Sample records for ELECTROFORESIS BIDIMENSIONAL (two-dimensional electrophoresis)
from WorldWideScience.org

Sample records 1 - 20 shown. Select sample records:



1

Zebrafish fin immune responses during high mortality infections with viral haemorrhagic septicemia rhabdovirus. A proteomic and transcriptomic approach

Encinas, Paloma; Rodríguez-Milla, Miguel A.; Novoa, Beatriz; Estepa, Amparo; Figueras, Antonio; Coll, Julio
2010-09-27

Digital.CSIC (Spain)

2

The apoplastic antioxidant system in Prunus: Response to long-term Plum pox virus infection

Díaz-Vivancos, Pedro; Rubio, Manuel; Mesonero, Victor; Periago, Paula María; Ros Barceló, Alfonso; Martínez-Gómez, Pedro; Hernández, José Antonio
2008-01-01

Digital.CSIC (Spain)

5

Proteomic analysis of human omental adipose tissue in the polycystic ovary syndrome using two-dimensional difference gel electrophoresis and mass spectrometry

Cortón, Marta; Botella-Carretero, José I.; López, Juan A.; Camafeita, Emilio; San Millán, José L.; Escobar-Morreale, Héctor F.; Peral, Belén
2007-03-01

Digital.CSIC (Spain)

7

Novel display of knotted DNA molecules by two-dimensional gel electrophoresis

Trigueros, Sonia; Arsuaga, Javier; Vázquez, María E.; Sumners, De Witt; Roca, Joaquim
2001-07-01

Digital.CSIC (Spain)

9

Lipoprotein lipase is nitrated in vivo after lipopolysaccharide challenge

Casanovas, Albert; Carrascal, Montserrat; Abián, Joaquín; López-Tejero, M. Dolores; Llobera, Miquel
2009-12-01

Digital.CSIC (Spain)

10

LA PROTEOMICA EN LA ERA POSTGENÓMICA/ The Proteomics In The Postgenomic Era

SANDOVAL-USME, MARÍA CLAUDIA; UMAÑAPÉREZ, ADRIANA; VALLEJO-PULIDO, ANDRÉS FELIPE; ARÉVALO-FERRO, CATALINA; SÁNCHEZGÓMEZ, MYRIAM
2009-12-01

Resumen en español El principal desafío de la biología moderna es entender la expresión, función y regulación del conjunto completo de proteínas codificadas por un organismo, lo cual describe el objetivo del nuevo campo de la proteómica. Las proteínas son las efectoras del trabajo celular, por ello el estudio de sus perfiles globales de expresión y de sus cambios bajo determinadas condiciones fisiológicas o patológicas, permite entender la red compleja de interacciones en que se (mas) basa el funcionamiento de una célula. La electroforesis en dos dimensiones (2D-PAGE) es la técnica central de la proteómica. En la actualidad no existe otro método con la capacidad para resolver simultáneamente miles de proteínas en un solo procedimiento y para detectar modificaciones post y co-traduccionales imposibles de predecir a partir de la secuencia genómica. Sus aplicaciones incluyen el análisis de proteomas, señalización, detección de marcadores de enfermedades y cáncer. Resumen en inglés The main challenge of modern biology is to understand the expression, function and regulation of the whole set of proteins codified by an organism, which is the objective of the new field of proteomics. Proteins are the effectors of cellular work and the knowledge of their global expression profiles and changes under physiological and pathological conditions can help us to understand the complex network of interactions involved in cellular function. Two-dimensional electr (mas) ophoresis (2-DE) is the central technology in proteomics. At present no other technique has the throughput and high resolution of 2-DE for the separation of thousands of proteins in one procedure and for the analysis of post-and co-translation modifications, not predictable from the genome sequence. The scope of applications extends from proteome analysis, to cell signaling, disease markers and cancer.

