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Utilidad de la reacción de polimerasa en cadena para la detección de Mycoplasma pneumoniae en adultos mayores con neumonía adquirida en la comunidad/ Diagnostic utility of the polymerase chain reaction for the diagnosis of Mycoplasma pneumoniae in elderly patients with community-acquired pneumonia

MARTÍNEZ T, M. ANGÉLICA; PINO P, YENIFER; SALAZAR B, TANIA; JOVER L, ELY; CAROCA C, CLAUDIA; ESPINOZA N, M. ANGÉLICA; AVENDAÑO C, LUIS F.
2005-09-01

Resumen en español Mycoplasma pneumoniae es una causa frecuente de neumonía adquirida en la comunidad (NAC) en niños y adultos jóvenes, existiendo escasa información de su frecuencia en el adulto mayor. Se analizó la reacción de polimerasa en cadena (RPC) con dos pares de partidores, gen de la adhesina P1 y gen 16S rRNA, para la detección de M. pneumoniae en lavado faríngeo de 84 pacientes de 60-96 años con diagnóstico clínico de NAC, desde septiembre de 2002 hasta agosto de 2004 (mas) . Los resultados de la RPC fueron comparados con los de la serología mediante inmunofluorescencia indirecta (IFI). Se detectó infección por M. pneumoniae mediante serología o RPC en 11 de 84 pacientes (13,1%). La serología fue positiva en 8 (72,7%) y la RPC en 7 (63,6%) muestras. La serología en la muestra de suero en fase aguda fue positiva en 5 de 11 pacientes (45,4%), en 4 de ellos por la presencia de IgM. En 4 pacientes con serología positiva la RPC fue negativa. En 3 pacientes con serología negativa la RPC fue positiva. Las dos RPC mostraron 100% de correlación y la sensibilidad fue la misma; no se detectaron muestras con efecto inhibitorio de la reacción. En conclusión, M. pneumoniae debería ser considerado en la etiología de la NAC en adultos mayores. La detección de este microorganismo debe basarse en el uso combinado de serología y RPC Resumen en inglés Mycoplasma pneumoniae is a common cause of community-acquired pneumonia (CAP) in children and young adults, but limited information about its prevalence in the elderly is available. The polymerase chain reaction (PCR) with primers targeting the cytadhesine P1 gene and the 16S rRNA gene was analyzed for detecting M. pneumoniae in throat washings of 84 patients, aged 60-96 years, with clinical diagnosis of CAP, from September 2002 through August 2004, in Santiago, Chile. PC (mas) R results were compared with serology performed by indirect immunofluorescence (IFI). Specimens from 11 of 84 patients (13.1%) were positive for M. pneumoniae by any test. The IFI test was positive in 8 (72.7%) patients and PCR in 7 (63.6%) cases. The acute phase sera allowed diagnosis of M. pneumoniae in 5 of 11 patients (45.4%), 4 of them showing an IgM response. PCR was negative in 4 patients with positive serology and 3 patients were positive only by PCR. The two PCR primers showed 100% correlation, and a similar sensitivity; no inhibitory specimens for PCR were detected. In conclusion, M. pneumoniae should be considered as a potential etiologic agent of CAP in the elderly. Its detection must be performed by a combination of PCR and serology

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The L1Tc non-LTR retrotransposon of Trypanosoma cruzi contains an internal RNA-pol II-dependent promoter that strongly activates gene transcription and generates unspliced transcripts

Heras, Sara R.; López López, Manuel Carlos; Olivares, Mónica; Thomas, María del Carmen

El copyright pertenece a Oxford University Press. La publicación original está disponible en http://nar.oxfordjournals.org/?code=nar&.cgifields=code | L1Tc is the best represented autonomous LINE of the Trypanosoma cruzi genome, throughout which several functional copies may exist. In this study, we...

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Suppression of viral infectivity through lethal defection

Grande-Pérez, Ana; Lázaro, Ester; Lowenstein, Pedro R.; Domingo, Esteban; Manrubia, Susanna C.

RNA viruses replicate with a very high error rate and give rise to heterogeneous, highly plastic populations able to adapt very rapidly to changing environments. Viral diseases are thus difficult to control because of the appearance of drug-resistant mutants, and it becomes essential to seek mechani...

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Sensibilidad a los antimicrobianos de micobacterias de crecimiento rápido mediante el método E-test/ Assessment of in vitro susceptibility to antimicrobials of rapidly growing mycobacteria by E-test

García-Agudo, Lidia; García-Martos, Pedro; Jesús, Iría; Rodríguez-Iglesias, Manuel
2009-07-01

Resumen en inglés Background: Rapidly growing mycobacteria (RGM) are considered opportunistic pathogens. An increasing number of post traumatic or surgical infections are caused by these microorganisms. Aim: To determine the antimicrobial susceptibility of RGM using the E-test method. Material and methods: A total of 54 isolates of RGM was obtained from several clinical samples and selected for this study Strains were identified to the species level by phenotypic and biochemical characteri (mas) stics, PCR-restriction enzyme analysis of the hsp65 gene (PRA) and sequencing of the 16S rRNA. Susceptibility was investigated by E-test to amikacin, cefoxitin, ciprofioxacin, clarithromycin, imipenem, quinupristin/dalfopristin, linezolid and tigecycline. Results: Twelve different species of RGM were identified: Mycobacterium fortuitum (23 strains), M chelonae (11), M abscessus (10), Msenegalense (2), Malvei (1), Mbrumae (1), Mmageritense (1), mucogenicum (1), M neoaurum (1), Mperegrinum (1), M septicum (1) y M smegmatis (1). All the strains were inhibited by low concentrations of amikacin and tigecycline. Susceptibility to cefoxitin, fluoroquinolones, clarithromycin, imipenem and linezolid was variable. All but two strains were resistant to quinupristin/ dalfopristin. Conclusions: Due to the uneven antimicrobial susceptibility of different species of RGM, an antimicrobial susceptibility test is mandatory for these microorganisms. The E-test method is well suited to determine minimum inhibitory concentrations

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Quantification of canine cytokines using real time reverse transcriptase polymerase chain reaction/ Cuantificación de citocinas caninas mediante reacción en cadena de la polimerasa de transcriptasa reversa en tiempo real

Saldarriaga, Omar A.; Travi, Bruno L; Melby, Peter C
2006-10-01

Resumen en inglés Introduction.Canines are the principal domestic reservoirs of visceral leishmaniasis in both the Old and New World. The development of highly sensitive and quantitative methods, such as real time reverse transcriptase polymerase chain reaction for measurement of canine cytokines has not been exploited in studies of visceral leishmaniasis. Objective. To standardize the relative quantification of canine IFN-g, IL-4, IL-10, IL-12p40 and IL-12p35 using real time reverse trans (mas) criptase polymerase chain reaction. Materials and methods. RNA was isolated from PBMCs from 1 year-old foxhounds and cultured with or without Con A, LPS or Staphylococcus aureus extract. This RNA was used in one-step real time reverse transcriptase polymerase chain reaction to optimize the concentrations of the cytokine primers and probes, generate standard curves for each cytokine, confirm equivalent amplification efficiency of cytokine and normalizer (18S rRNA) RNA, and to quantify the expression of the cytokine RNA. The comparative Ct method was used to determine the relative levels of gene expression in the samples, expressed as the fold-increase relative to the control samples. Results. The regression coefficient for the standard curves and the amplification efficiencies of the cytokine and normalizer RNA indicated that the quantification was reliable over a broad concentration range of input RNA. Relative to control cells, activation of PBMCs led to increased expression of IFN-g (132-fold), IL-4 (8.8-fold), IL-10 (7.2-fold), and IL-12p40 (275-fold). Basal expression of IL-12p35 was also detected. Conclusion. This approach provides several advantages over conventional assays for cytokine measurement and can be exploited in the study of the immunopathogenesis and immunity in canine leishmaniasis.

