Sample records for MAPA GENETICO (genetic mapping)
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1

Análisis de isonimia entre poblaciones del noroeste de Colombia/ Isonymy analysis between 2 populations in northwestern Colombia.

Bedoya, Gabriel; García, Jenny; Montoya, Patricia; Rojas, Winston; Amézquita, Maria Eugenia; Soto, Iván; López, Maria Cecilia; Ospina-Duque, Jorge; Ruiz-Linares, Andrés
2006-12-01

Resumen en español Introducción. La utilización de la frecuencia de apellidos como marcadores de linajes paternos ha permitido caracterizar poblaciones. Los principios de isonimia se han empleado para determinar el grado de estructuración genética, las tasas de migraciones y las relaciones de ancestría y origen entre poblaciones. Este análisis se aplicó a dos poblaciones históricamente relacionadas y consideradas como aislados genéticos. Objetivo. Evaluar las relaciones genéticas (mas) y de origen entre Aranzazu y Marinilla y su zona de influencia por medio de análisis de frecuencia de apellidos. Materiales y métodos. A partir de la base de datos del Sistema de Identificación de Beneficiarios de los Programas Sociales, Sisbén, se calcularon los parámetros poblacionales de coeficiente de parentesco (fiii), la homogeneidad poblacional con los estimadores B (porcentaje de la población que comparte los siete apellidos más frecuentes) y C (15 apellidos más frecuentes) y la distancia genética de Cavalli-Sforza en tres poblaciones del núcleo fundador de Marinilla y Rionegro como población externa. Resultados. Marinilla y Aranzazu, al igual que las poblaciones de Marinilla y su zona de influencia, mostraron los mayores valores de homogeneidad (valores B entre 0,25 y 0,5) comparados con Rionegro (B = 0,159) y también mayores valores de parentesco intrapoblacional (valores fiii entre 0,0034 y 0,01). Las menores distancias se encontraron entre Marinilla y Aranzazu. Conclusiones. Aranzazu es una población con características similares a las de Marinilla y su zona de influencia y debido al efecto fundador, estas poblaciones pueden presentar características genéticas similares. Por lo tanto, las enfermedades genéticas, principalmente las de herencia compleja, podrían tener la misma etiología genética en ambas poblaciones, lo que garantizaría las condiciones óptimas para estudios de cartografía genética. Resumen en inglés Introduction. Surname frequency (isonymy) is used as a marker of paternal lineage and is used to characterize human population structure. Principles of isonymy were used to determine the genetic structure, migration rates, ancestry relations and origins of populations. This analysis was applied to two historically related local populations which currently are considered to be genetically isolated. Objective. The genetic relationships and influence zones of the Aranzazu an (mas) d Marinilla populations were assessed by means of surname frequency analysis. Materials and methods. Data originated from database with the title "System of Identification of Beneficiaries of the Social Programs" database or Sisben. Population parameters such as a priori kinship (phiii), population homogeneity with B and C estimators, and Cavalli-Sforza’s genetic distance were calculated for (a) three towns of Marinilla and its influence zone and (b) Aranzazu. The Rionegro population served as an external, comparison population. Results. The Aranzazu and Marinilla populations showed the higher homogeneity (B value between 0.25 and 0.5) in contrast with Rionegro (B = 0.159), as well as greater a priori kinship values (phiii between 0.003 and 0.010). The lowest distances were found between Marinilla and Aranzazu. Conclusions. Aranzazu is a population with characteristics similar to those of Marinilla and its influence zone. The close similarity of genetic characteristics for these populations is due probably to a founder effect. Furthermore, the genetic similarity predicts that genetic diseases will have the same etiology in both populations and provides optimum conditions for gene mapping studies.

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2

Use of biotechnology for preserving rare fruit germplasm

Martínez-Gómez, Pedro; Majourhat, Khalid; Zeinalabedini, Mehrshad; Erogul, Deniz; Khayam-Nekoui, Mojtaba; Grigorian, Vazgin; Hafidi, Abdellatif; Piqueras, Abel; Gradziel, Thomas M.
2007-01-01

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3

Transcription Initiation Activity Sets Replication Origin Efficiency in Mammalian Cells

Sequeira-Mendes, Joana; Díaz-Uriarte, Ramón; Apedaile, Anwyn; Huntley, Derek; Brockdorff, Neil; Gómez, María
2009-04-10

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5

The genetic architecture of maize flowering time

Buckler, Edward S.; Holland, James B.; Bradbury, Peter J.; Acharya, Charlotte B.; Brown, Patrick J.; Browne, Chris; Ersoz, Elhan; Flint-Garcia, Sherry; Garcia, Arturo; Glaubitz, Jeffrey C.; Goodman, Major M.; Harjes, Carlos; Guill, Kate; Kroon, Dallas E.; Larsson, Sara; Lepak, Nicholas K.; Huihui, Li; Mitchell, Sharon E.; Pressoir, Gael; Peiffer, Jason A.; Oropeza Rosas, Marco; Rocheford, Torbert R.; Romay Álvarez, María Cinta; Romero, Susan; Salvo, Stella; Sánchez Villeda, Héctor; Da Silva, Sofia; Qi, Sun; Feng, Tian; Upadyayula, Narasimham; Ware, Doreen; Yates, Heather; Jianming, Yu; Zhiwu, Zhang; Kresovich, Stephen; McMullen, Michael D.
2009-08-07

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6

The Activity of Yeast Hog1 MAPK Is Required during Endoplasmic Reticulum Stress Induced by Tunicamycin Exposure

Torres Quiroz, Francisco; García Marqués, Sara; Coria, Roberto; Rández Gil, Francisca; Prieto Alamán, José Antonio
2010-04-29

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7

Synteny conservation between the Prunus genome and both the present and ancestral Arabidopsis genomes

Jung, Sook; Main, Dorrie; Staton, Margaret; Cho, Ilhyung; Zhebentyayeva, Tatyana; Arús, Pere; Abbott, Albert
2006-04-14

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8

Subdivisión litofacial e interpretación del volcanismo jurásico (Grupo Bahía Laura) en el este del Macizo del Deseado, provincia de Santa Cruz/ Litofacial subdivision and interpretation of the Jurassic volcanism (Bahía Laura Group) in the eastern Deseado Massif, Santa Cruz province

