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1

Recombinación homóloga en un paso en el cromosoma de Bacillus thuringiensis/ Homologous recombination to Bacillus thuringiensis chromosome in one step

Sansinenea-Royano, Estibaliz; Sánchez-Alonso, Patricia; Marcelino, E. Anastacio; Ibarra-Rendón, Jorge; Olmedo-Álvarez, Gabriela; Vázquez-Cruz, Candelario
2010-06-01

Resumen en español Bacillus thuringiensis es una bacteria del suelo gram-positiva utilizada como un bioinsecticida limpio para el ambiente. Aunque se conoce acerca de sus proteínas entomocidas, poco se ha estudiado su genética funcional debido a que la transformación celular es muy díficil. Por tanto, el desarrollo de la recombinación homóloga como herramienta de investigación ayudará a ampliar el conocimiento de su genética, pudiéndose incluso modificarse cepas para el control de (mas) plagas. En este trabajo se describe una secuencia cromosomal que funcionalmente sirve como sustrato para la recombinación molecular homóloga en el cromosoma bacteriano de B. thuringiensis var. israelensis IPS82. Se secuenció (Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad del Centro de Investigacion y Estudios Avanzados de Irapuato; Octubre 2007) un fragmento de 1500 pb del locus ihrI y la secuencia se depositó en GenBank (número de acceso GQ476797). Su análisis nucleotídico indica que esta región del genoma de B. thuringiensis var. israelensis IPS82 es muy similar pero no igual a otras secuencias de Bt. Esta secuencia está relativamente conservada en varias cepas de B. thuringiensis, B. cereus y B. anthracis según el análisis informático y experimental. Resumen en inglés Bacillus thuringiensis is a gram-positive soil bacterium used as a clean bioinsecticide for the environment. Although its entomocide proteins are known, little has been studied of its functional genetic, due to the fact that the cell transformation is very difficult. Therefore, the development of homologous recombination as a research tool will help to broaden the knowledge of its genetics, even making it possible to modify strains for pest control. In this paper a chromo (mas) somal sequence is described, which functionally serves as a substrate for the homologous molecular recombination in the bacterial chromosome of B. thuringiensis var. israelensis IPS82. A fragment of 1500 pb of the locus ihrI was sequenced (Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad del Centro de Investigación y Estudios Avanzados of Irapuato; October, 2007), and the sequence was deposited in GenBank (Access number GQ476797). Its nucleotide analysis indicates that this region of the genome of B. thuringiensis var. israelensis IPS82 is very similar but not equal to other sequences of Bt. This sequence is relatively conserved in various strains of B. thuringiensis, B. cereus and B. anthracis according to the computer and experimental analysis.

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Diversidad genética de Plasmodium falciparum y sus implicaciones en la epidemiología de la malaria/ Genetic diversity of Plasmodium falciparum and its implications in the epidemiology of malaria

Jiménez, Judy Natalia; Muskus, Carlos Enrique; Vélez, Iván Darío
2005-12-01

Resumen en español La diversidad genética le confiere a Plasmodium falciparum la capacidad de evadir la respuesta inmune del hospedero y producir variantes resistentes a medicamentos y a vacunas, aspectos que juegan un papel importante en el establecimiento de medidas de control contra la malaria. Diferentes autores han documentado la existencia de diversas cepas o clones de P. falciparum, cuya diversidad genética se ha confirmado a través de distintos ensayos de PCR (reacción en cadena (mas) de la polimerasa). Numerosas investigaciones realizadas en poblaciones con diferente grado de transmisión de malaria han mostrado la relación existente entre la estructura de la población de P. falciparum y la epidemiología de la enfermedad. En este artículo se describen las fases del ciclo de vida en las que los eventos de recombinación originan la diversidad genética de P. falciparum, se revisan los estudios realizados sobre este aspecto en regiones con diferentes grados de endemicidad, así como sobre sus implicaciones en la adquisición de inmunidad y en el desarrollo de medidas de control. Resumen en inglés Genetic diversity provides Plasmodium falciparum with the potential capacity of avoiding the immune response, and possibly supporting the selection of drug or vaccine resistant parasites. These genetic characters play key roles in the selection of appropriate malaria control measures. Diverse clones of Plasmodium falciparum, often denoted as strains, has been documented, and the degree of genetic diversity supported by several kinds of PCR (polymerase chain reaction) assa (mas) ys. Many studies in different endemic regions with differences in their level of disease transmission have clarified the interactions between the parasite populations and malaria epidemiology. This paper describes recombination events of the malaria parasite life cycle that originate such genetic diversity in P. falciparum, reviewing different studies on this aspect and its implications in the immunity and development of control measures in regions with different degrees of endemicity.