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Presencia de ADN bacteriano en el tejido valvular de pacientes con cardiopatía reumática crónica/ Presence of bacterial DNA in valvular tissue of patients with rheumatic heart disease

Figueroa, Fernando E; Carrión A, Flavio; Valenzuela M, Sylvia; Turner G, Eduardo; Aceitón E, Cristian; Hirigoyen P, Carolina; Bogdanic W, Katherine; Solís D, Claudia; Mansilla A, Karina; Urra G, Soledad
2007-08-01

Resumen en inglés Background: Rheumatic heart disease (RHD) is a delayed consequence of a pharyngeal infection with Group A streptococcus (GAS), usually ascribed to a cross-reactive immune response to the host cardiac tissues. Acute rheumatic fever (ARF) and its ensuing valvular sequelae are thus considered the prototype of a post-infectious autoimmune disease, with no direct evidence of residual streptococcal antigen in diseased valvular tissues. However, recent studies concerning the ant (mas) igenic specificity and clonality of intralesional lymphocytes have revealed oligoclonal expansions characteristic of an antigen specific response, that might be related to GAS. Aim: To search for bacterial DNA in valvular tissue from RHD patients and controls. Material and methods: We extracted DNA from surgically excised valve specimens from 15 RHD patients and 6 non RHD controls and tested for the presence of bacterial DNA by Polymerase Chain Reaction (PCR) with primers for 16S rRNA. Results: Eighty percent (12/15) of valve specimens from RHD patients were positive for bacterial DNA, as opposed to none of the valves (n =6) from non RHD controls. Conclusions: These results suggest that GAS might persist in valvular tissue in patients with ARF and contribute to the inflammatory scarring lesion that leads to cardiovascular sequelae (Rev Méd Chile 2007; 135: 959-66)

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Mutagenesis-induced, large fitness variations with an invariant arenavirus consensus genomic nucleotide sequence

Grande-Pérez, Ana; Gómez-Mariano, Gema; Lowenstein, Pedro R.; Domingo, Esteban

Enhanced mutagenesis may result in RNA virus extinction, but the molecular events underlying this process are not well understood. Here we show that 5-fluorouracil (FU)-induced mutagenesis of the arenavirus lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) resulted in preextinction populations whose consens...

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Infectious Bursal Disease Virus: Ribonucleoprotein Complexes of a Double-Stranded RNA Virus

Luque, Daniel; Saugar, Irene; Rejas, María Teresa; Carrascosa, José L.; Rodríguez, José F.; Castón, José R.

Genome-binding proteins with scaffolding and/or regulatory functions are common in living organisms and include histones in eukaryotic cells, histone-like proteins in some double-stranded DNA (dsDNA) viruses, and the nucleocapsid proteins of single-stranded RNA viruses. dsRNA viruses nevertheless la...

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Implementación de la técnica de PCR enla identificación de Babesia ssp en equinos/ IMPLEMENTATION OF PCR TECHNIQUE IN THE EQUINE IDENTIFICATION OF Babesia ssp

VARGAS, DANILO; BONET, RAFAEL; OLIVA, PAULINA; CAMPANO, SERGIO
2004-07-01

Resumen en español Aunque las técnicas de referencias citadas por la USDA y OIE son IFI y FC, para el diagnóstico de las infecciones por Babesia equi y Babesia caballi, éstas no permite la diferenciación entre las especies y no descartan resultados falsos negativos. La implementación de la PCR como técnica directa, en la identificación y carac-terización de estos parásitos, sin duda constituye un soporte al diagnóstico clínico de la piroplasmosis equina. Dado lo anteriormente exp (mas) uesto en el presente trabajo se estandarizó la PCr para la identificación de B. equi y B. caballi. El procedimiento contempló la implementación de un protocolo de extracción de DNA, a partir de muestras de sangre y la optimización de PCR, tanto para la mezcla de reacción como para el programa de termociclación, junto a 4 partidores: P1 y P2 para B equi y P3 y P4 para B caballi. Ambos amplifican en forma selectiva una secuencia conservada de los genes de 16S rDNA, equivalentes a 659 bp para B. caballi y 664 bp para B. equi. La sensibilidad técnica fue de 0,1ng/ml para B. equi y 1ng/ml para B. caballi. El estudio de especificidad técnica no mostró productos de amplificación al utilizar DNAs de Toxoplasma gondii, Trypanosoma cruzi, Echinococcus granulosus, Fasciola hepatica. Se estudiaron 77 muestras de sangre de equinos provenientes de la Región Metropolitana de Chile con y sin sospecha clínica, de las cuales 15 resultaron positivas (14 a B. equi y 1 a B. caballi). Nuestros resultados crearon la necesidad de una evaluación epidemiológica de la PCR y su confrontación con otras técnicas de diagnóstico directo, para lo cual en la actualidad se estudian muestras de sangre equina con sospecha a piroplasmosis Resumen en inglés Babesia equi and Babesia caballi are intraerythrocytic protozoan parasites transmitted by ticks, causing equine babesiosis. Although the reference techniques recommended by USDA and OIE are IFAT and CF, they yields falsenegative results and don´t let differentiate between babesia´s species. The implementation of polymerase chain reaction (PCR) as a direct technique for the identification and characterization of these parasites, without doubt enrich the clinical diagnosi (mas) s of babesiosis. . For all those reasons in the present report was estandarizated PCR for the identification of B. equi and B. caballi. The proceeding included blood DNA extraction protocol and the PCR optimization for the reaction mix and the termocyclig program, with four primers asigned P1 and P2 for B. equi and P3 and P4 for B. caballi. Both amplified in a selective way a conserved regions from the 16S rRNA genes (rDNA) of 659 bp for B. equi and 664 bp for B. caballi. The minimal amount of DNA detected from positives controls was 0,1 ng/ml for B. equi and 1ng/ml for B. caballi. The primer set chosen do not produced amplifications fragments using others DNAs, like Toxoplasma gondii, Trypanosoma cruzi, Echinococcus granulosus, Fasciola hepatica. 77 horse blood specimens from Metropolitan Region, were tested for B. equi and B. caballi by PCR, 62 samples were negatives and 15 positives (14 to B. equi and 1 to B. caballi). With the aim of developing epidemiological studies, comparison PCR and microscopy, we are testing horse blood samples with suspicious of babesiosis

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Impairment of transcription elongation by R-loops in vitro

Tous, Cristina; Aguilera, Andrés

PMID: 17603014.-- Final version of the paper available at: http://www.sciencedirect.com/science/journal/0006291X | Transcription elongation causes a local change in DNA superhelicity. An excess of negative supercoiling may lead to opening of DNA strands that could allow formation of R-loops. In yeas...

