio, los cuales deberían ser la base de futuros estudios de diversidad genética en Passiflora. Estos iniciadores permitieron observar diferentes posiciones de banda similares entre los individuos sugiriendo la presencia de varios alelos para esas características. Los patrones RAPD permitieron separar los materiales cultivados de las especies silvestres, encontrándose además un alto grado de variabilidad entre los materiales cultivados. Resumen en inglés An important collection of cultivated and wild species of Passiflora is maintained at the Germplasm Bank of INIA-CENIAP in Maracay, Venezuela, and it is essential to know the genetic identity of such materials in order to avoid duplicates. Sixty primers from the Operon series were used to determine the genetic fingerprint of 17 genotypes and identify patterns of bands for each genotype. Displayed bands by each genotype were numbered in ascending and sequential order thus (mas) creating a distinctive genetic pattern for each genotype in relation to each primer used, as well as the primer characterization in relation to each genotype studied. The genetic analysis established that RAPDs allowed generating a set of specific band patterns characteristic for each genotype that becomes their genetic fingerprint. Nineteen primers with a high discriminatory potential were chosen and should be the base of further genetic studies of Passiflora genetic diversity. These primers permitted observing different positions of similar bands among the individuals suggesting the existence of several alleles for these characteristics. RAPD patterns allowed separating cultivated materials from wild types, finding a high degree of variability among the cultivated materials.

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Coevolución de interacciones hospedante - patógeno en frijol común/ Coevolution of plant-pathogen interactions in common bean

Araya, Carlos Manuel
2003-06-01

Resumen en español La coevolución en varios patosistemas del frijol ha sido demostrada en los últimos años. Con base en diferencias morfológicas (color y tamaño del grano, hábitos de crecimiento de la planta, forma de las hojas, y forma y tamaño de las vainas), tipo de proteína en las semillas, respuestas serológicas, análisis de isoenzimas, y patrones polimórficos de bandas utilizando técnicas moleculares (RFLP, RAPD y AFLP), se han sugerido dos centros de domesticación del fr (mas) ijol común: Mesoamérica (América Central, Antillas y México) y la Zona de los Andes. En estas regiones, las variedades cultivadas y silvestres presentan una gran variabilidad fenotípica y genética. La amplia variabilidad genética es también una característica de la mayoría de los patógenos de plantas. En frijol, tres patógenos han mostrado una íntima asociación con el acervo genético del hospedante, estos son: Colletotrichum lindemuthianum,Phaeoisariopsis griseola y Uromyces appendiculatus. Estos hongos presentan patogenicidad específica en los hospederos del correspondiente centro de origen. Poblaciones mesoamericanas de los tres organismos son más virulentas que las respectivas andinas, y genéticamente más variables. Este comportamiento ha sugerido un proceso de coevolución del patosistema. El conocimiento de la variabilidad genética y especificidad en las poblaciones nativas es preciso para el desarrollo de programas de mejoramiento y selección de fuentes de resistencia durables y efectivos para cada país de la región (gene deployment). Resumen en inglés Coevolution in bean pathosystems have been demonstrated. Based on morphologial traits (seed color and size, growth habit, leaf shape, and pod size) seed protein type, serological reactions, isozymes analysis, and polymorphic patterns using molecular techniques (RFLP, RAPD, AFLP), two domestication centers of common bean have been proposed. They are Mesoamerica (Central America, the Caribbean and Mexico) and the Andean Region. Both wild and breed bean varieties are widely (mas) diverse in the two centers. The genetic variability is frequent among plant pathogen populations. On common beans, three pathogens have showed a strong association with the host gene pool, they are: Colletotrichum lindemuthianum, Phaeoisariopsis griseola and Uromyces appendiculatus. Most of their strains are host specific. However, the Mesoamerican pathogen populations are both more virulent and genetically variable than the Andean ones. The natural behavior of this pathosystem has suggested an ongoing coevolution process. To select appropriate sources of durable resistance and develop plant breeding programs it is necessary to know the genetic variability and specificity of native bean pathogen populations. Gene deployment is a suitable control strategy.

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Genotipos de Hepatitis B: Importancia clínica/ Hepatitis B Genotypes: Clinical importance

Martínez Méndez, Dilia Karina; Barboza, Luisa; Hernández Valles, Rosaura C.
2007-01-01

Resumen en español La infección por el Virus de Hepatitis B (VHB) representa un problema de salud pública a escala mundial, estimándose que más de dos millardos de personas en el mundo se han infectado, de los cuales aproximadamente 350 millones son portadores crónicos del virus. Cerca de un millón de muertes al año están relacionadas con hepatocarcinoma primario asociado a la infección por VHB, lo que hace a éste virus la cuarta causa de muerte por enfermedades infecciosas a nive (mas) l mundial. La replicación del VHB posee un potencial de variabilidad genética mayor que la de los virus ADN en general favoreciendo la aparición de mutantes naturales generadas por sustituciones puntuales, por reordenamiento de genes, o por cambios en los marcos de lectura denominados genotipos. La variabilidad genética podría estar asociada con las diferentes vías de transmisión, resistencia al interferón o progresión hacia el desarrollo de carcinoma hepatocelular. Resumen en inglés Hepatitis B virus (HBV) infection is a worldwide public health problem and it has been estimated that over 2000 million persons have been infected in the world, of approximately 350 million of which are chronic carriers of the virus. Around one million deaths per year are related to primary hepatic cancer associated to HBV infection, which makes this virus the fourth cause of death at a worldwide level. HBV replication has a greater potential of genetic variability than t (mas) hat of DNA viruses in general, favoring the occurrence of natural mutants generated by punctual substitutions, gene reordering, or to changes in the genotype denominated reading frames. Genetic variability could be associated with the various transmission forms, interferon resistance or progression towards the development of hepatocellular cancer.

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Caracterización morfoagronómica y genética de germoplasma mejorado de soya/ Morpho-Agronomic and genetic characterization of soybean bred germplasm

Gill-Langarica, Homar Rene; Pecina-Quintero, Víctor; Maldonado-Moreno, Nicolás; Hernández-Delgado, Sanjuana; Mayek-Pérez, Netzahualcóyotl
2006-12-01

Resumen en español El análisis de la diversidad genética del germoplasma de soya es importante para la identificación de los genotipos mejor adaptados a las condiciones agroclimáticas de una región. En esta investigación se caracterizaron 108 genotipos de soya: nueve variedades introducidas de soya, cinco mexicanas y 94 líneas experimentales con 18 parámetros morfoagronómicos y marcadores moleculares AFLP con el objetivo de determinar las relaciones genéticas y la diversidad gené (mas) tica en el germoplasma. En 2004 se evaluaron 82 genotipos por sus características morfoagronómicas en el Campo Experimental Sur de Tamaulipas. El color de las vainas y de la pubescencia de las vainas, número de vainas con un grano y con dos granos, y peso de la semilla fueron las variables con mayor valor descriptivo de acuerdo con el análisis de componentes principales. Con base en estas características, el germoplasma de soya se dividió en tres grupos. En el grupo I se incluyó el germoplasma con vainas y pubescencia de vainas grises, valores intermedios en vainas con una y dos semillas, y bajo peso de semilla y rendimiento. En el grupo II, el que mostró color de la pubescencia y de vaina café y alto rendimiento, y en el grupo III el que presentó valores intermedios en todas las características mencionadas. El dendrograma obtenido con datos AFLP presentó tres grupos principales de genotipos, con disimilitud genética de 7.25 a 8.25%. El grupo I incluyó líneas derivadas de los progenitores Júpiter y Santa Rosa, así como variedades mexicanas y extranjeras; el grupo II incluyó variedades introducidas, líneas experimentales derivadas de Júpiter y variedades mexicanas; el grupo III sólo incluyó líneas experimentales. Las variedades introducidas Júpiter y Santa Rosa generaron 3 8 y 3 7% de la variabilidad genética total, respectivamente. El análisis de componentes principales de datos AFLP no separó las variedades introducidas de las mexicanas, aunque las líneas experimentales derivadas de Santa Rosa y Júpiter fueron diferentes a estos progenitores. El análisis de varianza molecular indicó reducida diversidad genética en el germoplasma de soya. Los resultados indicaron que no existe estrecha asociación entre los patrones de variabilidad genética y morfoagronómica en soya, y que es necesario ampliar la base genética del germoplasma de soya en México. Resumen en inglés The analysis of genetic diversity in soybean germplasm is important for the identification of contrasting and complementary parental genotypes for its utilization in a given region. In this work nine introduced and eight local cultivars as well as 94 experimental soybean lines were characterized with 18 agronomic traits and AFLP molecular markers in order to determine the genetic relationships and genetic diversity in the germplasm. During 2004 at the Experimental Station (mas) South of Tamaulipas, Mexico, a subset of 82 genotypes was evaluated under field conditions. Based on results of a principal component analysis, color of pod and pubescence, number of pods with one and with two seeds and seed weight were the most descriptive agronomic traits. Using those traits, genotypes were then classifi ed in three groups. Group I included genotypes with grey pod and pod pubescence, intermediate number of pods with one and two seeds and low seed weight and seed yield; group II included genotypes with brown pods and pod pubescence and high seed yield; group III with genotypes of intermediate values for all traits. The dendrogram constructed based on AFLP data showed three major groups of genotypes with genetic dissimilarity from 7.25 to 8.25%. Group I included lines derived from cultivars Jupiter and Santa Rosa, local and introduced cultivars; group II included introduced cultivars, experimental lines derived from Jupiter and local cultivars; group III only included experimental lines. Cultivars Jupiter and Santa Rosa generated 38 and 37% of the total genetic variability, respectively. Principal component analysis from AFLP data did not separate introduced from local cultivars, although experimental lines derived from Santa Rosa and Jupiter were distinct from their parents. An analysis of molecular variance showed reduced genetic diversity. No significant association was found between genetic and agronomic variability patterns in the genotypes characterized. Broadening the soybean genetic basis of the germplasm in Mexico, is urgently needed.

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Utilización de Microsatélites para la Determinación de la Polilla de la Manzana Cydia pomonella L. (Lepidoptera: Tortricidae) en Chile Central/ Utilization of Microsatellites to Determine Genetic Variability of the Codling Moth Cydia pomonella L. (Lepidoptera: Tortricidae) in Central Chile

Espinoza, Juan L; Fuentes-Contreras, Eduardo; Barros, Wilson; Ramírez, Claudio
2007-09-01

Resumen en español La polilla de la manzana (Cydia pomonella L.) es la plaga más importante de los frutales pomáceos en el mundo. A pesar de su gran importancia económica, poco se sabe acerca de su estructura genética y patrones de movimiento a escala local y regional, aspectos importantes para establecer una estrategia de control de esta plaga. Mediante la utilización de microsatélites se realizó un análisis de la variabilidad genética de seis poblaciones de la polilla de la manza (mas) na en las dos principales regiones productoras de manzanas (Malus domestica Borkh.) en Chile Central. A pesar de las distancias geográficas entre algunas poblaciones (aprox. 180 km), se encontraron bajos coeficientes de diferenciación genética entre poblaciones (F ST = 0,0-0,00097 y G ST = 0,005-0,127), sin presencia de aislamiento por distancia, y con altos niveles de flujo génico (Nm ≈ 250). Se encontraron altas frecuencias de alelos nulos (Na = 0,292) para todos los loci, a través de las poblaciones analizadas, lo que explicaría el significativo déficit de heterocigotos encontrado. Aproximadamente un 98% de la variabilidad genética encontrada corresponde a una variación intraindividual, atribuyéndose prácticamente nada a los demás niveles jerárquicos. La alta diversidad génica y los altos niveles de flujo génico parecen indicar que las poblaciones estudiadas de la polilla de la manzana en ambas regiones estudiadas están distribuidas formando casi un continuo Resumen en inglés Codling moth (Cydia pomonella L.) is the main pest of pip fruits worldwide. Despite its economic importance, little is known about the genetic structure and patterns of movement at local and regional scale, important aspects for establishing a control strategy for this pest. An analysis of genetic variability on six populations of C. pomonella using microsatellite was performed in the two major apple (Malus domestica Borkh.) growing regions of Central Chile. In spite of g (mas) eographic distances between some populations (aprox. 180 km), there was little genetic differentiation among populations (F ST = 0.0-0.0097 and G ST = 0.005-0.127), without isolation by distance, and high levels of gene flow (Nm ≈ 250). High frequencies of null alleles were found over all loci across populations (Na = 0.292) which seem to explain the significant heterozygote deficiencies found. Approximatelly 98% of the variance was found within individuals and very little at the other hierarchical levels. The high levels of genetic diversity and gene flow detected seem to indicate that the codling moth populations studied in both regions have an almost continuous distribution

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DIVERSIDAD GENÉTICA DE Peronospora sparsa (PERONOSPORACEAE) EN CULTIVOS DE ROSA DE COLOMBIA/ Genetic Diversity of Peronospora sparsa (Peronosporaceae) on Rose Crops From Colombia

AYALA-VÁSQUEZ, MARILUZ; ARGEL-ROLDAN, LUZ EDITH; JARAMILLO-VILLEGAS, SONIA; MARÍN-MONTOYA, MAURICIO
2008-04-01

Resumen en español El mildeo velloso de la rosa es la enfermedad más limitante de este cultivo en Colombia . Aunque algunos trabajos de investigación se han adelantado recientemente sobre la epidemiología de esta enfermedad, uno de los campos menos estudiados es el nivel de variabilidad de su agente causal. El conocimiento de este aspecto es fundamental para definir las estrategias de manejo, especialmente aquellas relacionadas con la resistencia genética y el control químico. Los obje (mas) tivos de esta investigación fueron confirmar la identidad taxonómica del agente causal del mildeo velloso de la rosa y profundizar en el conocimiento de su estructura poblacional en Colombia . Para esto se colectaron 34 aislamientos del pseudohongo en cultivos de rosas ubicados en Antioquia y la sabana de Bogotá y se extrajo su ADN, para proceder a la amplificación mediante PCR de la región ITS del ADNr utilizando los primers especieespecíficos PS3 y PS1. Dichos productos se emplearon tanto para su secuenciación directa como para la evaluación de variabilidad genética mediante la técnica PCRRFLP, resultados que se complementaron con la utilización de los marcadores RAPD y RAMS. La presencia de un amplicón de aproximadamente 700 pb que compartió un porcentaje de identidad del 100% con secuencias depositadas en el GenBank, permitió confirmar a los aislamientos como pertenecientes a Peronospora sparsa, mientras que el análisis de RFLP, RAPD y RAMS indicó un muy bajo nivel de variabilidad entre todos los aislamientos, concluyéndose que la población de P. sparsa en Colombia es predominantemente clonal. Resumen en inglés Downy mildew of roses is the most restrictive disease of this crop in Colombia . Although some studies have been carried out on the epidemiology of this disease, one of the fields less studied is the level of variability of its causal agent. The knowledge of this aspect is fundamental to define management strategies, especially those related with the genetic resistance and the chemical control. The objectives of this research were to confirm the taxonomic identity of the (mas) causal agent of downy mildew of rose and to deepen in the knowledge of their population structure in Colombia. Thirtyfour isolates of the pseudofungi were collected in rose crops located in Antioquia and the Savanna of Bogota and their DNA was extracted to amplify by PCR the ITS region of the DNAr using the species-specific primers PS3 and PS1. The products were used for their direct sequencing and to evaluate genetic variability by PCR-RFLP. Additionally the study was complemented throught RAPD and RAMS markers. Presence of a band of approximately 700 pb that shared a percentage of identity of 100% with sequences deposited in the GenBank, allowed to confirm the identity of the isolates as belonging to Peronospora sparsa, while the analysis of RFLP, RAPD and RAMS indicated a very low level of variability among all the isolates, concluding that the population of P. sparsa in Colombia is predominantly clonal.

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Análisis de la estructura genética en una muestra poblacional de Bucaramanga, departamento de Santander/ An assessment of genetic structure in a Bucaramanga, department of Santander, population sample

Hincapié, Martha Lucía; Gil, Adriana María; Pico, Adriana Lucía; Gusmão, Leonor; Rondón, Fernando; Vargas, Clara Inés; Castillo, Adriana
2009-12-01

Resumen en español Introducción: El fenómeno de sub-estructura en las poblaciones ha tenido desde hace varios años un abordaje amplio, que se enfocó, entre otros, en la identificación y cuantificación de la mezcla étnica presente en estudios de mapeo asociativo, para comprobar la asociación de marcadores polimórficos en el desarrollo de enfermedades comunes complejas, como responsable de falsos positivos. No obstante el reconocimiento de este problema, no se tiene suficiente inform (mas) ación genética en el contexto nacional ni local que permita determinar la posible diferenciación de subgrupos poblacionales en cada región en particular. Objetivo: Determinar la estructura genética en una muestra poblacional de la ciudad de Bucaramanga, a partir del análisis de 19 marcadores microsatélites autosómicos en distintos subgrupos poblacionales. Metodología: De la base de datos del Laboratorio de Genética Humana de la Universidad Industrial de Santander, se seleccionaron aleatoriamente 350 muestras de ADN, y se amplificaron 19 marcadores autosómicos Short Tandem Repeat mediante los «kits Powerplex®16 y FFFL (Promega)». Resultados: En el análisis de equilibrio Hardy Weinberg, no se obtuvieron diferencias estadísticamente significativas en 18 de 19 marcadores Short Tandem Repeat autosómicos analizados en la población de Bucaramanga. El único marcador que mostró no estar en equilibrio Hardy Weinberg en la población de Bucaramanga fue el F13B (valor de significancia de p=0.00264, después de aplicar la corrección de Bonferroni). Discusión: Las poblaciones representadas en los seis estratos socioeconómicos mostraron alta diversidad genética intragrupos, que ratificó una alta variabilidad entre los individuos de la ciudad de Bucaramanga, acorde con el bajo valor de F STentre distintos grupos, determinado en el análisis molecular de varianza con base en frecuencias alélicas observadas para los 19 Short Tandem Repeat analizados. Conclusión: La alta diversidad genética y el análisis molecular de varianza mostraron una baja diferenciación entre los seis estratos socioeconómicos en la ciudad de Bucaramanga, y evidenciaron a la población como una misma unidad genética, no sub-estructurada. Resumen en inglés Introduction: The phenomenon of substructure in the populations has been greatly analyzed for several years, and it has been focused especially on the identification and quantification of ethnic mixture present in studies of associative mapping to verify the association of polymorphic markers in the development of complex and common diseases responsible for false positives. Nevertheless, despite the recognition of this issue, there is insufficient genetic information with (mas) in the national or local contexts that allow assessing the possible differentiation of population sub-groups in each particular region. Objective: To determine the genetic structure in the city of Bucaramanga through the analysis of 19 autosomal microsatellite markers in different subgroups of the population. Methodology: A total of 350 DNA samples were randomly selected from the database of the Human Genetic Laboratory at Universidad Industrial de Santander by using Epi Info version 6.04 2001. Also, 19 Short Tandem Repeat markers were amplified using «kits Powerplex® 16 and FFFL (Promega)». Results: In the Hardy Weinberg equilibrium analysis (100 steps in Markov chain and 1000 dememorization steps), no statistically significant differences in 18 out of the 19 analyzed STRs markers in the population of Bucaramanga were obtained. A unique marker that proved not present in HWE in the population of Bucaramanga was the F13B (for a significance value of p=0.00264, after applying the Bonferroni correction). Discussion: The populations represented in the six socioeconomic levels presented high genetic diversity intragroups, which ratified the high variability among the individuals in this city according to the low value of FST for different groups, determined via the molecular analysis of variance based on the allelic frequencies observed for the 19 analyzed Short Tandem Repeats. Conclusions: The high genetic diversity, as well as the analysis of molecular variance displayed low divergence for each of the six socioeconomic levels in the city of Bucaramanga. Therefore, it is suggested that this population is an equivalent genetic unit and not substructured.

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Determinación por medio de marcadores moleculares SSCP y RAPD de la diversidad genética en la especie Taenia solium en Colombia/ DETERMINATION BY SSCP AND RAPD OF GENETIC DIVERSITY IN Taenia solium ESPECIES, MAIN CAUSATIVE AGENT OF TENIOSIS AND CYSTICERCOSIS IN COLOMBIA

FERNÁNDEZ, MARCELA; MUÑOZ, AMALIA; CORREDOR, MAURICIO
2006-12-01

Resumen en español Utilizando las técnicas moleculares de SSCP y RAPD se pudo evidenciar rápida y claramente la variabilidad genética en Colombia de larvas del céstodo Taenia solium analizando fragmentos de genes de ADN mitocondrial y fragmentos aleatorios de ADN nuclear. El ADN estudiado se obtuvo de ocho aislados de cisticercos de cerdo provenientes de tres departamentos de Colombia: Antioquia, Nariño y Sucre. Los fragmentos obtenidos por PCR de los genes NADH deshidrogenasa 1 (ND1) (mas) y citocromo oxidasa c subunidad I (COI) al ser denaturados y analizados en geles no denaturantes de acrilamida, mostraron al menos tres patrones diferentes por cada gen analizado, verificando que estos genes conservados mitocondriales son polimórficos en T. solium colombiana. Por otra parte, los cebadores decaméricos de RAPD produjeron patrones polimórficos, corroboraron la diversidad genética entre los diferentes aislamientos analizados Resumen en inglés SSCP and RAPD techniques were performed in order to detect the genetic variability of Taenia solium cestode, using both mitochondrial and nuclear DNA fragments. The DNA was extracted from eight different cysts isolated of pigs originated from three distant Colombian provinces: Antioquia, Nariño and Sucre. Gene fragments corresponding to NADH dehydrogenase 1 (ND1) and cytochrome oxidase c subunit I (COI) were amplified by PCR using total DNA from individual cysts and late (mas) r run on non denaturing SSCP acrylamide gels. Three different patterns were obtained by SSCP for both genes indicating that ND1 and COI mitochondrial genes are polymorphic in Colombian T. solium species. COI patterns were more polymorphic, related to the geographical origin. Furthermore, RAPD decameric primers showed a nuclear polymorphic DNA, that corroborates the genetic diversity between this isolates

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Caracterización molecular de introducciones colombianas de caña flecha utilizando la técnica AFLP/ Molecular characterization of colombian wild cane accesions with AFLP

Rivera Jiménez, Hernando; Vallejo Cabrera, Franco Alirio; Suárez Padron, Isidro
2008-12-01

Resumen en español La fibra de la caña flecha Gynerium sagittatum (Aubl.) se utiliza como materia prima para fabricar el "sombrero vueltiao", sombrero típico de la costa caribeña colombiana. Se realizó la caracterización molecular con AFLP para estimar variabilidad genética teniendo en cuenta criterios geográficos y morfológicos de 25 introducciones colombianas del banco de germoplasma de la Universidad de Córdoba. El análisis de correspondencia múltiple discriminó las introducc (mas) iones en cuatro grupos, donde se identificaron características de importancia artesanal (comercial) y atributos agronómicos. Se observó escasa correlación entre distancia geográfica y diferenciación genética, lo cual indicó flujos antrópicos por la reproducción asexual del material. Resumen en inglés Wild cane (Gynerium sagittatum Aubl.) fiber is used as raw material for to make "hat vueltiao". A molecular characterization using AFLP was carriet out to estimate genetic variability of 25 accessions planted at the University of Cordoba, associated with geographical and morphological traits. Multiple discrimination correspondence analyses of introductions separated four groups, based on craft handling and agronomic attributes desirable. There was little correlation betwe (mas) en geographic distance and genetic differentiation, indicating an anthropic flows by asexual reproduction.

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Diversidad genética y contribución reproductiva de una progenie de Brycon orbignyanus en el sistema reproductivo seminatural, usando marcadores microsatélites/ Genetic diversity and reproductive contribution of Brycon orbignyanus offspring in the semi-natural reproductive system, using microsatellites markers

Lopera-Barrero, N. Mauricio; Vargas, Lauro; Nardez-Sirol, Rodolfo; Pereira-Ribeiro, Ricardo; Aparecido-Povh, Jayme; Streit Jr, D. Pedro; Cristina-Gomes, Patrícia
2010-03-01

Resumen en español La conservación de la variabilidad genética es prioritaria en lotes de peces usados en programas de repoblación de ríos, especialmente para especies amenazadas o en peligro de extinción como es el caso del Brycon orbignyanus. El objetivo del presente estudio fue estimar la diversidad genética y la contribución reproductiva de una progenie de B. orbignyanus usada en programas de repoblación, en un sistema reproductivo seminatural usando marcadores microsatélites. (mas) Se analizaron muestras de aleta caudal de 24 reproductores (12 y 12) y 95 larvas de su progenie. Reproductores y progenie mostraron dos a leí os, ausencia de alelos de baja frecuencia y una heterocigosis media de 0.470 y 0.510. El coeficiente Fis mostró que hubo ausencia de endogamia en los reproductores y progenie (-0.116 y -0.242) y no hubo diferencias (p>0.01) en el equilibrio de Hardy-Weinberg. De acuerdo con el análisis de varianza molecular (AMOVA), la mayor parte de la variación observada estuvo dentro de cada grupo y no entre los grupos, corroborado por el valor de índice de Shannon (reproductores = 0.477; progenie = 0.491). La diversidad genética en la progenie fue preservada y se verificó la presencia de paternidad múltiple y dominancia reproductiva en 50 % de la progenie mediante la utilización del sistema reproductivo seminatural. Resumen en inglés The conservation of genetic variability is a priority for fish lots used in restocking programs in rivers, especially for threatened or endangered fish species as is the case oí Brycon orbignyanus. The objective of this study was to estimate the genetic diversity and reproductive contribution of an offspring of B. orbignyanus used in stock programs in a semi-natural reproductive system using microsatellite markers. Samples of caudal fin from 24 breeders (12(mas) width=15 height=21 src="../../../../../img/revistas/agro/v44n2/a5s1.jpg"> and 12), and 95 larvae of their offspring. Breeders and offspring showed two alíeles, absence of low frequency alíeles and an average heterozygosity of 0.470 and 0.510. The coefficient Fis showed that there was no inbreeding in breeders and offspring (-0.116 and -0.242) and there were no differences (p>0.01) in the Hardy-Weinberg equilibrium. According to the analysis of molecular variance (AMOVA), most of the variation observed was within each group and not among groups, being confirmed by the Shannon index value (breeders = 0.477; offspring = 0.491). The genetic diversity in the offspring was preserved and the presence of multiple paternity and reproductive dominance was verified in 50 % of the offspring through the use of the semi-natural reproductive system.

