Efecto del Polimorfismo del Intrón 6 del Gen LTF Bovino con Algunas Enfermedades de Alta Incidencia en la Producción Lechera Effect of the Polymorphism in the Intron 6 of the Bovine LTF Gene with Some Diseases of High Incidence in Dairy Production

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Nancy Rodríguez Colorado

2012-06-01

Full Text Available Resumen. El objetivo de la investigación fue determinar la asociación del polimorfismo (C/T del intrón 6 del gen de la bLTF, con la incidencia de algunas enfermedades en ganado lechero. Para ello fueron observadas 482 vacas Holstein, durante al menos una lactancia, determinando la incidencia de algunas de las enfermedades mas importantes en la ganaderia de leche. La genotipificación para el polimorfismo de bLTF, se hizo usando la técnica de PCR-RFLP con DNA extraído de sangre periférica mediante la técnica de salting out. Para estudiar la asociación de los alelos del gen LTF, se utilizó el alelo B como control y se determinó el Odds Ratio (OR. Como resultados se obtiene que las frecuencias de los alelos A y B para el gen bLTF fueron 0,78 y 0,22 respectivamente. Las frecuencias genotípicas fueron 0,60, 0,36 y 0,04 para AA, AB y BB respectivamente. Una asociación altamente significativa (P≤0,001 fue hallada entre la incidencia de mastitis clínica y el polimorfismo del gen LTF. Los individuos portadores del alelo B tuvieron una probabilidad de incidencia de mastitis dos veces superior a los portadores del alelo A (OR=2.115 IC del 95%, 1.392-3.213. En el caso de la mastitis subclínica la probabilidad de incidencia fue de 1,6 veces más en los portadores del alelo B, con un OR=1.637 IC del 95% 1.184-2.264. Para la incidencia de enfermedades metabólicas, reproductivas, respiratorias, parasitarias, cáncer y cojeras, no se halló diferencia significativa (P>0,05 y se encontró asociación del alelo B del polimorfismo del intrón 6 del gen bLTF con la incidencia de mastitis clínica y subclínica.Abstract. The research objective was to determine the association of polymorphism (C/T of intron 6 bLTF gene, with the incidence of some diseases on dairy cattle. A total of 482 Holstein cows located in different herds in the department of Antioquia - Colombia, were used to follow the incidence of disease, for at least a full lactation

Relación del polimorfismo C-514T del gen de la lipasa hepática con indicadores nutricionales y lipoproteínas en una muestra poblacional peruana: una perspectiva nutrigenética

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Doris Huerta

2008-12-01

Full Text Available Introducción: Las enfermedades cardiovasculares son una de las principales causas de muerte en todo el mundo. El promotor del gen de la lipasa hepática presenta un polimorfismo funcional C-514T que se relaciona con la actividad de la enzima, la variación de los niveles de lipoproteínas y un posible riesgo para desarrollar enfermedades cardiovasculares. Objetivos: Establecer la relación del polimorfismo C-514T del promotor del gen de la lipasa hepática con indicadores nutricionales y los niveles de lipoproteínas plasmáticas en una muestra de peruanos saludables. Diseño: Estudio descriptivo, transversal, asociativo. Lugar: Centro de Investigación de Bioquímica y Nutrición Alberto Guzmán Barrón, Facultad de Medicina, Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Participantes: Noventiuna personas sanas de ambos sexos, cuyas edades fluctuaban entre 18 y 58 años, voluntarios con consentimiento informado. Intervenciones: Extracción del ADN genómico a partir de muestras sanguíneas según metodología estándar. Toma de medidas antropométricas, estableciéndose los indicadores nutricionales, determinación del perfil lipídico por el método enzimático. Análisis del polimorfismo C-514T mediante la técnica de PCR/RFLP, con primers específicos y digestión con la enzima de restricción NlaIII, detectándose los fragmentos de RFLP por electroforesis en gel de poliacrilamida (PAGE y tinción con nitrato de plata. Principales medidas de resultados: Frecuencias genotípicas y alélicas del gen de la lipasa hepática y relación con parámetros lipídicos y nutricionales. Resultados: Se encontró las frecuencias genotípicas CC=0,143; CT=0,593 y TT = 0,264, siendo la distribución consistente con el equilibrio de Hardy-Weinberg (X2 =3,8024, g.l.=1, p = 0,086. Las frecuencias alélicas fueron alelo C = 0,4395 y el alelo T = 0,5605. Los niveles de colesterol, HDLc, LDLc, TG y los promedios de pliegue subcutáneo, el IMC y el porcentaje de

Polimorfismos de los genes LEP, LDLR, APOA4 y sus relaciones con el sobrepeso, la obesidad y el riesgo de enfermedades crónicas en adultos del estado Sucre, Venezuela

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Greta Rodríguez-Arroyo

2016-03-01

Conclusión. En la mayoría de las variantes genéticas estudiadas, se registró la asociación con el sobrepeso y la obesidad de los genotipos ancestrales, aunque sin ser significativa. El polimorfismo rs5742911 podría resultar útil como indicador del riesgo de enfermedades crónicas.

Una aproximación al significado biológico del polimorfismo del Complejo Mayor de Histocompatibilidad. El modelo de la asociación HLA y ARJ

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Gloria Garavito

2002-01-01

Full Text Available Objetivos. Llevar a cabo una actualización del estado del arte acerca del significado biológico del polimorfismo del sistema genético Complejo Mayor de Histocompatibilidad (CMH. Revisar la literatura relacionada con la asociación de los antígenos de histocompatibilidad en el humano (HLA y la susceptibilidad o resistencia al desarrollo de la artritis reumatoidea juvenil (ARJ. Presentar un modelo hipotético para la comprensión de la susceptibilidad genética a desarrollar ARJ. Fuente de datos. Las referencia bibliográficas que soportan este artículo se obtuvieron a través de búsquedas en las siguientes bases de datos: Pubmed, Ovid, Ebsco. Inicialmente se encontraron 139 artículos, de los cuales se seleccionaron 75. Se incluyó también información del desarrollo de un proyecto de investigación de nuestro grupo, «Polimorfismo molecular de los antígenos HLA en ARJ» (cod. Colciencias 1215-04-280-96. Resultados. L artritis reumatoidea juvenil (ARJ es la enfermedad más común en la práctica reumatológica pediátrica y la menos estudiada inmunogenéticamente. A diferencia de la artritis reumatoide (AR del adulto, la ARJ tiene ciertas variantes clínicas, lo que la hace más interesante desde el punto de vista genético (fenotipos. En su etiopatogenia se han identificado varios factores que en su conjunto explicarían el inicio y la perpetuación de la respuesta inflamatoria que afecta las articulaciones y tejidos vecinos, y que de no ser controlados llegan a destruirlos, tal como sucede en otras enfermedades autoinmunes. La patogénesis de la enfermedad puede determinarse por alteraciones a nivel de complejo trimolecular, constituido por un antígeno putativo, el receptor de linfocitos T y el Complejo Mayor de Histocompatibilidad (CMH. Nuestro grupo durante los últimos 4 años ha estado estudiando la asociación entre ARJ y el polimorfismo de los alelos HLA DRB1* y DQB1* en niños mestizos de nuestro país. Los resultados son

Polimorfismo na produção de medicamentos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Gabriel Lima Barros de Araujo

2012-01-01

Full Text Available O polimorfismo pode ocasionar desvios de qualidade durante o processo produtivo e influenciar o desempenho dos medicamentos. Por isso, o entendimento do fenômeno e suas implicações abre um campo amplo de possibilidades a serem exploradas na área farmacêutica, incluindo o surgimento de novos paradigmas e ferramentas na garantia da qualidade de medicamentos. Este trabalho apresenta uma introdução aos aspectos básicos do fenômeno do polimorfismo e suas implicações na produção e controle de medicamentos, com ênfase no polimorfismo dos fármacos.

Diagnóstico genético del polimorfismo en citocromo P450 mediante ensayo de PCR múltiplex (Práctica en laboratorio virtual Cibertorio)

OpenAIRE

Herráez, Angel

2017-01-01

Guión de trabajo para el laboratorio virtual «Cibertorio» en Biomodel.UAH.es Se habla de diversidad genética de los individuos como el resultado de que, en diversas regiones del genoma, unas personas tenemos secuencias de nucleótidos que nos diferencian de otras; esto se denomina polimorfismo genético. Cuando estas regiones polimórficas corresponden a zonas codificantes de un producto, existen consecuencias funcionales. La superfamilia enzimática citocromo P450 juega un papel crucial ...

Polimorfismos del gen pfmdr1 en muestras clínicas de Plasmodium falciparum y su relación con la respuesta terapéutica a antipalúdicos y paludismo grave en Colombia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Paula Montoya

2007-06-01

Conclusiones. Los polimorfismos 86Tir y 1246Tir en el gen pfmdr1 no son útiles como factores de predicción de falla terapéutica o paludismo grave en los municipios estudiados. Este estudio describe por primera vez la presencia del alelo 86Tir en cuatro muestras clínicas de Suramérica.

Association between the DRD2-141C Insertion/Deletion polymorphism and schizophrenia Associação entre o polimorfismo -141C Ins/Del do gene do DRD2 e esquizofrenia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Quirino Cordeiro

2009-06-01

Full Text Available Epidemiological studies have demonstrated that the genetic component is an important risk factor for the development of schizophrenia. The genes that codify the different compounds of the dopaminergic system have created interest for molecular investigations in patients with schizophrenia because the antipsychotic drugs, especially those of first generation, act on this cerebral system. Thus the aim of the present study was to investigate the possible association between the -141 Ins/Del (rs1799732 polymorphism of the dopamine receptor type 2 (DRD2 and schizophrenia. The distribution of the alleles and genotypes of the studied polymorphism was investigated in a sample of 229 patients and 733 controls. There were statistical differences in the allelic (χ2=9.78; p=0.001 and genotypic genotypic (χ2=12.74; p=0.001 distributions between patients and controls. Thus the -141C Ins/Del polymorphism of the DRD2 gene (allele Ins was associated to the SCZ phenotype in the investigated sample.Estudos epidemiológicos têm demonstrado que o componente genético é um importante fator de risco para o desenvolvimento de esquizofrenia. Os genes que codificam os diferentes componentes do sistema dopaminérgico passaram a despertar interesse para os estudos moleculares em pacientes com esquizofrenia, devido ao fato dos antipsicóticos, em especial os de primeira geração, exercerem sua ação nesse sistema. Assim, o objetivo do presente estudo foi investigar a possível associação entre polimorfismo -141C Ins/Del (rs1799732 do gene do receptor dopaminérgico tipo 2 (DRD2 e esquizofrenia. Um total de 229 pacientes e 733 controles pareados para sexo e idade foi selecionado com o objetivo de investigar a distribuição dos alelos e genótipos do polimorfismo investigado entre os grupos de pacientes e controles. Houve diferença estatisticamente significante nas distribuições alélica (χ2=9,78; p=0,001 e genotípica (χ2=12,74; p=0,001 entre pacientes e

BSM searches (SUSY and Exotic) from ATLAS

CERN Document Server

ATLAS Collaboration; The ATLAS collaboration

2015-01-01

Searches for new physics beyond the Standard Model (SM) at the LHC are mainly driven by two approaches: a signature-based search where one looks for a deviation from the SM prediction in event yield or kinematic properties, and a more theory-oriented approach where the search is designed to look for specific signatures/topologies predicted by certain beyond standard model (BSM ) scenarios. Typical examples for the latter are searches for Supersymmetry and other BSM theories with extended symmetries. Supersymmetry predicts a new partner for every SM particle. An extension to the SM by introducing new gauge or global symmetries (including in Hidden Sector) usually leads to the presence of new heavy gauge bosons. Extensive searches for such particles have been performed in ATLAS at LHC in the context of Supersymmetry, Extended Gauge models, Technicolor, Little Higgs, Extra Dimensions, Left-Right symmetric models, and many other BSM scenarios. Highlights from these searches are presented.

Searches for BSM Higgs Bosons with ATLAS

CERN Document Server

Navarro, Gabriela; The ATLAS collaboration

2015-01-01

The discovery of a Higgs-like boson with a mass of about 125GeV has prompted the question of whether or not this particle is part of a much larger and more complex Higgs sector than that envisioned in the Standard Model. In this talk, the current results from the ATLAS Experiment regarding Beyond-the-Standard Model (BSM) Higgs hypothesis tests are outlined. Searches for additional Higgs bosons are presented and interpreted in well-motivated BSM Higgs frameworks, such as two-Higgs-doublet Models and the Minimal Supersymmetric Standard Model.

Composición de Ácidos Grasos (MUFA y CLA) en Tejido Muscular de Bovino Relacionado con la Presencia del Polimorfismo g.878TC en el Gen SCD

OpenAIRE

Inostroza, K; Larama, G; Sepúlveda, N

2012-01-01

El tejido muscular de muchos animales domésticos es fuente de proteínas, grasa y minerales para los seres humanos y está compuesto por una serie de estructuras que le otorgan propiedades nutricionales y bioquímicas. En los ultimos años se ha identificado un polimorfismo de único nucleótido (SNP) en el gen SCD (g.878TC), que influye sobre la composición de ácidos grasos en los bovinos. El objetivo de este estudio fue determinar la presencia del SNP g.878TC en músculo Longissimus dorsi de bovin...

pyBSM: A Python package for modeling imaging systems

Science.gov (United States)

LeMaster, Daniel A.; Eismann, Michael T.

2017-05-01

There are components that are common to all electro-optical and infrared imaging system performance models. The purpose of the Python Based Sensor Model (pyBSM) is to provide open source access to these functions for other researchers to build upon. Specifically, pyBSM implements much of the capability found in the ERIM Image Based Sensor Model (IBSM) V2.0 along with some improvements. The paper also includes two use-case examples. First, performance of an airborne imaging system is modeled using the General Image Quality Equation (GIQE). The results are then decomposed into factors affecting noise and resolution. Second, pyBSM is paired with openCV to evaluate performance of an algorithm used to detect objects in an image.

Thermostability of bovine submaxillary mucin (BSM) in bulk solution and at a sliding interface

DEFF Research Database (Denmark)

Madsen, Jan Busk; Pakkanen, Kirsi I.; Lee, Seunghwan

2014-01-01

Thermostability of bovine submaxillary mucin (BSM) was studied in terms of its structure, hydrodynamic size, surface adsorption, and lubricating properties in the temperature range of 5-85°C. The overall random coil structure of BSM showed a gradual loosening with increasing temperature as charac......Thermostability of bovine submaxillary mucin (BSM) was studied in terms of its structure, hydrodynamic size, surface adsorption, and lubricating properties in the temperature range of 5-85°C. The overall random coil structure of BSM showed a gradual loosening with increasing temperature...... as characterized by circular dichroism (CD) spectroscopy, but this change was fully reversible upon lowering temperature. Extended heating up to 120min at 80°C did not make any appreciable changes in the structure of BSM when it was cooled to room temperature. The hydrodynamic size of BSM, as studied by dynamic...

Estructura y diversidad genética en vacas Holstein de Antioquia usando un polimorfismo del gen bGH

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Juan Rincon F.

2013-03-01

Full Text Available Objetivo. Determinar las frecuencias alélicas y genotípicas del polimorfismo del intrón 3 del gen bGH y estimar algunos parámetros de estructura poblacional en ganado Holstein. Materiales y métodos. El estudio se realizó con 1366 vacas Holstein en 120 hatos de 11 municipios del departamento de Antioquia. Se extrajo DNA por el método de Salting out y la genotipificación se realizó usando la técnica de PCR-RFLPs. La diversidad genética se determinó mediante la comparación de las heterocigosidades, El equilibrio de Hardy-Weinberg (HW y la diferenciación genética entre las poblaciones se realizó usando el software Arlequín 2.0 Las frecuencias alélicas y genotípicas se evaluaron mediante el paquete estadístico SAS®. Resultados. Las frecuencias genotípicas encontradas fueron 0.764 (+/+, 0.223 (+/- y 0.013 (-/- y las frecuencias alélicas 0.876 (+ y 0.124 (-. No se encontraron desviaciones del Equilibrio de Hardy Weinberg en ninguna de las subpoblaciones. La diversidad genética determinada mediante la comparación de las heterocigosidades fue relativamente baja entre poblaciones pero al interior de estas no. El valor de FST de toda la población fue de 0.0068 y significativo (p<0.05, algunos FST pareados también lo fueron, tomando valores desde 0.0 a 0.13. Los estadísticos FIT y FIS no fueron significativos. Conclusiones. El gen bGH es un candidato interesante para evaluar características de importancia económica ya que no parece haber sido sometido a selección directa, presenta una variabilidad media en las poblaciones, observándose diferenciación genética significativa entre distintos municipios, producto de los diferentes sistemas de producción y acceso a las biotecnologías.

El polimorfismo en los alergenos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Alfredo Lagares

2002-03-01

Full Text Available Los alergenos son antígenos que inducen una respuesta inmunológica mediada por anticuerpos tipo IgE. Estos pueden provenir de diferentes fuentes como pólenes, ácaros, mohos, animales, insectos y alimentos. Una molécula alergénica consiste en un número determinado de epítopes o determinantes antigénicos. Algunos alergenos están constituidos por varias moléculas similares, las cuales presentan variaciones menores en la secuencia de aminoácidos, es decir, presentan polimorfismo y de acuerdo con el grado de similitud que presenten, se denominan isoalergenos o variantes. El polimorfismo puede ser el resultado de la presencia de varios alelos, como también de la presencia de familias de genes relacionados. Este fenómeno se ha detectado en alergenos de diferentes fuentes como los ácaros, los pólenes y las cucarachas, entre otros. El polimorfismo puede tener un efecto importante sobre los epítopes reconocidos por los linfocitos T, por los anticuerpos monoclonales y por la IgE de pacientes alérgicos, lo cual afecta la capacidad alergénica o el grado de reactividad cruzada con alergenos de otras especies. La existencia de isoformas con una capacidad nula o disminuida de unirse a la IgE, pero con capacidad de estimular los linfocitos T, se ha planteado como una alternativa atractiva en la inmunoterapia de las alergias. La estandarización de extractos alergénicos puede verse afectada por la presencia de isoformas en diferentes proporciones en fuentes alergénicas de diferentes regiones geográficas.

Decision support system for determining Bantuan Siswa Miskin (BSM) receivers with profile matching method

Science.gov (United States)

Situmorang, B. H.; Pibriana, E.; Tosida, E. T.

2018-03-01

Bantuan Siswa Miskin (BSM) is a National Programs aimed at eliminating the barriers of poor students participating to school by helping poor students gain access to appropriate education services, prevent dropping out of school, attract poor students back to school, assis students in providing for learning activities, support the Nine Years Basic Education (and even up to senior high school) program, as well as helping to smooth the school programs [1]. Decision Support System is made by applying Profile Matching method to assist teachers or school operators in SMP PGRI Ciasmara in selecting prospective recipients of BSM program and providing recommendations in decision making. Profile Matching is used to compare the actual data value of a profile to be assessed by the expected profile value, so that it can be known the difference of competence (also called GAP). If the resulting value of GAP is smaller then the weight of value will be greater, which means it has a greater chance to be recommended as a potential recipient of the BSM program. Decision Support System for determining BSM receivers is only choosing the right alternatives to receive BSM according to the BSM quota given to SMP PGRI Ciasmara. The right alternatives to receive this BSM is the highest ranking alternatives.

Polimorfismo en el gen COMT en una muestra de gestantes normales y con restricción del crecimiento intrauterino en un hospital de Lima

Directory of Open Access Journals (Sweden)

José Pacheco-Romero

2013-04-01

Full Text Available Antecedentes: Los procesos fisiopatológicos que ocurren a nivel celular y molecular en la restricción de crecimiento intrauterino (RCIU son aún desconocidos. La catecol-O-metiltransferasa (COMT es una enzima de fase II que inactiva los catecol estrógenos al transferir un grupo metílico. Se conoce un polimorfismo funcional Val158 Met en el gen COMT como un marcador susceptible para diversas enfermedades maternoperinatales, existiendo estudios que sugieren que el alelo que codifica una COMT de baja actividad puede ser un marcador susceptible para RCIU. Por lo tanto, el estudio del polimorfismo COMT ofrece una nueva estrategia para la evaluación de marcadores genéticos que pueden ser utilizados para la detección de ciertas alteraciones asociadas al embarazo. Objetivos: Establecer la asociación entre el polimorfismo Val158Met catecol-O-metiltransferasa (COMT y la restricción de crecimiento intrauterino. Institución: Facultad de Medicina, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Perú. Diseño: Estudio tipo relacional (asociativo, con diseño observacional, tipo caso-control (no experimental. Materiales: Muestra de sangre materna de parturientas. Métodos: Durante el año 2011, se obtuvo 81 muestras para genotipaje del gen COMT. De ellas, 26 (32,1% correspondieron a parturientas con RCIU (casos y 55 (67,9% a muestras de madres de hijos sin RCIU (controles. La distribución de los genotipos fue evaluada usando la prueba de chi cuadrado. Se comprobó la distribución proporcional de los genotipos en los grupos con RCIU y sin RCIU con la hipótesis nula de Hardy-Weinberg. Las madres participantes firmaron un consentimiento informado. Principales medidas de resultados: Asociación entre los genotipos COMT y la RCIU, y entre los alelos COMT Val/Met y la RCIU. Resultados: Las distribuciones de los genotipos en los grupos con RCIU y sin RCIU estuvieron de acuerdo a la hipótesis nula de Hardy-Weinberg. Al relacionar los genotipos COMT Val

BSM-MBR: a benchmark simulation model to compare control and operational strategies for membrane bioreactors.

Science.gov (United States)

Maere, Thomas; Verrecht, Bart; Moerenhout, Stefanie; Judd, Simon; Nopens, Ingmar

2011-03-01

A benchmark simulation model for membrane bioreactors (BSM-MBR) was developed to evaluate operational and control strategies in terms of effluent quality and operational costs. The configuration of the existing BSM1 for conventional wastewater treatment plants was adapted using reactor volumes, pumped sludge flows and membrane filtration for the water-sludge separation. The BSM1 performance criteria were extended for an MBR taking into account additional pumping requirements for permeate production and aeration requirements for membrane fouling prevention. To incorporate the effects of elevated sludge concentrations on aeration efficiency and costs a dedicated aeration model was adopted. Steady-state and dynamic simulations revealed BSM-MBR, as expected, to out-perform BSM1 for effluent quality, mainly due to complete retention of solids and improved ammonium removal from extensive aeration combined with higher biomass levels. However, this was at the expense of significantly higher operational costs. A comparison with three large-scale MBRs showed BSM-MBR energy costs to be realistic. The membrane aeration costs for the open loop simulations were rather high, attributed to non-optimization of BSM-MBR. As proof of concept two closed loop simulations were run to demonstrate the usefulness of BSM-MBR for identifying control strategies to lower operational costs without compromising effluent quality. Copyright © 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.

A Simplified Chromatographic Approach to Purify Commercially Available Bovine Submaxillary Mucins (BSM)

DEFF Research Database (Denmark)

Madsen, Jan Busk; Pakkanen, Kirsi I.; Duelund, Lars

2015-01-01

content and homogeneously distributed size, and in a high yield of 43% from BSM as received from the manufacturer. The purity and composition of commercially acquired BSM were assessed by sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) and mass spectrometry, which verified that BSA...

Variabilidad genética de la respuesta inflamatoria: I. Polimorfismo -511 C/T en el gen IL1β en diferentes subpoblaciones peruanas

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Óscar Acosta

2012-07-01

Full Text Available El polimorfismo -511 citosina/timina (-511 C/T en la región promotora del gen interleuquina 1 beta (IL1β estα implicado en la producciσn diferencial de la citoquina y por tanto puede estar asociado a la respuesta inmuno-inflamatoria en obesidad, dislipidemias, cardiopatías, cáncer, infecciones, y el tratamiento con nutrientes y fármacos. Objetivos: Establecer la distribución de frecuencias de los genotipos y alelos del polimorfismo -511 C/T del gen IL1β en diferentes subpoblaciones peruanas. Diseño: Estudio descriptivo, observacional, transversal. Instituciones: Centro de Investigación de Bioquímica y Nutrición e Instituto de Medicina Tropical D.A. Carrión, Facultad de Medicina, UNMSM y Centro de Genética y Biología Molecular, Facultad de Medicina, USMP, Lima, Perú. Participantes: Pobladores peruanos. Intervenciones: Extracción de ADN genómico a partir de muestras sanguíneas o epitelio bucal según metodología estándar, de 168 individuos de 9 grupos subpoblacionales: 23 mestizos de Lima, 33 amazónicos (20 de Pucallpa y 13 de Amazonas y 112 andinos (12 de Ancash, 10 de Cajamarca, 18 de Huarochirí-Lima, 25 de Puno-Taquile, 25 de Puno-Uros y 22 de Puno-Anapia. Análisis del polimorfismo -511 C/T mediante la técnica de PCR/RFLP, con primers específicos y digestión con la enzima de restricción AvaI, detectándose los fragmentos por electroforesis en geles de agarosa al 2% y tinción con bromuro de etidio. Principales medidas de resultados: Frecuencias genotípicas y alélicas del gen IL1β. Resultados: Se encontró las siguientes frecuencias genotípicas CC=0,024; CT=0,369 y TT=0,607, consistentes con el equilibrio de Hardy-Weinberg; y las frecuencias alélicas fueron alelo C=0,208 y aleloT= 0,792. La frecuencia del alelo T, considerado el mutante, fue muy alta en los Uros de Puno (0.940 y más baja en los mestizos de Lima (0.609. La comparación de las frecuencias genotípicas (TT versus CT+CC y alélicas (T versus C

Searches for BSM Physics in Rare B-Decays in ATLAS

CERN Document Server

Ibragimov, I; The ATLAS collaboration

2014-01-01

Beyond Standard Model (BSM) Physics can be searched for indirectly in processes strongly suppressed in the Standard Model, e.g. in flavor-changing neutral-current processes. Results of the study with ATLAS data of the renowned rare decay, Bs -> mu+mu-, will be presented. The measurement of the angular distribution parameters in the weak decay Bd -> K*mumu is also sensitive to BSM physics. Results with ATLAS data will be discussed in the presentation.

Germline TP53 mutations and single nucleotide polymorphisms in children Mutaciones y polimorfismos de un único nucleótido del gen TP53 en línea germinal en niños

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Pamela Valva

2009-02-01

Full Text Available Mutations in the gene TP53, which codifies the tumor suppressor protein p53, are found in about 50% of tumors. These mutations can occur not only at somatic level, but also in germline. Pediatric cancer patients, mostly with additional family history of malignancy, should be considered as potential TP53 germline mutation carriers. Germline TP53 mutations and polymorphisms have been widely studied to determine their relation with different tumors' pathogenesis. Our aim was to analyze the occurrence frequency of germline TP53 mutations and polymorphisms and to relate these to tumor development in a pediatric series. Peripheral blood mononuclear cell samples from 26 children with solid tumors [PST] and 21 pediatric healthy donors [HD] were analyzed for germline mutations and polymorphisms in TP53 gene spanning from exon 5 to 8 including introns 5 and 7. These PCR amplified fragments were sequenced to determine variations. A heterozygous mutation at codon 245 was found in 1/26 PST and 0/21 HD. Comparative polymorphisms distribution, at position 14181 and 14201(intron 7, between HD and PST revealed a trend of association (p= 0.07 with cancer risk. HD group disclosed a similar polymorphism distribution as published data for Caucasian and Central/South American populations. This is the first study about TP53 variant frequency and distribution in healthy individuals and cancer patients in Argentina.El gen que codifica para la proteína supresora de tumor p53 (TP53 se encuentra mutado en aproximadamente el 50% de los tumores. Estas mutaciones pueden presentarse como somáticas o en línea germinal. Los niños con tumores, sobre todo aquellos con historia familiar de enfermedad oncológica, deben considerarse potenciales portadores de mutaciones en línea germinal. Las mutaciones de TP53 y los polimorfismos son estudiados para determinar su relación con la patogénesis de diferentes tumores. El objetivo del trabajo fue analizar la frecuencia de

Amplified Detection of the Aptamer-Vanillin Complex with the Use of Bsm DNA Polymerase.

Science.gov (United States)

Andrianova, Mariia; Komarova, Natalia; Grudtsov, Vitaliy; Kuznetsov, Evgeniy; Kuznetsov, Alexander

2017-12-26

The electrochemical detection of interactions between aptamers and low-molecular-weight targets often lacks sensitivity. Signal amplification improves the detection of the aptamer-analyte complex; Bsm DNA polymerase was used to amplify the signal from the interaction of vanillin and its aptamer named Van_74 on an ion-sensitive field-effect transistor (ISFET)-based biosensor. The aptamer was immobilized on the ISFET sensitive surface. A short DNA probe was hybridized with the aptamer and dissociated from it upon vanillin addition. A free probe interacted with a special DNA molecular beacon initiated the Bsm DNA polymerase reaction that was detected by ISFET. A buffer solution suitable for both aptamer action and Bsm DNA polymerase activity was determined. The ISFET was shown to detect the Bsm DNA polymerase reaction under the selected conditions. Vanillin at different concentrations (1 × 10 -6 -1 × 10 -8 M) was detected using the biosensor with signal amplification. The developed detection system allowed for the determination of vanillin, starting at a 10 -8 M concentration. Application of the Bsm DNA polymerase resulted in a 15.5 times lower LoD when compared to the biosensor without signal amplification (10.1007/s00604-017-2586-4).

Polimorfismo del gen de la banda 3 eritrocítica en grupos étnicos de Costa Rica

Directory of Open Access Journals (Sweden)

M Chaves-Villalobos

2004-09-01

Full Text Available Banda 3 (AE1 es una de las proteínas más abundantes de la membrana del eritrocito humano. Ésta funciona como un intercambiador aniónico cloruro / bicarbonato y es el punto de anclaje de varias proteínas del citoesqueleto del eritrocito. Se han descrito varias mutaciones y muchas variantes polimórficas se han asociado a esferocitosis hereditaria. La identificación de un marcador genético en el extremo 5’ del gene AE1 podría asociarse a varios defectos moleculares del eritrocito. Este marcador genético es un fragmento de restricción de longitud polimórfica "RFLP" producido por la endonucleasa de restricción Pst I. Se analizaron para este polimorfismo un total de 216 individuos de siete poblaciones: una hispanomestiza (Valle Central, dos afrodescendientes (Limón y Guanacaste y cuatro amerindias (bribri, cabecar, maleku y guaymí. El alelo más frecuente en la población hispanomestiza fue el 2, mientras en los grupos afrodescendientes y amerindios se encontró el 1. No se observaron diferencias significativas con respecto al equilibrio de Hardy-Weinberg en seis de las poblaciones, sin embargo, el grupo Guaymí si presenta diferencias significativas con respecto al equilibrio de Hardy-Weinberg.Polymorphism of the erythrocyte band 3 gene (EPB3 in ethnic groups of Costa Rica. Band 3 (AE1 is one of the most abundant proteins in the membrane of the human erythrocyte. This protein works as an anionic CI - and HCO3- exchanger and it also functions as an anchor for several proteins of the erythrocyte's cytoesqueleton. Several mutations have been described and many polymorphic variants have been associated to hereditary spherocytosis. The identification of a genetic marker at position 5' of the AE1 gene could be associated to several molecular defects of the erythrocyte. This genetic marker is a restriction fragment length polymorphism (RFLP produced by restriction enzime Pst I. For this polymorphism a total of 216 individuals belonging to

Amplified Detection of the Aptamer–Vanillin Complex with the Use of Bsm DNA Polymerase

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Mariia Andrianova

2017-12-01

Full Text Available The electrochemical detection of interactions between aptamers and low-molecular-weight targets often lacks sensitivity. Signal amplification improves the detection of the aptamer-analyte complex; Bsm DNA polymerase was used to amplify the signal from the interaction of vanillin and its aptamer named Van_74 on an ion-sensitive field-effect transistor (ISFET-based biosensor. The aptamer was immobilized on the ISFET sensitive surface. A short DNA probe was hybridized with the aptamer and dissociated from it upon vanillin addition. A free probe interacted with a special DNA molecular beacon initiated the Bsm DNA polymerase reaction that was detected by ISFET. A buffer solution suitable for both aptamer action and Bsm DNA polymerase activity was determined. The ISFET was shown to detect the Bsm DNA polymerase reaction under the selected conditions. Vanillin at different concentrations (1 × 10−6–1 × 10−8 M was detected using the biosensor with signal amplification. The developed detection system allowed for the determination of vanillin, starting at a 10−8 M concentration. Application of the Bsm DNA polymerase resulted in a 15.5 times lower LoD when compared to the biosensor without signal amplification (10.1007/s00604-017-2586-4.

NLO qq -> ZH production and Effective Lagrangians for BSM Higgs Physics

CERN Document Server

Jomhari, Nur Zulaiha; CERN. Geneva. PH Department

2015-01-01

The naturalness issue is a compelling reason for the emergence of Beyond the Standard Model (BSM) physics at the Large Hadron Collider (LHC). Absence of hints in direct searches makes the model-independent Effective Field Theory (EFT) approach to Higgs physics interesting. It is important that to establish to which extent the new boson discovered at LHC is the scalar particle predicted by the SM. BSM physics can change the HZZ coupling that associated ZH production probes. Model-independent extensions of the SM can describe possible changes, described in a field-theoretical way, via an extended Lagrangian with the SM fields. In this project, Higgs boson is Attached to WeaK bosons (HAWK) and Madgraph5 are used as a Monte Carlo (MC) generator to distinguish higher-order SM corrections from actual BSM manifestations and this study attempts to address is whether one can “calibrate” EFT calculations to match the most accurate SM predictions.

Theory Advances in BSM Physics

CERN Document Server

McCullough, Matthew

2016-01-01

Rather than attempting to summarise the full spectrum of recent advances in Beyond the Standard Model (BSM) theory, which are many, in this talk I will instead take the opportunity to focus on two frameworks related to the hierarchy problem currently receiving significant attention. They are the `Twin Higgs' and the `Relaxion'. I will summarise the basic underlying structure of these theories at a non-expert level and highlight some interesting phenomenological signatures or outstanding problems.

Probing the BSM physics with CMB precision cosmology: an application to supersymmetry

Science.gov (United States)

Dalianis, Ioannis; Watanabe, Yuki

2018-02-01

The cosmic history before the BBN is highly determined by the physics that operates beyond the Standard Model (BSM) of particle physics and it is poorly constrained observationally. Ongoing and future precision measurements of the CMB observables can provide us with significant information about the pre-BBN era and hence possibly test the cosmological predictions of different BSM scenarios. Supersymmetry is a particularly motivated BSM theory and it is often the case that different superymmetry breaking schemes require different cosmic histories with specific reheating temperatures or low entropy production in order to be cosmologically viable. In this paper we quantify the effects of the possible alternative cosmic histories on the n s and r CMB observables assuming a generic non-thermal stage after cosmic inflation. We analyze TeV and especially multi-TeV super-symmetry breaking schemes assuming the neutralino and gravitino dark matter scenarios. We complement our analysis considering the Starobinsky R 2 inflation model to exemplify the improved CMB predictions that a unified description of the early universe cosmic evolution yields. Our analysis underlines the importance of the CMB precision measurements that can be viewed, to some extend, as complementary to the laboratory experimental searches for supersymmetry or other BSM theories.

Búsqueda de selección en el polimorfismo 677C>T (c.665C>T) del gen de la metilentetrahidrofolato reductasa (MTHFR) en una población Colombiana

OpenAIRE

Riaño Moreno, Julián Camilo

2014-01-01

Se realizó un estudio genético – poblacional en dos grupos etarios de población colombiana con la finalidad de evaluar las diferencias genéticas relacionadas con el polimorfismo MTHFR 677CT en busca de eventos genéticos que soporten la persistencia de este polimorfismo en la especie humana debido que este ha sido asociado con múltiples enfermedades. De esta manera se genotipificaron los individuos, se analizaron los genotipos, frecuencias alélicas y se realizaron diferentes pruebas genéticas...

CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE AISLADOS DE Sclerotium cepivorum MEDIANTE ANÁLISIS DEL POLIMORFISMO DE LOS FRAGMENTOS AMPLIFICADOS AL AZAR CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE AISLADOS DE Sclerotium cepivorum MEDIANTE ANÁLISIS DEL POLIMORFISMO DE LOS FRAGMENTOS AMPLIFICADOS AL AZAR

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Francisco Luna Martínez

2012-02-01

Full Text Available Sclerotium cepivorum is the etiologic agent of garlic "white rot". Knowledge of genetic variability of the fungus may help to design efficient strategies for its control. For this study, 47 isolates obtained from Aguascalientes, Guanajuato and Zacatecas as well as 7 reference strains were used. Morphological characterization was that established for this organism. PCR amplification of ribosomal 18S gene generated a DNA fragment of a size close to 2.2 Kb in all isolates and reference strains, as compared to that of 1.8 Kb amplified in control fungi. Variability was analyzed by Random Amplified Polymorphism Distance (RAPD. Isolates exhibited a similar gene pattern with an average dissimilitud of 9.4%. Some of the bands identified here can be useful as molecular markers in identification studies of this plant pathogen. Dendogram analysis of data revealed a tendency of isolates to group according to their geographic procedence.Sclerotium cepivorum es el agente causal de la "pudrición blanca" del ajo. El conocer su variabilidad genética permitirá buscar estrategias de control mas eficientes. Se utilizaron 47 aislados de S. cepivorum provenientes de Aguascalientes, Guanajuato, Zacatecas y 7 cepas de referencia. El análisis morfológico correspondió al establecido para este hongo. Se amplificó el gen ribosomal 18S dando un tamaño cercano a 2.2 kb en todos los aislados y cepas de S. cepivorum, en los hongos control fue de aproximadamente 18 kb. El grado de variabilidad se analizó por medio del Polimorfismo de los Fragmentos Amplificados al Azar (RAPD. Los aislados de S. cepivorum dieron un patrón génico similar, pero muy diferente al que muestran los otros hongos fitopatógenos. La disimilitud genética promedio fue de 9.4%. Se proponen algunas bandas como marcadores moleculares para identificar al fitopatógeno. En el dendograma se aprecia que hay tendencia de los aislados a agruparse según el estado de donde provienen.

Efeito do exercício físico e do polimorfismo T-786C na pressão arterial e no fluxo sanguíneo de idosas Efecto del ejercicio físico y del polimorfismo T-786C en la presión arterial y en el flujo sanguíneo de añosas Effect of physical activity and t-786C polymorphism in blood pressure and blood flow in the elderly

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Anderson Saranz Zago

2010-10-01

Full Text Available FUNDAMENTO: O polimorfismo T-786C do gene da sintetase do óxido nítrico endotelial (eNOS e a produção de ânion superóxido podem diminuir a produção e biodisponibilidade do óxido nítrico, comprometendo o grau de vasodilatação, podendo este efeito ser revertido pelo exercício físico. OBJETIVO: Investigar a influência do treinamento aeróbico e do polimorfismo T-786C nas concentrações dos metabólitos do óxido nítrico (NOx, no fluxo sanguíneo (FS e na pressão arterial (PA. MÉTODOS: Trinta e duas idosas pré-hipertensas (59 ± 6 anos foram separadas em dois grupos de acordo com o polimorfismo T-786C (TT e TC+CC. Foram analisadas as concentrações de NOx (plasma e fluxo sanguíneo por pletismografia de oclusão venosa em repouso, 1, 2 e 3 minutos pós-oclusão (FS-0, FS-1, FS-2, FS-3, respectivamente. As avaliações foram realizadas antes e após 6 meses de um programa de exercício aeróbico. RESULTADOS: Nas avaliações pré-treinamento, os níveis de NOx foram menores no grupo TC+CC em relação ao grupo TT. O grupo TT apresentou correlações entre NOx e FS-0 (r = 0,6 e pressão arterial diastólica (PAD e FS-0 (r = -0,7, porém nenhuma correlação foi encontrada no grupo TC+CC. Nas avaliações pós-treinamento, ocorreram correlações entre NOx e FS-0 (r = 0,6 e nas mudanças do NOx e PAD (r = -0,6 no grupo TT. Também foram obtidas correlações entre PAD e FS-1 (r = -0,8, PAD e FS-2 (r = -0,6, PAD e FS-3 (r = -0,6, nas mudanças entre NOx e FS-1 (r = 0,8 e mudanças do NOx e PAD (r = -0,7 no grupo TC+CC. CONCLUSÃO: Conclui-se que 6 meses de exercício aeróbico podem contribuir para aumentar as relações existentes entre NO, PA e FS em idosas portadores do alelo C.FUNDAMENTO: El polimorfismo T-786C del gen de la sintetasa del óxido nítrico endotelial (eNOS y la producción de anión superóxido pueden disminuir la producción y biodisponibilidad del óxido nítrico, comprometiendo el grado de vasodilataci

Association of vitamin D receptor BsmI (rs1544410) gene polymorphism with the chronic kidney disease susceptibility.