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Identificación de especies y relaciones interespecíficas en hongos endofíticos en poblaciones naturales de Lolium perenne.

Espadas Resendiz, M.; Romo Vaquero, M.; Vázquez de Aldana, Beatriz R.; García Ciudad, A.; García Criado, B.; Zabalgogeazcoa, I.
2004-01-01

Digital.CSIC (Spain)

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Identificación de especies en productos de origen animal mediante pcr/ PCR-Species-Identification in Animal Products

Aranguren-Méndez, José; Portillo, María; Ruiz, Jorge; Villasmil-Ontiveros, Yenen; Yáñez, Luis; Borjas, Lisbeth; Zabala, William
2009-04-01

Resumen en español La identificación de la especie en productos de origen animal (carne, leche o sus derivados) se hace necesaria y de exigencia por los consumidores modernos, entre otras razones: i) para evitar fraude económico, ya sea por sustitución o adulteración del mismo, ii) por motivos de salud humana, tales como alergias alimentarías, iii) por implicaciones culturales; de allí que se debe contar con herramientas analíticas y sensibles para dicha identificación tales como el (mas) análisis de fragmentos de ADN en especial de origen mitocondrial (gen 12S ARNr) dada su particularidad de ser especifica de especies. A tal fin se estableció una metodología de identificación mediante la amplificación de fragmentos específicos de ADN mitocondrial (ADNm) a partir de muestras biológicas de las principales especies animales implicadas en la producción de carnes o alimentos (bovina, porcina, ovina, caprina, equina, asnos, felina y canina), específicamente de una fracción parcial del gen 12s ARNr de una región conservada usando unos cebadores comunes para dichas especies, un “reverse” especifico de especie y análisis posterior mediante geles de agarosa al 1,5% y amplificación de fragmentos que oscilaron entre 150 y 364 pb. Los resultados indican que se puede identificar la especie a la que pertenece la muestra analizada en el 100% de los casos, ofreciendo una herramienta especifica para determinar la especie en alimentos de origen animal. Resumen en inglés Nowadays identification of animal-origin products (meat, milk and dairy products) is of paramount importance to costumers and specially as for species identification for a number of reasons: i) to avoid economic fraud for substitution or alteration of the product ; ii) to avoid health issues such as food allergies; iii) for culturals reasons. There for the value of analytic and sensitive identification tools such as DNA fragments analysis, especially those of mitochondria (mas) l origin (12S rRNA gene) because of its species-specific character. An identification methodology through amplification of a species-conserved region of 12S rRNA gene (forward primer) and of a species-specific region of the same gene (reverse primer). Template DNA was extracted from biological samples of bovine, swine, ovine, caprine, equine and canine origin. After 1.5% agarose gel electrophoresis, fragments ranging from 150 to 364 bp were observed. Results show that species could be easily identified through PCR in all cases and that this methodology could be a specific tool for determining the origin of animal products.

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Fenotipo atípico de Vibrio ordalii, bacteria altamente patogénica aislada desde salmón del Atlántico cultivado en las costas marinas del sur de Chile/ Atypical phenotype of Vibrio ordalii, a highly pathogenic bacteria isolated from Atlantic salmon reared on the marine coast of southern Chile

Bohle, H; Kjetil, F; Bustos, P; Riofrío, A; Peters, C
2007-01-01

Resumen en español Durante invierno y primavera de 2003, salmones del Atlántico cultivados en las costas marinas del sur de Chile fueron afectados por brotes de una enfermedad. El análisis patológico reveló la presencia de lesiones en piel, úlceras hemorrágicas, mientras que los signos internos incluyeron pericarditis, peritonitis y focos necróticos múltiples en el hígado. En todos los casos, los cultivos bacterianos puros fueron aislados de las lesiones externas y órganos interno (mas) s. La bacteriología convencional mostró como sospechoso a Vibrio sp como causante de la enfermedad. La identificación final de la bacteria fue llevada a cabo por análisis filogenético por la comparación de la secuencia casi total del gen que codifica el RNAr 16s. Este análisis reveló que las bacterias sospechosas pertenecen al grupo de los V. ordalii. Fenotípicamente, estas bacterias mostraron diferencias morfológicas, fisiológicas, bioquímicas, enzimáticas y antigénicas a los V. ordalii de referencia. Por esta razón, las cepas de campo podrían ser consideradas como un biotipo o fenotipo atípico de V. ordalii, aunque para ello es necesario más estudios comparativos entre los genomas completos de estas bacterias Resumen en inglés During the winter and spring of 2003, Atlantic salmon (Salmo salar) reared a sea farms along the marine coast of southern Chile, were affected by outbreaks of disease. The pathological analysis of the affected fish were characterized by the presence of skin lesions, haemorrhaging ulcers and mortality, while the internal signs included pericarditis, peritonitis, multiple necrotic foci in the liver and signs of systemic septicaemia. In all cases, pure cultures of bacteria w (mas) ere isolated from the lesions and internal organs. The isolated bacteria were characterized by means of conventional bacteriological identification assays, and a Vibrio sp. was suspected to be the agent of the disease. The final identification of the bacterial isolates was made after amplification and characterization of the 16s rRNA of the isolates using polymerase chain reaction (PCR), followed by comparison of the nucleotide sequence with previously submitted bacterial 16s rRNA sequences from a gene bank. According to the results of the analysis, the agents producing the disease were bacteria that belonged to the Vibrio ordalii group. However, the dissimilarities discovered by using the morphological, physiological, biochemical, enzymatic and antigenic assays did indicate important differences from the reference strains of V. ordalii. Forthis reason it is suggested that the Chilean field isolates of V. ordalii could be considered as an atypical biotype and/or phenotype of V. ordalii,although more comparative studies between the complete genomes of these bacteria are required

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Evaluation of commercially available and in-house reverse transcription-PCR assays for detection of hepatitis G virus or GB virus C.

Purcell, R H; Forns, X; Alter, H J; Tan, D; Bukh, J

Serum samples from 96 Spanish hemodialysis patients, as well as serial dilutions of RNA extracted from a reference strain of hepatitis G virus (HGV), were tested for HGV or GB virus C (GBV-C) RNA. Two different reverse transcription (RT)-PCR-based methods of detection were compared for the ability t...

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Especies de Colletotrichum en chirimoya (Annona cherimola Mill.)/ Species of Colletotrichum in cherimoya (Annona cherimola Mill.)