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EFECTOS DE LA CONTAMINACION SOBRE LA DIVERSIDAD GENETICA DE MAZZAELLA LAMINARIOIDES (BORY) FREDERICQ (GIGARTINALES, RHODOPHYTA) EN BAHIAS/ CONTAMINATION EFFECTS ON GENETIC DIVERSITY OF MAZZAELLA LAMINARIOIDES (BORY) FREDERICQ (GIGARTINALES, RHODOPHYTA) ON BAYS

Palma, Mario; González, Fidelina; Romo, Héctor; Ruiz, Eduardo; Fuentealba, Carmen
2007-06-01

Resumen en español Se determinó y comparó la variabilidad genética interpoblacional de Mazzaella laminaroides (Bory) Fredericq presente en Bahía Coliumo, Bahía San Vicente y Bahía Concepción, las que presentan diversos grados de contaminación. La variabilidad fue evaluada sobre la base del polimorfismo en un locus de la enzima super-óxido dismutasa en 50 ejemplares gametofitos de poblaciones de M. laminarioides en cada una de las bahías. Los sectores muestreados fueron 1) cercano (mas) al Puerto de la Segunda Zona Naval en Bahía Concepción (Talcahuano), 2) Caleta Lenga en Bahía San Vicente y 3) Dichato en Bahía Coliumo. El locus sod-1 mostró dos alelos (A y B). De los sectores estudiados, la mayor frecuencia para el alelo B se encontró en la población de Bahía Concepción con valores de 0.24, le sigue la población de Bahía San Vicente con frecuencia alélica B de 0.10 y por último la población de Bahía Coliumo con una frecuencia de 0.04. El estudio reveló que los lugares con mayor grado de contaminación presentan poblaciones con una frecuencia del alelo B significativamente mayor que en Bahía Coliumo, que es el sector menos expuesto a la contaminación por metales pesados o hidrocarburos Resumen en inglés In the present study, inter-population genetic variability of the intertidal Rhodophyta Mazzaella laminarioides (Bory) Fredericq from Concepción Bay, San Vicente Bay and Coliumo Bay, which show different levels of pollution, was evaluated. The variability was based on the polymorphism exhibited by the superoxide dismutase enzyme in 50 random sampled gametophyte fronds of M. laminarioides from each bay. The sampling was carried out at Talcahuano, in Concepción Bay; Lenga (mas) Cove, in San Vicente Bay; and Dichato, in Coliumo Bay. The three populations of M. laminarioides showed two alleles (A and B). The allele B in the population of Concepcion Bay showed the highest frequency corresponding to 0.24, followed by the population of San Vicente Bay with 0.10 and the lowest 0.04 B allelic frequency was found in the population of Coliumo Bay. The study revealed that the two most polluted sites showed high frequency of allele B

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Caracterización molecular de tres líneas de Cavia porcellus mediante la aplicación de AFLP/ Molecular characterization of three populations of Cavia porcellus with AFLP markers

Solarte-Portilla, Carlos; Cárdenas-Henao, Heiber; Rosero-Galindo, Carol; Burgos-Paz, William
2007-01-01

Resumen en español Los marcadores moleculares son una herramienta eficaz para determinar variabilidad genética entre y dentro de poblaciones, pero en el caso de Cavia porcellus, no existen reportes referentes al uso de estas técnicas. Con los marcadores moleculares AFLP´s (Amplified Fragment Length Polimorphism), se analizaron tres poblaciones, dos criollas y una mejorada genéticamente, sometida a selección durante varias generaciones y obtenida a partir del cruzamiento entre animales (mas) peruanos y nativos de Nariño. Para obtener los marcadores moleculares AFLP´s (Amplified Fragment Lenght Polimorphism), se utilizaron en total cinco combinaciones de cebadores, tres combinaciones recomendadas para el orden Rodenthia y dos por la casa fabricante del Kit, de las cuales sólo una de ellas, con 116 loci, permitió establecer diferencias entre las poblaciones estudiadas, de acuerdo con el valor de distancia genética insesgada de Nei (p Resumen en inglés Molecular markers are a powerful tool to determine genetic variability within and among populations, but for the Cavia porcellus there are no reports on the use of these techniques. Three populations, two native and another one, genetically improved which was obtained by crossing native and Peruvian animals and submitted to genetic selection through several generations were analyzed by means of AFLP markers. Five primer’s combinations recommended for Rodenthia were (mas) used, but only one allowed to establish significant differences (p

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Origen, evolución y diversidad del arroz/ Rice origin, evolution and diversity

Acevedo, Marco A; Castrillo, Willian A; Belmonte, Uira C
2006-06-01

Resumen en español Este trabajo tiene por objetivo presentar una revisión bibliográfica sobre el origen, evolución y diversidad del género Oryza, en las especies cultivadas. La especie O. sativa es la de mayor importancia económica, ya se cultiva en todo el mundo en climas tropicales y templados (latitud de 35° sur en la Argentina a 50° norte en la China), O. glaberrima, se cultiva solamente en el oeste de África. Se deduce que existen dos patrones evolutivos de origen y domesticaci (mas) ón del arroz cultivado, uno en Asia para la especie O. sativa y otro en África para O. glaberrima. La principal consecuencia de la domesticación en O. sativa es la reducción del desgrane, que favorece la cosecha manual y mecanizada. Trabajos de diversidad genética demuestran que la O. sativa presenta mayor variabilidad genética encontrándose hasta 3 sub-especies (Indica, Japónicas y Javánicas), basadas en su ecología y morfología, la tendencia no fue observada en O. glaberrima. Los estudios sobre genoma realizado en la especie O. sativa Subsp Japónica muestran que esta formado por 430 millones de pares de bases y aproximadamente 50% está compuesto de secuencias repetidas. Finalmente, la estrecha base genética encontrada en las variedades de arroz liberadas en el mundo en los últimos años como consecuencia de la uniformidad del núcleo citoplasmática, ha traido como consecuencias un techo en la productividad y vulnerabilidad a factores bióticos. En virtud de ello numerosos investigadores de diversos países han realizado trabajos de mejoramiento genético con ayuda de la técnicas biomoleculares para incrementar la diversidad genética en la especie O. sativa, utilizando para ello germoplasma exótico del género Oryza, principalmente las especies O. glaberrima, O. sativa spontánea, O rufipogon, O. officinalis, pertenecientes a los complejos O. sativa y O. Officinalis. Resumen en inglés This review has the objective to present a detailed bibliographical revision about origin, evolution and diversity of Oryza genus, with emphasis in the cultivated species. The O. sativa species is the one of more economic importance and is widely cultivated throughout the world in tropical and temperate climates (latitude 35° south in Argentina to 50° north in China), while O. glaberrima is only cultivated in the western Africa. These studies suggest that there are two (mas) evolutionary patterns of origin and domestication of the cultivated rice, being O. sativa from Asia and O. glaberrima from Africa. The most important consequence of domestication in O. sativa is the reduction of dehiscence, which favors the manual and automatic harvest. Studies show that O. sativa presents higher genetic variability geing up to three sub-species (Indica, Japonicas and Javanicas), with different ecology and morphology; however this tendency was not observed in O. glaberrima. Genomic studies show that O. sativa subsp Japonica has 430 megabases and approximately 50% are repeated sequences. Finally, the narrow genetic base found in liberated varieties of rice in the world in the last years, has resulted in a selection progress plateau in yield and vulnerability to biological factors as a consequence of the lack of variability in both the nuclear and cytoplasmic genetic background. Numerous researchers from many countries have carried out studies of breeding programs using molecular technique to increase genetic diversity in O. sativa, using exotic germoplasm of O. genus, mainly the species O. glaberrima, O. sativa spontanea, O. rufipogon, O. officinalis, belonging to the complex O. sativa and O. officinalis.

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Diversidad isoenzimática en accesiones de Medicago polymorpha colectadas a lo largo del gradiente climático en Chile, y su relación con otras especies de Medicago/ Isozymatic diversity in accesions of Medicago polymorpha collected along an environmental gradient in Chile, and its relationship with other species of Medicago

PAREDES, MARIO; BECERRA, VIVIANA; CORREA, PILAR; DEL POZO, ALEJANDRO
2000-09-01

Resumen en español Medicago polymorpha es una especie naturalizada en Chile que presenta una gran varaibilidad en características agronómicas, tales como precocidad, producción de semilla, y producción de materia seca, asociada de un gradiente climático. Los objetivos de este trabajo fueron evaluar la diversidad isoenzimática en accesiones de M. polymorpha y su relación con la variabilidad fenotípica, y establecer posibles relaciones genéticas con otras especies de Medicago. Para e (mas) sto se analizaron 12 sistemas isoenzimáticos en 41 accesiones de M. polymorpha, provenientes de un amplio rango de condiciones edafoclimáticas, y de 16 accesiones de M. arabica, M rotata, M. rigidula, M. tornata, M. littoralis y M. truncatula. Los resultados indicaron una escasa diversidad isoenzimática dentro de M. polymorpha, y una falta de correspondencia con la variabilidad fenotípica y distribución geográfica de las accesiones. El análisis multivariado permitió agrupar las especies en forma separada. M. arabica, que también está naturalizada en Chile, fue la especie mas cercana a M. polymorpha, en cambio, M. littoralis, M. rigidula y M. rotata fueron las especies que presentaron una mayor distancia genética con M. polymorpha Resumen en inglés Medicago polymorpha is a naturalized species in Chile which presents great variability in agronomic traits such as flowering and reproductive phenology, seed production, seed hardness, and dry matter production, associated to a climatic gradient. The objectives of this work were to assess the isozymatic diversity in accessions of M. polymorpha and its relation with the phenotypic variability, and to establish possible genetic links with other species of Medicago. Forty on (mas) e accessions of M. polymorpha obtained from a wide range of climatic and edaphic conditions, and 16 accessions of M. arabica, M. rotata, M. rigidula, M. tornata, M. littoralis and M. truncatula, were evaluated for 12 isozyme systems. The results showed a low isozymatic diversity within accessions of M. polymorpha, and a lack of association between geographical distribution and isozyme diversity. Multivariate analysis allowed to cluster the species separately. M. arabica, another naturalized species in Chile, was the closest species to M. polymorpha, whereas M. littoralis, M. rigidula and M. rotata presented a higher genetic distance from M. polymorpha

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Bacterias con alta tasa de mutación: los riesgos de una vida acelerada/ High mutation rate bacteria: Risks of a high-speed life

GALÁN, JUAN CARLOS; BAQUERO, MARÍA ROSARIO; MOROSINI, MARÍA ISABEL; BAQUERO, FERNANDO
2006-03-01

Resumen en español El proceso evolutivo de un ser vivo se acelera cuanto mayor sea su capacidad para producir variabilidad genética, bien por mutación, bien por recombinación. Sin embargo, cuanto mayor sea esta capacidad, mayor también será el riesgo de acumular mutaciones del etéreas. La variabilidad genética es, por tanto, un proceso altamente regulado, de tal manera que las bacterias tienden a mantener una baja tasa de mutación. En diferentes poblaciones bacterianas analizadas ha (mas) y siempre un porcentaje variable de cepas con una tasa de mutación superior a la frecuencia modal del resto de la población. Existe una relación directa entre la proporción de cepas que mutan y el grado de estrés del ambiente. Así, en los procesos infecciosos crónicos, en los que el tratamiento antibiótico es constante durante períodos prolongados, se observan los mayores porcentajes de bacterias que mutan, cercano al 50% de la población. Esta selección positiva de bacterias que mutan es debida al enorme potencial que presentan para desarrollar resistencia antibiótica (100 veces superior a una bacteria normal). Esta capacidad ha sido explotada, en algunos centros de investigación, como un modelo natural de evolución acelerada para predecir la facilidad con la que determinadas variantes resistentes pueden aparecer, saber qué posiciones serán las más susceptibles a los cambios y cuál será el costo para la bacteria. El laboratorio de microbiología debe hacer un esfuerzo por detectar estas cepas mutadoras antes de que desarrollen mecanismos de resistencia e induzcan el fracaso terapéutico. Resumen en inglés The potential of producing genetic variability, either by mutation or by recombination, is the driving force of evolution in a living organism. Genetic variability is a quite regulated process in which bacteria tend to maintain a low mutation rate. However, a variable proportion of bacteria with a higher mutation rate than that of the modal is always present in any population. Moreover, a direct relationship exists between the proportion of mutator strains and environment (mas) al stress. In chronic infectious diseases, due to prolonged antibiotic regimens, nearly 50% of the population may be represented by mutating bacteria. Such a positive selection is due to the capacity of this type of strains to develop antibiotic resistance (100 fold higher than normal bacteria) This trait has been used as an accelerated evolution model to predict the ease of certain resistant variants to emerge as well as to infer which targets are more prone to be modified and the concomitant cost that such variability would imply to the organism. The Microbiology laboratory might then do an effort to detect mutating strains before the appearance of resistance mechanisms that may lead to therapeutic failures.

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Síndrome de Aicardi: variabilidad fenotípica y factores pronósticos/ Clinical outcome of distinct Aicardi syndrome phenotypes

Galdós, M.; Martínez, R.; Prats, J.M.
2008-01-01

Resumen en español Objetivo: Analizar y comparar la casuística de nuestro hospital con los casos descritos en la literatura de Síndrome de Aicardi. El Síndrome de Aicardi es una rara enfermedad genética que afecta a las mujeres, y se caracteriza por agenesia del cuerpo calloso asociada a otras malformaciones del sistema nervioso central y lagunas coriorretinianas. Métodos: Se presentan tres casos clínicos de Síndrome de Aicardi, con importantes diferencias fenotípicas y de evolució (mas) n de la enfermedad. Resultados: El primer caso es el caso más benigno de Síndrome de Aicardi descrito en la literatura, y se caracteriza por la baja morbilidad ocular, ausencia de epilepsia y de anomalías de la migración neuronal y desarrollo psicomotor normal. El segundo caso presenta larga supervivencia y pocas alteraciones oculares, pero un retardo severo en el desarrollo psicomotor. El tercer caso presenta alteraciones oculares más severas y mala evolución clínica con mortalidad a una edad temprana. Conclusiones: El Síndrome de Aicardi puede ser fenotípicamente heterogéneo presentando gran variabilidad en la severidad de características clínicas como el desarrollo psicomotor y el pronóstico de supervivencia. Nuestro estudio apoyaría que las anomalías de la migración neuronal y las lesiones coriorretinianas pueden ser factores pronósticos de esta enfermedad. Resumen en inglés Objective: Three cases of Aicardi Syndrome were diagnosed in our hospital. This syndrome is a rare, female-restricted genetic disease, characterized by agenesis of the corpus callosum, other central nervous system malformations, and chorioretinal lacunae. We have compared these cases with other cases of Aicardi Syndrome described in the world literature. Methods: We have reported the three cases of Aicardi Syndrome and detailed the important heterogeneity of phenotypic fe (mas) atures and clinical severity. Results: The most benign case (case number 1) was characterized by mild ocular morbidity, absence of both migration abnormalities and epilepsy, and normal psychomotor development. Case number 2 achieved long-term survival with mild ocular alterations, but had severe retardation in psychomotor development. Case number 3 had the most severe ocular abnormalities which evolved rapidly and resulted in early death. Conclusions: Aicardi Syndrome can be phenotypically heterogeneous, presenting with substantial variability in the severity of clinical features such as psychomotor development and survival. Our study indicates that cortical migration abnormalities and retinal lesions may be useful prognostic factors.

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Diversidad morfológica e isoenzimática de 22 progenitores de una población básica indehiscente de ajonjolí

Díaz, Antonio; Layrisse, Alfredo; Laya, Damaris; Tovar, Luis
2003-07-01

Resumen en español Se estudiaron 14 descriptores morfológicos y 2 isoenzimáticos para caracterizar la diversidad genética de los posibles 22 progenitores que formarán la población básica indehiscente de ajonjolí, Sesamum indicum L., PUCV4. Las frecuencias relativas de cada categoría para cada descriptor fueron procesadas para estimar dos índices de diversidad, el índice de Shannon y Weaver (H) y el índice de uniformidad (E). Con los datos electroforéticos se calculó el índice (mas) de diversidad de Nei (h). El índice H fue empleado para obtener un índice de información (I), el cual permitió cuantificar la variabilidad total y la contenida dentro y entre las agrupaciones generadas por un árbol Neighbor Joining y el Análisis de Coordenadas Principales. Se encontró una alta diversidad genética, expresada como descriptores polimórficos con estimados promedios de E y H igual a 0,71 y 0,54, respectivamente. Los caracteres más polimórficos fueron pubescencia de la cápsula, pubescencia del tallo, color de la semilla, color del labio inferior de la flor y número de cápsulas por nudo. El análisis multivariado generó dos grupos; G1 y G2, con cinco y nueve progenitores, respectivamente; el resto de la colección se presentó dispersa, representada por los genotipos más divergentes, grupo designado como GR, La diversidad total se descompuso en dos fuentes principales: la primera contenida dentro de GR y la segunda entre G 1, G2 y GR. Se concluye que los progenitores presentan suficiente variabilidad para formar la población básica PUCV4 con una amplia diversidad genética, necesaria para garantizar ganancias con la selección durante el proceso de mejoramiento genético. Resumen en inglés In order to characterize the genetic diversity of the possible 22 progenitors of the sesame indehiscent basic population PUCV4, 14 morphological and 2 isoenzymatic descriptors were studied. The relative frequencies of each category for each descriptor were processed to estimate two diversity indexes, the Shannon and Weaver index (H) and the Eveness index (E). Also, the Nei genetic diversity index was calculated from electrophoretic data. An information index (I) was gener (mas) ated from H to quantify the total variability, inside and among the groups generated by a Neighbor-Joining tree and a principal coordinate analysis. A high genetic diversity was found, expressed as polymorphic descriptors with H and E estimates of 0.71 and 0.54, respectively. The most polymorphic characters were capsule hairiness, stem hairiness, seed color, lower lip color of flower and capsule number per node. Multivariate analysis generated two groups of genotypes (G1 and G2), with five and nine elements, respectively; the rest of the collection was diffused, formed by the most divergent genotypes, designated as GR. Total diversity was partitioned in two main sources: the first one contained within GR, and the second one among G1, G2 and GR. As a conclusion, it may be state that the progenitora show enough variability to generate the basic population PUCV4 with the broad genetic diversity needed to guarantee genetic gains with selection during breeding.

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Una variedad genética de la UDP-glucuronosil transferasa asociada a toxicidad gastrointestinal por irinotecan/ A prevalent genetic variety of UDP-glycuronosyl transferase predicts high risk of irinotecan toxicity

Valsecchi, Matías; Garberi, Juan; Ferrandini, Silvia; Berenguer, Roxana; Trini, Ernesto; Politi, Pedro
2007-02-01

Resumen en español Los avances en genética y biología molecular han impulsado la aparición de nuevas áreas de estudio en la medicina, como la farmacogenómica, la cual intenta predecir la respuesta y toxicidad a drogas en función de la variabilidad genética de cada individuo, constituyendo los llamados síndromes fármacogenómicos. La oncología podría beneficiarse debido a la gran toxicidad de sus fármacos. Hay varios loci genéticos que se están analizando por su potencial valor (mas) predictivo y hasta ahora sólo tres de ellos demostraron cierto grado de utilidad clínica. En especial, el estudio del número de repeticiones del dinucleótido timina-adenina (TA) en el promotor de la enzima UDP-glucuronosil-transferasa (UGT) mostró ser capaz de predecir neutropenia severa en pacientes expuestos a dosis intermedias y altas de irinotecan. Comunicamos el caso de una paciente con cáncer de pulmón de células pequeñas que padeció toxicidad hematológica y gastrointestinal grave tras haber sido tratada con dosis relativamente bajas (65 mg/m²) de irinotecan, y en quien un análisis del ADN leucocitario mostró la presencia de homocigosis para siete repeticiones de TA. Este caso es un ejemplo de aplicabilidad clínica del test, se discute su utilidad como predictor de toxicidad y la conducta a tomar frente a pacientes con estas características. Resumen en inglés The advances in genetics and molecular biology have raised new areas in medicine, such as pharmacogenomics, which tries to predict drug responses and toxicities based on the individual genetic variability, describing the so called: pharmacogenomic syndromes. Oncology would find this development extremely useful because of the severe toxicity of chemotherapy. There are a lot of genetic loci under investigation for their potential in predicting drug toxicity, but only three (mas) of them have showed clinical usefulness up to now. In particular, quantification of the number of thymine-adenine (TA) dinucleotics in the promoter region of the UDP-glucuronosyl-transferase 1A1 enzime (TA indel) proved to be capable of predicting severe neutropenia in patients exposed to intermediate or high doses of irinotecan. Herein we report a case of a patient with small cell lung cancer who suffered severe hematological and gastrointestinal toxicity after being treated with relatively low doses (65 mg/m²) of irinotecan and whose leucocyte DNA analysis showed the presence of seven TA repetitions in both alleles. This case is an example of the clinical applicability and the utility of the test as a toxicity predictor. We also discuss the clinical decisions that may be taken with these patients.

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Caracterización morfoagronómica de la colección núcleo de la forma cultivada de frijol común del INIFAP/ Morphoagronomic characterization of the INIFAP core collection of the cultivated form of common bean

Vargas-Vázquez, M. Luisa P.; Muruaga-Martínez, José S.; Pérez-Herrera, Patricia; Gill-Langarica, Homar R.; Esquivel-Esquivel, Gilberto; Martínez-Damián, Miguel Á.; Rosales-Serna, Rigoberto; Mayek-Pérez, Netzahualcoyotl
2008-11-01

Resumen en español La caracterización de los recursos fitogenéticos es una herramienta útil para su conservación y aprovechamiento en el mejoramiento genético. Las 200 accesiones de la colección núcleo de frijol común (Phaseolus vulgaris L.) del Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias (INIFAP) de México y que representan la variabilidad de la especie en el país fueron analizadas con base en 45 características relativas a datos de pasaporte, fenolo (mas) gía y morfología de la planta, componentes de rendimiento, calidad de la semilla y reacción a enfermedades en Santa Lucía de Prías, México, en el 2003. Las características morfológicas de la planta relacionadas principalmente con la flor, hábito de crecimiento y semilla mostraron mayor capacidad discriminante y permitieron agrupar a las 124 accesiones que completaron su ciclo biológico con base en su origen geográfico y su hábito de crecimiento, principalmente. Algunas accesiones originarias del trópico de México mostraron precocidad y tolerancia a enfermedades. Los resultados resaltan la variabilidad genética significativa de la especie que está incluida en la colección núcleo del INIFAP, por lo cual se considera representativa de la forma cultivada de P. vulgaris en México. Resumen en inglés The characterization of phytogenetic resources is a useful tool for their conservation and exploitation in genetic improvement. The 200 accessions of common bean (Phaseolus vulgaris L.) core collection of the Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias (INIFAP) of México, which represent the variability of species in our country, were analyzed based on 45 characteristics related to passport data, plant phenology and morphology, yield componen (mas) ts, seed quality, and reaction to diseases, in Santa Lucía de Prías, México, in 2003. The morphological plant characteristics mainly related to flower, growth habit, and seed showed higher discriminating capacity and allowed the grouping of the 124 accessions, which completed their biologic cycle based mainly on their geographical origin and their growth habit. Some accessions originating from Mexican tropic presented precociousness and disease tolerance. The results highlight significant genetic variability of the species included in the INIFAP core collection; therefore, it is considered representative of the cultivated form of P. vulgaris in México.

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Efecto de la variabilidad en genotipos de Yuca sobre factores vinculados a la brotación y crecimiento de Esquejes

Velásquez, Ennodio
2006-01-01

Resumen en español Para estudiar la influencia de la variabilidad en genotipos de yuca (Manihot esculenta Crantz) sobre la brotación y crecimiento de sus tallos se condujo un experimento con ocho clones como MVen-07, MVen-88, MBol-12, SG-107-35, Bonifacia-N, Bonifacia-R, Canaria-D y UCV- 2105. Éstos fueron previamente cultivados bajo un mismo sistema de manejo y cosechados a los 11 meses de edad, seleccionándose tallos con diámetros de 2,5-3,5 cm a objeto de controlar fuentes de variaci (mas) ón de origen no genético. La clasificación de genotipos se hizo mediante un método basado en descriptores de la planta. Se utilizó un diseño en bloques al azar con ocho tratamientos y cuatro réplicas. En los esquejes de estos clones se evaluó la humedad, brotación y materia seca producida en la parte aérea y radical. En los genotipos predominó el porte de 1,51-2,50 m, tallos con crecimiento recto, hábito erecto, ramificaciones de cuatro niveles o más, raíces con textura rugosa, forma cilindro-cónica, felodermis crema-amarillo, pulpa blanca, hojas oblanceoladas, con siete lóbulos, pecíolo amarillo verdoso, tallos amarillo-verdoso, y nivel tóxico en raíces. Se encontraron diferencias significativas (P≤0,01) entre clones excepto para la brotación, propiedad que no fue afectada. Las diferencias en el crecimiento aéreo y radical de los esquejes fueron atribuidas a causas de naturaleza genética reflejada en características tales como porte de planta, niveles de ramificación, forma de lóbulos de las hojas, altura de ramificación y decumbencia. El mejor balance obtenido respecto a las variables estudiadas se encontró en los genotipos MVen-07, Bonifacia-R y SG-107-35. Resumen en inglés In order to study the influence of cassava genotypes variability on sprouting and growth of stems cuttings, an experiment was conducted with eight clones identified as MVen-07, MVen-889, MBol-12, SG-107- 35, Bonifacia-N, Bonifacia-R, Canaria-D and UCV-2105. Previously, the clones were cultivated under similar managment system and harvested at 11 months old, selecting stems with diameters from 2.5 to 3.5 cm, for controlling no genetic sources of variation. A randomized com (mas) pletely block design with four replications was applied, and water content, sprouting, and aerial and root dry matter on the stems cuttings were evaluated. Characteristics more frequently found were plant size from 1,51 to 2,50 m, stems with right growth, erect habit, ramifications with four and more levels, roots with corrugated texture, cylinder- conic shape, cream- yellow felodermis, and white flesh, oblanceolate leafs, with seven lobules, yellow-green petioles, yellow- green stems and toxic roots. Significant differences were found between clones (P≤0.01) except for sprouting, factor that was not affected by genotype variations. The differences related to aerial and radical growth of stems cuttings was attributed to genetic reasons in characteristics, such us plant size, ramification levels, shape of leaf lobules, ramification height and decumbence. The best balance related to the studied variables was found on genotypes MVen-07, Bonifacia-R and SG-107-35.

