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Sample records for al gen env

  1. Detección de secuencias homologas al Gen Env del virus del tumor mamario murino (MMTV en Cáncer de mama de pacientes argentinas Detection of murine mammary tumor virus (MMTV env gene-like sequences in breast cancer from Argentine patients

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Stella M. Melana

    2002-08-01

    Full Text Available En los últimos años se ha renovado el interés en la investigación sobre la posible etiología viral del cáncer de mama humano. En publicaciones previas se ha demostrado la presencia de secuencias homólogas al gen env del virus del Tumor Mamario Murino (MMTV en alrededor del 38% de cánceres de mama de mujeres procedentes de Estados Unidos e Italia; estas secuencias están generalmente ausentes en otros tumores y en tejido mamario normal. En el presente trabajo se analizó la presencia de una secuencia de 250 pb similar a la del gen env de MMTV en biopsias de pacientes argentinas con cáncer de mama. Se detectó este fragmento retroviral en el 31% (23/74 de los tumores analizados, mientras que sólo se obtuvo un caso positivo en tejido de mama normal y ninguno en fibroadenomas. En 46 pacientes con cáncer se analizaron células mononucleares de sangre periférica, detectando la secuencia en el 17% (2/12 de las pacientes portadoras de tumores env positivos y en el 3% (1/34 de aquéllas cuyos tumores eran env negativos. Los datos de Argentina son similares a los obtenidos en Estados Unidos e Italia donde la incidencia de cáncer de mama es también semejante. Estos resultados apoyarían la hipótesis de un probable agente viral implicado en la génesis de esta neoplasia y alientan los estudios en marcha.In the last years research on the possible viral etiology of human breast cancer has been revised. Previous studies have demonstrated the presence of a Mouse Mammary Tumor Virus (MMTV env gene-like sequence in about 38% of breast cancers from American and Italian women; these sequences are generally absent in other tumors and in normal mammary tissue. In the present study we have analyzed the presence of a 250-bp sequence of the MMTV env gene in breast cancer biopsies from Argentine patients. The retroviral fragment was present in 31% (23/74 of the tumors, only in one normal mammary tissue and in none of the fibroadenomas analized. Peripheral

  2. Factores genéticos de pacientes con ictus asociados al pronóstico

    OpenAIRE

    Giralt Casellas, Dolors

    2016-01-01

    El objetivo de este trabajo es, utilizando una base de datos de pacientes que han padecido un ictus, encontrar tendencias entre pronóstico al alta y medicamentos que toman los pacientes previamente al ictus. Seguidamente, cruzar los factores genéticos asociados anteriormente con bases de datos del genoma humano para ver los genes asociados a las tendencias encontradas y ver la drogabilidad de los genes. L'objectiu d'aquest treball és, utilitzant una base de dades de pacients que han patit ...

  3. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001702 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001702 ABNY01028851 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + His GTG ...

  4. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001708 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001708 ABNY01042488 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Gly TCC ...

  5. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001716 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001716 ABNY01090914 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA - Gly GCC ...

  6. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001687 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001687 ABNY01010710 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA - Phe GAA ...

  7. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001694 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001694 ABNY01022656 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Val TAC ...

  8. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001699 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001699 ABNY01027832 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA - Tyr GTA ...

  9. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001704 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001704 ABNY01034507 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA - Met CAT ...

  10. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001706 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001706 ABNY01038212 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Ala TGC ...

  11. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001679 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001679 ABNY01001243 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Trp CCA ...

  12. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001712 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001712 ABNY01068626 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA - Arg ACG ...

  13. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001686 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001686 ABNY01010544 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA - Leu TAG ...

  14. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001680 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001680 ABNY01002362 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Trp CCA ...

  15. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001709 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001709 ABNY01042852 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Gln TTG ...

  16. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001683 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001683 ABNY01007198 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA - Met CAT ...

  17. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001681 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001681 ABNY01004105 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Leu TAG ...

  18. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001698 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001698 ABNY01026275 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + His GTG ...

  19. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001685 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001685 ABNY01008451 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Asp GTC ...

  20. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001713 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001713 ABNY01068850 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Cys GCA ...

  1. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001697 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001697 ABNY01025533 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA - Ser TGA ...

  2. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001701 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001701 ABNY01028675 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + His GTG ...

  3. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001691 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001691 ABNY01015907 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Ser GGA ...

  4. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001695 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001695 ABNY01023764 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA - Leu TAG ...

  5. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001689 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001689 ABNY01011527 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA - Gln TTG ...

  6. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001682 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001682 ABNY01006742 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA - Met CAT ...

  7. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001714 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001714 ABNY01072206 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Asn GTT ...

  8. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001693 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001693 ABNY01021289 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Leu TAG ...

  9. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001710 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001710 ABNY01043563 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Ala TGC ...

  10. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001707 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001707 ABNY01038603 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Gly TCC ...

  11. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001700 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001700 ABNY01028239 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA - Leu GAG ...

  12. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001684 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001684 ABNY01007726 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA - Gln TTG ...

  13. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001711 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001711 ABNY01068122 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Asn GTT ...

  14. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001696 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001696 ABNY01024252 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Leu TAG ...

  15. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001715 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001715 ABNY01081602 saltern metagenome; microbial... fraction from plasmids from marine microbial community in low salinity saltern in San Diego, CA + Arg CCG ...

  16. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002027 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002027 ABOL01019614 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + His GTG ...

  17. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001609 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001609 ABNJ01088362 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected at Buena Vista Lagoon in Oceanside, CA + Met CAT ...

  18. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001574 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001574 ABNJ01021258 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected at Buena Vista Lagoon in Oceanside, CA - Leu TAA ...

  19. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002049 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002049 ABOL01033247 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - Leu TAA ...

  20. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002157 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002157 ABOL01346421 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - Ala TGC ...

  1. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002045 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002045 ABOL01029424 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - His GTG ...

  2. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002132 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002132 ABOL01258260 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Lys TTT ...

  3. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002099 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002099 ABOL01173632 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Asp GTC ...

  4. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002048 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002048 ABOL01030883 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + His GTG ...

  5. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001591 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001591 ABNJ01052532 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected at Buena Vista Lagoon in Oceanside, CA - Pro TGG ...

  6. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001608 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001608 ABNJ01079185 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected at Buena Vista Lagoon in Oceanside, CA - Tyr GTA ...

  7. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001624 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001624 ABNJ01130619 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected at Buena Vista Lagoon in Oceanside, CA - Met CAT ...

  8. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002095 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002095 ABOL01163528 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Ile GAT ...

  9. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002100 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002100 ABOL01173734 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - Ile GAT ...

  10. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002186 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002186 ABOL01582464 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + His GTG ...

  11. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001572 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001572 ABNJ01018487 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected at Buena Vista Lagoon in Oceanside, CA + Tyr GTA ...

  12. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002064 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002064 ABOL01058741 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Arg CCT ...

  13. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001573 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001573 ABNJ01020371 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected at Buena Vista Lagoon in Oceanside, CA + Leu CAA ...

  14. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002046 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002046 ABOL01030261 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - His GTG ...

  15. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002063 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002063 ABOL01055660 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - His GTG ...

  16. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002131 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002131 ABOL01253080 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - Ile GAT ...

  17. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002130 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002130 ABOL01252839 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Glu TTC ...

  18. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002171 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002171 ABOL01418533 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Ala GGC ...

  19. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002115 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002115 ABOL01202194 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - Ile GAT ...

  20. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001610 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001610 ABNJ01089745 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected at Buena Vista Lagoon in Oceanside, CA + Lys TTT ...

  1. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002062 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002062 ABOL01054589 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - His GTG ...

  2. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002023 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002023 ABOL01018038 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - His GTG ...

  3. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002117 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002117 ABOL01206716 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Leu CAA ...

  4. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002098 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002098 ABOL01173441 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Gly CCC ...

  5. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001627 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001627 ABNJ01138625 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected at Buena Vista Lagoon in Oceanside, CA - Asn GTT ...

  6. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002028 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002028 ABOL01020878 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + His GTG ...

  7. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002113 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002113 ABOL01199944 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - Ile GAT ...

  8. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002139 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002139 ABOL01268880 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Ile GAT ...

  9. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002114 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002114 ABOL01201499 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Ile GAT ...

  10. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002047 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002047 ABOL01030601 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - His GTG ...

  11. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001625 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001625 ABNJ01132810 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected at Buena Vista Lagoon in Oceanside, CA - Lys TTT ...

  12. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002172 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002172 ABOL01426301 mosquito metageno...me; viral fraction from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - Glu TTC ...

  13. Optimized Gen-II FeCrAl cladding production in large quantity for campaign testing

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Yamamoto, Yukinori [Oak Ridge National Lab. (ORNL), Oak Ridge, TN (United States); Sun, Zhiqian [Oak Ridge National Lab. (ORNL), Oak Ridge, TN (United States); Pint, Bruce A. [Oak Ridge National Lab. (ORNL), Oak Ridge, TN (United States); Terrani, Kurt A. [Oak Ridge National Lab. (ORNL), Oak Ridge, TN (United States)

    2016-06-03

    There are two major objectives in this report; (1) to optimize microstructure control of ATF FeCrAl alloys during tube drawing processes, and (2) to provide an update on the progress of ATF FeCrAl tube production via commercial manufacturers. Experimental efforts have been made to optimize the process parameters balancing the tube fabricability, especially for tube drawing processes, and microstructure control of the final tube products. Lab-scale sheet materials of Gen II FeCrAl alloys (Mo-containing and Nb-containing FeCrAl alloys) were used in the study, combined with a stepwise warm-rolling process and intermediate annealing, aiming to simulate the tube drawing process in a commercial tube manufacturer. The intermediate annealing at 650ºC for 1h was suggested for the tube-drawing process of Mo-containing FeCrAl alloys because it successfully softened the material by recovering the work hardening introduced through the rolling step, without inducing grain coarsening due to recrystallization. The final tube product is expected to have stabilized deformed microstructure providing the improved tensile properties with sufficient ductility. Optimization efforts on Nb-containing FeCrAl alloys focused on the effect of alloying additions and annealing conditions on the stability of deformed microstructure. Relationships between the second-phase precipitates (Fe2Nb-Laves phase) and microstructure stability are discussed. FeCrAl tube production through commercial tube manufacturers is currently in progress. Three different manufacturers, Century Tubes, Inc. (CTI), Rhenium Alloys, Inc. (RAI), and Superior Tube Company, Inc. (STC), are providing capabilities for cold-drawing, warm-drawing, and HPTR cold-pilgering, respectively. The first two companies are currently working on large quantity tube production (expected 250 ft length) of Gen I model FeCrAl alloy (B136Y3, at CTI) and Gen II (C35M4, at RAI), with the process parameters obtained from the experimental efforts. The

  14. Optimized Gen-II FeCrAl cladding production in large quantity for campaign testing

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Yamamoto, Yukinori [Oak Ridge National Lab. (ORNL), Oak Ridge, TN (United States); Sun, Zhiqian [Oak Ridge National Lab. (ORNL), Oak Ridge, TN (United States); Pint, Bruce A. [Oak Ridge National Lab. (ORNL), Oak Ridge, TN (United States); Terrani, Kurt A. [Oak Ridge National Lab. (ORNL), Oak Ridge, TN (United States)

    2016-06-03

    There are two major objectives in this report; (1) to optimize microstructure control of ATF FeCrAl alloys during tube drawing processes, and (2) to provide an update on the progress of ATF FeCrAl tube production via commercial manufacturers. Experimental efforts have been made to optimize the process parameters balancing the tube fabricability, especially for tube drawing processes, and microstructure control of the final tube products. Lab-scale sheet materials of Gen II FeCrAl alloys (Mo-containing and Nb-containing FeCrAl alloys) were used in the study, combined with a stepwise warm-rolling process and intermediate annealing, aiming to simulate the tube drawing process in a commercial tube manufacturer. The intermediate annealing at 650ºC for 1h was suggested for the tube-drawing process of Mo-containing FeCrAl alloys because it successfully softened the material by recovering the work hardening introduced through the rolling step, without inducing grain coarsening due to recrystallization. The final tube product is expected to have stabilized deformed microstructure providing the improved tensile properties with sufficient ductility. Optimization efforts on Nb-containing FeCrAl alloys focused on the effect of alloying additions and annealing conditions on the stability of deformed microstructure. Relationships between the second-phase precipitates (Fe2Nb-Laves phase) and microstructure stability are discussed. FeCrAl tube production through commercial tube manufacturers is currently in progress. Three different manufacturers, Century Tubes, Inc. (CTI), Rhenium Alloys, Inc. (RAI), and Superior Tube Company, Inc. (STC), are providing capabilities for cold-drawing, warm-drawing, and HPTR cold-pilgering, respectively. The first two companies are currently working on large quantity tube production (expected 250 ft length) of Gen I model FeCrAl alloy (B136Y3, at CTI) and Gen II (C35M4, at RAI), with the process parameters obtained from the experimental

  15. ENV 100 UOP course tutorial/tutorialoutlet

    OpenAIRE

    NARESH 1

    2015-01-01

    For more course tutorials visit www.tutorialoutlet.com   ENV 100 Week 1 DQ 1   ENV 100 Week 1 DQ 2   ENV 100 Week 1 DQ 3   ENV 100 Week 1 Assignment Environmental Fundamentals Paper   ENV 100 Week 2 DQ 1   ENV 100 Week 2 DQ 2   ENV 100 Week 2 DQ 3   ENV 100 Week 2 Learning Team Assignment Ecosystems Paper   ENV 100 Week 3 DQ 1   ENV 100 Week 3 DQ 2   ...

  16. ENV 322 ASH Material-env322dotcom

    OpenAIRE

    Sandywilliam1

    2015-01-01

    ENV 322 Entire Course (Ash) For more course tutorials visit www.env322.com ENV 322 Complete Class Business - General Business   Gaia Hypothesis. In Chapter 3, the Gaia hypothesis is introduced. It addresses two hypotheses; (1) life, since its inception, has greatly affected the planetary environment and (2) life has altered Earth’s environment in ways that have allowed life to persist. Do you agree with these two hypotheses? Why or why not? Energy an...

  17. Env 322 ASH Course Tutorial / env322dotcom

    OpenAIRE

    anil14

    2015-01-01

    ENV 322 Entire Course (Ash) For more course tutorials visit www.env322.com ENV 322 Complete Class Business - General Business   Gaia Hypothesis. In Chapter 3, the Gaia hypothesis is introduced. It addresses two hypotheses; (1) life, since its inception, has greatly affected the planetary environment and (2) life has altered Earth’s environment in ways that have allowed life to persist. Do you agree with these two hypotheses? Why or why not? Energy an...

  18. ALV-J GP37 molecular analysis reveals novel virus-adapted sites and three tyrosine-based Env species.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jianqiang Ye

    Full Text Available Compared to other avian leukosis viruses (ALV, ALV-J primarily induces myeloid leukemia and hemangioma and causes significant economic loss for the poultry industry. The ALV-J Env protein is hypothesized to be related to its unique pathogenesis. However, the molecular determinants of Env for ALV-J pathogenesis are unclear. In this study, we compared and analyzed GP37 of ALV-J Env and the EAV-HP sequence, which has high homology to that of ALV-J Env. Phylogenetic analysis revealed five groups of ALV-J GP37 and two novel ALV-J Envs with endemic GP85 and EAV-HP-like GP37. Furthermore, at least 15 virus-adapted mutations were detected in GP37 compared to the EAV-HP sequence. Further analysis demonstrated that three tyrosine-based motifs (YxxM, ITIM (immune tyrosine-based inhibitory motif and ITAM-like (immune tyrosine-based active motif like associated with immune disease and oncogenesis were found in the cytoplasmic tail of GP37. Based on the potential function and distribution of these motifs in GP37, ALV-J Env was grouped into three species, inhibitory Env, bifunctional Env and active Env. Accordingly, 36.91%, 61.74% and 1.34% of ALV-J Env sequences from GenBank are classified as inhibitory, bifunctional and active Env, respectively. Additionally, the Env of the ALV-J prototype strain, HPRS-103, and 17 of 18 EAV-HP sequences belong to the inhibitory Env. And models for signal transduction of the three ALV-J Env species were predicted. Our findings and models provide novel insights for identifying the roles and molecular mechanism of ALV-J Env in the unique pathogenesis of ALV-J.

  19. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research—an update

    OpenAIRE

    Peakall, Rod; Smouse, Peter E.

    2012-01-01

    Summary: GenAlEx: Genetic Analysis in Excel is a cross-platform package for population genetic analyses that runs within Microsoft Excel. GenAlEx offers analysis of diploid codominant, haploid and binary genetic loci and DNA sequences. Both frequency-based (F-statistics, heterozygosity, HWE, population assignment, relatedness) and distance-based (AMOVA, PCoA, Mantel tests, multivariate spatial autocorrelation) analyses are provided. New features include calculation of new estimators of popula...

  20. Transhumanistas y Bioconservadores en torno al dopaje genético

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Raúl Francisco Sebastián Solanes

    2013-04-01

    Full Text Available En el presente texto proponemos una reflexión sobre uso de tecnologías genéticas que  aumentan el rendimiento deportivo como futuro campo de investigación de una Neuroética social. Este problema, que se ha dado en llamar “dopaje genético”, congrega a su alrededor un debate entre los partidarios del Bioconservadurismo y del Transhumanismo. Expondremos la concepción de dos importantes representantes del Transhumanismo (J. Savulescu y C. Tamburrini y de dos conocidos partidarios del Bioconservadurismo (M. Sandel y R. L. Simon, a fin de subrayar la importancia de este debate y las futuras implicaciones en la mejora del rendimiento físico, cognitivo y educacional a las que se deberá hacer frente desde el nivel socio-cultural de la Neuroética.

  1. Cabells blancs, un destí també escrit als gens

    OpenAIRE

    Bueno i Torrens, David, 1965-

    2016-01-01

    Un dels aspectes més evidents del pas del temps és l'emblanquiment dels cabells. Tanmateix, aquest procés únicament es produeix en les persones d'ascendència europea. En les d'origen asiàtic, africà i amerindi, és un fet rar i excepcional. Andrés Ruiz-Linares i els seus col·laboradors, de diverses universitats i centres de recerca europeus, sud-americans i australians, han aïllat el gen que el provoca, i també han identificat disset gens més que contribueixen a definir les característiques ge...

  2. Mutationen des Androgenrezeptor-Gens als mögliche Ursache der Antiandrogenresistenz beim Prostatakarzinom

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Röpke A

    2004-01-01

    Full Text Available Der Androgenrezeptor (AR ist ein nukleärer Transkriptionsfaktor, der die intrazelluläre Wirkung der Androgene vermittelt. Das Prostatakarzinom ist in Deutschland das häufigste Krebsleiden beim Mann. Bei fortgeschrittenem Prostatakarzinom ist eine radikale Entfernung der Prostata nicht immer möglich. In diesen Fällen wird auf eine palliative endokrine Behandlung zurückgegriffen. Da primäre Prostatakarzinome in ihrem Wachstum meist androgenabhängig sind, ist die Ansprechrate auf eine Antiandrogentherapie entsprechend hoch und liegt bei ca. 75 %. Mit der Antiandrogentherapie wird versucht, die Konzentration von freizirkulierenden Androgenen herabzusetzen oder die transkriptionelle Eigenschaft des AR zu blockieren. Bei den meisten Patienten kommt es jedoch trotz einer zunächst erfolgreichen Antiandrogentherapie sekundär unter der Therapie zu einer erneuten Proliferation oder Metastasierung des Prostatakarzinoms. Bei ca. 25 % der Patienten wird bereits primär eine Resistenz gegenüber der Antiandrogentherapie beobachtet. Für das Versagen der Antiandrogentherapie können Veränderungen des AR im Tumor verantwortlich sein. Bei Prostatakarzinomen mit sekundärer Antiandrogenresistenz besteht häufig eine Amplifikation des AR-Gens. Dagegen zeigen Prostatakarzinome ohne Antiandrogentherapie sehr selten (1 % eine Amplifikation des AR-Genlokus, jedoch in 11 % eine Polysomie des X-Chromosoms, einschließlich des AR-Gens. Mutationen im AR-Gen werden bei metastasierten oder hormonrefraktären, seltener bei primären Prostatakarzinomen beschrieben. Es konnte in einer Vielzahl von Studien festgestellt werden, daß verschiedene Steroidhormone eine höhere Affinität zu mutierten AR aufweisen, dadurch zu einer höheren transkriptionellen Aktivität führen und so die zelluläre Proliferation stimulieren.

  3. Microsatélites amplificados al azar (RAM en estudios de diversidad genética vegetal

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jaime Eduardo Muñoz Flórez

    2008-12-01

    Full Text Available Se revisó el uso e importancia, ventajas, desventajas y características de la técnica Microsatélites Amplificados al Azar (RAM en uchuva Physalis peruviana, mora Rubus spp, guayaba Psidium guajava y heliconias Heliconia spp. En mora se diferenciaron las especies R. glaucus, R. robustus y R. urticifolius, se detectaron duplicados y se encontró alta variabilidad genética en R. glaucus, la especie más importante. En uchuva se encontró alta diversidad y dos accesiones de fruto rojo que se diferenciaron genéticamente de las amarillas y una región geográfica con alta variabilidad. En guayaba los cebadores fueron altamente polimórficos y se encontró alta variabilidad en el Valle del Cauca. En heliconias y especies relacionadas se diferenciaron las familias del orden Zingiberales, algunos subgéneros y variaciones en la especie. La técnica es de bajo costo, utiliza un cebador, no requiere información previa, es altamente polimórfica y diferencia especies en los taxones evaluados.

  4. Incorporation of chimeric HIV-SIV-Env and modified HIV-Env proteins into HIV pseudovirions

    International Nuclear Information System (INIS)

    Low level incorporation of the viral glycoprotein (Env) into human immunodeficiency virus (HIV) particles is a major drawback for vaccine strategies against HIV/AIDS in which HIV particles are used as immunogen. Within this study, we have examined two strategies aimed at achieving higher levels of Env incorporation into non-infectious pseudovirions (PVs). First, we have generated chimeric HIV/SIV Env proteins containing the truncated C-terminal tail region of simian immunodeficiency virus (SIV)mac239-Env767stop, which mediates strongly increased incorporation of SIV-Env into SIV particles. In a second strategy, we have employed a truncated HIV-Env protein (Env-Tr752N750K) which we have previously demonstrated to be incorporated into HIV virions, generated in infected T-cells, to a higher level than that of Wt-HIV-Env. Although the chimeric HIV/SIV Env proteins were expressed at the cell surface and induced increased levels of cell-cell fusion in comparison to Wt-HIV-Env, they did not exhibit increased incorporation into either HIV-PVs or SIV-PVs. Only Env-Tr752N750K exhibited significantly higher (threefold) levels of incorporation into HIV-PVs, an improvement, which, although not dramatic, is worthwhile for the large-scale preparation of non-infectious PVs for vaccine studies aimed at inducing Env humoral responses

  5. Intervista al GEN. B. Mariano MOSSA, Comandante Carabinieri Tutela Patrimonio Culturale

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Luca Papi

    2014-09-01

    Full Text Available In the framework of the cultural heritage, several records are recognized to our Country. With regard to them, it is worth to mention the establishment of a selected body of investigators Carabinieri Tutela Patrimonio Culturale specifically dedicated to combating crimes against cultural heritage.The Interview to Gen. B. Mariano Mossa is mainly focused to highlight the experience gained over more than 40 years of activity by the mentioned body. In particular, it will be illustrated the features and services which can enjoy a citizen by downloading the mobile app developed by Carabinieri Tutela Patrimonio Culturale.

  6. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001973 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001973 ABOK01143647 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Met CAT ...

  7. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001933 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001933 ABOK01048051 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Gly GCC ...

  8. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001990 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001990 ABOK01217516 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Val GAC ...

  9. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001991 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001991 ABOK01218729 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - Lys TTT ...

  10. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001917 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001917 ABOK01014385 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Met CAT ...

  11. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002006 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002006 ABOK01337352 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Val GAC ...

  12. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001919 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001919 ABOK01017442 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - Gln CTG ...

  13. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001960 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001960 ABOK01092952 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Cys GCA ...

  14. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001975 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001975 ABOK01148089 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - Val TAC ...

  15. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001932 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001932 ABOK01046212 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Asp GTC ...

  16. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001959 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001959 ABOK01092151 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Ile GAT ...

  17. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001916 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001916 ABOK01013921 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Gln TTG ...

  18. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08002005 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08002005 ABOK01308326 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - Val GAC ...

  19. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001934 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001934 ABOK01050102 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - Arg CCT ...

  20. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001918 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001918 ABOK01017030 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Arg CCT ...

  1. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001958 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001958 ABOK01090996 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Lys TTT ...

  2. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001939 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001939 ABOK01055049 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA + Cys GCA ...

  3. tRNA配列、アノテーション及びキュレーションのデータ: >ENV08001974 [tRNADB-CE (tRNA gene database curated manually by experts)

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available Environmental sample (ENV) from GenBank >ENV08001974 ABOK01144549 mosquito metageno...me; viral fraction from Mung bean nuclease digestion of DNA from mixed species mosquitoes collected in Mission Valley in San Diego, CA - Leu TAG ...

  4. Microsatélites amplificados al azar (RAM en estudios de diversidad genética vegetal

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Muñoz Flórez Jaime Eduardo

    2008-12-01

    Full Text Available Se revisó el uso e importancia, ventajas, desventajas y características de la técnica Microsatélites Amplificados al Azar (RAM en uchuva Physalis peruviana, mora Rubus spp, guayaba Psidium guajava y heliconias Heliconia spp. En mora se diferenciaron las especies R. glaucus, R. robustus y R. urticifolius, se detectaron duplicados y se encontró alta variabilidad genética en R. glaucus, la especie más importante. En uchuva se encontró alta diversidad y dos accesiones de fruto rojo que se diferenciaron genéticamente de las amarillas y una región geográfica con alta variabilidad. En guayaba los cebadores fueron altamente polimórficos y se encontró alta variabilidad en el Valle del Cauca. En heliconias y especies relacionadas se diferenciaron las familias del orden Zingiberales, algunos subgéneros y variaciones en la especie. La técnica es de bajo costo, utiliza un cebador, no requiere información previa, es altamente polimórfica y diferencia especies en los taxones evaluados.

  5. Mecanismos genéticos en la predisposición hereditaria al cáncer colorrectal Genetic mechanisms in the hereditary predisposition to colorectal cancer

    OpenAIRE

    Alonso, A.; Moreno, S.; VALIENTE, A.; Artigas, M. (Mariano); A. Pérez-Juana; Ramos-Arroyo, M.A.

    2006-01-01

    Una proporción de los cánceres colorrectales presentan algún tipo de predisposición genética que es posible reconocer en la práctica clínica. Desde los clásicos patrones hereditarios dominantes de la poliposis adenomatosa familiar o el cáncer de colon hereditario no asociado a poliposis, pasando por la transmisión recesiva mostrada por la poliposis asociada al gen MYH, hasta llegar a los novedosos síndromes de la "vía serrada" o los alelos de baja penetrancia, el descubrimiento de nuevos gene...

  6. Análisis comparativo de la aplicación de distintos operadores genéticos al problema de job shop scheduling

    OpenAIRE

    Alfonso, Hugo; Salto, Carolina; Gallard, Raúl Hector

    2000-01-01

    Este trabajo describe un estudio de distintas soluciones al problema del job shop scheduling basado en algoritmos genéticos. La característica fundamental es la utilización de decodificadores incorporada a la representación del cromosuma. El objetivo del trabajo es comparar la performance de los distintos tipos de operadores de crossovers que se pueden usar con esta representación.

  7. DNA Cloning and Sequence Analysis of Partial env Gene of Avian Leukosis Virus Subgroup J in Wuhua Chicken Flocks%五华鸡J亚群白血病病毒env部分基因的和序列分析

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    戴银; 张丹俊; 胡晓苗; 赵瑞宏

    2011-01-01

    The partial sequence of avian leukosis virus subgroup J (ALV-J) env gene was cloned by PCR in Anhui province, which was named as ALV-J-envl. And we compared ALV-J-envl with the partial sequence of eight ALV-J env genes in the GenBank database. The results showed that ALV-J infection in Wuhua chicken was found in Anhui province. Alignment of nine gene sequences of ALV-J env, the homology between ALV-J-envl and the other sequences ranged from 94. 2% to 96. 6%. The result revealed that the env gene from different strains had the mutation at nucleotide sequence. However, the highest homology with ALV-J-envl were HQ425636 and HM235665 gene sequences isolated from strains in China, and they gathered together in the evolutionary tree, indicating a close genetic relationship, and they evolved from common strains. The lowest homology with ALV-J-envl was the gene sequence of AY312965 isolated from Malaysia, it could be further confirmed by phylogenetic analysis.%本试验通过PCR技术获得了安徽省地方品种五华鸡禽白血病病毒J亚群(avian leukosis virus subgroup J,ALV-J)env部分基因序列AL V-J-env1,并将该序列与GenBank数据库中登录的8条env基因相应序列进行了比对分析.结果表明,五华鸡已经感染了J亚群禽白血病,且部分鸡个体已经发病.通过分析可见,AL V-J-env1与所比较的基因序列同源性介于94.2%~96.6%之间,说明不同毒株之间的env基因有一定变异.但与ALV J-env1同源性最高的是来自于中国ALV-J毒株的HQ425636和HM235665基因序列,且在进化树中聚集为一组,暗示它们之间亲缘关系较近,由共同的毒株进化而来.与ALV-J-env1同源性最低的是来源于马来西亚毒株的AY312965基因序列,遗传进化分析也进一步证实,两者之间亲缘关系较远.

  8. La Comunidad Andina frente al reto del acceso a los recursos genéticos y la distribución de beneficios

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Martha Isabel Gómez Lee

    2012-11-01

    Full Text Available Este artículo estudia las medidas jurídicas y políticas que ha adoptado la Comunidad Andina (CAN sobre el acceso a los recursos genéticos y la distribución de beneficios a la luz de los estudios de equidad en la distribución de beneficios de Bram de Jonge y Niels Louwaar (2009. Según estos autores, el principio de Acceso y Distribución de Beneficios (ADB se justifica por tres asimetrías que están presentes en este asunto. Por un lado, la doble asimetría entre la asignación y la explotación de los recursos y, por otro, la asimetría entre los derechos de propiedad intelectual y los derechos legales de los recursos genéticos y los conocimientos tradicionales. En este contexto, la CAN ratifica los principios de soberanía de los recursos genéticos y de Acceso y Distribución de Beneficios del Convenio sobre Diversidad Biológica. Las principales respuestas que ha dado la CAN al reto del acceso a los recursos genéticos y distribución de beneficios son las Decisiones 391, 486 y 523. En este contexto, el Programa BIOCAN está trabajando en los temas de especial relevancia para la región, dentro de los cuales están los desafíos de asignarle valor a los recursos genéticos y el de la biopiratería.

  9. Quantifying CD4/CCR5 Usage Efficiency of HIV-1 Env Using the Affinofile System.

    Science.gov (United States)

    Webb, Nicholas E; Lee, Benhur

    2016-01-01

    Entry of HIV-1 into target cells involves the interaction of the HIV envelope (Env) with both a primary receptor (CD4) and a coreceptor (CXCR4 or CCR5). The relative efficiency with which a particular Env uses these receptors is a major component of cellular tropism in the context of entry and is related to a variety of pathological Env phenotypes (Chikere et al. Virology 435:81-91, 2013). The protocols outlined in this chapter describe the use of the Affinofile system, a 293-based dual-inducible cell line that expresses up to 25 distinct combinations of CD4 and CCR5, as well as the associated Viral Entry Receptor Sensitivity Assay (VERSA) metrics used to summarize the CD4/CCR5-dependent infectivity results. This system allows for high-resolution profiling of CD4 and CCR5 usage efficiency in the context of unique viral phenotypes.

  10. Microsatélites amplificados al azar (RAM) en estudios de diversidad genética vegetal Random amplified microsatellites (RAM´s) in plant genetic diversity studies

    OpenAIRE

    Jaime Eduardo Muñoz Flórez; Ana Cruz Morillo Coronado; Yacenia Morillo Coronado

    2008-01-01

    Se revisó el uso e importancia, ventajas, desventajas y características de la técnica Microsatélites Amplificados al Azar (RAM) en uchuva Physalis peruviana, mora Rubus spp, guayaba Psidium guajava y heliconias Heliconia spp. En mora se diferenciaron las especies R. glaucus, R. robustus y R. urticifolius, se detectaron duplicados y se encontró alta variabilidad genética en R. glaucus, la especie más importante. En uchuva se encontró alta diversidad y dos accesiones de fruto rojo que se difere...

  11. Retroviral Env Glycoprotein Trafficking and Incorporation into Virions

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Tsutomu Murakami

    2012-01-01

    Full Text Available Together with the Gag protein, the Env glycoprotein is a major retroviral structural protein and is essential for forming infectious virus particles. Env is synthesized, processed, and transported to certain microdomains at the plasma membrane and takes advantage of the same host machinery for its trafficking as that used by cellular glycoproteins. Incorporation of Env into progeny virions is probably mediated by the interaction between Env and Gag, in some cases with the additional involvement of certain host factors. Although several general models have been proposed to explain the incorporation of retroviral Env glycoproteins into virions, the actual mechanism for this process is still unclear, partly because structural data on the Env protein cytoplasmic tail is lacking. This paper presents the current understanding of the synthesis, trafficking, and virion incorporation of retroviral Env proteins.

  12. ENV 322 ASH COURSE Tutorial/UOPHELP

    OpenAIRE

    fgchjklkjhgfd

    2015-01-01

    For more course tutorials visit www.uophelp.com   ENV 322 Complete Class Business - General Business   Gaia Hypothesis. In Chapter 3, the Gaia hypothesis is introduced. It addresses two hypotheses; (1) life, since its inception, has greatly affected the planetary environment and (2) life has altered Earth’s environment in ways that have allowed life to persist. Do you agree with these two hypotheses? Why or why not? Energy and Food Supplies. The und...

  13. Array CGH com a primera opció per al diagnòstic genètic postnatal

    OpenAIRE

    Castells Sarret, Neus

    2015-01-01

    La citogenètica convencional detecta un 3-5% dels pacients amb retard global del desenvolupament / discapacitat intel·lectual (RGD / DI) i / o malformacions congènites (MC). L'amplificació de sondes múltiples dependents de lligació (MLPA) permet incrementar la taxa diagnòstica entre 2,4-5,8%. Actualment els arrays d'hibridació genòmica comparada (aCGH) constitueixen l'eina diagnòstica amb major rendiment en pacients amb RGD / DI, MC i trastorns de l'espectre autista (TEA). L'objectiu del p...

  14. La fábrica de la empatía. Del determinismo genético al origen social de la moral

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Hernández Castro, David

    2016-06-01

    Full Text Available Preston and De Waal have adopted a theoretical idea known as the “Perception-Action Model” (PAM, which suggests that empathy and morality have genetic and evolutionary roots. In this paper, the author proposes a critical reading of PAM and an alternative interpretation, “the empathy factory”, which reconsiders the “Perception-Action Hypothesis” and the discovery of mirror neurons in the light of Judith Butler’s concept of performativity and the social construction of emotions. The conclusion is that the origin of the moral impulse does not lie in genetic determinism but in social relationships, language and affective communication.Preston y De Waal han adoptado una idea teórica, el Mecanismo de Percepción-Acción (MPA, que sugiere que la empatía y la moral tienen raíces genéticas y evolutivas. En este artículo analizamos críticamente el MPA y proponemos una interpretación alternativa, la fábrica de la empatía, que reconsidera la “Hipótesis de la Percepción-Acción” y el descubrimiento de las neuronas espejo bajo la luz del concepto de performatividad de Judith Butler y la construcción social de las emociones. Frente al determinismo genético, nuestra investigación apunta a las relaciones sociales y el lenguaje.

  15. DEL GEN EGOISTA AL GEN ALTRUISTA

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Oscar José Fernández Galíndez

    2010-06-01

    Full Text Available The Darwinian thought derived from the interpretations and / or rereadings done on Charles Darwin's work, they have generated many controversy. Even the same Darwin demonstrated in many occasions her, doubts on her, before raised ideas, of there that I dress the evolutionism as paradigm, it suggests a serious review in the frame of the emergent thought and in the most igalitarian search of a society and less fragmented.

  16. Detección de Leishmania spp. en base al gen que codifica la proteína HSP20

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ana M Montalvo

    2014-10-01

    Full Text Available Objetivos. Explorar una nueva diana para el diagnóstico molecular de Leishmania. Materiales y métodos. Se evaluó la utilidad del gen que codifica la proteína de choque térmico de 20kDa (hsp20 para la detección de Leishmania por medio de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR.Se normalizó la PCR y se determinaron los parámetros analíticos, así como la validez y seguridad diagnóstica y la concordancia con la PCR-18S. Se evaluó la PCR-hsp20 con ADN obtenido de un grupo de muestras clínicas de distinta procedencia. Resultados. Los parámetros analíticos resultaron adecuados. La sensibilidad obtenida fue de 86% y la especificidad del 100%, la concordancia con el método de referencia resultó buena (κ = 0,731, lo que apoya su posible uso para el diagnóstico. La posibilidad de identificación posterior de la especie mediante secuenciación del producto amplificado le confiere una ventaja adicional. Conclusiones. Se demuestra la utilidad de este gen como una nueva diana para la detección del género Leishmania. Debido a su potencial, se recomienda mejorar la sensibilidad del procedimiento y realizar su evaluación en diversas regiones endémicas.