Science.gov (United States)

Zhou, Tian-Biao; Jiang, Zong-Pei; Huang, Miao-Fang

2015-02-01

Association of vitamin D receptor (VDR) BsmI (rs1544410) gene polymorphism with the chronic kidney disease (CKD) susceptibility from the published reports are still conflicting. This meta-analysis was performed to evaluate the relationship between VDR BsmI (rs1544410) gene polymorphism and the risk of CKD. The association studies were identified from PubMed, Cochrane Library and China Biological Medicine Database on 1 March 2014, and eligible investigations were included and synthesized using meta-analysis method. Nine reports were recruited into this meta-analysis for the association of VDR BsmI gene polymorphism with CKD susceptibility. In this meta-analysis for overall populations, the BsmI B allele BB genotype and bb genotype were not associated with the risk of CKD (B allele: OR = 1.12, 95% CI: 0.88-1.44, p = 0.36; BB genotype: OR = 1.15, 95% CI: 0.81-1.62, p = 0.43; bb genotype: OR = 0.86, 95% CI: 0.61-1.20, p = 0.36). Furthermore, VDR BsmI gene polymorphism was not associated with CKD susceptibility in Asians and in Caucasians. In conclusion, the BsmI gene polymorphism was not associated with CKD susceptibility in overall populations, in Asians and in Caucasians. However, more studies should be conducted to confirm it.

Identificación de un polimorfismo del gen Est9 relacionado con resistencia a piretroides en Rhipicephalus (Boophilus microplus

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Edgar Diaz R.

2013-10-01

Full Text Available Objetivo. Mediante procedimientos de PCR-RFLP, detectar un polimorfismo en el gen Est9 de garrapatas Rhipicephalus (Boophilus microplus resistentes a piretroides en Ibagué, Colombia, determinando el grado de asociación entre los fenotipos y los genotipos resultantes. Materiales y métodos. El ADN de 30 teleoginas R. (Boophilus microplus fenotípicamente susceptibles, resistentes o medianamente resistentes a piretroides en una prueba de Drummond modificada, fue amplificado por PCR con cebadores específicos para obtener un fragmento de 372 pb del gen Est9, que fue sometido a digestión con la enzima EcoRI para estudiar los RFLPs generados y poder diferenciar los respectivos genotipos. El grado de asociación entre los fenotipos y los genotipos resultantes se determinó mediante la prueba exacta de Fisher. Resultados. Luego de digerir el fragmento con la endonucleasa, se generaron dos segmentos en teleoginas con algún nivel de resistencia, mientras en las teleoginas susceptibles no hubo división del fragmento de 372 pb, demostrándose así la presencia de una mutación puntual y los genotipos homocigoto natural, homocigoto mutante y heterocigoto. Las diferencias altamente significativas (p<0.01 entre teleoginas susceptibles y aquellas con algún nivel de resistencia, mostraron una relación directa entre el genotipo y el fenotipo con un nivel de confianza de p=0.0009852. Conclusiones. Se comprobó, por primera vez en Colombia, la presencia de una mutación puntual en el gen Est9 de garrapatas R. (Boophilus microplus resistentes a piretroides, sugiriendo la necesidad de realizar estudios para detectar alteraciones moleculares en otros genes relacionados con quimioresistencia.

Interkoneksi Stain, Bsm, Dan Mes Dalam Mengembangkan Ekonomi Islam: Studi Kasus Di Purwokerto

OpenAIRE

Dahlan, Ahmad

2008-01-01

STAIN, Bank Syariah Mandiri (BSM), and Masyarakat Ekonomi Syariah (MES, Syariah Economic Society) have important rolein the development of Islam economy in Purwokerto. This research result evidenced that these three institutions have an Islamic economydevelopment program according with vision and mission of their institution. STAIN as Islamic higher education is on curriculum design andlecture quality domain, BSM as banking financial institution on enhancing employee/manager quality, and MES ...

INTERKONEKSI STAIN, BSM, DAN MES DALAM MENGEMBANGKAN EKONOMI ISLAM: STUDI KASUS DI PURWOKERTO

OpenAIRE

Dahlan, Ahmad

2015-01-01

STAIN, Bank Syariah Mandiri (BSM), and Masyarakat Ekonomi Syariah (MES, Syariah Economic Society) have important rolein the development of Islam economy in Purwokerto. This research result evidenced that these three institutions have an Islamic economydevelopment program according with vision and mission of their institution. STAIN as Islamic higher education is on curriculum design andlecture quality domain, BSM as banking financial institution on enhancing employee/manager quality, and MES ...

Feasibility of bovine submaxillary mucin (BSM) films as biomimetic coating for polymeric biomaterials

DEFF Research Database (Denmark)

Lee, Seunghwan; Madsen, Jan Busk; Pakkanen, Kirsi I.

2013-01-01

Feasibility of bovine submaxillary mucin (BSM) films generated via spontaneous adsorption from aqueous solutions onto polydimethylsiloxane (PDMS) and polystyrene (PS) surfaces have been investigated as biomimetic coatings for polymeric biomaterials. Two attributes as biomedical coatings, namely a......-on-disk tribometry, employing compliant PDMS as tribopairs, has shown that BSM coatings generated on PDMS surface via spontaneous adsorption from aqueous solution has effective lubricating properties, but for very limited duration only....

Non-SUSY BSM Searches: Recent Results from ATLAS & CMS

CERN Document Server

Malek, Fairouz; The ATLAS collaboration

2015-01-01

The Standard Model of particle physics is a sensational success, especially since the discovery the 125 GeV Higgs boson. However, there are still numerous unanswered questions… Why is the Higgs so light? Do the interactions couplings unify and how can gravity be included? Why three fermion generations? What is dark matter? Theories Beyond the Standard Model (BSM), such as Grand Unified Theories, Extra Dimensions or Technicolour are trying to answer these questions. In this talk, we will focus on the most recent results obtained by the ATLAS and CMS experiments at the LHC for BSM searches, excluding Higgs and supersymmetry searches. New results in Dark matter, heavy narrow bosons, new heavy quarks and 3rd generation lepto-quarks will be presented. A brief summary of the perspectives at 14 Tev and at HL-LHC will be shown.

Status and prospects for BSM ( (N)MSSM) Higgs searches at the LHC

CERN Document Server

AUTHOR|(INSPIRE)INSPIRE-00071410; The ATLAS collaboration

2016-01-01

Searches for Beyond the Standard Model (BSM) Higgs processes in the context of Minimal Supersymmetric Standard Model (MSSM) and Next to MSSM (NMSSM) are presented. The results are based on the first LHC run of pp collision data recorded by the ATLAS and CMS experiments at the CERN Large Hadron Collider at centre-of-mass energies of 7 and 8 TeV, corresponding to an integrated luminosity of about 5 and 20 fb-1 respectively. Current searches constrain large parts of the parameter space. No evidence for BSM Higgs is found.

Caracterización del complejo mayor de histocompatibilidad clase II en primates del género Aotus

OpenAIRE

Suárez Martínez, Carlos Fernando

2017-01-01

El presente trabajo tiene como propósito contribuir al conocimiento del complejo mayor de histocompatibilidad clase II (CMH-II) de los monos Aotus, contribuyendo a la validación de este primate como modelo experimental, y aumentando el conocimiento en la evolución de los genes del CMH en primates. Además, se profundizó en el análisis de convergencia y polimorfismo de los genes del CMH-DR en primates. Se implementaron metodologías de modelación computacional de la unión CMH-péptido, como ...

Uncertainty and sensitivity analysis of control strategies using the benchmark simulation model No1 (BSM1)

DEFF Research Database (Denmark)

Flores-Alsina, Xavier; Rodriguez-Roda, Ignasi; Sin, Gürkan

2009-01-01

The objective of this paper is to perform an uncertainty and sensitivity analysis of the predictions of the Benchmark Simulation Model (BSM) No. 1, when comparing four activated sludge control strategies. The Monte Carlo simulation technique is used to evaluate the uncertainty in the BSM1 predict...

Polimorfismos de la región promotora del gen de la IL-10 y artritis reumatoide en una población colombiana

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Olga María Moreno

2007-03-01

Conclusiones. La interleucina-10 es uno de los principales reguladores de la respuesta inmune y por lo tanto podría jugar un papel importante en la patogénesis de la artritis reumatoide; sin embargo, nuestros resultados no dan evidencia de una asociación genética entre los polimorfismos estudiados y el desarrollo o gravedad de la artritis reumatoide.

Investigation of the Thermostability of Bovine Submaxillary Mucin (BSM) and its Impact on Lubrication

DEFF Research Database (Denmark)

Madsen, Jan Busk; Pakkanen, Kirsi I.; Lee, Seunghwan

2013-01-01

Bovine Submaxillary Mucin (BSM) generates thin film layers via spontaneous adsorption onto hydrophobic surfaces such as Poly(dimethylsiloxane) (PDMS) and High Density Polyethylene (HDPE). A characteristic feature of mucin is its tribological- or lubricating properties. Circular dichroismspectrosc......Bovine Submaxillary Mucin (BSM) generates thin film layers via spontaneous adsorption onto hydrophobic surfaces such as Poly(dimethylsiloxane) (PDMS) and High Density Polyethylene (HDPE). A characteristic feature of mucin is its tribological- or lubricating properties. Circular...

GPU-BSM: a GPU-based tool to map bisulfite-treated reads.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Andrea Manconi

Full Text Available Cytosine DNA methylation is an epigenetic mark implicated in several biological processes. Bisulfite treatment of DNA is acknowledged as the gold standard technique to study methylation. This technique introduces changes in the genomic DNA by converting cytosines to uracils while 5-methylcytosines remain nonreactive. During PCR amplification 5-methylcytosines are amplified as cytosine, whereas uracils and thymines as thymine. To detect the methylation levels, reads treated with the bisulfite must be aligned against a reference genome. Mapping these reads to a reference genome represents a significant computational challenge mainly due to the increased search space and the loss of information introduced by the treatment. To deal with this computational challenge we devised GPU-BSM, a tool based on modern Graphics Processing Units. Graphics Processing Units are hardware accelerators that are increasingly being used successfully to accelerate general-purpose scientific applications. GPU-BSM is a tool able to map bisulfite-treated reads from whole genome bisulfite sequencing and reduced representation bisulfite sequencing, and to estimate methylation levels, with the goal of detecting methylation. Due to the massive parallelization obtained by exploiting graphics cards, GPU-BSM aligns bisulfite-treated reads faster than other cutting-edge solutions, while outperforming most of them in terms of unique mapped reads.

ATLAS experience with the modeling of SM processes in the context of Higgs studies / BSM searches

CERN Document Server

ATLAS Collaboration; The ATLAS collaboration

2015-01-01

much is known from the ATLAS/CMS SM articles about the performance of qcd tools (e.g. from the studies of W/Z+jets cross sections, top quark distributions, etc). A bit less is known about the efforts that are needed to ensure a proper description of backgrounds in the BSM searches or in Higgs studies. In the searches, for example, control samples are used, to avoid the need of inaccurate MC models, or to reweight improper modeling. Sometimes we don't see in teh final papers what is happening behind the scenes, and it's hard to learn about possible modeling issues. Are there clear deficiencies that, if fixed, would make your work simpler and more effective? These talks should focus on these specific aspects of the H and BSM studies. In other words, they should neither report H or BSM results, nor report on generic SM measurements, but give some perspective on the current status and on the possible needs for future improvements of SM modeling for H precision studies and BSM searches.

Role of the VDR Bsm I and Apa I polymorphisms in the risk of colorectal cancer in Kashmir.

Science.gov (United States)

Rasool, Sabha; Kadla, Showkat A; Rasool, Vamiq; Qazi, Falak; Khan, Tanzeela; Shah, Nisar A; Ganai, Bashir A

2014-01-01

A case-control study aiming to evaluate the relationship between Bsm I and Apa I restriction fragment gene polymorphisms and colorectal cancer (CRC) was carried out in Kashmir, including a total of 368 subjects (180 cases and 188 controls). DNA samples extracted from the blood of the subjects were analyzed for 3' untranslated region (3' UTR) Apa I and Bsm I polymorphisms using restriction fragment length polymorphism-polymerase chain reaction (RFLP-PCR). A statistically significant 2.7-fold increased risk was observed in individuals found homozygous for the presence of the 'b' allele, in comparison to subjects homozygous for the 'B' allele (odds ratio (OR) 2.7, 95% confidence interval (CI) 1.49-4.86 (Bsm I)), and a statistically insignificant 2-fold increased risk was found among individuals with the 'aa' genotype, as compared to subjects with the 'AA' genotype (OR 2.017, 95% CI 0.86-4.7). Our study also yielded statistically significant results when the Apa I polymorphism was stratified by age (≤ 50 years) and dwelling area (rural area), and the Bsm I polymorphism by gender (male gender), suggesting a possible role of Apa I and Bsm I polymorphisms in the etiology of CRC in Kashmir. We conclude that Apa I and Bsm I single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in the vitamin D receptor gene (VDR) might be associated with susceptibility to CRC among Kashmiris. © 2014 S. Karger GmbH, Freiburg.

Polimorfismos en el gen promotor de IL-10 en una muestra de pacientes colombianos con lepra

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Nora Cardona-Castro

2012-03-01

Conclusiones. El haplotipo que encontramos asociado con lepra, -1082A-819C-592C/-1082A-819C-592C, se ha relacionado con baja producción de IL-10. Funcionalmente, esta baja producción de IL-10 puede tener consecuencias en la respuesta inmunitaria, además de implicaciones clínicas. Se han reportado diferentes haplotipos de IL-10 como marcadores de vulnerabilidad y resistencia de lepra en otras poblaciones, lo cual sugiere que las diferencias en la distribución de diversos polimorfismos del gen de IL-10 entre grupos étnicos, es un factor importante al determinar la asociación entre enfermedad y genes.   DOI: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v32i1.386

Successful treatment of unicameral bone cyst by single percutaneous injection of alpha-BSM.

Science.gov (United States)

Thawrani, Dinesh; Thai, Chia Che; Welch, Robert D; Copley, Lawson; Johnston, Charles E

2009-01-01

Unicameral bone cyst (UBC) is a benign bone lesion, recognized for its high rate of recurrence and need for repeat procedures to achieve healing. We hypothesized that the osteoconductive material apatitic calcium phosphate (alpha-BSM) could be effective in filling and stimulating resolution of UBC. The purpose of this study was to evaluate clinical and radiographic outcomes of UBC treated by a single injection of alpha-BSM. Thirteen patients (6 male, 7 female) with a mean age of 10.5 years, underwent single percutaneous injection of alpha-BSM for presumed UBC. The aspiration of the cysts was followed by vigorous saline lavage using 2 wide bore needles to disrupt the cyst walls. alpha-BSM "paste" was then injected under fluoroscopic guidance. Radiographs were digitized to measure cystic area (millimeter squares) on 2 orthogonal views. Healing was rated according to a modified Neer outcome grading system. Nine of the 13 patients had had pathologic fractures in the past. Eleven of the 13 patients had had past unsuccessful treatment: multiple steroid injections in 6, curettage and bone grafting in 3, and bone marrow and demineralized bone matrix (Grafton) injection in 2. Five cysts were grade 1 (healed 100%), 6 grade 2 (healed >50%), 2 grade 3 (healed <50% with increased cortical thickness), and none grade 4 (recurrence/enlargement). The average resolution of cystic area in 11/13 cysts was 85.7% at final follow-up of 35.8 months (P=0.0001) with 2.8 mm of average gain in cortical thickness (P=0.0018). None of the 13 lesions required an additional procedure or repeat injection. All patients were clinically asymptomatic at latest follow-up. This is the first study quantifying cyst resolution objectively according to actual decrease in area (millimeter squares). A single injection of alpha-BSM is a safe, minimally invasive and efficacious method to treat UBC in the pediatric population.

Polimorfismos en los genes de dihidrofolato-reductasa (dhfr y dihidropteroato-sintasa (dhps y modelado estructural del gen dhps en aislamientos colombianos de Toxoplasma gondii

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Liliana Jazmín Cortés

2014-12-01

Conclusiones. La metodología estandarizada puede servir como base para la búsqueda de polimorfismos en muestras de pacientes con diferentes manifestaciones clínicas de toxoplasmosis y para establecer su posible relación con los cambios en la sensibilidad a los antifolatos y la reacción al tratamiento.

Síndrome de Turner e polimorfismo genético: uma revisão sistemática

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Alessandra Bernadete Trovó de Marqui

2015-09-01

Full Text Available ResumoObjetivo:Apresentar os principais resultados dos estudos que investigaram polimorfismos genéticos em síndrome de Turner, bem como sua associação com alguns sinais clínicos e etiologia desse distúrbio cromossômico.Fontes de dados:Revisão bibliográfica feita no PubMed, sem limite de período, com os seguintes termos: Turner syndrome and genetic polymorphism. Foram identificados 116 artigos e, de acordo com os critérios de inclusão e exclusão, 17 foram selecionados para leitura.Síntese dos dados:Os polimorfismos investigados em pacientes com síndrome de Turner estavam relacionados com déficit de crescimento, que causou baixa estatura, densidade mineral óssea baixa, autoimunidade e anomalias cardíacas, que podem estar presentes com frequências significativas nas pacientes. Também foi verificado o papel dos polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs na etiologia da síndrome de Turner, ou seja, na não disjunção cromossômica.Conclusões:Os polimorfismos genéticos parecem estar associados à síndrome de Turner. Entretanto, por conta dos poucos estudos publicados e dos achados contraditórios, pesquisas em diferentes populações são necessárias para esclarecer o papel dessas variantes genéticas para os sinais clínicos e a etiologia do distúrbio cromossômico.

Actividad de la proteína transportadora de ésteres de colesterol. Polimorfismos del gen en pacientes colombianos con enfermedad coronaria Activity of cholesteryl ester transfer protein. Gene polymorphism in colombian patients with coronary artery disease

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Alejandra M Giraldo

2012-08-01

Full Text Available Introducción: la literatura relaciona la actividad de la proteína transportadora de ésteres de colesterol (CETP con enfermedad coronaria, por reducir el colesterol en las lipoproteínas de alta densidad. Adicionalmente, estudios recientes han identificado variaciones en el gen de la CETP, aunque el papel funcional de algunas de estas variantes sobre la actividad enzimática y la enfermedad coronaria, es desconocido. Objetivos: examinar la asociación de los polimorfismos TaqIB, MspI y RsaI del gen de la CETP y la actividad de la enzima con enfermedad coronaria. Métodos: se evaluó la asociación entre la actividad de la enzima y los polimorfismos TaqIB, MspI y RsaI, en pacientes con obstrucción coronaria documentada por angiografía. Resultados: la angiografía permitió clasificar a los pacientes en dos grupos: uno (213 individuos con obstrucción coronaria no significativa (OC 50%. La edad fue significantemente mayor en el último grupo en comparación con el primero. La actividad de la CETP fue 95,8 y 94,7 pmol/μL.h, para los grupos OC 50%, respectivamente. Solo se encontró diferencia significativa entre los alelos M1 y M2 en la población general. Conclusión: no se halló asociación entre la actividad de la CETP, los polimorfismos TaqBI, MspI, Rsal y la obstrucción coronaria. En este trabajo se describen por primera vez los niveles de CETP en los polimorfismos TaqIB, MspI, Rsal para un grupo de pacientes colombianos. Se debe refinar la descripción del evento coronario, el contexto metabólico de los pacientes y el estudio de haplotipos para encontrar relaciones con enfermedad coronaria.Introduction: literature links the activity of cholesteryl ester transfer protein (CETP with coronary heart disease by lowering cholesterol in high density lipoproteins. Additionally, recent studies have identified variations in the CETP gene, although the functional role of some of these variants on enzyme activity and coronary heart disease is

Polimorfismos en los genes CYP11α y CYP17 y etiología del hiperandrogenismo en pacientes con poliquistosis ovárica Polymorphism in CYP11alpha and CYP17 genes and the etiology of hyperandrogenism in patients with polycystic ovary syndrome

Directory of Open Access Journals (Sweden)

María S. Pérez

2008-04-01

Full Text Available El síndrome de poliquistosis ovárica (PCOS es un desorden endocrino-metabólico de naturaleza multifactorial, con una marcada predisposición genética, que afecta al 6% de las mujeres en edad reproductiva. Se caracteriza por la presencia de hiperandrogenismo, oligo-anovulación y ovarios poliquísticos. Entre los genes candidatos se encuentran aquellos que codifican para enzimas que actúan en la síntesis de andrógenos. Dos de los genes candidatos son el CYP17 y el CYP11alfa que codifican para la 17alfa hidroxilasa (P45017alfa y para el P450scc (colesterol side chain cleavage respectivamente. Los polimorfismos en estos genes están asociados al desarrollo del fenotipo hiperandrogénico. Nuestro objetivo fue analizar las frecuencias alélicas de los polimorfismos de los dos genes mencionados en población con PCOS, compararla con población normal y analizar la relación de cada variante alélica con el fenotipo hiperandrogénico correspondiente. Se analizaron 65 pacientes y 58 controles sanos en los que se determinaron niveles de testosterona y frecuencia de polimorfismos en los genes mencionados. Se observó una diferencia estadísticamente significativa cuando se asoció el grupo de mayor nivel de androgenemia con la presencia del genotipo A2/A2 del gen CYP17, y se hallaron mayores niveles de andrógenos circulantes en las pacientes con PCOS portadoras del alelo 216- del gen CYP11alfa. Nuestros resultados sugieren que ambos alelos juegan un rol menor en el desarrollo de PCOS y podrían ser considerados como potenciales marcadores de riesgo genético para el desarrollo del fenotipo hiperandrogénico.The polycystic ovary syndrome (PCOS is a heterogeneous multifactorial endocrine metabolic disorder with genetic predisposition affecting 6% of women in the reproductive age. This syndrome is characterized by the presence of oligo-anovulation, hyperandrogenism and polycystic ovaries. Several genes have been postulated as responsible for the

Impacto do polimorfismo genetico da enzima conversora da angiotensina no remodelamento cardiaco

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Felipe Neves de Albuquerque

2014-01-01

Full Text Available Fundamento: O papel dos polimorfismos genéticos da enzima de conversão da angiotensina na insuficiência cardíaca, como preditor de desfechos ecocardiográficos, ainda não está estabelecido. é necessário identificar o perfil local para observar o impacto desses genótipos na população brasileira, sendo inédito o estudo da insuficiência cardíaca de etiologia exclusivamente não isquêmica em seguimento mais longo que 5 anos. Objetivo: Determinar a distribuição das variantes do polimorfismo genético da enzima de conversão da angiotensina e sua relação com a evolução ecocardiográfica de pacientes com insuficiência cardíaca de etiologia não isquêmica. Métodos: Análise secundária de prontuários de 111 pacientes e identificação das variantes do polimorfismo genético da enzima de conversão da angiotensina, classificadas como DD (Deleção/Deleção, DI (Deleção/Inserção ou II (Inserção/Inserção. Resultados: As médias da coorte foram: seguimento de 64,9 meses, idade de 59,5 anos, 60,4% eram homens, 51,4% eram brancos, 98,2% faziam uso de betabloqueadores e 89,2% de inibidores da enzima de conversão da angiotensina ou de bloqueador do receptor da angiotensina. A distribuição do polimorfismo genético da enzima de conversão da angiotensina foi: 51,4% de DD; 44,1% de DI; e 4,5% de II. Não se observou nenhuma diferença das características clínicas ou de tratamento entre os grupos. O diâmetro sistólico do ventrículo esquerdo final foi a única variável ecocardiográfica isolada significativamente diferente entre os polimorfismos genéticos da enzima de conversão da angiotensina: 59,2 ± 1,8 para DD versus 52,3 ± 1,9 para DI versus 59,2 ± 5,2 para II (p = 0,029. No seguimento ecocardiográfico, todas as variáveis (diferença entre a fração de ejeção do ventrículo esquerdo da última e da primeira consulta; diferença entre o diâmetro sistólico do ventrículo esquerdo da última e da primeira

Polimorfismos genéticos associados à hipertensão arterial sistêmica - doi: 10.5102/ucs.v6i1.464

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Luzitano Brandão Ferreira

2008-12-01

Full Text Available A hipertensão arterial sistêmica (HAS é uma doença poligênica e multifatorial que se constitui um grave problema de saúde publica, acometendo somente no Brasil, 15 milhões de pessoas. Ela está intimamente relacionada a diversas doenças cardiovasculares e renais, o que aumenta muito a sua morbmortalidade. Nos últimos anos vários estudos têm demonstrado a associação da HAS e suas complicações com diversos polimorfismos genéticos. O objetivo do presente estudo foi o de realizar uma revisão dos principais polimorfismos genéticos associados a HAS e suas complicações, especialmente cardiovasculares. Dentre os polimorfismos associados a HAS destacam-se os dos genes da enzima de conversão da angiotensina (ECA, haptoglobina, angiotensinogênio e angiotensina II. O conhecimento destes polimorfismos poderá, em breve, ser utilizado em larga escala na prática clínica para diagnóstico, acompanhamento e prognóstico de pacientes com HAS e suas complicações.

Susceptibilidad genética y riesgo de cáncer gástrico en una población del Cauca.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

María M. Torres

2004-06-01

Full Text Available El cáncer gástrico es la principal causa de mortalidad por cáncer en Colombia. El riesgo de desarrollar cáncer gástrico se ha asociado con factores ambientales y con la infección por Helicobacter pylori. Las enzimas glutatión-S-transferasas están involucradas en la desintoxicación de varios carcinógenos ambientales. Las deleciones homocigóticas de glutatión-S-transferasa M1 (GSTM1-0 y glutatión-S-transferasa T1 (GSTT1-0 se han asociado con algunos tipos de cáncer. Los niveles del factor de necrosis tumoral (FNT ? están aumentados en pacientes infectados por H. pylori. Una transición G/A en la posición -308 del promotor del FNT-? se ha visto relacionada en algunos estudios con un incremento en la expresión del gen, y está asociada con la susceptibilidad a cáncer gástrico. Se investigó la asociación de estos polimorfismos con cáncer gástrico y la interacción con otros factores de riesgo (estilo de vida. Se obtuvieron muestras de sangre de 46 pacientes con cáncer gástrico y 96 controles. Se empleó el modelo de regresión logística para obtener la razón de posibilidades (OR y sus intervalos de confianza del 95% y, así, establecer la asociación entre los polimorfismos enzimáticos y el cáncer gástrico, y entre otros factores independientes y esta enfermedad. Las frecuencias de los polimorfismos de deleción en pacientes y controles fueron: para la GSTM1, 65,2% y 37,5%, y para la GSTT1, 17,4% y 14,6%, respectivamente. La frecuencia del polimorfismo G/A del FNT ? en las personas infectadas con H. pylori fue de 18% en la población con cáncer gástrico y de 7% en el grupo control. Nuestros resultados sugieren que el polimorfismo de deleción de GSTM1 puede estar asociado con un riesgo aumentado de cáncer gástrico (OR 5,5; IC95%, 1,7-17,2. Igualmente, nuestros datos muestran que otros factores de riesgo como la infección por H. pylori y el consumo de cigarrillo y alcohol están asociados con este tipo de cáncer (OR

El papel de la genética en la aparición y desarrollo de la periodontitis: II: Polimorfismos asociados a la enfermedad periodontal The role of genetics in the development and progression of periodontitis: II: Polymorphism associated to periodontal disease

OpenAIRE

D. Rodrigo-Gómez; A. Oteo-Calatayud; A. Alonso-Rosado; A. Bascones-Martínez

2008-01-01

La periodontitis es una enfermedad multifactorial que resulta de la interacción de bacterias periodontopatógenas con los mecanismos de respuesta inmune del huésped y que se caracteriza por una reacción inflamatoria que afecta al aparato de inserción del diente. Las enfermedades multifactoriales habitualmente envuelven complejas interacciones de muchos genes y factores ambientales. El tipo de variaciones genéticas involucradas en este tipo de enfermedades se denominan polimorfismos genéticos, ...

Variantes del ADNmt en isleños del lago Titicaca: máxima frecuencia del haplotipo B1 y evidencia de efecto fundador

Directory of Open Access Journals (Sweden)

José Sandoval

2013-06-01

Full Text Available Los polimorfismos del ADN mitocondrial son herramientas en el estudio comparativo de poblaciones modernas y antiguas. Entre los más usados están los haplotipos mitocondriales basados en RFLP (polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción y un sistema de inserción /deleción. El presente estudio establece la frecuencia de estos haplotipos y compara un total de 144 individuos representativos de las islas Taquile y Amantaní (lengua quechua y de las islas de Los Uros y Anapia (lengua aymara del lago Titicaca, Perú. Nuestros resultados revelan la predominancia del haplotipo B1: 100% en Taquile (n=57; 88,6% en Amantaní (n=35; 75% en Los Uros (n=28 y 87,5% en Anapia (n=24, siendo las frecuencias más altas registradas en el mundo. Otros haplotipos se observan en menor proporción: 17,9% de A2 y 7,1% de D1 en Los Uros; 11,4% de la variante C1 en Amantaní; 4,2% de cada haplotipo C1, C2 y D1 en Anapia. La alta frecuencia de B1 indica que las poblaciones de Taquile, Amantaní y Anapia provienen de un grupo fundador reducido. Aunque hay afinidad entre las poblaciones aymaras de Anapia y Los Uros; la proporción de algunos alelos en los últimos, sugiere la persistencia de un acervo genético uru en contraposición a la idea de su extinción.

Is tumor necrosis factor - 376a promoter polymorphism associated with susceptibility to multiple sclerosis? ¿El polimorfismo-376A del promotor del gen del factor de necrosis tumoral se asocia con una mayor susceptibilidad a padecer esclerosis múltiple?

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Marcelo A. Kauffman

2007-10-01

Full Text Available A single nucleotide polymorphism (SNP at position -376 of the tumor necrosis factor á gene (TNFA has been associated with susceptibility to multiple sclerosis (MS in Spain. However, no association was found in populations from the USA and The Netherlands. Here we investigate the association between the TNFA - 376A SNP and MS susceptibility in Argentinean patients with MS. The A/G genotype was found in 4.4% of patients (n=90 and in 4.8% of healthy individuals (n=84; p=0.92; odds ratio=0.93; confidence interval: 0.23- 3.84. Thus, no significant differences in genotype and allele frequencies were found between healthy individuals and patients with MS in Argentina.Un polimorfismo de nucleótido único (SNP, por sus iniciales en inglés en la posición -376 del gen codificante del factor de necrosis tumoral á (TNFA ha sido asociado en España con un mayor riesgo a padecer esclerosis múltiple (EM. Sin embargo, esta asociación no fue encontrada en estudios hechos en poblaciones provenientes de los EE.UU. y Holanda. Aquí investigamos la asociación entre el SNP TNFA -376A y el desarrollo de EM en una población de pacientes argentinos con EM. El genotipo A/G fue encontrado en 4.4% de los pacientes (n=90 y en 4.8% de los controles sanos (n=84; p=0.92; odds ratio=0.93; intervalo de confianza: 0.23-3.84. En consecuencia, no encontramos diferencias en las frecuencias alélicas y genotípicas entre los sujetos enfermos y los controles sanos en Argentina.

Polimorfismo genético relacionado con la probabilidad de desarrollar asma ocupacional en trabajadores expuestos a isocianatos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Gaetano Pepe Betancourt

2014-03-01

Full Text Available Introducción: El desarrollo tecnológico ha traído como consecuencia el uso de sustancias químicas potencialmente perjudiciales para la salud de los trabajadores. Particularmente el uso de isocianatos ha resultado en una mayor morbilidad de patología respiratoria, especialmente el asma. Considerando que no todos los trabajadores expuestos desarrollan la enfermedad se ha propuesto un modelo de interacción gen-medioambiental, el cual trata de explicar la predisposición genética que tienen algunos individuos a desarrollar asma ocupacional y otros no. Objetivo: Conocer la evidencia científica relacionada con el polimorfismo genético y la susceptibilidad que tienen los trabajadores expuestos a isocianatos a desarrollar asma ocupacional. Metodología: Se realizó una revisión sistemática mediante una búsqueda bibliográfica utilizando las bases de datos PubMedline, así como en los repositorios Dialnet y ELSEVIER. Se extrajeron los artículos relacionados al objetivo de esta revisión, no se aplicaron filtros de temporalidad, utilizándose los siguientes descriptores: MeSH Major Topic, MeSH Terms. El periodo de búsqueda fue desde el 20 de noviembre de 2013 y finalizó el 15 de diciembre de 2013. El nivel de evidencia se estableció de acuerdo a los criterios GRADE. Resultados: Se analizaron a texto completo 42 artículos, la evidencia científica se sustentó en 11 estudios de casos-controles. Dada la complejidad del polimorfismo genético asociado con la expresión fenotípica de la enfermedad, como limitación de los estudios, los autores coinciden que el tamaño muestral no es suficientemente grande, sin embargo después de ajustar los factores de confusión los artículos encontrados tuvieron un nivel de evidencia B de GRADE. Conclusión: La genética tiene una influencia significativa en el asma ocupacional inducida por isocianatos. El peso de la susceptibilidad genética y de la interacción gen-medioambiente aún no se han

Polimorfismo Val108/158Met en el gen dopaminérgico catecol-o-metil transferasa (COMT en una población mixta peruana y su importancia para los estudios neuropsiquiátricos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Doris Huerta

2007-12-01

Full Text Available Introducción: El gen dopaminérgico catecol-o-metil transferasa (COMT, tiene un polimorfismo funcional Val108/158Met que da lugar a variantes de la enzima que cataliza la o-metilación de las catecolaminas activas, participando en el metabolismo de las drogas y neurotransmisores, como la L-dopa, norepinefrina, epinefrina y dopamina y, por consiguiente, puede asociarse a condiciones neuropsiquiátricas. Objetivos: Determinar las frecuencias genotípicas y alélicas del polimorfismo Val108/158Met del gen COMT en sujetos saludables de una población mixta peruana y establecer las implicancias para el estudio genético de enfermedades y otras condiciones neuropsiquiátricas. Diseño: Estudio descriptivo, observacional, transversal. Lugar: Centro de Investigación de Bioquímica y Nutrición ‘Alberto Guzmán Barrón’. Facultad de Medicina, Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Participantes: Ciento seis personas, hombres y mujeres, clínicamente saludables, sin enfermedades neurológicas ni mentales u otra patología similar, voluntarios con consentimiento informado, sin relación de parentesco, todos residentes en Lima, cuyas edades fluctuaban entre los 18 y 50 años. Intervenciones: Extracción del ADN genómico a partir de células de epitelio bucal, según metodología estándar. Amplificación mediante la PCR con primers específicos y digestión con la enzima de restricción NlaIII. Detección de fragmentos de restricción de longitud polimórfica (RFLP por electroforesis en gel de poliacrilamida al 6%, teñido con nitrato de plata. Principales medidas de resultados: Frecuencias genotípicas y alélicas del gen COMT en población mixta peruana. Resultados: Se encontró las frecuencias genotípicas Met/Met=0,0661, Val/Met=0,5094 y Val/Val=0,4245, siendo la distribución consistente con el equilibrio de Hardy-Weinberg (X² =3,0317, g.l.=1, p >0,05. Las frecuencias alélicas encontradas fueron alelo Val=0,68 y el alelo Met=0

Global sensitivity analysis of the BSM2 dynamic influent disturbance scenario generator

DEFF Research Database (Denmark)

Flores-Alsina, Xavier; Gernaey, Krist V.; Jeppsson, Ulf

2012-01-01

This paper presents the results of a global sensitivity analysis (GSA) of a phenomenological model that generates dynamic wastewater treatment plant (WWTP) influent disturbance scenarios. This influent model is part of the Benchmark Simulation Model (BSM) family and creates realistic dry/wet weat...

Searches for BSM Higgs bosons at ATLAS, including rare and invisible decays

CERN Document Server

Otero y Garzon, Gustavo; The ATLAS collaboration

2017-01-01

Several theories beyond the Standard Model predict the existence of high mass neutral or charged Higgs particles or BSM decay modes of the 125 GeV Higgs boson. In this presentation the latest ATLAS results on searches for these particles will be discussed.

Genotipificación de polimorfismos moleculares en los genes CYP2E1, GSTM1 y GSTT1 para evaluar susceptibilidad a Cáncer gastrointestinal en una población paisa

Directory of Open Access Journals (Sweden)

DL. Zuluaga

2001-07-01

Full Text Available Entre los años 2001 y 2002 se recogieron 40 muestras de pacientes diagnosticados con cáncergastrointestinal en los departamentos de Antioquia y Caldas, a los cuales se les determinó elgenotipo molecular para los genes CYP2E1, GSTM1 y GSTT1 en sangre y se les realizó una entre-vista para analizar su consumo de alcohol, cigarrillo y alimentos quemados y/o embutidos, ya queestudios previos en otras poblaciones han sugerido la asociación de algunos polimorfismos de estos genes (en combinación o no con factores ambientales, con una predisposición a la enfermedad. Por tanto, se comparó estadísticamente las frecuencias genotípicas con las de unapoblación de controles sanos apareada con los casos por edad y sexo, y se observó la suscep-tibilidad a cáncer gastrointestinal, mediante el análisis de asociación a polimorfismos en los genesque codifican para las enzimas CYP2E1, GSTM1 Y GSTT1 del metabolismo de xenobióticos.

Spectroscopy of the BSM sextet model

Science.gov (United States)

Fodor, Zoltan; Holland, Kieran; Kuti, Julius; Nogradi, Daniel; Wong, Chik Him

2018-03-01

As part of our ongoing lattice study of SU(3) gauge theory with two flavors of fermions in the two-index symmetric representation (the sextet model), we present the current status of the pseudoscalar particle spectrum. We use a mixed action approach based on the gradient flow to control lattice artifacts, allowing a simultaneous extrapolation to the chiral and continuum limits. We find strong evidence that the pseudoscalar is a Goldstone boson state, with spontaneously broken chiral symmetry and a non-zero Goldstone decay constant in the chiral limit. In agreement with our study of the gauge coupling β function, we find the sextet model appears to be a near-conformal gauge theory and serves as a prototype of the composite Higgs BSM template.

Influência do polimorfismo I/D do gene da eca na HPE de jovens normotensos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Manuella de Oliveira Fernandes

2015-08-01

Full Text Available INTRODUÇÃO: A hipotensão pós-exercício (HPE é considerada uma estratégia não farmacológica adotada para redução da pressão arterial (PA. Ademais, sabe-se que a presença de alguns polimorfismos genéticos influencia a resposta pressórica, como o I/D do gene da enzima conversora da angiotensina (ECA. Objetivo: Analisar a influência do polimorfismo I/D da ECA sobre a HPE após três diferentes intensidades de exercício em jovens normotensos e fisicamente ativos.MÉTODOS: Vinte e seis jovens saudáveis (DD = 11; ID/II = 15 realizaram uma sessão máxima de 1.600 metros, na pista de atletismo e outras três sessões experimentais (Sessão Moderada: 6% abaixo do limiar anaeróbio, Sessão Intensa: 6% acima do limiar anaeróbio e Sessão de Controle, com aferições prévias da PA, por 20 minutos e posteriores ao exercício por 60 minutos.RESULTADOS: Observou-se que o exercício moderado ocasionou HPE independentemente do grupo genotípico, sendo mais evidente para a pressão arterial sistólica nos momentos 45 minutos e 60 minutos (p ≤ 0,05. Verificou-se também que a característica gênica exerceu influência sobre a área abaixo da curva pressórica (p ≤ 0,005 sobre a pressão arterial diastólica, formada 1 hora após o exercício.CONCLUSÃO: Conclui-se que o exercício moderado ocasiona HPE em jovens normotensos e fisicamente ativos, independentemente do polimorfismo I/D no gene da ECA, sendo que esse polimorfismo exerce influência sobre a hipotensão diastólica, e os indivíduos portadores do alelo I apresentam maior decaimento da PA diastólica (PAD.