Guido, D.M.
2004-12-01

Resumen en español El Grupo Bahía Laura representa la unidad de mayor importancia de la provincia geológica Macizo del Deseado. Está constituido por un conjunto de rocas volcánicas ácidas de edad Jurásico medio a superior, que se distribuyen ampliamente en la provincia. El presente artículo describe la subdivisión litofacial del grupo surgida de los trabajos de mapeo en el sector oriental del Macizo del Deseado. Este criterio condujo a una clasificación en facies y subfacies volcá (mas) nicas desde un punto de vista descriptivo y genético. De este modo, se han determinado la facies volcaniclástica que comprende las subfacies piroclástica (de flujo, caída y surge) y la subfacies epiclástica, y la facies efusiva, que incluye las subfacies lávica y subvolcánica. Esta discriminación posibilitó la interpretación de los procesos que han actuado en la conformación de los depósitos volcánicos del sector estudiado, favoreciendo además la utilización del término "Complejo Bahía Laura". El volcanismo ácido jurásico de la región oriental se asocia a un ciclo mayor explosivo-efusivo. En un principio se generaron alta proporción de depósitos de caída, posteriormente se originaron grandes volúmenes de ignimbritas, principalmente de alto grado, y la etapa final fue dominada por materiales lávicos y depósitos volcánicos retrabajados. Se identificaron además los principales centros de emisión (la caldera del cerro Torta y varios complejos de domos, domos, pórfiros y diques) de los materiales volcánicos en el área. Su distribución se ajusta a lineamientos ENE y NNO, poniendo en evidencia la importancia del mecanismo de erupción fisural, asociado a las fracturas extensionales del sistema El Tranquilo, en la extrusión de los materiales volcánicos. Resumen en inglés The Bahía Laura Group represents the most important unit of the Deseado Massif geological province. It is composed by acid volcanic rocks of upper to middle Jurassic age, which are widely distributed in the province. This article describes a litofacial subdivision of the group, originated as a consequence of mapping activities on the eastern Deseado Massif area. These criteria conduce to a classification into volcanic facies and subfacies from a descriptive and genetic p (mas) oint of view. In that sense, a volcaniclastic facies, comprising the pyroclastic (flow, fall and surge) and epiclastic subfacies, and an effusive facies, including the lavic and subvolcanic subfacies, have been determined. This discrimination allowed the interpretation of the processes that acted in the eastern volcanic deposits conformation and favored the utilization of the term "Bahía Laura Complex". The acid Jurassic volcanism of the eastern region can be associated with an explosive-effusive mayor cycle. In the beginning fall deposits were generated, lately huge volumes of ignimbrites, mainly high grade type, were formed, and the final stage was dominated by lavas and reworked volcanic deposits. The main emission centers (the Cerro Torta caldera and various dome complexes, domes, porphyries and dikes) of the volcanic materials from the area, were also identified. Their distribution matches to ENE and NNW lineaments, evidencing the importance of the fissural mechanism of eruption, associated with the El Tranquilo system extensional fractures, in the volcanic material extrusion.

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10

Sequencing of 6.7 Mb of the melon genome using a BAC pooling strategy

González, Víctor M.; Benjak, Andrej; Hénaff, Elizabeth Marie; Mir, Gisela; Casacuberta, Josep M.; Garcia-Mas, Jordi; Puigdomènech, Pere
2010-11-12

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11

Sequencing of 6.7 Mb of the melon genome using a BAC pooling strategy

González, Víctor M.; García-Mas, Jordi; Arús, Pere; Puigdomènech, Pere
2010-05-28

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Saturación de un mapa genético de trigo candeal y detección de QTL asociados a actividad de lipoxigenasas/ Saturation of a durum wheat genetic map and detection of QTL associated to lipoxygenase activity

Picca, A; Roncallo, P; Carrera, A; Cervigni, G; Miranda, R.; Echenique, V
2008-12-01

Resumen en español Los objetivos de este trabajo fueron la saturación de un mapa genético de trigo candeal y el posterior mapeo de QTL, a fin de identificar regiones genómicas relacionadas con la actividad de lipoxigenasas. También se estimó la utilidad de los marcadores ligados a estas regiones como herramientas de selección de genotipos para mejorar el color de la pasta. Para tal fin se utilizó una población de mapeo obtenida por el método de descendencia de una sola semilla cons (mas) tituida por 83 líneas recombinantes endocriadas (RILs) derivadas del cru­zamiento entre los trigos candeales Kofa y UC1113 (Triticum turgidum L. var. durum). Se mapearon 44 AFLPs, 9 RAPDs, 2 isoenzimas y 1 proteína de reserva sobre un mapa base de 269 marcadores. La longitud total del mapa resultante fue de 1847,4 cM, con una distancia promedio entre pares de marcadores de 5,68 cM. El mapeo por el método de intervalos compuestos (CIM) indicó la presencia de un QTL mayor, en el cromosoma 4B, que explica un 58% de la variación fenotípica de la actividad de lipoxigenasas. La posición más probable del QTL (LOD=19,00) fue obtenida entre los marcadores "ksm62" y "wmc617b". Estos resultados fueron consistentes en dos años y a dos pH diferentes. Resumen en inglés The aims of this work were (1) the saturation of a linkage map of durum wheat using AFPLs and RAPDs, (2) mapping of QTL related to lipoxygenase activity and (3) estimation of its usefulness in marker-assisted selection to increase pasta colour. A mapping population of 83 recombinant lines (RILs) derived from the cross between durum wheat Kofa and UC1113 (Triticum turgidum L. var. durum) was evaluated for lipoxygenase activity during two growing seasons. It was used to gen (mas) erate a genetic map. Forty four AFLPs, 9 RAPDs, 2 isoenzymes and 1 storage protein were mapped onto a previous genetic map consisting on 269 markers. The total length of the map obtained was 1847.4 cM, with an average genetic distance between pairs of markers of 5.68 cM. The com-posite interval mapping (CIM) showed the presence of a major QTL explaining 58% of phenotypic variation in lipoxygenase activity on chromosome 4B. The highest LOD value (LOD=19,00) was obtained between the "ksm62" and "wmc617b" markers. These results were consistent in the two sampling years and at the two pH in which lipoxygenase activity was analyzed.

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13

Role of dehydrodiferulates in maize resistance to pests and diseases

Santiago Carabelos, Rogelio; Malvar Pintos, Rosa Ana
2010-02-09

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14

Rga2 IS a Rho2 GAP that regulates morphogenesis and cell integrity in Schizosaccharomyces pombe

Villar-Tajadura, María Antonia; Coll, Pedro M.; Santos, Beatriz; Pérez González, Pilar
2008-10-10

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Quantitative trait loci for resistance to trichostrongylid infection in Spanish Churra sheep

Gutiérrez-Gil, Beatriz; Pérez, Jorge; Álvarez, Lorena; Martínez-Valladares, Maria; Fuente, Luis Fernando de la; Bayón, Yolanda; Meana, Aranzazu; San Primitivo, Fermín; Rojo Vázquez, Francisco Antonio; Arranz, Juan José
2009-10-01

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16

QTL mapping for Mediterranean corn borer resistance in European flint germplasm using recombinant inbred lines

Ordás López, Bernardo; Malvar Pintos, Rosa Ana; Santiago Carabelos, Rogelio; Butrón Gómez, Ana María
2010-03-15

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New study of the local gravity field of El Hierro (Canary Islands)

González Montesinos, Fuensanta; Arnoso, José; Benavent, M.
2005-01-01

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New approaches to Prunus tree crop breeding

Martínez-Gómez, Pedro; Sozzi, Gabriel O.; Sánchez-Pérez, Raquel; Rubio, Manuel; Gradziel, Thomas M.
2003-01-01

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Network analysis identifies weak and strong links in a metapopulation system

Rozenfeld, Alejandro F.; Arnaud-Haond, Sophie; Hernández-García, Emilio; Eguíluz, Víctor M.; Serrão, Ester A.; Duarte, Carlos M.
2008-10-20

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Multiple Models for Rosaceae Genomics