  17. Detección de Leishmania spp. en base al gen que codifica la proteína HSP20

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ana M. Montalvo

    2014-12-01

    Full Text Available Objetivos. Explorar una nueva diana para el diagnóstico molecular de Leishmania. Materiales y métodos. Se evaluó la utilidad del gen que codifica la proteína de choque térmico de 20kDa (hsp20 para la detección de Leishmania por medio de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR.Se normalizó la PCR y se determinaron los parámetros analíticos, así como la validez y seguridad diagnóstica y la concordancia con la PCR-18S. Se evaluó la PCR-hsp20 con ADN obtenido de un grupo de muestras clínicas de distinta procedencia. Resultados. Los parámetros analíticos resultaron adecuados. La sensibilidad obtenida fue de 86% y la especificidad del 100%, la concordancia con el método de referencia resultó buena (κ = 0,731, lo que apoya su posible uso para el diagnóstico. La posibilidad de identificación posterior de la especie mediante secuenciación del producto amplificado le confiere una ventaja adicional. Conclusiones. Se demuestra la utilidad de este gen como una nueva diana para la detección del género Leishmania. Debido a su potencial, se recomienda mejorar la sensibilidad del procedimiento y realizar su evaluación en diversas regiones endémicas.

  18. Mecanismos genéticos en la predisposición hereditaria al cáncer colorrectal Genetic mechanisms in the hereditary predisposition to colorectal cancer

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    A. Alonso

    2006-04-01

    Full Text Available Una proporción de los cánceres colorrectales presentan algún tipo de predisposición genética que es posible reconocer en la práctica clínica. Desde los clásicos patrones hereditarios dominantes de la poliposis adenomatosa familiar o el cáncer de colon hereditario no asociado a poliposis, pasando por la transmisión recesiva mostrada por la poliposis asociada al gen MYH, hasta llegar a los novedosos síndromes de la "vía serrada" o los alelos de baja penetrancia, el descubrimiento de nuevos genes y el mejor conocimiento de los mecanismos de acción de los ya conocidos, están permitiendo comprender nuevos aspectos de la carcinogénesis colorrectal que arrojan nueva luz sobre algunas de las observaciones de patrones de agregación familiar al cáncer de colon que permanecían inexplicadas.A proportion of colorectal cancers shows some type of genetic predisposition that can be recognised in clinical practice. From the classical dominant inheritance pattern of familial adenomatous polyposis or hereditary non-polyposis colorectal cancer, through the recessive transmission of the MYH associated polyposis, to the new syndromes of the "serrated pathway" or low-penetrance alleles, the discovery of new genes and a deeper understanding of the mechanisms of action of already-known ones are enabling us to understand new aspects of the colorectal carcinogenesis. This is throwing a new light on some of the observed familial aggregation patterns which had remained unexplained.

  19. Structure and Dynamics of the Native HIV-1 Env Trimer

    OpenAIRE

    Munro, James B.; Mothes, Walther

    2015-01-01

    HIV-1/AIDS remains one of the worst pandemics in human history. Despite tremendous efforts, no effective vaccine has been found. Recent reports give new insights into the structure and dynamics of the HIV-1 Env trimer and renew hopes that a better understanding of Env will translate into new vaccine candidates and more-effective antiretroviral therapies.

  20. Parámetros genéticos y fenotípicos para peso al año, circunferencia escrotal y talla en ganado Simmental y Simbrah en México

    OpenAIRE

    José Antonio Torres-Vázquez; Coralia Inés Valentina Manzanilla Pech; Aurelio Borrayo Zepeda; Ángel Ríos-Utrera; Vicente Eliezer Vega-Murillo; Guillermo Martínez-Velázquez; Juan José Baeza Rodríguez; Moisés Montaño-Bermúdez

    2012-01-01

    El objetivo fue estimar los componentes de (co)varianza, heredabilidades y correlaciones genéticas y fenotípicas para peso al año (YW), circunferencia escrotal (SC) y talla (FS) en toros jóvenes Simmental y Simbrah de México. Todas las características se ajustaron a 305 días acorde a los lineamientos descritos por la Federación para el Mejoramiento Genético de los Bovinos de Carne (BIF). El archivo final de datos incluyó 1,949 registros Simmental y 1,259 Simbrah. Para estimar los compones de ...

  1. Métodos y usos agrícolas de la ingeniería genética aplicada al cultivo de arroz

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Cristina DiazGranados D.

    2012-08-01

    Full Text Available Methods and agricultural uses of genetic engineering applied to rice crop Resumen: En biotecnología de arroz se han logrado avances en transformación genética, con importantes resultados en el mejoramiento genético de variedades elite de las subespecies japónica e índica. Con el propósito de revisar los métodos y los usos agrícolas de la ingeniería genética aplicada al cultivo del arroz, se usaron varias palabras claves en idioma inglés en algunas de las bases de datos de revistas científicas indexadas, disponibles en el Sistema Nacional de Bibliotecas de la Universidad Nacional de Colombia (SINAB, seleccionando documentos publicados entre 2000 y 2011. La base de esta revisión inicial, se complementó con artículos publicados en fechas anteriores, que se consideraron relevantes, debido a que implicaban cambios metodológicos importantes. Desde que se logró producir la primera planta transgénica de arroz a finales de los 80´s, varios protocolos para la transferencia de genes se han empleado con éxito logrando la modificación genética de más de 60 cultivares de arroz. Para ello se han empleado sistemas de transformación tanto directos como indirectos.  Se han realizado modificaciones de rasgos importantes en el cultivo, tales como la resistencia a factores bióticos (insectos, hongos, bacterias, virus, nematodos, tolerancia a factores abióticos (salinidad, sequía, altas y bajas temperaturas, inmersión, y mejoramiento de características agronómicas (calidad nutricional, rendimiento, uso de nutrientes, tolerancia a herbicidas. Palabras claves: Arroz; cultivos transgénicos; factores bióticos; factores abióticos. Abstract: In rice biotechnology advances have been made in genetic transformation, with significant results in breeding elite varieties of japonica and indica subspecies. In order to review the methods and agricultural uses of genetic engineering applied to rice, calves were used several words in English in

  2. Microsatélites amplificados al azar (RAM en estudios de diversidad genética vegetal Random amplified microsatellites (RAM´s in plant genetic diversity studies

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jaime Eduardo Muñoz Flórez

    2008-12-01

    Full Text Available Se revisó el uso e importancia, ventajas, desventajas y características de la técnica Microsatélites Amplificados al Azar (RAM en uchuva Physalis peruviana, mora Rubus spp, guayaba Psidium guajava y heliconias Heliconia spp. En mora se diferenciaron las especies R. glaucus, R. robustus y R. urticifolius, se detectaron duplicados y se encontró alta variabilidad genética en R. glaucus, la especie más importante. En uchuva se encontró alta diversidad y dos accesiones de fruto rojo que se diferenciaron genéticamente de las amarillas y una región geográfica con alta variabilidad. En guayaba los cebadores fueron altamente polimórficos y se encontró alta variabilidad en el Valle del Cauca. En heliconias y especies relacionadas se diferenciaron las familias del orden Zingiberales, algunos subgéneros y variaciones en la especie. La técnica es de bajo costo, utiliza un cebador, no requiere información previa, es altamente polimórfica y diferencia especies en los taxones evaluados.The use and importance, advantages, disadvantages and features of the Random Amplified Microsatellites RAMs technique, were reviewed in Cape gooseberry Physalis peruviana, blackberry Rubus spp, guava Psidium guajava and heliconias Heliconia spp. In blackberry, we differentiated the species R. glaucus, R. robustus y R. urticifolius, detected duplicated accessions and found high genetic diversity in R. glaucus, the most important specie. In cape gooseberry we found high diversity and two red fruit accessions genetically differentiated from the yellow fruit ones and a geographical region with high variability. In guava, primers were highly polymorphic and found high variability in Valle del Cauca region. In Heliconia and related species we differentiated families belonging to Zingiberal order, between some sub genera and variation among specie. The technique has low cost of implementation, use a single primer, do not require previous information, is highly

  3. ADAPTACI N AL ESPA OL DEL CUESTIONARIO VEC ET SANTE PER UE DE L ADOLESCENT (VSP-A: UNA MEDIDA GEN RICA DE CALIDAD DE VIDA PARA ADOLESCENTES

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Vicky Serra-Sutton

    2002-01-01

    Full Text Available Fundamentos: En la última década se han desarrollado diversas medidas de calidad de vida relacionada con la salud para uso exclusivo en niños/as y adolescentes. No obstante, existen pocos instrumentos de estas características adaptados en España. El Vecú et Sante Perçue de l?adolescent (VSP-A es un instrumento genérico de calidad de vida relacionada con la salud para adolescentes de 11 a 17 años desarrollado en Francia. El objetivo de este estudio fue adaptar al español el VSP-A, como primera fase para la obtención del cuestionario. Métodos: Se adaptó la versión del VSP-A de 39 preguntas siguiendo la metodología de traducción directa e inversa incluyendo: 2 traducciones al español, puntuación del grado de dificultad (0 min-10 máx y clasificación de equivalencia semántica y cultural, 2 reuniones y discusión en paneles de adolescentes, así como reuniones de consenso del equipo de investigación. Finalmente se realizó una traducción inversa (retro-traducción al francés y se administró la versión final pre-test en la prueba piloto. Resultados: La mayoría de las preguntas se clasificaron como equivalentes (24 sobre 39. Tras las reuniones con adolescentes se modificaron algunas preguntas. Tras la retro-traducción, 3 preguntas necesitaron cambios menores. Conclusiones: La versión española del VSP-A parece semántica y culturalmente equivalente a la versión original en francés y adecuada para adolescentes en España. La sencillez de las preguntas, los comentarios de los adolescentes y la participación de los autores originales en el proceso de adaptación ha permitido obtener una versión pre-test adecuada. La siguiente fase del estudio es la comprobación de la fiabilidad y validez. Se espera que el VSP-A sea de utilidad para medir la calidad de vida relacionada con la salud en encuestas de salud o como instrumento de cribado en colegios o centros de atención primaria en nuestro medio.

  4. Caracterización de la diversidad genética en naranja y comparación del polimorfismo de microsatélites amplificados al azar (RAMs usando electroforesis de poliacrilamida y agarosa

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Muñoz Flores Jaime Eduardo

    2009-12-01

    Full Text Available Se compararon las eficiencias de tres métodos de electroforesis en agarosa y poliacrilamida, usando la cámara pequeña de DNA Sequencing System y cámara grande OWL Sequi-Gen Sequencing Cell, en la detección del polimorfismo en 21 accesiones de naranja (Citrus sinensis con empleo del cebador CGA. El gel de poliacrilamida dio mejor resolución de los productos amplificados vía PCR producidos por RAMs. Este permitió una mejor detección de bandas de ADN polimórficas, lo que facilitó la identificación de la variabilidad genética. La electroforesis en agarosa puede ser más conveniente en otras aplicaciones, debido al bajo costo y fácil aplicación. El estudio de diversidad genética en naranja usando microsatélites RAMs diferenció 51 accesiones en siete grupos con 0.75 de similaridad y 0.25 de heterocigosidad, lo que revela bajo polimorfismo genético. La técnica RAMs permitió agrupar las accesiones en Comunes o Blancas, Navel y Pigmentadas o Sanguinas.

  5. GEN 105 Courses/sanptutorial

    OpenAIRE

    ncbdf

    2015-01-01

    GEN 105 Assignment: Reading and Retention GEN 105 Assignment: Elevator Speech GEN 105 CheckPoint: Technological Tools GEN 105 CheckPoint: Distance Learning I GEN 105 CheckPoint: Distance Learning II GEN 105 CheckPoint: Communicating in Forums GEN 105 Week 2 Discussion Questions GEN 105 Week 4 Discussion Questions GEN 105 Week 6 Discussion Questions GEN 105 Week 8 Discussion Questions GEN 105 Assignment: University Library Article Search GEN 105 Chec...

  6. The role of the N-terminal segment of CCR5 in HIV-1 Env-mediated membrane fusion and the mechanism of virus adaptation to CCR5 lacking this segment

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Kabat David

    2007-08-01

    Full Text Available Abstract Background HIV-1 envelope glycoprotein (Env induces membrane fusion as a result of sequential binding to CD4 and chemokine receptors (CCR5 or CXCR4. The critical determinants of CCR5 coreceptor function are the N-terminal domain (Nt and the second extracellular loop. However, mutations in gp120 adapt HIV-1 to grow on cells expressing the N-terminally truncated CCR5(Δ18 (Platt et al., J. Virol. 2005, 79: 4357–68. Results We have functionally characterized the adapted Env (designated Env(NYP using a quantitative cell-cell fusion assay. The rate of fusion with target cells expressing wild-type CCR5 and the resistance to fusion inhibitors was virtually identical for wild-type Env and Env(NYP, implying that the coreceptor affinity had not increased as a result of adaptation. In contrast, Env(NYP-induced fusion with cells expressing CCR5(Δ18 occurred at a slower rate and was extremely sensitive to the CCR5 binding inhibitor, Sch-C. Resistance to Sch-C drastically increased after pre-incubation of Env(NYP- and CCR5(Δ18-expressing cells at a temperature that was not permissive to fusion. This indicates that ternary Env(NYP-CD4-CCR5(Δ18 complexes accumulate at sub-threshold temperature and that low-affinity interactions with the truncated coreceptor are sufficient for triggering conformational changes in the gp41 of Env(NYP but not in wild-type Env. We also demonstrated that the ability of CCR5(Δ18 to support fusion and infection mediated by wild-type Env can be partially reconstituted in the presence of a synthetic sulfated peptide corresponding to the CCR5 Nt. Pre-incubation of wild-type Env- and CCR5(Δ18-expressing cells with the sulfated peptide at sub-threshold temperature markedly increased the efficiency of fusion. Conclusion We propose that, upon binding the Nt region of CCR5, wild-type Env acquires the ability to productively engage the extracellular loop(s of CCR5 – an event that triggers gp41 refolding and membrane merger

  7. RRE-dependent HIV-1 Env RNA effects on Gag protein expression, assembly and release

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    López, Claudia S., E-mail: lopezcl@ohsu.edu [Departments of Molecular Microbiology and Immunology, Oregon Health and Sciences University, 3181 SW Sam Jackson Park Road, Portland, OR 97239 (United States); Sloan, Rachel; Cylinder, Isabel [Departments of Molecular Microbiology and Immunology, Oregon Health and Sciences University, 3181 SW Sam Jackson Park Road, Portland, OR 97239 (United States); Kozak, Susan L.; Kabat, David [Biochemistry and Molecular Biology, Oregon Health and Sciences University, 3181 SW Sam Jackson Park Road, Portland, OR 97239 (United States); Barklis, Eric, E-mail: barklis@ohsu.edu [Departments of Molecular Microbiology and Immunology, Oregon Health and Sciences University, 3181 SW Sam Jackson Park Road, Portland, OR 97239 (United States)

    2014-08-15

    The HIV-1 Gag proteins are translated from the full-length HIV-1 viral RNA (vRNA), whereas the envelope (Env) protein is translated from incompletely spliced Env mRNAs. Nuclear export of vRNAs and Env mRNAs is mediated by the Rev accessory protein which binds to the rev-responsive element (RRE) present on these RNAs. Evidence has shown there is a direct or indirect interaction between the Gag protein, and the cytoplasmic tail (CT) of the Env protein. Our current work shows that env gene expression impacts HIV-1 Gag expression and function in two ways. At the protein level, full-length Env expression altered Gag protein expression, while Env CT-deletion proteins did not. At the RNA level, RRE-containing Env mRNA expression reduced Gag expression, processing, and virus particle release from cells. Our results support models in which Gag is influenced by the Env CT, and Env mRNAs compete with vRNAs for nuclear export. - Highlights: • At the protein level, full-length HIV-1 Env alters Gag protein expression. • HIV-1 Env RNA expression reduces Gag levels and virus release. • Env RNA effects on Gag are dependent on the RRE. • RRE-containing Env RNAs compete with vRNAs for nuclear export.

  8. GEN 105 Course tutorial/ indigohelp

    OpenAIRE

    SCD

    2015-01-01

    For more classes visit www.indigohelp.com   GEN 105 Assignment: Reading and Retention GEN 105 Assignment: Elevator Speech GEN 105 CheckPoint: Technological Tools GEN 105 CheckPoint: Distance Learning I GEN 105 CheckPoint: Distance Learning II GEN 105 CheckPoint: Communicating in Forums GEN 105 Week 2 Discussion Questions GEN 105 Week 4 Discussion Questions GEN 105 Week 6 Discussion Questions GEN 105 Week 8 Discussion Questions GEN 105 A...

  9. Contribuciones de la genética y la proteómica al estudio de la enfermedad de Chagas Genomic and proteomic contributions for Chagas disease control

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Teresa López-Ordóñez

    2009-01-01

    Full Text Available La enfermedad de Chagas representa uno de los problemas más importantes de salud pública en el continente americano. El conocimiento sobre el genoma y el proteoma de los agentes de esta infección es esencial para desarrollar herramientas precisas y eficaces a corto y largo plazo y prevenir la transmisión. En el presente documento se destacan los aportes que han permitido mejorar el diseño, la implementación y la eficacia de las actividades de vigilancia y control de la enfermedad. Se revisan la contribución de la información genómica o proteómica sobre la distribución geográfica de los vectores, y la diversidad y la dinámica poblacional, además de la identificación de poblaciones y especies blanco para control. Por otra parte, se analiza la forma en que el conocimiento del genoma del parásito ha contribuido al diagnóstico de la infección, el estudio de las poblaciones de Trypanosoma cruzi, el tratamiento farmacológico y la interacción del parásito con sus hospederos. Una revisión de estas contribuciones incluye los temas de investigación básica y aplicada más destacados para el futuro inmediato.Chagas disease represents one of the more significant public health problems in the Americas. Information regarding the genome and proteome of vectors and parasite, as well as their interactions, will be essential to develop specific and effective diagnostic and preventive tools. Advances that have contributed to the design, implementation, and efficacy of disease surveillance and control activities are reviewed. Genomic and proteomic information has contributed to a better understanding of vector distributions and dispersion, diversity, population dynamics, and control targets (populations and species. In addition, genomic and proteomic studies have impacted parasite diagnostics, Trypanosoma cruzi population dynamics, pharmacological treatment and knowledge of parasite-host interactions. Discussion of these contributions includes

  10. ANALYSIS OF ENDOGENOUS AND EXOGENOUS ENV GENES OF JAAGSIEKTE SHEEP RETROVIRUS%绵羊肺腺瘤内、外源性env 基因比较分析

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    孔汉金; 张克山; 刘永杰; 尚佑军; 吴斌; 刘湘涛

    2013-01-01

      绵羊肺腺瘤(Ovine pulmonary adenocarcinoma,OPA)是由绵羊肺腺瘤反转录病毒(Jaagsiekte retrovirus, JSRV)感染引起的成年绵羊的一种慢性、进行性、接触传染性肺脏疾病。env 是 JSRV 的主要毒力基因之一,而在正常羊的基因组中也存在着JSRV的内源性基因片段。为比较分析JSRV内、外源性env 的特征,本文扩增并测定了正常绵羊肺组织的内源性env 基因(Enenv),运用生物信息学技术,比较分析了其与外源性绵羊肺腺瘤病毒 JSRV21(AF105220)env 基因(Exenv)的遗传进化关系,二、三级蛋白结构和抗原表位。结果表明 Enenv 和 Exenv 核苷酸同源性为88.1%,推导的氨基酸同源性为92.0%,两者的主要差异位于 TM 区和 YXXM 基序。本结果为进一步研究 JSRVenv 基因功能提供了新线索。%Ovine pulmonary adenomatosis (OPA) is a chronic, progressive and contagious lung tumor in adult sheep, which is caused by Jaagsiekte sheep retrovirus (JSRV). The envelop gene plays a key role in pathogenesis of OPA. On the other hand, an important finding is that multiple copies of highly related endogenous JSRV-like proviruses have been also identified in normal sheep genome. In order to analyze the difference of envelope genes between endogenous and exogenous Jaagsiekte sheep retroviruses, we amplified and sequenced env gene of enJSRV (Enenv) from lung tissue of normal sheep. The nucleotide and amino acid sequences of env gene were compared with JSRV21 strain (AF105220) (Exenv) published on the GenBank using DNAstar software. Then we predicted and compared the secondary structure, tertiary structure and antigenic epitopes of env genes of enJSRV and exJSRV. The results indicated that Enenv shared 88.1%homology with Exenv at nucleotide level and 92.0% homology at amino acid level. The main difference between them was located in the transmembrane (TM) domains of the envelope protein. The cytoplasmic tail (CT

  11. Variabilidad del gen de la envoltura del VIH-1 en tres grupos humanos con diferentes conductas sexuales de riesgo para adquirir ITS-VIH

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Carlos Yábar V

    2007-07-01

    Full Text Available Objetivo: Determinar la variabilidad genética del gen de la envoltura porción C2-V3-C3 (env del VIH-1 infectando grupos humanos con diferente conducta sexual de riesgo para adquirir ITS-VIH. Materiales y métodos: Se seleccionaron 50 sujetos infectados con VIH-1 de los cuales 19 fueron hombres trabajadores sexuales (HTS, 8 mujeres trabajadoras sexuales (MTS y 23 sujetos heterosexuales (SH. Se realizó la extracción de ADN genómico y la amplificación del gen env por PCR. Se identificó el subtipo genético por ensayo de movilidad de heterodúplex (HMA y se confirmaron los resultados por análisis filogenético. Asimismo, se realizó el análisis de recombinación intragenética, diversidad y distancia genética en las tres poblaciones. Resultados: Se amplificó el gen env en 49 muestras (98% y se logró secuenciar el fragmento en 40 de ellas. Se observó que el 97,5% de las muestras de VIH fueron subtipo B mientras que una muestra no pudo ser clasificada filogenéticamente. Asimismo, se encontraron pequeños tramos de recombinación en el gen env de VIH en MTS (33%, HTS (43% y SH (45%. El mayor índice de diversidad de nucleótidos (Pi de env se encontró entre las muestras de VIH provenientes de SH y HTS (0,12 y 0,13 respectivamente. Conclusiones: Se encontró una mayor variabilidad genética del gen env de VIH-1 en las poblaciones de HTS y SH, sin embargo, el subtipo genético y la frecuencia de recombinación de este fragmento genético fue similar en los tres grupos estudiados.

  12. Algoritmos genéticos

    OpenAIRE

    Martínez Páez, José Jesús

    2004-01-01

    Esta técnica se basa en el concepto de evolución a través de selección de los mejores individuos, y de los operadores genéticos de selección, reproducción y mutación. Se trata entonces, de definir un espacio de soluciones para el problema que se quiere solucionar, en una cadena de bits. A esto se le conoce como la codificación del cromosoma, donde cada bit, denominado gen  tiene cierto significado especial. Inicialmente el algoritmo genera al azar muchas de estas cadenas o seres, es decir, un...

  13. Marcadores genéticos dopaminérgicos, serotoninérgicos y de la monoamino-oxidasa (MAO) relacionados con la adicción a los opiáceos, a la cocaína y al alcohol

    OpenAIRE

    Mateu Hernández, César Andrés

    2013-01-01

    Introducción: la genética está experimentando un avance espectacular y se postula como una herramienta importante para aportar nuevos descubrimientos en trastornos complejos como son las adicciones. En el presente trabajo se ha realizado un estudio de asociación genética de polimorfismos VNTR, un estudio familiar y un estudio mixto de asociación genético-familiar en una muestra de policonsumidores con adicción al alcohol, la cocaína y los opiáceos. Material y métodos: en una muestra de 302 po...

  14. Appreciating HIV-1 diversity: subtypic differences in ENV

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Gnanakaran, S [Los Alamos National Laboratory; Shen, Tongye [Los Alamos National Laboratory; Lynch, Rebecca M [NON LANL; Derdeyn, Cynthia A [NON LANL

    2008-01-01

    Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) group M is responsible for the current AIDS pandemic and exhibits exceedingly high levels of viral genetic diversity around the world, necessitating categorization of viruses into distinct lineages, or subtypes. These subtypes can differ by around 35% in the envelope (Env) glycoproteins of the virus, which are displayed on the surface of the virion and are targets for both neutralizing antibody and cell-mediated immune responses. This diversity reflects the remarkable ability of the virus to adapt to selective pressures, the bulk of which is applied by the host immune response, and represents a serious obstacle for developing an effective vaccine with broad coverage. Thus, it is important to understand the underlying biological consequences of inter-subtype diversity. Recent studies have revealed that the HIV-1 subtypes exhibit phenotypic differences that result from subtle differences in Env structure, particularly within the highly immunogenic V3 domain, which participates directly in viral entry. This review will therefore explore current research that describes subtypic differences in Env at the genetic and phenotypic level, focusing in particular on V3, and highlighting recent discoveries about the unique features of subtype C Env, which is the most prevalent subtype globally.

  15. Insereixen material genètic al nucli cel·lular per a teràpia gènica amb nanodiscs

    OpenAIRE

    Villaverde Corrales, Antonio; Vázquez Gómez, Esther

    2011-01-01

    Investigadors de la UAB han aconseguit encapsular material genètic i alliberar-lo directament dins el nucli de les cèl·lules, per tal de dur a terme teràpia gènica, mitjançant partícules amb forma de disc de la grandària de només un pocs nanòmetres. Els nanodiscs, tal i com els han batejat els investigadors, travessen ràpidament l'interior de la cèl·lula i es concentren en el nucli, de manera que incrementarien l'eficiència del procés de transferència genètica.

  16. Mutationsstudie des Dihydropyrimidin-Dehydrogenase-Gens (DPYD) einer Kontrollpopulation zur Abklärung von DPD-Insuffizienz als genetische Ursache von Fluoropyrimidin-Intoleranz.

    OpenAIRE

    Seck, Katharina

    2006-01-01

    Mithilfe der denaturierenden HPLC wurde eine Mutationsanalyse des gesamten kodierenden Abschnitts des DPYD-Gens durchgeführt. Für jedes Exon und teilweise für einzelne Fragmente eines Exons wurden die optimale DHPLC-Temperatur und der Elutionsgradient anhand von Berechnung sowie experimentell ermittelt, so dass durch das jeweilige Chromatogramm eine definitive Zuordnung zu Wildtyp oder zu spezifischen bekannten Mutanten möglich wurde; stichprobenartige Kontrollen bestätigten in der Sequenzier...

  17. GenBank

    Data.gov (United States)

    U.S. Department of Health & Human Services — GenBank is the NIH genetic sequence database, an annotated collection of all publicly available DNA sequences. GenBank is designed to provide and encourage access...

  18. RRE-dependent HIV-1 Env RNA effects on Gag protein expression, assembly and release.

    Science.gov (United States)

    López, Claudia S; Sloan, Rachel; Cylinder, Isabel; Kozak, Susan L; Kabat, David; Barklis, Eric

    2014-08-01

    The HIV-1 Gag proteins are translated from the full-length HIV-1 viral RNA (vRNA), whereas the envelope (Env) protein is translated from incompletely spliced Env mRNAs. Nuclear export of vRNAs and Env mRNAs is mediated by the Rev accessory protein which binds to the rev-responsive element (RRE) present on these RNAs. Evidence has shown there is a direct or indirect interaction between the Gag protein, and the cytoplasmic tail (CT) of the Env protein. Our current work shows that env gene expression impacts HIV-1 Gag expression and function in two ways. At the protein level, full-length Env expression altered Gag protein expression, while Env CT-deletion proteins did not. At the RNA level, RRE-containing Env mRNA expression reduced Gag expression, processing, and virus particle release from cells. Our results support models in which Gag is influenced by the Env CT, and Env mRNAs compete with vRNAs for nuclear export. PMID:24971705

  19. Splicing of Friend Murine Leukemia Virus env-mRNA Enhances Its Ability to Form Polysomes.

    Science.gov (United States)

    Machinaga, Akihito; Ishihara, Syuhei; Shirai, Akiko; Takase-Yoden, Sayaka

    2016-01-01

    Friend murine leukemia virus (MLV) belongs to the gamma retroviruses of the Retroviridae family. The positive-sense RNA of its genome contains a 5' long terminal repeat (LTR), 5' leader sequence, gag, pol, env, and 3' LTR. Transcription from proviral DNA begins from the R region of the 5' LTR and ends at the polyadenylation signal located at the R region of the other end of the 3' LTR. There is a 5' splice site in the 5' leader sequence and a 3' splice site at the 3' end of the pol region. Both full-length unspliced mRNAs and a singly spliced mRNA (env-mRNA) are produced in MLV-infected cells. The MLV Env protein plays important roles both in viral adsorption to host cells and in neuropathogenic disease in MLV-infected mice and rats. Understanding the regulatory mechanisms controlling Env expression is important for determining the functions of the Env protein. We have previously shown that splicing increases env-mRNA stability and translation efficiency. Generally, mRNA polysome formation correlates with translation efficiency. Therefore, here we investigated the effects of env-mRNA splicing on polysome formation to identify mechanisms for Env up-regulation due to splicing. We performed polysome profile analyses using Env-expression plasmids producing spliced or unspliced env-mRNA and showed that the former formed polysomes more efficiently than the latter. Thus, splicing of env-mRNA facilitated polysome formation, suggesting that this contributes to up-regulation of Env expression. We replaced the env region of the expression plasmids with a luciferase (luc) gene, and found that in this case both unspliced and spliced luc-mRNA formed polysomes to a similar extent. Thus, we conclude that whether mRNA polysome formation is affected by splicing depends on the structure of gene in question. PMID:26909075

  20. Transcriptional and functional studies of Human Endogenous Retrovirus envelope EnvP(b) and EnvV genes in human trophoblasts

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Vargas, Amandine, E-mail: amandine.vargas@voila.fr; Thiery, Maxime, E-mail: thiery.maxime@courrier.uqam.ca; Lafond, Julie, E-mail: lafond.julie@uqam.ca; Barbeau, Benoit, E-mail: barbeau.benoit@uqam.ca

    2012-03-30

    HERV (Human Endogenous Retrovirus)-encoded envelope proteins are implicated in the development of the placenta. Indeed, Syncytin-1 and -2 play a crucial role in the fusion of human trophoblasts, a key step in placentation. Other studies have identified two other HERV env proteins, namely EnvP(b) and EnvV, both expressed in the placenta. In this study, we have fully characterized both env transcripts and their expression pattern and have assessed their implication in trophoblast fusion. Through RACE analyses, standard spliced transcripts were detected, while EnvV transcripts demonstrated alternative splicing at its 3 Prime end. Promoter activity and expression of both genes were induced in forskolin-stimulated BeWo cells and in primary trophoblasts. Although we have confirmed the fusogenic activity of EnvP(b), overexpression or silencing experiments revealed no impact of this protein on trophoblast fusion. Our results demonstrate that both env genes are expressed in human trophoblasts but are not required for syncytialization.

  1. Identification of the major capsid protein of erythrocytic necrosis virus (ENV) and development of quantitative real-time PCR assays for quantification of ENV DNA.

    Science.gov (United States)

    Purcell, Maureen K; Pearman-Gillman, Schuyler; Thompson, Rachel L; Gregg, Jacob L; Hart, Lucas M; Winton, James R; Emmenegger, Eveline J; Hershberger, Paul K

    2016-07-01

    Viral erythrocytic necrosis (VEN) is a disease of marine and anadromous fish that is caused by the erythrocytic necrosis virus (ENV), which was recently identified as a novel member of family Iridoviridae by next-generation sequencing. Phylogenetic analysis of the ENV DNA polymerase grouped ENV with other erythrocytic iridoviruses from snakes and lizards. In the present study, we identified the gene encoding the ENV major capsid protein (MCP) and developed a quantitative real-time PCR (qPCR) assay targeting this gene. Phylogenetic analysis of the MCP gene sequence supported the conclusion that ENV does not group with any of the currently described iridovirus genera. Because there is no information regarding genetic variation of the MCP gene across the reported host and geographic range for ENV, we also developed a second qPCR assay for a more conserved ATPase-like gene region. The MCP and ATPase qPCR assays demonstrated good analytical and diagnostic sensitivity and specificity based on samples from laboratory challenges of Pacific herring Clupea pallasii The qPCR assays had similar diagnostic sensitivity and specificity as light microscopy of stained blood smears for the presence of intraerythrocytic inclusion bodies. However, the qPCR assays may detect viral DNA early in infection prior to the formation of inclusion bodies. Both qPCR assays appear suitable for viral surveillance or as a confirmatory test for ENV in Pacific herring from the Salish Sea. PMID:27154315

  2. Identification of the major capsid protein of erythrocytic necrosis virus (ENV) and development of quantitative real-time PCR assays for quantification of ENV DNA

    Science.gov (United States)

    Purcell, Maureen K.; Pearman-Gillman, Schuyler; Thompson, Rachel L.; Gregg, Jacob L.; Hart, Lucas M.; Winton, James R.; Emmenegger, Eveline J.; Hershberger, Paul K.

    2016-01-01

    Viral erythrocytic necrosis (VEN) is a disease of marine and anadromous fish that is caused by the erythrocytic necrosis virus (ENV), which was recently identified as a novel member of family Iridoviridae by next-generation sequencing. Phylogenetic analysis of the ENV DNA polymerase grouped ENV with other erythrocytic iridoviruses from snakes and lizards. In the present study, we identified the gene encoding the ENV major capsid protein (MCP) and developed a quantitative real-time PCR (qPCR) assay targeting this gene. Phylogenetic analysis of the MCP gene sequence supported the conclusion that ENV does not group with any of the currently described iridovirus genera. Because there is no information regarding genetic variation of the MCP gene across the reported host and geographic range for ENV, we also developed a second qPCR assay for a more conserved ATPase-like gene region. The MCP and ATPase qPCR assays demonstrated good analytical and diagnostic sensitivity and specificity based on samples from laboratory challenges of Pacific herring Clupea pallasii. The qPCR assays had similar diagnostic sensitivity and specificity as light microscopy of stained blood smears for the presence of intraerythrocytic inclusion bodies. However, the qPCR assays may detect viral DNA early in infection prior to the formation of inclusion bodies. Both qPCR assays appear suitable for viral surveillance or as a confirmatory test for ENV in Pacific herring from the Salish Sea.

  3. Transcriptional and functional studies of Human Endogenous Retrovirus envelope EnvP(b) and EnvV genes in human trophoblasts

    International Nuclear Information System (INIS)

    HERV (Human Endogenous Retrovirus)-encoded envelope proteins are implicated in the development of the placenta. Indeed, Syncytin-1 and -2 play a crucial role in the fusion of human trophoblasts, a key step in placentation. Other studies have identified two other HERV env proteins, namely EnvP(b) and EnvV, both expressed in the placenta. In this study, we have fully characterized both env transcripts and their expression pattern and have assessed their implication in trophoblast fusion. Through RACE analyses, standard spliced transcripts were detected, while EnvV transcripts demonstrated alternative splicing at its 3′ end. Promoter activity and expression of both genes were induced in forskolin-stimulated BeWo cells and in primary trophoblasts. Although we have confirmed the fusogenic activity of EnvP(b), overexpression or silencing experiments revealed no impact of this protein on trophoblast fusion. Our results demonstrate that both env genes are expressed in human trophoblasts but are not required for syncytialization.

  4. Hanstruepera neustonica gen. nov., sp. nov., a zeaxanthin-producing member of the family Flavobacteriaceae isolated from estuarine water, and emendation of Sediminibacter furfurosus Khan et al. 2007 emend. Kwon et al. 2014, Mangrovimonas yunxiaonensis Li et al. 2013, Antarcticimonas flava Yang et al. 2009 and Hoppeia youngheungensis Kwon et al. 2014.