Associação entre polimorfismos genéticos e transtorno bipolar

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Verônica de Medeiros Alves

2012-01-01

Full Text Available Transtorno bipolar (TB é uma doença comum que afeta aproximadamente 1% da população. Apresenta características crônicas e agudas graves, com índices de remissão de baixa e alta prevalência de comorbidades clínicas e psiquiátricas. O objetivo do presente artigo é sintetizar dados de vários artigos que investigaram polimorfismos genéticos associados com TB. Dentre os 129 artigos selecionados, identificaram-se 79 (85,87% genes associados com TB. Essa análise identificou cinco genes que são os mais citados na literatura: CANAC1C, DAOA, TPH2, ANK3 e DISC1. Dos 92 genes identificados nesses artigos, 33 (35,87% não mostraram associação com TB. Essa análise mostrou que, apesar dos avanços recentes com relação ao papel do polimorfismo genético na predisposição para TB, mais pesquisas ainda são necessárias para elucidar sua influência sobre esse transtorno.

Polimorfismo en el gen COMT en una muestra de gestantes normales y con restricción del crecimiento intrauterino en un hospital de Lima

OpenAIRE

José Pacheco-Romero; Doris Huerta; Oscar Acosta; Santiago Cabrera

2013-01-01

Antecedentes: Los procesos fisiopatológicos que ocurren a nivel celular y molecular en la restricción de crecimiento intrauterino (RCIU) son aún desconocidos. La catecol-O-metiltransferasa (COMT) es una enzima de fase II que inactiva los catecol estrógenos al transferir un grupo metílico. Se conoce un polimorfismo funcional Val158 Met en el gen COMT como un marcador susceptible para diversas enfermedades maternoperinatales, existiendo estudios que sugieren que el alelo que codifica una COMT d...

Polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados (AFLP´s) a partir de muestras de sangre almacenadas en tarjetas FTA® para la especie Cavia porcellus Lin. (Rodentia: Caviidae)

OpenAIRE

Burgos-Paz, William; Rosero-Galindo, Carol; Cárdenas-Henao, Heiber; Solarte-Portilla, Carlos

2007-01-01

Una manera eficaz de establecer el grado de variabilidad entre y dentro de poblaciones, es a través del análisis de polimorfismos de ADN con marcadores moleculares como los AFLP`s. En este artículo se presenta una metodología que combina la utilización de tarjetas de FTA® (Whatman Bioscience, Cambridge) para colección y conservación de muestras de sangre, con los procedimientos de extracción de ADN y obtención de marcadores AFLP´s, aspectos sobre los cuales no existen antecedentes para la esp...

BSM Higgs Studies at the LHC in the Forward Proton Mode

CERN Document Server

Heinemeyer, S; Ryskin, M G; Tasevsky, M; Weiglein, G

2010-01-01

The prospects for central exclusive diffractive (CED) production of BSM Higgs bosons at the LHC are reviewed. This comprises the production of MSSM and 4th generation Higgs bosons. The sensitivity of the searches in the forward proton mode for the Higgs bosons as well as the possibility of a coupling structure determination are briefly discussed.

Origen, dispersión y diversidad del chirimoyo (Annona cherimola Mill.) en el continente americano

OpenAIRE

Larrañaga González, Nerea

2017-01-01

En este trabajo se ha profundizado en las razones que pueden explicar la distribución actual de la diversidad genética del chirimoyo (Annona cherimola Mill.), una especie frutal adaptada a climas subtropicales, con claras implicaciones para su uso y conservación. Gracias a un estudio de código de barras, se pudo comprobar el poder de discriminación del gen cloroplastídico maturasa K (matK) entre las especies con mayor importancia agronómica del género. Además, sobre los polimorfismos de nucle...

Scheme for Deterministic BSM-Free Controlled Teleportation of Unknown Atomic States

International Nuclear Information System (INIS)

Wang Yahong; Song Heshan; Li Chong

2007-01-01

We propose a controlled scheme for teleportation of an arbitrary one or two atomic state via a driven QED cavity. The scheme does not involve the joint Bell-state-measurement BSM and the probability of successful teleportation is 1. We show that the original atomic state cannot be perfectly restored by the receiver without all the agents collaborate and classical communication.

Polimorfismo g.17924a>g en el gen fasn y su relación con la composición de ácidos grasos (MUFA y CLA) En la carne de novillos aberdeen angus

OpenAIRE

Inostroza, Karla; Larama, Giovanni; Sepúlveda, Néstor

2013-01-01

El interés en la composición de ácidos grasos de la carne bovina está relacionado con producir alimentos más saludables, por ejemplo, con altos contenidos de ácidos grasos monoinsaturados (MUFA) y ácido linoleico conjugado (CLA), debido a que la carne es considerada un alimento con un excesivo contenido graso. El principal objetivo fue determinar la relación del polimorfismo g.17924A>G en el gen FASN con la composición de ácidos grasos en la carne de bovinos Aberdeen Angu...

Association of vitamin D receptor BsmI gene polymorphism with risk of tuberculosis: a meta-analysis of 15 studies.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Yu-Jiao Wu

Full Text Available BACKGROUND: Genetic variations in vitamin D receptor (VDR may contribute to tuberculosis (TB risk. Many studies have investigated the association between VDR BsmI gene polymorphism and TB risk, but yielded inconclusive results. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: We performed a comprehensive meta-analysis of 15 publications with a total of 2309 cases and 3568 controls. We assessed the strength of the association between VDR BsmI gene polymorphism and TB risk and performed sub-group analyses by ethnicity, sample size and Hardy-Weinberg equilibrium (HWE. We found a statistically significant correlation between VDR BsmI gene polymorphism and decreased TB risk in four comparison models: allele model (b vs. B: OR = 0.78, 95% CI = 0.67, 0.89; Pheterogeneity = 0.004, homozygote model (bb vs. BB: OR = 0.61, 95% CI = 0.43, 0.87; Pheterogeneity = 0.001, recessive model (bb vs. Bb+BB: OR = 0.70, 95% CI = 0.56, 0.88; Pheterogeneity = 0.005 and dominant model (bb+Bb vs. BB: OR = 0.77, 95% CI = 0.61, 0.97; Pheterogeneity = 0.010, especially in studies based on Asian population. Sub-group analyses also revealed that there was a statistically decreased TB risk in "small" studies (0.5. Meta-regression and stratification analysis both showed that the ethnicity and sample size contributed to heterogeneity. CONCLUSIONS: This meta-analysis suggests that VDR BsmI gene polymorphism is associated with a significant decreased TB risk, especially in Asian population.

Associação entre polimorfismo SLC6A3 3’UTR VNTR e a resposta ao tratamento da dependência de nicotina

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Guilherme Rubino de Azevedo Focchi

2011-01-01

Full Text Available Objetivo: Avaliar a associação entre a resposta ao tratamento da dependência de nicotina com bupropiona e a presença do polimorfismo SLC6A3 3’UTR VNTR, localizado no gene que codifica o transportador dopaminérgico. Método: Foram acompanhados no Ambulatório de Tabagismo do Instituto de Psiquiatria da Faculdade de Medicina da USP 100 pacientes do sexo masculino com diagnóstico de dependência de nicotina, sem outras patologias. Todos receberam bupropiona até 300 mg ao dia por 12 semanas, associada à terapia cognitivo-comportamental em grupo. A Escala de Fagerström foi aplicada no início e no final do tratamento, e avaliou-se a parada do uso de cigarros na última semana de tratamento e um mês após. Os pacientes tiveram 10 ml de sangue colhidos e genotipados para a existência do polimorfismo SLC6A3 3’UTR VNTR. Resultados: Não foi encontrada associação entre cessação do uso de cigarro e presença do polimorfismo. Conclusão: São necessários mais estudos para avaliar se a presença do polimorfismo SLC6A3 3’UTR VNTR estaria relacionada à melhor resposta ao tratamento da dependência de nicotina.

Use of Several Thermal Analysis Techniques to Study the Cracking of an Nitrile Butadiene Rubber (NBR) Insulator on the Booster Separation Motor (BSM) of the Space Shuttle

Science.gov (United States)

Wingard, Charles D.; Whitaker, Ann F. (Technical Monitor)

2000-01-01

Two different vendor rubber formulations have been used to produce the silica-filled NBR insulators for the BSM used on both of the Solid Rocket Boosters (SRBs) of the Space Shuttle. A number of lots of the BSM insulator in 1998-99 exhibited surface cracks and/or crazing. Each insulator is bonded to the BSM aluminum aft closure with an epoxy adhesive. Induced insulator stresses from adhesive cure are likely greatest where the insulator/adhesive contour is the greatest, thus showing increased insulator surface cracking in this area. Thermal analysis testing by Dynamic Mechanical Analyzer (DMA) and Thermomechanical Analysis (TMA) was performed on one each of the two vendor BSM insulators previously bonded that exhibited the surface cracking. The TMA data from the film/fiber technique yielded the most meaningful results, with thin insulator surface samples containing cracks having roughly the same modulus (stiffness) as thin insulator bulk samples just underneath.

Polimorfismos em genes de reparo do DNA (XPC, ERCC1, XRCC7) em mulheres com câncer do colo do útero

OpenAIRE

Saffar, Issamir Farias [UNIFESP

2010-01-01

Estudos demonstram que polimorfismos em genes relacionados ao reparo do DNA estão envolvidos na patogênese de diversas doenças neoplásicas, como o câncer ginecológico, particularmente o câncer do colo do útero. O presente estudo, caso-controle, compara os polimorfismos dos genes XPC, ERCC1 e XRCC7 em 77 mulheres com câncer cervical (70 casos de carcinoma espinocelular e 7 casos de adenocarcinoma do colo do útero) e 73 mulheres saudáveis atendidas no Hospital do Câncer Alfredo Abrão, entre Jun...

Análisis de PCR-RFLP del gen de leptina y su asociación con características de la leche en ganado nativo (Bos indicus de Irán

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Mojtaba Rezaei

2015-01-01

Full Text Available Se utilizó una muestra ganadera experimental para la caracterización de los genes y las frecuencias genotípicas y evaluar la asociación entre los polimorfismos de longitud del fragmento de restricción BsaAI en el gen de leptina y las características lácteas. Se recolectaron muestras de sangre de 390 vacas proporcionadas por el censo ganadero de la provincia de Guilán en Irán. La extracción de ADN genómico se basó en el método modificado de precipitación salina. El fragmento de 522 bp que comprende la región parcial del exón 3 e intrón 2 del locus del gen de leptina se amplificó mediante PCR-RFLP e iniciadores específicos. La digestión del fragmento amplificado con la enzima de restricción BsaAI reveló dos alelos de A y B con frecuencias de 0.447 y 0.553, y tres genotipos de AA, AB, BB con frecuencias de 0.185, 0.526 y 0.289 en la población estudiada, respectivamente. El resultado del contenido de polimorfismo fue 0.372 y para heterocigosis 0.526. Los resultados demostraron que la población estudiada estaba en equilibrio Hardy-Weinberg. El análisis estadístico indicó que el polimorfismo LEP- BsaAI tiene un efecto significativo en la producción de leche, porcentaje de grasa y proteína de la leche ( P <0.01. Animales portadores del genotipo heterocigoto (AB produjeron 1.17 y 0.7 kg/d más leche que los animales homocigotos AA y BB, respectivamente. Los animales con el genotipo AA tuvieron mayor grasa (0.28 % y porcentaje de proteína (0.17 % que el genotipo AB. Tales resultados pueden utilizarse como criterios para facilitar la selección genética en los programas de cría animal.

O papel do polimorfismo funcional VNTR da região promotora do gene MAOA nos transtornos psiquiátricos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Sílvia A. Nishioka

2011-01-01

Full Text Available INTRODUÇÃO: Muitos estudos têm investigado a associação do polimorfismo VNTR (número variável de repetições em série localizado na região promotora do gene da enzima monoamina oxidase A (MAOA com alterações no comportamento humano e em diversos transtornos psiquiátricos. OBJETIVO: O objetivo do presente trabalho foi revisar a literatura sobre a participação desse polimorfismo funcional na modulação do comportamento humano para o desenvolvimento dos transtornos psiquiátricos. MÉTODO: A pesquisa foi realizada na literatura em inglês, de janeiro de 1998 a junho de 2009, disponível no Medline, Embase, Web of Science e na base de dados PsycInfo, utilizando os seguintes termos: "MAOA e comportamento humano" e "MAOA e psiquiatria". RESULTADOS: Foram encontrados 3.873 estudos. Desses, 109 foram selecionados e incluídos na revisão. Encontrou-se associação de alelos de baixa atividade do VNTR com transtorno de personalidade antissocial, transtorno de conduta, transtorno de déficit de atenção e hiperatividade, jogo patológico e dependência de substâncias. Alelos da alta atividade da MAOA foram associados a depressão, ansiedade, neuroticismo e anorexia nervosa. Não se encontrou associação entre polimorfismos da MAOA e esquizofrenia e transtorno bipolar. CONCLUSÃO: Os principais achados dão suporte ao papel do polimorfismo VNTR da região promotora do gene da MAOA em alguns transtornos psiquiátricos, apesar das divergências encontradas devidas às dificuldades metodológicas de estudos em genética. De modo geral, os estudos associam os alelos de baixa atividade da MAOA com comportamentos impulsivos e agressivos ("comportamentos hiperativos", enquanto os alelos de alta atividade do gene são mais associados a "comportamentos hipoativos".

Polimorfismos de DNA nos genes dos receptores de estrogênio e FSHR e associação com resposta superovulatória em bovinos

OpenAIRE

Valeriano, Ana Cláudia de Melo

2010-01-01

Estudos baseados em genes candidatos buscam identificar polimorfismos e a prospecção de genes candidatos que estão envolvidos no processo de ovulação são ferramentas de importantes quando se pretende incrementar a eficiência reprodutiva de rebanhos e melhorar as respostas das biotécnicas de multiplicação animal. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi sequenciar e detectar polimorfismos em parte do “exon” 10 do gene do receptor do hormônio folículo estimulante (FSHR); genotipar doadoras de e...

Recent progress for Linear Collider SM/BSM Higgs/electroweak symmetry breaking calculations

International Nuclear Information System (INIS)

Reuter, Juergen

2012-01-01

In this paper I review the calculations (and partially simulations and theoretical studies) that have been made and published during the last two to three years focusing on the electroweak symmetry breaking sector and the Higgs boson(s) within the Standard Model and models beyond the Standard Model (BSM) at or relevant for either the International Linear Collider (ILC) or the Compact Linear Collider (CLIC), commonly abbreviated as Linear Collider (LC). (orig.)

Relationship between cardiometabolic profile, vitamin D status and BsmI polymorphism of the VDR gene in non-institutionalized elderly subjects: Cardiometabolic profile, vitamin D status and BsmI polymorphism of the VDR gene in non-institutionalized elderly subjects.

Science.gov (United States)

Issa, Chahira Taha Mahd Ibrahim; Silva, Alexandre Sérgio; Toscano, Luciana Tavares; Medeiros, Marcia Silva; Persuhn, Darlene Camati; da Silva Diniz, Alcides; de Carvalho Costa, Maria José; Rodrigues Gonçalves, Maria da Conceição

2016-08-01

This study aimed to evaluate the relationship between the cardiometabolic profile, vitamin D status and BsmI polymorphism of the VDR gene in non-institutionalized elderly subjects. A cross-sectional study was conducted with a random and representative sample of 142 elderly subjects selected by cluster and recruited from a municipal assistance program. Clinical, nutritional, biochemical and inflammatory profiles, oxidative stress and genotyping for the BsmI polymorphism were evaluated. Participants had mean age of 69.9 (7.0) years, BMI of 28.3 (4.4) kg/m(2) and 80.3% were women. The prevalence of a 25-hydroxyvitamin D [25(OH)D] status vitamin D levelDD≥75nmol/L]; this relationship was maintained only for women in the analysis by sex. The BsmI polymorphism showed allelic frequencies in the SUF group of B 49% and b 51% and in the INSUF/DEF group B 38% and b 62%. The frequency of bb homozygosity was significantly associated with lower serum total cholesterol and LDL cholesterol concentrations compared to Bb, both in the general population and in the SUF group. Among individuals with bb, the INSUF/DEF group showed higher levels of triglycerides and VLDL cholesterol. Blood glucose levels and oxidative stress were increased in elderly subjects with 25(OH)Dvitamin D status resulted in lower total and LDL cholesterol, but the benefit was lost when vitamin D insufficiency or deficiency was present. Copyright © 2016 Elsevier Inc. All rights reserved.

Medicina genómica: Aplicaciones del polimorfismo de un nucleótido y micromatrices de ADN Genomic Medicine: Polymorphisms and microarray applications

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Monica P. Spalvieri

2004-12-01

Full Text Available Esta actualización tiene por objeto difundir un nuevo enfoque de las variaciones del ADN entre individuos y comentar las nuevas tecnologías para su detección. La secuenciación total del genoma humano es el comienzo para conocer la diversidad genética. La unidad de medida reconocida de esta variabilidad es el polimorfismo de un solo nucleótido (single nucleotide polymorphism o SNP. El estudio de los SNPs está restringido a la investigación pero las numerosas publicaciones sobre el tema hacen vislumbrar su entrada en la práctica clínica. Se presentan ejemplos del uso de SNPs como marcadores moleculares en la genotipificación étnica, la expresión génica de enfermedades y como potenciales blancos farmacológicos. Se comenta la técnica de las matrices (arrays que facilita el estudio de múltiples secuencias de genes mediante chips de diseño específico. Los métodos convencionales analizan hasta un máximo de 20 genes, mientras que una sola micromatriz provee información sobre decenas de miles de genes simultáneamente con una genotipificación rápida y exacta. Los avances de la biotecnología permitirán conocer, además de la secuencia de cada gen, la frecuencia y ubicación exacta de los SNPs y su influencia en los comportamientos celulares. Si bien la validez de los resultados y la eficiencia de las micromatrices son aún controvertidos, el conocimiento y caracterización del perfil genético de un paciente impulsará seguramente un cambio radical en la prevención, diagnóstico, pronóstico y tratamiento de las enfermedades humanas.This update shows new concepts related to the significance of DNA variations among individuals, as well as to their detection by using a new technology. The sequencing of the human genome is only the beginning of what will enable us to understand genetic diversity. The unit of DNA variability is the polymorphism of a single nucleotide (SNP. At present, studies on SNPs are restricted to basic research

Estudio de polimorfismos genéticos implicados en el metabolismo de hormonas sexuales y su asociación con Abortos Espontáneos de causa desconocida.

OpenAIRE

Pérez Nevot, Beatriz

2016-01-01

En este trabajo nos hemos centrado en el estudio de 8 polimorfismos relacionados con el metabolismo de las hormonas sexuales en el feto y su relación con los abortos espontáneos de causa desconocida, bajo la hipótesis de que un desequilibrio en la producción de hormonas sexuales en el feto está implicado en la interrupción de la gestación. Para ello se seleccionaron muestras de tejido fetal procedentes de abortos espontáneos de causa desconocida y se estudiaron varios polimorfismos de dos enz...

Association of vitamin D receptor gene BsmI (A>G) and FokI (C>T) polymorphism in gestational diabetes among Saudi Women

Science.gov (United States)

El-Beshbishy, Hesham A.; Tawfeek, Manal A.; Taha, Inass M.; FadulElahi, Thoraya; Shaheen, Amal Y.; Bardi, Fouad A.; Sultan, Intessar I.

2015-01-01

Objective: Vitamin D receptor (VDR) gene polymorphism have a role in diabetes mellitus pathogenesis. Present study was conducted to determine VDR gene variants among Saudi gestational diabetics (GDM) in Madina, KSA. Methods: This cross sectional study was conducted on 112 GDM patients and 218 normal healthy control. Age, body mass index and blood pressure levels were recorded. Serum triglycerides (mg/dl), total cholesterol, HDL-cholesterol, LDL-cholesterol, fasting blood glucose FBG and post-prandial blood glucose PPBG were estimated. Extracted DNA template was amplified by PCR reaction and genotyped for single nucleotide polymorphism of BsmI and FokI by restriction fragment length polymorphism-PCR (RFLP-PCR) analysis. Results: FBG and PPBG levels in GDM patients were significantly elevated by +48.6% and +50%, respectively (P=0.005). Serum triglycerides, total cholesterol and LDL-cholesterol (mg/dl) levels in GDM patients were elevated significantly by +40.5% (P=0.005), +16% (P=0.01) and +30.8% (P=0.005), respectively. Serum HDL-cholesterol (mg/dl) showed significant decline by -10.5%. FokI VDR genotypes showed association with PPBG (P=0.05) among GDM patients. The Ff, FF and ff genotype percentage among GDM patients was 48.2%, 30.4% and 21.4%, respectively. FokI (F and f) and BsmI (B and b) alleles frequency showed no significant difference between GDM patients and control. Percentage BsmI and FokI total homozygous and heterozygous variants among GDM was 45.5% and 81.4%, respectively. Conclusion: VDR BsmI and FokI polymorphic marker not associated with Saudi GDM. PMID:26870091

Estructura genética del copépodo Acartia lilljeborgii en la costa del estado de Yucatán, México

OpenAIRE

Jorge Tello-Cetina; Lucia Gómez-Victoria; Roberto Zamora-Bustillos; Gerardo Rivera-Muñoz; Sara Solis-Pereira; Herbert Loria-Sunza

2013-01-01

Se determinó la estructura genética poblacional y sus implicancias dentro de la cadena trófica del copépodo Acartia lilljeborgii en la costa de Yucatán, mediante el uso de isoenzimas y su posterior determinación por electroforesis. Nueve sistemas se expresaron con un máximo de 30 loci. El polimorfismo y heterocigosis de las poblaciones estudiadas, al ser comparados con otras especies de copépodos, resultaron ser bajos y de los cuatro loci que presentaron variación, solo los loci EST2 y PGM1 s...

The associations between VDR BsmI polymorphisms and risk of vitamin D deficiency, obesity and insulin resistance in adolescents residing in a tropical country.

Science.gov (United States)

Rahmadhani, Rayinda; Zaharan, Nur Lisa; Mohamed, Zahurin; Moy, Foong Ming; Jalaludin, Muhammad Yazid

2017-01-01

The vitamin D receptor (VDR) gene is expressed abundantly in different tissues; including adipocytes and pancreatic beta cells. The rs1544410 or BsmI single nucleotide polymorphism (SNP) in the intronic region of the VDR gene has been previously associated with vitamin D levels, obesity and insulin resistance. This study was aimed to examine the association between BsmI polymorphism and risk of vitamin D deficiency, obesity and insulin resistance in adolescents living in a tropical country. Thirteen-year-old adolescents were recruited via multistage sampling from twenty-three randomly selected schools across the city of Kuala Lumpur, Malaysia (n = 941). Anthropometric measurements were obtained. Obesity was defined as body mass index higher than the 95th percentile of the WHO chart. Levels of fasting serum vitamin D (25-hydroxyvitamin D (25(OH)D)), glucose and insulin were measured. HOMA-IR was calculated as an indicator for insulin resistance. Genotyping was performed using the Sequenom MassARRAY platform (n = 807). The associations between BsmI and vitamin D, anthropometric parameters and HOMA-IR were examined using analysis of covariance and logistic regression. Those with AA genotype of BsmI had significantly lower levels of 25(OH)D (p = 0.001) compared to other genotypes. No significant differences was found across genotypes for obesity parameters. The AA genotype was associated with higher risk of vitamin D deficiency (p = 0.03) and insulin resistance (p = 0.03) compared to GG. The A allele was significantly associated with increased risk of vitamin D deficiency compared to G allele (adjusted odds ratio (OR) = 1.63 (95% Confidence Interval (CI) 1.03-2.59, p = 0.04). In those with concurrent vitamin D deficiency, having an A allele significantly increased their risk of having insulin resistance compared to G allele (adjusted OR = 2.66 (95% CI 1.36-5.19, p = 0.004). VDR BsmI polymorphism was significantly associated with vitamin D deficiency and insulin

Análisis de polimorfismos APO-E en mujeres colombianas con osteoporosis y correlación con variables clínicas y sociales de riesgo.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Elsa Villarreal

2004-03-01

Full Text Available Varios estudios han demostrado la asociación de los polimorfismos de la apolipoproteína E (APO-E con la osteoporosis, especialmente, la APO-E 4. Para analizar los polimorfismos APOE e identificar la asociación con variables clínicas y sociales, se realizó un estudio descriptivo de 32 mujeres con osteoporosis, provenientes de diferentes regiones de Colombia, mediante metodologías PCR y RFLP. Se observaron en osteoporosis, osteopenia y osteoporosis combinada con osteopenia frecuencias para el genotipo ?3/?3 en el 84,3% (n=27, y en el 15,6% para los genotipos con el alelo e4 (?3/e4=12,5%, ?=4; ?4/?4=3,1%, n=1; la misma tendencia se observó en la distribución por edad de la menopausia, ?3/?3 en el 83,3% (n=25, y genotipos con el alelo ?4 en el 16,6% (n=5 (?3/?4=13,3%, n=4; ?4/?4=3,3%, n=1. No hubo asociación de APO-E4 con estrato socioeconómico, fracturas, enfermedades o consumo de lácteos. Aunque no hubo efecto del alelo ?4 en la densidad mineral ósea (DMO de la columna lumbar: ?4+/-(?3/?4 0,960±0,144 g/cm2; ?4+/+ (?4/?4 0,873±0,00 g/cm2; ?4-/- (?3/?3 0,858±0,160 g/cm2; p=0,49, ni en cuello femoral: ?4+/-(?3/?4 0,841±0,026 g/cm2; ?4+/+ (?4/?4 0,842±0,00 g/cm2; ?4- /- (?3/?3 0,735±0,013 g/cm2, p=0,14, al explorar las diferencias de medias de DMO en el cuello femoral, se observó una diferencia significativa, t=4,17 p=0,05. Estos datos confirman una frecuencia del alelo e4 similar a lo reportado en poblaciones caucásicas y japonesas; se sugiere realizar estudios a gran escala para esclarecer el impacto de la APO-E sobre la DMO y su relación dosis-efecto.

Study of association between genetic polymorphisms of phospholipase A2 enzymes and Alzheimer's disease Associação entre polimorfismos das enzimas fosfolipases A2 e doença de Alzheimer

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Quirino Cordeiro

2010-04-01

Full Text Available Several genes have been related to late-onset Alzheimer's disease (LOAD. Phospholipases A2 (PLA2 influence the processing and secretion of the amyloid precursor protein, which gives rise to the beta-amyloid peptide, the major component of the amyloid plaque in AD. Hence, in the present study, polymorphisms of three genes encoding PLA2 enzymes group (cytosolic PLA2: BanI cPLA2 polymorphism; calcium-independent PLA2: AvrII iPLA2 polymorphism; PAFAH: Val279Phe PAFAH polymorphism were analysed in a case-control sample using 58 patients with LOAD and 107 matched healthy controls. There was a genotypic association between the BanI cPLA2 polymorphism and LOAD (χ2=6.25, 2df, p=0.04, however there was no allelic association. There were no associations between AvrII iPLA2 and Val279Phe PAFAH polymorphisms and LOAD. These data suggest that the BanI cPLA2 polymorphism may play a role in the susceptibility for LOAD in our Brazilian sample.Vários genes têm sido investigados como fatores de risco para o desenvolvimento da doença de Alzheimer (DA de início tardio. As fosfolipases A2 (PLA2 influenciam o processamento e secreção da proteína precursora do amilóide, que dá origem ao peptídeo meta-amilóide, o principal componente da placa amilóide na DA. Assim, no presente estudo, foram analisados três polimorfismos genéticos que codificam enzimas do grupo das PLA2 (PLA2 citosólica: polimorfismo BanI cPLA2; PLA2 cálcio-independente: polimorfismo AvrII iPLA2; PAFAH: polimorfismo Val279Phe PAFAH em 58 pacientes com DA de início tardio e 107 controles saudáveis pareados. Houve associação genotípica entre o polimorfismo BanI cPLA2 e DA de início tardio (χ2=6,25, 2df, p=0,04; no entanto não foi observada associação alélica. Não houve associação entre os polimorfismos AvrII iPLA2 e Val279Phe PAFAH com a doença. Tais dados sugerem que o polimorfismo BanI cPLA2 pode estar envolvido como fator de susceptibilidade para DA de início tardio em

Maternal MTHFR polymorphisms and risk of spontaneous abortion Polimorfismos maternos MTHFR y riesgo de aborto espontáneo

Directory of Open Access Journals (Sweden)

María del Rosario Rodríguez-Guillén

2009-02-01

Full Text Available OBJECTIVE: To asses the association between intake of folate and B vitamins and the incidence of spontaneous abortion (SA according to the maternal methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR polymorphisms (677 C>T and 1298 A>C. MATERIAL AND METHODS: We conducted a nested case-control study within a perinatal cohort of women recruited in the state of Morelos, Mexico. Twenty-three women with SA were compared to 74 women whose pregnancy survived beyond week 20th. Intake of folate and B vitamins respectively, was estimated using a validated food frequency questionnaire. Maternal MTHFR polymorphisms were determined by PCR-RFLP and serum homocysteine levels by HPLC. RESULTS: Carriers of MTHFR 677TT and 1298AC genotypes respectively showed an increased risk of SA (OR 677TT vs. CC/CT=5.0; 95% CI: 1.2, 20.9 and OR 1298 AC vs. AA=5.5; 95% CI: 1.1, 26.6. CONCLUSIONS: Our results support the role of MTHFR polymorphisms as a risk factor for SA, regardless of dietary intake of B vitamins.OBJETIVO: Evaluar la asociación entre aborto espontáneo (AE y el consumo dietético de vitaminas B en mujeres mexicanas portadoras de los polimorfismos de la metilentetrahidrofolato reductasa (MTHFR (677 C>T y 1298 A>C. MATERIAL Y MÉTODOS: Mediante un diseño de casos y controles anidados en una cohorte, se comparó la ingesta dietética materna de vitaminas B y folato, los polimorfismos maternos de la MTHFR y la concentración sérica de homocisteina de 23 casos de AE ( 20 semanas. RESULTADOS: Las portadoras de los genotipos MTHFR 677TT y 1298AC presentaron un incremento significativo en el riesgo de AE (RM 677TT vs. CC/CT=5.0; IC 95%: 1.2, 20.9 RM 1298 AC vs. AA=5.5; IC95%: 1.1, 26.6, respectivamente. CONCLUSIONES: Nuestros resultados apoyan el papel de la mutación de la MTHFR como posible factor de riesgo para el AE, independientemente del consumo de vitaminas B.

Determinación de la variabilidad genética entre aislamientos de Rosellinia sp. Rosellinia bunodes y Rosellinia pepo mediante la técnica de amplificación aleatoria de polimorfismos de DNA (RAPD y análisis de los espaciadores de transcritos internos (ITSS

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Javier Andrés López Quintero

2004-07-01

bunodes en los dendrogramas tanto de RAPD como de ITS1. Sin embargo, el alto grado de polimorfismo (>80% observado en el análisis de RAPD para las tres especies, está correlacionado con el aumento progresivo de las enfermedades en los cultivos de café, papa y cacao, con la procedencia geográfica de las cepas y con la alta divergencia encontrada en otros miembros de la familia Xylariaceae en el trópico. Ya que las regiones rDNA-ITS muestran un alto nivel de polimorfismo interespecífico y múltiples copias en el genoma celular, son un buen candidato para el diseño de iniciadores especie-específicos. Por tanto, las secuencias de las regiones ITS1 e ITS2 permitieron el desarrollo de iniciadores de PCR específicos para detectar y diferenciar Rosellinia sp. de otras especies, constituyéndose en un sistema de diagnóstico del patógeno en suelo y material vegetal. Se sugieren iniciadores específicos para Rosellinia pepo y Rosellinia bunodes que serán probados en ensayos posteriores.

Polymorphisms in the 5-HTR2A gene related to obstructive sleep apnea syndrome Polimorfismos no gene HTR2A relacionados à síndrome da apneia obstrutiva do sono

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Vânia Belintani Piatto

2011-06-01

Full Text Available Obstructive sleep apnea syndrome (OSAS is one of the most complex disorders of sleep; it involves several genetic factors that contribute to the phenotype. Serotonin (5-HT regulates a variety of visceral and physiological functions, including sleep. Gene 5-HTR2A polymorphisms may change the transcription of several receptors in the serotoninergic system, thereby contributing to OSAS. AIM: To investigate the prevalence of T102C and -1438G/A polymorphisms in the 5-HTR2A gene of patients with and without OSAS . MATERIAL AND METHOD: A molecular study of 100 index-cases and 100 controls of both genders. DNA was extracted from blood leukocytes samples and the regions that enclose both polymorphisms were amplified with PCR-RFLP. STUDY DESIGN: A cross-sectional case study. RESULTS: There was a significant prevalence of males in index cases compared to controls (pA síndrome da apneia obstrutiva do sono (SAOS é um dos distúrbios mais complexos do sono, envolvendo múltiplos fatores genéticos contribuintes para o fenótipo. A serotonina (5-HT está envolvida na regulação de uma variedade de funções viscerais e fisiológicas, inclusive o sono. Polimorfismos no gene 5-HTR2A podem alterar a transcrição, afetando o número de receptores do sistema serotoninérgico, contribuindo para a SAOS. OBJETIVO: Investigar a prevalência dos polimorfismos T102C e -1438G/A no gene HTR2A em pacientes com e sem SAOS. MATERIAL E MÉTODO: Estudo molecular em 100 pacientes como casos-índice e em 100 como grupo controle, de ambos os gêneros. O DNA foi extraído de leucócitos de sangue periférico e realizada a amplificação das regiões que abrangem ambos os polimorfismos pelas técnicas da PCR-RFLP. DESENHO DO ESTUDO: Estudo de caso/controle em corte transversal. Resultados: Houve prevalência significativa do gênero masculino nos casos-índice em relação aos controles (p<0,0001. Para o polimorfismo T102C, não houve diferença genotípica significante entre

Genetic variability of the inflammatory response. I. The -511 C/T IL1β polymorphism in different Peruvian subpopulations

OpenAIRE

Acosta, Oscar; Solano, Luis; Huerta, Doris; Oré, Daniel; Sandoval, José; Figueroa, José; Fujita, Ricardo

2012-01-01

El polimorfismo -511 citosina/timina (-511 C/T) en la región promotora del gen interleuquina 1 beta (IL1β) está implicado en la producción diferencial de la citoquina y por tanto puede estar asociado a la respuesta inmuno-inflamatoria en obesidad, dislipidemias, cardiopatías, cáncer, infecciones, y el tratamiento con nutrientes y fármacos. Objetivos: Establecer la distribución de frecuencias de los genotipos y alelos del polimorfismo -511 C/T del gen IL1β en diferentes subpoblaciones peruanas...

Efeitos da atorvastatina e do polimorfismo T-786C do gene eNOS sobre parâmetros do metabolismo lipídico plasmático

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Vanessa Helena de Souza Zago

2013-01-01

Full Text Available FUNDAMENTO: A atividade do óxido nítrico sintase endotelial (eNOS pode ser modulada pelo colesterol da lipoproteína de alta densidade (HDL-C, estatinas ou polimorfismos, como o T-786C de eNOS. OBJETIVO: Este estudo teve como objetivo avaliar se o polimorfismo T-786C está associado a alterações nos efeitos da atorvastatina no perfil lipídico, nas concentrações de metabólitos de óxido nítrico (NO e da proteína C reativa de alta sensibilidade (PCR-as. MÉTODOS: Trinta voluntários do sexo masculino, assintomáticos, com idade entre 18-56 anos foram genotipados e classificados de acordo com a ausência (TT, n = 15 ou presença (CC, n = 15 do polimorfismo. Eles foram selecionados aleatoriamente para a utilização de placebo e atorvastatina (10 mg/dia por 14 dias. Após cada tratamento foram medidos lípides, lipoproteínas, frações HDL2 e HDL3, atividade da proteína de transferência de colesteril éster (CETP, metabólitos de NO e PCR-as. RESULTADOS: As comparações entre genótipos após a administração de placebo mostraram aumento da atividade da CETP polimorfismo-dependente (TT, 12 ± 7; CC, 22 ± 12, p < 0,05. As análises da interação entre os tratamentos indicaram que a atorvastatina tem efeito sobre colesterol, LDL, nitrito e razões lípides/proteínas (HDL2 e HDL3 (p < 0,001 em ambos os genótipos. É interessante notar as interações genótipo/droga sobre a CETP (p < 0,07 e a lipoproteína (a [Lp(a] (p < 0,056, levando a uma diminuição limítrofe da CETP, embora sem afetar a Lp(a. A PRC-as não mostrou alterações. CONCLUSÃO: Os resultados sugerem que o tratamento com estatinas pode ser relevante para a prevenção primária da aterosclerose em pacientes com o polimorfismo T-786C do eNOS, considerando os efeitos no metabolismo lipídico.

Asociación entre el polimorfismo genético de la apolipoproteína E (ApoE y la enfermedad de Parkinson

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Victoria Marca

2013-07-01

Full Text Available Introducción: En nuestro país, con el incremento en la esperanza de vida, existe una tendencia creciente de enfermedades neurodegenerativas, por lo que se hace necesario realizar estudios sobre factores de riesgo genético en personas afectadas con la enfermedad de Parkinson (EP, entre ellos el gen de la apolipoproteína E (ApoE, ya que esta asociación es desconocida en nuestra población. Objetivo: Determinar la asociación del polimorfismo en el gen ApoE con la EP. Diseño: Estudio asociativo, observacional tipo casos y controles. Lugar: Instituto Nacional de Ciencias Neurológicas, Lima, Perú. Participantes: Personas de ambos sexos, 163 pacientes con la EP y 176 controles. Intervenciones: Extracción de ADN genómico según metodología estándar. Análisis del gen APOE mediante técnica PCR-RFLP. Principales medidas de resultados: Frecuencias genotípicas y alélicas del gen ApoE en los casos y controles, medidas de asociación y de riesgo. Resultados: No se encontró diferencias significativas entre el grupo control y los pacientes según genotipo de ApoE. La frecuencia del alelo ε4 fue similar en pacientes y en controles. El odds ratio para el alelo ε4 de la ApoE fue 1,0852 (IC 95%: 0,5812 a 2,0266. La edad de inicio de la EP no tuvo relaciσn con los genotipos ApoE. Conclusiones: El alelo ε4 de la ApoE no podrνa ser considerado un factor de riesgo para la EP, y los genotipos de la ApoE no se asociaron con la edad de inicio en esta muestra evaluada.

Search for BSM Higgs bosons in fermion decay modes with ATLAS

CERN Document Server

Straessner, Arno; The ATLAS collaboration

2017-01-01

Many physics models beyond the Standard Model (BSM) predict an extension of the Higgs sector, like the general 2-Higgs Doublet Model (2HDM) or supersymmetric models. In case of one additional Higgs doublet, there are five physical Higgs bosons: two CP neutral states (h,H), one CP odd state (A) and two charged Higgs bosons (H±). Typically, the already observed Higgs boson is identified with the h Higgs boson, while the others are assumed to be heavy. This presentation is reporting on recent results of direct searches for heavy neutral and charged Higgs bosons by the ATLAS Collaboration, in particular analyzing direct Higgs boson decays to fermions, like $H^\\pm \\to \\tau\

Influence of impurities and contact scale on the lubricating properties of bovine submaxillary mucin (BSM) films on a hydrophobic surface

DEFF Research Database (Denmark)

Nikogeorgos, Nikolaos; Madsen, Jan Busk; Lee, Seunghwan

2014-01-01

Lubricating properties of bovine submaxillary mucin (BSM) on a compliant, hydrophobic surface were studied as influenced by impurities, in particular bovine serum albumin (BSA), at macro and nanoscale contacts by means of pin-on-disk tribometry and friction force microscopy (FFM), respectively...