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Evaluación y diagnóstico de la Hipertensión Arterial/ Assessment and diagnosis of high blood pressure

Sellén Crombet, Joaquín; Sellén Sanchén, Elizabeth; Barroso Pacheco, Lourdes; Sellén Sánchez, Sybert
2009-03-01

Resumen en español La hipertensión arterial es un factor de riesgo cuyo diagnóstico se establece por una simple variable numérica aunque se ha comprobado que es un síndrome multifactorial que produce alteraciones sistémicas, complicaciones y muerte. Su definición ha variado con el tiempo y el mayor conocimiento. Es importante la medición correcta de la presión arterial, conocer su variabilidad y su fisiopatología donde la teoría genética del sistema renina angiotensina aldosteron (mas) a ha demostrado ser la que predomina. La clasificación y la estratificación del riesgo cardiovascular son elementos importantes cuando se realiza una cuidadosa historia clínica del paciente que unido a los exámenes de laboratorio, permiten descartar y tratar las causas de HTA secundarias. En el presente estudio se analizan todos estos factores y se discute sobre prehipertensión. Resumen en inglés High blood pressure is a risk factor where diagnosis is made by means of a simple numerical variable although it was confirmed that it is a multifactorial syndrome producing systemic alterations, complications and death. Its definition has changed with time and a great knowledge. It is important correct measurement of arterial pressure, to know its variability, and its physiopathology where genetic theory of rennin-angiotensin aldosterone system has shows to be the predom (mas) inant one. Classification and stratification of cardiovascular risk are significant elements when we make a careful medical record of patient, and joined with lab examinations allows us to rule out and to treat the causes of a secondary HBP. In present study all factors are analyzed and pre-hypertension stage is discussed.

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Establecimiento de una colección de trabajo de uchuva del suroccidente colombiano/ Establishment of a Cape gooseberry working collection collected in the colombian southwest zone

Bonilla Betancourt, Martha Liliana; Espinosa Piedrahíta, Katherine; Posso Terranova, Andrés Mauricio; Vásquez Amariles, Herney Darío; Muñoz Flórez, Jaime Eduardo
2008-06-01

Resumen en español Physalis peruviana L. es una especie frutícola promisoria para la zona andina colombiana; sin embargo, no ha sido un recurso genético prioritario de conservación. En el estudio se estableció una colección de trabajo registrada en una base de datos computarizada de 222 accesiones recolectadas en los departamentos de Nariño, Valle del Cauca, Cauca, Caldas, Quindío y Cundinamarca que representan la variabilidad existente de cultivariedades nativas y espontáneas. Las (mas) semillas del material recolectado se encuentran en el cuarto frío del Centro Experimental de la Universidad Nacional de Colombia sede Palmira. Esta colección contribuye a la conservación y al estudio de la diversidad de esta especie y a la disponibilidad de una base genética para futuros programas de selección y mejoramiento genético. Resumen en inglés Physalis peruviana L. is a promissory fruit specie for the Colombian Andean zone, however, it has not been a priority for genetic resource conservation. In this study a working collection of 222 accessions collected in the states of Nariño, Valle del Cauca, Cauca, Caldas, Quindío and Cundinamarca of Colombia was established and registered in a computational data base. It represent the variability present of native and spontaneous varieties. Seeds of the collected materi (mas) als are available in cold room in the Experimental Center of The National University of Colombia at Palmira’s campus. This collection contributes to the conservation and genetic diversity studies of this specie. In addition its contributes to implement breeding programs.

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Caracterización morfológica de poblaciones nativas de pasto banderita [Bouteloua curtipendula (Michx.) Torr.] en México/ Morphological characterization of native populations of sideoat grama [Bouteloua curtipendula (Michx.) Torr.] in Mexico

Morales-Nieto, Carlos R.; Quero-Carrillo, Adrián; Pérez-Pérez, Jorge; Hernández-Garay, Alfonso; Le-Blanc, Olivier
2008-11-01

Resumen en español Los descriptores morfológicos involucran el manejo de atributos para efectuar mejoramiento genético de especies forrajeras. Los objetivos del presente estudio fueron explorar la diversidad morfológica de poblaciones nativas de pasto banderita [Bouteloua curtipendula (Michx.) Torr.] y evaluar sus principales características morfológicas. Se calificaron y analizaron 177 ecotipos al momento de la floración mediante 14 descriptores morfológicos cuantitativos para conoc (mas) er y definir la estructura poblacional. Los datos fueron analizados usando componentes principales (ACP) y análisis de conglomerados jerárquico (ACJ). Hubo una alta variabilidad morfológica entre ecotipos. Los tres primeros componentes principales (CP) explicaron 63.3% de la variación total observada. Para el CP1 las variables más importantes fueron longitud de inflorescencia, diámetro de tallo en la base y en la altura media de los hijatos; para el CP2, densidad de tallos, altura de forraje y altura de planta y en el CP3, longitud de ramas, longitud del raquis de la inflorescencia y número de ramas. Estas variables contribuyeron significativamente con los valores más altos para explicar la variación total. El CP1 agrupó variables relacionadas con el tallo; con CP2 se observó que el potencial de forraje está relacionado con la densidad de tallos y altura de forraje; con CP3, que la longitud y número de ramas se relacionan con el rendimiento de semilla. Al aplicar el ACJ se obtuvieron cinco grupos: I con 19 ecotipos, II con 45, III con 29, IV con 22 y V con 62. Se detectaron ecotipos con alto potencial forrajero de acuerdo con su variabilidad morfológica: por tanto, se dispone de riqueza genética en el pasto banderita. Resumen en inglés The morphological descriptors involve the management of attributes to carry out breeding of forage species. The objectives of the present study were to explore the morphological diversity of native populations of sideoat grama [Bouteloua curtipendula (Michx.) Torr.] and to evaluate its principal morphological characteristics. To this effect, 177 ecotypes were qualified and analyzed at the moment of flowering by means of 14 quantitative morpological descriptors to know and (mas) define the population structure. The data were analyzed using principal components (PCA) and hierarchic analysis of conglomerates (HAC). There was a high morphological variability among ecotypes. The first three components (PC) explained 63.3% of the total variation observed. For PC1, the most important variables were length of inflorescence, stem diameter at the base and at the mean height of the tillers; for PC2, tiller density, forage height and plant height, and in PC3, branch length, length of the inflorescence of the rachis and number of branches. These variables contributed significantly with the highest values to explain the total variation. PC1 grouped variables related to the tiller; with PC2 it was observed that the forage potential is related to tiller density and forage height; with PC3, that the length and number of branches are related to seed yield. When the HAC was applied, five groups were obtained: I with 19 ecotypes, II with 29, IV with 22 and V with 62. Ecotypes with high forage potential were detected according to their morphological variability; therefore, there is genetic wealth in sideoat grama.

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Predisposición genética al sangrado durante el tratamiento con anticoagulantes orales/ Genetic predisposition to bleeding during treatment oral anticoagulants treatment

Montes, R.; Nantes, O.; Molina, E.; Zozaya, J.; Hermida, J.
2008-12-01

Resumen en español La anticoagulación conseguida durante el tratamiento con anticoagulantes orales antagonistas de la vitamina K (AVK) varía entre unos pacientes y otros debido a factores individuales y ambientales. La intensidad de la anticoagulación condiciona el riesgo hemorrágico. Por tanto, es probable que los pacientes especialmente sensibles a los AVK corran un riesgo hemorrágico mayor, especialmente durante las primeras semanas. En esta revisión se va a discutir el papel de un (mas) a serie de polimorfismos de las enzimas involucradas en la metabolización de los AVK o en el ciclo de la vitamina K. Dos polimorfismos del citocromo P450 2C9 y uno de la enzima VKORC1 son responsables de un alto porcentaje de la variabilidad observada en la sensibilidad a los AVK. Aunque parece que dichas alteraciones genéticas se asocian con el riesgo de experimentar una hemorragia severa, confirmar este extremo requerirá estudios más amplios y mejor diseñados. Resumen en inglés The degree of anticoagulation obtained during oral anticoagulation therapy with vitamin K antagonists (VKA) varies among patients due to individual and environmental factors. The rate of anticoagulation influences the hemorrhagic risk. Therefore, it is plausible that patients specially sensitive to oral anticoagulants are at higher hemorrhagicc risk, specially during the first weeks. The role of a series of polymorphisms of the enzymes involved in the metabolism of VKA or (mas) in the vitamin K cycle are reviewed. Three polymorphisms, two in the cytochrome P450 2C9 and one in the VKORC1 enzyme, are responsible for a high portion of the variability observed in the sensitivity to AVK. Although the available literature suggests that these genetic variants could increase the risk of severe hemorrhage, larger, well designed studies are needed to confirm this notion.

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Propagación asexual de uchuva (Physalis peruviana L.) en diferentes sustratos y a distintos niveles de auxina/ Asexual propagation of cape gooseberry (Physalis peruviana L.) using different substrates and auxin levels

Moreno, Nelson Hernán; Álvarez-Herrera, Javier Giovanni; Balaguera-López, Helber Enrique; Gerhard, Fischer
2009-12-01

Resumen en español La uchuva es el fruto exótico de mayor exportación en Colombia. Se propaga comercialmente mediante semillas, pero presenta alta variabilidad genética, lo cual determina que tanto el crecimiento y vigor de la planta como el rendimiento y la calidad del fruto sean igualmente heterogéneos. La propagación asexual mediante esquejes puede ser una alternativa viable, pero se debe garantizar un buen prendimiento y la formación de un sistema radical vigoroso. Para ello, dura (mas) nte un periodo de 90 días se evaluó el efecto de cinco concentraciones de ácido indolbutírico (AIB; 0, 200, 400, 600, 800 mg L-1) y dos sustratos (mezcla de cascarilla de arroz con suelo negro en relación 1:1 v/v, y turba canadiense), sobre el enraizamiento y crecimiento de esquejes terminales de plantas adultas de uchuva. Con la aplicación de 800 mg L-1 de AIB a esquejes sembrados en turba se obtuvieron los mejores resultados, en términos del porcentaje de enraizamiento, la longitud de raíz, la masa fresca y seca de la raíz, el número de hojas y el área foliar. Resumen en inglés Cape gooseberry, which is the most exported Colombian exotic fruit, is commercially propagated by seed, but its high genetic variability causes growth, vigor, yield and fruit quality heterogeneity. Asexual propagation by cuttings can be a viable alternative but it is necessary to ensure adequate rhyzogenesis and the formation of a strong root system. For a period of 90 days, the present study evaluated the effect of five concentrations of Indole Butyric Acid (IBA; 0, 200, (mas) 400, 600 and 800 mg L-1) and two substrates (peat moss, and a 1:1 v/v mixture of black soil and rice husks) on the rooting and growth of terminal cuttings from adult plants. The best results were observed when applying 800 mg L-1 IBA to cuttings planted in peat moss. This treatment combination determined the highest rooting percentage and the largest root length, roots fresh and dry mass, leaf number and leaf area scores.

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ESTIMACIÓN DE PARÁMETROS GENÉTICOS PARA PESO AL DESTETE EN GANADO BLANCO OREJINEGRO (BON) EN EL NOROCCIDENTE COLOMBIANO/ ESTIMATION OF GENETIC PARAMETERS FOR WEANING WEIGHT IN WHITE OREJINEGRO CATTLE IN THE COLOMBIAN NORTHWEST

Cañas á, Jhon; Ramirez T, Julian; Arboleda A, Oscar; Ochoa S, Jorge; Vergara G, Oscar; Cerón-Muñoz, Mario
2008-01-01

Resumen en español Objetivo.Estimar los componentes de varianza genético aditivo directo y materno para peso al destete en ganado criollo Blanco Orejinegro (BON). Materiales y métodos. Se utilizaron 356 registros entre los años 1988 al 2007, del núcleo de animales BON puro de la hacienda Vegas de la Clara de la Universidad de Antioquia. El análisis fue realizado utilizando un modelo animal incluyendo los efectos fijos de sexo y época de destete, y como covariable la edad al destete y (mas) los efectos aleatorios genético directo, genético materno, ambiente permanente y residual. Resultados. El peso promedio al destete fue de 196.3 ± 31.4 kg, a una edad promedio de 271.8 ± 13.5 días. Se encontraron 21 animales endogámicos con un coeficiente de endogamia de 24.5%. La heredabilidad directa y materna fueron de 0.63 ± 0.36 y 0.22 ± 0.19 con una correlación entre el efecto directo y el materno de -0.78 ± 0.21. Conclusión. De acuerdo a los resultados, existe variabilidad genética en el núcleo BON para esta característica. Resumen en inglés Objective.To estimate the direct and maternal additive genetic components of variance for weaning weight in native cattle, Blanco Orejinegro (BON). Materials and methods. 356 records of the animal nucleus pure breed BON belonging to Vegas de la Clara farm, property of Universidad de Antioquia, between the years 1988 to 2007 were used. Analysis was made using an animal model including sex and weaning time fixed effects, and as covariable weaning age and as random effects, (mas) direct genetic, maternal genetic, permanent environmental and residual. Results. Mean weaning weight was 196.3 ± 31.4 kg at a mean age of 271.8 ± 13.5 days. 21 inbreeding animals had an inbreeding coefficient of 24.5%. Direct and maternal heritability was of 0.63 ± 0.36 and 0.22 ± 0.19 respectively, with a correlation between the direct and maternal effect of -0.78 ± 0.21. Conclusions. According to these results, genetic variability exists in the nucleus BON for this characteristic

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Diversidad biológica humana en la provincia de Salta/ Human biological diversity in Salta

Acreche, Noemí; Albeza, María Virginia; Caruso, Graciela B.; Broglia, Viviana G.; Acosta, Rebeca
2004-05-01

Resumen en español La Provincia de Salta cuenta con una marcada heterogeneidad geoestructural, distinguiéndose básicamente las siguientes unidades: Puna, Valle Calchaquí, Valle de Lerma y Chaco, habitadas por el hombre desde hace al menos 9000 años. Las características ambientales y topográficas pueden determinar el aislamiento y la adaptación de las poblaciones provocando su diferenciación a nivel genético. Para poner a prueba esta relación, se consideraron variables genéticas y (mas) parámetros demográficos. En la Puna se analizaron los grupos eritrocitarios (Santa Rosa de los Pastos Grandes, Tolar Grande y Cobres) y leucocitarios (Cobres), heterocromatina constitutiva (Tolar Grande y Cobres) y STRs (San Antonio de los Cobres y Cobres) además de indicadores de Demografía Genética (Santa Rosa de los Pastos Grandes, Tolar Grande, Olacapato, San Antonio de los Cobres y Cobres). En el valle de Lerma se estimaron los parámetros demográfico-genéticos (San Agustín y Chicoana) y en el Chaco se analizó la heterocromatina constitutiva. Asimismo, se incorporaron al análisis los datos de Matson et al (1969) y Pagés Larraya (1978) referentes a grupos eritrocitarios del Valle Calchaquí y el Chaco. Los procesos microevolutivos estudiados (Selección Natural, Deriva Génica y Flujo Génico) a partir de medidas de variabilidad genética intra e interpoblacional, Indices de Oportunidad para la Selección Natural y Coeficientes de Endogamia y Aislamiento Reproductivo evidencian un fuerte y continuado contacto entre las poblaciones, moderada diferenciación y en algunos casos alta endogamia. Resumen en inglés The study area is highly heterogeneous, presenting the following ecological units: Puna, Valle Calchaquí, Valle de Lerma and Chaco. Environment and topography can determine isolation and adaptation of human population, inducing genetic differentiation. In order to consider this fact, several genetic and demographic variables were studied. In Puna, eritrocitary variants were analized in Santa Rosa de los Pastos Grandes, Tolar Grande and Cobres, leucocitary in Cobres, whil (mas) e Constitutive Heterochromatine was studied in Tolar Grande and Cobres and STRs in San Antonio de los Cobres and Cobres. On the other hand, Genetic Demography was used to study Opportunity for Selection, Reproductive Isolation and Endogamy in Santa Rosa de los Pastos Grandes, Tolar Grande, Olacapato, San Antonio de los Cobres and Cobres. In Lerma Valley, parameters for Genetic Demography were estimated in San Agustín and Chicoana; in the Calchaquí Valley in Pichao and La Alumbrera and in Chaco Constitutive Heterochromatine was analized. Data published by Matson et al (1969) and Pagés Larraya et al (1978) were included. Microevolutive processes studied (Natural Selection, Genetic Drift and Gene Flow), variability measures show strong and continued contact among populations, moderate differentiation and, in some cases, high endogamy.

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Mecanismos de evasión inmunitaria del Virus de Hepatitis C. Revisión./ Immune evasion mechanisms of Hepatitis C virus. Review.

Porto-Espinoza, Leticia; Cuadra-Sánchez, César; Moronta, Reyna; Monsalve-Castillo, Francisca; Callejas-Valero, Diana
2006-03-01

Resumen en español El virus de Hepatitis C (VHC) constituye un problema de salud pública mundial. La mayoría de las infecciones se tornan crónicas, ocasionando con frecuencia cirrosis hepática y carcinoma hepatocelular a largo plazo, precisándose no pocas veces de transplantes hepáticos para prolongar la vida del individuo. El mantenimiento de una infección crónica implica la evasión al sistema inmunitario del hospedero. Los mecanismos virales involucrados en dicha evasión están (mas) siendo estudiados arduamente con el fin de desarrollar nuevas terapias preventivas y curativas efectivas contra el virus. Una característica importante, la extrema variabilidad genética del virus, se cree que contribuya al escape inmunitario al cambiar continuamente los epítopos expuestos a la detección; sin embargo, algunos trabajos sugieren que no es necesaria para el establecimiento de la cronicidad de la infección. Por otra parte, el estudio comparativo de la respuesta inmunitaria de los pacientes que se recuperan espontáneamente con la de aquellos infectados de manera crónica, señala que algunas proteínas virales podrían inducir cierta inmunosupresión indispensable para la persistencia en el hospedero. Concretamente, se cree que las proteínas NS5A, E2 y core modulan ciertos mecanismos de las respuestas innata y específica. El análisis de los hallazgos relacionados con el tópico permite sugerir la existencia de una sinergia entre la variación genética y la inmunosupresión para evadir de manera continua la detección y destrucción por parte del sistema de defensas del individuo. Resumen en inglés Hepatitis Virus C (HCV) is a major worldwide health care problem. HCV infection usually tends to become chronic and can generate long term hepatic cirrhosis and hepatocellular carcinoma. These affections frequently require a liver transplant to prolong the patients life. Maintenance of the chronic infection implies evasion of the host immune responses. Viral mechanisms involved in this evasion are being profusely studied in order to develop new and effective therapies and (mas) vaccines against HCV. An important HCV characteristic, its high genetic variability, has been proposed to contribute to immune evasion by means of antigenic change and variation. On the other hand, some studies suggest that genetic variability is not necessary to establish a chronic infection. Other studies related to immune responses in patients with spontaneous virus clearance and patients with chronic infection show a possible immunosuppression caused by some viral proteins, that may be essential to persist in the host. Specifically, it is believed that viral proteins NS5A, E2 and Core modulate some innate and specific immune mechanisms. The analysis of all data related to this topic suggests the existence of synergistic cooperation between viral variation and immunosuppression to overcome the immune defenses of the host.

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La cachama blanca (Piaractus brachypomus), una especie potencial para el mejoramiento genético/ White cachama (Piaractus brachypomus), a potencial species for genetic improvement

Mesa-Granda, Martha N; Botero-Aguirre, Mónica C
2007-01-01

Resumen en español En Colombia, la piscicultura continental es una alternativa de seguridad alimentaria, que tiene un alto incremento (10% anual), considerándose especies como Tilapia (Oreochromis sp) y cachama blanca (Piaractus brachypomus), los dos renglones más importantes para su desarrollo. Aunque la cachama blanca es una especie en la cual se han realizado investigaciones que han demostrado su potencial zootécnico, gracias a características tales como poseer hábitos omnívoros, a (mas) daptación a diferentes tipos de producciones, gran docilidad y buena tasa de conversión alimenticia, se han desarrollado pocos estudios acerca de parámetros genéticos, que involucren la caracterización fenotípica, variabilidad genética y fenotípica, coeficiente de heredabilidad, correlaciones genéticas de sus características productivas más importantes; estos aportarían información para la toma de decisiones en el establecimiento de programas de mejoramiento genético, especialmente en características que limitan su desempeño comercial en el mercado internacional, como es la de ‘número de espinas intramusculares’ (EIMT). Resumen en inglés In Colombia continental pisciculturehas shown a significant growth (by 10% per year), because it is considered a good source of high quality protein for human beings. Some researches have proven that cachama blanca (Piaractus brachypomus) has several advantages because of its omnivorous behaviour, adaptation to different types of production, high docility, and good rate of food conversion among others. Very few studies have been done regarding white cachama`s genetic para (mas) meters such as phenotypic characterization, genetic variability, inheritance coefficient and other genetic correlation about its most important productive characteristics. This knowledge would be extremely useful at the time of making decisions concerning the establishment of programs for genetic improvement, particularly considering characteristics that impair its commercial performance in the international trade market such as the number of intramuscular spines.

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Mycobacterium tuberculosis: Espoligotipos en el Estado Carabobo, Venezuela/ Mycobacterium tuberculosis: Spoligotypes in the Carabobo State, Venezuela

Sequera C, Mónica; Delgado S, Víctor; Araque M, Wolfan; Torrealba O, Mariela; Núñez M, Raimunda; Da Mata J, Omaira; Abadía P, Edgar; Takiff, Howard; De Waard, Jacobus
2008-10-01

Resumen en español Con el objeto de estudiar la variabilidad genética de las cepas de Mycobacterium tuberculosis circulantes en el Estado Carabobo, Venezuela, se empleó la técnica de spoligotyping para caracterizar 317 cepas de M. tuberculosis aisladas de pacientes con baciloscopia y cultivo positivo, residentes en diferentes distritos sanitarios. Los espoligotipos obtenidos se contrastaron con la base de datos nacional y mundial (SpolDB4.0); 220 aislados (69,4%) se agruparon en 24 clust (mas) ers, con predominio de la familia LAM (34%). A diferencia de otras regiones venezolanas, el espoligotipo 605 fue el más frecuente con 46 aislados (14,5%). Se identificaron 97 (30,6%o) aislados únicos, 19 reportados en SpolDB4.0 y 78 no descritos. Co-infección con el virus de inmunodeficiencia humana se detectó en 11 pacientes (3,5%o). Los resultados son un aporte al estudio de la transmisión de la tuberculosis a nivel regional y nacional y sugieren que existen diferencias regionales en las cepas más comunes. La cepa 605, poco común fuera de Venezuela, requiere de estudios epidemiológicos adicionales Resumen en inglés In order to study the genetic variability oí Mycobacterium tuberculosis circulating in the Carabobo State at Venezuela, 317 strains of M. tuberculosis isolated from patients living in different health districts whose acid fast smears were positive, were included. Each strain was characterized by spoligotyping and the pattern compared with the national and worldwide SpolDB4.0 databases; 220 isolates (69.4%) were grouped in 24 clusters, being LAM the most common family (34 (mas) %). In contrast to other Venezuelan regions, the most common Carabobo spoligotype was number 605, with 46 isolates (14.5%). In addition, there were 97 (30.6%) orphan spoligotypes, 19 of which are found in SpolDB4.0, and 78 non described. Co-infection with human irnmunodeficiency virus was detected in 11 patients (3.5%). These results show high genotypic variability of M. tuberculosis in the región, contributing with new information for a better understanding of tuberculosis transmission in Venezuela

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Caracterización polifásica de salmonella spp: Aislada de campos agrícolas de melón (cucumis melo) y cilantro (coriandrum sativum)/ Polyphasic typing of salmonella spp: Isolated from cantaloupe melon (cucumis melo) and coriander (coriandrum sativum) fields/ Caracterização polifásica de salmonella spp: Isolada de campos agrícolas de melão (cucumis melo) e coentro (coriandrum sativum)

Acedo-Félix, Evelia; Núñez-Hernández, Yolanda; Pérez-Morales, Rosalva; Iñiguez-Palomares, Claudia M; Castillón-Campaña, Lucía
2009-06-01

Resumen en portugués Avaliou-se a diversidade sorológica e genética de cepas de Salmonella spp. isolada de campos de cultivo de melão Cantalupo (Cucumis melo) e coentro (Coriandrum sativum). Para identificar ao patógeno foram realizadas provas bioquímicas, sorologia, suscetibilidade a antibióticos e caracterização por PFGE. Encontraram-se 11 amostras contaminadas dos campos de coentro e 7 dos de melão. Isolou-se Salmonella anatum e S. give, principalmente. Somente uma das cepas apres (mas) entou resistência à tobramicina. O PFGE mostrou que cepas do mesmo sorogrupo, produziram padrões eletroforéticos similares e a análise polifásica desprendeu cinco grupos distintos com similitude menor a 35%. É necessário intensificar as boas práticas agrícolas e de produção, já que os sorogrupos identificados têm sido envolvidos em surtos epidêmicos. Por outro lado, a análise polifásica mostrou variabilidade genômica e além disso permite supor que as cepas de S. give são clonais, não sendo assim para S. anatum, que esteve presente em diferentes amostras. Resumen en español Se evaluó la diversidad serológica y genética de cepas de Salmonella spp. aislada de campos de cultivo de melón Cantaloupe (Cucumis melo) y cilantro (Coriandrum sativum). Para identificar al patógeno se realizaron pruebas bioquímicas, serología, susceptibilidad a antibióticos y caracterización por PFGE. Se encontraron 11 muestras contaminadas de los campos de cilantro y 7 de los de melón. Se aisló Salmonella anatum y S. give, principalmente. Solo una de las cep (mas) as presentó resistencia a tobramicina. El PFGE mostró que cepas del mismo serogrupo, produjeron patrones electroforéticos similares y el análisis polifásico desplegó cinco grupos distintos con similitud menor al 35%. Es necesario intensificar las buenas prácticas agrícolas y de producción, ya que los serogrupos identificados han sido involucrados en brotes epidémicos. Por otro lado, el análisis polifásico mostró variabilidad genómica y además permite suponer que las cepas de S. give son clonales, no así para S. anatum, que estuvo presente en diferentes muestras. Resumen en inglés The serological and genetic diversity of Salmonella spp. strains isolated from Cantaloupe melon (Cucumis melo) and coriander (Coriandrum sativum) fields were evaluated. Biochemical test, serology, antibiotic resistance and PFGE were performed to identify isolated strains. Eleven contaminated samples from coriander fields were found, and seven from melon fields. The serogroups identified were mainly Salmonella anatum and S. give. Only one strain was resistant to tobramicyn (mas) . PFGE showed five electrophoretic profiles, in agreement with the identified serotypes and in the polyphasic analysis five clusters were observed (

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Polimorfismo genético de la kappa-caseína en ganado criollo limonero/ Genetic polymorphism of kappa-casein in creole limonero bovine

Rojas, Inioska; Aranguren -Méndez, José; Portillo, María; Villasmil-Ontiveros, Yenen; Valbuena, Emiro; Rincón, Xomaira; Contreras, Gloria; Yañez, Luis
2009-12-01

Resumen en español Con el objeto de estudiar el polimorfismo del gen CSN3 en la raza bovina Criollo Limonero, se extrajeron muestras séricas de 163 individuos (machos y hembras), los cuales fueron caracterizados mediante la técnica PCR-RFLP. Los resultados obtenidos indican que las frecuencias encontradas correspondieron a 0,11; 0,56 y 0,33 para los AA, AB y BB, respectivamente, correspondiendo a frecuencias alélicas de 0,39 para el alelo A y 0,61 para el B, respectivamente. Cabe destaca (mas) r que a partir de esta información de la CSN3 y su relación con caracteres, tales como la producción de leche y rendimiento quesero, se pueden llevar a cabo planes de mejoramiento asistido por marcadores, garantizando el mantenimiento de la variabilidad genética de estas poblaciones locales que se caracterizan por censos reducidos y la amenaza constante por cruzamientos con razas mejoradoras o comerciales, que buscan incrementar el volumen de producción de leche en detrimento de la calidad del producto; así mismo, se indica la ventaja potencial que presenta la leche del ganado Criollo Limonero en la producción de quesos, por mostrar mayoritariamente alelos del tipo B de la CSN3. Resumen en inglés In order to assess the polymorphism of CSN3 gen in Limonero Creole breed, blood samples were collected from 163 male and female individuals, with which characterization through RFLP-PCR was conducted. Results showed that genotypic frequencies were 0.11, 0.56 and 0.33 for AA, AB and BB, respectively. Allelic frequencies were 0.39 and 0.61 for allele A and B, accordingly. It is important to mention that with this information of CSN3 and its relationship with some traits suc (mas) h as milk production and cheese productivity, markers-assisted genetic improvement plans can be undertaken, which would maintain genetic variability of these local populations characterized by small numbers of animals and by the constant threat of crossbreeding with improved or commercial breeds, with the objective of increasing milk production over product quality; moreover, a potential advantage of Limonero Creole breed in milk production by its having mainly B-type alleles in CSN3 is shown.