Shulaev, Vladimir; Korban, Schuyler S.; Sosinski, Bryon; Abbott, Albert G.; Aldwinckle, Herb S.; Folta, Kevin M.; Iezzoni, Amy; Main, Dorrie; Arús, Pere; Dandekar, Abhaya M.; Lewers, Kim; Brown, Susan K.; Davis, Thomas M.; Gardiner, Susan E.; Potter, Daniel; Veilleux, Richard E.
2008-05-16

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Multilocus sequence analysis for assessment of the biogeography and evolutionary genetics of four Bradyrhizobium species that nodulate soybeans on the asiatic continent

Vinuesa, P; Rojas-Jiménez, K.; Contreras-Moreira, Bruno; Mahna, S.K.; Prasad, B.N.; Moe, H.; Selvaraju, S.B.; Thierfelder, H.; Werner, D.
2008-01-01

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Multilocus Sequence Analysis for Assessment of the Biogeography and Evolutionary Genetics of Four Bradyrhizobium Species That Nodulate Soybeans on the Asiatic Continent

Vinuesa, Pablo; Rojas-Jiménez, Keilor; Contreras-Moreira, Bruno; Mahna, Suresh K.; Nandan Prasad, Braj; Moe, Hia; Babu Selvaraju, Suresh; Thierfeider, Heidemarie; Werner, Dietrich
2008-11-01

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Metodología de los estudios de asociación genética

Sevilla, Sergio D
2007-09-01

Resumen en español Los estudios de "asociación genética" buscan establecer la relación estadística entre variables genéticas poblacionales y un fenotipo determinado (ejemplo: rasgo, riesgo de enfermedad, etc.). Estos están siendo utilizados para descubrir el componente genético que subyace a las enfermedades comunes de alta prevalencia como la diabetes mellitus (DBT), la enfermedad coronaria o la insuficiencia cardíaca. Se trata generalmente de estudios de cohortes prospectivas o de (mas) tipo casos-controles en los cuales se establece el peso relativo del componente genómico con respecto a otros factores como el ambiente, en el riesgo de desarrollar la enfermedad. Habitualmente, se utilizan como marcadores genéticos a los polimorfismos simples puntuales (SNPs). Estas variaciones pueden ser en sí mismas funcionales y estar relacionadas a la fisiopatología de la enfermedad, pero en la mayoría de los casos, son utilizadas para el mapeo y ubicación de los verdaderos sitios relevantes. Los dos acercamientos posibles son el del "gen candidato" cuando existe evidencia previa de funcionalidad de la variante, o el de la "asociación indirecta". Actualmente, la técnica de asociación genómica amplia (wide genome association) está siendo utilizada para la realización de un screening del genoma completo con el fin de establecer posibles sitios de asociación. Estos estudios se articulan en forma horizontal con estudios de modelos genómicos animales (ratones). Las posiciones posiblemente relacionadas pueden describirse inicialmente en estudios de mapeo genético en ratones u otras especies y luego ser explorados a través de estudios de asociación en humanos. O pueden haber sido descubiertos en estudios de linkage disequilibrium en familias de pacientes y luego comprobar la hipótesis fisiopatológica en una cepa de ratón transgénico para dicho gen. Resumen en inglés Genomic association studies pursue to establish the statistical association between population genetic variants and a determined phenotype (i.e. a trait, the risk of disease, etc). These studies have been used to discover the genetic component of high prevalence diseases such diabetes, coronary hearth disease or cardiac failure. They are most commonly prospective cohort studies or case-control studies where the relative weight of genomic component, respect to other factor (mas) s such the environment in the risk of developing a disease, is established. Commonly, single nucleotide polymorphisms (SNPs) are used as genetic markers. These variations can be functional and related to the physiopathology of the disease. However, in most of the cases, they are utilized as proxy markers for the mapping of the actual relevant genetic variant. The two possible approaches are "candidate gene", when a previous evidence of functionality exist for the variant, and "indirect association" Currently, "wide genome association" technique is being used to screen the whole genome for possible sites of association. These type of studies articulate horizontally with animal genomic models studies (mice). Possibly related positions described in mice (or other species) genetic mapping studies could later be explored in human association trials. Or, on the other hand, discoveries done in linkage disequilibrium studies ( in families of patients) could later be tested for physiopathological hypothesis in mice strains transgenic for that particular gene.

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27

Mecanismos de construcción-destrucción de patrones macroestructurales en microclimas como sistemas complejos

Sánchez-Muñoz, L.; Rover, O.; Sanz Lázaro, Jesús; García Guinea, Javier
2006-09-01

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Marker-trait association for disease resistance in the Spanish barley core collection

Casas Cendoya, Ana María; Kopahnke, D.; Schweizer, G.; Gracia Gimeno, María Pilar; Lasa Dolhagaray, José Manuel; Ciudad, F. J.; Codesal, P.; Moralejo, M. A.; Molina-Cano, J. L.; Igartua Arregui, Ernesto; Ordon, Frank
2008-01-01

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Mapping major genes and quantitative trait loci controlling agronomic traits in almond

Sánchez-Pérez, Raquel; Howad, W.; Dicenta, Federico; Martínez-Gómez, Pedro
2007-02-21

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30

Mapeo genético y análisis de QTL para carotenos en una población s1 de yuca/ Genetic mapping and QTL analysis for carotenes in a s1 population of cassava

Marín Colorado, Jaime Alberto; Ramírez, Hernando; Fregene, Martin
2009-01-01

Resumen en español La población S1 de la variedad tailandesa de yuca MTAi8 (AM320), la cual presenta patrones de segregación definidos para el contenido de carotenos totales (Beta-caroteno), se sometió a un análisis de agrupamiento segregante (BSA = Bulk Segregant Analysis) empleando 700 marcadores moleculares tipo microsatélites o SSR. Se generaron 25 grupos de ligamiento identificando 3 QTL mayores asociados con una región del genoma de yuca con el contenido de carotenos totales. Tr (mas) es marcadores SSR explicaron el 37.2% (NS109), 32% (rSSRY251) y 27.7% (rSSRY313) de la varianza fenotipica total, situados en el grupo de ligamiento D fuertemente asociados con el contenido de carotenos totales en la familia AM320 S1, se estableció una fuerte correlación positiva entre color de pulpa de raíz y contenido de carotenos totales (r=0.81), y negativa entre carotenos totales y materia seca (r= -0.31). Los tres posibles QTL presentaron efecto positivo y de carácter aditivo para el contenido de carotenos totales, pueden ser la oportunidad para implementar selección asistida por marcadores para carotenos totales en yuca. Resumen en inglés The S1 population of the Thai variety MTAi8 (AM320), which shows patterns of segregation defined by the content of total carotenes (beta-carotene), underwent an analysis of segregating bulk (BSA = Bulk segregating Analysis) using 700 molecular markers type microsatellites or SSR. There were generated 25 tying groups and identifying 3 major QTLs associated with a region of the genome of cassava with the content of total carotenes. Three markers SSR; explained the 37.2% (NS (mas) 109), 32% (rSSRY251) and 27.7% (rSSRY313) of the total phenotypic variance, placed in the Group D strongly tying, associated with the content of total carotenes in the family AM320 S1, which established a strong positive correlation between color and content root pulp carotenes total (r = 0.81), and between negative and carotenes total dry matter (r = -0.31). The three possible QTLs showed positive and additive effect for the content of totals carotenes and could be an opportunity to implement assisted selection markers for total carotenes in cassava.