Polimorfismos del cromosoma Y humano en poblaciones de la región norte del Perú

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Néstor Carbajal-Caballero

2013-05-01

Full Text Available Se evaluaron los loci Y-específicos DYS287, DYS199 y DYS390 en un total de 105 individuos, en cuatro poblaciones del norte del Perú. Sólo un individuo presentó el linaje YAP+ /C, de probable origen africano. La frecuencia de cromosomas Y Amerindios, indicado por el linaje YAP- /T, fue mayor en la población Aguaruna de Yamayakat (97%, disminuyendo en mestizos de Moche (73%, Santiago de Chuco (53% y Trujillo (33%; por otro lado, el grado de mestizaje fue mayor en las poblaciones nor-occidentales. Los haplótipos más frecuentes fueron YAP- /C/24 en Trujillo (47% y YAP- /T/24 en Santiago de Chuco (23%. La diversidad haplotípica en Santiago de Chuco (0,881 fue mayor que en Trujillo (0,752. Es de resaltar la considerable proporción de cromosomas Y Amerindios en las poblaciones peruanas a pesar de más de 500 años de influencia hispánica y otras culturas.

Revisited the relationship between vitamin D level and receptors of BsmI- gene polymorphism with the pathogenetic mechanisms of placental dysfunction development

Directory of Open Access Journals (Sweden)

G. S. Manasova

2018-03-01

Full Text Available The role of the calcitriol / vitamin D receptor (VD endocrine system and the pleiotropic effects of this system in the pathogenetic mechanisms of various diseases development, in particular complications of pregnancy, has attracted researches’ increasing attention in recent years. The aim of the work: to compare the VD-status and frequency of occurrence of polymorphism of the VDR gene (BsmI (A> G, rs1544410 in patients with a physiological course of the gestation process and in patients with placental dysfunction (PD. Materials and methods. 56 pregnant women with PD (the main group and 40 patients with a physiological pregnancy (control group were examined. VD status was determined by ELISA at level 25 (OH D in serum, the frequency of BsmI polymorphism of the VDR gene (rs1544410 by polymerase chain reaction (PCR. Results. The average index of VD (31.40 ± 8.6 ng / ml in patients with PD is significantly lower than in patients with physiological pregnancy (43.54 ± 11.20 ng / ml, (p ≤ 0.05 . In patients with PD, homozygous carrier for the A-allele was found in 12% of cases, in healthy pregnant women - in 16.7%, (р ≥ 0.05, for the G-allele - in 20% and 47.20%, (р ≤ 0.01 cases, respectively to groups. Heterozygous combination of A / G alleles was noted in 68% of patients with PD and in 36.10% of the control group patients. In pregnant women with BsmI polymorphism of calcitriol gene (genotype A / G PD was 3.7 times more frequent (68% vs 36.10% : RR = 2.1, CI 1.0-6.6, OR = 3.7, CI 1.1-13.1. Conclusions. Vitamin D insufficiency or deficiency can be one of the reasons of PD formation. In carriers of BsmIgene’s polymorphism encoding VD receptor with genotype A / G, the course of pregnancy is complicated by placental dysfunction 3.7 times more often than in women without this polymorphism.

The BSM-AI project: SUSY-AI-generalizing LHC limits on supersymmetry with machine learning

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Caron, Sascha [Radboud Universiteit, Institute for Mathematics, Astro- and Particle Physics IMAPP, Nijmegen (Netherlands); Nikhef, Amsterdam (Netherlands); Kim, Jong Soo [UAM/CSIC, Instituto de Fisica Teorica, Madrid (Spain); Rolbiecki, Krzysztof [UAM/CSIC, Instituto de Fisica Teorica, Madrid (Spain); University of Warsaw, Faculty of Physics, Warsaw (Poland); Ruiz de Austri, Roberto [IFIC-UV/CSIC, Instituto de Fisica Corpuscular, Valencia (Spain); Stienen, Bob [Radboud Universiteit, Institute for Mathematics, Astro- and Particle Physics IMAPP, Nijmegen (Netherlands)

2017-04-15

A key research question at the Large Hadron Collider is the test of models of new physics. Testing if a particular parameter set of such a model is excluded by LHC data is a challenge: it requires time consuming generation of scattering events, simulation of the detector response, event reconstruction, cross section calculations and analysis code to test against several hundred signal regions defined by the ATLAS and CMS experiments. In the BSM-AI project we approach this challenge with a new idea. A machine learning tool is devised to predict within a fraction of a millisecond if a model is excluded or not directly from the model parameters. A first example is SUSY-AI, trained on the phenomenological supersymmetric standard model (pMSSM). About 300, 000 pMSSM model sets - each tested against 200 signal regions by ATLAS - have been used to train and validate SUSY-AI. The code is currently able to reproduce the ATLAS exclusion regions in 19 dimensions with an accuracy of at least 93%. It has been validated further within the constrained MSSM and the minimal natural supersymmetric model, again showing high accuracy. SUSY-AI and its future BSM derivatives will help to solve the problem of recasting LHC results for any model of new physics. SUSY-AI can be downloaded from http://susyai.hepforge.org/. An on-line interface to the program for quick testing purposes can be found at http://www.susy-ai.org/. (orig.)

The BSM-AI project: SUSY-AI-generalizing LHC limits on supersymmetry with machine learning

International Nuclear Information System (INIS)

Caron, Sascha; Kim, Jong Soo; Rolbiecki, Krzysztof; Ruiz de Austri, Roberto; Stienen, Bob

2017-01-01

A key research question at the Large Hadron Collider is the test of models of new physics. Testing if a particular parameter set of such a model is excluded by LHC data is a challenge: it requires time consuming generation of scattering events, simulation of the detector response, event reconstruction, cross section calculations and analysis code to test against several hundred signal regions defined by the ATLAS and CMS experiments. In the BSM-AI project we approach this challenge with a new idea. A machine learning tool is devised to predict within a fraction of a millisecond if a model is excluded or not directly from the model parameters. A first example is SUSY-AI, trained on the phenomenological supersymmetric standard model (pMSSM). About 300, 000 pMSSM model sets - each tested against 200 signal regions by ATLAS - have been used to train and validate SUSY-AI. The code is currently able to reproduce the ATLAS exclusion regions in 19 dimensions with an accuracy of at least 93%. It has been validated further within the constrained MSSM and the minimal natural supersymmetric model, again showing high accuracy. SUSY-AI and its future BSM derivatives will help to solve the problem of recasting LHC results for any model of new physics. SUSY-AI can be downloaded from http://susyai.hepforge.org/. An on-line interface to the program for quick testing purposes can be found at http://www.susy-ai.org/. (orig.)

El polimorfismo (CAGn del gen ATXN2, nuevo marcador de susceptibilidad para diabetes mellitus tipo 2

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Luis J. Flores-Alvarado

Full Text Available RESUMEN Objetivo Estimar si hay asociación del repetido (CAGn del gen ATXN2 en población mexicana con diabetes mellitus (DM tipo 2. Métodos Estudio epidemiológico de casos y controles. Se incluyeron personas sanas y personas diabéticas. La detección de la expansión (CAGn se realizó por reacción en cadena de la polimerasa (PCR-punto final. Los productos de PCR se analizaron mediante electroforesis (PAGE al 8% y tinción con nitrato de plata. Resultados La distribución de alelos del trinucleótido (CAGn en la población analizada resultó similar a la reportada en el centro del país. El alelo más frecuente es el de 22 repetidos; sin embargo, hay asociación con los portadores de los repetidos largos dentro del rango normal con diabetes. Conclusiones Los resultados sugieren que el repetido (CAGn del gen de ATXN2 podría ser un factor causal de DM tipo 2.

Polimorfismos genéticos do fator de crescimento do endotélio vascular na pré-eclâmpsia Genetic polymorphisms of vascular endothelial growth factor in pre-eclampsia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Valquiria Maria de Paula Cunha

2011-07-01

Full Text Available OBJETIVO: Identificar polimorfismos genéticos do fator de crescimento do endotélio vascular (VEGF, posições +936C/T e -2578C/A, em mulheres com pré-eclâmpsia. MÉTODOS:Trata-se de um estudo transversal,constituído por 80 mulheres distribuídas em dois grupos: pré-eclâmpsia e grupo controle. A caracterização da amostra foi realizada mediante entrevista pré-estruturadae complementada por dados transcritos dos prontuários. Para identificação dos polimorfismos foi realizada extração de DNA, amplificação das sequências pela Reação em Cadeia da Polimerase (PCR com primers específicos e análise por Polimorfismos de Comprimentos de Fragmentos de Restrição (RFLP. A análise estatística dos resultados foi realizada de forma descritiva e pelo teste do . O modelo de regressão logística múltipla foi utilizado para determinar o efeito dos polimorfismos na pré-eclampsia. RESULTADOS: Evidenciou-se uma maior frequência do alelo T do polimorfismo VEGF +936C/T nas pacientes com pré-eclâmpsia, embora com diferença não significativa.A presença do alelo A do VEGF -2578C/A foi maior no grupo controle, com diferença significativa. CONCLUSÕES: Não foi observada associação significativa do polimorfismo VEGF +936C/T com a pré-eclâmpsia. Para o polimorfismo VEGF -2578C/A observa-se diferença significativa entre os grupos, sendo o alelo A mais frequente no controle, sugerindo a possibilidade da portadora do alelo A apresentar menor suscetibilidade para o desenvolvimento de pré-eclâmpsia.PURPOSE: To identify genetic polymorphisms of endothelial growth factor (VEGF, positions +936C/T and -2578C/A, in women with pre-eclampsia. METHODS: This was a cross-sectional study conducted on 80 women divided into two groups: pre-eclampsia and control. The sample was characterized using a pre-structured interview and data transcribed from the medical records. DNA extraction, amplification of sequences by the Polymerase Chain Reaction (PCR

Association of vitamin D receptor BsmI, TaqI, FokI, and ApaI polymorphisms with susceptibility of chronic periodontitis: A systematic review and meta-analysis based on 38 case -control studies.

Science.gov (United States)

Mashhadiabbas, Fatemeh; Neamatzadeh, Hossein; Nasiri, Rezvan; Foroughi, Elnaz; Farahnak, Soudabeh; Piroozmand, Parisa; Mazaheri, Mahta; Zare-Shehneh, Masoud

2018-01-01

There has been increasing interest in the study of the association between Vitamin D receptor (VDR) gene polymorphisms and risk of chronic periodontitis. However, the results remain inconclusive. To better understand the roles of VDR polymorphisms (BsmI, TaqI, FokI, and ApaI) in chronic periodontitis susceptibility, we conducted this systematic review and meta-analysis. The PubMed, Google Scholar, and Web of Science database were systemically searched to determine all the eligible studies about VDR polymorphisms and risk of chronic periodontitis up to April 2017. Odds ratio (OR) and 95% confidence interval (CI) were used to evaluate the associations between VDR polymorphisms and chronic periodontitis risk. All the statistical analyses were performed by Comprehensive Meta-Analysis. All P values were two-tailed with a significant level at 0.05. Finally, a total of 38 case-control studies in 19 publications were identified which met our inclusion criteria. There are ten studies with 866 chronic periodontitis cases and 786 controls for BsmI, 16 studies with 1570 chronic periodontitis cases and 1676 controls for TaqI, five studies with 374 chronic periodontitis cases and 382 controls for FokI, and seven studies with 632 chronic periodontitis cases and 604 controls for ApaI. Overall, no significant association was observed between VDR gene BsmI, TaqI, FokI, and ApaI polymorphisms and risk of chronic periodontitis in any genetic model. Subgroup analysis stratified by ethnicity suggested a significant association between BsmI polymorphism and chronic periodontitis risk in the Caucasian subgroup under allele model (A vs. G: OR = 1.747, 95% CI = 1.099-2.778, P = 0.018). Further, no significant associations were observed when stratified by Hardy-Weinberg equilibrium status for BsmI, TaqI, and ApaI. Our results suggest that BsmI, TaqI, FokI, and ApaI polymorphisms in the VDR gene might not be associated with risk of chronic periodontitis in overall population.

RELACIÓN DE LOS NIVELES SÉRICOS DE LÍPIDOS Y LIPOPROTEÍNAS CON EL POLIMORFISMO ε 2, ε 3 Y ε 4 DEL GEN DE LA APOLIPOPROTEÍNA E, EN INDIVIDUOS CON DIABETES MELLITUS TIPO 2 Y EL RIESGO CARDIOVASCULAR

Directory of Open Access Journals (Sweden)

N. Coiza-Vargas

2005-12-01

Full Text Available Este trabajo describe la respuesta del perfil lipídico según el genotipo de la apolipoproteína E en personas con diabetes mellitus tipo 2 y la presencia o no de riesgo cardiovascular, por medio de la revisión sistemática de artículos científicos publicados entre 1990 y 2003. Seis estudios cumplieron con los criterios de inclusión y fueron seleccionados para realizar el trabajo de investigación.Inicialmente se realizó una descripción de características generales de los estudios y se utilizó la prueba estadística Chi - cuadrado para determinar diferencias entre grupos. Se encontró que el 66.6% de los artículos fueron realizados en Europa, el promedio de personas de los estudios fue de 473 y el promedio de edad estuvo en los 58 años.La distribución del genotipo E 3/3 (78.2%, fue la de mayor prevalencia en los diferentes grupos de diabéticos, seguido de E 4/3 en 12.8% y E 3/2 con un 8.7%. Las fracciones lipídicas más elevadas en los estudios fueron las de colesterol total, colesterol LDL y triglicéridos. Se observó que el polimorfismo de la apo E influye sobre el perfil lipídico, y por tanto, en el desarrollo de la enfermedad cardiovascular en los sujetos con DM tipo 2.

Polimorfismo G894T da óxido nítrico-sintetase endotelial e o prognóstico na insuficiência cardíaca

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Oziel Marcio Araujo Tardin

2013-10-01

Full Text Available FUNDAMENTO: Estudos prévios avaliaram o papel do polimorfismo genético da enzima óxido nítrico-sintetase endotelial sobre o prognóstico na insuficiência cardíaca. Entretanto, faltam estudos relacionando o G894T e a insuficiência cardíaca na população brasileira. OBJETIVO: Avaliar a associação do G894T com o prognóstico de amostra de pacientes brasileiros com insuficiência cardíaca. MÉTODOS: Coorte com 145 pacientes com insuficiência cardíaca sistólica, num segmento de 40 meses (média = 22 meses, em dois hospitais universitários do Estado do Rio de Janeiro. Foi avaliada a relação do G894T com os desfechos: remodelamento reverso; melhora da classe funcional (NYHA; taxas de mortalidade e hospitalização. Os diâmetros do átrio e ventrículo esquerdos e a fração de ejeção do ventrículo esquerdo foram medidos na admissão e após 6 meses, para avaliação do remodelamento reverso. A melhora na classe funcional foi avaliada após 6 meses e as taxas de mortalidade e de hospitalização durante todo o seguimento. A raça foi autodeclarada. O polimorfismo G894T foi analisado por reação em cadeia de polimerase e por análise do polimorfismo dos fragmentos de restrição. RESULTADOS: A frequência genotípica foi GG (40%, GT (48,3% e TT (11,7%, e a frequência alélica foi guanina (64,1% e tiamina (35,8%. Não houve diferença entre as frequências genotípica ou alélica conforme a raça autodeclarada, tampouco conforme as características basais. Não houve relação entre o genótipo ou a frequência alélica e os desfechos analisados. CONCLUSÃO: Não se observou associação do polimorfismo G894T (Glu298Asp com o prognóstico de amostra de pacientes ambulatoriais brasileiros com insuficiência cardíaca sistólica.

Caracterización citogenética del tinajo o borugo Agouti taczanowskii de Colombia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Torres Olga María

2000-12-01

Full Text Available We describe the cytogenetics of the mountain paca, A. teczenowskii, which inhabits the mountains of Colombia. It was established that A. taczanowskií has a diploid number of 78 chromosomes with fairly large amounts of constitutive heterochromatin and remarkable C-band polymorphism. These results permit the differentiation of individuals and may shed light on the family status of the genus Agouti.Este trabajo presenta los cariotipos G, R Y C del tinajo o borugo A. taczanowskii que habita en los Andes de Colombia. A. taczanowskií posee 78 cromosomas, con una cantidad relativamente grande de heterocromatina constitutiva y un notable polimorfismo de bandas C, que permitió la identificación individual de los animales estudiados. Los resultados encontrados constituyen un punto de referencia importante para la taxonomía del género Agouti.

Variantes del Papilomavirus Humano 16 y su asociación con el HLA en cáncer cervical Variants of Human Papillomavirus 16 and its association with HLA in cervical cancer

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jehidys Montiel Ramos

2010-12-01

Full Text Available El cáncer cervical es el segundo cáncer más común en mujeres en el mundo y es el principal cáncer en mujeres en países en desarrollo. La infección persistente por los genotipos oncogénicos del Virus del Papiloma Humano (VPH es la causa necesaria para el desarrollo del cáncer cervical, siendo el VPH-16 el genotipo responsable del 50-60% de los casos. Las variantes No Europeas del VPH-16 han sido asociadas con infección persistente, lesiones de alto grado y cáncer. Los polimorfismos del Antígeno Leucocitario Humano (HLA están también asociados con la susceptibilidad al cáncer cervical y se ha postulado una relación entre variantes del VPH y ciertos alelos del HLA. La presente revisión hace referencia a la relación entre los polimorfismos de HLA y el desarrollo de cáncer cervical y la evidencia que documenta la interrelación de este factor con la variabilidad del VPH-16. Salud UIS 2010; 42: 272-280Cervical cancer is the second most common cancer in women worldwide and the most frequent cancer in women of the majority of developing countries. Persistent infection with Human Papillomavirus (HPV oncogenic types of HPV is necessary to develop cervical, cancer, with HPV-16 responsible for 50-60% of cases. Non-European variants of HPV-16 have been associated with persistant infection and high degree cervical cancer. Human Leucocyte Antigen (HLA polymorphisms are also associated with susceptibility to cervical cancer. It has been suggested relationship between HPV-16 variability and some HLA Alleles., This revision refers to the relation between HLA polymorphisms and cervical cancer development, and present evidence that may explain its relation with HPV-16 variability. Salud UIS 2010; 42: 272-280

Uncertainty and sensitivity analysis of control strategies using the benchmark simulation model No1 (BSM1).

Science.gov (United States)

Flores-Alsina, Xavier; Rodriguez-Roda, Ignasi; Sin, Gürkan; Gernaey, Krist V

2009-01-01

The objective of this paper is to perform an uncertainty and sensitivity analysis of the predictions of the Benchmark Simulation Model (BSM) No. 1, when comparing four activated sludge control strategies. The Monte Carlo simulation technique is used to evaluate the uncertainty in the BSM1 predictions, considering the ASM1 bio-kinetic parameters and influent fractions as input uncertainties while the Effluent Quality Index (EQI) and the Operating Cost Index (OCI) are focused on as model outputs. The resulting Monte Carlo simulations are presented using descriptive statistics indicating the degree of uncertainty in the predicted EQI and OCI. Next, the Standard Regression Coefficients (SRC) method is used for sensitivity analysis to identify which input parameters influence the uncertainty in the EQI predictions the most. The results show that control strategies including an ammonium (S(NH)) controller reduce uncertainty in both overall pollution removal and effluent total Kjeldahl nitrogen. Also, control strategies with an external carbon source reduce the effluent nitrate (S(NO)) uncertainty increasing both their economical cost and variability as a trade-off. Finally, the maximum specific autotrophic growth rate (micro(A)) causes most of the variance in the effluent for all the evaluated control strategies. The influence of denitrification related parameters, e.g. eta(g) (anoxic growth rate correction factor) and eta(h) (anoxic hydrolysis rate correction factor), becomes less important when a S(NO) controller manipulating an external carbon source addition is implemented.

Associação do polimorfismo do gene da enzima conversora da angiotensina com dados ecocardiográficos em jovens normotensos filhos de hipertensos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Franken Roberto Alexandre

2004-01-01

Full Text Available OBJETIVOS: Os autores objetivaram no presente estudo avaliar o polimorfismo da enzima conversora da angiotensina com dados do ecocardiograma de jovens estudantes de Medicina, filhos de hipertensos, comparados com jovens filhos de normotensos. MÉTODOS: Foram estudados 80 jovens normotensos divididos em dois grupos: 40 filhos normotensos de pais hipertensos e 40 filhos normotensos de pais hipertensos. Critérios de exclusão foram hipertensão arterial, fumo, obesidade, uso de contraceptivos orais. Uso crônico de medicamentos e presença de qualquer doença. Os alunos foram incluídos entre 1994 e 1996. Cinqüenta alunos foram submetidos a ecocardiograma transtoráxico. A análise estatística foi feita através do teste T de Student. A avaliação do polimorfismo do gene da enzima conversora da angiotensina foi feita nos 80 alunos conforme segue: 1 5 ml de sangue em tubo contendo EDTA, 2 extração do DNA, 3 medida da concentração do DNA por eletroforese, 4 reação em cadeia de polimerase com ''primer'' do gene da enzima conversora da angiotensina, 5 análise do polimorfismo do gene da enzima conversora da angiotensina através da eletroforese e 6 análise estatística através do teste do Qui-quadrado. RESULTADOS: O grupo de estudantes filhos de hipertensos mostraram maior espessura do septo interventricular (7,82mm+/-0,69 contra 7,38 +/- 0,8, p 7,82mm; DD 32%, DI 24%, II 20% contra septo 7,38mm: DD28%, DI12%, II 12%, contra septo 131,52g: DD 20,69% DI 13,79%, II 6,9% contra massa 117,11g: DD 30,43%, DI 8,7%, II 8,7% contra massa < 117,11g: DD 13,04%, DI 21,74%, II 17,39% (p=0,17 CONCLUSÃO: Encontramos diferenças entre a espessura do septo interventricular de estudantes normotensos filhos de hipertensos e filhos de normotensos. Por outro lado, não encontramos diferenças entre os grupos considerando o polimorfismo do gene da enzima de conversão da angiotensina, assim como qualquer relação do gene da enzima de conversão da

Relação entre polimorfismos de IL-8 e a gravidade da bronquiolite viral aguda

OpenAIRE

Leitão, Lidiane Alves de Azeredo

2013-01-01

Introdução : Até os 2 anos de idade, praticamente, todos os lactentes apresentam infecção por vírus sincicial respiratório (VSR). Entretanto, a gravidade da bronquiolite viral aguda (BVA) pode variar significativamente. Essa grande variação pode ser causada por fatores genéticos e imunológicos. Estudos prévios indicam que vias aéreas infectadas por VSR contêm níveis elevados de interleucina-8 (IL-8). O conhecimento de polimorfismos genéticos associados à BVA grave pode ter grande relevância c...

Adiposidade corporal, mas não resistência insulínica, associa-se ao polimorfismo -675 4G/5G no gene PAI-1 em uma amostra de crianças mexicanas

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Ulises de la Cruz-Mosso

2013-10-01

Full Text Available OBJETIVO: Elaboramos este estudo para avaliar se o polimorfismo -675 4G/5G no gene inibidor 1 do ativador do plasminogênio se associa à obesidade e à resistência insulínica em crianças mexicanas. MÉTODOS: Foi realizado um estudo transversal em 174 crianças, 89 delas com peso normal e 85 obesas, variando sua idade de 6 a 13 anos. Todas as crianças eram do estado de Guerrero e foram recrutadas de três escolas primárias na cidade de Chilpancingo, México. Os níveis de insulina foram determinados por prova imunoenzimática. Foi usado o modelo de avaliação da homeostase para determinar resistência insulínica. O polimorfismo -675 4G/5G no gene PAI-1 foi analisado pelo método reação de polimerase em cadeia-polimorfismo no comprimento dos fragmentos de restrição. RESULTADOS: A prevalência de resistência insulínica no grupo obeso foi mais alta (49,41% do que no grupo com peso normal (16,85%. O polimorfismo 4G/5G do PAI-1 foi encontrado em equilíbrio de Hardy Weinberg. O genótipo 4G/5G contribuiu para um aumento significativo da relação cintura-quadril (β = 0,02, p = 0,006, da circunferência da cintura (β = 4,42, p = 0,009 e da espessura da prega subescapular (β = 1,79, p = 0,04, mas não se relacionou com a resistência insulínica. CONCLUSÃO: O genótipo -675 4G/5G do gene PAI-1 se associou a aumento da adiposidade corporal em crianças mexicanas.

Análisis del polimorfismo del gen APOE en la población de Barranquilla, Colombia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Martha Ruiz

2016-03-01

Conclusiones. Las frecuencias alélicas ε3 y el genotipo ε3/ε3 encontrados en la población estudiada, fueron similares a lo informado por la literatura científica en países como Brasil, México y Colombia, y en algunos grupos étnicos amerindios colombianos. No se encontró el genotipo ε2/ε2, resultado que coincide con otras poblaciones estudiadas a nivel mundial. La frecuencia del alelo ε4 y sus genotipos asociados en esta población, podría estar relacionada con la presencia de enfermedades como la hipercolesterolemia, el infarto de miocardio y la enfermedad de Alzheimer.

BSM Higgs physics in the exclusive forward proton mode at the LHC

International Nuclear Information System (INIS)

Heinemeyer, S.; Khoze, V.A.; Tasevsky, M.; Weiglein, G.

2010-12-01

We investigate the prospects for Central Exclusive Diffractive (CED) production of BSM Higgs bosons at the LHC using forward proton detectors installed at 220 m and 420 m distance around ATLAS and/or CMS. We update a previous analysis for the MSSM taking into account improvements in the theoretical calculations and the most recent exclusion bounds from the Tevatron. We extend the MSSM analysis to new benchmark scenarios that are in agreement with the cold dark matter relic abundance and other precision measurements. We analyse the exclusive production of Higgs bosons in a model with a fourth generation of fermions. Finally, we comment on the determination of Higgs spin-parity and coupling structures at the LHC and show that the forward proton mode could provide crucial information on the CP properties of the Higgs bosons. (orig.)

BSM Higgs physics in the exclusive forward proton mode at the LHC

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Heinemeyer, S. [Instituto de Fisica de Cantabria (CSIC-UC), Santander (Spain); Khoze, V.A. [Durham Univ. (United Kingdom). IPPP; Manchester Univ. (United Kingdom). School of Physics and Astronomy; Ryskin, M.G. [Durham Univ. (United Kingdom). IPPP; Petersburg Nuclear Physics Institute, St. Petersburg (Russian Federation); Tasevsky, M. [Institute of Physics, Prague (Czech Republic); Weiglein, G. [Deutsches Elektronen-Synchrotron (DESY), Hamburg (Germany)

2010-12-15

We investigate the prospects for Central Exclusive Diffractive (CED) production of BSM Higgs bosons at the LHC using forward proton detectors installed at 220 m and 420 m distance around ATLAS and/or CMS. We update a previous analysis for the MSSM taking into account improvements in the theoretical calculations and the most recent exclusion bounds from the Tevatron. We extend the MSSM analysis to new benchmark scenarios that are in agreement with the cold dark matter relic abundance and other precision measurements. We analyse the exclusive production of Higgs bosons in a model with a fourth generation of fermions. Finally, we comment on the determination of Higgs spin-parity and coupling structures at the LHC and show that the forward proton mode could provide crucial information on the CP properties of the Higgs bosons. (orig.)

Análisis preliminar de la estructura primaria y secundaria del ARNtTrp en tortugas marinas

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Harvey Infante-Rojas

2015-06-01

Full Text Available Actualmente existen siete especies de tortugas marinas, todas amenazadas o en riesgo inminente de extinción. Los estudios con ADN mitocondrial han permitido hacer acercamientos sobre filogenia, evolución, rutas migratorias y centros de dispersión, además para la identificación de polimorfismos y haplotipos, siendo base para planes de manejo y conservación. El presente estudio representa la primera descripción comparada de la estructura primaria y secundaria del ARNtTrp mitocondrial en tortugas marinas. Se realizó un alineamiento múltiple de 26 secuencias del gen que codifica para el ARNtTrp y se propuso la estructura secundaria utilizando el programa ARWEN. Se identificaron potenciales interacciones terciarias por homología comparada con el ARNtTrp de mamíferos. Los resultados mostraron una secuencia consenso de 76 bases con siete regiones conservadas que representan el 76 % de la molécula. Se identificaron polimorfismos que representan tres haplotipos para C. caretta, dos para C. mydas y uno para cada una de las demás especies. Las estructuras secundarias mostraron cambios nucleotídicos puntuales para cada especie y también mostraron que el tallo aceptor, el brazo TψC y el bucle anticodón son motivos conservados en el ARNtTrp de las tortugas marinas. Se encontró un enlace no canónico tipo A-A en el tallo DHU que podría considerarse característico de tortugas marinas. Además, se obtuvo una estructura secundaria consenso en donde se identificaron las siete regiones conservadas, seis posibles interacciones terciarias y el bucle DHU como región variable.

Uso de la técnica SSCP para detectar mutaciones puntuales del ADN mitocondrial humano

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Alejandro Estrada-Cuzcano

2013-05-01

Full Text Available En el presente trabajo se evalúa la técnica de SSCP (polimorfismo de conformación de cadena individual de ADN para detectar mutaciones puntuales, tanto por su sensibilidad en la detección (alrededor 80% en condiciones ideales, como por su implementación fácil y económica. Se utilizaron como controles positivos y negativos, ADN de voluntarios caracterizados previamente para las mutaciones puntuales de 5 RFLPs mitocondriales. Para la optimización de la prueba fueron ensayadas concentraciones variables del tampón TBE (1X y 0,5X y del glicerol (10%, 5% y 0 en geles de poliacrilamida. Cuatro de los 5 RFLPs fueron detectados en las condiciones utilizadas y pueden ser usados en estudios de rutina sin usar enzimas de restricción. Además, la técnica SSCP permitió determinar mutaciones desconocidas en un segmento de 394 nucleótidos de la región hipervariable (HVI del ADNmt. Diferencias en correspondencia a los distintos haplotipos fueron detectados e incluso permitió discernir grupos dentro del mismo subtipo. La secuenciación de dos muestras del subtipo B1 con migración diferencial en SSCP, corroboró la existencia de siete nucleótidos distintos

CYP1A1, CYP2E1 Y RIESGO A CÁNCER GÁSTRICO EN UNA POBLACIÓN COLOMBIANA DE ALTA INCIDENCIA

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Eduardo Castaño

2009-09-01

Full Text Available El objetivo fue probar la hipótesis de que en casos y controles, de una población colombiana con alta incidencia de cáncer gástrico, muestran diferencias significativas entre las frecuencias de los polimorfismos genéticos CYP1A1-m2 y CYP2E1-c2; y a la vez, probar si hay diferencias entre el hábito del tabaquismo, el consumo de licor y el estrato socioeconómico; así como también sus posibles interacciones. Ochenta y siete pacientes afectados por cáncer gástrico e igual número de controles, del mismo grupo poblacional, genéticamente aislado, pertenecientes a la comunidad “paisa” del departamento de Caldas, fueron genotipíficados por medio de PCR-RFLPs para los polimorfismos CYP1A1-m2 y CYP2E1-c2. Además, se tuvo en cuenta las variables socioeconómicas y el estilo de vida, con respecto al tabaquismo y al consumo de alcohol. Los resultados encontrados sugieren que los portadores del polimorfismo CYP2E1-c2, asociado con mayor actividad metabólica, tienen mayor riesgo a desarrollar cáncer gástrico (OR=3.6, CI95% 1.6-8.1/p=0,002. En contraste, la frecuencia del polimorfismo CYP1A1*2A (MspI, también asociado con mayor actividad enzimática, mostró similar frecuencia entre los dos grupos. El tabaquismo y el estrato socioeconómico bajo, también mostraron diferencias significativas. En conclusión, se evidencia interacción significativa entre gen-ambiente, particularmente entre el tabaquismo y los alelos bioactiavantes CYP2E1- c2 y CYP1A1-m2, que pueden alterar la susceptibilidad a cáncer de estómago en esta región Andina del noroeste de Sur América.

Ontogenetic polychromatism in marsupial frogs (Anura: Hylidae Ontogenetic polychromatism in marsupial frogs (Anura: Hylidae

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Duellman William E.

1986-12-01

Full Text Available Color polymorphism is common in many species of marsupial frogs.  Extreme cases of pattern polymorphism are documented in four species. In Amphignathodon guentheri, Castrotheca aureomaculata, G. qriswoldi, and G. helenae juveniles are known to have only one color morph, where as two or more patterns exist in adults. In these species, polymorphism apparently develops ontogenetically. El polimorfismo cromático es común a algunas especies de sapos marsupiales. Casos extremos del modelo de polimorfismo son evidentes en cuatro especies Amphignathodon guentheri, Gastrotheca aureomaculata, G. griswoldi, y G. helenae. En estas especies, se sabe que los juveniles tienen sólo un morfo de color; el polimorfismo, al parecer, se desarrolla ontogenéticamente.

APROXIMACIÓN A LA ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DE LA DESMINA BOVINA Y DETERMINACIÓN DEL EFECTO DE MUTACIONES PUNTUALES IN-SILICO

Directory of Open Access Journals (Sweden)

J. D. Leal

2013-01-01

Full Text Available La desmina es el mayor filamento proteico intermedio del miocito y desempeña un papel importante respecto de las características de calidad cárnica, dada su función intracelular de sostén y que es sustrato de los principales sistemas proteolíticos post-mortem . En la determinación de los parámetros fisicoquímicos de dicha proteína y de su ARNm, se consideraron siete mutaciones (polimorfismos de nucleótido simple, SNP en bovino y cinco en porcino ubicadas en regiones exónicas. Mediante procedimientos computacionales se obtuvo un modelo tridimensional que incluyó desde el aminoácido 39 al 470 de la secuencia DAA32384.1. Se identificó que las mutaciones T49C y A45C del ARNm del bovino son responsables de una modificación en la estructura bidimensional del ARNm y de la disminución de su estabilidad in-silico , por lo que se les considera como las mutaciones más significativas para evaluar experimentalmente en bovinos.

Marcadores RAPD para la identificación del sexo en papaya (Carica papaya L. en Colombia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Chaves-Bedoya Giovanni

2009-08-01

Full Text Available

temprana. Un enfoque analítico en un estudio piloto

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Gloria Garavito

2013-01-01

Full Text Available Objetivos: Identificar biomarcadores de susceptibilidad para AIJ poliarticular y AR de instalación temprana por estudio del polimorfismos de MHC/HLA-DRB1* y PTPN22. Materiales y métodos: Se realizó un estudio de casos y controles con una relación 1:2. Todos los sujetos de investigación y los controles provinieron de una corta anidada perteneciente a un proyecto institucional; 30 pacientes con AIJ y 30 con AR de instalación temprana. Como controles se estudiaron 60 individuos sanos. El ADN se obtuvo por salt- ing out modificado. La tipificación de los alelos MHC/DRB1* se realizó por PCR-SSP y en el polimorfismo (C1858T del sistema PTPN22 se utilizó PCR-RTq. Resultados: Para AIJ Poliarticular, el alelo DRB1*0404 se asoció con susceptibilidad (OR=10.82; p<0.05, en el grupo con AR de instalación temprana, DRB1*0101 se mostró como marcador de susceptibilidad (OR=4.04; p<0.05. Se destaca que el alelo HLA- DRB1*0701 aparece como marcador protector para ambas patologías (OR=0,15; p<0,05. El polimorfismo del SNP (C1858T PTPN22 no se asoció con AIJ Poliarticular. En con- traste, en AR de instalación temprana, el Alelo CC se asoció con protección p<0.05. En el mismo grupo, CT/TT se mostró como un marcador de susceptibilidad <0.05. El análisis de la secuencia aminoacídica 70QRRAA74 del epítope compartido se asoció con susceptibili- dad para ambas entidades (p<0.05 y la secuencia 70DRRGQ74 con protección en ambos grupos de pacientes (p<0.05. Conclusión: Se destaca que en la asociación con la secuencia del epítope compartido, la ubicación del tipo de aminoácido y posición del mismo define probable asociación como marcador molecular de susceptibilidad en ambas entidades. Los polimorfismos comparti- dos sugieren un origen genético común para ambas entidades.

Secuencias repetidas en el genoma de Echinococcus granulosus : Su utilización para la detección del parásito y estudios de variabilidad genética

OpenAIRE

Rosenzvit, Mara Cecilia

2000-01-01

Para determinar las cepas del parásito existentes en nuestro país, se analizaron quistes hidatidicos provenientes de distintos huéspedes intermediarios y zonas geográficas, mediante el estudio de polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción de un gen nuclear y la secuenciación de dos genes mitocondriales. Se detectó la presencia de cuatro cepas: oveja, oveja de Tasmania, camello y cerdo, determinándose además que las tres primeras pueden infectar al hombre. Se realizaron experimentos...

Use of Several Thermal Analysis Techniques to Study the Cracking of a Nitrile Butadiene Rubber (NBR) Insulator on the Booster Separation Motor (BSM) of the Space Shuttle

Science.gov (United States)

Wingard, Charles D.

1999-01-01

Two different vendor rubber formulations have been used to produce the silica-filled NBR insulators for the BSM of each of the two Solid Rocket Boosters (SRBs) on the Space Shuttle. Each cured insulator is bonded to the BSM aluminum aft closure with an epoxy adhesive, and some of the curved areas in the rubber may have significant residual stresses. A number of recently bonded NBR insulators have shown fine surface cracks, and stressed insulator areas may be aging at a faster rate than unstressed areas, thus hastening the surface cracking. Thermal analysis data on both vendor insulators by Dynamic Mechanical Analysis (DMA) through a temperature/frequency sweep from 24 to 74 C have shown a higher flexural storage modulus and Arrhenius activation energy for the stressed area than for the unstressed area. Other thermal analysis techniques are being used to study the insulator surface vs. bulk interior for better understanding this anomaly.

Variants of mtDNA among islanders of the lake Titicaca: highest frequency of haplotype B1 and evidence of founder effect

OpenAIRE

Sandoval, José; Delgado, Bedsabé; Rivas, Luis; Bonilla, Bertha; Nugent, Daniel; Fujita, Ricardo

2004-01-01

Los polimorfismos del ADN mitocondrial son herramientas en el estudio comparativo de poblaciones modernas y antiguas. Entre los más usados están los haplotipos mitocondriales basados en RFLP (polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción) y un sistema de inserción /deleción. El presente estudio establece la frecuencia de estos haplotipos y compara un total de 144 individuos representativos de las islas Taquile y Amantaní (lengua quechua) y de las islas de Los Uros y Anapia (lengua aym...

BsmI, ApaI and TaqI Polymorphisms in the Vitamin D Receptor Gene (VDR and Association with Lumbar Spine Pathologies: An Italian Case-Control Study.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Alessandra Colombini

Full Text Available Three adjacent single nucleotide polymorphisms of the vitamin D receptor gene (VDR BsmI (rs1544410, ApaI (rs7975232, and TaqI (rs731236 are commonly studied in several pathologies. We aimed to evaluate the distribution of VDR BsmI, ApaI, and TaqI allele, genotype, and haplotype frequencies in an Italian cohort of 266 patients with lumbar spine disorders assessed by Magnetic Resonance Imaging and 252 asymptomatic controls. The exposure to putative risk factors was evaluated by a questionnaire. Polymorphisms were detected by PCR-RFLP and TaqMan® SNP Genotyping Assay. The results were statistically adjusted for the identified conventional risk factors. The three SNPs were in linkage disequilibrium. For all cases BbAaTT was a 3-fold risk factor OR = 3.38, whereas bbAATT (OR = 0.22, and bbaaTT (OR = 0.47 genotypes were found to be protective. Specifically, for patients affected by disc herniation only (n = 88 and all lumbar pathologies excluding stenosis and/or spondylolistesis (n = 215 B allele, Bb, Aa, and BbAaTT genotypes were risky, whereas b allele, bb, aa, and bbaaTT genotypes were protective. In patients affected by osteochondrosis with or without disc hernation (n = 50, T allele, Aa, and bbAaTT genotypes were risky, whereas t allele, AA, tt genotypes were protective. In patients affected by stenosis and/or spondylolistesis (n = 51 no significant associations were found. This is the first study showing an association of the three genetic VDR variants BsmI, ApaI, and TaqI and lumbar spine pathologies. Our study contributes to delineate genetic risk factors for specific subgroups of patients with lumbar spine pathologies highlighting the importance of haplotype analysis, and of detailed clinical evaluation of the patients for identification of genetic biomarkers.