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Manipulación genética y el estudio del parásito protozoario Leishmania/ Genetic manipulation and the study of the protozoan parasite Leishmania

Cortázar, Tania M; Walker, John
2004-12-01

Resumen en español Durante los últimos 15 años se ha dado paso al entendimiento de muchos aspectos de la genómica funcional de Leishmania gracias a los avances en la metodología de transfección de ADN dentro de la célula de este protozoario, la eliminación y la complementación de genes por medio de recombinación homóloga y las estrategias para la selección de células transfectadas. Estos acercamientos tienen el potencial de brindar información sobre la expresión génica y la f (mas) unción de las proteínas en el contexto del parásito intacto. Dado que el genoma de Leishmania muestra una carencia acentuada de los factores conocidos de iniciación de la transcripción y que la expresión génica está regulada casi completamente a nivel postranscripcional (a través del empalme de los ARNm y los mecanismos que involucran el procesamiento diferencial de la región no traducida 3' del ARNm (3’UTR), la transfección génica representa una herramienta útil para la identificación y el análisis funcional de los genes de interés así como de los mecanismos que dirigen su regulación. El desarrollo de los sistemas de manipulación genética también ha abierto nuevos horizontes para la identificación de genes esenciales involucrados en la virulencia, la supervivencia intracelular y la resistencia a drogas de Leishmania, así como para la validación de proteínas específicas del parásito como nuevos blancos quimio e inmunoterapéuticos. En esta revisión presentamos los avances más recientes en el campo de la manipulación genética en Leishmania, los cuales permiten análisis estructurales, funcionales y de fenotipo, por medio de la eliminación y complementación génica a través de la transfección transitoria o permanente de genes en este parásito. Resumen en inglés During the last 15 years, many aspects of the functional genomics of Leishmania have been revealed due to advances in DNA transfection, gene disruption and complementation through homologous recombination, and efficient strategies for the selection of transfected cells. These strategies have provided information about gene expression and protein function in the context of the intact parasite. The genome of Leishmania shows a marked deficiency of known transcription initia (mas) tion factors, and gene expression is regulated almost entirely at the posttranscriptional level through trans-splicing of mRNAs and novel control mechanisms involving differential processing of 3' - untranslated regions (3'-UTRs) of mRNAs. Therefore, gene transfection represents a useful tool for the identification and functional analysis of genes of interest as well as the mechanisms that direct their regulation. The development of genetic manipulation systems has provided opportunities for the study of genes involved in virulence, intracellular survival and drug resistance of Leishmania, as well as for the functional validation of specific parasite proteins as new chemo- and immunotherapeutic targets. The current review presents recent advances in genetic manipulations that permit structural, functional and phenotypic analyses and by means of gene deletion and complementation using the methods of gene transfection.

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Bacterias con alta tasa de mutación: los riesgos de una vida acelerada/ High mutation rate bacteria: Risks of a high-speed life

