Sample records for DFA (dfa)
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Desempeño de la prueba de inmunofluorescencia directa en el diagnóstico del virus Influenza A(H1N1)/ Direct immunofluorescence assay performance in diagnosis of the Influenza A(H1N1) virus

Pianciola, Luis; González, Gladys; Mazzeo, Melina; Navello, Mariano; Quidel, Natalia; Bulgheroni, María Fernanda
2010-06-01

Resumen en español El 25 de abril de 2009, a menos de un mes de la detección en México del primer humano con virus Influenza A(H1N1), la enfermedad ya se había propagado a más de 40 países superando los 10 000 casos notificados. Dada su naturaleza impredecible, este tipo de virus requiere métodos diagnósticos apropiados, confiables y seguros, pero que también estén al alcance de los laboratorios clínicos. Mediante el estudio de 291 muestras de pacientes con sospecha de infección (mas) por virus Influenza A(H1N1) en Neuquén, Argentina, el presente trabajo compara los dos métodos de diagnóstico utilizados simultáneamente: la prueba de inmunofluorescencia directa (DFA) y la de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (RT-PCR). La DFA dio una sensibilidad de 44,4%, especificidad de 99,6%, valor predictivo positivo de 95,2% y valor predictivo negativo de 90,7%. Los resultados positivos de la metodología pueden considerarse verdaderos positivos. Un resultado negativo no excluye la presencia del virus y la muestra debe examinarse mediante RT-PCR. Del total de 291 muestras, 45 resultaron positivas por RT-PCR y 21 por DFA. Resumen en inglés By 25 April 2009, less than one month after the first human with Influenza A(H1N1) virus was detected in Mexico, the disease had already spread to more than 40 countries, with over 10 000 cases reported. Due to its unpredictability, this type of virus requires appropriate, reliable, and safe diagnostic methods that are also accessible to clinical laboratories. Through the analysis of 291 samples taken from patients with suspected Influenza A(H1N1) virus infection in Neuqu (mas) én, Argentina, this study compares the two diagnostic methods used simultaneously: direct immunofluorescence assay (DFA) and real-time polymerase chain reaction (RT-PCR). DFA had a sensitivity of 44.4%, a specificity of 99.6%, a positive predictive value of 95.2%, and a negative predictive value of 90.7%. Positive results obtained with this method can be considered true positives. A negative result does not rule out the presence of the virus. In this case, the sample should be examined by RT-PCR. Out of a total of 291 samples, there were 45 positive results with RT-PCR and 21 positive results with DFA.

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Conclusiones Fisiológicas y Estimadores Fractales/ Physiological conclusions and fractal estimators

Torres, María Eugenia; Schlotthauer, Gastón
2007-05-01

Resumen en español En este trabajo comparamos tres métodos diferentes utilizados para estimar el exponente de Hurst, y analizamos su eficiencia cuando son aplicados a series de datos de diferentes longitudes. Se analizan series temporales de fBm sintetizada pura y con tendencias sinusoidales superpuestas. Mostraremos que los tres métodos aquí discutidos, DFA, basado en wavelets y de variaciones discretas, no sólo son altamente dependientes de la longitud de la señal, sino también del (mas) orden o número de los momentos (polinómico, regularidad wavelet o variaciones discretas). Para longitudes de datos suficientemente grandes (superiores a 2(12)), los métodos basados en wavelets y de variaciones discretas mostraron ser menos sesgados y más estables para señales fBm simuladas. Mostraremos que el método de DFA, más utilizado en el ambiente biomédico, es el que proporciona peores estimaciones, arrojando resultados ambiguos cuando son aplicados a señales biológicas de diferentes longitudes o con diferentes parámetros de estimación, sin que pueda considerarse a ninguno de los otros dos como métodos confiables en el momento de desear obtener resultados de relevancia física o fisiológica. Los resultados obtenidos indican que debería procederse con más cautela cuando se trata de obtener conclusiones fisiológicas a partir de estimaciones realizadas a partir de señales reales. Resumen en inglés In this paper we compare three different methods used to estimate Hurst exponent and we analyze their efficiency while they are applied in data series of different lengths. We analyze synthesized fBm time series, pure and with superimposed sinusoidal trends. We show that the three methods here discussed, DFA, wavelets based and discrete variations, no only are highly dependent on the signal length, but also on the order or number of moments (polynomic, wavelet regularity (mas) or discrete variations). For large enough data length (higher than 2(12)), the methods based on wavelets and discrete variations have shown to be the less biased and the more stable ones for simulated fBm signals. We show that DFA method, the most widely used among the biomedical community, is the one that provides worst estimators, displaying ambiguous results while applied to real biological signals of different lengths and for different parameters in the estimator. More over, nor DFA neither the other two methods provide reliable estimators if physical or physiological conclusions are wanted. The obtained results indicate that more caution should have to be taken while trying to derive physiological conclusions from the Hurst exponent estimations obtained from real data.