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Selección masal para la adaptación a clima templado de razas tropicales y sub-tropicales de maíz de méxico/ Mass selection for adaptation to temperate climate of tropical and sub-tropical races of mexican maize

Pérez-Colmenárez, Alberto; Molina-Galán, José; Martínez-Garza, Ángel; García-M, Pedro; Reyes-López, Delfino
2007-12-01

Resumen en español México es considerado el lugar donde se encuentra la mayor diversidad genética del maíz (Zea mays L.). Sin embargo, el aprovechamiento de esa diversidad se ha limitado al desarrollo de variedades e híbridos de germoplasma proveniente de razas adaptadas a cada región agrícola por lo que la adaptación de germoplasma se presenta como una opción para ampliar la variabilidad genética en los programas de mejoramiento genético. La selección masal visual (SMV), utiliza (mas) ndo el aspecto de planta y mazorca como criterio de selección, es una estrategia en los programas de mejoramiento para adaptar germoplasma exótico. Considerando el valor potencial que ofrece el germoplasma exótico, a partir del año 1989 se sometieron tres razas de maíz de clima subtropical y siete del trópico de México a selección masal visual (SMV) para adaptación en Montecillo, estado de México, donde prevalecen condiciones de clima templado. Durante el ciclo primavera-verano de 1998 en Montecillo y Tecámac fueron evaluadas la variedad original de cada raza, ocho o nueve ciclos de SMV obtenidos de cada raza y cinco variedades locales, en un diseño de bloques completos al azar con cuatro repeticiones. En general, el último ciclo de selección de las razas superó en rendimiento a las variedades locales, lo cual sugiere que SMV fue un método efectivo en la adaptación de germoplasma. El avance genético promedio por ciclo de selección para rendimiento de mazorca por planta fue de 24,6 % en Pepitilla, 18,2 % en Olotillo, 12,5 % en Nal-Tel, 10,2 % en Tabloncillo, 9,1 % en Tepecintle, 6,6 % en Tuxpeño, 5,6 % en Comiteco, 4,5 en Zapalote Chico, 3,7 % en Vandeño y 2,5 % en Celaya Resumen en inglés Mexico is the place with the major genetic diversity of maize (Zea mays L.); however, plant breeding programs have been limited to the obtainment of improved open pollinated varieties and hybrids from races adapted to specific agricultural regions, so the adaptation of exotic germplasm is an option to broaden the genetic variability of breeding programs. Visual mass selection (VMS) using the plant and ear aspect as selection criterion is an important strategy in maize bre (mas) eding programs to adapt exotic germplasm. Considering the potential value that the exotic germplasm has to improve maize, in 1989 three subtropical and seven tropical mexican maize races were submited to VMS for adaptation in Montecillo, México, where temperate climate conditions prevail. The original varieties, eight or nine VMS cycles of each race plus five local varieties were evaluated for yield in the 1998 spring-summer period at Montecillo and Tecámac, México, in a randomized completely block design with four replications. In general, the last cycle of selection surpassed the yield of local varieties, suggesting that VMS was an effective method to adapt exotic germplasm. The mean genetic advance per VMS cycle for ear yield per plant was 24.6 % in Pepitilla, 18.2 % in Olotillo, 12.5 % in Nal-Tel, 10.2 % in Tabloncillo, 9.1 % in Tepecintle, 6.6 % in Tuxpeño, 5.6 % in Comiteco, 4.5 % in Zapalote Chico, 3.7 % in Vandeño, and 2.5 % in Celaya

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Utilización del diseño TTC para detectar epistasis en soya/ Use of the diseñ TTC to detect epistasis in soybean

Acevedo Barona, Marco Antonio; Colombari Filho, José Manoel; Olivio Geraldi, Isaías
2009-09-01

Resumen en español El estudio de la naturaleza de la variabilidad genética existente en una población es importante, no sólo para la selección del tipo de cultivar, sino también para la escogencia del método de mejoramiento más apropiado. Con el objetivo de estudiar la variancia epistática para el carácter rendimiento en granos en soya, Glycine max L., fue utilizando el análisis "Triple Test Cross" (TTC) modificadopara especies autógamas por Jinks et al., 1969. Elmaterial experim (mas) ental utilizado en este trabajo estuvo conformado por 32 líneas (Pi), escogidas aleatoriamente de una población entre los progenitores PI 123439 y PI 239235; las líneas Pi fueron posteriormente cruzadas con otras 2 líneas testadoras (L1 y L2) de la misma población, contrastantes para rendimiento en granos, las cuales fueron usadas como testadoras. Durante el ciclo 2006/2007, fueron evaluados 100 tratamientos en el arreglo experimental látice triple triplicado en parcelas experimentales de 2,00 metros de longitud, separadas 0,50 metros. Considerando la metodología del análisis biométrico, el contraste permitió detectar epistasis significativa para rendimiento en grano en soya, por las pruebas F y t. Entonces, es posible concluir que en soya, el carácter rendimiento en granos está afectado por la interacción entre los loci (epistasis) que la determinan Resumen en inglés The study of the nature of the genetic variability present in a population is important, not only for the selection of the type of the cultivar, but also for the selection of the more appropriate breeding method. In order to study the epistatic variation for grain yield in soybean, the "Modified Triple Test Cross" (TTC) method for plant self (Jinks et al., 1969) was used. The experimental material used in this work was conformed by 32 lines (Pi), chosen randomly, which la (mas) ter were crossed with other 2 lines of the same population, contrasting for grain yield and used as testers (L1 and L2).During cycle 2006/2007, 100 treatments were evaluated in the design triple lattice tripled (9 replicates) in experimental plots of 2.00 meters length, separated 0.50 meters. Considering the methodology of biometric analysis, the contrast of the means () allowed the detection of significant epistasis through F and t tests for grain yield in soybean. Therefore it is possible to conclude that, in soybean, the character grain yield is affected by the interaction between loci (epistasis)

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Respuesta morfológica y fenológica de maíces nativos de Tamaulipas a ambientes contrastantes de México/ Phenological and morphological response of Tamaulipas maize to contrasting environments in México

Pecina-Martínez, José A.; Mendoza-Castillo, M. Carmen; López-Santillán, José A.; Castillo-González, Fernando; Mendoza-Rodríguez, Moisés
2009-11-01

Resumen en español Introducir germoplasma de maíz a un ambiente particular permite incrementar la diversidad genética existente, pero éste puede presentar cambios fenológicos y morfológicos, como consecuencia de su desadaptación, lo cual agronómicamente puede ser indeseable. El objetivo del presente trabajo fue determinar los cambios fenológicos y morfológicos en maíz proveniente de diferentes regiones ecológicas del estado de Tamaulipas, México, en ambientes contrastantes en al (mas) titud, latitud y temperatura. Se evaluaron cuatro grupos de poblaciones nativas de Tamaulipas dos grupos de materiales mejorados, en los ambientes Trópico Seco, Transición Valles Altos. Las variables estudiadas fueron días a floración masculina femenina, asincronía floral longitud de entrenudos, para fenología; altura de planta, número de hojas, granos potenciales, hileras por mazorca, granos por hilera, granos totales peso individual de grano para morfología. Los grupos de poblaciones de Tamaulipas mostraron una alta variabilidad e interacción con los ambientes respecto a las variables estudiadas; además mostraron diferencias significativas (p Resumen en inglés Introducing maize germplasm into a particular environment can increase existing genetic diversity, but this can cause phenological and morphological changes as a consequence of its inability to adapt; agronomically, this may be undesirable. The objective of this work was to determine the phenological and morphological changes in maize from different ecological regions of the state of Tamaulipas, México, in environments that contrast in altitude, latitude and temperature. (mas) Four groups of native populations from Tamaulipas and two groups of improved materials were evaluated in Tropical dry, Transition, and High Valley environments. The variables studied for phenology were days to masculine and feminine flowering, floral asynchrony, and length of internodes; and for morphology the variables were plant height, number of leaves, potential grains, rows per ear, grains per row, total grains and individual grain weight. The groups of Tamaulipas populations exhibited high variability and interaction with the environment for the studied variables; besides, in Tropical dry climate they were significantly different (p

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Factores que influyen en el curso de la infección por el virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 en individuos sin progresión a largo plazo/ Factors influencing the course of type one human immunodeficiency virus infection in individuals classified as long term non-progressors

Patiño, Juan Camilo; Velilla, Paula Andrea; Rugeles, María Teresa
2009-06-01

Resumen en español La historia natural de la infección por el virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 (VIH-1) es un proceso variable que ha permitido identificar individuos con diferentes patrones de progresión de la infección. Entre estos individuos, existe un grupo de personas catalogadas como, sin progresión a largo plazo, las cuales se caracterizan por permanecer asintomáticas por largos periodos, sin evidencia de deterioro inmunológico y con cargas virales bajas o indetectabl (mas) es, en ausencia de tratamiento antirretroviral. Diferentes factores inmunológicos, genéticos y virales se han asociado con el patrón de progresión exhibido por estos individuos. Los factores inmunológicos contemplan mecanismos tanto de la inmunidad innata como de la adaptativa; los factores genéticos están relacionados con los genes que codifican los receptores de quimiocinas y sus ligandos naturales y genes del complejo mayor de histocompatibilidad. Por otro lado, los factores virales están relacionados con la variabilidad genética del virus y con su capacidad de replicación. De la forma en que estos factores se interrelacionen, dependen la capacidad infecciosa del virus, la respuesta inmune anti-VIH que pueda establecer el hospedero y, por consiguiente, el patrón de progresión que se establezca. Resumen en inglés The natural history of type one human immunodeficiency virus infection (HIV-1) is a variable process that has allowed identifying different patterns of progression. Among them, there is a group of individuals known as long-term non-progressors (LTNP). LTNP are characterized for being asymptomatic for long periods of time, showing no evidence of immune deterioration and having low or undetectable viral loads in absence of antiretroviral treatment. Different immunologic, ge (mas) netic and viral factors have been associated with the pattern of progression. Immunological factors include both, innate and adaptive mechanisms; genetic factors are related with genes of the chemokines family as well as genes of the major histocompatibility complex. On the other hand, viral factors are related to the genetic variability and replication ability of the virus. The disease pattern that is established depends on the interrelations of all these factors, which finally account for the type of anti- HIV-1 immune response developed and the infectious capacity of the virus.

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Marchitez Vascular del Tomate: I. Presencia de Razas de Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Sacc.) Snyder y Hansen en Culiacán, Sinaloa, México/ Vascular wilt of tomato; I. Races of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Sacc.) Snyder and Hansen present in Culiacan, Sinaloa, Mexico

Ascencio-Álvarez, Ada; López-Benítez, Alfonso; Borrego-Escalante, Fernando; Rodríguez-Herrera, Sergio Alfredo; Flores-Olivas, Alberto; Jiménez-Díaz, Florencio; Gámez-Vázquez, Alfredo Josué
2008-01-01

Resumen en español El objetivo de este trabajo fue determinar la variabilidad genética de Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol) en Culiacán, Sinaloa, México, región productora de tomate de importancia nacional. Además se buscó en especies de Lycopersicon, cultivares criollos y mejorados obsoletos de diferentes orígenes, resistencia a las razas presentes en el estado. Se colectaron 100 muestras de plantas con síntomas de Fol en Culiacán de las cuales se aisló del patógeno, y (mas) mediante la inoculación de los materiales diferenciales Bonny Best, Manapal, Walter e I3R3, se identificaron las razas 1, 2 y 3. La evaluación de los diferentes materiales indicó que todos los genotipos evaluados fueron susceptibles a la raza 1, 16 resistentes a la raza 2 y 4 resistentes a la raza 3. Se aislaron e identificaron 29 cepas de Fol a nivel de raza, encontrándose presentes las tres razas, 24% para la raza 1, 14% para la 2, y 62% para la 3. Los materiales resistentes a la raza 2 fueron Lycopersicon esculentum cv. saladette LA.2662 (88L1368); L. esculentum cv. prim. LA.147 (90L3518); y L. chmielewskii LA.2663(85L8673-8676), y a la raza 3, L. pimpinellifolium LA.722 (86L9486); L. pimpinellifolium LA.2184 (87L0413); L. peruvianum LA. 462 (79L4445-4449) y L. esculentum cv. motelle LA.2823 (87L0382). Resumen en inglés The objective of this study was to determine the genetic variability of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol) in Culiacan, Sinaloa, Mexico, a national important tomato-producing region, and to search for resistantce in species of Lycopersicon, landraces, improved but obsolete varieties of different origin present in the state. One hundred samples of tomato plants showing symptoms of Fusarium wilt disease were collected in Culiacan, from which the fungus was isolated (mas) , and through inoculation of differentials Bonny Best, Manapal, Walter, and I3R3, races 1, 2, and 3 were identified. All the genotypes evaluated were susceptible to race 1, sixteen resistant to race 2, and only four resistant to race 3. Twenty nine isolates of Fol were isolated and identified to the race level; 24 % belonged to race 1, 14 % to race 2, and 62% to race 3. Resistant materials to race 2 were Lycopersicon esculentum cv. saladette LA.2662 (88L1368); L. esculentum cv. primitive LA.147 (90L3518); and L. chmielewskii LA.2663 (85L8673-8676); and to race 3, L.pimpinellifolium LA.722 (86L9486); L. pimpinellifolium LA.2184 (87L0413); L.peruvianum LA. 462 (79L4445-4449), and L. esculentum cv. motelle LA.2823 (87L0382).

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La Psicología del curso de vida en el marco de la Psicología del Desarrollo

Lombardo, Enrique; Krzemien, Deisy
2008-06-01

Resumen en español Durante fines del siglo XIX y principios del XX, las principales líneas de la Psicología del Desarrollo intentaban explicar los cambios del desarrollo ontogenético a partir de un patrón universal del desarrollo, determinado por la herencia genética y la evolución biológica y vinculado a la fuerte presencia de las corrientes innatistas. Por otra parte, en las ciencias sociales aún no habían cobrado importancia los conceptos de diversidad cultural, contextualismo, (mas) variabilidad intergeneracional y relatividad transcultural. Avances en la investigación científica y en los diseños metodológicos han sentando las bases para nuevas concepciones acerca del desarrollo. Se ha replanteado el peso del factor biológico hacia la consideración de la influencia recíproca de factores culturales e históricos. La Psicología del curso de vida resulta adecuada para una comprensión más holística y metateórica de la naturaleza del desarrollo humano desde la concepción hasta la muerte, cuyas premisas básicas enfatizan el interjuego dinámico entre influencias biológicas y socioculturales; los cambios del desarrollo y del envejecimiento forman un proceso continuo, no limitado a alguna edad particular; el desarrollo es multidimensional y multidireccional. Una consecuencia de la incidencia de este paradigma en la Psicología del Desarrollo es la profundización del estudio del envejecimiento desde una perspectiva positiva. Resumen en inglés Throughout the late nineteenth and early twentieth century, main trends in developmental psychology attempted to explain the changes in onto-genetic development based on a universal development pattern determined by genetic legacy and biological evolution. This pattern was in turn closely associated to the important role of innatist approaches. On the other hand, the notions of cultural diversity, contextualism, intergenerational variability, and crosscultural relativity (mas) had not yet made their way in the social sciences. The progress of scientific research and methodological designs has laid the groundwork for new ways of thinking about development. The relevance of biological factors has been reconsidered vis-à-vis the reciprocal influence of cultural and historical factors. Lifespan psychology contributes to a more holistic and meta-theoretical understanding of the nature of human development from conception to death. This approach basically emphasizes the dynamic interplay between biological and sociocultural influences, developmental and aging changes as a continuous process not limited by any particular age; the multidirectional and multidimensional nature of development. The paradigm of developmental psychology allows us to delve more deeply into the study of aging from a positive perspective.

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Diversidad genética y heredabilidad en sentido amplio en agropiro alargado, Thinopyrum ponticum/ Genetic diversity and broad sense heritability in tall wheatgrass (Thinopyrum ponticum)

Pistorale, Susana M; Abbott, Liliana A; Andrés, Adriana
2008-12-01

Resumen en español Diez poblaciones naturalizadas de agropiro alargado (Thinopyrum ponticum) se evaluaron en un ensayo en bloques completamente aleatorizados, con tres repeticiones. Se analizaron, caracteres morfológicos y reproductivos por planta individual y se estimaron parámetros estadísticos y genéticos. Las comparaciones entre medias de las diez poblaciones, mediante la prueba de t, mostraron diferencias significativas (p (mas) e las poblaciones. Los resultados mostraron que los coeficientes de variación ambiental fueron altos para producción de total de semilla (69,24%), número de macollos (54,93%), número de espigas (48,50%) y producción de materia seca (49,01%), y fueron bajos para largo de espiga (19,11%) y peso de 1000 semillas (18,44%). La heredabilidad fue alta para peso de 1000 semillas (0,86), producción de materia seca (0,55) y número de macollos (0,55). Presentó heredabilidad media la producción total de semillas (0,30), y heredabilidad baja el número de espigas (0,19)yel largo de espiga(0,10). Si bien el número de espigas presentó una heredabilidad mediana, la correlación con la producción de semillas fue alta y positiva, y con peso de 1000 semillas fue mediana y positiva. El peso de 1000 semillas, que presentó alta heredabilidad, correlacionó positivamente con la producción de semillas. La amplia variabilidad detectada entre las poblaciones, para la casi totalidad de los caracteres estudiados, permitirá utilizarlas en programas de mejoramiento genético de agropiro alargado Resumen en inglés Ten naturalized populations of tall wheatgrass (Thinopyrum ponticum) were evaluated in a completely randomized block design with three replicates. Each plant was analyzed for morphological and reproductive characters, and statistical and genetic characters were estimated. Significant differences (p (mas) nts of variation were high for total seed production (69.24%), number of tillers (54.93%), number of spikes (48.50%), and dry matter production (49.01%). Coefficients of variation were rather low for spike length (19.11%) and the 1000-seed weight (18.44%). Heritability was high for seed weight (0.86), dry matter production (0.55), and the number of tillers (0.55). Intermedíate heritability was found for total seed production (0.30), and low heritability for the number (0.19) and length (0.09) of spikes. Even though the number of spikes showed an intermedíate heritability, it was highly and positively correlated with seed production (r=0.603), and a little less so with seed weight (r=0.177). Seed weight showed a high heritability and was positively correlated with seed production (r=0.285). The wide variability observed between populations for almost all the studied characters will allow them to be integrated into a single germoplasm or into a genetic pool that could be used in programs aimed at the genetic improvement of tall wheatgrass

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Sobre las causas ontogénicas de la productividad diferencial de semillas en la especie anficárpica Trifolium polymorphum (Leguminosae)/ On the causes of the differential seed production in the anficarpic species Trifolium polymorphum (Leguminosae)

Speroni, Gabriela; Izaguirre, Primavera; Bernardello, Gabriel
2010-06-01

Resumen en español Trifolium polymorphum es una leguminosa de pradera con buena adaptación y persistencia en este tipo de vegetación. Combina diferentes estrategias reproductivas como la reproducción vegetativa por estolones y la reproducción por semillas producidas en dos tipos de frutos y flores, subterráneas y aéreas. Las subterráneas son cleistógamas y las aéreas son casmógamas. Empíricamente se ha detectado mayor formación de semillas en los frutos subterráneos que en los (mas) aéreos. En el presente trabajo se realizan estudios embriológicos y de desarrollo de semillas en ambos tipos de flores para dilucidar si existen causas ontogenéticas que determinan la productividad diferencial de semillas en ambos tipos de frutos. No se detectaron causas embriológicas pre-cigóticas que expliquen el menor número de semillas en los frutos de las flores aéreas. Ambos tipos de semillas comparten características ontogenéticas y presentan apropiado desarrollo de los óvulos, sacos embrionarios y establecimiento de vías nutricionales para saco embrionario, embrión y endosperma. En general las floraciones insumen un costo energético importante para las especies vegetales. La floración aérea de T. polymorphum, aunque sometida a una fuerte presión de herbivoría del ganado, incorpora variabilidad genética a sus poblaciones a través de la polinización cruzada y permite la dispersión a distancia. Resumen en inglés Trifolium polymorphum is recognized as one of the best adapted legume in field conditions. It combines different reproductive strategies such as stoloniferous vegetative reproduction and seed reproduction by two types of fruits produced in underground and aerial flowers. These last ones are chasmogamous and underground flowers are cleistogamous. A higher seed production has empirically been detected in underground flowers rather than in aerial ones. In the present work, e (mas) mbryological studies in aerial and underground flowers were carried out in order to determine the existence of ontogenetic causes which may promote productivity differences in both types of seeds. No embryological pre-zygotic cause explaining aerial flowers low productivity was detected. Aerial and underground seeds share ontogenetic characteristics as both types of flowers showed normal ovule and embryo sac development. Similar nutritional pathways for embryo sacs, embryos and endosperms were also observed. In general, flowering represents a high energetic inversion for plant species. Aerial flowering in T. polymorphum, though subjected to a strong herbivorous pressure, incorporates genetic variability to populations through cross-pollination and succeeds in facilitating long distance dispersion.

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Selección por tamaño de camada en conejos para carne

Antonini, Alicia G.; Corva, Santiago G.; Oyarzabal, María Inés
2008-12-01

Resumen en español En conejos para carne, la mayoría de los planes de selección están enfocados a incrementar el tamaño de camada y de una manera indirecta, la fertilidad, debido al descarte de hembras improductivas. En el conejar de la Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales, UNLP, se evaluó la respuesta a la selección por prolificidad a partir del tamaño de camada nacida total (tct), nacida viva (tcv) y destetada (tcd) y se estimaron las heredabilidades y correlaciones genética (mas) s. Se analizaron siete generaciones de selección que incluyeron 390 hembras con dos o más partos apareadas con 63 machos. Se estimaron los diferenciales de selección (DS) esperados, efectivos y estandarizados, las respuestas directas y correlacionadas, los índices entre los DS efectivos y DS esperados (IDS). Las correlaciones genéticas y heredabilidades se calcularon por el método REML. Los DS fueron positivos en todas las generaciones, sin embargo, las respuestas a la selección observadas oscilaron entre valores positivos y negativos no permitiendo establecer una tendencia en ninguno de los caracteres estudiados a lo largo de las generaciones (tct: b=-0.02, tcv: b=-0.03, tcd: b=-0,27; p>0.05). El análisis de la relación entre los IDS y los DS estandarizados mostró que esta falta de respuesta a la selección no puede ser atribuida a un efecto contrario de la selección natural. Los bajos valores de las heredabilidades estimadas indicarían que la variabilidad fenotípica podría deberse al efecto de componentes genéticas no aditivas, efectos ambientales o interacciones entre ambos, que permitieran expresar fenotipos extremos y explicar en parte estos resultados. Resumen en inglés In rabbits, most of selection programs are mainly focused on prolificacy and indirectly, with low pressure, on fertility, thus rejecting sterile females. The aim of this work was to evaluate selection response to weaning litter size (tcd) on meat rabbits during seven generations and to estimate heritabilities and genetic correlations with total birth litter size (tct) and alive birth litter size (tcv). Records for litter size, fertility and survival (on 390 does with two (mas) or more pregnancies mated with 63 males) were analyzed. Selection differentials, selection responses, genetic correlations and heritabilities were calculated. The selection differentials were positive in all the generations, nevertheless, the observed selection responses oscillated between positive and negative values not allowing to establish a tendency in none of the studied characters (regression coefficients of each character on generations: btct=-0.02, btcv=-0.03, btcd=-0.27; p>0.05). Despite the fact that the selection was based on litter size, there were no increases on selected character and its correlated characters (tct and tcv). Natural selection was not the reason of this absence of response. Heritability low values indicated that phenotypic variability is due to non additive effects, environmental effects or their interactions and could explain these results.