    Science.gov (United States)

    Hameed, Asif; Shahina, Mariyam; Lai, Wei-An; Lin, Shih-Yao; Liu, You-Cheng; Hsu, Yi-Han; Young, Chiu-Chung

    2015-02-01

    A Gram-staining-negative, strictly aerobic, yellowish-orange, flexirubin-positive, rod-shaped, non-flagellated, non-spore-forming and non-gliding marine bacterium, designated strain CC-PY-50(T), was isolated from estuarine water off Pingtung, Taiwan. The strain produced zeaxanthin as a major carotenoid pigment, and showed highest pairwise 16S rRNA gene sequence similarity to Bizionia hallyeonensis T-y7(T) (93.9 %) followed by Corallibacter vietnamensis KMM 6217(T) (93.8 %), Geojedonia litorea YCS-16(T) (93.7 %) and other members of the family Flavobacteriaceae (5 % of total) fatty acids were iso-C15 : 0, iso-C15 : 1 G, iso-C17 : 0 3-OH, C16 : 0 and C16 : 1ω6c and/or C16 : 1ω7c. The DNA G+C content was 37.1 mol% and menaquinone-6 (MK-6) was the sole respiratory quinone. Based on the phylogenetic evidence and several distinguishing phenotypic and chemotaxonomic features, strain CC-PY-50(T) is proposed to represent a novel genus and species of the family Flavobacteriaceae, for which the name Hanstruepera neustonica gen. nov., sp. nov. is proposed. The type strain of the type species Hanstruepera neustonica gen. nov., sp. nov. is CC-PY-50(T) ( = JCM 19743(T) = BCRC 80747(T)). Emended descriptions of the species Sediminibacter furfurosus, Mangrovimonas yunxiaonensis, Antarcticimonas flava and Hoppeia youngheungensis are also proposed. PMID:25351879

  5. Algoritmo Genético aplicado al problema de programación en procesos tecnológicos de maquinado con ambiente Flow Shop

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    José Eduardo Márquez Delgado

    2012-01-01

    Full Text Available Debido a las limitaciones de las técnicas de optimización convencionales, en el siguiente trabajo se presenta una metaheurística basada en un algoritmo genético (AG, para resolver problemas de programación de tipo flow shop, con el objetivo de minimizar el tiempo de finalización de todos los trabajos, más conocido como makespan. Este problema, considerado de difícil solución, es típico de la optimización combinatoria y se presenta en talleres con tecnología de maquinado, donde existen máquinas herramientas convencionales y se fabrican diferentes tipos de piezas que tienen en común una misma ruta tecnológica (orden del proceso. La solución propuesta se probó con problemas clásicos publicados por otros autores, obteniéndose resultados satisfactorios en cuanto a la calidad de las soluciones encontradas y el tiempo de cómputo empleado.

  6. Predisposición genética al sangrado durante el tratamiento con anticoagulantes orales Genetic predisposition to bleeding during treatment oral anticoagulants treatment

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    R. Montes

    2008-12-01

    Full Text Available La anticoagulación conseguida durante el tratamiento con anticoagulantes orales antagonistas de la vitamina K (AVK varía entre unos pacientes y otros debido a factores individuales y ambientales. La intensidad de la anticoagulación condiciona el riesgo hemorrágico. Por tanto, es probable que los pacientes especialmente sensibles a los AVK corran un riesgo hemorrágico mayor, especialmente durante las primeras semanas. En esta revisión se va a discutir el papel de una serie de polimorfismos de las enzimas involucradas en la metabolización de los AVK o en el ciclo de la vitamina K. Dos polimorfismos del citocromo P450 2C9 y uno de la enzima VKORC1 son responsables de un alto porcentaje de la variabilidad observada en la sensibilidad a los AVK. Aunque parece que dichas alteraciones genéticas se asocian con el riesgo de experimentar una hemorragia severa, confirmar este extremo requerirá estudios más amplios y mejor diseñados.The degree of anticoagulation obtained during oral anticoagulation therapy with vitamin K antagonists (VKA varies among patients due to individual and environmental factors. The rate of anticoagulation influences the hemorrhagic risk. Therefore, it is plausible that patients specially sensitive to oral anticoagulants are at higher hemorrhagicc risk, specially during the first weeks. The role of a series of polymorphisms of the enzymes involved in the metabolism of VKA or in the vitamin K cycle are reviewed. Three polymorphisms, two in the cytochrome P450 2C9 and one in the VKORC1 enzyme, are responsible for a high portion of the variability observed in the sensitivity to AVK. Although the available literature suggests that these genetic variants could increase the risk of severe hemorrhage, larger, well designed studies are needed to confirm this notion.

  7. Neural Stem Cells as Engraftable Packaging Lines Can Mediate Gene Delivery to Microglia: Evidence from Studying Retroviral env-Related Neurodegeneration

    OpenAIRE

    Lynch, William P.; Sharpe, Arlene H.; Snyder, Evan Y.

    1999-01-01

    The induction of spongiform myeloencephalopathy by murine leukemia viruses is mediated primarily by infection of central nervous system (CNS) microglia. In this regard, we have previously shown that CasBrE-induced disease requires late, rather than early, virus replication events in microglial cells (W. P. Lynch et al., J. Virol. 70:8896–8907, 1996). Furthermore, neurodegeneration requires the presence of unique sequences within the viral env gene. Thus, the neurodegeneration-inducing events ...

  8. NMobTec-EnvEdu: M-Learning System for Environmental Education

    Science.gov (United States)

    Cavus, Nadire

    2008-01-01

    This paper introduced the implementation of a New Mobile Technologies and Environmental Education System (NMobTec-EnvEdu) designed for m-learning environments. The NMobTec-EnvEdu system has been developed to provide environmental education in a collaborative framework to undergraduate students through the Internet using mobile phones. The study…

  9. Estado emocional y creencias de salud en personas con agregación familiar al cáncer de mama que requieren consejo genético

    OpenAIRE

    Cabrera Torres, Esther

    2008-01-01

    Durante el año 2006, se produjeron 1.703.000 defunciones a causa del cáncer en Europa. El cáncer más frecuente fue el de mama, siendo el 13,5% de todos los casos de neoplasias. Sin embargo en España, los pacientes diagnosticados con cáncer de mama presentan mayor supervivencia que otros tipos tumorales; 94% al año, 84% a los 3 años y 78% a los 5 años. La mejora de la supervivencia es uno de los indicadores más importantes de la eficacia del sistema asistencial en la lucha contra el cáncer y ...

  10. GEN 105 UOP course tutorial/tutorialoutlet

    OpenAIRE

    NARESH 1

    2015-01-01

    For more course tutorials visit www.tutorialoutlet.com     GEN 105 Assignment: Reading and Retention GEN 105 Assignment: Elevator Speech GEN 105 CheckPoint: Technological Tools GEN 105 CheckPoint: Distance Learning I GEN 105 CheckPoint: Distance Learning II GEN 105 CheckPoint: Communicating in Forums GEN 105 Week 2 Discussion Questions GEN 105 Week 4 Discussion Questions GEN 105 Week 6 Discussion Questions GEN 105 Week 8 Discussion...

  11. Low Genetic Diversity Among Garlic (Allium sativum L. Accessions Detected Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD Escasa Diversidad Genética entre Accesiones de Ajo (Allium sativum L. Detectada Mediante ADN Polimórfico Amplificado al Azar (RAPD

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Mario Paredes C

    2008-03-01

    Full Text Available Garlic (Allium sativum L. is a species of vegetative propagation, showing high morphological diversity. Besides, its clones have specific adaptations to different agroclimatic regions. The objective of this study was to determine the genetic diversity of 65 garlic clones collected in Chile and introduced from different countries, by using RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA. Fourty random primers of 10 mers generated a total of 398 bands with an 87% of polymorphism. Each primer amplified between two and 20 bands. The size of the fragments obtained fluctuated between 3200 and 369 bp. The results showed that the clones analyzed had a genetic similarity rate of 94%. In addition, 70% of them were clustered in one major group. However, in spite of that situation several clones have different agronomic characteristicsEl ajo (Allium sativum L. es una especie de propagación vegetativa, que presenta una amplia variabilidad morfológica. Los clones de esta especie tienen una adaptación específica a diferentes regiones agroclimáticas. El objetivo de este estudio fue determinar la diversidad genética existente en 65 clones de ajos colectados en Chile e introducidos desde diferentes países, utilizando RAPD (ADN Polimórfico Amplificado al Azar. Para esta evaluación se utilizaron 40 partidores de 10-mers. Los partidores generaron entre dos y 20 bandas, observándose un alto número de patrones con bandas múltiples. Los fragmentos generados difieren en su tamaño entre 3.200 y 369 pb. Los partidores generaron 398 bandas, de las cuales un 87% fueron polimórficas. El análisis estadístico realizado detectó una similitud genética alta, de un 94% entre las accesiones evaluadas, donde aproximadamente un 70% de los clones formaron un grupo homogéneo. Sin embargo, este grupo incluye clones que presentan diferentes características agronómicas

  12. Gen quimérico que utiliza el gen o cDNA de la insulina, en especial para terapia génica de la diabetes

    OpenAIRE

    Bosch i Tubert, Fàtima; Valera Abril, Alfons

    2001-01-01

    Gen quimérico que utiliza el gen o CDNA de la insulina, en especial para terapia génica de la diabetes. El gen quimérico está dirigido por un promotor o fusión de promotores, los cuales preferentemente son regulables y están activados por el proceso diabético. Preferentemente, se obtiene por fusión del gen de la insulina humana al promotor de la PEPCK (p-enolpiruvato carboxiquinasa). Dicho promotor (fragmento - 460 pb a + 73 pb) está fusionado a la zona 5'' franqueante del gen de la insulina ...

  13. Linfohistiocitosis hemofagocítica, el espectro desde la enfermedad genética al síndrome de activación macrofágica

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Oscar Porras

    2011-06-01

    Full Text Available El compromiso de la regulación de la inflamación produce activación excesiva y expansión de macrófagos y linfocitos T que desencadenan una reacción inflamatoria severa, sin vías naturales de control. Los trastornos hemofagocíticos son la traducción clínica de este proceso inflamatorio. La linfohistiocitosis hemofagocítica se refiere a todas las variantes de esta patología, y el síndrome de activación macrofágica, a la variante asociada con enfermedad autoinmune. Los casos primarios se asocian con la forma familiar autosómica recesiva y los secundarios con inmunodeficiencias primarias, infección, malignidad y enfermedades autoinmunes. El principal distintivo de este grupo de patologías es la proliferación agresiva de macrófagos e histiocitos que fagocitan otras células sanguíneas. La reducción en la actividad de las células NK produce un aumento en la activación y expansión de linfocitos T, los cuales producen grandes cantidades de citoquinas. Las citoquinas inducen activación de macrófagos y células dendríticas, infiltración tisular y producción de interleuquinas, lo que genera una reacción inflamatoria severa, responsable del daño tisular y de las manifestaciones clínicas. El curso clínico se caracteriza principalmente por fiebre prolongada, hepatoesplenomegalia y citopenias. Los estudios de laboratorio muestran aumento de ferritina, triglicéridos e hipofibrinogenemia. La hemofagocitosis en médula ósea está presente en más del 80% de los casos al diagnóstico. El tratamiento está dirigido contra el linfocito T y los histiocitos hiperactivados, combinando quimioterapia con inmunosupresores y, en algunos casos, trasplante de células madre hematopoyéticas. Este tratamiento ha producido un cambio en la sobrevida de los pacientes. El protocolo de tratamiento HLH-2004 es una guía que estandariza el tratamiento, combinando etopósido, dexametazona y ciclosporina A. En Costa Rica se han reportado 60 casos en

  14. Using GenBank.

    Science.gov (United States)

    Sayers, Eric W; Karsch-Mizrachi, Ilene

    2016-01-01

    GenBank(®) is a comprehensive database of publicly available DNA sequences for 300,000 named organisms, more than 110,000 within the embryophyta, obtained through submissions from individual laboratories and batch submissions from large-scale sequencing projects. Daily data exchange with the European Nucleotide Archive (ENA) in Europe and the DNA Data Bank of Japan ensures worldwide coverage. GenBank is accessible through the NCBI Entrez retrieval system that integrates data from the major DNA and protein sequence databases with taxonomy, genome, mapping, protein structure and domain information, as well as the biomedical journal literature in PubMed. BLAST provides sequence similarity searches of GenBank and other sequence databases. Complete bimonthly releases and daily updates of the GenBank database are available by FTP. GenBank usage scenarios ranging from local analyses of the data available via FTP to online analyses supported by the NCBI web-based tools are discussed. To access GenBank and its related retrieval and analysis services, go to the NCBI home page at www.ncbi.nlm.nih.gov . PMID:26519398

  15. Comparison of the Immunogenicities of HIV-1 Mutants Based on Structural Modification of env

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    Jian-hui NIE; Chun-tao ZHANG; Hui-hui CHONG; Xue-ling WU; Chu-yu LIU; Yu WU; Chen-yan ZHAO; Lin-qi ZHANG; You-Chun WANG

    2008-01-01

    Eleven env mutants were designed and generated by site-directed mutagenesis of the regions around Nab epitopes and deletions of variable regions in env.The immunogenicities of the generated mutants were evaluated using single-cycle infection neutralization assays with two pseudoviruses and IFN-γELISPOT.Overall,five mutants(dWt,M2,M5-2,M5-1 and dM7)induced highed neutralization activities for both pseudoviruses than plasmid Wt,while only two of the mutants(dWt and M5-2)showed significant differences(P<0.05).Two mutants(M2 and dM2)induced more Env-specific T cells than plasmid Wt.Statistically however,significance was only reached for mutant M2.Thus,properly modified HIV-1 Env may have the potential to induce potent cellular and humoral immune responses.

  16. Inhibition of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Env-Mediated Fusion by DC-SIGN

    OpenAIRE

    Nobile, Cinzia; Moris, Arnaud; Porrot, Françoise; Sol-Foulon, Nathalie; Schwartz, Olivier

    2003-01-01

    DC-SIGN, a lectin expressed on dendritic cell and macrophage subsets, binds to human immunodeficiency virus Env glycoproteins, allowing capture of viral particles. Captured virions either infect target cells or are efficiently transmitted to lymphocytes. Cellular mechanisms underlying the effects of DC-SIGN remain poorly understood. Here we have analyzed the effects of DC-SIGN on viral entry and on syncytium formation induced by Env glycoproteins. The lectin enhanced susceptibility to viral i...

  17. PANACEA English automatically acquired lexicon for ENV domain: Subcategorization Frames and Lexical Semantic classes for nouns

    OpenAIRE

    University of Cambridge. Department of Theoretical and Applied Linguistics; Universitat Pompeu Fabra. Institut Universitari de Ling????stica Aplicada (IULA)

    2013-01-01

    This is a domain-specific lexicon for English for environment (ENV) domain. This lexicon contain both, subcategorization frames for verbs and lexical semantic classes for nouns. This lexicon has been automatically created using PANACEA webservices using crawled data. The crawled data was obtained crawling web pages that were automatically detected to be in the English language and were automatically classified as relevant to the ENV domain. Data collection took place in the summer of 2011.

  18. Generation of H9 T-cells stably expressing a membrane-bound form of the cytoplasmic tail of the Env-glycoprotein: lack of transcomplementation of defective HIV-1 virions encoding C-terminally truncated Env

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Bosch Valerie

    2006-05-01

    Full Text Available Abstract H9-T-cells do not support the replication of mutant HIV-1 encoding Env protein lacking its long cytoplasmic C-terminal domain (Env-CT. Here we describe the generation of a H9-T-cell population constitutively expressing the HIV-1 Env-CT protein domain anchored in the cellular membrane by it homologous membrane-spanning domain (TMD. We confirmed that the Env-TMD-CT protein was associated with cellular membranes, that its expression did not have any obvious cytotoxic effects on the cells and that it did not affect wild-type HIV-1 replication. However, as measured in both a single-round assay as well as in spreading infections, replication competence of mutant pNL-Tr712, lacking the Env-CT, was not restored in this H9 T-cell population. This means that the Env-CT per se cannot transcomplement the replication block of HIV-1 virions encoding C-terminally truncated Env proteins and suggests that the Env-CT likely exerts its function only in the context of the complete Env protein.

  19. Antibody to gp41 MPER alters functional properties of HIV-1 Env without complete neutralization.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Arthur S Kim

    2014-07-01

    Full Text Available Human antibody 10E8 targets the conserved membrane proximal external region (MPER of envelope glycoprotein (Env subunit gp41 and neutralizes HIV-1 with exceptional potency. Remarkably, HIV-1 containing mutations that reportedly knockout 10E8 binding to linear MPER peptides are partially neutralized by 10E8, producing a local plateau in the dose response curve. Here, we found that virus partially neutralized by 10E8 becomes significantly less neutralization sensitive to various MPER antibodies and to soluble CD4 while becoming significantly more sensitive to antibodies and fusion inhibitors against the heptad repeats of gp41. Thus, 10E8 modulates sensitivity of Env to ligands both pre- and post-receptor engagement without complete neutralization. Partial neutralization by 10E8 was influenced at least in part by perturbing Env glycosylation. With unliganded Env, 10E8 bound with lower apparent affinity and lower subunit occupancy to MPER mutant compared to wild type trimers. However, 10E8 decreased functional stability of wild type Env while it had an opposite, stabilizing effect on MPER mutant Envs. Clade C isolates with natural MPER polymorphisms also showed partial neutralization by 10E8 with altered sensitivity to various gp41-targeted ligands. Our findings suggest a novel mechanism of virus neutralization by demonstrating how antibody binding to the base of a trimeric spike cross talks with adjacent subunits to modulate Env structure and function. The ability of an antibody to stabilize, destabilize, partially neutralize as well as alter neutralization sensitivity of a virion spike pre- and post-receptor engagement may have implications for immunotherapy and vaccine design.

  20. Molecular identification of erythrocytic necrosis virus (ENV) from the blood of Pacific herring (Clupea pallasii)

    Science.gov (United States)

    2014-01-01

    Viral erythrocytic necrosis (VEN) is a condition affecting the red blood cells of more than 20 species of marine and anadromous fishes in the North Atlantic and North Pacific Oceans. Among populations of Pacific herring (Clupea pallasii) on the west coast of North America the disease causes anemia and elevated mortality in periodic epizootics. Presently, VEN is diagnosed by observation of typical cytoplasmic inclusion bodies in stained blood smears from infected fish. The causative agent, erythrocytic necrosis virus (ENV), is unculturable and a presumed iridovirus by electron microscopy. In vivo amplification of the virus in pathogen-free laboratory stocks of Pacific herring with subsequent virus concentration, purification, DNA extraction, and high-throughput sequencing were used to obtain genomic ENV sequences. Fragments with the highest sequence identity to the family Iridoviridae were used to design four sets of ENV-specific polymerase chain reaction (PCR) primers. Testing of blood and tissue samples from experimentally and wild infected Pacific herring as well as DNA extracted from other amphibian and piscine iridoviruses verified the assays were specific to ENV with a limit of detection of 0.0003 ng. Preliminary phylogenetic analyses of a 1448 bp fragment of the putative DNA polymerase gene supported inclusion of ENV in a proposed sixth genus of the family Iridoviridae that contains other erythrocytic viruses from ectothermic hosts. This study provides the first molecular evidence of ENV's inclusion within the Iridoviridae family and offers conventional PCR assays as a means of rapidly surveying the ENV-status of wild and propagated Pacific herring stocks.

  1. Role of the Cytoplasmic Tail of Ecotropic Moloney Murine Leukemia Virus Env Protein in Fusion Pore Formation

    OpenAIRE

    Melikyan, Grigory B.; Markosyan, Ruben M.; Brener, Sofya A.; Rozenberg, Yanina; Cohen, Fredric S.

    2000-01-01

    Fusion between cells expressing envelope protein (Env) of Moloney murine leukemia virus and target cells were studied by use of video fluorescence microscopy and electrical capacitance measurements. When the full-length 632-amino-acid residue Env was expressed, fusion did not occur at all for 3T3 cells as target and only somewhat for XC6 cells. Expression of Env 616*—a construct of Env with the last 16 amino acid residues (617 to 632; the R peptide) deleted from its C terminus to match the pr...

  2. Parenteral Administration of Capsule Depolymerase EnvD Prevents Lethal Inhalation Anthrax Infection.

    Science.gov (United States)

    Negus, David; Vipond, Julia; Hatch, Graham J; Rayner, Emma L; Taylor, Peter W

    2015-12-01

    Left untreated, inhalation anthrax is usually fatal. Vegetative forms of Bacillus anthracis survive in blood and tissues during infection due to elaboration of a protective poly-γ-D-glutamic acid (PDGA) capsule that permits uncontrolled bacterial growth in vivo, eventually leading to overwhelming bacillosis and death. As a measure to counter threats from multidrug-resistant strains, we are evaluating the prophylactic and therapeutic potential of the PDGA depolymerase EnvD, a stable and potent enzyme which rapidly and selectively removes the capsule from the surface of vegetative cells. Repeated intravenous administration of 10 mg/kg recombinant EnvD (rEnvD) to mice infected with lethal doses of B. anthracis Ames spores by inhalation prevented the emergence of symptoms of anthrax and death; all animals survived the 5-day treatment period, and 70% survived to the end of the 14-day observation period. In contrast to results in sham-treated animals, the lungs and spleen of rEnvD-dosed animals were free of gross pathological changes. We conclude that rEnvD has potential as an agent to prevent the emergence of inhalation anthrax in infected animals and is likely to be effective against drug-resistant forms of the pathogen.

  3. Parenteral Administration of Capsule Depolymerase EnvD Prevents Lethal Inhalation Anthrax Infection.

    Science.gov (United States)

    Negus, David; Vipond, Julia; Hatch, Graham J; Rayner, Emma L; Taylor, Peter W

    2015-12-01

    Left untreated, inhalation anthrax is usually fatal. Vegetative forms of Bacillus anthracis survive in blood and tissues during infection due to elaboration of a protective poly-γ-D-glutamic acid (PDGA) capsule that permits uncontrolled bacterial growth in vivo, eventually leading to overwhelming bacillosis and death. As a measure to counter threats from multidrug-resistant strains, we are evaluating the prophylactic and therapeutic potential of the PDGA depolymerase EnvD, a stable and potent enzyme which rapidly and selectively removes the capsule from the surface of vegetative cells. Repeated intravenous administration of 10 mg/kg recombinant EnvD (rEnvD) to mice infected with lethal doses of B. anthracis Ames spores by inhalation prevented the emergence of symptoms of anthrax and death; all animals survived the 5-day treatment period, and 70% survived to the end of the 14-day observation period. In contrast to results in sham-treated animals, the lungs and spleen of rEnvD-dosed animals were free of gross pathological changes. We conclude that rEnvD has potential as an agent to prevent the emergence of inhalation anthrax in infected animals and is likely to be effective against drug-resistant forms of the pathogen. PMID:26438506

  4. Cleavage-Independent HIV-1 Env Trimers Engineered as Soluble Native Spike Mimetics for Vaccine Design

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Shailendra Kumar Sharma

    2015-04-01

    Full Text Available Viral glycoproteins mediate entry by pH-activated or receptor-engaged activation and exist in metastable pre-fusogenic states that may be stabilized by directed rational design. As recently reported, the conformationally fixed HIV-1 envelope glycoprotein (Env trimers in the pre-fusion state (SOSIP display molecular homogeneity and structural integrity at relatively high levels of resolution. However, the SOSIPs necessitate full Env precursor cleavage, which requires endogenous furin overexpression. Here, we developed an alternative strategy using flexible peptide covalent linkage of Env subdomains to produce soluble, homogeneous, and cleavage-independent Env mimics, called native flexibly linked (NFL trimers, as vaccine candidates. This simplified design avoids the need for furin co-expression and, in one case, antibody affinity purification to accelerate trimer scale-up for preclinical and clinical applications. We have successfully translated the NFL design to multiple HIV-1 subtypes, establishing the potential to become a general method of producing native-like, well-ordered Env trimers for HIV-1 or other viruses.

  5. Complex determinants of macrophage tropism in env of simian immunodeficiency virus.

    Science.gov (United States)

    Mori, K; Ringler, D J; Kodama, T; Desrosiers, R C

    1992-04-01

    Macrophage-tropic virus variants evolved during the course of infection of individual rhesus monkeys with cloned, non-macrophagetropic simian immunodeficiency virus. Specific changes in the envelope gene (env) were found to be primarily responsible for the dramatic increase in the ability of the virus to replicate in macrophages. Cloned viruses differing at nine amino acid positions in env exhibited a more than 100-fold difference in replicative capacity for primary cultures of rhesus monkey alveolar macrophages. At least five of the nine amino acid changes contributed to macrophage tropism. These determinants were distributed across the full length of env, including both the gp120 and gp41 products of the env gene. Furthermore, the emergence of macrophagetropic variants in vivo was associated with specific pathologic manifestations in which the macrophage is the major infected cell type. Thus, major determinants of macrophage tropism reside in env, they can be complex in nature, and the presence of macrophage-tropic virus variants in vivo can influence the disease course and disease manifestations.

  6. Predisposição genética, hereditariedade e reabsorções radiculares em Ortodontia: cuidados com interpretações precipitadas: uma análise crítica do trabalho de Al-Qawasmi et al Genetics predisposition, heredity and radicular resorption, in Orthodontics: cares with precipitated interpretations and a critical analysis of Al-Qawasmi´s work

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Alberto Consolaro

    2004-05-01

    Full Text Available O trabalho de Al-Qawasmi et al.¹, publicado em março de 2003 pelo American Journal of Orthodontics and Dentofacial Orthopedics, procurou estabelecer uma predisposição genética para justificar as reabsorções dentárias em Ortodontia, mas apresentou algumas limitações metodológicas e equívocos na interpretação de seus resultados. A análise criteriosa deste artigo ressalta que, na maioria, estas limitações foram mencionadas e reconhecidas pelos autores na discussão do trabalho, mas o seu resumo e título foram muito taxativos e conclusivos. A linguagem de estudos genéticos nem sempre é familiar a todos os clínicos e isto também requer uma análise esclarecedora à luz de uma visão mais aplicada ao cotidiano ortodôntico. Referenciar ou citar este trabalho de Al-Qawasmi et al.¹, para afirmar de forma taxativa que se demonstrou a natureza hereditária das reabsorções dentárias em Ortodontia, pode denotar falta de conhecimento sobre o assunto ou uma leitura ou compreensão apenas do seu título. Ou ainda, a citação deste trabalho como prova definitiva de associação entre hereditariedade e reabsorções dentárias em Ortodontia pode traduzir também o desejo de excluir da prática clínica a responsabilidade de planejar de forma individualizada e detalhada cada tratamento com base no conhecimento das possibilidades e limitações técnicas oferecidas pela ciência ortodôntica, bem como nas suas bases biológicas, por exemplo, valorizando a morfologia radicular e da crista óssea alveolar e o papel dos cementoblastos na proteção da superfície radicular.The study published in the American Journal of Orthodontics and Dentofacial Orthopedics last March by Al-Qawasmi et al. tried to implicate dental resorption during orthodontic treatment to genetic predisposition. The methodology used, however, presents limitations and interpretative mistakes of the results. When analyzing the article sensibly, one is able to find that

  7. SHIV-1157i and passaged progeny viruses encoding R5 HIV-1 clade C env cause AIDS in rhesus monkeys

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Siddappa Nagadenahalli B

    2008-10-01

    Full Text Available Abstract Background Infection of nonhuman primates with simian immunodeficiency virus (SIV or chimeric simian-human immunodeficiency virus (SHIV strains is widely used to study lentiviral pathogenesis, antiviral immunity and the efficacy of AIDS vaccine candidates. SHIV challenges allow assessment of anti-HIV-1 envelope responses in primates. As such, SHIVs should mimic natural HIV-1 infection in humans and, to address the pandemic, encode HIV-1 Env components representing major viral subtypes worldwide. Results We have developed a panel of clade C R5-tropic SHIVs based upon env of a Zambian pediatric isolate of HIV-1 clade C, the world's most prevalent HIV-1 subtype. The parental infectious proviral clone, SHIV-1157i, was rapidly passaged through five rhesus monkeys. After AIDS developed in the first animal at week 123 post-inoculation, infected blood was infused into a sixth monkey. Virus reisolated at this late stage was still exclusively R5 tropic and mucosally transmissible. Here we describe the long-term follow-up of this initial cohort of six monkeys. Two have remained non-progressors, whereas the other four gradually progressed to AIDS within 123–270 weeks post-exposure. Two progressors succumbed to opportunistic infections, including a case of SV40 encephalitis. Conclusion These data document the disease progression induced by the first mucosally transmissible, pathogenic R5 non-clade B SHIV and suggest that SHIV-1157i-derived viruses, including the late-stage, highly replication-competent SHIV-1157ipd3N4 previously described (Song et al., 2006, display biological characteristics that mirror those of HIV-1 clade C and support their expanded use for AIDS vaccine studies in nonhuman primates.

  8. Human Antibodies that Recognize Novel Immunodominant Quaternary Epitopes on the HIV-1 Env Protein.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Mark D Hicar

    Full Text Available Numerous broadly neutralizing antibodies (Abs target epitopes that are formed or enhanced during mature HIV envelope formation (i.e. quaternary epitopes. Generally, it is thought that Env epitopes that induce broadly neutralizing Abs are difficult to access and poorly immunogenic because of the characteristic oligomerization, conformational flexibility, sequence diversity and extensive glycosylation of Env protein. To enhance for isolation of quaternary epitope-targeting Abs (QtAbs, we previously used HIV virus-like particles (VLPs to bind B cells from long-term non-progressor subjects to identify a panel of monoclonal Abs. When expressed as recombinant full-length Abs, a subset of these novel Abs exhibited the binding profiles of QtAbs, as they either failed to bind to monomeric Env protein or showed much higher affinity for Env trimers and VLPs. These QtAbs represented a significant proportion of the B-cell response identified with VLPs. The Ab genes of these clones were highly mutated, but they did not neutralize common HIV strains. We sought to further define the epitopes targeted by these QtAbs. Competition-binding and mapping studies revealed these Abs targeted four separate epitopes; they also failed to compete for binding by Abs to known major neutralizing epitopes. Detailed epitope mapping studies revealed that two of the four epitopes were located in the gp41 subunit of Env. These QtAbs bound pre-fusion forms of antigen and showed differential binding kinetics depending on whether oligomers were produced as recombinant gp140 trimers or as full-length Env incorporated into VLPs. Antigenic regions within gp41 present unexpectedly diverse structural epitopes, including these QtAb epitopes, which may be targeted by the naturally occurring Ab response to HIV infection.

  9. Human Antibodies that Recognize Novel Immunodominant Quaternary Epitopes on the HIV-1 Env Protein.

    Science.gov (United States)

    Hicar, Mark D; Chen, Xuemin; Sulli, Chidananda; Barnes, Trevor; Goodman, Jason; Sojar, Hakimuddin; Briney, Bryan; Willis, Jordan; Chukwuma, Valentine U; Kalams, Spyros A; Doranz, Benjamin J; Spearman, Paul; Crowe, James E

    2016-01-01

    Numerous broadly neutralizing antibodies (Abs) target epitopes that are formed or enhanced during mature HIV envelope formation (i.e. quaternary epitopes). Generally, it is thought that Env epitopes that induce broadly neutralizing Abs are difficult to access and poorly immunogenic because of the characteristic oligomerization, conformational flexibility, sequence diversity and extensive glycosylation of Env protein. To enhance for isolation of quaternary epitope-targeting Abs (QtAbs), we previously used HIV virus-like particles (VLPs) to bind B cells from long-term non-progressor subjects to identify a panel of monoclonal Abs. When expressed as recombinant full-length Abs, a subset of these novel Abs exhibited the binding profiles of QtAbs, as they either failed to bind to monomeric Env protein or showed much higher affinity for Env trimers and VLPs. These QtAbs represented a significant proportion of the B-cell response identified with VLPs. The Ab genes of these clones were highly mutated, but they did not neutralize common HIV strains. We sought to further define the epitopes targeted by these QtAbs. Competition-binding and mapping studies revealed these Abs targeted four separate epitopes; they also failed to compete for binding by Abs to known major neutralizing epitopes. Detailed epitope mapping studies revealed that two of the four epitopes were located in the gp41 subunit of Env. These QtAbs bound pre-fusion forms of antigen and showed differential binding kinetics depending on whether oligomers were produced as recombinant gp140 trimers or as full-length Env incorporated into VLPs. Antigenic regions within gp41 present unexpectedly diverse structural epitopes, including these QtAb epitopes, which may be targeted by the naturally occurring Ab response to HIV infection. PMID:27411063

  10. Monoclonal Antibodies Recognizing HIV-1 gp41 Could Inhibit Env-Mediated Syncytium Formation

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    ZHANG Geng; CHEN Yinghua

    2005-01-01

    Some monoclonal antibodies (mAbs) could inhibit infection by HIV-1. In this study, four mAbs against HIV-1 gp41 were prepared in mice. All four mAbs could bind to the recombinant soluble gp41 and recognize the native envelope glycoprotein gp160 expressed on the HIV-Env+ CHO-WT cell in flow cytometry analysis. Interestingly, the results show that all four mAbs purified by affinity chromatography could inhibit HIV-1 Env-mediated membrane fusion (syncytium formation) by 40%-60% at 10 μg/mL, which implies potential inhibitory activities against HIV-1.

  11. Avian sarcoma virus gag and env gene structural protein precursors contain a common amino-terminal sequence.

    Science.gov (United States)

    Ficht, T A; Chang, L J; Stoltzfus, C M

    1984-01-01

    The initiation site for translation of the avian sarcoma virus glycoprotein precursor, Pr63env, has been determined by analyzing the amino-terminal peptides of Pr63env and the polyprotein precursor Pr76gag encoded by the viral gag gene. The acceptor splice junction used to form the env gene mRNA has also been identified. Hybrid-selected virus-specific mRNAs were translated in vitro in the presence of either L-[35S]methionine to label at every methionine residue or L-[35S]methionine-tRNAMeti to label specifically at the amino-terminal methionine residues. Tryptic peptide maps of Pr63env labeled at every methionine residue contain all of the peptides, plus one additional peptide, present in the map of Pr57env, a nonglycosylated env-encoded polypeptide of molecular weight 57,000 immunoprecipitated from tunicamycin-treated cells. Specific amino-terminal labeling of the in vitro-synthesized polypeptides showed that the peptide missing from Pr57env corresponds to the amino-terminal tryptic peptide of Pr63env, which is removed in vivo as part of the amino-terminal signal peptide. Comparison of the amino-terminal tryptic peptides of Pr63env and Pr76gag showed that they are identical. In contrast, the chymotryptic amino-terminal peptides of Pr76gag and Pr63env are not identical. The location of the acceptor-splice junction in the env mRNA of the Prague A strain of avian sarcoma virus was determined by mung bean nuclease mapping to be at nucleotide 5,078. Fusion of the gag and env gene sequences during splicing results in use of the same AUG codon to initiate synthesis of Pr76gag and Pr63env. This sequence is contained within the 397-nucleotide 5' terminal leader that is spliced to the body of the env mRNA. The possible significance of these results for the regulation of avian sarcoma virus synthesis and translation is discussed.

  12. Repeated Vaccination of Cows with HIV Env gp140 during Subsequent Pregnancies Elicits and Sustains an Enduring Strong Env-Binding and Neutralising Antibody Response.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Behnaz Heydarchi

    Full Text Available An important feature of a potential vaccine against HIV is the production of broadly neutralising antibodies (BrNAbs capable of potentially blocking infectivity of a diverse array of HIV strains. BrNAbs naturally arise in some HIV infected individuals after several years of infection and their serum IgG can neutralise various HIV strains across different subtypes. We previously showed that vaccination of cows with HIV gp140 AD8 trimers resulted in a high titre of serum IgG against HIV envelope (Env that had strong BrNAb activity. These polyclonal BrNAbs concentrated into the colostrum during the late stage of pregnancy and can be harvested in vast quantities immediately after calving. In this study, we investigated the effect of prolonged HIV gp140 vaccination on bovine colostrum IgG HIV Env-binding and BrNAb activity over subsequent pregnancies. Repeated immunisation led to a maintained high titre of HIV Env specific IgG in the colostrum batches, but this did not increase through repeated cycles. Colostrum IgG from all batches also strongly competed with sCD4 binding to gp140 Env trimer and with human-derived monoclonal VRC01 and b12 BrNAbs that bind the CD4 binding site (CD4bs. Furthermore, competition neutralisation assays using RSC3 Env gp120 protein core and a derivative CD4bs mutant, RSC3 Δ371I/P363N, showed that CD4bs neutralising antibodies contribute to the neutralising activity of all batches of purified bovine colostrum IgG. This result indicates that the high IgG titre/avidity of anti-CD4bs antibodies with BrNAb activity was achieved during the first year of vaccination and was sustained throughout the years of repeated vaccinations in the cow tested. Although IgG of subsequent colostrum batches may have a higher avidity towards the CD4bs, the overall breadth in neutralisation was not enhanced. This implies that the boosting vaccinations over 4 years elicited a polyclonal antibody response that maintained the proportion of both

  13. Repeated Vaccination of Cows with HIV Env gp140 during Subsequent Pregnancies Elicits and Sustains an Enduring Strong Env-Binding and Neutralising Antibody Response

    Science.gov (United States)

    Center, Rob J.; Gonelli, Christopher; Muller, Brian; Mackenzie, Charlene; Khoury, Georges; Lichtfuss, Marit; Rawlin, Grant; Purcell, Damian F. J.