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Mapeo de loci de caracteres cuantitativos (QTL) usando un enfoque multivariado/ Mapping quantitative trait loci (QTLs) using a multivariate approach

Mora, Freddy; Santos, Alexandra I; Scapim, Carlos A
2008-08-01

Resumen en español Los procedimientos usados en el mapeo de loci de característica cuantitativa (QTL) son continuamente estudiados ya que son fundamentales para mejorar la precisión del análisis genético. El presente estudio tuvo como objetivo examinar QTLs a través de métodos muí ti variados, considerando el principio de mapeo por intervalo simple. Se simuló un conjunto de datos de marcadores moleculares microsatélites provenientes de una población F2. Al mismo tiempo se consider (mas) ó que los QTLs controlan características de distribución normal y binomial. En el caso normal se consideraron cinco modelos con las siguientes estructuras de covarianzas residuales: Componentes de varianza (VC), simetría compuesta (CS), no estructurada (UN), diagonal principal (Banded Main Diagonal; UNÍ) y toeplitz heterogénea (TOEPH). El criterio de información de Akaike (AIC) se usó para seleccionar la estructura apropiada. En el caso binomial se usó el procedimiento de ecuaciones generalizadas (GEE). La estructura tipo UN minimizó el valor de AIC dentro del intervalo de mayor probabilidad de presencia del QTL. En el caso binario, una matriz de correlación dependiente fue la más adecuada (p = 0,47). En ambos casos el efecto aditivo del QTL fue altamente significativo (p 0,05). Según los resultados obtenidos, se concluyó que el mapeo de QTLs usando un enfoque multivariado es una herramienta útil para los programas genéticos que buscan mejorar características cuantitativas cuyos valores fenotípicos cambian en el tiempo Resumen en inglés Statistical procedures for mapping quantitative trait loci (QTL) have been extensively studied because they are the essential for improving the accuracy of genetic analyses. The objective of the present study was to examine QTL using multivariate methods, considering the principie of simple interval mapping. A microsatellite marker data set from a F2 population was simulated. It was assumed that the QTL control binomial and normal traits. In the normal case, five QTL mapp (mas) ing models were evaluated that had the following residual covariance structures: variance components (VC), compound symmetry (CS), unstructured (UN), banded main diagonal (UNÍ) and heterogeneous toeplitz. Akaike's information criterion (AIC) was used to select the appropriate structure. In the binary case, the Generalized Estimating Equations (GEE) procedure was used. UN structure minimized the AIC valué on the interval that indicated a higher probability of the QTL. In the binomial case, a non-independent working correlation matrix (WCM) was fitted (p = 0.47). In both cases, the additive effect of QTL was significant (p 0.05). Thus, QTL mapping using a multivariate approach may be a useful tool for breeding programs that aim to improve quantitative traits that have phenotypic valúes that change over time

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Mapeo Genético mediante desequilibrio de ligamiento por mezcla y su aplicación en enfermedades complejas/ Genetic mapping by means of ligament unbalance by mix and its application in complex diseases

Vergara, Candelaria; Martínez Alfaro, Beatriz Mercedes
2008-06-01

Resumen en español La identificación de los genes implicados en enfermedades complejas es uno de los grandes desafíos en el campo de la genética humana. Dentro de las estrategias utilizadas para tal fin están los estudios de ligamiento en familias y los estudios de asociación poblacional usando casos y controles. Sin embargo, una alternativa propuesta en los últimos años es el método de mapeo genético por desequilibrio de ligamiento por mezcla, también denominado "Admixture Mappin (mas) g" (AM). Es una estrategia que metodológicamente se ubica entre los estudios de ligamiento en familias y los rastreos genómicos para asociación y que es aplicable a poblaciones genéticamente mezcladas Resumen en inglés Characterization of gens involved in complex diseases is one of greatest challenges in field of human genetics. Included in the more used strategies to this objective are studies of ligament in families, and studies of population association, using cases and controls. However, in pas years an alternative proposal is the genetic mapping method by unbalance of ligament by mix, also called "Admixture Mapping" (AM). It is an strategy that methodologically is placed among liga (mas) ment studies in families and the genomic searching for association, and it is applicable in populations presenting with genetic mixture

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MELOGEN: an EST database for melon functional genomics

González-Ibeas, Daniel; Blanca, José M.; Roig, Cristina; González-To, Mireia; Picó-Silvent, Belén; Truniger, Verónica; Gómez, Pedro; Deleu, Wim; Caño-Delgado, Ana; Arús, Pere; Nuez, Fernando; Garcia-Mas, Jordi; Puigdomènech, Pere; Aranda, Miguel A.
2007-09-03

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Lithogeochemical exploration in a Hercynian Tin-Bearing Batholith in the Northwest of the Iberian Peninsula

Fernandez-Turiel, J. L.; Hernández Chiva, E.; Durán Barrachina, M. E.; Querol, Xavier
1990-01-01

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La citogenética molecular y su aplicación en el estudio de los genomas vegetales/ Molecular cytogenetics in plant genome analysis

Herrera, Juan Carlos
2007-06-01

Resumen en español La citogenética es la disciplina que estudia las implicaciones genéticas de la estructura y el comportamiento de los cromosomas. Durante las últimas dos décadas los estudios citogenéticos avanzaron gracias a la información generada por métodos clásicos, los cuales permitieron establecer los primeros modelos citogenéticos en especies como tomate, trigo y arroz. Al final del siglo pasado los estudios citogenéticos mostraron un avance significativo gracias a la imp (mas) lementación de nuevas técnicas destinadas al análisis de cromosomas, tanto mitóticos como meióticos, entre las cuales se destacan el bandeo de cromosomas y la hibridación in situ sobre cromosomas. Actualmente, la mayoría de las técnicas de citogénetica molecular se basan en la tecnología de la hibridación in situ fluorescente o FISH (fluorescent in situ hybridization). Esta tecnología abrió la posibilidad de estudiar regiones específicas de la cromatina directamente sobre los cromosomas, gracias a la información derivada de la secuencia misma del ADN, y no solamente por simples características morfológicas. Como consecuencia, la citogenética molecular ha adquirido una importancia cada vez mayor en los diferentes proyectos de mapeo genético que se adelantan actualmente. En la presente revisión se hace una descripción breve de la progresión que han tenido las técnicas de citogenética, desde la llamada 'citogenética clásica' hasta las técnicas actuales de alta resolución. Esta descripción histórica es seguida de varios ejemplos concretos que ilustran la utilización de la FISH, no sólo en el mejoramiento genético de los cultivos, sino también en el estudio estructural y funcional de los genomas vegetales. Resumen en inglés Cytogenetics would be defined as a discipline concerned with the genetic implications of chromosome structure and behavior. During past twenty years cytogenetics studies were carried out due to the information derived from classical methods based on chromosome deletions and translocations. As a result of such studies, the first cytogenetic models in such species as tomato, wheat, and rice were created. Significant advances in most plant cytogenetic systems have occurred i (mas) n the last quarter of the 20 century with the introduction of chromosome banding, in situ hybridization, and other techniques for the analysis of somatic and meiotic chromosomes. Most of current cytogenetic protocols are based on the fluorescent in situ hybridization (FISH) technology. This DNA:DNA in situ method had opened a possibility to address chromatin regions of individual chromosomes on the basis of DNA sequence information in addition of mere morphological features. With genome mapping projects underway sequencing chromosomes and genomes, cytogenetic research had become more relevant. In this review, a historical perspective of chromosome research during the last 80 years is presented. It shows the progression of the 'classical cytogenetics' up to current 'molecular cytogenetics' founded on high resolution techniques such as FISH. The diversity of applications is illustrated through some practical examples of valuable current utilization of FISH-based methodologies in plant breeding programs, as well as in structural and functional genomics.