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Susceptibilidad de híbridos de girasol (Helianthus annuus) a la podredumbre media del tallo y quebrado caulinar producido por Sclerotinia sclerotiorum/ Susceptibility of sunflower hybrids (Helianthus annuus) to mid stem rot and broken stem caused by Sclerotinia sclerotiorum

Reimonte, Gabriela; Castaño, Fernando
2008-04-01

Resumen en español En el girasol (Helianthus annuus L.), cultivo de gran interés agronómico, Sclerotinia sclerotiorum ataca la parte media del tallo produciendo la podredumbre media del tallo. En Balcarce, Argentina, se realizó un ensayo a campo donde se evaluó la respuesta de 17 híbridos de girasol a S. sclerotiorum. Se evaluó la relación entre la lesión provocada por este patógeno y el quebrado del tallo enfermo. Los híbridos mostraron respuestas diferenciales al tamaño de la p (mas) odredumbre y en el número relativo de tallos rotos, medido a los 20 días de iniciada la floración (dif). No hubo variabilidad de plantas quebradas a los 60 dif. Los híbridos con mayor longitud de lesión promedio mostraron mayor número de plantas quebradas. El debilitamiento del eje caulinar, particularmente en genotipos con menor proporción de tejidos de sostén, habría facilitado la rotura del tallo. El grado de determinación genética sugirió que la longitud de las lesiones estaría menos influenciada por factores ambientales que la proporción de plantas quebradas a los 20 dif. Estos resultados permiten delinear un programa de mejoramiento, para incrementar el nivel de resistencia a esta enfermedad en girasol, basado en la selección de genotipos para ambos caracteres. Una selección fenotípica se podría realizar sobre plantas individuales, utilizando el carácter extensión de la podredumbre en tallos. La proporción de plantas quebradas se evaluaría, luego, en las familias F3 derivadas en F2 (líneas F2:3) Resumen en inglés In the sunflower, Sclerotinia sclerotiorum is the cause of stem rot and broken stems. Seventeen sunflower hybrids were evaluated in Balcarce, Argentina after mid-stem inoculation. The association between rot length and the rate of stem breakage was calculated. Sunflower hybrids showed considerable differences in the size of the rot lesion developed and in the relative number of broken stems, as determined 20 days after the beginning of flowering (daf). No variability was (mas) detected for broken stems, both 6 and 60 days after inoculation. Sunflower plants with greater mid stem rot length had a greater relative number of broken stems. The incidence of broken stems could have been enhanced by the mid-stem rot, especially in those genotypes with the lowest proportion of structural tissues in the stems. The degree of genetic determination suggested that environmental effects influence the length of symptoms less than that the proportion of broken stems determined at 20 daf. The results allowed us to propose a breeding program based on the selection of the most adequate genotypes given their level of resistance to these two characters. A phenotypic selection could be performed on individual plants based on the extent of rotting caused by S. sclerotiorum at the mid-stems. Then, the proportion of broken stems could be scored on F2-derived lines in F3 (F2:3 line)

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Medicina genómica: Aplicaciones del polimorfismo de un nucleótido y micromatrices de ADN/ Genomic Medicine: Polymorphisms and microarray applications

Spalvieri, Monica P.; Rotenberg, Rosa G.
2004-12-01

Resumen en español Esta actualización tiene por objeto difundir un nuevo enfoque de las variaciones del ADN entre individuos y comentar las nuevas tecnologías para su detección. La secuenciación total del genoma humano es el comienzo para conocer la diversidad genética. La unidad de medida reconocida de esta variabilidad es el polimorfismo de un solo nucleótido (single nucleotide polymorphism o SNP). El estudio de los SNPs está restringido a la investigación pero las numerosas publi (mas) caciones sobre el tema hacen vislumbrar su entrada en la práctica clínica. Se presentan ejemplos del uso de SNPs como marcadores moleculares en la genotipificación étnica, la expresión génica de enfermedades y como potenciales blancos farmacológicos. Se comenta la técnica de las matrices (arrays) que facilita el estudio de múltiples secuencias de genes mediante chips de diseño específico. Los métodos convencionales analizan hasta un máximo de 20 genes, mientras que una sola micromatriz provee información sobre decenas de miles de genes simultáneamente con una genotipificación rápida y exacta. Los avances de la biotecnología permitirán conocer, además de la secuencia de cada gen, la frecuencia y ubicación exacta de los SNPs y su influencia en los comportamientos celulares. Si bien la validez de los resultados y la eficiencia de las micromatrices son aún controvertidos, el conocimiento y caracterización del perfil genético de un paciente impulsará seguramente un cambio radical en la prevención, diagnóstico, pronóstico y tratamiento de las enfermedades humanas. Resumen en inglés This update shows new concepts related to the significance of DNA variations among individuals, as well as to their detection by using a new technology. The sequencing of the human genome is only the beginning of what will enable us to understand genetic diversity. The unit of DNA variability is the polymorphism of a single nucleotide (SNP). At present, studies on SNPs are restricted to basic research but the large number of papers on this subject makes feasible their ent (mas) rance into clinical practice. We illustrate here the use of SNPs as molecular markers in ethnical genotyping, gene expression in some diseases and as potential targets in pharmacological response, and also introduce the technology of arrays. Microarrays experiments allow the quantification and comparison of gene expression on a large scale, at the same time, by using special chips and array designs. Conventional methods provide data from up to 20 genes, while a single microarray may provide information about thousands of them simultaneously, leading to a more rapid and accurate genotyping. Biotechnology improvements will facilitate our knowledge of each gene sequence, the frequency and exact location of SNPs and their influence on cellular behavior. Although experimental efficiency and validity of results from microarrays are still controversial, the knowledge and characterization of a patient's genetic profile will lead, undoubtedly, to advances in prevention, diagnosis, prognosis and treatment of human diseases.

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POSIBILIDADES DE EXPANSIÓN DEL CULTIVO DE YUCA (MANIHOT ESCULENTUM CRANTZ) EN EL CARIBE SECO COLOMBIANO A PARTIR DE INVESTIGACIÓN MULTIDISCIPLINARIA/ POSSIBILITIES OF CASSAVA (MANIHOT ESCULENTUM CRANTZ) EXPANSION IN COLOMBIAN CARIBBEAN COAST DROUGHT ZONES BY MULTIDISCIPLINARY RESEARCH

Tofiño, Adriana; Ceballos, Hernán; Romero, Hernán M.
2008-01-01

Resumen en español En áreas donde la sequía es prolongada y el mayor limitante para el éxito de los cultivos alimenticios como los cereales, la yuca (Manihot esculenta Crantz) se produce razonablemente bien por su fotosíntesis intermedia C3-C4. La yuca ha entrado en la economía de mercado moderno y es creciente su demanda en la utilización en alimentos procesados, alimentación animal, bioetanol, almidón y sus derivados y para muchas otras aplicaciones industriales. Un cambio a parti (mas) r de las plantaciones tradicionales a pequeña escala para el mercado fresco, hacia plantaciones a gran escala para el abastecimiento de los centros de procesamiento, requiere incremento del rendimiento, calidad y estabilidad productiva. En Latinoamérica, aproximadamente el 45% del área total de cultivo de yuca proviene de zonas con estrés hídrico o con lluvias esporádicas. Adicionalmente, el potencial de expansión futuro del cultivo está ubicado en zonas marginales. A pesar que existe un amplio rango de variabilidad genética en la mayoría de los caracteres de tolerancia a la sequía en el germoplasma de yuca, la investigación multidisciplinaria, podría incrementar la eficacia en la selección de los mejores parentales y la piramidación de genes que potencialicen las características fisiológicas de tolerancia a la sequía preexistentes en el genoma de la yuca. El objetivo de esta revisión es delinear las posibilidades de la investigación integrada de la fisiología, biotecnología y mejoramiento para potencializar las características de tolerancia a sequía en yuca. Resumen en inglés Where prolonged drought is a major constraint for the success of food crops such as cereals and cassava (Manihot esculenta Crantz) produce reasonably well where prolonged drought is a major constraint for their commercial success. In the case of cassava, this is due to its intermediate C3-C4 photosynthesis. Cassava has entered the modern market economy and has a growing demand for its use in processed food, animal feeding, ethanol production, starch and its derivates, and (mas) for many different industrial applications. A shift from the traditional small-scale plantings for the fresh market to larger-scale plantings for factory sales requires increased yield, quality, and stability of production in drought-prone zones. In Latin America, approximately 45% of total cassava area comes from sub-humid zones or with sporadic rainfall. Moreover, expansion of this crop tends to occur in marginal lands. Although a wide range of genetic variability in most drought tolerant traits exists within cassava germoplasm, a multidisciplinary research could increase the efficiency for the selection of the best progenitors and gene pyramidation to increase preexisting drought tolerant physiological traits in cassava genome. The main goal of this review is to outline potential research on physiology, biotechnology, and breeding and their possibilities to improve traits to drougth tolerance in cassava.

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Colecta y rescate del conocimiento local de algodones nativos en las costas de los estados Falcón y Aragua, Venezuela/ Collection and rescues of the local knowledge of native cottons in the coasts of the states Falcon and Aragua, Venezuela

Gutiérrez M, Margaret; Trujillo, Baltazar; Pérez, Delis; Márques, Alexis; Pacheco, William
2009-03-01

Resumen en español Con el objetivo de rescatar la variabilidad genética del género Gossypium en Venezuela, se realizaron dos expedi­ciones de colecta en los estados Falcón (formaciones climásicas y sucesionales de espinares) y Aragua (zona costera). Fueron colectados 23 ejemplares nativos de creci­miento subespontáneo; para la clasificación botánica se utilizaron los descriptores color de planta y hoja, número de lóbulos, forma de las hojas, color de los pétalos, presencia de "P (mas) etal Spot" (mancha púrpura en la base de los pétalos), sobresaliencia del estigma, sensibilidad al fotoperíodo y color de linter y fibra. La información reco­pilada permitió conocer que los algodones "Pajarito" se presentan en estado silvestres desde tiempos remotos, por tres generaciones o más y que siempre han sido utilizado para hilar y elaborar tejidos de manera artesanal. Los habitantes afirman que nunca han sido cultivados por el hombre sino que se presentan en forma espontánea por lo que se asume que o bien son nativos de la zona o que la semilla ha entrado vía marítima al norte de Venezuela. Los algodones colectados tienen características tales como "Petal spot" presente, desde muy marcados hasta ligera­mente manchado, estigma desde marcadamente sobresa­liente hasta sobresaliente y frutos pequeños de tres a cuatro lóculos. El porte de los materiales es arbustivo con copas redondeadas y cilíndricas. Los algodones de Falcón se clasi­ficaron como Gossypium barbadense y G. hirsutum raza Maria Galante y uno de los colectados en Aragua fue clasi­ficado como G. purpurascens. Resumen en inglés With the objective of rescuing the genetic variability of the genus Gossypium in Venezuela, two collection expeditions were carried out on the States Falcon and Aragua, coastal area of Venezuela. Twenty three (23) native cottons of subspontaneous growth were collected. For the botanical classification the descriptors leaf color, number of lobes, leaf form, petal color, presence of petal spot (purple spot in the base of the petals), length of the stigma, sensibility to the (mas) photoperiod, fiber and linter color were used. The gathered information allowed to conclude that the ‘Pajarito’ cottons has been present in a wild state from remote times, for three or more generations, and that they have always been used for spinning and handmade-fabric elaboration. The inhabitants affirmed that these plants have never been cultivated but rather grow spontaneously. It is assumed that either they are native of this area or the seed entered through the sea by the north of Venezuela. The collected cottons have characteristics such as petal spot (ranging from very marked until light spotted petals), stigma (from markedly prominent to prominent) and small fruits with three to four locules. Materials were bushy with rounded and cylindrical architecture. Materials collected in Falcon State were classified as Gossypium barbadense and G. hirsutum race Marie Galant and one of the materials collected in Aragua State was classified as G. purpurascens.

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Epidemiología molecular de infección nosocomial por Klebsiella pneumoniae productora de beta-lactamasas de espectro extendido/ Molecular epidemiology of nosocomial infection by extended-spectrum beta-lactamases-producing Klebsiella pneumoniae

Espinal, Paula Andrea; Mantilla, José Ramón; Saavedra, Carlos H; Leal, Aura Lucía; Alpuche, Celia; Valenzuela, Emilia María
2004-09-01

Resumen en español La epidemiología molecular aplicada al estudio de las infecciones nosocomiales ha sido fundamental para la formulación y la evaluación de las medidas de control; con este fin, se caracterizaron microbiológica y molecularmente aislamientos de Klebsiella pneumoniae productores de beta-lactamasas de espectro extendido (BLEE) obtenidos de pacientes en un hospital de tercer nivel de Bogotá, D.C., Colombia. Se tipificaron quince aislamientos por electroforesis en gel de ca (mas) mpo pulsado (PFGE) y por amplificación de secuencias de AND repetidas (REP-PCR). La susceptibilidad antimicrobiana y la producción de BLEE se determinaron de acuerdo con las normas de NCCLS. Las beta-lactamasas se evaluaron por isoelectroenfoque y PCR. El 80% de estos aislamientos se asociaron con infección nosocomial y de éstos, el 91,7% provenía de unidades de cuidado intensivo. La susceptibilidad antibiótica mostró 13 patrones de resistencia; 87% de los aislamientos presentó corresistencia a amikacina, 53% a gentamicina, 33,3% a ciprofloxacina, 40% a cefepime, 66,7% a piperacilina/tazobactam, 60% trimetoprim/sulfametoxazol y 46,7% a cloranfenicol. Todos fueron sensibles a imipenem. En la mayoría de los aislamientos se detectó producción simultánea de beta-lactamasas del tipo TEM y SHV y el 93,3% produjo ceftazidimasa de pI 8.2 del tipo SHV-5. Los 15 aislamientos fueron agrupados por PFGE y REP-PCR en 11 y 12 patrones electroforéticos, respectivamente. Esta variabilidad genética está relacionada con infecciones nosocomiales de origen endógeno más que por infecciones cruzadas. Resumen en inglés Molecular epidemiology applied to the study of nosocomial infection has been fundamental in formulating and evaluating control methods. From patients in a level 3 Bogota hospital, Klebsiella pneumoniae samples were isolated that produced extended-spectrum beta-lactamases (ESBL). Each of 15 isolates was characterized microbiologically and by molecular characters realized by pulsed field gel electrophoresis (PFGE) and by repetitive-DNA sequences amplification (REP-PCR). Ant (mas) imicrobial susceptibility and ESBL production was determined in accordance with NCCLS guidelines. The beta-lactamases were evaluated by isoelectric-focusing and PCR. Twelve (80%) of the isolates were associated with nosocomial infection; 11 of them were from intensive care units. The antibiotic susceptibility displayed 13 resistance patterns - 87% presented co-resistance to amikacin, 53% to gentamicin, 33% to ciprofloxacin,40% to cefepime, 67% to piperacillin/tazobactam, 60% to trimethoprim/sulfamethoxazole and 47% to chloranphenicol. All were sensitive to imipenem. Production of TEM and SHV beta-lactamases was detected simultaneously in most isolates by isoelectric focusing and 93.3% produced a ceftazidimase of pI 8.2 of the SHV-5 type. The 15 isolates were grouped into 11 and 12 electrophoretic patterns by PFGE and REP-PCR, respectively. The degree of genetic variability indicated an endogenous origin of the nosocomial infections.

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Caracterización molecular de siete clones de ajo (Allium sativum L.) mediante la técnica rapd/ Molecular characterization of seven garlic clones (Allium sativum L.) revealed by RAPD markers

Pardo, Adriana; Hernández, Alexander; Méndez, Naileth
2009-08-01

Resumen en español El ajo es una especie ampliamente cultivada por sus cualidades culinarias y farmacológicas; sin embargo, su forma de reproducción asexual o apomíctica ha dificultado la producción de semillas certificadas, por lo que los productores hacen uso de los dientes o bulbos de procedencia desconocida como única forma de propagación comercial del cultivo. Debido a ello, se hace necesario caracterizar los genotipos utilizados para determinar la variabilidad y base genética d (mas) e los mismos con el fin de conformar un banco de germoplasma y dar inicio a programas de mejoramiento genético que conlleven a la producción de semillas certificadas para uso comercial. Esta investigación estableció como objetivo estandarizar un protocolo para la caracterización de siete clones de ajo procedentes de zonas productoras de los estados Lara y Trujillo, mediante marcadores morfológicos y moleculares (RAPD). Se empleó un análisis de agrupamiento UPGMA con su respectivo dendrograma, así como también el análisis de coordenadas principales. El análisis molecular diferenció a los clones evaluados en tres grupos. En el grupo I se ubicaron los clones colectados en las localidades ‘Agua Negra’ (AN-1, AN-2) y ‘El Páramo’ (PAL-1, PAL-2); el grupo II se conformó por los clones colectados en ‘Bojó’ (BO-1) y ‘Cubiro’ (CUB-1), mientras que en el grupo III se ubicó el clon UCLA-1 colectado en Carache, estado Trujillo. Los resultados sugieren que los clones AN-1 y AN-2, con idéntico perfil electroforético, constituyen un mismo genotipo; sin embargo, han sido distribuidos y sembrados por los productores como materiales distintos. Los clones PAL-1, PAL-2, CUB-1 y BO-1 muestran un valor de 83 % de similitud entre ellos, pero se diferencian en su comportamiento agronómico probablemente debido a la influencia de factores ambientales. Resumen en inglés Garlic is widely grown by its culinary and pharmacological applications; however, its asexual or apomictic reproduction makes seed certification to be difficult, and consequently, growers use bulbils or cloves with unknown origin for commercial propagation. In consideration, characterization of the genotypes used by growers is needed to determine their variability and genetic basis and thus create a germplasm bank and to initiate breeding programs to produce certificated (mas) seeds for commercial use. This study aims to standardize a protocol for molecular characterization in seven garlic clones from producer areas of Lara and Trujillo States, by using morphologic and molecular (RAPD) markers. A grouping UPGMA analysis was used with a dendrogram besides principal components analysis. The RAPD analysis separated the clones in three groups: Group I included those clones collected in ‘Agua Negra’ (AN-1 and AN-2), and ‘El Páramo’ (PAL-1 and PAL-2); in Group II clones from ‘Bojó’ (BO-1) and ‘Cubiro’ (CUB-1), and in Group III the clone UCLA-1 from Carache, Trujillo State. Results suggested that clones AN-1 and AN-2, showing identical electrophoretic profiles, constitute a similar genotype but they have been distributed and grown as different materials by growers. Clones PAL-1, PAL-2, CUB-1 and BO-1 showed 83 % similarity, although their agronomical performance is different probably due to environmental factors influence.

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Caracterización morfológica de 93 accesiones de Capsicum spp del banco de germoplasma de la Universidad Nacional de Colombia - Sede Palmira/ Morphologic characterization of 93 accesions of Capsicum spp of germoplasm bank of National University of Colombia - Palmira

Palacios Castro, Shirley; García Dávila, Mario Augusto
2008-12-01

Resumen en español Para la caracterización morfológica de 93 accesiones de Capsicum spp, procedentes de 11 países (Bolivia, Brasil, Colombia, Costa Rica, Cuba, Ecuador, Guatemala, Guyana, México, Perú, y El Salvador) y representativas de cuatro especies (C. annuum, C. baccatum, C. chinense, C. frutescens), se utilizaron 21 descriptores IBPGR (seis cuantitativos y 15 cualitativos; ocho de caracteres vegetativos, tres de flor y 10 de fruto y semilla). La caracterización morfológica con (mas) firmó la variabilidad dentro del género, en especial los descriptores de arquitectura de planta, estructuras reproductivas y producción, que explicaron el 78% de la variabilidad total (análisis de componentes principales- ACP). La distancia Dice posibilitó formar grupos con base en el origen de las accesiones y caracteres de flor y fruto, pero no discriminó entre especies. Las cortas distancias genéticas resultantes del análisis discriminante entre C. annuum, C. frutescens y C. chinense indicaron que conforman un solo grupo morfológico. Resumen en inglés Morphologic characterization of 93 Capsicum accessions of Capsicum spp., from 11 countries (Bolivia, Brasil, Colombia, Costa Rica, Cuba, Ecuador, Guatemala, Guyana, México, Perú and El Salvador) and representative of four species (C. annuum, C. baccatum, C. chinense, C. frutescens), 21 IBPGR's descriptors were used (six quantitative y 15 qualitative; eight of vegetative traits, three of flower traits and ten of fruit and seed traits). Morphologic characterization permit (mas) ed confirm the presence of intragenetic variability, in special for of plant architecture descriptors, reproductive structures and production, wich explain the 78% of the total variability. Dice's distance permitted groups formation based in their origin and flower and fruit traits, but didn't permit to interespecific discrimination. Narrow genetic distances among C. annuum, C. frutescens y C. chinense can indicate these three species conform only one morphological group.

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Análisis de polimorfismos en los genes tripanotión reductasa y cruzipaína en cepas colombianas de Trypanosoma cruzi/ Analysis of polymorphisms in the trypanothione reductase and cruzipain genes in Colombian strains of Trypanosoma cruzi

Rojas, Winston; Caro, Maria Antonieta; Lopera, Juan Guillermo; Triana, Omar; Dib, Juan Carlos; Bedoya, Gabriel
2007-01-01

Resumen en español Introducción. Los estudios genéticos en Trypanosoma cruzi han buscado establecer asociaciones de variantes genéticas del parásito con manifestaciones clínicas de la enfermedad, origen biológico y geográfico de los aislamientos; sin embargo, los resultados de asociación con los marcadores comúnmente usados en estos estudios han generado mucha controversia, principalmente en la asociación de grupos con características clínicas y epidemiológicas de la enfermedad (mas) . Objetivo. Se planteó determinar la variabilidad de genes que codifican para las proteínas tripanotión reductasa y cruzipaína, involucradas en mecanismos de infección y supervivencia del parásito en el hospedador mamífero, y probar la asociación de variantes génicas con origen biológico y geográfico de cepas colombianas de T. cruzi. Materiales y métodos. Se tipificaron por reacción en cadena de la polimerasa- polimorfismo de longitud del fragmento de restricción seis SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) en tripanotión reductasa y ocho SNPs en cruzipaína en 36 cepas colombianas de T. cruzi de diferentes regiones y origen biológico. Resultados. Con las enzimas Acy I y Hae III se determinaron tres genotipos para tripanotión reductasa. Para cruzipaína se identificaron seis genotipos con las enzimas Rsa I, Ban I y Bsu 36I. Conclusiones. Para tripanotión reductasa no fue posible establecer una asociación con el origen biológico o geográfico; sin embargo los alelos producidos en las posiciones 102 y 210, permitieron discriminar los grupos tradicionales I y II. Con los genotipos obtenidos para cruzipaína se establecieron relaciones a estos grupos, origen biológico y geográfico. Los resultados sugieren la utilidad de estos genes como marcadores moleculares para determinar y diferenciar variedades genéticas en T. cruzi Resumen en inglés Introduction. Genetic studies of Trypanosoma cruzi have tried to establish relations between genetic variants and their biological characteristics, such as clinical manifestations, host or geographic origin. However, much controversy exists on the associations between the commonly used DNA markers with group, clinical characteristics and disease epidemiology. Objective. In this study determined the variability of the genes that code for the proteins trypanothione reductas (mas) e and cruzipain, both involved in the infection and survival of the parasite in the mammalian host, was studied and the association between genetic polymorphism and biological and geographic sources in Colombian T. cruzi strains was examined. Materials and methods. The genotypes for each of six SNPs (single nucleotide polymorphisms) for trypanothione reductase and eight SNPs for cruzipain genes were identified by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism.in 36 T. cruzi Colombian stocks from several regions and biological origins. Results. Three genotypes were identified for trypanothione reductase with Acy I and Hae III enzymes and six genotypes for cruzipain with the Rsa I, Ban I and Bsu 36I enzymes. Conclusions. For trypanothione reductase ,an association was not established with biological or geographical origin; however, alleles at positions 102 and 210 allowed discrimination with groups I and II. For cruzipain, specific genotypes were associated with group, biological and geographic origin. The usefulness of molecular markers on these genes was demonstrated for the determination and differentiation of genetic varieties in T. cruzi.

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ÁRBOLES DE EXPANSIÓN MÍNIMOS: AYUDAS PARA UNA MEJOR INTERPRETACIÓN DE ORDENACIONES EN BANCOS DE GERMOPLASMA

Arroyo, Alejandra; Bruno, Cecilia; Di Rienzo, Julio; Mónica, Balzarini
2005-09-01

Resumen en portugués Em coleções de germoplasma, o material genético de interesse é caracterizado através de múltiplos descritores (variáveis). Cada acessão da coleção é representada por um vector de dados que pertence a um espaço multidimensional. As configurações multidimensionais são difíceis de interpretar ao não serem facilmente visualizadas. Um objetivo da análise de matrizes de dados de acessões×descritores é o ordenamento do material genético em um espaço bi-dim (mas) ensional, o qual comumente é ótimo por representar a máxima variabilidade. Métodos de análise vectorial, como a Análise de Componentes Principais (ACP), permitem reduzir a dimensão sob esse critério de optimalidade. Os resultados da ACP se visualizam representando as acessões a ordenar como pontos de um gráfico de dispersão segundo o valor que estas assumen sobre os dois eixos principais (de maior variação) de ordenação. Pela perda de informação ao ordenar em um espaço de duas dimensões, as distâncias no plano costumam não ser as distâncias no espaço original, conduzindo a erros de interpretação de relações entre acessões. Neste trabalho se quantifica o erro de interpretação nas relações inferidas do plano gerado pelos dois primeiros componentes principais (CP), sob cenários simulados que envolvem distintos tamanhos de coleções de germoplasma para uma faixa ampla de variabilidade explicada pelos dois primeiros CP (medida indireta da qualidade da representação). Os resultados sugerem que ainda que estes componentes expliquem >70% da variabilidade total maior, o erro de interpretação é estatísticamente >0 e depende do número de objetos ordenados. As Árvores de Expansão Mínimas, como complemento de ordenações produzidas por análises vectoriais, representam uma ferramenta eficiente para entender melhor as ordenações. Se ilustra a utilização desta técnica na interpretação das ordenações produzidas a partir da ACP. Resumen en español En colecciones de germoplasma, el material genético de interés es caracterizado a través de múltiples descriptores (variables). Cada accesión de la colección es representada por un vector de datos que pertenece a un espacio multidimensional. Las configuraciones multidimensionales son difíciles de interpretar al no ser fácilmente visualizadas. Un objetivo del análisis de matrices de datos de accesiones×descriptores es el ordenamiento del material genético en un (mas) espacio bi-dimensional, el cual comúnmente es óptimo por representar la máxima variabilidad. Métodos de análisis vectorial, como el Análisis de Componentes Principales (ACP), permiten reducir la dimensión bajo ese criterio de optimalidad. Los resultados del ACP se visualizan representando las accesiones a ordenar como puntos de un gráfico de dispersión según el valor que éstas asumen sobre los dos ejes principales (de mayor varianza) de ordenación. Por la pérdida de información al ordenar en un espacio de dos dimensiones, las distancias en el plano suelen no ser las distancias en el espacio original, conduciendo a errores de interpretación de relaciones entre accesiones. En este trabajo se cuantifica el error de interpretación en las relaciones inferidas del plano generado por los dos primeros componentes principales (CP), bajo escenarios simulados que involucran distintos tamaños de colecciones de germoplasma para un rango amplio de variabilidad explicada por los dos primeros CP (medida indirecta de la calidad de la representación). Los resultados sugieren que aunque estos componentes expliquen >70% de la variabilidad total mayor, el error de interpretación es estadísticamente >0 y depende del número de objetos ordenados. Los Árboles de Expansión Mínimos, como complemento de ordenaciones producidas por análisis vectoriales, representan una herramienta eficiente para entender mejor las ordenaciones. Se ilustra la utilización de esta técnica en la interpretación de las ordenaciones producidas a partir del ACP. Resumen en inglés In germplasm collections, the genetic material is characterized through several descriptors (variables). Each sampling unit (entry) is represented by a data vector that belongs to a multidimensional space. Multidimensional configurations are difficult to interpret because they cannot be easily visualized. A common goal in the analysis of an entry×descriptor data matrix is the ordination of the genetic material in a bi-dimensional space. Commonly, this space is optimal in (mas) the sense of maximum variance representation. Vector analysis methods, like Principal Components Analysis (PCA), allow to reduce the data dimensionality under such optimality criterion. The results from vector analyses are visualized by scatter plots displaying each entry as a point located according to its values on the first two principal axes (maximum variance) of ordination. Due to loss of information by using a bi-dimensional space, the distances in the plane may not correspond with the distances in the original space, leading to miss-interpretation of the true relationship between germplasm entries. In this paper, the miss-interpretation error in the entry relationships from the plane generated by the two first principal components (PC) is quantified. Interpretation errors under several simulated sceneries involving different germplasm collection sizes were estimated for a wide range of percent of variability explained by the two first PC (indirect measure of the ordination quality). The results suggest that even when these components explain >70% of total variability, the interpretation error is statistically >0 and its magnitude depends on the germplasm collection size. The Minimum Spanning Trees as complement of vector analysis results are efficient tools for better understanding of ordinations. The use of this technique in the interpretation of ordinations, arising in PCA, is illustrated.

