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Sample records for du site cas

  1. Cancer du sein au Cameroun, profil histo-épidémiologique: à propos de 3044 cas

    Science.gov (United States)

    Engbang, Jean Paul Ndamba; Essome, Henri; Koh, Valère Mve; Simo, Godefroy; Essam, Jean Daniel Sime; Mouelle, Albert Sone; Essame, Jean Louis Oyono

    2015-01-01

    Décrire les caractéristiques épidémiologiques et histo-pathologiques des tumeurs malignes du sein au Cameroun. Il s'agissait d'une étude rétrospective descriptive portant sur les tumeurs malignes du sein, colligées, dans les registres des différents laboratoires d'Anatomie Pathologique publiques et privés repartis dans cinq régions (centre, littoral, Ouest, Nord-ouest, Sud-ouest), pendant une période de 10 ans (2004-2013). Les paramètres étudiés étaient la fréquence, l’âge, le sexe, la localisation, le type et le grade histologique, et les récepteurs hormonaux. Un total de 3044 cas de cancers du sein a été recensé, soit une fréquence annuelle de 304,4 cas en moyenne. Le sexe féminin était le plus représenté avec 2971 cas (97,60%) et les hommes avec 73 cas (2,40%), soit un sexe ratio (H/F) de 0,02. L’âge moyen des patients était de 46±15,87 ans, avec des extrêmes de 13 et 95 ans. Selon la localisation, le sein gauche était atteint dans 1244 cas (52%) et le sein droit dans 1115 cas (47%). Au plan histologique, on retrouvait essentiellement des carcinomes avec 96,50% des cas, des sarcomes 1,39%, des lymphomes 1,07% et la maladie de Paget du mamelon, 1,03%. Les tumeurs épithéliales étaient infiltrantes dans 2049 cas (84,46%), avec une prédominance du carcinome canalaire infiltrant (1870 cas) et non infiltrantes dans 377 cas (15,54%). Le grade histo-pronostic de SBR avait révélé une prédominance du grade II dans 66% des cas. Les cancers du sein restent une pathologie fréquente au Cameroun et atteignent principalement la population féminine en âge de procréer. Ils sont caractérisés par la prédominance du carcinome canalaire infiltrant. PMID:26523182

  2. L’infarctus du myocarde du jeune adulte -Analyse rétrospective des cas colligés au CHU de Dakar

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Nobila Valentin Yameogo

    2010-09-01

    Full Text Available Les données relatives à l’infarctus du myocarde chez le jeune adulte sont rares en Afrique noir. Nous rapportons une série rétrospective de 14 cas d’infarctus du myocarde chez l’adulte jeune noir africain. Pour analyser les caractéristiques épidémiologiques, cliniques, électriques, échographiques, biologiques, thérapeutiques et évolutives de l’infarctus aigu du myocarde chez le jeune adulte nous avons étudié de manière rétrospective les dossiers médicaux d’une série consécutive des patients admis entre Janvier 2003 et Décembre 2008 pour prise en charge d’infarctus aigu du myocarde. Quatre-vingt quatre (84 cas d’infarctus du myocarde ont été pris en charge durant la période d’étude ,14 patients (16,6% avaient un âge inférieur ou égal à 40 ans. L’âge moyen était de 34 +ou-5ans (extrêmes 27ans et 40 ans. Les facteurs de risque cardio-vasculaire étaient dominés par le sexe masculin (n=11, la dyslipidémie (n=7 et le tabagisme par cigarette (n=6. La contraception orale était absente chez le 1/3 des patients. Le délai moyen d’admission était tardif (15 plus ou moins 4 heures. L’IDM était antérieur dans la moitié des cas. L’acide acétylsalicylique, les inhibiteurs de l’enzyme de conversion Les bétabloquants et les statines étaient les médicaments les plus prescrits. La thrombolyse et l’angioplastie étaient respectivement réalisées chez 3 patients et 0 patient. 4 cas d’insuffisance cardiaque, 2 cas de bloc atrio-ventriculaire complet et 1 cas de décès étaient les principales complications. L’infarctus du myocarde concerne également le sujet jeune noir africain. Les facteurs de risque sont essentiellement représentés par le sexe, la dyslipidémie, le tabagisme et la contraception orale.

  3. Hematome organise du sinus maxillaire a propos d'un cas | Beltaief ...

    African Journals Online (AJOL)

    L'hématome organisé du sinus maxillaire est une entité rare. Son étiopathogénie reste incertaine. Nous rapportons le cas d'une patiente âgée de 16 ans présentant une épistaxis unilatérale droite de grande abondance avec une endoscopie nasale strictement normale. L'imagerie était en faveur d'une tumeur vasculaire du ...

  4. Les synovites villonodulaires du genou: à propos de 20 cas

    Science.gov (United States)

    Margad, Omar; Boukhris, Jalal; Azriouil, Ouahb; Daoudi, Mohamed; Mortaji, Aziz; Koulali, Khalid

    2017-01-01

    La synovite villonodulaire pigmentée (SVNP) est une prolifération bénigne rare de la synoviale des articulations, des bourses séreuses et des gaines tendineuses, d'étiopathogénie inconnue. Notre travail porte sur 20 cas de SVN du genou colligés à l'hôpital militaire Avicenne de Marrakech sur une période de 9 ans allant de janvier 2000 au décembre 2009 Il vise à identifier les spécificités de cette lésion, et à étudier ses principaux aspects anatomocliniques et pronostiques. L'incidence annuelle était de 2,2 cas par an. Ils étaient 15 hommes et 5 femmes, d'âge moyen de 32,5 ans, atteints du coté droit dans 55%des cas sous un mode mono articulaire chez 18 patients et bi articulaire chez un seul. La douleur et la tuméfaction étaient présentes dans 80% des cas, une masse palpable dans un cas, un syndrome méniscal a été retenu dans un cas, une mono arthrite septique dans 3 circonstances de même qu'un kyste poplité dans 2 autres. L'atteinte était diffuse dans 14 cas (70%), localisée dans 6 cas. L'imagerie par résonnance magnétique(IRM) pratiquée chez 5 patients était évocatrice chez 3, l'arthroscopie diagnostique a été utilisée chez 2 malades. La confirmation s'est faite à chaque fois à l'examen anatomopathlogique. Le traitement a consisté en une synovectomie subtotale dans 15 cas et en l'exérèse de la tumeur dans les autres formes localisées, 2 cas présentant une destruction ostéocartilagineuse ont nécessité une arthroplastie. L'évolution a été marquée par la survenue de 2 récidives sous la forme diffuse avec un recul de 3, 7 ans. On a noté une raideur avec atrophie quadricipitale chez 3 patients et une arthrolyse a été réalisée. Un cas de SVN confirmé par l'histologie s'est révélé être 5 mois après la synovectomie totale un Synovialosarcome monophasique envahissant l'os d'où l'indication de l'amputation. PMID:29255556

  5. Diagnostic ?tiologique du diab?te insipide central: ? propos de 41 cas

    OpenAIRE

    Chaker, Fatma; Chihaoui, Melika; Yazidi, Meriem; Slimane, Hedia

    2016-01-01

    La survenue d'un syndrome polyuro-polydipsiqueavec des urines hypotoniques n?cessite une strat?gie diagnostique rigoureuse. Le but de cette ?tude ?tait d??tudier les modalit?s de diagnostic du diab?te insipide central. A travers une ?tude r?trospective de 41 cas de diab?te insipide central(DIC) collig?s au service d'Endocrinologie ? l'h?pital de la Rabta de Tunis, allant de l'ann?e 1990 ? l'an 2013, nous avons relev? les circonstances de d?couverte du DIC, les anomalies du bilan ant?-hypophys...

  6. Lymphome malin non hodgkinien du sein et VIH: à propos d'un cas ...

    African Journals Online (AJOL)

    Le lymphome malin non-hodgkinien (LNH) représente 0,5% de tous les cancers du sein. Son diagnostic est essentiellement histologique. Nous rapportons un cas de LMNH du sein chez une patiente de 42 ans et chez qui la sérologie VIH est positive. L'objectif de cet article est de discuter les aspects cliniques, ...

  7. Contribution à la connaissance des micromycètes du Maroc. Cas ...

    African Journals Online (AJOL)

    Contribution à la connaissance des micromycètes du Maroc. Cas des ... et qualitative des micromycètes d'origine terrestre de la région de Rabat (Maroc). ... elles ont été entraînées dans le milieu aquatique par différents moyens de transport.

  8. Les kystes hydatiques du foie rompus dans les voies biliaires: à propos de 120 cas

    Science.gov (United States)

    Moujahid, Mountassir; Tajdine, Mohamed Tarik

    2011-01-01

    Etude rétrospective rapportant une série de kystes hydatiques rompus dans les voies biliaires colligés dans le service de chirurgie de l'hôpital militaire Avicenne à Marrakech. Entre 1990 à 2008, sur 536 kystes hydatiques du foie opérés dans le service, 120 étaient compliqués de rupture dans les voies biliaires soit 22,38%. Il y avait 82hommes et 38 femmes. L’âge moyen était de 35 ans avec des extrêmes allant de 10 à 60 ans. La clinique était dominée par la crise d'angiocholite ou une douleur du flanc droit. L'ictère était isolé dans huit cas. La fistule biliokystique était latente dans plus de 50% des cas. Le traitement a consisté en une résection du dôme saillant dans103cas (85,84%), une périkystectomie chez 11 malades (9,16%) et une lobectomie gauche dans six cas (5%). Le traitement de la fistule bilio kystique a consisté en une suture chez 36malades et un drainage bipolaire dans 25 cas, La déconnexion kysto-biliaire ou cholédocotomie trans hépatico kystique selon Perdomo était pratiquée dans 49cas et une anastomose bilio-digestive cholédoco-duodénale dans 10 cas. La durée moyenne d'hospitalisation était de 20jours. Nous déplorons deux décès par choc septique et un troisième par encéphalopathie secondaire à une cirrhose biliaire. La morbidité était représentée par huit abcès sous phrénique, douze fistules biliaires prolongées et deux occlusions intestinales. Les kystes hydatiques rompus dans les voies biliaires représentent la complication la plus grave de cette pathologie bénigne. Le traitement repose sur des méthodes radicales qui sont d'une efficacité reconnue, mais de réalisation dangereuse et les méthodes conservatrices, en particulier la déconnexion kysto-biliaire qui est une méthode simple et qui donne de bons résultats à court et à long terme. PMID:22384289

  9. Les TIC au service du microcrédit : le cas des correspondants ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    Les TIC au service du microcrédit : le cas des correspondants bancaires au Brésil. Bien qu'il ait été prouvé que les programmes de microfinance constituaient un outil efficace pour lutter contre la pauvreté dans les pays en développement, ils tardent à prendre leur envol en Amérique latine, en particulier au Brésil.

  10. Diagnostic étiologique du diabète insipide central: à propos de 41 cas

    Science.gov (United States)

    Chaker, Fatma; Chihaoui, Melika; Yazidi, Meriem; Slimane, Hedia

    2016-01-01

    La survenue d'un syndrome polyuro-polydipsiqueavec des urines hypotoniques nécessite une stratégie diagnostique rigoureuse. Le but de cette étude était d’étudier les modalités de diagnostic du diabète insipide central. A travers une étude rétrospective de 41 cas de diabète insipide central(DIC) colligés au service d'Endocrinologie à l'hôpital de la Rabta de Tunis, allant de l'année 1990 à l'an 2013, nous avons relevé les circonstances de découverte du DIC, les anomalies du bilan anté-hypophysaire etde l'imagerie hypophysaire. Le DIC était post opératoire chez 20 patients. La diurèse moyenne de 24 heures était significativement plus élevée chez les patients ayant un DIC en dehors d'un contexte chirurgical. L’épreuve de restriction hydrique était concluante chez tous les patients qui en ont bénéficié. En dehors d'un contexte neurochirurgical, les causes infiltratives étaient retrouvées chez 6 patientset les causes tumorales chez 6 patients. Le DIC était associé à une selle turcique vide dans 1 cas et idiopathique chez 3 malades. L'imagerie par résonnance magnétique hypothalamo-hypophysaire et le bilan anté-hypophysaire sont systématiques en dehors d'un contexte de chirurgie hypophysaire et d'une polydipsie primaire évidente. PMID:27642481

  11. Examination of CRISPR/Cas9 design tools and the effect of target site accessibility on Cas9 activity.

    Science.gov (United States)

    Lee, Ciaran M; Davis, Timothy H; Bao, Gang

    2018-04-01

    What is the topic of this review? In this review, we analyse the performance of recently described tools for CRISPR/Cas9 guide RNA design, in particular, design tools that predict CRISPR/Cas9 activity. What advances does it highlight? Recently, many tools designed to predict CRISPR/Cas9 activity have been reported. However, the majority of these tools lack experimental validation. Our analyses indicate that these tools have poor predictive power. Our preliminary results suggest that target site accessibility should be considered in order to develop better guide RNA design tools with improved predictive power. The recent adaptation of the clustered regulatory interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated protein 9 (Cas9) system for targeted genome engineering has led to its widespread application in many fields worldwide. In order to gain a better understanding of the design rules of CRISPR/Cas9 systems, several groups have carried out large library-based screens leading to some insight into sequence preferences among highly active target sites. To facilitate CRISPR/Cas9 design, these studies have spawned a plethora of guide RNA (gRNA) design tools with algorithms based solely on direct or indirect sequence features. Here, we demonstrate that the predictive power of these tools is poor, suggesting that sequence features alone cannot accurately inform the cutting efficiency of a particular CRISPR/Cas9 gRNA design. Furthermore, we demonstrate that DNA target site accessibility influences the activity of CRISPR/Cas9. With further optimization, we hypothesize that it will be possible to increase the predictive power of gRNA design tools by including both sequence and target site accessibility metrics. © 2017 The Authors. Experimental Physiology © 2017 The Physiological Society.

  12. CRISPR-Cas9-Edited Site Sequencing (CRES-Seq): An Efficient and High-Throughput Method for the Selection of CRISPR-Cas9-Edited Clones.

    Science.gov (United States)

    Veeranagouda, Yaligara; Debono-Lagneaux, Delphine; Fournet, Hamida; Thill, Gilbert; Didier, Michel

    2018-01-16

    The emergence of clustered regularly interspaced short palindromic repeats-Cas9 (CRISPR-Cas9) gene editing systems has enabled the creation of specific mutants at low cost, in a short time and with high efficiency, in eukaryotic cells. Since a CRISPR-Cas9 system typically creates an array of mutations in targeted sites, a successful gene editing project requires careful selection of edited clones. This process can be very challenging, especially when working with multiallelic genes and/or polyploid cells (such as cancer and plants cells). Here we described a next-generation sequencing method called CRISPR-Cas9 Edited Site Sequencing (CRES-Seq) for the efficient and high-throughput screening of CRISPR-Cas9-edited clones. CRES-Seq facilitates the precise genotyping up to 96 CRISPR-Cas9-edited sites (CRES) in a single MiniSeq (Illumina) run with an approximate sequencing cost of $6/clone. CRES-Seq is particularly useful when multiple genes are simultaneously targeted by CRISPR-Cas9, and also for screening of clones generated from multiallelic genes/polyploid cells. © 2018 by John Wiley & Sons, Inc. Copyright © 2018 John Wiley & Sons, Inc.

  13. Nouvelles approches en theorie du champ moyen dynamique: le cas du pouvoir thermoelectrique et celui de l'effet orbital d'un champ magnetique

    Science.gov (United States)

    Arsenault, Louis-Francois

    Les applications reliees a la generation d'energie motivent la recherche de materiaux ayant un fort pouvoir thermoelectrique (S). De plus, S nous renseigne sur certaines proprietes fondamentales des materiaux, comme, par exemple, la transition entre l'etat coherent et incoherent des quasi-particules lorsque la temperature augmente. Empiriquement, la presence de fortes interactions electron-electron peut mener a un pouvoir thermoelectrique geant. Nous avons donc etudie le modele le plus simple qui tient compte de ces fortes interactions, le modele de Hubbard. La theorie du champ moyen dynamique (DMFT) est tout indiquee dans ce cas. Nous nous sommes concentres sur un systeme tridimensionnel (3d) cubique a face centree (fcc), et ce, pour plusieurs raisons. A) Ce type de cristal est tres commun dans la nature. B) La DMFT donne de tres bons resultats en 3d et donc ce choix sert aussi de preuve de principe de la methode. C) Finalement, a cause de la frustration electronique intrinseque au fcc, celui-ci ne presente pas de symetrie particule-trou, ce qui est tres favorable a l'apparition d'une grande valeur de S. Ce travail demontre que lorsque le materiau est un isolant a demi-remplissage a cause des fortes interactions (isolant de Mott), il est possible d'obtenir de grands pouvoirs thermoelectriques en le dopant legerement. C'est un resultat pratique important. Du point de vue methodologique, nous avons montre comment la limite de frequence infinie de S et l'approche dite de Kelvin, qui considere la limite de frequence nulle avant la limite thermodynamique pour S, donnent des estimations fiables de la vraie limite continue (DC) dans les domaines de temperature appropriee. Ces deux approches facilitent grandement les calculs en court-circuit ant la necessite de recourir a de problematiques prolongements analytiques. Nous avons trouve que la methode de calcul a frequence infinie fonctionne bien lorsque les echelles d'energie sont relativement faibles. En d'autres termes

  14. Profil épidémiologique des hémoglobinopathies: étude transversale descriptive autour du cas index

    Science.gov (United States)

    Dahmani, Fatima; Benkirane, Souad; Kouzih, Jaafar; Woumki, Aziz; Mamad, Hassan; Masrar, Azlarab

    2017-01-01

    Les hémoglobinopathies sont des affections constitutionnelles conséquentes à des anomalies des hémoglobines. Elles sont souvent graves dans leurs formes majeures, leur prise en charge est lourde avec un grand impact psycho-social sur les patients et leur famille. Classées parmi les maladies rares, elles sont encore insuffisamment connues des professionnels de santé. Cette méconnaissance est à l'origine d'une errance diagnostique, d'un retard dans leur prise en charge et par conséquent une morbidité et une mortalité élevée chez ces patients. L'Organisation Mondiale de la Santé (OMS) a publié en 2008 des données concernant l'épidémiologie des hémoglobinopathies: plus de 330000 cas naissent chaque année avec une hémoglobinopathie (83% des cas de drépanocytose, 17% des cas de thalassémie). Les troubles de l'hémoglobine sont responsables d'environ 3,4% des décès chez les moins de 5 ans. A l'échelle mondiale, 7% environ des femmes enceintes seraient porteuses d'une forme de la thalassémie et 1% des couples sont à risque. Toutefois, elles sont relativement fréquentes dans certaines régions du globe où les mariages consanguins sont communs. Afin de décrire les caractéristiques épidémiologiques des familles à risque d'hémoglobinopathies (étude autour du cas) dont les cas index sont suivis au service de pédiatrie à l'Hôpital Provincial El Idrisi de Kenitra au Maroc, une étude transversale descriptive a été réalisée durant deux enquêtes la première en mai 2015 et la deuxième en juin de la même année lors des journées de vaccination des cas index contre le pneumocoque. Après avoir recueilli les données épidémiologiques de nos patients, nous avons réalisé une étude biologique comportant: l'hémogramme avec étude morphologique des globules rouges en coloration MGG et numération automatique des réticulocytes; les électrophorèses de l'hémoglobine à pH alcalin (8.8) et secondairement à pH acide (5.4) sur gel d

  15. Sarcome à cellules claires du rein : À propos d’un cas chez un jeune de 17 ans

    Science.gov (United States)

    Mazdar, Adil; Sakel, Adil Ait; Essatara, Younes; Beddouche, Ali; Elsayegh, Hachem; Iken, Ali; Benslimane, Lounis; Nouini, Yassine

    2014-01-01

    Résumé Le sarcome à cellules claires du rein (SCCR) se voit très rarement chez les jeunes. Il est caractérisé par une évolution agressive marquée par un taux élevé de récidive et de mortalité. Nous rapportons le cas d’un SCCR chez un patient de 17 ans et nous discutons de son apport et de son intérêt médical en vue d’une bonne prise en charge thérapeutique. L’agressivité du SCCR et la prolifération de métastases surtout osseuses impliquent qu’il ne faut pas méconnaître ce diagnostic afin de mettre en place un traitement adapté. PMID:24940474

  16. Intérêt de l’enclouage centromédullaire dans les fractures du quart distal de la jambe: à propos de 30 cas

    Science.gov (United States)

    Margad, Omar; Boukhris, Jalal; Sallahi, Hicham; Azriouil, Ouahb; Daoudi, Mohamed; Koulali, Khalid

    2017-01-01

    Les fractures du quart distal de la jambe, sont des fractures dont le trait est situé au niveau du quart inférieur du tibia. Elles sont réputées graves et posent à la fois des problèmes de consolidation, de contention et de stabilité. Nous présentons l'expérience du service de traumatologie orthopédie de l'Hôpital militaire Avicenne de Marrakech, concernant 30 fractures fermées du quart inférieur de la jambe, sur une période de 10 ans (de Janvier 2001 à Décembre 2010) ayant reçu un enclouage centromédullaire. Le montage était verrouillé à 80% des cas et simple dans les autres cas. La moyenne d'âge de nos patients était de 36 ans. Il existait une nette prédominance masculine avec 27 hommes pour 3 femmes. La consolidation a été obtenue dans un délai normal de 17 semaines en moyenne et les résultats fonctionnels était satisfaisants. Un seul cas d'infection est survenu à 6 mois du geste chirurgical soit 3,3% et aucune autre complication n'a été mentionnée. Un cal vicieux a été retrouvé chez 30% de nos patients. Nos données épidémiologiques et nos résultats sont presque identiques à ceux de la littérature. Quant aux résultats angulaires, ils sont nettement inférieurs aux séries de plaques, à l'opposé, leurs résultats infectieux portent à la prudence et certains séries de clous rapportent d'excellents résultats angulaires à condition d'avoir un montage stable. A la lumière de ces résultats, nous sommes en droit de conclure au grand intérêt d'élargir les indications classiques de l'enclouage centromédullaire verrouillé à la prise en charge des fractures du quart distal de la jambe, à condition d'avoir un montage stable par un double verrouillage distal et une ostéosynthèse primaire des fractures distales de la fibula. PMID:29541322

  17. Erysipèle du membre inférieur: étude de 400 cas [Erysipelas of the lower limb: study of 400 cases

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Amina Aounallah

    2017-11-01

    Full Text Available Introduction: Erysipelas is an acute, non-necrotizing dermo-hypodermitis of predominantly streptococcal origin. Objective: To clarify the epidemiological and evolutionary features of the lower limb erysipelas through a hospital series. Materiels and Methods: We retrospectively analyzed all cases of lower limb erysipelas hospitalized in the Department of Dermatology of the Farhat Hached Hospital of Sousse between January 2000 and December 2015 (10 years. Results: Four hundred cases of erysipelas of the lower limb were recorded. The mean age of the patients was 55.82 years. The sex ratio was 1.51. The main predisposing factors were sedentarity, diabetes and obesity. In 96.75% of cases, entry lesion, like mycoses or traumatic injuries was noted. Clinically, a classic presentation of erysipelas was described in all cases. Erysipela was unilateral in 96% of cases. Treatment was based on intravenous penicillin G in 86.5% of cases, on an average of 9.75 days. The evolution was favorable in 83.25% of cases. Antibioprophylaxis was prescribed in 38% of cases. Loco-regional and general complications were noted in 10.25% of cases. Three patients died. Late complications were dominated by relapses and persistence of sequelled lymphedema. RÉSUMÉ Introduction: L’érysipèle est une dermo-hypodermite aigue, non nécrosante, d’origine principalement streptococcique. Objectif: préciser les particularités épidémio-cliniques et évolutives de l’Erysipèle du membre inferieur à travers une série hospitalière. Matériel et Méthodes: Nous avons rétrospectivement analysé tous les cas d’érysipèle du membre inférieur hospitalisés dans le service de dermatologie de l’hôpital Farhat Hached de Sousse entre janvier 2000 et décembre 2015 (10 ans. Résultats: Quatre cents cas d’érysipèle du membre inférieur ont été recensés. L’âge moyen des patients était de 55.82 ans. Le sexe ratio était de 1.51. Les principaux facteurs favorisants

  18. Le syndrome de Pepper: à propos de deux cas observés au Centre ...

    African Journals Online (AJOL)

    Le syndrome de Pepper est une forme métastatique hépatique du neuroblastome. C'est une entité spécifique du nourrisson de moins de six mois qui a la particularité de pouvoir régresser de façon spontanée avec un pronostic favorable dans 80% des cas. A cause de sa rareté, nous rapportons deux cas du syndrome de ...

  19. COSMID: A Web-based Tool for Identifying and Validating CRISPR/Cas Off-target Sites

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Thomas J Cradick

    2014-01-01

    Full Text Available Precise genome editing using engineered nucleases can significantly facilitate biological studies and disease treatment. In particular, clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR with CRISPR-associated (Cas proteins are a potentially powerful tool for modifying a genome by targeted cleavage of DNA sequences complementary to designed guide strand RNAs. Although CRISPR/Cas systems can have on-target cleavage rates close to the transfection rates, they may also have relatively high off-target cleavage at similar genomic sites that contain one or more base pair mismatches, and insertions or deletions relative to the guide strand. We have developed a bioinformatics-based tool, COSMID (CRISPR Off-target Sites with Mismatches, Insertions, and Deletions that searches genomes for potential off-target sites (http://crispr.bme.gatech.edu. Based on the user-supplied guide strand and input parameters, COSMID identifies potential off-target sites with the specified number of mismatched bases and insertions or deletions when compared with the guide strand. For each site, amplification primers optimal for the chosen application are also given as output. This ranked-list of potential off-target sites assists the choice and evaluation of intended target sites, thus helping the design of CRISPR/Cas systems with minimal off-target effects, as well as the identification and quantification of CRISPR/Cas induced off-target cleavage in cells.

  20. Stratégie transfusionnelle des hémorragies graves du post-partum: étude rétrospective à propos de 47 cas

    Science.gov (United States)

    Khouadja, Hosni; Rouissi, Wissem; Mahjoub, Mohamed; Sakhri, Jaballah; Beletaifa, Dhafer; Jazia, Khaled Ben

    2016-01-01

    Introduction L’hémorragie du post-partum est la principale cause de morbi-mortalité maternelle dans le monde. La prise en charge est multidisciplinaire. La stratégie transfusionnelle est capitale jouant un rôle majeur dans le pronostic maternel. L’objectif de ce travail a été de déterminer le rapport PFC/CGR lors de la prise en charge des hémorragies graves du post-partum. Méthodes Une étude Etude rétrospective sur une période de 4 ans (2009-2012) a été réalisée dans un centre de maternité de référence de niveau III du centre-Est tunisien. Elle a inclut les parturientes admises pour une hémorragie sévère du post-partum définit par la nécessité d’une transfusion de plus de 04 CGR durant les 3 premières heures ou de plus de 10 CGR durant les 24 premières heures de prise en charge. Résultats Notre étude a inclut 47 parturientes. Le diagnostic de l’HPP a été fait devant un saignement vaginal dans 28 cas et suite à une césarienne dans 19 cas. En préopératoire le taux d’Hb a été de 6.3 g/dl. Le rapport transfusionnel (PFC/CGR) a été de 1/0.7. Conclusion Au cours de notre prise en charge, le rapport transfusionnel a été plus élevé que les recommandations récentes de la littérature stipulant une administration précoce et massive de PFC avec un ratio PFC/CGR compris entre 1/2 et 1/1. L’administration du fibrinogène (Fbg) et de l’acide tranexamique doit être précoce. L’emploi du facteur VII activé recombinant (rFVIIa) doit rester une solution ultime de prise en charge. PMID:28292131

  1. Malformations du tube neural en chirurgie pediatrique du chu de ...

    African Journals Online (AJOL)

    encéphalocèle et 6 cas de sipina bifida. La cure chirurgicale a été le principal mode de prise en charge des patients. Seuls 91,38% des cas ont été opérés. Pour toutes les malformations du tube neural, nous avons enregistré 7 décès dont 2 décès ...

  2. Câbles electriques - Calcul du courant admissible - Partie 1: Equations de l'intensité du courant admissible (facteur de charge 100%) et calcul des pertes - Section 2: Facteurs de pertes par courants de Foucault dans les gaines dans le cas de deux circuits disposés en nappe

    CERN Document Server

    International Electrotechnical Commission. Geneva

    1993-01-01

    Câbles electriques - Calcul du courant admissible - Partie 1: Equations de l'intensité du courant admissible (facteur de charge 100%) et calcul des pertes - Section 2: Facteurs de pertes par courants de Foucault dans les gaines dans le cas de deux circuits disposés en nappe

  3. Streamlined Approach for Environmental Restoration Plan for Corrective Action Unit 484: Surface Debris, Waste Sites, and Burn Area, Tonopah Test Range, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    Bechel Nevada

    2004-01-01

    This Streamlined Approach for Environmental Restoration plan details the activities necessary to close Corrective Action Unit (CAU) 484: Surface Debris, Waste Sites, and Burn Area (Tonopah Test Range). CAU 484 consists of sites located at the Tonopah Test Range, Nevada, and is currently listed in Appendix III of the Federal Facility Agreement and Consent Order. CAU 484 consists of the following six Corrective Action Sites: (1) CAS RG-52-007-TAML, Davis Gun Penetrator Test; (2) CAS TA-52-001-TANL, NEDS Detonation Area; (3) CAS TA-52-004-TAAL, Metal Particle Dispersion Test; (4) CAS TA-52-005-TAAL, Joint Test Assembly DU Sites; (5) CAS TA-52-006-TAPL, Depleted Uranium Site; and (6) CAS TA-54-001-TANL, Containment Tank and Steel Structure

  4. Impact du cordon sableux déposé à l’embouchure du site Ramsar de l’estuaire de l’Oued Massa (Maroc sur l’hydrologie et l’avifaune

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    M. EL BEKKAY

    2014-03-01

    Full Text Available Situé sur un des principaux axes de migration des oiseaux d’eau entre l’Europe et l’Afrique, l’estuaire de l’oued Massa, inscrit dans la liste Ramsar depuis 2005, a connu des modifications hydrologiques importantes, à la suite de l’installation en amont du barrage Youssef Ben Tachfine en 1972. En effet, l’installation de ce barrage a induit le dépôt d’un cordon de sable au niveau de l’embouchure, séparant les eaux de l’oued de celles de l’océan atlantique et transformant le site d’un écosystème estuarien en écosystème lagunaire. Le site est aussi le siège de changements irréguliers, enregistrés lors de disparitions temporaires du cordon de sable survenues à la suite des lâchés de barrages lors des précipitations abondantes comme c’était le cas en 1983, 1992, 1996 et 2010. Ce travail de recherche vise à étudier l’effet des modifications de l’écosystème à la suite de la disparition du cordon du sable de l’embouchure, sur l’évolution des paramètres physicochimiques du milieu et sur les oiseaux fréquentent le site. Pour ce faire plusieurs paramètres physicochimiques de l’eau (pH, oxygène dissous, température, salinité, azote ammoniacal, ortho-phosphate et nitrates ont été mesurés avant (2009 et après (2010 la dernière disparition du cordon de sable survenue en février 2010. Concernant l’influence des changements de l’écosystème sur l’avifaune, elle a été évaluée grâce au suivi de 7 espèces d’oiseaux parmi les plus caractéristiques de ce site Ramsar. Les résultats obtenus montrent que le passage de l’embouchure d’un état lagunaire vers un état estuarien à la suite de la disparition du cordon sableux s’est traduit principalement par l’amélioration de la qualité des eaux par accroissement des valeurs de l’oxygène dissous. Le milieu a connu aussi une augmentation de la salinité. Concernant les oiseaux d’eau, les sept espèces étudiées ont

  5. CAS - CERN Accelerator School: Power Converters

    CERN Document Server

    2015-01-01

    These proceedings collate lectures given at the twenty-eighth specialized course organised by the CERN Accelerator School (CAS). The course was held at the Hotel du Parc, Baden, Switzerland from 7 - 14 May 2014, in collaboration with the Paul Scherrer Institute. Following introductory lectures on accelerators and the requirements on power converters, the course covered components and topologies of the different types of power converters needed for particle accelerators. Issues of design, control and exploitation in a sometimes-hostile environment were addressed. Site visits to ABB and PSI provided an insight into state-of-the-art power converter production and operation, while topical seminars completed the programme.

  6. Maternal Supply of Cas9 to Zygotes Facilitates the Efficient Generation of Site-Specific Mutant Mouse Models

    Science.gov (United States)

    Cebrian-Serrano, Alberto; Zha, Shijun; Hanssen, Lars; Biggs, Daniel; Preece, Christopher

    2017-01-01

    Genome manipulation in the mouse via microinjection of CRISPR/Cas9 site-specific nucleases has allowed the production time for genetically modified mouse models to be significantly reduced. Successful genome manipulation in the mouse has already been reported using Cas9 supplied by microinjection of a DNA construct, in vitro transcribed mRNA and recombinant protein. Recently the use of transgenic strains of mice overexpressing Cas9 has been shown to facilitate site-specific mutagenesis via maternal supply to zygotes and this route may provide an alternative to exogenous supply. We have investigated the feasibility of supplying Cas9 genetically in more detail and for this purpose we report the generation of a transgenic mice which overexpress Cas9 ubiquitously, via a CAG-Cas9 transgene targeted to the Gt(ROSA26)Sor locus. We show that zygotes prepared from female mice harbouring this transgene are sufficiently loaded with maternally contributed Cas9 for efficient production of embryos and mice harbouring indel, genomic deletion and knock-in alleles by microinjection of guide RNAs and templates alone. We compare the mutagenesis rates and efficacy of mutagenesis using this genetic supply with exogenous Cas9 supply by either mRNA or protein microinjection. In general, we report increased generation rates of knock-in alleles and show that the levels of mutagenesis at certain genome target sites are significantly higher and more consistent when Cas9 is supplied genetically relative to exogenous supply. PMID:28081254

  7. CRISPR/Cas9-loxP-Mediated Gene Editing as a Novel Site-Specific Genetic Manipulation Tool.

    Science.gov (United States)

    Yang, Fayu; Liu, Changbao; Chen, Ding; Tu, Mengjun; Xie, Haihua; Sun, Huihui; Ge, Xianglian; Tang, Lianchao; Li, Jin; Zheng, Jiayong; Song, Zongming; Qu, Jia; Gu, Feng

    2017-06-16

    Cre-loxP, as one of the site-specific genetic manipulation tools, offers a method to study the spatial and temporal regulation of gene expression/inactivation in order to decipher gene function. CRISPR/Cas9-mediated targeted genome engineering technologies are sparking a new revolution in biological research. Whether the traditional site-specific genetic manipulation tool and CRISPR/Cas9 could be combined to create a novel genetic tool for highly specific gene editing is not clear. Here, we successfully generated a CRISPR/Cas9-loxP system to perform gene editing in human cells, providing the proof of principle that these two technologies can be used together for the first time. We also showed that distinct non-homologous end-joining (NHEJ) patterns from CRISPR/Cas9-mediated gene editing of the targeting sequence locates at the level of plasmids (episomal) and chromosomes. Specially, the CRISPR/Cas9-mediated NHEJ pattern in the nuclear genome favors deletions (64%-68% at the human AAVS1 locus versus 4%-28% plasmid DNA). CRISPR/Cas9-loxP, a novel site-specific genetic manipulation tool, offers a platform for the dissection of gene function and molecular insights into DNA-repair pathways. Copyright © 2017 The Author(s). Published by Elsevier Inc. All rights reserved.

  8. Les enjeux socio-environnementaux du développement durable en Amérique du Sud. Considérations à partir du cas colombien

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Oscar Navarro

    2011-12-01

    Full Text Available Parler du développement durable dans le contexte des pays émergents tels ceux de l’Amérique Latine et particulièrement la Colombie, implique d’aborder le caractère conflictuel lié à la possibilité d’y atteindre les buts de ce paradigme du développement. Il est donc nécessaire de connaitre les obstacles sociopolitiques et culturels que rencontrent ces sociétés (corruption et instabilité institutionnelle, conflit armé, pauvreté, etc.. Étudier la base et les dynamiques psychosociales des conflits socio-environnementaux permet de mieux comprendre ces obstacles, mais aussi de dégager des réponses afin de mieux gérer ces tensions. Le cas de la Colombie et plus particulièrement des conflits autour de l’eau dans la Sierra Nevada de Santa Marta nous permettent d’illustrer nos propos.Talk about sustained development in emergent countries such as in Latin America and specifically Colombia, implies to tackle the conflicting character linked to the possibility to aim the objectives of this development paradigm. It is so necessary to know socio-political and cultural obstacles these societies meet (corruption and institutional instability, armed conflict, poverty, etc…. Study socio-environmental conflict’s bases and psychosocial dynamics help to better understand these obstacles, but also to find out answers to better manage this pressure. Colombia’s case and water conflicts in the “Sierra de Santa Marta” above all will allow us to give an illustration of this matter.

  9. Cancers du sein bilat?raux synchrones et grossesse a l'institut Joliot Curie de Dakar (S?n?gal)

    OpenAIRE

    Zongo, Nayi; Sawadogo, Yobi Alexis; Some, Some Ollo Roland; Bagre, Sidpawalmd? Carine; Ka, Sidy; Diouf, Doudou; Dieng, Mamadou Moustapha; Gaye, Papa Macoumba; Dem, Ahmadou

    2016-01-01

    D?crire notre strat?gie diagnostique et th?rapeutique dans les cancers du sein bilat?raux synchrones pendant la grossesse. L??ge gestationnel au moment du diagnostic du cancer ?tait respectivement de 7; 21 et 25 semaines. Il s'agissait de stade IV et IIIA respectivement dans deux et un cas. Elles ont toutes b?n?fici? d'une chimioth?rapie dans deux cas pendant la grossesse (6TEC et 3AC) et dans un cas apr?s l'accouchement. Une mastectomie bilat?rale a ?t? r?alis?e dans un cas. Une patiente est...

  10. How type II CRISPR-Cas establish immunity through Cas1-Cas2-mediated spacer integration.

    Science.gov (United States)

    Xiao, Yibei; Ng, Sherwin; Nam, Ki Hyun; Ke, Ailong

    2017-10-05

    CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) and the nearby Cas (CRISPR-associated) operon establish an RNA-based adaptive immunity system in prokaryotes. Molecular memory is created when a short foreign DNA-derived prespacer is integrated into the CRISPR array as a new spacer. Whereas the RNA-guided CRISPR interference mechanism varies widely among CRISPR-Cas systems, the spacer integration mechanism is essentially identical. The conserved Cas1 and Cas2 proteins form an integrase complex consisting of two distal Cas1 dimers bridged by a Cas2 dimer. The prespacer is bound by Cas1-Cas2 as a dual-forked DNA, and the terminal 3'-OH of each 3' overhang serves as an attacking nucleophile during integration. The prespacer is preferentially integrated into the leader-proximal region of the CRISPR array, guided by the leader sequence and a pair of inverted repeats inside the CRISPR repeat. Spacer integration in the well-studied Escherichia coli type I-E CRISPR system also relies on the bacterial integration host factor. In type II-A CRISPR, however, Cas1-Cas2 alone integrates spacers efficiently in vitro; other Cas proteins (such as Cas9 and Csn2) have accessory roles in the biogenesis phase of prespacers. Here we present four structural snapshots from the type II-A system of Enterococcus faecalis Cas1 and Cas2 during spacer integration. Enterococcus faecalis Cas1-Cas2 selectively binds to a splayed 30-base-pair prespacer bearing 4-nucleotide 3' overhangs. Three molecular events take place upon encountering a target: first, the Cas1-Cas2-prespacer complex searches for half-sites stochastically, then it preferentially interacts with the leader-side CRISPR repeat, and finally, it catalyses a nucleophilic attack that connects one strand of the leader-proximal repeat to the prespacer 3' overhang. Recognition of the spacer half-site requires DNA bending and leads to full integration. We derive a mechanistic framework to explain the stepwise spacer

  11. Cost-Effective Remediation of Depleted Uranium (DU) at Environmental Restoration Sites

    International Nuclear Information System (INIS)

    MILLER, MARK; GALLOWAY, ROBERT B.; VANDERPOEL, GLENN; JOHNSON, ED; COPLAND, JOHN; SALAZAR, MICHAEL

    1999-01-01

    Numerous sites in the United States and around the world are contaminated with depleted uranium (DU) in various forms. A prevalent form is fragmented DU originating from various scientific tests involving high explosives and DU during weapon-development programs, at firing practice ranges, or in war theaters where DU was used in armor-piercing projectiles. The contamination at these sites is typically very heterogeneous, with discrete, visually identifiable DU fragments mixed with native soil. The bulk-averaged DU activity is quite low, whereas DU fragments, which are distinct from the soil matrix, have much higher specific activity. DU is best known as a dark metal that is nearly twice as dense as lead, but DU in the environment readily weathers (oxidizes) to a distinctive bright yellow color that is quite visible. While the specific activity (amount of radioactivity per mass of soil) of DU is relatively low and presents only a minor radiological hazard, the fact that DU is radioactive and visually identifiable makes it desirable to remove the DU ''contamination'' from the environment. The typical approach to conducting this DU remediation is to use radiation-detection instruments to identify the contaminant and then to separate it from the adjacent soil, packaging it for disposal as radioactive waste. This process can be performed manually or by specialized, automated equipment. Alternatively, a more cost-effective approach might be simple mechanical or gravimetric separation of the DU fragments from the host soil matrix. At SNL/NM, both the automated and simple mechanical approaches have recently been employed. This paper discusses the pros/cons of the two approaches

  12. Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/Cas9 Triggered Isothermal Amplification for Site-Specific Nucleic Acid Detection.

    Science.gov (United States)

    Huang, Mengqi; Zhou, Xiaoming; Wang, Huiying; Xing, Da

    2018-02-06

    A novel CRISPR/Cas9 triggered isothermal exponential amplification reaction (CAS-EXPAR) strategy based on CRISPR/Cas9 cleavage and nicking endonuclease (NEase) mediated nucleic acids amplification was developed for rapid and site-specific nucleic acid detection. CAS-EXPAR was primed by the target DNA fragment produced by cleavage of CRISPR/Cas9, and the amplification reaction performed cyclically to generate a large number of DNA replicates which were detected using a real-time fluorescence monitoring method. This strategy that combines the advantages of CRISPR/Cas9 and exponential amplification showed high specificity as well as rapid amplification kinetics. Unlike conventional nucleic acids amplification reactions, CAS-EXPAR does not require exogenous primers, which often cause target-independent amplification. Instead, primers are first generated by Cas9/sgRNA directed site-specific cleavage of target and accumulated during the reaction. It was demonstrated this strategy gave a detection limit of 0.82 amol and showed excellent specificity in discriminating single-base mismatch. Moreover, the applicability of this method to detect DNA methylation and L. monocytogenes total RNA was also verified. Therefore, CAS-EXPAR may provide a new paradigm for efficient nucleic acid amplification and hold the potential for molecular diagnostic applications.

  13. Les dermites du siège chez le nourrisson à Dakar: Etude de 205 cas [Diaper dermatitis among the infant in Dakar: Study of 205 cases

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Boubacar Ahy Diatta

    2017-11-01

    Full Text Available Background: Diaper dermatitis in infant is a common reason for dermatological consultation. The aim of this study was to describe the epidemiological, clinical, etiological and evolutionary aspects of diaper dermatitis in infant. Materials and Methods: A cross-sectional descriptive study was conducted in three dermatology departments in Dakar. All infants [1-30 months] who are followed from October 1, 2015 to April 30, 2016 for diaper dermatitis was included. Results: We collected 205 cases, a hospital frequency of 22.18%. The sex ratio was 1.02 and the mean age was 8.49 months. Diaper dermatitis was inflammatory in 67%, irritative in 18%, infectious in 12% and associated with general disease in 3%. Dermatitis was seborrheic in 51.7%, mycotic in 14.6% and associated with: acrodermatitis enteropathic in 4 cases and granuloma gluteale infantum in one case. Baby diapers were used in 93.7% by moms with a change of less than 6 times a day in 84.9%. The clinical outcome was favorable in 56.1%. Conclusion: Diaper dermatitis in infant is a common infant dermatosis in Dakar. The multiple causes necessitate a rigorous diagnostic approach. Severity is related to association with general diseases. RÉSUMÉ Introduction: Les dermites du siège du nourrisson est un motif fréquent de consultation dermatologique. L’objectif de notre étude était de décrire les aspects épidémiologiques, cliniques, étiologiques et évolutifs des dermites du siège du nourrisson. Matériels et Méthodes: Une étude descriptive a été menée dans trois services de dermatologie à Dakar. Tous les nourrissons [1-30 mois] suivis du 1er Octobre 2015 au 30 Avril 2016 pour une dermite du siège étaient inclus. Résultats: Nous avons colligé 205 cas, soit une fréquence hospitalière de 22,18%. Le sex- ratio était de 1,02 et l’âge moyen de 8,49 mois. Les dermites du siège étaient inflammatoire dans 67%, irritative dans 18%, infectieuse dans 12% et associée à une maladie

  14. Caractérisation et estimation du gonflement des argiles algériennes, cas des argiles de Médéa

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Medjnoun Amal

    2014-04-01

    Full Text Available Le matériau argileux, dur et cassant lorsqu’il est asséché, présente la particularité de voir sa consistance se modifier en fonction de sa teneur en eau. Un certain degré d’humidité peut le transformer en un matériau plastique et malléable. Ces modifications de consistance peuvent s’accompagner, en fonction de la structure particulière de certains minéraux argileux, de variations de volume plus ou moins conséquentes qui se manifestent soit sous forme d’une forte augmentation de volume (phénomène de gonflement lorsque la teneur en eau augmente ou de rétrécissement (phénomène de retrait en période de déficit pluviométrique marqué. Ce comportement est lié essentiellement à certains paramètres environnementaux de ces sols à l’exemple de la géologie et de la lithologie du site, du climat, etc. La prévision du potentiel de gonflement des sols est possible moyennant certaines méthodes empiriques basées sur des paramètres d’identification tels que la plasticité et la granulométrie déterminées lors des campagnes de reconnaissance. Une fois le caractère de gonflement pressenti dans la phase de reconnaissance préliminaire, une estimation de l’amplitude et de la pression de gonflement peut être établie à partir des corrélations, qui tendent à mettre en relation les paramètres de gonflement avec les paramètres géotechniques issus des essais d’identification. C’est dans cet aspect que s’inscrit cet article en traitant le cas d’un site algérien. Les résultats obtenus montrent une concordance entre les méthodes empiriques appliquées. Ces résultats sont aussi comparés avec ceux obtenus des essais de gonflement à l’oedométrique. L’évolution de la structure argileuse au cours de retrait-gonflement est suivie dans l’objectif de comprendre le mécanisme de gonflement.

  15. CasA mediates Cas3-catalyzed target degradation during CRISPR RNA-guided interference.

    Science.gov (United States)

    Hochstrasser, Megan L; Taylor, David W; Bhat, Prashant; Guegler, Chantal K; Sternberg, Samuel H; Nogales, Eva; Doudna, Jennifer A

    2014-05-06

    In bacteria, the clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated (Cas) DNA-targeting complex Cascade (CRISPR-associated complex for antiviral defense) uses CRISPR RNA (crRNA) guides to bind complementary DNA targets at sites adjacent to a trinucleotide signature sequence called the protospacer adjacent motif (PAM). The Cascade complex then recruits Cas3, a nuclease-helicase that catalyzes unwinding and cleavage of foreign double-stranded DNA (dsDNA) bearing a sequence matching that of the crRNA. Cascade comprises the CasA-E proteins and one crRNA, forming a structure that binds and unwinds dsDNA to form an R loop in which the target strand of the DNA base pairs with the 32-nt RNA guide sequence. Single-particle electron microscopy reconstructions of dsDNA-bound Cascade with and without Cas3 reveal that Cascade positions the PAM-proximal end of the DNA duplex at the CasA subunit and near the site of Cas3 association. The finding that the DNA target and Cas3 colocalize with CasA implicates this subunit in a key target-validation step during DNA interference. We show biochemically that base pairing of the PAM region is unnecessary for target binding but critical for Cas3-mediated degradation. In addition, the L1 loop of CasA, previously implicated in PAM recognition, is essential for Cas3 activation following target binding by Cascade. Together, these data show that the CasA subunit of Cascade functions as an essential partner of Cas3 by recognizing DNA target sites and positioning Cas3 adjacent to the PAM to ensure cleavage.

  16. Formes hémorragiques graves de la fièvre de la vallée du Rift: à propos de 5 cas

    Science.gov (United States)

    Salem, Mohamed Lemine Ould; Baba, Sidi El Wafi Ould; Fall-Malick, Fatimetou Zahra; Boushab, Boushab Mohamed; Ghaber, Sidi Mohamed; Mokhtar, Abdelwedoud

    2016-01-01

    La fièvre de la vallée du Rift (FVR) est une arbovirose due à un virus à ARN appartenant à la famille de Bunyaviridae (genre phlebovirus). C'est une zoonose touchant principalement les animaux mais pouvant aussi contaminer l'homme, soit directement par la manipulation des viandes ou avortons d'animaux malades ou indirectement par la piqure de moustiques infectées (Aèdes sp, anophèles sp, Culex sp). Dans la majorité des cas, l'infection humaine à FVR est asymptomatique, mais elle peut également se manifester par un syndrome fébrile modérée d’évolution favorable. Néanmoins, certains patients peuvent développer un syndrome hémorragique et/ou des lésions neurologiques d’évolution mortelle. Nous décrivons l’évolution de cinq cas de patients atteints de la FVR, admis dans le service de médecine interne du Centre Hospitalier National de Nouakchott (Mauritanie), le mois d'Octobre 2015 et présentant tous, un syndrome hémorragique dans un contexte fébrile. L’évolution n’était favorable que pour 2 des cinq patients. Les 3 autres sont décédés, deux dans un tableau de choc hémorragique et dans un état de choc septique. PMID:27642413

  17. Cancers du sein bilatéraux synchrones et grossesse a l'institut Joliot Curie de Dakar (Sénégal)

    Science.gov (United States)

    Zongo, Nayi; Sawadogo, Yobi Alexis; Some, Some Ollo Roland; Bagre, Sidpawalmdé Carine; Ka, Sidy; Diouf, Doudou; Dieng, Mamadou Moustapha; Gaye, Papa Macoumba; Dem, Ahmadou

    2016-01-01

    Décrire notre stratégie diagnostique et thérapeutique dans les cancers du sein bilatéraux synchrones pendant la grossesse. L’âge gestationnel au moment du diagnostic du cancer était respectivement de 7; 21 et 25 semaines. Il s'agissait de stade IV et IIIA respectivement dans deux et un cas. Elles ont toutes bénéficié d'une chimiothérapie dans deux cas pendant la grossesse (6TEC et 3AC) et dans un cas après l'accouchement. Une mastectomie bilatérale a été réalisée dans un cas. Une patiente est décédée. Les autres étaient vivantes mais toutes métastatiques. Une hypotrophie fœtale a été notée dans un cas. Le diagnostic du cancer est tardif dans cette association. La chirurgie est faisable et le type de chirurgie serait seulement fonction du stade du cancer. La chimiothérapie est possible avec moins de complications fœtales aux deux derniers trimestres. PMID:27279967

  18. Atténuer la contamination du sol dans les sites miniers abandonnés ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    9 févr. 2018 ... Innovation. Solutions. Carrières · Communiquez avec nous · Plan du site. Abonnez-vous à notre bulletin pour recevoir les nouvelles du CRDI chaque mois. Abonnez-vous · Droits d'auteur · Éthique de la recherche · Politique de libre accès · Politique de confidentialité · Transparence · Utilisation du site Web.

  19. Coinfection pulmonaire par pneumocystis jirovecii et pseudomonas aeruginosa au cours du SIDA: à propos de deux cas

    Science.gov (United States)

    Mamoudou, Savadogo; Bellaud, Guillaume; Ana, Canestri; Gilles, Pialoux

    2015-01-01

    Rapporter deux cas cliniques de coinfections pulmonaires par Pneumocystis jirovecii et par Pseudomonas aeruginosa chez des patients vivant avec le VIH. Les deux patients étaient âgés respectivement de 32 ans et 46 ans. Un patient a été pris en charge à l'hôpital Yalgado Ouédraogo de Ouagadougou au Burkina Faso et l'autre a été pris en charge à l'hôpital Ténon de Paris, en France. Les deux souffraient de pneumopathie confirmée à la radiographie et à la tomodensitométrie. L'un des patients était sévèrement immuno déprimé, contrairement à l'autre. L'examen bactériologique dans les crachats avait permis d'isoler Pseudomonas aeruginosa et Pneumocystis jirovecii chez les deux patients. Sous traitement, l’évolution a été favorable. Les coinfections morbides sont relativement fréquentes chez les patients vivant avec le VIH. Devant une symptomatologie respiratoire du sujet vivant avec le VIH, il faut savoir rechercher en plus du Bacille de Koch, Pneumocystis jirovecii et Pseudomonas aeruginosa par un lavage broncho alvéolaire. PMID:26516396

  20. Les tuberculomes intracraniens: à propos de 125 cas

    Science.gov (United States)

    Moufid, Faycal; Oulali, Noureddine; El Fatemi, Nizare; Gana, Rachid; Maaqili, Rachid; Bellakhdar, Fouad

    2012-01-01

    Les tuberculomes intracrâniens représentent l'une des localisations les plus graves de la tuberculose, leur incidence varie en fonction du contexte représentant 0,2% des processus intracrâniens dans les pays occidentaux et 5 à 10% des masses intracrâniennes dans les pays en voie de développement. Nous rapportons une étude rétrospective de 125 cas. L'hypertension intracrânienne (45%) et le déficit neurologique (36%) sont les signes cliniques les plus fréquents. La lésion était localisée dans 60% des cas en sus-tentoriel et dans 40% des cas en sous-tentoriel. L'approche thérapeutique a consisté en un abord direct du tuberculome dans 67 cas (53%), une biopsie stéréotaxique dans 32 cas (25%), le traitement médical en première intention sans confirmation histologique dans 26 cas (20%). Avant 1993 notre service ne disposait pas de cadre de stéréotaxie, notre attitude thérapeutique consistait soit en un abord direct de la lésion dans 70% des cas, soit un traitement antituberculeux en première intention sans confirmation histologique (30%). Cette attitude était corrélée à une mortalité et morbidité non négligeables respectivement 3% et 10%. Après 1993; le taux d'abords direct a chuté a 38%, avec 47% de biopsies stéréotaxiques et seulement 13% des patients traités par antibacillaires sans preuve histologique. Ceci s'est accompagné d'une réduction significative de mortalité a 1,4% (p = 0,0003) et de morbidité a 2% (p = 0,0027). PMID:22937196

  1. Serotonin transporter gene polymorphism and myocardial infarction: Etude Cas-Témoins de l'Infarctus du Myocarde (ECTIM).

    Science.gov (United States)

    Fumeron, Frédéric; Betoulle, Dina; Nicaud, Viviane; Evans, Alun; Kee, Frank; Ruidavets, Jean-Bernard; Arveiler, Dominique; Luc, Gérald; Cambien, François

    2002-06-25

    Depression is a risk factor for myocardial infarction (MI). Selective serotonin reuptake inhibitors reduce this risk. The site of action is the serotonin transporter (SLC6A4), which is expressed in brain and blood cells. A functional polymorphism in the promoter region of the SLC6A4 gene has been described. This polymorphism may be associated with the risk of MI. The SLC6A4 polymorphism has been investigated by polymerase chain reaction in 671 male patients with MI and in 688 controls from the Etude Cas-Témoins de l'Infarctus du Myocarde (ECTIM) multicentric study. Percentages for LL, LS, and SS genotypes were 35.5%, 45.4%, and 19.1%, respectively, for cases versus 28.1%, 49.1%, and 22.8%, respectively, for controls. S allele frequency was 41.8% and 47.4% for cases and controls, respectively. After adjustment for age and center by using multivariable logistic regression, the odds ratio for MI associated with the LL genotype was 1.40 (95% CI 1.11 to 1.76, P=0.0047). The LL genotype of the SLC6A4 polymorphism is associated with a higher risk of MI. This could be attributable to the effect of the polymorphism on serotonin-mediated platelet activation or smooth muscle cell proliferation or on other risk factors, such as depression or response to stress.

  2. An alternative for cost-effective remediation of depleted uranium (DU) at certain environmental restoration sites

    International Nuclear Information System (INIS)

    Miller, M.; Galloway, B.; VanDerpoel, G.; Johnson, E.; Copland, J.; Salazar, M.

    2000-01-01

    Numerous sites in the United States and around the world are contaminated with depleted uranium (DU) in various forms. A prevalent form is fragmented DU originating from various scientific tests involving high explosives and DU during weapon development programs, at firing practice ranges, or war theaters where DU was used in armor-piercing projectiles. The contamination at these sites is typically very heterogeneous, with discreet, visually identifiable DU fragments mixed with native soil. That is, the bulk-averaged DU activity is quite low, while specific DU fragments, which are distinct from the soil matrix, have much higher specific activity. DU is best known as a dark, black metal that is nearly twice as dense as lead, but DU in the environment readily weathers to a distinctive bright yellow color that is readily visible. While the specific activity of DU is relatively low and presents only a minor radiological hazard, the fact that it is radioactive and visually identifiable makes it desirable to remove the DU contamination from the environment

  3. An alternative for cost-effective remediation of depleted uranium (DU) at certain environmental restoration sites

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Miller, M.; Galloway, B.; VanDerpoel, G.; Johnson, E.; Copland, J.; Salazar, M.

    2000-02-01

    Numerous sites in the United States and around the world are contaminated with depleted uranium (DU) in various forms. A prevalent form is fragmented DU originating from various scientific tests involving high explosives and DU during weapon development programs, at firing practice ranges, or war theaters where DU was used in armor-piercing projectiles. The contamination at these sites is typically very heterogeneous, with discreet, visually identifiable DU fragments mixed with native soil. That is, the bulk-averaged DU activity is quite low, while specific DU fragments, which are distinct from the soil matrix, have much higher specific activity. DU is best known as a dark, black metal that is nearly twice as dense as lead, but DU in the environment readily weathers to a distinctive bright yellow color that is readily visible. While the specific activity of DU is relatively low and presents only a minor radiological hazard, the fact that it is radioactive and visually identifiable makes it desirable to remove the DU contamination from the environment.

  4. Le kyste hydatique du cordon spermatique: une localisation exceptionnelle

    Science.gov (United States)

    Hamdane, Mohamed Moncef; Bougrine, Fethi; Msakni, Issam; Dhaoui-Ghozzi, Amen; Bouziani, Ammar

    2011-01-01

    L’ hydatidose est une anthropo-zoonose due au développement chez l'homme de la forme larvaire du taenia Echinococcus granulosis. La plupart des kystes hydatiques se localisent dans le foie et les poumons. Le kyste hydatique du cordon spermatique est extrêmement rare avec seulement 4 cas rapportés dans la littérature. Les auteurs rapportent dans cet article un nouveau cas d'hydatidose du cordon spermatique. Il s'agissait d'un homme de 40 ans qui consultait pour des douleurs scrotales évoluant depuis huit mois. L'examen clinique a mis en évidence une tuméfaction mobile, inguino-scrotale, droite. L’échographie testiculaire a objectivé une hernie inguinale droite associée à deux kystes épididymaires bilatéraux. Le patient a été opéré pour cure de son hernie avec découverte en per-opératoire d'un kyste du cordon spermatique qui a été réséqué. L'examen anatomopathologique a conclu à une hydatidose du cordon spermatique. PMID:22384304

  5. Tuberculose du col utérin simulant un cancer du col utérin : à propos ...

    African Journals Online (AJOL)

    Tuberculose du col utérin simulant un cancer du col utérin : à propos d'un cas, au Centre Hospitalier Universitaire Souro Sanou de Bobo-Dioulasso, Burkina Faso. A. Dembélé, V. Konségré, E. Birba, D.A. Somé, H. Zamané, A.S. Ouédraogo, S. Kiemtoré, S. Ouattara, A. Lamien-Sanou, M. Bambara, B. Bonané/Thiéba ...

  6. L’érysipèle sur cicatrice post opératoire en traumatologie: à propos d'un cas et revue de la littérature

    Science.gov (United States)

    Abid, Hatim; El Idrissi, Mohamed; Shimi, Mohamed; El Ibrahimi, Abdelhalim; El Mrini, Abdelmajid; Amraoui, Nissrine; Mernissi, Fatima Zohra

    2015-01-01

    L’érysipèle sur cicatrice post opératoire est une entité rare, décrite principalement chez des patients présentant les facteurs de risque classiques de la maladie au niveau des sites de veinectomie pour pontage coronarien. En traumatologie orthopédie, nous n'avons que les 3 cas rapportés dans le travail de Dhrif survenus au décours d'une implantation prothétique chez des malades à risque. Nous présentons à travers cet article, le cas d'un érysipèle post opératoire sur une cicatrice d'ostéosynthèse d'une fracture fermée du pilon tibial, ayant la particularité du terrain et des circonstances de survenues, pour enfin conclure aux principes de la prévention primaire à adopter. PMID:26401204

  7. La Modernité du modèle de consommation alimentaire Méditerranéen : cas de l’Algérie

    OpenAIRE

    CHIKHI, Kamel

    2015-01-01

    Cette thèse porte sur la modernité des modèles de consommation en méditerranée. Le type de recherche est une synthèse et analyse du cas Algérien. Une revue de littérature à été réalisée sur la modernité alimentaire et les approches conceptuelles de la consommation alimentaire. Elle nous à permis de ressortir les principaux déterminants de la modernité. L’analyse des enquêtes nationales sur les évolutions globales de long terme nous ont aidées à montrer les mutations de l’environne...

  8. Le cas du Brésil

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    pwust

    important volet des activités de coopération du Brésil dans les pays en développement, ...... attention à l'Amérique latine ou aux Caraïbes, malgré la priorité accordée à .... prudente et sélective face aux opérations triangulaires, afin d'éviter la ...

  9. Prise en charge des traumatismes graves du rein

    Science.gov (United States)

    Lakmichi, Mohamed Amine; Jarir, Redouane; Sadiki, Bader; Zehraoui; Bentani; Wakrim, Bader; Dahami, Zakaria; Moudouni; Sarf, Ismail

    2015-01-01

    Les traumatismes graves du rein de grade III, IV et V selon la classification de l'Amercan Society for Surgery For Trauma (ASST) sont plus rares et se retrouvent dans 5% des cas en moyenne. Leur prise en charge est souvent délicate, nécessitant alors des centres expérimentés dotés de moyen adéquats d'imagerie (scanner spiralé). Cependant, durant ces dernières années, la prise en charge de ces traumatismes a évolué vers une attitude de moins en moins chirurgicale grâce à l’évolution des techniques de la radiologie interventionnelle, de l'endourologie et des moyens de surveillance aux urgences et de réanimation. L'objectif de cette étude est d’évaluer notre expérience dans la prise en charge des traumatismes rénaux de haut grade. Notre étude rétrospective porte sur 25 cas de traumatismes grave du rein de grade III, IV et V selon la classification de l'ASST, colligés entre Janvier 2002 et Juin 2009 au service d'urologie du centre Hospitalier Universitaire Mohammed VI, Université Cadi Ayyad de Marrakech, Maroc. Nous avons étudié les données épidémiologiques, les signes cliniques et biologiques à l'admission (état de choc hémorragique, taux d'hémoglobine), les données radiologiques (échographie et scanner), les lésions associées, la prise en charge thérapeutique et les complications. L’âge moyen de nos patients était de 24,9 ans 15 et 58 ans, avec une prédominance masculine (sex-ratio = 7, 3). Le rein droit était intéressé dans 15 cas (60%). Le traumatisme rénal était fermé dans 15 cas, et ouvert par arme blanche dans 10 cas. Huit patients se sont présentés en état de choc hémorragique (32%). Une anémie inférieur à 10g /100ml a été observée dans 10 cas (40%). L'uroscanner fait systématiquement à l'admission a retrouvé un grade III (10 cas), grade IV (13 cas) et grade V (2 cas). La prise en charge a consisté en une exploration chirurgicale avec néphrectomie chez 2 cas de Grade IV pour une instabilité h

  10. World heritage site - Bien du Patrimoine Mondial - Kluane/Wrangell-St. Elias/Glacier Bay/Tatshenshini-Alsek

    Science.gov (United States)

    Labay, Keith A.; Wilson, Frederic H.

    2004-01-01

    The four parks depicted on this map make up a single World Heritage Site that covers 24.3 million acres. Together, they comprise the largest internationally protected land-based ecosystem on the planet. The United Nations Educational, Scientific and Cultural Organization (UNESCO) established the World Heritage Program in 1972 for the identification and protection of the world?s irreplaceable natural and cultural resources. World Heritage Sites are important as storehouses of memory and evolution, as anchors for sustainable tourism and community, and as laboratories for the study and understanding of the earth and culture. This World Heritage Site protects the prominent mountain ranges of Kluane, Wrangell, Saint Elias, and Chugach. It includes many of the tallest peaks on the continent, the world's largest non-polar icefield, extensive glaciers, vital watersheds, and expanses of dramatic wilderness. [Les quatre parcs figurant sur cette carte ne constituent qu?un seul site du patrimoine mondial recouvrant plus de 99 millions de km2, ce qui en fait le plus grand ecosysteme terrestre protege par loi internationale. En 1972, L?UNESCO (l?organisation des Nations Unies pour les sciences, l'education et la culture) a etabli le programme du patrimoine mondial afin d?identifier et de proteger les ressources naturelles et culturelles irremplacables de notre plan?te. Si les sites du patrimoine mondial sont si importants c'est parce qu'ils representent a la fois des livres ouverts sur l?histoire de la Terre, le point de depart du tourisme durable et du developpement des collectivites, des laboratoires pour etudier et comprendre la nature et la culture. Ce site du patrimoine mondial assure la protection des chaines de montagnes de Kluane, Wrangell, Saint Elias, et Chugach. On y trouve plusieurs des plus hauts sommets du continent, le plus grand champ de glace non-polaire du monde, d?immenses glaciers, des bassins hydrologiques essentiels, et de la nature sauvage a perte de vue.

  11. Une tumeur exceptionnelle du doigt: la tumeur fibreuse solitaire

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Taoufiq Harmouch

    2011-12-01

    Full Text Available La tumeur Fibreuse solitaire (TFS est une proliferation fusocellulaire rare, souvent de localisation intrathoracique. Nous rapportons le cas d�une localisation exceptionnelle au niveau du 3eme doigt de la main droite. En l�absence de marqueur specifique l�interpretation de l�immunomarquage depend du contexte histomorphologique. La similitude avec les differents neoplasmes a cellules fusiformes des tissus mous rend le diagnostic de ces tumeurs mesenchymateuses difficile et tardif. Dans 20a 30 % des cas le comportement de la TFS est celui d�une tumeur maligne localement agressive et recidivante, avec des metastases rares et tardives. Ce comportement impose une surveillance prolongee apres exerese chirurgicale.

  12. La police de proximité aux Pays-Bas: le cas de la ville de Haarlem

    NARCIS (Netherlands)

    van der Vijver, Kees

    2000-01-01

    Cet article donne un aperçu des résultats d’une étude de cas approfondie sur la police de proximité, menée entre 1983 et 1986 dans la ville de Haarlem. L’évaluation du dispositif de police par équipes de quartier conclut à des résultats convaincants : baisse du taux de criminalité, du sentiment

  13. Etude du strabisme chez des enfants de 0 à 15 ans suivis a Lubumbashi, République Démocratique du Congo: analyse des aspects épidémiologiques et cliniques

    Science.gov (United States)

    Bienvenu, Yogolelo Asani; Angel, Musau Nkola; Sebastien, Mbuyi Musanzayi; Philippe, Cilundika Mulenga; Léon, Kabamba Ngombe; Eugene, Twite Kabange; Chami, Cham Lubamba; Prosper, Kalenga Muenze Kayamba; Claude, Speeg-Schatz; Gaby, Chenge Borasisi

    2015-01-01

    Introduction Le strabisme est défini comme un syndrome à double composante: motrice et sensorielle. Le but de ce travail est de décrire les aspects épidémiologiques et cliniques du strabisme chez l'enfant congolais de 0 à 15 ans dans la ville de Lubumbashi. Méthodes Il s'agit d'une étude descriptive longitudinale sur les aspects épidémiologiques et cliniques du strabisme chez l'enfant congolais de 0 à 15 ans dans la ville de Lubumbashi entre Décembre 2012 à Décembre 2013. Nous avons recueilli l’âge des patients, leur sexe, leur provenance, le type de strabisme, la réfraction, le fond d'oeil, les antécédents (hérédité) ainsi que le type de la déviation strabique observé sur 70 patients. Résultats Nous avons observé 70 cas de strabisme manifeste dont 31 cas (44,28%) étaient dans la tranche d’âge comprise entre 0 et 5 ans. L’âge moyen de nos patients était de 6,7 ans avec une prédominance du sexe féminin, soit 51,42%. Le strabisme était convergent dans 65,71%, divergent dans 30%, et vertical dans 4,28%. Les ésotropies représentaient 65 cas (92,85%), quatre cas (5,71%) avaient un antécédent familial de strabisme au premier degré de parenté, 21 cas (30%) au second degré de parenté, 45 cas (64,28%) n'avaient pas cet antécédent. L'oeil gauche était le plus dominé dans 30% des cas. Les facteurs favorisant le strabisme étaient inconnus dans 54 cas (77,14%). Le strabisme était secondaire à l'hypermétropie chez 32 patients (42,71%). Conclusion La fréquence du strabisme dans la ville de Lubumbashi chez les enfants âgés de 0 à 15 ans est de 0,50%. Comme dans la plupart des études sur le strabisme de l'enfant, c'est l’ésotropie qui est la déviation la plus commune. PMID:26834919

  14. Directional R-Loop Formation by the CRISPR-Cas Surveillance Complex Cascade Provides Efficient Off-Target Site Rejection

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Marius Rutkauskas

    2015-03-01

    Full Text Available CRISPR-Cas systems provide bacteria and archaea with adaptive immunity against foreign nucleic acids. In type I CRISPR-Cas systems, invading DNA is detected by a large ribonucleoprotein surveillance complex called Cascade. The crRNA component of Cascade is used to recognize target sites in foreign DNA (protospacers by formation of an R-loop driven by base-pairing complementarity. Using single-molecule supercoiling experiments with near base-pair resolution, we probe here the mechanism of R-loop formation and detect short-lived R-loop intermediates on off-target sites bearing single mismatches. We show that R-loops propagate directionally starting from the protospacer-adjacent motif (PAM. Upon reaching a mismatch, R-loop propagation stalls and collapses in a length-dependent manner. This unambiguously demonstrates that directional zipping of the R-loop accomplishes efficient target recognition by rapidly rejecting binding to off-target sites with PAM-proximal mutations. R-loops that reach the protospacer end become locked to license DNA degradation by the auxiliary Cas3 nuclease/helicase without further target verification.

  15. Comparison of Various Nuclear Localization Signal-Fused Cas9 Proteins and Cas9 mRNA for Genome Editing in Zebrafish.

    Science.gov (United States)

    Hu, Peinan; Zhao, Xueying; Zhang, Qinghua; Li, Weiming; Zu, Yao

    2018-03-02

    The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/Cas9 system has been proven to be an efficient and precise genome editing technology in various organisms. However, the gene editing efficiencies of Cas9 proteins with a nuclear localization signal (NLS) fused to different termini and Cas9 mRNA have not been systematically compared. Here, we compared the ability of Cas9 proteins with NLS fused to the N-, C-, or both the N- and C-termini and N-NLS-Cas9-NLS-C mRNA to target two sites in the tyr gene and two sites in the gol gene related to pigmentation in zebrafish. Phenotypic analysis revealed that all types of Cas9 led to hypopigmentation in similar proportions of injected embryos. Genome analysis by T7 Endonuclease I (T7E1) assays demonstrated that all types of Cas9 similarly induced mutagenesis in four target sites. Sequencing results further confirmed that a high frequency of indels occurred in the target sites ( tyr1 > 66%, tyr2 > 73%, gol1 > 50%, and gol2 > 35%), as well as various types (more than six) of indel mutations observed in all four types of Cas9-injected embryos. Furthermore, all types of Cas9 showed efficient targeted mutagenesis on multiplex genome editing, resulting in multiple phenotypes simultaneously. Collectively, we conclude that various NLS-fused Cas9 proteins and Cas9 mRNAs have similar genome editing efficiencies on targeting single or multiple genes, suggesting that the efficiency of CRISPR/Cas9 genome editing is highly dependent on guide RNAs (gRNAs) and gene loci. These findings may help to simplify the selection of Cas9 for gene editing using the CRISPR/Cas9 system. Copyright © 2018 Hu et al.