GALÁN, JUAN CARLOS; BAQUERO, MARÍA ROSARIO; MOROSINI, MARÍA ISABEL; BAQUERO, FERNANDO
2006-03-01

Resumen en español El proceso evolutivo de un ser vivo se acelera cuanto mayor sea su capacidad para producir variabilidad genética, bien por mutación, bien por recombinación. Sin embargo, cuanto mayor sea esta capacidad, mayor también será el riesgo de acumular mutaciones del etéreas. La variabilidad genética es, por tanto, un proceso altamente regulado, de tal manera que las bacterias tienden a mantener una baja tasa de mutación. En diferentes poblaciones bacterianas analizadas ha (mas) y siempre un porcentaje variable de cepas con una tasa de mutación superior a la frecuencia modal del resto de la población. Existe una relación directa entre la proporción de cepas que mutan y el grado de estrés del ambiente. Así, en los procesos infecciosos crónicos, en los que el tratamiento antibiótico es constante durante períodos prolongados, se observan los mayores porcentajes de bacterias que mutan, cercano al 50% de la población. Esta selección positiva de bacterias que mutan es debida al enorme potencial que presentan para desarrollar resistencia antibiótica (100 veces superior a una bacteria normal). Esta capacidad ha sido explotada, en algunos centros de investigación, como un modelo natural de evolución acelerada para predecir la facilidad con la que determinadas variantes resistentes pueden aparecer, saber qué posiciones serán las más susceptibles a los cambios y cuál será el costo para la bacteria. El laboratorio de microbiología debe hacer un esfuerzo por detectar estas cepas mutadoras antes de que desarrollen mecanismos de resistencia e induzcan el fracaso terapéutico. Resumen en inglés The potential of producing genetic variability, either by mutation or by recombination, is the driving force of evolution in a living organism. Genetic variability is a quite regulated process in which bacteria tend to maintain a low mutation rate. However, a variable proportion of bacteria with a higher mutation rate than that of the modal is always present in any population. Moreover, a direct relationship exists between the proportion of mutator strains and environment (mas) al stress. In chronic infectious diseases, due to prolonged antibiotic regimens, nearly 50% of the population may be represented by mutating bacteria. Such a positive selection is due to the capacity of this type of strains to develop antibiotic resistance (100 fold higher than normal bacteria) This trait has been used as an accelerated evolution model to predict the ease of certain resistant variants to emerge as well as to infer which targets are more prone to be modified and the concomitant cost that such variability would imply to the organism. The Microbiology laboratory might then do an effort to detect mutating strains before the appearance of resistance mechanisms that may lead to therapeutic failures.

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Situación de la cepa epidémica de Neisseria meningitidis C:2b:P1.2,5 después de la vacunación A+C/ Situation of the epidemic strain of Neisseria meningitidis c:2b:P1.2,5 following A+C vaccination

Alcalá Galicia, Belén; Vázquez Moreno, Julio A.
2000-08-01

Resumen en español Tras la utilización de una amplia campaña de inmunización en la población de entre 2 y 19 años de edad en la mayoría de las Comunidades Autónomas, con objeto de controlar el "brote u onda epidémica" por serogrupo C de meningococos de los años 1996-97, interesaba conocer la situación de la conocida cepa epidémica C:2b:P1.2,5, que había sido identificada como la causante de los cambios producidos en el perfil epidemiológico de la enfermedad meningocócica en Es (mas) paña, lo que nos podría permitir analizar algunas de las posibles tendencias futuras de esta enfermedad en nuestro país. El análisis de la situación en los primeros 10 meses de 1999 revela que se ha vuelto a cifras semejantes a las que se daban, tanto en numero de casos como en frecuencia de serogrupos, similar a la que se observaba en España a principios de los años 90, aunque la cepa epidémica C:2b:P1.2,5 representa el 56% del total de casos de serogrupo C. Las cepas de serotipo 2a, muy frecuentes en el serogrupo C en países Europeos, siguen representando una minoría en España. Es interesante finalmente mencionar la aparición de variantes antigénicas que podrían ser resultado de procesos de recombinación genética intraespecíficos y que serían seleccionados en función de sus ventajas evolutivas. Resumen en inglés Following the use of an extensive immunisation campaign targeting the population between ages 2 and 19 in the majority of the Autonomous Communities (Regions), for the purpose of controlling the "outbreak or epidemic wave" caused by serogroup C in 1996-97, there was great interest in ascertaining the situation of the well-known epidemic strain C:2b:P1.2.5, which had been identified as the cause of the changes brought about in the epidemiological profile of meningococcal d (mas) isease in Spain, as this would enable us to analyse some of the possible future tendencies of this disease in our country. An analysis of the situation in the first 10 months of 1999 reveals that we have reverted to figures similar to those which, both insofar as the number of cases as well as the frequency of serogroups, were observed in Spain at the beginning of the decade of the nineties, although the epidemic strain C:2b:P1.2.5 represents 56% of the total cases of serogroup C. The strains of serotype 2a, very frequent in serogroup C in European countries, continue to represent a minority in Spain. Finally, it is of interest to mention the appearance of antigen variants which could be the result of processes of intra-specific genetic recombination and which would presumably have been selected in terms of their evolutive advantages.