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Vermicompost enhances germination of the maritime pine (Pinus pinaster Ait.)

Lazcano, Cristina; Sampedro, Luis; Zas Arregui, Rafael; Domínguez, Jorge
2010-05-01

Digital.CSIC (Spain)

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Variability in symbiotic nitrogen fixation in common bean

Rodiño Míguez, Ana Paula; Santalla Ferradás, Marta; González Fernández, Ana María; Drevon, Jean-Jacques

Yield responses of bean are often limited by the nitrogen deficiency, being the most common limiting factor for the growth of the plants. Common bean (Phaseolus vulgaris L.) is often considered as a poor N2-fixing legume. Thus, it is often cultivated with a complement of mineral nitrogenous fertiliz...

DRIVER (Spanish)

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Variability in symbiotic nitrogen fixation in common bean

Rodiño Míguez, Ana Paula; Santalla Ferradás, Marta; González Fernández, Ana María; Drevon, Jean-Jacques; Ron Pedreira, Antonio Miguel de
2006-03-01

Digital.CSIC (Spain)

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Variability and inheritance of peach SSR sequences

Sánchez-Pérez, Raquel; Dicenta, Federico; Ruiz, C.; Ballester, J.; Arús, Pere; Martínez-Gómez, Pedro
2005-01-01

Digital.CSIC (Spain)

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Valores normativos de resistencia a la insulina mediante HOMA-IR en adultos mayores de Santiago de Chile/ Homeostasis model assessment (HOMA) values in Chilean elderly subjects

Garmendia, María Luisa; Lera, Lydia; Sánchez, Hugo; Uauy, Ricardo; Albala, Cecilia
2009-11-01

Resumen en inglés Background: The homeostasis assessment model for insulin resistance (HOMA-IR) estimates insulin resistance using basal insulin and glucose values and has a good concordance with values obtained with the euglycemic clamp. However it has a high variability that depends on environmental, genetic and physiologic factors. Therefore it is imperative to establish normal HOMA values in different populations. Aim: To report HOMA-IR values in Chilean elderly subjects and to determi (mas) ne the best cutoff point to diagnose insulin resistance. Material and methods: Cross sectional study of 1003 subjects older than 60 years of whom 803 (71% women) did not have diabetes. In 154 subjects, an oral glucose tolerance test was also performed. Insulin resistance (IR) was defined as the HOMA value corresponding to percentile 75 of subjects without over or underweight. The behavior of HOMA-IR in metabolic syndrome was studied and receiver operating curves (ROC) were calculated, using glucose intolerance defined as a blood glucose over 140 mg/dl and hyperinsulinemia, defined as a serum insulin over 60 µU/ml, two hours after the glucose load. Results: Median HOMA-IR values were 1.7. Percentile 75 in subjects without obesity or underweight was 2.57. The area under the ROC curve, when comparing HOMA-IR with glucose intolerance and hyperinsulinemia, was 0.8 (95% confidence values 0.72-0.87), with HOMA-IR values ranging from 2.04 to 2.33. Conclusions: HOMA-IR is a useful method to determine insulin resistance in epidemiological studies. The HOMA-IR cutoff point for insulin resistance defined in thi spopulation was 2.6

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86

Transcriptomal profiling of site-specific Ras signals

Agudo-Ibáñez, Lorena; Núñez, Fátima; Calvo González, Fernando; Berenjeno, Inmaculada M.; Bustelo, Xosé R.; Crespo, Piero
2007-11-01

Digital.CSIC (Spain)

88

Tolerancia de la cebada (Hordeum vulgare L.) a la salinidad: revisión bibliográfica

Martínez-Cob, Antonio; Royo, Antonio; Aragüés Lafarga, Ramón
1987-01-01

Digital.CSIC (Spain)

90

The role of DNA-binding specificity in the evolution of bacterial regulatory networks

Lozada-Chávez, Irma; Espinosa Angarica, Vladimir; Collado-Vides, Julio; Contreras-Moreira, Bruno
2008-06-02

Digital.CSIC (Spain)

91

The determinants of gene order conservation in yeasts

Poyatos, Juan F.; Hurst, Laurence D.
2007-11-05

Digital.CSIC (Spain)

93

Thanatophoric dysplasia type II with encephalocele and semilobar holoprosencephaly: Insights into its pathogenesis

Martínez-Frías, María Luisa; Egüés, X.; Puras, A.; Hualde, J.; Frutos, Cristina A. de; Bermejo, Eva; Nieto, M. Ángela; Martínez, S.
2011-01-01

Digital.CSIC (Spain)

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Temporal variation of heterozygosity-based assortative mating and related benefits in a lesser kestrel population

Ortego, J.; Calabuig, G.; Bonal, Raúl; Muñoz, Alberto; Aparicio, José Miguel; Cordero, Pedro
2009-01-01

Digital.CSIC (Spain)

96

Study of genetic variability of Albariño (grapevine variety)

Vidal, J. R.; Masa Vázquez, Antón; Moreno, S.; Ortiz, Jesús María
1999-01-01

Digital.CSIC (Spain)

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Study of genetic variability in Dicrocoelium dendriticum using the random amplified polimorphic DNA

Sandoval, Hilda; Manga-González, M. Yolanda; Campo, Raquel; García, P.; Pérez de la Vega, M.
1996-01-01

Digital.CSIC (Spain)

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Simple Sequence Repeat Identification and Endocarp Characterization of Olive Tree Accessions in a Tunisian Germplasm Collection

Fendri, Mahdi; Trujillo, Isabel; Trigui, Ahmed; Rodríguez García, María I.; Alché Ramírez, Juan de Dios
2010-10-01

Digital.CSIC (Spain)

101

Side effects of antibiotics on genetic variability

Couce, Alejandro; Blázquez, Jesús
2009-01-01

Digital.CSIC (Spain)

102

SOFT project: a new forecasting system based on satellite data

Pascual, Ananda; Orfila, Alejandro; Álvarez, Alberto; Hernández-García, Emilio; Gomis, Damià; Barth, Alexander; Tintoré, Joaquín
2002-01-01

Digital.CSIC (Spain)

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Rol de la calpastatina en la variabilidad de la terneza de la carne bovina/ Role of calpastatin in the variability of beef tenderness

Motter, MM; Corva, P; Krause, M; Perez Cenci, M; Soria, L.
2009-06-01

Resumen en español La calpastatina es una enzima inhibidora de las calpaínas, principales enzimas proteolíticas del músculo esquelético. Está codificada por el gen CAST, a partir del cual se pueden expresar cuatro isoformas proteicas diferentes debido a la existencia de cuatro promotores distintos. Este gen ha sido estudiado como candidato para explicar diferencias de origen genético en la terneza de la carne. En bovinos se han descripto varios polimorfismos del tipo SNP en distintas (mas) regiones del gen. Algunos de ellos han sido incluidos en test comerciales por su asociación significativa con la variabilidad en terneza. Recientemente, la investigación se ha focalizado en establecer qué promotores están activos en músculo esquelético y si los mismos presentan polimorfismos funcionales que se asocien con la variabilidad en terneza. Resumen en inglés Calpastatin is a specific inhibitor of calpains, the main proteolytic enzymes of muscle. Calpastatin is encoded by the CAST gene, from which four different protein isoforms can be expressed due to the existence of four different promoters. This gene has been studied as a candidate to explain genetic differences in meat tenderness. In beef cattle, several single nucleotide polymorphisms (SNP) have been identified in different regions of the CAST gene. Some of them have bee (mas) n included in commercial tests because of their association with the variability in beef tenderness. Recently, research has focused on the regulation of different promoters in skeletal muscle and whether they have functional polymorphisms that are associated with the variability in tenderness.

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Robust dynamical pattern formation from a multifunctional minimal genetic circuit

Rodrigo, Guillermo; Carrera, Javier; Elena, Santiago F.; Jaramillo, Alfonso
2010-04-22

Digital.CSIC (Spain)

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Respuesta inflamatoria sistémica en cirugía cardíaca pediátrica/ Systemic inflammatory response in pediatric cardiac surgery

Lespron Robles, Ma. del Carmen
2006-06-01

Resumen en español La respuesta inflamatoria sistémica (RIS) es una entidad generalizada, no específica, dada por daño a los tejidos, de etiología indeterminada, rápida y altamente amplificada, y con un gran componente humoral y celular. La circulación extracorpórea (CEC) es indispensable para poder realizar una gran cantidad de cirugías cardíacas tanto en adultos como en niños, también se sabe de los efectos indeseables que provoca la RIS. El equipo quirúrgico a cargo de la cir (mas) ugía cardíaca pediátrica trata siempre de contribuir al manejo de los pacientes cuando existe la amenaza de secuelas adversas después de la CEC. Hay varios componentes de la RIS en cirugía cardíaca en los que intervienen los sistemas del complemento, inmunológico y endotelial. Las citocinas pueden ejercer efectos tanto proinflamatorios como antiinflamatorios en respuesta a una gran cantidad de estímulos fisiopatológicos, la tarea que deben realizar entre los dos tipos de éstas es ejercer una hemostasia o equilibrio inmunológico y fisiológico. Una RIS no controlada, juega un papel muy importante en la morbilidad y mortalidad en pacientes sometidos a CEC, contribuye en la patogénesis de disfunción pulmonar aguda, cardiovascular, neurológica, esplácnica, hematológica y del sistema inmune en el postoperatorio de cirugía cardíaca. Numerosas estrategias y agentes farmacológicos han sido postulados para reducir la severidad e incidencia de la RIS. Han sido estudiadas diversas técnicas, incluidas el mantenimiento de estabilidad hemodinámica, minimizar los tiempos de CEC, el uso de agentes inmunomoduladores y farmacológicos, también el uso de técnicas de hemofiltración, leucorreducción, la administración de inhibidores de proteasas y esteroides entre otras. La biología molecular ha revolucionado la medicina y la capacidad de valorar el impacto de la variabilidad en la caracterización de enfermedades y resultados perioperatorios. Recientes evidencias sugieren que el grado y severidad de la RIS después de cirugía cardíaca puede estar significativamente influenciada por el genotipo. Resumen en inglés Systemic Inflammatory Response (SIR) constitutes generalized, non- specific response to tissue injury of whatever etiology, and is a rapid, highly amplified, controlled humeral and cellular response. Cardiopulmonary Bypass (CPB) is necessary in many cardiac surgery as in adults as children. Also we know the undesirable effects of SIR. The pediatric surgical team to treat of management very well if exist the threat of undesirable outcome after CPB. There are several key co (mas) mponents of the inflammatory response to cardiac surgery involve the complement, immune and endothelial systems. Cytokines may exert either proinflammatory or antiinflammatory effects. Cytokines are essential for immunologic and physiologic homeostasis, are normally subject to thight homeostatic control, and are produced in response to a variety of physiologic and pathologic stimuli. An uncontrolled inflammatory response appears to play a significant role in the morbidity or mortality observed in patients undergoing CPB. The inflammatory response contributes to the pathogenesis of acute pulmonary, cardiovascular, neurologic, splanchnic, hematologic, and immune system dysfunction following cardiac surgery. The development of strategies to control the inflammatory response following cardiac surgery is currently the focus of considerable research efforts. Diverse techniques, including maintenance of hemodynamic stability, minimization of exposure to CPB circuitry, and pharmacologic and immunomodulatory agents have been studied. Also hemofiltration, leukodepletion, the use of serine protease inhibitors and corticosteroids. Molecular biology is revolutionizing medicine and the ability to assess the impact of genetic variability on disease characterization and perioperative outcome. Recent evidence suggests that the degree and severity of surgical- induced inflammation may be significantly influenced by genotype.

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106

Resistance to infection by fungal, bacterial, and viral pathogens in a common bean core collection from the Iberian Peninsula

Monteagudo, Ana B.; Rodiño Míguez, Ana Paula; Lema Márquez, Margarita; Fuente Martínez, María de la; Santalla Ferradás, Marta; Ron Pedreira, Antonio Miguel de; Singh, Shree P.
2006-01-01

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107

Rescue of multiple embryos in almond through in vivo micrografts

Martínez-Gómez, Pedro; Sánchez-Pérez, Raquel; Dicenta, Federico; Gradziel, Thomas M.
2004-01-01

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108

Relationships between the genetic distance of Epichloë festucae isolates and the ergovaline and peramine contents of their Fesuca rubra hosts.

Vázquez de Aldana, Beatriz R.; Zabalgogeazcoa, I.; Rubio de Casas, R.; García Ciudad, A.; García Criado, B.
2010-01-01

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109

Relationships among peach, almond, and related species as detected by simple sequence repeat markers

Martínez-Gómez, Pedro; Arulsekar, S.; Potter, D.; Gradziel, Thomas M.
2003-09-01

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110

Recent amplification and impact of MITEs on the genome of grapevine (Vitis vinifera L.)

Benjak, Andrej; Boué, Stéphanie; Fornaeck, Astrid; Casacuberta, Josep M.
2009-05-20

Digital.CSIC (Spain)

111

RB1 gene mutation up-date, a meta-analysis based on 932 reported mutations available in a searchable database

Valverde, José R.; Alonso García de la Rosa, Francisco Javier; Palacios, Itziar; Pestaña, Ángel
2005-11-04

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112

Presencia de alteraciones histopatológicas en vellosidades placentarias normales en Maracay (Venezuela)/ The presence of hystopathological alterations in normal placental villi in Maracay, Venezuela

Castejón-S, Olivar C; López-G, Ángela J; Pérez-Ybarra, Luis M
2009-09-01

Resumen en español Objetivo: determinar la proporción de las alteraciones histopatológicas en las vellosidades y en el espacio intervelloso obtenida de cuatro placentas normales del último trimestre del embarazo. Metodología: por medio de la microscopía de luz y la tinción de hematoxilina y eosina (H&E) se identificaron, en 25 láminas de 5 regiones de la placenta, 6 variables cuantitativas (p.ej. inmadurez vellosa, nódulos sincitiales, cambios fibrinoides, edema velloso, fibrosis es (mas) tromal y calcificación) y 9 variables cualitativas (p.ej. depósitos de fibrina, trombosis intervellosa, infartos, trombosis vascular, cambios en la pared del vaso, calcificación intraluminal, congestión vascular,inflamaciónyhemorragia).Los resultados de las variables cuantitativas se analizaron utilizando el Análisis de Varianza (ANAVAR) de 2 vías con submuestreo y el test de Tukey. En contraste, para las variables cualitativas se aplicó la prueba de Kruskal Wallis y se estimó el porcentaje de positividad según las regiones. Dichos análisis se realizaron por medio del software Statistix® 8.0 y SAS® 9.0 para Windows®. Resultados: no se presentaron diferencias significativas (p Resumen en inglés Objective: determining the percentage of histopathological changes in chorionic villi and intervillous space in four placentas obtained from normal women's pregnancies at term. Methodology: six quantitative variables (i.e. immaturity, syncytial knots, fibrinoid change, oedema, fibrosis and calcification) and nine qualitative variables (i.e. fibrin deposition, intervillous fibrin, infarction, thrombosis, changes in vessel walls, intraluminal calcification, vascular congest (mas) ion, inflammation and haemorrhage) were indentified on 25 slides covering 5 placental regions using light microscopy and H&E staining. Quantitative variable results were analysed using two-way variance analysis with sub-sampling and Tukey’s test; qualitative variables (the percentage of positive regions) were analysed by Kruskal-Wallis test. The software used was Statistix® 8.0 and SAS® 9.0 for Windows®. Results: there were significant differences (p

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113

Preliminary study on genetic variability of Dicrocoelium dendriticum determined by random amplified polymorphic DNA

Sandoval, Hilda; Manga-González, M. Yolanda; Campo, Raquel; García, Pedro; Castro, José María; Pérez de la Vega, Marcelino

2 figures, 2 tables.-- PMID: 11269322 [PubMed]. | Genetic variability of adult specimens of Dicrocoelium dendriticum has been studied using random amplified polymorphic DNA (RAPD). The worms were collected from the infected livers of different sheep from several localities in León province (NW Spain...

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114

Preliminary study on genetic variability of Dicrocoelium dendriticum determined by random amplified polymorphic DNA

Sandoval, Hilda; Manga-González, M. Yolanda; Campo, Raquel; García, Pedro; Castro, José María; Pérez de la Vega, Marcelino
1999-03-01

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115

Pollinizer influence on almond seed dormancy

García-Gusano, Marta; Martínez-Gómez, Pedro; Dicenta, Federico
2005-03-15

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118

Phylogeography and conservation genetics of endangered European Margaritiferidae (Bivalvia: Unionoidea)

Machordom, Annie; Erpenbeck, Dirk; Ramos Sánchez, M.ª Ángeles; Araujo, R.
2003-01-01

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119

Phylogeographic analysis reveals association of tick-borne pathogen, Anaplasma marginale, MSP1a sequences with ecological traits affecting tick vector performance

Estrada-Peña, Agustín; Naranjo, María Victoria; Acevedo-Whitehouse, Karina; Mangold, Atilio J.; Kocan, Katherine M.; Fuente García, José de la
2009-09-01

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121

Papel de las enzimas citocromo p450 en el metabolismo de fármacos antineoplásicos: Situación actual y perspectivas terapéuticas/ Role of cytochrome P450 enzymes in the metabolism of antineoplastic drugs

Quiñones S, Luis; Rosero P, Mario; Roco A, Ángela; Moreno T, Iván; Sasso A, Jaime; Varela F, Nelson; Cáceres L, Dante; Saavedra S, Iván
2008-10-01

Resumen en inglés Cytochrome P450 enzymes are very important to metabolize anti-carcinogenic agents. Therefore, understanding the role of these enzymes and their allele variants in the bioactivation or detoxification of drugs could greatiy benefit antineoplastic pharmacotherapy. The aim of thís manuscrípt is to give information about metabohzing enzymes for antineoplastic agents and to relate the current situation in antitumoral pharmacotherapy with recent knowledge about cytochrome P450 (mas) enzymes. This is crucial for the future perspectives towards personalized pharmacotherapy. We summarize the role of cytochrome P450 enzymes in the resistance and bioactivation of several antitumor agents, their induction and repression mechanisms and the effect of genetic polymorphisms on variability of drug metabolization. The understanding of genetic variability will help to develop new research Unes on innovative therapeutic possibilities

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122
125

Novel association of severe neonatal encephalopathy and Hirschsprung disease in a male with a duplication at the Xq28 region

Fernández, Raquel M.; Núñez-Torres, Rocío; González-Meneses, Antonio; Antiñolo, Guillermo; Borrego, Salud
2010-09-22

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126

Noninvasive estimation of minimun population sizes and variability of the major histocompatibility complex in the andean condor

Alcaide, Miguel; Cadahía, Luis; Lambertucci, Sergio A; Negro Balmaseda, Juan José
2010-08-01

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127

Niveles de homocisteína y polimorfismos de los genes de la MTHFR y la CBS en pacientes colombianos con trombosis venosa superficial y profunda/ Homocysteine levels and polymorphisms of MTHFR and CBS genes in Colombian patients with superficial and deep venous thrombosis

Ayala, Claudia; García, Reggie; Cruz, Edith; Prieto, Karol; Bermúdez, Marta
2010-06-01

Resumen en español Introducción. Se produce trombosis cuando en el sistema hemostático se desequilibran los mecanismos procoagulantes, anticoagulantes y fibrinolíticos, y se forman coágulos dentro de los vasos sanguíneos. Los factores de riesgo para el desarrollo de esta enfermedad pueden ser adquiridos o genéticos, polimorfismos o mutaciones en genes que conducen a hiperhomocisteinemia o que están comprometidos en las vías de coagulación. Objetivos. Analizar, en una población col (mas) ombiana con diagnóstico de trombosis venosa el perfil lipídico, los niveles de glucosa y homocisteína, y calcular las frecuencias alélicas y genotípicas de los polimorfismos c.677C>T del gen de la metilen-tetra-hidrofolato reductasa (MTHFR) y c. 699C>T, c.1080 C>T, c.844ins68 del gen de la cistationina betasintasa (CBS). Materiales y métodos. Se estudiaron 33 pacientes con sus respectivos controles. Las pruebas bioquímicas se realizaron por métodos colorimétricos y de inmunoensayo. Se utilizó la técnica de fragmentos de longitud polimórfica para la identificación de los polimorfismos mencionados. El estudio de asociación se hizo mediante la prueba de de ji al cuadrado. Resultados. Se confirmó el papel de algunos factores de riesgo ya establecidos para el desarrollo de enfermedad trombótica venosa y se encontró un efecto protector del polimorfismo CBS c.699C>T para el riesgo de hipercolesterolemia con diferencia estadísticamente significativa en el grupo de los casos al compararlo con los controles. Por otra parte, se encontró una tendencia estadística que podría indicar un efecto protector del polimorfismo 844ins68 para el desarrollo de enfermedad trombótica venosa. Conclusiones. No se encontraron diferencias estadísticamente significativas en los niveles de homocisteína entre el grupo de casos y de controles. Sin embargo, la variabilidad en las concentraciones plasmáticas fue mayor en los casos. Resumen en inglés Introduction. Thrombosis develops when the hemostatic system is incorrectly activated due to the unbalance between procoagulant, anticoagulant and fibrinolytic mechanisms allowing the formation of a clot within a blood vessel. The risk factors of this pathology can be acquired or can be genetic. Objectives. To analyze in a Colombian population with diagnosis of venous thrombosis, lipid profile, glucose and homocystein levels, to calculate the alleles and genotypic frequen (mas) cies of polymorphisms c.699 C>T, c.1080 C>T, c.844ins68 of the cystathionine ß synthase and the c.677 C>T of the methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) genes. Materials and methods. Thirty three patients and their controls were studied. The biochemical test was carried out by colorimetric methods and immunoassay. In this survey we used the restriction fragments longitude polymorphism (RLFP) technique to identify the polymorphisms mentioned. The association study was performed through the chi square test. Results. We confirmed that gene alterations increase risk for pathology; we found statistically significant differences in the group with hypercholesterolemia in presence of the polymorphism c.699 C>T in the CBS gene, showing a protective effect in the individuals carrying this genetic variation. Likewise, we found a statistical trend for an eventual protective effect of the CBS c.844ins68 polymorphism to venous thrombotic disease. Conclusions. There were not any statistically significant differences in homocystein levels between cases and controls; nevertheless, the variability in the plasma concentrations was greater in the group of cases.

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128

Nature and Culture in Prehistoric Amazonia Using G.I.S. to reconstruct ancient ethnogenetic processes from archaeology, linguistics, geography, and ethnohistory

Eriksen, Love

This thesis investigates the socio-cultural and linguistic development of pre-Columbian Amazonia, with a particular focus on the period between 500 BC and AD 1500. In assembling and analyzing data from archaeology, linguistics, ethnohistory, ethnography, and geography in a Geographical Information S...

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129

Múltiple genetic factors control self-fertility in almond

Gradziel, Thomas M.; Martínez-Gómez, Pedro; Dandekar, A. M.; Uratsu, S.; Ortega, Encarnación
2002-01-01

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130

Morphologic and Agronomic Diversity of Brassica napus Crops

Soengas Fernández, María del Pilar; Cartea González, María Elena; Velasco Pazos, Pablo; Padilla Alonso, Guillermo; Ordás Pérez, Amando
2008-01-01

Digital.CSIC (Spain)

131

Molecular variability within and among Verticillium dahliae vegetative compatibility groups determined by fluorescent amplified fragment length polymorphism and polymerase chain reaction markers

Collado-Romero, M.; Mercado Blanco, Jesús; Olivares-García, Concepción; Valverde-Corredor, Antonio; Jiménez-Díaz, Rafael M.
2006-05-01

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132

Molecular variability and phylogeny of Schistonchus caprifici (Gasperrini, 1864) Cobb, 1927 (Nematoda: Aphelenchoididae) from Italy and Spain

De Luca, Francesca; Castillo, Pablo; Troccoli, Alberto; Vovlas, Nicola; Palomares-Rius, J. E.; Juan, E.
2010-01-01

Digital.CSIC (Spain)

133

Molecular characterization of almond cultivars and related wild species using nuclear and chloroplast DNA markers

Zeinalabedini, Mehrshad; Majourhat, Khalid; Khayam-Nekoui, Mojtaba; Grigorian, Vazgin; Toorchi, M.; Dicenta, Federico; Martínez-Gómez, Pedro
2007-01-01

Digital.CSIC (Spain)

135

Molecular Phylogeny and Genome Size in European Lilies (Genus Lilium, Liliaceae)

Muratovic, E.; Hidalgo, O.; Garnatje, Teresa; Siljak-Yakovlev, S.
2010-01-01

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137

Modelación de funciones de crecimiento aplicadas a la producción animal/ Modeling of growth functions applied to animal production

Agudelo-Gómez, Divier A; Cerón-Muñoz M, Mario F; Restrepo L, Luis F
2007-06-01

Resumen en español El crecimiento animal es uno de los aspectos más importantes al momento de evaluar la productividad en las explotaciones dedicadas a la producción de carne y en algunos casos es usado como criterio de selección, sin embargo, debe tenerse en cuenta que el crecimiento no se debe exclusivamente a factores genéticos sino también, a efectos ambientales. Para medir el crecimiento animal se han usado diferentes modelos matemáticos lineales, no lineales y logarítmicos, ent (mas) re otros, eligiéndolos por su bondad de ajuste y la facilidad de interpretación biológica de sus parámetros. Recientemente se han usado modelos mixtos en los que sus parámetros están compuestos de efectos fijos y efectos aleatorios, representando los valores esperados y la varianza de los primeros, respectivamente, lo que permite evaluar la variabilidad de las diferentes curvas entre los individuos de una población, así como la covarianza entre los parámetros. Los criterios más usados para elegir la curva que mejor ajusta a los datos son: el coeficiente de determinación, el porcentaje de curvas significativas y atípicas encontradas para cada función; además se pueden aplicar criterios como el criterio de información Akaike y el criterio de información Bayesiano. El objetivo del presente trabajo es indicarle al lector una aplicación de los modelos no lineales y no lineales mixtos en el análisis del crecimiento animal. Resumen en inglés Animal growth is one of the most important aspect for evaluating animal productivity in beef cattle enterprises and in some cases it is used as a criterion of selection, nevertheless, the fact that animal growth is not exclusively due to genetic factors but also, to environmental effects should be keep in mind. Measurement of animal growth have been performed by several logarithmic, not lineal, lineal, and mathematical models, having as selection criteria its fitness of a (mas) djustment and the feasibility for biological interpretation of their parameters. Recently the mixed models have been used in which their parameters are composed of fixed and random effects representing the expected values and variance of the fixed ones, respectively, which permits to evaluate the variability of different curves between individuals of apopulation, as well as the covariance between parameters. The most used criteria for selection of the curve that best fit data are: determination coefficient and the percent of significant and atypical curves found for each function. In addition, other models as the Akaike information criteria and Bayesian information criteria can also be applied. The objective of the present review is to provide the criteria for application of linear and non linear models when analyzing animal growth.