  16. De quels ingénieurs parle-t-on ? Situation et trajectoires des ingénieurs des grandes écoles. Le cas du Maroc

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Pierre Vermeren

    2009-05-01

    Full Text Available Cet article est consacré au cas des « ingénieurs de conception » marocains, formés la plupart du temps dans les grandes écoles françaises. Cette fraction des ingénieurs marocains (dont la majorité est formée dans les écoles d'ingénieurs du Maroc n'est pas loin de constituer une véritable aristocratie de fonction. Ce phénomène illustre la structure sociale très inégalitaire du Maroc et la stratification opérée par la monarchie (le Makhzen pour sélectionner ses élites, qui sont aujourd'hui des élites à la fois technocratiques et sociales. Cette domination des « technocrates » sur l'appareil d'Etat marocain, analysée ici à travers des publics étudiants de grandes écoles, s'accompagne de l'émergence d'une contre-élite sociale de contestation. Les écoles d'ingénieurs de second rang, peuplées par les éléments des classes moyennes, ont été le premier terreau des mouvements islamistes en milieu universitaire. Elles produisent aujourd'hui une contre-élite politique et sociale qui piétine aux portes du vrai pouvoir.

  17. Le mal de Pott: à propos de 82 cas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Badr Fedoul

    2011-03-01

    Full Text Available Nous rapportant dans cette étude, les résultats de l’expérience du service de neurochirurgie du CHU Hassan II de Fès dans la prise en charge du mal de pott dans la région de Fès. Il s’agit d’une étude rétrospective de quatre-vingt-deux cas; étalée sur une période de cinq ans (janvier 2002 au décembre 2006. L’objectif de ce travail était d’illustrer les différents aspects épidémiologiques, diagnostiques et thérapeutiques de la localisation vertébrale de la tuberculose dans notre pratique. L'âge moyen de nos patients était de 43,1 ans, avec une légère prédominance féminine (53,82%. La durée d'évolution de la maladie était longue (dix mois en moyenne; ceci est expliquée par la symptomatologie initiale insidieuse faite de rachialgies (98,78% et une admission des patients au stade de complications neurologiques (41,46%. La radiographie standard était réalisée chez tous nos patients, et complétée par la TDM dans 86.58% des cas ce qui a permis de déceler la prédominance de l'atteinte dorsale et lombaire. L'IRM est l'examen de choix, elle était demandée chez tous les malades déficitaires (37,8%.Tous nos patients ont bénéficié d'un traitement antibacillaire associé à une immobilisation du foyer pottique. Une décompression par voie antérieure était réalisée chez 29 patients (35,36 %; alors que la laminectomie n'était pratiquée que chez 5 patients (6.09 %, tandis que l'évacuation de l'abcès de psoas était réalisée chez 25 patients (30,48 %. Le diagnostic de certitude histologique était posé dans 51 cas (62,19%. Les meilleurs résultats étaient obtenus chez les malades opérés par voie antérieure, 26 cas (89,65% de récupération totale et 3 cas (10,34% partielle. L'évolution vers la consolidation et la fusion vertébrale était la règle chez tous nos malades et ceci au bout de 4 à 18 mois après le traitement.

  18. Le lobe pulmonaire azygos: description anatomique d'un cas et ...

    African Journals Online (AJOL)

    Le lobe pulmonaire azygos: description anatomique d'un cas et revue de la ... de la veine azygos qui cravate anormalement le lobe supérieur du poumon droit. ... fortuite chez un homme de 69 ans souffrant d'un cancer broncho-pulmonaire.

  19. La Greffe de Peau dans le Traitement des Sequelles de la Main Brulee. A Propos de 152 Cas - Experience du Service de Chirurgie Plastique du Centre Hospitalier Universitaire Ibn-Sina, Rabat, Maroc

    Science.gov (United States)

    El Mazouz, S.; Fejjal, N.; Hafidi, J.; Cherkab, L.; Mejjati, H.; Belfqih, R.; Gharib, N.; Abbassi, A.

    2010-01-01

    Summary La main est fréquemment exposée aux brûlures, entraînant des séquelles esthétiques et fonctionnelles. Le traitement de ces séquelles est surtout chirurgical et consiste en la greffe de peau, dont le type dépend de la localisation de la brûlure et du type des séquelles. Dans ce travail rétrospectif, nous rapportons une série de 152 cas de brûlures des mains colligés au service de chirurgie plastique du Centre Hospitalier Universitaire Ibn-Sina de Rabat sur une période de dix ans, allant de 1998 à 2007. Les indications thérapeutiques dépendent du type de séquelles et de la localisation de la brûlure. En tout, 97 patients ont bénéficié d'une greffe cutanée, dont 76% par greffe de peau totale, 21% par greffe de peau demi-épaisse et 3% par peau fine. Les séquelles des brûlures des mains posent un problème thérapeutique majeur, malgré la diversité des procédés chirurgicaux, d'où l'intérêt de la prévention. PMID:21991196

  20. Dedicated Caravan Sites for French Gens du Voyage: Public Health Policy or Construction of Health and Environmental Inequalities?

    Science.gov (United States)

    Foisneau, Lise

    2017-12-01

    In France, gens du voyage ("people who travel" or "travellers") is a term used by the government to categorize various itinerant populations, the majority of which are diverse Romani groups. People categorized as gens du voyage are legally required to reside in particular locations called "dedicated caravan sites." Parliamentary debates about these dedicated caravan sites have clarified that one of the objectives of such sites is to help fulfill the gens du voyage 's right to health. However, there is a significant gap between the officially stated goals of such sites and the reality of life within them. This paper draws on research finding that the conditions in most dedicated caravan sites do not conform with the rights of gens du voyage to acceptable sanitary conditions and other underlying determinants of health.

  1. An alternative for cost-effective remediation of depleted uranium (DU) at certain environmental restoration sites.

    Science.gov (United States)

    Miller, M; Galloway, B; VanDerpoel, G; Johnson, E; Copland, J; Salazar, M

    2000-02-01

    Numerous sites in the United States and around the world are contaminated with depleted uranium (DU) in various forms. A prevalent form is fragmented DU originating from various scientific tests involving high explosives and DU during weapon development programs, at firing practice ranges, or war theaters where DU was used in armor-piercing projectiles. The contamination at these sites is typically very heterogeneous, with discreet, visually identifiable DU fragments mixed with native soil. That is, the bulk-averaged DU activity is quite low, while specific DU fragments, which are distinct from the soil matrix, have much higher specific activity. DU is best known as a dark, black metal that is nearly twice as dense as lead, but DU in the environment readily weathers (oxidizes) to a distinctive bright yellow color that is readily visible. While the specific activity (amount of radioactivity per mass of soil) of DU is relatively low and presents only a minor radiological hazard, the fact that it is radioactive and visually identifiable makes it desirable to remove the DU "contamination" from the environment. The typical approach to conducting this DU remediation is to use radiation detection instruments to identify the contaminant and separate it from the adjacent soil, packaging it for disposal as radioactive waste. This process can be performed manually or by specialized, automated equipment. Alternatively, in certain situations a more cost-effective approach might be simple mechanical or gravimetric separation of the DU fragments from the host soil matrix. At SNL/NM, both the automated and simple mechanical approaches have recently been employed. This paper discusses the pros/cons of the two approaches.

  2. Card sorting, test d’oculométrie et test d’utilisabilité sur le site web du Service d’information scientifique du CERN

    CERN Document Server

    Marchand, Alizée; Schneider, René

    Ce travail de Bachelor a pour objectif l’évaluation du site web du Service d’information scientifique du CERN. Cette évaluation est basée sur les méthodes utilisées en User Centered Design (UCD). Pour effectuer cette évaluation, nous avons sélectionné trois tests : un card sorting, un test d’oculométrie et un test d’utilisabilité. Selon la norme ISO 9241-11 :1998, l’utilisabilité se définit par « le degré selon lequel un produit peut être utilisé, par des utilisateurs identifiés, pour atteindre les buts définis avec efficacité, efficience et satisfaction, dans un contexte d’utilisation spécifié ». Les tests que nous avons réalisés nous ont permis d’identifier les problèmes d’utilisabilité du site du Service, en nous appuyant sur les caractéristiques d’utilisabilité définies dans cette norme. Pour ce faire, nous avons élaboré les tests en nous basant sur les pratiques utilisées par les spécialistes en UCD. Nous avons ensuite proposé à des employés du CERN, ...

  3. Accouchement par césarienne et mortalité maternelle du postpartum

    OpenAIRE

    Deneux-Tharaux , Catherine; Carmona , Elodie; Bouvier-Colle , Marie-Hélène; Bréart , Gérard

    2006-01-01

    Objectifs Une augmentation continue du taux d'accouchements par césarienne (CS)est observée dans la plupart des pays depuis 20 ans. Cette évolution a suscité l'émergence d'un débat controversé sur les risques et les bénéfices associés à la CS. L'objectif de cette étude était d'estimer le risque de mort maternelle du postpartum lié directement à la CS par comparaison à l'accouchement par voie basse, globalement et en distinguant les CS pre- ou intra- partum . Méthode Etude cas/témoins. Les cas...

  4. Etude des facteurs de risque du retard de croissance intra-utérin à Lubumbashi

    Science.gov (United States)

    Moyambe, Jules Ngwe Thaba; Bernard, Pierre; Khang'Mate, Faustin; Nkoy, Albert Mwembo Tambwe A; Mukalenge, Faustin Chenge; Makanda, Daudet; Twite, Eugene; Ndudula, Arthur Munkana; Lubamba, Cham; Kadingi, Arnauld Kabulu; Kayomb, Mutach; Kayamba, Prosper Kalenga Muenze

    2013-01-01

    Introduction Dans notre milieu, il n'existe aucune politique de prévention du Retard de Croissance Intra-Utérin (RCIU) clairement défini. L'objectif de ce travail était d'identifier les facteurs de risque de RCIU afin de proposer une stratégie de lutte contre cette pathologie en agissant surtout sur des facteurs pouvant faire l'objet d'une action préventive. Méthodes Une étude cas-témoins a été menée dans 11 centres hospitaliers de Lubumbashi en République Démocratique du Congo, de Janvier 2010 à Juin 2011, dans le but d'identifier les facteurs de risque du retard de croissance intra-utérin (RCIU). Au total 420 gestantes (cas et témoins) avec grossesse monofoetale d'au moins 24 semaines d'aménorrhée ont été inclues dans l'étude. Les cas correspondaient aux gestantes dont le poids du fœtus était resté inférieur au 10 eme percentile des courbes de référence d'Alexander, après 2 échographies successives réalisées à intervalle de 4 semaines. Les témoins correspondaient aux gestantes dont le poids du fœtus était supérieur ou égal au 10 eme percentile de mêmes courbes. A chaque cas a été apparié un témoin de même parité porteur d'une grossesse de même âge. Résultats L'analyse univariée a identifié comme facteurs de risque: la taille maternelle. Conclusion L'amélioration du niveau socio-économique des populations, la lutte contre le paludisme et les consultations prénatales mieux organisées couplées à une meilleure éducation sanitaire et nutritionnelle peuvent contribuer sensiblement à la réduction de la fréquence du RCIU à Lubumbashi. PMID:23504392

  5. Webzzle : paradoxal confort du confinement.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Marc Dumont

    2007-06-01

    Full Text Available La plupart des agences de « news » technologiques viennent de se faire l’écho du développement de Webzzle , un nouveau moteur de recherche dit « collaboratif ». Ce cas est tout à fait intéressant parce qu’il permet de pointer rapidement quelques grands enjeux du Web 2 que risquent souvent de dissimuler la jungle sémantique et l’enthousiasme qui l’entourent. Pour quelles raisons ? Rappelons d’abord les deux principales perspectives ouvertes par cette nouvelle ...

  6. Maladie de hodgkin a propos de 40 cas colliges a l'hopital national ...

    African Journals Online (AJOL)

    Journal de la Recherche Scientifique de l'Université de Lomé. Journal Home ... La sérologie VIH était positive dans 5,60% des cas. A l'imagerie, le ... Le diagnostic était souvent réalisé à un stade avancé de la maladie. L'extension de la maladie est sous-estimée du fait de l'insuffisance du plateau technique. Mots clés ...

  7. Construire la capacité de recherche parlementaire : le cas du ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    Le projet devrait permettre d'assurer la formation d'au moins 30 députés et de 30 employés parlementaires de l'État Shan, ainsi que de 20 représentants des deux organisations de la société civile. Projet nᵒ. 108572. État du projet. Actif. Durée. 12 mois. Agent(e) responsable du CRDI. Edgard Rodriguez. Financement total.

  8. Participation des médecins généralistes de la province de Benimellal (Maroc) dans le dépistage du cancer du col

    Science.gov (United States)

    Nani, Samira; Benallal, Mohamed; Hassoune, Samira; Kissi, Dounia; Maaroufi, Abderrahmane

    2013-01-01

    Introduction Au Maroc, chaque année il y aurait environ 2000 nouveaux cas de cancer du col et les 2/3 des cas sont pris en charge à un stade très avancé. Nous avons mené une étude transversale, exhaustive incluant les 71 médecins généralistes exerçant dans les établissements de soins de santé de base du secteur public et privé de la province de Benimellal. Le but était d’évaluer leurs connaissances et leur participation au dépistage du cancer du col. Méthodes Nous avons mené une étude transversale, exhaustive incluant les 71 médecins généralistes exerçant dans les établissements de soins de santé de base du secteur public et privé de la province de Benimellal. Le but était d’évaluer leurs connaissances et leur participation au dépistage du cancer du col. Résultats Le niveau de connaissance était relativement modeste, 22 médecins généraliste avaient répondu à la question sur l'incidence du cancer du col au Maroc, Parmi eux (81,8%) avaient donné une réponse incorrecte. L'Herpes Papilloma virus comme facteur de risque du cancer du col a été identifié par seulement 21% des médecins généralistes. La participation au dépistage était également défaillante, 92,8% n'avaient jamais pratiqué le FCV chez leurs patientes à cause principalement du manque de formation (95,5%). Conclusion Les résultats montrent la nécessité d'améliorer les connaissances théoriques et pratique des médecins généralistes concernant le dépistage du cancer du col. PMID:23785557

  9. Mise à jour sur le nouveau vaccin 9-valent pour la prévention du virus du papillome humain

    Science.gov (United States)

    Yang, David Yi; Bracken, Keyna

    2016-01-01

    Résumé Objectif Informer les médecins de famille quant à l’efficacité, à l’innocuité, aux effets sur la santé publique et à la rentabilité du vaccin 9-valent contre le virus du papillome humain (VPH). Qualité des données Des articles pertinents publiés dans PubMed jusqu’en mai 2015 ont été examinés et analysés. La plupart des données citées sont de niveau I (essais randomisés et contrôlés et méta-analyses) ou de niveau II (études transversales, cas-témoins et épidémiologiques). Des rapports et recommandations du gouvernement sont aussi cités en référence. Message principal Le vaccin 9-valent contre le VPH, qui offre une protection contre les types 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52 et 58 du VPH, est sûr et efficace et réduira encore plus l’incidence des infections à VPH, de même que les cas de cancer lié au VPH. Il peut également protéger indirectement les personnes non immunisées par l’entremise du phénomène d’immunité collective. Un programme d’immunisation efficace peut prévenir la plupart des cancers du col de l’utérus. Les analyses montrent que la rentabilité du vaccin 9-valent chez les femmes est comparable à celle du vaccin quadrivalent original contre le VPH (qui protège contre les types 6, 11, 16 et 18 du VPH) en usage à l’heure actuelle. Toutefois, il faut investiguer plus en profondeur l’utilité d’immuniser les garçons avec le vaccin 9-valent contre le VPH. Conclusion en plus d’être sûr, le vaccin 9-valent protège mieux contre le VPH que le vaccin quadrivalent. Une analyse coûtefficacité en favorise l’emploi, du moins chez les adolescentes. Ainsi, les médecins devraient recommander le vaccin 9-valent à leurs patients plutôt que le vaccin quadrivalent contre le VPH.

  10. Les masques trompeurs de la bipolarité: étude de 100 cas

    Science.gov (United States)

    Nabih, Fadoua Oueriagli; Benali, Abdesslam; Adali, Imane; Manoudi, Fatiha; Asri, Fatima

    2015-01-01

    Le trouble bipolaire (TB) est une pathologie dont la prévalence est estimée à 1-2%. Le diagnostic précoce du trouble constitue un enjeu thérapeutique majeur. L'objectif de ce travail est de déterminer les différents diagnostiques attribués aux patients bipolaires avant de recevoir le diagnostic adéquat et de préciser le délai moyen du retard diagnostique. C'est une étude descriptive transversale portant sur 100 patients atteints de TB, inclus selon les critères du DSM V, qui ont été vus en consultation ou bien hospitalisés dans le service de psychiatrie de l'hôpital Militaire Avicenne de Marrakech, durant une période de deux ans. L’âge moyen des patients était de 29,5 ans avec une prédominance masculine (80%). 40% de nos patients ont reçu au début un autre diagnostic que celui du TB et le premier diagnostic retenu était celui de l’épisode dépressif majeur dans 36% des cas, suivi de l'accès psychotique aigu dans 28% des cas, la schizophrénie dans 16,8% et le trouble de personnalité dans 10,2%. Le délai moyen du retard diagnostic était de 64 mois. 50% des patients ayant reçu un autre diagnostic avaient consulté au moins un psychiatre et 60% des patients avaient été hospitalisés au moins une fois avant le diagnostic du TB. Les errances diagnostiques du TB sont bien établies, conduisant forcément à un retard de prise en charge adéquate. Ces données devraient alerter les psychiatres pour favoriser un meilleur dépistage de la manie et de l'hypomanie qui restent les éléments clé du diagnostic du TB. PMID:26587161

  11. Compréhension des mécanismes de séchage dans les matériaux de construction : cas du plâtre

    OpenAIRE

    SECK, Mamadou Diaga

    2015-01-01

    Les enjeux liés aux problématiques de développement durable encouragent de plus en plus d'industriels, dans le secteur du bâtiment, à se lancer dans une politique de réduction de la consommation énergétique de leurs procédés industriels. C'est dans ce cadre qu'est menée cette étude, où nous nous intéressons au cas particulier de la fabrication des plaques de plâtre, qui de par les qualités qu'elles présentent liées à leur caractère pratique et rapide à poser (temps pour le neuf que la rénovat...

  12. CRISPR-Cas9 Structures and Mechanisms.

    Science.gov (United States)

    Jiang, Fuguo; Doudna, Jennifer A

    2017-05-22

    Many bacterial clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-CRISPR-associated (Cas) systems employ the dual RNA-guided DNA endonuclease Cas9 to defend against invading phages and conjugative plasmids by introducing site-specific double-stranded breaks in target DNA. Target recognition strictly requires the presence of a short protospacer adjacent motif (PAM) flanking the target site, and subsequent R-loop formation and strand scission are driven by complementary base pairing between the guide RNA and target DNA, Cas9-DNA interactions, and associated conformational changes. The use of CRISPR-Cas9 as an RNA-programmable DNA targeting and editing platform is simplified by a synthetic single-guide RNA (sgRNA) mimicking the natural dual trans-activating CRISPR RNA (tracrRNA)-CRISPR RNA (crRNA) structure. This review aims to provide an in-depth mechanistic and structural understanding of Cas9-mediated RNA-guided DNA targeting and cleavage. Molecular insights from biochemical and structural studies provide a framework for rational engineering aimed at altering catalytic function, guide RNA specificity, and PAM requirements and reducing off-target activity for the development of Cas9-based therapies against genetic diseases.

  13. Quels sont les obstacles au développement de la dématérialisation dans le secteur médical public à l’ère du numérique et de la quête du zéro papier ? Étude de cas de l’établissement hospitalier Ali Ait Idir d’Alger

    OpenAIRE

    Bitat, Aida

    2017-01-01

    Les technologies de l’information et de la communication rencontrent un vif engouement dans pratiquement tous les secteurs d’activité, ce qui a conduit à un changement significatif dans les modes de communication et de travail, c’est notamment le cas pour le secteur de la santé qui est fortement bénéficiaire de la dématérialisation de ses processus. Une réorganisation, ainsi qu’une formation continue du personnel en faveur du développement et de l’intégration des nouvelles technologies de l’i...

  14. Mettre l'emploi au coeur des priorités au Mexique : étude de cas ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    Depuis quelques années, on se préoccupe de plus en plus, dans de nombreux pays et sur la scène internationale, du chômage et du sous-emploi ainsi que des répercussions de l'emploi sur le bien-être, l'inclusion sociale et la stabilité politique. Ce projet produira une étude de cas pour le Rapport sur le développement ...

  15. Evaluation du niveau de connaissance des patients sur la gestion du traitement par les antis vitamines K dans le service de cardiologie de Ouagadougou

    Science.gov (United States)

    Samadoulougou, André; Temoua Naibe, Dangwé; Mandi, Germain; Yameogo, Relwendé Aristide; Kabore, Elisé; Millogo, Georges; Yameogo, Nobila Valentin; Kologo, Jonas Koudougou; Thiam/Tall, Anna; Toguyeni, Boubacar Jean Yves; Zabsonre, Patrice

    2014-01-01

    Introduction Les antivitamines K (AVK), traitement anticoagulant oral le plus largement prescrit, posent un réel problème de santé publique du fait de leur risque iatrogène. L'objectif de cette étude était de préciser le niveau de connaissance des patients sur la gestion de leur traitement par les AVK. Méthodes Il s'est agi d'une enquête transversale descriptive réalisée au CHU-Yalgado Ouédraogo, sur une période de 03 mois : du 1er mars au 31 mai 2012. Un questionnaire a été administré aux patients bénéficiant d'un traitement AVK depuis au moins un mois. Résultats Soixante-dix patients ont été inclus dans l'étude dont 30 hommes. L'âge moyen était de 49 ans ± 16 ans. Les cardiopathies et la maladie thromboembolique veineuse justifiant l'institution du traitement AVK étaient retrouvées respectivement dans 58,6% et 41,4% des cas. Le nom de l'AVK et la raison exacte du traitement étaient connus respectivement dans 91,4% et 67,1% des cas. Plus de la moitié des patients (68,6%) savaient que les AVK rendaient le sang plus fluide. Quarante-six patients (65,7%) citaient l'INR comme examen biologique de surveillance du traitement et seulement 28 patients (40%) connaissaient les valeurs cibles. La majorité des patients ne connaissait pas les risques encourus en cas de surdosage (72,8%) et de sous-dosage (71,4%). Une automédication par anti-inflammatoire non stéroïdien était signalée par 18 patients (25,7%). Les choux (74,3%) et la laitue (62,9%), aliments à consommer avec modération, étaient les plus cités. Conclusion Les connaissances des patients sur la gestion des AVK étaient fragmentaires et insuffisantes pour assurer la sécurité et l'efficacité du traitement. La création d'un programme d'éducation thérapeutique sur les AVK s'avère alors nécessaire. PMID:25870741

  16. Le discours rappporté comme effet de montage du discours citant et du segment citationnel. Contribution à l’étude du discours journalistique

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Biardzka Elżbieta

    2012-07-01

    Full Text Available Dans notre étude, nous nous proposons un vaste retour aux données empiriques qui nous permettra de repérer et de décrire un dispositif sémantico-énonciatif et grammatical qui est à l'origine de la prolifération de pratiques du discours rapporté (désormais DR, codifiées et non codifiées, particulièrement répandues dans la presse écrite. Nous avons calculé nos résultats de recherche sur l'analyse d'un corpus journalistique d'à peu près 1500 exemples. Nous considérons le DR comme une séquence textuelle binaire, embrassant deux segments: le discours citant (DC qui verbalise les données situationnelles de l'énonciation primaire, et le segment citationnel (Cit qui représente les paroles. Compris de la sorte, le DR peut se figurer sous l'équation suivante: DR= DC + Cit. Nous envisageons le DC et la Cit comme des sortes de briques, mettons comme des Lego, qui entrent dans plusieurs combinaisons possibles pour donner naissance aux séquences du DR. Pour étudier le mécanisme qui les engendre, nous inventorions et décrivons les propriétés formelles et sémantico-énonciatives des segments DC et Cit. L'inventaire des formes grammaticales que peut revêtir le DC embrasse 6 cas de figures: la phrase introductive, la phrase complète, l'interrogation, l'incise, les syntagmes en "selon A", ensuite d'autres syntagmes, comme les syntagmes nominaux, adjectivaux, représentant des cas de différentes "incomplétudes" formelles et de réductions. La Citation, terme générique dans notre étude, recouvre trois types d'occurrences: les Citations reproductions, les Citations reformulations et les Citations mixtes. Les relations syntaxiques entres les deux segments du DR dépendent de la forme du DC et se définissent par deux cas de figure. Soit le journaliste rapporte les paroles de différentes personnes sans les assimiler à la syntaxe de son propre énoncé (combinatoire libre, soit il les intègre dans son discours conformément aux

  17. Programmable RNA recognition and cleavage by CRISPR/Cas9.

    Science.gov (United States)

    O'Connell, Mitchell R; Oakes, Benjamin L; Sternberg, Samuel H; East-Seletsky, Alexandra; Kaplan, Matias; Doudna, Jennifer A

    2014-12-11

    The CRISPR-associated protein Cas9 is an RNA-guided DNA endonuclease that uses RNA-DNA complementarity to identify target sites for sequence-specific double-stranded DNA (dsDNA) cleavage. In its native context, Cas9 acts on DNA substrates exclusively because both binding and catalysis require recognition of a short DNA sequence, known as the protospacer adjacent motif (PAM), next to and on the strand opposite the twenty-nucleotide target site in dsDNA. Cas9 has proven to be a versatile tool for genome engineering and gene regulation in a large range of prokaryotic and eukaryotic cell types, and in whole organisms, but it has been thought to be incapable of targeting RNA. Here we show that Cas9 binds with high affinity to single-stranded RNA (ssRNA) targets matching the Cas9-associated guide RNA sequence when the PAM is presented in trans as a separate DNA oligonucleotide. Furthermore, PAM-presenting oligonucleotides (PAMmers) stimulate site-specific endonucleolytic cleavage of ssRNA targets, similar to PAM-mediated stimulation of Cas9-catalysed DNA cleavage. Using specially designed PAMmers, Cas9 can be specifically directed to bind or cut RNA targets while avoiding corresponding DNA sequences, and we demonstrate that this strategy enables the isolation of a specific endogenous messenger RNA from cells. These results reveal a fundamental connection between PAM binding and substrate selection by Cas9, and highlight the utility of Cas9 for programmable transcript recognition without the need for tags.

  18. Identification of genomic sites for CRISPR/Cas9-based genome editing in the Vitis vinifera genome

    Science.gov (United States)

    CRISPR/Cas9 has been recently demonstrated as an effective and popular genome editing tool for modifying genomes of human, animals, microorganisms, and plants. Success of such genome editing is highly dependent on the availability of suitable target sites in the genomes to be edited. Many specific t...

  19. CAS course on Power Converters in Baden, Switzerland

    CERN Multimedia

    CERN Accelerator School

    2014-01-01

    The CERN Accelerator School (CAS) and the Paul Scherrer Institute (PSI) recently organised a specialised course on Power Converters, which was held at the Hotel du Parc in Baden, Switzerland from 7 to 14 May 2014.   Photo courtesy of Markus Fischer, Paul Scherrer Institut. Following some recapitulation lectures on accelerators and the requirements on power converters, the course covered a wide range of topics related to the different types of power converters needed for particle accelerators. Topical seminars completed the programme. The course was very successful, attended by 84 students representing 21 nationalities, mostly from European countries but also from America, Brazil, Canada, China, Iran, Jordan and Thailand. Feedback from the participants was very positive, reflecting the high standard of the lectures and teaching. In addition to the academic programme, the participants also had an opportunity to take part in a full-day site visit to ABB and PSI and an excursion to the Rhine Fall...

  20. Incidence du cancer au Canada : tendances et projections (1983-2032

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Lin Xie

    2015-01-01

    Full Text Available Dans cette monographie, nous présentons, pour 1983 à 2032, un historique et des projections du nombre de nouveaux cas et des taux d'incidence du cancer pour le Canada, à l'exception des cancers de la peau autres que le mélanome (c.-à -d. les carcinomes basocellulaire et spinocellulaire. Ces renseignements visent à faciliter la planification stratégique et l'affectation de ressources et d'infrastructures pour assurer la prestation future de soins de santé et de mesures de lutte contre le cancer. Évolution projetée des taux d'incidence de cancer : De 2003-2007 à 2028-2032, les taux d'incidence normalisés selon l'âge (TINA pour l'ensemble des cancers devraient diminuer de 5 % pour les Canadiens, passant de 464,8 à 443,2 pour 100 000 habitants, et augmenter de 4 % pour les Canadiennes, passant de 358,3 à 371,0 pour 100 000 habitants. La diminution globale des taux de cancer chez les hommes sera le résultat de la baisse des taux de cancer du poumon chez les hommes de 65 ans et plus et des taux de cancer de la prostate chez les hommes de 75 ans et plus. L'augmentation globale des taux de cancer chez les femmes correspond à la hausse prévue des taux de cancer du poumon chez les femmes de 65 ans et plus. Elle représente également la hausse prévue des cas de cancer de l'utérus, de la thyroïde, du sein (chez les femmes de moins de 45 ans, du rein et du pancréas ainsi que des cas de leucémie et de mélanome. Parmi les changements les plus importants dans les TINA projetés sur un horizon de 25 ans, mentionnons une augmentation du nombre de cas de cancer de la thyroïde (55 % chez les hommes et 65 % chez les femmes et de cancer du foie chez les hommes (43 %, et une diminution du nombre de cas de cancer du larynx (47 % chez les hommes et 59 % chez les femmes, de cancer du poumon chez les hommes (34 % et de cancer de l'estomac (30 % chez les hommes et 24 % chez les femmes. Le taux d'incidence du cancer du poumon chez les femmes

  1. Engineered CRISPR-Cas9 nucleases with altered PAM specificities.

    Science.gov (United States)

    Kleinstiver, Benjamin P; Prew, Michelle S; Tsai, Shengdar Q; Topkar, Ved V; Nguyen, Nhu T; Zheng, Zongli; Gonzales, Andrew P W; Li, Zhuyun; Peterson, Randall T; Yeh, Jing-Ruey Joanna; Aryee, Martin J; Joung, J Keith

    2015-07-23

    Although CRISPR-Cas9 nucleases are widely used for genome editing, the range of sequences that Cas9 can recognize is constrained by the need for a specific protospacer adjacent motif (PAM). As a result, it can often be difficult to target double-stranded breaks (DSBs) with the precision that is necessary for various genome-editing applications. The ability to engineer Cas9 derivatives with purposefully altered PAM specificities would address this limitation. Here we show that the commonly used Streptococcus pyogenes Cas9 (SpCas9) can be modified to recognize alternative PAM sequences using structural information, bacterial selection-based directed evolution, and combinatorial design. These altered PAM specificity variants enable robust editing of endogenous gene sites in zebrafish and human cells not currently targetable by wild-type SpCas9, and their genome-wide specificities are comparable to wild-type SpCas9 as judged by GUIDE-seq analysis. In addition, we identify and characterize another SpCas9 variant that exhibits improved specificity in human cells, possessing better discrimination against off-target sites with non-canonical NAG and NGA PAMs and/or mismatched spacers. We also find that two smaller-size Cas9 orthologues, Streptococcus thermophilus Cas9 (St1Cas9) and Staphylococcus aureus Cas9 (SaCas9), function efficiently in the bacterial selection systems and in human cells, suggesting that our engineering strategies could be extended to Cas9s from other species. Our findings provide broadly useful SpCas9 variants and, more importantly, establish the feasibility of engineering a wide range of Cas9s with altered and improved PAM specificities.

  2. All-in-One CRISPR-Cas9/FokI-dCas9 Vector-Mediated Multiplex Genome Engineering in Cultured Cells.

    Science.gov (United States)

    Sakuma, Tetsushi; Sakamoto, Takuya; Yamamoto, Takashi

    2017-01-01

    CRISPR-Cas9 enables highly convenient multiplex genome engineering in cultured cells, because it utilizes generic Cas9 nuclease and an easily customizable single-guide RNA (sgRNA) for site-specific DNA double-strand break induction. We previously established a multiplex CRISPR-Cas9 assembly system for constructing an all-in-one vector simultaneously expressing multiple sgRNAs and Cas9 nuclease or other Cas9 variants including FokI-dCas9, which supersedes the wild-type Cas9 with regard to high specificity. In this chapter, we describe a streamlined protocol to design and construct multiplex CRISPR-Cas9 or FokI-dCas9 vectors, to introduce them into cultured cells by lipofection or electroporation, to enrich the genomically edited cells with a transient puromycin selection, to validate the mutation efficiency by Surveyor nuclease assay, and to perform off-target analyses. We show that our protocol enables highly efficient multiplex genome engineering even in hard-to-transfect HepG2 cells.

  3. Gestion communautaire des ressources naturelles au Bénin (Afrique de l’Ouest : le cas de la vallée du Sitatunga

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Pricette Dovonou-Vinagbè

    2009-09-01

    Full Text Available Le Bénin, pays de l’Afrique de l’Ouest est confronté à la destruction des terres humides particulièrement dans la partie sud du pays. Les terres humides riches biodiversité sont importantes tant pour les humains que pour milieu naturel. La menace la plus importante est la pression du anthropique. Même si ce territoire est reconnu par la Convention Ramsar, la destruction continue. En 1995 le gouvernement a décidé de créer une aire de gestion communautaire pour ces territoires. L’objectif de  cette recherche est de comprendre les grands défis liés à la mise en œuvre de la gestion communautaire des milieux humides à travers une étude de cas, en l’occurrence celui de la vallée du Sitatunga. Pour atteindre cet objectif, un séjour de 3 mois a été effectué sur le site. Des entrevues semi-dirigées ont été alors réalisées. Les résultats montrent que la vallée du Sitatunga est considérée comme inutile voire nuisible par les populations riveraines rencontrées dans le cadre de l’étude, qui sont davantage préoccupées à se sortir de leur état de pauvreté. Les traditions et valeurs autrefois attribuées à la conservation des milieux humides ont quasiment disparues et l’individualisme est grandissant. Il importe de tenir compte de tous ces facteurs pour espérer véritablement préserver ces milieux. D’un autre côté, parlant de gestion de l’environnement et plus particulièrement de gestion des milieux humides à l’échelle béninoise, le constat n’est pas reluisant. En effet, l’État étant donné son état de sous-développement et donc de manque de ressources, à du mal à coordonner ces activités. Il est de même pour les ONG. La situation est accentuée par l’état des relations entre ONG et structures de l’État qui se considèrent davantage comme des adversaires que comme des partenaires ce qui affecte l’efficacité des activités menées. Pour que la gestion communautaire devienne une

  4. Caractérisation de la variabilité climatique : cas du bassin versant ...

    African Journals Online (AJOL)

    DK

    anticlinaux plus étroits ... annuels des précipitations, est que, du point de vue stochastique, ceux-ci peuvent être considérés comme un .... uniforme pour la position du point de rupture la statistique U de Buishand est définie par. Ou: Pour k = 1, ..., N et ...

  5. Single-stranded DNA cleavage by divergent CRISPR-Cas9 enzymes

    Science.gov (United States)

    Ma, Enbo; Harrington, Lucas B.; O’Connell, Mitchell R.; Zhou, Kaihong; Doudna, Jennifer A.

    2015-01-01

    Summary Double-stranded DNA (dsDNA) cleavage by Cas9 is a hallmark of type II CRISPR-Cas immune systems. Cas9–guide RNA complexes recognize 20-base-pair sequences in DNA and generate a site-specific double-strand break, a robust activity harnessed for genome editing. DNA recognition by all studied Cas9 enzymes requires a protospacer adjacent motif (PAM) next to the target site. We show that Cas9 enzymes from evolutionarily divergent bacteria can recognize and cleave single-stranded DNA (ssDNA) by an RNA-guided, PAM-independent recognition mechanism. Comparative analysis shows that in contrast to the type II-A S. pyogenes Cas9 that is widely used for genome engineering, the smaller type II-C Cas9 proteins have limited dsDNA binding and unwinding activity and promiscuous guide-RNA specificity. These results indicate that inefficiency of type II-C Cas9 enzymes for genome editing results from a limited ability to cleave dsDNA, and suggest that ssDNA cleavage was an ancestral function of the Cas9 enzyme family. PMID:26545076

  6. Réduction du risque d'infection par le VIH au Botswana - essais ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    Au Botswana, ce sont les jeunes femmes qui sont le plus touchées par les nouvelles infections par le VIH. Le présent projet a pour but de réduire le nombre de nouveaux cas d'infection par le VIH, en particulier chez les femmes de 15 à 29 ans. Bien que l'on recense des cas de VIH/sida dans la plupart des régions du ...

  7. À « l’ombre du Père » ? L’autorité maternelle dans la première moitié du XVIIIe siècle

    OpenAIRE

    DOYON, Julie

    2007-01-01

    Du renforcement de la « monarchie paternelle » à l’existence d’un « empire des mères », la confrontation des sources du droit civil et des archives criminelles du Châtelet, au premier XVIIIe siècle, donne une vision complexe des rapports noués entre l’expérience de la maternité et l’exercice de l’autorité. Statutairement, les mères légitimes sont associées, sur un mode mineur ou de plein droit dans le cas du veuvage et de l’institution tutélaire, à l’exercice de l’autorité paternelle. Mais en...

  8. Site-directed mutagenesis in Petunia × hybrida protoplast system using direct delivery of purified recombinant Cas9 ribonucleoproteins.

    Science.gov (United States)

    Subburaj, Saminathan; Chung, Sung Jin; Lee, Choongil; Ryu, Seuk-Min; Kim, Duk Hyoung; Kim, Jin-Soo; Bae, Sangsu; Lee, Geung-Joo

    2016-07-01

    Site-directed mutagenesis of nitrate reductase genes using direct delivery of purified Cas9 protein preassembled with guide RNA produces mutations efficiently in Petunia × hybrida protoplast system. The clustered, regularly interspaced, short palindromic repeat (CRISPR)-CRISPR associated endonuclease 9 (CRISPR/Cas9) system has been recently announced as a powerful molecular breeding tool for site-directed mutagenesis in higher plants. Here, we report a site-directed mutagenesis method targeting Petunia nitrate reductase (NR) gene locus. This method could create mutations efficiently using direct delivery of purified Cas9 protein and single guide RNA (sgRNA) into protoplast cells. After transient introduction of RNA-guided endonuclease (RGEN) ribonucleoproteins (RNPs) with different sgRNAs targeting NR genes, mutagenesis at the targeted loci was detected by T7E1 assay and confirmed by targeted deep sequencing. T7E1 assay showed that RGEN RNPs induced site-specific mutations at frequencies ranging from 2.4 to 21 % at four different sites (NR1, 2, 4 and 6) in the PhNR gene locus with average mutation efficiency of 14.9 ± 2.2 %. Targeted deep DNA sequencing revealed mutation rates of 5.3-17.8 % with average mutation rate of 11.5 ± 2 % at the same NR gene target sites in DNA fragments of analyzed protoplast transfectants. Further analysis from targeted deep sequencing showed that the average ratio of deletion to insertion produced collectively by the four NR-RGEN target sites (NR1, 2, 4, and 6) was about 63:37. Our results demonstrated that direct delivery of RGEN RNPs into protoplast cells of Petunia can be exploited as an efficient tool for site-directed mutagenesis of genes or genome editing in plant systems.

  9. 329 Diversité végétale urbaine et estimation du stock de carbone ...

    African Journals Online (AJOL)

    TOSHIBA

    Diversité végétale urbaine et estimation du stock de carbone : cas de la commune du Plateau ... Urban plants diversity and carbon stock estimation: the case of Plateau district. Abidjan, Côte d'Ivoire ..... [15] - R. HOME; C. KELLER; P. NAGEL; N. BAUER et M. HUNZIKER, Selection criteria for flagship species by conservation ...

  10. Closure Report for Corrective Action Unit 107: Low Impact Soil Sites, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    2009-01-01

    Corrective Action Unit (CAU) 107 is identified in the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO) as 'Low Impact Soil Sites' and consists of the following 15 Corrective Action Sites (CASs), located in Areas 1, 2, 3, 4, 5, 9, 10, and 18 of the Nevada Test Site: CAS 01-23-02, Atmospheric Test Site - High Alt; CAS 02-23-02, Contaminated Areas (2); CAS 02-23-03, Contaminated Berm; CAS 02-23-10, Gourd-Amber Contamination Area; CAS 02-23-11, Sappho Contamination Area; CAS 02-23-12, Scuttle Contamination Area; CAS 03-23-24, Seaweed B Contamination Area; CAS 03-23-27, Adze Contamination Area; CAS 03-23-28, Manzanas Contamination Area; CAS 03-23-29, Truchas-Chamisal Contamination Area; CAS 04-23-02, Atmospheric Test Site T4-a; CAS 05-23-06, Atmospheric Test Site; CAS 09-23-06, Mound of Contaminated Soil; CAS 10-23-04, Atmospheric Test Site M-10; and CAS 18-23-02, U-18d Crater (Sulky). Closure activities were conducted from February through April 2009 according to the FFACO (1996; as amended February 2008) and Revision 1 of the Streamlined Approach for Environmental Restoration Plan for CAU 107 (U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office, 2009). The corrective action alternatives included No Further Action and Closure in Place with Administrative Controls. Closure activities are summarized.

  11. Crystal Structure of the Minimal Cas9 from Campylobacter jejuni Reveals the Molecular Diversity in the CRISPR-Cas9 Systems.

    Science.gov (United States)

    Yamada, Mari; Watanabe, Yuto; Gootenberg, Jonathan S; Hirano, Hisato; Ran, F Ann; Nakane, Takanori; Ishitani, Ryuichiro; Zhang, Feng; Nishimasu, Hiroshi; Nureki, Osamu

    2017-03-16

    The RNA-guided endonuclease Cas9 generates a double-strand break at DNA target sites complementary to the guide RNA and has been harnessed for the development of a variety of new technologies, such as genome editing. Here, we report the crystal structures of Campylobacter jejuni Cas9 (CjCas9), one of the smallest Cas9 orthologs, in complex with an sgRNA and its target DNA. The structures provided insights into a minimal Cas9 scaffold and revealed the remarkable mechanistic diversity of the CRISPR-Cas9 systems. The CjCas9 guide RNA contains a triple-helix structure, which is distinct from known RNA triple helices, thereby expanding the natural repertoire of RNA triple helices. Furthermore, unlike the other Cas9 orthologs, CjCas9 contacts the nucleotide sequences in both the target and non-target DNA strands and recognizes the 5'-NNNVRYM-3' as the protospacer-adjacent motif. Collectively, these findings improve our mechanistic understanding of the CRISPR-Cas9 systems and may facilitate Cas9 engineering. Copyright © 2017 Elsevier Inc. All rights reserved.

  12. Mariage non consommé et vaginisme: à propos de trois cas Clinique

    Science.gov (United States)

    2017-01-01

    Le vaginisme est un problème de couple. Il est source de mariages non consommés, d’infertilité et d’altération de la qualité de la relation sexuelle du couple. Par trois cas cliniques illustratifs rapportés de notre pratique clinique quotidienne et suivis sur deux années en consultation du service de psychiatrie de l’Hôpital Militaire Moulay Ismail de Meknès, nous essayons de clarifier les motifs de rencontre pour vaginisme, ses aspects cliniques et relationnels et ses particularités culturelles. PMID:28819482

  13. Evaluation de la prise en charge du paludisme chez les enfants de ...

    African Journals Online (AJOL)

    Devant l'ampleur du paludisme en pays intertropicaux le rôle du personnel soignant dans la réduction de la fréquence des cas de paludisme grave et de son taux de létalité devient évident. Nous avons alors voulu évaluer la qualité de la prise en charge de cette affection chez l'enfant de moins de cinq ans dans un hôpital ...

  14. Evolved Cas9 variants with broad PAM compatibility and high DNA specificity.

    Science.gov (United States)

    Hu, Johnny H; Miller, Shannon M; Geurts, Maarten H; Tang, Weixin; Chen, Liwei; Sun, Ning; Zeina, Christina M; Gao, Xue; Rees, Holly A; Lin, Zhi; Liu, David R

    2018-04-05

    A key limitation of the use of the CRISPR-Cas9 system for genome editing and other applications is the requirement that a protospacer adjacent motif (PAM) be present at the target site. For the most commonly used Cas9 from Streptococcus pyogenes (SpCas9), the required PAM sequence is NGG. No natural or engineered Cas9 variants that have been shown to function efficiently in mammalian cells offer a PAM less restrictive than NGG. Here we use phage-assisted continuous evolution to evolve an expanded PAM SpCas9 variant (xCas9) that can recognize a broad range of PAM sequences including NG, GAA and GAT. The PAM compatibility of xCas9 is the broadest reported, to our knowledge, among Cas9 proteins that are active in mammalian cells, and supports applications in human cells including targeted transcriptional activation, nuclease-mediated gene disruption, and cytidine and adenine base editing. Notably, despite its broadened PAM compatibility, xCas9 has much greater DNA specificity than SpCas9, with substantially lower genome-wide off-target activity at all NGG target sites tested, as well as minimal off-target activity when targeting genomic sites with non-NGG PAMs. These findings expand the DNA targeting scope of CRISPR systems and establish that there is no necessary trade-off between Cas9 editing efficiency, PAM compatibility and DNA specificity.

  15. La police de proximité aux Pays-Bas: le cas de la ville de Haarlem

    OpenAIRE

    van der Vijver, Kees

    2000-01-01

    Cet article donne un aperçu des résultats d’une étude de cas approfondie sur la police de proximité, menée entre 1983 et 1986 dans la ville de Haarlem. L’évaluation du dispositif de police par équipes de quartier conclut à des résultats convaincants : baisse du taux de criminalité, du sentiment d’insécurité et des problèmes de voisinage, amélioration de l’opinion vis-à-vis de la police, accroissement des taux de report de plainte. Ces bons résultats permettent d’étendre par la suite l’expérie...

  16. Tritium enrichment by thermal diffusion. I. Calculation of an installation for measuring natural tritium; Enrichissement du tritium par diffusion thermique. - I. Calcul d'une installation destinee a la mesure du tritium naturel

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Shimizu, M; Ravoire, J [Commissariat a l' Energie Atomique, Centre d' Etudes Nucleaires de Saclay, 91 - Gif-sur-Yvette (France)

    1966-07-01

    The natural content of tritium is so low that its measurement generally requires a preliminary enrichment. The thermal diffusion on hydrogen is studied as an enrichment method. The installation studied comprises two stages of columns of the hot-wire type, together with a device for transferring the tritium from the water sample into the hydrogen in the columns using catalytic exchange. A complete mathematical treatment for the operation of such a unit has been made and programmed for the IBM 7094 computer. An optimization has been effected by means of this program. It is shown that for similar performances, less hydrogen is retained in the case of hot-wire type columns than in the case of columns composed of concentric tubes. (authors) [French] La teneur naturelle du tritium est si faible que sa mesure demande generalement un enrichissement prealable. On etudie la diffusion thermique sur l'hydrogene comme moyen d'enrichissement. L'installation que l'on etudie comprend deux etages de colonnes du type fil chaud, et un dispositif de transfert du tritium de l'echantillon d'eau dans l'hydrogene des colonnes par echange catalytique. Un traitement mathematique complet du fonctionnement d'un tel ensemble a ete etabli et programme sur machine IBM 7094. Une optimisation a ete faite a l'aide du programme. On montre egalement qu'a performances egales, la retenue d'hydrogene est plus faible dans le cas des colonnes du type fil chaud que dans le cas des colonnes du type tubes concentriques. (auteurs)

  17. Profil épidémiologique des tumeurs malignes primitives des glandes salivaires : à propos de 154 cas

    Science.gov (United States)

    Setti, Khadija; Mouanis, Mohamed; Moumni, Abdelmounim; Maher, Mostafa; Harmouch, Amal

    2014-01-01

    Introduction Les tumeurs des glandes salivaires sont des tumeurs rares représentant 3à 5% des tumeurs de la tête et du cou. La classification de l'OMS 2005 distingue les tumeurs épithéliales, les tumeurs mésenchymateuses, les tumeurs hématologiques et les tumeurs secondaires. Méthodes Notre travail consiste en une étude rétrospective réalisée sur une période de 10 ans allant de janvier 2002 à janvier 2012. Les critères d'inclusion étaient: l'âge, le sexe, le siège de la tumeur et le type histologique. Résultats L'incidence annuelle des tumeurs malignes primitives des glandes salivaires dans notre série était de 15 cas par an. Cent cinquante quatre cas de tumeurs malignes primitives des glandes salivaires ont été colligés sans prédominance de sexe (78 femmes (50,6%) et 76 hommes (49,4%)). La moyenne d'âge était de 60 ans avec des extrêmes de 4 et 83 ans et un pic de fréquence entre 51et 70 ans. Deux tiers des cas (65%) avaient une localisation au niveau des glandes principales avec 66 cas au niveau de la parotide (43%) et 34 cas au niveau de la glande sous maxillaire (22%). Cinquante quatre patients avaient une tumeur maligne des glandes salivaires accessoires (35%) dont 61% au niveau du palais. Aucun cas de tumeur maligne de la glande sublinguale n'a été recensé dans notre étude. Le type histologique prédominant dans notre série était le carcinome adénoïde kystique et retrouvé chez 43 patients (27,9%), suivi de l'adénocarcinome sans autre indication chez 37 patients (24%) puis du carcinome mucoépidermoïde chez 16 patients (10,4%) et de l'adénocarcinome polymorphe de bas grade également chez 16 patients (10. 4%). Conclusion Les tumeurs malignes des glandes salivaires représentent un ensemble hétérogène de maladies de caractérisation complexe et de fréquence variable. PMID:25120861

  18. [CRISPR/Cas system for genome editing in pluripotent stem cells].

    Science.gov (United States)

    Vasil'eva, E A; Melino, D; Barlev, N A

    2015-01-01

    Genome editing systems based on site-specific nucleases became very popular for genome editing in modern bioengineering. Human pluripotent stem cells provide a unique platform for genes function study, disease modeling, and drugs testing. Consequently, technology for fast, accurate and well controlled genome manipulation is required. CRISPR/Cas (clustered regularly interspaced short palindromic repeat/CRISPR-associated) system could be employed for these purposes. This system is based on site-specific programmable nuclease Cas9. Numerous advantages of the CRISPR/Cas system and its successful application to human stem cells provide wide opportunities for genome therapy and regeneration medicine. In this publication, we describe and compare the main genome editing systems based on site-specific programmable nucleases and discuss opportunities and perspectives of the CRISPR/Cas system for application to pluripotent stem cells.

  19. Le Rôle du langage de programmation dans la réalisation de code ...

    African Journals Online (AJOL)

    Le Rôle du langage de programmation dans la réalisation de code de qualité, les cas de Delphi et C++ Nous discutons dans ce papier le rôle du langage de programmation dans la production d'un code de qualité. La qualité d'un code peut être atteinte en respectant certains critères simples au niveau de la programmation ...

  20. Site-specific integration in CHO cells mediated by CRISPR/Cas9 and homology-directed DNA repair pathway

    DEFF Research Database (Denmark)

    Lee, Jae Seong; Beuchert Kallehauge, Thomas; Pedersen, Lasse Ebdrup

    2015-01-01

    gene integration into site-specific loci in CHO cells using CRISPR/Cas9 genome editing system and compatible donor plasmid harboring a gene of interest (GOI) and short homology arms. This strategy has enabled precise insertion of a 3.7-kb gene expression cassette at defined loci in CHO cells following...

  1. Chapitre 6: Le cas de l'Afrique du Sud

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    pwust

    examiné un paiement fait par Sports and Recreation South Africa au tournoi de football de la Coupe d'Afrique des. Nations 2002, au ..... pays africains portent sur de l'aide relative aux technologies en place plutôt que sur la recherche .... en Afrique du Science and Technology Europe Africa Project (ST-EAP) qui favorise la.

  2. Chemical and Biophysical Modulation of Cas9 for Tunable Genome Engineering.

    Science.gov (United States)

    Nuñez, James K; Harrington, Lucas B; Doudna, Jennifer A

    2016-03-18

    The application of the CRISPR-Cas9 system for genome engineering has revolutionized the ability to interrogate genomes of mammalian cells. Programming the Cas9 endonuclease to induce DNA breaks at specified sites is achieved by simply modifying the sequence of its cognate guide RNA. Although Cas9-mediated genome editing has been shown to be highly specific, cleavage events at off-target sites have also been reported. Minimizing, and eventually abolishing, unwanted off-target cleavage remains a major goal of the CRISPR-Cas9 technology before its implementation for therapeutic use. Recent efforts have turned to chemical biology and biophysical approaches to engineer inducible genome editing systems for controlling Cas9 activity at the transcriptional and protein levels. Here, we review recent advancements to modulate Cas9-mediated genome editing by engineering split-Cas9 constructs, inteins, small molecules, protein-based dimerizing domains, and light-inducible systems.

  3. Tritium enrichment by thermal diffusion. I. Calculation of an installation for measuring natural tritium; Enrichissement du tritium par diffusion thermique. - I. Calcul d'une installation destinee a la mesure du tritium naturel

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Shimizu, M.; Ravoire, J. [Commissariat a l' Energie Atomique, Centre d' Etudes Nucleaires de Saclay, 91 - Gif-sur-Yvette (France)

    1966-07-01

    The natural content of tritium is so low that its measurement generally requires a preliminary enrichment. The thermal diffusion on hydrogen is studied as an enrichment method. The installation studied comprises two stages of columns of the hot-wire type, together with a device for transferring the tritium from the water sample into the hydrogen in the columns using catalytic exchange. A complete mathematical treatment for the operation of such a unit has been made and programmed for the IBM 7094 computer. An optimization has been effected by means of this program. It is shown that for similar performances, less hydrogen is retained in the case of hot-wire type columns than in the case of columns composed of concentric tubes. (authors) [French] La teneur naturelle du tritium est si faible que sa mesure demande generalement un enrichissement prealable. On etudie la diffusion thermique sur l'hydrogene comme moyen d'enrichissement. L'installation que l'on etudie comprend deux etages de colonnes du type fil chaud, et un dispositif de transfert du tritium de l'echantillon d'eau dans l'hydrogene des colonnes par echange catalytique. Un traitement mathematique complet du fonctionnement d'un tel ensemble a ete etabli et programme sur machine IBM 7094. Une optimisation a ete faite a l'aide du programme. On montre egalement qu'a performances egales, la retenue d'hydrogene est plus faible dans le cas des colonnes du type fil chaud que dans le cas des colonnes du type tubes concentriques. (auteurs)

  4. SYNDROME DE GELINEAU. A PROPOS D\\'UN CAS NIGERIAN ET ...

    African Journals Online (AJOL)

    Au Nigéria, le syndrome de Gélineau est un trouble rare avec une prévalence hospitalière de 0.026%. Nous étudions ici le cas d'un patient nigérien âgé de 14 ans atteint de narcolepsie, de cataplexie, d'hallucinations hypnagogiques visuelles et de paralysie du sommeil hypnopompique. Il a été effectué un test de latence ...

  5. La tuberculose extra-ganglionnaire primitive de la sphère ORL: à propos de 15 cas

    Science.gov (United States)

    Touati, Mohamed Mliha; Darouassi, Youssef; Chihani, Mehdi; Lakouichmi, Mohammed; Tourabi, Khalid; Ammar, Haddou; Bouaity, Brahim

    2014-01-01

    Les localisations ORL extra ganglionnaires de la tuberculose sont rares. La symptomatologie clinique ainsi que les examens paracliniques sont souvent trompeurs,posant ainsi le problème de diagnostic différentiel avec la pathologie tumorale. Nous rapportons 15 cas de localisations extra ganglionnaires de tuberculose, colligés au service ORL et CCF de l'Hopital Militaire Avicenne de Marrakech colligés entre 2009 et 2013. L’âge moyen de nos patients est de 33 ans. L’étude topographique a montré 6 cas au niveau du cavum, un cas de miliaire tuberculeuse pharyngée, 4 cas laryngés; 2 localisations auriculaires; 1 parotidienne et 1 localisation sous maxillaire. Le diagnostic était anatomopathologiquedans tous les cas. Tous nos patients ont reçu un traitement antituberculeux avec une bonne évolution. Mots-clés: Tuberculose, amygdale, rhinopharynx, larynx, glandes salivaires,Oreille moyenne. PMID:25815100

  6. DNA interrogation by the CRISPR RNA-guided endonuclease Cas9.

    Science.gov (United States)

    Sternberg, Samuel H; Redding, Sy; Jinek, Martin; Greene, Eric C; Doudna, Jennifer A

    2014-03-06

    The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated enzyme Cas9 is an RNA-guided endonuclease that uses RNA-DNA base-pairing to target foreign DNA in bacteria. Cas9-guide RNA complexes are also effective genome engineering agents in animals and plants. Here we use single-molecule and bulk biochemical experiments to determine how Cas9-RNA interrogates DNA to find specific cleavage sites. We show that both binding and cleavage of DNA by Cas9-RNA require recognition of a short trinucleotide protospacer adjacent motif (PAM). Non-target DNA binding affinity scales with PAM density, and sequences fully complementary to the guide RNA but lacking a nearby PAM are ignored by Cas9-RNA. Competition assays provide evidence that DNA strand separation and RNA-DNA heteroduplex formation initiate at the PAM and proceed directionally towards the distal end of the target sequence. Furthermore, PAM interactions trigger Cas9 catalytic activity. These results reveal how Cas9 uses PAM recognition to quickly identify potential target sites while scanning large DNA molecules, and to regulate scission of double-stranded DNA.

  7. DNA interrogation by the CRISPR RNA-guided endonuclease Cas9

    Science.gov (United States)

    Sternberg, Samuel H.; Redding, Sy; Jinek, Martin; Greene, Eric C.; Doudna, Jennifer A.

    2014-03-01

    The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated enzyme Cas9 is an RNA-guided endonuclease that uses RNA-DNA base-pairing to target foreign DNA in bacteria. Cas9-guide RNA complexes are also effective genome engineering agents in animals and plants. Here we use single-molecule and bulk biochemical experiments to determine how Cas9-RNA interrogates DNA to find specific cleavage sites. We show that both binding and cleavage of DNA by Cas9-RNA require recognition of a short trinucleotide protospacer adjacent motif (PAM). Non-target DNA binding affinity scales with PAM density, and sequences fully complementary to the guide RNA but lacking a nearby PAM are ignored by Cas9-RNA. Competition assays provide evidence that DNA strand separation and RNA-DNA heteroduplex formation initiate at the PAM and proceed directionally towards the distal end of the target sequence. Furthermore, PAM interactions trigger Cas9 catalytic activity. These results reveal how Cas9 uses PAM recognition to quickly identify potential target sites while scanning large DNA molecules, and to regulate scission of double-stranded DNA.

  8. Incidence du cancer au Canada : tendances et projections (1983-2032)

    OpenAIRE

    Lin Xie; Robert Semenciw; Les Mery

    2015-01-01

    Dans cette monographie, nous présentons, pour 1983 à 2032, un historique et des projections du nombre de nouveaux cas et des taux d'incidence du cancer pour le Canada, à l'exception des cancers de la peau autres que le mélanome (c.-à -d. les carcinomes basocellulaire et spinocellulaire). Ces renseignements visent à faciliter la planification stratégique et l'affectation de ressources et d'infrastructures pour assurer la prestation future de soins de santé et de mesures de lutte contre le canc...

  9. Rupture Uterine Par Accident De La Voie Publique: A propos d'un cas.

    African Journals Online (AJOL)

    Abstract. Un cas de rupture utérine par accident de la voie publique associée à une fracture de l'humérus droit et du bassin est décrit. Les pronostics maternels et foetal sont discutés à la lumière de la revue de la littérature.

  10. Spectrophotometric study of the complexes of cerium and uranides with diethylenetetraaminepentaacetic acid (DTPA); Contribution a l'etude de la complexation du cerium et des uranides par l'acide diethylenetetraminepentaacetique (DTPA)

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Hafez, M B [Commissariat a l' Energie Atomique, Fontenay-aux-Roses (France). Centre d' Etudes Nucleaires

    1968-03-01

    A spectrophotometric determination was made of the complexes of cerium and uranides in their different degrees of oxidation with diethylenetriaminepentaacetic acid (DTPA). Two physico-chemical states, the ionic and hydrolysis ones, were considered. In the former case, we studied the influence of the pH on the formation of the complex, and whenever the complexes were stable, we determined the molecular ratio and calculated their stability constants. In the latter case, we studied the conditions of solubilization of the precipitate by formation of complexes soluble in water as a function of pH, age of the precipitate and time of precipitate-chelate contact. (authors) [French] Etude spectrophotometrique de la complexation du cerium et des uranides (uranium, neptunium, plutonium et americium) dans leurs differents etats d'oxydation par l'acide diethylenetriaminepentaacetique (DTPA). Deux etats physicochimiques ont retenu notre attention, l'etat ionique et l'etat precipite d'hydrolyse. Dans le premier cas, nous avons etudie l'influence du pH sur la formation du complexe, et dans tous les cas ou le complexe est stable, nous avons determine le rapport moleculaire (5) [element]/[chelatant] du complexe forme et nous avons calcule leurs constantes de stabilite. Dans le deuxieme cas, l'etat de precipite d'hydrolyse, nous avons etudie les conditions de solubilisation du precipite, par formation du complexe, en fonction du pH, de l'age du precipite et du temps de contact precipite - chelatant. (auteurs)

  11. LESIONS INFRA CLINIQUES DU SEIN A LIBREVILLE (GABON ...

    African Journals Online (AJOL)

    de foyer de micro calcifications d'allure évolutive et suspecte (11%). Une reprise chirurgicale a été jugée nécessaire pour 17 cas de carcinomes canalaires invasifs du fait des marges d'exérèse insuffisantes : 5 mastectomies selon Patey et 12 mastectomies partielles associées, à chaque fois, à un curage ganglionnaire.

  12. Relationship between drug resistance and the clustered, regularly interspaced, short, palindromic repeat-associated protein genes cas1 and cas2 in Shigella from giant panda dung.

    Science.gov (United States)

    Ren, Lu; Deng, Lin-Hua; Zhang, Ri-Peng; Wang, Cheng-Dong; Li, De-Sheng; Xi, Li-Xin; Chen, Zhen-Rong; Yang, Rui; Huang, Jie; Zeng, Yang-Ru; Wu, Hong-Lin; Cao, San-Jie; Wu, Rui; Huang, Yong; Yan, Qi-Gui

    2017-02-01

    To detect drug resistance in Shigella obtained from the dung of the giant panda, explore the factors leading to drug resistance in Shigella, understand the characteristics of clustered, regularly interspaced, short, palindromic repeats (CRISPR), and assess the relationship between CRISPR and drug resistance. We collected fresh feces from 27 healthy giant pandas in the Giant Panda Conservation base (Wolong, China). We identified the strains of Shigella in the samples by using nucleotide sequence analysis. Further, the Kirby-Bauer paper method was used to determine drug sensitivity of the Shigella strains. CRISPR-associated protein genes cas1 and cas2 in Shigella were detected by polymerase chain reaction (PCR), and the PCR products were sequenced and compared. We isolated and identified 17 strains of Shigella from 27 samples, including 14 strains of Shigella flexneri, 2 strains of Shigella sonnei, and 1 strain of Shigella dysenteriae. Further, drug resistance to cefazolin, imipenem, and amoxicillin-clavulanic acid was identified as a serious problem, as multidrug-resistant strains were detected. Further, cas1 and cas2 showed different degrees of point mutations. The CRISPR system widely exists in Shigella and shares homology with that in Escherichia coli. The cas1 and cas 2 mutations contribute to the different levels of resistance. Point mutations at sites 3176455, 3176590, and 3176465 in cas1 (a); sites 3176989, 3176992, and 3176995 in cas1 (b); sites 3176156 and 3176236 in cas2 may affect the resistance of bacteria, cause emergence of multidrug resistance, and increase the types of drug resistance.

  13. La tuberculose iléo-caecale : à propos de deux cas au CHU ...

    African Journals Online (AJOL)

    Le traitement antituberculeux instauré était conforme au protocole du programme national burkinabè de lutte contre la tuberculose. L'évolution a été favorable dans les deux cas. Mots clés: tuberculose - jonction iléocaécale - traitement antituberculeux - chirurgie. English Abstract. The ileo-caecal tuberculosis is rare and ...

  14. An economic study of the site of Marcoule; Etude economique du site de Marcoule

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Duprat, H [Commissariat a l' Energie Atomique, Marcoule (France). Centre d' Etudes Nucleaires

    1964-07-01

    The study of this site of the Marcoule Center shows that its regional economical influence is limited to the buying power distributed among its personnel. This entails distortions between first this supplementary buying power and the overall markets within the possible Marcoule influence zone, and secondly the concentration on Bagnols-sur-Ceze and this town's normal extension possibilities. (author) [French] L'etude du site de Marcoule demontre que son influence economique se limite, pour la region, au pouvoir d'achat distribue a son personnel. Ceci entraine une disproportion d'une part entre ce pouvoir d'achat supplementaire et l'ensemble des marches contenus dans l'aire d'influence possible de Marcoule, d'autre part entre la concentration realisee a Bagnole-sur-Ceze et la capacite d'extension normale de cette agglomeration. (auteur)

  15. Vulnérabilité de l’organisation des interactions institutionnelles face aux écrans : le cas singulier du traitement d'un appel visiophonique au tribunal

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Veyrier Clair-Antoine

    2014-07-01

    Notre étude s’appuie sur un travail de terrain dans les cours d’appels de deux villes française et s’inscrit dans un projet plus large sur l’usage de la vidéoconférence dans les tribunaux. Dans une perspective d’analyse de conversation (Schegloff 1987, l’analyse d’un cas singulier d’appel visiophonique qui aboutit à un placement séquentiel inhabituel (en pleine audience révèle les attentes normatives de la production d’un appel, en particulier la disponibilité de l’appelant. Nous montrerons comment les membres s’orientent vers les attentes normatives de la production de l’appel et gèrent la multiactivité en interférrant sur la progressivité du déroulement de l’audience.

  16. Estimation de l'impact en santé publique de la chimioprévention du ...

    African Journals Online (AJOL)

    ménage a permis d'échantillonner 482 enfants dont 241 cas et 241 témoins. La CPS réduit le .... l'incidence du paludisme entre les deux zones. (P<0,05). Distribution du nombre d'épisodes de paludisme par enfant. Il y a eu 234 épisodes de paludisme dans la zone témoin .... joueraient un important rôle. La CPS réduit ...

  17. Cas3 is a single-stranded DNA nuclease and ATP-dependent helicase in the CRISPR/Cas immune system.

    Science.gov (United States)

    Sinkunas, Tomas; Gasiunas, Giedrius; Fremaux, Christophe; Barrangou, Rodolphe; Horvath, Philippe; Siksnys, Virginijus

    2011-04-06

    Clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR) is a recently discovered adaptive prokaryotic immune system that provides acquired immunity against foreign nucleic acids by utilizing small guide crRNAs (CRISPR RNAs) to interfere with invading viruses and plasmids. In Escherichia coli, Cas3 is essential for crRNA-guided interference with virus proliferation. Cas3 contains N-terminal HD phosphohydrolase and C-terminal Superfamily 2 (SF2) helicase domains. Here, we provide the first report of the cloning, expression, purification and in vitro functional analysis of the Cas3 protein of the Streptococcus thermophilus CRISPR4 (Ecoli subtype) system. Cas3 possesses a single-stranded DNA (ssDNA)-stimulated ATPase activity, which is coupled to unwinding of DNA/DNA and RNA/DNA duplexes. Cas3 also shows ATP-independent nuclease activity located in the HD domain with a preference for ssDNA substrates. To dissect the contribution of individual domains, Cas3 separation-of-function mutants (ATPase(+)/nuclease(-) and ATPase(-)/nuclease(+)) were obtained by site-directed mutagenesis. We propose that the Cas3 ATPase/helicase domain acts as a motor protein, which assists delivery of the nuclease activity to Cascade-crRNA complex targeting foreign DNA.

  18. Streamlined Approach for Environmental Restoration Plan for Corrective Action Unit 107: Low Impact Soil Sites, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    2008-01-01

    This Streamlined Approach for Environmental Restoration Plan covers activities associated with Corrective Action Unit (CAU) 107 of the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO, 1996 (as amended February 2008)). CAU 107 consists of the following Corrective Action Sites (CASs) located in Areas 1, 2, 3, 4, 5, 9, 10, and 18 of the Nevada Test Site. (1) CAS 01-23-02, Atmospheric Test Site - High Alt; (2) CAS 02-23-02, Contaminated Areas (2); (3) CAS 02-23-03, Contaminated Berm; (4) CAS 02-23-10, Gourd-Amber Contamination Area; (5) CAS 02-23-11, Sappho Contamination Area; (6) CAS 02-23-12, Scuttle Contamination Area; (7) CAS 03-23-24, Seaweed B Contamination Area; (8) CAS 03-23-27, Adze Contamination Area; (9) CAS 03-23-28, Manzanas Contamination Area; (10) CAS 03-23-29, Truchas-Chamisal Contamination Area; (11) CAS 04-23-02, Atmospheric Test Site T4-a; (12) CAS 05-23-06, Atmospheric Test Site; (13) CAS 09-23-06, Mound of Contaminated Soil; (14) CAS 10-23-04, Atmospheric Test Site M-10; and (15) CAS 18-23-02, U-18d Crater (Sulky). Based on historical documentation, personnel interviews, site process knowledge, site visits, photographs, engineering drawings, field screening, analytical results, and the results of data quality objectives process (Section 3.0), closure in place with administrative controls or no further action will be implemented for CAU 107. CAU 107 closure activities will consist of verifying that the current postings required under Title 10 Code of Federal Regulations (CFR) Part 835 are in place and implementing use restrictions (URs) at two sites, CAS 03-23-29 and CAS 18-23-02. The current radiological postings combined with the URs are adequate administrative controls to limit site access and worker dose

  19. Closure Report for Corrective Action Unit 139: Waste Disposal Sites, Nevada Test Site, Nevada

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    NSTec Environmental Restoration

    2009-07-31

    Corrective Action Unit (CAU) 139 is identified in the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO) as 'Waste Disposal Sites' and consists of the following seven Corrective Action Sites (CASs), located in Areas 3, 4, 6, and 9 of the Nevada Test Site: CAS 03-35-01, Burn Pit; CAS 04-08-02, Waste Disposal Site; CAS 04-99-01, Contaminated Surface Debris; CAS 06-19-02, Waste Disposal Site/Burn Pit; CAS 06-19-03, Waste Disposal Trenches; CAS 09-23-01, Area 9 Gravel Gertie; and CAS 09-34-01, Underground Detection Station. Closure activities were conducted from December 2008 to April 2009 according to the FFACO (1996, as amended February 2008) and the Corrective Action Plan for CAU 139 (U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office, 2007b). The corrective action alternatives included No Further Action, Clean Closure, and Closure in Place with Administrative Controls. Closure activities are summarized. CAU 139, 'Waste Disposal Sites,' consists of seven CASs in Areas 3, 4, 6, and 9 of the NTS. The closure alternatives included No Further Action, Clean Closure, and Closure in Place with Administrative Controls. This CR provides a summary of completed closure activities, documentation of waste disposal, and confirmation that remediation goals were met. The following site closure activities were performed at CAU 139 as documented in this CR: (1) At CAS 03-35-01, Burn Pit, soil and debris were removed and disposed as LLW, and debris was removed and disposed as sanitary waste. (2) At CAS 04-08-02, Waste Disposal Site, an administrative UR was implemented. No postings or post-closure monitoring are required. (3) At CAS 04-99-01, Contaminated Surface Debris, soil and debris were removed and disposed as LLW, and debris was removed and disposed as sanitary waste. (4) At CAS 06-19-02, Waste Disposal Site/Burn Pit, no work was performed. (5) At CAS 06-19-03, Waste Disposal Trenches, a native soil cover was installed

  20. Closure Report for Corrective Action Unit 139: Waste Disposal Sites, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    2009-01-01

    Corrective Action Unit (CAU) 139 is identified in the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO) as 'Waste Disposal Sites' and consists of the following seven Corrective Action Sites (CASs), located in Areas 3, 4, 6, and 9 of the Nevada Test Site: CAS 03-35-01, Burn Pit; CAS 04-08-02, Waste Disposal Site; CAS 04-99-01, Contaminated Surface Debris; CAS 06-19-02, Waste Disposal Site/Burn Pit; CAS 06-19-03, Waste Disposal Trenches; CAS 09-23-01, Area 9 Gravel Gertie; and CAS 09-34-01, Underground Detection Station. Closure activities were conducted from December 2008 to April 2009 according to the FFACO (1996, as amended February 2008) and the Corrective Action Plan for CAU 139 (U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office, 2007b). The corrective action alternatives included No Further Action, Clean Closure, and Closure in Place with Administrative Controls. Closure activities are summarized. CAU 139, 'Waste Disposal Sites,' consists of seven CASs in Areas 3, 4, 6, and 9 of the NTS. The closure alternatives included No Further Action, Clean Closure, and Closure in Place with Administrative Controls. This CR provides a summary of completed closure activities, documentation of waste disposal, and confirmation that remediation goals were met. The following site closure activities were performed at CAU 139 as documented in this CR: (1) At CAS 03-35-01, Burn Pit, soil and debris were removed and disposed as LLW, and debris was removed and disposed as sanitary waste. (2) At CAS 04-08-02, Waste Disposal Site, an administrative UR was implemented. No postings or post-closure monitoring are required. (3) At CAS 04-99-01, Contaminated Surface Debris, soil and debris were removed and disposed as LLW, and debris was removed and disposed as sanitary waste. (4) At CAS 06-19-02, Waste Disposal Site/Burn Pit, no work was performed. (5) At CAS 06-19-03, Waste Disposal Trenches, a native soil cover was installed, and a UR was

  1. Gestion des forêts domaniales en période de conflits : cas de la forêt ...

    African Journals Online (AJOL)

    Gestion des forêts domaniales en période de conflits : cas de la forêt classée du Haut-Sassandra, Centre-Ouest de la Côte d'Ivoire. Akoua Tamia Madeleine Kouakou, Yao Sadaiou Sabas Barima, Souleymane Konate, Issouf Bamba, Justin Yatty Kouadio, Jan Bogaert ...