Importância de polimorfismos de genes reguladores de citocinas em transplantes de células progenitoras hematopoiéticas Importance of regulatory cytokine gene polymorphisms in hematopoietic stem cell transplantation

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jeane Eliete Laguila Visentainer

2008-12-01

Full Text Available A compatibilidade genética HLA entre doador e receptor é um fator importante para o sucesso do transplante de células progenitoras hematopoiéticas (TCPH. No entanto, outros genes não-HLA estão sendo investigados em relação ao seu papel na incidência e gravidade da doença do enxerto contra o hospedeiro e na sobrevida, por modularem a intensidade da inflamação e os danos teciduais. Estes genes, não-HLA, incluem os genes de citocinas com polimorfismos dentro das seqüências 5' ou 3' regulatórias dos genes. Os polimorfismos ou microssatélites podem alterar a ligação dos fatores de transcrição aos sítios dentro dos genes promotores e a quantidade de citocina produzida. Este estudo revisa o papel potencial destes polimorfismos genéticos relativos às citocinas em prever o curso do TCPH.HLA genetic matching of donor and recipient is an important requirement for optimizing outcome following hematopoietic stem cell transplantation (HSCT. However, other non-HLA genes are being investigated for their role in graft-versus-host disease incidence and severity and in survival, by modulating the intensity of inflammation and tissue injury. These non-HLA-encoded genes include cytokine genes with polymorphisms within the 5' or 3' regulatory sequences of the genes. The polymorphisms or microsatellites may alter the transcription factor binding sites within the gene promoters and the amount of cytokine produced. This chapter summarizes the potential role of these genetic polymorphisms regarding the cytokines in predicting outcome of HSCT.

Marcadores moleculares asociados a la Capacidad de Retención de Agua (CRA) en carne de Bos indicus y sus cruces

OpenAIRE

Leal Gutiérrez, Joel David

2013-01-01

La Capacidad de Retención de Agua (CRA) es una de las características de la carne con mayor efecto sobre la rentabilidad del sector, al estar asociada a las mermas y a la jugosidad. Los objetivos principales son: resaltar la importancia de la CRA de la carne de bovino, evaluar el desempeño de estos parámetros según los factores tiempo de maduración y cruce de los animales y establecer polimorfismos en genes candidatos asociados al parámetro evaluado. Varios genes y sus polimorfismos han sido ...

Single nucleotide polymorphisms (SNPs at CDH1 promoter region in familial gastric cancer Polimorfismos de nucleótido único (SNPs en la región promotora CDH1 en cáncer gástrico familiar

Directory of Open Access Journals (Sweden)

A. Ramos-de la Medina

2006-01-01

Full Text Available Introduction: gastric cancer is the most frequent gastrointestinal malignancy in Mexico and the proportion of patients younger than 40 years is one of the highest reported in the world literature. Recently several families with familial diffuse gastric cancer have been identified at the National Institute of Medical Sciences and Nutrition. Germline mutations in the E-cadherin gene (CHD1 have been described that result in the development of diffuse hereditary gastric cancer in young patients. Methods: the complete coding sequence at exons 1 to 16 and the promoter region of CDH1 was amplified by polymerase chain reaction in peripheral blood samples of two patients with early onset familial diffuse gastric cancer. Results: no germline inactivating mutations of CHD1 were found on either patient. Single nucleotide polymorphisms -160 C→A were detected in the promoter region of CDH1 in both patients. Conclusions: the polymorphism -160 C→A theoretically confers an increased risk of developing diffuse gastric cancer. The relatives of these patients may an increased risk of gastric cancer among other tumors. There is presently not enough evidence to consider the -160 C→A polymorphism an etiologic factor of diffuse gastric cancer in these patients since the frequency and type of genetic alterations of CDH1 are largely unknown in the Mexican population. It will be necessary to conduct epidemiologic studies in the Mexican population to determine the influence that genetic alterations have on the genesis of diffuse gastric carcinoma.Introducción: el cáncer gástrico es la neoplasia más frecuente del tracto gastrointestinal en México y la proporción de pacientes menores de 40 años es una de las más altas reportadas en la literatura mundial. Recientemente se han identificado en el Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición varias familias con cáncer gástrico difuso familiar. Múltiples mutaciones germinales del gene de E-cadherina (CHD1

BÚSQUEDA DE LA MUTACIÓN Phe-809 EN EL GEN DEL SUSTRATO DEL RECEPTOR DE INSULINA -1 (IRS-1 EN RATAS DIABÉTICAS eSS

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Stella Maris Daniele

2010-01-01

Full Text Available El gen del sustrato del receptor de insulina IRS-1 juega un rol clave en la transducción de señales de insulina en músculo esquelético. Diversos polimorfismos del gen IRS-1 han sido reportados en estados de insulinorresistencia como obesidad y diabetes tipo 2.Las ratas eSS desarrollan espontáneamente diabetes tipo 2 magra, con insulinoresistencia caracterizada por hiperglucemia e hiperinsulinemia. Durante el segundo año existe disminución progresiva de la insulinemia y agravamiento del síndrome. Nuestro propósito fue buscar la mutación Phe-809 en el gen IRS-1, que implica sustitución del aminoácido Ser por Phe en el codon 809; dicho sitio se halla conservado en la rata. Esta variante fue identificada en pacientes diabéticos tipo 2. El gen del IRS-1 consta de un solo exón.Se analizó un fragmento de 281pb del gen IRS-1, que posee 90% de homología con el mismo fragmento en humanos. Se purificó ADN de leucocitos de un pool de sangre de ratas machos eSS y controles Wistar. Se cuantificó y amplificó por PCR utilizando un par de primers para amplificar ese mismo fragmento en el gen IRS-1 en humanos. Se usó sangre humana como control de amplificación. Se empleó el método de Sanger en la secuenciación del fragmento obtenido por PCR, previa extracción del mismo de un gel de agarosa al 2%. Se observó que la rata eSS y las controles mantuvieron la lectura esperada para ese fragmento, no encontrándose la mutación investigada. Se descarta la mutación Phe-809 como origen de la insulinoresistencia de la rata eSS.

Mortalidad por defectos del tubo neural en México, 1980-1997

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Ramírez-Espitia José A

2003-01-01

Full Text Available OBJETIVO: Describir la mortalidad en México por defectos del tubo neural, durante el periodo 1980-1997. MATERIAL Y MÉTODOS: Las tasas anuales de mortalidad estatales y nacionales, por defectos del tubo neural, se calcularon por 10 000 nacidos vivos. La tendencia temporal fue evaluada por el porcentaje de cambio anual obtenido mediante un modelo de regresión de Poisson. Se calculó la razón de mortalidad, tomando la media nacional como referencia. Las tasas y las razones se representaron gráficamente en mapas. RESULTADOS: Durante el periodo la tasa bruta de mortalidad por defectos del tubo neural fue de 5.8 por 10 000 nacidos vivos. La anencefalia fue el tipo de defecto más frecuente (37.7%, seguida de la espina bífida sin hidrocefalia (31.6%. La tendencia nacional de la mortalidad por defectos del tubo neural fue ascendente entre 1980 y 1990 (porcentaje de cambio anual 7.5 IC 95% 6.5, 8.6 y descendente entre 1990-1997 (porcentaje de cambio anual -2.3 IC 95% -3.6, -0.9. CONCLUSIONES: Las altas tasas de mortalidad por defectos del tubo neural fueron debidas principalmente a la elevada frecuencia de las anencefalias. El incremento observado parece no ser sólo atribuible a cuestiones puramente diagnósticas o de mejora en los registros. La influencia de factores asociados a estos defectos, como determinados polimorfismos genéticos, la deficiencia de ácido fólico, la obesidad materna, la exposición laboral a plaguicidas y la pobreza deberán evaluarse mediante estudios específicos.

Extending the BSM platform with occurrence, transport and fate of micro-pollutants using the ASM-X framework

DEFF Research Database (Denmark)

Flores-Alsina, Xavier; Plósz, Benedek; Lindblom, Erik

The objective of this paper is to demonstrate how occurrence, transport and fate of trace chemicals can be assessed when modelling wastewater treatment plants (WWTP). A modified version of the International Water Association (IWA) Benchmark Simulation Model No 1 (BSM1) used to evaluate control......) is modelled using an influent generator. Administration patterns, bioavailability and body residence time are the basis to generate the user-defined profiles that will describe SMX daily variation patterns in the raw wastewater. Additional simulations also show that transport conditions such as sewer length...... is complemented with: i) a critical discussion of the presented results; ii) a thorough analysis of the limitations of the proposed approach; and, iii) future pathways to improve the overall modelling of trace chemicals....

Associação de níveis plasmáticos de PAI-1 e polimorfismo 4G/5G em pacientes com doença arterial coronariana

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Luciana Moreira Lima

2011-12-01

Full Text Available FUNDAMENTO: O polimorfismo 4G/5G do inibidor ativador do plasminogênio tipo 1 (PAI-1 pode influenciar a expressão do PAI-1. Níveis plasmáticos elevados de PAI-1 estão associados com Doença Arterial Coronariana (DAC. OBJETIVO: O presente estudo investigou a influência do polimorfismo 4G/5G do PAI-1 nos níveis plasmáticos de PAI-1 e sua associação com DAC avaliada por angiografia coronária. MÉTODOS: Foi avaliada amostra de sangue de 35 indivíduos com artérias coronárias angiograficamente normais, 31 indivíduos apresentando ateromatose leve/moderada, 57 indivíduos apresentando ateromatose grave e 38 indivíduos saudáveis (controles. Em pacientes e controles, o polimorfismo 4G/5G do PAI-1 foi determinado por amplificação da proteína-C reativa utilizando primers específicos de alelo. Os níveis plasmáticos de PAI-1 foram quantificados pelo ensaio ELISA (American Diagnostica. RESULTADOS: Não houve diferença entre os grupos quanto a sexo, idade e índice de massa corporal. Níveis plasmáticos de PAI-1 e frequência do genótipo 4G/4G mostravam-se significativamente maiores no grupo com ateromatose grave em comparação com os outros grupos (p 70% (p < 0,001. CONCLUSÃO: O achado mais importante deste estudo foi a associação entre o genótipo 4G/4G, elevados níveis plasmáticos de PAI-1 e estenose coronariana superior a 70% em indivíduos brasileiros. Ainda não foi estabelecido se elevados níveis plasmáticos de PAI-1 são um fator decisivo para o agravamento da aterosclerose ou se são uma consequência.

Polimorfismo de liposomas

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Araceli Arteaga Jiménez

2015-06-01

Full Text Available Revisamos las teorías actuales que explican los cambios de forma de liposomas. Incluimos resultados experimentales de Microscopía Óptica (MO, Contraste de Interferencia Diferencial (DIC y Microscopía Electrónica de Criofractura (TEM que muestran la variedad de formas y tamaños de liposomas obtenidos por el método de hidratación. Presentamos una explicación sencilla del posible mecanismo de formación de liposomas helicoidales y la necesidad de formular una teoría basada en Termodinámica de No Equilibrio para entender los cambios de topología de estas fascinantes estructuras

Efecto de las alteraciones genéticas, epigenéticas y expresión transcripcional de cadherina-E en la susceptibilidad al cáncer de mama

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Andrés Felipe Aristizábal-Pachón

2016-12-01

Full Text Available Introducción. La cadherina-E (CDH1 cumple un papel importante en la transición epitelio-mesénquima y está relacionada con la invasión y metástasis en varios tipos de carcinomas. Sin embargo, el efecto de mutaciones y epimutaciones germinales en la susceptibilidad al cáncer de mama no es claro. Objetivo. Evaluar el polimorfismo rs5030625, cambios en el patrón de metilación del promotor y expresión transcripcional de CDH1 en pacientes con cáncer de mama. Materiales y métodos. Fueron colectadas muestras de sangre periférica de 102 pacientes con cáncer de mama y 102 mujeres control. La genotipificación del polimorfismo rs5030625 fue realizado a través de PCR-RFLP; la PCR y el análisis de disociación de alta resolución sensibles a metilación fueron usadas para determinar el estatus y semicuantificar el nivel de metilación del promotor de CDH1; finalmente, la RT-qPCR permitió evaluar el nivel de expresión transcripcional de CDH1. Resultados. Los resultados no mostraron asociación entre el polimorfismo rs5030625 y el cáncer de mama. Se encontraron perfiles aberrantes de metilación del promotor de CDH1, en las pacientes con cáncer de mama, relacionados con las primeras etapas de desarrollo del cáncer. La disminución de la expresión de CDH1 fue asociada con la presencia de metástasis y el estatus metilado del promotor. Conclusión. Alteraciones en CDH1 fueron relacionadas con invasión y metástasis en cáncer de mama, proporcionando evidencia adicional de la relevancia de CDH1 en el desarrollo y progresión del cáncer de mama.

Polimorfismos genéticos e desempenho físico em jogadores de futebol das categorias de base do São Paulo Futebol Clube

OpenAIRE

Thiago José Dionísio

2014-01-01

Há relatos na literatura de que os polimorfismos genéticos podem determinar importantes modulações nos fenótipos dos atletas, como por exemplo, estatura, adaptações cardiovasculares, utilização dos substratos energéticos bem como balanço eletrolítico e hormonal. É possível que indivíduos que expressem o gene alfa actinina 3 (ACTN3; genótipos RR para homozigotos ancestrais ou RX para heterozigotos) possam apresentar vantagens em movimentos que exijam força e rápida contração muscular quando co...

Influencia de polimorfismos genéticos, variables analíticas y ambientales en las concentraciones valle de terapia anti-TNF de pacientes con enfermedad inflamatoria intestinal

OpenAIRE

Romero Cara, Patricia

2015-01-01

OBJETIVOS La terapia anti-TNF-alfa está indicada en el tratamiento de las enfermedades inflamatorias crónicas. Cuando la respuesta es inadecuada se recomienda la intensificación de la dosis. Sin embargo, ni las razones para esta recomendación, ni los múltiples mecanismos implicados son bien conocidos. Nuestro objetivo principal es investigar si polimorfismos en los genes FCGRT, FCGR2A y FCGR3A (relacionados con el metabolismo y eliminación de inmunoglobulinas) ejercen una influencia en la ...

Novos polimorfismos no gene da obesidade em raças divergentes de suínos Polymorphisms in the leptin gene in divergent swine breeds

Directory of Open Access Journals (Sweden)

M.A.M. Soares

2006-06-01

Full Text Available Investigou-se a existência de polimorfismo no gene da leptina (gene da obesidade entre varrões da raça nativa Piau (porco tipo banha e matrizes mestiças de raças comerciais (Landrace/Large White e Landrace/Large White com Pietrain, selecionadas para peso e precocidade. Oito pares de primers foram desenhados a partir da seqüência disponível no GenBank (U66254, usada, neste trabalho, como seqüência de referência. Amostras de DNA foram extraídas de células sangüíneas brancas utilizando-se solução de fenol:clorofórmio, após tratamento com proteinase K. Os fragmentos gerados por amplificação da reação em cadeia da polimerase foram purificados e seqüenciados em seqüenciador automático. As seqüências de nucleotídeos, obtidas a partir do DNA das raças comerciais de suíno, apresentaram maior similaridade com a seqüência de referência, e as seqüências geradas a partir do DNA dos animais nativos divergiram de ambas em algumas posições. Dos 28 polimorfismos encontrados, oito foram observados em apenas uma das três seqüências geradas a partir do DNA das raças nativas. Doze estavam presentes em duas seqüências, e os oito polimorfismos restantes foram encontrados nos três animais nativos.Leptin gene (obese gene polymorphism was investigated in Piau boars (a fat, native breed and sows from commercial strains (Landrace/Large White and Landrace/Large White by Pietrain chosen for rapid growth and early sexual maturity. Eight pairs of primers designed using the sequence available from GenBank (access nº U66254 were identified as the reference sequence in this project. DNA samples were extracted from white blood cells using phenol:chloroform solution, after treatment with proteinase K. Fragments generated by amplification of the Polymerase Chain Reaction were purified and sequenced in an automatic sequencer. Nucleotide sequences obtained from DNA of commercial swine breeds were similar to the reference sequence; whereas

Polimorfismos genéticos asociados a pre-eclampsia

OpenAIRE

Baquero Mejía, Ingrid Carolina

2013-01-01

RESUMEN: La pre-eclampsia es un trastorno multisistémico del embarazo y del puerperio, que complica aproximadamente del 6 al 8% de todos los embarazos en los países desarrollados. Es considerada un problema de salud pública debido a su alta prevalencia. Es una de las causas más frecuentes de mortalidad materno-fetal en países en desarrollo, igualmente es causa de preocupación en los países desarrollados por su gran relación causal con el retraso de crecimiento intrauterino y partos prematuro...

Association between the SLC6A3 A1343G polymorphism and schizophrenia Associação entre o polimorfismo A1343G do SLC6A3 e esquizofrenia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Quirino Cordeiro

2010-10-01

Full Text Available Epidemiological studies have demonstrated that the genetic component is an important risk factor for the development of schizophrenia. The genes that codify the different compounds of the dopaminergic system have created interest for molecular investigations in patients with schizophrenia because the antipsychotic drugs, especially those of first generation, act on this cerebral system. Thus the aim of the present study was to investigate the possible association between a new single nucleotide polymorphism (rs6347 located in exon 9 of the protein transporter (SLC6A3 and schizophrenia. The distribution of the alleles and genotypes of the studied polymorphism was investigated in a sample of 235 patients and 834 controls matched by gender and age. There were statistical differences in the allelic (χ2=5.97, 1d.f. , p=0.01, OR=1.33-1.05Estudos epidemiológicos têm demonstrado que o componente genético é um importante fator de risco para a esquizofrenia. Os genes que codificam os diferentes componentes do sistema dopaminérgico passaram a despertar interesse para estudos moleculares em pacientes com esquizofrenia, pois os antipsicóticos, em especial os de primeira geração, exercem sua ação nesse sistema. Assim, o objetivo do presente estudo foi investigar a associação entre um novo polimorfismo de nucleotídeo único (rs6347 localizado no exon 9 do gene do transportador de dopamina (SLC6A3 e esquizofrenia. Um total de 235 pacientes e 834 controles pareados para sexo e idade foi selecionado para a investigação da distribuição dos alelos e genótipos do polimorfismo investigado entre os grupos de pacientes e controles. Houve diferenças estatisticamente significantes nas distribuições alélicas (χ2=5,97, 1d.f. , p=0,01, OR=1,33-1,05polimorfismo SLC6A3 A1343G mostrou associação com esquizofrenia na amostra estudada.

Polymorphism of the grasshopper Rhammatocerus schistocercoides populations revealed by RAPD Polimorfismo em populações do gafanhoto Rhammatocerus schistocercoides revelado por marcadores RAPD

Directory of Open Access Journals (Sweden)

João Batista Tavares da Silva

2002-11-01

Full Text Available The objective of this work was to study the genetic variability of the grasshopper Rhammatocerus schistocercoides (Orthoptera: Acrididae using RAPD analysis among individuals from three populations, one from Colombia and two from Brazil (Goiás and Mato Grosso States. Ninety scorable binary markers were obtained by fingerprinting with 11 oligonucleotide primers. Most of the polymorphism was attributed to 42 markers with variable frequency among the different populations. Although the existence of significant difference among populations (PO objetivo deste trabalho foi estudar a variabilidade genética do gafanhoto Rhammatocerus schistocercoides (Orthoptera: Acrididae por meio da análise de RAPD entre indivíduos de três populações, uma da Colômbia e duas do Brasil (Goiás e Mato Grosso. Noventa marcadores binários foram selecionados através de análise de polimorfismo com o uso de 11 oligonucleotídeos. A maior parte do polimorfismo observado foi atribuída a 42 marcadores com freqüência variável entre as diferentes populações. Apesar da existência de diferença significativa interpopulacional (P<0,0001, grande proporção da variabilidade genética foi detectada dentro das populações (87,7% da variação total. As distâncias entre as populações colombianas e brasileiras foram 0,12 (P<0,0001 e 0,18 (P<0,0001 para Goiás e Mato Grosso, respectivamente. A distância obtida entre Goiás e Mato Grosso foi 0,06 (P<0,0001. Estes dados indicam que as diferenças fenotípicas entre populações estão associadas principalmente às distâncias geográficas entre as populações do Brasil e a da Colômbia.

Brain-derived neurotrophic factor gene val66met polymorphism and executive functioning in patients with bipolar disorder Polimorfismo do gene do fator neurotrófico derivado do cérebro val66met e função executiva em pacientes com transtorno bipolar

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Juliana Fernandes Tramontina

2009-06-01

Full Text Available OBJECTIVE: In the present study, we investigate the association between the val66met polymorphism of the brain-derived neurotrophic factor (BNDF and the performance on the Wisconsin Card Sorting Test in a sample of Caucasian Brazilian patients with bipolar disorder. METHOD: Sixty-four patients with bipolar disorder were assessed and their performance on the Wisconsin Card Sorting Test was compared with the allele frequency and genotype of the val66met polymorphism of the brain-derived neurotrophic factor. RESULTS: The percentage of non-perseverative errors was significantly higher among patients with the val/val genotype. There was no association between (BNDF genotype frequency and other Wisconsin Card Sorting Test domains. CONCLUSION: Our results did not replicate previous descriptions of an association between a worse cognitive performance and the presence of the met allele of the val66met brain-derived neurotrophic factor gene polymorphism.OBJETIVO: O presente estudo tem por objetivo investigar a associação entre o polimorfismo val66met do gene do fator neurotrófico derivado do cérebro (BDNF e o desempenho cognitivo no Teste Wisconsin de Classificação de Cartas em uma amostra de pacientes bipolares brasileiros caucasianos. MÉTODO: Sessenta e quatro pacientes com transtorno bipolar foram avaliados em relação a sua cognição por meio do Teste Wisconsin de Classificação de Cartas que foi comparada com a freqüência alélica e genotípica do polimorfismo val66met do gene do fator neurotrófico derivado do cérebro. RESULTADOS: O percentual de erros não-perseverativos foi significativamente maior nos indivíduos com genótipo val/val. Não foi encontrada diferença significativa entre a freqüência genotípica do polimorfismo do BDNF e os outros domínios do Teste Wisconsin de Classificação de Cartas. CONCLUSÃO: O estudo do polimorfismo val66met em relação ao desempenho executivo em pacientes bipolares caucasianos de uma

Caracterización de Staphylococcus Aureus aislados del personal de salud de un hospital de mediana complejidad de la ciudad de Cali en el año 2012

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Mónica Chávez

2014-04-01

Full Text Available Introducción. Los estudios de Staphylococcus aureus en personal de salud permiten reducir su diseminación en las infecciones intrahospitalarias y mejorar la calidad de vida de los pacientes. La colonización por S. aureus en personal de salud de un hospital de tercer nivel, se evaluó caracterizándolo fenotípica y molecularmente. Métodos: Una población de 62 trabajadores y 216 estudiantes de medicina, mediante análisis del antibiograma y polimorfismo del gen agr. Resultados: S. aureus colonizó el 30,1% del personal; 17,5% trabajadores, 33,8% estudiantes. El 10,8% fueron meticilino-resistentes, 9 aislados presentaron el gen mecA, ocho resistentes a oxacilina y cefoxitina (88,9% de sensibilidad. La variante II considerada de origen hospitalario, se presentó en el 7,7% de aislados, el agr tipo III de origen comunitario en el 27,6% de aislados meticilino-sensibles. Conclusión. El personal hospitalario presentó colonización por S. aureus de origen hospitalario y comunitario. Es necesario adoptar medidas profilácticas e higiénicas para evitar diseminación y prevenir infecciones.

Optimization of biosurfactant production from Vibrio sp. BSM-30 isolated in tropical waters

Science.gov (United States)

Su, Zengjian; Li, Min; Zhang, Yuxiu

2017-01-01

The strain BSM-30 (Vibrio sp.), isolated from Chinese tropical waters, could be a biosurfactant producing bacteria according with results obtained by the oil spreading method. The culture conditions for biosurfactant production were tested respectively such as inoculation (2%,6%,10%,14% as setting), shaking speed(120 r/min,150 r/min,180 r/min as setting), temperature (25°C,30°C,35°C as setting), pH (7,8,9 as setting), salinity (1.5%, 2.5%, 3.0%, 4.5%, 5.5% as setting), which results showed that the best culture conditions for BS production were 10% inoculation quantity, 180 r/min, 25°C, pH 8, and 3.5% salinity. The optimization of carbon sources (20g/ of glucose, 20g/L of starch, 20g/L of paraffin oil 20g/L of diesel, 20g/L of oil as setting) and nitrogen sources (6g/L of NaNO3,7.1g/L of KNO3,5.6g/L of NH4NO3,9.3g/L of (NH4)2SO4, 4.2g/L of CO(NH2)2 as setting) were also tested, which results showed that the best nitrogen source and carbon source were (NH4) 2SO4 and soluble starch.

Análisis de la diversidad genética de 21 aislamientos del hongo Moniliophthora roreri basado en marcadores RAPD

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Boris Gutarra Castillo

2013-12-01

Full Text Available Objetivos: Estudiar la diversidad genética de 21 aislamientos del hongo que afecta al cultivo del cacao, Moniliophthora roreri, en tres zonas cacaoteras del Perú (Tocache, Mariscal Cáceres y Leoncio Prado. Métodos: Se utilizó 14 iniciadores RAPD (random amplified polymorphic DNA polimórficos y una pareja de oligonucleótidos, los que fueron empleados bajo condiciones de amplificación estandarizadas. Con los datos obtenidos se construyó un dendograma utilizando el coeficiente de Jaccard y el algoritmo UPGMA (Unweighted Pair-Group Method using Arithmetic Average. La estructura genética fue estimada en función del análisis molecular de variancia (AMOVA y la diversidad mediante los índices de Shannon y Nei. Resultados: Fueron conseguidas 59 bandas RAPD con un 73% de polimorfismo. El dendograma obtenido a un índice de similitud de 0,70, claramente dividió los individuos en tres grupos. El análisis de la diversidad genética mostró altos valores en las zonas estudiadas de acuerdo con el índice de Shannon (0,3936 y de Nei (0,2622, con mayor riqueza en Leoncio Prado. Estas zonas presentan alta variabilidad, y según el AMOVA realizado: 88% entre accesiones por zona y solo 12% entre zonas. Conclusiones: Existe más de un grupo genético de Moniliophthora roreri en la Amazonía del Perú. Estos grupos, provenientes del Ecuador, pudieron haber ingresado por el intercambio de semillas y/o de forma natural por medio de los ríos en común y estarían originando nuevos grupos genéticos locales.

Associação dos polimorfismos dos genes da óxido nítrico sintase e metaloproteinases da matriz extracelular com a pré-eclâmpsia

OpenAIRE

Daniela Pinheiro Leonardo

2015-01-01

Resumo: A pré-eclâmpsia é uma das principais causas de morbidade e mortalidade materna e neonatal no mundo, porém a sua fisiopatologia ainda não foi totalmente elucidada, sendo considerada uma síndrome com acometimento multisistêmico e etiologia multifatorial. O fator genético tem sido bastante estudado, com associação dos polimorfismos de nucleotídeo único em genes que codificam óxido nítrico sintase e metaloproteases de matriz com pré-eclâmpsia, porém os resultados foram inconclusivos em di...

Efecto de los suplementos de calcio, vitamina D e isoflavonas sobre marcadores del remodelado óseo en mujeres postmenopaúsicas recientes: papel de polimorfismos del receptor de vitamina D

OpenAIRE

Pérez Alonso, María

2016-01-01

La osteoporosis es una enfermedad de elevada prevalencia, morbimortalidad y alto coste económica que se hace clínicamente evidente cuando aparecen las fracturas características. La vitamina D juega un importante papel en el mantenimiento de la integridad del esqueleto y de la resistencia ósea, principal determinante de la aparición de fracturas. Pot otra parte la incidencia de la hipovitaminosis D es muy frecuente con hiperparatiroidismo secundario asociado y aumento del remodelado óseo Ob...

Association between IGF-IR gene polymorphisms and productive and reproductive traits in Holstein cows Associação entre polimorfismos do gene IGF-IR e características produtivas e reprodutivas em fêmeas bovinas da raça Holandesa

Directory of Open Access Journals (Sweden)

W. Schoenau

2005-12-01

Full Text Available The association between single-strand conformation polymorphism (SSCP in the gene of insulin-like growth factor-I receptor (IGF-IR and age at first calving (AFC, calving interval (CI, lactation length (LL, and milk yield (MY was studied using 106 graded Holstein females. The polimerase chain reaction (PCR with specific initiating oligonucleotides, resulted an amplified fragment of 335pb. The population genotypes frequencies were 82.1% and 17.9%, for AA and AB genotypes, respectively. The frequency of A allele was 0.91 and 0.09 of B allele. No association between the identified polymorphism and AFC, CI, and MY was observed. The LL was positively associated (PEstudou-se a associação entre polimorfismos de conformação de fita simples (SSCP no gene do receptor do fator-I de crescimento semelhante à insulina (IGF-IR e idade ao primeiro parto (IPP, intervalo entre partos (IEP, duração da lactação (DL e produção de leite (PL, em 106 fêmeas puras por cruza da raça Holandesa. A reação em cadeia da polimerase (PCR com oligonucleotídeos iniciadores específicos gerou um fragmento de 335pb. A freqüência genotípica da população para o polimorfismo foi 82,1% de indivíduos homozigotos para o alelo A e 17,9% de heterozigotos (AB. A freqüência do alelo A foi 0,91 e a do alelo B, 0,09. Não foi encontrada associação entre o polimorfismo estudado e as características IPP, IEP e PL. A característica DL foi positivamente associada (P<0,05 à ausência do alelo B. A lactação dos animais portadores do genótipo AA foi mais longa.

Aplicaciones de la genética molecular en la practica forense

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Oscar F. Ramos M.

1993-10-01

Full Text Available Desde el desarrollo de las huellas digitales a finales del siglo XIX, la tipificación del ADN por VNTR, representa la innovación más poderosa que se haya desarrollado en las ciencias forenses durante el siglo XX. Con el descubrimiento en 1980 del polimorfismo del ADN en el genoma humano y con la subsecuente demostración de que tal hipervariabilidad esta ampliamente distribuida en los humanos, las ciencias forenses han reconocido el enorme potencial que ofrece la tipificación del ADN para la identificación de un individuo a partir de una muestra biológica dejada en la escena del crimen. La utilidad de la tipificación del ADN como herramienta forense recae no solo en su alto poder de discriminación entre los individuos de una población, sino también porque se pueden utilizar muchos materiales de origen biológico, en diferentes circunstancias, que de otra manera serian inútiles en las pruebas de tipificación tradicional. El debate actual sobre las pruebas de ADN pone de relieve la necesidad de imponer un mayor rigor ante las dificultades que aparecen cuando una tecnología científica bastante compleja se introduce como prueba ante un tribunal de justicia. Se discuten las ventajas y limitaciones sobre el uso del polimorfismo del ADN en la medicina forense. En Colombia se deben establecer criterios nacionales para que las pruebas forenses del ADN sirvan a los intereses de la justicia, bien sea para identificar a un criminal o para absolver a un inocente.

Genética molecular de caracteres cuantitativos en cruzamientos dialélicos de tomate

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Guillermo Raúl Pratta

2011-05-01

Full Text Available El objetivo de este trabajo fue evaluar marcadores moleculares y caracteres cuantitativos en un cruzamiento dialélico completo sin recíprocos, entre cinco líneas recombinantes de tomate y sus híbridos. Se obtuvieron perfiles de AFLP ("amplified fragment length polymorphism" y de polipéptidos del pericarpio en cuatro estados de madurez del fruto de 15 genotipos. Se evaluaron, entre otros: peso, acidez titulable, pH, vida poscosecha y firmeza. Se calculó el porcentaje de polimorfismo para los marcadores moleculares y el porcentaje de variabilidad genética para los caracteres cuantitativos en el grupo de líneas recombinantes, el de híbridos y el conjunto de genotipos. Se realizaron análisis de agrupamiento con cada nivel de variación genética. Para AFLP, el porcentaje de polimorfismo varió entre 34 y 54% y, para los perfiles polipeptídicos, entre 40 y 78%. Mayor polimorfismo fue observado en el grupo de híbridos. La variabilidad genética fue de 100% para acidez y 34% para firmeza, con los mayores valores en los parentales. La similitud genética varió entre los genotipos según el nivel de variación genética; pero la consistencia en el agrupamiento de algunas líneas recombinantes y sus híbridos fue conservada, lo que evidenció asociaciones entre los datos moleculares y fenotípicos.

LSSP-PCR para la identificación de polimorfismos en el gen cry1B en cepas nativas de Bacillus thuringiensis

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Martha Ilce Orozco Mera

2012-01-01

Full Text Available Título en ingles: LSSP-PCR to identify polymorphisms in the gene cry1B of Bacillus thuringiensis native strain Resumen: Se estandarizó la técnica LSSP-PCR (reacción en cadena de la polimerasa con un único oligonucleótido en condiciones de baja astringencia, para identificar polimorfismos del gen cry1B en aislamientos nativos de Bacillus thuringiensis (Bt. Se evaluaron 164 aislamientos nativos colombianos identificándose el gen cry1Ba en 11 de estos aislamientos. Los 11 fragmentos amplificados, junto con el de la cepa de referencia Bt subsp. aizawai HD137, se analizaron por LSSP-PCR y los patrones electroforéticos obtenidos se compararon cualitativamente. Con los productos amplificados mediante el oligonucleótido directo se construyó un dendrograma utilizando UPGMA que  mostró tres agrupamientos con similitud de 83, 79 y 68%. La agrupación con 68% de similaridad correspondió al aislamiento nativo BtGC120 que presentó el patrón de bandas más variable. Con el oligonucleótido reverso el aislamiento BtGC120 mostró una menor variabilidad (43%. La secuencia nucleotidica obtenida de este fragmento de 806 pares de bases mostró una identidad de 93% con la secuencia de los genes cry1Bc1 de Bt morrisoni y cry1Bb1 de la cepa BT-EG5847. Se predijo del marco de lectura +3 una proteína de 268 residuos aminoácidicos, con 88% de identidad con la proteína Cry1Bc. Esta  secuencia reveló dos dominios, una endotoxina N implicada en la formación del poro y otra endotoxina M relacionada en el reconocimiento del receptor. La evaluación biológica del aislamiento BtGC120 sobre larvas de primer instar del insecto plaga Spodoptera frugiperda, mostró una CL50 de 1,896 ng de proteína total por cm2. Este estudio muestra que la LSSP-PCR es una técnica que permite identificar de una manera específica variaciones en las secuencias de los genes cry de Bt, con potencialidad de encontrar nuevos genes con novedosas actividades biológicas. Abstract

Polimorfismo R577X del gen ACTN3 en nadadores de velocidad, medio fondo y fondo y su relación con el rendimiento

OpenAIRE

Calle Pérez, Laura de la; Díaz Ureña, Germán; Muniesa Ferrero, Carlos Alberto

2013-01-01

Son numerosas las investigaciones que ponen de manifiesto una relación entre el genotipo del gen ACTN3 y el rendimiento deportivo, vinculado con la velocidad y la fuerza explosiva. El objetivo de este estudio, fue determinar si existe entre los nadadores, una distribución genotípica del gen ACTN3 diferente a la de la población general, y diferente en función del tipo de prueba que nadan. Participaron en este estudio 75 nadadores españoles, de categoría absoluta, velocistas, medio fondis...

Polimorfismo isoenzimático en cuatro razas y un híbrido de Bactris gasipaes (Palmae

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Sonia Rojas-Vargas

1999-12-01

Full Text Available Se estandarizó un sistema de electroforesis de isoenzimas con tejido de hojas que permitió la identificación del polimorfismo fenético entre cuatro razas y un híbrido de pejibaye Bactris gasipaes provenientes de Brasil, Perú, Bolivia, Panamá y Costa Rica. Las isoenzimas ensayadas fueron: PRX, EST, ACP, ME, DIA, MDH, G6PDH, PGI, SOD, PGM, ADH, GOT, de estas solamente las dos œltimas no mostraron actividad. El resto de isoenzimas mostraron polimorfismo fenético en diferentes grados, por esto se consideran marcadores polimórficos potenciales para estudios de variabilidad genética en pejibaye. Se encontró un locus único en el zimograma de la enzima PRX en las muestras de Utilis-Guápiles (CR, el cual podría usarse como un marcador discriminatorio para esta raza. Se establecieron relaciones de similitud isoenzimática entre las razas Utilis-Guápiles (CR y Tuira-Darién (Pa; Tembé-Chapare (Bo y Pará-Belem (Bra respectivamente, mientras que el híbrido Yurimaguas (Pe se ubicó aparte y ligeramente más cercano a Utilis y Tuira, por esto se considera que posiblemente desciende de padres aún no identificados.The study of genetic diversity in peach palm (Bactris gasipaes K. is important for the breeding work on this palm and to corroborate the hypotheses on its origins. For that purpose it is necessary to use alternative techniques to complement the morphological studies traditionally made. One of the techniques that responds to that need is isozyme electrophoresis. The isozymes are biochemical markers of importance in the study of genetic variability in plants of economic importance, because they are the primary products of genetic expression. This work is an electrophoretic analysis on gels of polyacrilamide to study phenetic relations using twelve isozymes on four races and an spontaneous hybrid of peach palm. The biological material used came from the germplasm bank from Los Diamantes Experimental Station, Guápiles-Costa Rica. Four

Polimorfismo do gene dos receptores de progesterona e o aborto espontâneo de repetição Progesterone receptor gene polymorphism and recurrent spontaneous abortion

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Évelyn Traina

2010-05-01

Full Text Available OBJETIVO: investigar se polimorfismos dos genes que codificam o receptor de progesterona (PROGINS estão relacionados à ocorrência de aborto espontâneo de repetição (AER. MÉTODOS: em estudo caso-controle, foram selecionados 85 pacientes com antecedente de pelo menos três abortos precoces sem etiologia definida (Grupo Caso e 157 mulheres com história de pelo menos duas gestações de termo sem intercorrências e sem passado de abortamento (Grupo Controle. Realizada coleta de 10 mL de sangue por punção venosa periférica e extração de DNA pela técnica DTAB/CTAB. As genotipagens foram feitas por reação em cadeia de polimerase (PCR, nas condições de ciclagem específica para o polimorfismo em estudo, seguida de amplificação em gel de agarose a 2%. A visualização das bandas foi feita sob luz ultravioleta e os géis foram fotografados. As diferenças genotípicas e alélicas entre os dois grupos para o polimorfismo PROGINS foram calculadas pelo teste de χ2, adotando-se como nível de significância valores de pPURPOSE: to assess a possible association between polymorphism of the progesterone receptor gene (PROGINS and recurrent spontaneous abortion (RSA. METHODS: in this case-control study, 85 women with at least three previous spontaneous abortions without an identifiable cause (RSA Group and 157 women with at least two previous term pregnancies without pathologies and no previous miscarriage (Control Group were selected. An amount of 10 mL of peripheral blood was collected by venipuncture and genomic DNA was extracted by the DTAB/CTAB method, followed by the polymerase chain reaction (PCR under specific conditions for this polymorphism and by amplification by 2% agarose gel electrophoresis. The bands were visualized with an ultraviolet light transilluminator and the gels were photographed. Differences in the PROGINS genotype and allele frequencies between groups were analyzed by the χ2 test, with the level of significance set

Análisis de genotipos del virus de la hepatitis B mediante el análisis de polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Julio-C Rendón

2016-08-01

Conclusiones. Se caracterizó el patrón de genotipificación del genotipo F, subgenotipo F3, del HBV mediante RFLP, análisis in silico y secuenciación. Se requieren nuevos análisis in silico con un número mayor de secuencias para validar los patrones de RFLP de los genotipos y subgenotipos del VHB.