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11

Infection with Salmonella typhimurium has no effect on the composition and cleavage specificity of the 20S proteasome in human lymphoid cells

Marcilla Goldaracena, Miguel; López de Castro Álvarez, José Antonio; Castaño, José G.; Álvarez, Iñaki
2007-09-01

Digital.CSIC (Spain)

12

Improved resolution of the human adipose tissue proteome at alkaline and wide range pH by the addition of hydroxyethyl disulfide

Cortón, Marta; Villuendas, Gemma; Botella-Carretero, José L.; San Millán, José L.; Escobar-Morreale, Héctor F.; Peral, Belén
2004-02-01

Digital.CSIC (Spain)

13

Expression of differential antennal proteins in males and females of an important crop pest, Sesamia nonagrioides

Acín, Patricia; Carrascal, Montserrat; Abián, Joaquín; Guerrero, Ángel; Quero, Carmen
2009-01-01

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14

Expresión diferencial de proteínas cardiacas en ratas diabéticas tipo Sprague-Dawley/ Differential heart protein expression in diabetic type Sprague-Dawley rats

Southgate, Richard; Osorio, Cristina; Bustamante, John; Alzate, Óscar
2006-12-01

Resumen en español Se purificaron proteínas cardiacas a partir de ratas diabéticas y sanas de tipo Sprague-Dawley. Las proteínas fueron fraccionadas por medio de gel de electroforesis de dos dimensiones (2D-PAGE). La separación resultante fue visualizada por tinción con Coomassie azul. Luego de ser convertidas en imagen digital, las proteínas del grupo diabético y del grupo control fueron comparadas y correlacionadas para determinar los niveles de expresión diferenciada. Sesenta de (mas) las ciento ochenta proteínas en el gel fueron removidas y digeridas en fragmentos pequeños de péptidos, los cuales se analizaron por medio de espectrometría de masas para determinar la estructura primaria de los péptidos resultantes (secuencia de los aminoácidos). Esta información se registró en una base de datos (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) para determinar la identidad de las proteínas precedentes a los péptidos. Se determinó la identidad de las proteínas expresadas diferencialmente en el tejido cardiaco de ambos grupos; se encontraron varias proteínas expresadas en diferentes niveles a los normales cuando se analizaron los corazones de ratas diabéticas, incluyendo fosfatasa de tiroxina (PTP, Q60998), receptores de lipoproteínas de muy baja densidad (VLDL-R, P98156), perioxidasa de glutation (PHGPx, O70325), transferasa de serina hidroxilamina (SHMT, P50431), adenylyl cyclasa proteína 1 asociada (CAP1, P40124) y teletonina (TELT, O70548). Resumen en inglés Cardiac proteins were isolated from diabetic and wild type Sprague-Dawley rats, then fractionated by two dimensional gel electrophoresis (2D-PAGE) using isoelectric focusing and molecular weight. The resulting protein spots were stained to facilitate detection. After being converted into a digital image, the proteins on the diabetic and wild type gels were matched to each other then compared to determine levels of expression. Sixty of the one hundred and eighty proteins o (mas) n the gel were removed and digested to produce peptide fragments, which were analyzed by mass spectrometry to determine their amino acid sequence. This information was entered into a protein database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) to determine the identity of the corresponding proteins. The identity of proteins differentially expressed in cardiac tissue of both groups was determined: several proteins were found to be expressed at different levels than normal in the hearts of diabetic rats, including protein tyrosine phosphatase (PTP, Q60998), very low-density lipoprotein receptor (VLDL-R, P98156), glutathione peroxidase (PHGPx, O70325), serine hydroxymethyl transferase (SHMT, P50431), adenylyl cyclase-associated protein 1 (CAP1, P40124), and telethonin (TELT, O70548).

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15

Discovery of lipoprotein lipase pI isoforms and contributions to their characterization

Casanovas, Albert; Carrascal, Montserrat; Abián, Joaquín; López-Tejero, M. Dolores; Llobera, Miquel
2009-08-20

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16

Differential Proteomics of Omental and Subcutaneous Adipose Tissue Reflects Their Unalike Biochemical and Metabolic Properties

Pérez Pérez, Rafael; Ortega Delgado, Francisco J.; García Santos, Eva; López, Juan A.; Camafeita, Emilio; Ricart, Wifredo; Fernández Real, José Manuel; Peral, Belén
2009-02-09

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17

Differential Protein Accumulation in Banana Fruit during Ripening

Domínguez-Puigjaner, Eva; Vendrell Melich, Miguel; Ludevid, M. Dolors
1992-01-01

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19

Caracterización tridimensional de proteínas de soya mediante electroforesis de dos dimensiones y partición en fases acuosas/ Tridimensional soy protein characterization using two-dimensional electrophoresis and partition in aqueous phases