  2. La manipulation du genre dans les pratiques discriminatoires

    OpenAIRE

    Delphy, Christine

    2010-01-01

    La constitution de castes raciales en France a commencé avec la colonisation de l’Afrique par la France au XIXe siècle. Dans le cas de la colonisation du Maghreb, le genre a joué un rôle éminent dans la nécessaire dépréciation des colonisés. La France du XXIe siècle refuse d’intégrer les descendants des immigrés et ex‑colonisés nord‑africains ; elle les constitue en caste inférieure et héréditaire définie par des traits culturels quasiment génétiques, et pour justifier ce traitement utilise u...

  3. CRISPR-Cas9 Based Engineering of Actinomycetal Genomes

    DEFF Research Database (Denmark)

    Tong, Yaojun; Charusanti, Pep; Zhang, Lixin

    2015-01-01

    . To facilitate the genetic manipulation of actinomycetes, we developed a highly efficient CRISPR-Cas9 system to delete gene(s) or gene cluster(s), implement precise gene replacements, and reversibly control gene expression in actinomycetes. We demonstrate our system by targeting two genes, actIORF1 (SCO5087......) and actVB (SCO5092), from the actinorhodin biosynthetic gene cluster in Streptomyces coelicolor A3(2). Our CRISPR-Cas9 system successfully inactivated the targeted genes. When no templates for homology-directed repair (HDR) were present, the site-specific DNA double-strand breaks (DSBs) introduced by Cas9....... Moreover, we developed a system to efficiently and reversibly control expression of target genes, deemed CRISPRi, based on a catalytically dead variant of Cas9 (dCas9). The CRISPR-Cas9 based system described here comprises a powerful and broadly applicable set of tools to manipulate actinomycetal genomes....

  4. Streamlined Approach for Environmental Restoration Plan for Corrective Action Unit 107: Low Impact Soil Sites, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    2009-01-01

    This Streamlined Approach for Environmental Restoration Plan covers activities associated with Corrective Action Unit (CAU) 107 of the Federal Facility Agreement and Consent Order (1996 (as amended February 2008)). CAU 107 consists of the following Corrective Action Sites (CASs) located in Areas 1, 2, 3, 4, 5, 9, 10, and 18 of the Nevada Test Site. (sm b ullet) CAS 01-23-02, Atmospheric Test Site - High Alt(sm b ullet) CAS 02-23-02, Contaminated Areas (2)(sm b ullet) CAS 02-23-03, Contaminated Berm(sm b ullet) CAS 02-23-10, Gourd-Amber Contamination Area(sm b ullet) CAS 02-23-11, Sappho Contamination Area(sm b ullet) CAS 02-23-12, Scuttle Contamination Area(sm b ullet) CAS 03-23-24, Seaweed B Contamination Area(sm b ullet) CAS 03-23-27, Adze Contamination Area(sm b ullet) CAS 03-23-28, Manzanas Contamination Area(sm b ullet) CAS 03-23-29, Truchas-Chamisal Contamination Area(sm b ullet) CAS 04-23-02, Atmospheric Test Site T4-a(sm b ullet) CAS 05-23-06, Atmospheric Test Site(sm b ullet) CAS 09-23-06, Mound of Contaminated Soil(sm b ullet) CAS 10-23-04, Atmospheric Test Site M-10(sm b ullet) CAS 18-23-02, U-18d Crater (Sulky) Based on historical documentation, personnel interviews, site process knowledge, site visits, photographs, engineering drawings, field screening, analytical results, and the results of data quality objectives process (Section 3.0), closure in place with administrative controls or no further action will be implemented for CAU 107.

  5. Gestion des forêts domaniales en période de conflits : cas de la forêt ...

    African Journals Online (AJOL)

    Gestion des forêts domaniales en période de conflits : cas de la forêt classée du. Haut-Sassandra ... trois zones subi la même dynamique de déforestation pendant la période de conflits. .... partie Nord sous contrôle des groupements rebelles ...

  6. Rapid development of stable transgene CHO cell lines by CRISPR/Cas9-mediated site-specific integration into C12orf35.

    Science.gov (United States)

    Zhao, Menglin; Wang, Jiaxian; Luo, Manyu; Luo, Han; Zhao, Meiqi; Han, Lei; Zhang, Mengxiao; Yang, Hui; Xie, Yueqing; Jiang, Hua; Feng, Lei; Lu, Huili; Zhu, Jianwei

    2018-07-01

    Chinese hamster ovary (CHO) cells are the most widely used mammalian hosts for recombinant protein production. However, by conventional random integration strategy, development of a high-expressing and stable recombinant CHO cell line has always been a difficult task due to the heterogenic insertion and its caused requirement of multiple rounds of selection. Site-specific integration of transgenes into CHO hot spots is an ideal strategy to overcome these challenges since it can generate isogenic cell lines with consistent productivity and stability. In this study, we investigated three sites with potential high transcriptional activities: C12orf35, HPRT, and GRIK1, to determine the possible transcriptional hot spots in CHO cells, and further construct a reliable site-specific integration strategy to develop recombinant cell lines efficiently. Genes encoding representative proteins mCherry and anti-PD1 monoclonal antibody were targeted into these three loci respectively through CRISPR/Cas9 technology. Stable cell lines were generated successfully after a single round of selection. In comparison with a random integration control, all the targeted integration cell lines showed higher productivity, among which C12orf35 locus was the most advantageous in both productivity and cell line stability. Binding affinity and N-glycan analysis of the antibody revealed that all batches of product were of similar quality independent on integrated sites. Deep sequencing demonstrated that there was low level of off-target mutations caused by CRISPR/Cas9, but none of them contributed to the development process of transgene cell lines. Our results demonstrated the feasibility of C12orf35 as the target site for exogenous gene integration, and strongly suggested that C12orf35 targeted integration mediated by CRISPR/Cas9 is a reliable strategy for the rapid development of recombinant CHO cell lines.

  7. Genre et dynamique organisationnelle au Moyen Atlas : cas du douar Maâmar dans la région de Khénifra

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Fatima Zahid

    2014-03-01

    Full Text Available Le droit au développement semble animer tous les efforts visant à promouvoir la montagne marocaine, dans toutes ses dimensions politiques, sociales, organisationnelles à travers des projets de développement dont le plus réputé au Moyen Atlas est le projet MEDA-Khénifra. Ses actions diverses et ambitieuses ont façonné un douar de la région par de nouvelles organisations qui ont impacté les relations sociales et en particulier les relations du genre. Nous analysons à travers ce cas l’impact des projets de développement sur les relations du genre et l’empowerment des femmes dans cet espace. Les enquêtes ont été menées sous forme de questionnaires et d’entretiens collectifs. Le projet a créé deux organisations formelles : une association de développement et une coopérative pour la valorisation des plantes aromatiques et médicinales. Les femmes n’ont pas été impliquées dans ces organisations et certaines d’entre elles ont été invitées à participer à deux groupements informels. Le premier, pour la production de plantes aromatiques et médicinales, est resté sous la tutelle des organisations formelles gérées par les hommes. L’autre, dédié à l’apiculture, est plus autonome et a mieux réussi. Par ailleurs, la montée en puissance des organisations formelles a conduit à une moindre capacité d’action des femmes au niveau du village, car elles n’ont plus sur ces organisations les droits qu’elles ont traditionnellement dans le cadre de la jmâa. Cette expérience montre qu’un projet de développement peut influencer négativement les relations de genre malgré les bonnes volontés. La réflexion sur la question de genre doit alors impérativement animer l’ensemble des actions des projets de développement.

  8. Nouvelles Techniques d'Intervention sur la Corrosion des Armatures du Béton Armé

    CERN Document Server

    Colloca, C

    1999-01-01

    Les principaux dégâts constatés dans les armatures passives du béton armé sont la corrosion généralisée et la corrosion locale. Ces dégradations sont provoquées soit par la carbonatation du béton soit par le contact avec l'eau pure ou l'eau chargée de chlorures pénétrant dans les pores et dans les fissures de surface. Ce document présente de nouvelles techniques d'intervention, fondées sur d'anciens principes, introduites pour le traitement électrochimique des zones altérées liées aux différentes conditions. La réalcalinisation (dans le cas de béton carbonaté) permet d'augmenter le pH du béton et de rétablir un niveau de basicité garantissant la passivation de l'armature. La désalification (dans le cas de béton entamé par les chlorures) provoque l'élimination des ions chlorure à travers la surface du béton. Les avantages de ces traitements, par rapport aux anciennes techniques, sont appréciables si l'on considère la durée d'exécution et leur coût moins élevé.

  9. Syndrome de Sturge-Weber : A propos d'un cas a Lome. | Adigo ...

    African Journals Online (AJOL)

    Le syndrome de Sturge-Weber est une rare maladie congénitale, sporadique et non héréditaire. Il implique des malformations vasculaires de la peau (angiome cutané plan), des yeux et du cerveau (angiome leptoméningé). Les auteurs rapportent un cas révélé à l'âge adulte et dont le traitement a été médical ...

  10. Le paludisme grave d’importation chez l’adulte: étude rétrospective de treize cas admis en réanimation à Marrakech

    Science.gov (United States)

    El Mezouari, El Mostafa; Belhadj, Ayoub; Ziani, Mohamed; Boughanem, Mohamed; Moutaj, Redouane

    2016-01-01

    Le paludisme d’importation est une affection de plus en plus fréquente en zone non endémique. Les formes graves représentent 10 % des cas de paludisme à Plasmodium falciparum. Au Maroc, plus de 50 cas de paludisme sont enregistrés chaque année dont 83 % à P. falciparum. Ont été inclus dans l’étude tous les patients ayant développé un paludisme grave, admis au service de réanimation durant la période comprise entre le 1er Novembre 2009 et le 31 décembre 2015. Les principales données épidémiologiques, les motifs d’admission, la prise en charge et l’évolution ont été étudiés. Treize patients sont retenus. L’âge moyen est de 31 ans. Tous les patients ont séjourné en afrique subsaharienne et étaient non-immuns. La chimioprophylaxie était adéquate dans 33% des cas. Le délai moyen entre le début des symptômes et l’instauration du traitement était de six jours. La parasitémie moyenne initiale était de 12 %. Les motifs d’admission en réanimation étaient un coma (15%), une convulsion (07%), une détresse respiratoire (07%), une prostration (07%), une insuffisance rénale (07%), un choc associé à un ictère et une acidose (07%) et enfin une insuffisance rénale conjuguée à un coma (07%). Tous les patients ont reçu un traitement par la quinine intraveineuse avec une dose de charge dans 100 % des cas. Le taux de mortalité était de 23 %. Les causes du décès étaient dues à la défaillance multi viscérale et au syndrome de détresse respiratoire aigu. La mortalité des formes graves du paludisme reste élevée. L’adéquation de la chimioprophylaxie associée à la précocité du diagnostic et du traitement permettrait d’améliorer significativement le pronostic de cette parasitose. PMID:28292141

  11. Apport des approches inspirées de la neuropsychologie au diagnostic d'autisme chez l'adulte: une étude de cas

    OpenAIRE

    Weiner , L.; Baratta , A.; Henry , J.; Di Santi , C.

    2010-01-01

    Resume Nous allons illustrer a partir d?un cas clinique les procedures diagnostiques des troubles du spectre autistique chez l?adulte, inspirees des theories neurocognitives actuelles. Nous relatons le cas d?un homme de 29 ans recu en consultation psychiatrique. Le diagnostic initialement retenu etait celui de personnalite evitante, compliquee de phobie sociale et d?un trouble depressif intercurrent. Malgre la diminution des symptomes anxieux et depressifs apres l?instauration d?un...

  12. Cas9-nickase-mediated genome editing corrects hereditary tyrosinemia in rats.

    Science.gov (United States)

    Shao, Yanjiao; Wang, Liren; Guo, Nana; Wang, Shengfei; Yang, Lei; Li, Yajing; Wang, Mingsong; Yin, Shuming; Han, Honghui; Zeng, Li; Zhang, Ludi; Hui, Lijian; Ding, Qiurong; Zhang, Jiqin; Geng, Hongquan; Liu, Mingyao; Li, Dali

    2018-05-04

    Hereditary tyrosinemia type I (HTI) is a metabolic genetic disorder caused by mutation of fumarylacetoacetate hydrolase (FAH). Because of the accumulation of toxic metabolites, HTI causes severe liver cirrhosis, liver failure, and even hepatocellular carcinoma. HTI is an ideal model for gene therapy, and several strategies have been shown to ameliorate HTI symptoms in animal models. Although CRISPR/Cas9-mediated genome editing is able to correct the Fah mutation in mouse models, WT Cas9 induces numerous undesired mutations that have raised safety concerns for clinical applications. To develop a new method for gene correction with high fidelity, we generated a Fah mutant rat model to investigate whether Cas9 nickase (Cas9n)-mediated genome editing can efficiently correct the Fah First, we confirmed that Cas9n rarely induces indels in both on-target and off-target sites in cell lines. Using WT Cas9 as a positive control, we delivered Cas9n and the repair donor template/single guide (sg)RNA through adenoviral vectors into HTI rats. Analyses of the initial genome editing efficiency indicated that only WT Cas9 but not Cas9n causes indels at the on-target site in the liver tissue. After receiving either Cas9n or WT Cas9-mediated gene correction therapy, HTI rats gained weight steadily and survived. Fah-expressing hepatocytes occupied over 95% of the liver tissue 9 months after the treatment. Moreover, CRISPR/Cas9-mediated gene therapy prevented the progression of liver cirrhosis, a phenotype that could not be recapitulated in the HTI mouse model. These results strongly suggest that Cas9n-mediated genome editing is a valuable and safe gene therapy strategy for this genetic disease. © 2018 by The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Inc.

  13. Nucleosome breathing and remodeling constrain CRISPR-Cas9 function

    Science.gov (United States)

    Isaac, R Stefan; Jiang, Fuguo; Doudna, Jennifer A; Lim, Wendell A; Narlikar, Geeta J; Almeida, Ricardo

    2016-01-01

    The CRISPR-Cas9 bacterial surveillance system has become a versatile tool for genome editing and gene regulation in eukaryotic cells, yet how CRISPR-Cas9 contends with the barriers presented by eukaryotic chromatin is poorly understood. Here we investigate how the smallest unit of chromatin, a nucleosome, constrains the activity of the CRISPR-Cas9 system. We find that nucleosomes assembled on native DNA sequences are permissive to Cas9 action. However, the accessibility of nucleosomal DNA to Cas9 is variable over several orders of magnitude depending on dynamic properties of the DNA sequence and the distance of the PAM site from the nucleosome dyad. We further find that chromatin remodeling enzymes stimulate Cas9 activity on nucleosomal templates. Our findings imply that the spontaneous breathing of nucleosomal DNA together with the action of chromatin remodelers allow Cas9 to effectively act on chromatin in vivo. DOI: http://dx.doi.org/10.7554/eLife.13450.001 PMID:27130520

  14. Guide des bases de données du CRDI

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    Par exemple, entrez wom?n pour trouver tous les documents contenant woman ou women. •. Dans le cas du caractère de .... Propriétés de l'e- mail : n'oubliez pas d'inclure votre adresse de courriel. 4. Pour reconnaître l'alerte plus facilement dans votre boîte de réception, donnez- lui un titre. Cliquez sur Sauvegarder.

  15. La neurotoxoplasmose congenitale du nourrisson : a propos d'une ...

    African Journals Online (AJOL)

    Les auteurs rapportent un cas isolé d'une Toxoplasmose cérébrale congénitale chez un enfant de 02 ans hospitalisé dans le service de neurologie du centre hospitalouniversitaire (C.H.U) Campus de Lomé. La revue de la littérature permet d'insister sur les formes cliniques, l'imagerie médicale, la biologie ainsi que les ...

  16. traumatismes externes du larynx external laryngeal trauma of larynx

    African Journals Online (AJOL)

    Les signes cliniques étaient dominés par la dyspho- ... Methods: Twenty-one patients with laryngeal injuries were analyzed retrospectively. ... évoquer un traumatisme du larynx sur un faisceau d'ar- ... Faculté de médecine de Tunis - Université De Tunis El Manar ... a été indiquée sous anesthésie générale dans tous les cas.

  17. Safety apparatus for serious radioactive accidents (1962); Materiel d'intervention en cas d'accident radioactif grave (1962)

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Estournel, R; Rodier, J [Commissariat a l' Energie Atomique, Centre de Production de Plutonium, Marcoule (France). Centre d' Etudes Nucleaires

    1962-07-01

    In the case of a serious radioactive accident, radioactive dust and gases may be released into the atmosphere. It is therefore necessary to be able to evaluate rapidly the importance of the risk to the surrounding population, and to be able to ensure, even in the event of an evacuation of the Centre, the continuation of the radioactivity analyses and the decontamination of the personnel. For this, the Anti-radiation Protection Service at Marcoule has organised mobile detection teams and designed a mobile laboratory and a mobile shower-unit. After describing the duty of the mobile teams, the report gives a description of the apparatus which would be used at the Marcoule Centre in the case of a serious radioactive accident. The method of using this apparatus is given. (authors) [French] Lors d'un accident radioactif grave, des poussieres et des gaz radioactifs peuvent etre relaches dans l'atmosphere. II est alors indispensable d'evaluer rapidement l'importance du risque couru par les populations environnantes, et de pouvoir assurer, meme dans le cas de l'evacuation du Centre, la poursuite des analyses radioactives et la decontamination du personnel. Pour cela, le Service de Protection contre les Radiations du Centre de Marcoule a mis sur pied des equipes mobiles de detection et realise une semi-remorque laboratoire ainsi qu'une semi-remorque douches. Apres avoir defini la mission des equipes mobiles, le rapport donne la description du materiel d'intervention qui serait mis en oeuvre par le Centre de Marcoule dans le cas d'un accident radioactif grave. Il precis le mode d'utilisation de ce materiel. (auteurs)

  18. Interleukin-6 gene polymorphisms and susceptibility to myocardial infarction: the ECTIM study. Etude Cas-Témoin de l'Infarctus du Myocarde.

    Science.gov (United States)

    Georges, J L; Loukaci, V; Poirier, O; Evans, A; Luc, G; Arveiler, D; Ruidavets, J B; Cambien, F; Tiret, L

    2001-06-01

    There is growing evidence that interleukin (IL) 6 plays an important role in the atherosclerotic process because of its role in mediating immune and inflammatory responses and inducing cell proliferation. The present study examined whether molecular variations at the IL-6 locus are involved in the predisposition to myocardial infarction. The entire coding region, 1,158 bp of the 5' flanking region and 237 bp of the 3' flanking region of the IL-6 gene were screened. We detected three nucleotide substitutions in the 5' region at positions -174 (G/C), -572 (G/C), and -596 (G/A) from the transcription start site, and one insertion/deletion in the 3' region at position +528 after the Stop codon. These polymorphisms were genotyped in the Etude Cas-Témoin de l'Infarctus du Myocarde study comparing male patients (n=640) and age-matched controls (n=719) from Northern Ireland and France. The IL-6/G-174C and IL-6/G-596A polymorphisms were in nearly complete association. Carriers of the IL-6/-174 C allele were more frequent in patients than in controls. The population-adjusted odds ratio for myocardial infarction associated with genotype CC+CG vs. GG was estimated as 1.34. In French patients the number of coronary arteries with greater than 50% stenosis was assessed by angiography. The IL-6/-174 C allele was more frequent in patients with two or fewer stenosed vessels than in patients with three-vessel lesions. These results suggest that genetic variation at the IL-6 locus is associated with susceptibility to myocardial infarction, especially events occurring on less extended lesions. These findings would be compatible with a lower IL-6 secretion associated with the IL-6/-174 C allele, itself or in combination with other promoter polymorphisms, leading to more unstable plaques.

  19. A mathematical model for cost of maritime transport. Application to competitiveness of nuclear vessels; Modele mathematique du cout de transport maritime application a la competitivite du navire nucleaire

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Dorval, C [Commissariat a l' Energie Atomique, 75 - Paris (France)

    1966-05-01

    competitivite, nous considerons deux cas: 1) le tonnage a transporter annuellement est limite; 2) le tonnage a transporter annuellement n'est pas limite. Dans les deux cas, nous recherchons les optima du navire classique et du navire nucleaire, et nous les comparons. Nous construisons les courbes de competitivite en fonction des rapports des couts de combustible nucleaire et classique, et des couts marginaux de la puissance nucleaire et classique. Ces courbes traduisent les valeurs limites des deux rapports ci-dessus pour lesquelles les couts de transport du navire nucleaire et du navire classique sont egaux. Suivant les hypotheses adoptees pour le marche du fret et pour la limite du tonnage transporte annuellement, nous avons des courbes de competitivite tres differentes. De toute facon, c'est l'augmentation de puissance qui favorise le nucleaire. On peut obtenir cette augmentation en accroissant le deplacement ce qui est toujours interessant dans la mesure ou le fret le justifie, et en accroissant la vitesse, mais dans ce cas le modele met en evidence l'existence d'une limite. Le sous-marin peut presenter certains avantages (moindre resistance hydrodynamique de l'eau, possibilite de vitesse plus reguliere, et eventuellement reduction de trajet) qui rendent la competitivite du nucleaire plus aisee. (auteur)

  20. SCPRI Emergency Kit for Use in the Event of a Nuclear Accident; Le Dispositif d'Intervention Rapide du SCPRI en Cas d'Accident Nucleaire

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Ervet, P.; Moroni, J. P.; Pellerin, P. [Service Central de Protection Contre les Rayonnements Ionisants, Ministere des Affaires Sociales, Le Vesinet (France)

    1969-10-15

    In the event of a nuclear accident necessitating implementation of the ORSEC radiation protection plan, the Service central de protection contre les rayonnements ionisants (Central Service for Protection against Ionizing Radiations), in conjunction with the Service national de la protection civile (National Civil Defence Service), has adopted the necessary measures for rapid evaluation of possible contamination as promptly as possible. With this aim in mind the Service has prepared emergency kits, which are permanently stored at airfields in the Paris region; these can be carried by aircraft together with two engineers from the Service, thereby enabling them to reach the site of the incident with the specialized equipment in a few hours at most. This paper describes the monitoring and sampling equipment as well as the conditions under which the kit is carried and used (it operates independently by having a built-in generating unit). It is basically designed to permit an initial assessment of the situation, to furnish local authorities with data on which to base decisions for the safety of the population, and to determine any additional measures that need to be adopted. (author) [French] Dans le cas d'un accident nucleaire impliquant la mise en application du plan ORSEC radiologique, en liaison avec le Service national de la protection civile, le Service central de protection contre les rayonnements ionisants a pris les dispositions necessaires pour faire une evaluation rapide, aussi preooce que possible, des contaminations eventuelles. Dans ce but, il a realise des cantines d'intervention qui sont deposees en permanence sur les aerodromes de la region parisienne, et peuvent etre embarquees par avion avec deux ingenieurs du service qui peuvent etre ainsi sur les lieux de l'incident, avec un materiel specialise, dans un delai qui n'excede pas quelques heures. Le memoire decrit le materiel de mesure et de prelevement, ainsi que les conditions de transport et d

  1. Real-space and real-time dynamics of CRISPR-Cas9 visualized by high-speed atomic force microscopy.

    Science.gov (United States)

    Shibata, Mikihiro; Nishimasu, Hiroshi; Kodera, Noriyuki; Hirano, Seiichi; Ando, Toshio; Uchihashi, Takayuki; Nureki, Osamu

    2017-11-10

    The CRISPR-associated endonuclease Cas9 binds to a guide RNA and cleaves double-stranded DNA with a sequence complementary to the RNA guide. The Cas9-RNA system has been harnessed for numerous applications, such as genome editing. Here we use high-speed atomic force microscopy (HS-AFM) to visualize the real-space and real-time dynamics of CRISPR-Cas9 in action. HS-AFM movies indicate that, whereas apo-Cas9 adopts unexpected flexible conformations, Cas9-RNA forms a stable bilobed structure and interrogates target sites on the DNA by three-dimensional diffusion. These movies also provide real-time visualization of the Cas9-mediated DNA cleavage process. Notably, the Cas9 HNH nuclease domain fluctuates upon DNA binding, and subsequently adopts an active conformation, where the HNH active site is docked at the cleavage site in the target DNA. Collectively, our HS-AFM data extend our understanding of the action mechanism of CRISPR-Cas9.

  2. L’évaluation des dimensions territoriale et institutionnelle du developpement durable : le cas des politiques de Gestion Intégrée des Zones Côtières

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Hélène Rey-Valette

    2006-12-01

    Full Text Available Cet article se propose d’étudier dans quelle mesure la prise en compte du développement durable au sens d’un nouveau référentiel prônant des logiques de transversalité, de long terme et de participation pour les politiques publiques oblige à revoir les méthodes d’évaluation de ces politiques. Le champ d’étude porte sur la Gestion Intégrée des Zones Côtières (GIZC qui est un cas exemplaire de la prise en compte du développement durable à l’échelle d’un espace spécifique, le littoral, par ailleurs porteur d’enjeux importants. L’analyse est centrée sur la dimension institutionnelle du développement durable ainsi que sur l’évaluation de la gouvernance au sein des dispositifs de GIZC, et plus généralement sur l’évaluation des politiques d’aménagement des territoires.This paper studies to what extent public policy evaluation practices need to be revised whilst considering sustainable development as a system of references regarding transversality, the long-run as well as public participation. We focus on Integrated Coastal Zone Management (ICZM that takes into account sustainable development in costal management. We analyze the institutional part of sustainable development and governance processes in ICZM implementation schemes, and we show new insights in planning policy evaluation.

  3. ÉTUDE DE CAS — Vietnam : Les communes du Vietnam ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    16 déc. 2010 ... Les communes du Vietnam progressent grâce à l'information Au Vietnam, un système de suivi communautaire de la pauvreté s'appuie sur des enquêtes officielles afin de mieux cibler les pauvres. Les données supplémentaires permettent d'améliorer la vie des collectivités, celle des femmes en particulier.

  4. Cas4-Dependent Prespacer Processing Ensures High-Fidelity Programming of CRISPR Arrays.

    Science.gov (United States)

    Lee, Hayun; Zhou, Yi; Taylor, David W; Sashital, Dipali G

    2018-04-05

    CRISPR-Cas immune systems integrate short segments of foreign DNA as spacers into the host CRISPR locus to provide molecular memory of infection. Cas4 proteins are widespread in CRISPR-Cas systems and are thought to participate in spacer acquisition, although their exact function remains unknown. Here we show that Bacillus halodurans type I-C Cas4 is required for efficient prespacer processing prior to Cas1-Cas2-mediated integration. Cas4 interacts tightly with the Cas1 integrase, forming a heterohexameric complex containing two Cas1 dimers and two Cas4 subunits. In the presence of Cas1 and Cas2, Cas4 processes double-stranded substrates with long 3' overhangs through site-specific endonucleolytic cleavage. Cas4 recognizes PAM sequences within the prespacer and prevents integration of unprocessed prespacers, ensuring that only functional spacers will be integrated into the CRISPR array. Our results reveal the critical role of Cas4 in maintaining fidelity during CRISPR adaptation, providing a structural and mechanistic model for prespacer processing and integration. Copyright © 2018 Elsevier Inc. All rights reserved.

  5. Gestion des risques naturels et prise en compte du développement durable : un lien équivoque. Le cas du sud grenoblois

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Lauren Andres

    2009-01-01

    Full Text Available Cet article questionne la nature du lien envisageable entre risque naturel et développement durable à travers l’étude du territoire du sud grenoblois, soumis notamment à deux aléas naturels majeurs : le mouvement de terrain de grande ampleur dit des « Ruines de Séchilienne » et les probables crues de la Romanche et du Drac. Trois étapes structurent cette réflexion questionnant la transition supposée entre une gestion des risques naturels et une gestion durable des territoires soumis aux risques naturels : une association toute relative, un lien logique mais limité sur le terrain, une relation surtout indirecte. Les interactions identifiées, en termes législatifs mais aussi idéels et opérationnels, entre risque et durabilité se révèlent ainsi complexes et ne sont pas forcément explicites ; elles dépendent en particulier de multiples échelles territoriales (nationales à locales, confrontant alors pour l’essentiel des stratégies d’acteurs – porteurs des décisions ou du savoir technique – distinctes.

  6. CRISPR/Cas9 in Genome Editing and Beyond.

    Science.gov (United States)

    Wang, Haifeng; La Russa, Marie; Qi, Lei S

    2016-06-02

    The Cas9 protein (CRISPR-associated protein 9), derived from type II CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) bacterial immune systems, is emerging as a powerful tool for engineering the genome in diverse organisms. As an RNA-guided DNA endonuclease, Cas9 can be easily programmed to target new sites by altering its guide RNA sequence, and its development as a tool has made sequence-specific gene editing several magnitudes easier. The nuclease-deactivated form of Cas9 further provides a versatile RNA-guided DNA-targeting platform for regulating and imaging the genome, as well as for rewriting the epigenetic status, all in a sequence-specific manner. With all of these advances, we have just begun to explore the possible applications of Cas9 in biomedical research and therapeutics. In this review, we describe the current models of Cas9 function and the structural and biochemical studies that support it. We focus on the applications of Cas9 for genome editing, regulation, and imaging, discuss other possible applications and some technical considerations, and highlight the many advantages that CRISPR/Cas9 technology offers.

  7. Comportement des métaux et fonctionnement d’un estuaire en zone sub aride : cas de l’estuaire du Souss (côte atlantique Marocaine

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Elmouden, A.

    2005-04-01

    des teneurs en métaux dans les carottes montre un enrichissement dans les horizons à granulométrie fine attribué une migration des métaux par diagenèse précoce et leurs rétention dans les couches argileuses, et aussi probablement au contrôle par les conditions oxydo-réductrices du milieu. L’estuaire du Souss ne joue pas donc un rôle de piége vis-à-vis des métaux polluants comme c’est le cas de nombreux estuaires des zones tempérées. Par contre, la colonne sédimentaire de la slikke enregistre une légère augmentation des teneurs en éléments métalliques qui pourraient constituer un risque pour la vie aquatique et pour la salubrité des plages environnantes, en cas de changement des conditions physico-chimiques du milieu

  8. Comportement mécanique du foie en contexte traumatique : Rupture et endommagement des tissus

    OpenAIRE

    CONTE, Cécile

    2012-01-01

    Chaque année en France, on dénombre environ 2000 cas de lésions de la région abdominale lors d'accidents de la route. Ces lésions sont très souvent sévères, mortelles dans 20% des cas, et nécessitent un traitement médical délicat, long et coûteux car il fait appel à la chirurgie dans un cas sur deux. Parmi ces lésions, celles du foie font partie des plus fréquentes mais aussi des plus graves à cause de leur risque hémorragique et sceptique élevé. Une voie d'amélioration de leur prévention pas...

  9. Arthroplastie totale du coude sur séquelles d'ostéoarthrite négligée ...

    African Journals Online (AJOL)

    L'arthroplastie totale au cours des séquelles d'infection ostéo-articulaire a été destinée surtout pour la hanche et le genou. Cependant, peu de travaux ont étaient consacrée pour l'articulation du coude. Nous rapportons le cas d'une patiente, âgée de 26 ans, ayant présentée dans l'enfance une ostéoarthrite du coude ...

  10. La motivation au travail dans un contexte de changement: Cas du ...

    African Journals Online (AJOL)

    User

    La mise en œuvre de nouvelles méthodes de gestion des tâches, le développement de .... dynamique motivationnelle dans les services centraux du ministère de ..... tâches qui augmentent le contrôle de chacun sur l'organisation de son travail.

  11. ÉTUDE DE CAS — Cuba : Le logement et le capital humain à Cuba ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    10 janv. 2011 ... ÉTUDE DE CAS — Cuba : Le logement et le capital humain à Cuba ... Centre de recherches pour le développement international (CRDI) du Canada révèle ... Les ressources déjà limitées sont devenues encore plus rares. ... de l'Institut national pour l'hygiène, l'épidémiologie et la microbiologie (INHEM), ...

  12. La lithiase du bas appareil urinaire: Analyse rétrospective de 111 ...

    African Journals Online (AJOL)

    La lithiase du bas appareil urinaire: Analyse rétrospective de 111 cas au CHU de Conakry. I Bah. Abstract. No Abstract. Full Text: EMAIL FREE FULL TEXT EMAIL FREE FULL TEXT · DOWNLOAD FULL TEXT DOWNLOAD FULL TEXT · AJOL African Journals Online. HOW TO USE AJOL... for Researchers · for Librarians ...

  13. Corrective Action Plan for Corrective Action Unit 139: Waste Disposal Sites, Nevada Test Site, Nevada

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    NSTec Environmental Restoration

    2007-07-01

    Corrective Action Unit (CAU) 139, Waste Disposal Sites, is listed in the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO) of 1996 (FFACO, 1996). CAU 139 consists of seven Corrective Action Sites (CASs) located in Areas 3, 4, 6, and 9 of the Nevada Test Site (NTS), which is located approximately 65 miles (mi) northwest of Las Vegas, Nevada (Figure 1). CAU 139 consists of the following CASs: CAS 03-35-01, Burn Pit; CAS 04-08-02, Waste Disposal Site; CAS 04-99-01, Contaminated Surface Debris; CAS 06-19-02, Waste Disposal Site/Burn Pit; CAS 06-19-03, Waste Disposal Trenches; CAS 09-23-01, Area 9 Gravel Gertie; and CAS 09-34-01, Underground Detection Station. Details of the site history and site characterization results for CAU 139 are provided in the approved Corrective Action Investigation Plan (CAIP) (U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office [NNSA/NSO], 2006) and in the approved Corrective Action Decision Document (CADD) (NNSA/NSO, 2007). The purpose of this Corrective Action Plan (CAP) is to present the detailed scope of work required to implement the recommended corrective actions as specified in Section 4.0 of the approved CADD (NNSA/NSO, 2007). The approved closure activities for CAU 139 include removal of soil and debris contaminated with plutonium (Pu)-239, excavation of geophysical anomalies, removal of surface debris, construction of an engineered soil cover, and implementation of use restrictions (URs). Table 1 presents a summary of CAS-specific closure activities and contaminants of concern (COCs). Specific details of the corrective actions to be performed at each CAS are presented in Section 2.0 of this report.

  14. Corrective Action Plan for Corrective Action Unit 139: Waste Disposal Sites, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    NSTec Environmental Restoration

    2007-01-01

    Corrective Action Unit (CAU) 139, Waste Disposal Sites, is listed in the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO) of 1996 (FFACO, 1996). CAU 139 consists of seven Corrective Action Sites (CASs) located in Areas 3, 4, 6, and 9 of the Nevada Test Site (NTS), which is located approximately 65 miles (mi) northwest of Las Vegas, Nevada (Figure 1). CAU 139 consists of the following CASs: CAS 03-35-01, Burn Pit; CAS 04-08-02, Waste Disposal Site; CAS 04-99-01, Contaminated Surface Debris; CAS 06-19-02, Waste Disposal Site/Burn Pit; CAS 06-19-03, Waste Disposal Trenches; CAS 09-23-01, Area 9 Gravel Gertie; and CAS 09-34-01, Underground Detection Station. Details of the site history and site characterization results for CAU 139 are provided in the approved Corrective Action Investigation Plan (CAIP) (U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office [NNSA/NSO], 2006) and in the approved Corrective Action Decision Document (CADD) (NNSA/NSO, 2007). The purpose of this Corrective Action Plan (CAP) is to present the detailed scope of work required to implement the recommended corrective actions as specified in Section 4.0 of the approved CADD (NNSA/NSO, 2007). The approved closure activities for CAU 139 include removal of soil and debris contaminated with plutonium (Pu)-239, excavation of geophysical anomalies, removal of surface debris, construction of an engineered soil cover, and implementation of use restrictions (URs). Table 1 presents a summary of CAS-specific closure activities and contaminants of concern (COCs). Specific details of the corrective actions to be performed at each CAS are presented in Section 2.0 of this report

  15. L'amenagement du territoire au Benin : Les rendez-vous manques ...

    African Journals Online (AJOL)

    Le leadership est une variable-clé de l'aménagement du territoire. L'histoire, à travers l'expérience de certains pays, en donne la démonstration. Le cas certainement le plus illustratif est celui de la France au sortir de la Seconde guerre mondiale. La « politique de reconstruction de la France libérée » a connu son ...

  16. Incidence du contexte sur l'efficacité des think tanks dans les pays ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    indicateurs quantitatifs de mesures clés du contexte et de l'efficacité à la lumière des résultats des études de cas. Le projet devrait aboutir à la formulation de recommandations concrètes et applicables à l'intention des think tanks, des bailleurs de fonds ...

  17. La ponction biopsie hépatique à Dakar: indications, complications et apport diagnostique - à propos de 70 cas

    Science.gov (United States)

    Touré, Papa Souleymane; Léye, Abdoulaye; Diop, Madoky Maguette; Gueye, Mame Daouda; Léye, Yakham Mohamed; Berthé, Adama; Mourtalla Ka, Mamadou

    2014-01-01

    Introduction Les objectifs de notre travail étaient de déterminer les indications, les complications et l'apport diagnostique de la ponction biopsie hépatique (PBH) transpariétale. Méthodes Il s'agissait d'une étude rétrospective descriptive allant du janvier 2006 à décembre 2010, réalisée dans le service de Médecine Interne de l'hôpital de Pikine de Dakar. Etaient inclus, tous les malades ayant subi une biopsie hépatique, en ambulatoire ou en hospitalisation. Etaient exclus, tous les patients qui ont bénéficié d'une PBH dont les résultats n'ont pas été retrouvés. Les données suivantes étaient étudié: l’âge, le sexe, les indications, la taille du fragment biopsique, Le nombre de carottes, les complications, la comparaison des diagnostics pré biopsiques avec les comptes rendus histologiques. Résultats Ont été colligées 70 patients atteints d'hépatopathie chronique ayant bénéficiés d'une PBH. Il s'agissait de 46 hommes (65.71%) et 24 femmes (34.29%). L’âge moyen des patients était de 36 ans. Les PBH étaient réalisées en ambulatoire chez 58 patients (82.86%) et chez 12 malades hospitalisés (17,14%). Les indications étaient dominées par les hépatites virales chroniques dans 62,86% (44cas), suivi des processus tumoraux du foie dans 24.29% (17 cas). Les complications survenues chez 15 patients (21.43%) étaient représentées de 14 cas de douleur (20%) et d'un cas de malaise vagal (1.43%). Les 70 PBH effectuées ont ramené une carotte dans 35,71% des cas, 2 à 6 carottes dans 32,87% des cas. La longueur moyenne des fragments biopsiques était de 22 ±8 mm. Soixante-six résultats étaient interprétables et 4 non interprétables soit une performance diagnostique de 94,29%. Conclusion La PBH est de pratique sure, avec un respect des contres indications et une bonne maitrise de la technique. Son acceptabilité a été bonne dans notre pratique et sa rentabilité diagnostique excellente. Elle devrait être beaucoup plus

  18. la tumeur de warthin de la parotide : a propos de 11 cas

    African Journals Online (AJOL)

    9 mai 2013 ... Nodule de densité tissulaire à contours nets du pôle infé- rieur de la glande parotide gauche avec prise de contraste hétérogène. L'iRM réalisée pour 3 autres patients a posé le diagnos- tic de tumeur bénigne de la parotide dans tous les cas en montrant des tumeurs aux contours réguliers et biens définis.

  19. Les Cicatrices Retractiles Post-Brulures Du Membre Inferieur Chez L’Enfant

    Science.gov (United States)

    Sankale, A.A.; Manyacka Ma Nyemb, P.; Coulibaly, N.F.; Ndiaye, A.; Ndoye, M.

    2010-01-01

    Summary Il s'agit d'une étude faisant ressortir les aspects épidémiologiques, cliniques et thérapeutiques des séquelles de brûlures du membre inférieur chez l'enfant, à propos de 42 cas colligés au service de chirurgie infantile de l'Hôpital Aristide Le Dantec (Sénégal). L'âge moyen retrouvé est de 5 ans et 3 mois, et le sex-ratio garçons/filles de 1,8/1. La brûlure thermique est causée par une flamme dans 33% des cas, par un liquide chaud dans 21% des cas, et par des braises dans 21% des cas. Les cicatrices rétractiles intéressent le genou et le creux poplité dans 47% des cas et le pied dans 45% des cas. Elles sont bilatérales dans 21% des cas, et concernent une autre localisation associée dans 21% des cas. Quant aux brides, 21% ont bénéficié d'une chirurgie, avec un délai moyen de 3 ans et 2 mois après la brûlure. Cette procédure chirurgicale consiste en une plastie en Z dans 91% des cas, à laquelle est associée une greffe de peau dans 54% des cas. Une rééducation fonctionnelle est pratiquée chez 54% des opérés. Parallèlement aux données de la littérature, nos résultats montrent que l'optimisation de la prise en charge passe par une meilleure prévention des accidents domestiques et une bonne codification thérapeutique. PMID:21991202

  20. Corrective Action Investigation Plan for Corrective Action Unit 137: Waste Disposal Sites, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    Wickline, Alfred

    2005-01-01

    This Corrective Action Investigation Plan (CAIP) contains project-specific information including facility descriptions, environmental sample collection objectives, and criteria for conducting site investigation activities at Corrective Action Unit (CAU) 137: Waste Disposal Sites. This CAIP has been developed in accordance with the ''Federal Facility Agreement and Consent Order'' (FFACO) (1996) that was agreed to by the State of Nevada, the U.S. Department of Energy (DOE), and the U.S. Department of Defense. Corrective Action Unit 137 contains sites that are located in Areas 1, 3, 7, 9, and 12 of the Nevada Test Site (NTS), which is approximately 65 miles (mi) northwest of Las Vegas, Nevada (Figure 1-1). Corrective Action Unit 137 is comprised of the eight corrective action sites (CASs) shown on Figure 1-1 and listed below: (1) CAS 01-08-01, Waste Disposal Site; (2) CAS 03-23-01, Waste Disposal Site; (3) CAS 03-23-07, Radioactive Waste Disposal Site; (4) CAS 03-99-15, Waste Disposal Site; (5) CAS 07-23-02, Radioactive Waste Disposal Site; (6) CAS 09-23-07, Radioactive Waste Disposal Site; (7) CAS 12-08-01, Waste Disposal Site; and (8) CAS 12-23-07, Waste Disposal Site. The Corrective Action Investigation (CAI) will include field inspections, radiological surveys, geophysical surveys, sampling of environmental media, analysis of samples, and assessment of investigation results, where appropriate. Data will be obtained to support corrective action alternative evaluations and waste management decisions. The CASs in CAU 137 are being investigated because hazardous and/or radioactive constituents may be present in concentrations that could potentially pose a threat to human health and the environment. Existing information on the nature and extent of potential contamination is insufficient to evaluate and recommend corrective action alternatives for the CASs. Additional information will be generated by conducting a CAI before evaluating and selecting corrective action

  1. La n?phrotoxicite secondaire ? l'hyperbilribinemie: ? propos d'un cas

    OpenAIRE

    Jomni, Med Taieb; Largueche, Mouna; Kaab, Badreddine Ben; Abdelaal, Imen; Bellakhal, Syrine; Douggui, Med H?di

    2015-01-01

    L'hyperbilirubin?mie ? des taux ?lev?s est nephrotoxique par divers m?canismes allant de la tubulopathie proximale aux d?p?ts massifs de bilirubine. Cette entit? bien que d?crite depuis le d?but du vingti?me si?cle est souvent m?connue dans la litt?rature moderne. Nous rapportons le cas d'un patient pr?sentant une cirrhose probablement d'origine m?dicamenteuse (Amiodarone*), dont la fonction r?nale s'est alt?r?e parall?lement ? la majoration de l'hyperbilirubin?mie. Aucune autre cause de l'in...

  2. Processus d'innovation et recomposition des territoires agricoles : le cas du semis sous couvert végétal au nord du Cameroun

    OpenAIRE

    Dugué, Patrick; Olina Bassala, Jean-Paul

    2015-01-01

    Au nord du Cameroun, l'adoption des systèmes de culture sous couvert végétal (SCV) butte sur le partage des résidus de culture fourragers en saison sèche entre le bétail et la couverture du sol. Elle nécessite donc d'accroître l'offre fourragère et de prendre en compte les différents types d'élevage (villageois, semi-sédentaire, transhumant, etc.). Dans les conditions actuelles de pratique des SCV par les producteurs (faible couverture du sol, peu d'années successives en SCV) les effets atten...

  3. A Mathematical model for gastrointestinal tract dosimetry, and its application to adults; Modele mathematique destine a la dosimetrie du tractus gastrointestinal - application a l'adulte

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Vacca, G; Bazin, J P; Karhausen, L [Commissariat a l' Energie Atomique, Fontenay-aux-Roses (France). Centre d' Etudes Nucleaires

    1969-07-01

    A new method is proposed for the computation of the dose delivered to any level of the gastrointestinal tract after ingestion of radioactive substances. The same method is used as that proposed by ICRP. The concentration of the radionuclide during the progression of the meal is the central concept of this model. A graph relates the MPC with the radioactive half life of the radionuclide and with any level of the gastrointestinal tract of adults.Soluble and insoluble radionuclides are considered. The case of daughter products is discussed in the Appendix. (author) [French] Une methode nouvelle permet le calcul de la dose delivree a un niveau quelconque du tractus gastrointestinal apres ingestion de substances radioactives. Elle utilise d une part la technique de calcul proposee par l'ICRP et de l'autre la notion de concentration du radionuclide au cours de la progression du repas. Un graphique simple met en relation la valeur de la concentration maximale admissible avec la periode radioactive du radionuclide et le niveau considere du tractus gastrointestinal de l'adulte. Le cas d'un radionuclide soluble et celui d'un radionuclide insoluble sont envisages. Un appendice traite le cas des filiations. (auteur)

  4. Sr{sup 90} determination in calcareous water; Determination du {sup 90}Sr dans des eaux chargees en calcium

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Cohen, P; Pardo, G; Wormser, G [Commissariat a l' Energie Atomique, Saclay (France). Centre d' Etudes Nucleaires

    1958-07-01

    The Straub method (ref. 2) for determination of radioactive strontium in water containing calcium is valid within very wide limits, and particularly in the case of residual water from the chemical purification treatment of the radioactive liquid effluent at the C.E.N. Saclay. (author) [French] La methode de Straub (ref. 2) de determination du strontium radioactif dans une eau chargee en calcium est valable dans des limites tres larges et en particulier dans le cas d'eaux residuaires provenant du traitement d'epuration chimique des effluents liquides radioactifs du C.E.N. de Saclay. (auteur)

  5. Néotoponymie contestée à Potchefstroom / Tlokwe (Province du Nord-Ouest, Afrique du Sud

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Myriam Houssay-Holzschuch

    2010-09-01

    Full Text Available Illustration 1 - Extrait du site de la municipalité de Potchefstroom / TlokweSource : http://www.potch.co.za/newsarchive/streetnames.htmlIllustration 2- Potchefstroom (Afrique du SudAuteur : Béatrice Obry-Guyot, début décembre 2007.Illustration 3 - Extrait du plan Google Map de PotchefstroomSource : Google Map.La question toponymique en Afrique du Sud sur la longue durée porte sur deux thèmes essentiels porteurs de controverses : le plurilinguisme et le marquage symbolique et mémoriel du te...

  6. Cas9 specifies functional viral targets during CRISPR-Cas adaptation.

    Science.gov (United States)

    Heler, Robert; Samai, Poulami; Modell, Joshua W; Weiner, Catherine; Goldberg, Gregory W; Bikard, David; Marraffini, Luciano A

    2015-03-12

    Clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR) loci and their associated (Cas) proteins provide adaptive immunity against viral infection in prokaryotes. Upon infection, short phage sequences known as spacers integrate between CRISPR repeats and are transcribed into small RNA molecules that guide the Cas9 nuclease to the viral targets (protospacers). Streptococcus pyogenes Cas9 cleavage of the viral genome requires the presence of a 5'-NGG-3' protospacer adjacent motif (PAM) sequence immediately downstream of the viral target. It is not known whether and how viral sequences flanked by the correct PAM are chosen as new spacers. Here we show that Cas9 selects functional spacers by recognizing their PAM during spacer acquisition. The replacement of cas9 with alleles that lack the PAM recognition motif or recognize an NGGNG PAM eliminated or changed PAM specificity during spacer acquisition, respectively. Cas9 associates with other proteins of the acquisition machinery (Cas1, Cas2 and Csn2), presumably to provide PAM-specificity to this process. These results establish a new function for Cas9 in the genesis of prokaryotic immunological memory.

  7. LA PELLAGRE: ASPECTS EPIDEMIOLOGIQUES ET CLINIQUES DANS LA REGION OUEST DU BURKINA FASO

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Fatou Barro/Traoré

    2013-10-01

    Full Text Available Introduction: La pellagre est une carence en vitamine PP qui regroupe l’acide nicotinique ou niacine et le nicotinamide. Elle est encore fréquente dans notre pays. Le but de cette étude était de décrire les aspects épidémiologiques et cliniques de la pellagre dans la région Ouest du Burkina Faso. Patients et Méthodes: Il s’est agi d’une étude rétrospective, descriptive à partir des dossiers des patients ayant consulté ou ayant été hospitalisés dans les services de dermatologie-vénéréologie et de psychiatrie à Bobo-Dioulasso, de 2005 à 2012. Résultats: Durant la période, 223 cas de pellagre ont été enregistrés. L’âge moyen des patients était de 37,7+17,2 ans avec des extrêmes de 6 et 85 ans et un sex-ratio de 1/3. Ces cas ont été observés dans les zones aussi bien rurales qu’urbaines de l’Ouest du Burkina Faso. Les femmes étaient les plus atteintes (76,7%, particulièrement les femmes au foyer (47,1%. Les formes ulcéreuses représentaient 6,3% des cas, les atteintes neurologiques 62% et la diarrhée chronique (6,5%. Trois patients sont décédés (1,3%. Conclusion: La pellagre est une affection fréquente chez les femmes dans l’Ouest du Burkina Faso où le maïs constitue la céréale de base dans l’alimentation des populations. Les formes ulcéreuses pouvaient égarer le diagnostic. Une sensibilisation de la population est indispensable pour prévenir cette affection.

  8. Carcinome épidermoïde Primitif de la Prostate: A propos d'un cas et ...

    African Journals Online (AJOL)

    A. Bahloul

    RAU: rétention aigu d'urine, SUBA: symptômes urinaires du bas appareil, ADP: adénopathies, PRP: prostatectomie rétro-pubienne, CPT: cysto- prostatectomie totale, RTUP: résection trans-urétrale de la prostate nécessaires [9]. Munoz F et al. [1] a présenté un cas traité par une association radio-chimiothérapie, permettant ...

  9. Epidémiologie des PFA et les performances du système de surveillance en Mauritanie de 2008 à 2012

    Science.gov (United States)

    Doumtsop, Jean Gérard Tatou; Khalef, Ishagh; Diakite, Med Lemine Brahim; Boubker, Naouri

    2014-01-01

    Introduction La Commission Régionale de Certification de l'Eradication de la poliomyélite pour l'Afrique(CRCA) en session à Brazzaville du 8 au 10 octobre 2007 avait déclaré la Mauritanie « libérée de la poliomyélite ». Objectif Décrire l’épidémiologie des PFA (Paralysies flasques aigues) et évaluer les indicateurs de performance du système de surveillance pour la période de 2008 à 2012 ayant suivi cette déclaration. Méthodes Les données du service de surveillance épidémiologique ont été nettoyées et analysées à l'aide du logiciel Epi-infoversion 3.4.3 (CDC Atlanta). Résultats 319 cas de PFA ont été notifié soit une incidence moyenne de 4.61/100000 enfants de moins de 15 ans par an. La distribution des cas cumulés par mois montre une importante notification des cas PFA pendant la période de Février à Juillet et à la suite de l’épidémie de 2009 alors que l'incidence des cas confirmés a été plus importante entre Novembre et Février. L’âge moyen était de 4ans (E.T. ±4ans) et 77.4% avaient un âge = 5ans. 18 cas de PFA ont été confirmés poliovirus sauvage(PVS) dont 6 en 2009 et 12 en 2010 et tous d'importation. L’âge moyen était de 3.4 ans (E.T ±2.6 ans). 44,4% étaient des filles et 55.5% garçons. Cette proportion était proche de celle des PFA non polio (45.1% versus 54.9%). 61% avaient reçu au plus une dose de vaccin polio orale (VPO) pour les cas de PFA polio contre 7.4% pour les PFA non polio. Aucune discrimination de genre n'a été observé sur la population des PFA ayant reçu une dose au plus (ratio-sexe= 16/17=0.94). La fièvre était présente pour 90%des cas de PFA non polio contre 85% pour les cas PVS. Cette fièvre à progresser en 3 jours pour tous les cas de PVS et pour 82,7% des cas de PFA non polio. Le taux d'hospitalisation était de 13.6% pour les cas de PFA non polio contre 89% pour les PFA polio. Dans tous les deux groupes, les membres de prédilection étaient d'abord l'un des 2 membres

  10. Analyse pragma-énonciative des s/citations du site d’Arrêt sur images A pragma-enunciative analysis of quotations on the Web site Arrêt sur images (Freeze-frame

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Alain Rabatel

    2010-04-01

    Full Text Available Cet article analyse différentes formes de citations dans les sites de presse sur le WEB, en prenant comme exemple le site d’Arrêt sur images. Après avoir analysé les deux grandes catégories d’enchâssements énonciatifs à l’œuvre sur le site et dégagé quelques spécificités du discours représenté/montré et du discours d’escorte qui commente le précédent, l’article montre que le discours d’escorte joue un rôle argumentatif majeur dans la mesure où il fait plus qu’inciter le lecteur à faire apparaître les citations, il les présente comme des éléments de preuve, bref, comme des citations à faire comparaître. La fonction rhétorico-argumentative de ces citations est confirmée par le procédé du montage, qui démonte les situations servant de support à une démonstration basée sur des preuves. Enfin, compte tenu du caractère médiacritique du site, le discours d’escorte construit un ethos de professionnalisme exigeant et une communauté discursive et interprétative soudée autour de valeurs partagées.This article analyzes different forms of quotation on Web press sites, using the site Arrêt sur images as an example. After analyzing the two large categories of enunciative embeddings at work on the site and identifying the marks of direct represented/shown discourse and accompanying discourse, it shows that accompanying discourse plays a major argumentative role in so far as it does more than incite the reader to display the quotations, it presents them as elements of proof, in short, as quotations to be summoned. The rhetoric-argumentative function of quotations is confirmed through the process of editing, which dissects the situation while serving as a support to demonstration. This editing rests on a circular logic of justification based on proof. At last, considering the media critical character of the site, the accompanying discourse constructs an ethos of demanding professionalism and a united

  11. Lambeau Expanse du Cuir Chevelu dans la Couverture des Alopecies Cicatricielles sur Sequelles de Brulures. A Propos d'une Observation

    Science.gov (United States)

    El Mazouz, S.; Hafidi, J.; Fejjal, N.; Mejjati, H.; Cherkab, L.; Gharib, N.; Abbassi, A.

    2010-01-01

    Summary Les séquelles esthétiques des alopécies cicatricielles sur séquelles de brûlures sont responsables de préjudices empêchant parfois la réinsertion sociale du patient, surtout chez les sujets de sexe féminin. Le cuir chevelu permet la réalisation de lambeaux permettant de couvrir ces alopécies. Les Auteurs décrivent le cas d'une jeune patiente victime d'une alopécie cicatricielle sur séquelles de brûlures chez qui ils ont réalisé un lambeau expansé du cuir chevelu et mettent le point sur la prise en charge de ces lésions à travers ce cas clinique et une revue de littérature. PMID:21991195

  12. Le stéréotype du bandit catalan dans la littérature espagnole du Siècle d’Or

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Mathias Ledroit

    2009-12-01

    Full Text Available Le bandit catalan est un personnage que l’on rencontre fréquemment dans la littérature espagnole du Siècle d’Or et des auteurs tels que Cervantès, Lope de Vega et Tirso de Molina se sont beaucoup intéressés à lui à une époque où le banditisme resurgit avec force en Espagne. Le poncif littéraire présente de nombreux points communs avec le stéréotype social tel qu’il est représenté dans les documents contemporains qui exposent les origines du phénomène. Il est dans les deux cas dépeint comme un justicier qui n’écoute que ce que lui dicte son honneur. Toutefois, il s’agit d’une vision déformée de la réalité qui pose un problème d’interprétation : comment expliquer que les auteurs espagnols du XVIIe siècle aient pu voir dans ce criminel un modèle de vertu ?

  13. Phylogeny of Cas9 determines functional exchangeability of dual-RNA and Cas9 among orthologous type II CRISPR-Cas systems

    Science.gov (United States)

    Fonfara, Ines; Le Rhun, Anaïs; Chylinski, Krzysztof; Makarova, Kira S.; Lécrivain, Anne-Laure; Bzdrenga, Janek; Koonin, Eugene V.; Charpentier, Emmanuelle

    2014-01-01

    The CRISPR-Cas-derived RNA-guided Cas9 endonuclease is the key element of an emerging promising technology for genome engineering in a broad range of cells and organisms. The DNA-targeting mechanism of the type II CRISPR-Cas system involves maturation of tracrRNA:crRNA duplex (dual-RNA), which directs Cas9 to cleave invading DNA in a sequence-specific manner, dependent on the presence of a Protospacer Adjacent Motif (PAM) on the target. We show that evolution of dual-RNA and Cas9 in bacteria produced remarkable sequence diversity. We selected eight representatives of phylogenetically defined type II CRISPR-Cas groups to analyze possible coevolution of Cas9 and dual-RNA. We demonstrate that these two components are interchangeable only between closely related type II systems when the PAM sequence is adjusted to the investigated Cas9 protein. Comparison of the taxonomy of bacterial species that harbor type II CRISPR-Cas systems with the Cas9 phylogeny corroborates horizontal transfer of the CRISPR-Cas loci. The reported collection of dual-RNA:Cas9 with associated PAMs expands the possibilities for multiplex genome editing and could provide means to improve the specificity of the RNA-programmable Cas9 tool. PMID:24270795

  14. CRISPR-Cas9 technology and its application in haematological disorders

    Science.gov (United States)

    Zhang, Han; McCarty, Nami

    2018-01-01

    Summary The recent advent of the Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)-CRISPR associated protein 9 (Cas9) system for precise genome editing has revolutionized methodologies in haematology and oncology studies. CRISPR-Cas9 technology can be used to remove and correct genes or mutations, and to introduce site-specific therapeutic genes in human cells. Inherited haematological disorders represent ideal targets for CRISPR-Cas9-mediated gene therapy. Correcting disease-causing mutations could alleviate disease-related symptoms in the near future. The CRISPR-Cas9 system is also a useful tool for delineating molecular mechanisms involving haematological malignancies. Prior to the use of CRISPR-Cas9-mediated gene correction in humans, appropriate delivery systems with higher efficiency and specificity must be identified, and ethical guidelines for applying the technology with controllable safety must be established. Here, the latest applications of CRISPR-Cas9 technology in haematological disorders, current challenges and future directions are reviewed and discussed. PMID:27619566

  15. Modification of ethylene sensitivity in ornamental plants using CRISPR/Cas9

    DEFF Research Database (Denmark)

    Kemp, Oliver; Favero, Bruno Trevenzoli; Hegelund, Josefine Nymark

    2017-01-01

    ; the Clustered Regularly Interspaced Palindromic Repeats (CRISPR) RNA guided Cas9 DNA nuclease (CRISPR/Cas9). CRISPR/Cas9 may be employed to introduce targeted double-stranded breaks (DSBs) at desired sites in the host genome. The DSBs will be repaired by the non-homologous end-joining (NHEJ) repair mechanism...... which often results in small indels and consequently gene knockout. The CRISPR/Cas9 system consists of a protein DNA nuclease (Cas9) which is guided to the target sequence by a small RNA molecule (sgRNA) that recognizes a 20 bp target sequence in the genome situated immediately downstream of a 3 bp...... protospacer adjacent motif (PAM). The sgRNA confers the sequence specificity of the CRISPR/Cas9 complex and may thus be designed to target virtually any sequence, a feature that has made it the method of choice within precise genetic engineering. Although most research with CRISPR/Cas9 has been conducted...

  16. La dimension symbolique du capital social: les grandes cercles et Rotary clubs de Milan

    NARCIS (Netherlands)

    Cousin, B.; Chauvin, S.

    2010-01-01

    Les cercles et clubs bourgeois des métropoles européennes ont jusqu'ici surtout fait l'objet de monographies isolées. Le cas milanais permet de passer à une analyse relationnelle : les institutions de gestion collective du capital social des classes dominantes y forment en effet un espace de jeu et

  17. CCTop: An Intuitive, Flexible and Reliable CRISPR/Cas9 Target Prediction Tool.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Manuel Stemmer

    Full Text Available Engineering of the CRISPR/Cas9 system has opened a plethora of new opportunities for site-directed mutagenesis and targeted genome modification. Fundamental to this is a stretch of twenty nucleotides at the 5' end of a guide RNA that provides specificity to the bound Cas9 endonuclease. Since a sequence of twenty nucleotides can occur multiple times in a given genome and some mismatches seem to be accepted by the CRISPR/Cas9 complex, an efficient and reliable in silico selection and evaluation of the targeting site is key prerequisite for the experimental success. Here we present the CRISPR/Cas9 target online predictor (CCTop, http://crispr.cos.uni-heidelberg.de to overcome limitations of already available tools. CCTop provides an intuitive user interface with reasonable default parameters that can easily be tuned by the user. From a given query sequence, CCTop identifies and ranks all candidate sgRNA target sites according to their off-target quality and displays full documentation. CCTop was experimentally validated for gene inactivation, non-homologous end-joining as well as homology directed repair. Thus, CCTop provides the bench biologist with a tool for the rapid and efficient identification of high quality target sites.

  18. Sud du Sahara | Page 158 | CRDI - Centre de recherches pour le ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    Les prévisions des services météorologiques du Kenya ont gagné en fiabilité, mais les agriculteurs n'y ont guère recours pour prendre des décisions appropriées relativement à la gestion de leur exploitation, car elles ne tiennent pas compte des réalités locales. Dans le cadre de cette étude de cas, des chercheurs ont ...

  19. Sud du Sahara | Page 141 | CRDI - Centre de recherches pour le ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    Les prévisions des services météorologiques du Kenya ont gagné en fiabilité, mais les agriculteurs n'y ont guère recours pour prendre des décisions appropriées relativement à la gestion de leur exploitation, car elles ne tiennent pas compte des réalités locales. Dans le cadre de cette étude de cas, des chercheurs ont ...

  20. The CAS Classroom

    Science.gov (United States)

    Garner, Sue

    2004-01-01

    The Victorian Curriculum and Assessment Authority (VCAA) Computer Algebra System (CAS)Pilot study (2001-2005) is monitoring the use of CAS in senior secondary mathematics. This article explores the author's experiences in the CAS classroom and delineates changes in teaching style, as a result of the introduction of CAS into the senior mathematics…

  1. Port du hijab et « défaut d’assimilation »

    OpenAIRE

    Hajjat, Abdellali

    2013-01-01

    Dans le cadre de deux procédures d’attribution de la nationalité française, l’administration doit évaluer le « degré d’assimilation » des candidats. Le gouvernement peut ainsi refuser l’acquisition de la nationalité au motif du « défaut d’assimilation » pour la procédure de naturalisation (article 21-24 du code civil) et pour l’acquisition par mariage (article 21-4). Cet article analyse le « sens pratique de la mesure » de l’assimilation et prend pour objet un cas particulièrement problématiq...

  2. Excision of Nucleopolyhedrovirus Form Transgenic Silkworm Using the CRISPR/Cas9 System

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Zhanqi Dong

    2018-02-01

    Full Text Available The CRISPR/Cas9-mediated genome engineering has been shown to efficiently suppress infection by disrupting genes of the pathogen. We recently constructed transgenic lines expressing CRISPR/Cas9 and the double sgRNA target Bombyx mori nucleopolyhedrovirus (BmNPV immediate early-1 (ie-1 gene in the silkworm, respectively, and obtained four transgenic hybrid lines by G1 generation hybridization: Cas9(-/sgRNA(-, Cas9(+/sgRNA(-, Cas9(-/sgRNA(+, and Cas9(+/sgRNA(+. We demonstrated that the Cas9(+/sgRNA(+ transgenic lines effectively edited the target site of the BmNPV genome, and large fragment deletion was observed after BmNPV infection. Further antiviral analysis of the Cas9(+/sgRNA(+ transgenic lines shows that the median lethal dose (LD50 is 1,000-fold higher than the normal lines after inoculation with occlusion bodies. The analysis of economic characters and off-target efficiency of Cas9(+/sgRNA(+ transgenic hybrid line showed no significant difference compared with the normal lines. Our findings indicate that CRISPR/Cas9-mediated genome engineering more effectively targets the BmNPV genomes and could be utilized as an insect antiviral treatment.

  3. Excision of Nucleopolyhedrovirus Form Transgenic Silkworm Using the CRISPR/Cas9 System.

    Science.gov (United States)

    Dong, Zhanqi; Dong, Feifan; Yu, Xinbo; Huang, Liang; Jiang, Yaming; Hu, Zhigang; Chen, Peng; Lu, Cheng; Pan, Minhui

    2018-01-01

    The CRISPR/Cas9-mediated genome engineering has been shown to efficiently suppress infection by disrupting genes of the pathogen. We recently constructed transgenic lines expressing CRISPR/Cas9 and the double sgRNA target Bombyx mori nucleopolyhedrovirus (BmNPV) immediate early-1 ( ie-1 ) gene in the silkworm, respectively, and obtained four transgenic hybrid lines by G1 generation hybridization: Cas9(-)/sgRNA(-), Cas9(+)/sgRNA(-), Cas9(-)/sgRNA(+), and Cas9(+)/sgRNA(+). We demonstrated that the Cas9(+)/sgRNA(+) transgenic lines effectively edited the target site of the BmNPV genome, and large fragment deletion was observed after BmNPV infection. Further antiviral analysis of the Cas9(+)/sgRNA(+) transgenic lines shows that the median lethal dose (LD50) is 1,000-fold higher than the normal lines after inoculation with occlusion bodies. The analysis of economic characters and off-target efficiency of Cas9(+)/sgRNA(+) transgenic hybrid line showed no significant difference compared with the normal lines. Our findings indicate that CRISPR/Cas9-mediated genome engineering more effectively targets the BmNPV genomes and could be utilized as an insect antiviral treatment.

  4. ÉTUDE DE CAS — Pérou : Des défenseurs du marché équitable ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    16 déc. 2010 ... Bibliothèque numérique du CRDI extrants du projet 102003 · Competition, Competitiveness and Development: Lessons from Developing Countries Dans son analyse de la politique de la concurrence dans les stratégies de développement, cet ouvrage montre comment une politique de la concurrence, ...

  5. ?Off-Spotter?: very fast and exhaustive enumeration of genomic lookalikes for designing CRISPR/Cas guide RNAs

    OpenAIRE

    Pliatsika, Venetia; Rigoutsos, Isidore

    2015-01-01

    Background CRISPR/Cas (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/CRISPR associated nucleases) is a powerful component of the prokaryotic immune system that has been adapted for targeted genetic engineering in higher organisms. A key element of CRISPR/Cas is the ?guide? RNA (gRNA) that is ~20 nucleotides (nts) in length and designed to be complementary to the intended target site. An integral requirement of the CRISPR/Cas system is that the target site be followed by a protospa...

  6. Non est hic. Le cas exemplaire de la protection du fugitif

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jean-Pierre Cavaillé

    2007-06-01

    Full Text Available Le cas dont je voudrais ici esquisser l’histoire et montrer quelques uns des enjeux, est surtout, sinon exclusivement connu, aujourd’hui encore, dans la version proposée par Benjamin Constant pour mettre en évidence une conséquence nécessaire et selon lui inacceptable de la morale kantienne. Constant en effet écrit, dans ces Réactions politiques, publiées en 1797 : Le principe moral […] que dire la vérité est un devoir, s’il était pris d’une manière absolue et isolée, rendrait toute société i...

  7. Sylvie CHAPERON, La médecine du sexe et les femmes. Anthologie des perversions féminines au XIXe siècle

    OpenAIRE

    Edelman, Nicole

    2009-01-01

    L’ouvrage présente une anthologie de quarante huit cas de perversions féminines publiés par vingt-quatre médecins différents du xixe siècle, précédés d’une introduction de vingt pages et se concluant par une bibliographie de trois pages. Les cas sont classés selon les termes de l’époque dans l’ordre suivant : onanisme (12 cas), nymphomanie (13), érotomanie (5), anaphrodisme, frigidité et impuissance (1), bestialité, zoophilie (2), nécrophilie (1), exhibitionnisme (1), saphisme, tribadisme et ...

  8. Broadening the targeting range of Staphylococcus aureus CRISPR-Cas9 by modifying PAM recognition.

    Science.gov (United States)

    Kleinstiver, Benjamin P; Prew, Michelle S; Tsai, Shengdar Q; Nguyen, Nhu T; Topkar, Ved V; Zheng, Zongli; Joung, J Keith

    2015-12-01

    CRISPR-Cas9 nucleases target specific DNA sequences using a guide RNA but also require recognition of a protospacer adjacent motif (PAM) by the Cas9 protein. Although longer PAMs can potentially improve the specificity of genome editing, they limit the range of sequences that Cas9 orthologs can target. One potential strategy to relieve this restriction is to relax the PAM recognition specificity of Cas9. Here we used molecular evolution to modify the NNGRRT PAM of Staphylococcus aureus Cas9 (SaCas9). One variant we identified, referred to as KKH SaCas9, showed robust genome editing activities at endogenous human target sites with NNNRRT PAMs, thereby increasing SaCas9 targeting range by two- to fourfold. Using GUIDE-seq, we show that wild-type and KKH SaCas9 induce comparable numbers of off-target effects in human cells. Our strategy for evolving PAM specificity does not require structural information and therefore should be applicable to a wide range of Cas9 orthologs.

  9. La gestion de la relation client dans la banque: Cas du marché marocain

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    EL KORAICHI Mustapha

    2014-03-01

    Full Text Available Face aux évolutions du secteur bancaire (concurrence accrue, crise de confiance l’adoption d’un système de gestion de la relation client représente un enjeu important pour les banques. Il contribue à l’optimisation de la gestion du portefeuille client, plus précisément ce système permet d’acquérir de nouveaux clients et d’augmenter la rentabilité des clients existants. Cet article a pour objectif de répondre à la problématique suivante: le système de gestion de la relation client permet-il aux banques d’atteindre les objectifs attendus? L’étude que nous avons réalisée auprès de 47 banques commerciales marocaines montre que malgré le potentiel anticipé, les bénéfices escomptés d’un tel système restent limités. En effet, l’utilisation de ce système reste à son état embryonnaire, il se centre principalement sur la collecte des informations clients au niveau des agences tandis que l’analyse et l’exploitation de ces informations se fait au niveau du siège de la banque. De même, les opérations basiques de la banque occupent une grande part du temps de travail des agents de la banque au dépend des services bancaires à valeur ajoutée. D’un autre côté, une grande part des banques adoptant ce système ne mesurent pas le coût de la relation avec leurs clients.