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Algoritmo basado en autómatas finitos para la obtención de óptimos globales en problemas combinatorios/ Algorithm based on finite automata for obtaining global optimum combinatorial problems

Niño, Elías D; Ardila, Carlos J
2009-06-01

Resumen en español En este artículo se propone un Autómata Finito Determinista de Intercambio (AFD - I) que permite modelar el espacio de soluciones factibles a problemas de naturaleza combinatoria, específicamente a problemas asociados con el orden de elementos. Con la estructura AFD - I definida, se diseña e implementa un algoritmo con cuyo uso se obtiene un óptimo global a problemas combinatorios. El problema que aquí se trata puede ser extrapolado a cualquiera de los siguientes ca (mas) sos: asignación de n procesos a n máquinas que trabajan en paralelo, selección de la ruta óptima en el problema del agente viajero y el problema del bin packing. Resumen en inglés This article states a Deterministic Finite Automaton of Exchange (DFA - E). It allows modeling of the space of feasible solutions to combinatorial problems, specifically, the problems associated with the order of elements. With the structure DFA - E defined, we designed and implemented an algorithm that uses it for obtaining a global solution of combinatorial problems. The problem we treat here can be extrapolated to any of the following: an allocation of n processes mach (mas) ines working in parallel, selecting the optimal route in the traveling salesman problem (TSP) and the problem of Bin Packing.

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Aplicación de nuevos métodos de análisis de la variabilidad de la frecuencia cardiaca en pacientes Chagásicos Crónicos/ APPLICATION OF NEW METHODS FOR THE ANALYSIS OF HEART RATE VARIABILITY INCHRONIC CHAGASIC PATIENTS

Jugo, Diego; Medina, Rubén; Rojas, Rubén; Schlegel, Tood; Arenare, Brian
2008-07-01

Resumen en español Este trabajo describe dos nuevos métodos de análisis de la Variabilidad de la Frecuencia Cardiaca (VFC) que están siendo implementados en equipos de electrocardiografía de alta resolución de última generación. Uno de los métodos, el Periodograma de Lomb, resuelve los problemas asociados con el muestreo irregular y produce una robusta estimación de la Densidad de Potencia Espectral (DPE) en presencia de ruido y complejos ectópicos. El segundo método realiza un A (mas) nálisis de Variaciones de Tendencias (AVT) que cuantifica la dinámica no lineal involucrada en la serie de tiempo formada por los intervalos inter-complejos (RR) de la señal electrocardiográfica. Para corroborar la efectividad de ambos métodos, se presentan los resultados obtenidos sobre grupo de pacientes chagásicos crónicos. Por el método de Lomb los resultados indican una alteración del balance simpático-vagal en los pacientes chagásicos. El método de Análisis de Variaciones de Tendencias permitió discriminar entre los pacientes chagásicos y el grupo de control seleccionado. Resumen en inglés This work describes two new methods for the analysis of Heart Rate Variability (HRV) that are being implemented in last generation high resolution electrocardiography equipments. One of the methods, the Lomb periodogram, avoids the problems associated with the irregular sampling and it produces a robust Power Spectral Density (PSD) estimation in presence of noise and ectopy beats. The second method performs a Detrended Fluctuation Analysis (DFA) that tries to quantify the (mas) non lineal dynamics involved in the time series of intercomplex intervals (RR) obtained from the electrocardiographic signal. This work reports results obtained when applying both methods to a group of chronic chagasic patients. Results obtained when applying the Lomb method for estimating the Power Spectral Density indicate an alteration of simpatho-vagal balance in chagasic patients. Similarly, the DFA method enables discrimination between the chagasic patients and control subjects