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140

Microbial oceanography of the dark ocean's pelagic realm

Arístegui, Javier; Gasol, Josep M.; Duarte, Carlos M.; Herndl, Gerhard J.
2009-04-16

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141
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Marker-trait association for disease resistance in the Spanish barley core collection

Casas Cendoya, Ana María; Kopahnke, D.; Schweizer, G.; Gracia Gimeno, María Pilar; Lasa Dolhagaray, José Manuel; Ciudad, F. J.; Codesal, P.; Moralejo, M. A.; Molina-Cano, J. L.; Igartua Arregui, Ernesto; Ordon, Frank
2008-01-01

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143

Level and transmission of genetic heterozygosity in apricot (Prunus armeniaca L.) Explored using simple sequence repeat markers

Sánchez-Pérez, Raquel; Martínez-Gómez, Pedro; Dicenta, Federico; Egea, José; Ruiz, David
2006-06-01

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144

Las enfermedades emergentes y reemergentes: un problema de salud en las Américas/ Emerging and reemerging diseases: a health problem in the Americas

Ridel, Guillermo Mesa; Luis, Iraida Rodríguez; Teja, Julio
2004-04-01

Resumen en inglés In the Region of the Americas the emerging and reemerging infectious diseases that had the greatest impact on health, in terms of their incidence and the number of deaths that they caused during the five-year period of 1999­2003, were: malaria, yellow fever, dengue hemorrhagic fever, AIDS, anthrax, and SARS, as well as infection by hantavirus and by West Nile virus. The appearance of epidemics of emerging and reemerging diseases is related to biological, social, and e (mas) conomic factors. Growth in international trade, the movement of large numbers of people across national borders, the variability and genetic adaptability of the causative microorganisms, and inefficiencies in public health systems help to spread infections and epidemics. To avoid or reduce the serious effects of these epidemics, countries should give priority in their national agendas to surveillance of emerging and reemerging diseases and should implement a set of measures to combat the diseases. The most important of these measures is to develop a strategy that is based on early warning and rapid response mechanisms, with personnel and laboratories as well as communications networks that link laboratories with health service providers. This strategy should be backed by priority funding and adequate policies.

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145

La farmacogenómica y el camino hacia la medicina personalizada/ Pharmacogenomics and the path towards personalized medicine

Belloso, Waldo H.; Redal, María A.
2010-06-01

Resumen en español La variabilidad interindividual de la respuesta a fármacos reconoce a los aspectos genéticos como su principal explicación. El estudio de polimorfismos asociados con una alteración de la actividad o expresión de las proteínas que metabolizan, transportan o son blancos de acción de drogas, constituye la base de la farmacogenómica. Si bien se encuentra en sus etapas iniciales de desarrollo, en varias áreas terapéuticas el análisis farmacogenético contribuye sign (mas) ificativamente a la selección de drogas y de dosis apropiadas para pacientes individuales, y es ya reconocido y recomendado tanto por sociedades científicas como por agencias regulatorias y organismos de políticas sanitarias. La capacidad de maximizar la eficacia y prevenir efectos adversos de fármacos mediante el estudio genético del huésped abre la puerta para la terapéutica personalizada del futuro. Resumen en inglés Interindividual variability in the response to drugs is primarily explained by genetic factors. The study of polymorphisms associated with abnormal expression or activity of proteins involved in drug metabolism, transport or pharmacological activity constitutes the basis of pharmacogenomics. Although still in early phases of development, pharmacogenetic analysis in different therapeutic areas significantly contributes to the selection of drugs and doses for the individual (mas) patient and is already recognized and recommended by scientific societies, regulatory agencies and public health organisms. The ability to maximize drug efficacy and prevent adverse effects through the analysis of host genetics paves the way to the personalized therapy of the future.

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Impacto de la apolipoproteína A5 en el riesgo cardiovascular: Modulaciones genéticas y ambientales/ Impact of apolipoprotein A5 on cardiovascular risk: Genetic and environmental modulation

SOTOS-PRIETO, MERCEDES; FRANCÉS, FRANCESC; CORELLA, DOLORES
2010-07-01

Resumen en inglés Triglyceride concentrations are an independent risk factor for coronary heart disease. Apolipoprotein A5 gene (APOA5) has an important role determining triglyceride metabolism and it is a potential cardiovascular risk. However the mechanisms for these actions are not well-known. Despite the different allelic frequency of its major polymorphisms in different populations, multiple studies have shown consistent associations between these variants and fasting triglycerides. V (mas) ariations in the APOA5 gene have also been associated with postprandial triglycerides, as well as with different sizes of lipoproteins and other markers. Moreover, some of the APOA5 gene variants have been associated with ischemic heart disease, stroke, and carotid intima media thickness, although the references on this issue are scanty and contradictory. This may be due to the presence of gene-environment interactions that have been poorly studied until now. Among the few studies that have examined the infuence of environmental factors on possible genetic variations, the most important are those that contemplate possible gene-diet interactions. However, the evidence is still scarce and more research is required in the feld of nutrigenomics. To understand the impact of this gene on cardiovascular disease, we review the genetic functionality and variability of APOA5, its associations with intermediate and fnal phenotypes and gene-environment interactions detected

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Identificación de subtipos B y F de VIH-1 en pacientes chilenos/ Identification of B and F human immunodeficiency virus subtypes in Chilean patients

Ríos V, Maritza; Villanueva C, Carola; San Martín, Carolina; Ramírez V, Eugenio
2003-07-01

Resumen en inglés Background: Type I human immunodeficiency virus (HIV) is characterized by a great genetic variability. There are three groups of virus throughout the world: O, N and M. Group M is responsible for AIDS pandemic and is subdivided in 9 genetic subtypes. Most viral strains in South America are subtype B. Aim: To determine the frequency of HIV subtypes in Chilean patients. Material and methods: Genetic analysis of C2-V3-C3 region of the gene env in HIV strains coming from 77 C (mas) hilean subjects infected by different means. DNA heteroduplex mobility assay was used to determine HIV subtypes. Results: Sixty eight cases were infected with subtype B (88.3%) and nine cases were infected with subtype F (11.7%). Conclusions: Subtype B is the predominant HIV in Chile, but subtype F is also present (Rev Méd Chile 2003; 131: 711-8)

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150

Human Impacts on Drainages of the Mesa Central, Mexico, and Its Genetic Effects on an Endangered Fish, Zoogoneticus quitzeoensis

Domínguez-Domínguez, Omar; Boto, Luis; Alda, Fernando; Pérez-Ponce de León, Gerardo; Doadrio Villarejo, Ignacio
2007-01-01

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151

High prevalence of secondary resistance mutations in Venezuelan HIV-1 isolates./ Alta prevalencia de mutaciones secundarias en aislados venezolanos del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1.

Dieudonne, Mariacarolina; Garzaro, Domingo; Torres, Jaime; Naranjo, Laura; Suárez, José Antonio; Castro, Julio; Martínez, Nahir; Castro, Erika; Berrueta, Lisbeth; Salmen, Siham; Devesa, Marisol; Rangel, Héctor R; Pujol, Flor Helene
2006-03-01

Resumen en español Se estudiaron pacientes seropositivos para el virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 (VIH-1) con y sin tratamiento, con el fin de determinar el polimorfismo y la prevalencia de mutaciones de resistencia a la terapia antirretroviral. El material genético viral fue extraído a partir de células mononucleares de sangre periféricas (ADN) y del plasma (ARN) de 30 pacientes. Se amplificaron 2 regiones del gen Pol, Transcriptasa Reversa (TR) y Proteasa (Pr) y el gen de envo (mas) ltura (Env) por medio de la técnica de PCR y se obtuvo la secuencia genómica de los productos. Todos los aislados analizados pertenecieron al subtipo B. No se observaron mutaciones primarias asociadas a resistencia a inhibidores de Pr pero sí un alto porcentaje (86%, 19/22) de mutaciones no asociadas con resistencia sino a restitución de la capacidad replicativa de cepas mutantes (mutaciones secundarias). Se observó la presencia de mutaciones asociadas a resistencia a inhibidores nucleósidos de la TR (INTR) en 35% (6/17) de los pacientes sometidos a tratamiento, mientras que 12% (2/17) de ellos presentaron mutaciones de resistencia a inhibidores no nucleósidos de la TR (INNTR). Interesantemente, un paciente no tratado estaba infectado con una cepa que presentaba mutaciones primarias (7,7%); este resultado sugiere que podría ser importante plantearse el estudio local de determinación de resistencia genotípica en pacientes antes del tratamiento, con miras a minimizar fallas terapéuticas. Se requieren estudios adicionales para evaluar el rol de las mutaciones secundarias en el éxito de la infección viral. Resumen en inglés The genetic variability was studied in HIV-1 from Venezuelan patients with and without treatment, in order to evaluate the presence of polymorphisms and drug resistance mutations. Proviral DNA from peripheral blood mononuclear cells or viral RNA from plasma was extracted from the blood of 30 patients. Two regions from the polymerase gene, protease (Pr) and reverse transcriptase (RT) and one genomic fragment from the envelope (Env) gene were amplified and sequenced. All HI (mas) V-1 samples analyzed were classified as subtype B, without evidence of recombination. Although no primary protease mutations were detected, a high frequency of secondary mutations (86%, 19/22), associated to restoration of viral replicative fitness, was observed in strains circulating both in treated and non-treated patients. Resistance mutations to nucleoside RT inhibitors (NRTI) and non-nucleoside RT inhibitors (NNRTI) were detected in 35% (6/17) and 12% (2/17) of the viruses circulating in treated patients, respectively. Resistance mutations were also present in the virus infecting one antiretroviral naïve individual (7.7%), suggesting that local screening for resistant mutation in naïve patient might be important to minimize therapy failure. Future studies are warranted to assess the role of secondary mutation in the success of viral infection.

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Gynogenesis assessment using microsatellite genetic markers in turbot ( Scophthalmus maximus)

Castro, Jaime; Bouza, Carmen; Sánchez, Laura; Cal, Rosa M.; Piferrer, Francesc; Martínez, Paulino
2003-10-23

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155

Genetic variation, population structure and linkage disequilibrium in peach commercial varieties

Aranzana, Maria José; Abbassi, Kadri El-; Howad, Werner; Arús, Pere
2010-07-20

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156

Genetic variation at bx1 controls DIMBOA content in maize

Butrón Gómez, Ana María; Chen, Y.C.; Rottinghaus, G.E.; McMullen, Michael D.
2010-02-01

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Genetic variability of carotenoid concentration and degree of esterification among tritordeum (xTritordeum Ascherson et Graebner) and durum wheat accessions

Atienza, Sergio G.; Ballesteros, Juan; Martín Muñoz, Antonio; Hornero Méndez, Dámaso

8 pages, 3 figures, 2 tables.-- PMID: 17439153 [PubMed].-- Printed version published May 16, 2007. | The higher carotenoid content (commonly referred as “yellow pigment content”) of tritordeum seeds as compared to wheat and the potential of this species as a donor of useful traits to wheat led us to...

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Genetic variability in Muscari comosum (Liliaceae). III. Enzyme polymorphism in European and Canarian populations

Ruiz Rejón, C.; Lozano, R.; Ruíz Rejón, M.

[EN] Electrophoretic variation at six loci from 33 European and Canarian populations of Muscari comosum (Liliaceae) were studied. Only GDH was monomorphic, being polymorphic the remaining loci (GOT-1, GOT-2, GOT-3, IDH and ADH). Although apparently the populations are differentiated, such as showed ...

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Genetic structure and ecogeographical adaptation in wild barley (Hordeum chilense Roemer et Schultes) as revealed by microsatellite markers

Castillo, Almudena; Dorado, Gabriel; Feuillet, Catherine; Sourdille, Pierre; Hernández, Pilar
2010-11-30

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163

Genetic relationship among seven specialized forms of Fusarium oxysporum determined by DNA sequencing of the ITS region and AFLPs

Arroyo García, Rosa; Cenis Anadón, José Luis; Tello Marquina, Julio César; Martínez Zapater, José Miguel; Cifuentes Romo, Dina

[ENG] The fungus Fusarium oxysporum Sch.: Fr. present a high biological and genetic variability, manifested the exixtence of many specialized forms and races. With the goal of evaluating the genetic relationship among different specialized forms, an experiment was carried out involving the applicati...

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Genetic parameters for resistance to trichostrongylid infection in dairy sheep

Gutiérrez Gil, B.; Pérez, J.; Fuente, L. F. de la; Meana, A.; Martínez Valladares, María; San Primitivo, Fermín; Rojo Vázquez, Francisco Antonio; Arranz, J. J.
2010-04-01

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Genetic diversity in Hordeum chilense Roem. et Schult. germplasm collection

Atienza, Sergio G.; Satovic, Zlatko; Martín Muñoz, Antonio; Martin, L. M.

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Genetic diversity in Hordeum chilense Roem. et Schult. germplasm collection

Atienza, Sergio G.; Satovic, Zlatko; Martín Muñoz, Antonio Pedro; Martin, L. M.
2005-03-01

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Genetic diversity and symbiotic efficiency of rhizobial isolates obtained from nodules of Arachis hypogaea in northwestern Morocco

El-Akhal, M. Rabie; Rincón Herranz, A.; Arenal, F.; Lucas, M. Mercedes; El Mourabit, Nourdin; Barrijal, Said; Pueyo, José J.
2008-01-01

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Functional, fractal nonlinear response with application to rate processes with memory, allometry, and population genetics

Vlad, Marcel O.; Morán, Federico; Popa, Vlad T.; Szedlacsek, Stefan E.; Ross, John
2007-03-14

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Evaluación agronómica de diez clones promisorios CIP y dos materiales nativos de Ipomoea batatas L./ Agronomic evaluation of ten promissory CIP clones and two sweet potato (Ipomoea batatas L.) native materials

Tique, José; Chaves, Bernardo; Zurita, Jorge Humberto
2009-08-01

Resumen en español Con el propósito de rescatar la riqueza genética de la batata (Ipomoea batatas), durante dos ciclos de cultivo se realizaron evaluaciones agronómicas de dos materiales nativos, en comparación con diez clones provenientes del Centro Internacional de la Papa, clasificados allí como promisorios. El trabajo se llevó a cabo en el municipio de Coyaima, en el departamento del Tolima (Colombia), con la participación de los integrantes del Cabildo Indígena Autónomo Indepe (mas) ndiente Buenavista, y la colaboración del Consorcio Latinoamericano y del Caribe de Apoyo a la Investigación y el Desarrollo de la Yuca. Los materiales nativos se colectaron en parcelas de agricultores y se clasificaron como 'Bonanza' y 'Sangretoro', nombres tradicionales dados por los indígenas de la zona. El experimento fue desarrollado a través de un diseño de bloques completos al azar, con siete tratamientos y cuatro repeticiones. Los tratamientos correspondieron a los cinco clones CIP y las dos variedades regionales. Los resultados de la investigación permitieron cuantificar el alto potencial productivo de la batata como especie cultivada, encontrándose materiales muy promisorios que pueden ser incorporados a modelos agropecuarios de producción. Resumen en inglés With the aim of rescuing the genetic variability of sweet potato (Ipomoea batatas), the agronomical performance of two native materials was evaluated and compared to that of ten clones classified as promissory at Centro Internacional de la Papa. Carried out along two crop cycles, the study took place in the municipality of Coyaima (Tolima - Colombia), with the participation of the members of the Buenavista Autonomous and Independent Indigenous Council, and the collaborati (mas) on of the Consortium for the Support and Development of Cassava in Latin America and the Caribbean. The native materials were collected at local farms, and classified as 'Bonanza' and 'Sangretoro', which are their traditional indigenous names. The experiment was conducted under a completely randomized block design, with seven treatments (five CIP clones and the two regional varieties) and four repetitions. The results allowed quantifying the remarkably productive potential of cultivated sweet potato, and identifying very promissory materials that can therefore be incorporated to agricultural production models.

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Estudio de la inestabilidad cariotípica de levaduras vínicas

Llagostera Casas, Montserrat; Piña, Bejamín; Carro Puentedura, David
2006-01-01

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Epidemiología Molecular de la Tuberculosis en Bogotá en Aislados Clínicos obtenidos durante 11 Años/ Molecular epidemiology of tuberculosis in Bogotá in clinical isolates obtained over an 11-year period

Hernández, Johana E; Murcia, Martha I; de la Hoz, Fernando
2008-02-01

Resumen en español Objetivo Tipificar molecularmente aislados clínicos de Mycobacterium tuberculosis obtenidas en Bogotá entre los años 1995 a 2006, mediante la técnica RFLP-IS6110 para establecer las relaciones filogenéticas existentes entre ellos y determinar casos debidos a infección reciente (casos agrupados) Vs reactivaciones endógenas (patrones únicos). Métodos Se realizó un estudio retrospectivo, en el que se incluyeron 137 aislados clínicos pertenecientes al complejo Myco (mas) bacterium tuberculosis, obtenidos en Bogotá entre los años 1995 a 2006. Las variables estudiadas para cada paciente fueron: sexo, edad, confección con el Virus de la Inmunodeficiencia Humana , habitante en situación de calle, resultado de la baciloscopia, fecha del cultivo. Los aislados fueron identificados fenotípicamente y confirmados genotípicamente mediante el método molecular PRA y evaluados para sensibilidad a fármacos antituberculosos de primera línea utilizando el método simplificado de las proporciones múltiples. La genotipificación se realizó empleando el método de referencia RFLP-IS6110 (Polimorfismo en la Longitud de los Fragmentos de restricción). Resultados Todos los aislados fueron confirmados como pertenecientes al complejo M. tuberculosis, mostrando la identificación fenotípica una concordancia del 100 % con la identificación genotípica. La monorresistencia encontrada fue de 9,4 %, y la MDR (resistencia a Rifampicina e Isoniazida) fue 2,9 %. La genotipificación se realizó a 129 aislados, de los cuales 96 (74 %) mostraron diferentes patrones RFLP-IS6110 y 35 aislados (26 %) estuvieron agrupados en 17 clusters conformados por 2 a 4 aislados. La relación epidemiológica entre los pacientes no pudo ser establecida en la mayoría de los casos. De las variables estudiadas solamente el estado de coinfección con VIH fue un predictor significativo para el agrupamiento (p Resumen en inglés Objective Characterising clinical Mycobacterium tuberculosis isolates obtained from 1995 to 2006 in Bogotá , Colombia , using standardised IS6110-based RFLP typing for determining phylogenetic relationships. Calculating cases due to recent infection (grouped cases) cf endogenous reactivation (single patterns). Methods This retrospective study characterised 137 clinical Mycobacterium tuberculosis isolates obtained in Bogotá from 1995 to 2006. Study variables consisted of (mas) gender, age, HIV status, homelessness, Ziehl Neelsen smear result and date of culture. All isolates were freshly identified by phenotypic methods, confirmed by PRA and evaluated for susceptibility to antimicrobial agents according to the proportional method. Mycobacterium tuberculosis cultures were typed by standardised IS6110-based RFLP. Results All isolates were confirmed as being M. tuberculosis by phenotypic and genotypic methods. 9,4 % monoresistance and 2,9 % MDR (rifampicin- and isoniazid-resistant) were found. 129 M . tuberculosis isolates were genotyped; 96 (74 %) of them presented unique DNA fingerprints, whilst 35 (26 %) were grouped into 17 clusters consisting of two to four isolates. Direct epidemiological links between patients could not be established in most cases. Only HIV status was a significant predictor of clustering amongst the variables being studied (p

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Epidemiología Molecular de la Tuberculosis en Bogotá en Aislados Clínicos obtenidos durante 11 Años/ Molecular epidemiology of tuberculosis in Bogotá in clinical isolates obtained over an 11-year period

Hernández, Johana E; Murcia, Martha I; de la Hoz, Fernando
2008-01-01

Resumen en español Objetivo Tipificar molecularmente aislados clínicos de Mycobacterium tuberculosis obtenidas en Bogotá entre los años 1995 a 2006, mediante la técnica RFLP-IS6110 para establecer las relaciones filogenéticas existentes entre ellos y determinar casos debidos a infección reciente (casos agrupados) Vs reactivaciones endógenas (patrones únicos). Métodos Se realizó un estudio retrospectivo, en el que se incluyeron 137 aislados clínicos pertenecientes al complejo Myco (mas) bacterium tuberculosis, obtenidos en Bogotá entre los años 1995 a 2006. Las variables estudiadas para cada paciente fueron: sexo, edad, confección con el Virus de la Inmunodeficiencia Humana , habitante en situación de calle, resultado de la baciloscopia, fecha del cultivo. Los aislados fueron identificados fenotípicamente y confirmados genotípicamente mediante el método molecular PRA y evaluados para sensibilidad a fármacos antituberculosos de primera línea utilizando el método simplificado de las proporciones múltiples. La genotipificación se realizó empleando el método de referencia RFLP-IS6110 (Polimorfismo en la Longitud de los Fragmentos de restricción). Resultados Todos los aislados fueron confirmados como pertenecientes al complejo M. tuberculosis, mostrando la identificación fenotípica una concordancia del 100 % con la identificación genotípica. La monorresistencia encontrada fue de 9,4 %, y la MDR (resistencia a Rifampicina e Isoniazida) fue 2,9 %. La genotipificación se realizó a 129 aislados, de los cuales 96 (74 %) mostraron diferentes patrones RFLP-IS6110 y 35 aislados (26 %) estuvieron agrupados en 17 clusters conformados por 2 a 4 aislados. La relación epidemiológica entre los pacientes no pudo ser establecida en la mayoría de los casos. De las variables estudiadas solamente el estado de coinfección con VIH fue un predictor significativo para el agrupamiento (p Resumen en inglés Objective Characterising clinical Mycobacterium tuberculosis isolates obtained from 1995 to 2006 in Bogotá , Colombia , using standardised IS6110-based RFLP typing for determining phylogenetic relationships. Calculating cases due to recent infection (grouped cases) cf endogenous reactivation (single patterns). Methods This retrospective study characterised 137 clinical Mycobacterium tuberculosis isolates obtained in Bogotá from 1995 to 2006. Study variables consisted of (mas) gender, age, HIV status, homelessness, Ziehl Neelsen smear result and date of culture. All isolates were freshly identified by phenotypic methods, confirmed by PRA and evaluated for susceptibility to antimicrobial agents according to the proportional method. Mycobacterium tuberculosis cultures were typed by standardised IS6110-based RFLP. Results All isolates were confirmed as being M. tuberculosis by phenotypic and genotypic methods. 9,4 % monoresistance and 2,9 % MDR (rifampicin- and isoniazid-resistant) were found. 129 M . tuberculosis isolates were genotyped; 96 (74 %) of them presented unique DNA fingerprints, whilst 35 (26 %) were grouped into 17 clusters consisting of two to four isolates. Direct epidemiological links between patients could not be established in most cases. Only HIV status was a significant predictor of clustering amongst the variables being studied (p

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Embriología y genética del reflujo vesicoureteral primario y de la displasia renal asociada/ Embryology and genetics of primary vesicoureteral reflux and associated renal dysplasia

Morales Martínez, Antonio; Calvo Medina, Rocío; Chaffanel Peláez, Mercedes; Bueno Fernández, Alberto; Miguelez Lago, Carlos; Castillo Acedo del Olmo, Emilia del
2008-03-01

Resumen en español Objetivo: Realizar una aproximación a la embriología y genética del reflujo vesicoureteral (RVU) y de la nefropatía de reflujo (NR). Reconocer los patrones de asociación familiar del RVU y tratar de ver en qué casos se deberían considerar estudios genéticos a estos pacientes y, en tal caso, qué tipo de estudios. Por último, estudiar qué tipo de asociación presentan estos dos fenómenos (RVU y NR). Métodos: Revisión bibliográfica de artículos relacionados h (mas) asta junio de 2007. Resultados: Se reconocen dos tipos de RVU primario según la presentación: aislado y sindrómico; de este último se conocen sus mecanismos de transmisión y sigue patrones de herencia mendeliana. Los estudios epidemiológicos ponen de manifiesto que el RVU aislado también presenta asociación familiar, y es objeto de estudio el patrón de herencia del mismo; la mayoría de los autores sostienen la idea de que se trata de un fenómeno genéticamente heterogéneo en el que interactúan diferentes genes y efectos medioambientales. Son múltiples los genes candidatos implicados. Las características del RVU (expresividad y penetrancia variables, resolución espontánea) hacen difícil seleccionar aquellos pacientes subsidiarios de estudio genético. A pesar del tratamiento del RVU, la incidencia de fallo renal crónico secundario al mismo no ha descendido. Algunos de los genes candidatos en estudio para el RVU se han identificado como reguladores de la embriogénesis de la yema ureteral, paso clave para el desarrollo del riñón y tracto urinario. Análisis en ratones y humanos sugieren que parte del daño renal asociado al RVU es congénito y debido a una malformación congénita; por lo que la asociación entre RVU y fallo renal puede deberse a un defecto genético del desarrollo y no a la mala evolución del paciente con RVU. La investigación en animales es un paso clave para profundizar en los conocimientos en este tema (genes candidatos y asociación de RVU con NR). Conclusiones: Es importante conocer los patrones de asociación familiar del RVU (aislado y sindrómico) para dar consejo genético cuando sea posible. Por ello, en todo paciente con RVU, son necesarias una anamnesis y exploración específicas y dirigidas. La indicación actual de estudio genético tiene limitaciones. Se realizará diagnóstico prenatal si existe RVU sindrómico con mutación conocida, expresividad fija y penetrancia completa o si las manifestaciones conllevan riesgo vital. Los datos epidemiológicos y estudios de laboratorio nos orientan a la posibilidad de nefropatía congénita asociada en casos de RVU grave. Resumen en inglés Objectives: The main reasons of this review are: To determine some of the embryological and genetic mechanisms of vesicoureteral reflux (VUR) and associated congenital reflux nephropathy (NR); recognize different patterns of familiar clustering and identify appropriate cases where genetic counselling and investigations might be indicated; and finally, to establish the association of these phenomena (VUR and NR). Methods: Bibliographic search of related articles until June (mas) 2007. Results: There are two kinds of primary VUR: isolated VUR and syndromic VUR; the last one has an inherited Mendelian transmission and we know the mechanisms. Epidemiological studies seem to demonstrate that isolated VUR also presents familiar clustering and its inheritance pattern is the main object of interest in some studies; most authors support the hypothesis that VUR is genetically heterogeneous and is caused by a number of different genes acting with random environmental effects. There are lots of candidate implicated genes. The characteristics of VUR (incomplete penetrance, variability of expression, spontaneous resolution…) make difficult to configure a selection of patients subsidiary of genetic study. Despite different treatment options, the incidence of renal chronic failure secondary to VUR has not decreased. Some of the candidate genes identified regulate the position of ureteral budding, a critical step in both kidney and urinary tract development. Analysis of data from humans and mice suggests that some of the renal damage associated with VUR is congenital and is due to a kidney malformation. Therefore, in these cases, the association of VUR and renal failure may be caused by a genetic defect affecting the formation of the kidney and the urinary tract and not by evolution of VUR. Investigation in animals is fundamental to know more about this issue (candidate genes and VUR-NR association). Conclusion: It is important to learn patterns of familiar clustering of isolated and syndromic VUR to offer genetic counselling if possible. For this reason, we should be screening carefully all patients suffering from VUR. It is known that limitations in actual indications of genetic study exist. Prenatal diagnosis may be realized if there is a syndromic VUR with known mutation, invariable expressivity or if clinical manifestations involve risk of death. Epidemiological data and laboratory studies may give us guidance to elicit new cases of nephropathy associated to severe VUR.