  10. A Mathematical model for gastrointestinal tract dosimetry, and its application to adults; Modele mathematique destine a la dosimetrie du tractus gastrointestinal - application a l'adulte

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Vacca, G.; Bazin, J.P.; Karhausen, L. [Commissariat a l' Energie Atomique, Fontenay-aux-Roses (France). Centre d' Etudes Nucleaires

    1969-07-01

    A new method is proposed for the computation of the dose delivered to any level of the gastrointestinal tract after ingestion of radioactive substances. The same method is used as that proposed by ICRP. The concentration of the radionuclide during the progression of the meal is the central concept of this model. A graph relates the MPC with the radioactive half life of the radionuclide and with any level of the gastrointestinal tract of adults.Soluble and insoluble radionuclides are considered. The case of daughter products is discussed in the Appendix. (author) [French] Une methode nouvelle permet le calcul de la dose delivree a un niveau quelconque du tractus gastrointestinal apres ingestion de substances radioactives. Elle utilise d une part la technique de calcul proposee par l'ICRP et de l'autre la notion de concentration du radionuclide au cours de la progression du repas. Un graphique simple met en relation la valeur de la concentration maximale admissible avec la periode radioactive du radionuclide et le niveau considere du tractus gastrointestinal de l'adulte. Le cas d'un radionuclide soluble et celui d'un radionuclide insoluble sont envisages. Un appendice traite le cas des filiations. (auteur)

  11. Influence of the anisotropy of expansion coefficients on the elastic properties of uranium of zirconium and of zinc; Influence de l'anisotropie des coefficients de dilatation sur les proprietes elastiques de l'uranium du zirconium et du zinc

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Calais, Daniel; Saada, Georges; Simenel, Nicole [Commissariat a l' energie atomique et aux energies alternatives - CEA (France)

    1959-07-01

    The anisotropy of the expansion coefficients of uranium, zirconium and zinc provoke internal tensions in the course of cooling these metals. These tensions are eliminated in the case of zinc by restoration to room temperature, but persist in uranium and zirconium and are responsible for the absence of an elastic limit in these two metals. Reprint of a paper published in Comptes rendus des seances de l'Academie des Sciences, t. 249, p. 1225-1227, sitting of 5 October 1959 [French] L'anisotropie des coefficients de dilatation de l'uranium, du zirconium et du zinc provoque au cours du refroidissement de ces metaux des tensions internes. Eliminees par restauration a la temperature ambiante dans le cas du zinc, ces tensions persistent pour l'uranium et le zirconium et sont responsable de l'absence de limite elastique dans ces deux metaux. Reproduction d'un article publie dans les Comptes rendus des seances de l'Academie des Sciences, t. 249, p. 1225-1227, seance du 5 octobre 1959.

  12. Thrombophlebite du sinus caverneux d'origine otogene : a propos d ...

    African Journals Online (AJOL)

    But : Nous illustrons un cas de thrombophlébite du sinus caverneux compliquant une oto-mastoïdite. Nous étudions à la lumière de la littérature les difficultés diagnostiques et l'importance de la mise en oeuvre d'un traitement précoce et adapté afin d'éviter les séquelles ultérieures. Observation : Il s'agit d'un enfant âgé de ...

  13. Les arbres fruitiers sahéliens dans l'économie rurale; Cas du Burkina Faso et du Mali

    NARCIS (Netherlands)

    Kuhlman, J.W.; Coulibaly, K.; Yago, E.L.; Michels, R.; Berg, van den J.

    2010-01-01

    Ce document est le compte-rendu d’une enquête réalisée dans neuf villages au Mali et au Burkina Faso sur l’importance des fruits et d’autres produits provenant des arbres fruitiers indigènes. Ces arbres font partie du paysage agricole de la savane ouest-africaine. L’étude porte sur le rôle de ces

  14. CONTROLE DU RISQUE ET EXPERTISE : France : la précaution entre expertise et débat public Le cas des plantes transgéniques

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Roy Alexis

    2000-07-01

    précaution s’élabore à travers un processus émergeant d’apprentissage collectif où un certain relativisme est de mise vis-à-vis des connaissances scientifiques, quelle place et fonction attribuer aux comités d’experts ? Dans un contexte de controverse publique, la précaution vise-t-elle à une meilleure maîtrise du développement technique ou alors, ne constitue-t-elle qu’un simple outil politique de gestion des conflits ? Telles sont certaines des nombreuses questions que soulève l’émergence de la précaution comme principe général de la prise de décision dans le cas des plantes génétiquement modifiées.

  15. La Baule, du tourisme au lieu de vie

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Philippe Violier

    2002-06-01

    Full Text Available Créées par et pour le tourisme, certaines stations anciennes tendent à sortir du tourisme. La diversification de leurs fonctions liée à la mobilité croissante de la société affecte et perturbe parfois la fonction touristique. Un nouvel espace est produit qui résulte de la transformation des espaces autrefois appropriés par le tourisme, avec d'autres logiques, en filiation ou en rupture avec le tourisme. Le cas de la Baule est pris pour exemple de ces mutations.

  16. Chaînes logistiques et consommation d'énergie : cas du yaourt et du jean

    OpenAIRE

    Rizet , C.; Keita , Basile

    2005-01-01

    Contrat INRETS/ADEME n°: 0203034; Rapport de recherche; Pour analyser l'efficacité énergétique et les émissions de GES des chaînes logistiques, on compare différentes chaînes aboutissant aux mêmes consommateurs. Deux produits sont étudiés : le yaourt, caractéristique de la chaîne du froid et des flux tendus et le blue jean, intégré au marché mondial, tant pour sa matière première principale (le coton) que pour les différentes étapes de sa fabrication. Les chaînes étudiées pour le jean différe...

  17. Les enjeux liés à l’intégration de l’approche BIM de modélisation des données du bâtiment à l’enseignement universitaire : cas d’une école d’ingénierie

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Conrad Boton

    2017-01-01

    Full Text Available Le succès grandissant de l’approche de modélisation des données du bâtiment (BIM change le paradigme de fonctionnement de l’industrie de la construction et les universités sont confrontées à des défis importants dans leurs efforts pour introduire l’approche BIM dans l’enseignement. Plusieurs travaux ont étudié la question, mais chaque étude en a abordé des aspects spécifiques. Ainsi, il n’existe pas de cadre global fournissant des lignes directrices pratiques et neutres. Le cadre proposé dans cet article établit sept grands défis : les compétences à acquérir, l’approche pédagogique, les méthodes d’évaluation, l’environnement technologique, les partenariats industriels, l’approche de mise en œuvre et le calendrier. L’étude du cas d’une université d’ingénierie canadienne est également proposée.

  18. Les traces matérielles de la Carte du Ciel. Le cas des observatoires d'Alger et de Bordeaux.

    Science.gov (United States)

    Le Guet Tully, F.; Davoigneau, J.; Lamy, J.; de La Noë, J.; Rousseau, J.-M.; Sadsaoud, H.

    2008-06-01

    Le chapitre évoque les traces matérielles de la Carte du ciel subsistant dans les observatoires d'Alger et de Bordeaux. Les auteurs examinent d'abord l'opération d'inventaire du patrimoine astronomique entreprise à partir du milieu des années 1990. Ils examinent ensuite les éléments concrets constituant aujourd'hui le patrimoine de la Carte du Ciel : lunettes, abris, accessoires, laboratoires, réseaux, plaques de verre, registres, machines à mesurer les clichés, et cartes.

  19. Synthèse des études écologique et halieutique du site de Flamanville de 1983 à 1991

    OpenAIRE

    Angely, C; Bordet, F

    1994-01-01

    Située sur la côte ouest du Cotentin, la centrale de Flamanville comporte deux tranches de puissance électrique nette nominale de 1300 MWe environ, mises en service en décembre 1986 pour la tranche 1 et en mars 1987 pour la tranche 2. Depuis 1976, de nombreuses études écologiques et halieutiques ont été réalisées pour connaitre le milieu marin au voisinage du site de Flamanville, et surveiller l'évolution de la flore et de la faune aquatiques après la mise en service de la centrale.

  20. The Conformational Dynamics of Cas9 Governing DNA Cleavage Are Revealed by Single-Molecule FRET.

    Science.gov (United States)

    Yang, Mengyi; Peng, Sijia; Sun, Ruirui; Lin, Jingdi; Wang, Nan; Chen, Chunlai

    2018-01-09

    Off-target binding and cleavage by Cas9 pose major challenges in its application. How the conformational dynamics of Cas9 govern its nuclease activity under on- and off-target conditions remains largely unknown. Here, using intra-molecular single-molecule fluorescence resonance energy transfer measurements, we revealed that Cas9 in apo, sgRNA-bound, and dsDNA/sgRNA-bound forms spontaneously transits among three major conformational states, mainly reflecting significant conformational mobility of the catalytic HNH domain. We also uncovered surprising long-range allosteric communication between the HNH domain and the RNA/DNA heteroduplex at the PAM-distal end to ensure correct positioning of the catalytic site, which demonstrated that a unique proofreading mechanism served as the last checkpoint before DNA cleavage. Several Cas9 residues were likely to mediate the allosteric communication and proofreading step. Modulating interactions between Cas9 and heteroduplex at the PAM-distal end by introducing mutations on these sites provides an alternative route to improve and optimize the CRISPR/Cas9 toolbox. Copyright © 2017 The Author(s). Published by Elsevier Inc. All rights reserved.

  1. CRISPR/Cas9 Inhibits Multiple Steps of HIV-1 Infection.

    Science.gov (United States)

    Yin, Lijuan; Hu, Siqi; Mei, Shan; Sun, Hong; Xu, Fengwen; Li, Jian; Zhu, Weijun; Liu, Xiaoman; Zhao, Fei; Zhang, Di; Cen, Shan; Liang, Chen; Guo, Fei

    2018-05-09

    CRISPR/Cas9 is an adaptive immune system where bacteria and archaea have evolved to resist the invading viruses and plasmid DNA by creating site-specific double-strand breaks in DNA. This study tested this gene editing system in inhibiting human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection by targeting the viral long terminal repeat and the gene coding sequences. Strong inhibition of HIV-1 infection by Cas9/gRNA was observed, which resulted not only from insertions and deletions (indels) that were introduced into viral DNA due to Cas9 cleavage, but also from the marked decrease in the levels of the late viral DNA products and the integrated viral DNA. This latter defect might have reflected the degradation of viral DNA that has not been immediately repaired after Cas9 cleavage. It was further observed that Cas9, when solely located in the cytoplasm, inhibits HIV-1 as strongly as the nuclear Cas9, except that the cytoplasmic Cas9 does not act on the integrated HIV-1 DNA and thus cannot be used to excise the latent provirus. Together, the results suggest that Cas9/gRNA is able to target and edit HIV-1 DNA both in the cytoplasm and in the nucleus. The inhibitory effect of Cas9 on HIV-1 is attributed to both the indels in viral DNA and the reduction in the levels of viral DNA.

  2. Corrective Action Investigation Plan for Corrective Action Unit 137: Waste Disposal Sites, Nevada Test Site, Nevada, Rev. No.:0

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Wickline, Alfred

    2005-12-01

    This Corrective Action Investigation Plan (CAIP) contains project-specific information including facility descriptions, environmental sample collection objectives, and criteria for conducting site investigation activities at Corrective Action Unit (CAU) 137: Waste Disposal Sites. This CAIP has been developed in accordance with the ''Federal Facility Agreement and Consent Order'' (FFACO) (1996) that was agreed to by the State of Nevada, the U.S. Department of Energy (DOE), and the U.S. Department of Defense. Corrective Action Unit 137 contains sites that are located in Areas 1, 3, 7, 9, and 12 of the Nevada Test Site (NTS), which is approximately 65 miles (mi) northwest of Las Vegas, Nevada (Figure 1-1). Corrective Action Unit 137 is comprised of the eight corrective action sites (CASs) shown on Figure 1-1 and listed below: (1) CAS 01-08-01, Waste Disposal Site; (2) CAS 03-23-01, Waste Disposal Site; (3) CAS 03-23-07, Radioactive Waste Disposal Site; (4) CAS 03-99-15, Waste Disposal Site; (5) CAS 07-23-02, Radioactive Waste Disposal Site; (6) CAS 09-23-07, Radioactive Waste Disposal Site; (7) CAS 12-08-01, Waste Disposal Site; and (8) CAS 12-23-07, Waste Disposal Site. The Corrective Action Investigation (CAI) will include field inspections, radiological surveys, geophysical surveys, sampling of environmental media, analysis of samples, and assessment of investigation results, where appropriate. Data will be obtained to support corrective action alternative evaluations and waste management decisions. The CASs in CAU 137 are being investigated because hazardous and/or radioactive constituents may be present in concentrations that could potentially pose a threat to human health and the environment. Existing information on the nature and extent of potential contamination is insufficient to evaluate and recommend corrective action alternatives for the CASs. Additional information will be generated by conducting a CAI before evaluating and selecting

  3. Le kyste hydatique du rein fistulisé dans les voies urinaires, prise en ...

    African Journals Online (AJOL)

    Les suites ont été marquées par une fistule stercorale colique chez un patient et deux cas d'infection de paroi. Conclusion: Tout kyste hydatique du rein doit avoir un bilan d'imagerie comportant un uroscanner avec des clichés tardifs à la recherche d'une fistulisation dans la voie excrétrice urinaire. Il est conseillé de mettre ...

  4. Une méthode pour estimer l’interception du rayonnement par un couvert bas : application au colza avant montaison

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Denoroy Pascal

    2002-01-01

    Full Text Available Dans les modèles de simulation du fonctionnement des cultures, l’interception du rayonnement est une variable cruciale pour la prévision de la productivité en biomasse. D’autre part, la connaissance de l’interception du rayonnement par une culture permet de mieux analyser la réponse à un traitement en autorisant la distinction entre les effets morphogénétique et physiologique du traitement. Par exemple, dans l’étude de la fertilisation azotée du colza [1] on a pu faire la part de l’effet morphogénétique (accroissement de l’indice foliaire, donc de l’interception et de l’amélioration de la conversion photosynthétique du rayonnement absorbé. Dans un cas comme dans l’autre, une estimation correcte de l’interception du rayonnement est essentielle. Très souvent, un formalisme dérivé de la loi de Beer-Lambert est utilisé pour quantifier la part interceptée du rayonnement : PARi = epsiloni PAR (1 et epsiloni = 1 - e- k.IF (2, PAR représentant le rayonnement photosynthétiquement actif incident (exprimé en Joules ou en moles de photons, PARi la part de ce dernier interceptée par le couvert, epsiloni le coefficient (sans dimension d’interception, IF l’indice foliaire et k le coefficient d’extinction du rayonnement. Un formalisme un peu plus complexe doit être utilisé si on veut considérer le rayonnement absorbé [1, 2]. Pour des cultures couvrantes, la sensibilité de ces modèles à la valeur de k est faible pour les IF élevés, c’est pourquoi ces modèles sont souvent utilisés avec succès. Mais aux faibles IF, les modèles sont sensibles à k, d’où l’importance de l’estimation de ce paramètre pour les cultures présentant une longue période de faible couverture du sol, tel le colza peu fertilisé en phase hivernale. De plus, pour les cultures discontinues, c’est-à-dire présentant des zones où le sol n’est pas du tout couvert par la végétation, comme les inter-rangs, on doit

  5. L’interface Habitat / Habitant : quand le lieu de vie est porteur de maladie - Le cas du radon en PACA

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Cissé E.

    2012-10-01

    Full Text Available Les préoccupations sont croissantes pour étudier les liens entre des conditions environnementales spécifiques et la fréquence de certaines pathologies. Nous proposons d’analyser ici le lien présupposé entre une exposition au radon et le cancer du poumon. Le radon, est un gaz radioactif d’origine naturelle (issu de la désintégration naturelle de l’uranium présent dans la croûte terrestre et plus particulièrement dans certaines formations géologiques. A partir du sol et de l’eau, le radon se diffuse dans l’air (exhalation et se trouve, par effet de confinement, à des concentrations plus élevées à l’intérieur des bâtiments qu’à l’extérieur. Les descendants solides du radon sont alors inhalés avec l’air respiré et se déposent dans le poumon. Il est établi par diverses études scientifiques que le radon a un impact non négligeable sur certains cancers, notamment du poumon (augmentation de 16 % du risque de cancer du poumon par tranche de 100 Bq/m3, et des cancers digestifs via la consommation d’eau qui s’est chargée en radon au contact du socle. Le nombre annuel de décès par cancer du poumon attribuable à l’exposition domestique au radon en France métropolitaine varie entre 1 200 à 3 575 en fonction des relations exposition-réponse utilisées. Plusieurs régions en France se caractérisent par une problématique radon reconnue et étudiée depuis longtemps (Bretagne, Massif central, Corse. Or, si le radon ne recouvre pas l’ensemble de la région PACA, certaines zones géographiques sont particulièrement concernées et méritent d’être étudiées : le Massif des Maures dans le Var, du Mercantour dans les Alpes-Maritimes et du Briançonnais dans les Hautes-Alpes. La région PACA est une des régions de France et d’Europe les plus touchées par la pollution atmosphérique principalement due à l’augmentation du trafic routier et des contributions de régions industrialisées telles que

  6. CRISPR-Cas9-Mediated Genome Editing in Leishmania donovani.

    Science.gov (United States)

    Zhang, Wen-Wei; Matlashewski, Greg

    2015-07-21

    The prokaryotic CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat)-Cas9, an RNA-guided endonuclease, has been shown to mediate efficient genome editing in a wide variety of organisms. In the present study, the CRISPR-Cas9 system has been adapted to Leishmania donovani, a protozoan parasite that causes fatal human visceral leishmaniasis. We introduced the Cas9 nuclease into L. donovani and generated guide RNA (gRNA) expression vectors by using the L. donovani rRNA promoter and the hepatitis delta virus (HDV) ribozyme. It is demonstrated within that L. donovani mainly used homology-directed repair (HDR) and microhomology-mediated end joining (MMEJ) to repair the Cas9 nuclease-created double-strand DNA break (DSB). The nonhomologous end-joining (NHEJ) pathway appears to be absent in L. donovani. With this CRISPR-Cas9 system, it was possible to generate knockouts without selection by insertion of an oligonucleotide donor with stop codons and 25-nucleotide homology arms into the Cas9 cleavage site. Likewise, we disrupted and precisely tagged endogenous genes by inserting a bleomycin drug selection marker and GFP gene into the Cas9 cleavage site. With the use of Hammerhead and HDV ribozymes, a double-gRNA expression vector that further improved gene-targeting efficiency was developed, and it was used to make precise deletion of the 3-kb miltefosine transporter gene (LdMT). In addition, this study identified a novel single point mutation caused by CRISPR-Cas9 in LdMT (M381T) that led to miltefosine resistance, a concern for the only available oral antileishmanial drug. Together, these results demonstrate that the CRISPR-Cas9 system represents an effective genome engineering tool for L. donovani. Leishmania donovani is the causative agent of fatal visceral leishmaniasis. To understand Leishmania infection and pathogenesis and identify new drug targets for control of leishmaniasis, more-efficient ways to manipulate this parasite genome are required. In this

  7. The Conformational Dynamics of Cas9 Governing DNA Cleavage Are Revealed by Single-Molecule FRET

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Mengyi Yang

    2018-01-01

    Full Text Available Summary: Off-target binding and cleavage by Cas9 pose major challenges in its application. How the conformational dynamics of Cas9 govern its nuclease activity under on- and off-target conditions remains largely unknown. Here, using intra-molecular single-molecule fluorescence resonance energy transfer measurements, we revealed that Cas9 in apo, sgRNA-bound, and dsDNA/sgRNA-bound forms spontaneously transits among three major conformational states, mainly reflecting significant conformational mobility of the catalytic HNH domain. We also uncovered surprising long-range allosteric communication between the HNH domain and the RNA/DNA heteroduplex at the PAM-distal end to ensure correct positioning of the catalytic site, which demonstrated that a unique proofreading mechanism served as the last checkpoint before DNA cleavage. Several Cas9 residues were likely to mediate the allosteric communication and proofreading step. Modulating interactions between Cas9 and heteroduplex at the PAM-distal end by introducing mutations on these sites provides an alternative route to improve and optimize the CRISPR/Cas9 toolbox. : Yang et al. revealed significant conformational dynamics of Cas9 at global and local scales using single-molecule FRET. They uncovered surprising long-range allosteric communication between the HNH nuclease domain and the RNA/DNA heteroduplex at the PAM-distal end that serves as a proofreading checkpoint to govern the nuclease activity and specificity of Cas9. Keywords: CRISPR, Cas9, single-molecule, FRET, conformational dynamics, proofreading, off-target, allosteric communication, genome editing

  8. Les tumeurs desmoides de la paroi thoracique : à propos de 12 cas Dermoid tumors of the thoracic wall: about 12 cases

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Abdellatif Benosman

    2009-11-01

    Full Text Available Les tumeurs desmoides sont des tumeurs rares des tissus mous qui peuvent être très agressives localement. A travers l’expérience de notre service, nous analyserons les résultats du traitement chirurgical de ces tumeurs. De 1980 à 2008, 12 patients ont été opérés pour tumeur desmoide de la paroi thoracique. Le diagnostic a été suspecté sur la base des signes cliniques et radiologiques. Aucun patient n’avait un syndrome de Gardner. L’abord chirurgical a été souvent électif à l’aplomb de la tumeur. La résection a été complète dans 11 cas. La confirmation diagnostique a été apportée par l’étude histologique de la pièce opératoire. La durée du suivi post opératoire variait entre 24 et 180 mois. Une patiente était décédée par insuffisance cardiaque et rénale. 7 cas avaient récidivé, et qui ont été traités par simple résection complète dans 5 cas, dont un avait nécessité une greffe myocutanée ; par ailleurs, deux cas ont été traités par résection incomplète associée à une radiothérapie adjuvante. La chirurgie des tumeurs desmoides de la paroi thoracique doit être aussi large que possible pour diminuer le risque de récidive.

  9. Expanding CRISPR/Cas9 Genome Editing Capacity in Zebrafish Using SaCas9

    OpenAIRE

    Feng, Yan; Chen, Cheng; Han, Yuxiang; Chen, Zelin; Lu, Xiaochan; Liang, Fang; Li, Song; Qin, Wei; Lin, Shuo

    2016-01-01

    The type II CRISPR/Cas9 system has been used widely for genome editing in zebrafish. However, the requirement for the 5′-NGG-3′ protospacer-adjacent motif (PAM) of Cas9 from Streptococcus pyogenes (SpCas9) limits its targeting sequences. Here, we report that a Cas9 ortholog from Staphylococcus aureus (SaCas9), and its KKH variant, successfully induced targeted mutagenesis with high frequency in zebrafish. Confirming previous findings, the SpCas9 variant, VQR, can also induce targeted mutation...

  10. Les Brulures Electriques par Haut Voltage - A Propos de 10 Cas

    Science.gov (United States)

    Belmir, R.; Fejjal, N.; El Omari, M.; El Mazouz, S.; Gharib, N.; Abassi, A.; Belmahi, A.

    2008-01-01

    Summary Les accidents électriques par haute tension (AEHT) provoquent des brûlures profondes par effet Joule le long des axes vasculo-nerveux entre les points d'entrée et de sortie, qui sont le siège de lésions délabrantes. Les Auteurs rapportent une série de dix cas d'AEHT admis au service de chirurgie réparatrice et de brûlés de l'Hôpital Ibn Sina de Rabat à travers laquelle ils étudient les caractéristiques épidémiologiques, cliniques et thérapeutiques. Tous les patients étaient des adultes de sexe masculin dont l'âge moyen était de 31 ans. Dans 70% des cas, ces brûlures étaient secondaires à un contact avec les distributeurs d'électricité avec une surface brûlée inférieure à 20%. Le traitement des lésions électrothermiques a nécessité des interventions itératives avec amputation des segments de membres nécrosés dans 70% des cas, dont les suites étaient marquées par des séquelles fonctionnelles invalidantes. La prévention des AEHT, en particulier pour les accidents du travail au sein des professions exposées, reste fondamentale. PMID:21991124

  11. CRISPR/Cas-mediated knock-in via non-homologous end-joining in the crustacean Daphnia magna.

    Science.gov (United States)

    Kumagai, Hitoshi; Nakanishi, Takashi; Matsuura, Tomoaki; Kato, Yasuhiko; Watanabe, Hajime

    2017-01-01

    The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated system (Cas) is widely used for mediating the knock-in of foreign DNA into the genomes of various organisms. Here, we report a process of CRISPR/Cas-mediated knock-in via non-homologous end joining by the direct injection of Cas9/gRNA ribonucleoproteins (RNPs) in the crustacean Daphnia magna, which is a model organism for studies on toxicology, ecology, and evolution. First, we confirmed the cleavage activity of Cas9 RNPs comprising purified Cas9 proteins and gRNAs in D. magna. We used a gRNA that targets exon 10 of the eyeless gene. Cas9 proteins were incubated with the gRNAs and the resulting Cas9 RNPs were injected into D. magna eggs, which led to a typical phenotype of the eyeless mutant, i.e., eye deformity. The somatic and heritable mutagenesis efficiencies were up to 96% and 40%, respectively. Second, we tested the CRISPR/Cas-mediated knock-in of a plasmid by the injection of Cas9 RNPs. The donor DNA plasmid harboring the fluorescent reporter gene was designed to contain the gRNA recognition site. The co-injection of Cas9 RNPs together with the donor DNAs resulted in generation of one founder animal that produced fluorescent progenies. This transgenic Daphnia had donor DNA at the targeted genomic site, which suggested the concurrent cleavage of the injected plasmid DNA and genomic DNA. Owing to its simplicity and ease of experimental design, we suggest that the CRISPR/Cas-mediated knock-in method represents a promising tool for studying functional genomics in D. magna.

  12. Profil étiologique des surdités neurosensorielle sévère et profonde de l'enfant dans la région du centre-nord du Maroc

    Science.gov (United States)

    Ridal, Mohammed; Outtasi, Naouar; Taybi, Zainab; Boulouiz, Redouan; Chaouki, Sanae; Boubou, Meryem; Maaroufi, Mustapha; Benmansour, Najib; Zaki, Zouheir; Ouldim, Karim; Barakat, Hamid; Hida, Mustapha; Tizniti, Siham; El Alami, Mohamed Noreddine

    2014-01-01

    Introduction Le diagnostic d'une surdité profonde est possible dès les premiers jours de vie. Or, le développement du langage et l'intégration scolaire et professionnelle ne sont pas possible que si la surdité est prise en charge précocement. L’établissement d'un diagnostc étiologique a des implications pronostiques et thérapeutiques. Méthodes C'est une étude rétrospective allant de Juin 2009 au mois de Janvier 2012 ayant recensé 250 cas d'enfants porteurs d'une surdité sévère et profonde. Résultats La moyenne d’âge au moment de l'annonce du diagnostic est de 3.7 ans. Les étiologies prédominantes sont les surdités génétiques dans 35.6% suivies des surdités acquises dans 30.8% des cas. Dans 34.4% des cas aucune étiologie n'a pu être retrouvée. Conclusion Cette étude met en évidence la prédominance éventuelle de causes génétiques de la surdité neurosensorielle de l'enfant au Maroc, et souligne la nécessité d'améliorer les politiques de prévention des maladies infectieuses et de dépistage de la surdité néonatale. Cependant, des analyses moléculaires plus ciblées et la réalisation d'un scanner des rochers systématiques sont nécessaires pour évaluer plus précisément la contribution des étiologies génétiques. PMID:25018837

  13. Lois : J.O n° 55 du 6 mars 2007 page 4206, texte n° 5

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    2009-12-01

    Full Text Available LOI n° 2007-291 du 5 mars 2007 tendant à renforcer l’équilibre de la procédure pénale (1NOR: JUSX0600156LL’Assemblée nationale et le Sénat ont adopté, Le Président de la République promulgue la loi dont la teneur suit :Chapitre IerDispositions instaurant la collégialité de l’instructionArticle 1Le premier alinéa de l’article 83 du code de procédure pénale est remplacé par deux alinéas ainsi rédigés : « Le président du tribunal ou, en cas d’empêchement, le magistrat qui le remplace, désigne, ...

  14. Bourse du CRDI aux chercheurs candidats au doctorat 2018 | CRDI ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    Carrières · Communiquez avec nous · Plan du site. Abonnez-vous à notre bulletin pour recevoir les nouvelles du CRDI chaque mois. Abonnez-vous · Droits d'auteur · Éthique de la recherche · Politique de libre accès · Politique de confidentialité · Transparence · Utilisation du site Web. Suivez-nous; Facebook · Twitter ...

  15. Diagnostic étiologique du diabète insipide central: à propos de 41 cas

    African Journals Online (AJOL)

    Le DIC était associé à une selle turcique vide dans 1 cas et idiopathique chez 3 malades. L'imagerie par résonnance magnétique hypothalamo-hypophysaire et le bilan anté-hypophysaire sont systématiques en dehors d'un contexte de chirurgie hypophysaire et d'une polydipsie primaire évidente. The Pan African Medical ...

  16. CasEMBLR: Cas9-Facilitated Multiloci Genomic Integration of in Vivo Assembled DNA Parts in Saccharomyces cerevisiae

    DEFF Research Database (Denmark)

    Jakociunas, Tadas; Rajkumar, Arun Stephen; Zhang, Jie

    2015-01-01

    , we present a method for marker-free multiloci integration of in vivo assembled DNA parts. By the use of CRISPR/Cas9-mediated one-step double-strand breaks at single, double and triple integration sites we report the successful in vivo assembly and chromosomal integration of DNA parts. We call our...

  17. Methods for Optimizing CRISPR-Cas9 Genome Editing Specificity

    Science.gov (United States)

    Tycko, Josh; Myer, Vic E.; Hsu, Patrick D.

    2016-01-01

    Summary Advances in the development of delivery, repair, and specificity strategies for the CRISPR-Cas9 genome engineering toolbox are helping researchers understand gene function with unprecedented precision and sensitivity. CRISPR-Cas9 also holds enormous therapeutic potential for the treatment of genetic disorders by directly correcting disease-causing mutations. Although the Cas9 protein has been shown to bind and cleave DNA at off-target sites, the field of Cas9 specificity is rapidly progressing with marked improvements in guide RNA selection, protein and guide engineering, novel enzymes, and off-target detection methods. We review important challenges and breakthroughs in the field as a comprehensive practical guide to interested users of genome editing technologies, highlighting key tools and strategies for optimizing specificity. The genome editing community should now strive to standardize such methods for measuring and reporting off-target activity, while keeping in mind that the goal for specificity should be continued improvement and vigilance. PMID:27494557

  18. Cholestéatome du méat acoustique externe

    Science.gov (United States)

    Azeddine, Lachkar; Aabach, Ahmed; Chouai, Mohamed; Elayoubi, Fahd; Ghailan, Mohamed Rachid

    2016-01-01

    Le cholestéatome du méat acoustique externe se définit comme une accumulation de kératine en regard d’une érosion osseuse de nature ostéitique. C’est une entité otologique rare ou peut diagnostiquée. Le but de notre travail est d’illustrer sur la base d’un cas un cholestéatome du méat acoustique externe. Il s’agit d’un patient âgé de 65 ans diabétique et hypertendu sous traitement, présentant depuis 3 mois une otalgie droite intense, insomniante, avec hypoacousie, otorrhée purulente minime et paralysie faciale droite grade V. Le diagnostic évoqué était dans un premier temps celui d’otite externe maligne. Il a été mis sous traitement antibiotique sans amélioration. L’examen otologique a trouvé une lésion ulcéro-bourgeonnante de la paroi postérieure du méat acoustique externe droit, une biopsie systématique de la lésion a été pratiquée et a conclu à un cholestéatome. Le patient a bénéficié d’une tympanoplastie en technique ouverte. Le cholestéatome du méat acoustique externe est rare, la symptomatologie clinique n’est pas spécifique, le scanner des rocher est d’un grand apport pour le diagnostic positif montrant un cratère osseux du méat acoustique externe. Le traitement dépend de l’extension des lésions allant des simples soins locaux à une tympanoplastie en technique ouverte. Le cholestéatome du méat acoustique externe peut revêtir plusieurs aspects, et prêter confusion avec d’autres pathologies du méat acoustique externe. PMID:28154624

  19. Efficient fdCas9 Synthetic Endonuclease with Improved Specificity for Precise Genome Engineering

    KAUST Repository

    Aouida, Mustapha

    2015-07-30

    The Cas9 endonuclease is used for genome editing applications in diverse eukaryotic species. A high frequency of off-target activity has been reported in many cell types, limiting its applications to genome engineering, especially in genomic medicine. Here, we generated a synthetic chimeric protein between the catalytic domain of the FokI endonuclease and the catalytically inactive Cas9 protein (fdCas9). A pair of guide RNAs (gRNAs) that bind to sense and antisense strands with a defined spacer sequence range can be used to form a catalytically active dimeric fdCas9 protein and generate double-strand breaks (DSBs) within the spacer sequence. Our data demonstrate an improved catalytic activity of the fdCas9 endonuclease, with a spacer range of 15–39 nucleotides, on surrogate reporters and genomic targets. Furthermore, we observed no detectable fdCas9 activity at known Cas9 off-target sites. Taken together, our data suggest that the fdCas9 endonuclease variant is a superior platform for genome editing applications in eukaryotic systems including mammalian cells.

  20. Efficient fdCas9 Synthetic Endonuclease with Improved Specificity for Precise Genome Engineering

    KAUST Repository

    Aouida, Mustapha; Eid, Ayman; Ali, Zahir; Cradick, Thomas; Lee, Ciaran; Deshmukh, Harshavardhan; Atef, Ahmed; Abu Samra, Dina Bashir Kamil; Gadhoum, Samah Zeineb; Merzaban, Jasmeen; Bao, Gang; Mahfouz, Magdy M.

    2015-01-01

    The Cas9 endonuclease is used for genome editing applications in diverse eukaryotic species. A high frequency of off-target activity has been reported in many cell types, limiting its applications to genome engineering, especially in genomic medicine. Here, we generated a synthetic chimeric protein between the catalytic domain of the FokI endonuclease and the catalytically inactive Cas9 protein (fdCas9). A pair of guide RNAs (gRNAs) that bind to sense and antisense strands with a defined spacer sequence range can be used to form a catalytically active dimeric fdCas9 protein and generate double-strand breaks (DSBs) within the spacer sequence. Our data demonstrate an improved catalytic activity of the fdCas9 endonuclease, with a spacer range of 15–39 nucleotides, on surrogate reporters and genomic targets. Furthermore, we observed no detectable fdCas9 activity at known Cas9 off-target sites. Taken together, our data suggest that the fdCas9 endonuclease variant is a superior platform for genome editing applications in eukaryotic systems including mammalian cells.

  1. Multiplex metabolic pathway engineering using CRISPR/Cas9 in Saccharomyces cerevisiae

    DEFF Research Database (Denmark)

    Jakociunas, Tadas; Bonde, Ida; Herrgard, Markus

    2015-01-01

    CRISPR/Cas9 is a simple and efficient tool for targeted and marker-free genome engineering. Here, we report the development and successful application of a multiplex CRISPR/Cas9 system for genome engineering of up to 5 different genomic loci in one transformation step in baker's yeast Saccharomyces...... cerevisiae. To assess the specificity of the tool we employed genome re-sequencing to screen for off-target sites in all single knock-out strains targeted by different gRNAs. This extensive analysis identified no more genome variants in CRISPR/Cas9 engineered strains compared to wild-type reference strains...

  2. Closure Report for Corrective Action Unit 166: Storage Yards and Contaminated Materials, Nevada Test Site, Nevada

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    NSTec Environmental Restoration

    2009-08-01

    Corrective Action Unit (CAU) 166 is identified in the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO) as 'Storage Yards and Contaminated Materials' and consists of the following seven Corrective Action Sites (CASs), located in Areas 2, 3, 5, and 18 of the Nevada Test Site: CAS 02-42-01, Condo Release Storage Yd - North; CAS 02-42-02, Condo Release Storage Yd - South; CAS 02-99-10, D-38 Storage Area; CAS 03-42-01, Conditional Release Storage Yard; CAS 05-19-02, Contaminated Soil and Drum; CAS 18-01-01, Aboveground Storage Tank; and CAS 18-99-03, Wax Piles/Oil Stain. Closure activities were conducted from March to July 2009 according to the FF ACO (1996, as amended February 2008) and the Corrective Action Plan for CAU 166 (U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office, 2007b). The corrective action alternatives included No Further Action and Clean Closure. Closure activities are summarized. CAU 166, Storage Yards and Contaminated Materials, consists of seven CASs in Areas 2, 3, 5, and 18 of the NTS. The closure alternatives included No Further Action and Clean Closure. This CR provides a summary of completed closure activities, documentation of waste disposal, and confirmation that remediation goals were met. The following site closure activities were performed at CAU 166 as documented in this CR: (1) At CAS 02-99-10, D-38 Storage Area, approximately 40 gal of lead shot were removed and are currently pending treatment and disposal as MW, and approximately 50 small pieces of DU were removed and disposed as LLW. (2) At CAS 03-42-01, Conditional Release Storage Yard, approximately 7.5 yd{sup 3} of soil impacted with lead and Am-241 were removed and disposed as LLW. As a BMP, approximately 22 ft{sup 3} of asbestos tile were removed from a portable building and disposed as ALLW, approximately 55 gal of oil were drained from accumulators and are currently pending disposal as HW, the portable building was removed and

  3. Closure Report for Corrective Action Unit 166: Storage Yards and Contaminated Materials, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    2009-01-01

    Corrective Action Unit (CAU) 166 is identified in the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO) as 'Storage Yards and Contaminated Materials' and consists of the following seven Corrective Action Sites (CASs), located in Areas 2, 3, 5, and 18 of the Nevada Test Site: CAS 02-42-01, Condo Release Storage Yd - North; CAS 02-42-02, Condo Release Storage Yd - South; CAS 02-99-10, D-38 Storage Area; CAS 03-42-01, Conditional Release Storage Yard; CAS 05-19-02, Contaminated Soil and Drum; CAS 18-01-01, Aboveground Storage Tank; and CAS 18-99-03, Wax Piles/Oil Stain. Closure activities were conducted from March to July 2009 according to the FF ACO (1996, as amended February 2008) and the Corrective Action Plan for CAU 166 (U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office, 2007b). The corrective action alternatives included No Further Action and Clean Closure. Closure activities are summarized. CAU 166, Storage Yards and Contaminated Materials, consists of seven CASs in Areas 2, 3, 5, and 18 of the NTS. The closure alternatives included No Further Action and Clean Closure. This CR provides a summary of completed closure activities, documentation of waste disposal, and confirmation that remediation goals were met. The following site closure activities were performed at CAU 166 as documented in this CR: (1) At CAS 02-99-10, D-38 Storage Area, approximately 40 gal of lead shot were removed and are currently pending treatment and disposal as MW, and approximately 50 small pieces of DU were removed and disposed as LLW. (2) At CAS 03-42-01, Conditional Release Storage Yard, approximately 7.5 yd 3 of soil impacted with lead and Am-241 were removed and disposed as LLW. As a BMP, approximately 22 ft 3 of asbestos tile were removed from a portable building and disposed as ALLW, approximately 55 gal of oil were drained from accumulators and are currently pending disposal as HW, the portable building was removed and disposed as LLW, and

  4. Fracture unicondylienne latérale sagittale du fémur associée à une ...

    African Journals Online (AJOL)

    Un patient de 24 ans a subit un traumatisme du genou droit suite à un accident de la voie publique occasionnant une fracture simultanée uni condylienne latérale et patellaire verticale. Cette association est exceptionnelle et aucun cas n'as été retrouvé dans la littérature .Un diagnostic précis clinique et radiologique suivi ...

  5. Caractéristiques épidémiologiques du cancer de la vessie chez la ...

    African Journals Online (AJOL)

    Le tabagisme était retrouvé chez 29,6 % des patientes,l'exposition professionnelle aux carcinogènes dans 5.4 % des cas. Discussion: L'incidence du cancer de la vessie chez la femme est parmi les plus basses dans le monde. Elle est plus élevée dans le grand Tunis et les zones côtières. Elle augmente directement avec ...

  6. Fragmentation of the CRISPR-Cas Type I-B signature protein Cas8b.

    Science.gov (United States)

    Richter, Hagen; Rompf, Judith; Wiegel, Julia; Rau, Kristina; Randau, Lennart

    2017-11-01

    CRISPR arrays are transcribed into long precursor RNA species, which are further processed into mature CRISPR RNAs (crRNAs). Cas proteins utilize these crRNAs, which contain spacer sequences that can be derived from mobile genetic elements, to mediate immunity during a reoccurring virus infection. Type I CRISPR-Cas systems are defined by the presence of different Cascade interference complexes containing large and small subunits that play major roles during target DNA selection. Here, we produce the protein and crRNA components of the Type I-B CRISPR-Cas complex of Clostridium thermocellum and Methanococcus maripaludis. The C. thermocellum Cascade complexes were reconstituted and analyzed via size-exclusion chromatography. Activity of the heterologous M. maripaludis CRISPR-Cas system was followed using phage lambda plaques assays. The reconstituted Type-I-B Cascade complex contains Cas7, Cas5, Cas6b and the large subunit Cas8b. Cas6b can be omitted from the reconstitution protocol. The large subunit Cas8b was found to be represented by two tightly associated protein fragments and a small C-terminal Cas8b segment was identified in recombinant complexes and C. thermocellum cell lysate. Production of Cas8b generates a small C-terminal fragment, which is suggested to fulfill the role of the missing small subunit. A heterologous, synthetic M. maripaludis Type I-B system is active in E. coli against phage lambda, highlighting a potential for genome editing using endogenous Type-I-B CRISPR-Cas machineries. This article is part of a Special Issue entitled "Biochemistry of Synthetic Biology - Recent Developments" Guest Editor: Dr. Ilka Heinemann and Dr. Patrick O'Donoghue. Copyright © 2017 Elsevier B.V. All rights reserved.

  7. Sylvie Chaperon, La médecine du sexe et les femmes, Paris, La Musardine, 2008, 198 p.

    OpenAIRE

    Quin, Grégory

    2010-01-01

    Après un travail fouillé sur les origines de la sexologie, Sylvie Chaperon, historienne spécialiste d’histoire des femmes et du genre, maîtresse de conférences à l’Université de Toulouse 2, propose dans son nouveau livre une anthologie de textes que des médecins du XIXe siècle ont produits sur la sexualité féminine et ses diverses pathologies. L’ouvrage est construit autour d’une cinquantaine de cas de quelques-unes de ces pathologies associées à la sexualité des femmes : l’onanisme, la nymph...

  8. Spacer capture and integration by a type I-F Cas1-Cas2-3 CRISPR adaptation complex.

    Science.gov (United States)

    Fagerlund, Robert D; Wilkinson, Max E; Klykov, Oleg; Barendregt, Arjan; Pearce, F Grant; Kieper, Sebastian N; Maxwell, Howard W R; Capolupo, Angela; Heck, Albert J R; Krause, Kurt L; Bostina, Mihnea; Scheltema, Richard A; Staals, Raymond H J; Fineran, Peter C

    2017-06-27

    CRISPR-Cas adaptive immune systems capture DNA fragments from invading bacteriophages and plasmids and integrate them as spacers into bacterial CRISPR arrays. In type I-E and II-A CRISPR-Cas systems, this adaptation process is driven by Cas1-Cas2 complexes. Type I-F systems, however, contain a unique fusion of Cas2, with the type I effector helicase and nuclease for invader destruction, Cas3. By using biochemical, structural, and biophysical methods, we present a structural model of the 400-kDa Cas1 4 -Cas2-3 2 complex from Pectobacterium atrosepticum with bound protospacer substrate DNA. Two Cas1 dimers assemble on a Cas2 domain dimeric core, which is flanked by two Cas3 domains forming a groove where the protospacer binds to Cas1-Cas2. We developed a sensitive in vitro assay and demonstrated that Cas1-Cas2-3 catalyzed spacer integration into CRISPR arrays. The integrase domain of Cas1 was necessary, whereas integration was independent of the helicase or nuclease activities of Cas3. Integration required at least partially duplex protospacers with free 3'-OH groups, and leader-proximal integration was stimulated by integration host factor. In a coupled capture and integration assay, Cas1-Cas2-3 processed and integrated protospacers independent of Cas3 activity. These results provide insight into the structure of protospacer-bound type I Cas1-Cas2-3 adaptation complexes and their integration mechanism.

  9. 2001-2011 : une décennie pour la Fontaine Solaire au CERN !

    CERN Multimedia

    Solar Club

    2011-01-01

    2001-2011 10e anniversaire de la fontaine solaire Lundi 17 octobre 2011 à midi, devant la terrasse du restaurant principal du site de Meyrin, le Solar Club du CERN marquera les 10 ans de sa fontaine solaire. Vous êtes tous les bienvenus ! Le SOLEIL* aussi ! *) En cas de mauvais temps, cet événement sera reporté à une date ultérieure.

  10. Plan du site | CRDI - Centre de recherches pour le développement ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    Carrières · Possibilité de nomination · Possibilités d'emploi · Emplois pour étudiants · Ce que nous avons à offrir · Possibilité d'emploi avec le Conseil des gouverneurs du CRDI · Nouvelles et événements · Communiquez avec nous · Gouvernance · Conseil des gouverneurs · Gestion du Centre · Plan stratégique du CRDI.

  11. Figures du sage et du savoir païens dans le Libro de buen amor

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Olivier Biaggini

    2013-06-01

    Full Text Available Au-delà de la simple relation de dépendance à ses sources, le Libro de buen amor élabore diverses figures du sage antique, tantôt comme producteur et garant d’une parole d’autorité (Aristote, tantôt, au contraire, comme pur personnage au seuil de la fiction (Virgile. Dans les deux cas, le traitement est largement parodique et remet en question une révérence trop stricte face au système des autorités. Le cas d’Ovide, qui relève conjointement des deux catégories précédentes, est particulièrement intéressant car il montre comment les noms liés à la tradition ovidienne (Ovidio, Nasón, mais aussi Pánfilo, don Amor, doña Venus… sont autant de masques que l’archiprêtre peut successivement adopter et rejeter. Enfin, l’exemplum introductif des Grecs et des Romains est centré sur la transmission du savoir antique pour le placer au fondement du savoir de l’archiprêtre lui-même tout en offrant une représentation de sa part d’incertitude.Más allá de la simple relación de dependencia respecto a sus fuentes, el Libro de buen amor elabora diversas figuras del sabio antiguo, sea como productor y garante de una palabra de autoridad (Aristóteles, sea, al contrario, como mero personaje al borde de la ficción (Virgilio. En ambos casos, el tratamiento aplicado se revela sumamente paródico y pone en tela de juicio una reverencia demasiado estricta para con el sistema de las autoridades. El caso de Ovidio, que corresponde simultáneamente a las dos categorías precedentes, resulta de especial interés al enseñar cómo los nombres ligados a la tradición ovidiana (Ovidio, Nasón, pero también Pánfilo, don Amor, doña Venus… llegan a ser máscaras que el arcipreste puede sucesivamente adoptar y rechazar. Por fin, el exemplum introductorio de los griegos y los romanos se centra en la transmisión del saber antiguo presentándolo como uno de los fundamentos del saber del propio arcipreste al mismo tiempo que ofrece una

  12. A Biophysical Model of CRISPR/Cas9 Activity for Rational Design of Genome Editing and Gene Regulation

    Science.gov (United States)

    Farasat, Iman; Salis, Howard M.

    2016-01-01

    The ability to precisely modify genomes and regulate specific genes will greatly accelerate several medical and engineering applications. The CRISPR/Cas9 (Type II) system binds and cuts DNA using guide RNAs, though the variables that control its on-target and off-target activity remain poorly characterized. Here, we develop and parameterize a system-wide biophysical model of Cas9-based genome editing and gene regulation to predict how changing guide RNA sequences, DNA superhelical densities, Cas9 and crRNA expression levels, organisms and growth conditions, and experimental conditions collectively control the dynamics of dCas9-based binding and Cas9-based cleavage at all DNA sites with both canonical and non-canonical PAMs. We combine statistical thermodynamics and kinetics to model Cas9:crRNA complex formation, diffusion, site selection, reversible R-loop formation, and cleavage, using large amounts of structural, biochemical, expression, and next-generation sequencing data to determine kinetic parameters and develop free energy models. Our results identify DNA supercoiling as a novel mechanism controlling Cas9 binding. Using the model, we predict Cas9 off-target binding frequencies across the lambdaphage and human genomes, and explain why Cas9’s off-target activity can be so high. With this improved understanding, we propose several rules for designing experiments for minimizing off-target activity. We also discuss the implications for engineering dCas9-based genetic circuits. PMID:26824432

  13. Les leishmanioses cutanées à Leishmania major et à Leishmania tropica au Maroc: aspects épidémio-cliniques comparatifs de 268 cas

    Science.gov (United States)

    Chiheb, Soumia; Slaoui, Widad; Mouttaqui, Tarik; Riyad, Meriem; Benchikhi, Hakima

    2014-01-01

    Introduction Depuis 1995, le Maroc a connu une réactivation des foyers de leishmanioses cutanées (LC) à L. major et une nouvelle répartition géographique des foyers à L. tropica. Le but de cette étude est de comparer les aspects épidémio-cliniques associés aux LC potentiellement dûes à L. major et à L. tropica. Méthodes Une étude rétrospective a colligé 268 cas de LC au service de dermatologie du CHU Ibn Rochd de Casablanca entre Janvier 1995 et Septembre 2010. Les données étaient analysées par Epi info version 3.5.1. Le test X2 était appliqué (Différence significative = p< 0,05). Résultats Deux cent soixante-huit cas de LC ont été colligés, dont 160 femmes et 108 hommes. Ils ont été répartis en 123 patients originaires des foyers à L.major et 145 patients originaires des foyers à L. tropica. L'aspect ulcéronodulaire, ulcérovégétant ou végétant était retrouvé dans 58 cas (47,2%) des cas de LC à L. major versus 24 cas (16,7%) dans la L.C à L. tropica. L'aspect papulonodulaire était retrouvé dans 84 cas (58%) de LC à L. tropica contre 41 cas (33,3%) de LC à L. major. Conclusion Dans la LC à L. major, l'atteinte des membres et les aspects cliniques végétant ou ulcéro-végétant restent toujours prédominants. Dans la L.C à L. tropica, l'atteinte papulonodulaire unique du visage reste prédominante mais des formes ulcéronodulaires, végétantes ou ulcérovégétantes existent également dans les foyers récents à L. tropica, prêtant à confusion cliniquement avec des LC à L. major. PMID:25810796

  14. Mise en pratique du schéma 2BSvs dans le groupe industriel Sofiprotéol : étude de cas sur toute la filière (de l’agriculteur au pétrolier

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Guizouarn Kristell

    2015-01-01

    Full Text Available Pour réduire sensiblement les émissions de CO liées aux transports routiers, l’Union européenne mise sur le développement des biocarburants, en respectant des conditions de durabilité. Afin de répondre à cette obligation et d’être en mesure de démontrer la conformité du biodiesel à ces critères, depuis l’agriculteur jusqu’au distributeur pétrolier, la filière des oléagineux a engagé la rédaction d’un schéma de vérification volontaire : 2BSvs, pour Biomasse Biocarburant Schéma volontaire sur la durabilité. Reconnu par la Commission Européenne le 19 juillet 2011, le schéma 2BSvs couvre l’ensemble de la chaîne de production des biocarburants, du producteur de biomasse à l’entrée dans un entrepôt sous douanes. À travers une étude de cas sur toute la filière, de l’agriculteur au pétrolier, cet article présente les implications pour les acteurs de la filière oléagineuse, les changements intervenus depuis avril 2013, et les défis futurs à relever.

  15. CRISPR/Cas9 delivery with one single adenoviral vector devoid of all viral genes.

    Science.gov (United States)

    Ehrke-Schulz, Eric; Schiwon, Maren; Leitner, Theo; Dávid, Stephan; Bergmann, Thorsten; Liu, Jing; Ehrhardt, Anja

    2017-12-07

    The Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)/Cas9 system revolutionized the field of gene editing but viral delivery of the CRISPR/Cas9 system has not been fully explored. Here we adapted clinically relevant high-capacity adenoviral vectors (HCAdV) devoid of all viral genes for the delivery of the CRISPR/Cas9 machinery using a single viral vector. We present a platform enabling fast transfer of the Cas9 gene and gRNA expression units into the HCAdV genome including the option to choose between constitutive or inducible Cas9 expression and gRNA multiplexing. Efficacy and versatility of this pipeline was exemplified by producing different CRISPR/Cas9-HCAdV targeting the human papillomavirus (HPV) 18 oncogene E6, the dystrophin gene causing Duchenne muscular dystrophy (DMD) and the HIV co-receptor C-C chemokine receptor type 5 (CCR5). All CRISPR/Cas9-HCAdV proved to be efficient to deliver the respective CRISPR/Cas9 expression units and to introduce the desired DNA double strand breaks at their intended target sites in immortalized and primary cells.

  16. Systèmes coopératifs hybride Satellite-Terrestre : analyse de performance et dimensionnement du système

    OpenAIRE

    Sreng, Sokchenda

    2012-01-01

    Les systèmes de communications par satellite sont utilisés dans le contexte de la radiodiffusion, de la navigation, du sauvetage et du secours aux sinistrés, car ils permettent de fournir des services sur une large zone de couverture. Cependant, cette zone de couverture est limitée par l'effet de masquage provoqué par des obstacles qui bloquent la liaison directe entre le satellite et un utilisateur terrestre. L'effet de masquage devient plus sévère en cas de satellites à faibles angles d'élé...

  17. [Advances in CRISPR-Cas-mediated genome editing system in plants].

    Science.gov (United States)

    Wang, Chun; Wang, Kejian

    2017-10-25

    Targeted genome editing technology is an important tool to study the function of genes and to modify organisms at the genetic level. Recently, CRISPR-Cas (clustered regularly interspaced short palindromic repeats and CRISPR-associated proteins) system has emerged as an efficient tool for specific genome editing in animals and plants. CRISPR-Cas system uses CRISPR-associated endonuclease and a guide RNA to generate double-strand breaks at the target DNA site, subsequently leading to genetic modifications. CRISPR-Cas system has received widespread attention for manipulating the genomes with simple, easy and high specificity. This review summarizes recent advances of diverse applications of the CRISPR-Cas toolkit in plant research and crop breeding, including expanding the range of genome editing, precise editing of a target base, and efficient DNA-free genome editing technology. This review also discusses the potential challenges and application prospect in the future, and provides a useful reference for researchers who are interested in this field.

  18. Genome Editing in Cotton with the CRISPR/Cas9 System

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Wei Gao

    2017-08-01

    Full Text Available Genome editing is an important tool for gene functional studies as well as crop improvement. The recent development of the CRISPR/Cas9 system using single guide RNA molecules (sgRNAs to direct precise double strand breaks in the genome has the potential to revolutionize agriculture. Unfortunately, not all sgRNAs are equally efficient and it is difficult to predict their efficiency by bioinformatics. In crops such as cotton (Gossypium hirsutum L., with labor-intensive and lengthy transformation procedures, it is essential to minimize the risk of using an ineffective sgRNA that could result in the production of transgenic plants without the desired CRISPR-induced mutations. In this study, we have developed a fast and efficient method to validate the functionality of sgRNAs in cotton using a transient expression system. We have used this method to validate target sites for three different genes GhPDS, GhCLA1, and GhEF1 and analyzed the nature of the CRISPR/Cas9-induced mutations. In our experiments, the most frequent type of mutations observed in cotton cotyledons were deletions (∼64%. We prove that the CRISPR/Cas9 system can effectively produce mutations in homeologous cotton genes, an important requisite in this allotetraploid crop. We also show that multiple gene targeting can be achieved in cotton with the simultaneous expression of several sgRNAs and have generated mutations in GhPDS and GhEF1 at two target sites. Additionally, we have used the CRISPR/Cas9 system to produce targeted gene fragment deletions in the GhPDS locus. Finally, we obtained transgenic cotton plants containing CRISPR/Cas9-induced gene editing mutations in the GhCLA1 gene. The mutation efficiency was very high, with 80.6% of the transgenic lines containing mutations in the GhCLA1 target site resulting in an intense albino phenotype due to interference with chloroplast biogenesis.

  19. Transcriptional reprogramming in yeast using dCas9 and combinatorial gRNA strategies

    DEFF Research Database (Denmark)

    Damgaard Jensen, Emil; Ferreira, Raphael; Jakociunas, Tadas

    2017-01-01

    on developing synthetic biology tools for orthogonal control of transcription. Most recently, the nuclease-deficient Cas9 (dCas9) has emerged as a flexible tool for controlling activation and repression of target genes, by the simple RNA-guided positioning of dCas9 in the vicinity of the target gene...... transcription start site. In this study we compared two different systems of dCas9-mediated transcriptional reprogramming, and applied them to genes controlling two biosynthetic pathways for biobased production of isoprenoids and triacylglycerols (TAGs) in baker's yeast Saccharomyces cerevisiae. By testing 101...... production and increases in TAG. Taken together, we show similar performance for a constitutive and an inducible dCas9 approach, and identify multiplex gRNA designs that can significantly perturb isoprenoid production and TAG profiles in yeast without editing the genomic context of the target genes. We also...

  20. Agir sur la langue pour agir sur le monde : Micropolitiques linguistiques autogérées du genre dans les brochures libertaires

    OpenAIRE

    Abbou, Julie

    2015-01-01

    La dimension agissante de la langue sur le monde entraîne avec elle, comme un appel d'air, l'action sur la langue elle-même, et l'action sur la langue n'est jamais loin de se faire action politique. Les politiques linguistiques de féminisation en sont un exemple, où l'action politique se concentre sur la catégorisation du genre. Dans de nombreux cas, la politique linguistique se fait planification linguistique, cherchant de nouvelles normes. Dans de nombreux cas, mais pas toujours. Il existe ...

  1. La place du nom propre dans les dictionnaires collaboratifs : le cas de La Parlure

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Dolar Kaja

    2014-07-01

    Full Text Available Suite à l’émergence des nouvelles technologies et des possibilités qu’elles offrent, nous assistons à la floraison des dictionnaires dits collaboratifs. A la différence des dictionnaires numériques/informatisés, qui sont en réalité des dictionnaires académiques mis en ligne, la particularité des dictionnaires collaboratifs réside dans le fait que leur rédaction soit proposée au grand public ; elle se fait par les internautes, sans intervention de linguistes ou spécialistes de la lexicographie. Avec leur apparition, la lexicographie a sans doute pris un nouveau tournant en mettant en avant une tendance actuelle, la lexicographie participative. Dans notre étude, nous nous intéressons en premier lieu à la forme particulière de ces dictionnaires ainsi qu’à leur fonctionnement général. A ce propos, nous nous penchons plus précisément sur le dictionnaire collaboratif français La Parlure pour analyser son fonctionnement ainsi que certaines des particularités qui le caractérisent et le distinguent des autres dictionnaires de ce genre. Dans un deuxième temps, nous nous interrogeons sur la place du nom propre dans ces dictionnaires collaboratifs. Nous analysons quelques entrées relevant du nom propre dans le dictionnaire collaboratif La Parlure pour savoir comment le nom propre s’insère dans la nomenclature ainsi que dans l’ensemble du dictionnaire. On retiendra en somme que dans La Parlure le nom propre se trouve au sein de divers types d’entrées, soit dans les noms propres à proprement parler, soit dans les noms et locutions métaphoriques soit dans les néologismes créés à partir de noms propres. En conclusion, nous pouvons dire que non seulement la place du nom propre dans les dictionnaires collaboratifs est significative, mais également que les noms propres se trouvent au cœur de l’innovation linguistique actuelle en langue française.

  2. CRISPR/Cas9:A powerful tool for crop genome editing

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    Gaoyuan Song; Meiling Jia; Kai Chen; Xingchen Kong; Bushra Khattak; Chuanxiao Xie; Aili Li; Long Mao

    2016-01-01

    The CRISPR/Cas9 technology is evolved from a type II bacterial immune system and represents a new generation of targeted genome editing technology that can be applied to nearly all organisms. Site-specific modification is achieved by a single guide RNA(usually about 20nucleotides) that is complementary to a target gene or locus and is anchored by a protospaceradjacent motif. Cas9 nuclease then cleaves the targeted DNA to generate double-strand breaks(DSBs), which are subsequently repaired by non-homologous end joining(NHEJ) or homology-directed repair(HDR) mechanisms. NHEJ may introduce indels that cause frame shift mutations and hence the disruption of gene functions. When combined with double or multiplex guide RNA design, NHEJ may also introduce targeted chromosome deletions,whereas HDR can be engineered for target gene correction, gene replacement, and gene knock-in. In this review, we briefly survey the history of the CRISPR/Cas9 system invention and its genome-editing mechanism. We also describe the most recent innovation of the CRISPR/Cas9 technology, particularly the broad applications of modified Cas9 variants, and discuss the potential of this system for targeted genome editing and modification for crop improvement.

  3. CRISPR/Cas9:A powerful tool for crop genome editing

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    Gaoyuan Song; Meiling Jia; Kai Chen; Xingchen Kong; Bushra Khattak; Chuanxiao Xie; Aili Li; Long Mao

    2016-01-01

    The CRISPR/Cas9 technology is evolved from a type II bacterial immune system and represents a new generation of targeted genome editing technology that can be applied to nearly all organisms. Site-specific modification is achieved by a single guide RNA (usually about 20 nucleotides) that is complementary to a target gene or locus and is anchored by a protospacer-adjacent motif. Cas9 nuclease then cleaves the targeted DNA to generate double-strand breaks (DSBs), which are subsequently repaired by non-homologous end joining (NHEJ) or homology-directed repair (HDR) mechanisms. NHEJ may introduce indels that cause frame shift mutations and hence the disruption of gene functions. When combined with double or multiplex guide RNA design, NHEJ may also introduce targeted chromosome deletions, whereas HDR can be engineered for target gene correction, gene replacement, and gene knock-in. In this review, we briefly survey the history of the CRISPR/Cas9 system invention and its genome-editing mechanism. We also describe the most recent innovation of the CRISPR/Cas9 technology, particularly the broad applications of modified Cas9 variants, and discuss the potential of this system for targeted genome editing and modification for crop improvement.

  4. Les fractures du Talus - a propos de 23 cas | James | Journal de la ...

    African Journals Online (AJOL)

    Douze patients (52,17%) présentaient des fractures totales classées selon Hawkins. Neuf autres (39,13%) présentaient des fractures parcellaires et deux patients (8,69%) présentaient une fracture séparation du corps. Résultats : Onze des patients présentant une fracture totale ont été traités chirurgicalement avec une ...

  5. CRISPR/Cas9-Advancing Orthopoxvirus Genome Editing for Vaccine and Vector Development.

    Science.gov (United States)

    Okoli, Arinze; Okeke, Malachy I; Tryland, Morten; Moens, Ugo

    2018-01-22

    The clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)/associated protein 9 (Cas9) technology is revolutionizing genome editing approaches. Its high efficiency, specificity, versatility, flexibility, simplicity and low cost have made the CRISPR/Cas9 system preferable to other guided site-specific nuclease-based systems such as TALENs (Transcription Activator-like Effector Nucleases) and ZFNs (Zinc Finger Nucleases) in genome editing of viruses. CRISPR/Cas9 is presently being applied in constructing viral mutants, preventing virus infections, eradicating proviral DNA, and inhibiting viral replication in infected cells. The successful adaptation of CRISPR/Cas9 to editing the genome of Vaccinia virus paves the way for its application in editing other vaccine/vector-relevant orthopoxvirus (OPXV) strains. Thus, CRISPR/Cas9 can be used to resolve some of the major hindrances to the development of OPXV-based recombinant vaccines and vectors, including sub-optimal immunogenicity; transgene and genome instability; reversion of attenuation; potential of spread of transgenes to wildtype strains and close contacts, which are important biosafety and risk assessment considerations. In this article, we review the published literature on the application of CRISPR/Cas9 in virus genome editing and discuss the potentials of CRISPR/Cas9 in advancing OPXV-based recombinant vaccines and vectors. We also discuss the application of CRISPR/Cas9 in combating viruses of clinical relevance, the limitations of CRISPR/Cas9 and the current strategies to overcome them.

  6. Lèpre au Togo: étude rétrospective de 2630 cas sur 15 ans [Leprosy in Togo: retrospective study of 2630 cases over 15 years

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Koussake Kombate

    2017-11-01

    Full Text Available Objective: The aim of this study was to determine the evolutionary trends, the clinical forms of leprosy cases notified in Togo and to map them. Methods: This was a retrospective study from 1 January 2000 to 31 December 2014 on all leprosy cases notified by all districts to the national leprosy control program (PNLL. Results: A total of 2,630 new cases of leprosy were notified. The mean annual incidence was 175.33 cases with extremes of 73 to 266 cases. The median age of patients was 40 years, and the sex ratio was 1.13. Children aged 0 to 15 accounted for 5.5% of the cases. The plateau region in the center of the country had the highest annual incidence (around 800 cases. Clinically, multibacillary forms accounted for 74.2% of cases. All patients were treated with multidrug therapy (MDT. The WHO grade 2 disease was found in 15% of patients and 9.5% were lost to follow-up. Conclusion: Our results confirm the elimination of leprosy in Togo. There is a high incidence of leprosy in some areas of the country, which may raise fears of a resurgence of the disease RÉSUMÉ Objectif: Le but de cette étude était de déterminer les tendances et les formes cliniques de lèpre notifiées au Togo. Méthode: Il s’agissait d’une étude rétrospective du 1er janvier 2000 au 31 décembre 2014 portant sur les cas de lèpre notifiés par l’ensemble des districts sanitaires au programme national de lutte contre la lèpre (PNLL. Résultats: Au total, 2630 nouveaux cas de lèpre avaient été notifiés. L’incidence annuelle moyenne était de 175,33 cas avec des extrêmes de 73 à 266 cas. L’âge médian des patients était de 40 ans, et le sex-ratio de 1,13. Les enfants âgés de 0 à 15 ans représentaient 5,5% des cas. La région des plateaux dans le centre du pays cumulait l’incidence annuelle le plus élevé (environs 800 cas. Sur le plan clinique, les formes multibacillaires représentaient 74,2% des cas. Tous les patients étaient traités par

  7. CRISPR/Cas9 mediates efficient conditional mutagenesis in Drosophila.

    Science.gov (United States)

    Xue, Zhaoyu; Wu, Menghua; Wen, Kejia; Ren, Menda; Long, Li; Zhang, Xuedi; Gao, Guanjun

    2014-09-05

    Existing transgenic RNA interference (RNAi) methods greatly facilitate functional genome studies via controlled silencing of targeted mRNA in Drosophila. Although the RNAi approach is extremely powerful, concerns still linger about its low efficiency. Here, we developed a CRISPR/Cas9-mediated conditional mutagenesis system by combining tissue-specific expression of Cas9 driven by the Gal4/upstream activating site system with various ubiquitously expressed guide RNA transgenes to effectively inactivate gene expression in a temporally and spatially controlled manner. Furthermore, by including multiple guide RNAs in a transgenic vector to target a single gene, we achieved a high degree of gene mutagenesis in specific tissues. The CRISPR/Cas9-mediated conditional mutagenesis system provides a simple and effective tool for gene function analysis, and complements the existing RNAi approach. Copyright © 2014 Xue et al.

  8. Influence de la présence de contaminants lors du recyclage des thermoplastiques Influence of contaminants during the recycling of thermoplastics

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Casetta Mathilde

    2013-11-01

    Full Text Available Le recyclage des matières plastiques constitue un enjeu environnemental majeur en raison de la diminution des ressources pétrolières et du problème de la gestion des déchets en fin de vie. Toutefois, ce recyclage est rendu difficile par la présence d'additifs ou de pollutions au sein des polymères. L'objectif de cette communication est de présenter et de commenter deux principaux exemples permettant d'illustrer l'influence de la présence de contaminants sur les propriétés du matériau recyclé. Dans un cas, on étudiera l'influence de la méthode de recyclage sur les propriétés finales du matériau et dans l'autre cas, on cherchera à remédier à la diminution des propriétés mécaniques du polymère recyclé en compatibilisant le contaminant au sein du matériau plastique. The recycling of plastic materials represents a major environmental challenge due to the decrease of petroleum resources and the problem of end-of-life products management. However, the presence of additives or pollutants inside polymers generally makes the recycling more difficult. The aim of the presentation is to describe two main examples illustrating the influence of the presence of contaminants on the properties of recycled polymers. First, the influence of the recycling method on the final properties of the material will be studied. Then, the decrease of the mechanical properties of the recycled polymer will be overcome by compatibilizing the contaminant inside the plastic material.

  9. Sylvie Chaperon, La médecine du sexe et les femmes, Paris, La Musardine, 2008, 198 p.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Grégory Quin

    2010-07-01

    Full Text Available Après un travail fouillé sur les origines de la sexologie, Sylvie Chaperon, historienne spécialiste d’histoire des femmes et du genre, maîtresse de conférences à l’Université de Toulouse 2, propose dans son nouveau livre une anthologie de textes que des médecins du XIXe siècle ont produits sur la sexualité féminine et ses diverses pathologies. L’ouvrage est construit autour d’une cinquantaine de cas de quelques-unes de ces pathologies associées à la sexualité des femmes : l’onanisme, la nymph...

  10. Drainage percutané de l'abcès du psoas: Notre expérience et revue ...

    African Journals Online (AJOL)

    M. Asseban

    et al. Les abcès pyogènes secondaires du psoas: à propos de six cas et revue de la littérature. Rev Med Interne 2006;27:828–35. [3] Muttarak M, Peh WC. CT of unusual iliopsoas compartment lesions. Radiographics 2000. Oct; 20 Spec No: S53-S66. [4] Zissin R, Gayer G, Kots E, Werner M, Shapiro-Feinberg M, Hertz M.

  11. diversité botanique dans le sud du parc national de taï, côte d

    African Journals Online (AJOL)

    AKA Boko Mathieu

    Contrôle du convertisseur monophasé par réseau de neurones ... pour Tc=T1. Le contrôle de cette puissance n'est donc possible que pour des puissances moyennes comprises entre ces deux valeurs limites. 2-2. Modélisation interne ..... performances de la commande numérique non linéaire utilisée en présentant le cas ...

  12. Cas9 versus Cas12a/Cpf1: Structure-function comparisons and implications for genome editing.

    Science.gov (United States)

    Swarts, Daan C; Jinek, Martin

    2018-05-22

    Cas9 and Cas12a are multidomain CRISPR-associated nucleases that can be programmed with a guide RNA to bind and cleave complementary DNA targets. The guide RNA sequence can be varied, making these effector enzymes versatile tools for genome editing and gene regulation applications. While Cas9 is currently the best-characterized and most widely used nuclease for such purposes, Cas12a (previously named Cpf1) has recently emerged as an alternative for Cas9. Cas9 and Cas12a have distinct evolutionary origins and exhibit different structural architectures, resulting in distinct molecular mechanisms. Here we compare the structural and mechanistic features that distinguish Cas9 and Cas12a, and describe how these features modulate their activity. We discuss implications for genome editing, and how they may influence the choice of Cas9 or Cas12a for specific applications. Finally, we review recent studies in which Cas12a has been utilized as a genome editing tool. This article is categorized under: RNA Interactions with Proteins and Other Molecules > Protein-RNA Interactions: Functional Implications Regulatory RNAs/RNAi/Riboswitches > Biogenesis of Effector Small RNAs RNA Interactions with Proteins and Other Molecules > RNA-Protein Complexes. © 2018 Wiley Periodicals, Inc.

  13. L’enjeu du régionalisme dans les relations entre les pays émergents. Le cas du Brésil et de l’Afrique du Sud

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Audrey Lauriello

    2011-01-01

    Full Text Available La présente contribution se penche sur la place accordée au régionalisme dans les relations entre les pays dits «émergents» que sont le Brésil et l’Afrique du Sud. La dernière décennie a vu apparaître de nouvelles puissances qui entendent participer à l’édiction des règles régissant le comportement des États sur la scène internationale au même titre que les grandes puissances industrielles traditionnelles. À cette fin, le Brésil et l’Afrique du Sud notamment ont développé une diplomatie active et multi-niveaux et s’accordent mutuellement davantage de place dans leur agenda extérieur. Parmi les différents instruments – bilatéraux, régionaux, et multilatéraux – qu’ils mobilisent, la relation interrégionale apparaît comme un outil parmi d’autres qui vise avant tout à concrétiser leurs aspirations plus globales.

  14. The expanding footprint of CRISPR/Cas9 in the plant sciences

    Science.gov (United States)

    CRISPR/Cas9 has evolved and transformed the field of biology at an unprecedented pace. From the initial purpose of introducing a site specific mutation within a genome of choice, this technology has morphed into enabling a wide array of molecular applications, including site-specific transgene inser...

  15. CRISPR-Cas systems exploit viral DNA injection to establish and maintain adaptive immunity.

    Science.gov (United States)

    Modell, Joshua W; Jiang, Wenyan; Marraffini, Luciano A

    2017-04-06

    Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-Cas systems provide protection against viral and plasmid infection by capturing short DNA sequences from these invaders and integrating them into the CRISPR locus of the prokaryotic host. These sequences, known as spacers, are transcribed into short CRISPR RNA guides that specify the cleavage site of Cas nucleases in the genome of the invader. It is not known when spacer sequences are acquired during viral infection. Here, to investigate this, we tracked spacer acquisition in Staphylococcus aureus cells harbouring a type II CRISPR-Cas9 system after infection with the staphylococcal bacteriophage ϕ12. We found that new spacers were acquired immediately after infection preferentially from the cos site, the viral free DNA end that is first injected into the cell. Analysis of spacer acquisition after infection with mutant phages demonstrated that most spacers are acquired during DNA injection, but not during other stages of the viral cycle that produce free DNA ends, such as DNA replication or packaging. Finally, we showed that spacers acquired from early-injected genomic regions, which direct Cas9 cleavage of the viral DNA immediately after infection, provide better immunity than spacers acquired from late-injected regions. Our results reveal that CRISPR-Cas systems exploit the phage life cycle to generate a pattern of spacer acquisition that ensures a successful CRISPR immune response.