Villanueva-Arce, Ramón; Yáñez-Morales, María de J.; Hernández-Anguiano, Ana M.
2008-09-01

Resumen en español Dado que hay pocos estudios fitosanitarios en el cultivo de chirimoya, el objetivo de este estudio fue generar información sobre las especies de Colletotrichum asociadas con diferentes síntomas de enfermedad en frutos y hojas de chirimoya. En medios de cultivo papa-dextrosa-agar y papa-zanahoria-agar se seleccionaron seis aislamientos de Colletotrichum de frutos y hojas recolectados en el Estado de Medra y Michoacán. Se identificaron y analizaron molecularmente tres es (mas) pecies de Colletotrichum considerando las estructuras morfológicas asexuales y sexuales, las diferencias en cultivo, la identificación molecular de los genes rARN por PCR-ITS y las pruebas de patogenicidad. En frutos se identificó C. fragarie, C. gloeosporioides y C. orbiculare como causantes de antracnosis, y C. gloeosporioides, de mancha negra y pudrición de pedúnculo. En hoja se encontró C. gloeosporioides asociado con síntomas de antracnosis. Las identificaciones se corroboraron molecularmente y las secuencias se depositaron en el Banco de Genes del NCBI. La especie C. orbiculare así como los síntomas de antracnosis, mancha negra y pudrición de pedúnculo constituyen nuevos reportes fitosanitarios en frutos y hojas de chirimoya. Resumen en inglés Given that there are few phytosanitary studies of the cherimoya crop, the objective of this study was to generate information of the species of Colletotrichum associated with different symptoms of disease in fruits and leaves of cherimoya. In culture media of potato-dextrose-agar and potato-carrot-agar, six isolates of Colletotrichum were selected of fruits and leaves collected in the State of México and Michoacán. Three species of Colletotrichum were identified and mol (mas) ecularly analyzed, considering the asexual and sexual morphological structures, the differences in culture, the molecular identification of the genes rRNA by PCR-ITS and the pathogenicity tests. In fruits, C. fragariae, C. gloeosporioides and C. orbiculare were identified as causes of anthracnosis, and C. gloeosporioides as causes of black spot and stem-end rot. In the leaf, C. gloeosporioides was found associated with symptoms of anthracnosis. The identifications were confirmed molecularly and the sequences were deposited in the Gene Bank of the NCBI. The species C. orbiculare, along with the symptoms of anthracnose, black spot and stem-end rot constitute new phytosanitary reports in fruits and leaves of cherimoya.

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El nucléolo como un regulador del envejecimiento celular/ The nucleolus as a regulator of cellular senescence

Rosete, María; Padrós, María Rosa; Vindrola, Osvaldo
2007-04-01

Resumen en español El nucléolo, considerado únicamente como el sitio de síntesis de los ribosomas, actualmente representa una estructura nuclear dinámica que participa en la regulación de importantes procesos celulares. Numerosas evidencias han demostrado que el envejecimiento celular es una de las diversas funciones que son controladas por el nucléolo. Las mutaciones en las proteínas de localización nucleolar promueven el envejecimiento prematuro en levaduras y humanos. La carencia (mas) de represión en la transcripción de genes que codifican para el ARNr que se encuentran dañados, y las mutaciones en las helicasas del ADN encargadas de minimizar la formación de círculos extra-cromosómicos del ADN que codifica para el ARNr, provocan modificaciones en la estructura del nucléolo e inducen envejecimiento prematuro en levaduras. De igual manera, en los humanos la carencia de las helicasas del ADN localizadas en el nucléolo y que participan en el mantenimiento de la integridad genómica, favorecen el desarrollo de aquellas enfermedades asociadas con el envejecimiento acelerado. Además, la presencia de algunos componentes de la telomerasa en el nucléolo, indica que parte de la biosíntesis de esta enzima se realiza en esta estructura nuclear, sugiriendo una conexión entre el nucléolo y la síntesis de los telómeros en la regulación del envejecimiento celular. Por otra parte, el nucléolo secuestra proteínas para regular su actividad biológica durante el inicio o término de la vida replicativa celular. Resumen en inglés The nucleolus has been considered originally only as the site for the ribosome synthesis, but now it is well known that it represents a dynamic nuclear structure involved in important cellular processes. Several evidences have demonstrated that the nucleolus regulates the cellular senescence. Specific mutations on the DNAs codifying for nucleolar proteins induced premature senescence from yeast to human. The failure to repress the genes transcription codifying for damaged (mas) rRNA, and the mutations in DNA helicases, which minimizes the formation of DNA extra-chromosomal circles codifying for rRNA, modify the nucleolar structure and induce premature senescence in yeast. Similarly, in humans, the reduction of these DNA helicases levels, which are localized in the nucleoli and participate in maintenance of genomic integrity, helps to the development of those diseases associated with premature senescence. Furthermore, the presence in the nucleolus of some telomerase components, indicates that part of the biosynthesis of this enzyme occurred in this nuclear structure; suggesting a communication between the nucleolus and the synthesis of the telomeres in the regulation of cell senescence. On the other hand, the nucleolus sequesters proteins to regulate its own biological activity, from the start to the end of cellular replication. In addition this nuclear structure is involved in the biosynthesis of most cellular ribonucleoprotein particles, as well as in cell cycle regulation, making it central to gene expression. In conclusion, the nucleolus became a multifunctional subnuclear structure involved from cell proliferation to cell senescence.

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Eficacia de una prueba rápida para el diagnóstico de Plasmodium vivax en pacientes sintomáticos de Chiapas, México/ Eficacia de una prueba rápida para el diagnóstico de Plasmodium vivax en pacientes sintomáticos de Chiapas, México

González-Cerón, Lilia; Rodríguez, Mario H; Betanzos, Angel F; Abadía, Acatl
2005-07-01

Resumen en español OBJETIVO: Evaluar en condiciones de laboratorio la sensibilidad y especificidad de una prueba rápida de diagnóstico (OptiMAL), basada en tiras inmunorreactivas para detectar Plasmodium vivax en pacientes febriles del sur de Chiapas, México. MATERIAL Y MÉTODOS: Entre diciembre de 2000 a abril de 2002 se investigó la presencia de parásitos en muestras sanguíneas de 893 pacientes por examen microscópico de gotas gruesas teñidas con Giemsa (prueba de referencia). Otr (mas) a gota de sangre de la misma punción fue empleada en las tiras inmunorreactivas para investigar la presencia de pLDH del parásito. Los resultados discordantes se resolvieron por PCR del gen de la subunidad ribosomal 18S del parásito para descartar infección. RESULTADOS: OptiMAL mostró una sensibilidad de 93.3% y especificidad de 99.5%, con valores predictivo positivo y negativo de 96.5 y 98.9%, respectivamente. La intensidad de las reacciones en las tiras OptiMAL correlacionaron con la densidad parasitaria (r=0.601, p=0.0001). CONCLUSIONES: La prueba rápida presentó sensibilidad y especificidad aceptables para detectar P. vivax en condiciones de laboratorio y podría ser útil para el diagnóstico de paludismo en operaciones de campo en México. Resumen en inglés OBJECTIVE: To evaluate, under laboratory conditions, the sensitivity and specificity of a rapid diagnostic test (OptiMAL), based on immunoreactive strips, to detect Plasmodium vivax infection in febrile patients in Southern Chiapas, Mexico. MATERIAL AND METHODS: The presence of parasites in blood samples of 893 patients was investigated by Giemsa-stained thick blood smear microscopic examination (gold standard). A blood drop from the same sample was smeared on immunoreact (mas) ive strips to investigate the presence of the parasite pLDH. Discordant results were resolved by PCR amplification of the parasite's 18S SSU rRNA, to discard infection. RESULTS: OptiMAL had an overall sensitivity of 93.3% and its specificity was 99.5%. Its positive and negative predictive values were 96.5% and 98.9%, respectively. Signal intensity in OptiMAL strips correlated well with the parasitemia density in the blood samples (r= 0.601, p= 0.0001). CONCLUSIONS: This rapid test had acceptable sensitivity and specificity to detect P. vivax under laboratory conditions and could be useful for malaria diagnosis in field operations in Mexico.