Aguilar, O.; Rito-Palomares, M.; Glatz, C. E.
2009-04-01

Resumen en español El conocimiento general de las propiedades moleculares de las potenciales proteínas contaminantes favorece la selección y el diseño de estrategias adecuadas para la recuperación de proteínas recombinantes. Una nueva estrategia experimental resultado de la combinación de electroforesis de dos dimensiones (2DE) cuantitativa con sistemas de dos fases acuosas (SDFA) hidrofóbicos fue empleada para la caracterización tridimensional de proteínas de soya. Los gráficos t (mas) ridimensionales formados por peso molecular (M R), punto isoeléctrico (pI) e hidrofobicidad superficial (Log Kp) fueron obtenidos usando dos diferentes composiciones de SDFA (poli-etilenoglicol (PEG) 3350 (15.7%)-sulfato de sodio (8.9%)-NaCl (3%) y PEG 3350 (14.8%)-fosfato de potasio (10.3%)-NaCl (3%)). Los dos sistemas evaluados resultaron en diferentes valores de hidrofobicidad para el mismo extracto protéico, sugiriendo una alta influencia de la sal empleada para formar los SDFA en el comportamiento de partición de las proteínas. La presencia de proteínas dominantes derivadas de las dos principales proteínas de almacenamiento, limitó el número de proteínas detectadas en los geles, y por tanto el número de puntos caracterizados en 3D. La identificación de las principales proteínas contaminantes y su proporción relativa en las graficas tridimensionales, representa una etapa inicial para la selección de mejores estrategias de purificación o incluso la selección de un hospedero más adecuado en el desarrollo de procesos biotecnológicos. Resumen en inglés General knowledge of the molecular properties of the potential contaminant proteins benefits the selection and design of suitable strategies for the recovery of recombinant proteins. A novel experimental approach that resulted from the combination of quantitative 2D electrophoresis (2-DE) with hydrophobic partitioning in aqueous two-phase systems (ATPS) was applied for the three-dimensional characterization of soybean proteins. The three dimensional scatter plots of molec (mas) ular weight (M R), isoelectric point (pI) and surface hydrophobicity (log K P) were obtained using two different ATPS compositions, PEG 3350 (15.7%)-sodium sulfate (8.9%)-NaCl (3%) and PEG 3350 (14.8%)-potassium phosphates (10.3%)-NaCl (3%). Molecular properties of soybean proteins were obtained (M R, pI and log K P) simultaneously using two different ATPS resulting in two different protein profiles, suggesting a high influence of the phase-forming salt on the partitioning behavior of soybean proteins. The presence of dominant proteins derived from two main storage proteins limited the number of spots detected in gels and consequently the number of 3D spots characterized. The identification of the major contaminants proteins and their relative concentration depicted in the tridimensional graph represents the first stage in the selection of better strategies for the purification of products or the selection of a potential host in the development of bioprocesses.

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20

Biochemical Characterization and Cellular Localization of 11S Type Storage Proteins in Olive (Olea europaea L.) Seeds

Alché Ramírez, Juan de Dios; Jiménez-López, José Carlos; Wang, Wei; Castro López, Antonio Jesús; Rodríguez García, María I.
2006-01-01

Digital.CSIC (Spain)

21

Application of proteomic tools to detect the nonspecificity of a polyclonal antibody against lipoprotein lipase

Casanovas, Albert; Carrascal, Montserrat; Abián, Joaquín; López-Tejero, M. Dolores; Llobera, Miquel
2008-07-17

Digital.CSIC (Spain)

22

Application of highly sensitive saturation labeling to the analysis of differential protein expression in infected ticks from limited samples

Villar, Margarita; Torina, Alessandra; Núñez, Yolanda; Zivkovic, Zorica; Marina, Anabel; Alongi, Angelina; Scimeca, Salvatore; Barbera, Giuseppa la; Caracappa, Santo; Vázquez, Jesús; Fuente García, José de la
2010-08-12

Digital.CSIC (Spain)

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A preliminary analysis of bifidobacterium longum exported proteins by two-Ddmensional electrophoresis

Sánchez García, Borja; Champomier-Vergès, Marie-Christine; Anglade, Patricia; Baraige, Fabienne; González de los Reyes-Gavilán, Clara; Margolles Barros, Abelardo; Zagorec, Monique
2008-01-01

Digital.CSIC (Spain)