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ESTUDIO POBLACIONAL DEL RECURSO ANCHOVETA (ENGRAULIS RINGENS JENYNS 1842) (CLUPEIFORMES, ENGRAULIDAE), MEDIANTE ANALISIS DE ADN/ POPULATION STUDY OF THE ANCHOVY RESOURCE (ENGRAULIS RINGENS JENYNS 1842) (CLUPEIFORMES, ENGRAULIDAE), THROUGH DNA ANALYSIS

Ferrada, Sandra; Hernández, Klaudia; Montoya, R.; Galleguillos, Ricardo
2002-01-01

Resumen en español Se estudió la variabilidad de 2 genes nucleares, el intrón 4/5 del gen de Calmodulina (CaM) por amplificación PCR y la región ITS (Internal Transcribed Spacers) del ADNr, por PCR y digestión en 139 ejemplares de E. ringens provenientes de las costas de Iquique (20°13'S; 70°09'W) y Talcahuano (36°41'S; 73°06'W). Para CaM se identificaron 8 genotipos en las muestras de Talcahuano y 7 en Iquique, presentando 1 a 3 fragmentos amplificados de 550 a 1.100 pb. En la dig (mas) estión del fragmento ITS amplificado, sólo la endonucleasa TaqªI detectó 3 diferentes genotipos, 2 presentes en Talcahuano y 3 en Iquique. Se discuten las frecuencias observadas para cada gen y área de estudio. Los resultados llevan a confirmar la existencia de un solo stock, desde un punto de vista genético Resumen en inglés The genetic variability of two nuclear genes, the 4/5 intron of the Calmodulin (CaM) and the ITS (Internal Transcribed Spacers) of the DNAr were studied. The methodology applied in 139 anchovies (E. ringens) from Iquique and Talcahuano, were the PCR amplification for CaM samples and the PCR amplification and digestion, for ITS samples. The results exhibited 8 genotypes for CaM in Talcahuano, and 7 were identified in Iquique. The size of the fragments founded (1-3), ranged (mas) from 550 to 1100 bp. The ITS amplification and digestion of a fragment determined the existence of 3 genotypes, 2 in Talcahuano and 3 in Iquique. But in the digestion of the ITS amplifications, only the TaqªI endonuclease showed diferences in the restriction profiles. The genotypic frequencies are discussed for each gene and study area, as well as the presence of only one stock from a genetic point of view

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Diversidad genética de Brycon orbignyanus en el sistema reproductivo semi-natural, utilizando el marcador RAPD/ Genetic diversity of Brycon orbignyanus in the semi-natural reproductive system, using the RAPD marker

Lopera Barrero, Nelson Mauricio; Pereira Ribeiro, Ricardo; arecido Povh, Jayme; Vargas, Lauro; Fornari, Darci Carlos; Nardez Sirol, Rodolfo; Rodríguez Rodríguez, María del Pilar
2010-03-01

Resumen en español Los programas de repoblamiento de ríos vienen siendo usados con mayor frecuencia como métodos de conservación de la ictiofauna. Sin embargo, el monitoreo genético y evaluación de procedimientos reproductivos son necesarios para obtener resultados viables en los ecosistemas impactados negativamente por el hombre. El objetivo de este estudio fue analizar la diversidad genética de Brycon orbignyanus utilizado en programas de repoblamiento, en el sistema reproductivo se (mas) mi-natural (SRSN), con el marcador RAPD. Fueron analizados 15 reproductores (Rp;10 machos y 5 hembras) y 95 larvas de la progenie. El SRSN permitió la obtención de una baja mortalidad de los Rp utilizados en el cruzamiento y todos presentaron desova/espermiación. Los 9 iniciadores utilizados produjeron 90 fragmentos (fg), de los cuales 73,33% fueron polimórficos. Encontrándose diferencias (P Resumen en inglés The stock enhancement programs are being used more frequently as methods of fish conservation. However, the genetic monitoring and the reproductive procedures evaluation are necessary to achieve viable and reliable results. The purpose of this study was to analyze the genetic diversity of Brycon orbignyanus used in stock enhancement programs, in the semi-natural reproductive system, with the RAPD marker. Fifteen broodstocks (10 male and 5 female) and 95 larvae of the offs (mas) pring were analyzed. The semi-natural reproductive system allowed the obtaining of a low mortality of the broodstocks using in the mating and all presented spawing/spermiation. The nine primers used yielded 90 fragments, of which 73,33% were polymorphic. Differences (P

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Criptosporidiosis en pacientes con el virus de la inmunodeficiencia humana/ Cryptosporidiosis in patients with the human immunodeficiency virus/ Criptosporidiose em pacientes com o vírus da imunodeficiência humana

Chacín-Bonilla, Leonor; Cheng-Ng, Rosita
2008-10-01

Resumen en portugués O alto potencial oportunista de Cryptosporidium e a cronicidade e gravidade eventual da infecção em indivíduos imuno-comprometidos tem acentuado sua importância como um problema de saúde pública global. A taxa de infecção do parasito em indivíduos com o Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) e diarréia é alta, com média de 32%. Estes pacientes são mais propensos a infecção e a espécies que geralmente não são infecciosas para os humanos. Os pacientes co (mas) m a Síndrome de Imunodeficiência Adquirida são susceptíveis a uma forma devastadora da criptosporidiose, manifestada por diarréia aquosa, voluminosa e crônica, e podem experimentar infecções atípicas que afetam tecidos extra-intestinais. No entanto, existe uma marcada variedade na apresentação clínica, incluindo a assintomática. Em geral, o risco à infecção, a enfermidade severa e ao desenvolvimento de complicações é proporcional a diminuição no número e a função dos linfócitos CD4+; a forma crônica mais severa está limitada a pacientes com contas de estas células menores de 150/ml. A variedade genética do parasito também pode afetar a apresentação clínica da infecção. Não existe uma quimioterapia curativa nem imunoterapêuticos ou vacinas aprovadas para o tratamento ou prevenção da infecção em pacientes infectados com o HIV. O melhor para a terapia e prevenção da criptosporidiose nestes pacientes é o tratamento anti-retroviral, já que a restauração dos linfócitos CD4+ permite a recuperação clínica ou a erradicação da infecção. Resumen en español El alto potencial oportunista de Cryptosporidium y la cronicidad y gravedad eventual de la infección en individuos inmunocomprometidos han acentuado su importancia como un problema de salud pública global. La tasa de infección del parásito en individuos con el Virus de la Inmunodeficiencia Humana (VIH) y diarrea es alta, con promedio de 32%. Estos pacientes son más propensos a la infección y a especies que generalmente no son infecciosas para los humanos. Los pacien (mas) tes con el Síndrome de Inmunodeficiencia Adquirida son susceptibles a una forma devastadora de la criptosporidiosis, manifestada por diarrea acuosa, voluminosa y crónica, y pueden experimentar infecciones atípicas que afectan tejidos extraintestinales. Sin embargo, existe una marcada variedad en la presentación clínica, incluyendo la asintomática. En general, el riesgo a la infección, a la enfermedad severa y al desarrollo de complicaciones es proporcional a la disminución en el número y la función de los linfocitos CD4+; la forma crónica más severa está limitada a pacientes con cuentas de estas células menores de 150/ml. La variedad genética del parásito también puede afectar la presentación clínica de la infección. No existe una quimioterapia curativa ni inmunoterapéuticos o vacunas aprobados para el tratamiento o prevención de la infección en pacientes infectados con el VIH. Lo mejor para la terapia y prevención de la criptosporidiosis en estos pacientes es el tratamiento antirretroviral, ya que la restauración de los linfocitos CD4+ permite la recuperación clínica o la erradicación de la infección. Resumen en inglés The high opportunistic and severe life-threatening potential of Cryptosporidium in immuno-compromised individuals have increased the importance of cryptosporidiosis as a global public health problem. The prevalence of the parasite in patients infected with the Human Immunodeficiency Virus (HIV) and diarrhea is high, with a median of 32%. These patients are more susceptible to the infection and species that are not usually infectious to humans. People with the Acquired Imm (mas) unodeficiency Syndrome are susceptible to a devastating form of cryptosporidiosis, manifested by chronic, voluminous, watery diarrhea, and can develop atypical extra-intestinal disease presentations. However, there is actually a marked variability in the clinical presentation, including asymptomatic infection. In general, the risk of infection, severity of illness, and development of unusual complications of cryptosporidiosis is proportional to the decrease of CD4+ cell numbers or function; severe life-threatening diarrhea is limited to patients with cell counts below 150 cells/ml. Symptoms may also be influenced by the genetic differences of the parasite. There is no reliable curative chemotherapy and no vaccines or immuno-therapeutics have been approved for the prevention or treatment of cryptosporidiosis in HIV infected patients. The best approach to prevention and therapy of the infection in these individuals is the maintenance of the immune system function by using the antiretroviral therapy that allows clinical recovery or parasite eradication.

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Contribution of recombination and selection to molecular evolution of Citrus tristeza virus

Martín, Susana; Sambade, Adrián; Rubio, Luis; Vives, María C.; Moya, Patricia; Guerri, José; Elena, Santiago F.

The genetic variation of Citrus tristeza virus (CTV) was analyzed comparing the predominant sequence variants in seven genomic regions (p33, p65, p61, p18, p13, p20, and p23) of 18 pathogenically distinct isolates from seven different countries. Analyses of the selective constraints acting on each c...

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Contribution of recombination and selection to molecular evolution of Citrus tristeza virus

Martín, Susana; Sambade, Adrián; Rubio, Luis; Vives, María C.; Moya, Patricia; Guerri, José; Elena, Santiago F.; Moreno, Pedro
2009-05-19

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Constraints to virus infection in Nicotiana benthamiana plants transformed with a potyvirus amplicon

Calvo, María; Dujovny, Gabriela; Lucini, Cristina; Ortuño, Jesús; Alamillo, Josefa M.; Simón-Mateo, Carmen; López-Moya Gómez, Juan José; García Álvarez, Juan Antonio
2010-07-06

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188

Concordancia de lesiones histológicas en ratones infectados por dos poblaciones de Trypanosoma cruzi de Chile/ Prepatency, parasitemia and histological lesions in mice infected with two Trypanosoma cruzi populations isolated in Chile

Pizzi P, Tulio; Wallace R, Anne; Villagra O, Rebeca; Muñoz V, Sergio; Ortiz Z, Sylvia; Solari I, Aldo
2005-04-01

Resumen en inglés The great variability in the clinical presentation of Chagas disease may depend in part in the genetic variability of Trypanosoma cruzi populations. Aim: To compare prepatent period, parasitemia, mortality and histological lesions in mice infected with two populations of Trypanosoma cruzi isolated in Chile. Material and methods: Two Trypanosoma cruzi populations, isolated from Chilean Triatomides and genetically characterized by kinetoplast restriction fragment DNA profil (mas) es, were compared. Two groups of 40 Balb/c mice were studied. Each mouse was inoculated with 10(4) trypomastigotes, of the V-121 and sp COMB 2 Trypanosoma cruzi populations. The prepatent period, parasitemia, mortality and histopathological lesions, at different evolutionary stages of infection were registered during 32 days. Results: Prepatency and mortality were similar in both groups of mice. However, parasitemia was significantly greater in mice inoculated with V-121 than those inoculated with sp COMB 2. Amastigote pseudocysts and inflammation were present only in skeletal muscle and myocardium in both groups of mice. The intensity of tissue involvement was associated to the level of parasitemia, therefore it was greater in mice inoculated with V-121 population. Conclusions: V-121 population of Trypanosoma cruzi caused a greater parasitemia than COMB 2, in inoculated mice

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189

Comparison of ‘Verna’ lemon juice quality for new ingredients and food products

García-Viguera, Cristina; Moreno, Diego A.; González-Molina, Elena
2009-05-01

Digital.CSIC (Spain)

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Climatic and Genotypic Effects for Grain Yield in Maize under Stress Conditions

Romay Álvarez, María Cinta; Malvar Pintos, Rosa Ana; Campo, L.; Álvarez Rodríguez, Ángel; Moreno-González, Jesús; Ordás Pérez, Amando; Revilla Temiño, Pedro
2010-02-01

Digital.CSIC (Spain)

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Citrus exocortis viroid and Hop Stunt viroid Doubly infecting grapevines in Brazil

Eiras, Marcelo; Targon, Maria Luisa P.N; Fajardo, Thor V.M.; Flores, Ricardo; Kitajima, Elliot W.
2006-01-01

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CARACTERIZACIÓN GENÉTICA DE LOTES DE Brycon orbignyanus UTILIZADOS EN PROGRAMAS DE REPOBLAMIENTO/ GENETIC CHARACTERIZATION OF Brycon orbignyanus STOCKS USED IN RESTOCKING PROGRAMS

Lopera B, Nelson; Ribeiro P, Ricardo; Sirol N, Rodolfo; Povh, Jayme; Gomes, Patricia; Streit Jr, Danilo; Vargas M, Lauro
2008-01-01

Resumen en español Objetivo. Caracterizar genéticamente dos lotes y una progenie de Brycon orbignyanus destinados para programas de repoblamiento, utilizando la técnica molecular de RAPD (Random amplified polymorphic DNA). Materiales y métodos. Se analizaron 58 reproductores originarios de dos piscícolas ubicadas en las ciudades de Castillo (A:30 individuos) y Porto Ferreira (C:28 individuos), mantenidos en cautiverio hace seis años en la estación de acuicultura e hidrología de la Du (mas) ke Energy Internacional (Geração Paranapanema) (São Paulo-Brasil). Treinta larvas de la progenie del lote A (B) también se analizaron. Resultados. Los 14 primers usados produjeron 87 fragmentos de los cuales 70.11% fueron polimórficos. Fueron observadas diferencias (p≤0.05) en la frecuencia de 31 fragmentos, con tres exclusivos para el lote A. Los valores de divergencia, distancia e identidad genética mostraron que la diversidad genética del lote A fue mantenida en la progenie y que existe una baja diferenciación entre los lotes de reproductores. El análisis de variancia molecular mostró que la mayor parte de la variación está dentro de cada lote (87.45%) y no entre ellos (12.55%). Este resultado se corroboró con los valores de F ST (0.125) y con el dendrograma, que indicaron una moderada diferenciación genética, sin la formación de agrupamientos. Conclusiones. La diversidad genética fue preservada en la progenie debido al manejo eficiente de la reproducción. No hubo una diferenciación genética entre los lotes de reproductores, debido posiblemente a que el origen natural de ambos fue el río Paraná. Resumen en inglés Objective. To genetically characterize two Brycon orbignyanus stocks and one progeny intended for restocking programs using the molecular technique RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Materials and methods. Fifty eight broodstocks native to two fish farms in the cities of Castilho (A:30 individuals) and Porto Ferreira (C:28 individuals) were analyzed. The fish had been maintained for six years in captivity in the aquaculture and hydrology station of Duke Energy Inter (mas) national (Geração Paranapanema. São Paulo - Brazil); thirty larvae of progeny from the stock A (B) were also analyzed. Results. The fourteen primers used produced 87 fragments of which 70.11% were polymorphic. Differences were observed (p≤0.05) in the frequency of 31 fragments, with three exclusive from stock A. The values for divergence, distance and genetic identity showed that genetic diversity of stock A was maintained in progeny and that a low differentiation exists among reproductive stocks. Analysis of Molecular variance showed that most of the variation is inside each stock (87.45%) and not between them (12.55%). This result was corroborated with F ST (0.125) values and with the dendrogram indicating a moderate genetic differentiation, without cluster formation. Conclusions. Genetic variability was maintained in progeny, possibly because both were native to the Paraná river.

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195

Aspectos del polimorfismo genético en Drosophila pseudoobscura, D. willistoni y D. nebulosa/ Aspects of genetic polymorphism in Drosophila pseudoobscura, D. willistoni and D. nebulosa

Salceda Sacanelles, Víctor Manuel
2008-06-01

Resumen en español En México el polimorfismo cromosómico en poblaciones naturales de Drosophila se estudió en D. pseudoobscura, D. willistoni y D. nebulosa. En la primera, más ampliamente analizada, se reconocen 27 inversiones correspondientes al 67.5% de la variabilidad para esta característica, identificando cuatro razas. Diferentes recolectas detectaron nuevas inversiones que permitieron reestructurar el árbol filogenético para la característica. Con base en el alto número de es (mas) tas nuevas inversiones y otras evidencias se postuló como arreglo ancestral el Tree Line (TL) y se sugiere como centro de origen de la especie la región en que colindan los estados de Michoacán y Zacatecas. Se encontraron gradientes geográficos para algunas inversiones tanto en localidades distantes como micro-geográficas. Un estudio de recolectas semestrales por ocho años con las otras dos especies señaló alto grado de diversidad para la frecuencia de inversiones, 64.3% para D. willistoni y 52.9% para D. nebulosa. En ambas especies se cuantificó el número promedio de inversiones por hembra de 2.57 para D. willistoni y de 1.57 para D. nebulosa, que las sitúan dentro del área marginal de la distribución de la especie. Sin embargo, conservan alto grado de diversidad que aparentemente no les correspondería debido a su marginalidad. Resumen en inglés In Mexico , chromosomal polymorphism in Drosophila has been studied in D. pseudoobscura, D. willistoni and D. nebulosa. The first species is better studied with respect to the number of populations analyzed (close to 60), in which there were recognized up to 27 inversions corresponding to the 67.5 % of the total variability for this characteristic, identifying four races. With all of these evidences we rebuilt phylogenetic tree and postulate as ancestral gene arrangement (mas) the sequence Tree Line (TL) and suggesting as origin center of the species the surrounded area between Michoacán and Zacatecas states. Geographical gradients for several inversions at both macro and micro-geographic scales were also detected. The other species were both studied for a seasonal changes during eight years. As a result, it was found a high variability degree for the inversions number, 64.3% of the total variability for this parameter in D. willistoni and 52.9 % in D. nebulosa. Average number of inversions carried by a female was 2.57 in D. willistoni and 1.57 in D. Nebulosa, which set as marginal with respect to the distribution. Nevertheless, they show a considerable variability not expected for a marginal population.

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Aplicación de técnicas bayesianas en el análisis genético de árboles forestales/ Applications of bayesian techniques in forest tree breeding

Mora, Freddy; Perret, Sandra
2007-01-01

Resumen en español El objetivo de este estudio fue investigar los métodos bayesianos como una alternativa de inferencia científica aplicada a la evaluación genética forestal. Se usaron los algoritmos de Cadenas Independientes (IC) y de Gibbs (GS) en un conjunto de datos provenientes de un ensayo de Eucalyptus cladocalyx, para la predicción del efecto familiar e individual, respectivamente. El ensayo fue establecido en el sector costero de la Región de Coquimbo, norte de Chile. Se eval (mas) uó la tasa de crecimiento promedio de la altura (TCA) y el diámetro (TCD), medidas en un periodo de 30 meses. Los procedimientos se compararon con la mejor predicción linear inses-gada (BLUP). Se confirmó una significativa asociación entre el ranking familiar de BLUP e IC, aunque se evidenciaron mayores intensidades de selección al utilizar las regiones de credibilidad de los efectos genotípicos (enfoque bayesiano). Se obtuvieron altas y significativas correlaciones de Spearman (Ts= 0,9) entre BLUP y GS. Se obtuvieron moderadas heredabilidades individuales: h²=0,42 (TCA) y h² = 0,43 (TCD). Las características se correlacionaron significativamente entre sí (Fs = 0,7). Las ganancias genéticas, en relación al promedio del ensayo, variaron de 17% a 28%. Al seleccionar para TCD, mayor ganancia y diversidad genética puede ser alcanzada y mantenida que la diversidad encontrada en este ensayo de progenie. Se concluyó que la inferencia bayesiana puede ser una herramienta metodológica útil en la evaluación genética forestal, ya que permitió incorporar la variación de los parámetros genéticos a través de las distribuciones a posteriori Resumen en inglés This study was undertaken to investigate bayesian methods to scientific inference in forest tree breeding. The Independence Chain (IC) and Gibbs sampling (GS) algorithms were applied on data sets from a field trial of Eucalyptus cladocalyx aiming to predict random family and additive genetic effects, respectively. The trial was carried out in the coastal area of Coquimbo Region, northern Chile. Diameter and height growth rate (TCD and TCA) were the data sets collected in (mas) a period of 30 months. Bayesian procedures were compared with the ranking obtained by Best Linear Unbiased Prediction (BLUP). BLUP and IC had similar family ranking, although the family selection based on credible intervals of the genoty-pic effects (bayesian framework) was clearly more intensive. Spearman rank correlation coefficients were high and significant (Ps= 0.99) between BLUP and GS. The estimates of heritability were moderate: h²= 0.42 (TCA) and h²= 0.43 (TCD). The traits had a significant correlation (Ts= 0.7). The estimated genetic gains, in relation to the experimental average, ranged from 17% to 28%. The greatest genetic gain and genetic diversity of the original diversity of the experimental populations may be achieved and maintained if the trees are selected for TCD. It was conclude hat the bayesian inference may be a useful tool in the genetic evaluation of forest trees, since it incorporates the variability of the genetic parameters by using posterior distributions

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200

Analysis of diversity in wild and cultivated common beans from Argentina

Galván, M. Z.; Menéndez-Sevillano, M.ª Carmen; Ron Pedreira, Antonio Miguel de; Santalla Ferradás, Marta

Northwestern Argentina is the southernmost limit of the Andean domestication area of common bean hosting, like other areas in South America, wild relatives of beans, which are the main source of variability of beans. In addition, different cultivars developed at CIAT that are adapted to the environm...

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Analysis of diversity in wild and cultivated common beans from Argentina

Galván, M. Z.; Menéndez-Sevillano, M.ª Carmen; Ron Pedreira, Antonio Miguel de; Santalla Ferradás, Marta; Balatti, Pedro A.
2005-03-01

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ANALISIS ISOENZIMÁTICO EN BRAMA AUSTRALIS VALENCIENNES 1837 (PISCES, PERCIFORMES, BRAMIDAE) EN LA ZONA CENTRO-SUR DE CHILE/ ISOENZYME ANALYSIS IN BRAMA AUSTRALIS VALENCIENNES 1837 (PISCES, PERCIFORMES, BRAMIDAE) IN THE SOUTH CENTER ZONE OF CHILE

Espinoza, Pablo; Galleguillos, Ricardo; Astete, Sofia
2002-01-01

Resumen en español Los resultados muestran un valor de heterocigosidad de 11% si se considera los 12 loci presuntivos analizados. El polimorfismo es de 25%, semejante al reportado en distintas especies de peces marinos. Por otro lado el análisis estadístico de las pruebas Fst y X² sugieren que las poblaciones de Valparaíso y Lebu se ajustan al equilibrio de Hardy-Weinberg. Los valores de Identidad genética (I = 0,996) y Distancia genética de Nei (D = 0,004), demuestran diferencias no significativas Resumen en inglés The pacific pomfret, Brama australis, is an epipelagic and mesopelagic fish and the distribution is from Coquimbo in the north to the Austral zone in the south. The main fisheries area are the V and VIII Región. We study the genetic variability in this species using starch gel electrophoresis of proteins. The samples com from Valparaíso (33°05'S; 71°40'W) and from Lebu (37°37'S; 73°40''`W). The results show that the heterozygosity is 11% when 12 presuntive loci are (mas) analized. The polymorphism is 25 %, similar to those reported in different species of marine fish. On the other hand, the statistical analysis of Fst and X² test suggest that populations of Valparaíso and Lebu fit to Hardy-Weinberg equilibrium. The values of genetic identity (I = 0.996) and Nei genetic distance (D = 0,004) demonstrate not significative differences

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204

A molecular genetic perspective of reproductive development in grapevine

Carmona, María José; Chaïb, Jamila; Martínez-Zapater, José M.; Thomas, Mark R.
2008-10-01

Digital.CSIC (Spain)