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Utilidad de la reacción de polimerasa en cadena en tiempo real en el diagnóstico de infecciones por virus respiratorio sincicial en adultos/ Utility of real time polymerase chain reaction in the diagnosis of respiratory syncytial virus infection among adult patients

Rabagliati B, Ricardo; Serri V, Michel; Montecinos P, Luisa; Azocar A, Teresa; Ferrés G, Marcela
2007-12-01

Resumen en español Introducción: Las infecciones respiratorias virales (IRV) son causa importante de morbilidad en adultos. Virus respiratorio sincicial (VRS) causa hasta 20% de las IRV en esta edad; sin embargo, su diagnóstico es subestimado debido a una menor sensibilidad de las técnicas diagnosticas convencionales (IF y ELISA). Objetivos: Evaluar el impacto del uso de reacción de la polimerasa en cadena en tiempo real (TR-RPC en tiempo real) en el diagnóstico de IRV por VRS en adult (mas) os y caracterizar su perfil clínico. Pacientes y Métodos: Durante ocho semanas del año 2005, los adultos hospitalizados en Hospital Clínico de la Universidad Católica con sospecha de IRV, e IFD negativa para VRS, FLU-A, -B, paraFLU-1, 2, 3 y ADV de muestra de hisopado nasofaríngeo, fueron sometidos a detección de VRS por TR-RPC en tiempo real. Se confeccionó una base de datos con los antecedentes clínicos, laboratorio y evolución de cada paciente. Resultados: De 114 pacientes con IFD negativa en 17 (14,9%) se detectó VRS. Fiebre, congestión faríngea, tos y signos de obstrucción bronquial, configuraron en más de 80% de los casos el perfil clínico de los pacientes. Treinta por ciento presentaba enfermedad crónica y 47% eran inmunocomprometidos. Tres de 17 (18%) presentaron descompensación de la enfermedad de base y 1/17 (6%) requirió ventilación mecánica. No hubo mortalidad asociada. Conclusiones: El uso de TR-RPC en tiempo real permitió duplicar la detección de infecciones por VRS en adultos hospitalizados respecto a las diagnosticadas por IFD. Se recomienda considerar el empleo la técnica de TR-RPC en tiempo real en aquellos pacientes con sospecha clínica de VRS durante la temporada de VRS y estudio viro lógico negativo por métodos convencionales Resumen en inglés Introduction: Viral respiratory infections (VRI) are a frequent cause of morbidity among adult population. Respiratory syncytial virus (RSV) produces 20%> of VRI, however diagnosis is limited for a low sensitivity of conventional (FDA and ELISA) tests. Aim: To assess the impact of real time reverse transcriptase-polymerase chain reaction (real time RT-PCR) technique in RSV diagnosis in adult hospitalized patients; to characterize RSV infection among these patients. Patien (mas) ts and Methods: All adults hospitalized in Hospital Clínico Universidad Católica during 8 weeks of winter season, with clinical picture of VRI, and with negative DFA for influenza A and B, parainfluenza 1, 2, 3 and adenovirus were included. Real time RT-PCR was performed from nasopharyngeal sample. Clinical information, general laboratory exams and chest X ray reports were collected. Results: Out of 114 patients with negative DFA, 17 (14.9%o) Debe decir: RSV cases were demonstrated using real time RT- PCR. Fever, pharyngeal congestion, cough and bronchial obstruction were present in 80%> of patients. Thirty percent of them had a baseline chronic disease and 47%> were immunocompromised. One out of 17 patients (6%) required mechanical ventilation. No mortality was observed. Conclusions: Use of RT-PCR allowed increasing detection of RSV infection over 100%> among adults with VRI without virological diagnosis with conventional techniques. It is necessary to consider RSV RT-PCR test among patients with clinical picture of VRI during RSV season, with negative virological screening tests