  16. Vocabulaire du droit pénal français: cas de polysémie externe

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Olivera Vušović

    2013-12-01

    Full Text Available La polysémie constitue un moyen important de lʼéconomie linguistique. Si les langues de spécialité ne disposent pas dʼun terme spécifique, elles trouvent la solution dans le vocabulaire général auquel elles empruntent des mots comprenant de nombreuses acceptions. Lʼune dʼelles sera précisée dʼaprès les besoins du domaine en question. Dans le présent article, nous rendons compte de lʼinterpénétration existant entre le vocabulaire du droit pénal français (issu de Code de procédure pénale et de Vocabulaire juridique, le vocabulaire général et dʼautres vocabulaires de spécialité. Les approches contemporaines de la terminologie qui prennent en considération les dimensions discursive, sociale, cognitive et culturelle permettent dʼaborder le terme avec plus de flexibilité et de ne pas le considérer comme une simple étiquette destinée à classer les connaissances. Les migrations qui sʼeffectuent entre vocabulaire général et vocabulaires de spécialité, connues sous les noms de terminologisation et déterminologisation,sʼaccompagnent des modifications sémantiques. En fonction du contexte et du domaine spécialisé, un mot peut avoir des acceptions différentes. A titre dʼexemple, le mot blanchiment ne renverra pas à la même notion pour un agent qui lutte contre la criminalité financière, un horticulteur, un cuisinier, un photographe ou un dentiste. Nous nous proposons de vérifier à quel point la polysémie externe est un phénomène répandu. Notre objectif est dʼexplorer ces transferts sémantiques, cʼest-à-dire les diverses facettes dʼun terme

  17. CRISPR/Cas9 cleavages in budding yeast reveal templated insertions and strand-specific insertion/deletion profiles.

    Science.gov (United States)

    Lemos, Brenda R; Kaplan, Adam C; Bae, Ji Eun; Ferrazzoli, Alexander E; Kuo, James; Anand, Ranjith P; Waterman, David P; Haber, James E

    2018-02-27

    Harnessing CRISPR-Cas9 technology provides an unprecedented ability to modify genomic loci via DNA double-strand break (DSB) induction and repair. We analyzed nonhomologous end-joining (NHEJ) repair induced by Cas9 in budding yeast and found that the orientation of binding of Cas9 and its guide RNA (gRNA) profoundly influences the pattern of insertion/deletions (indels) at the site of cleavage. A common indel created by Cas9 is a 1-bp (+1) insertion that appears to result from Cas9 creating a 1-nt 5' overhang that is filled in by a DNA polymerase and ligated. The origin of +1 insertions was investigated by using two gRNAs with PAM sequences located on opposite DNA strands but designed to cleave the same sequence. These templated +1 insertions are dependent on the X-family DNA polymerase, Pol4. Deleting Pol4 also eliminated +2 and +3 insertions, which are biased toward homonucleotide insertions. Using inverted PAM sequences, we also found significant differences in overall NHEJ efficiency and repair profiles, suggesting that the binding of the Cas9:gRNA complex influences subsequent NHEJ processing. As with events induced by the site-specific HO endonuclease, CRISPR-Cas9-mediated NHEJ repair depends on the Ku heterodimer and DNA ligase 4. Cas9 events are highly dependent on the Mre11-Rad50-Xrs2 complex, independent of Mre11's nuclease activity. Inspection of the outcomes of a large number of Cas9 cleavage events in mammalian cells reveals a similar templated origin of +1 insertions in human cells, but also a significant frequency of similarly templated +2 insertions.

  18. Cas9-catalyzed DNA Cleavage Generates Staggered Ends: Evidence from Molecular Dynamics Simulations

    Science.gov (United States)

    Zuo, Zhicheng; Liu, Jin

    2016-11-01

    The CRISPR-associated endonuclease Cas9 from Streptococcus pyogenes (spCas9) along with a single guide RNA (sgRNA) has emerged as a versatile toolbox for genome editing. Despite recent advances in the mechanism studies on spCas9-sgRNA-mediated double-stranded DNA (dsDNA) recognition and cleavage, it is still unclear how the catalytic Mg2+ ions induce the conformation changes toward the catalytic active state. It also remains controversial whether Cas9 generates blunt-ended or staggered-ended breaks with overhangs in the DNA. To investigate these issues, here we performed the first all-atom molecular dynamics simulations of the spCas9-sgRNA-dsDNA system with and without Mg2+ bound. The simulation results showed that binding of two Mg2+ ions at the RuvC domain active site could lead to structurally and energetically favorable coordination ready for the non-target DNA strand cleavage. Importantly, we demonstrated with our simulations that Cas9-catalyzed DNA cleavage produces 1-bp staggered ends rather than generally assumed blunt ends.

  19. SaCas9 Requires 5'-NNGRRT-3' PAM for Sufficient Cleavage and Possesses Higher Cleavage Activity than SpCas9 or FnCpf1 in Human Cells.

    Science.gov (United States)

    Xie, Haihua; Tang, Lianchao; He, Xiubin; Liu, Xiexie; Zhou, Chenchen; Liu, Junjie; Ge, Xianglian; Li, Jin; Liu, Changbao; Zhao, Junzhao; Qu, Jia; Song, Zongming; Gu, Feng

    2018-04-01

    CRISPR/Cas9-mediated gene therapy holds great promise for the treatment of human diseases. The protospacer adjacent motif (PAM), the sequence adjacent to the target sequence, is an essential targeting component for the design of CRISPR/Cas9-mediated gene editing. However, currently, very few studies have attempted to directly study the PAM sequence in human cells. To address this issue, the authors develop a dual fluorescence reporter system that could be harnessed for identifying functional PAMs for genome editing endonuclease, including Cas9. With this system, the authors investigate the effects of different PAM sequences for SaCas9, which is small and has the advantage of allowing in vivo genome editing, and found only 5'-NNGRRT-3' PAM could induced sufficient target cleavage with multi-sites. The authors also found SaCas9 possesses higher activity than SpCas9 or FnCpf1 via plasmids (episomal) and chromosomes with integrated eGFP-based comparison. Taken together, the authors show that a dual fluorescence reporter system is a means to identifying a functional PAM and quantitatively comparing the efficiency of different genome editing endonucleases with the similar or identical target sequence in human cells. © 2017 WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim.

  20. Kyste hydatique de la surrénale: à propos d'un cas

    Science.gov (United States)

    Mahmoudi, Ammar; Maâtouk, Mezri; Noomen, Faouzi; Nasr, Mohamed; Zouari, Khadija; Hamdi, Abdelaziz

    2015-01-01

    Le kyste hydatique de la surrénale reste une affection exceptionnelle et une localisation inhabituelle du kyste hydatique, même dans les pays où l'hydatidose sévit à l’état endémique. Nous rapportons un cas de kyste hydatique surrénalien révélé par des douleurs de l'hypochondre droit. Le diagnostic a été évoqué en préopératoire sur les données de la tomodensitométrie abdominale qui avait objectivé une masse kystique surrénalienne droite. La sérologie hydatique était positive. Le traitement chirurgical avait consisté en une résection du dôme saillant et avait permis de conserver la glande. Le kyste était univésiculaire contenant un liquide eau de roche avec une membrane proligère. Les suites opératoires étaient simples. La surveillance à distance, échographique et immunologique, n'avait pas décelé de récidive avec un recul de deux ans PMID:26587122

  1. Différencier les pairs. Mise en gestion du travail universitaire et encastrement organisationnel des carrières académiques (Royaume-Uni, 1970-2010)

    OpenAIRE

    Payé, Simon

    2013-01-01

    En considérant le cas britannique, cette thèse étudie les mutations du travail universitaire dans un contexte marqué par la montée en puissance des pratiques de gestion du personnel et l'instauration de mécanismes de « quasi-marchés » par des politiques inspirées du New Public Management. À partir d'une enquête dans deux universités britanniques croisant entretiens biographiques, analyse de séquences des mobilités académiques et dépouillement d'archives, cette thèse révèle un important « trav...

  2. Le contextualisme de Quentin Skinner à l’épreuve du cas Machiavel

    OpenAIRE

    Marcotte-Chénard, Sophie

    2013-01-01

    Dans cet article, nous cherchons à penser les enjeux philosophiques et politiques de l’application des méthodes interprétatives en histoire de la philosophie politique. À partir d’une étude de l’interprétation de Machiavel développée par Quentin Skinner, nous interrogeons la relation entre l’exposition théorique de sa méthodologie et son application effective à la pensée machiavélienne. Dans un premier temps, nous exposons les fondements du contextualisme skinnérien, en insistant d’une part s...

  3. Evolution du pH et de la température au cours de la transformation artisanale du cymbium (voluté). Essai sur les perspectives de valorisation du produit transformé

    OpenAIRE

    Diouf, A.

    2008-01-01

    L’étude porte sur l’évolution du pH et de la température au cours de la transformation artisanale du Cymbium, ainsi que sur les perspectives de valorisation du produit transformé. Les expérimentations menées au site de transformation artisanale de Joal ont permis de constater que : Après 12 heures de séjour en bac (1ère nuit), le Cymbium est encore en phase de rigor mortis. Le pH moyen affiché à l’issue de cette première nuit est de 7,6 ; donc proche de celui du mollusque ...

  4. L’utilisation du prémélange de monensin chez les vaches laitières : un suivi simple et essentiel pour s’assurer d’une utilisation adéquate

    Science.gov (United States)

    Dubuc, Jocelyn; Baril, Jean; DesCôteaux, Luc

    2009-01-01

    Le prémélange de monensin est utilisé fréquemment sur les fermes laitières canadiennes. L’ingrédient actif de ce produit est le monensin sodique. Bien que son utilisation chez les vaches laitières soit sécuritaire, des cas de surdose ont été rapportés à la suite de consommation de niveaux de monensin plus élevés que ceux recommandés. Un suivi hebdomadaire du pourcentage de matières grasses du réservoir de lait de la ferme devrait être fait de routine suite à la livraison d’aliment médicamenteux contenant du monensin pour détecter rapidement les situations de surdose. L’observation d’une baisse soudaine de la consommation volontaire de matière sèche et l’apparition de diarrhée dans un troupeau sont d’autres signes cliniques de surdose de monensin. Une détection rapide de ces cas permettra de corriger la situation. PMID:19721781

  5. Efficient CRISPR-Cas9 Gene Disruption System in Edible-Medicinal Mushroom Cordyceps militaris

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Bai-Xiong Chen

    2018-06-01

    Full Text Available Cordyceps militaris is a well-known edible medicinal mushroom in East Asia that contains abundant and diverse bioactive compounds. Since traditional genome editing systems in C. militaris were inefficient and complicated, here, we show that the codon-optimized cas9, which was used with the newly reported promoter Pcmlsm3 and terminator Tcmura3, was expressed. Furthermore, with the help of the negative selection marker ura3, a CRISPR-Cas9 system that included the Cas9 DNA endonuclease, RNA presynthesized in vitro and a single-strand DNA template efficiently generated site-specific deletion and insertion. This is the first report of a CRISPR-Cas9 system in C. militaris, and it could accelerate the genome reconstruction of C. militaris to meet the need for rapid development in the fungi industry.

  6. A p130Cas tyrosine phosphorylated substrate domain decoy disrupts v-Crk signaling

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Hanafusa Hidesaburo

    2002-07-01

    Full Text Available Abstract Background The adaptor protein p130Cas (Cas has been shown to be involved in different cellular processes including cell adhesion, migration and transformation. This protein has a substrate domain with up to 15 tyrosines that are potential kinase substrates, able to serve as docking sites for proteins with SH2 or PTB domains. Cas interacts with focal adhesion plaques and is phosphorylated by the tyrosine kinases FAK and Src. A number of effector molecules have been shown to interact with Cas and play a role in its function, including c-crk and v-crk, two adaptor proteins involved in intracellular signaling. Cas function is dependent on tyrosine phosphorylation of its substrate domain, suggesting that tyrosine phosphorylation of Cas in part regulates its control of adhesion and migration. To determine whether the substrate domain alone when tyrosine phosphorylated could signal, we have constructed a chimeric Cas molecule that is phosphorylated independently of upstream signals. Results We found that a tyrosine phosphorylated Cas substrate domain acts as a dominant negative mutant by blocking Cas-mediated signaling events, including JNK activation by the oncogene v-crk in transient and stable lines and v-crk transformation. This block was the result of competition for binding partners as the chimera competed for binding to endogenous c-crk and exogenously expressed v-crk. Conclusion Our approach suggests a novel method to study adaptor proteins that require phosphorylation, and indicates that mere tyrosine phosphorylation of the substrate domain of Cas is not sufficient for its function.

  7. CRISPR/Cas9—Advancing Orthopoxvirus Genome Editing for Vaccine and Vector Development

    Science.gov (United States)

    Okoli, Arinze; Okeke, Malachy I.; Tryland, Morten; Moens, Ugo

    2018-01-01

    The clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)/associated protein 9 (Cas9) technology is revolutionizing genome editing approaches. Its high efficiency, specificity, versatility, flexibility, simplicity and low cost have made the CRISPR/Cas9 system preferable to other guided site-specific nuclease-based systems such as TALENs (Transcription Activator-like Effector Nucleases) and ZFNs (Zinc Finger Nucleases) in genome editing of viruses. CRISPR/Cas9 is presently being applied in constructing viral mutants, preventing virus infections, eradicating proviral DNA, and inhibiting viral replication in infected cells. The successful adaptation of CRISPR/Cas9 to editing the genome of Vaccinia virus paves the way for its application in editing other vaccine/vector-relevant orthopoxvirus (OPXV) strains. Thus, CRISPR/Cas9 can be used to resolve some of the major hindrances to the development of OPXV-based recombinant vaccines and vectors, including sub-optimal immunogenicity; transgene and genome instability; reversion of attenuation; potential of spread of transgenes to wildtype strains and close contacts, which are important biosafety and risk assessment considerations. In this article, we review the published literature on the application of CRISPR/Cas9 in virus genome editing and discuss the potentials of CRISPR/Cas9 in advancing OPXV-based recombinant vaccines and vectors. We also discuss the application of CRISPR/Cas9 in combating viruses of clinical relevance, the limitations of CRISPR/Cas9 and the current strategies to overcome them. PMID:29361752

  8. Récupération assistée du pétrole par le C02 : disponibilités et coûts en Europe de l'Ouest Enhanced Oil Recovery by C02: Availability and Cost in Western Europe

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Chauvel A.

    2006-11-01

    Full Text Available Aux deux périodes de la mise en valeur d'un champ pétrolier par le gaz carbonique : - expérimentation pilote, - puis exploitation industrielle, correspondent des besoins sensiblement différents: de l'ordre de 30 à 100 t/j dans le premier cas, de 300 à 10 000 t/j dans le second, selon l'importance du gisement. Pour satisfaire ces demandes, on peut avoir recours : - soit aux sources actuellement exploitées (essentiellement les unités d'ammoniac, dont il convient alors de répertorier les quantités supplémentaires mobilisables ; - soit aux sources potentielles jusqu'à présent inemployées (fumées d'origines diverses, exigeant des procédés d'extraction complexes et gros consommateurs d'énergie qu'il s'avérerait donc nécessaire d'améliorer. Le prix de revient de la purification du CO2 est fonction de la complexité des traitements de récupération; il est compris entre 150 FF/t et plus de 600 FF/t pour les cas les plus défavorables. Le deuxième élément intervenant dans le coût du CO2 rendu sur site est le transport, variable selon la distance et le moyen d'acheminement choisi (pipeline, citernes routières ou ferroviaires ; pour les faibles demandes, on utilise les citernes routières, pour les fortes le pipeline et les citernes ferroviaires pour les cas intermédiaires, dans la mesure où la ligne de chemin de fer passe près du gisement. D'autre part, le prix de la tonne de CO2 payée par l'utilisateur dépend de facteurs plus aléatoires tels que l'état du marché et la marge bénéficiaire du fournisseur résultant des négociations entre acheteur et vendeur. The two periods of production from an oil field by carbon-dioxide injection are: (i pilot expérimentation and (ii industrial opération. There are quite différent CO2 requirements for these two periods, i. e. about 30 to 100 t/d for the first case, and 300 to 10000 t/d in the second case, depending on the size of the field. These demands can be fulfilled: (i

  9. Characterization of CRISPR-Cas system in clinical Staphylococcus epidermidis strains revealed its potential association with bacterial infection sites

    DEFF Research Database (Denmark)

    Li, Qiuchun; Xie, Xiaolei; Yin, Kequan

    2016-01-01

    Staphylococcus epidermidis is considered as a major cause of nosocomial infections, bringing an immense burden to healthcare systems. Virulent phages have been confirmed to be efficient in combating the pathogen, but the prensence of CRISPR-Cas system, which is a bacterial immune system eliminating...... phages was reported in few S. epidermidis strains. In this study, the CRISPR-Cas system was detected in 12 from almost 300 published genomes in GenBank and by PCR of cas6 gene in 18 strains out of 130 clinical isolates obtained in Copenhagen. Four strains isolated in 1965-1966 harboured CRISPR elements...... spacers located in the CRISPR1 locus with homolgy to virulent phage 6ec DNA sequences, and 19 strains each carrying 2 or 3 different spacers recognizing this phage, implied that the CRISPR-Cas immunity could be abrogated by nucleotide mismatch between the spacer and its target phage sequence, while new...

  10. Analyse des facteurs prédictifs de malignité des goitres nodulaires : à propos de 500 cas

    Science.gov (United States)

    Bouaity, Brahim; Darouassi, Youssef; Chihani, Mehdi; Touati, Mohamed Mliha; Ammar, Haddou

    2016-01-01

    Les nodules thyroïdiens sont très fréquents et moins de 10% d'entre eux sont malin. Ils posent un véritable problème diagnostique et thérapeutique surtout par rapport à leur nature bénigne ou maligne. L’étude de certains facteurs cliniques et paracliniques de présomption de malignité permet de bien codifier la stratégie thérapeutique. Le but de ce travail est d’étudier les facteurs prédictifs de malignité des goitres nodulaires et comparer nos résultats à ceux de la littérature. Il s'agit d'une étude rétrospective à propos de 500 cas de goitres nodulaires opérés au service d'Oto-rhino-laryngologie (ORL) et Chirurgie cervico-faciale (CCF) de l'hôpital militaire Avicenne de Marrakech entre 2006 et 2012. Le pourcentage de cancers a été de 6,8%. L’âge moyen de nos patients était de 46 ans, avec une sex-ratio de 5 (F/H). A la palpation cervicale; le caractère dure du nodule a été constaté dans 94,4% des cas de cancer, avec des limites irrégulières dans 64,70% des cas de cancer. Trois nodules étaient fixes et ils étaient tous malins. Les adénopathies cervicales ont été constatées chez 8 malades dont 7 présentaient des cancers. A l’échographie, 61,8% des nodules malins présentaient un aspect hypoéchogène, avec des contours flous dans 88,24% des cas. La vascularisation intra nodulaire était présente dans 35,3% de ces cas des cancers avec des microcalcifications chez 55,9% d'entre eux. Le halo hypoéchogene périnodulaire était incomplet dans 73,5% des cas de cancer. Nos patients étaient en euthyroïdie dans 84,6% des cas. Les facteurs prédictifs de malignité d'un goitre nodulaire, étaient donc dans notre étude d'abord cliniques: l’âge supérieur à 60 ans, la consistance dure du nodule, sa fixité, son caractère irrégulier et mal limité à la palpation, ainsi que la présence d'adénopathie(s) cervicale(s) à l'examen; et échographiques: le caractère hypoéchogène, les limites floues, la présence de

  11. La longévité du pollen de colza

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Pierre Jacqueline

    2002-01-01

    Full Text Available Connaître la longévité d’un pollen est une donnée particulièrement intéressante dans le cadre des études de risques de dissémination du pollen. En effet, cela permet de savoir combien de temps une parcelle dont la floraison est terminée reste une source de pollen fécondant. Par ailleurs, une étude de la longévité du pollen pourrait permettre de mieux comprendre les résultats en apparence contradictoires obtenus au cours de diverses expérimentations menées sur la dissémination du pollen de colza. Ainsi, alors que des travaux montrent que ce pollen est peu anémophile [1] et qu’au niveau de la parcelle sa dispersion se fait sur de courtes distances [2-4], des cas de contaminations sur de grandes distances ont été signalés [5] et les relevés palynologiques effectués sur des filtres (placés à 10 m de hauteur, voire plus confirment que ce pollen peut se disperser sur de grandes distances [6]. Toutefois, on ignore si le pollen ainsi collecté est viable ou non. Si l’on fait l’hypothèse que cette dernière dispersion se fait par le biais de la mise en suspension du pollen dans l’air dans les couches de l’atmosphère et que son transport dure un certain temps, il devient également nécessaire de connaître la durée de vie du pollen pour mieux évaluer les risques de ce type de dissémination. Au plan méthodologique, mesurer la longévité du pollen peut a priori paraître simple. Cependant les critères retenus peuvent être nombreux et divers : mesure de la viabilité, mesure du pouvoir germinatif in vitro ou in vivo, mesure du pouvoir fécondant réel. Dans chacun des cas, les techniques appliquées sont différentes et chacune comporte des biais parfois importants tels que des faux-positifs dans les tests colorimétriques de viabilité, l’incidence du milieu de culture dans les tests de germination in vitro, sans parler des tests présentant des risques carcinogènes pour l’expérimentateur [7]. De plus

  12. Hernie de Spiegel: a propos d’un cas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Karim Ibn Majdoub Hassani

    2010-02-01

    Full Text Available La hernie de Spiegel ou hernie ventrale latérale est une déhiscence inhabituelle apparaissant sur la ligne ou fascia semi-lunaire de Spiegel. C’est une entité clinique rare, représente 0.10 à 1 pourcent des hernies. Aussi, nous a-t-il paru opportun de rapporter ce cas colligé dans le service de chirurgie B du CHU Hassan II de Fès. Nous rapportons l’observation d’une patiente âgée de 60 ans, sans antécédent particulier qui présentais une tuméfaction para ombilicale gauche augmentant progressivement de volume, Une hernie de Spiegel a été suspectée à l’examen clinique, et le diagnostic d’éventration antérolatérale gauche a été retenu à la tomodensitométrie abdominale. Une cure de la hernie par plaque de prolène a été réalisée et les suites opératoires étaient simples. La hernie de Spiegel est une affection rare, son diagnostic clinique peut être difficile. Elle est asymptomatique dans 90 pourcent des cas et Son diagnostic positif est radiologique. Le risque d’étranglement non négligeable impose un traitement chirurgical une fois le diagnostic est confirmé.

  13. Off-target Effects in CRISPR/Cas9-mediated Genome Engineering

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Xiao-Hui Zhang

    2015-01-01

    Full Text Available CRISPR/Cas9 is a versatile genome-editing technology that is widely used for studying the functionality of genetic elements, creating genetically modified organisms as well as preclinical research of genetic disorders. However, the high frequency of off-target activity (≥50%—RGEN (RNA-guided endonuclease-induced mutations at sites other than the intended on-target site—is one major concern, especially for therapeutic and clinical applications. Here, we review the basic mechanisms underlying off-target cutting in the CRISPR/Cas9 system, methods for detecting off-target mutations, and strategies for minimizing off-target cleavage. The improvement off-target specificity in the CRISPR/Cas9 system will provide solid genotype–phenotype correlations, and thus enable faithful interpretation of genome-editing data, which will certainly facilitate the basic and clinical application of this technology.

  14. L'azote ammoniacal, un toxique potentiel en élevage de poissons : le cas du turbot

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    PERSON-LE RUYET J.

    1998-07-01

    Full Text Available L'azote ammoniacal est un toxique potentiel en élevage de poissons ayant des effets plus ou moins sévères selon la concentration ambiante et la durée d'exposition. Dans une première partie, nous rappelons que l'AAT (somme de NH4+ et NH3 est toxique essentiellement sous sa forme NH3 . Dès qu'un poisson se trouve en présence de niveaux d'AAT anormalement élevés, il y a entrée d'AAT surtout sous forme de NH3 et diffusion dans les différents compartiments du poisson (à l'équilibre, le NH4+ est dominant. Selon les conditions d'exposition, différents états d'équilibre se succèdent entre le poisson et le milieu dès lors que ses capacités d'excrétion sont affectées. A partir d'un certain niveau de concentration d'AAT dans le sang et les tissus, le poisson n'arrive plus à réguler ses fonctions vitales, le seuil de toxicité est atteint. Nous faisons ensuite la synthèse de l'état des connaissances des effets de l'AAT sur la survie et la croissance du turbot (Psetta maxima en le comparant à d'autres espèces de poissons élevées en mer ou en eau douce. A court terme, la sensibilité du turbot à l'AAT est du même ordre de grandeur que celle de la daurade et du bar, la 96-h CL50 (concentration létale pour 50 % de la population varie dans une fourchette de 1 à 3 mg/l NH3 . Des valeurs aussi élevées ne peuvent être qu'accidentellement rencontrées, même dans les élevages à haute densité. Chez toutes les espèces marines éprouvées, le seuil de toxicité chronique est plus bas, 0,8-1 mg/l NH3 pour une durée d'exposition n'excédant pas un mois. Chez le turbot, la croissance est ralentie à 0,33 mg/l NH3 en moyenne et sensiblement aux mêmes valeurs chez le bar et la daurade. Chez ces mêmes espèces selon la duré d'exposition, il y a risque de perturbation de la croissance au-dessus de 0,11 mg/l NH3 , ce qui correspond aux pics de concentrations dans les élevages à haute densité utilisant des circuits fermés. Ces

  15. Gene Inactivation by CRISPR-Cas9 in Nicotiana tabacum BY-2 Suspension Cells.

    Science.gov (United States)

    Mercx, Sébastien; Tollet, Jérémie; Magy, Bertrand; Navarre, Catherine; Boutry, Marc

    2016-01-01

    Plant suspension cells are interesting hosts for the heterologous production of pharmacological proteins such as antibodies. They have the advantage to facilitate the containment and the application of good manufacturing practices. Furthermore, antibodies can be secreted to the extracellular medium, which makes the purification steps much simpler. However, improvements are still to be made regarding the quality and the production yield. For instance, the inactivation of proteases and the humanization of glycosylation are both important targets which require either gene silencing or gene inactivation. To this purpose, CRISPR-Cas9 is a very promising technique which has been used recently in a series of plant species, but not yet in plant suspension cells. Here, we sought to use the CRISPR-Cas9 system for gene inactivation in Nicotiana tabacum BY-2 suspension cells. We transformed a transgenic line expressing a red fluorescent protein (mCherry) with a binary vector containing genes coding for Cas9 and three guide RNAs targeting mCherry restriction sites, as well as a bialaphos-resistant (bar) gene for selection. To demonstrate gene inactivation in the transgenic lines, the mCherry gene was PCR-amplified and analyzed by electrophoresis. Seven out of 20 transformants displayed a shortened fragment, indicating that a deletion occurred between two target sites. We also analyzed the transformants by restriction fragment length polymorphism and observed that the three targeted restriction sites were hit. DNA sequencing of the PCR fragments confirmed either deletion between two target sites or single nucleotide deletion. We therefore conclude that CRISPR-Cas9 can be used in N. tabacum BY2 cells.

  16. Festival du rire de Genève

    CERN Document Server

    Staff Association

    2015-01-01

    Connaissez-vous le Festival du rire de Genève ? La deuxième édition aura lieu du 25 au 28 mars 2015 au Casino-Théâtre à Carouge. Côté programmation, Marc Donnet-Monay ouvre les festivités avant trois autres soirées de folie et d’humour que nous vous laissons le soin de découvrir dans le programme : http://www.rire-geneve.ch/#programme. Réduction de 30% sur l’achat de places pour les membres du personnel du CERN. Pour cela, il suffit de se rendre sur la billetterie en ligne de notre site : www.rire-geneve.ch et d’utiliser le code promotionnel. Contacter le secrétariat de l’Association du personnel (Staff.Association@cern.ch) pour connaitre ce code promotionnel.

  17. Standing up to Intersectional Discrimination: a Multi-dimensional Approach to the Case of Spain Faire face à la discrimination intersectionelle : une approche multi-dimensionnelle du cas espagnol

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Olga Jubany

    2012-05-01

    Full Text Available In analysing and understanding discrimination in our globalised society, the intersectional approach becomes fundamental to move beyond presumed collective classifications and adopt a conceptual framework inclusive of all forms of discrimination and their intersections. However, this does not only relate to the existence of different forms of the discriminatory experience, but also to the diversity in resistance and to the ways in which individuals stand up to it. By presenting an in-depth exploration of the case of Spain, this paper illustrates the key elements that play a role in the use of resources to complain against experiences of discrimination as a means of resistance. This is analysed through a multi-dimensional approach which reveals the existence of a breach between the prominent application of the intersectional concept at the academic level and its minimal use by individuals experiencing discrimination and those dealing with discrimination complaints. It is by linking the results of an empirical investigation with the arguments outlined at the wider academic sphere that this paper attempts to bridge the gap between the everyday experiences and the conceptual debate.En analysant et en comprenant la discrimination à l’aune de notre société globalisée, l’approche intersectionnelle devient fondamentale pour dépasser les classifications collectives présumées et pour adopter un cadre conceptuel incluant toutes les formes de discrimination et leurs intersections. Cela renvoie non seulement à l’existence de différentes formes d’expérience discriminatoire mais aussi aux différentes manières dont les individus y font face et y résistent. À partir d’une exploration approfondie du cas espagnol, cet article montre les éléments-clés qui jouent un rôle dans l’usage des ressources mobilisées comme moyen de résistance en cas d’expériences discriminatoires. Grâce à une approche multi-dimensionnelle, l’analyse r

  18. Legalis.net

    CERN Document Server

    Site Web regroupant de nombreuses publications, associations, cas de jurisprudence, modèles de contrats dans le domaine juridique de l'informatique, du multimedia, de l'Internet et des télécommunications.

  19. CRISPR-Cas and Contact-Dependent Secretion Systems Present on Excisable Pathogenicity Islands with Conserved Recombination Modules.

    Science.gov (United States)

    Carpenter, Megan R; Kalburge, Sai S; Borowski, Joseph D; Peters, Molly C; Colwell, Rita R; Boyd, E Fidelma

    2017-05-15

    Pathogenicity islands (PAIs) are mobile integrated genetic elements that contain a diverse range of virulence factors. PAIs integrate into the host chromosome at a tRNA locus that contains their specific bacterial attachment site, attB , via integrase-mediated site-specific recombination generating attL and attR sites. We identified conserved recombination modules (integrases and att sites) previously described in choleragenic Vibrio cholerae PAIs but with novel cargo genes. Clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)-associated proteins (Cas proteins) and a type VI secretion system (T6SS) gene cluster were identified at the Vibrio pathogenicity island 1 (VPI-1) insertion site in 19 V. cholerae strains and contained the same recombination module. Two divergent type I-F CRISPR-Cas systems were identified, which differed in Cas protein homology and content. The CRISPR repeat sequence was identical among all V. cholerae strains, but the CRISPR spacer sequences and the number of spacers varied. In silico analysis suggests that the CRISPR-Cas systems were active against phages and plasmids. A type III secretion system (T3SS) was present in 12 V. cholerae strains on a 68-kb island inserted at the same tRNA-serine insertion site as VPI-2 and contained the same recombination module. Bioinformatics analysis showed that two divergent T3SSs exist among the strains examined. Both the CRISPR and T3SS islands excised site specifically from the bacterial chromosome as complete units, and the cognate integrases were essential for this excision. These data demonstrated that identical recombination modules that catalyze integration and excision from the chromosome can acquire diverse cargo genes, signifying a novel method of acquisition for both CRISPR-Cas systems and T3SSs. IMPORTANCE This work demonstrated the presence of CRISPR-Cas systems and T3SSs on PAIs. Our work showed that similar recombination modules can associate with different cargo genes and

  20. The Impact of Chromatin Dynamics on Cas9-Mediated Genome Editing in Human Cells.

    Science.gov (United States)

    Daer, René M; Cutts, Josh P; Brafman, David A; Haynes, Karmella A

    2017-03-17

    In order to efficiently edit eukaryotic genomes, it is critical to test the impact of chromatin dynamics on CRISPR/Cas9 function and develop strategies to adapt the system to eukaryotic contexts. So far, research has extensively characterized the relationship between the CRISPR endonuclease Cas9 and the composition of the RNA-DNA duplex that mediates the system's precision. Evidence suggests that chromatin modifications and DNA packaging can block eukaryotic genome editing by custom-built DNA endonucleases like Cas9; however, the underlying mechanism of Cas9 inhibition is unclear. Here, we demonstrate that closed, gene-silencing-associated chromatin is a mechanism for the interference of Cas9-mediated DNA editing. Our assays use a transgenic cell line with a drug-inducible switch to control chromatin states (open and closed) at a single genomic locus. We show that closed chromatin inhibits binding and editing at specific target sites and that artificial reversal of the silenced state restores editing efficiency. These results provide new insights to improve Cas9-mediated editing in human and other mammalian cells.

  1. Unification of Cas protein families and a simple scenario for the origin and evolution of CRISPR-Cas systems

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Wolf Yuri I

    2011-07-01

    Full Text Available Abstract Background The CRISPR-Cas adaptive immunity systems that are present in most Archaea and many Bacteria function by incorporating fragments of alien genomes into specific genomic loci, transcribing the inserts and using the transcripts as guide RNAs to destroy the genome of the cognate virus or plasmid. This RNA interference-like immune response is mediated by numerous, diverse and rapidly evolving Cas (CRISPR-associated proteins, several of which form the Cascade complex involved in the processing of CRISPR transcripts and cleavage of the target DNA. Comparative analysis of the Cas protein sequences and structures led to the classification of the CRISPR-Cas systems into three Types (I, II and III. Results A detailed comparison of the available sequences and structures of Cas proteins revealed several unnoticed homologous relationships. The Repeat-Associated Mysterious Proteins (RAMPs containing a distinct form of the RNA Recognition Motif (RRM domain, which are major components of the CRISPR-Cas systems, were classified into three large groups, Cas5, Cas6 and Cas7. Each of these groups includes many previously uncharacterized proteins now shown to adopt the RAMP structure. Evidence is presented that large subunits contained in most of the CRISPR-Cas systems could be homologous to Cas10 proteins which contain a polymerase-like Palm domain and are predicted to be enzymatically active in Type III CRISPR-Cas systems but inactivated in Type I systems. These findings, the fact that the CRISPR polymerases, RAMPs and Cas2 all contain core RRM domains, and distinct gene arrangements in the three types of CRISPR-Cas systems together provide for a simple scenario for origin and evolution of the CRISPR-Cas machinery. Under this scenario, the CRISPR-Cas system originated in thermophilic Archaea and subsequently spread horizontally among prokaryotes. Conclusions Because of the extreme diversity of CRISPR-Cas systems, in-depth sequence and structure

  2. Communication du Service juridique et du Département HR à l'attention des membres du personnel domiciliés en France

    CERN Multimedia

    HR Department

    2007-01-01

    Déclaration de revenus 2006 Les membres du personnel trouveront ci-après les informations nécessaires sur la manière de remplir la déclaration de revenus 2006, qui doit être retournée au plus tard le 31 mai 2007. Qui doit remplir la déclaration? Comment l'obtenir? Tous les membres du personnel1) domiciliés en France2), qu'ils soient ou non de nationalité française, doivent remplir la déclaration de revenus 2006 sur la base des présentes instructions et la renvoyer signée, au plus tard le 31 mai 2007, au centre des impôts de leur domicile. Les membres du personnel devraient recevoir la déclaration de revenus 2006 fin avril - début mai. Ceux qui ne la recevraient pas directement devront la retirer au centre des impôts, à la trésorerie ou à la mairie de leur domicile ou bien encore la télécharger sur le site internet du Ministère des Finances (www.finances.gouv.fr). Comment remplir la déclaration Les membres du personnel doivent remplir la DECLARATION PAPIER uniquement. Dé...

  3. Bases en technique du vide

    CERN Document Server

    Rommel, Guy

    2017-01-01

    Cette seconde édition, 20 ans après la première, devrait continuer à aider les techniciens pour la réalisation de leur système de vide. La technologie du vide est utilisée, à présent, dans de nombreux domaines très différents les uns des autres et avec des matériels très fiables. Or, elle est souvent bien peu étudiée, de plus, c'est une discipline où le savoir-faire prend tout son sens. Malheureusement la transmission par des ingénieurs et techniciens expérimentés ne se fait plus ou trop rapidement. La technologie du vide fait appel à la physique, à la chimie, à la mécanique, à la métallurgie, au dessin industriel, à l'électronique, à la thermique, etc. Cette discipline demande donc de maîtriser des techniques de domaines très divers, et ce n'est pas chose facile. Chaque installation est en soi un cas particulier avec ses besoins, sa façon de traiter les matériaux et celle d'utiliser les matériels. Les systèmes de vide sont parfois copiés d'un laboratoire à un autre et le...

  4. Closure Report for Corrective Action Unit 537: Waste Sites, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    NSTec Environmental Restoration

    2007-01-01

    Corrective Action Unit (CAU) 537 is identified in the ''Federal Facility Agreement and Consent Order'' (FFACO) of 1996 as Waste Sites. CAU 537 is located in Areas 3 and 19 of the Nevada Test Site, approximately 65 miles northwest of Las Vegas, Nevada, and consists of the following two Corrective Action Sites (CASs): CAS 03-23-06, Bucket; Yellow Tagged Bags; and CAS 19-19-01, Trash Pit. CAU 537 closure activities were conducted in April 2007 according to the FFACO and Revision 3 of the Sectored Clean-up Work Plan for Housekeeping Category Waste Sites (U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office [NNSA/NSO], 2003). At CAS 03-23-06, closure activities included removal and disposal of a 15-foot (ft) by 15-ft by 8-ft tall wooden shed containing wood and metal debris and a 5-gallon plastic bucket containing deteriorated plastic bags with yellow radioactive contamination tape. The debris was transported to the Area 9 U10c Landfill for disposal after being screened for radiological contamination according to the ''NV/YMP Radiological Control Manual'' (NNSA/NSO, 2004). At CAS 19-19-01, closure activities included segregation, removal, and disposal of non-friable, non-regulated asbestos-containing material (ACM) and construction debris. The ACM was determined to be non-friable by waste characterization samples collected prior to closure activities. The ACM was removed and double-bagged by licensed, trained asbestos workers and transported to the Area 9 U10c Landfill for disposal. Construction debris was transported in end-dump trucks to the Area 9 U10c Landfill for disposal. Closure activities generated sanitary waste/construction debris and ACM. Waste generated during closure activities was appropriately managed and disposed. Waste characterization sample results are included as Appendix A of this report, and waste disposition documentation is included as Appendix B of this report. Copies of the Sectored Housekeeping Site Closure

  5. diversité botanique dans le sud du parc national de taï, côte d

    African Journals Online (AJOL)

    AKA Boko Mathieu

    [I] est le vecteur courant (Ampère). [L] est la matrice d'inductance par unité de longueur (H/m). Ses termes diagonaux représentent les inductances propres des éléments du résonateur et les autres termes correspondent aux inductances mutuelles entre ces éléments. Dans le cas où les fréquences sont très élevées et les ...

  6. Genome editing: the road of CRISPR/Cas9 from bench to clinic

    KAUST Repository

    Eid, Ayman

    2016-10-14

    Molecular scissors engineered for site-specific modification of the genome hold great promise for effective functional analyses of genes, genomes and epigenomes and could improve our understanding of the molecular underpinnings of disease states and facilitate novel therapeutic applications. Several platforms for molecular scissors that enable targeted genome engineering have been developed, including zinc-finger nucleases (ZFNs), transcription activator-like effector nucleases (TALENs) and, most recently, clustered regularly interspaced palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated-9 (Cas9). The CRISPR/Cas9 system\\'s simplicity, facile engineering and amenability to multiplexing make it the system of choice for many applications. CRISPR/Cas9 has been used to generate disease models to study genetic diseases. Improvements are urgently needed for various aspects of the CRISPR/Cas9 system, including the system\\'s precision, delivery and control over the outcome of the repair process. Here, we discuss the current status of genome engineering and its implications for the future of biological research and gene therapy.

  7. Cet obscur objet du désir… multiculturel (III : ethnogenèse, ethnicisation et ethnification

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Guillaume Boccara

    2010-06-01

    Full Text Available L’ouvrage collectif El Regreso de lo Indígena se propose d’aborder les problèmes théoriques et pratiques liés à la mise en place du multiculturalisme en Amérique latine au cours des 20 dernières années. Partant d’une lecture critique de certains des articles qui composent ce recueil, nous développons une réflexion sur les liens entre multiculturalisme et néolibéralisme, reconfiguration de l’Etat et gestion de la différence ainsi que sur les tensions entre particularisme et universalisme. Nous nous interrogeons sur l’émergence de nouvellesidentités politiques de caractère ethnique et les ethnogenèses contemporaines tout en les réinscrivant dans le contexte plus global de construction d‘un « indien écologiste » et du nouveau culte à la diversité culturelle promu par les agents de la globalisation néolibérale. A partir de l’analyse du cas latino-américain, nous examinons les liens entre capitalisme, ethnicité, nationalisme, racialisation et construction de l’Etat à l’aube du troisième millénaire. Ce faisant, nous posons la question du statut et du rôle de la recherche anthropologique dans ce contexte d’ethnification des relations sociales, de politisation de la culture et de diffusion d’une culture néolibérale

  8. Cet obscur objet du désir … multiculturel (I : Pouvoir et Différence

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Guillaume Boccara

    2010-06-01

    Full Text Available L’ouvrage collectif El Regreso de lo Indígena se propose d’aborder les problèmes théoriques et pratiques liés à la mise en place du multiculturalisme en Amérique latine au cours des 20 dernières années. Partant d’une lecture critique de certains des articles qui composent ce recueil, nous développons une réflexion sur les liens entre multiculturalisme et néolibéralisme, reconfiguration de l’Etat et gestion de la différence ainsi que sur les tensions entre particularisme et universalisme. Nous nous interrogeons sur l’émergence de nouvellesidentités politiques de caractère ethnique et les ethnogenèses contemporaines tout en les réinscrivant dans le contexte plus global de construction d‘un « indien écologiste » et du nouveau culte à la diversité culturelle promu par les agents de la globalisation néolibérale. A partir de l’analyse du cas latino-américain, nous examinons les liens entre capitalisme, ethnicité, nationalisme, racialisation et construction de l’Etat à l’aube du troisième millénaire. Ce faisant, nous posons la question du statut et du rôle de la recherche anthropologique dans ce contexte d’ethnification des relations sociales, de politisation de la culture et de diffusion d’une culture néolibérale

  9. Survie au cancer du sein à Rabat (Maroc) 2005-2008

    Science.gov (United States)

    Mechita, Nada Bennani; Tazi, Mohammed Adnane; Er-Raki, Abdelouahed; Mrabet, Mustapha; Saadi, Asma; Benjaafar, Noureddine; Razine, Rachid

    2016-01-01

    Introduction Le cancer du sein représente un problème de santé publique au Maroc. L’objectif de ce travail était d’estimer le taux de survie au cancer du sein chez les patientes habitant la ville de Rabat. Méthodes Etude pronostique réalisée chez les patientes diagnostiquées pour cancer du sein de 2005 à 2008, habitant la ville de Rabat et enregistrées au registre des cancers de Rabat. La date d’inclusion dans l’étude correspondait à la date de confirmation histologique du cancer. L’estimation de la survie a été réalisée par la méthode de Kaplan Meier, et la comparaison entre les différentes classes d’une variable a été réalisée par le test de log rank. L’étude des facteurs associés à la survie a été effectuée par le modèle de Cox. Résultats Durant la période d’étude 628 cas de cancer du sein ont été collectés. Le pourcentage de décès était de 19,9%. La survie globale à un an était de 97,1%, elle était de 89,2% à 3 ans et de 80,6 % à 5 ans. En analyse multivariée la survie au cancer du sein était statistiquement moins bonne chez les patientes âgées de plus de 70 ans (p<0,001), ayantune grande taille de tumeur (p<0,001), un stade avancé d’adénopathies (p=0,007), présentant des métastases (p<0,001) et non traitées par hormonothérapie (p=0,002). Conclusion Une grande taille de la tumeur et la présence de métastases sont des facteurs de mauvais pronostic du cancer du sein d’où la nécessité de renforcer les programmes de dépistage. PMID:28292106

  10. Induced mutation and epigenetics modification in plants for crop improvement by targeting CRISPR/Cas9 technology.

    Science.gov (United States)

    Khan, Muhammad Hafeez Ullah; Khan, Shahid U; Muhammad, Ali; Hu, Limin; Yang, Yang; Fan, Chuchuan

    2018-06-01

    Clustered regularly interspaced palindromic repeats associated protein Cas9 (CRISPR-Cas9), originally an adaptive immunity system of prokaryotes, is revolutionizing genome editing technologies with minimal off-targets in the present era. The CRISPR/Cas9 is now highly emergent, advanced, and highly specific tool for genome engineering. The technology is widely used to animal and plant genomes to achieve desirable results. The present review will encompass how CRISPR-Cas9 is revealing its beneficial role in characterizing plant genetic functions, genomic rearrangement, how it advances the site-specific mutagenesis, and epigenetics modification in plants to improve the yield of field crops with minimal side-effects. The possible pitfalls of using and designing CRISPR-Cas9 for plant genome editing are also discussed for its more appropriate applications in plant biology. Therefore, CRISPR/Cas9 system has multiple benefits that mostly scientists select for genome editing in several biological systems. © 2017 Wiley Periodicals, Inc.

  11. Anesthésie pour prothése totale de la hanche: à propos de 50 cas

    Science.gov (United States)

    Serghini, Issam; Qamouss, Youssef; Zoubir, Mohamed; Lalaoui, Jaafar Salim; Koulali, Idrissi Khalid; Boughalem, Mohamed

    2015-01-01

    La chirurgie de la prothèse totale de la hanche (PTH) est une chirurgie fonctionnelle qui consiste en un remplacement d'une articulation endommagée afin d'améliorer la qualité de vie du patient. L'anesthésie pour PTH exige une préparation rigoureuse à l'intervention, la consultation d'anesthésie sera donc la clef de cette réussite. Nous avons réalisé une étude rétrospective concernant 60 arthroplasties totales de la hanche implantées chez 50 patients adultes, colligée au sevice de Traumatologie et de chirurgie orthopédique à l'Hôpital Militaire Avicenne de Marrakech sur une période étalée de Janvier 2010 au Décembre 2012. Nous avons évalué la prise en charge anesthésique: pré, per et postopératoire des patients opérés pour une PTH. La moyenne d’âge était de 56,5 ans, le sex-ratio était de 1,63 en faveur des hommes. L'indication prédominante était la coxarthrose primitive. L'anesthésie générale était la technique anesthésique la plus utilisée (66% des cas), l'intubation difficile était rencontrée chez 6% de nos patients. La durée moyenne de l'acte chirurgical était de 114 +/- 25,33 mn. 12% de nos patients ont présenté une hypotension artérielle peropératoire. L'incidence de la transfusion homologue perop était de 14%. Nous avons noté 08 cas de complications postop: 03 cas d'infection de la PTH 15 jours après l'intervention, 03 cas de descellement aseptique, 01 cas de luxation de PTH et 01 cas de descellement septique avec un recul moyen de 54 mois. PMID:27047619

  12. La grammaire du français et son historiographie: appréhensions, à deux siècles de distance, d'un objet de débats

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Pierre Swiggers

    2000-12-01

    Full Text Available Dans cet article, consacré à l 'historiographie de la grammaire franrçaise, on abordera d'abord le problème de la définition du champ de l'histoire (ou de l'historiographie de la grammaire franrçaise (et de la linguistique franrçaise. La deuxième partie du texte sera consacrée à un problème central de l' epistémologie historique de la grammaire franrçaise: celui de la "récurrence du fait historique ", problème que je voudrais analyser à travers un cas concret, celui de l 'accueil fait à la grammaire de l 'Académie.

  13. Efficient gene knock-out and knock-in with transgenic Cas9 in Drosophila.

    Science.gov (United States)

    Xue, Zhaoyu; Ren, Mengda; Wu, Menghua; Dai, Junbiao; Rong, Yikang S; Gao, Guanjun

    2014-03-21

    Bacterial Cas9 nuclease induces site-specific DNA breaks using small gRNA as guides. Cas9 has been successfully introduced into Drosophila for genome editing. Here, we improve the versatility of this method by developing a transgenic system that expresses Cas9 in the Drosophila germline. Using this system, we induced inheritable knock-out mutations by injecting only the gRNA into embryos, achieved highly efficient mutagenesis by expressing gRNA from the promoter of a novel non-coding RNA gene, and recovered homologous recombination-based knock-in of a fluorescent marker at a rate of 4.5% by co-injecting gRNA with a circular DNA donor. Copyright © 2014 Xue et al.

  14. Publications | Page 196 | CRDI - Centre de recherches pour le ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    Gestion et valorisation des déchets d'équipements électroniques et informatiques en Afrique de l'Ouest (cas du Bénin, du Mali et du Sénégal) : rapport sur le cas du Bénin, 2007-2010 (restricted access) ...

  15. A Convenient Cas9-based Conditional Knockout Strategy for Simultaneously Targeting Multiple Genes in Mouse.

    Science.gov (United States)

    Chen, Jiang; Du, Yinan; He, Xueyan; Huang, Xingxu; Shi, Yun S

    2017-03-31

    The most powerful way to probe protein function is to characterize the consequence of its deletion. Compared to conventional gene knockout (KO), conditional knockout (cKO) provides an advanced gene targeting strategy with which gene deletion can be performed in a spatially and temporally restricted manner. However, for most species that are amphiploid, the widely used Cre-flox conditional KO (cKO) system would need targeting loci in both alleles to be loxP flanked, which in practice, requires time and labor consuming breeding. This is considerably significant when one is dealing with multiple genes. CRISPR/Cas9 genome modulation system is advantaged in its capability in targeting multiple sites simultaneously. Here we propose a strategy that could achieve conditional KO of multiple genes in mouse with Cre recombinase dependent Cas9 expression. By transgenic construction of loxP-stop-loxP (LSL) controlled Cas9 (LSL-Cas9) together with sgRNAs targeting EGFP, we showed that the fluorescence molecule could be eliminated in a Cre-dependent manner. We further verified the efficacy of this novel strategy to target multiple sites by deleting c-Maf and MafB simultaneously in macrophages specifically. Compared to the traditional Cre-flox cKO strategy, this sgRNAs-LSL-Cas9 cKO system is simpler and faster, and would make conditional manipulation of multiple genes feasible.

  16. ÉTUDE DE CAS — Inde : Suivi de la santé et du bien-être dans la ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    10 janv. 2011 ... Mais ses effets, tant néfastes que favorables, sur la santé et le ... dans la région minière : si les effets sont néfastes ou favorables; .... ÉTUDE DE CAS — Équateur (les pesticides) : L'intoxication par les pesticides en Équateur.

  17. Le traumatisme du colon: l'expérience du CHU Hassan II de Fès

    Science.gov (United States)

    Benjelloun, El Bachir; Hafid, Hasnai; Karim, Ibnmajdoub; Ousadden, Abdelmalek; Mazaz, Khalid; Taleb, Kahlid Ait

    2012-01-01

    Introduction Les traumatismes du colon sont associés à un risque majeur de complications septiques et de mortalité. Le but de notre étude est d’évaluer les circonstances, la prise en charge, le suivi et les facteurs pronostic de morbidité postopératoire des malades victimes d'un traumatisme colique. Méthodes Il s'agit d'une étude rétrospective sur une série de 49 patients opérés pour des plaies coliques aux services de chirurgie viscérale du CHU HASSAN II de Fès sur une période de 8 ans de juillet 2003 à juillet 2011. Résultats L’âge moyen de nos patients était de 25ans (16-70) avec une nette prédominance masculine (93.8%). Les plaies coliques secondaires à un traumatisme par arme blanche représentent 85% des cas (42 patients), suivi par les plaies iatrogènes au cours d'une coloscopie chez 6 patients (13%), puis les contusions abdominales chez 1 patient (2%). Les parties du cadre colique les plus touchées étaient le colon transverse chez 19 patients (38%) et le colon descendant chez 12 patients (24, 5%). Le colon sigmoïde était le segment le plus touché au cours d'une coloscopie4/6. Quarante-deux patients (85%) ont eu une suture primaire des plaies coliques, six patients (13%) une diversion fécale et un patient (2%) une résection-anastomose. Deux patients (4%) sont décédés suite à un choc septique. La morbidité globale était de 38,7% dominé essentiellement par l'infection de la paroi chez 14 patients et une péritonite post opératoire chez 3 patients. L'analyse univarié a montré une différence significatif en terme d'infection de la paroi entre le groupe colostomie versus suture simple (50% vs 20,9% p<0,05). L'atteinte du colon gauche et la réalisation d'une colostomie sont associés à un risque plus élevés de complications postopératoires. Conclusion La suture primaire peut être effectuée avec un faible taux de complications postopératoire chez la majorité des patients suite à un traumatisme du colon. PMID

  18. A newly discovered Bordetella species carries a transcriptionally active CRISPR-Cas with a small Cas9 endonuclease

    Science.gov (United States)

    The Cas9 endonuclease of the Type II-a clustered regularly interspersed short palindromic repeats (CRISPR), of Streptococcus pyogenes (SpCas9) has been adapted as a widely used tool for genome editing and genome engineering. Herein, we describe a gene encoding a novel Cas9 ortholog (BpsuCas9) and th...

  19. CLOSURE REPORT FOR CORRECTIVE ACTION UNIT 204: STORAGE BUNKERS, NEVADA TEST SITE, NEVADA

    International Nuclear Information System (INIS)

    2006-01-01

    Corrective Action Unit (CAU) 330 consists of four Corrective Action Sites (CASs) located in Areas 6, 22, and 23 of the Nevada Test Site (NTS). The unit is listed in the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO, 1996) as CAU 330: Areas 6, 22, and 23 Tanks and Spill Sites. CAU 330 consists of the following CASs: CAS 06-02-04, Underground Storage Tank (UST) and Piping CAS 22-99-06, Fuel Spill CAS 23-01-02, Large Aboveground Storage Tank (AST) Farm CAS 23-25-05, Asphalt Oil Spill/Tar Release

  20. 2010 Annual Summary Report for the Area 3 and Area 5 Radioactive Management Sites at the Nevada National Security Site, Nye County, Nevada

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    NSTec Environmental Management

    2011-03-01

    The U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office performed an annual review of the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Site (RWMS) Performance Assessments (PAs) and Composite Analyses (CAs) in fiscal year (FY) 2010. This annual summary report presents data and conclusions from the FY 2010 review, and determines the adequacy of the PAs and CAs. Operational factors (e.g., waste forms and containers, facility design, and waste receipts), closure plans, monitoring results, and research and development (R&D) activities were reviewed to determine the adequacy of the PAs. Likewise, the environmental restoration activities at the Nevada National Security Site (NNSS) (formerly the Nevada Test Site) relevant to the sources of residual radioactive material that are considered in the CAs, the land-use planning, and the results of the environmental monitoring and R&D activities were reviewed to determine the adequacy of the CAs.

  1. Information from the MEDICAL SERVICE

    CERN Document Server

    HR Department

    2008-01-01

    (The English version will be available next week). L’infirmerie du CERN (bâtiment 57-Rdc) est ouverte de 8h00 à 17h30, tous les jours ouvrables. La période de 12h30 à 13h30 est réservée uniquement aux urgences, afin de respecter un moment de pause pour les infirmières. Le service médical délivre des soins de premier secours et ne peut en aucun cas se substituer au médecin traitant. Une liste de médecins, dentistes et d’autres professionnels de santé du pays de Gex et de Meyrin est disponible sur la page web du service médical et mise à jour régulièrement : http://sc-me.web.cern.ch/sc-me/ En cas d’urgence sur le site du CERN, appeler en priorité le 74444.

  2. Construire les stratégies avec le Balanced Scorecard:vers une approche interactive du modèle de Kaplan et Norton

    OpenAIRE

    Gérald Naro; Denis Travaillé

    2010-01-01

    (VF)L’objectif de cet article est de confronter le Balanced Scorecard avec le modèle des leviers de contrôle de Simons (1995) et de discuter de son rôle dans les différentes phases du processus stratégique. Nous privilégions une représentation du BSC comme outil de contrôle interactif. Notre recherche est fondée sur une méthodologie longitudinale de type recherche action à partir de l’étude de deux cas. Les résultats montrent que le BSC crée un processus de construction collective favorisant ...

  3. A RecET-assisted CRISPR-Cas9 genome editing in Corynebacterium glutamicum.

    Science.gov (United States)

    Wang, Bo; Hu, Qitiao; Zhang, Yu; Shi, Ruilin; Chai, Xin; Liu, Zhe; Shang, Xiuling; Zhang, Yun; Wen, Tingyi

    2018-04-23

    Extensive modification of genome is an efficient manner to regulate the metabolic network for producing target metabolites or non-native products using Corynebacterium glutamicum as a cell factory. Genome editing approaches by means of homologous recombination and counter-selection markers are laborious and time consuming due to multiple round manipulations and low editing efficiencies. The current two-plasmid-based CRISPR-Cas9 editing methods generate false positives due to the potential instability of Cas9 on the plasmid, and require a high transformation efficiency for co-occurrence of two plasmids transformation. Here, we developed a RecET-assisted CRISPR-Cas9 genome editing method using a chromosome-borne Cas9-RecET and a single plasmid harboring sgRNA and repair templates. The inducible expression of chromosomal RecET promoted the frequencies of homologous recombination, and increased the efficiency for gene deletion. Due to the high transformation efficiency of a single plasmid, this method enabled 10- and 20-kb region deletion, 2.5-, 5.7- and 7.5-kb expression cassette insertion and precise site-specific mutation, suggesting a versatility of this method. Deletion of argR and farR regulators as well as site-directed mutation of argB and pgi genes generated the mutant capable of accumulating L-arginine, indicating the stability of chromosome-borne Cas9 for iterative genome editing. Using this method, the model-predicted target genes were modified to redirect metabolic flux towards 1,2-propanediol biosynthetic pathway. The final engineered strain produced 6.75 ± 0.46 g/L of 1,2-propanediol that is the highest titer reported in C. glutamicum. Furthermore, this method is available for Corynebacterium pekinense 1.563, suggesting its universal applicability in other Corynebacterium species. The RecET-assisted CRISPR-Cas9 genome editing method will facilitate engineering of metabolic networks for the synthesis of interested bio-based products from renewable

  4. Steamlined Approach for Environmental Restoration (SAFER) Plan For Corrective Action Unit 394: Areas 12, 18, and 29, Spill/Release Sites, Nevada Test Site, Nevada (November 2001, Rev. 0)

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Operations Office (NNSA/NV)

    2001-09-24

    This plan addresses the actions necessary for the characterization and closure of Corrective Action Unit (CAU) 394: Areas 12, 18, and 29, Spill/Release Sites, identified in the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO). The CAU, located on the Nevada Test Site, consists of six Corrective Action Sites (CASs): CAS 12-25-04, UST 12-16-2 Waste Oil Release; CAS 18-25-02, Oil Spills; CAS 18-25-02, Oil Spills; CAS 18-25-03, Oil Spill; CAS 18-25-04, Spill (Diesel Fuel); CAS 29-44-01, Fuel Spill (a & b). Process knowledge is the basis for the development of the conceptual site models (CSMs). The CSMs describe the most probable scenario for current conditions at each site, and define the assumptions that are the basis for the SAFER plan. The assumptions are formulated from historical information and process knowledge. Vertical migration of contaminant(s) of potential concern (COPCs) is expected to be predominant over lateral migration in the absence of any barrier (with asphalt /concrete being the exception at least two of the CASs). Soil is the impacted or potentially impacted media at all the sites, with asphalt and/or concrete potentially impacted at two of the CASs. Radionuclides are not expected at any CAS; hydrocarbons are the primary COPC at each CAS, and can be used to guide the investigation; future land-use scenarios limit use to various nonresidential uses; and exposure scenarios are limited by future land-use scenarios to site workers. There is sufficient information and process knowledge from historical documentation regarding the expected nature and extent of potential contaminants to recommend closure of CAU 394 using the SAFER process. On completion of the field activities, a Closure Report will be prepared and submitted to the NDEP for review and approval.

  5. [Detection of CRSPR-Cas system in Streptococcus thermophiles].

    Science.gov (United States)

    Li, Wan; Liang, Hongzhang; Zhang, Danqing; Wang, Nana; Tang, Yaru; Li, Bailiang; Huo, Guicheng

    2016-04-14

    We aimed to detect the CRSPR-Cas system of six Streptococcus thermophilus. Bioinformatics method was used to predict CRSPR-Cas system of nine S. thermophilus that published in National Center for Biotechnology Information. Four primers were designed according to the flanking sequences of standard strains and the CRISPR-Cas system of six S. thermophilus have been detected by PCR method. S. thermophilus S4 had a Cas9 gene, others all had Cas9 gene, Cas10 gene and Cas9* gene. In addition, 79 and KLDS3.0207 still had Cas3 gene. Signature genes amplification of CRSPR-Cas system could predict the type of CRSPR-Cas system in unsequenced strains, these findings will help establish the foundation for the study of CRSPR-Cas system in lactic acid bacteria.

  6. Mechanism of duplex DNA destabilization by RNA-guided Cas9 nuclease during target interrogation.

    Science.gov (United States)

    Mekler, Vladimir; Minakhin, Leonid; Severinov, Konstantin

    2017-05-23

    The prokaryotic clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated 9 (Cas9) endonuclease cleaves double-stranded DNA sequences specified by guide RNA molecules and flanked by a protospacer adjacent motif (PAM) and is widely used for genome editing in various organisms. The RNA-programmed Cas9 locates the target site by scanning genomic DNA. We sought to elucidate the mechanism of initial DNA interrogation steps that precede the pairing of target DNA with guide RNA. Using fluorometric and biochemical assays, we studied Cas9/guide RNA complexes with model DNA substrates that mimicked early intermediates on the pathway to the final Cas9/guide RNA-DNA complex. The results show that Cas9/guide RNA binding to PAM favors separation of a few PAM-proximal protospacer base pairs allowing initial target interrogation by guide RNA. The duplex destabilization is mediated, in part, by Cas9/guide RNA affinity for unpaired segments of nontarget strand DNA close to PAM. Furthermore, our data indicate that the entry of double-stranded DNA beyond a short threshold distance from PAM into the Cas9/single-guide RNA (sgRNA) interior is hindered. We suggest that the interactions unfavorable for duplex DNA binding promote DNA bending in the PAM-proximal region during early steps of Cas9/guide RNA-DNA complex formation, thus additionally destabilizing the protospacer duplex. The mechanism that emerges from our analysis explains how the Cas9/sgRNA complex is able to locate the correct target sequence efficiently while interrogating numerous nontarget sequences associated with correct PAMs.

  7. Second Line of Defense Virtual Private Network Guidance for Deployed and New CAS Systems

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Singh, Surya V.; Thronas, Aaron I.

    2010-01-01

    This paper discusses the importance of remote access via virtual private network (VPN) for the Second Line of Defense (SLD) Central Alarm System (CAS) sites, the requirements for maintaining secure channels while using VPN and implementation requirements for current and future sites.

  8. Building Cre Knockin Rat Lines Using CRISPR/Cas9.

    Science.gov (United States)

    Ma, Yuanwu; Zhang, Lianfeng; Huang, Xingxu

    2017-01-01

    Conditional gene inactivation strategy helps researchers to study the gene functions that are critical in embryogenesis or in defined tissues of adulthood. The Cre/loxP system is widely used for conditional gene inactivation/activation in cells or organisms. Cre knockin animal lines are essential for gene expression or inactivation in a spatially and temporally restricted manner. However, to generate a Cre knockin line by traditional approach is laborious. Recently, the clustered regularly interspaced short palindromic repeats and CRISPR-associated protein 9 (CRISPR/Cas9) has been proven as a simple and efficient genome-editing tool. We have used CRISPR/Cas9 system to generate rat strains that carry Cre genes in different targeted gene loci by direct delivery of gRNAs/Cas9/donors into fertilized eggs. Here, we described a stepwise procedure for the generation of Cre knockin rat, including target site selection, RNA preparation, the construction of the template donor, pronuclear injection, and the genotyping of precise Cre insertion in F 0 rats. Taken together, the establishment of Cre knockin line can be achieved within 6 weeks.

  9. Les conjonctivites néonatales dans le canton de Glidji au Sud du Togo: une étude transversale à propos de 159 nouveau-nés

    Science.gov (United States)

    Kokou, Vonor; Nidain, Maneh; Kassoula, Nononsaa Batomguela; Kwassi, Fiaty- Amenouvor; Meba, Banla; Patrice, Balo Komi

    2016-01-01

    Introduction Le but de l’étude était décrire les aspects épidémiologiques des conjonctivites néonatales dans le canton de Glidji au Sud du Togo. Methodes Nous avons mené une étude transversale dans les 4 Unités Sanitaires Périphériques du canton de Glidji du 19 Mars au 13 Mai 2009 soit 8 semaines. Tous les nouveau-nés ont été inclus et la conjonctivite néonatale était définie par la présence chez un nouveau-né d'au moins deux des signes suivants: hyperhémie conjonctivale, œdème palpébral, chémosis, sécrétions purulentes, larmoiement. Les paramètres étudiés étaient l’âge, le sexe, les facteurs de risque, les antécédents, la présence ou non de conjonctivite, les germes en causes et l’évolution sous traitement. Resultats Sur la période, 159 nouveau-nés ont été examinés. L’âge moyen était de 10,9 jours avec des extrêmes de 0 à 28 jours. Il y avait 80 garçons pour 79 filles soit un sex-ratio de 1,01. Sur les 159 nouveau-nés, 7 cas de conjonctivite ont été diagnostiqués soit une prévalence de 4,4%. Les facteurs de risque identifiés étaient l'accouchement par voie basse et la présence d'IST chez la mère pendant la grossesse. Sur les 7 cas de conjonctivite, l'examen cytobactériologique a permis d'isoler le staphylococcus aureus dans 2 cas. L’évolution des cas de conjonctivite sous traitement était favorable avec régression des signes dès le 3è jour. Conclusion Les conjonctivites néonatales avaient une prévalence de 4,4% dans le canton de Glidji au sud du Togo et le staphylocoque doré était le germe en cause. Leur prévention passe par un bon suivi lors de la consultation prénatale et l'instillation de collyre antibiotique à la naissance PMID:27642383

  10. Recherche d'une détente dans le dossier du piratage des médias ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

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  11. Résultats de recherche | Page 79 | CRDI - Centre de recherches ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    Gestion et valorisation des déchets d'équipements électroniques et informatiques en Afrique de l'Ouest (cas du Bénin, du Mali et du Sénégal) : rapport sur le cas du Bénin, 2007-2010. Published date. 1 janvier 2010. Rapports. MALI ...

  12. A newly discovered Bordetella species carries a transcriptionally active CRISPR-Cas with a small Cas9 endonuclease.

    Science.gov (United States)

    Ivanov, Yury V; Shariat, Nikki; Register, Karen B; Linz, Bodo; Rivera, Israel; Hu, Kai; Dudley, Edward G; Harvill, Eric T

    2015-10-26

    Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) and CRISPR-associated genes (cas) are widely distributed among bacteria. These systems provide adaptive immunity against mobile genetic elements specified by the spacer sequences stored within the CRISPR. The CRISPR-Cas system has been identified using Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) against other sequenced and annotated genomes and confirmed via CRISPRfinder program. Using Polymerase Chain Reactions (PCR) and Sanger DNA sequencing, we discovered CRISPRs in additional bacterial isolates of the same species of Bordetella. Transcriptional activity and processing of the CRISPR have been assessed via RT-PCR. Here we describe a novel Type II-C CRISPR and its associated genes-cas1, cas2, and cas9-in several isolates of a newly discovered Bordetella species. The CRISPR-cas locus, which is absent in all other Bordetella species, has a significantly lower GC-content than the genome-wide average, suggesting acquisition of this locus via horizontal gene transfer from a currently unknown source. The CRISPR array is transcribed and processed into mature CRISPR RNAs (crRNA), some of which have homology to prophages found in closely related species B. hinzii. Expression of the CRISPR-Cas system and processing of crRNAs with perfect homology to prophages present in closely related species, but absent in that containing this CRISPR-Cas system, suggest it provides protection against phage predation. The 3,117-bp cas9 endonuclease gene from this novel CRISPR-Cas system is 990 bp smaller than that of Streptococcus pyogenes, the 4,017-bp allele currently used for genome editing, and which may make it a useful tool in various CRISPR-Cas technologies.

  13. Financiarisation de la gestion et concentration des risques : une étude de cas d'un gestionnaire de fonds public

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Frédéric Hanin

    2012-05-01

    Full Text Available Cet article propose une analyse de la financiarisation de la gestion à partir de l’étude du cas de la principale institution financière publique au Canada, la Caisse de Dépôt et Placement du Québec. Cette évolution de la gestion est documentée ici à travers deux éléments. Le premier élément est le modèle d'affaire mis de l'avant par l'institution avec l'arrivée d'un nouveau PDG en 2002 qui repose sur une nouvelle interprétation du mandat de l'institution et de sa responsabilité sociétale. Le second élément est la réforme de l'organisation interne de la Caisse avec l'adoption d'un modèle organisationnel de conglomérat financier basé sur l'utilisation indirecte des produits dérivés ou indirect à travers des produits structurés. Cette étude de cas permet également d’analyser les transformations récentes des modes de gouvernance dans les institutions financières.This article proposes an analysis of the financialization of public pension’s asset managers through the case study of the most important one in Canada. The 2008 fallout is the result of structural changes in the regulation and management of the organization. Two elements are here at the core of financialization. First, the new business model was built on a different analysis of the mission of the institution. Second, the creation of "value added" was expected by the use of interactions between portfolios, facilitated by the development of derivatives and structured financial products. This case study is also interesting to analyze the transformation of the governance structure in the financial sector.

  14. Breaking-Cas—interactive design of guide RNAs for CRISPR-Cas experiments for ENSEMBL genomes

    Science.gov (United States)

    Oliveros, Juan C.; Franch, Mònica; Tabas-Madrid, Daniel; San-León, David; Montoliu, Lluis; Cubas, Pilar; Pazos, Florencio

    2016-01-01

    The CRISPR/Cas technology is enabling targeted genome editing in multiple organisms with unprecedented accuracy and specificity by using RNA-guided nucleases. A critical point when planning a CRISPR/Cas experiment is the design of the guide RNA (gRNA), which directs the nuclease and associated machinery to the desired genomic location. This gRNA has to fulfil the requirements of the nuclease and lack homology with other genome sites that could lead to off-target effects. Here we introduce the Breaking-Cas system for the design of gRNAs for CRISPR/Cas experiments, including those based in the Cas9 nuclease as well as others recently introduced. The server has unique features not available in other tools, including the possibility of using all eukaryotic genomes available in ENSEMBL (currently around 700), placing variable PAM sequences at 5′ or 3′ and setting the guide RNA length and the scores per nucleotides. It can be freely accessed at: http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/breakingcas, and the code is available upon request. PMID:27166368

  15. Steamlined Approach for Environmental Restoration (SAFER) Plan For Corrective Action Unit 394: Areas 12, 18, and 29, Spill/Release Sites, Nevada Test Site, Nevada (November 2001, Rev. 0); FINAL

    International Nuclear Information System (INIS)

    2001-01-01

    This plan addresses the actions necessary for the characterization and closure of Corrective Action Unit (CAU) 394: Areas 12, 18, and 29, Spill/Release Sites, identified in the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO). The CAU, located on the Nevada Test Site, consists of six Corrective Action Sites (CASs): CAS 12-25-04, UST 12-16-2 Waste Oil Release; CAS 18-25-02, Oil Spills; CAS 18-25-02, Oil Spills; CAS 18-25-03, Oil Spill; CAS 18-25-04, Spill (Diesel Fuel); CAS 29-44-01, Fuel Spill (a and b). Process knowledge is the basis for the development of the conceptual site models (CSMs). The CSMs describe the most probable scenario for current conditions at each site, and define the assumptions that are the basis for the SAFER plan. The assumptions are formulated from historical information and process knowledge. Vertical migration of contaminant(s) of potential concern (COPCs) is expected to be predominant over lateral migration in the absence of any barrier (with asphalt /concrete being the exception at least two of the CASs). Soil is the impacted or potentially impacted media at all the sites, with asphalt and/or concrete potentially impacted at two of the CASs. Radionuclides are not expected at any CAS; hydrocarbons are the primary COPC at each CAS, and can be used to guide the investigation; future land-use scenarios limit use to various nonresidential uses; and exposure scenarios are limited by future land-use scenarios to site workers. There is sufficient information and process knowledge from historical documentation regarding the expected nature and extent of potential contaminants to recommend closure of CAU 394 using the SAFER process. On completion of the field activities, a Closure Report will be prepared and submitted to the NDEP for review and approval

  16. A Broad-Spectrum Inhibitor of CRISPR-Cas9.

    Science.gov (United States)

    Harrington, Lucas B; Doxzen, Kevin W; Ma, Enbo; Liu, Jun-Jie; Knott, Gavin J; Edraki, Alireza; Garcia, Bianca; Amrani, Nadia; Chen, Janice S; Cofsky, Joshua C; Kranzusch, Philip J; Sontheimer, Erik J; Davidson, Alan R; Maxwell, Karen L; Doudna, Jennifer A

    2017-09-07

    CRISPR-Cas9 proteins function within bacterial immune systems to target and destroy invasive DNA and have been harnessed as a robust technology for genome editing. Small bacteriophage-encoded anti-CRISPR proteins (Acrs) can inactivate Cas9, providing an efficient off switch for Cas9-based applications. Here, we show that two Acrs, AcrIIC1 and AcrIIC3, inhibit Cas9 by distinct strategies. AcrIIC1 is a broad-spectrum Cas9 inhibitor that prevents DNA cutting by multiple divergent Cas9 orthologs through direct binding to the conserved HNH catalytic domain of Cas9. A crystal structure of an AcrIIC1-Cas9 HNH domain complex shows how AcrIIC1 traps Cas9 in a DNA-bound but catalytically inactive state. By contrast, AcrIIC3 blocks activity of a single Cas9 ortholog and induces Cas9 dimerization while preventing binding to the target DNA. These two orthogonal mechanisms allow for separate control of Cas9 target binding and cleavage and suggest applications to allow DNA binding while preventing DNA cutting by Cas9. Copyright © 2017 Elsevier Inc. All rights reserved.