    2016-01-01

    An important feature of a potential vaccine against HIV is the production of broadly neutralising antibodies (BrNAbs) capable of potentially blocking infectivity of a diverse array of HIV strains. BrNAbs naturally arise in some HIV infected individuals after several years of infection and their serum IgG can neutralise various HIV strains across different subtypes. We previously showed that vaccination of cows with HIV gp140 AD8 trimers resulted in a high titre of serum IgG against HIV envelope (Env) that had strong BrNAb activity. These polyclonal BrNAbs concentrated into the colostrum during the late stage of pregnancy and can be harvested in vast quantities immediately after calving. In this study, we investigated the effect of prolonged HIV gp140 vaccination on bovine colostrum IgG HIV Env-binding and BrNAb activity over subsequent pregnancies. Repeated immunisation led to a maintained high titre of HIV Env specific IgG in the colostrum batches, but this did not increase through repeated cycles. Colostrum IgG from all batches also strongly competed with sCD4 binding to gp140 Env trimer and with human-derived monoclonal VRC01 and b12 BrNAbs that bind the CD4 binding site (CD4bs). Furthermore, competition neutralisation assays using RSC3 Env gp120 protein core and a derivative CD4bs mutant, RSC3 Δ371I/P363N, showed that CD4bs neutralising antibodies contribute to the neutralising activity of all batches of purified bovine colostrum IgG. This result indicates that the high IgG titre/avidity of anti-CD4bs antibodies with BrNAb activity was achieved during the first year of vaccination and was sustained throughout the years of repeated vaccinations in the cow tested. Although IgG of subsequent colostrum batches may have a higher avidity towards the CD4bs, the overall breadth in neutralisation was not enhanced. This implies that the boosting vaccinations over 4 years elicited a polyclonal antibody response that maintained the proportion of both neutralising and non

  14. Caracterización de la diversidad genética en naranja y comparación del polimorfismo de microsatélites amplificados al azar (RAMs usando electroforesis de poliacrilamida y azarosa Characterization of the genetic diversity in orange, and comparison of polymorphism in randomly-amplifed microsatellites (RAMs, using polyacrylamide and agarose electrophoresis

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ana Cruz Morillo Coronado

    2009-10-01

    Full Text Available Se compararon las eficiencias de tres métodos de electroforesis en agarosa y poliacrilamida, usando la cámara pequeña de DNA Sequencing System y cámara grande OWL Sequi-Gen Sequencing Cell, en la detección del polimorfismo en 21 accesiones de naranja (Citrus sinensis con empleo del cebador CGA. El gel de poliacrilamida dio mejor resolución de los productos amplificados vía PCR producidos por RAMs. Este permitió una mejor detección de bandas de ADN polimórficas, lo que facilitó la identificación de la variabilidad genética. La electroforesis en agarosa puede ser más conveniente en otras aplicaciones, debido al bajo costo y fácil aplicación. El estudio de diversidad genética en naranja usando microsatélites RAMs diferenció 51 accesiones en siete grupos con 0.75 de similaridad y 0.25 de heterocigosidad, lo que revela bajo polimorfismo genético. La técnica RAMs permitió agrupar las accesiones en Comunes o Blancas, Navel y Pigmentadas o Sanguinas.We compared the efficiency of three methods of agarose and polyacrylamide electrophoresis (using the small tank of the DNA Sequencing System and the large OWL Sequi-Gen Sequencing Cell, for the detection of polymorphism in 21 accessions of orange (Citrus sinensis, using the primer CGA. The polyacrylamide gel gave better resolution of the PCR-amplified RAM products. This method allowed better detection of polymorphic DNA bands, facilitating the identification of genetic variability. The agarose electrophoresis may be more convenient in other applications, due to its low cost and easy implementation. The study of genetic diversity in orange using RAMs separated 51 accessions into seven groups with 0.75 similarity, and 0.25 heterozygosity, revealing low genetic polymorphism. The RAMs technique grouped the accessions into “Common or White”, “Navel” and “Pigmented or “Sanguine”.

  15. Selected HIV-1 Env trimeric formulations act as potent immunogens in a rabbit vaccination model

    DEFF Research Database (Denmark)

    Heyndrickx, Leo; Stewart-Jones, Guillaume; Jansson, Marianne Bendixen;

    2013-01-01

    Ten to 30% of HIV-1 infected subjects develop broadly neutralizing antibodies (bNAbs) during chronic infection. We hypothesized that immunizing rabbits with viral envelope glycoproteins (Envs) from these patients may induce bNAbs, when formulated as a trimeric protein and in the presence...

  16. AquaEnv: an aquatic acid–base modelling environment in R

    NARCIS (Netherlands)

    Hofmann, A.F.; Soetaert, K.E.R.; Middelburg, J.J.; Meysman, F.J.R.

    2010-01-01

    AquaEnv is an integrated software package for aquatic chemical model generation focused on ocean acidification and antropogenic CO2 uptake. However, the package is not restricted to the carbon cycle or the oceans: it calculates, converts, and visualizes information necessary to describe pH, related

  17. Targeted Isolation of Antibodies Directed against Major Sites of SIV Env Vulnerability.

    Science.gov (United States)

    Mason, Rosemarie D; Welles, Hugh C; Adams, Cameron; Chakrabarti, Bimal K; Gorman, Jason; Zhou, Tongqing; Nguyen, Richard; O'Dell, Sijy; Lusvarghi, Sabrina; Bewley, Carole A; Li, Hui; Shaw, George M; Sheng, Zizhang; Shapiro, Lawrence; Wyatt, Richard; Kwong, Peter D; Mascola, John R; Roederer, Mario

    2016-04-01

    The simian immunodeficiency virus (SIV) challenge model of lentiviral infection is often used as a model to human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) for studying vaccine mediated and immune correlates of protection. However, knowledge of the structure of the SIV envelope (Env) glycoprotein is limited, as is knowledge of binding specificity, function and potential efficacy of SIV antibody responses. In this study we describe the use of a competitive probe binding sort strategy as well as scaffolded probes for targeted isolation of SIV Env-specific monoclonal antibodies (mAbs). We isolated nearly 70 SIV-specific mAbs directed against major sites of SIV Env vulnerability analogous to broadly neutralizing antibody (bnAb) targets of HIV-1, namely, the CD4 binding site (CD4bs), CD4-induced (CD4i)-site, peptide epitopes in variable loops 1, 2 and 3 (V1, V2, V3) and potentially glycan targets of SIV Env. The range of SIV mAbs isolated includes those exhibiting varying degrees of neutralization breadth and potency as well as others that demonstrated binding but not neutralization. Several SIV mAbs displayed broad and potent neutralization of a diverse panel of 20 SIV viral isolates with some also neutralizing HIV-2(7312A). This extensive panel of SIV mAbs will facilitate more effective use of the SIV non-human primate (NHP) model for understanding the variables in development of a HIV vaccine or immunotherapy. PMID:27064278

  18. Kommentarer til arbejdsdokument ENV/04/27. Dokument fra "Antibiotic resistance marker genes working group"

    DEFF Research Database (Denmark)

    Kjellsson, Gøsta

    2012-01-01

    "DMU har modtaget og vurderet det fremsendte dokument ENV/04/27 og bilag (mail fra Skov- og Naturstyrelsen d. 14-10-2004) om anvendelsen af antibiotikaresistensmarkører (ARM) hos GMO. Vi har tidligere flere gange kommenteret anvendelsen af antibiotikaresistens (se f.eks. brev til Skov- og Naturst...

  19. XIAO Pei-gen

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    2013-01-01

    <正>Academician of Chinese Academy of Engineering Editor-in-chief of Chinese Herbal Medicines(CHM)Honorary director of Institute of Medicinal Plant Development,Chinese Academy of Medical Sciences,Beijing100193,China Tel/Fax:+86-10-62894462 E-mail:xiaopg@public.bta.net.cn Professor XIAO Pei-gen is the founder of the Institute of Medicinal Plant Development(IMPLAD),Chinese Academy of Medical Sciences(CAMS).He is also one of the founders and leading

  20. Antigenic properties of a transport-competent influenza HA/HIV Env chimeric protein

    International Nuclear Information System (INIS)

    The transmembrane subunit (gp41) of the HIV Env glycoprotein contains conserved neutralizing epitopes which are not well-exposed in wild-type HIV Env proteins. To enhance the exposure of these epitopes, a chimeric protein, HA/gp41, in which the gp41 of HIV-1 89.6 envelope protein was fused to the C-terminus of the HA1 subunit of the influenza HA protein, was constructed. Characterization of protein expression showed that the HA/gp41 chimeric proteins were expressed on cell surfaces and formed trimeric oligomers, as found in the HIV Env as well as influenza HA proteins. In addition, the HA/gp41 chimeric protein expressed on the cell surface can also be cleaved into 2 subunits by trypsin treatment, similar to the influenza HA. Moreover, the HA/gp41 chimeric protein was found to maintain a pre-fusion conformation. Interestingly, the HA/gp41 chimeric proteins on cell surfaces exhibited increased reactivity to monoclonal antibodies against the HIV Env gp41 subunit compared with the HIV-1 envelope protein, including the two broadly neutralizing monoclonal antibodies 2F5 and 4E10. Immunization of mice with a DNA vaccine expressing the HA/gp41 chimeric protein induced antibodies against the HIV gp41 protein and these antibodies exhibit neutralizing activity against infection by an HIV SF162 pseudovirus. These results demonstrate that the construction of such chimeric proteins can provide enhanced exposure of conserved epitopes in the HIV Env gp41 and may represent a novel vaccine design strategy for inducing broadly neutralizing antibodies against HIV

  1. La gens Licinia y el Nordeste peninsular. Una aproximación al estudio de las formas de propiedad y de gestión de un rico patrimonio familiar

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Berni, Piero

    2005-12-01

    Full Text Available In the last years, either progress in landscape archaeology as well as studies on the epigraphy of production areas, have contribute to increase our volume of information. However, such headway not always has come along with an improvement in the data interpretation, in other words, in the study of the complex forms of landownership and management of resources in Roman Spain. We believed it is necessary to integrate diverse types of existent documentation sources, and we propose in the present case to study a working model focus on the gens Licinia. The importance of this gens in the Northeast of the Peninsula and the outstanding volume of information preserved allow us to put forward a series of methodological and historical reflections we judge significant.En los últimos años, tanto el progreso de la arqueología del paisaje, como especialmente el de los estudios sobre la epigrafía de la producción, han contribuido a incrementar nuestro volumen de información, aunque ello no siempre ha ido acompañado de un progreso en la interpretación de los datos, es decir, en el estudio de las complejas formas de propiedad de la tierra y de la gestión de sus recursos en la Hispania romana. Creemos necesario, por tanto, integrar en este estudio los diversos tipos de fuentes documentales existentes y proponer un modelo de trabajo centrado en el caso de la gens Licinia, cuya importancia en el Nordeste peninsular por el notable volumen de información conservada nos permite plantear algunas reflexiones metodológicas e históricas que creemos significativas.

  2. Cálcul estructural d'un Observatori Astronómic situat a La Palma (Canàries), segons Normativa ENV 1993-1-1

    OpenAIRE

    Lacroizette i Mañas, Xavier

    2004-01-01

    Premi al millor Projecte de Fi de Carrera presentat durant el curs 2004-2005 en l'àmbit de Construcció que atorga el GREMI DE CONSTRUCTORS D'OBRES El present Projecte de Fi de Carrera està dedicat al disseny i càlcul estructural d’un dels complexes que composen l’Observatori Astronòmic del "Roque de los Muchachos", situat a la illa de la Palma (Canàries). Els diferents càlculs de la estructura metàl·lica s’han realitzat segons la normativa experimental europea ENV 1993-1-1, més coneg...

  3. GEN 499 ASH course tutorial/tutorialoutlet

    OpenAIRE

    NARESH 34

    2015-01-01

    For more course tutorials visit www.tutorialoutlet.com       GEN 499 Week 1 DQ 1 Final Research Paper Topic and Plan (Ash) GEN 499 Week 1 DQ 2 Social Media (Ash) GEN 499 Week 2 DQ 1 Professional Resume and Cover Letter (Ash) GEN 499 Week 2 Assignment Critiquing Internet Sources (Ash) GEN 499 Week 3 DQ 1 Social Capital (Ash) GEN 499 Week 3 DQ 2 Federal Policy (Ash) GEN 499 Week 3 Assignment Annotated Bibliography (Ash) GEN 499 Week 4 DQ 1...

  4. Genética molecular del alcoholismo

    OpenAIRE

    Mauricio Rey-Buitrago

    2015-01-01

    El alcoholismo es una patología psiquiátrica compleja y de origen multifactorial en la que el factor genético explica alrededor del 50 % del fenómeno. Son numerosos los genes que se han asociado a esta enfermedad, pero su aporte individual es mínimo y contradictorio. Estos genes operan a través de características intermedias como la impulsividad y la sensibilidad al alcohol, lo que hace compleja la definición del fenotipo del alcoholismo. Los estudios de asociación de SNPs, de asociación a to...

  5. La genómica de las plantas

    OpenAIRE

    Cánovas, Francisco M.

    2009-01-01

    La mejora vegetal es una actividad tan antigua como la propia agricultura. El estudio de las variedades genéticas de la vegetación permite conocer en profundidad sus funciones y mecanismos para localizar los beneficios alimenticios, textiles, cosméticos o combustibles que la naturaleza ha puesto al servicio del ser humano.

  6. Gen quimérico que comprende el gen o ADNc de la fructoquinasa para el desarrollo de aproximaciones terapéuticas a la intolerancia hereditaria a la fructosa

    OpenAIRE

    Bosch i Tubert, Fàtima; Feliu Albiñana, Juan Emilio; Pujol i Altarriba, Anna; Sánchez Gutiérrez, Julio César

    2003-01-01

    Gen quimérico para el desarrollo de aproximaciones terapéuticas a la intolerancia hereditaria a la fructosa. Comprende un promotor unido al gen o al ADNc de la fructoquinasa. Dicho gen quimérico se inserta en una célula hepática, permitiendo la expresión de fructoquinasa. También se refiere a un animal transgénico cuyo genoma comprende dicho gen quimérico y desarrollando, dicho animal transgénico, alteraciones asociadas a la intolerancia hereditaria a la fructosa tras la administración de fru...

  7. Gen-Umwelt-Interaktionen und Gen-Umwelt-Korrelationen bei psychiatrischen Erkrankungen

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Winkler D

    2010-01-01

    Full Text Available Die seit Langem bestehende Frage, in welchem Ausmaß Anlage und Umwelt zu psychologischen Merkmalen und psychiatrischen Erkrankungen beitragen, wird durch Ergebnisse von Zwillingsstudien und in letzter Zeit durch Untersuchungen des Zusammenhangs zwischen molekulargenetischen Merkmalen und Umwelteinflüssen bereichert. Eine Gen-Umwelt-Interaktion liegt dann vor, wenn genetische Faktoren die Auswirkungen von Umweltbedingungen modulieren. Die Genetik kann weiters die Wahrscheinlichkeit der Exposition gegenüber bestimmten Umwelteinflüssen verändern, was als Gen- Umwelt-Korrelation bezeichnet wird. Beide Phänomene liegen aber häufig gleichzeitig vor, was eine besondere Herausforderung für die Konzeption von wissenschaftlichen Studien darstellt.

  8. EnvMine: A text-mining system for the automatic extraction of contextual information

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    de Lorenzo Victor

    2010-06-01

    Full Text Available Abstract Background For ecological studies, it is crucial to count on adequate descriptions of the environments and samples being studied. Such a description must be done in terms of their physicochemical characteristics, allowing a direct comparison between different environments that would be difficult to do otherwise. Also the characterization must include the precise geographical location, to make possible the study of geographical distributions and biogeographical patterns. Currently, there is no schema for annotating these environmental features, and these data have to be extracted from textual sources (published articles. So far, this had to be performed by manual inspection of the corresponding documents. To facilitate this task, we have developed EnvMine, a set of text-mining tools devoted to retrieve contextual information (physicochemical variables and geographical locations from textual sources of any kind. Results EnvMine is capable of retrieving the physicochemical variables cited in the text, by means of the accurate identification of their associated units of measurement. In this task, the system achieves a recall (percentage of items retrieved of 92% with less than 1% error. Also a Bayesian classifier was tested for distinguishing parts of the text describing environmental characteristics from others dealing with, for instance, experimental settings. Regarding the identification of geographical locations, the system takes advantage of existing databases such as GeoNames to achieve 86% recall with 92% precision. The identification of a location includes also the determination of its exact coordinates (latitude and longitude, thus allowing the calculation of distance between the individual locations. Conclusion EnvMine is a very efficient method for extracting contextual information from different text sources, like published articles or web pages. This tool can help in determining the precise location and physicochemical

  9. PANACEA English automatically acquired lexicon for ENV domain: Lexical Semantic classes for nouns

    OpenAIRE

    Universitat Pompeu Fabra. Institut Universitari de Ling????stica Aplicada (IULA)

    2012-01-01

    This is a domain-specific lexicon of for English for environtment (ENV) domain. This lexicon contains a set of nouns classified into seven different semantic classes. It has been automatically created using the PANACEA web services for noun classification and the crawled data for this domain and language, previously annotated with FreeLing tagger. The crawled data was obtained crawling web pages that were automatically detected to be in the English language and were automatically classified a...

  10. Antibodies to a conformational epitope on gp41 neutralize HIV-1 by destabilizing the Env spike

    Science.gov (United States)

    Lee, Jeong Hyun; Leaman, Daniel P.; Kim, Arthur S.; Torrents de La Peña, Alba; Sliepen, Kwinten; Yasmeen, Anila; Derking, Ronald; Ramos, Alejandra; de Taeye, Steven W.; Ozorowski, Gabriel; Klein, Florian; Burton, Dennis R.; Nussenzweig, Michel C.; Poignard, Pascal; Moore, John P.; Klasse, Per Johan; Sanders, Rogier W.; Zwick, Michael B.; Wilson, Ian A.; Ward, Andrew B.

    2015-09-01

    The recent identification of three broadly neutralizing antibodies (bnAbs) against gp120-gp41 interface epitopes has expanded the targetable surface on the HIV-1 envelope glycoprotein (Env) trimer. By using biochemical, biophysical and computational methods, we map the previously unknown trimer epitopes of two related antibodies, 3BC315 and 3BC176. A cryo-EM reconstruction of a soluble Env trimer bound to 3BC315 Fab at 9.3 Å resolution reveals that the antibody binds between two gp41 protomers, and neutralizes the virus by accelerating trimer decay. In contrast, bnAb 35O22 binding to a partially overlapping quaternary epitope at the gp120-gp41 interface does not induce decay. A conserved gp41-proximal glycan at N88 was also shown to play a role in the binding kinetics of 3BC176 and 3BC315. Finally, our data suggest that the dynamic structure of the Env trimer influences exposure of bnAb epitopes.

  11. Antibody potency relates to the ability to recognize the closed, pre-fusion form of HIV Env

    Science.gov (United States)

    Guttman, Miklos; Cupo, Albert; Julien, Jean-Philippe; Sanders, Rogier W.; Wilson, Ian A.; Moore, John P.; Lee, Kelly K.

    2015-02-01

    HIV’s envelope glycoprotein (Env) is the sole target for neutralizing antibodies. The structures of many broadly neutralizing antibodies (bNAbs) in complex with truncated Env subunits or components have been reported. However, their interaction with the intact Env trimer, and the structural determinants that underlie neutralization resistance in this more native context are less well understood. Here we use hydrogen/deuterium exchange to examine the interactions between a panel of bNAbs and native-like Env trimers (SOSIP.664 trimers). Highly potent bNAbs cause only localized effects at their binding interface, while the binding of less potent antibodies is associated with elaborate changes throughout the trimer. In conjunction with binding kinetics, our results suggest that poorly neutralizing antibodies can only bind when the trimer transiently samples an open state. We propose that the kinetics of such opening motions varies among isolates, with Env from neutralization-sensitive viruses opening more frequently than Env from resistant viruses.

  12. HIV-1 tat promotes integrin-mediated HIV transmission to dendritic cells by binding Env spikes and competes neutralization by anti-HIV antibodies.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Paolo Monini

    Full Text Available Use of Env in HIV vaccine development has been disappointing. Here we show that, in the presence of a biologically active Tat subunit vaccine, a trimeric Env protein prevents in monkeys virus spread from the portal of entry to regional lymph nodes. This appears to be due to specific interactions between Tat and Env spikes that form a novel virus entry complex favoring R5 or X4 virus entry and productive infection of dendritic cells (DCs via an integrin-mediated pathway. These Tat effects do not require Tat-transactivation activity and are blocked by anti-integrin antibodies (Abs. Productive DC infection promoted by Tat is associated with a highly efficient virus transmission to T cells. In the Tat/Env complex the cysteine-rich region of Tat engages the Env V3 loop, whereas the Tat RGD sequence remains free and directs the virus to integrins present on DCs. V2 loop deletion, which unshields the CCR5 binding region of Env, increases Tat/Env complex stability. Of note, binding of Tat to Env abolishes neutralization of Env entry or infection of DCs by anti-HIV sera lacking anti-Tat Abs, which are seldom present in natural infection. This is reversed, and neutralization further enhanced, by HIV sera containing anti-Tat Abs such as those from asymptomatic or Tat-vaccinated patients, or by sera from the Tat/Env vaccinated monkeys. Thus, both anti-Tat and anti-Env Abs are required for efficient HIV neutralization. These data suggest that the Tat/Env interaction increases HIV acquisition and spreading, as a mechanism evolved by the virus to escape anti-Env neutralizing Abs. This may explain the low effectiveness of Env-based vaccines, which are also unlikely to elicit Abs against new Env epitopes exposed by the Tat/Env interaction. As Tat also binds Envs from different clades, new vaccine strategies should exploit the Tat/Env interaction for both preventative and therapeutic interventions.

  13. La genética de las poblaciones centroamericanas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Barrantes, Ramiro

    2005-01-01

    Full Text Available Las poblaciones centroamericanas no han sido objeto de muchos estudios genéticos con la excepción de análisis esporádicos de la variación entre y dentro de los grupos amerindios y de origen africano ubicados en el área. No obstante, en los últimos 15 años se efectuaron investigaciones sistemáticas en este sentido incluyendo poblaciones mestizas, particularmente las de Costa Rica y Panamá. En los amerindios se efectuaron estudios detallados de su estructura genética y las relaciones filogenéticas entre poblaciones en un contexto regional y continental. De manera general estos grupos mantienen una baja diversidad genética. Por otra parte, estimativas de la mezcla génica en la población mestiza muestran diferencias dentro y entre los distintos países del área. Al Valle Central de Costa Rica se le atribuye la condición de aislado con una supuesta constitución genética homogénea favorable para los estudios de desequilibrio de ligamiento y asociaciones con algunas enfermedades hereditarias; sin embargo, los resultados obtenidos con relación el flujo génico direccional, la amalgama de etnias y otros componentes de su estructura como la variación temporal y espacial de la consanguinidad y la migración indican una mayor heterogeneidad. Se muestran los resultados y conclusiones obtenidas y se plantean las perspectivas y tendencias al mediano plazo que vinculan los enfoques y métodos de la epidemiología y la antropología genética y el estudio genético de poblaciones.

  14. El psicoanálisis como envés de la ley // Psychoanalysis as the underside of the law

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Paula Winkler

    2011-06-01

    Full Text Available El psicoanálisis se ocupa del sujeto. El restituir al sujeto en su decir verdad a partir del inconsciente (y de la palabra aparece, desde el inicio, epistemológicamente, como el envés de la ley. La ley se debe a lo público y aquél a lo privado. La distinción entre "público" y "privado" deviene, reglada, desde el Derecho Romano —primer Digesto jurídico—. Pero la praxis analítica, como política institucional, al recomponer el lazo social y presentificar la tensión entre el sujeto y el derecho, permite que el sujeto aborde lo real "haciendo uso" de la norma y que se ubique, además así, en la dimensión simbólica social de la ley. // Psychoanalysis deals with the subject. The return to the subject in saying truth as from the unconscious (and the word appears, from the beginning, as the epistemological reverse of the law. This latter is due to the public whereas psychoanalysis is due to the private. The distinction between "public" and "private" becomes, regulated, from the Roman law - first-Legal Digest. Yet, the analytical practice as an institutional policy, while rebuilding the social ties and materializing tension between the subject and the rule of law, allows the subject to dwell into the the real thing "making use" of the rule of law and placing it also in the social/ symbolic dimension of the law

  15. Low pH Is Required for Avian Sarcoma and Leukosis Virus Env-Induced Hemifusion and Fusion Pore Formation but Not for Pore Growth

    OpenAIRE

    Melikyan, G. B.; Barnard, R. J. O.; Markosyan, R M; Young, J. A. T.; Cohen, F S

    2004-01-01

    Binding of avian sarcoma and leukosis virus (ASLV) to its cognate receptor on the cell surface causes conformational changes in its envelope protein (Env). It is currently debated whether low pH is required for ASLV infection. To elucidate the role of low pH, we studied the association between ASLV subgroup B (ASLV-B) and liposomes and fusion between effector cells expressing Env from ASLV-A and ASLV-B and target cells expressing cognate receptors. Neither EnvA nor EnvB promoted cell-cell fus...

  16. Complementation of diverse HIV-1 Env defects through cooperative subunit interactions: a general property of the functional trimer

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Salzwedel Karl

    2009-08-01

    Full Text Available Abstract Background The HIV-1 Env glycoprotein mediates virus entry by catalyzing direct fusion between the virion membrane and the target cell plasma membrane. Env is composed of two subunits: gp120, which binds to CD4 and the coreceptor, and gp41, which is triggered upon coreceptor binding to promote the membrane fusion reaction. Env on the surface of infected cells is a trimer consisting of three gp120/gp41 homo-dimeric protomers. An emerging question concerns cooperative interactions between the protomers in the trimer, and possible implications for Env function. Results We extended studies on cooperative subunit interactions within the HIV-1 Env trimer, using analysis of functional complementation between coexpressed inactive variants harboring different functional deficiencies. In assays of Env-mediated cell fusion, complementation was observed between variants with a wide range of defects in both the gp120 and gp41 subunits. The former included gp120 subunits mutated in the CD4 binding site or incapable of coreceptor interaction due either to mismatched specificity or V3 loop mutation. Defective gp41 variants included point mutations at different residues within the fusion peptide or heptad repeat regions, as well as constructs with modifications or deletions of the membrane proximal tryptophan-rich region or the transmembrane domain. Complementation required the defective variants to be coexpressed in the same cell. The observed complementation activities were highly dependent on the assay system. The most robust activities were obtained with a vaccinia virus-based expression and reporter gene activation assay for cell fusion. In an alternative system involving Env expression from integrated provirus, complementation was detected in cell fusion assays, but not in virus particle entry assays. Conclusion Our results indicate that Env function does not require every subunit in the trimer to be competent for all essential activities. Through

  17. Autismo: genética Autism: genetics

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Abha R Gupta

    2006-05-01

    Full Text Available O autismo é um transtorno fortemente genético, com uma herdabilidade estimada de mais de 90%. Uma combinação de heterogeneidade fenotípica e o provável envolvimento de múltiplos loci que interagem entre si dificultam os esforços de descobertas de genes. Conseqüentemente, a etiologia genética dos transtornos relacionados ao autismo permanece, em grande parte, desconhecida. Nos últimos anos, a convergência entre tecnologias genômicas em rápido avanço, a finalização do projeto genoma humano e os crescentes e exitosos esforços em colaboração para aumentar o número de pacientes disponíveis para estudo conduziram às primeiras pistas sólidas sobre as origens biológicas desses transtornos. Este artigo revisará a literatura até nossos dias, resumindo os resultados de estudos de ligação genética, citogenéticos e de genes candidatos com um foco no progresso recente. Além disso, são consideradas as vias promissoras para pesquisas futuras.Autism is a strongly genetic disorder, with an estimated heritability of greater than 90%. A combination of phenotypic heterogeneity and the likely involvement of multiple interacting loci have hampered efforts at gene discovery. As a consequence, the genetic etiology of the spectrum of autism related disorders remains largely unknown. Over the past several years, the convergence of rapidly advancing genomic technologies, the completion of the human genome project, and increasingly successful collaborative efforts to increase the number of patients available for study have led to the first solid clues to the biological origins of these disorders. This paper will review the literature to date summarizing the results of linkage, cytogenetic, and candidate gene studies with a focus on recent progress. In addition, promising avenues for future research are considered.

  18. Equivalencia clínica entre el rociador nasal de propionato de fluticasona genérico y comercial en pacientes con rinitis alérgica: Clinical equival ence between generic and branded fluticasone propionate nasal spray in patients with alergic rhinitis

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Vikki Brandi

    2009-10-01

    Full Text Available Objetivo. Establecer la equivalencia clínica de un rociador nasal de propionato de fluticasona (RNF genérico comparado con dos formulas farmacéuticas comerciales del mismo producto (Flonase® y Flixonase® durante la estación de polinización del cedro de montaña (Juniperus ashei en Texas, EEUU. Materiales y métodos. Estudio multicéntrico, aleatorizado, doble ciego, controlado con placebo, en grupos paralelos diseñado para investigar la seguridad y eficacia de RNF (200 mcg una vez al día, Flonase® (200 mcg una vez al día y Flixonase® (200 mcg una vez al día, comparados con placebo, administrados por 13 a 15 días. Los pacientes registraron diariamente, en la mañana y en la tarde, sus síntomas nasales totales (SNT. La variable de desenlace primaria fue la suma de SNT en la mañana y tarde + 1. Las variables de desenlace secundarias fueron los SNT AM + 1 y SNT PM + 1, y la evaluación de seguridad. Resultados. No se observó diferencia estadísticamente significativa en ningún día de estudio, ni en todo el periodo de tratamiento, ni al punto de final entre SNT promedio tanto de Flonase® como Flixonase® y RNF. La equivalencia clínica entre RNF y Flonase® (cociente= 0,98; intervalo de confianza [IC] al 90%, 0,91 a 1,06, y entre RNF y Flixonase® (cociente= 1,02; IC 90%, 0,94 a 1,10 fue demostrada tanto para la variable de desenlace primaria como para las otras variables de eficacia. Conclusiones. Estos resultados respaldan la equivalencia clínica entre RNF 200 mcg una vez al día tanto con Flonase® como Flixonase® en el tratamiento de rinitis alérgica estacional.

  19. Drosophila germline invasion by the endogenous retrovirus gypsy: involvement of the viral env gene.

    Science.gov (United States)

    Pelisson, A; Mejlumian, L; Robert, V; Terzian, C; Bucheton, A

    2002-10-01

    The endogenous retrovirus gypsy is expressed at high levels in mutant flamenco female flies. Gypsy viral particles extracted from such flies can infect naive flamenco individuals raised in the presence of these extracts mixed into their food. This results in the integration of new proviruses into the germline genome. These proviruses can then increase their copy number by (1) expression in the flamenco female somatic cells, (2) transfer into the oocyte and (3) integration into the genome of the progeny. Surprisingly, unlike the infection observed in the feeding experiments, this strategy of endogenous proviral multiplication does not seem to involve the expression of the viral env gene. PMID:12225916

  20. Organismos modificados genéticamente en la alimentación humana

    OpenAIRE

    Barros Fernández, Paula

    2014-01-01

    El presente trabajo trata la controversia del tema de los organismos modificados genéticamente (OMG). Se mencionan los beneficios que aporta la ingeniería genética y también los principales riesgos y preocupaciones existentes en torno al consumo de los alimentos modificados genéticamente, reportando casos de estudios que así lo constatan.Se tratan temas como seguridad alimentaria, legislación y normativas de etiquetado de estos nuevos alimentos, señalando su relación con la salud. Además, se ...

  1. «Mögen sich die Rekrutenprüfungen als kräftiger Hebel für Fortschritt im Schulwesen erweisen!» PISA im 19. Jahrhundert: Die schweizerischen Rekrutenprüfungen – Absichten und Auswirkungen

    OpenAIRE

    Crotti, Claudia; Kellerhals, Katharina

    2007-01-01

    Die Implementierung von Bildungsstandards im schweizerischen Bildungswesen ist keine aktuelle Modeerscheinung, vielmehr haben Leistungsmessungen in der Schweiz Tradition. Bereits im 19. Jahrhundert wurde zunächst in einzelnen Kantonen der Bildungsstand der männlichen Bevölkerung erhoben und damit die Effekte des Bildungssystems evaluiert. So führte 1832 der Kanton Solothurn die sogenannten pädagogischen Rekrutenprüfungen ein, die zunächst als Zuweisungsinstrument militärischen Zwecken dienten...

  2. A Molecular Epidemiology Analysis of HIV in Shenzhen and HIV Env Gene Variation Replication Analysis

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    CHEN Lin(陈琳); FENG Tiejian(冯铁建); LI Liangcheng(李良成); HE Jianfan(何建凡)

    2002-01-01

    Objective: To analyze molecular trends of the HIV epidemic in Shenzhen.Methods: Serum collected from Shenzhen AIDS patientsbetween 1992-1999 was analyzed using molecular techniques.DNA fragments of the HIV-1 Env gene were amplified bynested PCR from uncultured peripheral blood mononuclearcells (PBMCs) from these serum samples. The C2-C3 region ofthe Env gene was sequenced and analyzed. Specific high-riskbehaviors were also analyzed.Results: We found that the transmission of HIV in the citywas mainly through sexual behaviors (46.0%). There werefour HIV-1 subtypes: B', B, C and E with 6.31%, 7.95%,3.09% and 8.92% gene divergence inside each subtype inShenzhen. These results suggested that epidemic times were 6,8, 3 and 9 respectively. The main epidemic subtypes were Eand B strains. AIDS patient's antigenic variation was slightlyhigher than that of HIV infected individuals.Conclusion: Surveillance data reflect trends and theepidemic time of HIV, which will be useful for policy makersto formulate effective strategies of HIV/AIDS prevention andcontrol in Shenzhen.

  3. FutureGen Project Report

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Cabe, Jim; Elliott, Mike

    2010-09-30

    This report summarizes the comprehensive siting, permitting, engineering, design, and costing activities completed by the FutureGen Industrial Alliance, the Department of Energy, and associated supporting subcontractors to develop a first of a kind near zero emissions integrated gasification combined cycle power plant and carbon capture and storage project (IGCC-CCS). With the goal to design, build, and reliably operate the first IGCC-CCS facility, FutureGen would have been the lowest emitting pulverized coal power plant in the world, while providing a timely and relevant basis for coal combustion power plants deploying carbon capture in the future. The content of this report summarizes key findings and results of applicable project evaluations; modeling, design, and engineering assessments; cost estimate reports; and schedule and risk mitigation from initiation of the FutureGen project through final flow sheet analyses including capital and operating reports completed under DOE award DE-FE0000587. This project report necessarily builds upon previously completed siting, design, and development work executed under DOE award DE-FC26- 06NT4207 which included the siting process; environmental permitting, compliance, and mitigation under the National Environmental Policy Act; and development of conceptual and design basis documentation for the FutureGen plant. For completeness, the report includes as attachments the siting and design basis documents, as well as the source documentation for the following: • Site evaluation and selection process and environmental characterization • Underground Injection Control (UIC) Permit Application including well design and subsurface modeling • FutureGen IGCC-CCS Design Basis Document • Process evaluations and technology selection via Illinois Clean Coal Review Board Technical Report • Process flow diagrams and heat/material balance for slurry-fed gasifier configuration • Process flow diagrams and heat/material balance

  4. A critical appraisal of ATLAS9 and NextGen 5 model atmospheres

    CERN Document Server

    Bertone, E; Chavez, M; Rodríguez, L H

    2001-01-01

    The fitting atmosphere parameters (Teff, g, and [Fe/H]) for over 300 stars in the Gunn & Striker and Jacoby et al. catalogs have been obtained relying on the Kurucz (1992) ATLAS9 and Hauschildt et al (1999) NextGen5 synthesis models. The output results are compared, and a critical appraisal of both theoretical codes is performed.

  5. Structures of HIV-1-Env V1V2 with broadly neutralizing antibodies reveal commonalities that enable vaccine design

    OpenAIRE

    Gorman, Jason; Soto, Cinque; Yang, Max M.; Davenport, Thaddeus M.; Guttman, Miklos; Robert T Bailer; Chambers, Michael; Chuang, Gwo-Yu; DeKosky, Brandon J.; Doria-Rose, Nicole A.; Druz, Aliaksandr; Ernandes, Michael J.; Georgiev, Ivelin S.; Jarosinski, Marissa C.; Joyce, M. Gordon

    2015-01-01

    Broadly neutralizing antibodies (bNAbs) against HIV-1-Env V1V2 arise in multiple donors. However, atomic-level interactions had only been determined with antibodies from a single donor, making commonalities in recognition uncertain. Here we report the co-crystal structure of V1V2 with antibody CH03 from a second donor and model Env interactions of antibody CAP256-VRC26 from a third. These V1V2-directed bNAbs utilized strand-strand interactions between a protruding antibody loop and a V1V2 str...

  6. Estructura y diversidad genética en vacas Holstein de Antioquia usando un polimorfismo del gen bGH

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Juan Rincon F.