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Implications of a RAD54L polymorphism (2290C/T) in human meningiomas as a risk factor and/or a genetic marker

Leone, Paola E; Mendiola, Marta; Alonso, Javier; Paz-y-Miño, César; Pestaña, Ángel
2003-03-04

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Identification of quantitative trait loci for resistance to powdery mildew in a Spanish barley landrace

Silvar, Cristina; Dhif, Hichem; Igartua Arregui, Ernesto; Kopah, Doris; Gracia Gimeno, Pilar; Lasa Dolhagaray, José Manuel; Ordon, Frank; Casas Cendoya, Ana María
2010-04-01

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Identificación de distintos loci de susceptibilidad relacionados al desarrollo de diabetes de inicio temprano y enfermedad cardiovascular en familias mexicanas/ Identifying different susceptibility loci associated with early onset diabetes and cardiovascular disease in mexican families

Canizales-Quinteros, Samuel; Huertas-Vázquez, Adriana; Riba-Ramírez, Laura; Monroy-Guzmán, Adriana; Domínguez-López, Aarón; Romero-Hidalgo, Sandra; Aguilar-Salinas, Carlos; Rodríguez-Torres, Maribel; Ramírez-Jiménez, Salvador; Tusié-Luna, María Teresa
2005-04-01

Resumen en español La enfermedad arterial coronaria y la diabetes mellitus figuran entre las primeras causas de mortalidad y morbilidad en México. Factores genéticos juegan un papel fundamental en el desarrollo de estas entidades. A partir del reconocimiento y estudio de familias con formas monogénicas de diabetes y distintas dislipidemias asociadas al desarrollo de ateroesclerosis, se han identificado en los últimos años distintos genes y loci relacionados con estos padecimientos a tr (mas) avés de estudios de mapeo genético. Estos estudios han evidenciado la heterogeneidad genética que existe en cuanto al tipo de genes involucrados en los distintos grupos étnicos. El estudio de familias mexicanas con diabetes de inicio temprano e hiperlipidemia familiar combinada mostró la participación de distintos loci génicos asociados a estas entidades en la población mexicana. Esto muestra la utilidad de las estrategias de mapeo para la identificación del componente genético de estas entidades en nuestra población. Resumen en inglés Coronary artery disease and diabetes mellitus are among the primary mortality and morbidity causes in Mexico. Genetic factors play a fundamental role in the development of these entities. In the past few years due to the recognition and study of families with monogenic forms of diabetes and dislipidemias associated with development of atherosclerosis, several genes and loci have been associated with these conditions through genetic linkage studies. These studies have prov (mas) ided evidence of the genetic heterogeneity that exists and the type of genes involved in different ethnic groups. The study of Mexican families with early onset diabetes and combined familial hyperlipidemia showed the participation of different genetic loci associated with these conditions in the Mexican population. These findings show the value of gene mapping strategies in the identification of the genetic component in these entities in our population.

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Identificación de cultivares de arroz con alta capacidad de ajuste osmótico para el mejoramiento genético de la tolerancia a la sequía/ Identification of rice cultivars with high osmotic adjustment capacity for the genetic improvement of drought tolerance

Ghneim-Herrera, Thaura; Rosales, Arnaldo; Marwan Aguilar; Pieters, Alejandro J; Pérez Almeida, Iris; Torrealba, Gelis
2006-12-01

Resumen en español Su disección genética, mediante la identificación de loci de caracteres cuantitativos (QTLs), es parte de la estrategia para el mejoramiento genético de la tolerancia a la sequía en accesiones del germoplasma nacional. Como primer paso dentro de esta estrategia de caracterizar la capacidad de ajuste osmótico (AO) en 7 cultivares de arroz de riego (‘Araure 4’, ‘Araure 50’, ‘Cimarrón’, ‘Fonaiap 1’, ‘Fonaiap 2000’, ‘Línea 17’ y ‘Venezuela 21’) sometidos (mas) a déficit hídrico bajo condiciones de invernadero. El grado de ao varió significativamente entre los cultivares estudiados en el rango 0,08-0,5 MPa. ‘Fonaiap 2000’ mostró la mayor capacidad de AO con valores ~0,5 MPa; esto estuvo asociado a la acumulación de carbohidratos bajo condiciones de sequía. Los síntomas de estrés hídrico (enrollamiento foliar) aparecieron más tardíamente en ‘Fonaiap 2000’ que en el resto de los cultivares y a potenciales hídricos más negativos (ψh ~ -3,1 MPa), lo cual evidencia la efectividad del AO para el mantenimiento de un estatus hídrico favorable. Los valores de AO medidos son similares al de otras variedades de arroz utilizadas en la actualidad para el mapeo de QTLs asociados a esta característica, lo cual hace de ‘Fonaiap 2000’ una candidata para el desarrollo de poblaciones de mapeo, y una fuente potencial para el mejoramiento de esta característica dentro del germoplasma nacional. Resumen en inglés Its genetic dissection, through the identification of quantitative trait loci (QTLs) is an important component of the strategy for the genetic improvement of drought tolerance in local rice cultivars. As a first step within this strategy, we measured the capacity of osmotic adjustment (OA) in 8 local rice varieties (‘Araure 4’, ‘Araure 50’, ‘Cimarrón’, ‘Línea 17’, ‘Fonaiap 1’, ‘Fonaiap 2000’ and ‘Venezuela 21’) subjected to water deficit (drought) under gl (mas) asshouse conditions. The OA values varied between 0.08 0.6 MPa. ‘Fonaiap 2000’ showed the highest capacity for OA with values ca. 0.5 MPa. In this cultivar, OA was associated with the accumulation of carbohydrates under drought stress. Drought stress symptoms (leaf rolling) appeared later and at more negatives leaf water potemtials (ψh ~ -3.1 MPa) in ‘Fonaiap 2000’ than in the rest of the cultivars studied, indicating that OA is an effective mechanism for maintaining a favorable water status. The values of OA measured in this study are similar to those reported for other cultivars used for mapping QTLs associated to this trait. Thus, ‘Fonaiap 2000’ appears as a good candidate for developing mapping populations for QTL identification and as a potential donor for the improvement of osmotic adjustment capacity in our rice germplasm.