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Eficacia de una prueba rápida para el diagnóstico de Plasmodium vivax en pacientes sintomáticos de Chiapas, México/ Eficacia de una prueba rápida para el diagnóstico de Plasmodium vivax en pacientes sintomáticos de Chiapas, México

González-Cerón, Lilia; Rodríguez, Mario H; Betanzos, Angel F; Abadía, Acatl
2005-07-01

Resumen en español OBJETIVO: Evaluar en condiciones de laboratorio la sensibilidad y especificidad de una prueba rápida de diagnóstico (OptiMAL), basada en tiras inmunorreactivas para detectar Plasmodium vivax en pacientes febriles del sur de Chiapas, México. MATERIAL Y MÉTODOS: Entre diciembre de 2000 a abril de 2002 se investigó la presencia de parásitos en muestras sanguíneas de 893 pacientes por examen microscópico de gotas gruesas teñidas con Giemsa (prueba de referencia). Otr (mas) a gota de sangre de la misma punción fue empleada en las tiras inmunorreactivas para investigar la presencia de pLDH del parásito. Los resultados discordantes se resolvieron por PCR del gen de la subunidad ribosomal 18S del parásito para descartar infección. RESULTADOS: OptiMAL mostró una sensibilidad de 93.3% y especificidad de 99.5%, con valores predictivo positivo y negativo de 96.5 y 98.9%, respectivamente. La intensidad de las reacciones en las tiras OptiMAL correlacionaron con la densidad parasitaria (r=0.601, p=0.0001). CONCLUSIONES: La prueba rápida presentó sensibilidad y especificidad aceptables para detectar P. vivax en condiciones de laboratorio y podría ser útil para el diagnóstico de paludismo en operaciones de campo en México. Resumen en inglés OBJECTIVE: To evaluate, under laboratory conditions, the sensitivity and specificity of a rapid diagnostic test (OptiMAL), based on immunoreactive strips, to detect Plasmodium vivax infection in febrile patients in Southern Chiapas, Mexico. MATERIAL AND METHODS: The presence of parasites in blood samples of 893 patients was investigated by Giemsa-stained thick blood smear microscopic examination (gold standard). A blood drop from the same sample was smeared on immunoreact (mas) ive strips to investigate the presence of the parasite pLDH. Discordant results were resolved by PCR amplification of the parasite's 18S SSU rRNA, to discard infection. RESULTS: OptiMAL had an overall sensitivity of 93.3% and its specificity was 99.5%. Its positive and negative predictive values were 96.5% and 98.9%, respectively. Signal intensity in OptiMAL strips correlated well with the parasitemia density in the blood samples (r= 0.601, p= 0.0001). CONCLUSIONS: This rapid test had acceptable sensitivity and specificity to detect P. vivax under laboratory conditions and could be useful for malaria diagnosis in field operations in Mexico.

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Diversidad filogenética de especies de Microcoleus de costras biológicas de suelo de la península de Baja California, México/ Phylogenetic diversity of Microcoleus species from biological desert crusts of the Baja California Peninsula, Mexico

López-Cortés, Alejandro; Maya, Yolanda; García-Maldonado, José Q.
2010-04-01

Resumen en español Microcoleus vaginatus fue proclamada como especie cosmopolita. Este supuesto no lo confirman los estudios morfológicos previos que se realizaron en poblaciones naturales de costras de suelo en una región con historia geológica particular, llamada sierra de la Laguna (SL), al sur de la península de Baja California (México). Por ello, en este estudio se comparó la estructura de comunidades de cianobacterias, con énfasis en el género Microcoleus, en costras biológic (mas) as de 10 localidades situadas a lo largo de la península. Se analizaron y cotejaron poblaciones naturales de cianobacterias con cepas tipo de colecciones públicas: Microcoleus sociatus (Sammlung von Algenkulturen Germany-SAG 26.92), M. paludosus (SAG 1445. 1a), M. vaginatus (Pasteur Culture Collection-PCC 9802) y M. chthonoplastes (PCC 7420). Se realizaron análisis microscópicos y de clusters de patrones de bandeado de secuencias del 16S rRNA, obtenidos por electroforesis de gel en gradiente desnaturalizante (DGGE). En los análisis microscópicos de muestras naturales no se detectaron morfotipos de M. vaginatus en 6 de las 10 localidades, 4 de ellas de la SL. La comparación de patrones de bandeado obtenidos por DGGE mostró diferencias significativas en la estructura de las comunidades de cianobacterias y ausencia de bandas equivalentes a M. vaginatus (PCC9802), en todas las localidades de la SL. Resumen en inglés Microcoleus vaginatus has been proclaimed to be a cosmopolitan species. However, morphological studies performed on natural populations of cyanobacterial crusts in a region with a particular geological history at the southern part of the Baja California Peninsula, Mexico, called Sierra de la Laguna (SL), do not support the last assertion. We compared the community structure of cyanobacteria, with emphasis in the genus Microcoleus, in biological desert crusts from 10 diffe (mas) rent localities along the Baja California Peninsula. We analyzed natural cyanobacterial populations and matched them with type cultures from public collections: Microcoleus sociatus (Sammlung von Algenkulturen Germany- SAG 26.92), M. paludosus (SAG 1445. 1a), M. vaginatus (Pasteur Culture Collection-PCC 9802), and M. chthonoplastes (PCC 7420). Microscopy and cluster analysis of band patterns of 16S rRNA sequences from denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) were applied. The microscopic analysis of natural samples resulted in the undetection of morphotypes of M. vaginatus in 6 of the 10 localities, 4 or them from the SL. Comparison of band profiles from denaturing gradient gel electrophoresis showed significant differences in the natural cyanobacterial community structure and the absence of the band that matches with that of M. vaginatus (PCC 9802) in all of the SL localities.

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Diagnóstico de Mycoplasma genitalium por amplificación de los genes MgPa y ARN ribosomal 16S/ Diagnosis of Mycoplasma genitalium by MgPa and rRNA 16S gene amplification

Fernández-Molina, Carmen; Rodríguez-Preval, Nadia; Rodríguez-González, Islay; Agnese-Latino, María; Rivera-Tapia, José Antonio; Ayala-Rodríguez, Idalia
2008-10-01