    2013-03-01

    Full Text Available Objetivo. Determinar las frecuencias alélicas y genotípicas del polimorfismo del intrón 3 del gen bGH y estimar algunos parámetros de estructura poblacional en ganado Holstein. Materiales y métodos. El estudio se realizó con 1366 vacas Holstein en 120 hatos de 11 municipios del departamento de Antioquia. Se extrajo DNA por el método de Salting out y la genotipificación se realizó usando la técnica de PCR-RFLPs. La diversidad genética se determinó mediante la comparación de las heterocigosidades, El equilibrio de Hardy-Weinberg (HW y la diferenciación genética entre las poblaciones se realizó usando el software Arlequín 2.0 Las frecuencias alélicas y genotípicas se evaluaron mediante el paquete estadístico SAS®. Resultados. Las frecuencias genotípicas encontradas fueron 0.764 (+/+, 0.223 (+/- y 0.013 (-/- y las frecuencias alélicas 0.876 (+ y 0.124 (-. No se encontraron desviaciones del Equilibrio de Hardy Weinberg en ninguna de las subpoblaciones. La diversidad genética determinada mediante la comparación de las heterocigosidades fue relativamente baja entre poblaciones pero al interior de estas no. El valor de FST de toda la población fue de 0.0068 y significativo (p<0.05, algunos FST pareados también lo fueron, tomando valores desde 0.0 a 0.13. Los estadísticos FIT y FIS no fueron significativos. Conclusiones. El gen bGH es un candidato interesante para evaluar características de importancia económica ya que no parece haber sido sometido a selección directa, presenta una variabilidad media en las poblaciones, observándose diferenciación genética significativa entre distintos municipios, producto de los diferentes sistemas de producción y acceso a las biotecnologías.

  7. Distributed Generation Market Demand Model (dGen): Documentation

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Sigrin, Benjamin [National Renewable Energy Lab. (NREL), Golden, CO (United States); Gleason, Michael [National Renewable Energy Lab. (NREL), Golden, CO (United States); Preus, Robert [National Renewable Energy Lab. (NREL), Golden, CO (United States); Baring-Gould, Ian [National Renewable Energy Lab. (NREL), Golden, CO (United States); Margolis, Robert [National Renewable Energy Lab. (NREL), Golden, CO (United States)

    2016-02-01

    The Distributed Generation Market Demand model (dGen) is a geospatially rich, bottom-up, market-penetration model that simulates the potential adoption of distributed energy resources (DERs) for residential, commercial, and industrial entities in the continental United States through 2050. The National Renewable Energy Laboratory (NREL) developed dGen to analyze the key factors that will affect future market demand for distributed solar, wind, storage, and other DER technologies in the United States. The new model builds off, extends, and replaces NREL's SolarDS model (Denholm et al. 2009a), which simulates the market penetration of distributed PV only. Unlike the SolarDS model, dGen can model various DER technologies under one platform--it currently can simulate the adoption of distributed solar (the dSolar module) and distributed wind (the dWind module) and link with the ReEDS capacity expansion model (Appendix C). The underlying algorithms and datasets in dGen, which improve the representation of customer decision making as well as the spatial resolution of analyses (Figure ES-1), also are improvements over SolarDS.

  8. Algoritmos genéticos locales

    OpenAIRE

    García-Martínez, Carlos; Lozano, Manuel

    2007-01-01

    Los Algoritmos Genéticos Locales son procedimientos que iterativamente re nan soluciones dadas. Su diferencia con procedimientos de mejora iterativa clásicos reside en el uso de operadores genéticos para realizar el re namiento. En este estudio presentamos un nuevo Algoritmo Genético Local Binario basado en un Algoritmo Genético Estacionario. Hemos comparado el Algoritmo Genético Local Binario con otros procedimientos de mejora iterativa de la literatura. Los res...

  9. Inhibition of HIV Env binding to cellular receptors by monoclonal antibody 2G12 as probed by Fc-tagged gp120

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Wilson Ian A

    2006-07-01

    Full Text Available Abstract During natural HIV infection, an array of host receptors are thought to influence virus attachment and the kinetics of infection. In this study, to probe the interactions of HIV envelope (Env with various receptors, we assessed the inhibitory properties of various anti-Env monoclonal antibodies (mAbs in binding assays. To assist in detecting Env in attachment assays, we generated Fc fusions of full-length wild-type gp120 and several variable loop-deleted gp120s. Through investigation of the inhibition of Env binding to cell lines expressing CD4, CCR5, DC-SIGN, syndecans or combinations thereof, we found that the broadly neutralizing mAb, 2G12, directed to a unique carbohydrate epitope of gp120, inhibited Env-CCR5 binding, partially inhibited Env-DC-SIGN binding, but had no effect on Env-syndecan association. Furthermore, 2G12 inhibited Env attachment to primary monocyte-derived dendritic cells, that expressed CD4 and CCR5 primary HIV receptors, as well as DC-SIGN, and suggested that the dual activities of 2G12 could be valuable in vivo for inhibiting initial virus dissemination and propagation.

  10. GenLab, Laboratorio Virtual de Genética

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    García Sergio

    2000-12-01

    Full Text Available

    GenLab es el nombre que tiene el software diseñado por nosotros, en el cual se modela el proceso meiótico y la fecundación en organismos diploides. El objetivo de esta aplicación es ilustrar el resultado de un cruce determinado, tratando de ser lo más ajustados a la realidad. La modelación de la reproducción sexual se realiza internamente y el GenLab se limita a presentar los resultados según el número de descendencia seleccionado para un cruce específico, esto significa que se puede escoger una gran cantidad de características para los parentales y se puede estudiar la frecuencia de estos en la descendencia. El modelo cuenta con base de datos donde están almacenados algunos de los locus de Drosophila melanogaster junto con su ubicación en centimorgans 1. EI propósito de este modelo es servir como herramienta pedagógica  y didáctica tanto en universidades como en colegios, facilitando el aprendizaje de algunos principios básicos de la genética, por lo cual puede ser usado si se cuenta con una conexión a Internet y un navegador visitando http://biologia.unal.edu.co/fidel.

  11. A nova genética para além da gestão de riscos e promoção da saúde: prolegômenos ao conceito de Biodesign The new genetics beyond of risk management and promotion of health: introduction to the concept of Biodesign

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Murilo Mariano Vilaça

    2011-01-01

    Full Text Available A nova genética apontaria para uma nova era da metamorfose do humano, que seria marcada pelo protagonismo desse na seleção e aperfeiçoamento da sua natureza. Assim, o human enhancement tornaria-se uma realidade antropotécnica tangível. Esse artigo, inserido em uma pesquisa do campo da Ethics of Enhancement Human Beings, pretende excogitar um novo conceito para compreender nuances da chamada Genetic Age até agora aparentemente negligenciadas por outros dois conceitos já disponíveis, a saber, biopolítica e biossociabilidade. Para tanto, recorremos à revisão de parte da bibliografia sobre o tema e à análise e crítica desses conceitos, os quais focalizam a temática fundamentalmente através das noções de gestão de riscos e promoção da vida saudável. O objetivo foi apontar a parcial pertinência da grade de inteligibilidade fornecida por eles para compreender a nova genética. Destarte, apresentamos o conceito de biodesign como uma alternativa complementar. Com ele, esperamos oferecer, introdutoriamente, um conceito que apreenda, sobretudo, o que as possibilidades de artificialização da vida humana representam para além de uma nova forma de gestão de riscos/promoção da saúde.The new genetics would point to a new era of metamorphosis of the human, which would be marked by the prominence of that in the selection and improvement of their nature. Thus, the Human Enhancement would become a tangible reality anthropo-technique. This paper, included a research of the field of Ethics Enhancement of Human Beings, intends excogitate a new concept to understand nuances called Genetic Age apparently overlooked by other already available, namely, Biopolitics and Biosociality. Therefore, we refer the review of the bibliography on Human Enhancement and the analysis and critique of these concepts, which focus on the issue mainly of risk management and promotion of healthy living. The objective was to identify the partial relevance of the

  12. Specifically modified Env immunogens activate B-cell precursors of broadly neutralizing HIV-1 antibodies in transgenic mice.

    Science.gov (United States)

    McGuire, Andrew T; Gray, Matthew D; Dosenovic, Pia; Gitlin, Alexander D; Freund, Natalia T; Petersen, John; Correnti, Colin; Johnsen, William; Kegel, Robert; Stuart, Andrew B; Glenn, Jolene; Seaman, Michael S; Schief, William R; Strong, Roland K; Nussenzweig, Michel C; Stamatatos, Leonidas

    2016-01-01

    VRC01-class broadly neutralizing HIV-1 antibodies protect animals from experimental infection and could contribute to an effective vaccine response. Their predicted germline forms (gl) bind Env inefficiently, which may explain why they are not elicited by HIV-1 Env-immunization. Here we show that an optimized Env immunogen can engage multiple glVRC01-class antibodies. Furthermore, this immunogen activates naive B cells expressing the human germline heavy chain of 3BNC60, paired with endogenous mouse light chains in vivo. To address whether it activates B cells expressing the fully humanized gl3BNC60 B-cell receptor (BCR), we immunized mice carrying both the heavy and light chains of gl3BNC60. B cells expressing this BCR display an autoreactive phenotype and fail to respond efficiently to soluble forms of the optimized immunogen, unless it is highly multimerized. Thus, specifically designed Env immunogens can activate naive B cells expressing human BCRs corresponding to precursors of broadly neutralizing HIV-1 antibodies even when the B cells display an autoreactive phenotype. PMID:26907590

  13. Construção de um env quimérico HIV-1 / HIV-2

    OpenAIRE

    Figueiredo, Inês Brito

    2014-01-01

    Dissertação para obtenção do grau de Mestre no Instituto Superior de Ciências da Saúde Egas Moniz Introdução: O Síndrome da Imunodeficiência Adquirida (SIDA) representa, a nível mundial, um dos principais problemas de saúde pública. O agente etiológico responsável por esta pandemia é o Vírus da Imunodeficiência Humana (VIH), que afeta 35 milhões de pessoas em todo o mundo. Objetivos: Construção dum env quimérico contendo a região C2, V3 e C3 do VIH-2 e as restantes do VIH-1 e reconstruç...

  14. Comportamento de dois genótipos de milho cultivados em sistema de aléias preestabelecido com diferentes leguminosas arbóreas Behaviour of two maize genotypes grown in alley cropping system pre-established with diferents leguminous trees

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Andréia Araújo Lima Leite

    2008-12-01

    Full Text Available O cultivo em aléias tem sido recomendado como alternativa para a substituição da agricultura de corte e queima, no trópico úmido, devido à grande capacidade de produção de matéria orgânica e de reciclagem de nutrientes, mas algumas dúvidas quanto à sustentabilidade e à competição interespecífica são persistentes. O objetivo no trabalho foi avaliar a viabilidade da cultura do milho em um sistema de cultivo em aléias de leguminosas arbóreas. O delineamento experimental utilizado foi em blocos casualisados, com quatro repetições dos tratamentos: aléias de sombreiro (Clitoria fairchildiana, ingá (Inga edulis, guandu (Cajanus cajan e leucena (Leucaena leucocephala e uma testemunha sem aléias. Foram avaliadas a remobilização de carbono e nitrogênio, massa de grãos, massa de mil grãos e competição interespecífica entre as cultivares de milho e as leguminosas. A produção de grãos foi maior nas parcelas com C. fairchildiana e L. leucocephala. A produtividade do híbrido de milho foi superior à da variedade em todos os tratamentos. A produtividade e a massa de mil grãos de milho não são negativamente afetadas pela distância da linha da leguminosa arbórea. Esse estudo conclui que o sistema de aléias com leguminosas arbóreas é uma alternativa importante ao manejo sustentável dos agroecossistemas no tropico úmido. Além disso, nessa região a produtividade em grãos na cultura do milho é favorecida no sistema de aléias preeestabelecidas com as leguminosas arbóreas sombreiro, ingá e leucena e pela utilização de genótipos eficientes no aproveitamento do nitrogênio, cujo sincronismo entre a liberação e a absorção do N aplicado por meio das leguminosas deve ser aprimorado.Alley cropping has been recommended as alternative land use to slash-and-burn agriculture in humid tropics. However, interespecific competition between cash crop and hedgerow can reduce this potential. This study aimed to evaluate the

  15. Macrophage entry mediated by HIV Envs from brain and lymphoid tissues is determined by the capacity to use low CD4 levels and overall efficiency of fusion

    International Nuclear Information System (INIS)

    HIV infects macrophages and microglia in the central nervous system (CNS), which express lower levels of CD4 than CD4+ T cells in peripheral blood. To investigate mechanisms of HIV neurotropism, full-length env genes were cloned from autopsy brain and lymphoid tissues from 4 AIDS patients with HIV-associated dementia (HAD). Characterization of 55 functional Env clones demonstrated that Envs with reduced dependence on CD4 for fusion and viral entry are more frequent in brain compared to lymphoid tissue. Envs that mediated efficient entry into macrophages were frequent in brain but were also present in lymphoid tissue. For most Envs, entry into macrophages correlated with overall fusion activity at all levels of CD4 and CCR5. gp160 nucleotide sequences were compartmentalized in brain versus lymphoid tissue within each patient. Proline at position 308 in the V3 loop of gp120 was associated with brain compartmentalization in 3 patients, but mutagenesis studies suggested that P308 alone does not contribute to reduced CD4 dependence or macrophage-tropism. These results suggest that HIV adaptation to replicate in the CNS selects for Envs with reduced CD4 dependence and increased fusion activity. Macrophage-tropic Envs are frequent in brain but are also present in lymphoid tissues of AIDS patients with HAD, and entry into macrophages in the CNS and other tissues is dependent on the ability to use low receptor levels and overall efficiency of fusion

  16. Algoritmos genéticos incrementales

    OpenAIRE

    Nesmachnow, Sergio; Dominioni, Federico; Musso, Pablo

    2005-01-01

    Este artículo presenta el estudio, diseño e implementación de un modelo particular de algoritmos genéticos paralelos, los algoritmos genéticos incrementales. La principal ventaja del motor de algoritmos genéticos implementado es su potencialidad de ejecución en entornos no dedicados, detectando la carga generada por los usuarios del entorno y consumiendo de un modo “inteligente” los recursos computacionales disponibles. Se presenta la descripción teórica del modelo de algoritmos genéticos inc...

  17. A rev1-vpu polymorphism unique to HIV-1 subtype A and C strains impairs envelope glycoprotein expression from rev-vpu-env cassettes and reduces virion infectivity in pseudotyping assays

    International Nuclear Information System (INIS)

    Functional studies of HIV-1 envelope glycoproteins (Envs) commonly include the generation of pseudoviruses, which are produced by co-transfection of rev-vpu-env cassettes with an env-deficient provirus. Here, we describe six Env constructs from transmitted/founder HIV-1 that were defective in the pseudotyping assay, although two produced infectious virions when expressed from their cognate proviruses. All of these constructs exhibited an unusual gene arrangement in which the first exon of rev (rev1) and vpu were in the same reading frame without an intervening stop codon. Disruption of the rev1-vpu fusion gene by frameshift mutation, stop codon, or abrogation of the rev initiation codon restored pseudovirion infectivity. Introduction of the fusion gene into wildtype Env cassettes severely compromised their function. The defect was not due to altered env and rev transcription or a dominant negative effect of the expressed fusion protein, but seemed to be caused by inefficient translation at the env initiation codon. Although the rev1-vpu polymorphism affects Env expression only in vitro, it can cause problems in studies requiring Env complementation, such as analyses of co-receptor usage and neutralization properties, since 3% of subtype A, 20% of subtype C and 5% of CRF01A/E viruses encode the fusion gene. A solution is to eliminate the rev initiation codon when amplifying rev-vpu-env cassettes since this increases Env expression irrespective of the presence of the polymorphism.

  18. Justicia en salud y genética

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Maria Graciela De Ortuzar

    2014-06-01

    Full Text Available Las expectativas puestas en el conocimiento genético exceden el ámbito de la medicina tradiciona, debido a que la intervención directa en la lotería natural demandaría el replanteamiento de conceptos centrales de justicia en salud: necesidades médicas, enfermedad, normalidad, e igualdad de oportunidades en el acceso a la salud. El punto en debate es sí el replanteo de dichos conceptos conlleva un cambio radical en las teorías de justicia (libertariana y/o liberal, mostrando su obsolescencia, o sí simplemente se requiere ampliar dichos conceptos claves por fallas estructurales en las mismas teorías. Como hipótesis general considero que los supuestos cuestionamientos, lejos de socavar las bases de las teorías de justicia, sólo ponen en evidencia sus viejos problemas estructurales. Por razones expositivas, dividiré la presentación tres partes. En la Primera parte, analizo la teoría libertariana, estudiando las contradicciones del modelo a través del impacto de la información genética en el seguro privado de salud. En la Segunda Parte, desarrollo la propuesta alternativa liberal rawlsianadanielsiana del modelo de seguro público, evaluando las implicaciones de la genética a partir de la crítica de su concepto biológico de enfermedad y su restricción al acceso a la salud por necesidades naturales. En la Tercera parte presento un modelo integral de necesidades y capacidades básicas, comprendiendo la prevención, el tratamiento y el mejoramiento moralmente permisible (genético y no genético.Mi aporte principal consiste en la elaboración de este modelo normativo integral de necesidades y capacidades para la regulación conjunta de la información y terapia genética con los restantes problemas de salud.

  19. SHIV-1157i and passaged progeny viruses encoding R5 HIV-1 clade C env cause AIDS in rhesus monkeys

    OpenAIRE

    Siddappa Nagadenahalli B; Kramer Victor G; Chenine Agnès L; Sharma Prachi; Ong Helena; Song Ruijiang; Rasmussen Robert A; Humbert Michael; Xu Weidong; Else James G; Novembre Francis J; Strobert Elizabeth; O'Neil Shawn P; Ruprecht Ruth M

    2008-01-01

    Abstract Background Infection of nonhuman primates with simian immunodeficiency virus (SIV) or chimeric simian-human immunodeficiency virus (SHIV) strains is widely used to study lentiviral pathogenesis, antiviral immunity and the efficacy of AIDS vaccine candidates. SHIV challenges allow assessment of anti-HIV-1 envelope responses in primates. As such, SHIVs should mimic natural HIV-1 infection in humans and, to address the pandemic, encode HIV-1 Env components representing major viral subty...

  20. Timing of use of cod liver oil, a vitamin D source, and multiple sclerosis risk: The EnvIMS study.

    OpenAIRE

    Cortese, Marianna; Riise, Trond; Bjørnevik, Kjetil Lauvland; Holmøy, Trygve; Kampman, Margitta Theodora; Magalhaes, Sandra; Pugliatti, Maura; Wolfson, Christina; Myhr, Kjell-Morten

    2015-01-01

    Background: Low vitamin D levels have been associated with an increased risk of multiple sclerosis (MS), although it remains unknown whether this relationship varies by age. Objective: The objective of this paper is to investigate the association between vitamin D3 supplementation through cod liver oil at different postnatal ages and MS risk. Methods: In the Norwegian component of the multinational case-control study Environmental Factors In Multiple Sclerosis (EnvIMS), a total of 953 M...

  1. Warum Englisch allein als Wissenschaftssprache nicht genügt

    OpenAIRE

    Baschera, Marco

    2010-01-01

    Einst war Latein Lingua franca der intellektuellen Welt. Gegenwärtig wird darüber debattiert, ob sich Englisch dafür eignet. Doch Latein war eine künstliche Gelehrtensprache, während Englisch heute einem unkontrollierbaren Sprachwandel unterworfen ist. Kulturell unterschiedene Denkweisen vermag es nicht zu spiegeln.

  2. Cocirculation of Two env Molecular Variants, of Possible Recombinant Origin, in Gorilla and Chimpanzee Simian Foamy Virus Strains from Central Africa

    OpenAIRE

    Richard, Léa; Rua, Réjane; Betsem, Edouard; Mouinga-Ondémé, Augustin; Kazanji, Mirdad; Leroy, Eric; Njouom, Richard; Buseyne, Florence; Afonso, Philippe V; Gessain, Antoine

    2015-01-01

    Simian foamy virus (SFV) is a ubiquitous retrovirus in nonhuman primates (NHPs) that can be transmitted to humans, mostly through severe bites. In the past few years, our laboratory has identified more than 50 hunters from central Africa infected with zoonotic SFVs. Analysis of the complete sequences of five SFVs obtained from these individuals revealed that env was the most variable gene. Furthermore, recombinant SFV strains, some of which involve sequences in the env gene, were recently ide...

  3. Proviral amplification of the Gypsy endogenous retrovirus of Drosophila melanogaster involves env-independent invasion of the female germline.

    Science.gov (United States)

    Chalvet, F; Teysset, L; Terzian, C; Prud'homme, N; Santamaria, P; Bucheton, A; Pélisson, A

    1999-05-01

    Gypsy is an infectious endogenous retrovirus of Drosophila melanogaster. The gypsy proviruses replicate very efficiently in the genome of the progeny of females homozygous for permissive alleles of the flamenco gene. This replicative transposition is correlated with derepression of gypsy expression, specifically in the somatic cells of the ovaries of the permissive mothers. The determinism of this amplification was studied further by making chimeric mothers containing different permissive/restrictive and somatic/germinal lineages. We show here that the derepression of active proviruses in the permissive soma is necessary and sufficient to induce proviral insertions in the progeny, even if the F1 flies derive from restrictive germ cells devoid of active proviruses. Therefore, gypsy endogenous multiplication results from the transfer of some gypsy-encoded genetic material from the soma towards the germen of the mother and its subsequent insertion into the chromosomes of the progeny. This transfer, however, is not likely to result from retroviral infection of the germline. Indeed, we also show here that the insertion of a tagged gypsy element, mutant for the env gene, occurs at high frequency, independently of the production of gypsy Env proteins by any transcomplementing helper. The possible role of the env gene for horizontal transfer to new hosts is discussed. PMID:10228177

  4. Production of Mucosally Transmissible SHIV Challenge Stocks from HIV-1 Circulating Recombinant Form 01_AE env Sequences.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Lawrence J Tartaglia

    2016-02-01

    Full Text Available Simian-human immunodeficiency virus (SHIV challenge stocks are critical for preclinical testing of vaccines, antibodies, and other interventions aimed to prevent HIV-1. A major unmet need for the field has been the lack of a SHIV challenge stock expressing circulating recombinant form 01_AE (CRF01_AE env sequences. We therefore sought to develop mucosally transmissible SHIV challenge stocks containing HIV-1 CRF01_AE env derived from acutely HIV-1 infected individuals from Thailand. SHIV-AE6, SHIV-AE6RM, and SHIV-AE16 contained env sequences that were >99% identical to the original HIV-1 isolate and did not require in vivo passaging. These viruses exhibited CCR5 tropism and displayed a tier 2 neutralization phenotype. These challenge stocks efficiently infected rhesus monkeys by the intrarectal route, replicated to high levels during acute infection, and established chronic viremia in a subset of animals. SHIV-AE16 was titrated for use in single, high dose as well as repetitive, low dose intrarectal challenge studies. These SHIV challenge stocks should facilitate the preclinical evaluation of vaccines, monoclonal antibodies, and other interventions targeted at preventing HIV-1 CRF01_AE infection.

  5. Structures of HIV-1-Env V1V2 with broadly neutralizing antibodies reveal commonalities that enable vaccine design

    Science.gov (United States)

    Gorman, Jason; Soto, Cinque; Yang, Max M.; Davenport, Thaddeus M.; Guttman, Miklos; Bailer, Robert T.; Chambers, Michael; Chuang, Gwo-Yu; DeKosky, Brandon J.; Doria-Rose, Nicole A.; Druz, Aliaksandr; Ernandes, Michael J.; Georgiev, Ivelin S.; Jarosinski, Marissa C.; Joyce, M. Gordon; Lemmin, Thomas M.; Leung, Sherman; Louder, Mark K.; McDaniel, Jonathan R.; Narpala, Sandeep; Pancera, Marie; Stuckey, Jonathan; Wu, Xueling; Yang, Yongping; Zhang, Baoshan; Zhou, Tongqing; Mullikin, James C.; Baxa, Ulrich; Georgiou, George; McDermott, Adrian B.; Bonsignori, Mattia; Haynes, Barton F.; Moore, Penny L.; Morris, Lynn; Lee, Kelly K.; Shapiro, Lawrence; Mascola, John R.; Kwong, Peter D.

    2016-01-01

    Broadly neutralizing antibodies (bNAbs) against HIV-1-Env V1V2 arise in multiple donors. However, atomic-level interactions had only been determined with antibodies from a single donor, making commonalities in recognition uncertain. Here we report the co-crystal structure of V1V2 with antibody CH03 from a second donor and model Env interactions of antibody CAP256-VRC26 from a third. These V1V2-directed bNAbs utilized strand-strand interactions between a protruding antibody loop and a V1V2 strand, but differed in their N-glycan recognition. Ontogeny analysis indicated protruding loops to develop early, with glycan interactions maturing over time. Altogether, the multidonor information suggested V1V2-directed bNAbs to form an ‘extended class’, for which we engineered ontogeny-specific antigens: Env trimers with chimeric V1V2s that interacted with inferred ancestor and intermediate antibodies. The ontogeny-based design of vaccine antigens described here may provide a general means for eliciting antibodies of a desired class. PMID:26689967

  6. The conserved dileucine- and tyrosine-based motifs in MLV and MPMV envelope glycoproteins are both important to regulate a common Env intracellular trafficking

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Lopez-Vergès Sandra

    2006-09-01

    Full Text Available Abstract Background Retrovirus particles emerge from the assembly of two structural protein components, Gag that is translated as a soluble protein in the cytoplasm of the host cells, and Env, a type I transmembrane protein. Because both components are translated in different intracellular compartments, elucidating the mechanisms of retrovirus assembly thus requires the study of their intracellular trafficking. Results We used a CD25 (Tac chimera-based approach to study the trafficking of Moloney murine leukemia virus and Mason-Pfizer monkey virus Env proteins. We found that the cytoplasmic tails (CTs of both Env conserved two major signals that control a complex intracellular trafficking. A dileucine-based motif controls the sorting of the chimeras from the trans-Golgi network (TGN toward endosomal compartments. Env proteins then follow a retrograde transport to the TGN due to the action of a tyrosine-based motif. Mutation of either motif induces the mis-localization of the chimeric proteins and both motifs are found to mediate interactions of the viral CTs with clathrin adaptors. Conclusion This data reveals the unexpected complexity of the intracellular trafficking of retrovirus Env proteins that cycle between the TGN and endosomes. Given that Gag proteins hijack endosomal host proteins, our work suggests that the endosomal pathway may be used by retroviruses to ensure proper encountering of viral structural Gag and Env proteins in cells, an essential step of virus assembly.

  7. Human Ubc9 is involved in intracellular HIV-1 Env stability after trafficking out of the trans-Golgi network in a Gag dependent manner.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Christopher R Bohl

    Full Text Available The cellular E2 Sumo conjugase, Ubc9 interacts with HIV-1 Gag, and is important for the assembly of infectious HIV-1 virions. In the previous study we demonstrated that in the absence of Ubc9, a defect in virion assembly was associated with decreased levels of mature intracellular Envelope (Env that affected Env incorporation into virions and virion infectivity. We have further characterized the effect of Ubc9 knockdown on HIV Env processing and assembly. We found that gp160 stability in the endoplasmic reticulum (ER and its trafficking to the trans-Golgi network (TGN were unaffected, indicating that the decreased intracellular mature Env levels in Ubc9-depleted cells were due to a selective degradation of mature Env gp120 after cleavage from gp160 and trafficked out of the TGN. Decreased levels of Gag and mature Env were found to be associated with the plasma membrane and lipid rafts, which suggest that these viral proteins were not trafficked correctly to the assembly site. Intracellular gp120 were partially rescued when treated with a combination of lysosome inhibitors. Taken together our results suggest that in the absence of Ubc9, gp120 is preferentially degraded in the lysosomes likely before trafficking to assembly sites leading to the production of defective virions. This study provides further insight in the processing and packaging of the HIV-1 gp120 into mature HIV-1 virions.

  8. Genève Reconnaissante

    CERN Multimedia

    2001-01-01

    Robert Cailliau (centre), with Geneva's Mayor Alain Vaissade (left) and Jean Erhardt, Secretary General of the Administrative Council of Geneva (right). Geneva recognised the contribution of two CERN people to the reputation of the city last Tuesday when Mayor Alain Vaissade presented the Genève Reconaissante Medal to Tim Berners-Lee and Robert Cailliau. Berners-Lee, who was not able to be present in person, invented the World Wide Web at CERN just over a decade ago, while Cailliau was his first collaborator. Quoting Cailliau, Vaissade said that whilst there is no doubt that something like the Web would have appeared sooner or later, the fact that it happened at CERN, in Geneva, was no accident. Both the Laboratory and the city are places where people from around the world meet and work in harmony.

  9. Enfermedades de base genética Genetically based diseases

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    D. González-Lamuño

    2008-01-01

    Full Text Available La genética constituye uno de los mayores avances científicos del siglo XX, que comienza con el redescubrimiento de las leyes de Mendel y termina con la elaboración del primer "borrador" de la secuencia completa del genoma humano. La genética utiliza diferentes estrategias de investigación, como los estudios de gemelos y de adopción, que investigan la influencia de los factores genéticos y ambientales, y las estrategias para identificar genes específicos (genética molecular. Además del importante grado de discapacidad que generan, el impacto social de las enfermedades hereditarias es enorme, por su carácter potencialmente recurrente en una misma familia y por el elevado coste socio-sanitario derivado de la enorme carga de cuidados que requiere. El diagnóstico de las enfermedades hereditarias presenta características diferenciadoras muy significativas ya que el resultado de un diagnóstico genético tiene no sólo efectos sobre el paciente sino también sobre todos los individuos emparentados. Por tanto, la unidad de estudio en el diagnóstico genético es la familia y todo proceso de diagnóstico implica una investigación familiar. También conviene tener en cuenta que los protocolos de diagnóstico se desarrollan de forma paralela a la investigación básica y generalmente están poco estandarizados. Los resultados obtenidos en los estudios genéticos y el tipo de información que se facilita al paciente y a su familia deben ser matizados dentro del proceso del "consejo genético".Genetics is one of the greatest scientific advances of the XX century, which begins with the rediscovery of Mendel’s laws and culminates in the elaboration of the first "draft" of the complete sequence of the human genome. Genetics employs different research strategies, such as the study of twins and adoption, investigating the influence of genetic and environmental factors, and strategies for identifying specific genes (molecular genetics. Besides the

  10. An automated HIV-1 Env-pseudotyped virus production for global HIV vaccine trials.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Anke Schultz

    Full Text Available BACKGROUND: Infections with HIV still represent a major human health problem worldwide and a vaccine is the only long-term option to fight efficiently against this virus. Standardized assessments of HIV-specific immune responses in vaccine trials are essential for prioritizing vaccine candidates in preclinical and clinical stages of development. With respect to neutralizing antibodies, assays with HIV-1 Env-pseudotyped viruses are a high priority. To cover the increasing demands of HIV pseudoviruses, a complete cell culture and transfection automation system has been developed. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: The automation system for HIV pseudovirus production comprises a modified Tecan-based Cellerity system. It covers an area of 5×3 meters and includes a robot platform, a cell counting machine, a CO(2 incubator for cell cultivation and a media refrigerator. The processes for cell handling, transfection and pseudovirus production have been implemented according to manual standard operating procedures and are controlled and scheduled autonomously by the system. The system is housed in a biosafety level II cabinet that guarantees protection of personnel, environment and the product. HIV pseudovirus stocks in a scale from 140 ml to 1000 ml have been produced on the automated system. Parallel manual production of HIV pseudoviruses and comparisons (bridging assays confirmed that the automated produced pseudoviruses were of equivalent quality as those produced manually. In addition, the automated method was fully validated according to Good Clinical Laboratory Practice (GCLP guidelines, including the validation parameters accuracy, precision, robustness and specificity. CONCLUSIONS: An automated HIV pseudovirus production system has been successfully established. It allows the high quality production of HIV pseudoviruses under GCLP conditions. In its present form, the installed module enables the production of 1000 ml of virus-containing cell

  11. Guidelines for evaluating performance of oyster habitat restoration should include tidal emersion: reply to Baggett et al.

    NARCIS (Netherlands)

    Walles, B.; Fodrie, F.J.; Nieuwhof, S.; Jewell, O.J.W; Herman, P.M.J.; Ysebaert, T.

    2016-01-01

    Baggett et al. (2015) identified a set of three universal environmental variables to be monitored for evaluating all oyster habitat restoration projects: salinity, temperature, and dissolved oxygen. Perhaps evidencing a bias toward subtidal reefs, this set of parameters omits another first-order env

  12. Hereditariedade e suscetibilidade à reabsorção radicular em Ortodontia não se fundamentam: erros metodológicos e interpretativos repetidamente publicados podem gerar falsas verdades. Análise crítica do trabalho de Al-Qawasmi et al.² sobre a predisposição genética à reabsorção radicular de natureza ortodôntica Heredity and susceptibility to radicular resorption in Odontology do not base: methodological and interpretative repeatedly published mistakes can generate false truths. Critical analysis of Al-Qawasmi work about genetics predisposition to radicular reabsorption of orthodontic kind

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Alberto Consolaro

    2004-05-01

    Full Text Available O trabalho de Al-Qawasmi et al.², publicado em agosto de 2003 no periódico Journal of Dental Research, procurou estabelecer um gene candidato para a hereditariedade e predisposição genética nas reabsorções dentárias em Ortodontia, mas apresentou e repetiu algumas limitações metodológicas e equívocos na interpretação de seu trabalho anterior de março de 2003¹. Nas conclusões afirmam explicitamente que os achados são preliminares e sugestivos, necessitando de confirmação por meio de estudos adicionais. Os resultados são correlacionados fundamentando-se em dados de outros autores sobre síndromes ósseas associadas a reabsorções por substituição, cervicais externas e não com as reabsorções radiculares externas apicais induzidas ortodonticamente. O gene da reabsorção radicular externa apical relacionada a tratamentos ortodônticos não foi determinado e muito menos a sua natureza hereditária. Nem tampouco, a suscetibilidade à reabsorção radicular em Ortodontia foi detectada ou provada. O trabalho analisado e os demais relacionados com o mesmo tema não conseguiram comprovar suas hipóteses porque ignoram que o primeiro passo para a reabsorção radicular externa é a destruição da camada cementoblástica e isto apenas ocorre a partir da ação de fatores locais. Analisando criticamente estes trabalhos podemos afirmar que procurar o gene da reabsorção radicular e da suscetibilidade a partir de pesquisas em mediadores e células clásticas demonstra a falta de um conhecimento completo e amplo da etiopatogenia deste importante fenômeno biológico, imprescindível para o estabelecimento da premissa dos trabalhos.The study of Al-Qawasmi et al.² published in August 2003 on Journal of Dental Research, aimed to establish a candidate gene for heritability and genetic predisposition to external root resorption in orthodontic patients. This paper, however, presents and repeated some methodological faults and equivocated

  13. Single Amino Acid Substitution N659D in HIV-2 Envelope Glycoprotein (Env) Impairs Viral Release and Hampers BST-2 Antagonism

    Science.gov (United States)

    Dufrasne, François E.; Lombard, Catherine; Goubau, Patrick; Ruelle, Jean

    2016-01-01

    BST-2 or tetherin is a host cell restriction factor that prevents the budding of enveloped viruses at the cell surface, thus impairing the viral spread. Several countermeasures to evade this antiviral factor have been positively selected in retroviruses: the human immunodeficiency virus type 2 (HIV-2) relies on the envelope glycoprotein (Env) to overcome BST-2 restriction. The Env gp36 ectodomain seems involved in this anti-tetherin activity, however residues and regions interacting with BST-2 are not clearly defined. Among 32 HIV-2 ROD Env mutants tested, we demonstrated that the asparagine residue at position 659 located in the gp36 ectodomain is mandatory to exert the anti-tetherin function. Viral release assays in cell lines expressing BST-2 showed a loss of viral release ability for the HIV-2 N659D mutant virus compared to the HIV-2 wild type virus. In bst-2 inactivated H9 cells, those differences were lost. Subtilisin treatment of infected cells demonstrated that the N659D mutant was more tethered at the cell surface. Förster resonance energy transfer (FRET) experiments confirmed a direct molecular link between Env and BST-2 and highlighted an inability of the mutant to bind BST-2. We also tested a virus presenting a truncation of 109 amino acids at the C-terminal part of Env, a cytoplasmic tail partial deletion that is spontaneously selected in vitro. Interestingly, viral release assays and FRET experiments indicated that a full Env cytoplasmic tail was essential in BST-2 antagonism. In HIV-2 infected cells, an efficient Env-mediated antagonism of BST-2 is operated through an intermolecular link involving the asparagine 659 residue as well as the C-terminal part of the cytoplasmic tail. PMID:27754450

  14. A pilot study comparing the development of EIAV Env-specific antibodies induced by DNA/recombinant vaccinia-vectored vaccines and an attenuated Chinese EIAV vaccine.