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41

HvFT1 (VrnH3) drives latitudinal adaptation in Spanish barleys

Casas Cendoya, Ana María; Djemel, Abderrahmane; Ciudad, Francisco J.; Yahiaoui, Samia; Ponce, Luis J.; Contreras-Moreira, Bruno; Gracia Gimeno, María Pilar; Lasa Dolhagaray, José Manuel; Igartua Arregui, Ernesto
2011-05-01

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42

High throughput SNP discovery and genotyping in grapevine (Vitis vinifera L.) by combining a re-sequencing approach and SNPlex technology

Lijavetzky, Diego; Cabezas, José A.; Ibáñez, Ana; Rodríguez, Virginia; Martínez-Zapater, José M.
2007-11-19

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43

Genomic organization, chromosomal localization, alternative splicing,and isoforms of the human synaptosome-associated protein-23 gene implicated in vesicle-membrane fusion processes

Lazo, Pedro A.; Nadal, Marga; Ferrer, Milagros; Area, Estela; Hernández-Torres, Javier; Nabokina, S. M.; Mollinedo, Faustino; Estivill, Xavier
2001-03-06

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44

Genomic characterization of putative allergen genes in peach/almond and their synteny with apple

Chen, Lin; Zhang, Shuiming; Illa, Eudald; Song, Lijuan; Wu, Shandong; Howad, Werner; Arús, Pere; Van de Weg, Eric; Chen, Kunsong; Gao, Zhongshan
2008-11-17

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45

Genomic analysis of the aromatic catabolic pathways from Pseudomonas putida KT2440

Jiménez, José I.; Miñambres Rodríguez, Baltasar; García, José L.; Díaz, Eduardo
2002-01-01

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46

Genome-wide association mapping in barley

Yahiaoui, Samia; Casas Cendoya, Ana María; Moralejo, M. A.; Medina del Río, Blanca; Gracia Gimeno, María Pilar; Ciudad, F. J.; Codesal, P.; Molina-Cano, J. L.; Lasa Dolhagaray, José Manuel; Igartua Arregui, Ernesto
2008-01-01

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47

Genome-Wide Identification of Transcription Start Sites, Promoters and Transcription Factor Binding Sites in E. coli

Mendoza-Vargas, A.; Olvera, L.; Olvera, M.; Grande, R.; Vega-Alvarado, L.; Taboada, B.; Jiménez-Jacinto, V.; Salgado, H.; Juárez, K.; Contreras-Moreira, Bruno; Huerta, A. M.; Collado-Vides, J.; Morett, E.
2009-10-19

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Genetic variation, population structure and linkage disequilibrium in peach commercial varieties

Aranzana, Maria José; Abbassi, Kadri El-; Howad, Werner; Arús, Pere
2010-07-20

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49

Genetic variation at bx1 controls DIMBOA content in maize

Butrón Gómez, Ana María; Chen, Y.C.; Rottinghaus, G.E.; McMullen, Michael D.
2010-02-01

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50

Genetic markers for doubled haploid response in barley

Chen, Xi-Wen; Cistué Sola, Luis; Muñoz-Amatriaín, María; Sanz, Miguel; Romagosa, Ignacio; Castillo Alonso, Ana María; Vallés Brau, María Pilar
2007-12-01

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Genetic control of pre-heading phases and other traits related to development in a double-haploid barley (Hordeum vulgare L.) population

Borràs-Gelonch, Gisela; Slafera, Gustavo A.; Casas Cendoya, Ana María; van Eeuwijkd, Fred; Romagosa, Ignacio
2010-10-01

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52

Generation of a BAC-based physical map of the melon genome

González, Víctor M.; Garcia-Mas, Jordi; Arús, Pere; Puigdomènech, Pere
2010-05-28

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53

Generation of a BAC-based physical map of the melon genome

González, Víctor M.; García-Mas, Jordi; Arús, Pere; Puigdomènech, Pere
2010-05-28

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54

Evaluación de la asociación entre marcadores de microsatélite en 6p22-25 y fisura labiopalatina no sindrómica utilizando el diseño de tríos caso-progenitores en la población chilena/ Evidence for association between microsatellite markers located on 6p22-25 and nonsyndromic cleft lip palate using the case-parents trio design in the Chilean population

Blanco C, Rafael; Suazo S, José; Santos M, José Luis; Carreño Z, Hernán; Paredes A, Mónica; Jara S, Lilian; Eltit G, Felipe
2003-07-01

Resumen en inglés Background: Genetic studies indicate that nonsyndromic cleft lip/palate (NSCLP) has the characteristics of a complex genetic trait. Reports from different authors have suggested several candidate genes mapping in different chromosome regions. Association studies have suggested that a clefting locus is located on chromosome 6p. On these grounds we have investigated the possible association between five microsatellite markers located on 6p22-25 and NSCLP. Aim: To test the h (mas) ypothesis on the possible association of a clefting locus with microsatellite markers located in 6p22-25. Patients and Methods: The sample consisted of 54 unrelated case-parent trios that comprise 54 NSCLP probands and 108 parents. Five microsatellite markers spanning the region 6p22-25 were analyzed for each individual by means of polymerase chain reaction with fluorescent labeled microsatellite markers. Electrophoresis of the PCR products was performed on a laser-fluorescent DNA sequencer. Nonparametric ETDT and MCETDT programs, were used to analyze the genotype data. Results: The family based association study showed that for the genotype wise analysis, only D6S259 presented a significant p-value (0.03). Nevertheless no individual allele of this marker showed an evident preferential transmission from heterozygous parents to affected offspring. Conclusions: The results of the present study do not show a clear evidence that a candidate gene for NSCLP may be located within or near the analyzed chromosome region in our sample. Nevertheless, it must be emphasized that the genotype wise analysis shows a significant p-value for D6S259 marker (Rev Méd Chile 2003; 131: 765-72)

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55

Estudio de la inestabilidad cariotípica de levaduras vínicas

Llagostera Casas, Montserrat; Piña, Bejamín; Carro Puentedura, David
2006-01-01

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56

Entorno genético de CTX-M-2 en aislamientos de Klebsiella pneumoniae provenientes de pacientes hospitalizados en Uruguay/ Genetic environment of CTX-M-2 in Klebsiella pneumoniae isolates from hospitalized patients in Uruguay

Vignoli, R.; Cordeiro, N.; Seija, V.; Schelotto, F.; Radice, M.; Ayala, J.; Power, P.; Gutkind, G.
2006-04-01

Resumen en español Se estudiaron las cepas de Klebsiella pneumoniae K96005 y K13, productoras de la beta-lactamasa de espectro extendido CTX-M-2, aisladas durante 1996 y 2003, respectivamente, de pacientes hospitalizados en Uruguay. Se realizó la caracterización del entorno génico del gen blaCTX-M-2 mediante mapeo por PCR y secuenciación de los amplicones. Los resultados revelan que en ambos aislamientos el gen codificante de dicha enzima se encuentra en un integrón complejo de clase 1 (mas) , asociado a la presencia de orf513. El integrón identificado, cuyo arreglo de genes es aac(6')-Ib, blaOXA-2, orfD, asociados a orf513-blaCTX-M-2, parece estar ampliamente diseminado en la región del Río de la Plata. Resumen en inglés We studied two CTX-M-2-producing Klebsiella pneumoniae clinical strains, K96005 and K13, isolated from hospitalized patients in Uruguay, during 1996 and 2003, respectively. The genomic surroundings of blaCTX-M-2 were characterized by PCR-mapping and DNA sequencing. Our results show that blaCTX-M-2 is included in a complex class-1 integron (InK13), associated with an orf513 in both isolates. The genetic array of the integron, aac(6')-Ib, blaCTX-M-2, orfD (gene cassette reg (mas) ion), associated with an orf513-blaCTX-M-2, seems to be widely disseminated over the Río de la Plata region.