Resumen en español OBJETIVO: El microorganismo Mycoplasma genitalium se ha relacionado con la uretritis no gonocócica (UNG). La técnica de PCR se ha convertido en el principal método de detección de este patógeno. En consecuencia, debe aplicarse un método de diagnóstico mediante la amplificación de fragmentos de ADN por la técnica PCR. MATERIAL Y MÉTODOS: Se seleccionaron los cebadores MGF-MGR y MgPaF-MgPaR, complementarios de los genes de ARNr 16S y MgPa de M. genitalium, respect (mas) ivamente. Se efectuaron ensayos de especificidad y sensibilidad y se estudiaron muestras clínicas. RESULTADOS: La PCR con cada grupo de cebadores utilizado fue específica sólo para M. genitalium y la sensibilidad fue mayor con el grupo de cebadores MGF-MGR. En el estudio de 34 muestras clínicas, 18.5% fue positivo a M. genitalium y se encontró un mayor número de muestras positivas al utilizar los cebadores MgPaF-MgPaR. CONCLUSIONES: Debe aplicarse en la práctica clínica el diagnóstico de M. genitalium mediante la amplificación del ADN por PCR en los pacientes con UNG. Resumen en inglés OBJECTIVE: Mycoplasma genitalium has been associated with nongonococcal urethritis (NGU). Diagnosis by PCR has become the primary detection method for this organism. Thus, diagnosis by DNA amplification using the PCR technique should be utilized. MATERIAL AND METHODS: GMF/GMR and MgpF/MgpR primer pairs, complementary to the M. genitalium 16S rRNA and MgPa genes, respectively, were selected. Specificity and sensibility assays were conducted and clinical samples were studie (mas) d. RESULTS: The PCR with each primer pair was specific only for M. genitalium, and the sensibility was higher with the GMF/GMR primers. In the study of 34 clinical samples, 18,5% were positive for M. genitalium, with more positive samples when the MgpF/MgpR primers were used. CONCLUSIONS: DNA amplification by PCR should be applied in clinical practice to the diagnosis of M. genitalium in patients with NGU should using.

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Diagnóstico de Mycoplasma genitalium por amplificación de los genes MgPa y ARN ribosomal 16S/ Diagnosis of Mycoplasma genitalium by MgPa and rRNA 16S gene amplification

Fernández-Molina, Carmen; Rodríguez-Preval, Nadia; Rodríguez-González, Islay; Agnese-Latino, María; Rivera-Tapia, José Antonio; Ayala-Rodríguez, Idalia
2008-10-01

Resumen en español OBJETIVO: El microorganismo Mycoplasma genitalium se ha relacionado con la uretritis no gonocócica (UNG). La técnica de PCR se ha convertido en el principal método de detección de este patógeno. En consecuencia, debe aplicarse un método de diagnóstico mediante la amplificación de fragmentos de ADN por la técnica PCR. MATERIAL Y MÉTODOS: Se seleccionaron los cebadores MGF-MGR y MgPaF-MgPaR, complementarios de los genes de ARNr 16S y MgPa de M. genitalium, respect (mas) ivamente. Se efectuaron ensayos de especificidad y sensibilidad y se estudiaron muestras clínicas. RESULTADOS: La PCR con cada grupo de cebadores utilizado fue específica sólo para M. genitalium y la sensibilidad fue mayor con el grupo de cebadores MGF-MGR. En el estudio de 34 muestras clínicas, 18.5% fue positivo a M. genitalium y se encontró un mayor número de muestras positivas al utilizar los cebadores MgPaF-MgPaR. CONCLUSIONES: Debe aplicarse en la práctica clínica el diagnóstico de M. genitalium mediante la amplificación del ADN por PCR en los pacientes con UNG. Resumen en inglés OBJECTIVE: Mycoplasma genitalium has been associated with nongonococcal urethritis (NGU). Diagnosis by PCR has become the primary detection method for this organism. Thus, diagnosis by DNA amplification using the PCR technique should be utilized. MATERIAL AND METHODS: GMF/GMR and MgpF/MgpR primer pairs, complementary to the M. genitalium 16S rRNA and MgPa genes, respectively, were selected. Specificity and sensibility assays were conducted and clinical samples were studie (mas) d. RESULTS: The PCR with each primer pair was specific only for M. genitalium, and the sensibility was higher with the GMF/GMR primers. In the study of 34 clinical samples, 18,5% were positive for M. genitalium, with more positive samples when the MgpF/MgpR primers were used. CONCLUSIONS: DNA amplification by PCR should be applied in clinical practice to the diagnosis of M. genitalium in patients with NGU should using.

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Detección e identificación por PCR de microorganismos causantes de meningoencefalitis bacteriana/ Detection and identification by PCR of microorganisms causing bacterial meningocephalitis

Climent, Yanet; Martínez, Isabel; Nuñez, Niurys; Ginebra, Mónica; Zamora, Leydis; Gutiérrez, Mercedes; Sotolongo, Francklin; Acosta, Armando; Climent, Luis W
2002-08-01

Resumen en español Reportamos el empleo de cebadores para la detección e identificación de microorganismos causantes de meningoencefalitis bacteriana (MEB) en 24 muestras de líquido cefalorraquídeo (LCR) y a partir de ADN genómico de cepas de referencia previamente purificado. Se emplearon cebadores generales y específicos derivados del gen 16S ARNr (ARN ribosómico). Los cebadores generales amplificaron en todas las especies bacterianas analizadas: Neisseria meningitidis, Haemophilus (mas) influenzae tipo b, Streptococcus sp y Staphylococcus aureus, en una misma banda de 825 pb. Los cebadores específicos solamente amplificaron en el microorganismo del que se derivan, obteniendo bandas de 667, 478 y 253 pb para N. meningitidis, H. influenzae y Streptococcus sp, respectivamente. También se diferenció Streptococcus agalactiae mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR), donde se obtuvo una banda de 478 pb. Al evaluar estos cebadores en muestras clínicas de LCR se constató que hubo una sensibilidad del 100% de las MEB por PCR; la especificidad fue del 100%. Los productos de PCR se analizaron por digestión Hae III, encontrando correspondencia en los patrones de restricción de las muestras clínicas y las cepas de referencia. Resumen en inglés Our work reports the use of genomic DNA primers previously purified from reference strains to detect and identify the microorganisms that cause bacterial meningocephalitis (BME) in 24 samples of cerebrospinal fluid (CSF). General and specific primers derived from the 16S rRNA (ribosomal RNA) gene were used. The general primers were amplified in all the bacterial species analyzed:Neisseria meningitidis, type b Haemophylus influenzae and Streptococcus sp. in the same 825 pb (mas) band, but the specific ones only amplified in the microorganism from which they were derived. Bands of 667, 478 and 253 pb were respectively obtained for N. meningitidis,H. influenzae and Streptococcus sp. Streptococcus agalactiae was also detected by PCR in which a 478 pb band was obtained. Upon evaluating the primers in clinical CSF samples, 100% detection of the BME causing microorganisms was observed. The specificity was 100%. The PCR products were analyzed by Hae III digestion, and correspondence found for the restriction patterns of the clinical samples and the reference strains.