    Science.gov (United States)

    Meng, Qinglai; Lin, Yuezhi; Ma, Jian; Ma, Yan; Zhao, Liping; Li, Shenwei; Yang, Kai; Zhou, Jianhua; Shen, Rongxian; Zhang, Xiaoyan; Shao, Yiming

    2012-12-01

    Data from successful attenuated lentiviral vaccine studies indicate that fully mature Env-specific antibodies characterized by high titer, high avidity, and the predominant recognition of conformational epitopes are associated with protective efficacy. Although vaccination with a DNA prime/recombinant vaccinia-vectored vaccine boost strategy has been found to be effective in some trials with non-human primate/simian/human immunodeficiency virus (SHIV) models, it remains unclear whether this vaccination strategy could elicit mature equine infectious anemia virus (EIAV) Env-specific antibodies, thus protecting vaccinated horses against EIAV infection. Therefore, in this pilot study we vaccinated horses using a strategy based on DNA prime/recombinant Tiantan vaccinia (rTTV)-vectored vaccines encoding EIAV env and gag genes, and observed the development of Env-specific antibodies, neutralizing antibodies, and p26-specific antibodies. Vaccination with DNA induced low titer, low avidity, and the predominant recognition of linear epitopes by Env-specific antibodies, which was enhanced by boosting vaccinations with rTTV vaccines. However, the maturation levels of Env-specific antibodies induced by the DNA/rTTV vaccines were significantly lower than those induced by the attenuated vaccine EIAV(FDDV). Additionally, DNA/rTTV vaccines did not elicit broadly neutralizing antibodies. After challenge with a virulent EIAV strain, all of the vaccinees and control horses died from EIAV disease. These data indicate that the regimen of DNA prime/rTTV vaccine boost did not induce mature Env-specific antibodies, which might have contributed to immune protection failure. PMID:23171359

  15. Estudi comparatiu de l'estructura del gen "Adh" a vàries espècies de "Drosophila"

    OpenAIRE

    Marfany i Nadal, Gemma

    1991-01-01

    S'ha caracterizat l'estructura de la regió genòmica del gen "Adh" a quatre espècies del gènere "Drosophila", pertanyents al subgrup "obscura": "D. ambigua", "D. subobscura", "D. madeirensis" i "D. guanche" amb els objectius d'analitzar l'organització i l'evolució d'aquesta regió genòmica dins d'aquest gènere i clarificar les relacions filogenètiques d'aquestes espècies. Per assolir aquestes fites, es van construir llibreries genòmiques de cada espècie que es van crivellar amb una sonda que co...

  16. The conserved His8 of the Moloney murine leukemia virus Env SU subunit directs the activity of the SU-TM disulphide bond isomerase

    International Nuclear Information System (INIS)

    Murine leukemia virus (MLV) fusion is controlled by isomerization of the disulphide bond between the receptor-binding surface (SU) and fusion-active transmembrane subunits of the Env-complex. The bond is in SU linked to a CXXC motif. This carries a free thiol that upon receptor binding can be activated (ionized) to attack the disulphide and rearrange it into a disulphide isomer within the motif. To find out whether His8 in the conserved SPHQ sequence of Env directs thiol activation, we analyzed its ionization in MLV vectors with wtEnv and Env with His8 deleted or substituted for Tyr or Arg, which partially or completely arrests fusion. The ionization was monitored by following the pH effect on isomerization in vitro by Ca2+ depletion or in vivo by receptor binding. We found that wtEnv isomerized optimally at slightly basic pH whereas the partially active mutant required higher and the inactive mutants still higher pH. This suggests that His8 directs the ionization of the CXXC thiol

  17. Unleashing Gen Y: Marketing Mars to Millennials

    Science.gov (United States)

    Leahy, Bart D.; Hidalgo, Loretta; Kloberdanz, Cassie

    2007-01-01

    Space advocates need to engage Generation Y (born 1977-1999).This outreach is necessary to recruit the next generation of scientists and engineers to explore Mars. Space advocates in the non-profit, private, and government sectors need to use a combination of technical communication, marketing, and politics, to develop messages that resonate with Gen Y. Until now, space messages have been generated by and for college-educated white males; Gen Y is much more diverse, including as much as one third minorities. Young women, too, need to be reached. My research has shown that messages emphasizing technology, fun, humor, and opportunity are the best means of reaching the Gen Y audience of 60 million (US population is 300 million). The important things space advocates must avoid are talking down to this generation, making false promises, or expecting them to "wait their turn" before they can participate. This is the MTV generation! We need to find ways of engaging Gen Y now to build a future where human beings can live and work on the planet Mars. In addition to the messages themselves, advocates need to keep up with Gen Y' s social networking and use of iPods, cell phones, and the Internet. NASA and space advocacy groups can use these tools for "viral marketing," where young people share targeted space-related information via cell phones or the Internet because they like it. Overall, Gen Y is a socially dynamic and media-savvy group; advocates' space messages need to be sincere, creative, and placed in locations where Gen Y lives. Mars messages must be memorable!

  18. Intercompartmental recombination of HIV-1 contributes to env intrahost diversity and modulates viral tropism and sensitivity to entry inhibitors.

    Science.gov (United States)

    Brown, Richard J P; Peters, Paul J; Caron, Catherine; Gonzalez-Perez, Maria Paz; Stones, Leanne; Ankghuambom, Chiambah; Pondei, Kemebradikumo; McClure, C Patrick; Alemnji, George; Taylor, Stephen; Sharp, Paul M; Clapham, Paul R; Ball, Jonathan K

    2011-06-01

    HIV-1 circulates within an infected host as a genetically heterogeneous viral population. Viral intrahost diversity is shaped by substitutional evolution and recombination. Although many studies have speculated that recombination could have a significant impact on viral phenotype, this has never been definitively demonstrated. We report here phylogenetic and subsequent phenotypic analyses of envelope genes obtained from HIV-1 populations present in different anatomical compartments. Assessment of env compartmentalization from immunologically discrete tissues was assessed utilizing a single genome amplification approach, minimizing in vitro-generated artifacts. Genetic compartmentalization of variants was frequently observed. In addition, multiple incidences of intercompartment recombination, presumably facilitated by low-level migration of virus or infected cells between different anatomic sites and coinfection of susceptible cells by genetically divergent strains, were identified. These analyses demonstrate that intercompartment recombination is a fundamental evolutionary mechanism that helps to shape HIV-1 env intrahost diversity in natural infection. Analysis of the phenotypic consequences of these recombination events showed that genetic compartmentalization often correlates with phenotypic compartmentalization and that intercompartment recombination results in phenotype modulation. This represents definitive proof that recombination can generate novel combinations of phenotypic traits which differ subtly from those of parental strains, an important phenomenon that may have an impact on antiviral therapy and contribute to HIV-1 persistence in vivo. PMID:21471230

  19. Implication of the env Gene of the Human Endogenous Retrovirus W Family in the Expression of BDNF and DRD3 and Development of Recent-Onset Schizophrenia

    OpenAIRE

    Huang, Wenjie; Li, Shan; Hu, Yuanming; Yu, Honglian; Luo, Feng; Zhang, Qi; Zhu, Fan

    2010-01-01

    Objective: Retrovirus has been suggested as one of agents involved in the development of schizophrenia. In the present study, we examined the role of the human endogenous retrovirus W family (HERV-W) env gene in the etiopathogenesis of recent-onset schizophrenia, using molecular and epidemiological approaches. Methods: Nested RT-PCR was used to detect the messenger RNA (mRNA) of the HERV-w env gene in plasmas. Quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) was employed to detect the v...

  20. Zum gotischen gen. pl. auf-ë

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    M. Grošelj

    1964-12-01

    Full Text Available Bekanntlich ist die got. Endung -ē eine Besonderheit, der in den übrigen germ. Sprachen nichts Vergleichbares gegenübersteht. Man nimmt wohl -allgemein an, dass es sich um eine innergot. Neuschöpfung handelt; auch ist eine idg. Endung des Gen. Pl. -ēm; linbelegt. Folgender Erklärungsversuch geht von der Annahme aus, dass die Triebkraft für dfese Neuschöpfupg in der Neigung zur Differenzierung des Maskulinums vom Femininum auf -ō (gibō : dagē zu suchen ist. Diese Neigung ist besonders im Nom. und Gen. bemerkbar.

  1. VARIABILIDAD DEL GEN NUCLEAR G3PDH EN JATROPHA CURCAS L.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Sonia Castro Guzmán

    2015-11-01

    Full Text Available Jatrophacurcas L.es una especie nativa de América tropical; en nuestro país se ha venido utilizando principalmente como medicinal y alimenticia desde la época prehispánica. Actualmente el aceite extraído de sus semillas ha adquirido importancia internacional ya que puede ser transformado a biodiesel. El conocimiento que existe sobre la variabilidad genética de la especie es escaso. Un gen utilizado con éxito para el estudio de patrones de variación y origen de la yuca (ManihotesculentaL. y del caco (Theobromacacao L. es el gen nuclearG3pdh(Gliceraldehído3 fosfato deshidrogenasa involucrado en la fotosíntesis. Con base en ello, en este trabajo se exploró la variabilidad del gen G3pdh en individuos deJ. curcasprovenientes de 15 poblaciones de los estados de Veracruz, Campeche, Yucatán y Quintana Roo. Para obtener el gen G3pdh completo de alrededor de 1000 pares de bases, se amplificó utilizando losprimersdiseñados porStrandet al. (1997 y los dosprimersinternos reverse diseñados porOlsenySchaal(1999 para obtener segmentos más cortos, de 600 y 800 pares de bases aproximadamente. Por primera vez se amplificaron aproximadamente 500pby los resultados demuestran que el gen G3pdh es útil para analizar la variabilidad deJ. curcas, y con un importante potencial para evaluar la distribución y evolución de sus poblaciones en México, conocer las relaciones ancestro descendiente a nivel poblacional y explicar las causas de la distribución de los distintoshaplotipos.

  2. Kontrolle der Expression des UNUSUAL FLORAL ORGANS (UFO) Gens in Arabidopsis thaliana

    OpenAIRE

    Hobe, Martin

    2004-01-01

    Die vorliegende Arbeit befaßt sich mit der Kontrolle des Expressionsmusters des UNUSUAL FLORAL ORGANS (UFO) Gens von Arabidopsis thaliana. UFO wird im Sproß- und Blütenmeristemen aller Entwicklungsstadien der Pflanze exprimiert. In Blütenmeristemen agiert UFO als Kofaktor von LEAFY (LFY) bei der Aktivierung der Organidentitätsgene des zweiten und dritten Wirtels. UFO stellt also einen generellen Faktor der Musterbildung in Meristemen dar. Um regulatorische Gene, die die Expression von UFO bee...

  3. Preserving Accuracy in GenBank

    DEFF Research Database (Denmark)

    Bidartondo, M.I.; Bruns, T. D.; Blackwell, M.;

    2008-01-01

    GenBank, the public repository for nucleotide and protein sequences, is a critical resource for molecular biology, evolutionary biology, and ecology. While some attention has been drawn to sequence errors (1), common annotation errors also reduce the value of this database. In fact, for organisms...

  4. Riesgos sobre la salud de los alimentos modificados genéticamente: una revision bibliografica

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    José L. Domingo Roig

    2000-01-01

    Full Text Available A lo largo de 1999, se ha venido intensificando el debate sobre la seguridad de los alimentos modificados genéticamente, una importante y compleja área de investigación científica, la cual demanda unos estándares rigurosos. Diversos grupos, incluyendo asociaciones de consumidores y Organizaciones no Gubernamentales (ONGs han sugerido que todos los alimentos modificados genéticamente deberían ser sometidos a estudios a largo plazo con animales antes de su aprobación para el consumo humano. El principal objetivo de la presente revisión ha sido conocer cual es el estado actual de la cuestión en lo referente a los potenciales efectos adversos sobre la salud de los alimentos modificados genéticamente. Dos bases de datos, Medline y Toxline, así como una serie de direcciones de internet, han sido empleadas para la obtención de bibliografía. Aunque son numerosos los comentarios, noticias generales y cartas al Editor aparecidos en prestigiosas revistas, los artículos referentes a estudios experimentales sobre la seguridad de los alimentos modificados genéticamente son, sorprendentemente, muy escasos. Si se han obtenido resultados procedentes de la evaluación toxicológica de estos alimentos, no han sido publicados en revistas científicas y, por lo tanto, no han podido ser debidamente juzgados o contrastados.

  5. Editorial: Cartas al Editor

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Guillermo Llanos

    2006-06-01

    Full Text Available En todas las revistas biomédicas del mundo existe una sección habitual denominada como el título de este editorial y que en Colombia Médica la llamamos correspondencia. Este espacio tiene como objetivo fundamental que los lectores escriban a los autores (investigadores comentando los artículos que se han publicado en números anteriores de la revista. Las cartas son, entonces, breves comentarios de desacuerdo o acuerdo (conceptual, metodológico, interpretativo sobre falencias ubicadas por un lector alerta al tema debatido en cualquiera de las secciones como en los artículos originales, editoriales, revisiones, presentación de casos, etc. publicados previamente en la revista. Las cartas deben permitir el intercambio de opiniones y formas de pensar y analizar los problemas planteados entre los autores y los lectores. En ocasiones una serie de cartas motivadas por un artículo original puede ser tan o más interesante como el artículo que generó la correspondencia. Las cartas son también un formato adecuado para comunicar un hecho novedoso de una observación clínica juiciosa no descrita antes. Un ejemplo de ello es la carta de un gineco-obstetra australiano cuando informó a Lancet los primeros efectos adversos informados de la talidomida. Colombia Médica, a pesar de mantener vigente esta sección, no ha sido muy afortunada en establecer una buena cultura del envío de cartas al editor. Pero últimamente han llegado juiciosas observaciones a las cuales se les ha dado prioridad en su publicación. Toda carta que comenta los hallazgos de un artículo es enviada a los autores para su respuesta, porque ello genera el debate académico buscado, y luego se publican, tanto la carta como su respuesta. El Estilo Vancouver recomienda que la carta y su respuesta deban ser breve, no pasar de dos o tres párrafos y contener sólo cuatro o cinco referencias. En lo posible (a menos que sea indispensable no presentar ni cuadros ni gráficos. El t

  6. Evolución genómica por diseño molecular de levaduras industriales

    OpenAIRE

    SANI, DANIELE

    2013-01-01

    En esta Tesis Doctoral se propone una alternativa a la coyuntura actual de rechazo social frente al uso de OMGs en la industria agroalimentaria, mediante la demostración y el desarrollo de un nuevo concepto sobre el uso de las técnicas de biología molecular en la obtención de levaduras modificadas genéticamente, el concepto de Evolución Genómica mediante Diseño Molecular. La idea básica de este nuevo concepto es simple y se basa en imitar a la propia naturaleza en su const...

  7. Los algoritmos genéticos y el método de generación y prueba

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Luis Roberto Ojeda Ch.

    2011-01-01

    Full Text Available Este trabajo pretende mostrar dos paradigmas de solución de problemas en inteligencia artificial. Los algoritmos genéticos han tomado una posición destacada en los últimos tiempos y el método de generación y prueba, cuyo perfil se aproxima al fundamento de los algoritmos genéticos constituye la forma de diseño de DENDRAL, un producto ampliamente reconocido en IA. Se desea mostrar que ambos paradigmas se ubican naturalmente dentro de las expectativas de la inteligencia artificial.

  8. Anomalías y displasias dentarias de origen genético-hereditario Inherited dental abnormalities and dysplasias

    OpenAIRE

    J. Martín-González; B. Sánchez-Domínguez; M.L. Tarilonte-Delgado; L. Castellanos-Cosano; J.M. Llamas-Carreras; F.J. López-Frías; J.J. Segura-Egea

    2012-01-01

    Las alteraciones del desarrollo embriológico de la dentición provocan anomalías y displasias dentarias. Los factores etiopatogénicos implicados en las alteraciones del desarrollo dentario son básicamente dos: genéticos y ambientales. Según la fase del desarrollo en que afecten al órgano del esmalte y a los tejidos dentarios, aparecerán diferentes anomalías y/o displasias dentales. El control genético del desarrollo dentario se lleva a cabo mediante dos procesos: a) control de la histogénesis ...

  9. Los algoritmos genéticos y el método de generación y prueba

    OpenAIRE

    Luis Roberto Ojeda Ch.

    2011-01-01

    Este trabajo pretende mostrar dos paradigmas de solución de problemas en inteligencia artificial. Los algoritmos genéticos han tomado una posición destacada en los últimos tiempos y el método de generación y prueba, cuyo perfil se aproxima al fundamento de los algoritmos genéticos constituye la forma de diseño de DENDRAL, un producto ampliamente reconocido en IA. Se desea mostrar que ambos paradigmas se ubican naturalmente dentro de las expectativas de la inteligencia artificial.

  10. Gen IV Materials Handbook Implementation Plan

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Rittenhouse, P.; Ren, W.

    2005-03-29

    A Gen IV Materials Handbook is being developed to provide an authoritative single source of highly qualified structural materials information and materials properties data for use in design and analyses of all Generation IV Reactor Systems. The Handbook will be responsive to the needs expressed by all of the principal government, national laboratory, and private company stakeholders of Gen IV Reactor Systems. The Gen IV Materials Handbook Implementation Plan provided here addresses the purpose, rationale, attributes, and benefits of the Handbook and will detail its content, format, quality assurance, applicability, and access. Structural materials, both metallic and ceramic, for all Gen IV reactor types currently supported by the Department of Energy (DOE) will be included in the Gen IV Materials Handbook. However, initial emphasis will be on materials for the Very High Temperature Reactor (VHTR). Descriptive information (e.g., chemical composition and applicable technical specifications and codes) will be provided for each material along with an extensive presentation of mechanical and physical property data including consideration of temperature, irradiation, environment, etc. effects on properties. Access to the Gen IV Materials Handbook will be internet-based with appropriate levels of control. Information and data in the Handbook will be configured to allow search by material classes, specific materials, specific information or property class, specific property, data parameters, and individual data points identified with materials parameters, test conditions, and data source. Details on all of these as well as proposed applicability and consideration of data quality classes are provided in the Implementation Plan. Website development for the Handbook is divided into six phases including (1) detailed product analysis and specification, (2) simulation and design, (3) implementation and testing, (4) product release, (5) project/product evaluation, and (6) product

  11. Safety Assurance in NextGen

    Science.gov (United States)

    HarrisonFleming, Cody; Spencer, Melissa; Leveson, Nancy; Wilkinson, Chris

    2012-01-01

    The generation of minimum operational, safety, performance, and interoperability requirements is an important aspect of safely integrating new NextGen components into the Communication Navigation Surveillance and Air Traffic Management (CNS/ATM) system. These requirements are used as part of the implementation and approval processes. In addition, they provide guidance to determine the levels of design assurance and performance that are needed for each element of the new NextGen procedures, including aircraft, operator, and Air Navigation and Service Provider. Using the enhanced Airborne Traffic Situational Awareness for InTrail Procedure (ATSA-ITP) as an example, this report describes some limitations of the current process used for generating safety requirements and levels of required design assurance. An alternative process is described, as well as the argument for why the alternative can generate more comprehensive requirements and greater safety assurance than the current approach.

  12. Gen. Keen discusses Americas with JFSSPP

    OpenAIRE

    2011-01-01

    Army Lt. Gen. P. K. Keen, he Militay Deputy Commander for USSOUTHCOM, met with Foreign Area Officers (FAOs) attending a Latin American in-residence course at NPS for the School of International Graduate Studies (SIGS) Joint Foreign Area OFficer Skill Sustainment Pilot Program (JFSSPP). Keen spoke for nearly an hour to more than 35 participants in the course, which ran from February 21 though March 4. JFSSPP students are non-matriculated students who come to NPS for topical short courses rela...

  13. Genética de poplaciones de Atta sexdens rubropilosa (Hymenoptera: Formicidae) POPULATION GENETICS OF Atta sexdens rubropilosa (HYMENOPTERA: FORMICIDAE)

    OpenAIRE

    LIRIANA BELIZÁRIO CANTAGALLI; CLAUDETE APARECIDA MANGOLIN; MARIA CLAUDIA COLLA RUVOLO TAKASUSUKI

    2013-01-01

    La variabilidad genética de las hormigas Atta sexdens rubropilosa colectadas en cinco lugares distintos de Brasil fueron evaluados por la técnica PCR-RAPD. Un total de 15 primers produjeron 148 fragmentos, de los cuales 123 fueron polimórficos, lo que corresponden al 83,11 %. La estimación de la diversidad genética por el índice de Shannon fue 0,3836 y el desviación estándar fue de ± 0,2335. Estos valores demuestran una alta diversidad genética. El valor de G ST fue 0,2372 y ΦPT = 0,184 l...

  14. Diagnostico genético prenatal y aborto. Dos cuestiones de eugenesia y discriminación

    OpenAIRE

    FABIOLA VILLELA CORTÉS; Jorge E. Linares Salgado

    2012-01-01

    Los avances en genética seguidos de las nuevas tecnologías en la detección temprana de afecciones genéticas conllevan dilemas bioéticos sobre el uso adecuado de estas técnicas, la información que se le da a la mujer embarazada y la decisión que ella tomará al recibirla. Detectar a tiempo anomalías genéticas permite, en algunas ocasiones, el inicio de un tratamiento adecuado que permita que el niño por nacer no desarrolle una enfermedad discapacitante, como el caso de la fenilcetonuria, o una ...

  15. Aïllament, identificació i caracterització de nematodes entomopatògens en sòls de cultius del Baix Llobregat i les muntanyes de Prades i possible utilització per al control de plagues

    OpenAIRE

    Suárez Cano, Pedro

    2015-01-01

    Durant els últims anys s'estan realitzant nombrosos estudis sobre l'ús de nematodes com a mètode de control biològic. Mitjançant el present treball s'ha pretès realitzar un aïllament de nematodes entomopatògens en les zones de Prades i del Baix Llobregat i un cop aïllats i identificats realitzar diferents proves d'eficàcia d'aquests aïllats com mètodes de control de diferents plagues. Per dur a terme aquests assajos s'han realitzat diferents sistemes pel manteniment i producció de les pob...

  16. Genética de comunidades

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    M. Verdú

    2009-01-01

    Full Text Available Los estudios sobre los procesos responsables del ensamblaje de las especies en comunidades ecológicas tradicionalmente han considerado a las especies como unidades de estudio. Sin embargo, dentro de las especies existe gran cantidad de variación genotípica y fenotípica que puede finalmente ser decisiva en el resultado de las interacciones con el resto de especies en la comunidad (competencia, mutualismo, etc. Recientemente se ha propuesto una nueva regla de ensamblaje de las comunidades que sugiere que la composición genética de una población afecta a la estructura y composición de la comunidad (es decir alfenotipo de la comunidad. Apoyando esta regla, varios estudios han demostrado que los cambios en la diversidad genética de poblaciones de plantas conllevan cambios predecibles en sus comunidades asociadas de herbívoros y predadores. Más allá de la visión poblacional, la nueva genética de comunidades pretende demostrar 1 que el genotipo particular de ciertos individuos es responsable del fenotipo de la comunidad, 2 que el fenotipo de la comunidad es heredable, y por lo tanto 3 que las comunidades evolucionan. Tras explicar estos tres conceptos, se discute el valor que esta aproximación puede tener desde el punto de vista de la biología de la conservación.

  17. Structures and stability of metal-doped GenM (n = 9, 10 clusters

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Wei Qin

    2015-06-01

    Full Text Available The lowest-energy structures of neutral and cationic GenM (n = 9, 10; M = Si, Li, Mg, Al, Fe, Mn, Pb, Au, Ag, Yb, Pm and Dy clusters were studied by genetic algorithm (GA and first-principles calculations. The calculation results show that doping of the metal atoms and Si into Ge9 and Ge10 clusters is energetically favorable. Most of the metal-doped Ge cluster structures can be viewed as adding or substituting metal atom on the surface of the corresponding ground-state Gen clusters. However, the neutral and cationic FeGe9,10,MnGe9,10 and Ge10Al are cage-like with the metal atom encapsulated inside. Such cage-like transition metal doped Gen clusters are shown to have higher adsorption energy and thermal stability. Our calculation results suggest that Ge9,10Fe and Ge9Si would be used as building blocks in cluster-assembled nanomaterials because of their high stabilities.

  18. Avances genéticos y moleculares en el estudio de trastornos mentales

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Daisy Natalia Salamanca-Ortíz

    2014-04-01

    Full Text Available Actualmente, con el aumento de la disponibilidad de técnicas para la realización de estudios genéticos, han aparecido nuevas áreas del conocimiento como la epigenética y la farmacogenética. Estas nuevas áreas han permitido esclarecer las bases genéticas implicadas en la aparición de las enfermedades que afectan al ser humano. Dada su aplicación global, la psiquiatría no ha sido ajena al alcance de estas nuevas disciplinas, lo cual se refleja en el gran número de estudios realizados a nivel mundial que han relacionado la presencia de variantes genéticas en los individuos con la aparición de trastornos mentales específicos. De la misma forma, otros estudios han evidenciado que la efectividad de los tratamientos farmacológicos empleados en psiquiatría se correlaciona con polimorfismos en las enzimas encargadas de metabolizar dichos medicamentos. Por lo tanto, es importante que los psiquiatras conozcan los aspectos básicos de estas relaciones para obtener mejores resultados en el diagnóstico y tratamiento de los principales trastornos mentales.

  19. Diversidad genética y estructura de la población de Vibrio choierae en Colombia

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Riaño Pachón Diego Mauricio

    2003-06-01

    Full Text Available Se realizó la electroforesis en gel por campo pulsado (PFGE de los macrofragmentos de restricción de 34 aislamien­tos de Vibrio choierae pertenecientes a la epidemia de cólera que se presentó en Colombia entre 1991 y 1996, adicionalmente se analizaron 3 aislamientos de V. choierae no pertenecientes a esta epidemia y un aislamiento de V fluvialis. La diversidad genética observada para los 38 aislamientos tipificados fue de 0,95 valor muy similar al obtenido por Electroforesis de Enzimas Multilocus (MLEE. No se observó correlación entre las variables que carac­terizan a estos aislamientos (serotipo, origen [clínico o ambiental], departamento, tipo electroforético (MLEE y perfil de macrofragmentos de restricción (PFGE. No se obtuvo evidencia de desequilibrio de ligamiento al evaluar esta población con los marcadores genéticos PFGE y MLEE. Se sugiere que la población de Vibrio choierae en Colom­bia presenta una estructura genética sexual, hipótesis que está soportada por la falta de evidencia de desequilibrio de ligamiento y la ausencia de correlaciones entre las variables epidemiológicas, bioquímicas y moleculares a dispo­sición, y por el alto valor de diversidad genética obtenido, que puede ser el reflejo de la coexistencia de varias líneas de descendencia entre las cuales existe un alto flujo genético. Palabras clave: Vibrio choierae; Electroforesis en gel por campo pulsado; epidemiología molecular; genética de po­blaciones; desequilibrio de ligamiento.

  20. Generic classification of the Archiborborinae (Diptera: Sphaeroceridae), with a revision of Antrops Enderlein, Coloantrops gen. nov., Maculantrops gen. nov., Photoantrops gen. nov., and Poecilantrops gen. nov.

    Science.gov (United States)

    Kits, Joel H; Marshall, Stephen A

    2013-01-01

    The Archiborborinae comprise a diverse clade of flies in the family Sphaeroceridae. We here revise the generic classification, redefining the genus Antrops Enderlein and naming 5 new genera: Boreantrops gen. nov., Coloantrops gen. nov., Maculantrops gen. nov., Photoantrops gen. nov., and Poecilantrops gen. nov. The genus Archiborborus, until recently a paraphyletic assemblage including most of the described species in the subfamily, is treated as a junior synonym of Antrops (syn. nov.) We revise the genera Antrops (53 species, including 40 sp. nov.: Antrops anovariegatus, Antrops aurantifemur, Antrops baeza, Antrops bellavista, Antrops biflavus, Antrops bucki, Antrops carpishensis, Antrops cochabamba, Antrops cochinoca, Antrops coniobaptos, Antrops coroico, Antrops cotopaxi, Antrops didactylos, Antrops diversipennis, Antrops eurus, Antrops fulgiceps, Antrops fuliginosus, Antrops guandera, Antrops guaramacalensis, Antrops inca, Antrops juninensis, Antrops mucarensis, Antrops niger, Antrops papallacta, Antrops pecki, Antrops podocarpus, Antrops quadrilobus, Antrops siberia, Antrops sierrazulensis, Antrops tachira, Antrops tequendama, Antrops tetrastichus, Antrops tumbrensis, Antrops unduavi, Antrops variegatus, Antrops versabilis, Antrops vittatus, Antrops yungas, and Antrops zongo and the following comb. nov.: Antrops annulatus (Richards), Antrops chaetosus (Richards), Antrops femoralis (Blanchard), Antrops hirtus (Bigot), Antrops maculipennis (Duda), Antrops maximus (Richards), Antrops microphthalmus (Richards), Antrops quadrinotus (Bigot), Antrops setosus (Duda), Antrops simplicimanus (Richards), Antrops nitidicollis (Becker), and Antrops orbitalis (Duda)), Coloantrops (1 species: Coloantrops daedalus, sp. nov.), Maculantrops (2 species, Maculantrops hirtipes (Macquart) comb. nov. and Maculantrops altiplanus, sp. nov.), Photoantrops (1 species: Pho-toantrops echinus sp. nov.), and Poecilantrops (10 species: Poecilantrops baorucensis, Poecilantrops boraceiensis

  1. Comportamiento productivo de cerdos portadores del gen del halotano en condiciones medioambientales no controladas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Sánchez-Chiprés, David Román

    2008-05-01

    Full Text Available El síndrome de estrés porcino es una enfermedad genética que afecta acerdos de crecimiento rápido, manifestándose con muerte súbita durante las condiciones de manejo o al sacrificio, como carne pálida, suave y exudativa. Se econoce que el síndrome de estrés porcino (PSS, el síndrome de la carne pálida suave y exudativa (PSE así como la hipertermia maligna (MH, comparten una mutación en el gen receptor de la rianodina (RYR1. Un método de diagnóstico basado en DNA y el uso de la técnica de reacción en cadena de la polimerasa, permite hacer una distinción de los genotipos para el locus halotano.

  2. Una revisión de la genética del autismo.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Alison Mcinnes

    2002-01-01

    Full Text Available El autismo es un severo trastorno del desarrollo neuropsicológico, caracterizado por una alteración de la comunicación y de la interacción social, y por restringidas, repetitivas y obsesivas pautas de conducta. Afecta más a hombres que a mujeres y, con frecuencia, existe un bajo cociente intelectual. Recientes estimaciones de su prevalencia en California muestran un creciente aumento. Se piensa en posibles causas genéticas y ambientales con un carácter fuertemente hereditario. Existen progresos recientes en lo que respecta al aislamiento de los genes de susceptibilidad, habiéndose confirmado definitivamente los factores de predisposición no ambientales. En la presente revisión se exponen los más recientes hallazgos epidemiológicos, así como los resultados de los actuales estudios sobre la genética del trastorno.

  3. Mucopolisacaridosis II: nueva mutación patogénica en gen IDS

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Eugenia Pérez-Elizondo

    2014-12-01

    Full Text Available La mucopolisacaridosis tipo II es una enfermedad lisosomal producida por la deficiencia de la enzima iduronato 2 sulfatasa. Es una condición infrecuente de herencia recesiva ligada al X, que puede producir importante discapacidad progresiva. El análisis molecular es una técnica útil en la confirmación diagnóstica, que además permite detección de portadores asintomáticos, brindando la oportunidad de asesoría genética. Se presenta el caso de un paciente con mucopolisacaridosis tipo II, en quien se documentó una nueva mutación patogénica en el Gen IDS.

  4. Market share scenarios for Gen-DIII and gen-IV reactors in Europe

    International Nuclear Information System (INIS)

    Nuclear energy is back on the agenda worldwide in order to meet growing energy demand and especially the growth in electricity demand. Many objectives direct to an increased use of nuclear energy, i.e. minimising energy costs, reducing climate change effects and others. In the light of the potential renewed growth of nuclear energy, the public demands a clear view on what nuclear energy may contribute towards meeting these objectives and especially how nuclear energy may address some socio-political obstructions with respect to economics, radioactive waste, safety and proliferation of fissile materials. To address these questions, the future nuclear reactor park mix in Europe has been analysed applying an integrated dynamic process modelling technique. Various market share scenarios for nuclear energy are derived including sub-variants with regard to the intra-nuclear options. In the analyses, it is assumed that different types of new reactors may be built, taking into account the introduction date of considered Gen-Ill (i.e. EPR) and Gen-IV (i.e. SCWR, HTR, FR) reactors, and the economic evaluation of the complete fuel cycle. The assessment was undertaken using the DANESS code (Dynamic Analysis of Nuclear Energy System Strategies). The analyses show that given the considered realistic nuclear energy demand and given a limited number of available Gen-III and Gen-IV reactor types, the future European nuclear park will exist of combinations of Gen-III and Gen-IV reactors. This mix will always consist of a set of reactor types each having its specific strengths. The analyses also highlight the triggers influencing the choice between different nuclear energy deployment scenarios. (authors)

  5. Parámetros y tendencias genéticas para características de crecimiento predestete en la población mexicana de Simmental

    OpenAIRE

    Javier Rosales; Elzo, Mauricio A.; Moisés Montaño; Vicente Eliezer Vega

    2004-01-01

    Se utilizaron registros de pesos al nacimiento (18,383) y al destete (9,023) de la población mexicana de ganado Simmental, para estimar varianzas genéticas aditivas directas y maternas, heredabilidades, correlaciones y tendencias genéticas. La información se obtuvo en 434 hatos de socios de la Asociación Mexicana Simmental-Simbrah, entre 1980 y 1999. El grupo contemporáneo se definió como hatoaño- estación. Se utilizó un modelo animal de dos características con efectos aditivos directos y mat...

  6. Immunological responses during a virologically failing antiretroviral regimen are associated with in vivo synonymous mutation rates of HIV type-1 env

    DEFF Research Database (Denmark)

    Mens, Helene; Jørgensen, Louise Bruun; Kronborg, Gitte;

    2009-01-01

    BACKGROUND: Little is known about the underlying causes of differences in immunological response to antiretroviral therapy during multidrug-resistant (MDR) HIV type-1 (HIV-1) infection. This study aimed to identify virological factors associated with immunological response during therapy failure....... METHODS: Individuals with MDR HIV-1 receiving therapy for > or =3 months were included. CD4+ T-cell count slopes and pol and clonal env sequences were determined. Genetic analyses were performed using distance-based and maximum likelihood methods. Synonymous mutations rates of env were used to estimate...... for analysis. In a longitudinal mixed-effects model, plasma HIV-1 RNA only tended to predict immunological response (P=0.06), whereas minor protease inhibitor (PI) and nucleoside reverse transcriptase (NRTI) mutations at baseline correlated significantly with CD4+ T-cell count slopes (r= -0.56, P=0.04 and r...

  7. Targeted infection of HIV-1 Env expressing cells by HIV(CD4/CXCR4 vectors reveals a potential new rationale for HIV-1 mediated down-modulation of CD4

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Harmison George G

    2005-12-01

    Full Text Available Abstract Background Efficient targeted gene transfer and cell type specific transgene expression are important for the safe and effective expression of transgenes in vivo. Enveloped viral vectors allow insertion of exogenous membrane proteins into their envelopes, which could potentially aid in the targeted transduction of specific cell types. Our goal was to specifically target cells that express the T cell tropic HIV-1 envelope protein (Env using the highly specific interaction of Env with its cellular receptor (CD4 inserted into the envelope of an HIV-1-based viral vector. Results To generate HIV-1-based vectors carrying the CD4 molecule in their envelope, the CD4 ectodomain was fused to diverse membrane anchors and inserted together with the HIV-1 coreceptor CXCR4 into the envelopes of HIV-1 vector particles. Independent of the type of CD4 anchor, all chimeric CD4 proteins inserted into HIV-1 vector envelopes and the resultant HIV(CD4/CXCR4 particles were able to selectively confer neomycin resistance to cells expressing the fusogenic T cell tropic HIV-1 Env protein. Unexpectedly, in the absence of Env on the target cells, all vector particles carrying the CD4 ectodomain anchored in their envelope adhered to various cell types without infecting these cells. This cell adhesion was very avid. It was independent of the presence of Env on the target cell, the type of CD4 anchor or the presence of CXCR4 on the particle. In mixed cell populations with defined ratios of Env+/Env- cells, the targeted transduction of Env+ cells by HIV(CD4/CXCR4 particles was diminished in proportion to the number of Env- cells. Conclusion Vector diversion caused by a strong, non-selective cell binding of CD4+-vector particles effectively prevents the targeted transduction of HIV-1 Env expressing cells in mixed cell populations. This Env-independent cell adhesion severely limits the effective use of targeted HIV(CD4/CXCR4 vectors designed to interfere with HIV-1

  8. Early Antibody Lineage Diversification and Independent Limb Maturation Lead to Broad HIV-1 Neutralization Targeting the Env High-Mannose Patch.