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Situación de la cepa epidémica de Neisseria meningitidis C:2b:P1.2,5 después de la vacunación A+C/ Situation of the epidemic strain of Neisseria meningitidis c:2b:P1.2,5 following A+C vaccination

Alcalá Galicia, Belén; Vázquez Moreno, Julio A.
2000-08-01

Resumen en español Tras la utilización de una amplia campaña de inmunización en la población de entre 2 y 19 años de edad en la mayoría de las Comunidades Autónomas, con objeto de controlar el "brote u onda epidémica" por serogrupo C de meningococos de los años 1996-97, interesaba conocer la situación de la conocida cepa epidémica C:2b:P1.2,5, que había sido identificada como la causante de los cambios producidos en el perfil epidemiológico de la enfermedad meningocócica en Es (mas) paña, lo que nos podría permitir analizar algunas de las posibles tendencias futuras de esta enfermedad en nuestro país. El análisis de la situación en los primeros 10 meses de 1999 revela que se ha vuelto a cifras semejantes a las que se daban, tanto en numero de casos como en frecuencia de serogrupos, similar a la que se observaba en España a principios de los años 90, aunque la cepa epidémica C:2b:P1.2,5 representa el 56% del total de casos de serogrupo C. Las cepas de serotipo 2a, muy frecuentes en el serogrupo C en países Europeos, siguen representando una minoría en España. Es interesante finalmente mencionar la aparición de variantes antigénicas que podrían ser resultado de procesos de recombinación genética intraespecíficos y que serían seleccionados en función de sus ventajas evolutivas. Resumen en inglés Following the use of an extensive immunisation campaign targeting the population between ages 2 and 19 in the majority of the Autonomous Communities (Regions), for the purpose of controlling the "outbreak or epidemic wave" caused by serogroup C in 1996-97, there was great interest in ascertaining the situation of the well-known epidemic strain C:2b:P1.2.5, which had been identified as the cause of the changes brought about in the epidemiological profile of meningococcal d (mas) isease in Spain, as this would enable us to analyse some of the possible future tendencies of this disease in our country. An analysis of the situation in the first 10 months of 1999 reveals that we have reverted to figures similar to those which, both insofar as the number of cases as well as the frequency of serogroups, were observed in Spain at the beginning of the decade of the nineties, although the epidemic strain C:2b:P1.2.5 represents 56% of the total cases of serogroup C. The strains of serotype 2a, very frequent in serogroup C in European countries, continue to represent a minority in Spain. Finally, it is of interest to mention the appearance of antigen variants which could be the result of processes of intra-specific genetic recombination and which would presumably have been selected in terms of their evolutive advantages.

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Ética científica de la terapia génica de individuos: Urgencia de la Cirugía Génica del ADN/ Scientific ethics of gene therapy for individuals: The urgency for DNA gene surgery

Valenzuela, Carlos Y
2003-10-01

Resumen en inglés Gene therapy for individuals is mainly directed to somatic or germ cells. The present technology aims to insert a DNA segment in the recipient cells. This therapy is useful in Mendelian recessive diseases. There is an ethical moratorium to perform insertion gene therapy in germ cells, because this procedure increases the human genome. Somatic cell gene therapy cures individuals but increases the gene frequency of genetic diseases in the population. This occurs because the (mas) descendants of the cured patient should carry his or her «ill» genes. We denote by «DNA gene surgery» the procedure that replaces «ill» nucleotide(s) by healthy one(s) conserving the genome size and the gene context of expression and regulation. Several procedures for gene surgery have been applied to cells and animals. Those based on DNA repair as Chimeric RNA/DNA, one stranded oligonucleotides and tristranded DNA. Those based on DNA recombination with oligo-DNA or one stranded DNA, and transposable DNA segments. Gene surgery can be applied to germ cell gene therapy without ethical contraindications. It can cure Mendelian dominant diseases and it can be applied to heterozygotes. It preserves the regulation and expression gene context. If a technical safe procedure is available, the entire mankind could be treated and cured of all the Mendelian diseases, in one generation. Susceptibilities for all diseases could also be treated. The moratorium for research on germ cell gene therapy by gene surgery should be interrupted. Safe gene surgery is a moral imperative for gene therapy of patients and their descendants, for the treatment of dominant genetic diseases and for heterozygous carriers of recessive disorders (Rev Méd Chile 2003; 131: 1208-14)

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Perspectivas para el control del Virus de la Diarrea Viral Bovina (BVDV)/ Perspectives to control Bovine Viral Diarrhea Virus (BVDV)/ Perspectivas para o controle do vírus da diarréia viral Bovina (BVDV)