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Detección de plesiomonas shigelloides mediante la pcr en tilapias silvestres (oreochromis mossambicus) y cultivadas (tetrahíbrido o. Mossambicus × o. Urolepis hornorum × o. Niloticus × o. Aureus) en venezuela/ Detection of plesiomonas shigelloides by pcr in feral (oreochromis mossambicus) and cultured tilapias (tetrahybrid of o. Mossambicus × o. Urolepis hornorum × o. Niloticus × o. Aureus) in venezuela

Marianella, Moreno; Medina, Lourdes Yelitza; Álvarez Rivera, Julia Dolores; Obregón, José M; Medina, Gladys
2006-10-01

Resumen en español Plesiomonas shigelloides es un bacilo Gram negativo, anaerobio facultativo, móvil, que pertenece a la familia Enterobactereaceae. No forma parte de la flora normal del humano, mientras que los peces dulceacuícolas como las tilapias se tienen como su reservorio primario. Considerando: a) La implicación cada vez más frecuente de este microorganismo como agente causal de enfermedades intra y extra intestinales, b) El incremento de la comercialización de tilapias silvest (mas) res y de cultivo a nivel nacional y c) La necesidad de métodos de detección e identificación rápidos y efectivos de patógenos, se aplicó el método biomolecular de la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR). Se procesaron mediante la PCR, cepas de P. shigelloides y homogeneizados de pools de bazo, riñón y cerebro, y de intestino de tilapias, utilizándose oligonucleótidos iniciadores específicos para el gen 23S ARNr de P. shigelloides. Se obtuvo el reconocimiento del 75% de las 20 cepas identificadas por pruebas fenotípicas convencionales, detectándose además en 27% de los homogeneizados frescos y en 18% de los congelados. Estos resultados confirman la especificidad del método para la identificación de diversas bacterias potencialmente patógenas, su utilidad en el mejoramiento del sistema de control de calidad de granjas dulceacuícolas y en el estudio de casos clínicos, aumentando la efectividad del sistema de salud relacionado con estas áreas Resumen en inglés Plesiomonas shigelloides is a Gram negative rod, facultative anaerobic, motile, that belongs to the Enterobacteriaceae. It’s not part of the normal human flora, while fresh water fish like tilapias are thought to be its primary reservoir. Considering: a) The more frequent implication of this microorganism as the causal agent of intra and extraintestinal infections, b) The wide spread of national commercialization of feral and cultured tilapias and c) The need for rapid a (mas) nd effective detection and identification methods, the biomolecular technique of Polymerase Chain Reaction (PCR) was applied. Strains of P. shigelloides and pools of homogenates from spleen, kidney and brain and the intestine of tilapias were processed by PCR, using specific primers for the gene 23S rRNA of P. shigelloides. The 20 strains identified by conventional phenotypic traits were identified in 75%, additionally it was detected in 27% of the fresh homogenates and in 18% of the frozen ones. These results confirm the specificity of the technique for the identification of a diverse range of potential pathogenic bacteria, its usefulness in the improvement of quality control in freshwater farms and in the study of clinical cases, improving the effectiveness of health systems related with these areas

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Detección de contaminación por Mollicutes en cultivos celulares mediante amplificación del gen 16S rARN/ Detection of Mollicutes contamination in cell cultures by 16S rRNA amplification

Sobarzo Aguayo, Gustavo; Martínez Tagle, María Angélica; Vidal Alvarez, Roberto; Martínez Torrens, María Cristina; Avendaño Carvajal, Luis Fidel
2006-12-01

Resumen en español La contaminación de los cultivos celulares por Mollicutes es un hecho frecuente en los laboratorios, reportándose hasta un 80% de cultivos contaminados, lo que resulta en ensayos experimentales poco confiables y en productos biológicos poco seguros. Los objetivos del presente estudio fueron: estimar la frecuencia de micoplasmas como contaminantes de cultivos celulares y analizar la eficiencia de un ensayo de PCR que emplea como ADN blanco al gen 16S rARN de los Mollicu (mas) tes. Se estudiaron 39 cultivos celulares, representativos de las líneas celulares más utilizadas y 17 cultivos celulares primarios, recibidos para análisis de contaminación, entre julio y diciembre de 2005. Se detectaron micoplasmas en 18/39 (46,2%) cultivos de líneas celulares, mientras que no se detectaron micoplasmas en los cultivos celulares primarios. El análisis mediante HpaII del espacio intergénico 16S-23S rARN de 6 cultivos positivos determinó dos patrones de restricción. La secuenciación del ADN de dos amplicones identificó a Mycoplasma hyorhinis y a Mycoplasma salivarium como micoplasmas contaminantes. La sensibilidad analítica de la PCR, determinada a partir de diluciones de un cultivo de Mycoplasma hominis fue 0,01 u.c.c./mL (unidades cambiadoras de color por mL), mientras que su especificidad analítica fue 100%. Los resultados de este estudio confirman la importancia de los micoplasmas como contaminantes de cultivos celulares y sugieren que la PCR dirigida al gen 16S rARN es un procedimiento útil para el diagnóstico de estos microorganismos. Resumen en inglés Up to 80% of cell cultures have been reported to be contaminated with Mollicutes, causing unreliable experimental results and giving rise to unsafe biological products. The aims of this study were to estimate the frequency of mycoplasmas as contaminants in cell cultures, and to analyze the performance of a PCR assay targeting the 16S rRNA of Mollicutes. Thirty-nine cell cultures representing the most used lines of cell cultures and 17 primary cell cultures submitted for d (mas) etection of mycoplasma contamination were studied between July and December 2005. Mycoplasmas were detected in 18/39 (46.2%) cell line cultures, and in none of the primary cell cultures. HpaII analysis of the 16S-23S rRNA intergenic space of 6 positive cultures belonging to different laboratories gave two different restriction patterns. The sequentiation of each of the two patterns identified Mycoplasma hyorhinis and Mycoplasma salivarium as the contaminant mycoplasmas. The analytic sensitivity of the 16S rRNA PCR was 0.01 color-changing units per mL, as determined for dilutions of a Mycoplasma hominis culture, whereas the analytical specificity was 100%. In conclusion, these results reaffirm the importance of mycoplasmas as cell culture contaminants, and suggest that 16S rRNA PCR is a reliable method for detection of these organisms as cell culture contaminants.

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Detección de Mycoplasma genitalium y correlación con manifestaciones clínicas en una población del estado Zulia, Venezuela/ Mycoplasma genitalium detection and correlation with clinical manifestations in population of the Zulia State, Venezuela

Arráiz R, Nailet; Colina Ch, Sonia; Marcucci J, Rafael; Rondón G, Netxibeth; Reyes S, Francia; Bermúdez P, Valmore; Romero F, Zoila
2008-08-01

Resumen en español Diversos estudios demuestran una asociación entre Mycoplasma genitalium y patologías urogenitales. El objetivo de este trabajo fue investigar la prevalencia de infecciones por M. genitalium en pacientes atendidas en clínicas privadas (n = 172). Se utilizaron ensayos de amplificación de genes 16S rARN y MgPa. La prevalencia de M. genitalium en esta población fue 7,5%. Mycoplasma genitalium fue detectado en 12,1 y 4,1%) de las pacientes sintomáticas y asintomáticas, (mas) respectivamente (p = 0,047). La infección se diagnosticó en pacientes con cervicitis (17,2%) y con secreción mucopurulenta (16,6%) y la mayor prevalencia de infecciones se registró en el grupo etario de 31 a 40 años. No se encontró asociación significativa entre la presencia de M. genitalium y manifestaciones clínicas individuales o edad de las pacientes (p > 0,05). La alta prevalencia de infecciones por M. genitalium, principalmente en pacientes con manifestaciones clínicas demostrada en este estudio, demanda la aplicación de estrategias diagnósticas en la población para investigar el significado clínico de estos microorganismos y reevaluar esquemas terapéuticos contra infecciones no gonocóccicas y no clamidiales Resumen en inglés Diverse studies demonstrate an association between Mycoplasma genitalium and urogenital pathologies. The aim of this study was to investigate the prevalence of M. genitalium in patients attending gynecological evaluation in private clinics (n = 172). DNA amplification assays of the genes 16S rRNA and MgPa were utilized. The prevalence of M. genitalium in the study population was 7.5%. M. genitalium was detected in 12.1% and 4.1% of the symptomatic and asymptomatic patient (mas) s, respectively (p = 0.047). The infection was diagnosed in patients with cervicitis (17.2%) and mucopurulent secretion (16.6%) and the highest prevalence of infections was registered in the 31-40 years age group. No significant association between the presence of M.genitalium and individual clinical manifestations or the patients age was showed (p > 0.05). The high prevalence of M. genitalium infections, mostly in patients with clinical manifestations showed in this study, warrants the application of diagnostic strategies in the population to investigate the clinical meaning of these microorganisms and to reevaluate therapeutic schemes against non-gonococcal and non-chlamydial infections