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Entorno genético de CTX-M-2 en aislamientos de Klebsiella pneumoniae provenientes de pacientes hospitalizados en Uruguay

Vignoli, R.; Cordeiro, N.; Seija, V.; Schelotto, F.; Radice, M.; Ayala, Juan Alfonso; Power, P.; Gutkind, Gabriel
2006-04-01

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59

Drosophila as a model system for genetic and genomic research

Molnar, Cristina; Cruz, Cristina; Terriente, Ana; de Celis, Jose F.
2006-01-01

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60

Differential expression of genes mapping to recurrently abnormal chromosomal regions characterize neuroblastic tumours with distinct ploidy status

Lavarino, Cinzia; Garcia, Idoia; Mackintosh, Carlos; Cheung, Nai-Kong V.; Domenech, Gema; Ríos, José; Perez, Noelia; Rodríguez, Eva; Torres, Carmen de; Gerald, William L.; Tuset, Esperanza; Acosta, Sandra; Beleta, Helena; Álava, Enrique de; Mora, Jaume
2008-08-13

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61

Development and bin mapping of a Rosaceae Conserved Ortholog Set (COS) of markers

Cabrera, Antonio; Kozik, Alex; Howad, Werner; Arús, Pere; Iezzoni, Amy F.; Knaap, Esther van der
2009-11-01

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62

Deletion at ITPR1 Underlies Ataxia in Mice and Spinocerebellar Ataxia 15 in Humans

van de Leemput, Joyce; Chandran, Jayanth; Knight, Melanie A.; Holtzclaw, Lynne A.; Scholz, Sonja; Cookson, Mark R.; Houlden, Henry; Gwinn-Hardy, Katrina; Fung, Hon-Chung; Lin, Xian; Hernández, Dena; Simón-Sánchez, Javier; Wood, Nick W.; Giunti, Paola; Rafferty, Ian; Hardy, John; Storey, Elsdon; McKinlay Gardner, R. J.; Forrest, Susan M.; Fisher, Elizabeth M. C.; Russell, James T.; Cai, Huaibin; Singleton, Andrew B.
2007-06-22

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64

Construction and application for QTL analysis of a Restriction Site Associated DNA (RAD) linkage map in barley

Chutimanitsakun, Yada; Nipper, Rick W.; Cuesta-Marcos, Alfonso; Cistué Sola, Luis; Corey, Ann; Filichkina, Tanya; Johnson, Eric A.; Hayes, Patrick M.
2011-01-01

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65

Comparison of translation loads for standard and alternative genetic codes

Sammet, Stefanie Gabriele; Bastolla, Ugo; Porto, Markus
2010-06-14

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68

Chilling injury susceptibility in an intra-specific peach [Prunus persica (L.) Batsch] progeny

Cantín Mardones, Celia M.; Crisosto, C. H.; Ogundiwin, E. A.; Gradziel, T.; Torrente, J.; Moreno Sánchez, María Ángeles; Gogorcena Aoiz, Yolanda
2010-11-01

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69

Binding of microtubule-associated protein 1B to LIS1 affects the interaction between dynein and LIS1

Jiménez-Mateos, Eva María; Wandosell Jurado, Francisco; Reiner, Orly; Avila, Jesús; González-Billault, Christian
2005-03-11

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70

Application of recent biotechnologies to prunus tree crop genetic improvement

Martínez-Gómez, Pedro; Sánchez-Pérez, Raquel; Rubio, Manuel; Dicenta, Federico
2005-08-01

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71

Application of amplified fragment length polymorphism (AFLPs) analysis to plant breeding and genetics: Procedures, applications and prospects

Sorkheh, Karim; Shiran, Behrouz; Aranzana, Maria José; Mohammadi, S. A.; Martínez-Gómez, Pedro
2007-01-01

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Análisis de la estructura genética en una muestra poblacional de Bucaramanga, departamento de Santander/ An assessment of genetic structure in a Bucaramanga, department of Santander, population sample

Hincapié, Martha Lucía; Gil, Adriana María; Pico, Adriana Lucía; Gusmão, Leonor; Rondón, Fernando; Vargas, Clara Inés; Castillo, Adriana
2009-12-01

Resumen en español Introducción: El fenómeno de sub-estructura en las poblaciones ha tenido desde hace varios años un abordaje amplio, que se enfocó, entre otros, en la identificación y cuantificación de la mezcla étnica presente en estudios de mapeo asociativo, para comprobar la asociación de marcadores polimórficos en el desarrollo de enfermedades comunes complejas, como responsable de falsos positivos. No obstante el reconocimiento de este problema, no se tiene suficiente inform (mas) ación genética en el contexto nacional ni local que permita determinar la posible diferenciación de subgrupos poblacionales en cada región en particular. Objetivo: Determinar la estructura genética en una muestra poblacional de la ciudad de Bucaramanga, a partir del análisis de 19 marcadores microsatélites autosómicos en distintos subgrupos poblacionales. Metodología: De la base de datos del Laboratorio de Genética Humana de la Universidad Industrial de Santander, se seleccionaron aleatoriamente 350 muestras de ADN, y se amplificaron 19 marcadores autosómicos Short Tandem Repeat mediante los «kits Powerplex®16 y FFFL (Promega)». Resultados: En el análisis de equilibrio Hardy Weinberg, no se obtuvieron diferencias estadísticamente significativas en 18 de 19 marcadores Short Tandem Repeat autosómicos analizados en la población de Bucaramanga. El único marcador que mostró no estar en equilibrio Hardy Weinberg en la población de Bucaramanga fue el F13B (valor de significancia de p=0.00264, después de aplicar la corrección de Bonferroni). Discusión: Las poblaciones representadas en los seis estratos socioeconómicos mostraron alta diversidad genética intragrupos, que ratificó una alta variabilidad entre los individuos de la ciudad de Bucaramanga, acorde con el bajo valor de F STentre distintos grupos, determinado en el análisis molecular de varianza con base en frecuencias alélicas observadas para los 19 Short Tandem Repeat analizados. Conclusión: La alta diversidad genética y el análisis molecular de varianza mostraron una baja diferenciación entre los seis estratos socioeconómicos en la ciudad de Bucaramanga, y evidenciaron a la población como una misma unidad genética, no sub-estructurada. Resumen en inglés Introduction: The phenomenon of substructure in the populations has been greatly analyzed for several years, and it has been focused especially on the identification and quantification of ethnic mixture present in studies of associative mapping to verify the association of polymorphic markers in the development of complex and common diseases responsible for false positives. Nevertheless, despite the recognition of this issue, there is insufficient genetic information with (mas) in the national or local contexts that allow assessing the possible differentiation of population sub-groups in each particular region. Objective: To determine the genetic structure in the city of Bucaramanga through the analysis of 19 autosomal microsatellite markers in different subgroups of the population. Methodology: A total of 350 DNA samples were randomly selected from the database of the Human Genetic Laboratory at Universidad Industrial de Santander by using Epi Info version 6.04 2001. Also, 19 Short Tandem Repeat markers were amplified using «kits Powerplex® 16 and FFFL (Promega)». Results: In the Hardy Weinberg equilibrium analysis (100 steps in Markov chain and 1000 dememorization steps), no statistically significant differences in 18 out of the 19 analyzed STRs markers in the population of Bucaramanga were obtained. A unique marker that proved not present in HWE in the population of Bucaramanga was the F13B (for a significance value of p=0.00264, after applying the Bonferroni correction). Discussion: The populations represented in the six socioeconomic levels presented high genetic diversity intragroups, which ratified the high variability among the individuals in this city according to the low value of FST for different groups, determined via the molecular analysis of variance based on the allelic frequencies observed for the 19 analyzed Short Tandem Repeats. Conclusions: The high genetic diversity, as well as the analysis of molecular variance displayed low divergence for each of the six socioeconomic levels in the city of Bucaramanga. Therefore, it is suggested that this population is an equivalent genetic unit and not substructured.