Vargas, Diana S; Jaime, Jairo; Vera, Víctor J
2009-12-01

Resumen en portugués O vírus da diarréia viral bovina (VDVB) é um dos agentes mais importantes do gado bovino. Este patogénio tem uma distribuição mundial e é endêmico na maioria das populações bovinas onde alcança um nível de seropositividade do 40 ao 80%. Também ocasiona perdas econômicas, principalmente de origem reprodutivo. Uma das características mais importantes do vírus é sua alta freqüência de mutação e tendência à recombinação, o que tem ocasionado uma grand (mas) e diversidade genética e antigênica; problema que ocasiona múltiples manifestações clinicas observadas nos animais afetados e no difícil controle da doença. Os programas de controle utilizados por alguns países que fundamentam em grande medida a eliminação da principal fonte de infecção: os animais persistentemente infectados (PI). Assim como melhorar a resposta imune mediante o uso de vacinas. A imunização com vacinas inativas e vírus vivo modificado contra o VDVB tem-se utilizado por décadas sim evidencia de uma redução significativa da prevalência da doença o um controle da infecção, pelo qual se utilizam estratégias experimentais como vacinas recombinantes, onde se selecionam genes específicos do BVDV com o propósito de imunizar o gado buscando superar os inconvenientes das vacinas convencionais. Resumen en español El virus de la diarrea viral bovina (VDVB) es uno de los agentes infecciosos más importantes del ganado bovino. Este patógeno tiene una distribución mundial y es endémico en la mayoría de las poblaciones bovinas donde alcanza un nivel de seropositividad del 40 al 80%. Así mismo, ocasiona pérdidas económicas principalmente de origen reproductivo. Una de las características más importantes de este virus es su alta frecuencia de mutación y la tendencia a la recomb (mas) inación, lo que ha llevado a que tenga una gran diversidad genética y antigénica; problema que se ve reflejado en las múltiples manifestaciones clínicas observadas en los animales afectados y en el difícil control de la enfermedad. Los programas de control utilizados por algunos países se fundamentan en gran medida en la eliminación de la principal fuente de infección: los animales persistentemente infectados (PI), así como en mejorar la respuesta inmune mediante el empleo de vacunas. La inmunización con vacunas inactivadas y virus vivo modificado contra VDVB se ha empleado por décadas sin evidencia de una reducción significativa de la prevalencia de la enfermedad o un control de la infección, por lo cual se han empezado a desarrollar otras estrategias experimentales como las vacunas recombinantes, donde se seleccionan genes específicos del BVDV con el fin de inmunizar al ganado buscando superar los inconvenientes de las vacunas convencionales. Resumen en inglés Bovine Viral Diarrhea Virus (BVDV) is one of the most important infectious agents in cattle population. BVDV is widespread throughout the world and it is endemic disease in most of the cattle population where 40 to 80% are seropositive. It causes economic losses mainly in breeding cattle. BVDV genetic and antigenic diversity is due to the virus high mutation and recombination frequency, which is reflected in many clinical manifestations and the difficult control of the di (mas) sease. Control and prevention measures implemented by some countries are based on the elimination of the main source of infection: the persistently infected animals (PI animals), as well as the improvement of the immune response through the use of vaccines. Immunization with inactivated and modified-live vaccines has been used for decades without any significant improvement. New experimental strategies are being developed: recombinant vaccines where BVDV specific genes are selected in order to immunize cattle and thus overcome the shortcomings of conventional vaccines.

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Mitotic recombination and genetic changes in Saccharomyces cerevisiae during wine fermentation

Puig, Sergi; Querol, Amparo; Barrio, Eladio; Pérez Ortín, José E

Natural strains of Saccharomyces cerevisiae are prototrophic homothallic yeasts that sporulate poorly, are often heterozygous, and may be aneuploid. This genomic constitution may confer selective advantages in some environments. Different mechanisms of recombination, such as meiosis or mitotic rearr...

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High prevalence of secondary resistance mutations in Venezuelan HIV-1 isolates./ Alta prevalencia de mutaciones secundarias en aislados venezolanos del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1.