Aspectos genéticos da escoliose idiopática do adolescente Aspectos genéticos de la escoliosis idiopática del adolescente Genetic aspects of the adolescent idiopathic scoliosis

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Marcelo Wajchenberg

2012-09-01

Full Text Available A escoliose idiopática do adolescente é uma doença frequente e sua etiologia permanece obscura. Várias hipóteses foram formuladas, entre elas a possibilidade da transmissão genética. Estudos na literatura procuraram analisar a prevalência da doença em determinadas populações, as possíveis formas de transmissão, a localização dos genes responsáveis e as variações de determinados genes (polimorfismos que podem influenciar o desenvolvimento da deformidade. O objetivo deste artigo é revisar e atualizar os conceitos sobre a influência genética na etiologia da escoliose idiopática do adolescente.La escoliosis idiopática del adolescente es una enfermedad frecuente y su etiología continúa siendo obscura. Varias hipótesis fueron elaboradas, entre ellas, la posibilidad de la transmisión genética. Los estudios en la literatura procuraron analizar la prevalencia de la enfermedad en determinadas poblaciones, las posibles formas de transmisión, la localización de los genes responsables y las variaciones de genes específicos (polimorfismos que pueden influenciar en el desarrollo de la deformidad. El objetivo de este artículo es revisar y actualizar los conceptos sobre la influencia genética en la etiología de la escoliosis idiopática del adolescente.The adolescent idiopathic scoliosis is a common disease and its etiology remains unclear. Several hypotheses have been devised, including the possibility of genetic transmission. Studies in the literature have examined the prevalence of the disease in certain populations, the possible modes of transmission, the location of genes and variations of certain genes (polymorphisms that may influence the development of the deformity. This article intends to review and update the concepts of genetic influence in the etiology of adolescent idiopathic scoliosis.

Comparación entre 5 métodos para la extracción de ADN de Triatomíneos: su utilización en la técnica de ADN polimórfico amplificado al azar (RAPD)

OpenAIRE

Fraga Nodarse, Jorge; Rodríguez, Jinnay; Fuentes, Omar; Castex, Mayda; Fernández-Calienes, Aymé

2004-01-01

Se evaluó la aplicabilidad de 5 protocolos útiles para la extracción del ADN genómico de Triatomíneos, y se describió el método del acetato de potasio modificado, como un método con el que se obtiene un alto rendimiento y pureza del ADN en el menor tiempo y costo, para su utilización como molde en la técnica de ADN polimórfico amplificado al azar (RAPD [la cual es un método simple para detectar el polimorfismo genético del ADN]) y probablemente en otras técnicas moleculares basadas en la ampl...

Detección de mutaciones de los genes hMLH1 y hMSH2 del sistema de reparación de malos apareamientos del ADN en familias colombianas sospechosas de cancer colorrectal no polipósico hereditario (síndrome de Lynch.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Andrea Gómez

2005-09-01

Full Text Available Introducción. El cáncer colorrectal es la segunda causa de morbilidad y mortalidad por cáncer en los países desarrollados. En Colombia es la quinta causa de muerte entre los diferentes cánceres. Cerca del 75% de éstos corresponde a cánceres esporádicos, alrededor del 25% son familiares, y son claramente hereditarios el 5%. De éstos, el más importantes es el cáncer colorrectal no polipósico hereditario o síndrome de Lynch. Objetivo. Analizar los dos genes más importantes involucrados en el síndrome de Lynch, el hMLH1 y el hMSH2. Materiales y métodos. En 17 familias colombianas que cumplían con los criterios de Ámsterdam II o las pautas de Bethesda, se analizaron por SSCP los 35 exones de estos dos genes y las variantes electroforéticas se secuenciaron. Resultados. Se detectaron 8 mutaciones de línea germinal en las familias analizadas, 7 en el gen hMLH1 y 1 en hMSH2, y se encontró una tasa de detección de mutaciones del 47%. Seis de las 8 mutaciones encontradas en este estudio han sido previamente reportadas en la literatura. Un cambio de una base en el sitio donador de empalme en el exón 9 del gen hMLH1 (G>A (dos familias, un cambio A>G en el codón 755 del exón 17, y un cambio G>A en el exón 18. Se detectaron dos nuevas mutaciones, una en el exón 17, un cambio C>T en el codón 640, y una deleción de TG en el codón 184 del exón 3 del gen hMSH2. También se detectó en dos familias un polimorfismo del intrón 13 del hMLH1. Conclusión. Este es el primer estudio realizado en Colombia que detecta mutaciones en el síndrome de Lynch y pretende establecer un programa integral de manejo y prevención.

Aproximación a la filogenia de Spodoptera (Lepidoptera: Noctuidae con el uso de un fragmento del gen de la citocromo oxidasa I (COI

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Clara Inés Saldamando

2012-09-01

Full Text Available En este trabajo se secuenció un fragmento de 451pb del gen mitocondrial de la citocromo oxidasa I (COI en 62 secuencias del género Spodoptera y una secuencia de Bombix mori (grupo externo. Los resultados mostraron gran diferenciación genética (distancia K2 entre los haplotipos de Spodoptera frugiperda de Colombia y Estados Unidos, según los estimadores de diversidad haplotípica, diversidad y polimorfismo nucleotídicos calculados. Un árbol de ML agrupó las especies con valores de bootstrap entre 73-99% en las ramas internas. No obstante algunas ramas presentaron bajos valores de bootstrap. Este árbol formó un grupo constituido por las especies del hemisferio oriental (S. littoralis y S. litura y también agrupó las especies localizadas en el hemisferio occidental (S. androgea, S. dolichos, S. eridania, S. exigua, S. frugiperda, S. latifascia, S. ornithogalli y S. pulchella. Esto demuestra que el árbol agrupó las especies con base en su origen geográfico. Contrariamente, el árbol no agrupó a S. frugiperda con S. ornithogalli, demostrando que a pesar de que ambas coexisten en el cultivo de algodón, no comparten un ancestro común reciente. En Colombia, estas especies forman parte del “complejo Spodoptera” del algodón, y nuestros resultados demuestran que la secuenciación de este gen permite diferenciarlas sin necesidad del uso de claves taxonómicas de sus estadios larvales. Este trabajo es una aproximación a la filogenia de este género, por lo cual la inclusión de más genes (mitocondriales y nucleares son necesarios para futuros trabajos.

Genes y variantes polimórficas asociadas a la enfermedad cardiovascular

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Eliana C. Portilla

2014-09-01

Full Text Available La aterosclerosis se considera como la principal causante de enfermedades cardiovasculares. Es una enfermedad multifactorial, caracterizada por procesos inflamatorios y la internalización continua de moléculas lipídicas al interior del vaso. Los estudios de genes candidato han proporcionado conocimiento acerca de la fisiopatología de esta enfermedad y han permitido la postulación de algunos polimorfismos como responsables de la susceptibilidad genética en diversas poblaciones. En particular, estos polimorfismos que modulan ciertas vías moleculares tales como el estrés oxidativo, el metabolismo lipídico y la trombogénesis se asocian con el desarrollo de las enfermedades cardiovasculares. Se han conducido varios estudios para identificar nuevas variantes asociadas con la enfermedad que han permitido el descubrimiento de nuevas vías de la enfermedad. Aunque el hallazgo de nuevos genes asociados a la enfermedad cardiovascular a través de enfoques como el escaneo global del genoma ha contribuido al entendimiento del desarrollo de esta condición, el conocimiento aún es limitado y poco concluyente. El objetivo de esta revisión es identificar los genes y las variantes polimórficas asociadas a la enfermedad cardiovascular, de acuerdo con los diferentes enfoques de análisis de asociación genética.

Interação toxicogenética de polimorfismos da metaloproteinase-9 (MMP-9) da matriz extracelular e exposição ao mercúrio : efeitos sobre a atividade plasmática da MMP-9

OpenAIRE

Anna Laura Bechara Jacob Ferreira

2010-01-01

Resumo: A exposição ao mercúrio (Hg) causa efeitos deletérios à saúde, incluindo doenças cardiovasculares. Embora os mecanismos não estejam precisamente definidos, metaloproteinases (MMPs) -2 e -9 podem estar envolvidas. Expressão e atividades aumentadas destas MMPs são demonstradas em diversas condições patológicas, e estudos demonstraram que os níveis circulantes de MMPs poderiam ser usados como marcadores de risco cardiovascular. O gene que codifica a MMP-9 apresenta polimorfismos que afet...

Common polymorphisms and cardiovascular factors in patients with myocardial infarction of Costa Rica

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Lizbeth Salazar-Sánchez

2006-03-01

Full Text Available Eight common polymorphisms of known myocardial infarction (MIrisk factors (factor V Leiden (FVL, factor V HR2 (FVHR2,factor II 20210G>A (FII,factor VII IVS7 (FVII IVS7,factor VII Arg353Gln (FVII, factor XIII Val34Leu (FXIII,Methylenetetrahydrofolate reductase C677T (MTHFR, Angiotensin Converting Enzyme (ACEand environmental risk factors were analyzed in a MI patients of Costa Rica.This case-control study included 186 MI subjects,95 of them Se estudiaron ocho polimorfismos comunes asociados como factores de riesgo para el infarto al miocardio (IM:factor V Leiden (FVL,factor VHR2 (FVHR2, factor II 20210G>A (FII,factor VII IVS7 (FVII IVS7, factor VIIArg353Gln (FVII,factor XIIIVal34Leu (FXIII, metilentetrahidrofolato reductase C677T (MTHFR, enzima convertidora de la angiotensina (ACE y factores ambientales de riesgo,en pacientes costarricenses.Este es un estudio de casos y controles,donde participan 186 pacientes,95 de ellos con edades <45 años y 201 sujetos controles.Se utilizó la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCRy por medio de entrevistas personales se recolectó información epidemiológica adicional.Se encontró que la hipercolesterolemia y el fumado estan asociados como factores de riesgo en los pacientes jóvenes.Niveles elevados del fibrinógeno fueron detectados como un factor de riesgo importante y se observo interacción entre fumado y estos valores aumentados de fibrinógeno. El genotipo 34LeuLeu del FXIII presentó un efecto protector significante mientras que los otros polimorfimos estudiados no mostraron diferencia estadísticamente significativa entre los casos y controles. Los polimorfismos del FVII y FXIII demostraron interación con el fibrinógeno,según el análisis estadístico aplicado. Se evidencia, la interación entre factores de riesgo común y ciertos polimorfismos (FVII;FXIIIen la patogénesis del IM.Este es uno de los primeros informes sobre estos marcadores moleculares y su asociación con IM en

Toxicidad del irinotecán en pacientes con cáncer colorrectal y variabilidad del gen UGT1A

OpenAIRE

Gayoso Rey, Mónica

2012-01-01

El cáncer colorrectal (CCR) ocupa el segundo lugar como causa de mortalidad por cáncer en la mayoría de los países desarrollados. El irinotecán es uno de los fármacos más empleados en la quimioterapia. Sin embargo, existe una variabilidad interindividual en la aparición de efectos adversos. Se han publicado diversos estudios que intentan correlacionar determinados polimorfismos genéticos con la toxicidad, mostrando discrepancias. Pocos de estos trabajos se han centrado en la población español...

Análise do polimorfismo Fok1 do gene VDR em mulheres inférteis com endometriose Analysis of VDR gene polymorphism Fok1 in infertile women with endometriosis

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Fábia Lima Vilarino

2011-02-01

Full Text Available OBJETIVO: avaliar a frequência do polimorfismo Fok1 do gene do receptor da vitamina D (VDR em mulheres inférteis com endometriose e Grupo Controle, e sua associação com a doença. MÉTODOS: estudo caso-controle que incluiu 147 mulheres inférteis com endometriose e 154 mulheres férteis sem endometriose como Controle. O polimorfismo Fok1 (rs10735810, T2C, que promove uma troca de T/C no éxon 2 do gene VDR, foi identificado por PCR-RFLP (análise de polimorfismos de fragmentos de restrição, que envolve a combinação de amplificação por PCR (reação em cadeia da polimerase e digestão com endonuclease de restrição. O teste do χ2 foi utilizado para comparar as frequências dos genótipos e alelos entre os grupos. Todos os valores de p foram bicaudais, e o nível de significância considerado foi 0,05 (αPURPOSE: to evaluate the frequency of VDR gene polymorphism Fok1 in infertile women with endometriosis and Control and its relation to the disease. METHODS: a case-control study that included 147 infertile women with endometriosis and 154 fertile women without endometriosis as Control. Fok1 polymorphism (rs10735810, T2C, which promotes a T/C exchange in exon 2 of the VDR gene, was identified by the polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP, that involves the combination of amplification by PCR and digestion with restriction endonuclease. The χ2 test was used to compare allele and genotype frequencies between groups. All p-values were two-tailed and a p-value < 0.05 was considered statistically significant. RESULTS: the TT, TC and CC genotype frequencies of VDR Fok1 polymorphism were 44.2%, 46.9% and 8.9% in infertile women with endometriosis and 41.6%, 50% and 8.4% in the Control Group. No significant difference was found (p=0.8, even when the patients were subdivided according to the stage of endometriosis (p=0.3 for minimal and mild endometriosis and p=0.2 for moderate and severe endometriosis

Polimorfismo da hemoglobina de bubalinos (Bubalis bubalis da raça Murrah criados no Estado de São Paulo, Brasil

Directory of Open Access Journals (Sweden)

A. M. F. Rosenfeld

2006-03-01

Full Text Available Os tipos de hemoglobina foram determinados em 41 amostras de sangue de bubalinos sadios da raça Murrah, criados no município de Roseira, no Estado de São Paulo, sendo cinco animais machos e 36 fêmeas. As amostras sangüíneas foram colhidas por venipunção da jugular, em tubos contendo EDTA e a determinação dos tipos de hemoglobina foi realizada pela técnica de eletroforese alcalina em acetato de celulose, utilizando-se o Tris-EDTA-Borato (pH 8,6 como solução tampão. Duas bandas de migração relativas aos alelos HbA e HbB foram observadas, identificando-se dois genótipos Hb-AA e Hb-AB e as suas freqüências na população avaliada foram: 95,1% dos bubalinos apresentaram o tipo heterozigoto Hb-AB e 4,9% o tipo homozigoto Hb-AA. O polimorfismo da hemoglobina foi observado nos bubalinos e o genótipo heterozigoto Hb-AB foi o mais freqüente.

Influencia de polimorfismos genéticos de CYP3A4/5 en la farmacocinética de levonorgestrel: estudio piloto

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Iván Moreno

2012-12-01

Full Text Available Introducción. El levonorgestrel, un progestágeno sintético usado para endometriosis, dismenorrea y anticoncepción de emergencia, es rápida y completamente absorbido en el tubo digestivo. Su metabolismo es principalmente hepático, mediante las enzimas CYP3A4 y CYP3A5. Objetivo. El presente estudio tuvo como objetivo evaluar la asociación entre la farmacocinética de levonorgestrel y las variantes alélicas de CYP3A4*1B y CYP3A5*3. Materiales y métodos. En un grupo de 17 mujeres adultas sanas, que firmaron un consentimiento informado, se practicó genotipificación para CYP3A4*1B y CYP3A5*3 mediante PCR. Posteriormente, las voluntarias fueron sometidas a un estudio farmacocinético donde, luego de 12 horas de ayuno, recibieron una dosis de 0,75 mg de levonorgestrel. Se extrajeron muestras sanguíneas seriadas (0 a 24 horas y se determinaron las concentraciones de levonorgestrel mediante un método validado de UPLC-ms/ms, para luego obtener los parámetros farmacocinéticos. Todos los procedimientos consideraron los aspectos éticos de la Declaración de Helsinki y las buenas prácticas clínicas. Resultados. Las frecuencias genotípicas observadas para el grupo de estudio fueron 11,8 % para*1B/*1B; 5,8 % para *1/*1B, y 82,4 % para *1/*1 de CYP3A4*1B. Para CYP3A5*3, las frecuencias genotípicas fueron 70,5 % para *3/*3; 23,5 % para *1/*3, y 6,5 % para *1/*1. Se observa una interesante variabilidad entre las voluntarias que sugiere una relación con las variantes genéticas CYP3A, pero que no permite establecer una asociación estadísticamente significativa, presumiblemente debido albajo número de individuos homocigotos mutados de CYP3A4 y silvestres de CYP3A5. Conclusiones. Los polimorfismos genéticos podrían ser factores relevantes en la determinación de la variabilidad entre pacientes en las concentraciones plasmáticas de levonorgestrel, lo cual, sin embargo, no pudo ser establecido estadísticamente en este estudio. Por lo tanto

Correlación fenotipo-genotipo de variantes génicas en síndrome metabólico

OpenAIRE

Antolí Royo, Ana Cristina

2016-01-01

[ES]La importancia del Síndrome Metabólico viene dada por el aumento del riesgo cardiovascular que genera, con un aumento de la mortalidad, y por su alta prevalencia. Esto ha llevado a investigar diferentes factores genéticos que puedan estar implicados en la resistencia insulínica y la obesidad. Nuestro objetivo ha sido encontrar una asociación entre determinados polimorfismos genéticos, como son la IL-1β, IL-4, IL-6, PPAR-γ y TNF-α, y su relación con el Síndrome Metabólico (según l...

Diversity of the marine picocyanobacteria Prochlorococcus and Synechococcus assessed by terminal restriction fragment length polymorphisms of 16S-23S rRNA internal transcribed spacer sequences Diversidad de las picocianobacterias marinas Prochlorococcus y Synechococcus por medio de polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción terminal en secuencias del espaciador transcrito interno del ARNr 16S - 23S

Directory of Open Access Journals (Sweden)

PARIS LAVIN

2008-12-01

distribution of these organisms.Con el fin de evaluar la utilización de secuencias del espaciador interno transcrito (ITS en estudios de genética de población de cianobacterias marinas, se amplificó y clonó la secuencia del gen ARNr 16S junto a la region espadadora 16S-23S ARNr de seis cepas de Prochlorococcus y Synechococcus. Se analizaron los amplicones del ITS por electroforesis en gel de gradiente de desnaturalización (DGGE y por polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción terminal (T-RFLP. Al aplicar los métodos estándares de estas técnicas, se obtuvo más de una banda o fragmento de restricción terminal (T-RF por cepa o secuencia clonada. Informes en la literatura han sugerido que estas anomalías podrían ser atribuidas a la formación de estructuras secundarias. Por consiguiente, la estructura secundaria de las secuencias de ITS de las cepas de Prochlorococcus y Synechococcus fue modelada a las diferentes temperaturas que se utilizaron durante la reacción en cadena de polimerasa (PCR. Dicho modelamiento predijo la existencia de bucles que podrían persistir incluso durante la temperatura de extensión. Es probable que estos bucles generen productos de PCR con fragmentos incompletos y hebras simples. En este trabajo se modificó el procedimiento del método de T-RFLP añadiendo el partidor marcado en los últimos dos ciclos. Esto resultó, para la mayoría de los casos, la obtención de un solo fragmento de restricción por ribotipo. La aplicación de esta técnica a una muestra del medio ambiente obtenida frente al norte de Chile, demostró que es posible identificar la presencia, y determinar la abundancia relativa, de varios linajes filogenéticos de los géneros Prochlorococcus y Synechococcus que habitan la zona eufótica. El análisis filogenético de las secuencias de ITS obtenidos por clonación y secuenciación de ADN a partir de la misma muestra confirmó la presencia de los diferentes genotipos. Con la modificación propuesta, el m

Genetic polymorphisms related to meat traits in purebred and crossbred Nelore cattle Polimorfismos genéticos relacionados às características da carne em bovinos Nelore puros e cruzados

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Rogério Abdallah Curi

2009-12-01

Full Text Available The objective of this work was to estimate the allelic and genotypic frequencies of CAST/XmnI, a calpastatin gene polymorphism, and CAPN530, a calpain 1 large subunit gene polymorphism, in different beef genetic groups (Nelore and Nelore x Bos taurus, and to investigate associations between these polymorphisms and carcass and meat traits. Three hundred animals - comprising 114 Nelore, 67 Angus x Nelore, 44 Rubia Gallega x Nelore, 41 Canchim, 19 Brangus three-way cross and 15 Braunvieh three-way cross- were genotyped by PCR-RFLP and phenotyped for rib-eye area (REA, back-fat thickness (BT, intramuscular fat (IF, shear force (SF and myofibrillar fragmentation index (MFI. The occurrence of the two alleles of the CAST/XmnI and CAPN530 single nucleotide polymorphisms (SNPs in a B. indicus breed, which permitted association studies in purebred and crossbred Nelore cattle, was first shown in the present work. No relationship was found between the CAST or CAPN1 SNPs and growth-related traits (REA or fat deposition (BT and IF, since calpastatin and µ-calpain are not physiologically involved with these traits. Moreover, the association results between genotypes and aged meat tenderness (assessed by SF and MFI showed that these markers are useless in assisted selection for purebred Nelore and their crosses with B. taurus.O presente trabalho objetivou estimar, em bovinos de corte de diferentes grupos genéticos (Nelore e Nelore x Bos taurus, as frequências alélicas e genotípicas dos polimorfismos CAST/XmnI, do gene da calpastatina, e CAPN530, do gene da calpaína, bem como avaliar a ocorrência de associações entre esses polimorfismos e características da carcaça e da carne produzida. Trezentos animais - 114 Nelore, 67 Angus x Nelore, 44 Rubia Galega x Nelore, 41 Canchim, 19 tricross Brangus e 15 tricross Braunvieh - foram genotipados por PCR-RFLP e fenotipados para área de olho de lombo (AOL, cobertura de gordura subcutânea (CGS, gordura

Estudo do polimorfismo genético no gene p53 (códon 72 em câncer colorretal Role of the genetic polymorphism of p53 (codon 72 gene in colorectal cancer

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jacqueline Miranda de Lima

2006-03-01

Full Text Available RACIONAL: Polimorfismos genéticos são variações genéticas que podem ocorrer em seqüências codificadoras e não-codificadoras, levando a alterações qualitativas e/ou quantitativas das proteínas em questão. O p53 é o gene mais comumente alterado no câncer humano. O polimorfismo desse gene no códon 72 ocorre por substituição de uma base e tem sido associado a maior risco de câncer. OBJETIVO: Determinar a possível associação entre o polimorfismo no códon 72 (72 arginina/prolina do gene p53 e câncer colorretal. CASUÍSTICA E MÉTODOS: Foram avaliados em 100 pacientes com câncer colorretal e em 100 indivíduos sem câncer, pareados quanto ao sexo idade, o hábito de fumar, o etilismo e no grupo caso o estádio, o grau de diferenciação e a evolução da doença. O genótipo (72 arginina/prolina foi determinado por PCR, utilizando-se primers (seqüências de nucleotídeos específicos. RESULTADOS: O genótipo homozigoto arginina/arginina foi prevalente em 56% no grupo controle e em 58% no grupo caso. Não se observou diferença entre os dois grupos. No estádio IV este genótipo foi mais freqüente quando comparado ao estádio I (80% versus 14%. Não se observou diferença entre as variações do genótipo e fumo, álcool, evolução clínica ou grau de diferenciação. CONCLUSÃO: A prevalência do genótipo arginina/arginina foi a mais freqüente nos dois grupos. Não foi encontrada correlação entre maior risco de câncer e o polimorfismo no códon 72 prolina/arginina do gene p53. Apesar do pequeno número de doentes com câncer em estádio avançado (IV, estes tiveram maior prevalência do genótipo arginina/arginina.BACKGROUND: Polymorphisms are genetic variations that can occur in sequences of codons, leading to defective proteins. p53 is the most commonly gene affected in human cancer. The polymorphism of this gene occurs by a substitution of a base in codon 72 and may increase the risk of cancer. AIM: To investigate the

Associação entre os polimorfismos HaeIII e MspI do gene para o receptor alfa de estrogênio e densidade mamográfica em mulheres após a menopausa Association between HaeIII and MspI polymorphisms of estrogen receptor alpha gene and mammographic density in post-menopausal women

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Eduardo Henrique de Moura Ramos

2006-10-01

Full Text Available OBJETIVO: Avaliar a presença dos polimorfismos HaeIII e MspI do gene para o receptor de estrogênio alfa, bem como fatores clínicos e suas possíveis associações com a densidade mamográfica em mulheres após a menopausa. MÉTODOS: Foram avaliadas 115 mulheres após a menopausa, não usuárias de terapia hormonal e sem lesão mamária clínica ou mamograficamente identificada. A densidade mamográfica foi determinada por três observadores independentes, tomando-se como base a classificação dos padrões mamográficos do ACR-BIRADS®, 2003 (duas avaliações subjetivas e uma computadorizada - Adobe Photoshop® 7.0. Amostras de raspado bucal foram obtidas para extração de DNA e em seguida foi realizada uma PCR-RFLP (Polymerase Chain Reation - Restriction Fragment Length Polymorphism para análise de polimorfismos presentes no íntron 1 e éxon 1 do gene do REalfa (HaeIII e MspI. RESULTADOS: O polimorfismo HaeIII foi encontrado em 43 (37,4% das 115 mulheres, ao passo que o MspI estava presente em 96 (83,5% das mesmas. Houve alto grau de concordância entre os três observadores na determinação da densidade mamográfica. Trinta e quatro (29,6% mulheres tinham mamas densas, e 81 (70,4%, mamas lipossubstituídas. CONCLUSÃO: Não houve associação entre o polimorfismo HaeIII do gene para o receptor de estrogênio alfa e densidade mamográfica (Fisher = 0,712. Houve associação próxima à significância estatística entre o polimorfismo MspI e densidade (Fisher = 0,098. Idade, paridade e índice de massa corporal mostraram-se associados com densidade mamográfica.PURPOSE: To assess the presence of estrogen receptor gene polymorphisms HaeIII and MspI as well as clinical factors, and their possible associations with high mammographic density in post-menopausal women. METHODS: One hundred and fifteen post-menopausal women, not in use of hormonal therapy and without clinical or mammographic lesions were evaluated. Three independent observers

Lack of association between VNTR polymorphism of dopamine transporter gene (SLC6A3 and schizophrenia in a Brazilian sample Ausência de associação entre o polimorfismo VNTR do gene do transportador de dopamina (SLC6A3 e esquizofrenia em uma população brasileira

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Quirino Cordeiro

2004-12-01

Full Text Available A role of dopaminergic dysfunction has been postulated in the aetiology of schizophrenia. We hypothesized that variations in the dopamine transporter gene (SLC6A3 may be associated with schizophrenia. We conducted case-control and family based analysis on the polymorphic SLC6A3 variable number tandem repeat (VNTR in a sample of 220 schizophrenic patients, 226 gender and ethnic matched controls, and 49 additional case-parent trios. No differences were found in allelic or genotypic distributions between cases and controls and no significant transmission distortions from heterozygous parents to schizophrenic offspring were detected. Thus, our results do not support an association of the SLC6A3 VNTR with schizophrenia in our sample.Genes do sistema dopaminérgico são de escolha para a pesquisa de susceptibilidade para a esquizofrenia. Desse modo, possível contribuição do polimorfismo do gene do transportador de dopamina (SLC6A3 no aumento da vulnerabilidade para a esquizofrenia foi investigada no presente estudo. Analisou-se a distribuição do sítio polimórfico do gene do transportador de dopamina (VNTR em uma população de 220 pacientes com esquizofrenia (critério diagnóstico: DSM-IV e comparou-se com a distribuição em uma população controle de 226 indivíduos pareados para sexo e etnia. Nenhuma diferença foi observada na distribuição dos alelos entre casos e controles. O mesmo polimorfismo também foi investigado em uma segunda amostra composta por 49 trios (pais e probando. O resultado também foi negativo. Tais dados não dão suporte para a participação do polimorfismo do gene do transportador de dopamina no aumento de susceptibilidade para esquizofrenia na amostra estudada.

Diet-gene interactions between dietary fat intake and common polymorphisms in determining lipid metabolism

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Corella, Dolores

2009-03-01

-genotipo. Estas interacciones incluyen: la interacción entre el consumo de grasa total y el polimorfismo 514C/T en el promotor del gen de la lipasa hepática determinando las concentraciones de colesterol ligado a lipoproteínas de alta densidad (c-HDL; la interacción entre el consumo de ácidos grasos poliinsaturados y el polimorfismo 75G/A en el promotor del gen APOA1 en las concentraciones plasmáticas de c-HDL; la interacción entre los ácidos grasos poliinsaturados y el polimorfismo L162V en el gen PPARA determinando las concentraciones plasmáticas de triglicéridos y de apolipoproteína C-III; la interacción entre el polimorfismo 1131TC en el promotor del gen de la APOA5 determinando el metabolismo de los triglicéridos. Aunque se han publicado cientos de estudios dieta-genotipo en el ámbito del metabolismo lipídico, el nivel de evidencia científica todavía es bajo para realizar recomendaciones nutricionales a la población, por lo que se requiere mucha más investigación nutrigenética.

Polimorfismo VAL158MET del gen Catecol-O-Metiltransferasa y características clínicas en primeros episodios de psicosis

OpenAIRE

Pelayo Terán, José María

2011-01-01

RESUMEN: La esquizofrenia está considerada un síndrome clínico heterogéneo con una etiopatogenia de origen multifactorial, en el que se incluyen factores ambientales, caracteriales y genéticos. A pesar de que más del 50% de la variabilidad de la enfermedad se puede deber a uno o varios factores genéticos, sólo un número limitado de variantes de riesgo genético y con un efecto muy débil han podido ser identificados. Muchos de ellos no han podido reproducirse tanto por la diversidad de las mues...

Estimación de las frecuencias alélicas y genotípicas de los genes CAPN1 Y CAST asociados a la calidad de la carne en bovinos de la Cuenca del Papaloapan

Directory of Open Access Journals (Sweden)

C.M. Desgarennes-Alcalá

2017-01-01

Full Text Available El ganado de doble propósito es aquel utiliz ado para producir carne y leche. G eneralmente es el producto del cruce de razas de origen Cebú x europeas y/o Criollo. Este grupo genético se ha adaptado a las condiciones climáticas de temperatura, humedad, baja calidad de pastos y clases de parásitos que prevalecen en las regiones tropicales. En este trabajo, se realizó un escrutinio molecular para observar la frecuencia de dos polimorfismos d el gen de la μ - calpaína (CAPN1 - 316, CAPN1 - 530 y uno del gen de la calpastatina ( CAST, asociados a la suavidad de la carne en ganado bovino de doble propósito de la Cuenca del Papaloapan. Las pruebas se basaron en Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR y Polimorfismos de la Longitud de Fragmentos de Restricción (RFLPs con las enzimas de restricción Btg I, Ava II y Rsa I para los alelos C - G, A - G y C - G, respectivamente (n=331. Para CAPN1 - 316 las frecuencias genotípicas obtenidas fueron de 0.03 (AA, 0.8 6 (GG y 0.11 (GA y las frecuencias alélicas fueron 0.86 (G y 0.14 (A. Para el marcador CAPN1 - 530 las frecuencias genotípicas fueron de 0.02 (CC, 0.85 (GG y 0.13 (GC, con una frecuencia alélica de 0.85 para G y 0.15 para C. Las frecuencias genotípica s para el marcador CAST fueron de 0.32 (CC, 0.28 (GG y 0.4 (GC, con una frecuencia alélica de 0.68 para el alelo G y 0.32 para el alelo C. La pobl a ción en estudio no se encontró en equilibrio Hardy Weinberg y los valores de χ 2 P con dos grados de liberta d fueron de 0.964, 0.985 y 0.9803 para CAPN1 - 316, CAPN1 - 530 y CAST, respectivamente. De acuerdo con el porcentaje de la genotipificación de los marcadores en los genes CAPN1 y CAST se concluye que la población analizada tiene bajos índices de marc a dores pa ra la suavidad o terneza de la carne, probablemente por las cruzas no dirigidas que se realizan habitualmente, de esta forma se propone, mejorar la calidad de la carne en base a programas de mejoramiento gen

Frequência de polimorfismos nos genes codificadores das enzimas 17βHSD5 e aromatase em mulheres com diferentes fenótipos da síndrome dos ovários policísticos e resposta ao tratamento com anticoncepcional oral

OpenAIRE

Polyana Sartori Maier

2012-01-01

A Síndrome dos Ovários Policísticos (PCOS) é a endocrinopatia mais frequente em mulheres na idade reprodutiva, além de ser a causa mais comum de hiperandrogenismo e anovulação crônica. Diferentes fenótipos da PCOS foram identificados, e um melhor entendimento dessas diferentes apresentações clínicas se faz necessário para o reconhecimento de riscos, medidas preventivas e terapêuticas específicas para cada fenótipo. Associações entre polimorfismos de substituição de um único nucleotídeo (SNPs)...

Variación de la coloración en poblaciones argentinas de Melanophryniscus rubriventris (Vellard, 1947)

OpenAIRE

Vaira, Marcos

2002-01-01

Tanto los patrones como el tono de la coloración dorsal y ventral han sido caracteres comúnmente utilizados para el reconocimiento y diferenciación de numerosas especies y subespecies del género de Bufonidae Melanophryniscus. Sin embargo, raramente se han presentado análisis detallados y sistematizados que indiquen la ausencia o la baja frecuencia de polimorfismos en estos caracteres para asegurar que son realmente diagnósticos. Mediante una metodología sistematizada se estableció la validez ...

Variación de la coloración en poblaciones argentinas de Melanophryniscus rubriventris (Vellard, 1947)

OpenAIRE

Vaira, Marcos

2002-01-01

Tanto los patrones como el tono de la coloración dorsal y ventral han sido caracteres comúnmente utilizados para el reconocimiento y diferenciación de numerosas especies y subespecies del género de Bufonidae Melanophryniscus. Sin embargo, raramente se han presentado análisis detallados y sistematizados que indiquen la ausencia o la baja frecuencia de polimorfismos en estos caracteres para asegurar que son realmente diagnósticos. Mediante una metodología sistematizada se estableció la validez ...

Haplotipos de la hemoglobina S: importancia epidemiológica, antropológica y clínica

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Walter E. Rodríguez Romero

1998-01-01

Full Text Available La relación entre la drepanocitosis y los diferentes haplotipos del gen que codifica la subunidad betas de la globina ha permitido llegar a entender mejor las manifestaciones clínicas de aquella enfermedad. El uso de mejores técnicas de laboratorio permite descartar la presencia de otros factores hereditarios capaces de ocultar el verdadero genotipo hemoglobínico. La heterogeneidad clínica de la drepanocitosis, afección caracterizada por la presencia de una hemoglobina anormal denominada HbS, depende de las concentraciones de hemoglobina fetal (HbF, la razón de cadenas Ggamma a cadenas Agamma en la molécula de globina, las concentraciones de 2,3-difosfoglicerato, la presencia de mutaciones ligadas, los haplotipos del gen betas, la presencia simultánea de alfa-talasemia, y factores ambientales. En particular, los polimorfismos Senegal y árabe-saudí o indio del conglomerado de genes que codifican la subunidad betas se asocian con una evolución clínica menos grave, mientras que los haplotipos de la República Centroafricana (CAR o Bantú, Camerún y Benín se asocian con drepanocitosis grave. De todos, el haplotipo CAR es el de peor pronóstico (concentraciones de HbF de menos de 12% y razón de Ggamma:Agamma propia de la edad adulta. Estos polimorfismos del ácido desoxirribonucleico, una vez caracterizados, adquieren enorme importancia como marcadores antropológicos y genéticos. En las Américas, los haplotipos betas permiten entender mejor las raíces ancestrales africanas de las poblaciones de raza negra. Se ha comprobado la presencia de variedad genética no solo entre las diferentes poblaciones negras de las Américas, sino también dentro de un mismo país, como se observa en Costa Rica.

Genotypes of vitamin D and estrogen receptors in pre and perimenopausal women from Córdoba, Argentina Genotipos de los receptores de vitamina D y de estrógeno en mujeres pre y perimenopáusicas de Córdoba, Argentina

Directory of Open Access Journals (Sweden)

María Ulla

2007-02-01

Full Text Available The aim of this study was to determine the frequency of vitamin D receptor and estrogen receptor genotypes and their relationship with the lumbar spine or femoral neck bone mineral density in healthy pre and perimenopausal women from Córdoba (Argentina and adjacent areas. Genotypes were assessed by restriction fragment length polymorphism-polymerase chain reaction technique. Bsm I and Fok I for vitamin D receptor gene and XbaI and PvuII for estrogen receptor gene were used as restrictases. Two hundred and ten healthy pre and perimenopausal women were recruited and analyzed by age. Calcemia and serum parathyroid hormone did not change, but serum P and b-CrossLaps decreased with age. Femoral neck bone mineral density decreased significantly after 30 years old. Vitamin D receptor and estrogen receptor genotype frequencies were similar to those from other Caucasian women. No association between vitamin D receptor and estrogen receptor genotypes with the lumbar spine or femoral neck bone mineral density has been detected. Analysis of interaction between vitamin D receptor and estrogen receptor genes using covariates such as age, height and body mass index did not show any influence of the combination of those genotypes on bone mineral density. Lifestyle, smoking and alcohol intake had no effect on lumbar spine and femoral neck bone mineral density. To conclude, these data do not support the hypothesis that vitamin D receptor and estrogen receptor genotypes influence on lumbar spine and femoral neck bone mineral density in healthy pre and perimenopausal women from this area of Argentina.El propósito del estudio fue determinar la frecuencia de los genotipos de los receptores de vitamina D y de estrógeno y su relación con la densidad mineral ósea en mujeres sanas pre y perimenopáusicas de la ciudad de Córdoba y alrededores. Los genotipos se determinaron con la técnica de reacción en cadena de la polimerasa y análisis de los polimorfismos de

Caracterización de accesiones de papaya (Carica papaya L. a través de marcadores AFLP en Cuba

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Maruchi Alonso Esquivel

2009-07-01

Full Text Available Los marcadores moleculares son herramientas valiosas en los estudios genéticos en plantas, y están siendo empleados exitosamente en programas de mejoramiento principalmente en la elección de progenitores y en la selección. El polimorfismo observado mediante la técnica molecular AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism ha sido de utilidad para estudios de diversidad genética en frutales. En el presente trabajo se realizó la caracterización molecular de 12 accesiones de papaya (Carica papaya L. del banco de germoplasma del Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical (IIFT, empleando la técnica AFLP. Se evaluaron seis combinaciones de iniciadores para la amplificación selectiva, las cuales amplificaron un total de 431 bandas con 73,3% de polimorfismo. El número total de patrones de bandas identificados fue igual en todas las combinaciones utilizadas, con un porcentaje de identificación alto, lo que sugiere que dichas combinaciones pudieran ser empleadas para estudios de variabilidad genética en papaya. En general, los resultados presentados demuestran que existe diversidad genética entre las accesiones evaluadas, lo cual constituye un reflejo del origen que presentan los genotipos analizados a partir de la introducción de materiales foráneos y la polinización abierta de un grupo de materiales selectos. Por tanto, se recomienda retomar la prospección y selección de accesiones locales, así como la introducción de nuevos genotipos foráneos, como dos vías fundamentales para aumentar la diversidad genética presente en el banco de germoplasma de papaya de Cuba.

Ausência de associação entre polimorfismo do gene da interleucina-1 beta e o prognóstico de pacientes com traumatismo crânio-encefálico grave Lack of association between interleukin-1 gene polymorphism and prognosis in severe traumatic brain injury patients

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Taís Frederes Krämer Alcalde

2009-12-01

Full Text Available OBJETIVO: O traumatismo crânio-encefálico é a principal causa de óbito em indivíduos com idade entre 1 a 45 anos. O desfecho do traumatismo crânio-encefálico pode estar relacionado, além de fatores pré-morbidade e gravidade do dano, com fatores genéticos. Genes que podem ter relação com o resultado pós-trauma vêm sendo estudados, porém, ainda existem poucas informações sobre a associação entre polimorfismos genéticos e o desfecho do traumatismo crânio-encefálico. O gene da interleucina-1 beta (IL-1B é um dos genes estudados, pois esta citocina encontra-se em níveis elevados após o traumatismo crânio-encefálico e pode afetar de forma negativa seu desfecho. O objetivo do presente estudo foi analisar o polimorfismo -31C/T, localizado na região promotora do gene IL-1B, em pacientes com traumatismo crânio-encefálico grave visando correlacioná-lo com o desfecho primário precoce (alta do centro de terapia intensiva ou morte. MÉTODOS: Foram estudados 69 pacientes internados por traumatismo crânio-encefálico grave em três hospitais de Porto Alegre e região metropolitana. O polimorfismo foi analisado através da reação em cadeia da polimerase, seguida da digestão com enzima de restrição. RESULTADOS: O traumatismo crânio-encefálico grave foi associado a uma mortalidade de 45%. Não foram observadas diferenças significativas nas frequências alélicas e genotípicas entre os grupos de pacientes divididos pelo desfecho do traumatismo crânio-encefálico. CONCLUSÃO: Nossos resultados sugerem que o polimorfismo -31C/T do gene IL-1B não tem impacto significativo no desfecho fatal dos pacientes com traumatismo crânio-encefálico grave.OBJECTIVE: Traumatic brain injury is the major cause of death among individuals between 1-45 years-old. The outcome of traumatic brain injury may be related to brain susceptibility to the injury and genetic factors. Genes that may affect traumatic brain injury outcome are being

Melanin nanoparticles derived from a homology of medicine and food for sentinel lymph node mapping and photothermal in vivo cancer therapy.