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CTCF regulates the local epigenetic state of ribosomal DNA repeats

Nobelen, Suzanne van de; Rosa-Garrido, Manuel; Delgado, M. Dolores; Galjart, Niels; Sleutels, Frank
2010-11-08

Digital.CSIC (Spain)

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Brote de micoplasmosis clínica por Mycoplasma ovis en ovinos de Salta, Argentina: Diagnóstico clínico, microbiológico y molecular/ Clinical mycoplasmosis outbreak due to Mycoplasma ovis in sheep from Salta, Argentina: Clinical, microbiological and molecular diagnosis

Aguirre, D. H.; Thompson, C.; Neumann, R. D.; Salatin, A. O.; Gaido, A. B.; Torioni de Echaide, S.
2009-12-01

Resumen en español Mycoplasma ovis es un parásito obligado de los eritrocitos de los pequeños rumiantes (ovinos, caprinos), en los que produce anemia crónica o aguda. Su distribución es mundial, aunque se desconoce la difusión de esta bacteria en la Argentina. Este trabajo describe un brote de micoplasmosis en un rebaño ovino de la localidad salteña de Rosario de la Frontera, ocurrido en enero de 2007. Durante ese brote resultó afectada la categoría de ovinos adultos, con una morta (mas) lidad del 17,8%. El diagnóstico en extendidos de sangre (tinción de Giemsa) reveló pequeños cuerpos basófilos, característicos de la infección por M. ovis, en todas las muestras examinadas (n = 11), lo que indica una alta prevalencia de la infección en la majada. El diagnóstico molecular (n = 9) confirmó los hallazgos mediante la amplificación de dos fragmentos del gen 16S rRNA. Este representa el tercer registro del microorganismo en la Argentina y el primero con expresión clínica a escala poblacional (rebaño). Resumen en inglés Mycoplasma ovis is an obligatory parasite of the erythrocytes from small ruminants (sheep, goat), wherein it causes chronic or acute anaemia. This agent shows worldwide distribution. However, its dispersion is still unknown in Argentina. This work describes an outbreak of mycoplasmosis occurred in January 2007 in a sheep flock from Rosario de la Frontera, Salta, Argentina. Adult sheep became ill with a mortality rate of 17.8%. All blood smears (n = 11) examined by Giemsa (mas) stain showed the presence of small basophile bodies characteristic of M. ovis infection, indicating a high prevalence of the infection in the flock. The molecular diagnosis (n = 9) confirmed the findings through the amplification of two fragments from the 16S rRNA gene. This is the third report of M. ovis in Argentina and the first one concomitant with clinical signs at flock level.

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Angiomatosis bacilar por Bartonella quintana en un paciente con infección por virus de inmunodeficiencia humana/ Bacillary angiomatosis caused by Bartonella quintana in an human immunodeficiency virus positive patient

Vásquez T, Patricia; Chanqueo C, Leonardo; García C, Patricia; Poggi M, Helena; Ferrés G, Marcela; Bustos M, Marisol; Piottante B, Antonio
2007-04-01

Resumen en español Reportamos el primer caso de angiomatosis bacilar por Bartonella quintana en un paciente con infección por VIH en nuestro país. Este corresponde a un hombre de 27 años, heterosexual, indigente, seropositivo para VIH conocido desde septiembre de 2003, en control irregular. En abril de 2005, el paciente desarrolló un aumento progresivo de volumen en la región frontal y aparición de pápulas eritematosas en las extremidades, que luego se extendieron a la cara, tórax y (mas) mucosas, tornándose nodulares y violáceas. El diagnóstico de angiomatosis bacilar se planteó inicialmente por el cuadro clínico del paciente, siendo confirmado por serología y tinción de Warthin Starry positiva en la biopsia de piel. El agente causal se identificó como Bartonella quintana por RPC universal para el gen del 16S ARNr de un nódulo cutáneo. Se inició terapia antimicrobiana con azitromicina y ciprofloxacina, además de terapia antiretroviral, con desaparición de las lesiones en forma progresiva Resumen en inglés We report the first case of bacillary angiomatosis due to Bartonella quintana affecting a Chilean a HIV positive patient in Chile. He was a 27 years old, heterosexual male, indigentman known to be HIV positive serological status known from September, 2003, under irregular medical control. On April, 2005, he presented a progressive abscess in the frontal region and erythematous papules in the extremities, that extended to face, thorax and mucoses, becoming nodular and viol (mas) aceous lesions. Bacillary angiomatosis diagnosis was initially sustained on account of the clinical manifestations, and was confirmed by serology and Warthin Starry staining from a skin biopsy. The etiological agent was identified as Bartonella quintana through universal RPC performed from a cutaneous nodule to detect 16S rRNA gen. Azithromycin plus ciprofloxacin was started, besides of anti retroviral therapy antiretroviral, with the lesions being progressively disappearing

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Aminoglucósidos-aminociclitoles: Características estructurales y nuevos aspectos sobre su resistencia/ Aminoglycosides-aminocyclitols: Structural characteristics and new aspects on resistance

Mella M, Sergio; Sepúlveda A, Marcela; González R, Gerardo; BelloT, Helia; Domínguez Y, Mariana; Zemelman Z, Raúl; Ramírez G, César
2004-12-01

Resumen en inglés The aminoglycoside-aminocyclitol antibiotics constitute one of the antibacterial agent families with greater activity upon aerobic Gram-negative bacilli. These compounds are formed by the combination of one amino-cyclic alcohol (aminocyclitol) and aminosaccharides (aminoglycosides) linked by glycosidic bonds. The strong bactericidal activity exhibited for these compounds is not only explained by their ability to inhibit the protein synthesis, but also by pleiotropic effec (mas) t altering the permeability of cytoplasmatic membrane. The penetration of these antibiotics to the bacterial cells is mediated by three well defined phases, being the two latest dependant of the proton-motive force. This fact explains that this kind of compounds have no antibacterial activity upon anaerobic bacteria. Bacterial resistance to aminoglycosides is mainly due to aminoglycoside-modifying enzymes (AME), which are commonly encoded by extrachromosomal genetic elements as are plasmids and transposons. Nevertheless, new mechanisms of resistance and genetic elements participating in the resistance to these compounds have been identified. Thus, recently the methylation of the 16S rRNA binding the aminoglycosides has been described. On the other hand, the gene cassettes acquire an increasing importance, because they can host a varied of families of antibiotic resistance genes, including the aminoglycoside-aminocyclitols. These gene cassettes are associated to integrons, which are able to integrate and express these antibiotic resistance determinants

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