    Science.gov (United States)

    MacLeod, Daniel T; Choi, Nancy M; Briney, Bryan; Garces, Fernando; Ver, Lorena S; Landais, Elise; Murrell, Ben; Wrin, Terri; Kilembe, William; Liang, Chi-Hui; Ramos, Alejandra; Bian, Chaoran B; Wickramasinghe, Lalinda; Kong, Leopold; Eren, Kemal; Wu, Chung-Yi; Wong, Chi-Huey; Kosakovsky Pond, Sergei L; Wilson, Ian A; Burton, Dennis R; Poignard, Pascal

    2016-05-17

    The high-mannose patch on HIV Env is a preferred target for broadly neutralizing antibodies (bnAbs), but to date, no vaccination regimen has elicited bnAbs against this region. Here, we present the development of a bnAb lineage targeting the high-mannose patch in an HIV-1 subtype-C-infected donor from sub-Saharan Africa. The Abs first acquired autologous neutralization, then gradually matured to achieve breadth. One Ab neutralized >47% of HIV-1 strains with only ∼11% somatic hypermutation and no insertions or deletions. By sequencing autologous env, we determined key residues that triggered the lineage and participated in Ab-Env coevolution. Next-generation sequencing of the Ab repertoire showed an early expansive diversification of the lineage followed by independent maturation of individual limbs, several of them developing notable breadth and potency. Overall, the findings are encouraging from a vaccine standpoint and suggest immunization strategies mimicking the evolution of the entire high-mannose patch and promoting maturation of multiple diverse Ab pathways. PMID:27192579

  9. Aconselhamento genético Genetic counseling

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    João Monteiro de Pina-Neto

    2008-08-01

    Full Text Available OBJETIVO: Esta revisão sobre aconselhamento genético (AG teve o objetivo de mostrar os conceitos atuais e os princípios filosóficos e éticos aceitos na grande maioria dos países e recomendados pela Organização Mundial da Saúde, as fases do processo, seus resultados e o impacto psicológico de uma doença genética em uma família. FONTES DOS DADOS: Os conceitos apresentados são baseados em uma síntese histórica da literatura sobre AG desde a década de 1930 até o momento atual, sendo que os artigos citados representam os principais trabalhos publicados e que hoje fundamentam a teoria e a prática do AG. SÍNTESE DOS DADOS: O AG modernamente é definido como um processo de comunicação que trata dos problemas humanos relacionados à ocorrência de uma doença genética em uma família. É fundamental que os profissionais da saúde conheçam os aspectos psicológicos desencadeados pela doença genética e como estes aspectos podem ser manejados. Vivemos ainda na genética humana e médica uma fase de predomínio dos aspectos técnicos e científicos e de pouca ênfase no estudo das reações emocionais e dos processos de adaptação das pessoas a estas doenças, o que leva ao baixo entendimento dos clientes sobre os fatos ocorridos, com conseqüências negativas sobre a vida familiar e para a sociedade. CONCLUSÕES: Conclui-se pela necessidade de que as famílias com doenças genéticas sejam encaminhadas para AG e que os profissionais desta área invistam mais na humanização do atendimento, desenvolvendo mais as técnicas do AG psicológico não-diretivo.OBJECTIVE: The objective of this review of genetic counseling (GC is to describe the current concepts and philosophical and ethical principles accepted by the great majority of countries and recommended by the World Health Organization, the stages of the process, its results and the psychological impact that a genetic disease has on a family. SOURCES: The concepts presented are

  10. TidGen Power System Commercialization Project

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Sauer, Christopher R. [President & CEO; McEntee, Jarlath [VP Engineering & CTO

    2013-12-30

    ORPC Maine, LLC, a wholly-owned subsidiary of Ocean Renewable Power Company, LLC (collectively ORPC), submits this Final Technical Report for the TidGen® Power System Commercialization Project (Project), partially funded by the U.S. Department of Energy (DE-EE0003647). The Project was built and operated in compliance with the Federal Energy Regulatory Commission (FERC) pilot project license (P-12711) and other permits and approvals needed for the Project. This report documents the methodologies, activities and results of the various phases of the Project, including design, engineering, procurement, assembly, installation, operation, licensing, environmental monitoring, retrieval, maintenance and repair. The Project represents a significant achievement for the renewable energy portfolio of the U.S. in general, and for the U.S. marine hydrokinetic (MHK) industry in particular. The stated Project goal was to advance, demonstrate and accelerate deployment and commercialization of ORPC’s tidal-current based hydrokinetic power generation system, including the energy extraction and conversion technology, associated power electronics, and interconnection equipment capable of reliably delivering electricity to the domestic power grid. ORPC achieved this goal by designing, building and operating the TidGen® Power System in 2012 and becoming the first federally licensed hydrokinetic tidal energy project to deliver electricity to a power grid under a power purchase agreement in North America. Located in Cobscook Bay between Eastport and Lubec, Maine, the TidGen® Power System was connected to the Bangor Hydro Electric utility grid at an on-shore station in North Lubec on September 13, 2012. ORPC obtained a FERC pilot project license for the Project on February 12, 2012 and the first Maine Department of Environmental Protection General Permit issued for a tidal energy project on January 31, 2012. In addition, ORPC entered into a 20-year agreement with Bangor Hydro Electric

  11. Gen IV Materials Handbook Functionalities and Operation

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Ren, Weiju [ORNL

    2009-12-01

    This document is prepared for navigation and operation of the Gen IV Materials Handbook, with architecture description and new user access initiation instructions. Development rationale and history of the Handbook is summarized. The major development aspects, architecture, and design principles of the Handbook are briefly introduced to provide an overview of its past evolution and future prospects. Detailed instructions are given with examples for navigating the constructed Handbook components and using the main functionalities. Procedures are provided in a step-by-step fashion for Data Upload Managers to upload reports and data files, as well as for new users to initiate Handbook access.

  12. Apratylenchus vietnamensis gen. n., sp. n. and A. binhi gen. n., sp. n., sedentary Pratylenchidae (Nematoda:Tylenchida) from coffee in Vietnam, with proposal of Apratylenchinae subfam. n.

    NARCIS (Netherlands)

    Trinh, P.Q.; Waeyenberge, L.; Nguyen, C.N.; Baldwin, J.G.; Karssen, G.; Moens, M.

    2009-01-01

    Apratylenchinae subfam. n. is proposed within the Pratylenchidae to include Apratylenchus gen. n. and two new species, A. vietnamensis gen. n., sp. n. and A. binhi gen. n., sp. n., from coffee plantations in Vietnam. Apratylenchus gen. n. is distinguished by the presence of transverse rows of cuticu

  13. R5 clade C SHIV strains with tier 1 or 2 neutralization sensitivity: tools to dissect env evolution and to develop AIDS vaccines in primate models.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Nagadenahalli B Siddappa

    Full Text Available BACKGROUND: HIV-1 clade C (HIV-C predominates worldwide, and anti-HIV-C vaccines are urgently needed. Neutralizing antibody (nAb responses are considered important but have proved difficult to elicit. Although some current immunogens elicit antibodies that neutralize highly neutralization-sensitive (tier 1 HIV strains, most circulating HIVs exhibiting a less sensitive (tier 2 phenotype are not neutralized. Thus, both tier 1 and 2 viruses are needed for vaccine discovery in nonhuman primate models. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: We constructed a tier 1 simian-human immunodeficiency virus, SHIV-1157ipEL, by inserting an "early," recently transmitted HIV-C env into the SHIV-1157ipd3N4 backbone [1] encoding a "late" form of the same env, which had evolved in a SHIV-infected rhesus monkey (RM with AIDS. SHIV-1157ipEL was rapidly passaged to yield SHIV-1157ipEL-p, which remained exclusively R5-tropic and had a tier 1 phenotype, in contrast to "late" SHIV-1157ipd3N4 (tier 2. After 5 weekly low-dose intrarectal exposures, SHIV-1157ipEL-p systemically infected 16 out of 17 RM with high peak viral RNA loads and depleted gut CD4+ T cells. SHIV-1157ipEL-p and SHIV-1157ipd3N4 env genes diverge mostly in V1/V2. Molecular modeling revealed a possible mechanism for the increased neutralization resistance of SHIV-1157ipd3N4 Env: V2 loops hindering access to the CD4 binding site, shown experimentally with nAb b12. Similar mutations have been linked to decreased neutralization sensitivity in HIV-C strains isolated from humans over time, indicating parallel HIV-C Env evolution in humans and RM. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: SHIV-1157ipEL-p, the first tier 1 R5 clade C SHIV, and SHIV-1157ipd3N4, its tier 2 counterpart, represent biologically relevant tools for anti-HIV-C vaccine development in primates.

  14. Türk ankilozan spondilitli hastalarda HLA-B27 ve MEFV gen mutasyonları arasındaki ilişki

    OpenAIRE

    SARIKAYA PEKACAR, Filiz

    2015-01-01

    Ankilozan spondilit (AS), patogenezinde bir çok genetik, immunolojik ve çevresel faktörün birlikte rol oynadığı  inflamatuvar bir hastalıktır. Genetik faktörler arasında en büyük pay HLA -B27’nindir. Genom  çapında ilişkilendirme çalışmaları sonucu AS ile ilgili bir çok gen bulunmuş MHC dışı genlerin hastalığın  gelişiminde rol oynadığı düşünülmüştür.
    Bu tez çalışmasında HLA-B27, MEFV gen mutasyonları, IL12B, IL23R ve ERAP1 gen polimorfiz...

  15. Genética, performance física humana e doping genético: o senso comum versus a realidade científica

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Rodrigo Gonçalves Dias

    2011-02-01

    Full Text Available Atletas de elite são reconhecidos como fenômenos esportivos e o potencial para atingir níveis superiores de performance no esporte está parcialmente sob o controle de genes. A excelência atlética é essencialmente multifatorial e determinada por complexas interações entre fatores ambientais e genéticos. Existem aproximadamente 10 milhões de variantes genéticas dispersas por todo o genoma humano e uma parcela destas variantes têm demonstrado influenciar a responsividade ao treinamento físico. Os fenótipos de performance física humana parecem ser altamente poligênicos e alguns estudos têm comprovado a existência de raras combinações genotípicas em atletas. No entanto, os mecanismos pelos quais genes se interagem para amplificar a performance física são desconhecidos. O conhecimento sobre os genes que influenciam a treinabilidade somado ao potencial uso indevido dos avanços da terapia gênica, como a possível introdução de genes em células de atletas, fez surgir o termo doping genético, um novo e censurado método de amplificação da performance física, além dos limites fisiológicos. Aumentos na hipertrofia muscular esquelética e nos níveis de hematócrito estão sendo conseguidos através da manipulação da expressão de genes específicos, mas a grande parte das impressionáveis alterações foi obtida em experimentação com animais de laboratório. A compreensão dos resultados científicos envolvendo genética, performance física humana e doping genético é uma difícil tarefa. Com o propósito de evitar a contínua má interpretação e propagação de conceitos errôneos, esta revisão, intencionalmente, vem discutir as evidências científicas produzidas até o momento sobre o tema, permitindo a compreensão do atual "estado da arte"

  16. Correlaciones fenotípicas, ambientales y genéticas en berenjena

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Hermes Araméndiz Tatis

    2009-10-01

    Full Text Available En el Centro de Investigaciones Turipaná de la Corporación Colombiana de Investigaciones (Corpoica (Cereté, Córdoba, Colombia -8° 31' N y 75° 58' O, a 13 m.s.n.m se estudiaron las correlaciones, ambientales y genéticas entre seis caracteres de 24 cultivares de berenjena (Solanum melongena. Para el efecto se utilizó un diseño de bloques completamente al azar con tres repeticiones y unidades experimentales de 10 m². Los resultados mostraron que las correlaciones fueron de mayor o igual magnitud que las fenotípicas, mientras que las ambientales fueron de escaso valor. El número de frutos y el rendimiento estuvieron genéticamente correlacionados (r = 0.56, P < 0.01, la longitud y la resistencia del fruto mostraron correlación genética negativa (r = -0.68, P < 0.01 y entre el rendimiento y peso de fruto la correlación fue muy baja (r = 0.04. El número de frutos y su peso de frutos se correlacionaron de manera negativa (r =-0.63, P < 0.01. El número de frutos por planta puede ser utilizado como criterio de selección para la obtención de cultivares de berenjena de altos rendimientos.

  17. Towards an International Culture: Gen Y Students and SNS?

    Science.gov (United States)

    Lichy, Jessica

    2012-01-01

    This article reports the findings of a small-scale investigation into the Internet user behaviour of generation Y (Gen Y) students, with particular reference to social networking sites. The study adds to the literature on cross-cultural Internet user behaviour with specific reference to Gen Y and social networking. It compares how a cohort of…

  18. Engenharia Genética: busca da mercadoria perfeita?

    OpenAIRE

    José Neivaldo de Souza

    2014-01-01

    Resenha:Engenharia Genética: busca da mercadoria perfeita? -SANDEL, Michael J. Contra a Perfeição: ética na era da engenharia genética. 1ª.ed. Tradução por Ana Carolina Mesquita. Rio de janeiro: Civilização Brasileira, 2013. 160p. 

  19. Ética y genética

    OpenAIRE

    2002-01-01

    Este documento contiene una transcripción de las ponencias presentadas en la Mesa Redonda sobre Ética y Genética celebrada en Oviedo, el día 10 de octubre de 2001, y organizada por el Real Patronato sobre Discapacidad en el marco del XXI Congreso Nacional de Genética Humana.

  20. Hoja informativa de pruebas genéticas

    Science.gov (United States)

    Trata de pruebas genéticas para riesgos heredados de cáncer; incluye tipos de pruebas, para quién son, explicación y confidencialidad de los resultados. Ofrece información de pruebas genéticas a domicilio o pruebas para el consumidor.

  1. Université de Genève

    CERN Multimedia

    2008-01-01

    Ecole de physique - Département de physique nucléaire et corspusculaire 24, quai Ernest-Ansermet 1211 GENÈVE 4 Tél: (022) 379 62 73 - Fax: (022) 379 69 92 Lundi 1er décembre 2008 PARTICLE PHYSICS SEMINAR at 17.00 hrs – Stückelberg Auditorium Superconducting Interfaces between Insulating Oxide Prof. Jean-Marc TRISCONE / Université de Genève At interfaces between complex oxides, electronic systems with unusual properties can be generated. A striking example is the interface between LaAlO3 and SrTiO3, two good insulating perovskite oxides, which was found in 2004 to be conducting with a high mobility. We recently discovered that the ground state of this system is a superconducting condensate, with a critical temperature of about 200 mK. The characteristics observed for the superconducting transitions are consistent with a two-dimensional superconducting sheet as thin as a few nanometers. Recent field effect experiments revealed the sensitivity of the normal and superconducting states to the carrier d...

  2. Université de Genève

    CERN Multimedia

    2008-01-01

    Ecole de physique - Département de physique nucléaire et corspusculaire 24, quai Ernest-Ansermet - 1211 GENÈVE 4 Tél: (022) 379 62 73 - Fax: (022) 379 69 92 Lundi 1er décembre 2008 PARTICLE PHYSICS SEMINAR at 17.00 hrs – Stückelberg Auditorium Superconducting Interfaces between Insulating Oxide Prof. Jean-Marc TRISCONE / Université de Genève At interfaces between complex oxides, electronic systems with unusual properties can be generated. A striking example is the interface between LaAlO3 and SrTiO3, two good insulating perovskite oxides, which was found in 2004 to be conducting with a high mobility. We recently discovered that the ground state of this system is a superconducting condensate, with a critical temperature of about 200 mK. The characteristics observed for the superconducting transitions are consistent with a two-dimensional superconducting sheet as thin as a few nanometers. Recent field effect experiments revealed the sensitivity of the normal and superconducting states to the carrier ...

  3. Genética de la conservación: la aplicación de los conceptos de la evolución a la conservación de la diversidad biológica

    OpenAIRE

    Caballero Rúa, Armando

    2013-01-01

    La comprensión de las fuerzas de cambio evolutivo que actúan sobre las poblaciones, en conjunción con las técnicas más modernas de análisis genético, lleva aplicándose en los últimos veinte años al servicio de la conservación de la biodiversidad. Esta nueva aplicación de la genética ha recibido el nombre de genética de la conservación.

  4. La figura del autor en el arte genético y transgénico

    OpenAIRE

    Matewecki, Natalia

    2006-01-01

    Las prácticas artísticas contemporáneas redefinen constantemente el estatuto del arte tradicional al tensionar, por ejemplo, los límites entre el arte y la ciencia. El arte genético y el arte transgénico plantean un trabajo multidisciplinario en el que participan artistas y científicos a la vez, dando lugar así a la construcción de nuevas figuras de autor como las de artista-científico, artista-investigador, artista-técnico o científico-artista. La figura de artista se configura, según Dan...

  5. Optimización global con algoritmos genéticos

    OpenAIRE

    Carretero López, Félix

    2010-01-01

    El objetivo principal de este TFC es dar a conocer al lector el mundo de los métodos de optimización global mediante los algoritmos genéticos. Para alcanzar este objetivo empezaremos por exponer las bases teóricas en las que se fundamentan y a continuación las intentaremos corroborar empíricamente mediante un conjunto de pruebas simples. A partir de los resultados y con todo lo aprendido intentaremos resolver un problema real más complejo. En concreto intentaremos equilibrar la carga de las b...

  6. Vizier: un sistema de recomendación genérico y multidimensional

    OpenAIRE

    Carrillo Ramos, Angela Cristina

    2012-01-01

    Los Sistemas de Recomendación, al ser herramientas que puedan ser utilizadas para identificar fácilmente productos de interés, han surgido para apoyar, aumentar y automatizar el proceso natural y diario de compartir recomendaciones, y de esta manera, reducir un espacio de alternativas. Este artículo tiene como objetivo presentar Vizier, un framework construido bajo un enfoque genérico, que proporciona servicios a aplicaciones de recuperación de información para que éstas a su vez, se encuentr...

  7. Thaumetopoea pityocampa i nematodes entomopatògens : un mètode alternatiu de control biològic de la plaga

    OpenAIRE

    Franquet Barrera, Laura; García del Pino, Fernando

    2009-01-01

    L'objectiu principal d'aquesta investigació és determinar la viabilitat dels nematodes entomopatògens per controlar les plagues de Thaumetopoea pityocampa, tenint en compte que presenten tot un seguit de característiques que els fan adequats per al control de diferents plagues d'insectes.

  8. Lamotheoxyuris ackerti n. gen., n. comb. (Nematoda: Heteroxynematidae parasite of Neotoma spp. (Rodentia: Muridae Lamotheoxyuris ackerti n. gen., n. comb. (Nematoda: Heteroxynematidae parásito de Neotoma spp. (Rodentia: Muridae

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    JORGE FALCÓN-ORDAZ

    2010-06-01

    Full Text Available On the basis of the revision of the type material of Aspiculuris ackerti Kruidenier & Mehra, 1959, and new specimens collected from Neotoma nelsoni Goldman, 1905 (Rodentia: Cricetidae, in Veracruz, Mexico, we herein to which A. ackerti is transferred as Lamotheoxyuris ackerti This new genus differs from all other genera included in 1 mouth surrounded by six lips; 2 extension of lateral alae describe a new genus (Lamotheoxyuris n. gen., (Kruidener & Mehra, 1959 n. gen., n. comb. Heteroxynematinae by the following main traits: reduced; and 3 lack of caudal alae.Con base en la revisión del material tipo de Aspiculuris ackerti Kruidenier y Mehra, 1959 y de nuevos ejemplares recolectados en Neotoma nelsoni Goldman, 1905 (Rodentia: Cricetidae, en Veracruz, México, se describe un nuevo género (Lamotheoxyuris n. gen., al que A. ackerti es transferido como Lamotheoxyuris ackerti (Kruidener y Mehra, 1959 n. gen., n. comb. Este nuevo género se distingue de todos los demás géneros incluidos en Heteroxynematinae por las siguientes características: 1 presencia de seis labios rodeando la boca; 2 extensión reducida del ala lateral; y 3 carencia de ala caudal.

  9. NextGen Future Safety Assessment Game

    Science.gov (United States)

    Ancel, Ersin; Gheorghe, Adrian; Jones, Sharon Monica

    2011-01-01

    The successful implementation of the next generation infrastructure systems requires solid understanding of their technical, social, political and economic aspects along with their interactions. The lack of historical data that relate to the long-term planning of complex systems introduces unique challenges for decision makers and involved stakeholders which in turn result in unsustainable systems. Also, the need to understand the infrastructure at the societal level and capture the interaction between multiple stakeholders becomes important. This paper proposes a methodology in order to develop a holistic approach aiming to provide an alternative subject-matter expert (SME) elicitation and data collection method for future sociotechnical systems. The methodology is adapted to Next Generation Air Transportation System (NextGen) decision making environment in order to demonstrate the benefits of this holistic approach.

  10. Polimorfismo genético relacionado con la probabilidad de desarrollar asma ocupacional en trabajadores expuestos a isocianatos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Gaetano Pepe Betancourt

    2014-03-01

    Full Text Available Introducción: El desarrollo tecnológico ha traído como consecuencia el uso de sustancias químicas potencialmente perjudiciales para la salud de los trabajadores. Particularmente el uso de isocianatos ha resultado en una mayor morbilidad de patología respiratoria, especialmente el asma. Considerando que no todos los trabajadores expuestos desarrollan la enfermedad se ha propuesto un modelo de interacción gen-medioambiental, el cual trata de explicar la predisposición genética que tienen algunos individuos a desarrollar asma ocupacional y otros no. Objetivo: Conocer la evidencia científica relacionada con el polimorfismo genético y la susceptibilidad que tienen los trabajadores expuestos a isocianatos a desarrollar asma ocupacional. Metodología: Se realizó una revisión sistemática mediante una búsqueda bibliográfica utilizando las bases de datos PubMedline, así como en los repositorios Dialnet y ELSEVIER. Se extrajeron los artículos relacionados al objetivo de esta revisión, no se aplicaron filtros de temporalidad, utilizándose los siguientes descriptores: MeSH Major Topic, MeSH Terms. El periodo de búsqueda fue desde el 20 de noviembre de 2013 y finalizó el 15 de diciembre de 2013. El nivel de evidencia se estableció de acuerdo a los criterios GRADE. Resultados: Se analizaron a texto completo 42 artículos, la evidencia científica se sustentó en 11 estudios de casos-controles. Dada la complejidad del polimorfismo genético asociado con la expresión fenotípica de la enfermedad, como limitación de los estudios, los autores coinciden que el tamaño muestral no es suficientemente grande, sin embargo después de ajustar los factores de confusión los artículos encontrados tuvieron un nivel de evidencia B de GRADE. Conclusión: La genética tiene una influencia significativa en el asma ocupacional inducida por isocianatos. El peso de la susceptibilidad genética y de la interacción gen-medioambiente aún no se han

  11. The GenDev Curriculum Development Workshop.

    Science.gov (United States)

    D'cunha, J

    1997-01-01

    This article describes the second Curriculum Development Workshop held in May 1997 at the Asian Institute of Technology (AIT) in Bangkok, Thailand. The workshop aimed to review critically and restructure the Gender and Development Studies (GenDev) curriculum and to assess AIT's role in training gender experts for the region. Participants included 22 people from 16 countries in Asia, Europe, and the US who were teaching graduate students about gender issues and who were activists with nongovernmental organizations working on gender issues. It was determined that the following were required courses: Culture, Knowledge and Gender Relations; Gender, Technology, and Development; Principles of Gender Research and Methodology in Science and Technology; and Gender Analysis and Field Methods. Other suggested core courses included: Gender and Natural Resource Management; Enterprise Management, Technology, and Gender; Gender and Agrarian Reform; Urbanization: A Gender Perspective; Gender-Responsive Development Planning; and Gender and Economic Change: Past and Present Concerns. Participants distinguished between GenDev courses offered to anyone attending AIT and training courses designed to produce gender experts in the region. The aim of training courses for AIT graduate students was to sensitize potential managers, technologists, and others on gender issues and to create awareness of the importance of including gender perspectives within decision-making, policy formation, and implementation. Training courses to produce gender experts should be directed to those with a prior background in gender studies and include gender analysis in field methods. Participants agreed that there should be an independent and autonomous field of gender and development studies. Participants made six recommendations for such a field of study. PMID:12179927

  12. ALS - resources

    Science.gov (United States)

    Resources - ALS ... The following organizations are good resources for information on amyotrophic lateral sclerosis : Muscular Dystrophy Association -- mda.org/disease/amyotrophic-lateral-sclerosis National Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) Registry -- ...

  13. From genetic neighbourhood to local community: Estimating a key parameter of the Unified Neutral Theory of Biodiversity A partir del vecindario genético al vecindario de comunidad: Estimación de un parámetro clave de la Teoría Neutral Unificada de la biodiversidad

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    BARRY J RICHARDSON

    2011-12-01

    la Teoría Neutral Unificada. Avances en el campo de la Teoría neutral de la Genética permiten calcular el tamaño de un vecindario genético en el contexto de aislamiento a través de procesos de distancia, lo cual sugiere una manera de estimar los tamaños equivalentes de una comunidad local (el vecindario de la comunidad ecológica. Ellos se deriva estimando valores de autocorrelación espacial a la distancia geográfica cero, lo cual se obtiene usando la distribución de frecuencias relativas de las especies de las muestras de campos, separadas por distintas distancias geográficas. Para demostrar los métodos propuestos, consistentes muestras de coleópteros fueron colectadas con la fumigación de 52 árboles en bosques de Nothofagus y 24 árboles en bosques de Araucaria, los cuales estaban ampliamente distribuidos en el centro sur de Chile. También se obtuvo un set de datos de 62000 coleópteros para otros propósitos. El tamaño efectivo estimado de las comunidades de coleópteros locales para cada tipo de bosque es alrededor de 12000 individuos para depredadores y 30000 individuos para fitófago/xilófagos. Por otra parte, la extensión geográfica de la comunidad de un barrio puede ser utilizados de otras maneras. En primer lugar, porque se relaciona con la distancia recorrida entre el nacimiento y la crianza, lo que proporciona información sobre los procesos de la comunidad a escala geográfica; entrega medidas de escalas donde la recolonización rápida es posible y escalas en las cuales las sobre que barreras no son fáciles de pasar en un hábitat. En segundo lugar, las réplicas de muestras geográficamente separadas por el tamaño de la comunidad de un barrio, no son independientes, representando pseudoréplicas de la metacomunidad característica.

  14. Sobre el significado del descubrimiento del gen FOXP2

    OpenAIRE

    Víctor Manuel LONGA MARTÍNEZ

    2006-01-01

    El reciente descubrimiento del gen FOXP2 ha ofrecido la primera evidencia clara de la base genética del lenguaje, mostrando una correlación inequívoca desde la perspectiva genética entre una versión mutada de F0XP2 y los trastornos lingüísticos de diferente tipo sufridos por una familia inglesa, conocida como KE. El objetivo central del presente trabajo es discutir diferentes aspectos relacionados con tal descubrimiento; especialmente, la discusión del significado de FOXP2 con ...

  15. Estudio de bloques constructivos en algoritmos genéticos

    OpenAIRE

    Murias Rodríguez, Angel

    2007-01-01

    Estudio experimental sobre el efecto de las modificaciones en los bloques constructivos. Para conseguirlo, primero se ha diseñado un algoritmo genético genérico con posibilidad de adaptarlo a un problema específico (función de objetivo a optimizar) e incorporar fácilmente diferentes características que pueden tener estos algoritmos. Como referencia de comparación se ha diseñado y implementado un algoritmo genético estándar y los algoritmos con las modificaciones. Se han probado los algorit...

  16. Las exploraciones oceánicas españolas del siglo XVIII y los envíos de plantas y animales desde América

    OpenAIRE

    Pablo Núñez, Luis

    2015-01-01

    Las exploraciones oceánicas españolas del siglo XVIII y los envíos de plantas y animales desde América", en: De Beni, Matteo (ed.): De los descubrimientos a las taxonomías: La botánica y la zoología en la lengua española del Renacimiento a la Ilustración. Mantova: Universitas Studiorum (Pliegos Hispánicos. Serie Intersecciones; 1), pp. 229-260. ISBN 978-88-97683-88-9.

  17. Preparation and identification of Env-pseudotyped subtype B HIV-1%HIV-1 B亚型假病毒的制备与鉴定

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    王茂鹏; 李昌; 杜寿文; 朱羿龙; 朱娜; 孙丹丹; 金宁一

    2014-01-01

    目的:制备携带增强绿色荧光蛋白( EGFP)基因和ENV包膜蛋白的HIV-1 B亚型假病毒用于感染研究,并建立可行的鉴定方法。方法双质粒共转染HEK293 T细胞后收获病毒上清, TRIzol法提取病毒基因组并采用RT-PCR进行报告基因扩增,Western印迹和ELISA法检测病毒P24抗原。假病毒感染HIV-1允许细胞,进行报告基因检测、病毒滴度测定以及单轮感染活性实验研究。结果与结论建立了HIV-1假病毒制备与鉴定方法,制备获得了B型HIV-1假病毒,经鉴定具备感染SupT1和TZM-bl细胞能力,为HIV-1与宿主细胞相互作用研究奠定了基础。%Objective To prepare the Env-pseudotyped subtype B HIV-1 with enhanced green fluorescent protein ( EG-FP) gene,explore HIV-1 infection mechanisms and develop feasible methods of identification .Methods The Env-pseudo-typed viruses were packaged in HEK293T cells by cotransfection, and the reporter gene and P24 protein were detected by PCR, Western blot and ELISA .Reporter gene amplification , viral titration assay and a single round of infection assay were performed after the env-pseudotyped viruses infected HIV-1 permissive cell .Results and Conclusion A generation and identification method of the pseudotyped HIV-1 was established . The Env-pseudotyped subtype B HIV-1 has been prepared, which is able to infect SupT1 and TZM-bl cells through infection assay .

  18. Estimación de componentes de varianza genética con cruzas autofecundadas de progenitores no endogámicos.

    OpenAIRE

    Jaime Sahagún Castellanos

    2003-01-01

    En el fitomejoramiento genético, la estimación de componentes de la varianza genética frecuentemente requiere hacer cruzas, tarea que se complica por la reducida producción de semilla para evaluación. Para incrementar la cantidad de semilla se ha sugerido el uso de cruzas autofecundadas (CA), pero la teoría de este enfoque se ha restringido al caso, muy limitado, de progenitores homocigóticos con un modelo de dos alelos. Aquí se pretende, para poblaciones panmícticas con multialelismo: 1) Der...

  19. Clonación artificial de un controlador on-line, basado en lógica difusa y algoritmos genéticos

    OpenAIRE

    Javier Ballesteros; Alonso Guevara

    2006-01-01

    Los Algoritmos Genéticos son procedimientos adaptativos para la búsqueda de soluciones en espacios complejos, inspirados en la evolución biológica, con patrones de operaciones basados en el principio darwiniano de reproducción y supervivencia de los individuos que mejor se adaptan al entorno en que viven. En este artículo se presenta un estudio sobre los Algoritmos Genéticos y la Lógica Difusa, para desarrollar una metodología propuesta y replicar la caja negra de un controlador, utilizando p...

  20. Diversidad y estructura genética de accesiones de palma de aceite (Elaeis guineesis Jacq.) provenientes de Camerún

    OpenAIRE

    Jose Estiben Pacheco Diaz; Diana Marcela Arias Moreno; Zaida Zarely Ojeda Perez; Hernán Mauricio Romero Angulo

    2014-01-01

    Título en español: Diversidad y estructura genética de accesiones de palma de aceite (Elaeis guineesis Jacq.) provenientes de CamerúnTítulo en ingles: Diversity and genetic structure of oil palm accession (Elaeis guineesis Jacq.)  from CameroonTítulo corto: Diversidad genética de accesiones de palma de aceiteResumen: La palma de aceite Elaeis guineesis Jacq. posee gran importancia debido al aceite que se extrae de sus frutos, del cual se obtienen derivados refinados de gran valor comercial co...

  1. Evaluación del polimorfismo del gen leptina en bovinos en el sistema doble proposito en Chiapas, México.

    OpenAIRE

    Ortiz Salazar, Jorge Alberto

    2011-01-01

    La leptina es una hormona proteica de 16 KDa, compuesta de 146 aminoácidos y es sintetizada principalmente por el tejido adiposo. En el eje hipotálamo-hipófisisgonadal, la leptina juega un papel muy importante en la regulación de la reproducción de los mamíferos. La mutación del gen leptina TT está asociado con la calidad de la carne y leche en bovinos. El objetivo de este estudio fue estimar las frecuencias genotípicas y alélicas del polimorfismo (SNP, Single Nucleotide Polymorphism) del gen...

  2. Uso de algoritmos genéticos para detección de objetos en tiempo real

    OpenAIRE

    Martínez Gómez, Jesús; Gómez Martín, José Antonio; García Varea, Ismael; Matellán Olivera, Vicente

    2009-01-01

    El artículo presenta un sistema de Visión para la detección de objetos mediante el uso de algoritmos genéticos. La principal aportación del mismo consiste en la adaptación al tiempo real de algoritmos generalmente utilizados offline. Para conseguir esto se necesita una ejecución eficiente que reduzca al máximo la complejidad del algoritmo. El ámbito de aplicación del sistema es el campeonato de fútbol robótico RoboCup, en concreto la categoría Standard Platform, y debe permi...

  3. Intención de compra de medicamentos genéricos por parte de los usuarios de Asturias

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Santiago González Hernando

    2003-01-01

    Full Text Available Fundamento: Conocer las percepciones de los consumidores acerca del riesgo asociado al uso de medicamentos genéricos y los factores que más influyen en la intención de solicitar un genérico al médico (prescriptor y/o al farmacéutico, a fin de determinar posibles barreras o frenos a la aceptación de los mismos y obtener información que apoye la toma de decisiones de los gestores sanitarios. Métodos: Estudio sobre utilización de medicamentos centrado en la disposición de los pacientes a solicitar una EFG. En esta investigación transversal cuantitativa se entrevistó personalmente a 542 individuos, a la salida de un centro de salud o de un establecimiento de farmacia en Asturias. En el cuestionario se incluía una escala de medición del riesgo percibido en la compra de un medicamento con 15 atributos agrupados en cinco dimensiones. Asimismo se recogió información sobre la intención de consumir medicamentos genéricos y sobre las características demográficas y socioeconómicas de los entrevistados. Para el análisis de los resultados se aplicaron un análisis factorial confirmatorio, regresión múltiple y análisis univariable. El tratamiento de los datos se efectuó con los programas estadísticos EQS y SPSS. Resultados:Percepción media del riesgo (escalas de 1 a 7: funcional: 2,75; físico: 2,68; financiero: 2,19; psicológico: 1,99; social: 1,42. Factores influyentes sobre la intención de solicitar genéricos al médico: riesgo psicológico (p=0,000. Sobre la solicitud al farmacéutico: riesgo psicológico (p=0,000 y riesgo social (p=0,020. Conclusiones: Los agentes interesados en el desarrollo en el mercado de las EFG deben mantener sus esfuerzos de comunicación hacia la equiparación de los aspectos funcionales y financieros entre especialidades del fabricante y especialidades genéricas, pero no deben dejar de lado aspectos psicológicos y sociales del comportamiento de compra del consumidor.

  4. Intención de compra de medicamentos genéricos por parte de los usuarios de Asturias

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    González Hernando Santiago

    2003-01-01

    Full Text Available Fundamento: Conocer las percepciones de los consumidores acerca del riesgo asociado al uso de medicamentos genéricos y los factores que más influyen en la intención de solicitar un genérico al médico (prescriptor y/o al farmacéutico, a fin de determinar posibles barreras o frenos a la aceptación de los mismos y obtener información que apoye la toma de decisiones de los gestores sanitarios. Métodos: Estudio sobre utilización de medicamentos centrado en la disposición de los pacientes a solicitar una EFG. En esta investigación transversal cuantitativa se entrevistó personalmente a 542 individuos, a la salida de un centro de salud o de un establecimiento de farmacia en Asturias. En el cuestionario se incluía una escala de medición del riesgo percibido en la compra de un medicamento con 15 atributos agrupados en cinco dimensiones. Asimismo se recogió información sobre la intención de consumir medicamentos genéricos y sobre las características demográficas y socioeconómicas de los entrevistados. Para el análisis de los resultados se aplicaron un análisis factorial confirmatorio, regresión múltiple y análisis univariable. El tratamiento de los datos se efectuó con los programas estadísticos EQS y SPSS. Resultados: Percepción media del riesgo (escalas de 1 a 7: funcional: 2,75; físico: 2,68; financiero: 2,19; psicológico: 1,99; social: 1,42. Factores influyentes sobre la intención de solicitar genéricos al médico: riesgo psicológico (p=0,000. Sobre la solicitud al farmacéutico: riesgo psicológico (p=0,000 y riesgo social (p=0,020. Conclusiones: Los agentes interesados en el desarrollo en el mercado de las EFG deben mantener sus esfuerzos de comunicación hacia la equiparación de los aspectos funcionales y financieros entre especialidades del fabricante y especialidades genéricas, pero no deben dejar de lado aspectos psicológicos y sociales del comportamiento de compra del consumidor.