Science.gov (United States)

Chu, Maoquan; Hai, Wangxi; Zhang, Zheyu; Wo, Fangjie; Wu, Qiang; Zhang, Zefei; Shao, Yuxiang; Zhang, Ding; Jin, Lu; Shi, Donglu

2016-06-01

The use of non-toxic or low toxicity materials exhibiting dual functionality for use in sentinel lymph node (SLN) mapping and cancer therapy has attracted considerable attention during the past two decades. Herein, we report that the natural black sesame melanin (BSM) extracted from black sesame seeds (Sesamum indicum L.) shows exciting potential for SLN mapping and cancer photothermal therapy. Aqueous solutions of BSM under neutral and alkaline conditions can assemble into sheet-like nanoparticles ranging from 20 to 200 nm in size. The BSM nanoparticles were encapsulated by liposomes to improve their water solubility and the encapsulated and bare BSM nanoparticles were both non-toxic to cells. Furthermore, the liposome-encapsulated BSM nanoparticles (liposome-BSM) did not exhibit any long-term toxicity in mice. The liposome-BSM nanoparticles were subsequently used to passively target healthy and tumor-bearing mice SLNs, which were identified by the black color of the nanoparticles. BSM also strongly absorbed light in the near-infrared (NIR) range, which was rapidly converted to heat energy. Human esophagus carcinoma cells (Eca-109) were killed efficiently by liposome-BSM nanocomposites upon NIR laser irradiation. Furthermore, mouse tumor tissues grown from Eca-109 cells were seriously damaged by the photothermal effects of the liposome-BSM nanocomposites, with significant tumor growth suppression compared with controls. Given that BSM is a safe and nutritious biomaterial that can be easily obtained from black sesame seed, the results presented herein represent an important development in the use of natural biomaterials for clinical SLN mapping and cancer therapy. Copyright © 2016 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Una variante del gen CAPN10 y los factores ambientales muestran asociación con el exceso de peso en jóvenes colombianos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Ana C. Orozco

2014-12-01

Full Text Available Introducción. La obesidad resulta de la interacción entre factores de riesgo genéticos y ambientales. Objetivo. Evaluar el efecto de tres variantes genéticas y factores ambientales en el exceso de peso en jóvenes de 10 a 18 años de Medellín, Colombia. Materiales y métodos. Se hizo un estudio transversal en 424 jóvenes divididos en tres grupos: 100 obesos, 112 jóvenes con sobrepeso, y, pareados con ellos, 212 jóvenes con peso adecuado, que conformaron el grupo de control. Se evaluó la asociación entre tres polimorfismos genéticos (UCP3-rs1800849, FTO-rs17817449 y CAPN10-rs3842570 y el exceso de peso, así como su interacción con antecedentes familiares de enfermedad, el tiempo dedicado a ver televisión y a jugar videojuegos y el consumo de alimentos. Resultados. Los antecedentes familiares de obesidad, la dedicación de más de dos horas al día a ver televisión y jugar videojuegos, la falta de lactancia materna, el bajo consumo de cereales, legumbres, frutas y verduras y el gran consumo de comidas rápidas fueron más frecuentes entre los obesos que en los controles. Se observó una asociación significativa entre el genotipo I/I (SNP19 del CAPN10 y el exceso de peso, incluso en los jóvenes que llevaban una vida activa. Además, se encontró una asociación significativa entre los genotipos C/C del UCP3 y G/G y T/T del FTO y el exceso de peso, pero solo en los jóvenes sedentarios. Conclusiones. En esta población, la alimentación inadecuada y el sedentarismo aumentaron el riesgo de exceso de peso. El genotipo I/I de SNP19 del CAPN10 se asoció significativamente con el exceso de peso. Algunas variantes del FTO y el UCP3 mostraron tener efecto solo en jóvenes sedentarios.

Summary report on development of bilateral servo manipulator (BSM) for nuclear fuel cycle facilities in the Japan Nuclear Cycle Development Institute

International Nuclear Information System (INIS)

Miki, Yasuo; Koizumi, Tsutomu; Aoshima, Atsushi; Kawanobe, Kazunori; Kobayashi, Yuichi

2000-03-01

In order to improve availability of nuclear fuel cycle facilities such as fuel reprocessing plants, reduce occupational radiation exposure, the Japan Nuclear Cycle Development Institute (JNC) has been developing an advanced remote manipulative system for fully remote maintenance and repair tasks in large volume repair cells. Fully remote maintenance and repair task is performed primarily by the utilization of overhead bridge cranes, mechanical master-slave manipulators and electro-mechanical power manipulators. This system requires also that plant process and remote processing equipment should be designed to provide modular or unit replacement based on the potential mode of system failures. Repair of equipment is performed following removal of the failed component from process line and transfer to the repair cell. Equipment repair in the cell is commonly carried out by the use of remote manipulators. However, the realization of fully remote maintenance facility requires so remote manipulative systems as to provide excellent controllability, durability and remote maintenance capability, development of a bilateral servo-manipulator was initiated in 1982. Two of BSM were installed in the Tokai Vitrification Facility (TVF) cell and their remote maintenance feasibility was evaluated. Following installation in the TVF, developing efforts toward achieving advanced remote maintenance capability for the Recycle Equipment Test Facility (RETF) have been made. This report summarizes mainly mechanical and control system design for improvement, particularly upgrading controllability. (Itami, H.)

A benchmark simulation model to describe plant-wide phosphorus transformations in WWTPs

DEFF Research Database (Denmark)

Flores-Alsina, Xavier; Ikumi, D.; Kazadi-Mbamba, C.

It is more than 10 years since the publication of the BSM1 technical report (Copp, 2002). The main objective of BSM1 was to create a platform for benchmarking C and N removal strategies in activated sludge systems. The initial platform evolved into BSM1_LT and BSM2, which allowed for the evaluati...

Distancias genéticas en poblaciones del NOA

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Acreche, Noemí

1996-01-01

Full Text Available La mayor parte de los trabajos realizados en nuestro país sobre polimorfismos hematológicos, abordan la necesaria descripción de las poblaciones. Se pone de relieve la importancia de encarar estudios, en base a la valiosa información publicada, que vinculen los grupos con técnicas que permitan realizar nuevas inferencias sobre sus relaciones. Conocidas en gran medida en cuanto a sus manifestaciones culturales, pueden aportar desde lo genético a la comprensión de los procesos microevolutivos ocurridos en una región. Para el NOA, se ha considerado la presencia de comunidades aborígenes incluídas en cuatro familias lingüísticas. Se tendrán en cuenta estos complejos como representativos de afinidades que se establecen a partir de estrechas relaciones entre las etnias, no sólo por la lengua, sino también por las características de sus sistemas productivos, religiosidad y organización. En base a las frecuencias génicas publicadas correspondientes a los siguientes alelos: I*A, I*B, I*O; M, N, S, s; Dia , Dib; P1, P2; C, c; D, d, E, e; Le, le; Fya, Fyb; Jka, Jkb; K y k se construyeron tablas de frecuencias. Se estimaron los coeficientes de distancias genéticas que fueron analizados y posteriormente incluídos en la construcción de un fenograma de los grupos de estudio, mediante agrupaciones (Sahn Cluster secuenciales, aglomerativas, jerárquicas y anidadas. De acuerdo a la información recopilada de las frecuencias de los 25 alelos estudiados en trece poblaciones de aborígenes del NOA y Paraguay, las distancias genéticas obtenidas reflejan los caracteres lingüístico-culturales.

Polimorfismos dos genes do receptor de serotonina (5-HT2A e da catecol-O-metiltransferase (COMT: fatores desencadeantes da fibromialgia? Serotonin receptor (5-HT 2A and catechol-O-methyltransferase (COMT gene polymorphisms: Triggers of fibromyalgia?

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Josie Budag Matsuda

2010-04-01

Full Text Available INTRODUÇÃO: A fibromialgia é uma síndrome reumática caracterizada por dor difusa e crônica associada a fadiga, insônia, ansiedade, depressão, perda de memória e tontura. Embora os mecanismos fisiológicos que controlam a fibromialgia não tenham sido estabelecidos, fatores neuroendócrinos, genéticos ou moleculares podem estar envolvidos. OBJETIVO: O objetivo do presente estudo foi caracterizar os polimorfismos dos genes do receptor de serotonina (5-HT2A e da catecolO-metiltransferase (COMT em pacientes brasileiros com fibromialgia, a fim de avaliar sua participação na etiologia da doença. MATERIAL E MÉTODOS: O DNA genômico extraído de 102 amostras de sangue (51 pacientes, 51 controles foi usado para a caracterização molecular dos polimorfismos dos genes 5-HT2A e COMT, por meio de PCR-RFLP. RESULTADOS: A análise molecular dos polimorfismos do gene 5-HT2A demonstrou frequências de 25,49% C/C, 49,02% T/C e 25,49% T/T, nos pacientes com fibromialgia, e 17,65% C/C, 62,74% T/C e 19,61% T/T, no grupo controle, não apresentando diferença significativa entre o grupo de pacientes e o grupo controle. Os polimorfismos do gene da COMT em pacientes com fibromialgia apresentaram uma frequência de 17,65% e 45,10% para os genótipos H/H e L/H, respectivamente. No grupo controle, as frequências foram de 29,42%, para H/H, e 60,78%, para L/H, sem diferença significativa entre ambos os grupos. Entretanto, houve diferença significativa na frequência do genótipo L/L em pacientes (37,25% e controles (9,8%, o que permitiu a diferenciação entre os dois grupos. CONCLUSÃO: A frequência do genótipo L/L foi maior nos pacientes com fibromialgia. Apesar de a fibromialgia envolver uma situação poligênica e fatores ambientais, o estudo molecular do SNP rs4680 do gene da COMT pode auxiliar a identificação de indivíduos suscetíveis.INTRODUCTION: Fibromyalgia is a rheumatic syndrome characterized by diffuse and chronic pain associated with

Diagnóstico genético de variantes polimórficas asociadas a la celiaquía, mediante ensayo de PCR múltiplex sobre los marcadores DQ2 y DQ8 (Práctica en laboratorio virtual Cibertorio)

OpenAIRE

Herráez, Angel

2017-01-01

Guión de trabajo para el laboratorio virtual «Cibertorio» en Biomodel.UAH.es Se habla de diversidad genética de los individuos como el resultado de que, en diversas regiones del genoma, unas personas tenemos secuencias de nucleótidos que nos diferencian de otras; esto se denomina polimorfismo genético. Cuando estas regiones polimórficas corresponden a zonas codificantes de un producto, existen consecuencias funcionales. El diagnóstico y el pronóstico de la enfermedad celíaca son compl...

Association of vitamin D receptor polymorphisms and type 1 diabetes susceptibility in children: a meta-analysis

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Ozlem Atan Sahin

2017-03-01

Full Text Available Background: There have been studies focused on FokI, BsmI, ApaI and TaqI polymorphisms of the vitamin D receptor (VDR gene and susceptibility to type 1 diabetes mellitus with controversial results.Methods: This present study is a meta-analysis investigating the association between FokI, ApaI, TaqI and BsmI polymorphisms of VDR gene and type 1 DM in children. A literature search was performed using Medline, EMBASE, Cochrane and PubMed. Any study was considered eligible for inclusion if at least one of FokI, ApaI, TaqI and BsmI polymorphisms was determined, and outcome was type 1 DM at pediatric age.Results: A total of 9 studies comprising 1053 patients and 1017 controls met the study inclusion criteria. The pooled odds ratios (ORs of the FokI, ApaI, TaqI and BsmI polymorphisms were combined and calculated. Forest plots and funnel plots of the OR value distributions were drawn. Our meta-analysis has demonstrated statistically significant associations between DM1 and VDR genotypes, BsmIBB (P < 0.05, BsmIBb, (P < 0.05, BsmIbb (P < 0.05, TaqITT (P < 0.05 and TaqItt (P < 0.05 in children.Conclusion: The results indicated that BsmIBB, BsmIBb and TaqItt polymorphisms were associated with an increased risk of type 1 DM, whereas BsmIbb and TaqITT had protective effect for type 1 DM in children.

INFLUENCIA DEL POLIMORFISMO DEL GEN DE LA APOPROTEÍNA E Y EL TIPO DE DIETA SOBRE EL PERFIL LIPÍDICO EN PERSONAS ADULTAS CON DISLIPIDEMIA

Directory of Open Access Journals (Sweden)

M. Camargo

2005-12-01

Full Text Available El objetivo de este trabajo fue determinar los efectos de las diferentes modificaciones dietarias sobre la respuesta lipídica en individuos adultos con dislipidemia, teniendo en cuenta el genotipo de la ApoE presente en ellos. Para esto se realizó una revisión sistemática, encontrando que la distribución alélica de los sujetos incluidos en los estudios analizados fue similar sólo para el alelo ε 2 con respecto a la población normolipémica, mientras que para el alelo ε 3 fue más baja y para el alelo e4 más alta. Por otro lado, se evidenció la influencia que posee el alelo ε 4 en la respuesta lipídica a la modificación dietaria, especialmente de grasa y colesterol, ya que se encontró en la mayoría de los estudios una disminución significativa del colesterol total y LDL. El alelo ε 3 mostró una respuesta lipídica intermedia a la dieta y como se había citado en diversos estudios el alelo ε 2 no respondió significativamente a la intervención dietaria. De igual forma se propuso evaluar la respuesta lipídica según género, lo cual no fue posible debido a que sólo un artículo presentó estos resultados; finalmente se puede concluir que este gen tiene influencia en la respuesta lipídica al tipo de dieta en individuos dislipidémicos.

Sistemática molecular de algunas especies de Lutzomyia spp del grupo verrucarum (Theodor 1965. Búsqueda de marcadores moleculares para la caracterización de especies

Directory of Open Access Journals (Sweden)

I. D. Vélez

2000-02-01

, proteína que participa en la fosforilación oxidativa. Estas especies son: L. evansi (Nuñez-Tovar, L. ovallesi (Ortiz, L. spinicrassa (Osorno & Hoyos, L. nuneztovari (Ortiz y L. columbiana (Ristorcelli & Van Ty. El estudio incluye en el análisis secuencias previamente reportadas de L. longipalpis (del subgénero Lutzomyia franca, serie longipalpis y de insectos de otro género, Phlebotomus papatasi. Adicionalmente pretende buscar a través de análisis de polimorfismos en longitud de fragmentos de restricción (RFLP marcadores moleculares propios de especie, los cuales pueden ayudar en su determinación.

En una primera etapa se estandarizaron las técnicas de preservación de especímenes, extracción de ADN, amplificación, purificación y digestión de la región 5’del gen ND4. A través de ellas se ha obtenido un fragmento de aproximadamente 680 pb para individuos de las especies de estudio y adicionalmente para L. longipalpis y Phlebotomus papatasi. Algunos de los productos amplificados se han secuenciado y dichas secuencias se han editado, alineado y sometido a un análisis filogenético usando el Software phillip 3.5 en el que se logró obtener un cladograma preliminar. Los ensayos de RFLP con las enzimas de restricción Dra I y Vsp I han revelado fragmentos que pueden ser marcadores moleculares diagnósticos de especies al tiempo que revelan polimorfismo intraespecífico para L. evansi y L. ovallesi. Sin embargo las conclusiones sobre su utilidad para estudiar estructura de poblaciones debe ser confirmada aumentando el número de muestras. El estudio se encuentra en la etapa de análisis de los datos y procesamiento de más especímenes para obtener un mayor número de secuencias y RFLP.

Variantes polimórficas Ala513Pro y Gly972Arg del gen IRS-1 no se asocian a la diabetes mellitus tipo 2 en un grupo de la población cubana The Ala513Pro and Gly972ARg polymorphous variants of IRS-1 gen are not associated with type diabetes mellitus in a group of the Cuban population

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Luis Miguel Pérez

2011-08-01

Full Text Available Introducción: la diabetes mellitus tipo 2 es una enfermedad heterogénea y multifactorial, que está determinada por factores genéticos y no genéticos. El sustrato 1 del receptor de la insulina (IRS-1 cumple una función fundamental en la transmisión de la señal insulínica, por tanto sus variantes génicas constituyen blancos importantes en el estudio de la susceptibilidad genética a esta enfermedad en las diferentes poblaciones. Objetivo: explorar el papel de las variantes polimórficas Gly972Arg y Ala513Pro del gen IRS-1 en la susceptibilidad genética de la diabetes mellitus tipo 2 en un grupo de la población cubana. Métodos: se determinó la frecuencia de los polimorfismos Gly972Arg y Ala513Pro del IRS-1 en 499 ciudadanos cubanos, con un índice de masa corporal entre 22-30, con edades comprendidas entre los 40 y 70 años: de ellos 272 (54,5 % diabéticos y 227 (45,5 % no diabéticos. Resultados: la frecuencia del alelo Pro513 fue baja (1,2 % y similar para ambos grupos (1,1 % vs. 1,3 % para el grupo de diabéticos y el grupo control, respectivamente. La frecuencia del polimorfismo Gly972Arg fue de 16,2%, superior a la reportada para la mayoría de las poblaciones estudiadas. No se encontraron diferencias significativas en la frecuencia del alelo Arg972 entre el grupo de diabéticos y el grupo control (15,4 % vs. 17,3 %, ni cambios en los niveles de glucemia e insulinemia asociados a la presencia del alelo polimórfico Arg972. Conclusiones: en este grupo de sujetos de la población cubana, las variantes polimórficas Ala513Pro y Gly972Arg del gen IRS-1 no participan en la etiología de la diabetes mellitus tipo 2.Introduction: the type 2 diabetes mellitus is a heterogeneous and multifactor disease determined by genetic and no-genetic factors. The substrate 1 of insulin receptor (IRS-1 has a fundamental function in transmission of insulin signal, thus its genic variants are significant targets in study of genetic susceptibility to

Frequency and expression of mutacin biosynthesis genes in isolates of Streptococcus mutans with different mutacin-producing phenotypes.

Science.gov (United States)

Kamiya, Regianne Umeko; Höfling, José Francisco; Gonçalves, Reginaldo Bruno

2008-05-01

The aim of this study was to analyse the frequency and expression of biosynthesis genes in 47 Streptococcus mutans isolates with different mutacin-producing phenotypes. Detection of the frequency and expression of genes encoding mutacin types I, II, III and IV were carried out by PCR and semi-quantitative RT-PCR, respectively, using primers specific for each type of biosynthesis gene. In addition, a further eight genes encoding putative bacteriocins, designated bsm 283, bsm 299, bsm 423, bsm 1889c, bsm 1892c, bsm 1896, bsm 1906c and bsm 1914, were also screened. There was a high phenotypic diversity; some Streptococcus mutans isolates presented broad antimicrobial spectra against other Streptococcus mutans clinical isolates, including bacteria resistant to common antibiotics, as well as Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus faecalis and Streptococcus pyogenes. The expression frequency of the bsm gene was higher than that of the previously characterized mutacins (I-IV). There was no positive correlation between the number of indicator strains inhibited (antimicrobial spectra) and the number of biosynthesis genes expressed (Spearman correlation test, r=-0.03, P>0.05). In conclusion, the high diversity of mutacin-producing phenotypes, associated with high frequency of expression of the biosynthesis genes screened, reveals a broad repertoire of genetic determinants encoding antimicrobial peptides that can act in different combinations.

Asociación de polimorfismos en DNA mitocondrial y diabetes mellitus tipo 2 Descriptive study of the current status of the pediatric practice in Antioquia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Gabriel Bedoya Berrío

2003-01-01

Full Text Available

La Diabetes mellitus tipo 2 (DM2 es un trastorno metabólico
caracterizado por una marcada resistencia a la insulina en los tejidos blanco; la prevalencia de DM2 presenta grandes diferencias en poblaciones humanas; es muy alta en aquéllas originadas por migraciones que han cambiado su etilo de vida; alcanza niveles hasta del 30% en poblaciones de americanos nativos como los Pima, que presentan la incidencia más alta en el ámbito mundial (1, en contraste con la población británica que sólo alcanza el 2%. Para explicar este fenómeno James Neel propuso la hipótesis del ";;;;genotipo económico";;;; en la cual sugiere que el genotipo que confiere susceptibilidad a DM2 acompañada de obesidad, aparece en los humanos como un genotipo con ventajas evolutivas para períodos de escasez de alimentos, pero es desventajoso cuando la población entra a períodos de abundancia.

Con el fin de probar el efecto que el DNA mitocondrial (mtDNA, puede tener en el genotipo económico nos propusimos evaluar la asociación de polimorfismos en mtDNA y DM2, comparando estadísticamente las frecuencias alélicas y haplotípicas de locipolimórficos en el mtDNA entre un grupo de casos y un grupo control para DM2 en población antioqueña.

Associação de níveis plasmáticos de PAI-1 e polimorfismo 4G/5G em pacientes com doença arterial coronariana PAI-1 4G/5G polymorphism and plasma levels association in patients with coronary artery disease

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Luciana Moreira Lima

2011-12-01

Full Text Available FUNDAMENTO: O polimorfismo 4G/5G do inibidor ativador do plasminogênio tipo 1 (PAI-1 pode influenciar a expressão do PAI-1. Níveis plasmáticos elevados de PAI-1 estão associados com Doença Arterial Coronariana (DAC. OBJETIVO: O presente estudo investigou a influência do polimorfismo 4G/5G do PAI-1 nos níveis plasmáticos de PAI-1 e sua associação com DAC avaliada por angiografia coronária. MÉTODOS: Foi avaliada amostra de sangue de 35 indivíduos com artérias coronárias angiograficamente normais, 31 indivíduos apresentando ateromatose leve/moderada, 57 indivíduos apresentando ateromatose grave e 38 indivíduos saudáveis (controles. Em pacientes e controles, o polimorfismo 4G/5G do PAI-1 foi determinado por amplificação da proteína-C reativa utilizando primers específicos de alelo. Os níveis plasmáticos de PAI-1 foram quantificados pelo ensaio ELISA (American Diagnostica. RESULTADOS: Não houve diferença entre os grupos quanto a sexo, idade e índice de massa corporal. Níveis plasmáticos de PAI-1 e frequência do genótipo 4G/4G mostravam-se significativamente maiores no grupo com ateromatose grave em comparação com os outros grupos (p 70% (p BACKGROUND: Type-1 plasminogen activator inhibitor (PAI-1 4G/5G polymorphism may influence the PAI-1 expression. High plasma levels of PAI-1 are associated with coronary artery disease (CAD. OBJECTIVE: This study investigated the influence of PAI-1 4G/5G polymorphism on plasma PAI-1 levels and its association with CAD assessed by coronary angiography. METHODS: Blood sample of 35 individuals with angiographycally normal coronary arteries, 31 individuals presenting mild/moderate atheromatosis, 57 individuals presenting severe atheromatosis and 38 healthy individuals (controls were evaluated. In patients and controls, the PAI-1 4G/5G polymorphism was determined by PCR amplification using allele-specific primers. Plasma PAI-1 levels were quantified by ELISA assay (American Diagnostica

PENGHUNI SEBAGAI INDIKATOR KEBERADAAN EKSTERNALITAS RUANG NEGATIF

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Happy Indira Dewi

2009-01-01

Full Text Available ABSTRAK. Pembangunan obyek apapun yang tidak terintegrasi dengan lingkungannya seringkali menimbulkan dampak negatif.  Penelitian ini menggunakan studi kasus sebuah Pusat Perbelanjaan Berskala Besar di kota Bandung yaitu Bandung Super Mall (selanjutnya disebut BSM yang dibangun di tengah-tengah kawasan permukiman.   Tujuan dari penelitian ini untuk mengetahui eksternalitas ruang negatif yang timbul akibat pembangunan BSM. Metode penelitian yang digunakan adalah kualitatif dan kuantitatif. Dari penelitian ini dapat diketahui ternyata respon penghuni terhadap keberadaan ruang BSM, dapat menjadi indikator keberadaan eksternalitas ruang negatif BSM.    Kata kunci: eksternalitas, ruang negatif   ABSTRACT. Negative impact will occurred in any disintegrated objects development with their environment. This research has used a case study of City Shopping Mall in Bandung, which known as Bandung Super Mall (BSM, which has been developed in the middle of settlement areas within Bandung. This research is attempted to explore the externality of negative space which has been created from the development of BSM. The research methodologies that have been chosen are qualitative and quantitative. The research will deliver many responses about the existence of BSM space. These are will be used as indicator of the existence negative space externality of BSM.   Keywords: externality, negative space

Molecular characterization using ISSR primers of Magnolia mexicana DC. from two regions in Zongolica, Veracruz, Mexico

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jessica M. Medrano-Hernández

2017-01-01

Full Text Available Introducción: Magnolia mexicana DC . es una especie amenazada según la NOM-059-SEMARNAT-2010, situación atribuida a la fragmentación y destrucción del hábitat. No existen estudios sobre la diversidad genética de M. mexicana, a pesar de que es endémica de nuestro país. Objetivo: Evaluar la variabilidad genética en dos poblaciones de M. mexicana mediante marcadores moleculares tipo ISSR. Materiales y métodos: Las colectas provienen de Amatitla y Zapotla en Zongolica, Veracruz. El ADN se extrajo de las hojas jóvenes. Se probaron 55 iniciadores ISSR, se seleccionaron los 10 que produjeron mayor número de bandas con polimorfismo y se amplificaron por PCR. Resultados y discusión: Los iniciadores ISSR mostraron 86 % de polimorfismo. El análisis de agrupamiento, con el método de varianza mínima de Ward, fue capaz de separar las colectas por su procedencia geográfica. El análisis de varianza molecular demostró que la mayor variabilidad (90.88 % se encuentra dentro de cada población. El índice de diversidad de Shannon-Weaver fue de 0.47 y 0.41 para Amatitla y Zapotla, respectivamente. Conclusión: Las poblaciones de M. mexicana no han sufrido cambios en su estructura genética; no hay evidencia, a nivel genético, de alteraciones ocasionadas por la reducción de poblaciones o fragmentación del hábitat.

Poliformismo e expressão gênica da leptina em bovinos superprecoces

OpenAIRE

Salman, Ana Karina Dias [UNESP

2003-01-01

Este estudo foi conduzido com novilhos pertencentes a diferentes grupos genéticos, Angus x Nelore (n=31), Simental x Nelore (n=30) e Canchim (n=30), objetivando identificar SSCPs (Polimorfismos de Conformação de Cadeia Simples) e RFLP (Polimorfismo no Comprimento do Fragmento de Restrição) no gene da obesidade e relacionar esses polimorfismos com a área-de-olho-de-lombo (AOL) e a espessura de gordura subcutânea (EGS) na carcaça. Cinco pares de oligonucleotídeos iniciadores foram desenhados co...

Towards a plant-wide Benchmark Simulation Model with simultaneous nitrogen and phosphorus removal wastewater treatment processes

DEFF Research Database (Denmark)

Flores-Alsina, Xavier; Ikumi, David; Batstone, Damien

It is more than 10 years since the publication of the Benchmark Simulation Model No 1 (BSM1) manual (Copp, 2002). The main objective of BSM1 was creating a platform for benchmarking carbon and nitrogen removal strategies in activated sludge systems. The initial platform evolved into BSM1_LT and BSM....... This extension aims at facilitating simultaneous carbon, nitrogen and phosphorus (P) removal process development and performance evaluation at a plant-wide level. The main motivation of the work is that numerous wastewater treatment plants (WWTPs) pursue biological phosphorus removal as an alternative...... to chemical P removal based on precipitation using metal salts, such as Fe or Al. This paper identifies and discusses important issues that need to be addressed to upgrade the BSM2 to BSM2-P, for example: 1) new influent wastewater characteristics; 2) new (bio) chemical processes to account for; 3...

Determination of the Effects of Nutrient sources on Enhancement of Crop Tolerance to Bean Root Rot and Bean Stem Maggot in Western Kenya

International Nuclear Information System (INIS)

Otsyula, R.M.; Nderitu, J.H.

1999-01-01

Field bean phaseolus vulgaris tolerance to root rot (BRR) and bean stem maggot (BSM) is enhanced by improvement of soil nutrients. Organic and inorganic sources of soil nutrients were evaluated in this study to determine their effects on crop tolerance to BRR and BSM. Three variety of GLP 585 susceptible to BRR and BSM; GLP X92 tolerant to BRR and BSM; and KK-8 resistant to BRR and BSM were used. The study was conducted in farmer's field with high level of BRR and BSM over three seasons in a split plot design. Nutrient sources were laid down in main plots while varieties were in subplots. KK-8 gave the highest plant survival and yield over the seasons. GLP 585 had the lowest mean yield and plant survival. Crop tolerance was greatly improved by application of DAP as applied as nutrient sources and varieties for crop tolerance were identified

Interaction by known beta cell loci on the association of antihypertensive drug therapies with hyperglycemia in the Framingham Offspring Study

OpenAIRE

Miguel y Yanes, José María de

2013-01-01

Antecedentes: Los polimorfismos de nucleótido simple (SNPs) comunes asociados a función de célula beta y la hipertensión o su tratamiento podrían interaccionar con la variación en el tiempo en la glucosa en ayunas (ΔGA) o la aparición de diabetes mellitus tipo 2 (DM-2). Métodos: Agrupamos datos de 3.471 participantes del Estudio Descendencia de Framingham en 6 períodos de ~4 años (15.852 personas-examen; edad media 52 años, 54% mujeres). Definimos tres exposiciones de hipertensión: 1) hiperte...

Peces del Noroeste del Ecuador

OpenAIRE

Barriga, Ramiro

1994-01-01

La ictiofauna del occidente del Ecuador es poco conocida. Los peces del noroccidente son diferentes a los del suroccidente del Ecuador. 34 familias y 82 especies fueron colectadas que equivale al 11 % de las especies de peces continentales registradas en el Ecuador. Icteogeográficamente se sabe que la costa ecuatoriana posee dos provincias: la del Pacifico Norte y la del Guayas, se determinó que el límite de las dos provincias es el río Santiago ya que las especies del mencionado río so...

Genotipificación de los polimorfismos -511, -31 y +3954 del gen de la interleucina-1β humana en una población colombiana con cuadro de dispepsia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

María Teresa Arango

2010-08-01

Conclusión. No se encontraron diferencias significativas en los genotipos de los individuos infectados y los no infectados por H. pylori, a excepción del genotipo CC en la región polimórfica -31, el cual se encontró con mayor frecuencia en los pacientes con enfermedades benignas.

Cow biological type affects ground beef colour stability.

Science.gov (United States)

Raines, Christopher R; Hunt, Melvin C; Unruh, John A

2009-12-01

To determine the effects of cow biological type on colour stability of ground beef, M. semimembranosus from beef-type (BSM) and dairy-type (DSM) cows was obtained 5d postmortem. Three blends (100% BSM, 50% BSM+50% DSM, 100% DSM) were adjusted to 90% and 80% lean points using either young beef trim (YBT) or beef cow trim (BCT), then packaged in high oxygen (High-O(2); 80% O(2)) modified atmosphere (MAP). The BSM+YBT patties had the brightest colour initially, but discoloured rapidly. Although DSM+BCT patties had the darkest colour initially, they discoloured least during display. Metmyoglobin reducing ability of ground DSM was up to fivefold greater than ground BSM, and TBARS values of BSM was twofold greater than DSM by the end of display (4d). Though initially darker than beef cow lean, dairy cow lean has a longer display colour life and may be advantageous to retailers using High-O(2) MAP.

Farmacogenética: importancia de la determinación del fenoticpo acetilador Pharmacogenitecs: importance of acetylating phenotype determination

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Alvaro Perez Arcila

1994-02-01

Full Text Available

El campo de la investigación relacionado con las respuestas de base hereditaria a las drogas se ha denominado farmacogenética. Se han descrito al menos 60 polimorfismos farmacogenéticos en la medicina clínica; muchos de ellos son responsables de las marcadas diferencias en la predisposición gen ética para

desarrollar toxicidad por drogas O cáncer. En este momento los polimorfismos de mayor atención son los de la debrisoquina-esparteína y de la N-acetilación por el gran número de fármacos de prescripción común y de aminas carcinogénicas que utilizan estas enzimas para su inactivación.

Research concerning hereditary basis of response to drugs is known as pharmacogenetics; at least 60 pharmacogenetic polymorphisms have been described in clinical medicine; many of them are responsible for marked differences in predisposition towards drug toxicity or cancer. The debrisoquine.esparteine and the N-acetylation polymorphisms are presently the most important, since they involve both many frequently prescribed drugs, and carcinogenic amines that use this enzyme for inactivation.

Caracterización Citogenética y Aproximación Taxonómica en Individuos del Género Lagothrix en Colombia (Primates: Atelidae.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

LAURA YISSEL RENGIFO

2011-05-01

Full Text Available El género Lagothrix se encuentra representado en Colombia por Lagothrix lagotricha lagotricha y Lagothrix lagotricha lugens y siendo un género llamativo para el tráfico y caza, se han realizado varios trabajos encaminados a conocer sobre su ecología y ciclo de vida mostrando la importancia de este género en el ecosistema aunque sus características citogenéticas no han sido bien estudiadas. En este trabajo se analizaron 18 individuos (6 L. l. lugens y 12 L. l. lagothricha en cautiverio provenientes de zoológicos y de centros de rescate, en donde por medio de técnicas de cultivo de sangre periférica y de bandeo cromosómico G, C, R, Q y NOR se determinó un cariotipo estándar de 2n=62 para todos los individuos con dos variantes de éste cariotipo o también conocidos como cariomorfos que se originan por la diferencia en su número fundamental (NF, debido a una inversión pericéntrica en el par cromosómico 24. Dentro de estos cariomorfos se encontraron polimorfismos en varios pares cromosómicos que no fueron determinantes para diferenciar subespecies en los individuos trabajados, por lo que se recomienda revisar la taxonomía del género.

ColliderBit. A GAMBIT module for the calculation of high-energy collider observables and likelihoods

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Balazs, Csaba [Monash University, School of Physics and Astronomy, Melbourne, VIC (Australia); Australian Research Council Centre of Excellence for Particle Physics at the Tera-scale (Australia); Buckley, Andy [University of Glasgow, SUPA, School of Physics and Astronomy, Glasgow (United Kingdom); Dal, Lars A.; Krislock, Abram; Raklev, Are [University of Oslo, Department of Physics, Oslo (Norway); Farmer, Ben [AlbaNova University Centre, Oskar Klein Centre for Cosmoparticle Physics, Stockholm (Sweden); Jackson, Paul; Murnane, Daniel; White, Martin [Australian Research Council Centre of Excellence for Particle Physics at the Tera-scale (Australia); University of Adelaide, Department of Physics, Adelaide, SA (Australia); Kvellestad, Anders [NORDITA, Stockholm (Sweden); Putze, Antje [Universite de Savoie, LAPTh, Annecy-le-Vieux (France); Rogan, Christopher [Harvard University, Department of Physics, Cambridge, MA (United States); Saavedra, Aldo [Australian Research Council Centre of Excellence for Particle Physics at the Tera-scale (Australia); The University of Sydney, Faculty of Engineering and Information Technologies, Centre for Translational Data Science, School of Physics, Sydney, NSW (Australia); Scott, Pat [Imperial College London, Blackett Laboratory, Department of Physics, London (United Kingdom); Weniger, Christoph [University of Amsterdam, GRAPPA, Institute of Physics, Amsterdam (Netherlands); Collaboration: The GAMBIT Scanner Workgroup

2017-11-15

We describe ColliderBit, a new code for the calculation of high energy collider observables in theories of physics beyond the Standard Model (BSM). ColliderBit features a generic interface to BSM models, a unique parallelised Monte Carlo event generation scheme suitable for large-scale supercomputer applications, and a number of LHC analyses, covering a reasonable range of the BSM signatures currently sought by ATLAS and CMS. ColliderBit also calculates likelihoods for Higgs sector observables, and LEP searches for BSM particles. These features are provided by a combination of new code unique toColliderBit, and interfaces to existing state-of-the-art public codes. ColliderBit is both an important part of the GAMBIT framework for BSM inference, and a standalone tool for efficiently applying collider constraints to theories of new physics. (orig.)

Pramana – Journal of Physics | Indian Academy of Sciences

Indian Academy of Sciences (India)

In this talk, I shall first discuss the Standard Model Higgs mechanism and then highlight some of its deficiencies making a case for the need to go beyond the Standard Model (BSM). The BSM tour will be guided by symmetry arguments. I shall pick up four specific BSM scenarios, namely, supersymmetry, little Higgs, ...

Polimorfismos genéticos de aislamientos del género Malassezia obtenidos en Colombia de pacientes con lesión dermatológica y sin ella.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Adriana M. Celis

2005-12-01

Full Text Available Introducción. Las especies del género Malassezia se consideran levaduras oportunistas emergentes de gran importancia. Han sido asociadas a diferentes patologías dermatológicas y sistémicas de las cuales se aislan una o más especies de este género. El papel de estas levaduras en las enfermedades dermatológicas no se ha aclarado completamente, ya que la Malassezia spp. pertenece a la flora normal de la piel. Objetivo. Buscar marcadores genéticos en los aislamientos de Malassezia spp. que permitan correlacionar las lesiones dermatológicas con las especies aisladas. Materiales y métodos. Se obtuvieron 103 aislamientos de Malassezia spp. a partir de muestras de pacientes con pitiriasis versicolor, dermatitis seborreica, dermatitis seborreica en pacientes positivos para VIH, dermatitis atópica, y de individuos sanos. Para los controles se usaron ocho cepas del Centraalbureau voor Schimmelcultures (CBS, Holanda. El perfil genético se realizó utilizando la técnica de ADN polimórfico amplificado aleatorio (RAPD con tres iniciadores (OPA2, OPA4, OPA13. Los datos obtenidos se analizaron con los programas Diversity Database y SYN-TAX-PC. Resultados. Se observó heterogeneidad genética intraespecífica en Malassezia furfur, Malassezia globosa, Malassezia restricta, Malassezia slooffiae y Malassezia obtusa, mientras que Malassezia sympodialis mostró mayor homogeneidad. Conclusión. No se determinó ningún patrón genético específico mediante la técnica de RAPD para las especies de Malassezia que se pudiera relacionar con la entidad dermatológica implicada.

O polimorfismo A1166C do receptor tipo 1 da angiotensina II no infarto agudo do miocárdio The A1166C polymorphism of the angiotensin II type-1 receptor in acute myocardial infarction

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Messias Antônio de Araújo

2004-11-01

Full Text Available RESUMO OBJETIVO:Avaliar a associação do polimorfismo A1166C do gene do receptor AT1 da angiotensina II (AT1R com o infarto agudo do miocárdio e a severidade da doença arterial coronariana. MÉTODOS: Estudo prospectivo, transversal de 110 pacientes com infarto agudo do miocárdio submetidos à angiografia coronariana com lesão significante (> 50% avaliada por três critérios de severidade: número de vasos lesados, morfologia da placa aterosclerótica e escore de risco coronariano. Sem lesões coronarianas 104 indivíduos controles. O polimorfismo A1166C do gene do AT1R foi determinado pela reação em cadeia da polimerase no DNA dos leucócitos do sangue periférico. Os fatores de risco coronariano clássicos foram analisados em todos os indivíduos. RESULTADOS: Na estratificação dos genótipos em relação aos fatores de risco apenas o tabagismo teve predominância nos heterozigotos AC (p = 0,02. A freqüência dos genótipos nos pacientes infartados foi de AA = 54,5%; AC = 35,5% e CC = 10%, sendo similar e não significativa em relação aos controles (p = 0,83. Não houve aumento do risco de infarto agudo do miocárdio nas comparações dos genótipos CC vs AA (OR = 1,35; IC-95% = 0,50 - 3,59, AC vs AA (OR = 1,03; IC-95% = 0,58 - 1,84 e AA+AC vs AA (OR = 1,33; IC-95% = 0,51 - 3,45. Nenhum dos critérios de severidade teve associação significativa com os genótipos. CONCLUSÃO: Os nossos resultados indicam não haver associação do polimorfismo A1166C do AT1R com o infarto agudo do miocárdio e nem com a severidade da doença arterial coronariana segundo nossos resultados.OBJECTIVE: To assess the association of the A1166C polymorphism of the angiotensin II type-1 receptor (AT1R gene with acute myocardial infarction and also with the severity of coronary artery disease. METHODS: A prospective, cross-sectional study was carried out with 110 patients with acute myocardial infarction, who, on coronary angiography, had significant

Silver Nanoparticles Complexed with Bovine Submaxillary Mucin Possess Strong Antibacterial Activity and Protect against Seedling Infection.