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Influenza pandémica a un año de la primera ola: ¿Qué podemos decir ahora?/ Pandemic influenza one year after the first wave: What did we learn?

Perret P, Cecilia
2010-04-01

Resumen en español Durante el año 2009 nuestro país vivió la primera ola pandémica causada por el nuevo virus de influenza A (H1N1) 2009 aparecido en el hemisferio norte a fines de abril del ese año. La tasa de ataque estimada fue entre 6 a 12% afectando más frecuentemente a los escolares quienes presentaron una enfermedad leve. Los grupos etáreos con mayor riesgo de hospitalización fueron los adultos mayores y los niños bajo 5 años de edad. Tuvieron mayor riesgo de fallecer los a (mas) dultos mayores y aquellas personas con una co-morbilidad asociada. Aprendimos que el diagnóstico clínico de influenza se confirma por laboratorio en alrededor del 80% pero tiene una baja correlación en los niños bajo 5 años de edad, especialmente en lactantes bajo 1 año de edad, al circular concomitantemente con VRS. Los métodos de diagnóstico como la IFD y los inmunocromatográficos tienen una sensibilidad que no supera el 80% y es muy baja en los adultos mayores cuando se compara con PCR. Dado el impacto clínico de este nuevo virus se justifica el uso de vacunación en los grupos de riesgo previamente descritos y el tratamiento con antivirales en los pacientes que cursan con enfermedad grave o con riesgo de evolucionar a una enfermedad más complicada Resumen en inglés During year 2009 our nation experimented the first influenza pandemic wave due to the novel influenza A (H1N1) 2009 virus that emerged in the Northern hemisphere at the end of April, 2009. Estimated attack rate was about 6 to 12% affecting mainly to schoolchildren who presented with a mild disease. Age groups with highest risk of hospitalization were elderly people and children under 5 years old. Elderly patients and patients with co-morbidities had the highest risk to di (mas) e. We have learnt that clinical diagnosis of influenza has a laboratory confirmation in about 80% of cases but its correlation is lower in kids under 5 years old, especially in infants when RSV co-circulates with influenza virus. Laboratory diagnostic methods like DFA and immuno-cromatography have about 80% of sensitivity but a significantly lower rate in elderly patients compared to PCR. The clinical impact of this new virus justifies the recommendation to vaccinate traditionally established risk groups and to prescribe antiviral treatment to patients that acquire severe influenza or have risk factors to progress to complications

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Spacer-mediated synthesis of contra-thermodynamic spiroacetals: stereoselective synthesis of C2-symmetric difructose dianhydrides.

Rubio, Enrique M.; García Moreno, María Isabel; Balbuena, Patricia; Lahoz, Fernando J.; Álvarez, Eleuterio; Ortiz Mellet, Carmen; García Fernández, José M.
2006-02-18

Digital.CSIC (Spain)

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New fluorinated derivatives as esterase inhibitors. Synthesis, hydration and crossed specificity studies

Quero, Carmen; Rosell, Gloria; Jiménez, Óscar; Rodríguez Ropero, Sergio; Bosch, María Pilar; Guerrero, Ángel
2003-03-01

Digital.CSIC (Spain)