  17. Annotation and Classification of CRISPR-Cas Systems.

    Science.gov (United States)

    Makarova, Kira S; Koonin, Eugene V

    2015-01-01

    The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-Cas (CRISPR-associated proteins) is a prokaryotic adaptive immune system that is represented in most archaea and many bacteria. Among the currently known prokaryotic defense systems, the CRISPR-Cas genomic loci show unprecedented complexity and diversity. Classification of CRISPR-Cas variants that would capture their evolutionary relationships to the maximum possible extent is essential for comparative genomic and functional characterization of this theoretically and practically important system of adaptive immunity. To this end, a multipronged approach has been developed that combines phylogenetic analysis of the conserved Cas proteins with comparison of gene repertoires and arrangements in CRISPR-Cas loci. This approach led to the current classification of CRISPR-Cas systems into three distinct types and ten subtypes for each of which signature genes have been identified. Comparative genomic analysis of the CRISPR-Cas systems in new archaeal and bacterial genomes performed over the 3 years elapsed since the development of this classification makes it clear that new types and subtypes of CRISPR-Cas need to be introduced. Moreover, this classification system captures only part of the complexity of CRISPR-Cas organization and evolution, due to the intrinsic modularity and evolutionary mobility of these immunity systems, resulting in numerous recombinant variants. Moreover, most of the cas genes evolve rapidly, complicating the family assignment for many Cas proteins and the use of family profiles for the recognition of CRISPR-Cas subtype signatures. Further progress in the comparative analysis of CRISPR-Cas systems requires integration of the most sensitive sequence comparison tools, protein structure comparison, and refined approaches for comparison of gene neighborhoods.

  18. Annotation and Classification of CRISPR-Cas Systems

    Science.gov (United States)

    Makarova, Kira S.; Koonin, Eugene V.

    2018-01-01

    The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-Cas (CRISPR-associated proteins) is a prokaryotic adaptive immune system that is represented in most archaea and many bacteria. Among the currently known prokaryotic defense systems, the CRISPR-Cas genomic loci show unprecedented complexity and diversity. Classification of CRISPR-Cas variants that would capture their evolutionary relationships to the maximum possible extent is essential for comparative genomic and functional characterization of this theoretically and practically important system of adaptive immunity. To this end, a multipronged approach has been developed that combines phylogenetic analysis of the conserved Cas proteins with comparison of gene repertoires and arrangements in CRISPR-Cas loci. This approach led to the current classification of CRISPR-Cas systems into three distinct types and ten subtypes for each of which signature genes have been identified. Comparative genomic analysis of the CRISPR-Cas systems in new archaeal and bacterial genomes performed over the 3 years elapsed since the development of this classification makes it clear that new types and subtypes of CRISPR-Cas need to be introduced. Moreover, this classification system captures only part of the complexity of CRISPR-Cas organization and evolution, due to the intrinsic modularity and evolutionary mobility of these immunity systems, resulting in numerous recombinant variants. Moreover, most of the cas genes evolve rapidly, complicating the family assignment for many Cas proteins and the use of family profiles for the recognition of CRISPR-Cas subtype signatures. Further progress in the comparative analysis of CRISPR-Cas systems requires integration of the most sensitive sequence comparison tools, protein structure comparison, and refined approaches for comparison of gene neighborhoods. PMID:25981466

  19. Asie du sud | Page 58 | CRDI - Centre de recherches pour le ...

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  3. Les tumeurs malignes naso-sinusiennes: à propos de 32 cas et revues de la littérature

    Science.gov (United States)

    Darouassi, Youssef; Touati, Mohamed Mliha; Chihani, Mehdi; El Alami, Jihane; Bouaity, Brahim; Ammar, Haddou

    2015-01-01

    Sous l’appellation tumeurs malignes naso-sinusiennes est regroupé un vaste éventail de tumeurs, aux histologies et localisations variées, mais aux tableaux cliniques souvent similaires. Le diagnostic de ces tumeurs est difficile, nécessitant une approche multidisciplinaire, à savoir oto-rhino-laryngologique, radiologique et anatomopathologique. Notre étude rétrospective concerne 32 cas de tumeurs malignes naso-sinusiennes, colligées au service d’ORL de l’hôpital militaire Avicenne de Marrakech, entre Janvier 2004 et Décembre 2014. L’analyse des données a noté que la fréquence des tumeurs épithéliales (75% des cas) était supérieure à celle des tumeurs non épithéliales (25% des cas), avec en tête de file l’adénocarcinome de l’ethmoïde (31,25%) et le carcinome épidermoïde du sinus maxillaire (18,75%). Ces tumeurs surviennent le plus souvent chez le sujet âgé avec une moyenne d’âge de 52 ans et une répartition équitable entre les deux sexes. Le délai de consultation moyen était de 12 mois avec une symptomatologie dominée par un syndrome nasosinusien (71,8%), associé dans certains cas à des signes ophtalmologiques (12,5%) ou neurologiques (15,6%). Tous nos patients ont bénéficié d’un examen clinique notamment endoscopique, d’une exploration radiologique des tumeurs et de leurs extensions, et d’une confirmation diagnostique par un examen anatomopathologique. Le traitement a consisté en une exérèse chirurgicale de la tumeur dès que cela était possible, soit dans 81,3% des cas (26 patients), généralement complété par un traitement adjuvant radio-chimiothérapique (77%). Le suivi à un an de nos patients a permis de noter une bonne évolution pour 08 d’entre eux (25%), une récidive dans 6 cas (18,75%), le décès de neuf patients (28,1%), et l’absence d’information concernant les autres cas (28,1%). PMID:26985260

  4. CRISPR-Cas: Adapting to change.

    Science.gov (United States)

    Jackson, Simon A; McKenzie, Rebecca E; Fagerlund, Robert D; Kieper, Sebastian N; Fineran, Peter C; Brouns, Stan J J

    2017-04-07

    Bacteria and archaea are engaged in a constant arms race to defend against the ever-present threats of viruses and invasion by mobile genetic elements. The most flexible weapons in the prokaryotic defense arsenal are the CRISPR-Cas adaptive immune systems. These systems are capable of selective identification and neutralization of foreign DNA and/or RNA. CRISPR-Cas systems rely on stored genetic memories to facilitate target recognition. Thus, to keep pace with a changing pool of hostile invaders, the CRISPR memory banks must be regularly updated with new information through a process termed CRISPR adaptation. In this Review, we outline the recent advances in our understanding of the molecular mechanisms governing CRISPR adaptation. Specifically, the conserved protein machinery Cas1-Cas2 is the cornerstone of adaptive immunity in a range of diverse CRISPR-Cas systems. Copyright © 2017, American Association for the Advancement of Science.

  5. Marché du carbone et solutions de gestion intégrée des déchets ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    Marché du carbone et solutions de gestion intégrée des déchets : étude de cas menée en Indonésie. Le Mécanisme de développement propre (MDP) prévu au Protocole de Kyoto signé en 1997 a le double objectif d'aider les pays en développement à connaître un développement durable (tel que défini par chaque pays) ...

  6. Coalition Battle Management Language (C-BML) (Language de gestion du champ de bataille (C-BML)

    Science.gov (United States)

    2012-02-01

    concernent certains Panels, vous pouvez demander d’être inclus soit à titre personnel, soit au nom de votre organisation, sur la liste d’envoi. Les ...AGARD doivent comporter la dénomination « RTO » ou « AGARD » selon le cas, suivi du numéro de série. Des informations analogues, telles que le titre est...Opérations SICF Système d’Information pour le Commandement des Forces SIMBAD Command Post Simulator from Battalion to Platoon SISO Simulation

  7. Amélioration des tribunaux du travail au Mexique : le cas de Cuautitlán

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    Ce projet de recherche dirigé par l'Instituto Tecnológico de México s'intéressera au contexte juridique du pays et aux procédures administratives liées aux décisions et aux ... Monitoring and notification : evidence from a field experiment in a Mexican labor court ... Delay and corruption : a simple model with empirical tests.

  8. COMMUNICATION DU CREDIT AGRICOLE - French version only

    CERN Multimedia

    2003-01-01

    La Direction du Crédit Agricole informe son aimable clientèle du CERN des jours et heures d'ouverture de l'agence du site de Prévessin à compter du mardi 14 janvier 2003 : 1. Horaires pour les opérations bancaires courantes 7 jours sur 7 et 24h/24 avec l'espace libre service bancaire. 2. Horaires conseil du mardi au vendredi - Mardi, de 9h. à 12h. et de 14h.15 à 16h.30. - Mercredi, jeudi et vendredi, de 9h. à 12h. et de 13h.30 à 16h.30. Deux collaboratrices au lieu d'une seront désormais présentes toute la journée du mardi au vendredi pour vous accueillir, vous informer et vous conseiller en crédits et placements (réception conseil sur rendez-vous). Autre nouveauté : les mêmes conseillers seront aussi à votre disposition le samedi, sur notre agence de Gex, de 8h.15 à 13h.05, notamment pour les études de financements habitat. La Direction et toute l'équipe de l'agence du Crédit Agricole vous souhaitent une excellent année 2003.

  9. New CRISPR-Cas systems from uncultivated microbes

    Science.gov (United States)

    Burstein, David; Harrington, Lucas B.; Strutt, Steven C.; Probst, Alexander J.; Anantharaman, Karthik; Thomas, Brian C.; Doudna, Jennifer A.; Banfield, Jillian F.

    2017-02-01

    CRISPR-Cas systems provide microbes with adaptive immunity by employing short DNA sequences, termed spacers, that guide Cas proteins to cleave foreign DNA. Class 2 CRISPR-Cas systems are streamlined versions, in which a single RNA-bound Cas protein recognizes and cleaves target sequences. The programmable nature of these minimal systems has enabled researchers to repurpose them into a versatile technology that is broadly revolutionizing biological and clinical research. However, current CRISPR-Cas technologies are based solely on systems from isolated bacteria, leaving the vast majority of enzymes from organisms that have not been cultured untapped. Metagenomics, the sequencing of DNA extracted directly from natural microbial communities, provides access to the genetic material of a huge array of uncultivated organisms. Here, using genome-resolved metagenomics, we identify a number of CRISPR-Cas systems, including the first reported Cas9 in the archaeal domain of life, to our knowledge. This divergent Cas9 protein was found in little-studied nanoarchaea as part of an active CRISPR-Cas system. In bacteria, we discovered two previously unknown systems, CRISPR-CasX and CRISPR-CasY, which are among the most compact systems yet discovered. Notably, all required functional components were identified by metagenomics, enabling validation of robust in vivo RNA-guided DNA interference activity in Escherichia coli. Interrogation of environmental microbial communities combined with in vivo experiments allows us to access an unprecedented diversity of genomes, the content of which will expand the repertoire of microbe-based biotechnologies.

  10. 2010 Annual Summary Report for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada National Security Site, Nye County, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    2011-01-01

    The U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office performed an annual review of the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Site (RWMS) Performance Assessments (PAs) and Composite Analyses (CAs) in fiscal year (FY) 2010. This annual summary report presents data and conclusions from the FY 2010 review, and determines the adequacy of the PAs and CAs. Operational factors (e.g., waste forms and containers, facility design, and waste receipts), closure plans, monitoring results, and research and development (R and D) activities were reviewed to determine the adequacy of the PAs. Likewise, the environmental restoration activities at the Nevada National Security Site (NNSS) (formerly the Nevada Test Site) relevant to the sources of residual radioactive material that are considered in the CAs, the land-use planning, and the results of the environmental monitoring and R and D activities were reviewed to determine the adequacy of the CAs.

  11. Mobile Genetic Elements and Evolution of CRISPR-Cas Systems: All the Way There and Back

    Science.gov (United States)

    Makarova, Kira S.

    2017-01-01

    Abstract The Clustered Regularly Interspaced Palindromic Repeats (CRISPR)-CRISPR-associated proteins (Cas) systems of bacterial and archaeal adaptive immunity show multifaceted evolutionary relationships with at least five classes of mobile genetic elements (MGE). First, the adaptation module of CRISPR-Cas that is responsible for the formation of the immune memory apparently evolved from a Casposon, a self-synthesizing transposon that employs the Cas1 protein as the integrase and might have brought additional cas genes to the emerging immunity loci. Second, a large subset of type III CRISPR-Cas systems recruited a reverse transcriptase from a Group II intron, providing for spacer acquisition from RNA. Third, effector nucleases of Class 2 CRISPR-Cas systems that are responsible for the recognition and cleavage of the target DNA were derived from transposon-encoded TnpB nucleases, most likely, on several independent occasions. Fourth, accessory nucleases in some variants of types I and III toxin and type VI effectors RNases appear to be ultimately derived from toxin nucleases of microbial toxin–antitoxin modules. Fifth, the opposite direction of evolution is manifested in the recruitment of CRISPR-Cas systems by a distinct family of Tn7-like transposons that probably exploit the capacity of CRISPR-Cas to recognize unique DNA sites to facilitate transposition as well as by bacteriophages that employ them to cope with host defense. Additionally, individual Cas proteins, such as the Cas4 nuclease, were recruited by bacteriophages and transposons. The two-sided evolutionary connection between CRISPR-Cas and MGE fits the “guns for hire” paradigm whereby homologous enzymatic machineries, in particular nucleases, are shuttled between MGE and defense systems and are used alternately as means of offense or defense. PMID:28985291

  12. Descriptions énonciative, informationnelle et argumentative : aspects discursifs sur quelques cas de figure

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Forsgren Mats

    2012-07-01

    Full Text Available Les recherches sur l’énonciation, en l’occurrence celles appartenant au courant Ducrot, à l’école dit de Genève comme à l’école dite scandinave (portant le sigle « Scapoline », pour n’en mentionner que quelques-unes, donnent depuis quelques décennies de remarquables résultats portant sur la dimension polyphonique et argumentative du langage, sur le jeu discursif des points de vue et des êtres discursifs, de la prise en charge énonciative et du statut assertif (assertion/présupposition/supposition, comme sur le fonctionnement des différents types de marqueurs dits « discursifs ». La contribution de Henning Nølke, donnée lors du CMLF organisé en 2008 à Paris, brosse brillamment l’historique et l’élaboration ultérieure de ce courant. Nul doute que les résultats de bon nombre de ces recherches appartiendront dorénavant aux acquis descriptifs de notre science, qu’il s’agisse du discours rapporté, de la négation, des marqueurs de par exemple la concession ou la causalité. Cependant, il me semble que cette théorisation énonciative, pour heuristiquement valable qu’elle soit – ce qui est indéniable– rencontre parfois des problèmes lorsqu’elle est confrontée avec d’autres dimensions de la description du sens discursif, et testée dans «... le patient travail de confrontation minutieuse des outils avec le réel (en l’occurrence les textes dont ils sont censés rendre compte » (Alain Rabatel, 2010 : 109. C’est pourquoi dans cette communication j’aimerais discuter, à partir d’une enquête portant sur la distribution des marqueurs causaux dans plusieurs genres discursifs, deux problèmes de l’approche énonciative : sa rencontre avec la structure dite informationnelle et la prise en charge énonciative dans un cas bien précis, notamment certaines structures appositives.

  13. Cirque du Monde en tant qu’intervention en santé

    Science.gov (United States)

    Fournier, Cynthia; Drouin, Mélodie-Anne; Marcoux, Jérémie; Garel, Patricia; Bochud, Emmanuel; Théberge, Julie; Aubertin, Patrice; Favreau, Gil; Fleet, Richard

    2014-01-01

    Résumé Objectif Présenter le programme Cirque du Monde du Cirque du Soleil et son potentiel en tant qu’intervention en soins de santé de première ligne pour les médecins de famille. Sources des données Une revue de la littérature menée dans les bases de données PubMed, Cochrane Library, PsycINFO, La Presse, Eureka, Google Scholar et Érudit à l’aide des mots-clés circus, social circus, Cirque du Monde et Cirque du Soleil. Une initiative à Montréal nommée Espace Transition qui s’inspire directement de Cirque du Monde. Communication personnelle avec le conseiller principal en formation en cirque social du Cirque du Soleil. Sélection d’études Les 50 premiers articles ou sites Internet répertoriés pour chaque mot-clé dans chacune des bases de données ciblées ont été révisés sur la base des titres et des résumés, s’il s’agissait d’un article, ou sur la base du titre et du contenu de la page, s’il s’agissait d’une page Internet. Ensuite, les articles et les sites Internet qui étudiaient un aspect du cirque social ou qui présentaient une intervention impliquant le cirque étaient retenus pour une révision. Aucune contrainte d’année de publication n’a été appliquée étant donné qu’on cherchait une littérature générale sur le cirque social. Synthèse Aucun article n’a été trouvé sur le cirque social en tant qu’intervention en santé. Nous avons trouvé une étude sur l’utilisation du cirque en tant qu’intervention en milieu scolaire. Cette étude a démontré une augmentation de l’estime personnelle des enfants grâce à l’intervention. Nous avons trouvé une étude sur l’utilisation du cirque en tant qu’intervention sur une réserve amérindienne. Cette étude présente des résultats qualitatifs non spécifiques au programme du cirque social. Les autres articles répertoriés n’étaient que des descriptions du cirque social. Un site web concernant l’utilisation du cirque social pour

  14. Naturally Occurring Off-Switches for CRISPR-Cas9.

    Science.gov (United States)

    Pawluk, April; Amrani, Nadia; Zhang, Yan; Garcia, Bianca; Hidalgo-Reyes, Yurima; Lee, Jooyoung; Edraki, Alireza; Shah, Megha; Sontheimer, Erik J; Maxwell, Karen L; Davidson, Alan R

    2016-12-15

    CRISPR-Cas9 technology would be enhanced by the ability to inhibit Cas9 function spatially, temporally, or conditionally. Previously, we discovered small proteins encoded by bacteriophages that inhibit the CRISPR-Cas systems of their host bacteria. These "anti-CRISPRs" were specific to type I CRISPR-Cas systems that do not employ the Cas9 protein. We posited that nature would also yield Cas9 inhibitors in response to the evolutionary arms race between bacteriophages and their hosts. Here, we report the discovery of three distinct families of anti-CRISPRs that specifically inhibit the CRISPR-Cas9 system of Neisseria meningitidis. We show that these proteins bind directly to N. meningitidis Cas9 (NmeCas9) and can be used as potent inhibitors of genome editing by this system in human cells. These anti-CRISPR proteins now enable "off-switches" for CRISPR-Cas9 activity and provide a genetically encodable means to inhibit CRISPR-Cas9 genome editing in eukaryotes. VIDEO ABSTRACT. Copyright © 2016 Elsevier Inc. All rights reserved.

  15. Site-Directed Genome Knockout in Chicken Cell Line and Embryos Can Use CRISPR/Cas Gene Editing Technology

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Qisheng Zuo

    2016-06-01

    Full Text Available The present study established an efficient genome editing approach for the construction of stable transgenic cell lines of the domestic chicken (Gallus gallus domesticus. Our objectives were to facilitate the breeding of high-yield, high-quality chicken strains, and to investigate gene function in chicken stem cells. Three guide RNA (gRNAs were designed to knockout the C2EIP gene, and knockout efficiency was evaluated in DF-1 chicken fibroblasts and chicken ESCs using the luciferase single-strand annealing (SSA recombination assay, T7 endonuclease I (T7EI assay, and TA clone sequencing. In addition, the polyethylenimine-encapsulated Cas9/gRNA plasmid was injected into fresh fertilized eggs. At 4.5 d later, frozen sections of the embryos were prepared, and knockout efficiency was evaluated by the T7EI assay. SSA assay results showed that luciferase activity of the vector expressing gRNA-3 was double that of the control. Results of the T7EI assay and TA clone sequencing indicated that Cas9/gRNA vector-mediated gene knockdown efficiency was approximately 27% in both DF-1 cells and ESCs. The CRISPR/Cas9 vector was also expressed in chicken embryos, resulting in gene knockdown in three of the 20 embryos (gene knockdown efficiency 15%. Taken together, our results indicate that the CRISPR/Cas9 system can mediate stable gene knockdown at the cell and embryo levels in domestic chickens.

  16. Somatic cell nuclear transfer followed by CRIPSR/CAS9 microinjection results in highly efficient genome editing in cloned pigs

    Science.gov (United States)

    The domestic pig is an ideal “dual purpose” animal model for agricultural and biomedical research. With the availability of genome editing tools [e.g. clustered regularly interspersed short palindromic repeat (CRISPR) and associated nuclease Cas9 (CRISPR/Cas9)] it is now possible to perform site-sp...

  17. Closure Report for Corrective Action Unit 134: Aboveground Storage Tanks, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    2009-01-01

    Corrective Action Unit (CAU) 134 is identified in the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO) as 'Aboveground Storage Tanks' and consists of the following four Corrective Action Sites (CASs), located in Areas 3, 15, and 29 of the Nevada Test Site: (1) CAS 03-01-03, Aboveground Storage Tank; (2) CAS 03-01-04, Tank; (3) CAS 15-01-05, Aboveground Storage Tank; and (4) CAS 29-01-01, Hydrocarbon Stain

  18. Frontières administratives et identités communales. Le cas de la France, XVIII-XXe siècles

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Claude Motte

    2009-01-01

    Full Text Available Parmi les différentes déclinaisons du terme "frontière" (naturelle, politique, administrative, identitaire, existe-t-il une combinaison d'entre elles qui résisterait le plus farouchement à l'épreuve du temps? Le cas de la France qui, au sein de l'Europe, connaît une exception administrative particulière, est intéressant à observer. Ses nombreuses frontières intérieures ont repoussé avec obstination toute tentative de réduction de leur nombre. Sans doute parce que, laissée à l'initiative des populations locales et respectée par les successifs gouvernements, la définition des territoires s'est appuyée sur la reconnaissance des identités communales construites au cours des siècles par le quotidien des habitants. La correspondance cartographique établie entre le tissu paroissial du XVIIIe siècle en France, et le maillage communal d'aujourd'hui illustre, en dépit des quelques variations observées, la remarquable stabilité de ses frontières administratives.

  19. Use of the CRISPR/Cas9 system as an intracellular defense against HIV-1 infection in human cells.

    Science.gov (United States)

    Liao, Hsin-Kai; Gu, Ying; Diaz, Arturo; Marlett, John; Takahashi, Yuta; Li, Mo; Suzuki, Keiichiro; Xu, Ruo; Hishida, Tomoaki; Chang, Chan-Jung; Esteban, Concepcion Rodriguez; Young, John; Izpisua Belmonte, Juan Carlos

    2015-03-10

    To combat hostile viruses, bacteria and archaea have evolved a unique antiviral defense system composed of clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPRs), together with CRISPR-associated genes (Cas). The CRISPR/Cas9 system develops an adaptive immune resistance to foreign plasmids and viruses by creating site-specific DNA double-stranded breaks (DSBs). Here we adapt the CRISPR/Cas9 system to human cells for intracellular defense against foreign DNA and viruses. Using HIV-1 infection as a model, our results demonstrate that the CRISPR/Cas9 system disrupts latently integrated viral genome and provides long-term adaptive defense against new viral infection, expression and replication in human cells. We show that engineered human-induced pluripotent stem cells stably expressing HIV-targeted CRISPR/Cas9 can be efficiently differentiated into HIV reservoir cell types and maintain their resistance to HIV-1 challenge. These results unveil the potential of the CRISPR/Cas9 system as a new therapeutic strategy against viral infections.

  20. Streamlined Approach for Environmental Restoration Plan for Corrective Action Unit 398: Area 25 Spill Sites, Nevada Test Site, Nevada; TOPICAL

    International Nuclear Information System (INIS)

    K. B. Campbell

    2001-01-01

    This Streamlined Approach for Environmental Restoration (SAFER) plan addresses the activities necessary to close Corrective Action Unit (CAU) 398: Area 25 Spill Sites. CAU 398, located in Area 25 of the Nevada Test Site, is currently listed in Appendix III of the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO) (FFACO, 1996), and consists of the following 13 Corrective Action Sites (CASs) (Figure 1): (1) CAS 25-44-01 , a fuel spill on soil that covers a concrete pad. The origins and use of the spill material are unknown, but the spill is suspected to be railroad bedding material. (2) CAS 25-44-02, a spill of liquid to the soil from leaking drums. (3) CAS 25-44-03, a spill of oil from two leaking drums onto a concrete pad and surrounding soil. (4) CAS 25-44-04, a spill from two tanks containing sulfuric acid and sodium hydroxide used for a water demineralization process. (5) CAS 25-25-02, a fuel or oil spill from leaking drums that were removed in 1992. (6) CAS 25-25-03, an oil spill adjacent to a tipped-over drum. The source of the drum is not listed, although it is noted that the drum was removed in 1991. (7) CAS 25-25-04, an area on the north side of the Engine-Maintenance, Assembly, and Disassembly (E-MAD) facility, where oils and cooling fluids from metal machining operations were poured directly onto the ground. (8) CAS 25-25-05, an area of oil and/or hydraulic fluid spills beneath the heavy equipment once stored there. (9) CAS 25-25-06, an area of diesel fuel staining beneath two generators that have since been removed. (10) CAS 25-25-07, an area of hydraulic oil spills associated with a tunnel-boring machine abandoned inside X-Tunnel. (11) CAS 25-25-08, an area of hydraulic fluid spills associated with a tunnel-boring machine abandoned inside Y-Tunnel. (12) CAS 25-25-16, a diesel fuel spill from an above-ground storage tank located near Building 3320 at Engine Test Stand-1 (ETS-1) that was removed in 1998. (13) CAS 25-25-17, a hydraulic oil spill

  1. Assembly and Multiplex Genome Integration of Metabolic Pathways in Yeast Using CasEMBLR

    DEFF Research Database (Denmark)

    Jakočiūnas, Tadas; Jensen, Emil D.; Jensen, Michael Krogh

    2018-01-01

    and marker-free integration of the carotenoid pathway from 15 exogenously supplied DNA parts into three targeted genomic loci. As a second proof-of-principle, a total of ten DNA parts were assembled and integrated in two genomic loci to construct a tyrosine production strain, and at the same time knocking......Genome integration is a vital step for implementing large biochemical pathways to build a stable microbial cell factory. Although traditional strain construction strategies are well established for the model organism Saccharomyces cerevisiae, recent advances in CRISPR/Cas9-mediated genome...... engineering allow much higher throughput and robustness in terms of strain construction. In this chapter, we describe CasEMBLR, a highly efficient and marker-free genome engineering method for one-step integration of in vivo assembled expression cassettes in multiple genomic sites simultaneously. Cas...

  2. CRISPR/Cas9 gene drives in genetically variable and nonrandomly mating wild populations.

    Science.gov (United States)

    Drury, Douglas W; Dapper, Amy L; Siniard, Dylan J; Zentner, Gabriel E; Wade, Michael J

    2017-05-01

    Synthetic gene drives based on CRISPR/Cas9 have the potential to control, alter, or suppress populations of crop pests and disease vectors, but it is unclear how they will function in wild populations. Using genetic data from four populations of the flour beetle Tribolium castaneum , we show that most populations harbor genetic variants in Cas9 target sites, some of which would render them immune to drive (ITD). We show that even a rare ITD allele can reduce or eliminate the efficacy of a CRISPR/Cas9-based synthetic gene drive. This effect is equivalent to and accentuated by mild inbreeding, which is a characteristic of many disease-vectoring arthropods. We conclude that designing such drives will require characterization of genetic variability and the mating system within and among targeted populations.

  3. Fistules scrotales révélant un adénocarcinome mucineux du scrotum: à propos d’un cas

    Science.gov (United States)

    El Alaoui, Abdelilah; El Boté, Hicham; Ziouani, Oussama; Dembele, Oussman; El Sayegh, Hachem; Iken, Ali; Benslimane, Lounis; Nouini, Yassine

    2017-01-01

    Les fistules scrotales sont rares, et souvent secondaires à des lésions de tuberculose. Les adénocarcinomes mucineux sont des tumeurs qui renferment au moins 50% de mucus extracellulaire, et siègent préférentiellement sur le recto sigmoïde, la localisation scrotale est inhabituelle. Nous rapportons un cas d’adénocarcinome mucineux secondaire du scrotum révélé par des fistules scrotales, chez un patient âgé de 54 ans, sans antécédents pathologiques notables, qui présente depuis deux ans des fistules scrotales à répétition, sans autres signes associés. L’examen trouve de multiples fistules scrotales avec issue de pus épais, le toucher rectal est normal. Les explorations urologiques (UIV, UCRM, Cystoscopie, …) sont normales, le bilan infectieux ainsi que la recherche de BK dans les urines et le crachat sont négatives. La biopsie de la peau scrotale est revenue en faveur d’un adénocarcinome mucineux moyennement différencié, dont l’étude immun histochimique est en faveur d’une origine primitive colorectale. L’évolution a été marqué par l’apparition de fistules anales complexes, ayant a l’IRM une caractéristique active, alimentant plusieurs collections pelvi périnéales comportant des bourgeons charnus. Sur le plan thérapeutique et vu la rareté de ce cancer, il n’y a pas de consensus. La résection chirurgicale reste le traitement de choix pour cette affection. La radio chimiothérapie pré opératoire est préconisée pour ce type de cancer mais son rôle n’est pas bien établi. Chez notre patient on a opté pour une radio chimiothérapie néo adjuvante première, avant la réalisation d’une amputation abdomino- périnéale. PMID:28674583

  4. Not all predicted CRISPR-Cas systems are equal: isolated cas genes and classes of CRISPR like elements.

    Science.gov (United States)

    Zhang, Quan; Ye, Yuzhen

    2017-02-06

    The CRISPR-Cas systems in prokaryotes are RNA-guided immune systems that target and deactivate foreign nucleic acids. A typical CRISPR-Cas system consists of a CRISPR array of repeat and spacer units, and a locus of cas genes. The CRISPR and the cas locus are often located next to each other in the genomes. However, there is no quantitative estimate of the co-location. In addition, ad-hoc studies have shown that some non-CRISPR genomic elements contain repeat-spacer-like structures and are mistaken as CRISPRs. Using available genome sequences, we observed that a significant number of genomes have isolated cas loci and/or CRISPRs. We found that 11%, 22% and 28% of the type I, II and III cas loci are isolated (without CRISPRs in the same genomes at all or with CRISPRs distant in the genomes), respectively. We identified a large number of genomic elements that superficially reassemble CRISPRs but don't contain diverse spacers and have no companion cas genes. We called these elements false-CRISPRs and further classified them into groups, including tandem repeats and Staphylococcus aureus repeat (STAR)-like elements. This is the first systematic study to collect and characterize false-CRISPR elements. We demonstrated that false-CRISPRs could be used to reduce the false annotation of CRISPRs, therefore showing them to be useful for improving the annotation of CRISPR-Cas systems.

  5. Apport de l’histopathologie dans le diagnostic d’une calcinose scrotale: a propos d’un cas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    K. Doh

    2015-03-01

    Full Text Available La calcinose scrotale est une maladie rare, bénigne, de pathogénie incertaine caractérisée par de nombreux nodules indolores, durs du scrotum en absence de tout trouble métabolique systémique. Nous rapportons le cas d’un patient âgé de 57 ans qui présente une calcinose scrotale de découverte histologique fortuite associée à un eczéma chronique et une hernie inguinale gauche. Nous discutons après une revue de la littérature, les aspects pathogéniques, cliniques, thérapeutiques et anatomopathologiques de cette pathologie mal comprise.

  6. Assembly and Multiplex Genome Integration of Metabolic Pathways in Yeast Using CasEMBLR.

    Science.gov (United States)

    Jakočiūnas, Tadas; Jensen, Emil D; Jensen, Michael K; Keasling, Jay D

    2018-01-01

    Genome integration is a vital step for implementing large biochemical pathways to build a stable microbial cell factory. Although traditional strain construction strategies are well established for the model organism Saccharomyces cerevisiae, recent advances in CRISPR/Cas9-mediated genome engineering allow much higher throughput and robustness in terms of strain construction. In this chapter, we describe CasEMBLR, a highly efficient and marker-free genome engineering method for one-step integration of in vivo assembled expression cassettes in multiple genomic sites simultaneously. CasEMBLR capitalizes on the CRISPR/Cas9 technology to generate double-strand breaks in genomic loci, thus prompting native homologous recombination (HR) machinery to integrate exogenously derived homology templates. As proof-of-principle for microbial cell factory development, CasEMBLR was used for one-step assembly and marker-free integration of the carotenoid pathway from 15 exogenously supplied DNA parts into three targeted genomic loci. As a second proof-of-principle, a total of ten DNA parts were assembled and integrated in two genomic loci to construct a tyrosine production strain, and at the same time knocking out two genes. This new method complements and improves the field of genome engineering in S. cerevisiae by providing a more flexible platform for rapid and precise strain building.

  7. Enhancement of single guide RNA transcription for efficient CRISPR/Cas-based genomic engineering.

    Science.gov (United States)

    Ui-Tei, Kumiko; Maruyama, Shohei; Nakano, Yuko

    2017-06-01

    Genomic engineering using clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) and CRISPR-associated (Cas) protein is a promising approach for targeting the genomic DNA of virtually any organism in a sequence-specific manner. Recent remarkable advances in CRISPR/Cas technology have made it a feasible system for use in therapeutic applications and biotechnology. In the CRISPR/Cas system, a guide RNA (gRNA), interacting with the Cas protein, recognizes a genomic region with sequence complementarity, and the double-stranded DNA at the target site is cleaved by the Cas protein. A widely used gRNA is an RNA polymerase III (pol III)-driven single gRNA (sgRNA), which is produced by artificial fusion of CRISPR RNA (crRNA) and trans-activation crRNA (tracrRNA). However, we identified a TTTT stretch, known as a termination signal of RNA pol III, in the scaffold region of the sgRNA. Here, we revealed that sgRNA carrying a TTTT stretch reduces the efficiency of sgRNA transcription due to premature transcriptional termination, and decreases the efficiency of genome editing. Unexpectedly, it was also shown that the premature terminated sgRNA may have an adverse effect of inducing RNA interference. Such disadvantageous effects were avoided by substituting one base in the TTTT stretch.

  8. Les carcinomes epidermoïdes du scrotum: à propos de 7 cas avec revue de la litterature

    Science.gov (United States)

    Halfya, Ayoub; Elmortaji, Khalid; Redouane, Rabii; fethi, Meziane; Rafik, Amine; Mohamed, Ezzoubi; Abdessamad, Chlihi

    2015-01-01

    Quoique rare le carcinome épidermoïde du scrotum a un mauvais pronostic. Les Carcinomes du scrotum induite et - liées au travail sont moins fréquentes en raison d'une meilleure hygiène, vêtements de protection, et la sensibilisation de la cancérogénicité des huiles industrielles. L’épidémie à l'HPV a induit une augmentation de l'incidence. Le traitement de dépend toujours exérèse locale de la lésion primaire. La radiothérapie a peu de bénéfice thérapeutique dans le traitement d'un carcinome épidermoïde du scrotum. La bléomycine peut être utile comme traitement adjuvant pour les maladies ilio-inguinal généralisée avant la tentative exérèse, même si cela n'a pas encore été prouvé. Entre janvier 2011 au 1er janvier 2013, 7 patients atteints de carcinome épidermoïde ont été pris en charge, Trois patients ont présenté une localisation ganglionnaire. Les sept patients ont eu un traitement chirurgical par exérèse large avec reconstruction, Deux patients ont été adressé pour chimiothérapie.2 patients ont présenté une récidive, dont un est décédé. PMID:26113906

  9. Le piano touchant/touché: l'instrument du contretemps chez Gide, le cas du Journal et des Notes sur Chopin

    OpenAIRE

    Zorica Vukušić, Maja

    2011-01-01

    André Gide, romancier, essayiste, critique et traducteur, a été le diariste dont le journal (écrit de 1887 jusqu`à 1949) est imbibé de musique. Gide a aussi été pianiste – amateur (dans le sens barthésien du terme), tout comme Nietzsche, Sartre ou Barthes. Leur proximité nous est donnée dans une sorte de polémique imaginée qui dépasse le discours. Sans doute Adorno et Jankélévitch ont été meilleurs pianistes et meilleurs philosophes de la musique, mais Gide s`est éloigné de la ...

  10. Couzeix – Les Terres du Puy Dieu

    OpenAIRE

    Maniquet, Christophe

    2013-01-01

    Identifiant de l'opération archéologique : 122281 Date de l'opération : 2005 (EX) Dans le cadre du projet de construction d'un lotissement constitué de trois pavillons au lieu-dit « Les Terres du Puy Dieu », un diagnostic archéologique a été prescrit par le service régional de l'Archéologie. En effet, plusieurs sites archéologiques avaient été inventoriés à proximité immédiate de la zone d'intervention. On notera, en particulier, la découverte en 1982, près du Puy Dieu, au cours de travaux de...

  11. Efficient mutagenesis by Cas9 protein-mediated oligonucleotide insertion and large-scale assessment of single-guide RNAs.

    Science.gov (United States)

    Gagnon, James A; Valen, Eivind; Thyme, Summer B; Huang, Peng; Akhmetova, Laila; Ahkmetova, Laila; Pauli, Andrea; Montague, Tessa G; Zimmerman, Steven; Richter, Constance; Schier, Alexander F

    2014-01-01

    The CRISPR/Cas9 system has been implemented in a variety of model organisms to mediate site-directed mutagenesis. A wide range of mutation rates has been reported, but at a limited number of genomic target sites. To uncover the rules that govern effective Cas9-mediated mutagenesis in zebrafish, we targeted over a hundred genomic loci for mutagenesis using a streamlined and cloning-free method. We generated mutations in 85% of target genes with mutation rates varying across several orders of magnitude, and identified sequence composition rules that influence mutagenesis. We increased rates of mutagenesis by implementing several novel approaches. The activities of poor or unsuccessful single-guide RNAs (sgRNAs) initiating with a 5' adenine were improved by rescuing 5' end homogeneity of the sgRNA. In some cases, direct injection of Cas9 protein/sgRNA complex further increased mutagenic activity. We also observed that low diversity of mutant alleles led to repeated failure to obtain frame-shift mutations. This limitation was overcome by knock-in of a stop codon cassette that ensured coding frame truncation. Our improved methods and detailed protocols make Cas9-mediated mutagenesis an attractive approach for labs of all sizes.

  12. Troubles du rythme liés à l’administration des inhibiteurs de la tyrosine kinase dans la leucémie myéloïde chronique

    OpenAIRE

    Spechbach, Hervé

    2016-01-01

    Le cas présenté dans l’article référencé permet de soupçonner un lien de l’ordre du probable selon l’organisation mondiale de la santé (OMS), entre le dasatinib (Sprycel®) et une arythmie ventriculaire. En complément, cette thèse fait le point sur les connaissances médicales actuelles quant aux arythmies cardiaques potentiellement liées aux inhibiteurs de tyrosine kinases. Selon la base de données mondiale de l’OMS sur les effets secondaires des médicaments, des centaines de cas ont été décla...

  13. La ‘dimension du visuel’ chez Tacite: réflexion sur la ‘thématisation du regard’ dans la textualité des Annales

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    José Mambwini-Kivuial-Kiaku

    2009-09-01

    Full Text Available E . Dans les écrits historiques de Tacite, il se dégage une notion importante que la critique a peu exploitée, à savoir la « thématisation du regard ». Il est clairement établi que, dans sa textualité, Tacite a souvent recours à des images à facture realiste pour obliger ses lecteurs à prendre conscience non seulement des préoccupations quotidiennes du peuple romain, mais aussi et surtout de tous les méfaits commis dans l’espace politique romain sous l’Empire. Pour y parvenir, l’historien insiste sur la technique du portrait, de la description physique ou psychologique, sur le panoramique. Loin de lui accorder l’attribut de cinéaste, il paraît évident que, si l’on relit les Histoires et les Annales avec un regard d’un lecteur du XXIe siècle, on y découvrirait des traces d’une écriture dite « cinématographique », laquelle a permis l’inscription des regards, des gestes, des paroles et surtout leur mise en filière dans les récits sans pour autant négliger le faisceau des relations qui définissent leur esthétique. En tout cas, l’univers littéraire et historique de Tacite se voulant en prise direct avec le vécu quotidien des romains se donne non seulement à voir mais aussi à entendre. Le recours à des procédés de polyfocalisation et à des techniques venant de plus champs artistiques (dont certaines ressemblent étonnement à celles exploitées dans le cinema d’aujourd’hui sollicite les lecteurs tacitéens à participer activement à la production de sens de ses récits. Le présent article doit être considéré comme une introduction à une étude beaucoup plus approfondie du regard dans l’œuvre de Tacite.

  14. Non-Mendelian Dominant Maternal Effects Caused by CRISPR/Cas9 Transgenic Components in Drosophila melanogaster

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Chun-Chieh Lin

    2016-11-01

    Full Text Available The CRISPR/Cas9 system has revolutionized genomic editing. The Cas9 endonuclease targets DNA via an experimentally determined guide RNA (gRNA. This results in a double-strand break at the target site . We generated transgenic Drosophila melanogaster in which the CRISPR/Cas9 system was used to target a GAL4 transgene in vivo. To our surprise, progeny whose genomes did not contain CRISPR/Cas9 components were still capable of mutating GAL4 sequences. We demonstrate this effect was caused by maternal deposition of Cas9 and gRNAs into the embryo, leading to extensive GAL4 mutations in both somatic and germline tissues. This serves as a cautionary observation on the effects of maternal contributions when conducting experiments using genomically encoded CRISPR/Cas9 components. These results also highlight a mode of artificial inheritance in which maternal contributions of DNA editing components lead to transmissible mutant defects even in animals whose genomes lack the editing components. We suggest calling this a dominant maternal effect to reflect it is caused by the gain of maternally contributed products. Models of CRISPR-mediated gene drive will need to incorporate dominant maternal effects in order to accurately predict the efficiency and dynamics of gene drive in a population.

  15. Les conséquences financières de l'épisode pluvieux dans le bassin-versant du Buëch, 1993-1994

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Pierre PECH

    1994-12-01

    Full Text Available Les épisodes pluvio-orageux d’octobre 1993 et de janvier 1994 sont à l’origine de nombreux dommages dans les communes du bassin-versant du Buëch (Hautes-Alpes. La cartographie des phénomènes naturels et de leurs coûts permet de définir une typologie de communes en fonction de l’ampleur de ces dégâts et ces coûts. Les villes et les petites communes rurales montagnardes subissent des charges financières lourdes pour des raisons totalement différentes: dans un cas l’urbanisation est responsable des coûts, dans l’autre c’est la morphologie des versants.

  16. Interaction between focal adhesion kinase and Crk-associated tyrosine kinase substrate p130Cas.

    Science.gov (United States)

    Polte, T R; Hanks, S K

    1995-11-07

    The focal adhesion kinase (FAK) has been implicated in integrin-mediated signaling events and in the mechanism of cell transformation by the v-Src and v-Crk oncoproteins. To gain further insight into FAK signaling pathways, we used a two-hybrid screen to identify proteins that interact with mouse FAK. The screen identified two proteins that interact with FAK via their Src homology 3 (SH3) domains: a v-Crk-associated tyrosine kinase substrate (Cas), p130Cas, and a still uncharacterized protein, FIPSH3-2, which contains an SH3 domain closely related to that of p130Cas. These SH3 domains bind to the same proline-rich region of FAK (APPKPSR) encompassing residues 711-717. The mouse p130Cas amino acid sequence was deduced from cDNA clones, revealing an overall high degree of similarity to the recently reported rat sequence. Coimmunoprecipitation experiments confirmed that p130Cas and FAK are associated in mouse fibroblasts. The stable interaction between p130Cas and FAK emerges as a likely key element in integrin-mediated signal transduction and further represents a direct molecular link between the v-Src and v-Crk oncoproteins. The Src family kinase Fyn, whose Src homology 2 (SH2) domain binds to the major FAK autophosphorylation site (tyrosine 397), was also identified in the two-hybrid screen.

  17. Le syndrome néphrotique idiopathique (SNI) de l’enfant à Dakar: à propos de 40 cas

    Science.gov (United States)

    Keita, Younoussa; Lemrabott, Ahmed Tall; Sylla, Assane; Niang, Babacar; Ka, El Hadji Fary; Dial, Chérif Mohamed; Ndongo, Aliou Abdoulaye; Sow, Amadou; Moreira, Claude; Niang, Abdou; Ndiaye, Ousmane; Diouf, Boucar; Sall, Mouhamadou Guélaye

    2017-01-01

    Introduction L’objectif de ce travail était d’analyser les caractéristiques diagnostiques, thérapeutiques et évolutives de l’enfant atteint de néphrose dans un service de pédiatrie de Dakar. Méthodes L’étude était réalisée au service de pédiatrie de l’hôpital Aristide Le Dantec. Il s’agissait d’une étude rétrospective sur une période de 03 ans allant du 1er janvier 2012 au 31 décembre 2014. Ont été inclus tous les patients âgés de 02 ans à 12 ans présentant un tableau de Syndrome néphrotique idiopathique. Résultats Quarante cas de néphrose étaient colligés soit une prévalence de 23% parmi les néphropathies prises en charge dans le service. L’âge moyen était de 7,11± 3,14 ans. Le syndrome néphrotique était pur chez 72,5% (n=29) des patients. Les œdèmes des membres inférieurs étaient présents chez 100% des patients, l’oligurie dans 55% (n=22) et l’HTA dans 5% (n=2) des cas. La protéinurie moyenne était de 145,05 ± 85,54 mg/kg/24heures. La protidémie moyenne était de 46,42 ±7,88 g/L et l’albuminémie moyenne de 17,90 ± 7,15 g/L. Trente-neuf patients avaient reçu une corticothérapie à base de prednisone. La corticosensibilité était retenue chez 77% (n=30) des patients et la corticorésistance chez 13% (n=5) des cas. Le facteur de mauvaise réponse à la corticothérapie était un niveau de protéinurie initiale supérieure à 150 mg/kg/jour (p = 0,024). La biopsie rénale était réalisée chez 18% (n=7) des patients et retrouvait dans 57,2% (n=4) des cas une hyalinose segmentaire et focale. Le cyclophosphamide et l’azathioprine étaient associés aux corticoïdes dans 10% (n=4) des cas chacun. Le taux de rémission globale était de 89,8%. L’évolution vers l’insuffisance rénale chronique était notée chez trois (03) des patients. Conclusion La néphrose représentait près du quart des néphropathies prises en charge dans notre service. Le taux de rémission globale était élevé. Le

  18. Asteroid named after CAS scientist

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    2007-01-01

    @@ An asteroid has been named after CAS astronomy historian XI Zezong with the approval of the International Minor Planet Nomenclature Committee (IMPNC), announced China's National Astronomical Observatories at CAS (NAOC) on 17 August.

  19. Mécanisme pour un développement propre (MDP) du protocole de Kyoto: barrières et opportunités pour les pays moins avancés d'Afrique :cas du Burundi

    OpenAIRE

    Bisore, Simon

    2012-01-01

    Du Protocole de Kyoto est née une série d’objectifs de réduction des émissions de GES. Le respect de ces objectifs peut entraîner des coûts très lourds pour les économies des pays développés engagés dans la lutte contre les changements climatiques. Pour minimiser les coûts imposés par ces objectifs, des instruments économiques ont été développés, avec notamment la création de marchés du carbone. Y participent les trois mécanismes de flexibilité du Protocole de Kyoto parmi lesquels figure le M...

  20. Targeted Gene Knockin in Porcine Somatic Cells Using CRISPR/Cas Ribonucleoproteins

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ki-Eun Park

    2016-05-01

    Full Text Available The pig is an ideal large animal model for genetic engineering applications. A relatively short gestation interval and large litter size makes the pig a conducive model for generating and propagating genetic modifications. The domestic pig also shares close similarity in anatomy, physiology, size, and life expectancy, making it an ideal animal for modeling human diseases. Often, however, the technical difficulties in generating desired genetic modifications such as targeted knockin of short stretches of sequences or transgenes have impeded progress in this field. In this study, we have investigated and compared the relative efficiency of CRISPR/Cas ribonucleoproteins in engineering targeted knockin of pseudo attP sites downstream of a ubiquitously expressed COL1A gene in porcine somatic cells and generated live fetuses by somatic cell nuclear transfer (SCNT. By leveraging these knockin pseudo attP sites, we have demonstrated subsequent phiC31 integrase mediated integration of green fluorescent protein (GFP transgene into the site. This work for the first time created an optimized protocol for CRISPR/Cas mediated knockin in porcine somatic cells, while simultaneously creating a stable platform for future transgene integration and generating transgenic animals.

  1. Efficient CRISPR-Cas9-mediated generation of knockin human pluripotent stem cells lacking undesired mutations at the targeted locus.

    Science.gov (United States)

    Merkle, Florian T; Neuhausser, Werner M; Santos, David; Valen, Eivind; Gagnon, James A; Maas, Kristi; Sandoe, Jackson; Schier, Alexander F; Eggan, Kevin

    2015-05-12

    The CRISPR-Cas9 system has the potential to revolutionize genome editing in human pluripotent stem cells (hPSCs), but its advantages and pitfalls are still poorly understood. We systematically tested the ability of CRISPR-Cas9 to mediate reporter gene knockin at 16 distinct genomic sites in hPSCs. We observed efficient gene targeting but found that targeted clones carried an unexpectedly high frequency of insertion and deletion (indel) mutations at both alleles of the targeted gene. These indels were induced by Cas9 nuclease, as well as Cas9-D10A single or dual nickases, and often disrupted gene function. To overcome this problem, we designed strategies to physically destroy or separate CRISPR target sites at the targeted allele and developed a bioinformatic pipeline to identify and eliminate clones harboring deleterious indels at the other allele. This two-pronged approach enables the reliable generation of knockin hPSC reporter cell lines free of unwanted mutations at the targeted locus. Copyright © 2015 The Authors. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.

  2. Epithelioma Spinocellulaire sur Cicatrice de Brulure (a Propos de Cinq Cas)

    Science.gov (United States)

    Tourabi, K.; Mejjati, H.; Ribqg, Y.; Achbouk, A.; Arrob, A.; Moussaoui, A.; Ihrai, H.

    2009-01-01

    Summary Pour étudier l'ulcère de Marjolin, tous les dossiers des patients qui se sont présentés pendant une période quinquennale à un Service de Chirurgie Plastique et des Brûlés au Maroc ayant un cancer sur cicatrice de brûlure, objectivé par un examen histopathologique, ont été inclus dans une fiche de recueil de données comprenant des paramètres liés à l'identité du malade, à l'inventaire préthérapeutique, au traitement et à l'évolution du cas. Les Auteurs, après avoir présenté les données des cinq patients inclus dans l'étude, considèrent les problèmes posés par les épithéliomas spinocellulaires sur cicatrice de brûlure, qui sont des affections graves et rares. La dégénérescence des cicatrices de brûlures est une évolution dramatique, causée par la négligence. Le traitement préventif par exérèse systématique de toute lésion suspecte doit être fortement souligné puisqu'il garantit la guérison quasi certaine. PMID:21991185

  3. Closure Report for Corrective Action Unit 262: Area 25 Septic Systems and Underground Discharge Point, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    Tobiason, D. S.

    2003-01-01

    This Closure Report (CR) documents the activities undertaken to close Corrective Action Unit (CAU) 262: Area 25 Septic Systems and Underground Discharge Point, in accordance with the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO) of 1996. Site closure was performed in accordance with the Nevada Division of Environmental Protection (NDEP)-approved Corrective Action Plan (CAP) for CAU 262 (U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Operations Office [NNSA/NV, 2002a]). CAU 262 is located at the Nevada Test Site (NTS) approximately 105 kilometers (65 miles) northwest of Las Vegas, Nevada. CAU 262 consists of the following nine Corrective Action Sites (CASs) located in Area 25 of the NTS: CAS 25-02-06, Underground Storage tank CAS 25-04-06, Septic Systems A and B CAS 25-04-07, Septic System CAS 25-05-03, Leachfield CAS 25-05-05, Leachfield CAS 25-05-06, Leachfield CAS 25-05-08, Radioactive Leachfield CAS 25-05-12, Leachfield CAS 25-51-01, Dry Well

  4. The use tri-n-butyl phosphate in plutonium extraction. Radiolysis and recycling of the solvent (1963); Le phosphate de tri-n-butyle dans l'extraction du plutonium. Radiolyse et recyclage du solvant (1963)

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Isaac, M [Commissariat a l' Energie Atomique, Saclay (France). Centre d' Etudes Nucleaires

    1963-07-01

    The work concerns the radiolysis and recycling of tri-n-butyl phosphate used as extraction solvent for plutonium. The radiolysis is studied on an industrial solvent using a cobalt 60 source. Figures are given for the yield of the mono- and di-butyl-phosphoric acids formed from the dry and water-saturated solvents and the influence of nitric acid on the formation of dibutyl-phosphoric acid is indicated. The recycling treatment of the solvent is reconsidered with a view to lowering the residual contamination due to fission products. The tests carried out on a solvent from the plutonium extraction plant at Marcoule show the efficiency of the sodium carbonate treatment. Of all the products studied, only caustic soda led to a better decontamination than sodium carbonate; in all cases however, the elimination of ruthenium is always incomplete. (author) [French] L'etude porte sur la radiolyse et le recyclage du phosphate de tri-n-butyle utilise comme solvant d'extraction du plutonium. La radiolyse est etudiee sur un solvant industriel a l'aide d'une source de cobalt 60. On donne les rendements de formation des acides mono- et dlbutylphosphoriques a partir de solvants secs et satures d'eau, et on montre l'influence de l'acide nitrique sur la formation de l'acide dibutylphosphorique. Le traitement de recyclage du solvant est repris en vue d'abaisser la contamination residuelle en produits de fission. Les essais, effectues sur un solvant provenant de l'usine d'extraction du plutonium de Marcoule, montrent l'efficacite du traitement au carbonate de sodium. De tous les reactifs etudies, seule la soude a donne une decontamination superieure au carbonate de sodium; mais dans tous les cas, l'elimination du ruthenium est toujours incomplete. (auteur)

  5. Un établissement du début du premier âge du Fer en Eure-et-Loir : Sours, Les Ouches A settlement from the first Iron Age in Eure-et-Loir: Sours, Les Ouches

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Frédéric Dupont

    2012-01-01

    Full Text Available La fouille du site des Ouches à Sours (28 a permis la mise au jour d’une importante occupation du Néolithique ancien et la découverte, dans la partie nord de l’emprise, de plusieurs structures datables du début de l’âge du Fer (Hallstatt C. Elles correspondent à des structures domestiques (un bâtiment et des fosses et à une entité “ cultuelle ”: un double enclos en “ U ”.L’habitation et ses annexes sont représentées par un bâtiment de plan quadrangulaire sur poteaux et une grande fosse riche en mobilier (céramiques, ossements et silex taillés. Cette structure peut être associée au fonctionnement d’un four de type “ polynésien ” et avoir servi de fosse de rejet.Le double enclos, ouvert vers le nord, est localisé au nord-est du site.Même si trois céramiques entières ont été trouvées dans son fossé externe, l’essentiel du mobilier céramique (177 individus sur 192 est issu de la grande fosse. Il s’agit principalement de coupes, de jattes parfois incisées, de petits gobelets à panse globulaire typiques du Hallstatt C ou de vases servant au stockage. Ils sont dotés de manière régulière de cordons digités.Ce petit établissement du début de l’âge du Fer a livré un bon échantillon des céramiques en usage en Eure-et-Loir à cette époque ainsi que des vestiges archéozoologiques et lithiques en quantité intéressante. Ces découvertes donnent de nouvelles informations sur les affinités culturelles à la transition entre l’âge du Bronze et l’âge du Fer, période peu documentée dans le Nord de la région Centre.The excavation of the site of Ouches at Sours (28 has enabled the updating of an important settlement from the early Neolithic and the discovery, in the northern part of the site, of several structures datable to the beginning of the Iron Age (Hallstatt C. They correspond to domestic structures (a building and some ditches and a “worship” entity: a double

  6. Using CRISPR-Cas systems as antimicrobials.

    Science.gov (United States)

    Bikard, David; Barrangou, Rodolphe

    2017-06-01

    Although CRISPR-Cas systems naturally evolved to provide adaptive immunity in bacteria and archaea, Cas nucleases can be co-opted to target chromosomal sequences rather than invasive genetic elements. Although genome editing is the primary outcome of self-targeting using CRISPR-based technologies in eukaryotes, self-targeting by CRISPR is typically lethal in bacteria. Here, we discuss how DNA damage introduced by Cas nucleases in bacteria can efficiently and specifically lead to plasmid curing or drive cell death. Specifically, we discuss how various CRISPR-Cas systems can be engineered and delivered using phages or phagemids as vectors. These principles establish CRISPR-Cas systems as potent and programmable antimicrobials, and open new avenues for the development of CRISPR-based tools for selective removal of bacterial pathogens and precise microbiome composition alteration. Copyright © 2017 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  7. Corrective Action Investigation Plan for Corrective Action Unit 550: Smoky Contamination Area Nevada National Security Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    Evenson, Grant

    2012-01-01

    Corrective Action Unit (CAU) 550 is located in Areas 7, 8, and 10 of the Nevada National Security Site, which is approximately 65 miles northwest of Las Vegas, Nevada. CAU 550, Smoky Contamination Area, comprises 19 corrective action sites (CASs). Based on process knowledge of the releases associated with the nuclear tests and radiological survey information about the location and shape of the resulting contamination plumes, it was determined that some of the CAS releases are co-located and will be investigated as study groups. This document describes the planned investigation of the following CASs (by study group): (1) Study Group 1, Atmospheric Test - CAS 08-23-04, Atmospheric Test Site T-2C; (2) Study Group 2, Safety Experiments - CAS 08-23-03, Atmospheric Test Site T-8B - CAS 08-23-06, Atmospheric Test Site T-8A - CAS 08-23-07, Atmospheric Test Site T-8C; (3) Study Group 3, Washes - Potential stormwater migration of contaminants from CASs; (4) Study Group 4, Debris - CAS 08-01-01, Storage Tank - CAS 08-22-05, Drum - CAS 08-22-07, Drum - CAS 08-22-08, Drums (3) - CAS 08-22-09, Drum - CAS 08-24-03, Battery - CAS 08-24-04, Battery - CAS 08-24-07, Batteries (3) - CAS 08-24-08, Batteries (3) - CAS 08-26-01, Lead Bricks (200) - CAS 10-22-17, Buckets (3) - CAS 10-22-18, Gas Block/Drum - CAS 10-22-19, Drum; Stains - CAS 10-22-20, Drum - CAS 10-24-10, Battery. These sites are being investigated because existing information on the nature and extent of potential contamination is insufficient to evaluate and recommend corrective action alternatives (CAAs). Additional information will be obtained by conducting a corrective action investigation before evaluating CAAs and selecting the appropriate corrective action for each study group. The results of the field investigation will support a defensible evaluation of viable CAAs that will be presented in the Corrective Action Decision Document. The sites will be investigated based on the data quality objectives (DQOs) developed

  8. Aux frontières du politique et du religieux

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Frédéric Sylvanise

    2006-05-01

    Full Text Available The Autobiography of Miss Jane Pittman met en scène de manière spectaculaire deux figures de leadership noir-américain au XIXe siècle (Ned et au XXe siècle (Jimmy. Ned, fils adoptif de Jane Pittman, se rebaptise Professor Douglass en hommage au leader abolitionniste Frederick Douglass. S’il est fondamentalement laïc (il est instituteur, le texte lui confère néanmoins une dimension religieuse, notamment dans le chapitre intitulé « The Sermon at the River » , qui renvoie à la fois à Moïse (le fleuve et à Jésus (le sermon sur la montagne. Abattu par un tueur à gages, Ned est un martyr dont l’histoire était déjà écrite. Le personnage de Jimmy, attendu par toute une communauté comme le messie (alors que lui aussi est un laïc et un homme qui perd la foi, s’inscrit dans la même histoire. Lettré, éloquent et impliqué dans le mouvement pour les droits civils, il est assassiné comme son prédécesseur. Dans les deux cas, le texte lie donc le politique et le biblique comme s’il ne faisait qu’un : être un leader politique, c’est être un preacher et un messie qui guide le peuple. Il est possible de lire l’évocation de ces deux hommes à la lumière d’une certaine actualité. Ned et Jimmy connaissent en effet un sort proche de celui de Malcolm X et de Martin Luther King, récemment assassinés au moment de l’écriture de The Autobiography of Miss Jane Pittman. C’est l’histoire de la répression du leadership noir, au travers du portrait de deux de ses avatars, qui peut donc se lire en creux ici.

  9. Efficient Genome Editing in Chicken DF-1 Cells Using the CRISPR/Cas9 System

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Yichun Bai

    2016-04-01

    Full Text Available In recent years, genome engineering technology has provided unprecedented opportunities for site-specific modification of biological genomes. Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR/CRISPR-associated (Cas 9 is one such means that can target a specific genome locus. It has been applied in human cells and many other organisms. Meanwhile, to efficiently enrich targeted cells, several surrogate systems have also been developed. However, very limited information exists on the application of CRISPR/Cas9 in chickens. In this study, we employed the CRISPR/Cas9 system to induce mutations in the peroxisome proliferator-activated receptor-γ (PPAR-γ, ATP synthase epsilon subunit (ATP5E, and ovalbumin (OVA genes in chicken DF-1 cells. The results of T7E1 assays showed that the mutation rate at the three different loci was 0.75%, 0.5%, and 3.0%, respectively. In order to improve the mutation efficiency, we used the PuroR gene for efficient enrichment of genetically modified cells with the surrogate reporter system. The mutation rate, as assessed via the T7E1 assay, increased to 60.7%, 61.3%, and 47.3%, and subsequent sequence analysis showed that the mutation efficiency increased to 94.7%, 95%, and 95%, respectively. In addition, there were no detectable off-target mutations in three potential off-target sites using the T7E1 assay. As noted above, the CRISPR/Cas9 system is a robust tool for chicken genome editing.

  10. Conjugation and Evaluation of Triazole?Linked Single Guide RNA for CRISPR?Cas9 Gene Editing

    OpenAIRE

    He, Kaizhang; Chou, Eldon T.; Begay, Shawn; Anderson, Emily M.; van?Brabant?Smith, Anja

    2016-01-01

    Abstract The CRISPR?Cas9 gene editing system requires Cas9 endonuclease and guide RNAs (either the natural dual RNA consisting of crRNA and tracrRNA or a chimeric single guide RNA) that direct site?specific double?stranded DNA cleavage. This communication describes a click ligation approach that uses alkyne?azide cycloaddition to generate a triazole?linked single guide RNA (sgRNA). The conjugated sgRNA shows efficient and comparable genome editing activity to natural dual RNA and unmodified s...

  11. Prediction du profil de durete de l'acier AISI 4340 traite thermiquement au laser

    Science.gov (United States)

    Maamri, Ilyes

    Les traitements thermiques de surfaces sont des procedes qui visent a conferer au coeur et a la surface des pieces mecaniques des proprietes differentes. Ils permettent d'ameliorer la resistance a l'usure et a la fatigue en durcissant les zones critiques superficielles par des apports thermiques courts et localises. Parmi les procedes qui se distinguent par leur capacite en terme de puissance surfacique, le traitement thermique de surface au laser offre des cycles thermiques rapides, localises et precis tout en limitant les risques de deformations indesirables. Les proprietes mecaniques de la zone durcie obtenue par ce procede dependent des proprietes physicochimiques du materiau a traiter et de plusieurs parametres du procede. Pour etre en mesure d'exploiter adequatement les ressources qu'offre ce procede, il est necessaire de developper des strategies permettant de controler et regler les parametres de maniere a produire avec precision les caracteristiques desirees pour la surface durcie sans recourir au classique long et couteux processus essai-erreur. L'objectif du projet consiste donc a developper des modeles pour predire le profil de durete dans le cas de traitement thermique de pieces en acier AISI 4340. Pour comprendre le comportement du procede et evaluer les effets des differents parametres sur la qualite du traitement, une etude de sensibilite a ete menee en se basant sur une planification experimentale structuree combinee a des techniques d'analyse statistiques eprouvees. Les resultats de cette etude ont permis l'identification des variables les plus pertinentes a exploiter pour la modelisation. Suite a cette analyse et dans le but d'elaborer un premier modele, deux techniques de modelisation ont ete considerees, soient la regression multiple et les reseaux de neurones. Les deux techniques ont conduit a des modeles de qualite acceptable avec une precision d'environ 90%. Pour ameliorer les performances des modeles a base de reseaux de neurones, deux

  12. Développement d’un programme multidisciplinaire de diagnostic de l’adrénoleucodystrophie liée à l’X au Maroc: résultats de la mise en œuvre du programme de diagnostic clinique et biologique

    Science.gov (United States)

    Benjelloun, Fatima-Zohra Madani; Chabraoui, Layachi; Kriouile, Yamna

    2017-01-01

    Introduction L'adrénoleucodystrophie liée à l'X (X-ALD) est une maladie neurodégénérative sévère, due à des mutations du gène ABCD1. Elle se manifeste par une atteinte du système nerveux central et périphérique, une insuffisance surrénalienne et une atteinte des testicules chez le garçon. Son diagnostic repose sur le dosage des Acides Gras à Très Longue Chaine. Le diagnostic précoce est d'une grande importance puisque il définit l'accessibilité aux traitements selon le stage de la maladie. Méthodes Nous avons mis en place un programme de diagnostic de l'X-ALD au Maroc au niveau de l'Hôpital d'enfants et du Laboratoire centrale des maladies héréditaires et du métabolisme de Rabat. Le programme s'articule sur trois axes à savoir : le recrutement des patients, le diagnostic et la sensibilisation. Le diagnostic s'effectue selon trois protocoles : un protocole pour les cas symptomatiques, un deuxième pour les cas asymptomatiques et un troisième pour les femmes hétérozygotes. Résultats Durant trois ans après la mise en place de notre programme de diagnostic de l'Adrénoleucodystrophie liée à l'X, nous avons diagnostiqué la maladie chez sept familles, avec neuf garçons et trois femmes hétérozygotes. Tous les enfants diagnostiqués présentaient la forme cérébrale démyélinisante. Toutes les femmes hétérozygotes étaient asymptomatiques. Une prise en charge thérapeutique a été mise place selon la symptomatologie de chaque cas. Conclusion l'X-ALD est une maladie rare. Notre programme de diagnostique a permis de diagnostiquer un nombre important de cas, ce qui montre son importance. Les compagnes de sensibilisation auprès des professionnels permettront de mieux comprendre la maladie et mieux la diagnostiquer et ainsi donner accès à un nombre plus élevé de patients. PMID:29599883

  13. Streamlined approach for environmental restoration closure report for Corrective Action Unit 464: Historical underground storage tank release sites, Nevada Test Site, Nevada

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    NONE

    1998-04-01

    This report addresses the site characterization of two historical underground storage tank petroleum hydrocarbon release sites identified by Corrective Action Site (CAS) Numbers 02-02-03 and 09-02-01. The sites are located at the Nevada Test Site in Areas 2 and 9 and are concrete bunker complexes (Bunker 2-300, and 9-300). Characterization was completed using drilling equipment to delineate the extent of petroleum hydrocarbons at release site 2-300-1 (CAS 02-02-03). Based on site observations, the low hydrocarbon concentrations detected, and the delineation of the vertical and lateral extent of subsurface hydrocarbons, an ``A through K`` evaluation was completed to support a request for an Administrative Closure of the site.

  14. Streamlined approach for environmental restoration closure report for Corrective Action Unit 464: Historical underground storage tank release sites, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    1998-04-01

    This report addresses the site characterization of two historical underground storage tank petroleum hydrocarbon release sites identified by Corrective Action Site (CAS) Numbers 02-02-03 and 09-02-01. The sites are located at the Nevada Test Site in Areas 2 and 9 and are concrete bunker complexes (Bunker 2-300, and 9-300). Characterization was completed using drilling equipment to delineate the extent of petroleum hydrocarbons at release site 2-300-1 (CAS 02-02-03). Based on site observations, the low hydrocarbon concentrations detected, and the delineation of the vertical and lateral extent of subsurface hydrocarbons, an ''A through K'' evaluation was completed to support a request for an Administrative Closure of the site

  15. Evolution and classification of the CRISPR-Cas systems

    Science.gov (United States)

    S. Makarova, Kira; H. Haft, Daniel; Barrangou, Rodolphe; J. J. Brouns, Stan; Charpentier, Emmanuelle; Horvath, Philippe; Moineau, Sylvain; J. M. Mojica, Francisco; I. Wolf, Yuri; Yakunin, Alexander F.; van der Oost, John; V. Koonin, Eugene

    2012-01-01

    The CRISPR–Cas (clustered regularly interspaced short palindromic repeats–CRISPR-associated proteins) modules are adaptive immunity systems that are present in many archaea and bacteria. These defence systems are encoded by operons that have an extraordinarily diverse architecture and a high rate of evolution for both the cas genes and the unique spacer content. Here, we provide an updated analysis of the evolutionary relationships between CRISPR–Cas systems and Cas proteins. Three major types of CRISPR–Cas system are delineated, with a further division into several subtypes and a few chimeric variants. Given the complexity of the genomic architectures and the extremely dynamic evolution of the CRISPR–Cas systems, a unified classification of these systems should be based on multiple criteria. Accordingly, we propose a `polythetic' classification that integrates the phylogenies of the most common cas genes, the sequence and organization of the CRISPR repeats and the architecture of the CRISPR–cas loci. PMID:21552286

  16. Bahia et la réponse du peuple

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Tahar Chikhaoui

    2013-12-01

    Full Text Available Que disent les révolutions arabes sur le cinéma ? La question est d'autant plus intéressante que jamais dans le monde arabe l'image au sens large n'a joué un rôle aussi décisif dans les bouleversements socio-politiques. Les petites caméras ont servi d'armes contres les dictatures et l'impact de la diffusion à travers les réseaux sociaux des images prises par ces caméras a été considérable. L'histoire du cinéma semble, du coup, s'être accélérée. Rétrospectivement, les films engagés réalisés depuis les années 1970 se sont éloignés dans le temps et ceux plus personnels des années 1980, 1990 et 2000 paraissent complètement décalés par rapport à la réalité. En analysant de près les rapports secrets, complexes, toujours décalés entre le mode d'expression de l'art cinématographique et la logique de l'évolution des événements sociopolitiques, on se rend mieux compte des illusions d'optique déroutantes dues à l'accélération de l'histoire et à l'imbrication de plus en plus grande des facteurs politiques, sociaux, culturels et technologiques. Et en considérant de plus près la nature de l'évolution récente de l'histoire du monde arabe, de l'accélération des modes de représentation politique et culturelle, on réalise mieux la place du cinéma et la nécessaire distinction des types d'image en circulation, de leur nature, de leur fonction. Et de mieux cerner les enjeux futurs, en tout cas d'y « voir » plus clair.