Science.gov (United States)

Makarovsky, Daria; Fadeev, Ludmila; Salam, Bolaji Babajide; Zelinger, Einat; Matan, Ofra; Inbar, Jacob; Jurkevitch, Edouard; Gozin, Michael; Burdman, Saul

2018-02-15

A simple method for the synthesis of nanoparticles (NPs) of silver (Ag) in a matrix of bovine submaxillary mucin (BSM) was reported previously by some of the authors of this study. Based on mucin characteristics such as long-lasting stability, water solubility, and surfactant and adhesive characteristics, we hypothesized that these compounds, named BSM-Ag NPs, may possess favorable properties as potent antimicrobial agents. The goal of this study was to assess whether BSM-Ag NPs possess antibacterial activity, focusing on important plant-pathogenic bacterial strains representing both Gram-negative ( Acidovorax and Xanthomonas ) and Gram-positive ( Clavibacter ) genera. Growth inhibition and bactericidal assays, as well as electron microscopic observations, demonstrate that BSM-Ag NPs, at relatively low concentrations of silver, exert strong antimicrobial effects. Moreover, we show that treatment of melon seeds with BSM-Ag NPs effectively prevents seed-to-seedling transmission of Acidovorax citrulli , one of the most threatening pathogens of cucurbit production worldwide. Overall, our findings demonstrate strong antimicrobial activity of BSM-Ag NPs and their potential application for reducing the spread and establishment of devastating bacterial plant diseases in agriculture. IMPORTANCE Bacterial plant diseases challenge agricultural production, and the means available to manage them are limited. Importantly, many plant-pathogenic bacteria have the ability to colonize seeds, and seed-to-seedling transmission is a critical route by which bacterial plant diseases spread to new regions and countries. The significance of our study resides in the following aspects: (i) the simplicity of the method of BSM-Ag NP synthesis, (ii) the advantageous chemical properties of BSM-Ag NPs, (iii) the strong antibacterial activity of BSM-Ag NPs at relatively low concentrations of silver, and (iv) the fact that, in contrast to most studies on the effects of metal NPs on plant pathogens

Is MTHFR polymorphism a risk factor for Alzheimer's disease like APOE? Polimorfismo da MTHFR é um fator de risco para demência de Alzheimer como APOE?

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Liana Lisboa Fernandez

2005-03-01

Full Text Available BACKGROUND: The role of methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR gene polymorphisms as risk factors for the occurence of Alzheimer's disease (AD is still controversial: OBJECTIVE: To verify the association between MTHFR and apolipoprotein E (APOE polymorphisms and Alzheimer's disease. METHOD: This work was conducted as a case-control study. Cases included thirty patients with probable AD. Controls were constituted by 29 individuals without dementia according to neuropsychological tests paired to age, sex, race and educational level. DNA was isolated from peripheral leukocytes of anticoagulated venous blood. Genotyping of APOE and MTHFR were performed by DNA amplification and digestion. The frequences of APOE and MTHFR genotypes were submitted by chi-square test corrected by Fisher test; the APOE genotypes, to chi-square linear tendency test and the frequences of MTHFR mutant and AD, by stratificated anlysis adjust by Mantel-Haenszel method. RESULTS: There was significant difference about APOE4 and APOE2 in the groups. (p=0.002 The odds ratio increased exponentially with the increased number of E4 allele (chi2 linear tendency test. No significant difference was detected on MTHFR genotypes in both case and control groups. CONCLUSION: The APOE4 is a risk factor and demonstrated a dose-depenent effect while APOE2 allele conferred a protection to AD. The MTHFR mutation had no correlation with AD.INTRODUÇÃO: O papel do polimorfismo do gene da metilenotetrahidrofolato redutase (MTHFR como um fator de risco para demência de Alzheimer (DA é controverso ainda. OBJETIVO: Verificar a associação entre os polimorfismos da MTHFR e apolipoproteína E (APOE e DA. MÉTODO: O trabalho foi conduzido como um estudo caso-controle. Trinta pacientes com DA provável foram incluídos no grupo caso. Vinte e nove indivíduos sem demência comprovadas por testes neuropsicológicos, emparelhados pela idade, sexo, cor e nível educacional constituíram o grupo

Probing into the Interaction of Nicotine and Bovine Submaxillary Mucin: NMR, Fluorescence, and FTIR Approaches

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Xiaoxiang Liao

2016-01-01

Full Text Available Nicotine, the important component of cigarette products, may have an impact on the oral environment after inhalation. The research of interaction between nicotine and bovine submaxillary mucin (BSM contributes to understand the binding mechanism of nicotine and BSM, and the effects of nicotine on the structure and function of the mucin. NMR data demonstrated that the interaction between nicotine and BSM did exist, and it was pyrrolidyl ring of nicotine playing the major role in the binding. The quenching mechanisms of nicotine and BSM in different pH were different: for acidic environment, the quenching was dynamic; while it became static in the alkaline circumstance. Synchronous fluorescence spectra indicated that nicotine had effect on the microenvironment of the Trp rather than Tyr residue. Meanwhile, the impact of nicotine on the conformation of BSM was also confirmed by 3D fluorescence and FTIR spectra.

Phenotypic polomorphism in indigenous strains of sporothrix schenckii Polimorfismo fenotípico de cepas autóctonas de Sporothrix schenckii

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Fernando Montoya Maya

1996-02-01

características de pigmentación. El 85% de las cepas en mycosel fueron café claras, café oscuras, plisadas o plisadas y umbilicadas. Todas las cepas asimilaron D-glucosa, glicerol y D-xilosa en el sistema Api 20C y 25 cepas se clasificaron en 9 biotipos de asimilación de la A a la I. La mayoría de las cepas tanto pigmentadas como albinas, resultaron virulentas para ratones. En éstos predominaron los cuerpos en cigarro en forma de naveta y no se visual izaron cuerpos asteroides en los exudados testiculares. Se demuestra así la gran heterogeneidad fenotípica de las cepas autóctonas de S. schenckii, se plantea la importancia de correlacionar estos hallazgos con los patrones de heterogeneidad gen ética informados por investigadores Japoneses y quizás explicar por esta diversidad fenotípica y genotípica, el polimorfismo clínico de la enfermedad y establecer mapas de distribución de los diferentes biotipos o genotipos en Colombia y América Latina. Incluso el cruzar cepas distantes en su biotipo o genotipo podría facilitar la obtención de la forma de reproducción sexual del microorganismo.

La superaci??n del modelo del ??ngel del hogar:

OpenAIRE

Hurtado Mu??oz, M??nica

2012-01-01

La Tesis Doctoral titulada "La superaci??n del modelo del "??ngel del hogar". Recuperaci??n de la escritora Leonor Canalejas y Fustegueras (1869-1945)" aborda, en primer lugar, un an??lisis sociol??gico de las circunstancias que rodearon a la mujer espa??ola en el cambio de siglo en el ??mbito social y educativo, en un intento de esclarecer las caracter??sticas propias del contexto en el que la mujer accede a la intelectualidad en general y a la literatura en particular. Esta parte concluye q...

Improved MDCT monitoring of pelvic myeloma bone disease through the use of a novel longitudinal bone subtraction post-processing algorithm

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Horger, Marius; Thaiss, Wolfgang M.; Nikolaou, Konstantin; Kloth, Christopher [Eberhard-Karls-University Tuebingen, Department of Diagnostic and Interventional Radiology, Tuebingen (Germany); Ditt, Hendrik [Sector Imaging and Interventional Radiology, Siemens AG Healthcare, Forchheim (Germany); Weisel, Katja [Eberhard-Karls-University Tuebingen, Department of Internal Medicine II, Tuebingen (Germany); Fritz, Jan [Johns Hopkins University School of Medcine, Russell H. Morgan Department of Radiology and Radiological Science, Baltimore, MD (United States); Liao, Shu [Siemens Medical Solutions, Malvern, PA (United States)

2017-07-15

To evaluate the diagnostic performance of a novel CT post-processing software that generates subtraction maps of baseline and follow-up CT examinations in the course of myeloma bone lesions. This study included 61 consecutive myeloma patients who underwent repeated whole-body reduced-dose MDCT at our institution between November 2013 and June 2015. CT subtraction maps classified a progressive disease (PD) vs. stable disease (SD)/remission. Bone subtraction maps (BSMs) only and in combination with 1-mm (BSM+) source images were compared with 5-mm axial/MPR scans. Haematological response categories at follow-up were: complete remission (n = 9), very good partial remission (n = 2), partial remission (n = 17) and SDh (n = 19) vs. PDh (n = 14). Five-millimetre CT scan yielded PD (n = 14) and SD/remission (n = 47) whereas bone subtraction + 1-mm axial scans (BSM+) reading resulted in PD (n = 18) and SD/remission (n = 43). Sensitivity/ specificity/accuracy for 5-mm/1-mm/BSM(alone)/BSM + in ''lesion-by-lesion'' reading was 89.4 %/98.9 %/98.3 %/ 99.5 %; 69.1 %/96.9 %/72 %/92.1 % and 83.8 %/98.4 %/92.1 %/98.3 %, respectively. The use of BSM+ resulted in a change of response classification in 9.8 % patients (n = 6) from SD to PD. BSM reading is more accurate for monitoring myeloma compared to axial scans whereas BSM+ yields similar results with 1-mm reading (gold standard) but by significantly reduced reading time. (orig.)

Improved MDCT monitoring of pelvic myeloma bone disease through the use of a novel longitudinal bone subtraction post-processing algorithm

International Nuclear Information System (INIS)

Horger, Marius; Thaiss, Wolfgang M.; Nikolaou, Konstantin; Kloth, Christopher; Ditt, Hendrik; Weisel, Katja; Fritz, Jan; Liao, Shu

2017-01-01

To evaluate the diagnostic performance of a novel CT post-processing software that generates subtraction maps of baseline and follow-up CT examinations in the course of myeloma bone lesions. This study included 61 consecutive myeloma patients who underwent repeated whole-body reduced-dose MDCT at our institution between November 2013 and June 2015. CT subtraction maps classified a progressive disease (PD) vs. stable disease (SD)/remission. Bone subtraction maps (BSMs) only and in combination with 1-mm (BSM+) source images were compared with 5-mm axial/MPR scans. Haematological response categories at follow-up were: complete remission (n = 9), very good partial remission (n = 2), partial remission (n = 17) and SDh (n = 19) vs. PDh (n = 14). Five-millimetre CT scan yielded PD (n = 14) and SD/remission (n = 47) whereas bone subtraction + 1-mm axial scans (BSM+) reading resulted in PD (n = 18) and SD/remission (n = 43). Sensitivity/ specificity/accuracy for 5-mm/1-mm/BSM(alone)/BSM + in ''lesion-by-lesion'' reading was 89.4 %/98.9 %/98.3 %/ 99.5 %; 69.1 %/96.9 %/72 %/92.1 % and 83.8 %/98.4 %/92.1 %/98.3 %, respectively. The use of BSM+ resulted in a change of response classification in 9.8 % patients (n = 6) from SD to PD. BSM reading is more accurate for monitoring myeloma compared to axial scans whereas BSM+ yields similar results with 1-mm reading (gold standard) but by significantly reduced reading time. (orig.)

IDENTIFICACIÓN DE DELECIONES EN AFECTADOS DE DISTROFIA MUSCULAR DE DUCHENNE Y BECKER (DMD/DMB Y DIAGNÓSTICO DE PORTADORAS POR METODOLOGÍAS MOLECULARES

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Patricia Hernández Rodríguez

2002-06-01

Full Text Available Se diseñó un ensayo de PCR múltiplex (6-plex que amplifica simultáneamente 6 exones del gen de la distrofina, estos exones son los que presentan mayor frecuencia de mutación. La proporción de deleciones observada en este estudio mediante el sistema 6-plex correspondió al31,25%, además el60% del total de las deleciones involucró los exones 44 al 52. Con el fin de identificar mujeres portadoras de DMD y DMB se utilizó el cálculo de dosis génica, a través de esta metodología fueron identificadas 7 mujeres como portadoras y 15 como no portadoras de deleción para los exones analizados, en este estudio no se encontró ninguna mujer como portadora de duplicación. Con la utilización de polimorfismos dinucleotídicos (CAn localizados en el interior del gen fue posible establecer inforrnación sobre el cromosoma X que posiblemente está afectado en el 63% de las mujeresanalizadas.

Effect of vitamin D3 supplementation and influence of BsmI polymorphism of the VDR gene of the inflammatory profile and oxidative stress in elderly women with vitamin D insufficiency: Vitamin D3 megadose reduces inflammatory markers.

Science.gov (United States)

de Medeiros Cavalcante, Isa Gabriela; Silva, Alexandre Sérgio; Costa, Maria José Carvalho; Persuhn, Darlene Camati; Issa, Chahira Taha Mahd Ibrahim; Issa, ChariraTahaMad Ibraim; de Luna Freire, Tiago Lima; da Conceição Rodrigues Gonçalves, Maria

2015-06-01

This study aimed to evaluate the effect of vitamin D3 megadose supplementation and influence of BsmI polymorphism in the VDR gene on the inflammatory profile and oxidative stress in elderly women with vitamin D deficiency. A double blind, randomized, placebo-controlled trial was conducted with 40 elderly women (aged 68±6 years) diagnosed with vitamin D insufficiency (24.7±3.1 ng/mL). Participants were distributed into a supplementation group that received 200,000 IU of vitamin D3 (SG; n=20) and a placebo group (PG; n=20). Blood samples were collected at baseline and after intervention to analyse the 25(OH)D, parathyroid hormone, serum calcium, ultra-sensitive C-reactive protein (us-CRP), alpha 1-acid glycoprotein (AGP-A), total antioxidant capacity (TAC), and malondialdehyde (MDA) levels, as well as the renal and hepatic function, and genotyping was performed for BsmI polymorphism. Four weeks after supplementation, elderly women in the SG group showed a significant increase in the serum concentration of 25(OH)D (25.29±2.8 to 31.48±6.0; p=0.0001), which was followed by increased TAC (65.25±15.66 to 71.83±10.71; p=0.03) and decreased serum PTH (46.32±13.2 to 35.45±11.0; p=0.009), us-CRP (0.38±0.3 to 0.19±0.1; p=0.007) and AGP-A levels (75.3±15.4 to 61.1±5.9; p=0.005). Changes in BP, ANAC and MDA were not observed. The 25(OH)D and PTH, us-CRP and AGP-A levels of participants with the BB/Bb genotype were more responsive to supplementation, but their other markers did not change. Supplementation with a vitamin D3 megadose reduced inflammatory markers and increased the total antioxidant capacity in elderly women with vitamin D insufficiency. The 25(OH)D, PTH, us-CRP and AGP-A levels of elderly patients with the BB/Bb genotype were more responsive to supplementation compared with those with the bb genotype. Copyright © 2015 Elsevier Inc. All rights reserved.

Discovery Physics at the LHC

CERN Document Server

Höcker, A

2006-01-01

Introductory lecture to the phenomenology of, and the LHC search for physics beyond the Standard Model (BSM). The first lecture discusses the empirical and theoretical reasons that require BSM physics, and how Supersymmetry, extra dimension and little Higgs models can cope with these. The second lecture introduces the experimental approaches adopted by ATLAS and CMS to search for BSM physics signals, and to measure some of their properties.

A case-control association study between Obsessive-Compulsive Disorder (OCD and the MCP-1 -2518G/A polymorphism in a Chinese sample Estudo de associação de casos-controle entre Transtorno Obsessivo-Compulsivo (TOC e polimorfismo MCP-1 -2518G/A em uma coorte chinesa

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Xinhua Zhang

2012-12-01

Full Text Available OBJECTIVE: To investigate the association between Obsessive-Compulsive Disorder (OCD and a functional polymorphism of MCP-1 in the Chinese Han population. METHOD: We genotyped and performed a case-control association analysis of the MCP-1 -2518G/A polymorphism in 200 OCD patients and 294 healthy control subjects. RESULTS: There was no significant difference in MCP-1 -2518G/A genotypic and allelic frequencies between OCD cases and controls (x² = 1.123, df = 2, P = 0.57 by genotype; x² = 0.802, df = 1, P = 0.37 by allele. CONCLUSIONS: Our results indicated that MCP-1 -2518G/A may not play a major role in the genetic predisposition of the Chinese Han population to OCD. However, further studies using a larger number of subjects are required to obtain a clear conclusion.OBJETIVO: Investigar a relação entre Transtorno Obsessivo-Compusilvo (TOC e um polimorfismo funcional de MCP-1 na população chinesa de etnia Han. MÉTODOS: Determinamos os genótipos e realizamos uma análise de associações de casos-controle de polimorfismo MCP-1 -2518G/A em 200 indivíduos com TOC e 294 indivíduos saudáveis (controle. RESULTADOS: Não houve diferença significativa no genótipo MCP-1 -2518G/A e nas frequências alélicas entre casos de TOC e controles (x² = 1,123, df = 2, P = 0,57 por genotipo; x² = 0,802, df = 1, P = 0,37 por alelo. CONCLUSÕES: Nossos resultados indicaram que MCP-1 -2518G/A pode não ter grande participação na predisposição genética da etnia Han no que diz respeito ao TOC. Contudo, novos estudos com um maior número de indivíduos são necessários para uma conclusão mais clara.

Estudio del polimorfismo de debrisoquina en una muestra de la población cubana Study of debrisoquine polymorphism in a sample of the Cuban population.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Mayra Álvarez Corredera

2005-04-01

Full Text Available Las diferencias en la capacidad con que cada individuo metaboliza una droga por una vía determinada tiene relevancia clínica para medicamentos de amplio uso, de estrecho margen de seguridad, si esa es la principal vía en la eliminación de la droga, o si el número de alternativas terapéuticas es limitada; por tanto, la información farmacogenética es esencial en la terapéutica individualizada y contribuye a un uso racional de medicamentos. Como el citocromo P4502D6 (CYP2D6 cataliza más del 65 % de los fármacos comúnmente empleados en la práctica habitual, se propusó identificar la presencia de diferentes fenotipos metabolizadores del CYP2D6 en una muestra de 104 sujetos de la población cubana. Se determinó la razón metabólica entre las concentraciones urinarias de debrisoquina y su metabolito 4OH-debrisoquina, cuantificados mediante cromatografía líquida de alta resolución. Se encontró que el 3,84 % de los individuos estudiados son metabolizadores lentos.The differences in the capacity with which every individual metabolises a drug by a specific route has a clinical relevance for widely used drugs of a narrow safety range if that is the main route in the elimination of the drug, or if the number of therapeutic alternatives is limited; therefore, the pharmacogenetic information is essential in the personalized therapeutics and it contributes to a rational use of drugs. As the cytochrome P4502D6 (CYP2D6 catalyzes more than 65% of the commonly used drugs, the aim of this paper was to identify different CYP2D6 metabolising phenotypes in a sample of 104 subjects of the Cuban population by determining the metabolic ratio between urinary concentrations of debrisoquine and its metabolite 4OH-debrisoquine, quantified by high performance liquid chromatography. We found that 3.84% of the individuals studied were slow metabolisers.

Biomass Scenario Model Documentation: Data and References

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Lin, Y.; Newes, E.; Bush, B.; Peterson, S.; Stright, D.

2013-05-01

The Biomass Scenario Model (BSM) is a system dynamics model that represents the entire biomass-to-biofuels supply chain, from feedstock to fuel use. The BSM is a complex model that has been used for extensive analyses; the model and its results can be better understood if input data used for initialization and calibration are well-characterized. It has been carefully validated and calibrated against the available data, with data gaps filled in using expert opinion and internally consistent assumed values. Most of the main data sources that feed into the model are recognized as baseline values by the industry. This report documents data sources and references in Version 2 of the BSM (BSM2), which only contains the ethanol pathway, although subsequent versions of the BSM contain multiple conversion pathways. The BSM2 contains over 12,000 total input values, with 506 distinct variables. Many of the variables are opportunities for the user to define scenarios, while others are simply used to initialize a stock, such as the initial number of biorefineries. However, around 35% of the distinct variables are defined by external sources, such as models or reports. The focus of this report is to provide insight into which sources are most influential in each area of the supply chain.

A Novel High-Performance Beam-Supported Membrane Structure with Enhanced Design Flexibility for Partial Discharge Detection

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Chenzhao Fu

2017-03-01

Full Text Available A novel beam-supported membrane (BSM structure for the fiber optic extrinsic Fabry-Perot interferometer (EFPI sensors showing an enhanced performance and an improved resistance to the temperature change was proposed for detecting partial discharges (PDs. The fundamental frequency, sensitivity, linear range, and flatness of the BSM structure were investigated by employing the finite element simulations. Compared with the intact membrane (IM structure commonly used by EFPI sensors, BSM structure provides extra geometrical parameters to define the fundamental frequency when the diameter of the whole membrane and its thickness is determined, resulting in an enhanced design flexibility of the sensor structure. According to the simulation results, it is noted that BSM structure not only shows a much higher sensitivity (increased by almost four times for some cases, and a wider working range of fundamental frequency to choose, but also an improved linear range, making the system development much easier. In addition, BSM structure presents a better flatness than its IM counterpart, providing an increased signal-to-noise ratio (SNR. A further improvement of performance is thought to be possible with a step-forward structural optimization. The BSM structure shows a great potential to design the EFPI sensors, as well as others for detecting the acoustic signals.

Historia del Pádel = History of Padel

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Bernardino Javier Sánchez-Alcaraz Martínez

2013-10-01

Full Text Available El presente trabajo resume la historia del deporte del pádel. Existen dos versiones sobre el origen del pádel. La primera versión relaciona los antecedentes del pádel con los de otros deportes de raqueta como el tenis o el bádminton, siendo su origen común el jeu de la paume francés. Posteriormente, surgen variantes en Estados Unidos como el Paddle Tennis y el Platform Tennis, siendo versiones reducidas del tenis, pero con elementos muy comunes al pádel actual. La segunda versión, aprobada por la Federación Internacional de Pádel, afirma que este deporte nació en México, en 1969, a través del empresario Enrique Corcuera.--------------------------------------------------------------------This research summarizes the history of paddle sport. There are two versions about the origin of paddle. The first version relates the history of paddle with other racket sports like tennis or badminton, and its common origin of the Jeu de Paume French. Later, in in the United States, appear two sports called Paddle Tennis and Platform Tennis, which are reduced versions of tennis sport, but these have lot of common characteristics with paddle. The second version, approved by the International Padel Federation, said the sport was born in Mexico in 1969, through the businessman Enrique Corcuera.

Overview of the Biomass Scenario Model

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Peterson, Steve [Lexidyne, LLC, Colorado Springs, CO (United States)

2015-09-01

This report describes the structure of the October 2012 version of the Biomass Scenario Model (BSM) in considerable detail, oriented towards readers with a background or interest in the underlying modeling structures. Readers seeking a less-detailed summary of the BSM may refer to Peterson (2013). BSM aims to provide a framework for exploring the potential contribution of biofuel technologies to the transportation energy supply for the United States over the next several decades. The model has evolved significantly from the prototype developed as part of the Role of Biomass in America" tm s Energy Future (RBAEF) project. BSM represents the supply chain surrounding conversion pathways for multiple fuel products, including ethanol, butanol, and infrastructure-compatible biofuels such as diesel, jet fuel, and gasoline.

In situ adsorption of bovine submaxillary mucin at the mica/aqueous solution interface

International Nuclear Information System (INIS)

Perez, E.; Proust, J.E.; Baszkin, A.; Boissonnade, M.M.

1984-01-01

An in situ adsorption measurement method at the mica/protein solution interface is described. An apparatus especially constructed for this purpose permits direct and continuous measurement of total adsorption (reversible and irreversible) of 14 C-labelled proteins. Bovine submaxillary mucin (BSM), extracted from salivary glands, was acetylated with (CH 3 14 CO) 2 O. The results show the increase of BSM adsorbed on mica surfaces with its concentration in solution and adsorption time. Pseudo plateaux are obtained for all concentrations studied, indicating the formation of thick layers. The loosely bound fraction of adsorbed mucin is proportional to the bulk concentration in solution. The amount of BSM adsorbed increases in the neighbourhood of the isoelectric point of BSM (pH 3). (Auth.)

Potencial del Agua del suelo

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Bustamante Heliodoro

1986-12-01

Full Text Available La energía potencial del agua presenta diferencias de un punto del suelo a otro; esas diferencias son las que originan el movimiento del agua de acuerdo a la tendencia universal de la materia en el sentido de moverse de donde la energía potencial es mayor a donde dicha energía es menor. En el suelo el agua en consecuencia se mueve hacia donde su energía decrece hasta lograr su estado de equilibrio. Se desprende entonces que la cantidad de energía potencial absoluta contenida en el agua, no es importante por sí misma, sino por su relación con la energía en diferentes lugares dentro del suelo. El concepto Potencial de agua del suelo es un criterio para esta energía.

Physicochemical and microstructural properties of a novel edible film synthesized from Balangu seed mucilage.

Science.gov (United States)

Sadeghi-Varkani, Atina; Emam-Djomeh, Zahra; Askari, Gholamreza

2018-03-01

This paper reports the synthesis of a novel edible film from Balangu seed mucilage (BSM) as a new carbohydrate source. Optimal formulation of the proposed edible film was found through fabricating several distinct films with different concentrations of BSM and glycerol. The effect of these formulation variables on the physical, mechanical, thermal, barrier, and microstructural properties of the manufactured films was then investigated. Optimal formulation of the BSM edible film was then determined based on the measured mechanical and barrier characteristics. These characteristics were found to deteriorate with an excessive use of glycerol which caused non-homogeneity of the films as observed through scanning electron micrographs. In-depth analysis of the optimal BSM film properties was performed through investigating its oxygen permeability, Fourier transform infrared spectroscopy, atomic force microscopy, X-ray diffraction, and water sorption isotherm. The superior mechanical and barrier characteristics of the obtained optimal BSM edible film make it a potential candidate for packaging that aim at an extended shelf-life. Copyright © 2017 Elsevier B.V. All rights reserved.

and Antioxidant Activity of Endophytic Fungi from Mahogoni Plant (Swietenia macrophylla King

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Edward J Dompeipen

2015-06-01

Full Text Available Diabetes mellitus is a degenerative disease characterized by hyperglycemia due to insulin insulin deficiency either absoluteor relative. This study was conducted to isolate endophytic fungi from plant twigs mahogany (Swietenia macrophylla King which active as antidiabetic and antioxidant. Antidiabetic activity conducted by using the α-glucosidase inhibitory and antioxidant activity using free radical reduction method with reagent 2.2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH. Isolation of microbes conducted in the media Corn Meal Malt Agar (CMMA and Potato Dextrose Agar (PDA which 7 isolates of fungus in total. Inhibitory activity against α-glucosidase to extract the filtrate and biomass of the isolates A.Sm.2F (72.59 and 92.22%, A.Sm.3F (81.87 and 79.37%, B.Sm.1F (63.40 and 98.84%, B.Sm.2F (65.60 and 62.72%, B.Sm.3F (93.91 and 51.48%, B.Sm.4F (87.48 and 74.64% thus has potential as an antidiabetic activity. B.Sm.1F was the only isolates active as antioxidants with IC50 of 84.41.

Efecto del silicio y plaguicidas en la fertilidad del suelo y rendimiento del arroz

OpenAIRE

Furcal-Beriguete, Parménides; Herrera-Barrantes, Alejandra

2013-01-01

Efecto del silicio y plaguicidas en la fertilidad del suelo y rendimiento del arroz. El objetivo de este trabajo fue evaluar el efecto del silicio en la fertilidad del suelo, la incidencia de enfermedades y plagas insectiles, el rendimiento y la calidad de granos del cultivo de arroz. El estudio se realizó en La Vega, Florencia, San Carlos, Costa Rica entre mayo y octubre en los años 2010 y 2011, en el mismo lote con la variedad CR 4477. Se establecieron cinco tratamientos: silicio al suelo, ...

Caracterización molecular de introducciones colombianas de zapallo Cucurbita moschata

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Javier A. Restrepo S

2008-01-01

Full Text Available Se realizó la caracterización molecular mediante el polimorfismo en la longitud de fragmentos amplificados (AFLP de 121 introducciones de C. moschata, del Banco de Germoplasma del Programa de Investigación en Hortalizas de la Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira, provenientes de ocho departamentos de Colombia. Los datos AFLP se evaluaron utilizando análisis de correspondencia múltiple (ACM, distancia genética, análisis genético con el programa TFPGA y el método de agrupamiento UPGMA. La diversidad genética de estas introducciones fue alta y estuvo de acuerdo con la diversidad morfoagronómica estudiada previamente. Los valores Fst indicaron que existe estructura genética entre la mayoría de las introducciones. La mayoría de la variación genética entre las introducciones se atribuyó a variación entre individuos dentro de cada departamento.

Hypothyroidism modifies morphometry and thyroid-hormone receptor expression in periurethral muscles of female rabbits.

Science.gov (United States)

Sánchez-García, Octavio; Rodríguez-Castelán, Julia; Martínez-Gómez, Margarita; Cuevas, Estela; Castelán, Francisco

2016-11-01

To evaluate the morphometry and thyroid-hormone receptor (TR) expression in pelvic (pubococcygeus, Pcm) and perineal (bulbospongiosus, Bsm) muscles of control and hypothyroid female rabbits. Hypothyroidism was induced administering 0.02% methimazole in the drinking water for one month. Hematoxylin-eosin stained muscle sections were used to evaluate the fiber cross-sectional area (CSA) and the number of peripheral myonuclei per fiber. Immunohistochemistry was used to calculate the proportion of TR immunoreactive nuclei per fiber. Significant differences were considered at a P ≤ 0.05. As compared to control rabbits, hypothyroidism increased the averaged fiber CSA and the myonuclei per fiber in the Bsm. Although the myonuclei number per fiber was also increased in the Pcm, the effect concerning the fiber CSA was only observed in a fraction of the Pcm fibers. Both TRα and TRβ were similarly expressed in the Pcm and Bsm. Hypothyroidism increased the expression of the TRα in the Bsm. Meanwhile, the expression of TR isoforms in the Pcm was not altered. Our findings support that the TR signaling is directly involved in morphometrical changes induced by hypothyroidism in the Pcm and Bsm. The effect of hypothyroidism on the Pcm and Bsm could be related to the different type of fiber and metabolism that these muscles have. Neurourol. Urodynam. 35:895-901, 2016. © 2015 Wiley Periodicals, Inc. © 2015 Wiley Periodicals, Inc.

Determinantes del trabajo infantil y la escolaridad: el caso del Valle del Cauca en Colombia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Sebastián Urueña Abadía

2009-10-01

Full Text Available Colombia, al igual que la mayoría de países latinoamericanos, consciente de las repercusiones sociales y económicas negativas del trabajo infantil, se ha comprometido en la lucha por la erradicación de este fenómeno. Prueba de ello es la ratificación por parte del gobierno colombiano en el año 2007, del Convenio 182 de la OIT sobre la Prohibición de las Peores Formas de Trabajo Infantil y la Acción Inmediata para su Eliminación. En el plano regional, como parte del Plan de Desarrollo del Departamento del Valle del Cauca 2008-2011, se está implementando actualmente una estrategia territorial de erradicación del trabajo infantil en sus 42 municipios. Considerando este panorama, este trabajo indaga cuáles son los determinantes del trabajo infantil y la escolaridad en el departamento del Valle a partir de los datos de la Encuesta Nacional de Calidad de Vida del año 2003. Para el análisis se emplea un modelo econométrico Probit Bivariado, que permite el estudio conjunto e interrelacionado de decisiones diferentes, en este caso la asistencia escolar y el trabajo.

Relaciones filogenéticas de las serpientes del género Conopsis con base en la morfología Phylogenetic relationships of the snake genus Conopsis based on morphology

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Irene Goyenechea

2009-12-01

Full Text Available El género Conopsis es endémico de México y se distribuye desde Chihuahua hasta Oaxaca. Recientemente se estudió su taxonomía, al modificarse su nomenclatura en los últimos años. Estas serpientes colúbridas de hábitos enterradores pueden reconocerse por diversas características, entre las que destaca un surco en por lo menos 1 de los 3 últimos dientes maxilares. El género cuenta con 6 especies reconocidas: C. acuta, C. amphisticha, C. biserialis, C. lineata, C. megalodon y C. nasus. Estudios previos intentaron resolver la filogenia del género con base en caracteres morfológicos, pero debido al polimorfismo encontrado en ellos no hubo resolución. En este estudio se reevaluaron los caracteres morfológicos de Conopsis usando el método de frecuencias generalizadas para obtener una filogenia de las especies que componen el género. Los resultados obtenidos indican que se pueden recobrar las relaciones al interior del género usando el programa Fastmorphology, y que C. nasus y C. megalodon son grupos hermanos que junto con C. biserialis y C. amphisticha forman un clado. Conopsis acuta resultó el taxón más basal del género. Las relaciones de los grupos externos no se resuelven del todo pero los análisis indican que el grupo de los Sonorini no se sustenta.The snake genus Conopsis is endemic to Mexico and is found from Chihuahua to Oaxaca. It has been subject of study on its taxonomy due to recent modifications on its nomenclature. Now, this burrowing snake genus is diagnosed by several characters, standing out a groove in at least 1 of the 3-rear maxillary teeth. It comprises 6 known species: Conopsis acuta, Conopsis amphisticha, Conopsis biserialis, Conopsis lineata, Conopsis megalodon and Conopsis nasus. Previous works using morphological characters tried to solve the phylogenetic relationships between species in the genus but failed due to polymorphisms found in almost all characters studied. In this work those morphological

Beyond the Standard Model

International Nuclear Information System (INIS)

Lykken, Joseph D.

2010-01-01

'BSM physics' is a phrase used in several ways. It can refer to physical phenomena established experimentally but not accommodated by the Standard Model, in particular dark matter and neutrino oscillations (technically also anything that has to do with gravity, since gravity is not part of the Standard Model). 'Beyond the Standard Model' can also refer to possible deeper explanations of phenomena that are accommodated by the Standard Model but only with ad hoc parameterizations, such as Yukawa couplings and the strong CP angle. More generally, BSM can be taken to refer to any possible extension of the Standard Model, whether or not the extension solves any particular set of puzzles left unresolved in the SM. In this general sense one sees reference to the BSM 'theory space' of all possible SM extensions, this being a parameter space of coupling constants for new interactions, new charges or other quantum numbers, and parameters describing possible new degrees of freedom or new symmetries. Despite decades of model-building it seems unlikely that we have mapped out most of, or even the most interesting parts of, this theory space. Indeed we do not even know what is the dimensionality of this parameter space, or what fraction of it is already ruled out by experiment. Since Nature is only implementing at most one point in this BSM theory space (at least in our neighborhood of space and time), it might seem an impossible task to map back from a finite number of experimental discoveries and measurements to a unique BSM explanation. Fortunately for theorists the inevitable limitations of experiments themselves, in terms of resolutions, rates, and energy scales, means that in practice there are only a finite number of BSM model 'equivalence classes' competing at any given time to explain any given set of results. BSM phenomenology is a two-way street: not only do experimental results test or constrain BSM models, they also suggest - to those who get close enough to listen

Beyond the Standard Model

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Lykken, Joseph D.; /Fermilab

2010-05-01

'BSM physics' is a phrase used in several ways. It can refer to physical phenomena established experimentally but not accommodated by the Standard Model, in particular dark matter and neutrino oscillations (technically also anything that has to do with gravity, since gravity is not part of the Standard Model). 'Beyond the Standard Model' can also refer to possible deeper explanations of phenomena that are accommodated by the Standard Model but only with ad hoc parameterizations, such as Yukawa couplings and the strong CP angle. More generally, BSM can be taken to refer to any possible extension of the Standard Model, whether or not the extension solves any particular set of puzzles left unresolved in the SM. In this general sense one sees reference to the BSM 'theory space' of all possible SM extensions, this being a parameter space of coupling constants for new interactions, new charges or other quantum numbers, and parameters describing possible new degrees of freedom or new symmetries. Despite decades of model-building it seems unlikely that we have mapped out most of, or even the most interesting parts of, this theory space. Indeed we do not even know what is the dimensionality of this parameter space, or what fraction of it is already ruled out by experiment. Since Nature is only implementing at most one point in this BSM theory space (at least in our neighborhood of space and time), it might seem an impossible task to map back from a finite number of experimental discoveries and measurements to a unique BSM explanation. Fortunately for theorists the inevitable limitations of experiments themselves, in terms of resolutions, rates, and energy scales, means that in practice there are only a finite number of BSM model 'equivalence classes' competing at any given time to explain any given set of results. BSM phenomenology is a two-way street: not only do experimental results test or constrain BSM models, they also suggest

La superación del modelo del ángel del hogar:

OpenAIRE

Hurtado Muñoz, Mónica

2013-01-01

La Tesis Doctoral titulada "La superación del modelo del "ángel del hogar". Recuperación de la escritora Leonor Canalejas y Fustegueras (1869-1945)" aborda, en primer lugar, un análisis sociológico de las circunstancias que rodearon a la mujer española en el cambio de siglo en el ámbito social y educativo, en un intento de esclarecer las características propias del contexto en el que la mujer accede a la intelectualidad en general y a la literatura en particular. Esta parte concluye que la cr...

ASOCIACIÓN ENTRE NIVELES SÉRICOS DE VITAMINA D, RESPUESTA IgE Y VARIANTES GENÉTICAS DEL GEN DEL RECEPTOR DE LA VITAMINA D EN NIÑOS OBESOS DEL CARIBE COLOMBIANO: UN ESTUDIO DE CASOS Y CONTROLES

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Eduardo A. Egea Bermejo

2016-07-01

Full Text Available

Introducción: Estudios previos han evaluado la relación entre vitamina D y atopía. En pacientes obesos es incierta esta asociación, sin embargo se acepta hoy que polimorfismos en el receptor de vitamina D pueden asociarse con obesidad. Actualmente son escasos los estudios que han buscado esta asociación en grupos en el litoral Caribe.

Objetivo: Analizar la asociación entre los polimorfismos de los SNPs del receptor de vitamina D con la susceptibilidad para obesidad, su influencia en los niveles séricos de vitamina D e IgE en una población infantil.

Metodología: Se realizó un estudio analítico de casos (n=120 y controles (n=182 con niños obesos entre los 5 y 17 años de edad, procedentes de la costa caribe colombiana. Los niveles séricos de 25(OH vitamina D e IgE Total se midieron mediante ELISA. Valores de p<0.05 fueron estadísticamente significativos.

Resultados y conclusiones: Se encontró asociación entre niveles altos de vitamina-D y obesidad infantil. El 48,3% (n=58 de los casos presentaron niveles >100 ng/mL en comparación a un 0,5% (n = 1 de los controles. Ambos grupos presentaron altos niveles de IgE, (317,07±331,5 vs. 280,6±272.7; p = 0,786. Nuestros resultados no mostraron asociación alguna entre las variantes genéticas con los niveles séricos de vitamina-D con IgE total, como tampoco con obesidad. Todos los SNPs estuvieron en equilibrio Hardy-Weingber. Nuestros resultados no muestran asociación de deficiencia de Vitamina D con obesidad en este grupo poblacional, pero sí IgE elevada en la mayoría de la población, sin tener ninguna relación entre ellos. (Rho spearman: 0,023; p = 0,641.

ASSOCIATION BETWEEN SERUM LEVELS OF VITAMIN D, IgE RESPONSE AND GENETIC VARIANTS OF THE GENE FOR VITAMIN D RECEPTOR IN OBESE CHILDREN IN THE COLOMBIAN CARIBBEAN