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74

ABCA1 polymorphisms and Alzheimer´s disease

Wavrant-De Vrièze, Fabienne; Compton, Danielle; Womick, Meridith; Arepalli, Sampath; Adighibe, Omanma; Li, Ling; Pérez-Tur, Jordi; Hardy, John
2007-02-07

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75

A set of EST-SNPs for map saturation and cultivar identification in melon

Deleu, Wim; Esteras, Cristina; Roig, Cristina; González-To, Mireia; Fernández Silva, Iria; González-Ibeas, Daniel; Blanca, José M.; Aranda, Miguel A.; Arús, Pere; Nuez, Fernando; Monforte, Antonio J.; Picó-Silvent, Belén; Garcia-Mas, Jordi
2009-07-15

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A microsatellite genetic map of the turbot (Scophthalmus maximus)

Bouza, Carmen; Hermida, Miguel; Pardo, Belén G.; Fernández, Carlos; Fortes, Gloria G.; Castro, Jaime; Sánchez, Laura; Presa, Pablo; Pérez, Montse; Sanjuán, Andrés; Carlos, Alejandro de; Álvarez-Dios, José Antonio; Ezcurra, Susana; Cal, Rosa M.; Piferrer, Francesc; Martínez, Paulino
2007-12-01

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77

A genetic map of Welschriesling × Sirius for the identification of magnesium-deficiency by QTL analysis

Mandl, Karin; Santiago Blanco, José Luis; Hack, Robert; Fardossi, Adel; Regner, Ferdinand
2006-06-02

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Genética y biología molecular de las cardiopatías congénitas y adquiridas/ Genetics and molecular biology of the congenital, and acquired heart disease

Cruz Robles, David; de la Peña Díaz, Aurora; Arce Fonseca, Minerva; García Trejo, José de Jesús; Pérez Méndez, Óscar A; Vargas Alarcón, Gilberto
2005-12-01

Resumen en español El corazón es el primer órgano que se forma y funciona en el embrión, de tal suerte que todos los eventos subsecuentes en la vida del organismo dependen de la habilidad de este órgano para atender las demandas de oxígeno y nutrientes que éste requiere. Las anormalidades en la formación del corazón, la forma más común de defectos humanos al nacimiento, afecta al 1 % de los nacidos vivos, y su frecuencia en abortos espontáneos se eleva diez veces más. La patofis (mas) iología de este tipo de malformaciones congénitas se ha venido enriqueciendo en los últimos años con el conocimiento del Proyecto Genoma Humano; debido al gran avance que se ha producido en el conocimiento genético y molecular de los diferentes genes y cromosomas que suelen ser afectados y muchas veces heredados para producir una enfermedad congénita en general. Esta revisión trata de enfocar su atención sobre la información extraída de los análisis genéticos y moleculares en el diagnóstico, tratamiento y entendimiento de la patogénesis de las enfermedades cardiovasculares pediátricas, dirigidas tanto por los más comunes defectos cardíacos congénitos o heredados, como por los desórdenes esporádicos o adquiridos. Resumen en inglés The heart is the first organ to form and function in the embryo, and all subsequent events in the life of the organism depend on the heart's ability to match its output with the organism's demands for oxygen and nutrients. Abnormalities in heart formation, the most common form of human birth defects, afflict nearly 1% of newborns, and their frequency in spontaneously aborted pregnancies is estimated to be tenfold higher. With the completion of the sequencing of the human (mas) genome, molecular genetic efforts directed at finding genes for monogenic traits have accelerated dramatically. Breakthroughs in molecular genetic technology have just begun to be applied in pediatric cardiology stemming from the use of chromosomal mapping and the identification of genes involved in both the primary etiology and as significant risk factors in the development of cardiac and vascular abnormalities. This review will focus on information provided by molecular and genetic analysis in the diagnosis, treatment and overall heart disorders.

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Genética de la preeclampsia: una aproximación a los estudios de ligamiento genético/ Genetics of preeclampsia: an approach to genetic linkage studies

Zuluaga, Nora Alejandra; Cuartas, Jorge Mauricio; Londoño, Juan Guillermo
2004-06-01

Resumen en español La preeclampsia es considerada un problema de salud pública debido a su alta prevalencia. Muchas investigaciones coinciden en que su origen se relaciona con la interacción entre factores genéticos y ambientales. Por esta razón, múltiples estudios han explorado tales factores genéticos tratando de identificar regiones cromosómicas y genes candidatos cuyas variantes se relacionen con una mayor susceptibilidad a la enfermedad. Diversos estudios de asociación han iden (mas) tificado algunos genes de susceptibilidad a la preeclampsia, pero los resultados no se han replicado consistentemente en todas las poblaciones, quizá por su complejidad clínica y genética. El levantamiento de mapas de genes y regiones cromosómicas basado en análisis de ligamiento ha mostrado resultados interesantes con algunos marcadores en los cromosomas 2 y 4. En este sentido, hay muchas expectativas con respecto a los genes localizados en tales regiones candidatas, debido a que la identificación de los factores de riesgo genético podría ayudar al entendimiento de esta condición y en proveer claves para su prevención y tratamiento. Resumen en inglés Due to its high prevalence during pregnancies, preeclampsia is considered an important public health problem. Many investigators agree in that its expression is related to the interaction between genetic and environmental factors. Many studies have searched for genetic factors, attempting to identify chromosomal regions or candidate genes whose variants may be related to high preeclampsia susceptibility. Several studies have associated a number of susceptibility genes to (mas) preeclampsia, but the results have not been replicated consistently in all populations. Mapping of genes and chromosomal regions by linkage analysis has located potential markers on chromosomes 2 and 4. Identification of the genes located in these candidate regions will pinpoint the genetic risk factors, will lead to a better understanding of the syndrome, and will provide clues for its prevention and treatment.

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