  17. Cas4 Facilitates PAM-Compatible Spacer Selection during CRISPR Adaptation

    OpenAIRE

    Sebastian N. Kieper; Cristóbal Almendros; Juliane Behler; Rebecca E. McKenzie; Franklin L. Nobrega; Anna C. Haagsma; Jochem N.A. Vink; Wolfgang R. Hess; Stan J.J. Brouns

    2018-01-01

    Summary: CRISPR-Cas systems adapt their immunological memory against their invaders by integrating short DNA fragments into clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR) loci. While Cas1 and Cas2 make up the core machinery of the CRISPR integration process, various class I and II CRISPR-Cas systems encode Cas4 proteins for which the role is unknown. Here, we introduced the CRISPR adaptation genes cas1, cas2, and cas4 from the type I-D CRISPR-Cas system of Synechocystis sp....

  18. CRISPR-Cas: biology, mechanisms and relevance

    Science.gov (United States)

    Hille, Frank

    2016-01-01

    Prokaryotes have evolved several defence mechanisms to protect themselves from viral predators. Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) and their associated proteins (Cas) display a prokaryotic adaptive immune system that memorizes previous infections by integrating short sequences of invading genomes—termed spacers—into the CRISPR locus. The spacers interspaced with repeats are expressed as small guide CRISPR RNAs (crRNAs) that are employed by Cas proteins to target invaders sequence-specifically upon a reoccurring infection. The ability of the minimal CRISPR-Cas9 system to target DNA sequences using programmable RNAs has opened new avenues in genome editing in a broad range of cells and organisms with high potential in therapeutical applications. While numerous scientific studies have shed light on the biochemical processes behind CRISPR-Cas systems, several aspects of the immunity steps, however, still lack sufficient understanding. This review summarizes major discoveries in the CRISPR-Cas field, discusses the role of CRISPR-Cas in prokaryotic immunity and other physiological properties, and describes applications of the system as a DNA editing technology and antimicrobial agent. This article is part of the themed issue ‘The new bacteriology’. PMID:27672148

  19. A guild of 45 CRISPR-associated (Cas protein families and multiple CRISPR/Cas subtypes exist in prokaryotic genomes.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Daniel H Haft

    2005-11-01

    Full Text Available Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPRs are a family of DNA direct repeats found in many prokaryotic genomes. Repeats of 21-37 bp typically show weak dyad symmetry and are separated by regularly sized, nonrepetitive spacer sequences. Four CRISPR-associated (Cas protein families, designated Cas1 to Cas4, are strictly associated with CRISPR elements and always occur near a repeat cluster. Some spacers originate from mobile genetic elements and are thought to confer "immunity" against the elements that harbor these sequences. In the present study, we have systematically investigated uncharacterized proteins encoded in the vicinity of these CRISPRs and found many additional protein families that are strictly associated with CRISPR loci across multiple prokaryotic species. Multiple sequence alignments and hidden Markov models have been built for 45 Cas protein families. These models identify family members with high sensitivity and selectivity and classify key regulators of development, DevR and DevS, in Myxococcus xanthus as Cas proteins. These identifications show that CRISPR/cas gene regions can be quite large, with up to 20 different, tandem-arranged cas genes next to a repeat cluster or filling the region between two repeat clusters. Distinctive subsets of the collection of Cas proteins recur in phylogenetically distant species and correlate with characteristic repeat periodicity. The analyses presented here support initial proposals of mobility of these units, along with the likelihood that loci of different subtypes interact with one another as well as with host cell defensive, replicative, and regulatory systems. It is evident from this analysis that CRISPR/cas loci are larger, more complex, and more heterogeneous than previously appreciated.

  20. Potential high-frequency off-target mutagenesis induced by CRISPR/Cas9 in Arabidopsis and its prevention.

    Science.gov (United States)

    Zhang, Qiang; Xing, Hui-Li; Wang, Zhi-Ping; Zhang, Hai-Yan; Yang, Fang; Wang, Xue-Chen; Chen, Qi-Jun

    2018-03-01

    We present novel observations of high-specificity SpCas9 variants, sgRNA expression strategies based on mutant sgRNA scaffold and tRNA processing system, and CRISPR/Cas9-mediated T-DNA integrations. Specificity of CRISPR/Cas9 tools has been a major concern along with the reports of their successful applications. We report unexpected observations of high frequency off-target mutagenesis induced by CRISPR/Cas9 in T1 Arabidopsis mutants although the sgRNA was predicted to have a high specificity score. We also present evidence that the off-target effects were further exacerbated in the T2 progeny. To prevent the off-target effects, we tested and optimized two strategies in Arabidopsis, including introduction of a mCherry cassette for a simple and reliable isolation of Cas9-free mutants and the use of highly specific mutant SpCas9 variants. Optimization of the mCherry vectors and subsequent validation found that fusion of tRNA with the mutant rather than the original sgRNA scaffold significantly improves editing efficiency. We then examined the editing efficiency of eight high-specificity SpCas9 variants in combination with the improved tRNA-sgRNA fusion strategy. Our results suggest that highly specific SpCas9 variants require a higher level of expression than their wild-type counterpart to maintain high editing efficiency. Additionally, we demonstrate that T-DNA can be inserted into the cleavage sites of CRISPR/Cas9 targets with high frequency. Altogether, our results suggest that in plants, continuous attention should be paid to off-target effects induced by CRISPR/Cas9 in current and subsequent generations, and that the tools optimized in this report will be useful in improving genome editing efficiency and specificity in plants and other organisms.

  1. Corrective Action Plan for Corrective Action Unit 543: Liquid Disposal Units, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    NSTec Environmental Restoration

    2006-01-01

    Corrective Action Unit (CAU) 543, Liquid Disposal Units, is listed in Appendix III of the Federal Facility Agreement and Consent Order of 1996. CAU 543 consists of seven Corrective Action Sites (CASs) located in Areas 6 and 15 of the Nevada Test Site, which is approximately 65 miles northwest of Las Vegas, Nevada. CAU 543 consists of the following seven CASs: (sm b ullet) CAS 06-07-01, Decon Pad (sm b ullet) CAS 15-01-03, Aboveground Storage Tank (sm b ullet) CAS 15-04-01, Septic Tank (sm b ullet) CAS 15-05-01, Leachfield (sm b ullet) CAS 15-08-01, Liquid Manure Tank (sm b ullet) CAS 15-23-01, Underground Radioactive Material Area (sm b ullet) CAS 15-23-03, Contaminated Sump, Piping From January 24, 2005 through April 14, 2005, CAU 543 site characterization activities were conducted, and are reported in Appendix A of the CAU 543 Corrective Action Decision Document (CADD) (U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office [NNSA/NSO], 2005). The recommended corrective action as stated in the approved CADD is No Further Action for five of the CAU 543 CASs, and Closure In Place for the remaining two CASs

  2. Rational Design of Mini-Cas9 for Transcriptional Activation.

    Science.gov (United States)

    Ma, Dacheng; Peng, Shuguang; Huang, Weiren; Cai, Zhiming; Xie, Zhen

    2018-04-20

    Nuclease dead Cas9 (dCas9) has been widely used for modulating gene expression by fusing with different activation or repression domains. However, delivery of the CRISPR/Cas system fused with various effector domains in a single adeno-associated virus (AAV) remains challenging due to the payload limit. Here, we engineered a set of downsized variants of Cas9 including Staphylococcus aureus Cas9 (SaCas9) that retained DNA binding activity by deleting conserved functional domains. We demonstrated that fusing FokI nuclease domain to the N-terminal of the minimal SaCas9 (mini-SaCas9) or to the middle of the split mini-SaCas9 can trigger efficient DNA cleavage. In addition, we constructed a set of compact transactivation domains based on the tripartite VPR activation domain and self-assembled arrays of split SpyTag:SpyCatch peptides, which are suitable for fusing to the mini-SaCas9. Lastly, we produced a single AAV containing the mini-SaCas9 fused with a downsized transactivation domain along with an optimized gRNA expression cassette, which showed efficient transactivation activity. Our results highlighted a practical approach to generate down-sized CRISPR/Cas9 and gene activation systems for in vivo applications.

  3. Remediation of uranium contaminated sites: clean-up activities in Serbia

    International Nuclear Information System (INIS)

    Raicevic, S.; Raicevic, J. . E-mail address of corresponding author: raich@beotel.yu; Raicevic, S.)

    2005-01-01

    One of the serious environmental problems in Serbia represent sites contaminated with depleted uranium (DU) during past war activities. According to UNEP reports and our findings there are two types of contamination: (i) localized points of high, concentrated contamination where DU penetrators enter the soil, and (ii) low level of widespread DU contamination, which indicates that during the conflict DU dust was dispersed into the environment. Remediation of these sites is an urgent need because they represent a permanent threat to the population living in this area. Here we give a brief description of approaches commonly used in remediation of DU contaminated sites, and an overview of current clean-up activities performed in Serbia. (author)

  4. Tenth anniversary of CAS ONLINE service : What CAS services should be in the new era of chemical information

    Science.gov (United States)

    Kostakos, Charles N.

    Chemical Abstracts Service celebrated 10th anniversary of CAS online information service in 1990. A speech given on the occasion reviewed history of the CAS ONLINE, in relation to its most important benefits for scientists and engineers. The development of STN international, the network through which CAS ONLINE is accessible around the world, was also discussed in the speech. The CAS ONLINE now contains a wide variety of files relating to chemical field including CA file, Registry file. CA previews,. CASREACT, CIN. MARPAT, etc for supplying chemical information worldwide.

  5. Some particular aspects of control in nuclear power reactors; Quelques aspects particuliers du controle dans les piles atomiques de puissance

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Furet, J [Commissariat a l' Energie Atomique, Saclay (France). Centre d' Etudes Nucleaires; Pupponi, J [Electricite de France (EDF), 75 - Paris (France)

    1964-07-01

    les differents laboratoires du Commissariat a l'Energie Atomique et de l'Electricite de France. A - Dans le domaine de l'instrumentation, ces etudes portent actuellement sur les technologies utilisees pour le developpement des detecteurs et cables susceptibles de fonctionner a haute temperature; sous rayonnement {gamma} eleve - et sur les techniques d'electronique rapide appliquees aux chambres a fissions qui permettent de faire des mesures de flux neutronique sous rayonnement {gamma} eleve (105 R/h). B - Dans le domaine general du controle et de la securite, les difficultes de redemarrage liees aux empoisonnements par les produits de fission conduisent a des etudes approfondies sur le comportement du reacteur en regime sous-critique. Les perturbations apportees aux mesures neutroniques par le mouvement des barres de controle necessitent une nouvelle organisation des chaines de mesure et de securite neutronique faisant intervenir au niveau de puissance des parametres correcteurs tels que: puissance thermique, temperature, activation Azote 16. En ce qui concerne les demarrages rapides, deux methodes nouvelles sont decrites liees essentiellement a la mesure du taux de fissions en fonction du temps, soit dans le cas d'une liberation continue a vitesse constante et elevee de reactivite, soit dans le cas d'une liberation de reactivite par paliers. Par ailleurs, l'application des techniques de deplacement automatique des detecteurs dans le cas des demarrages normaux semblent apporter une solution rationnelle au controle et a la securite. C - Dans le cadre des techniques ci-dessus, on decrit les dispositifs retenus pour la mesure et le controle de la puissance de la pile EDF III. (auteurs)

  6. 2006 Annual Summary Report for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada Test Site, Nye County, Nevada

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Gregory J, Shott, Vefa Yucel

    2007-03-01

    The Maintenance Plan for the Performance Assessments and Composite Analyses for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada Test Site (National Security Technologies, LLC, 2006) requires an annual review to assess the adequacy of the performance assessments (PAs) and composite analyses (CAs) for each of the facilities, with the results submitted as an annual summary report to the U.S. Department of Energy (DOE) Headquarters. The Disposal Authorization Statements for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites (RWMSs) also require that such reviews be made and that secondary or minor unresolved issues be tracked and addressed as part of the maintenance plan (DOE, 2000; 2002). The DOE, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office performed annual reviews in fiscal year (FY) 2006 by evaluating operational factors and research results that impact the continuing validity of the PAs and CAs results. This annual summary report presents data and conclusions from the FY 2006 review, and determines the adequacy of the PAs and CAs. Operational factors, such as the waste form and containers, facility design, waste receipts, and closure plans, as well as monitoring results and research and development (R&D) activities, were reviewed in FY 2006 for determination of the adequacy of the PAs. Likewise, the environmental restoration activities at the Nevada Test Site relevant to the sources of residual radioactive material that are considered in the CAs, the land-use planning, and the results of the environmental monitoring and R&D activities were reviewed for determination of the adequacy of the CAs.

  7. 2006 Annual Summary Report for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada Test Site, Nye County, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    Gregory J; Shott, Vefa Yucel

    2007-01-01

    The Maintenance Plan for the Performance Assessments and Composite Analyses for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada Test Site (National Security Technologies, LLC, 2006) requires an annual review to assess the adequacy of the performance assessments (PAs) and composite analyses (CAs) for each of the facilities, with the results submitted as an annual summary report to the U.S. Department of Energy (DOE) Headquarters. The Disposal Authorization Statements for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites (RWMSs) also require that such reviews be made and that secondary or minor unresolved issues be tracked and addressed as part of the maintenance plan (DOE, 2000; 2002). The DOE, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office performed annual reviews in fiscal year (FY) 2006 by evaluating operational factors and research results that impact the continuing validity of the PAs and CAs results. This annual summary report presents data and conclusions from the FY 2006 review, and determines the adequacy of the PAs and CAs. Operational factors, such as the waste form and containers, facility design, waste receipts, and closure plans, as well as monitoring results and research and development (R and D) activities, were reviewed in FY 2006 for determination of the adequacy of the PAs. Likewise, the environmental restoration activities at the Nevada Test Site relevant to the sources of residual radioactive material that are considered in the CAs, the land-use planning, and the results of the environmental monitoring and R and D activities were reviewed for determination of the adequacy of the CAs

  8. [Fond du Lac archeological resources within the Draft Area Recommendation Report

    International Nuclear Information System (INIS)

    Danz, D.L.

    1986-01-01

    Research into archaeological resources of the Fond du Lac Band within the DOE proposed high-level nuclear waste sites resulted in the discovery of four traditional ancestral sites. A number of ancestral sites that are located within other proposed repository sites were also discovered

  9. Tentative d'évaluation du systéme d'information marketing au niveau des banques publiques Algériennes

    OpenAIRE

    Hassaine-kazi-tani, Amel

    2014-01-01

    Le premier chapitre présente les fondements théoriques relatifs au marketing, marketing des services et notamment le marketing bancaire.dans le deuxiéme chapitre seront développées les notions de base du concept d'information et celui de systéme d'information et puis le systéme d'information marketing.le troisiéme chapitre pratique présente une étude de cas auprés des banques publiques Algériennes.

  10. A kinetic study of the reaction of water vapor and carbon dioxide on uranium; Cinetique de la reaction de la vapeur d'eau et du dioxyde de carbone sur l'uranium

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Santon, J P [Commissariat a l' Energie Atomique, Grenoble (France). Centre d' Etudes Nucleaires

    1964-09-15

    The kinetic study of the reaction of water vapour and carbon dioxide with uranium has been performed by thermogravimetric methods at temperatures between 160 and 410 deg G in the first case, 350 and 1050 deg C in the second: Three sorts of uranium specimens were used: uranium powder, thin evaporated films, and small spheres obtained from a plasma furnace. The experimental results led in the case of water vapour, to a linear rate of reaction controlled by diffusion at the lower temperatures, and by a surface reaction at the upper ones. In the case of carbon dioxide, a parabolic law has been found, controlled by diffusional processes. (author) [French] L'etude cinetique de la reaction de la vapeur d'eau et du dioxyde de carbone sur l'uranium a ete entreprise au moyen de methodes thermogravimetriques, dans te premier cas entre 160 et 410 deg C et dans le second entre 350 et 1050 deg C. Le materiau utilise se presentait sous trois formes: poudres, couches minces evaporees et billes obtenues par fusion en chalumeau a plasma. Les resultats experimentaux ont permis de mettre en evidence, dans le cas de la vapeur d'eau, une cinetique lineaire controlee par la diffusion a basse temperature et d'interface a haute temperature. Dans le cas du dioxyde de carbone par contre, on trouve une cinetique parabolique controlee par la diffusion. (auteur)

  11. Pratiques sacrificielles et funéraires au site Moche de la Huaca de La Luna, côte nord du Pérou

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    1998-01-01

    Full Text Available De récentes recherches archéologiques au site Moche de la Huaca de la Luna ont conduit à la découverte d’un important site sacrificiel et d’une plate-forme funéraire. Dans une enceinte située vers l’arrière du temple et jointe à la plate-forme principale, plusieurs individus auraient été sacrifiés lors de pluies torrentielles (phénomène de El Niño. Dans une structure attenante au site sacrificiel, des tombes ont également été localisées dont celles de deux officiants religieux. Des artefacts retrouvés dans ces sépultures semblent indiquer que ceux-ci étaient des spécialistes du sacrifice. Certains résultats préliminaires seront présentés ici. Il appert d’ores et déjà que ce site exceptionnel permettra de mieux comprendre les dimensions funéraires et sacrificielles du système idéologique et religieux Moche. PRÁCTICAS SACRIFICIALES Y FUNERARIAS EN EL SITIO MOCHE DE LA HUACA DE LA LUNA, COSTA NORTE DEL PERÚ. Investigaciones arqueológicas realizadas en el sitio Moche de la Huaca de la Luna han conducido al descubrimiento de un importante sitio sacrificial y de una plataforma funeraria. En primer lugar, en una plaza de la Huaca, numerosos individuos habrían sido sacrificados durante lluvias torrenciales (fenómeno de El Niño. En segundo lugar, en una plataforma asociada a la plaza, cuatro tumbas elaboradas han sido localizadas. Algunos elementos descubiertos en dos de estas tumbas parecen indicar que serían las de dos especialistas de los sacrificios. Solamente los resultados preliminares estarán presentados aquí, pero parece que este sitio excepcional permitirá comprender mejor las dimensiones funerarias y sacrificiales del sistema ideológico y religioso Moche. SACRIFICIAL AND FUNERARY PRACTICES AT THE MOCHE SITE HUACA DE LA LUNA, NORTH COAST OF PERU. Archaeological research carried out at the Moche site of Huaca de la Luna has led to the discovery of a sacrificial site and a funerary platform. A number

  12. Recherche chronologique sur la culture mochica du Pérou : datation de la tombe du Prêtre de Sipán par thermoluminescence (TL) et par radiocarbone

    OpenAIRE

    Roque, Céline; Vartanian, Emmanuel; Guibert, Pierre; Schvoerer, Max; Lévine, Daniel; Alva, Walter; Jungner, Hogne

    2007-01-01

    La culture mochica du Pérou et le site de Sipán : problématique chronologiqueDe l’importance des recherches chronologiques sur la culture mochica du PérouLa culture Moche, ou mochica, est sans doute l’une des plus brillantes de l’époque pré-Inca. Elle s’épanouit sur la côte nord du Pérou, parallèlement aux civilisations Paracas Nécropolis et Nasca, qui se développent sur la côte sud du pays. Elle marque l’apogée d’un art particulièrement raffiné qui se manifeste notamment à travers l’orfèvrer...

  13. Corrective Action Investigation Plan for Corrective Action Unit 550: Smoky Contamination Area Nevada National Security Site, Nevada, Revision 0

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Grant Evenson

    2012-05-01

    Corrective Action Unit (CAU) 550 is located in Areas 7, 8, and 10 of the Nevada National Security Site, which is approximately 65 miles northwest of Las Vegas, Nevada. CAU 550, Smoky Contamination Area, comprises 19 corrective action sites (CASs). Based on process knowledge of the releases associated with the nuclear tests and radiological survey information about the location and shape of the resulting contamination plumes, it was determined that some of the CAS releases are co-located and will be investigated as study groups. This document describes the planned investigation of the following CASs (by study group): (1) Study Group 1, Atmospheric Test - CAS 08-23-04, Atmospheric Test Site T-2C; (2) Study Group 2, Safety Experiments - CAS 08-23-03, Atmospheric Test Site T-8B - CAS 08-23-06, Atmospheric Test Site T-8A - CAS 08-23-07, Atmospheric Test Site T-8C; (3) Study Group 3, Washes - Potential stormwater migration of contaminants from CASs; (4) Study Group 4, Debris - CAS 08-01-01, Storage Tank - CAS 08-22-05, Drum - CAS 08-22-07, Drum - CAS 08-22-08, Drums (3) - CAS 08-22-09, Drum - CAS 08-24-03, Battery - CAS 08-24-04, Battery - CAS 08-24-07, Batteries (3) - CAS 08-24-08, Batteries (3) - CAS 08-26-01, Lead Bricks (200) - CAS 10-22-17, Buckets (3) - CAS 10-22-18, Gas Block/Drum - CAS 10-22-19, Drum; Stains - CAS 10-22-20, Drum - CAS 10-24-10, Battery. These sites are being investigated because existing information on the nature and extent of potential contamination is insufficient to evaluate and recommend corrective action alternatives (CAAs). Additional information will be obtained by conducting a corrective action investigation before evaluating CAAs and selecting the appropriate corrective action for each study group. The results of the field investigation will support a defensible evaluation of viable CAAs that will be presented in the Corrective Action Decision Document. The sites will be investigated based on the data quality objectives (DQOs) developed

  14. CLOSURE REPORT FOR CORRECTIVE ACTION UNIT 390: AREAS 9, 10, AND 12 SPILL SITES, NEVADA TEST SITE, NEVADA

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    NONE

    2005-10-01

    Corrective Action Unit (CAU) 390 consists four Corrective Action Sites (CASs) located in Areas 9, 10, and 12 of the Nevada Test Site. The closure activities performed at the CASs include: (1) CAS 09-99-03, Wax, Paraffin: 2 cubic yards of drilling polymer was removed on June 20,2005, and transported to the Area 9 Landfill for disposal. (2) CAS 10-99-01, Epoxy Tar Spill: 2 cubic feet of asphalt waste was removed on June 20,2005, and transported to the Area 9 Landfill for disposal. (3) CAS 10-99-03, Tar Spills: 3 cubic yards of deteriorated asphalt waste was removed on June 20,2005, and transported to the Area 9 Landfill for disposal. (4) CAS 12-25-03, Oil Stains (2); Container: Approximately 16 ounces of used oil were removed from ventilation equipment on June 28,2005, and recycled. One CAS 10-22-19, Drums, Stains, was originally part of CAU 390 but was transferred out of CAU 390 and into CAU 550, Drums, Batteries, and Lead Materials. The transfer was approved by the Nevada Division of Environmental Protection on August 19,2005, and a copy of the approval letter is included in Appendix D of this report.

  15. Disabling Cas9 by an anti-CRISPR DNA mimic.

    Science.gov (United States)

    Shin, Jiyung; Jiang, Fuguo; Liu, Jun-Jie; Bray, Nicolas L; Rauch, Benjamin J; Baik, Seung Hyun; Nogales, Eva; Bondy-Denomy, Joseph; Corn, Jacob E; Doudna, Jennifer A

    2017-07-01

    CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats)-Cas9 gene editing technology is derived from a microbial adaptive immune system, where bacteriophages are often the intended target. Natural inhibitors of CRISPR-Cas9 enable phages to evade immunity and show promise in controlling Cas9-mediated gene editing in human cells. However, the mechanism of CRISPR-Cas9 inhibition is not known, and the potential applications for Cas9 inhibitor proteins in mammalian cells have not been fully established. We show that the anti-CRISPR protein AcrIIA4 binds only to assembled Cas9-single-guide RNA (sgRNA) complexes and not to Cas9 protein alone. A 3.9 Å resolution cryo-electron microscopy structure of the Cas9-sgRNA-AcrIIA4 complex revealed that the surface of AcrIIA4 is highly acidic and binds with a 1:1 stoichiometry to a region of Cas9 that normally engages the DNA protospacer adjacent motif. Consistent with this binding mode, order-of-addition experiments showed that AcrIIA4 interferes with DNA recognition but has no effect on preformed Cas9-sgRNA-DNA complexes. Timed delivery of AcrIIA4 into human cells as either protein or expression plasmid allows on-target Cas9-mediated gene editing while reducing off-target edits. These results provide a mechanistic understanding of AcrIIA4 function and demonstrate that inhibitors can modulate the extent and outcomes of Cas9-mediated gene editing.

  16. Ostéogenèse imparfaite: à propos de quatre cas à Ouagadougou (Burkina Faso)

    Science.gov (United States)

    Kaboré, Aïssata; Cissé, Aissata; Yonaba, Caroline; Savadogo, Hamidou; Ouédraogo, Sylvie Armelle; Dao, Lassina; Kaboret, Sonia; Nagalo, Kisito; Koueta, Fla; Bandré, Emile; Yé, Diarra; Kam, Ludovic

    2015-01-01

    L'ostéogenèse imparfaite (OI) regroupe un ensemble d'affections constitutionnelles de gravité variable dû à une anomalie de la production du collagène et de la matrice de l'os entraînant une fragilité osseuse. La présente étude rapporte quatre cas d'ostéogenèse imparfaite suivis aux Centres Hospitaliers Universitaires Charles de Gaulle et Yalgado Ouédraogo. Le but de ce travail était d'analyser les aspects cliniques, thérapeutiques et évolutifs de la maladie. Cette étude souligne la nécessité d'améliorer la prise en charge de cette maladie rare mais non exceptionnelle et handicapante. PMID:26834922

  17. Determining the Specificity of Cascade Binding, Interference, and Primed Adaptation In Vivo in the Escherichia coli Type I-E CRISPR-Cas System

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Lauren A. Cooper

    2018-04-01

    Full Text Available In clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR-Cas (CRISPR-associated immunity systems, short CRISPR RNAs (crRNAs are bound by Cas proteins, and these complexes target invading nucleic acid molecules for degradation in a process known as interference. In type I CRISPR-Cas systems, the Cas protein complex that binds DNA is known as Cascade. Association of Cascade with target DNA can also lead to acquisition of new immunity elements in a process known as primed adaptation. Here, we assess the specificity determinants for Cascade-DNA interaction, interference, and primed adaptation in vivo, for the type I-E system of Escherichia coli. Remarkably, as few as 5 bp of crRNA-DNA are sufficient for association of Cascade with a DNA target. Consequently, a single crRNA promotes Cascade association with numerous off-target sites, and the endogenous E. coli crRNAs direct Cascade binding to >100 chromosomal sites. In contrast to the low specificity of Cascade-DNA interactions, >18 bp are required for both interference and primed adaptation. Hence, Cascade binding to suboptimal, off-target sites is inert. Our data support a model in which the initial Cascade association with DNA targets requires only limited sequence complementarity at the crRNA 5′ end whereas recruitment and/or activation of the Cas3 nuclease, a prerequisite for interference and primed adaptation, requires extensive base pairing.

  18. Le renouvellement des pratiques territoriales a travers la fonction alimentaire. Leçons a partir du cas « Saveurs du Coin » et du projet Confluent 1

    OpenAIRE

    Buclet , Nicolas; Debuisson , Marion

    2015-01-01

    National audience; Les politiques alimentaires représentent un enjeu politique fondamental pour les sociétés, dictant parfois des orientations d'aménagement urbain dans le but de garantir la sécurité alimentaire pour un territoire donné. Les politiques d'aménagement se sont longtemps détournées du système alimentaire, laissant la définition de sa stratégie et de son organisation aux acteurs privés. Ajouté à cette évolution des échelles de décision, un changement de périmètre d'action s'est op...

  19. Closure Report for Corrective Action Unit 543: Liquid Disposal Units, Nevada Test Site, Nevada

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    NSTec Environmental Restoration

    2008-01-01

    This Closure Report (CR) documents closure activities for Corrective Action Unit (CAU) 543, Liquid Disposal Units, according to the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO, 1996) and the Corrective Action Plan (CAP) for CAU 543 (U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office [NNSA/NSO], 2007). CAU 543 is located at the Nevada Test Site (NTS), Nevada (Figure 1), and consists of the following seven Corrective Action Sites (CASs): CAS 06-07-01, Decon Pad; CAS 15-01-03, Aboveground Storage Tank; CAS 15-04-01, Septic Tank; CAS 15-05-01, Leachfield; CAS 15-08-01, Liquid Manure Tank; CAS 15-23-01, Underground Radioactive Material Area; CAS 15-23-03, Contaminated Sump, Piping; and CAS 06-07-01 is located at the Decontamination Facility in Area 6, adjacent to Yucca Lake. The remaining CASs are located at the former U.S. Environmental Protection Agency (EPA) Farm in Area 15. The purpose of this CR is to provide a summary of the completed closure activities, to document waste disposal, and to present analytical data confirming that the remediation goals were met. The closure alternatives consisted of closure in place for two of the CASs, and no further action with implementation of best management practices (BMPs) for the remaining five CASs.

  20. The new CAS-DIS digital ionosonde

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Wang Shun

    2013-04-01

    Full Text Available A high quality digital ionosonde called the Chinese Academy of Sciences digital ionosonde (CAS-DIS has been developed for investigations of the ionosphere. Two important features are used for the CAS-DIS; first, the technique of analog down-conversion has been replaced by the new approach of digital down-conversion technology. Secondly, to solve the problem of large instantaneous receiving bandwidth in digital receivers, an analog narrowband tracking filter is used for the CAS-DIS. The center frequency of the filter tracks the carrier frequency transmitted in real-time, to ensure that the frequency components are filtered out of the effective bandwidth. This report describes the system architecture of the CAS-DIS, its main features, and its test results for ionosphere detection. 

  1. Sulfonamide inhibition studies of two β-carbonic anhydrases from the ascomycete fungus Sordaria macrospora, CAS1 and CAS2.

    Science.gov (United States)

    Vullo, Daniela; Lehneck, Ronny; Pöggeler, Stefanie; Supuran, Claudiu T

    2018-12-01

    The two β-carbonic anhydrases (CAs, EC 4.2.1.1) recently cloned and purified from the ascomycete fungus Sordaria macrospora, CAS1 and CAS2, were investigated for their inhibition with a panel of 39 aromatic, heterocyclic, and aliphatic sulfonamides and one sulfamate, many of which are clinically used agents. CAS1 was efficiently inhibited by tosylamide, 3-fluorosulfanilamide, and 3-chlorosulfanilamide (K I s in the range of 43.2-79.6 nM), whereas acetazolamide, methazolamide, topiramate, ethoxzolamide, dorzolamide, and brinzolamide were medium potency inhibitors (K I s in the range of 360-445 nM). CAS2 was less sensitive to sulfonamide inhibitors. The best CAS2 inhibitors were 5-amino-1,3,4-thiadiazole-2-sulfonamide (the deacetylated acetazolamide precursor) and 4-hydroxymethyl-benzenesulfonamide, with K I s in the range of 48.1-92.5 nM. Acetazolamide, dorzolamide, ethoxzolamide, topiramate, sulpiride, indisulam, celecoxib, and sulthiame were medium potency CAS2 inhibitors (K I s of 143-857 nM). Many other sulfonamides showed affinities in the high micromolar range or were ineffective as CAS1/2 inhibitors. Small changes in the structure of the inhibitor led to important differences of the activity. As these enzymes may show applications for the removal of anthropically generated polluting gases, finding modulators of their activity may be crucial for designing environmental-friendly CO 2 capture processes.

  2. Surdité brusque: étude rétrospective à propos de 36 cas

    Science.gov (United States)

    Nadour, Karim; Chihani, Mehdi; Darouassi, Youssef; Touati, Mliha; Moujahid, Mountassir; Ammar, Haddou; Bouaity, Brahim

    2014-01-01

    L'Objectif de cette étude est de rapporter notre expérience concernant la prise en charge des surdités brusques en soulignant la notion d'urgence, et en montrant les facteurs influant la probabilité de récupération. Nous rapportons une étude rétrospective concernant 36 patients colligés au service ORL de l'Hôpital Militaire Avicenne de Marrakech au Maroc, pendant 05 ans. Uniquement les surdités brusques unilatérales ont été incluses dans notre étude. Il s'agit de 21 oreilles droites et 15 gauches. Les données cliniques étaient recueillies par l'interrogatoire et l'examen clinique complet. L’évolution du déficit auditif a été évaluée à l'admission, toutes les 48 heures et après arrêt du traitement par audiométrie tonale liminaire. Tous nos patients ont bénéficié des potentiels évoqués auditifs du tronc cérébral, 09 d'entre eux d'une tomodensitométrie. Une IRM a été réalisée chez une seule patiente. Le protocole thérapeutique comprend des corticostéroïdes, vasodilatateurs. Seulement 16,6% des patients ont récupéré la totalité de la perte auditive initiale. Les potentiels évoqués auditifs (P.E.A) ont décelé un cas de neurinome de l'acoustique confirmé par l'imagerie. PMID:25995795

  3. Caractérisation intégrée du vignoble alsacien : aspects méthodologiques et application à l'étude des composantes naturelles des principaux terroirs

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Éric Lebon

    1993-12-01

    Full Text Available Parmi les méthodes utilisées en vue de la définition des potentialités viticoles, l'approche intégrée des terroirs fondée sur la notion de séquence écogéopédologique développée en Moyenne Vallée de la Loire par l'INRA d'Angers s'est révélée particulièrement performante. Son application à la caractérisation du vignoble d'Alsace, fondamentalement différent sur le plan de sa structure géologique, nécessite un certain nombre d'aménagements méthodologiques liés à une variabilité paysagère marquée. Ainsi, une typologie des paysages s'appuyant sur des paramètres tels que l'ouverture du paysage, la répartition et l'orientation des masques est proposée. Elle vient compléter les descripteurs stationnels classiques (altitude, pente et exposition. Le concept de séquence écogéopédologique reste pertinent dans ce contexte moyennant l'adjonction du paramètre exposition, dans le cas des terroirs sur versants. Dans cette optique, les caractéristiques des composantes naturelles des grands types de terroirs alsaciens sont présentées à partir de l'étude de cas concrets.

  4. CRISPR/Cas9 as tool for functional study of genes involved in preimplantation embryo development.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jeongwoo Kwon

    Full Text Available The CRISPR/Cas9 system has proven to be an efficient gene-editing tool for genome modification of cells and organisms. However, the applicability and efficiency of this system in pig embryos have not been studied in depth. Here, we aimed to remove porcine OCT4 function as a model case using the CRISPR/Cas9 system. Injection of Cas9 and single-guide RNA (sgRNA against OCT4 decreased the percentages of OCT4-positive embryos to 37-50% of total embryos, while ~100% of control embryos exhibited clear OCT4 immunostaining. We assessed the mutation status near the guide sequence using polymerase chain reaction (PCR and DNA sequencing, and a portion of blastocysts (20% in exon 2 and 50% in exon 5 had insertions/deletions near protospacer-adjacent motifs (PAMs. Different target sites had frequent deletions, but different concentrations of sgRNA made no impact. OCT4 mRNA levels dramatically decreased at the 8-cell stage, and they were barely detectable in blastocysts, while mRNA levels of other genes, including NANOG, and CDX2 were not affected. In addition, the combination of two sgRNAs led to large-scale deletion (about 1.8 kb in the same chromosome. Next, we injected an enhanced green fluorescent protein (eGFP vector targeting the OCT4 exon with Cas9 and sgRNA to create a knockin. We confirmed eGFP fluorescence in blastocysts in the inner cell mass, and also checked the mutation status using PCR and DNA sequencing. A significant portion of blastocysts had eGFP sequence insertions near PAM sites. The CRISPR/CAS9 system provides a good tool for gene functional studies by deleting target genes in the pig.

  5. Cas Clinique

    African Journals Online (AJOL)

    du rein droit un volumineux AMLR polaire inférieur de 7 cm sans signe hémorragique ... anatomopathologique définitif a confirmé le diagnostic d'AMLR hémorragique sans signes .... du rein gauche aurait pu être proposée le lendemain de l'admission pour mettre la patiente à l'abri. (relatif) d'une récidive hémorragique et ...

  6. Bacterial CRISPR/Cas DNA endonucleases: A revolutionary technology that could dramatically impact viral research and treatment

    International Nuclear Information System (INIS)

    Kennedy, Edward M.; Cullen, Bryan R.

    2015-01-01

    CRISPR/Cas systems mediate bacterial adaptive immune responses that evolved to protect bacteria from bacteriophage and other horizontally transmitted genetic elements. Several CRISPR/Cas systems exist but the simplest variant, referred to as Type II, has a single effector DNA endonuclease, called Cas9, which is guided to its viral DNA target by two small RNAs, the crRNA and the tracrRNA. Initial efforts to adapt the CRISPR/Cas system for DNA editing in mammalian cells, which focused on the Cas9 protein from Streptococcus pyogenes (Spy), demonstrated that Spy Cas9 can be directed to DNA targets in mammalian cells by tracrRNA:crRNA fusion transcripts called single guide RNAs (sgRNA). Upon binding, Cas9 induces DNA cleavage leading to mutagenesis as a result of error prone non-homologous end joining (NHEJ). Recently, the Spy Cas9 system has been adapted for high throughput screening of genes in human cells for their relevance to a particular phenotype and, more generally, for the targeted inactivation of specific genes, in cell lines and in vivo in a number of model organisms. The latter aim seems likely to be greatly enhanced by the recent development of Cas9 proteins from bacterial species such as Neisseria meningitidis and Staphyloccus aureus that are small enough to be expressed using adeno-associated (AAV)-based vectors that can be readily prepared at very high titers. The evolving Cas9-based DNA editing systems therefore appear likely to not only impact virology by allowing researchers to screen for human genes that affect the replication of pathogenic human viruses of all types but also to derive clonal human cell lines that lack individual gene products that either facilitate or restrict viral replication. Moreover, high titer AAV-based vectors offer the possibility of directly targeting DNA viruses that infect discrete sites in the human body, such as herpes simplex virus and hepatitis B virus, with the hope that the entire population of viral DNA genomes

  7. Bacterial CRISPR/Cas DNA endonucleases: A revolutionary technology that could dramatically impact viral research and treatment

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Kennedy, Edward M.; Cullen, Bryan R., E-mail: bryan.cullen@duke.edu

    2015-05-15

    CRISPR/Cas systems mediate bacterial adaptive immune responses that evolved to protect bacteria from bacteriophage and other horizontally transmitted genetic elements. Several CRISPR/Cas systems exist but the simplest variant, referred to as Type II, has a single effector DNA endonuclease, called Cas9, which is guided to its viral DNA target by two small RNAs, the crRNA and the tracrRNA. Initial efforts to adapt the CRISPR/Cas system for DNA editing in mammalian cells, which focused on the Cas9 protein from Streptococcus pyogenes (Spy), demonstrated that Spy Cas9 can be directed to DNA targets in mammalian cells by tracrRNA:crRNA fusion transcripts called single guide RNAs (sgRNA). Upon binding, Cas9 induces DNA cleavage leading to mutagenesis as a result of error prone non-homologous end joining (NHEJ). Recently, the Spy Cas9 system has been adapted for high throughput screening of genes in human cells for their relevance to a particular phenotype and, more generally, for the targeted inactivation of specific genes, in cell lines and in vivo in a number of model organisms. The latter aim seems likely to be greatly enhanced by the recent development of Cas9 proteins from bacterial species such as Neisseria meningitidis and Staphyloccus aureus that are small enough to be expressed using adeno-associated (AAV)-based vectors that can be readily prepared at very high titers. The evolving Cas9-based DNA editing systems therefore appear likely to not only impact virology by allowing researchers to screen for human genes that affect the replication of pathogenic human viruses of all types but also to derive clonal human cell lines that lack individual gene products that either facilitate or restrict viral replication. Moreover, high titer AAV-based vectors offer the possibility of directly targeting DNA viruses that infect discrete sites in the human body, such as herpes simplex virus and hepatitis B virus, with the hope that the entire population of viral DNA genomes

  8. Carcinome à cellule vitreuse du col de l'utérus: à propos d'un cas et revue de littérature

    Science.gov (United States)

    Hakimi, Ihssane; Zazi, Abdelghani; Chahdi, Hafsa; Guelzim, Khalid; Kouach, Jaouad; Babahabib, Myabdellah; Elhassani, Myehdi; Rahali, Driss Moussaoui; Dehayni, Mohammed

    2015-01-01

    Le carcinome à cellule vitreuse du col de l'utérus est un type de histologique rare de cancer du col de l'utérus qui survient à un âge plus jeune, et s'associe au risque élevé d’échec thérapeutique et le pronostic est plus mauvais en comparaison au type cellulaire squameux. La radiothérapie est associée au risque diminué de récidive. Le but de cette étude est de récapituler à travers d'une observation et une revue de littérature les données sur l'incidence, le comportement clinique et la survie globale de patients avec le carcinome à cellule vitreuse du col de l'utérus. PMID:26664556

  9. Efficient CRISPR/Cas9-Mediated Genome Editing Using a Chimeric Single-Guide RNA Molecule

    KAUST Repository

    Butt, Haroon; Eid, Ayman; Ali, Zahir; Atia, Mohamed A. M.; Mokhtar, Morad M.; Hassan, Norhan; Lee, Ciaran M.; Bao, Gang; Mahfouz, Magdy M.

    2017-01-01

    used CRISPR/Cas9 to generate targeted double-strand breaks and to deliver an RNA repair template for HDR in rice (Oryza sativa). We used chimeric single-guide RNA (cgRNA) molecules carrying both sequences for target site specificity (to generate

  10. [CRISPR/CAS9, the King of Genome Editing Tools].

    Science.gov (United States)

    Bannikov, A V; Lavrov, A V

    2017-01-01

    The discovery of CRISPR/Cas9 brought a hope for having an efficient, reliable, and readily available tool for genome editing. CRISPR/Cas9 is certainly easy to use, while its efficiency and reliability remain the focus of studies. The review describes the general principles of the organization and function of Cas nucleases and a number of important issues to be considered while planning genome editing experiments with CRISPR/Cas9. The issues include evaluation of the efficiency and specificity for Cas9, sgRNA selection, Cas9 variants designed artificially, and use of homologous recombination and nonhomologous end joining in DNA editing.

  11. Évaluation de la restauration des rivières chenalisées pour le flottage du bois : étude du cas de la rivière Kutinjoki, Finlande du Nord

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    HUUSKO A.

    1995-04-01

    Full Text Available Au cours de la dernière décennie, plusieurs projets de restauration de rivières à grande échelle ont été initiés en Finlande, afin de réhabiliter la structure originale de l'habitat dans des rivières chenalisées pour le flottage du bois dans les années 1950-1960. L'objectif principal de la restauration est d'augmenter la diversité des berges et d'améliorer l'habitat des poissons en réarrangeant le substrat sur le fond de la rivière. Les digues de blocs utilisées sur la rivière Kutinjoki ont augmenté la diversité et la variabilité des profondeurs, des vitesses et des classes de substrats dominants disponibles, et ont augmenté la complexité spatiale des rapides. Sur les sites étudiés, les successions radiers-mouilles étaient clairement visibles après restauration et contrastaient avec les écoulements plus ou moins homogènes d'avant restauration. L'opération de restauration semble favoriser les truites de un an (1+ et plus. Si l'on souhaite planifier et évaluer ce type d'amélioration de l'habitat piscicole, il est fortement conseillé d'utiliser une modélisation des conditions physiques et hydrologiques à une échelle pertinente pour les poissons et d'y inclure une analyse des préférences d'habitat des poissons.

  12. CRISPR/Cas9 for cancer research and therapy.

    Science.gov (United States)

    Zhan, Tianzuo; Rindtorff, Niklas; Betge, Johannes; Ebert, Matthias P; Boutros, Michael

    2018-04-16

    CRISPR/Cas9 has become a powerful method for making changes to the genome of many organisms. First discovered in bacteria as part of an adaptive immune system, CRISPR/Cas9 and modified versions have found a widespread use to engineer genomes and to activate or to repress the expression of genes. As such, CRISPR/Cas9 promises to accelerate cancer research by providing an efficient technology to dissect mechanisms of tumorigenesis, identify targets for drug development, and possibly arm cells for cell-based therapies. Here, we review current applications of the CRISPR/Cas9 technology for cancer research and therapy. We describe novel Cas9 variants and how they are used in functional genomics to discover novel cancer-specific vulnerabilities. Furthermore, we highlight the impact of CRISPR/Cas9 in generating organoid and mouse models of cancer. Finally, we provide an overview of the first clinical trials that apply CRISPR/Cas9 as a therapeutic approach against cancer. Copyright © 2018 The Authors. Published by Elsevier Ltd.. All rights reserved.

  13. Diaspora et économie internationale: le cas des Sud-Africains d’origine indienne

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Frédéric Landy

    2003-03-01

    Full Text Available L’Inde rêve que la diaspora indienne joue un rôle économique comparable à celui de la diaspora chinoise pour la Chine. En comparant trois cartes de la répartition mondiale des personnes d’origine indienne et des investissements internationaux, on constate que les pays à forte communauté indienne ne sont pas toujours des partenaires économiques majeurs de l’Inde. Celle-ci demeure une référence forte pour la diaspora, parfois très ancienne. Le cas de l’Afrique du Sud illustre bien la dissolution des liens matériels entre les personnes d’origine indienne et l’Inde, aggravée par la coupure de l’apartheid: la carte de l’Inde a souvent disparu des esprits, au profit d’une Inde bien plus abstraite.

  14. Efficient generation of Rosa26 knock-in mice using CRISPR/Cas9 in C57BL/6 zygotes.

    Science.gov (United States)

    Chu, Van Trung; Weber, Timm; Graf, Robin; Sommermann, Thomas; Petsch, Kerstin; Sack, Ulrike; Volchkov, Pavel; Rajewsky, Klaus; Kühn, Ralf

    2016-01-16

    The CRISPR/Cas9 system is increasingly used for gene inactivation in mouse zygotes, but homology-directed mutagenesis and use of inbred embryos are less established. In particular, Rosa26 knock-in alleles for the insertion of transgenes in a genomic 'safe harbor' site, have not been produced. Here we applied CRISPR/Cas9 for the knock-in of 8-11 kb inserts into Rosa26 of C57BL/6 zygotes. We found that 10-20 % of live pups derived from microinjected zygotes were founder mutants, without apparent off-target effects, and up to 50 % knock-in embryos were recovered upon coinjection of Cas9 mRNA and protein. Using this approach, we established a new mouse line for the Cre/loxP-dependent expression of Cas9. Altogether, our protocols and resources support the fast and direct generation of new Rosa26 knock-in alleles and of Cas9-mediated in vivo gene editing in the widely used C57BL/6 inbred strain.

  15. Intoxication aiguë sévère par les pesticides organophosphorés: à propos de 28 cas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ali Derkaoui

    2011-03-01

    Full Text Available Les pesticides organophosphorés (POP sont des pesticides organiques de synthèse, largement utilisés en agriculture essentiellement comme insecticide, nemacide ou acaricide. Ce sont les produits agricoles, les plus incriminés dans les intoxications dans notre contexte. L’objectif de ce travail était de déterminer les caractéristiques cliniques, paracliniques, et évolutives de cette intoxication en milieu de réanimation. étude rétrospective portant sur les cas admis en réanimation (2003-2010. Les critères d’inclusion étaient d’ordre clinique, para clinique, thérapeutique et évolutif. 28 cas ont été recensés : 19 femmes et 9 hommes, âge moyen = 24,5 plus or minus 11 ans. La tentative de suicide était le principal motif d’intoxication (19cas. Le Glasgow coma score était en moyenne de 11 plus or minus 4. Le syndrome central, était présent chez 78% de nos patients, suivi du syndrome muscarinique 71% et le syndrome nicotinique dans 53% des cas. La prise en charge thérapeutique a consisté à la ventilation mécanique dans 50% des cas, l’usage des drogues vasoactives dans 14% des cas et l’administration d’un traitement antidotique dans 64% des cas. La mortalité globale était de 25%. Les pesticides organophosphorés sont les toxiques agricoles, le plus souvent incriminés dans notre contexte. Les symptômes résultent d’une importante accumulation d’Acétyle-choline (Ach dans l’organisme ; responsable de l’apparition des trois syndromes caractéristiques. Le diagnostic biologique se fait par le dosage de l’activité cholinestérasique dans le plasma. Le traitement associe des mesures symptomatiques qui reposent essentiellement sur la réanimation respiratoire et neurologique au traitement antidotique. L’évolution clinique dans ce type d’intoxication, est généralement favorable sous traitement avec régression des signes en quelques jours. Le décès est essentiellement, le fait d

  16. Cas9-triggered chain ablation of cas9 as a gene drive brake

    OpenAIRE

    Wu, Bing; Luo, Liqun; Gao, Xiaojing J.

    2016-01-01

    With the advent of clustered, regularly interspaced, short palindromic repeats (CRISPR)–CRISPR-associated protein 9 (Cas9) technology, researchers can construct gene drives that can bias the inheritance of edited alleles to alter entire populations. As demonstrated with the mutagenic chain reaction in Drosophila4, the CRISPR-Cas9 system can propagate genomic modification together with the genome-editing machinery itself. Although gene drives might have the potential to control insect-borne di...

  17. Closure Report for Corrective Action Unit 562: Waste Systems, Nevada National Security Site, Nevada

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    NSTec Environmental Restoration

    2012-08-15

    This Closure Report (CR) presents information supporting closure of Corrective Action Unit (CAU) 562, Waste Systems, and provides documentation supporting the completed corrective actions and confirmation that closure objectives for CAU 562 were met. This CR complies with the requirements of the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO) that was agreed to by the State of Nevada; the U.S. Department of Energy (DOE), Environmental Management; the U.S. Department of Defense; and DOE, Legacy Management (FFACO, 1996 as amended). CAU 562 consists of the following 13 Corrective Action Sites (CASs), located in Areas 2, 23, and 25 of the Nevada National Security Site: · CAS 02-26-11, Lead Shot · CAS 02-44-02, Paint Spills and French Drain · CAS 02-59-01, Septic System · CAS 02-60-01, Concrete Drain · CAS 02-60-02, French Drain · CAS 02-60-03, Steam Cleaning Drain · CAS 02-60-04, French Drain · CAS 02-60-05, French Drain · CAS 02-60-06, French Drain · CAS 02-60-07, French Drain · CAS 23-60-01, Mud Trap Drain and Outfall · CAS 23-99-06, Grease Trap · CAS 25-60-04, Building 3123 Outfalls Closure activities began in October 2011 and were completed in April 2012. Activities were conducted according to the Corrective Action Plan for CAU 562 (U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office [NNSA/NSO], 2011). The corrective actions included No Further Action and Clean Closure. Closure activities generated sanitary waste and hazardous waste. Some wastes exceeded land disposal limits and required offsite treatment prior to disposal. Other wastes met land disposal restrictions and were disposed in appropriate onsite or offsite landfills. NNSA/NSO requests the following: · A Notice of Completion from the Nevada Division of Environmental Protection to NNSA/NSO for closure of CAU 562 · The transfer of CAU 562 from Appendix III to Appendix IV, Closed Corrective Action Units, of the FFACO

  18. Dépendance économique aux produits forestiers non ligneux : cas des ménages riverains des forêts de Boulon et de Koflandé au Sud-Ouest du Burkina Faso

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Mathieu Ouédraogo

    2013-06-01

    Full Text Available Dépendance économique aux produits forestiers non ligneux : cas des ménages riverains des forêts de Boulon et de Koflandé au Sud-Ouest du Burkina Faso Résumé Cette étude a pour objectif d’évaluer la dépendance économique des ménages riverains des forêts de Boulon et de Koflandé aux produits forestiers non ligneux (PFNL et d’identifier les déterminants de cette dépendance. Des enquêtes ont été menées auprès de 583 ménages de 14 villages riverains de ces forêts. Les résultats montrent que le revenu moyen annuel par ménage est de 846 800 F CFA avec une contribution de 60% du revenu des cultures et 12% du revenu d’élevage. Les PFNL procurent en moyenne 72 479 F CFA par ménage et par an à près de 93% des ménages enquêtés. La dépendance économique des ménages aux PFNL est estimée à 12%. Elle diminue avec le revenu, traduisant une plus grande dépendance des ménages pauvres des PFNL. Par ailleurs, les hommes sont économiquement moins dépendants des PFNL que les femmes. Les principaux déterminants de la dépendance aux PFNL sont le statut d’autochtone, la taille du ménage, la superficie forestière et la densité de population du département qui affectent positivement la dépendance aux PFNL. Dans le cadre d’une politique de réduction de la pauvreté en milieu rural, il faut prendre des mesures qui favorisent l’accès durable des ménages les plus pauvres aux ressources forestières. Mots clés : Produits forestiers non ligneux, dépendance économique, modélisation économétrique, Burkina Faso.   Economic dependence on non-timber forest products: case of households living near the Forests of Boulon and Koflande, in the south-western of Burkina Faso Abstract This study aims at assessing the household economic dependence on non-timber forest products (NTFPs in Boulon and Koflande Forest area and the main determinants of that dependence. The data have been collected with a sample of 583

  19. Corrective Action Decision Document/Closure Report for Corrective Action Unit 383: Area E-Tunnel Sites, Nevada Test Site

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    NSTec Environmental Restoration

    2010-03-15

    This Corrective Action Decision Document/Closure Report (CADD/CR) was prepared by the Defense Threat Reduction Agency (DTRA) for Corrective Action Unit (CAU) 383, Area 12 E-Tunnel Sites, which is the joint responsibility of DTRA and the U.S. Department of Energy (DOE), National Nuclear Security Administration Nevada Site Office (NNSA/NSO). This CADD/CR is consistent with the requirements of the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO) agreed to by the State of Nevada, the DOE, and the U.S. Department of Defense. Corrective Action Unit 383 is comprised of three Corrective Action Sites (CASs) and two adjacent areas: • CAS 12-06-06, Muckpile • CAS 12-25-02, Oil Spill • CAS 12-28-02, Radioactive Material • Drainage below the Muckpile • Ponds 1, 2, and 3 The purpose of this CADD/CR is to provide justification and documentation to support the recommendation for closure with no further corrective action, by placing use restrictions at the three CASs and two adjacent areas of CAU 383.

  20. Les déterminants internes qui évaluent la performance des banques islamiques : cas de la zone de Moyen Orient et Afrique du Nord

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Hayet Dami

    2017-09-01

    Full Text Available Le but de cette recherche est d’étudier les déterminants internes qui évaluent la performance des 22 banques islamiques cotées en Bourse et ils ont appliqué la même norme comptable internationale dans la zone de Moyen Orient et Afrique du Nord en utilisant une analyse des indicateurs financiers tels que la rentabilité, la liquidité, la solvabilité et le risque de crédit, l’adéquation du capital, l’efficacité opérationnelle et l’efficacité d’allocation des ressources. Nous avons utilisé un modèle MCO avec une régression linéaire multiple comprenant de la variable dépendante (ROA ou ROE et de nombreuses variables indépendantes selon les données du panel. Les résultats empiriques indiquent que la liquidité, l’adéquation du capital, l’efficacité opérationnelle et l’efficacité d’allocation des ressources sont des déterminants significatifs dans notre étude. Par contre, les indicateurs de risque du crédit et la solvabilité ne sont pas significatifs pour évaluer la performance des banques islamiques au Moyen Orient et Afrique du Nord. Notre résultat est robust.

  1. Closure Report for Corrective Action Unit 563: Septic Systems, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    2010-01-01

    Corrective Action Unit (CAU) 563 is identified in the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO) as 'Septic Systems' and consists of the following four Corrective Action Sites (CASs), located in Areas 3 and 12 of the Nevada Test Site: (1) CAS 03-04-02, Area 3 Subdock Septic Tank; (2) CAS 03-59-05, Area 3 Subdock Cesspool; (3) CAS 12-59-01, Drilling/Welding Shop Septic Tanks; and (4) CAS 12-60-01, Drilling/Welding Shop Outfalls Closure activities were conducted from September to November 2009 in accordance with the FFACO (1996, as amended February 2008) and the Corrective Action Plan for CAU 563. The corrective action alternatives included No Further Action and Clean Closure.

  2. Closure Report for Corrective Action Unit 563: Septic Systems, Nevada Test Site, Nevada

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    NSTec Environmental Restoration

    2010-02-28

    Corrective Action Unit (CAU) 563 is identified in the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO) as “Septic Systems” and consists of the following four Corrective Action Sites (CASs), located in Areas 3 and 12 of the Nevada Test Site: · CAS 03-04-02, Area 3 Subdock Septic Tank · CAS 03-59-05, Area 3 Subdock Cesspool · CAS 12-59-01, Drilling/Welding Shop Septic Tanks · CAS 12-60-01, Drilling/Welding Shop Outfalls Closure activities were conducted from September to November 2009 in accordance with the FFACO (1996, as amended February 2008) and the Corrective Action Plan for CAU 563. The corrective action alternatives included No Further Action and Clean Closure.

  3. Recent Advances in Genome Editing Using CRISPR/Cas9

    Science.gov (United States)

    Ding, Yuduan; Li, Hong; Chen, Ling-Ling; Xie, Kabin

    2016-01-01

    The CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat)-Cas9 (CRISPR-associated nuclease 9) system is a versatile tool for genome engineering that uses a guide RNA (gRNA) to target Cas9 to a specific sequence. This simple RNA-guided genome-editing technology has become a revolutionary tool in biology and has many innovative applications in different fields. In this review, we briefly introduce the Cas9-mediated genome-editing method, summarize the recent advances in CRISPR/Cas9 technology, and discuss their implications for plant research. To date, targeted gene knockout using the Cas9/gRNA system has been established in many plant species, and the targeting efficiency and capacity of Cas9 has been improved by optimizing its expression and that of its gRNA. The CRISPR/Cas9 system can also be used for sequence-specific mutagenesis/integration and transcriptional control of target genes. We also discuss off-target effects and the constraint that the protospacer-adjacent motif (PAM) puts on CRISPR/Cas9 genome engineering. To address these problems, a number of bioinformatic tools are available to help design specific gRNAs, and new Cas9 variants and orthologs with high fidelity and alternative PAM specificities have been engineered. Owing to these recent efforts, the CRISPR/Cas9 system is becoming a revolutionary and flexible tool for genome engineering. Adoption of the CRISPR/Cas9 technology in plant research would enable the investigation of plant biology at an unprecedented depth and create innovative applications in precise crop breeding. PMID:27252719

  4. Highly specific targeted mutagenesis in plants using Staphylococcus aureus Cas9

    OpenAIRE

    Hidetaka Kaya; Masafumi Mikami; Akira Endo; Masaki Endo; Seiichi Toki

    2016-01-01

    The CRISPR/Cas9 system is an efficient and convenient tool for genome editing in plants. Cas9 nuclease derived from Streptococcus pyogenes (Sp) is commonly used in this system. Recently, Staphylococcus aureus Cas9 (SaCas9)-mediated genome editing was reported in human cells and Arabidopsis. Because SaCas9 (1053 a.a.) is smaller than SpCas9 (1368 a.a.), SaCas9 could have substantial advantages for delivering and expressing Cas9 protein, especially using virus vectors. Since the protospacer adj...

  5. Corrective Action Decision Document for Corrective Action Unit 322: Areas 1 and 3 Release Sites and Injection Wells Nevada Test Site, Nevada, Rev. No. 0

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Robert Boehlecke

    2004-12-01

    This Corrective Action Decision Document has been prepared for Corrective Action Unit (CAU) 322, Areas 1 and 3 Release Sites and Injection Wells, Nevada Test Site, Nevada, in accordance with the ''Federal Facility Agreement and Consent Order'' (1996). Corrective Action Unit 322 is comprised of the following corrective action sites (CASs): (1) 01-25-01 - AST Release Site; (2) 03-25-03 - Mud Plant and AST Diesel Release; and (3) 03-20-05 - Injection Wells and BOP Shop. The purpose of this Corrective Action Decision Document is to identify and provide the rationale for the recommendation of a corrective action alternative for each CAS within CAU 322. Corrective action investigation activities were performed from April 2004 through September 2004, as set forth in the Corrective Action Investigation Plan. The purposes of the activities as defined during the data quality objectives process were: (1) Determine if contaminants of concern (COCs) are present; (2) If COCs are present, determine their nature and extent; and (3) Provide sufficient information and data to recommend appropriate corrective actions for the CASs. Analytes detected during the corrective action investigation were evaluated against appropriate preliminary action levels to identify contaminants of concern for each corrective action site. Radiological field measurements were compared to unrestricted release criteria. Assessment of the data generated from investigation activities revealed the following: (1) CAS 01-25-01 contains an AST berm contaminated with total petroleum hydrocarbons (TPH) diesel-range organics (DRO). (2) CAS 03-25-03 includes two distinct areas: Area A where no contamination remains from a potential spill associated with an AST, and Area B where TPH-DRO contamination associated with various activities at the mud plant was identified. The Area B contamination was found at various locations and depths. (3) CAS 03-25-03 Area B contains TPH-DRO contamination at various

  6. Streamlined Approach for Environmental Restoration Plan for Corrective Action Unit 330: Areas 6, 22, and 23 Tanks and Spill Sites, Nevada Test Site, Nevada

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    T. M. Fitzmaurice

    2001-08-01

    This Streamlined Approach for Environmental restoration (SAFER) plan addresses the action necessary for the closure of Corrective Action Unit (CAU) 330, Areas 6,22, and 23 Tanks and Spill Sites. The CAUs are currently listed in Appendix III of the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO). This CAU is located at the Nevada Test Site (NTS) (Figure 1). CAU 330 consists of the following Corrective Action Sites (CASs): (1) CAS 06-02-04 - Consists of an underground tank and piping. This CAS is close to an area that was part of the Animal Investigation Program (AIP), conducted under the U.S. Public Health Service. Its purpose was to study and perform tests on the cattle and wild animals in and around the NTS that were exposed to radionuclides. It is unknown if this tank was part of these operations. (2) CAS 22-99-06 - Is a fuel spill that is believed to be a waste oil release which occurred when Camp Desert Rock was an active facility. This CAS was originally identified as being a small depression where liquids were poured onto the ground, located on the west side of Building T-1001. This building has been identified as housing a fire station, radio station, and radio net remote and telephone switchboard. (3) CAS 23-01-02 - Is a large aboveground storage tank (AST) farm that was constructed to provide gasoline and diesel storage in Area 23. The site consists of two ASTs, a concrete foundation, a surrounding earthen berm, associated piping, and unloading stations. (4) CAS 23-25-05 - Consists of an asphalt oil spill/tar release that contains a wash covered with asphalt oil/tar material, a half buried 208-liter (L) (55-gallon [gal]) drum, rebar, and concrete located in the vicinity.

  7. Etude séro-épidémiologique de la leishmaniose canine au centre du Maroc

    Science.gov (United States)

    Fellah, Hajiba; Doughmi, Oursula; Maniar, Saâd; Lalami, Abdelhakim El Ouali

    2014-01-01

    Dans le monde, la leishmaniose viscérale humaine est connue pour avoir comme principale source d'infection les Canidés domestiques et sauvages. Au centre du Maroc, les données épidémiologiques, cliniques et parasitologiques sur la leishmaniose canine, sont quasiment inexistantes. Ce travail traite une étude prospective au cours de laquelle 61 sérums canins ont été analysés par un test rapide et par l'immunofluorescence indirecte. La sensibilité du test rapide par rapport à celle de l'immunofluorescence indirecte (IFI) est de 33,33%. La fréquence de la maladie chez les chiens s’élève à 9,83% (Test Rapide) et 24,59% (IFI). 73,33% des cas canins positifs à la sérologie sont asymptomatiques. Ce sont les jeunes chiens de moins de 5 ans qui sont les plus fréquemment atteints avec une sensibilité de la race Berger Allmand à l'infection. Cette étude a permis de mettre en évidence la présence de chiens leishmaniens (15 chiens séropositifs parmi 61) et de prouver l'existence du réservoir canin. Une stratégie de prévention active doit être mise en place. PMID:25852791

  8. Kyste anévrismal osseux de la clavicule: à propos d’un cas

    Science.gov (United States)

    Bakkaly, Achraf El; Hanine, Moulay Dris; Amrani, Abdelouahed; Dendane, Anouar; El Alami, Sidi Zouhair Fellouss; Madhi, Tarik El

    2017-01-01

    Le kyste osseux anévrismal est une lésion agressive et destructrice, mais bénigne, des os longs, de la colonne vertébrale ou du bassin, touchant principalement les enfants et les jeunes adultes. Il s’agit cependant d’une véritable tumeur rare. Nous rapportons un cas d’un garçon de 8 ans,présentant une localisation très rare de kyste anévrismal, claviculaire, qui s'est initialement présenté pour une fracture sur os pathologique soit une lésion kystique bénigne. L'enfant a bénéficié d'un traitement radical avec résection complète du kyste situé au niveau de la clavicule droite avec envoi de la pièce opératoire pour étude anatomo-pathologique, confirmant notre diagnostic. L'évolution a été marquée par l'absence de récidive et un bon remodelage osseux sur le plan radiologique. Le traitement radical par résection semble permettre d'éviter la récidive. A travers notre travail, nous voulons mettre le point sur cette affection orthopédique rare en comparant nos résultats avec ceux de la littérature mondiale. PMID:28819536

  9. Production of Purified CasRNPs for Efficacious Genome Editing.

    Science.gov (United States)

    Lingeman, Emily; Jeans, Chris; Corn, Jacob E

    2017-10-02

    CRISPR-Cas systems have been harnessed as modular genome editing reagents for functional genomics and show promise to cure genetic diseases. Directed by a guide RNA, a Cas effector introduces a double stranded break in DNA and host cell DNA repair leads to the introduction of errors (e.g., to knockout a gene) or a programmed change. Introduction of a Cas effector and guide RNA as a purified Cas ribonucleoprotein complex (CasRNP) has recently emerged as a powerful approach to alter cell types and organisms. Not only does CasRNP editing exhibit increased efficacy and specificity, it avoids optimization and iteration of species-specific factors such as codon usage, promoters, and terminators. CasRNP editing has been rapidly adopted for research use in many contexts and is quickly becoming a popular method to edit primary cells for therapeutic application. This article describes how to make a Cas9 RNP and outlines its use for gene editing in human cells. © 2017 by John Wiley & Sons, Inc. Copyright © 2017 John Wiley & Sons, Inc.

  10. EasyCloneYALI: CRISPR/Cas9-based synthetic toolbox for engineering of the yeast Yarrowia lipolytica

    DEFF Research Database (Denmark)

    Holkenbrink, Carina; Dam, Marie Inger; Kildegaard, Kanchana Rueksomtawin

    2018-01-01

    . Here, we present the EasyCloneYALI genetic toolbox, which allows streamlined strain construction with high genome editing efficiencies in Y. lipolytica via the CRISPR/Cas9 technology. The toolbox allows marker-free integration of gene expression vectors into characterized genome sites as well as marker......-free deletion of genes with the help of CRISPR/Cas9. Genome editing efficiencies above 80% were achieved with transformation protocols using non-replicating DNA repair fragments (such as DNA oligos). Furthermore, the toolbox includes a set of integrative gene expression vectors with prototrophic markers...

  11. A Cas9 transgenic Plasmodium yoelii parasite for efficient gene editing.

    Science.gov (United States)

    Qian, Pengge; Wang, Xu; Yang, Zhenke; Li, Zhenkui; Gao, Han; Su, Xin-Zhuan; Cui, Huiting; Yuan, Jing

    2018-06-01

    The RNA-guided endonuclease Cas9 has applied as an efficient gene-editing method in malaria parasite Plasmodium. However, the size (4.2 kb) of the commonly used Cas9 from Streptococcus pyogenes (SpCas9) limits its utility for genome editing in the parasites only introduced with cas9 plasmid. To establish the endogenous and constitutive expression of Cas9 protein in the rodent malaria parasite P. yoelii, we replaced the coding region of an endogenous gene sera1 with the intact SpCas9 coding sequence using the CRISPR/Cas9-mediated genome editing method, generating the cas9-knockin parasite (PyCas9ki) of the rodent malaria parasite P. yoelii. The resulted PyCas9ki parasite displays normal progression during the whole life cycle and possesses the Cas9 protein expression in asexual blood stage. By introducing the plasmid (pYCs) containing only sgRNA and homologous template elements, we successfully achieved both deletion and tagging modifications for different endogenous genes in the genome of PyCas9ki parasite. This cas9-knockin PyCas9ki parasite provides a new platform facilitating gene functions study in the rodent malaria parasite P. yoelii. Copyright © 2018 Elsevier B.V. All rights reserved.

  12. Actes des 5èmes Journées Scientifiques du GDR3544 Sciences du Bois. Journées Annuelles du GDR 3544 Sciences du Bois

    OpenAIRE

    CHAPLAIN, Myriam; CARE, Sabine; GRIL, Joseph

    2016-01-01

    Le Groupement de Recherche en Sciences du bois (GDR3544 Sciences du Bois) a été créé en 2012 par le CNRS et renouvelé en 2016 pour 5 ans. La mission de ce groupement est : (1) de structurer la recherche sur le bois en France pour lui donner une visibilité nationale, (2) de contribuer au développement de la formation en sciences du bois et (3) de servir de relai aux réseaux internationaux de sciences du bois. Les 5èmes journées annuelles du GDR Bois ont été organisées à Bordeaux, au domaine du...

  13. 2009 Annual Summary Report for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada Test Site, Nye County, Nevada: Review of the Performance Assessments and Composite Analysis

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    NSTec Environmental Management

    2010-03-15

    The U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office performed an annual review of the Area 3 and Area 5 Radioactive Wate Management Site (RWMS) Performance Assessments (PAs) and Composite Analyses (CAs) in fiscal year (FY) 2009. This annual summary report presents data and conclusions from the FY 2009 review, and determines the adequacy of the PAs and CAs. Operational factors (e.g., waste forms and containers, facility design, and waste receipts), closure plans, monitoring results, and research and development (R&D) activities were reviewed to determine the adequacy of the PAs. Likewise, the environmental restoration activities at the Nevada Test Site relevant to the sources of residual radioactive material that are considered in the CAs, the land-use planning, and the results of the environmental monitoring and R&D activities were reviewed to determine the adequacy of the CAs.

  14. 2009 Annual Summary Report for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada Test Site, Nye County, Nevada: Review of the Performance Assessments and Composite Analysis

    International Nuclear Information System (INIS)

    2010-01-01

    The U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office performed an annual review of the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Site (RWMS) Performance Assessments (PAs) and Composite Analyses (CAs) in fiscal year (FY) 2009. This annual summary report presents data and conclusions from the FY 2009 review, and determines the adequacy of the PAs and CAs. Operational factors (e.g., waste forms and containers, facility design, and waste receipts), closure plans, monitoring results, and research and development (R and D) activities were reviewed to determine the adequacy of the PAs. Likewise, the environmental restoration activities at the Nevada Test Site relevant to the sources of residual radioactive material that are considered in the CAs, the land-use planning, and the results of the environmental monitoring and R and D activities were reviewed to determine the adequacy of the CAs.

  15. The Revolution Continues: Newly Discovered Systems Expand the CRISPR-Cas Toolkit.

    Science.gov (United States)

    Murugan, Karthik; Babu, Kesavan; Sundaresan, Ramya; Rajan, Rakhi; Sashital, Dipali G

    2017-10-05

    CRISPR-Cas systems defend prokaryotes against bacteriophages and mobile genetic elements and serve as the basis for revolutionary tools for genetic engineering. Class 2 CRISPR-Cas systems use single Cas endonucleases paired with guide RNAs to cleave complementary nucleic acid targets, enabling programmable sequence-specific targeting with minimal machinery. Recent discoveries of previously unidentified CRISPR-Cas systems have uncovered a deep reservoir of potential biotechnological tools beyond the well-characterized Type II Cas9 systems. Here we review the current mechanistic understanding of newly discovered single-protein Cas endonucleases. Comparison of these Cas effectors reveals substantial mechanistic diversity, underscoring the phylogenetic divergence of related CRISPR-Cas systems. This diversity has enabled further expansion of CRISPR-Cas biotechnological toolkits, with wide-ranging applications from genome editing to diagnostic tools based on various Cas endonuclease activities. These advances highlight the exciting prospects for future tools based on the continually expanding set of CRISPR-Cas systems. Copyright © 2017 Elsevier Inc. All rights reserved.