Dieudonne, Mariacarolina; Garzaro, Domingo; Torres, Jaime; Naranjo, Laura; Suárez, José Antonio; Castro, Julio; Martínez, Nahir; Castro, Erika; Berrueta, Lisbeth; Salmen, Siham; Devesa, Marisol; Rangel, Héctor R; Pujol, Flor Helene
2006-03-01

Resumen en español Se estudiaron pacientes seropositivos para el virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 (VIH-1) con y sin tratamiento, con el fin de determinar el polimorfismo y la prevalencia de mutaciones de resistencia a la terapia antirretroviral. El material genético viral fue extraído a partir de células mononucleares de sangre periféricas (ADN) y del plasma (ARN) de 30 pacientes. Se amplificaron 2 regiones del gen Pol, Transcriptasa Reversa (TR) y Proteasa (Pr) y el gen de envo (mas) ltura (Env) por medio de la técnica de PCR y se obtuvo la secuencia genómica de los productos. Todos los aislados analizados pertenecieron al subtipo B. No se observaron mutaciones primarias asociadas a resistencia a inhibidores de Pr pero sí un alto porcentaje (86%, 19/22) de mutaciones no asociadas con resistencia sino a restitución de la capacidad replicativa de cepas mutantes (mutaciones secundarias). Se observó la presencia de mutaciones asociadas a resistencia a inhibidores nucleósidos de la TR (INTR) en 35% (6/17) de los pacientes sometidos a tratamiento, mientras que 12% (2/17) de ellos presentaron mutaciones de resistencia a inhibidores no nucleósidos de la TR (INNTR). Interesantemente, un paciente no tratado estaba infectado con una cepa que presentaba mutaciones primarias (7,7%); este resultado sugiere que podría ser importante plantearse el estudio local de determinación de resistencia genotípica en pacientes antes del tratamiento, con miras a minimizar fallas terapéuticas. Se requieren estudios adicionales para evaluar el rol de las mutaciones secundarias en el éxito de la infección viral. Resumen en inglés The genetic variability was studied in HIV-1 from Venezuelan patients with and without treatment, in order to evaluate the presence of polymorphisms and drug resistance mutations. Proviral DNA from peripheral blood mononuclear cells or viral RNA from plasma was extracted from the blood of 30 patients. Two regions from the polymerase gene, protease (Pr) and reverse transcriptase (RT) and one genomic fragment from the envelope (Env) gene were amplified and sequenced. All HI (mas) V-1 samples analyzed were classified as subtype B, without evidence of recombination. Although no primary protease mutations were detected, a high frequency of secondary mutations (86%, 19/22), associated to restoration of viral replicative fitness, was observed in strains circulating both in treated and non-treated patients. Resistance mutations to nucleoside RT inhibitors (NRTI) and non-nucleoside RT inhibitors (NNRTI) were detected in 35% (6/17) and 12% (2/17) of the viruses circulating in treated patients, respectively. Resistance mutations were also present in the virus infecting one antiretroviral naïve individual (7.7%), suggesting that local screening for resistant mutation in naïve patient might be important to minimize therapy failure. Future studies are warranted to assess the role of secondary mutation in the success of viral infection.

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Generation of Food-Grade Recombinant Lactic Acid Bacterium Strains by Site-Specific Recombination

Martín, M. Cruz; Alonso, Juan C.; Suárez Fernández, Juan Evaristo; Álvarez González, Miguel Ángel

Final full-text version of the paper available at: http://aem.asm.org/cgi/content/abstract/66/6/2599. | The construction of a delivery and clearing system for the generation of food-grade recombinant lactic acid bacterium strains, based on the use of an integrase (Int) and a resolvo-invertase (β-rec...

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Estudio de la inestabilidad cariotípica de levaduras vínicas

Llagostera Casas, Montserrat; Piña, Bejamín; Carro Puentedura, David
2006-01-01

Digital.CSIC (Spain)

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Dynamic structures of Bacillus subtilis RecN–DNA complexes

Sánchez, Humberto; Cárdenas, Paula P.; Yoshimura, Shige H.; Takeyasu, Kunio; Alonso, Juan Carlos

Genetic and cytological evidences suggest that Bacillus subtilis RecN acts prior to and after endprocessing of DNA double-strand ends via homologous recombination, appears to participate in the assembly of a DNA repair centre and interacts with incoming single-stranded (ss) DNA during natural transf...

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Drosophila mus301/spindle-C Encodes a Helicase With an Essential Role in Double-Strand DNA Break Repair and Meiotic Progression

McCaffrey, Ruth; St Johnston, Daniel; González-Reyes, Acaimo

PMCID: PMC1667076 | mus301 was identified independently in two genetic screens, one for mutants hypersensitive to chemical mutagens and another for maternal mutants with eggshell defects. mus301 is required for the proper specification of the oocyte and for progression through meiosis in the Drosoph...

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Different physiological relevance of yeast THO/TREX subunits in gene expression and genome integrity

García Rubio, María; Chávez, Sebastián; Huertas, Pablo; Tous, Cristina; Jimeno, Sonia; Luna, Rosa; Aguilera, Andrés

PMID: 17960421.-- Final full-text version available at: http://dx.doi.org/10.1007/s00438-007-0301-6 (www.springerlink.com) | THO/TREX is a conserved nuclear complex that functions in mRNP biogenesis and plays a role in preventing the transcription-associated genetic instability. THO is composed of T...

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Different genetic requirements for repair of replication-born double-strand breaks by sister-chromatid recombination and break-induced replication

Cortés-Ledesma, Felipe; Tous, Cristina; Aguilera, Andrés

PMCID: PMC2095809 | Homologous recombination (HR) is the major mechanism used to repair double-strand breaks (DSBs) that result from replication, but a study of repair of DSBs specifically induced during S-phase is lacking. Using an inverted-repeat assay in which a DSB is generated by the encounteri...

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Contribution of recombination and selection to molecular evolution of Citrus tristeza virus

Martín, Susana; Sambade, Adrián; Rubio, Luis; Vives, María C.; Moya, Patricia; Guerri, José; Elena, Santiago F.

The genetic variation of Citrus tristeza virus (CTV) was analyzed comparing the predominant sequence variants in seven genomic regions (p33, p65, p61, p18, p13, p20, and p23) of 18 pathogenically distinct isolates from seven different countries. Analyses of the selective constraints acting on each c...

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CREACIÓN DE LA POBLACIÓN PQUI-1 DESARROLLADA CON TOLERANCIA A FRÍOMEDIANTE SELECCIÓN RECURRENTE EN ARROZ/ PQUI-1 rice population developed with cold tolerance by recurrent selection

Hernaiz L, Santiago; Alvarado A, Roberto; Chatel, Marc; Borrero, Jaime
2000-04-01

Resumen en español El acervo genético de arroz (Oriza sativa L.) GPIRAT- 10 formado por variedades y líneas de tipo japónica, con tolerancia a frío, se cruzó con material chileno. Como resultado se obtuvo una nueva población para selección recurrente denominada PQUI-1. En esta nueva población participa GPIRART- 10 en un 50 %; Diamante en un 10,3%; Buli 13,3%; Brillante16,22%; CINIA 609 5,09% y CINIA 606 5,09%. La población PQUI-1 tiene características de mayor precocidad y conserv (mas) a su tolerancia a frío. Durante el primer ciclo de recombinación se sembró la población PQUI-1 en dos ecosistemas diferentes (Colchagua y Chillán), se realizó selección de plantas por medio ambiente y características agronómicas, obteniéndose dos nuevas poblaciones, que se denominaron PQUI-1 \CO\0\1 y PQUI-1\CH\0\1 Resumen en inglés Rice genetic stock (Oryza sativa L.) GPIRAT-10 made up of japanese type varieties and strains was crossed with Chilean material to introduce greater cold tolerance. As a result, a new population for recurrent selection named PQUI-1 was obtained. This new population was composed of GPIRAT-10 (50%) and the Chilean genotypes Diamante-INIA (10.3%), Buli -INIA (13.3%), Quila 67108 (16.22%), CINIA 609 (5.09%) and CINIA 606 (5.09%). The population PQUI-1 ripens earlier and has g (mas) reater cold resistance. During the first recombination cycle, the population PQUI-1 was sowed in two different ecosystems (Chillán and Colchagua), and a selection of plants was made based on environmental and agricultural characteristics, finally obtaining two new populations named PQUI-1\CO\0\1 and PQUI-1 \CH\0\1

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Agronomic Potential Value of Great Northern Recombinant Lines and Breeding Implications in Common Bean

Santalla Ferradás, Marta; Monteagudo, Ana B.; González Fernández, Ana María; Fuente Martínez, María de la

Common bean (Phaseolus vulgaris L.) was introduced into the Iberian Paninsula (Spain and Portugal), mainly from Central America around 1506 and from the southern Andes after 1532, through sailors and traders, who brought the nicely colored, easily transportable seeds with them as a curiosity. The pr...

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Genética de la enfermedad de Charcot-Marie-Tooth autosómica recesiva

Palau Martínez, Francesc; Claramunt Alonso, Reyes
2008-12-10

Digital.CSIC (Spain)