  16. Guayaquil au temps du choléra

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    1996-01-01

    Full Text Available L’épidémie de choléra survenue en 1991 en Équateur a frappé certaines villes et régions plus que d’autres sur la Côte. Guayaquil, la première ville du pays par le nombre de ses habitants (1 600 000 habitants, a connu le record de cas. L’analyse de la répartition des malades hospitalisés dans la ville montre que les quartiers pauvres, récents et, de surcroît, bâtis sur les eaux polluées du delta ne sont pas les plus frappés alors que la zone centrale taudifiée a concentré un nombre de cas élevé. Les pratiques sociales sont-elles davantage responsables de cette situation que les facteurs pourtant très contraignants ici de l’environnement ? GUAYAQUIL EN LOS TIEMPOS DEL CÓLERA. La epidemia del cólera, ocurrida en 1991 en Ecuador, ha golpeado mucho más algunas ciudades y regiones de la Costa. Guayaquil, la primera ciudad del país con 1 600 000 habitantes, ha conocido un número de casos record. El análisis de la distribución de los enfermos hospitalizados en la ciudad revela que los barrios pobres, recientes y además construidos sobre las aguas contaminadas del delta no son los más afectados por esta epidemia en relación con la parte central tugurizada. Las prácticas sociales tal vez tienen más responsabilidad en esta situación que las condiciones particularmente difíciles del medio ambiente. GUAYAQUIL DURING THE CHOLERA. The cholera epidemic, which occured in 1991, impacted some cities and regions of the coast much more than others. Guayaquil, inhabitants Ecuador's largest city with a population of some 1, 6000 000 inhabitants, experienced a record number of cases. An analysis of the sick hospitalized in this city reveals that the poor urban sections, which were built recently and moreover were constructed upon the contaminated waters of the delta, were not the most affected by this epidemic, particularly when compared to the congested central part of the city. This suggests that social practices were more

  17. Disposal of the radioactive effluents at the 'Commissariat a l'Energie Atomique'. Treatment leading to evacuation into a river; Probleme du rejet des residus radioactifs liquides au CEA. Traitements aboutissant a des rejets en riviere

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Duhamel,; Menoux,; Candillon, [Commissariat a l' Energie Atomique, Saclay (France). Centre d' Etudes Nucleaires

    1958-07-01

    loaded water, 10) Impot elements other than Sr{sup 90} are also studied. (author) [French] Le probleme du traitement des residus radioactifs liquides au CEA est envisage sous l'angle du rejet ultime en riviere dans des conditions optima permettant de satisfaire aux Normes de la protection. 2) A Saclay, ou l'on ne dispose que d'un etang ou l'eau ne se renouvelle pas, les liquides epures sont envoyes par camion citerne a Fontenay-aux-Roses, ou ils sont deverses provisoirement - dans les egouts - en attendant qu'un point de rejet en Seine ait ete determine. 3) Au Bouchet, les eaux residuaires de l'Usine de traitement de minerais d'urano-thorianite devront etre traitees en deux temps de facon a separer le radium dans une premiere phase, ce qui facilitera l'epuration au cours de la deuxieme phase. 4) En vue des futurs rejets a Marcoule, une etude a ete conduite a Saclay, sur des effluents synthetiques - type Marcoule - ayant pour but de mettre au point des procedes d'elimination selective du Sr d'une part, du Cs d'autre part, par coprecipitation. 5) Dans le cas general du rejet ultime en riviere, les problemes suivants sont successivement envisages: - predilution entre les bassins de stockage des eaux epurees et le fleuve; - mode d'injection dans le fleuve; - dilution dans le fleuve (etude prealable par traceurs); - evolution de l'activite dans les eaux du fleuve (adsorption par les organismes inertes ou vivants, contamination des berges); - incidence sur le choix d'un site; - dilution isotopique. 6) Ce dernier probleme est specialement detaille. 7) La teneur de l'eau en un element donne conditionne la dilution isotopique de son isotope radioactif. L'analyse decelant une carence, il est possible d'y suppleer par des rejets d'isotope stable. 8) Cette methode conduit en certains cas a des analyses delicates (en particulier dans le cas du {sup 90}Sr), la teneur en isotope stable necessaire a une forte dilution isotopique restant faible (ce qui est d'ailleurs un avantage). 9

  18. Embryonal Fyn-associated substrate (EFS) and CASS4: The lesser-known CAS protein family members.

    Science.gov (United States)

    Deneka, Alexander; Korobeynikov, Vladislav; Golemis, Erica A

    2015-10-01

    The CAS (Crk-associated substrate) adaptor protein family consists of four members: CASS1/BCAR1/p130Cas, CASS2/NEDD9/HEF1/Cas-L, CASS3/EFS/Sin and CASS4/HEPL. While CAS proteins lack enzymatic activity, they contain specific recognition and binding sites for assembly of larger signaling complexes that are essential for cell proliferation, survival, migration, and other processes. All family members are intermediates in integrin-dependent signaling pathways mediated at focal adhesions, and associate with FAK and SRC family kinases to activate downstream effectors regulating the actin cytoskeleton. Most studies of CAS proteins to date have been focused on the first two members, BCAR1 and NEDD9, with altered expression of these proteins now appreciated as influencing disease development and prognosis for cancer and other serious pathological conditions. For these family members, additional mechanisms of action have been defined in receptor tyrosine kinase (RTK) signaling, estrogen receptor signaling or cell cycle progression, involving discrete partner proteins such as SHC, NSP proteins, or AURKA. By contrast, EFS and CASS4 have been less studied, although structure-function analyses indicate they conserve many elements with the better-known family members. Intriguingly, a number of recent studies have implicated these proteins in immune system function, and the pathogenesis of developmental disorders, autoimmune disorders including Crohn's disease, Alzheimer's disease, cancer and other diseases. In this review, we summarize the current understanding of EFS and CASS4 protein function in the context of the larger CAS family group. Copyright © 2015 Elsevier B.V. All rights reserved.

  19. Effets de la microdose sur la production du niébé, du mil et du ...

    African Journals Online (AJOL)

    Effets de la microdose sur la production du niébé, du mil et du sorgho en fonction la toposéquence. Fatimata Saba, Sibiri Jean Baptiste Taonda, Idriss Serme, Alimata A. Bandaogo, Augustin P. Sourwema, Adama Kabre ...

  20. Mise en oeuvre de la Convention-cadre pour la lutte antitabac au ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    SEATCA) de coordonner un programme de recherche pour appuyer la mise en oeuvre (dans le cas du Cambodge) et la ratification (dans le cas du Laos) de la Convention-cadre pour la lutte antitabac (CCLAT) de l'Organisation mondiale de la santé.

  1. Streamlined Approach for Environmental Restoration Plan for Corrective Action Unit 330: Areas 6, 22, and 23 Tanks and Spill Sites, Nevada Test Site, Nevada; TOPICAL

    International Nuclear Information System (INIS)

    T. M. Fitzmaurice

    2001-01-01

    This Streamlined Approach for Environmental restoration (SAFER) plan addresses the action necessary for the closure of Corrective Action Unit (CAU) 330, Areas 6,22, and 23 Tanks and Spill Sites. The CAUs are currently listed in Appendix III of the Federal Facility Agreement and Consent Order (FFACO). This CAU is located at the Nevada Test Site (NTS) (Figure 1). CAU 330 consists of the following Corrective Action Sites (CASs): (1) CAS 06-02-04 - Consists of an underground tank and piping. This CAS is close to an area that was part of the Animal Investigation Program (AIP), conducted under the U.S. Public Health Service. Its purpose was to study and perform tests on the cattle and wild animals in and around the NTS that were exposed to radionuclides. It is unknown if this tank was part of these operations. (2) CAS 22-99-06 - Is a fuel spill that is believed to be a waste oil release which occurred when Camp Desert Rock was an active facility. This CAS was originally identified as being a small depression where liquids were poured onto the ground, located on the west side of Building T-1001. This building has been identified as housing a fire station, radio station, and radio net remote and telephone switchboard. (3) CAS 23-01-02 - Is a large aboveground storage tank (AST) farm that was constructed to provide gasoline and diesel storage in Area 23. The site consists of two ASTs, a concrete foundation, a surrounding earthen berm, associated piping, and unloading stations. (4) CAS 23-25-05 - Consists of an asphalt oil spill/tar release that contains a wash covered with asphalt oil/tar material, a half buried 208-liter (L) (55-gallon[gal]) drum, rebar, and concrete located in the vicinity

  2. Structural and biochemical analysis of nuclease domain of clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)-associated protein 3 (Cas3).

    Science.gov (United States)

    Mulepati, Sabin; Bailey, Scott

    2011-09-09

    RNA transcribed from clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPRs) protects many prokaryotes from invasion by foreign DNA such as viruses, conjugative plasmids, and transposable elements. Cas3 (CRISPR-associated protein 3) is essential for this CRISPR protection and is thought to mediate cleavage of the foreign DNA through its N-terminal histidine-aspartate (HD) domain. We report here the 1.8 Å crystal structure of the HD domain of Cas3 from Thermus thermophilus HB8. Structural and biochemical studies predict that this enzyme binds two metal ions at its active site. We also demonstrate that the single-stranded DNA endonuclease activity of this T. thermophilus domain is activated not by magnesium but by transition metal ions such as manganese and nickel. Structure-guided mutagenesis confirms the importance of the metal-binding residues for the nuclease activity and identifies other active site residues. Overall, these results provide a framework for understanding the role of Cas3 in the CRISPR system.

  3. CRISPR/Cas9 Based Genome Editing of Penicillium chrysogenum.

    Science.gov (United States)

    Pohl, C; Kiel, J A K W; Driessen, A J M; Bovenberg, R A L; Nygård, Y

    2016-07-15

    CRISPR/Cas9 based systems have emerged as versatile platforms for precision genome editing in a wide range of organisms. Here we have developed powerful CRISPR/Cas9 tools for marker-based and marker-free genome modifications in Penicillium chrysogenum, a model filamentous fungus and industrially relevant cell factory. The developed CRISPR/Cas9 toolbox is highly flexible and allows editing of new targets with minimal cloning efforts. The Cas9 protein and the sgRNA can be either delivered during transformation, as preassembled CRISPR-Cas9 ribonucleoproteins (RNPs) or expressed from an AMA1 based plasmid within the cell. The direct delivery of the Cas9 protein with in vitro synthesized sgRNA to the cells allows for a transient method for genome engineering that may rapidly be applicable for other filamentous fungi. The expression of Cas9 from an AMA1 based vector was shown to be highly efficient for marker-free gene deletions.

  4. L’usage politique de l’islam : l’universel au service d’un État. Le cas du Maroc The Political Use of Islam. The Universal in the Service of a State. The Moroccan Case

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Abdessamad Belhaj

    2011-03-01

    Full Text Available Lorsqu’il s’agit d’étudier les rapports des pays arabes à la mondialisation, il est nécessaire d’évoquer l’islam. En tant que facteur local, la symbolique islamique offre des ressources de légitimation au pouvoir. Le cas marocain illustre bien la manière dont les rapports existant entre le Makhzen et le répertoire religieux (Amīr al-Mu’minīne, la bayca , la chérifibilité…  font de l’introduction de la modernité un simple espace virtuel et fonctionnel. L’émergence de la contestation islamiste participe à la consécration du répertoire traditionnel. D’autre part, depuis les trois dernières décennies, l’essor de l’islam mondialisé offre au Maroc des opportunités politiques à l’échelle mondiale. Ceci est observable au niveau du rôle joué par le pays dans le cadre de la diplomatie islamique (OCI, ISESCO…  ou au niveau de son positionnement dans l’islam européen. La gestion de l’interaction entre l’islam local et l’islam global, adaptée à la conjoncture internationale, assure le maintien au pouvoir du régime.One cannot study the relationships between Arab countries and globalization without taking Islam into account for it offers symbolic support to legitimizing local power. Morocco is a good example : the relations between the royal court (Makhzen and Islamic features such as being the Commander of the Faithful or Sheriffhood make of modernity a mere virtual or functional sphere. Even the emergence of Islamic contestation contributes to the consecration of the traditional repertory. On the other hand, the rise of world Islam during the last thirty years has opened up political opportunities for Morocco on the international stage – for instance the agencies of Islamic diplomacy (OCI, ISESCO or the quest for a new role in European Islam. By managing the interaction between the local and the global, the regime is able to keep itself in power.

  5. Développement et institutionnalisation de la sociologie appliquée aux politiques publiques :le cas du Chili entre 1980 et 2000  The development and Institutionalisation of Sociology applied to Public Policies – A Case Study from Chile (1980-2000

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Javier Corvalán

    2011-03-01

    Full Text Available La présente contribution étudie ce champ de connaissances de la sociologie qui cherche à influencer les politiques de développement et/ou d’intégration sociale menées par l’État au sein des sociétés modernes. Notre démarche, centrée sur le cas spécifique du Chili, s’articule sur la critique, la reformulation et l’analyse de l’apport des principes qui structurent ces politiques mais également sur la pro­position de cadres d’analyse destinés à comprendre leurs effets dans la société.This article details the making of sociology relevant to public policies in particular to state piloted integration. Sociology can bring its positive but critical approach to bear on the (reformulation of such policies as well as contribute to the understanding of their wider implications and impact.

  6. Utilisation du foncier agricole à des fins de culture de Jatropha dans le Bassin arachidier sénégalais: une démarche controversée et des gains pas à la hauteur des attendus du programme

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Aminata Ndour

    2017-10-01

    Full Text Available Durant les années 2000, le secteur énergétique mondial a connu un tourment décisif du fait de la diminution des réserves, de la demande importante et surtout de la fluctuation des prix du pétrole. Le Sénégal, pays dépendant encore des énergies fossiles, s’est engagé dans une politique de diversification énergétique. Par conséquent, un programme biocarburant est initié. Le Bassin Arachidier est un des espaces sollicités pour l’application des politiques de promotion des biocarburants. Une zone du production agricole a accueilli une innovation énergétique. Ce fait marquant a guidé nos interrogations sur les problèmes énergétiques qui ont incité la culture de Jatropha dans le Bassin Arachidier. De façon spécifique, notre analyse de la filière Jatropha précise les stratégies déployées. Il est questions dans ce cas d’étudier les effets de Jatropha sur l’espace de production et les conditions de vie des agriculteurs, des risques de réduction des superficies de cultures traditionnelles.

  7. INTERROGATION DU MYTHE DE L'ENTREPRENEUR A TRAVERS LA TRAJECTOIRE INÉGALE D'UN CRÉATEUR PERSISTANT

    OpenAIRE

    Vincent Lagarde

    2006-01-01

    International audience; Le créateur persistant, archétype de l'entrepreneur, a fait l'objet de plusieurs descriptions théoriques, mais a été peu observé durablement. L'étude des trajectoires double-décennales d'un échantillon d'entrepreneurs agricoles atypiques, a été l'occasion de rechercher et d'analyser des comportements de créateurs persistants. La situation du seul cas résistant à l'analyse sur les 20 années, révèle quelques paradoxes qui interrogent la théorie. Les changements fréquents...

  8. Mechanisms controlling lateral and vertical porewater migration of depleted uranium (DU) at two UK weapons testing sites

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Graham, Margaret C., E-mail: Margaret.Graham@ed.ac.uk [School of GeoSciences, Crew Building, University of Edinburgh, The King' s Buildings, West Mains Road, Edinburgh, EH9 3JN (United Kingdom); Oliver, Ian W.; MacKenzie, Angus B.; Ellam, Robert M. [Scottish Universities Environmental Research Centre (SUERC), Rankine Avenue, Scottish Enterprise Technology Park, East Kilbride, G75 0QF (United Kingdom); Farmer, John G. [School of GeoSciences, Crew Building, University of Edinburgh, The King' s Buildings, West Mains Road, Edinburgh, EH9 3JN (United Kingdom)

    2011-04-15

    } into the truly dissolved phase. - Research Highlights: {yields} U associations in soil porewaters at DU munitions sites were investigated. {yields} U distribution among colloidal/dissolved fractions varied with soil type and depth. {yields} U association with large Fe-Al-organic colloids led to removal from soil porewaters. {yields} Small organic colloidal association inhibited U removal from sandy soil porewaters. {yields} Reductive dissolution of Mn can release 'truly dissolved' U into soil porewaters.

  9. L'administration du travail et la production du droit du travail (1906-1960). : Note de synthèse du rapport de recherche

    OpenAIRE

    Le Crom , Jean-Pierre

    2007-01-01

    Synthèse d'un rapport de recherche dont l'objectif est d'appréhender le rôle de l'administration centrale du travail dans la production du droit du travail. Deux dimensions sont explorées : le profil des rédacteurs et l'organisation des structures.

  10. Corrective Action Plan for Corrective Action Unit 543: Liquid Disposal Units, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    NSTec Environmental Restoration

    2007-01-01

    Corrective Action Unit (CAU) 543: Liquid Disposal Units is listed in Appendix III of the ''Federal Facility Agreement and Consent Order'' (FFACO) which was agreed to by the state of Nevada, the U.S. Department of Energy (DOE), and the U.S. Department of Defense (FFACO, 1996). CAU 543 sites are located in Areas 6 and 15 of the Nevada Test Site (NTS), which is approximately 65 miles northwest of Las Vegas, Nevada. CAU 543 consists of the following seven Corrective Action Sites (CASs) (Figure 1): CAS 06-07-01, Decon Pad; CAS 15-01-03, Aboveground Storage Tank; CAS 15-04-01, Septic Tank; CAS 15-05-01, Leachfield; CAS 15-08-01, Liquid Manure Tank; CAS 15-23-01, Underground Radioactive Material Area; and CAS 15-23-03, Contaminated Sump, Piping. All Area 15 CASs are located at the former U.S. Environmental Protection Agency (EPA) Farm, which operated from 1963 to 1981 and was used to support animal experiments involving the uptake of radionuclides. Each of the Area 15 CASs, except CAS 15-23-01, is associated with the disposal of waste effluent from Building 15-06, which was the primary location of the various tests and experiments conducted onsite. Waste effluent disposal from Building 15-06 involved piping, sumps, outfalls, a septic tank with leachfield, underground storage tanks, and an aboveground storage tank (AST). CAS 15-23-01 was associated with decontamination activities of farm equipment potentially contaminated with radiological constituents, pesticides, and herbicides. While the building structures were removed before the investigation took place, all the original tanks, sumps, piping, and concrete building pads remain in place. The Area 6 CAS is located at the Decontamination Facility in Area 6, a facility which operated from 1971 to 2001 and was used to decontaminate vehicles, equipment, clothing, and other materials that had become contaminated during nuclear testing activities. The CAS includes the effluent collection and distribution systems for Buildings

  11. CRISPR/Cas9-mediated viral interference in plants

    KAUST Repository

    Ali, Zahir

    2015-11-11

    Background The CRISPR/Cas9 system provides bacteria and archaea with molecular immunity against invading phages and conjugative plasmids. Recently, CRISPR/Cas9 has been used for targeted genome editing in diverse eukaryotic species. Results In this study, we investigate whether the CRISPR/Cas9 system could be used in plants to confer molecular immunity against DNA viruses. We deliver sgRNAs specific for coding and non-coding sequences of tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) into Nicotiana benthamiana plants stably overexpressing the Cas9 endonuclease, and subsequently challenge these plants with TYLCV. Our data demonstrate that the CRISPR/Cas9 system targeted TYLCV for degradation and introduced mutations at the target sequences. All tested sgRNAs exhibit interference activity, but those targeting the stem-loop sequence within the TYLCV origin of replication in the intergenic region (IR) are the most effective. N. benthamiana plants expressing CRISPR/Cas9 exhibit delayed or reduced accumulation of viral DNA, abolishing or significantly attenuating symptoms of infection. Moreover, this system could simultaneously target multiple DNA viruses. Conclusions These data establish the efficacy of the CRISPR/Cas9 system for viral interference in plants, thereby extending the utility of this technology and opening the possibility of producing plants resistant to multiple viral infections.

  12. Les campagnes communautaires de promotion du depistage VIH en Afrique de l’Ouest : perceptions des usagers au Burkina Faso

    Science.gov (United States)

    Desclaux, Alice; Ky-Zerbo, Odette; Somé, Jean-François; Makhlouf-Obermeyer, Carla

    2014-01-01

    Résumé La politique actuelle de lutte contre le sida qui repose sur l’extension de l’accès aux traitements et à la prévention exige qu’une proportion élevée de la population connaisse son statut en matière de VIH. Pour cela, l’OMS a proposé le développement de stratégies communautaires délivrant le dépistage et le conseil au-delà des services de soins, comme le test à domicile ou les campagnes de sensibilisation et dépistage de grande envergure, appliqués en Afrique australe et de l’Est. Pour définir les stratégies pertinentes dans des régions de basse prévalence comme l’Afrique de l’Ouest, les expériences communautaires de promotion du dépistage doivent y être évaluées. Cet article présente une évaluation des campagnes au Burkina Faso du point de vue des usagers. Dans le cadre d’un projet sur les pratiques et l’éthique du dépistage dans quatre pays africains (MATCH), une enquête qualitative spécifique a été menée pendant la campagne de 2008, auprès de personnes ayant fait le test pendant la campagne, ayant fait le test hors campagne ou n’ayant pas fait le test. Les appréciations sont globalement très favorables aux campagnes, notamment à cause de l’information dispensée, l’accessibilité des sites, la gratuité du test, la qualité des services et l’effet d’entrainement. Les limites ou critiques sont essentiellement liées à l’affluence ou à la crainte de ne pas être soutenu en cas de résultat positif. La démarche de recours au test ne fait plus l’objet de suspicion, au moins pendant la campagne. Cette « normalisation » du recours au test et la mobilisation collective facilitent des pratiques en groupe, ce qui peut rendre difficile de garder son statut VIH secret. L’évaluation des campagnes par les usagers les présente comme une opportunité pour accéder facilement au test et pour communiquer à ce sujet dans divers espaces sociaux à partir des informations délivrées sur le VIH

  13. Development and potential applications of CRISPR-Cas9 genome editing technology in sarcoma.

    Science.gov (United States)

    Liu, Tang; Shen, Jacson K; Li, Zhihong; Choy, Edwin; Hornicek, Francis J; Duan, Zhenfeng

    2016-04-01

    Sarcomas include some of the most aggressive tumors and typically respond poorly to chemotherapy. In recent years, specific gene fusion/mutations and gene over-expression/activation have been shown to drive sarcoma pathogenesis and development. These emerging genomic alterations may provide targets for novel therapeutic strategies and have the potential to transform sarcoma patient care. The RNA-guided nuclease CRISPR-Cas9 (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)-associated protein-9 nuclease) is a convenient and versatile platform for site-specific genome editing and epigenome targeted modulation. Given that sarcoma is believed to develop as a result of genetic alterations in mesenchymal progenitor/stem cells, CRISPR-Cas9 genome editing technologies hold extensive application potentials in sarcoma models and therapies. We review the development and mechanisms of the CRISPR-Cas9 system in genome editing and introduce its application in sarcoma research and potential therapy in clinic. Additionally, we propose future directions and discuss the challenges faced with these applications, providing concise and enlightening information for readers interested in this area. Copyright © 2016 Elsevier Ireland Ltd. All rights reserved.

  14. 2007 Annual Summary Report for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada Test Site, Nye County, Nevada

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    NSTec Environmental Management

    2008-01-01

    This report summarizes the results of an annual review of conditions affecting the operation of the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites (RWMSs) and a determination of the continuing adequacy of the performance assessments (PAs) and composite analyses (CAs). The Area 5 RWMS PA documentation consists of the original PA (Shott et al., 1998), referred to as the 1998 Area 5 RWMS PA and supporting addenda (Bechtel Nevada [BN], 2001b; 2006a). The Area 5 RWMS CA was issued as a single document (BN, 2001a) and has a single addendum (BN, 2001c). The Area 3 PA and CA were issued in a single document (Shott et al., 2000). The Maintenance Plan for the PAs and CAs (National Security Technologies, LLC [NSTec], 2006) and the Disposal Authorization Statements (DASs) for the Area 3 and 5 RWMSs (U.S. Department of Energy [DOE], 2000; 2002) require preparation of an annual summary and a determination of the continuing adequacy of the PAs and CAs. The annual summary report is submitted to DOE Headquarters. Following the annual report format in the DOE PA/CA Maintenance Guide (DOE, 1999), this report presents the annual summary for the PAs in Section 2.0 and the CAs in Section 3.0. The annual summary for the PAs includes the following: Section 2.1 summarizes changes in waste disposal operations; Section 2.1.5 provides an evaluation of the new estimates of the closure inventories derived from the actual disposals through fiscal year (FY) 2007; Section 2.2 summarizes the results of the monitoring conducted under the U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office's (NNSA/NSO's) Integrated Closure and Monitoring Plan for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada Test Site (BN, 2005), and the research and development (R&D) activities; Section 2.4 is a summary of changes in facility design, operation, or expected future conditions; monitoring and R&D activities; and the maintenance program; and

  15. 2007 Annual Summary Report for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada Test Site, Nye County, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    NSTec Environmental Management

    2008-01-01

    This report summarizes the results of an annual review of conditions affecting the operation of the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites (RWMSs) and a determination of the continuing adequacy of the performance assessments (PAs) and composite analyses (CAs). The Area 5 RWMS PA documentation consists of the original PA (Shott et al., 1998), referred to as the 1998 Area 5 RWMS PA and supporting addenda (Bechtel Nevada [BN], 2001b; 2006a). The Area 5 RWMS CA was issued as a single document (BN, 2001a) and has a single addendum (BN, 2001c). The Area 3 PA and CA were issued in a single document (Shott et al., 2000). The Maintenance Plan for the PAs and CAs (National Security Technologies, LLC [NSTec], 2006) and the Disposal Authorization Statements (DASs) for the Area 3 and 5 RWMSs (U.S. Department of Energy [DOE], 2000; 2002) require preparation of an annual summary and a determination of the continuing adequacy of the PAs and CAs. The annual summary report is submitted to DOE Headquarters. Following the annual report format in the DOE PA/CA Maintenance Guide (DOE, 1999), this report presents the annual summary for the PAs in Section 2.0 and the CAs in Section 3.0. The annual summary for the PAs includes the following: Section 2.1 summarizes changes in waste disposal operations; Section 2.1.5 provides an evaluation of the new estimates of the closure inventories derived from the actual disposals through fiscal year (FY) 2007; Section 2.2 summarizes the results of the monitoring conducted under the U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office's (NNSA/NSO's) Integrated Closure and Monitoring Plan for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada Test Site (BN, 2005), and the research and development (R and D) activities; Section 2.4 is a summary of changes in facility design, operation, or expected future conditions; monitoring and R and D activities; and the maintenance program; and

  16. Simulation de l'habitat physique du barbeau fluviatile (Barbus barbus, L. 1758 : choix des modèles biologiques et sensibilité de la réponse

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    POUILLY M.

    1994-07-01

    Full Text Available Des courbes monovariées et des modèles multivariés de préférence d'habitat du barbeau, Barbus barbus, ont été établis à partir de données récoltées sur 3 cours d'eau. Dans les deux cas (monovarié et multivarié, trois modèles locaux, correspondant aux données d'une rivière, et un modèle général, regroupant l'ensemble des données, ont été établis. La qualité de la prédiction et la sensibilité de la réponse lors de la simulation des capacités d'accueil d'un cours d'eau révèlent : 1 que les modèles multivariés ont une valeur prédictive plus forte que les courbes de préférence, 2 que les modèles construits à partir de jeux de données locaux sont plus performants que les modèles généraux, et 3 que la perte de précision est moindre dans le cas du modèle général multivarié.

  17. Cancer du rein et Grossesse: A propos d’une nouvelle observation

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    A. Majdoub

    2017-12-01

    Nous rapportons le cas d’une patiente âgée de 38 ans, sans antécédents pathologiques notables, enceinte avec un terme de 16 semaines d’aménorrhée, présentant des lombalgies gauches. Le diagnostic de tumeur rénale était retenu sur les données du couple échographie rénale et IRM abdominale. La patiente a bénéficié d’une néphrectomie élargie par voie lombaire. L’analyse histologique de la pièce de néphrectomie totale a révélé un adénocarcinome à cellules claires. L’évolution était favorable après le traitement avec une grossesse menée à terme.

  18. Corrective Action Plan for Corrective Action Unit 563: Septic Systems, Nevada Test Site, Nevada

    International Nuclear Information System (INIS)

    2009-01-01

    This Corrective Action Plan (CAP) has been prepared for Corrective Action Unit (CAU) 563, Septic Systems, in accordance with the Federal Facility Agreement and Consent Order. CAU 563 consists of four Corrective Action Sites (CASs) located in Areas 3 and 12 of the Nevada Test Site. CAU 563 consists of the following CASs: CAS 03-04-02, Area 3 Subdock Septic Tank CAS 03-59-05, Area 3 Subdock Cesspool CAS 12-59-01, Drilling/Welding Shop Septic Tanks CAS 12-60-01, Drilling/Welding Shop Outfalls Site characterization activities were performed in 2007, and the results are presented in Appendix A of the CAU 563 Corrective Action Decision Document. The scope of work required to implement the recommended closure alternatives is summarized below. CAS 03-04-02, Area 3 Subdock Septic Tank, contains no contaminants of concern (COCs) above action levels. No further action is required for this site; however, as a best management practice (BMP), all aboveground features (e.g., riser pipes and bumper posts) will be removed, the septic tank will be removed, and all open pipe ends will be sealed with grout. CAS 03-59-05, Area 3 Subdock Cesspool, contains no COCs above action levels. No further action is required for this site; however, as a BMP, all aboveground features (e.g., riser pipes and bumper posts) will be removed, the cesspool will be abandoned by filling it with sand or native soil, and all open pipe ends will be sealed with grout. CAS 12-59-01, Drilling/Welding Shop Septic Tanks, will be clean closed by excavating approximately 4 cubic yards (yd3) of arsenic- and chromium-impacted soil. In addition, as a BMP, the liquid in the South Tank will be removed, the North Tank will be removed or filled with grout and left in place, the South Tank will be filled with grout and left in place, all open pipe ends will be sealed with grout or similar material, approximately 10 yd3 of chlordane-impacted soil will be excavated, and debris within the CAS boundary will be removed. CAS 12

  19. indCAPS: A tool for designing screening primers for CRISPR/Cas9 mutagenesis events.

    Science.gov (United States)

    Hodgens, Charles; Nimchuk, Zachary L; Kieber, Joseph J

    2017-01-01

    Genetic manipulation of organisms using CRISPR/Cas9 technology generally produces small insertions/deletions (indels) that can be difficult to detect. Here, we describe a technique to easily and rapidly identify such indels. Sequence-identified mutations that alter a restriction enzyme recognition site can be readily distinguished from wild-type alleles using a cleaved amplified polymorphic sequence (CAPS) technique. If a restriction site is created or altered by the mutation such that only one allele contains the restriction site, a polymerase chain reaction (PCR) followed by a restriction digest can be used to distinguish the two alleles. However, in the case of most CRISPR-induced alleles, no such restriction sites are present in the target sequences. In this case, a derived CAPS (dCAPS) approach can be used in which mismatches are purposefully introduced in the oligonucleotide primers to create a restriction site in one, but not both, of the amplified templates. Web-based tools exist to aid dCAPS primer design, but when supplied sequences that include indels, the current tools often fail to suggest appropriate primers. Here, we report the development of a Python-based, species-agnostic web tool, called indCAPS, suitable for the design of PCR primers used in dCAPS assays that is compatible with indels. This tool should have wide utility for screening editing events following CRISPR/Cas9 mutagenesis as well as for identifying specific editing events in a pool of CRISPR-mediated mutagenesis events. This tool was field-tested in a CRISPR mutagenesis experiment targeting a cytokinin receptor (AHK3) in Arabidopsis thaliana. The tool suggested primers that successfully distinguished between wild-type and edited alleles of a target locus and facilitated the isolation of two novel ahk3 null alleles. Users can access indCAPS and design PCR primers to employ dCAPS to identify CRISPR/Cas9 alleles at http://indcaps.kieber.cloudapps.unc.edu/.

  20. Importance de la stratégie du marketing-mix en assurances de personnes ( cas de l'assurance scolaire de la CAAR dans la wilaya de Tlemcen)

    OpenAIRE

    Ali-belhadj, Yassine

    2014-01-01

    L'objectif de cette recherche est de déterminer les causes qui frénenet l'évolution du marché national des assurances de personne et la possibilité de le faire développer grâce de l'utilisation du marketing-mix des assurances.la premiére partie traite de l'aspect théorique du marketing des assurances .la deuxiéme partie observera le marketing des assurances en Algérie.

  1. Genome engineering in ophthalmology: Application of CRISPR/Cas to the treatment of eye disease.

    Science.gov (United States)

    Hung, Sandy S C; McCaughey, Tristan; Swann, Olivia; Pébay, Alice; Hewitt, Alex W

    2016-07-01

    The Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat (CRISPR) and CRISPR-associated protein (Cas) system has enabled an accurate and efficient means to edit the human genome. Rapid advances in this technology could results in imminent clinical application, and with favourable anatomical and immunological profiles, ophthalmic disease will be at the forefront of such work. There have been a number of breakthroughs improving the specificity and efficacy of CRISPR/Cas-mediated genome editing. Similarly, better methods to identify off-target cleavage sites have also been developed. With the impending clinical utility of CRISPR/Cas technology, complex ethical issues related to the regulation and management of the precise applications of human gene editing must be considered. This review discusses the current progress and recent breakthroughs in CRISPR/Cas-based gene engineering, and outlines some of the technical issues that must be addressed before gene correction, be it in vivo or in vitro, is integrated into ophthalmic care. We outline a clinical pipeline for CRISPR-based treatments of inherited eye diseases and provide an overview of the important ethical implications of gene editing and how these may influence the future of this technology. Copyright © 2016 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  2. Editing plants for virus resistance using CRISPR-Cas.

    Science.gov (United States)

    Green, J C; Hu, J S

    This minireview summarizes recent advancements using the clustered regularly interspaced palindromic repeats-associated nuclease systems (CRISPR-Cas) derived from prokaryotes to breed plants resistant to DNA and RNA viruses. The CRISPR-Cas system represents a powerful tool able to edit and insert novel traits into plants precisely at chosen loci offering enormous advantages to classical breeding. Approaches to engineering plant virus resistance in both transgenic and non-transgenic plants are discussed. Iterations of the CRISPR-Cas system, FnCas9 and C2c2 capable of editing RNA in eukaryotic cells offer a particular advantage for providing resistance to RNA viruses which represent the great majority of known plant viruses. Scientists have obtained conflicting results using gene silencing technology to produce transgenic plants resistant to geminiviruses. CRISPR-Cas systems engineered in plants to target geminiviruses have consistently reduced virus accumulation providing increased resistance to virus infection. CRISPR-Cas may provide novel and reliable approaches to control geminiviruses and other ssDNA viruses such as Banana bunchy top virus (BBTV).

  3. Scarless Cas9 Assisted Recombineering (no-SCAR) in Escherichia coli, an Easy-to-Use System for Genome Editing.

    Science.gov (United States)

    Reisch, Christopher R; Prather, Kristala L J

    2017-01-05

    The discovery and development of genome editing systems that leverage the site-specific DNA endonuclease system CRISPR/Cas9 has fundamentally changed the ease and speed of genome editing in many organisms. In eukaryotes, the CRISPR/Cas9 system utilizes a "guide" RNA to enable the Cas9 nuclease to make a double-strand break at a particular genome locus, which is repaired by non-homologous end joining (NHEJ) repair enzymes, often generating random mutations in the process. A specific alteration of the target genome can also be generated by supplying a DNA template in vivo with a desired mutation, which is incorporated by homology-directed repair. However, E. coli lacks robust systems for double-strand break repair. Thus, in contrast to eukaryotes, targeting E. coli chromosomal DNA with Cas9 causes cell death. However, Cas9-mediated killing of bacteria can be exploited to select against cells with a specified genotype within a mixed population. In combination with the well described λ-Red system for recombination in E. coli, we created a highly efficient system for marker-free and scarless genome editing. © 2017 by John Wiley & Sons, Inc. Copyright © 2017 John Wiley & Sons, Inc.

  4. Effet du Pediococcus acidilactici sur le bilan lipidique sanguin du ...

    African Journals Online (AJOL)

    Les résultats relatifs aux performances zootechniques ont montré que l'addition du probiotique a amélioré significativement le gain de poids pendant la phase de croissance se traduisant par un indice de consommation meilleur. Les dosages du cholestérol total, des triglycérides, du HDL et du LDL ont été déterminés à la ...

  5. Standardissimo. Les limitations théoriques du Modèle Standard. Quelles réponses y apporter?

    Science.gov (United States)

    Renard, F. M.

    Nous présentons I 'état du Modèle Standard des interactions fortes, faibles et électromagnétiques. Après une description rapide de ses 3 secteurs, secteur de jauge (radiation), secteur fermionique (matière) et secteur scalaire (génération des masses), nous insistons sur le grand nombre de paramètres libres et sur les choix arbitraires qu'il a fallu faire dans l'élaboration du modèle. Nous faisons ressortir les problèmes techniques non résolus et nous dressons la liste des questions fondamentales restées sans réponses. Nous passons ensuite en revue les idées et méthodes proposées pour répondre à ces questions. Elles utilisent essentiellement 3 voies différentes. La première consiste à requérir plus de symétrie (extension du modèle, symétrie Gauche-Droite, Grandes Unifications, Supersymétrie,...). La seconde contient les diverses alternatives au Modèle Standard impliquant des modifications dans certains secteurs (par exemple le secteur scalaire avec le modèle de la Technicouleur) ou de façon plus violente l'hypothèse d'une sous-structure des leptons, des quarks et des bosons W et Z eux-mêmes. Une dernière voie cherche à justifier les particularités du Modèle Standard et relier ses paramètres libres en se basant sur des principes de cohérence interne du modèle. Les conséquences observables de ces diverses approches sont dans chaque cas mentionnées.

  6. 2008 Annual Summary Report for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada Test Site, Nye County, Nevada: Review of the Performance Assessments and Composite Analyses

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    NSTec Environmental Management

    2009-03-30

    The Maintenance Plan for the Performance Assessments and Composite Analyses for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada Test Site requires an annual review to assess the adequacy of the Performance Assessments (PAs) and Composite Analyses (CAs) for each of the facilities, with the results submitted annually to U.S. Department of Energy (DOE) Headquarters. The Disposal Authorization Statements for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites (RWMSs) also require that such reviews be made and that secondary or minor unresolved issues be tracked and addressed as part of the maintenance plan. The U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office (NNSA/NSO) performed an annual review in fiscal year (FY) 2008 by evaluating operational factors and research results that impact the continuing validity of the PAs and CAs. This annual summary report presents data and conclusions from the FY 2008 review, and determines the adequacy of the PAs and CAs. Operational factors (e.g., waste forms and containers, facility design, and waste receipts), closure plans, monitoring results, and research and development (R&D) activities were reviewed to determine the adequacy of the PAs. Likewise, the environmental restoration activities at the Nevada Test Site relevant to the sources of residual radioactive material that are considered in the CAs, the land-use planning, and the results of the environmental monitoring and R&D activities were reviewed to determine the adequacy of the CAs.

  7. 2008 Annual Summary Report for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada Test Site, Nye County, Nevada: Review of the Performance Assessments and Composite Analyses

    International Nuclear Information System (INIS)

    2009-01-01

    The Maintenance Plan for the Performance Assessments and Composite Analyses for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites at the Nevada Test Site requires an annual review to assess the adequacy of the Performance Assessments (PAs) and Composite Analyses (CAs) for each of the facilities, with the results submitted annually to U.S. Department of Energy (DOE) Headquarters. The Disposal Authorization Statements for the Area 3 and Area 5 Radioactive Waste Management Sites (RWMSs) also require that such reviews be made and that secondary or minor unresolved issues be tracked and addressed as part of the maintenance plan. The U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office (NNSA/NSO) performed an annual review in fiscal year (FY) 2008 by evaluating operational factors and research results that impact the continuing validity of the PAs and CAs. This annual summary report presents data and conclusions from the FY 2008 review, and determines the adequacy of the PAs and CAs. Operational factors (e.g., waste forms and containers, facility design, and waste receipts), closure plans, monitoring results, and research and development (R and D) activities were reviewed to determine the adequacy of the PAs. Likewise, the environmental restoration activities at the Nevada Test Site relevant to the sources of residual radioactive material that are considered in the CAs, the land-use planning, and the results of the environmental monitoring and R and D activities were reviewed to determine the adequacy of the CAs.

  8. L’école historique française du droit a-t-elle existé?

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Philippe Sturmel

    2002-01-01

    Full Text Available Jourdan ou Klimrath, émules français de Savigny dans la première moitié du XIXe siècle, sont des noms que les historiens du droit connaissent bien. Mais cela a-t-il toujours été le cas et surtout quelle a été la portée de leur action scientifique au XIXe siècle? Ce sont ces questions auxquelles l’article tente de répondre et cela de deux points de vue: d’une part en examinant la réception en France des thèses de ce que l’on a appelé l’Ecole historique française dans un temps où l’Ecole de l’exégèse exerce une domination sans partage; d’autre part, en observant les réactions allemandes devant cette production juridique historique française qui s’inscrit dans le courant savignien, observation basée notamment sur le dépouillement exhaustif de la Kritische Zeitschrift für Rechtswissenschaft und Gesetzgebung des Auslandes dirigée par Mittermaier. Que constate-t-on? Des deux côtés du Rhin, l’Ecole historique française a été étouffée. Ici, ses adeptes étaient accusés de pro germanisme; là, ils n’étaient finalement que les disciples de Savigny. Et pourtant leur action en faveur des sciences juridique et historique mérite pleinement qu’on voie en eux les fondateurs d’une véritable Ecole historique française du droit.

  9. Versatile High-Throughput Fluorescence Assay for Monitoring Cas9 Activity.

    Science.gov (United States)

    Seamon, Kyle J; Light, Yooli K; Saada, Edwin A; Schoeniger, Joseph S; Harmon, Brooke

    2018-06-05

    The RNA-guided DNA nuclease Cas9 is now widely used for the targeted modification of genomes of human cells and various organisms. Despite the extensive use of Clustered Regularly Interspaced Palindromic Repeats (CRISPR) systems for genome engineering and the rapid discovery and engineering of new CRISPR-associated nucleases, there are no high-throughput assays for measuring enzymatic activity. The current laboratory and future therapeutic uses of CRISPR technology have a significant risk of accidental exposure or clinical off-target effects, underscoring the need for therapeutically effective inhibitors of Cas9. Here, we develop a fluorescence assay for monitoring Cas9 nuclease activity and demonstrate its utility with S. pyogenes (Spy), S. aureus (Sau), and C. jejuni (Cje) Cas9. The assay was validated by quantitatively profiling the species specificity of published anti-CRISPR (Acr) proteins, confirming the reported inhibition of Spy Cas9 by AcrIIA4 and Cje Cas9 by AcrIIC1 and no inhibition of Sau Cas9 by either anti-CRISPR. To identify drug-like inhibitors, we performed a screen of 189 606 small molecules for inhibition of Spy Cas9. Of 437 hits (0.2% hit rate), six were confirmed as Cas9 inhibitors in a direct gel electrophoresis secondary assay. The high-throughput nature of this assay makes it broadly applicable for the discovery of additional Cas9 inhibitors or the characterization of Cas9 enzyme variants.

  10. Alimentation du nouveau-ne et du nourrisson dans la region ...

    African Journals Online (AJOL)

    Alimentation du nouveau-ne et du nourrisson dans la region centrale du togo : pratiques familiales et communautaires avant la mise en oeuvre de la strategie « prise en charge integree des maladies de l'enfant »

  11. A thermostable Cas9 with increased lifetime in human plasma

    OpenAIRE

    Harrington, LB; Paez-Espino, D; Staahl, BT; Chen, JS; Ma, E; Kyrpides, NC; Doudna, JA

    2017-01-01

    © 2017 The Author(s). CRISPR-Cas9 is a powerful technology that has enabled genome editing in a wide range of species. However, the currently developed Cas9 homologs all originate from mesophilic bacteria, making them susceptible to degradation and unsuitable for applications requiring cleavage at elevated temperatures. Here, we show that the Cas9 protein from the thermophilic bacterium Geobacillus stearothermophilus (GeoCas9) catalyzes RNA-guided DNA cleavage at elevated temperatures. GeoCas...

  12. La situation politique du Jawf au Ier millénaire avant J.-C.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Mounir Arbach

    2003-09-01

    Full Text Available La région du Jawf, située à une centaine de kilomètres au nord-est de Sanaa, possède un nombre important de sites archéologiques sudarabiques. Les plus importants sont, du sud-est au nord-ouest : Barâqish, l’antique Yathill, dont l’enceinte est l’ouvrage défensif le mieux conservé parmi les sites préislamiques ; Ma‘în, l’antique Qarnaw, capitale du royaume de Ma‘în ; Kharibat Hamdân, l’antique Haram ; Kamna, l’antique Kaminahû ; al-Sawdâ’, l’antique Nashshân ; et al-Baydâ’, l’antique Nashq. L...

  13. A la recherche de l'opérationnalité : le cas de l'agriculture familiale dans le Nordeste du Brésil

    OpenAIRE

    Caron, P.; Sabourin, E.; Sautier, D.; Gama da Silva, P.C.; Tonneau, J.P.

    1997-01-01

    Le projet d'appui au développement de l'agriculture familiale dans le Nordeste du Brésil a pour but de produire des références méthodologiques (analyse de situation et intervention) pour la recherche (identification de thèmes prioritaires), pour le développement (connaissances pour l'action) et pour la formation. Pour atteindre ces objectifs, l'équipe du projet est impliquée dans différentes opérations de développement conduites en partenariat avec des acteurs locaux, en assurant trois princi...

  14. Inconclusive studies on possible CRISPR-Cas off-targets should ...

    Indian Academy of Sciences (India)

    Sandeep Chakraborty

    Published online: 30 April 2018. Keywords. ... in gene-editing technologies have resulted from the simplicity of the single effector (Cas9) class 2 CRISPR-Cas ... a Cas9/gRNA concentration dependence on off-target activity (Pattanayak et al.

  15. CRISPR-spacer integration reporter plasmids reveal distinct genuine acquisition specificities among CRISPR-Cas I-E variants of Escherichia coli.

    Science.gov (United States)

    Díez-Villaseñor, César; Guzmán, Noemí M; Almendros, Cristóbal; García-Martínez, Jesús; Mojica, Francisco J M

    2013-05-01

    Prokaryotes immunize themselves against transmissible genetic elements by the integration (acquisition) in clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) loci of spacers homologous to invader nucleic acids, defined as protospacers. Following acquisition, mono-spacer CRISPR RNAs (termed crRNAs) guide CRISPR-associated (Cas) proteins to degrade (interference) protospacers flanked by an adjacent motif in extrachomosomal DNA. During acquisition, selection of spacer-precursors adjoining the protospacer motif and proper orientation of the integrated fragment with respect to the leader (sequence leading transcription of the flanking CRISPR array) grant efficient interference by at least some CRISPR-Cas systems. This adaptive stage of the CRISPR action is poorly characterized, mainly due to the lack of appropriate genetic strategies to address its study and, at least in Escherichia coli, the need of Cas overproduction for insertion detection. In this work, we describe the development and application in Escherichia coli strains of an interference-independent assay based on engineered selectable CRISPR-spacer integration reporter plasmids. By using this tool without the constraint of interference or cas overexpression, we confirmed fundamental aspects of this process such as the critical requirement of Cas1 and Cas2 and the identity of the CTT protospacer motif for the E. coli K12 system. In addition, we defined the CWT motif for a non-K12 CRISPR-Cas variant, and obtained data supporting the implication of the leader in spacer orientation, the preferred acquisition from plasmids harboring cas genes and the occurrence of a sequential cleavage at the insertion site by a ruler mechanism.

  16. CRISPR-spacer integration reporter plasmids reveal distinct genuine acquisition specificities among CRISPR-Cas I-E variants of Escherichia coli

    Science.gov (United States)

    Díez-Villaseñor, César; Guzmán, Noemí M.; Almendros, Cristóbal; García-Martínez, Jesús; Mojica, Francisco J.M.

    2013-01-01

    Prokaryotes immunize themselves against transmissible genetic elements by the integration (acquisition) in clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) loci of spacers homologous to invader nucleic acids, defined as protospacers. Following acquisition, mono-spacer CRISPR RNAs (termed crRNAs) guide CRISPR-associated (Cas) proteins to degrade (interference) protospacers flanked by an adjacent motif in extrachomosomal DNA. During acquisition, selection of spacer-precursors adjoining the protospacer motif and proper orientation of the integrated fragment with respect to the leader (sequence leading transcription of the flanking CRISPR array) grant efficient interference by at least some CRISPR-Cas systems. This adaptive stage of the CRISPR action is poorly characterized, mainly due to the lack of appropriate genetic strategies to address its study and, at least in Escherichia coli, the need of Cas overproduction for insertion detection. In this work, we describe the development and application in Escherichia coli strains of an interference-independent assay based on engineered selectable CRISPR-spacer integration reporter plasmids. By using this tool without the constraint of interference or cas overexpression, we confirmed fundamental aspects of this process such as the critical requirement of Cas1 and Cas2 and the identity of the CTT protospacer motif for the E. coli K12 system. In addition, we defined the CWT motif for a non-K12 CRISPR-Cas variant, and obtained data supporting the implication of the leader in spacer orientation, the preferred acquisition from plasmids harboring cas genes and the occurrence of a sequential cleavage at the insertion site by a ruler mechanism. PMID:23445770

  17. Acceptabilité du test VIH proposé aux nourrissons dans les services pédiatriques, en Côte d'Ivoire, Significations pour la couverture du diagnostic pédiatrique

    Science.gov (United States)

    Oga, Maxime; Brou, Hermann; Dago-Akribi, Hortense; Coffie, Patrick; Amani-Bossé, Clarisse; Ékouévi, Didier; Yapo, Vincent; Menan, Hervé; Ndondoki, Camille; Timité-Konan, M.; Leroy, Valériane

    2014-01-01

    éalisation du test pédiatrique disent s'y opposer ; bien entendu, même dans le cas où le conjoint l'accepterait. Discussion: Les mères sont les principales mises en cause et craignent les réprimandes et la stigmatisation. Le père, le conjoint peut être un obstacle, quand il s'oppose au test VIH du nourrisson, ou devenir le facilitateur de sa réalisation s'il est convaincu. Le positionnement du père demeure donc essentiel dans la question de l'acceptabilité du VIH pédiatrique. Les mères en ont conscience et présagent des difficultés à faire dépister ou non les enfants sans avis préalable du conjoint à la fois père, et chef de famille. Conclusion: La question du dépistage pédiatrique du VIH, au terme de notre analyse, met en face trois éléments qui exigent une gestion globale pour assurer une couverture effective. Ces trois éléments n'existeraient pas sans s'influencer, donc ils sont constamment en interaction et empêchent ou favorisent la réalisation ou non du test pédiatrique. Aussi, dans une intention d'aboutir à une couverture effective du dépistage VIH des nourrissons, faut-il tenir compte d'une gestion harmonieuse de ces trois éléments: La première, la mère seule (avec ses connaissances, ses perceptions), son environnement conjugal (de proposition du test intégrant 1- l’époux et / ou père de l'enfant avec ses perceptions et connaissances sur l'infection 2- la facilité de parler du test et sa réalisation chez les deux ou un des parents, la mère) et les connaissances, attitudes et pratiques du personnel de l’établissement sanitaire sur l'infection du VIH. Recommandations: Nos recommandations proposent une redéfinition de l'approche du VIH/sida vers des familles exposées au VIH et une intégration plus accentuée du père facilitant leur propre acceptation du test VIH et celle de leur enfant. PMID:25088574

  18. Nouvelle procédure pour l'augmentation du temps d'usinage simulé en coupe orthogonale

    OpenAIRE

    Guediche , Mayssa; Mabrouki , Tarek; Donnet , Christophe; Bergheau , Jean-Michel; Hamdi , Hedi

    2015-01-01

    International audience; Cette étude présente une nouvelle méthodologie visant à augmenter le temps d'usinage simulé en coupe orthogonale .Le but est d'étudier ultérieurement l'évolution de l'usure des outils de coupe dans le cas de l'usinage de l'acier 42CD4. Un modèle lagrangien est donc développé sous le code de calcul ABAQUS simulant la formation du copeau. Une approche baptisée de « modélisation verticale » est développée dans le but d'augmenter le temps de coupe simulé tout en gardant un...

  19. Portage vaginal du streptocoque du groupe B chez la femme ...

    African Journals Online (AJOL)

    Introduction: le streptocoque du groupe B est le principal agent impliqué dans les infections materno-fœtales, les septicémies et les méningites du nouveau-né à terme. L'objectif est de déterminer le taux de portage maternel du streptocoque du groupe B (SGB) à terme. Méthodes: un prélèvement vaginal a été réalisé de ...

  20. CRISPR-Cas

    NARCIS (Netherlands)

    Jackson, Simon A.; McKenzie, Rebecca E.; Fagerlund, Robert D.; Kieper, Sebastian N.; Fineran, Peter C.; Brouns, Stan J.J.

    2017-01-01

    Bacteria and archaea are engaged in a constant arms race to defend against the ever-present threats of viruses and invasion by mobile genetic elements. The most flexible weapons in the prokaryotic defense arsenal are the CRISPR-Cas adaptive immune systems. These systems are capable of selective

  1. Disposal of the radioactive effluents at the 'Commissariat a l'Energie Atomique'. Treatment leading to evacuation into a river; Probleme du rejet des residus radioactifs liquides au CEA. Traitements aboutissant a des rejets en riviere

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Duhamel; Menoux; Candillon [Commissariat a l' Energie Atomique, Saclay (France). Centre d' Etudes Nucleaires

    1958-07-01

    to find out in loaded water, 10) Impot elements other than Sr{sup 90} are also studied. (author) [French] Le probleme du traitement des residus radioactifs liquides au CEA est envisage sous l'angle du rejet ultime en riviere dans des conditions optima permettant de satisfaire aux Normes de la protection. 2) A Saclay, ou l'on ne dispose que d'un etang ou l'eau ne se renouvelle pas, les liquides epures sont envoyes par camion citerne a Fontenay-aux-Roses, ou ils sont deverses provisoirement - dans les egouts - en attendant qu'un point de rejet en Seine ait ete determine. 3) Au Bouchet, les eaux residuaires de l'Usine de traitement de minerais d'urano-thorianite devront etre traitees en deux temps de facon a separer le radium dans une premiere phase, ce qui facilitera l'epuration au cours de la deuxieme phase. 4) En vue des futurs rejets a Marcoule, une etude a ete conduite a Saclay, sur des effluents synthetiques - type Marcoule - ayant pour but de mettre au point des procedes d'elimination selective du Sr d'une part, du Cs d'autre part, par coprecipitation. 5) Dans le cas general du rejet ultime en riviere, les problemes suivants sont successivement envisages: - predilution entre les bassins de stockage des eaux epurees et le fleuve; - mode d'injection dans le fleuve; - dilution dans le fleuve (etude prealable par traceurs); - evolution de l'activite dans les eaux du fleuve (adsorption par les organismes inertes ou vivants, contamination des berges); - incidence sur le choix d'un site; - dilution isotopique. 6) Ce dernier probleme est specialement detaille. 7) La teneur de l'eau en un element donne conditionne la dilution isotopique de son isotope radioactif. L'analyse decelant une carence, il est possible d'y suppleer par des rejets d'isotope stable. 8) Cette methode conduit en certains cas a des analyses delicates (en particulier dans le cas du {sup 90}Sr), la teneur en isotope

  2. The role of Cas8 in type I CRISPR interference.

    Science.gov (United States)

    Cass, Simon D B; Haas, Karina A; Stoll, Britta; Alkhnbashi, Omer S; Sharma, Kundan; Urlaub, Henning; Backofen, Rolf; Marchfelder, Anita; Bolt, Edward L

    2015-05-05

    CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat) systems provide bacteria and archaea with adaptive immunity to repel invasive genetic elements. Type I systems use 'cascade' [CRISPR-associated (Cas) complex for antiviral defence] ribonucleoprotein complexes to target invader DNA, by base pairing CRISPR RNA (crRNA) to protospacers. Cascade identifies PAMs (protospacer adjacent motifs) on invader DNA, triggering R-loop formation and subsequent DNA degradation by Cas3. Cas8 is a candidate PAM recognition factor in some cascades. We analysed Cas8 homologues from type IB CRISPR systems in archaea Haloferax volcanii (Hvo) and Methanothermobacter thermautotrophicus (Mth). Cas8 was essential for CRISPR interference in Hvo and purified Mth Cas8 protein responded to PAM sequence when binding to nucleic acids. Cas8 interacted physically with Cas5-Cas7-crRNA complex, stimulating binding to PAM containing substrates. Mutation of conserved Cas8 amino acid residues abolished interference in vivo and altered catalytic activity of Cas8 protein in vitro. This is experimental evidence that Cas8 is important for targeting Cascade to invader DNA. © 2015 Authors.

  3. 983-IJBCS-Article-Charababil Mohamed M

    African Journals Online (AJOL)

    hp

    Qualitatives. DAF, SEF: Mayotte; 90 p. Pascal O. 2002. Plantes et forêts de Mayotte. Patrimoines Naturels 53, MNHN, IEGB,. 108p. Rajemison AH. 2010. Typologie de la végétation rémanente en vue d'une restauration écologique. Cas du site d'Ankafobe – Tampoketsa d'Ankazobe -. Hautes terres centrales de Madagascar.

  4. Phrases sans parole : à propos d'une histoire d'amour du XXe siècle

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Patron Sylvie

    2012-07-01

    Full Text Available Cet article porte sur les relations entre récit (plus précisément narration et fiction dans une nouvelle de Mario Benedetti, "Cinq ans de vie", extraite des Histoires de Paris. Son cadre de référence théorique est la théorie non communicationnelle ou théorie poétique de la narration de S.-Y. Kuroda et Ann Banfield. Dans la première partie, je présente brièvement la théorie pour pouvoir déterminer ensuite ses modalités d"application à la nouvelle de Benedetti (nouvelle "fantastique", selon le terme de l'auteur, "transfictionnelle" selon la terminologie contemporaine. La théorie peut se résumer dans les huit propositions suivantes: (1 Les théories communicationnelles du récit, basées sur les concepts de narrateur et de narrataire, réels ou fictionnels, ne peuvent rendre compte que d’une sous-catégorie de récits de fiction ; (2 Il existe des récits de fiction avec narrateur (sous-entendu fictionnel et des récits de fiction sans narrateur. (3 Le narrateur omniscient est, dans la plupart des cas, une explication ad hoc. (4 Il convient de distinguer clairement ce qui relève du contenu de la représentation fictionnelle et ce qui relève des moyens mobilisés au service de la construction de cette représentation ; (5 Le récit de fiction moderne à la troisième personne peut être considéré comme une collection structurée d’informations, les unes sans origine assignable dans le monde de la fiction, les autres provenant d’un ou de plusieurs sujets de conscience appartenant au monde de la fiction ; (6 La lecture d’un récit de fiction moderne à la troisième personne implique que l’on reconnaisse les intentions de l’auteur relativement au caractère objectif ou subjectif des phrases ou des contextes. La deuxième partie propose une approche du dénouement de "Cinq ans de vie" selon le protocole défini par Kuroda et Banfield. Après avoir montré que la théorie pouvait prétendre à l'adéquation descriptive

  5. Exploiting CRISPR-Cas to manipulate Enterococcus faecalis populations.

    Science.gov (United States)

    Hullahalli, Karthik; Rodrigues, Marinelle; Palmer, Kelli L

    2017-06-23

    CRISPR-Cas provides a barrier to horizontal gene transfer in prokaryotes. It was previously observed that functional CRISPR-Cas systems are absent from multidrug-resistant (MDR) Enterococcus faecalis , which only possess an orphan CRISPR locus, termed CRISPR2, lacking cas genes. Here, we investigate how the interplay between CRISPR-Cas genome defense and antibiotic selection for mobile genetic elements shapes in vitro E. faecalis populations. We demonstrate that CRISPR2 can be reactivated for genome defense in MDR strains. Interestingly, we observe that E. faecalis transiently maintains CRISPR targets despite active CRISPR-Cas systems. Subsequently, if selection for the CRISPR target is present, toxic CRISPR spacers are lost over time, while in the absence of selection, CRISPR targets are lost over time. We find that forced maintenance of CRISPR targets induces a fitness cost that can be exploited to alter heterogeneous E. faecalis populations.

  6. La thèse de Feldstein-Horioka: Ue mesure de la mobilité internationale du capital

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    de Sousa Andrade Alberto Joao

    2007-01-01

    Full Text Available (portugalski Nous présentons la thèse de Feldstein-Horioka (F-H sur la mobilité du capital et les développements qu’elle a suscités. Il s’agit d’une thèse qui est très ouverte à la possibilité de réfutation et dont l’histoire illustre bien la pensée méthodologique nonnaïve de Karl Popper: les discussions sur sa réfutation, en parallèle avec les tentatives de consolidation ("d’immunisation", au sens de K. Popper, ont conduit à de nouvelles lectures sur la mobilité du capital. Ces efforts de consolidation (d’ "immunization" ont conduit cette thèse à intégrer des nouvelles méthodologies économétriques et à changer partiellement son objet, en mesurant aussi la soutenabilité externe. La thèse de F-H constitue un cas exemplaire d’intégration de l’analyse théorique et d’analyse empirique.

  7. NSP-CAS Protein Complexes: Emerging Signaling Modules in Cancer.

    Science.gov (United States)

    Wallez, Yann; Mace, Peter D; Pasquale, Elena B; Riedl, Stefan J

    2012-05-01

    The CAS (CRK-associated substrate) family of adaptor proteins comprises 4 members, which share a conserved modular domain structure that enables multiple protein-protein interactions, leading to the assembly of intracellular signaling platforms. Besides their physiological role in signal transduction downstream of a variety of cell surface receptors, CAS proteins are also critical for oncogenic transformation and cancer cell malignancy through associations with a variety of regulatory proteins and downstream effectors. Among the regulatory partners, the 3 recently identified adaptor proteins constituting the NSP (novel SH2-containing protein) family avidly bind to the conserved carboxy-terminal focal adhesion-targeting (FAT) domain of CAS proteins. NSP proteins use an anomalous nucleotide exchange factor domain that lacks catalytic activity to form NSP-CAS signaling modules. Additionally, the NSP SH2 domain can link NSP-CAS signaling assemblies to tyrosine-phosphorylated cell surface receptors. NSP proteins can potentiate CAS function by affecting key CAS attributes such as expression levels, phosphorylation state, and subcellular localization, leading to effects on cell adhesion, migration, and invasion as well as cell growth. The consequences of these activities are well exemplified by the role that members of both families play in promoting breast cancer cell invasiveness and resistance to antiestrogens. In this review, we discuss the intriguing interplay between the NSP and CAS families, with a particular focus on cancer signaling networks.

  8. Control of gene expression by CRISPR-Cas systems

    Science.gov (United States)

    2013-01-01

    Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) loci and their associated cas (CRISPR-associated) genes provide adaptive immunity against viruses (phages) and other mobile genetic elements in bacteria and archaea. While most of the early work has largely been dominated by examples of CRISPR-Cas systems directing the cleavage of phage or plasmid DNA, recent studies have revealed a more complex landscape where CRISPR-Cas loci might be involved in gene regulation. In this review, we summarize the role of these loci in the regulation of gene expression as well as the recent development of synthetic gene regulation using engineered CRISPR-Cas systems. PMID:24273648

  9. Genome-wide Specificity of Highly Efficient TALENs and CRISPR/Cas9 for T Cell Receptor Modification

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Friederike Knipping

    2017-03-01

    Full Text Available In T cells with transgenic high-avidity T cell receptors (TCRs, endogenous and transferred TCR chains compete for surface expression and may pair inappropriately, potentially causing autoimmunity. To knock out endogenous TCR expression, we assembled 12 transcription activator-like effector nucleases (TALENs and five guide RNAs (gRNAs from the clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR/CRISPR-associated (Cas9 system. Using TALEN mRNA, TCR knockout was successful in up to 81% of T cells. Additionally, we were able to verify targeted gene addition of a GFP gene by homology-directed repair at the TALEN target site, using a donor suitable for replacement of the reporter transgene with therapeutic TCR chains. Remarkably, analysis of TALEN and CRISPR/Cas9 specificity using integrase-defective lentiviral vector capture revealed only one off-target site for one of the gRNAs and three off-target sites for both of the TALENs, indicating a high level of specificity. Collectively, our work shows highly efficient and specific nucleases for T cell engineering.

  10. Functional Insights Revealed by the Kinetic Mechanism of CRISPR/Cas9.

    Science.gov (United States)

    Raper, Austin T; Stephenson, Anthony A; Suo, Zucai

    2018-02-28

    The discovery of prokaryotic adaptive immunity prompted widespread use of the RNA-guided clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)-associated (Cas) endonuclease Cas9 for genetic engineering. However, its kinetic mechanism remains undefined, and details of DNA cleavage are poorly characterized. Here, we establish a kinetic mechanism of Streptococcus pyogenes Cas9 from guide-RNA binding through DNA cleavage and product release. Association of DNA to the binary complex of Cas9 and guide-RNA is rate-limiting during the first catalytic turnover, while DNA cleavage from a pre-formed ternary complex of Cas9, guide-RNA, and DNA is rapid. Moreover, an extremely slow release of DNA products essentially restricts Cas9 to be a single-turnover enzyme. By simultaneously measuring the contributions of the HNH and RuvC nuclease activities of Cas9 to DNA cleavage, we also uncovered the kinetic basis by which HNH conformationally regulates the RuvC cleavage activity. Together, our results provide crucial kinetic and functional details regarding Cas9 which will inform gene-editing experiments, guide future research to understand off-target DNA cleavage by Cas9, and aid in the continued development of Cas9 as a biotechnological tool.

  11. CRISPR/Cas9: Transcending the Reality of Genome Editing.

    Science.gov (United States)

    Chira, Sergiu; Gulei, Diana; Hajitou, Amin; Zimta, Alina-Andreea; Cordelier, Pierre; Berindan-Neagoe, Ioana

    2017-06-16

    With the expansion of the microbiology field of research, a new genome editing tool arises from the biology of bacteria that holds the promise of achieving precise modifications in the genome with a simplicity and versatility that surpasses previous genome editing methods. This new technique, commonly named CRISPR/Cas9, led to a rapid expansion of the biomedical field; more specifically, cancer characterization and modeling have benefitted greatly from the genome editing capabilities of CRISPR/Cas9. In this paper, we briefly summarize recent improvements in CRISPR/Cas9 design meant to overcome the limitations that have arisen from the nuclease activity of Cas9 and the influence of this technology in cancer research. In addition, we present challenges that might impede the clinical applicability of CRISPR/Cas9 for cancer therapy and highlight future directions for designing CRISPR/Cas9 delivery systems that might prove useful for cancer therapeutics. Copyright © 2017 The Author(s). Published by Elsevier Inc. All rights reserved.

  12. Le ministre du Commerce international du Canada rencontre des ...

    International Development Research Centre (IDRC) Digital Library (Canada)

    17 juil. 2017 ... La promotion de l'entrepreneuriat, la façon dont le commerce peut profiter aux femmes et à leur famille, et la création d'emplois pour les plus vulnérables étaient au coeur de la discussion en table ronde du ministre du Commerce international du Canada, l'honorable François-Philippe Champagne, et des ...

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  16. Corrective Action Investigation Plan for Corrective Action Unit 536: Area 3 Release Site, Nevada Test Site, Nevada (Rev. 0 / June 2003), Including Record of Technical Change No. 1

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    None

    2003-06-27

    This Corrective Action Investigation Plan contains the U.S. Department of Energy, National Nuclear Security Administration Nevada Site Office's approach to collect the data necessary to evaluate corrective action alternatives (CAAs) appropriate for the closure of Corrective Action Unit (CAU) 536: Area 3 Release Site, Nevada Test Site, Nevada, under the Federal Facility Agreement and Consent Order. Corrective Action Unit 536 consists of a single Corrective Action Site (CAS): 03-44-02, Steam Jenny Discharge. The CAU 536 site is being investigated because existing information on the nature and extent of possible contamination is insufficient to evaluate and recommend corrective action alternatives for CAS 03-44-02. The additional information will be obtained by conducting a corrective action investigation (CAI) prior to evaluating CAAs and selecting the appropriate corrective action for this CAS. The results of this field investigation are to be used to support a defensible evaluation of corrective action alternatives in the corrective action decision document. Record of Technical Change No. 1 is dated 3-2004.

  17. Contribution to the study of the vertical molten zone process (1963); Contribution a l'etude du procede de la zone fondue verticale (1963)

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Lenzin, M [Commissariat a l' Energie Atomique, Saclay (France). Centre d' Etudes Nucleaires

    1963-07-01

    Construction and use of several molten zone apparatuses operating either vertically or horizontally. Efficient purification of uranyl nitrate hexahydrate but less successful in the case of other hydrated double salts and of zirconyl chloride in the hydrochloric gel form. Demonstration and study of the dissymmetry in the direction of the transport of the impurity during, the purification by a vertical molten zone process. (author) [French] Construction et utilisation de plusieurs appareils de zone fondue travaillant soit en vertical, soit en horizontal. Purification efficace du nitrate d'uranyle hexahydrate mais peu significative dans le cas des autres couples de sels hydrates et du chlorure de zirconyle a l'etat de gel chlorhydrique. Mise en evidence et etude de la dissymetrie sur le sens de transport de l'impurete au cours de la purification par zone fondue verticale. (auteur)

  18. Interference activity of a minimal Type I CRISPR–Cas system from Shewanella putrefaciens

    Science.gov (United States)

    Dwarakanath, Srivatsa; Brenzinger, Susanne; Gleditzsch, Daniel; Plagens, André; Klingl, Andreas; Thormann, Kai; Randau, Lennart

    2015-01-01

    Type I CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)–Cas (CRISPR-associated) systems exist in bacterial and archaeal organisms and provide immunity against foreign DNA. The Cas protein content of the DNA interference complexes (termed Cascade) varies between different CRISPR-Cas subtypes. A minimal variant of the Type I-F system was identified in proteobacterial species including Shewanella putrefaciens CN-32. This variant lacks a large subunit (Csy1), Csy2 and Csy3 and contains two unclassified cas genes. The genome of S. putrefaciens CN-32 contains only five Cas proteins (Cas1, Cas3, Cas6f, Cas1821 and Cas1822) and a single CRISPR array with 81 spacers. RNA-Seq analyses revealed the transcription of this array and the maturation of crRNAs (CRISPR RNAs). Interference assays based on plasmid conjugation demonstrated that this CRISPR-Cas system is active in vivo and that activity is dependent on the recognition of the dinucleotide GG PAM (Protospacer Adjacent Motif) sequence and crRNA abundance. The deletion of cas1821 and cas1822 reduced the cellular crRNA pool. Recombinant Cas1821 was shown to form helical filaments bound to RNA molecules, which suggests its role as the Cascade backbone protein. A Cascade complex was isolated which contained multiple Cas1821 copies, Cas1822, Cas6f and mature crRNAs. PMID:26350210

  19. CRISPR-Cas Technologies and Applications in Food Bacteria.

    Science.gov (United States)

    Stout, Emily; Klaenhammer, Todd; Barrangou, Rodolphe

    2017-02-28

    Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPRs) and CRISPR-associated (Cas) proteins form adaptive immune systems that occur in many bacteria and most archaea. In addition to protecting bacteria from phages and other invasive mobile genetic elements, CRISPR-Cas molecular machines can be repurposed as tool kits for applications relevant to the food industry. A primary concern of the food industry has long been the proper management of food-related bacteria, with a focus on both enhancing the outcomes of beneficial microorganisms such as starter cultures and probiotics and limiting the presence of detrimental organisms such as pathogens and spoilage microorganisms. This review introduces CRISPR-Cas as a novel set of technologies to manage food bacteria and offers insights into CRISPR-Cas biology. It primarily focuses on the applications of CRISPR-Cas systems and tools in starter cultures and probiotics, encompassing strain-typing, phage resistance, plasmid vaccination, genome editing, and antimicrobial activity.

  20. Le mélanome malin: une tumeur rare des fosses nasales - à propos d'une série de 10 cas

    Science.gov (United States)

    Errachdi, Amal; Epala, Brice Nkoua; Asabbane, Amal; Kabbali, Naoual; Hemmich, Mariem; Kebdani, Tayeb; Benjaafar, Noureddine

    2014-01-01

    Le mélanome malin des fosses nasales est une tumeur rare mais très agressive, de traitement complexe et de pronostic défavorable. Son traitement relève en principe d'une prise en charge essentiellement chirurgicale complétée par une radiothérapie. L'objectif de ce travail est de rapporter les caractéristiques cliniques, thérapeutiques et évolutives des mélanomes des fosses nasales. Nous avons analysé rétrospectivement 10 cas de mélanomes des fosses nasales suivis à l'institut national d'oncologie de Rabat. La rhinoscopie avec biopsie a permis la confirmation histologique du diagnostic de mélanome. Le bilan d'extension comprenait une tomodensitométrie ou imagerie par résonnance magnétique du massif facial, une radiographie thoracique et une échographie abdominale. Dans notre série, l’âge médian était de 67.5 ans, avec une prédominance féminine (7femmes et 3hommes). Le délai médian de découverte était de 6 mois. Deux patients étaient métastatiques d'emblée, et toutes les tumeurs étaient localement avancées au moment du diagnostic. Sept patients ont été opérés avec des limites chirurgicales envahies dans 2 cas et 3 patients étaient inopérables. 2 patients ont été irradiés après la chirurgie et 2 patients ont reçu une chimiothérapie arrêtée au moment de la progression. Deux patients ont récidivé après traitement, et un patient était en mauvais état général et a bénéficié uniquement de soins palliatifs. Tous les patients sont décédés avec un délai médian de survie de 12 mois. Le mélanome malin muqueux des fosses nasales, bien que rare, demeure une pathologie de pronostic défavorable et pose des problèmes de prise en charge. PMID:25404963