  5. GenBank blastx search result: AK243655 [KOME

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available putative transcriptional activator; similar to cAMP-receptor (CAP, CRP) protein: PIR Access...ion Number A26049; similar to fnr (nirR) gene product encoded by GenBank Accession Number J01608;

  6. GenBank blastx search result: AK242621 [KOME

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available putative transcriptional activator; similar to cAMP-receptor (CAP, CRP) protein: PIR Access...ion Number A26049; similar to fnr (nirR) gene product encoded by GenBank Accession Number J01608;

  7. GenBank blastx search result: AK062102 [KOME

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available transcriptional activator; similar to cAMP-receptor (CAP, CRP) protein: PIR Access...ion Number A26049; similar to fnr (nirR) gene product encoded by GenBank Accession Number J01608; aspartic

  8. Desempenho de genótipos de batata-doce submetidos ao efeito da calagem em Rio Largo-Alagoas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Islan Diego Espindula de Carvalho

    2015-09-01

    Full Text Available O objetivo desse trabalho foi avaliar o desempenho de genótipos de batata-doce submetidos ao efeito da calagem em Rio Largo-AL. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados no esquema fatorial (7 x 2,  com sete genótipos de batata-doce e dois tipos de correção do solo, em três repetições. As variáveis avaliadas foram: Número de Raízes Comerciais (NRC; Número Total de Raízes (NTR; Comprimento de Raízes Comerciais (CRC; Diâmetro de Raízes Comerciais (DRC; Rendimento de Raízes Comerciais (RRC; Rendimento Total de Raízes (RTR e Peso Médio de Raízes Comerciais (PMRC. Dentre os genótipos de batata-doce avaliados no experimento, o Clone-06 apresentou o melhor desempenho, superando todos os genótipos avaliados, inclusive as testemunhas, Rainha de Penedo e Sergipana, tanto em produtividade, com rendimento médio de 15,79 t.ha-1de raízes comerciais, quanto em qualidade, apresentando dimensões de raízes comerciais dentro dos padrões de comercialização como Extra A. O desempenho dos genótipos, bem como a grande maioria das variáveis de batata-doce não foram influenciadas pela correção do solo.

  9. Clonación artificial de un controlador on-line, basado en lógica difusa y algoritmos genéticos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Javier Ballesteros

    2006-10-01

    Full Text Available Los Algoritmos Genéticos son procedimientos adaptativos para la búsqueda de soluciones en espacios complejos, inspirados en la evolución biológica, con patrones de operaciones basados en el principio darwiniano de reproducción y supervivencia de los individuos que mejor se adaptan al entorno en que viven. En este artículo se presenta un estudio sobre los Algoritmos Genéticos y la Lógica Difusa, para desarrollar una metodología propuesta y replicar la caja negra de un controlador, utilizando procedimientos de obtención del conjunto de reglas de inferencia, agrupamiento difuso y después aplicar el desarrollo del algoritmo genético simple con algunas alteraciones, buscando el objetivo del trabajo propuesto.

  10. Intercompartmental Recombination of HIV-1 Contributes to env Intrahost Diversity and Modulates Viral Tropism and Sensitivity to Entry Inhibitors▿†‡

    Science.gov (United States)

    Brown, Richard J. P.; Peters, Paul J.; Caron, Catherine; Gonzalez-Perez, Maria Paz; Stones, Leanne; Ankghuambom, Chiambah; Pondei, Kemebradikumo; McClure, C. Patrick; Alemnji, George; Taylor, Stephen; Sharp, Paul M.; Clapham, Paul R.; Ball, Jonathan K.

    2011-01-01

    HIV-1 circulates within an infected host as a genetically heterogeneous viral population. Viral intrahost diversity is shaped by substitutional evolution and recombination. Although many studies have speculated that recombination could have a significant impact on viral phenotype, this has never been definitively demonstrated. We report here phylogenetic and subsequent phenotypic analyses of envelope genes obtained from HIV-1 populations present in different anatomical compartments. Assessment of env compartmentalization from immunologically discrete tissues was assessed utilizing a single genome amplification approach, minimizing in vitro-generated artifacts. Genetic compartmentalization of variants was frequently observed. In addition, multiple incidences of intercompartment recombination, presumably facilitated by low-level migration of virus or infected cells between different anatomic sites and coinfection of susceptible cells by genetically divergent strains, were identified. These analyses demonstrate that intercompartment recombination is a fundamental evolutionary mechanism that helps to shape HIV-1 env intrahost diversity in natural infection. Analysis of the phenotypic consequences of these recombination events showed that genetic compartmentalization often correlates with phenotypic compartmentalization and that intercompartment recombination results in phenotype modulation. This represents definitive proof that recombination can generate novel combinations of phenotypic traits which differ subtly from those of parental strains, an important phenomenon that may have an impact on antiviral therapy and contribute to HIV-1 persistence in vivo. PMID:21471230

  11. Environmental impacts of consumers' choice of food products and housing. Final report of the ConsEnv project; Aterioiden ja asumisen valinnat kulutuksen ympaeristoevaikutusten ytimessae. ConsEnv-hankkeen loppuraportti

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Saarinen, M.; Kurppa, S.; Nissinen, A.; Maekelae, J. (eds.)

    2011-06-15

    In the ConsEnv project, climate and eutrophication impacts of food consumption were assessed, and different everyday means of mitigating climate impacts of housing were studied. The life-cycle models that were used for the production of primary raw materials corresponded to average Finnish production, with the exception of imported food products, for which LCA-based specific data from the literature were used. When assessing environmental impacts of the food industry and food commerce, the study evaluated data received from specific companies (Saarioinen, HK Ruokatalo, Fazer Bakeries, Raisio and Ruokakesko). The models used for school meals were based on data received from the kitchen supplying food to the school involved in the study (Kauriala, Haemeenlinna). The impact assessments of consumers' own behaviour, that is, purchasing of food, and food storage and preparation were based on previously published data. When estimating electricity and heat consumption in the food chain, the average profile of Finnish energy production was used. According to the results, animal-based meals have a two- to three-fold climate change impact and a four- to fivefold eutrophication impact, compared to vegetarian dishes. The results also show differences between different meat and vegetable meals. In most cases, the main food ingredient of the meal has the greatest environmental impact. For some meals, the proportion of the impact of salad can be as high as one-third of the total. The relatively higher impact of rice in comparison with that of pasta is not decisive, when the total impact of the meal is taken into account. The differences between home-cooked and convenience food are mainly due to different types of raw materials used. The way of cooking and the anticipated benefits of central kitchens are not as dominant as expected in regard to climate change. The main conclusion from the study is that the greatest source of impacts of different types of meals is the

  12. New sequestrate fungi from Guyana: Jimtrappea guyanensis gen. sp. nov., Castellanea pakaraimophila gen. sp. nov., and Costatisporus cyanescens gen. sp. nov. (Boletaceae, Boletales).

    Science.gov (United States)

    Smith, Matthew E; Amses, Kevin R; Elliott, Todd F; Obase, Keisuke; Aime, M Catherine; Henkel, Terry W

    2015-12-01

    Jimtrappea guyanensis gen. sp. nov., Castellanea pakaraimophila gen. sp. nov., and Costatisporus cyanescens gen. sp. nov. are described as new to science. These sequestrate, hypogeous fungi were collected in Guyana under closed canopy tropical forests in association with ectomycorrhizal (ECM) host tree genera Dicymbe (Fabaceae subfam. Caesalpinioideae), Aldina (Fabaceae subfam. Papilionoideae), and Pakaraimaea (Dipterocarpaceae). Molecular data place these fungi in Boletaceae (Boletales, Agaricomycetes, Basidiomycota) and inform their relationships to other known epigeous and sequestrate taxa within that family. Macro- and micromorphological characters, habitat, and multi-locus DNA sequence data are provided for each new taxon. Unique morphological features and a molecular phylogenetic analysis of 185 taxa across the order Boletales justify the recognition of the three new genera. PMID:26732137

  13. Banque Cantonale de Genève

    CERN Multimedia

    Banque Cantonale de Genève

    2011-01-01

    7e Salon Immobilier BCGE le samedi 3 septembre 2011, de 8 h 30 à 13 h 00, au Centre de formation de Conches À cette occasion, les meilleurs spécialistes professionnels genevois de l’immobilier seront réunis en un seul et même lieu. Si vous le souhaitez, un conseiller spécialisé dans les financements hypothécaires évaluera vos possibilités d’investissement immobilier adaptées à votre situation personnelle. En parallèle, les plus importantes régies immobilières de Genève seront à votre disposition pour vous présenter leurs offres actuelles, ainsi que les projets immobiliers futurs et discuter avec vous de la meilleure stratégie à adopter pour trouver l’objet de vos rêves. De plus, vous aurez la possibilité...

  14. 生防荧光假单胞菌2 P24中EnvZ/OmpR双因子系统克隆与OmpR原核表达%Cloning of EnvZ/OmpR Two-component System from Pseudomonas fluorescens 2 P24 and Prokaryotic Expression of OmpR

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    孙冰冰; 张伟; 段红英; 李伟; 田涛; 张力群

    2014-01-01

    用Mini-Tn5转座子随机突变荧光假单胞菌野生型菌株2P24,得到抗生素2,4二乙酰基间苯三酚(2,4-di-acetylphloroglucinol,2,4-DAPG)产量提高的突变体Sesu-25。对转座子侧翼序列分析表明,转座子插入到EnvZ/OmpR双因子系统的反应调节因子ompR基因。克隆得到包含完整EnvZ/OmpR系统,全长约为5.9 kb的DNA片段。该双因子系统中的envZ基因和ompR基因与P. fluorescens F113的envZ基因和ompR基因同源性分别为93%和96%。将ompR基因克隆到表达载体pET-22b(+)中,得到重组表达载体pET-ompR。将pET-ompR转入Escherichia coli BL21中得到重组菌株BL21-ompR,用IPTG诱导表达和亲和柱层析法纯化的OmpR蛋白,经SDS-PAGE电泳分析表明ompR基因得到成功表达和纯化。%Using the colour of colony as the selective marker, the random mutagenesis of mini-Tn5 was per-formed to wild-type biocontrol strain Pseudomonas fluorescens 2P24 for the screening of mutants,which might have altered yields of polyketide metabolite 2,4-diacetylphloroglucinol(2,4-DAPG). The strain Sesu-25 with a increased yield of 2,4-DAPG was screened from the mutant pool. The analysis of flank sequence of transposon implied that the response regulator OmpR of EnvZ/OmpR two-component regulatory system ( TCS ) was disrupted in mutant strain Sesu-25. A DNA fragment harbouring a intact EnvZ/OmpR TCS was obtained by subcloning. The envZ and ompR of P. fluorescens 2P24 shared a identity of 93% and 96% with P. fluorescens F113,respectively. The ompR was ligated into the expression vector pET-22b( +) to obtain the recombinated plasmid pET-ompR,and the plasmid pET-ompR was transformed into E. coli BL21 to generate the strain BL21-ompR. The His-taged OmpR was purified by affinity chromatography and verified by SDS-PAGE electrophoresis analysis.

  15. Pré-melhoramento do camucamuzeiro: estudo de parâmetros genéticos e dissimilaridade

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Walnice Maria Oliveira do Nascimento

    2014-08-01

    Full Text Available O camucamuzeiro pertence à família Myrtaceae e é espécie em processo de domesticação, encontrada na forma extrativa, a partir de plantas crescendo naturalmente nas margens dos rios e lagos, ou cultivadas em pequenas áreas de terra firme. As estimativas e a compreensão dos parâmetros genéticos desta espécie são importantes para o conhecimento da estrutura genética das populações e para a inferência da diversidade genética presente, além de proporcionar subsídios para predizer os ganhos genéticos e o possível sucesso no programa de melhoramento dessa cultura. Neste sentido, o objetivo deste trabalho foi estimar parâmetros genéticos e a dissimilaridade genética, em acessos existentes no Banco Ativo de Germoplasma de camucamuzeiro, da Embrapa Amazônia Oriental. Para o estudo, foram analisados 46 progênies, colhidos 40 frutos por planta matriz em completo estádio de maturação (frutos com epicarpo totalmente roxo, sendo avaliados sete caracteres morfoagronômicos: peso de fruto (g, PFR, comprimento de fruto (cm, CFR, diâmetro de fruto (cm, DFR, peso da casca (g, PCS, espessura da casca (cm, ECS, número de sementes (n, NSE, peso de sementes (g, PSE. Por meio do Programa Genes, estimaram-se os componentes de variância, herdabilidade e a variabilidade. A importância relativa de caracteres e dissimilaridades entre as progênies, bem como as correlações genéticas entres os caracteres avaliados também foram estudadas. Verificou-se que há dissimilaridade entre os acessos do BAG de camucamuzeiro e que, por causa das correlações significativas entre as variáveis, podem-se adotar métodos de seleção indireta como ferramenta auxiliar no processo de domesticação e melhoramento desta espécie.

  16. Reflexión bioética sobre el uso de organismos genéticamente modificados

    Science.gov (United States)

    Yunta, Eduardo Rodríguez

    2011-01-01

    El presente artículo reflexiona desde los 4 principios de la bioética el uso comercial de organismos genéticamente modificados. Se cuestiona fundamentalmente la falta de transferencia de tecnología entre el mundo desarrollado y en desarrollo y el que el presente sistema de patentamiento de organismos vivos modificados fomenta intereses comerciales y no da debida importancia al desarrollo sostenible de la agricultura y ganadería en los países en desarrollo, donde más se necesita. Se reflexiona sobre la importancia que tiene evaluar los riesgos antes de introducirse en el mercado organismos genéticamente modificados y la necesidad de regulación en los países. PMID:21927675

  17. Diversidad y diferenciación genética de la yuca ( Manihot esculenta Crantz con marcadores microsatélites en poblaciones de África y Latinoamérica

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Fregene Martin

    2004-12-01

    Full Text Available Se estudió la diversidad y diferenciación genética de 224 accesiones de yuca tradicionalmente cultivadas en Uganda. Adicionalmente, se incluyeron estudios previos de diversidad, 20 materiales de Tanzania, 20 de Ghana, 22 de Nigeria, 20 de Guatemala y 12 accesiones representando la colección núcleo de Latinoamérica, mantenidas en CIAT. Nueve grupos basados en el país de origen fueron creados para estudiar la variación genética dentro y entre países. Usando secuencias simples repetidas (SSR o marcadores microsatélites, la variación en las frecuencias alélicas en 35 loci no ligados sirvió para estimar los parámetros de diversidad y diferenciación genética. Los resultados afirman una divergencia genética entre accesiones africanas y latinoamericanas, y una fuerte diferenciación de algunas accesiones de Guatemala con respecto a los
    otros países. Ellos también muestran una alta diversidad genética dentro de países y una moderada diferenciación entre ellos. En particular Uganda mantiene alta diversidad genética
    dentro Distritos aún después de una reciente epidemia de CMD (cassava mosaic disease pero baja diferenciación entre ellos. Se discuten las posibles fuerzas implicadas en la dinámica de la diversidad genética, la importancia de Guatemala en los programas de mejoramiento de yuca en la búsqueda de grupos con potencial heterótico, el bajo impacto causado por CMD en la constitución genética del cultivo en Uganda y la observación de una distribución continua de la diversidad genética.

  18. Variabilidad genética en cepas de Plasmodium falciparum circulantes en regiones colombianas con riesgo diferente para malaria

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Mauricio Arcos Burgos

    2000-02-01

    grado de variabilidad genética de la población de P. falciparum circulante en estas regiones se utilizarán como marcadores genéticos los genes que codifican para las proteínas superficiales del merozoito 1 y 2 (MSP-1 y MSP-2 y para la proteína rica en glutamato (GLURP. Por medio de una PCR anidada se amplificarán segmentos altamente polimórficos de estos genes; variantes de las familias alélicas de MSP-1 (MAD20, K1 y RO33 y MSP-2 (FC27 e IC se amplificarán en la segunda reacción. Los productos de la PCR se analizarán por electroforesis en geles de agarosa para determinar el número de alelos para cada gen y la presencia de infección multiclonal.

  19. Description of Cellulophaga baltica gen. nov., sp. nov. and Cellulophaga fucicola gen. nov., sp. nov. and reclassification of [Cytophaga] lytica to Cellulophaga lytica gen. nov., comb. nov.

    Science.gov (United States)

    Johansen, J E; Nielsen, P; Sjøholm, C

    1999-07-01

    Phenotypic data indicate that gliding, yellow/orange-pigmented, agar-digesting bacterial strains were members of the Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides (CFB) group. The strains were isolated from the surface of the marine benthic macroalga Fucus serratus L. and the surrounding seawater at three localities in Danish waters. The bacteria were Gram-negative, flexirubin-negative, aerobic, catalase-positive and oxidase-negative and were psychrophilic and halophilic. All strains utilized D-fructose, L-fucose and alpha-ketobutyric acid and degraded alginic acid, carrageenan, starch and autoclaved yeast cells. Amplification with primers specific for repetitive extragenic palindromic elements by PCR divided the strains of this study into two groups. Both groups showed unique PCR amplification patterns compared to reference strains of the CFB group. Phylogenetic analysis of 16S rDNA sequences showed association of these organisms and [Cytophaga] lytica at the genus level. Hybridization of total chromosomal DNA revealed that the new strains and [Cytophaga] lytica ATCC 23178T were clearly distinct from each other and other previously described species of the CFB group. A new genus is described, Cellulophaga gen. nov. comprising two new species, Cellulophaga baltica gen. nov., sp. nov. (NN015840T = LMG 18535T) and Cellulophaga fucicola gen. nov., sp. nov. (NN015860T = LMG 18536T), as well as the emendation of [Cytophaga] lytica to Cellulophaga lytica gen. nov., comb. nov. PMID:10425785

  20. Construction and characterization of a new simian/human immunodeficiency viruses clone carrying an env gene derived from a CRF07_BC strain

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    LI Yue; YANG Gui-bo; CHEN Qi-min; LIU Qiang; MENG Zhe-feng; GENG Yun-qi; QIAO Wen-tao; SHAO Yi-ming

    2009-01-01

    Background The CRF07_BC recombinant strain has been one of the most predominantly circulated HIV-1 strains in China, it is therefore necessary and urgent to develop a relevant animal model to evaluate candidate vaccines targeting HIV-1 CRF07_BC. A highly replication-competent simian/human immunodeficiency viruses (SHIV) construct containing the Chinese CRF07_BC HIV-1 env gene with the ability to infect Chinese rhesus monkeys would serve as an important tool in the development of HIV vaccines. The aim of this study was to examine whether SHIV XJDC6431 with the env fragment from a Chinese HIV-1 isolate virus could infect the human and monkey peripheral blood mononuclear cell (PBMC), establish infection in Chinese rhesus macaque.Methods A SHIV strain was constructed by replacing the rev/env genes of SHIV KB9 with the corresponding fragment derived from the HIV-1 CRF07_BC strain. The infectious activity of the SHIV clones was determined in vitro in PBMCs from both non-human primate animals and humans. Finally, one Chinese rhesus macaques (Macaca mulatto) was infected with one SHIV via intravenous infusion.Results One SHIV clone designated as SHIV XJDC6431, was generated that could infect macaque and human PBMC. The virus produced from this clone also efficiently infected the CCR5-expressing GHOST cell lines, indicating that it uses CCR5 as its coreceptor. Finally, the virus was intravenously inoculated into one Chinese rhesus macaque. Eventually, the animal became infected as shown by the occurrence of viremia within 3 of infection. The viral load reached 10~5 copies of viral RNA per ml of plasma during the acute phase of infection and lasted for 10 weeks post infection. Conclusions We conclude that SHIV XJDC6431 is an R5-tropic chimeric virus, which can establish infection not only in vitro but also in vivo in the Chinese rhesus macaque. Although the animal inoculated with SHIV XJDC6431 became infected without developing a pathologic phenotype, the virus efficiently

  1. Productividad acumulada y su relación genética con características reproductivas en hembras Brahman

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Orlando Duitama C.

    2013-10-01

    Full Text Available Objetivo. Estimar parámetros genéticos para la característica de productividad acumulada (PAC y correlaciones genéticas con edad al primer parto (EPP, intervalo entre el primero y segundo parto (IEP1 y longevidad (LONG. Materiales y métodos. Fueron usados 8584 registros de hembras Brahman, utilizando un modelo animal en análisis multi-característico con el método de máxima verosimilitud restricta, implementado en el software WOMBAT. Los modelos consideraron los efectos fijos de grupo contemporáneo, número de partos, y la covariable peso al destete del primer ternero; el único efecto aleatorio fue el genético aditivo directo. El peso al destete (P240 fue incluido para disminuir el efecto de la selección en la estimación de los componentes de varianza. Resultados. Las estimativas de heredabilidad fueron de 0.3±0.04, 0.11±0.03, 0.07±0.03 y 0.24±0.04 para EPP, IEP1, LONG y PAC respectivamente. Las correlaciones entre PAC y las otras características se presentaron de moderadas a altas y en sentido favorable. Conclusiones. PAC puede ser incluida en los programas de mejoramiento genético para Brahman, y utilizada como criterio de selección por su heredabilidad moderada y correlación genética favorable con las características reproductivas en estudio.

  2. Genetic Analysis of Relative Cell Injury Percentage and Some Yield Contributing Traits in Wheat Under Nomral and Heat Stress Conditions Análisis Genético del Porcentaje Relativo de Daño celular y algún Rasgo que Contribuye al Rendimiento en Trigo bajo Condiciones Normales y de Estrés Térmico

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jehanzeb Farooq

    2011-12-01

    Full Text Available Several wheat genotypes were screened against heat stress. Seven wheat (Triticum aestivum L. cultivars obtained after screening against heat classified as tolerant, moderately tolerant, and susceptible to heat stress, were mated in a complete diallel mating system to study the inheritance pattern of relative cell injury percentage (cell injury % and some yield contributing parameters under normal and heat stress conditions. Significant genotypic differences were found (P Varios genotipos de trigo se discriminaron para estrés térmico. De ellos siete cultivares de trigo (Triticum aestivum L. incluyendo tolerantes, moderadamente tolerantes, y susceptibles a estrés térmico obtenidos después de discriminar con calor se aparearon en un sistema de apareamiento de dialelo completo para estudiar el patrón de heredabilidad del porcentaje de daño celular relativo (daño celular % y algunos parámetros que contribuyen al rendimiento bajo condiciones normales o de estrés térmico. Se encontraron diferencias genotípicas significativas (P < 0.01 para todos los rasgos estudiados bajo ambas condiciones. Pruebas de ajuste revelaron adecuación parcial para rasgos como días a espigadura y días a madurez en ambas condiciones pero mostraron suficiencia completa para área hoja bandera y daño celular % en ambas condiciones. El modelo para producción de grano por planta y biomasa por planta fue completamente suficiente bajo condiciones normales y completamente adecuado en estrés. El componente aditivo de variación genotípica (D fue significativo para todos los rasgos estudiados y más que los componentes de dominancia H1 y H2. Los valores de la proporción de genes con efectos positivos y negativos en los progenitores (H2/4H1 demostraron distribución desigual de genes dominantes en los progenitores para casi todos los rasgos excepto área de hoja bandera, producción de grano, y daño celular % en ambas condiciones. Se encontraron estimaciones

  3. Diversidad genética y filogenia molecular de poblaciones de Mauritia flexuosa L.f. “aguaje” de la Amazonía Peruana

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jorge Angulo-Quintanilla

    2014-07-01

    Full Text Available Mauritia flexuosa es una especie vegetal amazónica que forma extensas poblaciones denominadas “aguajales”. Como los pobladores amazónicos emplean varios órganos de M. flexuosa para suplir sus necesidades y con fines comerciales, se está ejerciendo un gran impacto negativo sobre esta especie. A pesar de ello, a la fecha no se conoce la diversidad genética de esta especie en la Amazonía peruana. Consecuentemente, los planes de manejo para la especie serían limitados sin este tipo de información. Por tanto, el objetivo de esta investigación fue determinar la diversidad genética y filogenia molecular de poblaciones de M. flexuosa aledañas a la carretera Iquitos-Nauta. Las hojas se colectaron en seis zonas contiguas a la carretera Iquitos–Nauta. El ADN purificado con protocolos estándares fue amplificado mediante la técnica de ADN Polimórfico Amplificado al Azar (RAPD con dos cebadores aleatorios.  En total se generaron 28 amplicones RAPD (26 polimórficos y 2 monomórficos. Dentro de los aguajales la diversidad genética fue tres veces mayor (75±19 % que la diversidad genética entre las seis poblaciones de M. flexuosa (25±19 %. La diferenciación genética entre las poblaciones varió de 0,0 a 0,6. Los aguajales que se agruparon en clados en el dendrograma por su mayor similitud genética tuvieron proximidad geográfica. La similitud genética entre las poblaciones de M. flexuosa depende de la distancia geográfica, de tal manera que las poblaciones con más similitud genética están más próximas entre sí que las que tienen menos similitud genética.

  4. Diversidad genética de la población colombiana de ganado Cebú Brahman Americano Bos Indicus (Bovidae

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Novoa Bravo Miguel Adriano

    2006-12-01

    Full Text Available La raza Cebú Brahman Americano se encuentra en Colombia alrededor de 100 años. Todo ese tiempo, esta raza ha estado bajo un proceso continuo de selección artificial dirigida, reproducción endogámica, efectos de deriva genética causados por eventos fundadores, migraciones de ejemplares entre las fincas del país y animales importados desde otros países. Estos hechos hacen a esta raza interesante y particular desde el punto de vista de la genética de poblaciones. El objetivo de este trabajo es estudiar la estructura y diversidad genética de la raza Cebú Brahman americano. Se utilizaron 162 animales registrados en la asociación colombiana de criadores de ganado cebú (ASOCEBU de 20 departamentos de Colombia. La genotipificación de los animales se llevó a cabo con el kit StockMarks® for cattle bovine genotyping de Applied Biosystems®, empleando 10 microsatélites dinucleótidos. Los resultados de los distintos análisis multivariados (Análisis de componentes principales y análisis de correspondencias múltiples, de inferencia bayesiana y distancias genéticas interindividuales, demuestran que no se presenta subestructura en la población, lo cual se explica por una alta tasa de migración de animales entre las diferentes fincas y regiones, que homogeniza las frecuencias en todo el país. Además, esta población posee un alto grado de heterocigocidad y diversidad alélica, comparado con otras razas, lo cual refleja su origen de mezcla multiracial. También se encontraron diferencias genéticas entre sexos, lo cual es causado por un proceso reproductivo diferencial, donde actúan diferentes criterios de selección entre sexos. Finalmente, al realizar un análisis de componentes principales para analizar las relaciones genéticas de Cebú Brahman americano colombiano con las razas cebuinas y taurinas, se determinó que esta raza se diferencia genéticamente de las demás razas cebuinas, debido a un aporte genético de razas taurinas

  5. Bases genéticas del dolor Genetic foundations of pain

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    P. Armero

    2004-11-01

    Full Text Available La percepción de la sensación dolorosa es un proceso complejo en el que intervienen mútiples procesos bioquímicos bien conocidos junto con otros de integración cortical desconocidos hasta el momento. La existencia de diferencias individuales en la respuesta al estímulo doloroso es una observación bien conocida que sugiere qué factores genéticos pueden estar implicados en la modulación de la respuesta a estímulos dolorosos. Existen dos aproximaciones experimentales para estudiar la implicación del genotipo en la respuesta al estímulo doloroso, los estudios de ligamiento y los estudios de asociación. Hasta el momento los estudios de ligamiento han permitido asociar mutaciones en el gen TRKA con el síndrome de insensibilidad congénita al dolor con anhidrosis (CIPA y el gen CACNL1A4 y la migraña hemipléjica familiar (FHM. Los estudios de asociación son escasos y se han centrado principalmente en el estudio de pacientes con migraña. En este trabajo revisamos los estudios llevados a cabo hasta el momento en diferentes laboratorios y planteamos nuevas perspectivas de futuro.Perception of pain is a complex process which implies multiple biochemical pathways together with unknown processes of cortical integration. The existence of individual differences in the response to painful stimuli suggests that genetic factors can be involved in its modulation. Two different experimental approaches have been developed to study the implication of genotype in the response to pain: linkage studies and the association studies. Up to now linkage studies have allowed the association of TRKA gene mutations with the syndrome of congenital insensitivity to pain with anhidrosis (CIPA and CACNL1A4 gene mutations with the familial hemiplegic migraine (FHM. Few association studies have been performed until now, and have been focused on the study of patients with migraine. Here we review the studies carried out up to now in different laboratories and suggest

  6. Estudio de bioequivalencia del ibuprofeno genérico 400mg tabletas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ofelia Villalva-Rojas

    2007-10-01

    Full Text Available Objetivo. Determinar la biodisponibilidad de dos formulaciones de ibuprofeno 400mg tabletas, para establecer si el medicamento multifuente (genérico es bioequivalente al de referencia (Motrin® 400mg. Materiales y métodos. Se diseñó un estudio abierto, randomizado, cruzado, dos periodos, con siete días de lavado, con 12 voluntarios sanos de ambos sexos, entre 21 y 48 años, quienes ingirieron una tableta del medicamento genérico o de referencia, según randomización, con 200mL de agua. Luego de ingerir el medicamento se colectó 4mL de sangre por voluntario para la cuantificación plasmática de ibuprofeno. Las muestras de plasma se analizaron por cromatografía líquida acoplada al espectrofotómetro de masas (LC-MS/MS con ionización electrospray ión negativo, aplicando monitoreo de reacción selectiva. La bioequivalencia se determinó con los parámetros farmacocinéticos de área bajo la curva AUC(0-t, AUC(0-∞ y concentración máxima (Cmax. Resultados. Según análisis estadístico, se encontraron: AUCmultifuente(0-t = 86,85 (μg*h/ mL, AUCRef.(0-t= 81,20 (μg*h/mL, AUCmultifuente(0-∞= 88,67 (μg*h/mL, AUCRef.(0-∞= 82,83(μg*h/mL, Cmαxmultifuente = 17,70 ug/mL, CmαxRef. =18,09 μg/mL, con rango de 0,93-1,24 para AUC(0-t, 0,93-1,24 para AUC(0-∞ y 0,81-1,19 para Cmax. Conclusión. Los valores encontrados de ibuprofeno están dentro de los requisitos de la OMS y la FDA, para establecer bioequivalencia (0,80-1,25, demostrándose que el ibuprofeno genérico es bioequivalente al de referencia en velocidad y cantidad de ibuprofeno absorbido en el organismo.

  7. Aspectos genético-quantitativos da qualidade da carne em frangos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Gaya Leila de Genova

    2006-01-01

    Full Text Available O estudo dos parâmetros genéticos das características de qualidade de carne de aves permite à industria avícola se adequar às exigências da indústria processadora, aumentando sua eficiência, e melhorando a aceitação da carne de frango pelo mercado consumidor. Além disso, por meio do estudo destes parâmetros, valiosas informações sobre a caracterização do fenômeno denominado PSE, que representa a carne pálida, flácida e exsudativa, podem ser obtidas, uma vez que são escassos os estudos a esse respeito em frangos. O conhecimento do comportamento genético e da relação entre os atributos da carne e outras características de interesse em frangos de corte pode favorecer o estabelecimento mais preciso e adequado das estratégias utilizadas nos programas de seleção.

  8. ANALISIS GEN HAEMAGGLUTININ PADA VIRUS CAMPAK LIAR

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Subangkit Subangkit

    2015-05-01

    Full Text Available AbstrakPenyakit Campak disebabkan oleh virus campak yang termasuk genus Morbilivirus dan Family Paramyxoviridae. Penyakit campak masih menjadi masalah kesehatan karena masih ditemukan Kejadian Luar Biasa (KLB di Indonesia. Salah satu penyebab terjadinya KLB tersebut diduga sebagaiakibat perbedaan antigenesitas antara strain vaksin yang digunakan dengan strain virus campak liar yang beredar di Indonesia. Penelitian ini bertujuan mendapatkan gambaran tentang karakteristik genetik gen Haemagglutinin virus campak liar yang ada di Indonesia. Spesimen yang digunakan sebanyak 27 isolat virus penyebab KLB dari 17 propinsi selama periode tahun 2003-2010. Isolat virus dilakukan pemeriksaan secara RT-PCR dan sekuensing dengan metode Sanger. Hasil sekuensing dianalisis dengan menggunakan perangkat lunak Bioedit 7.0 dan MEGA 4.0. Hasil penelitian didapatkan perbedaan 10 asam amino antara virus campak strain vaksin CAM-70 dan virus campak liar pada posisi D416N; K424T; V451M; N455T; V466I; I473T; F476L; Y481S atau Y481N; H495N; G505D. Kesimpulan penelitian ini adalah terdapat perbedaan karakteristik genetik antara virus campak liar di Indonesia berbeda dengan strain virus vaksin CAM-70.Kata kunci : Campak, Analisis Molekuler, Hemagglutinin, CD46AbstractMeasles is caused by virus belonging to the genus Morbilivirus and Family Paramyxoviridae. Measles is still a public health problem because outbreak of measles still found in Indonesia. Outbreak is suspected as a result of differences in antigenicity between vaccine strains used with wild-type measles virus strains circulating in Indonesia. This study aims to get genetic characteristics of wild-type measles virus haemagglutinin gene in Indonesia. The specimens were used 27 viral isolates from 17 provinces period 2003-2010. Viral isolates examined by RT-PCR and sequencing with Sanger method. Sequencing analysis were conducted using Bioedit 7.0 and MEGA 4.0 software. The results showed 10 amino acid differences

  9. Linfohistiocitosis hemofagocítica, el espectro desde la enfermedad genética al síndrome de activación macrofágica Hemophagocityc Lymphohistiocytosis: A Spectrum from the Genetic Disorder to the Macrophage Activation Syndrome

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Oscar Porras

    2011-06-01

    Full Text Available El compromiso de la regulación de la inflamación produce activación excesiva y expansión de macrófagos y linfocitos T que desencadenan una reacción inflamatoria severa, sin vías naturales de control. Los trastornos hemofagocíticos son la traducción clínica de este proceso inflamatorio. La linfohistiocitosis hemofagocítica se refiere a todas las variantes de esta patología, y el síndrome de activación macrofágica, a la variante asociada con enfermedad autoinmune. Los casos primarios se asocian con la forma familiar autosómica recesiva y los secundarios con inmunodeficiencias primarias, infección, malignidad y enfermedades autoinmunes. El principal distintivo de este grupo de patologías es la proliferación agresiva de macrófagos e histiocitos que fagocitan otras células sanguíneas. La reducción en la actividad de las células NK produce un aumento en la activación y expansión de linfocitos T, los cuales producen grandes cantidades de citoquinas. Las citoquinas inducen activación de macrófagos y células dendríticas, infiltración tisular y producción de interleuquinas, lo que genera una reacción inflamatoria severa, responsable del daño tisular y de las manifestaciones clínicas. El curso clínico se caracteriza principalmente por fiebre prolongada, hepatoesplenomegalia y citopenias. Los estudios de laboratorio muestran aumento de ferritina, triglicéridos e hipofibrinogenemia. La hemofagocitosis en médula ósea está presente en más del 80% de los casos al diagnóstico. El tratamiento está dirigido contra el linfocito T y los histiocitos hiperactivados, combinando quimioterapia con inmunosupresores y, en algunos casos, trasplante de células madre hematopoyéticas. Este tratamiento ha producido un cambio en la sobrevida de los pacientes. El protocolo de tratamiento HLH-2004 es una guía que estandariza el tratamiento, combinando etopósido, dexametazona y ciclosporina A. En Costa Rica se han reportado 60 casos en

  10. HIV-specific humoral and cellular immunity in rabbits vaccinated with recombinant human immunodeficiency virus-like gag-env particles

    International Nuclear Information System (INIS)

    Recombinant human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1)-like gag-env particles produced in mammalian cells were inoculated into two New Zealand white rabbits. In parallel, two control rabbits were inoculated with the homologous HIV-1 virions inactivated by ultraviolet light (uv) and psoralen treatments. The humoral and cellular immune responses to HIV-1 were evaluated for both groups of animals. Recombinant particles elicited humoral immunity that was specific for all the viral structural proteins. The antibodies recognized both denatured and nondenatured proteins. Moreover, the sera neutralized the in vitro infectivity of the homologous virus in CEM cells. Importantly, the recombinant particles also generated a T helper response by priming with the HIV proteins. Similar results were observed with inactivated virus immunization. Therefore, the authors results suggest that the recombinant HIV-like particles elicit functional humoral immunity as well as cellular immunity and represent a novel vaccine candidate for AIDS

  11. Diversidad genética, entre y dentro de los mayores grupos humanos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Barbujani, G.

    2003-01-01

    Full Text Available Varios estudios están de acuerdo cuando reportan que cerca del 85% de la diversidad del ADN autosomal y de los loci de las proteínas se debe a diferencias entre individuos dentro de la misma población, mientras que las diferencias entre los grupos de diferentes continentes son responsables de solamente 10% de la variación genética total. Estos resultados están en conflicto con nociones populares de razas humanas claramente distintas y relativamente homogéneas, y nos hacen cuestionar la utilidad de clasificaciones étnicas en diagnósticos médicos, en el campo forense y en genética farmacológica. Nuevos datos obtenidos de inserciones polimórficas de Alu y del cromosoma Y confirman los resultados previos, aunque indican una diversidad mayor en algunos (pero no todos los loci del cromosoma Y. Estos datos nos permiten investigar dos preguntas: (1 si las diferencias continentales, aunque pequeñas, son suficientemente grandes como para asignar a individuos a sus continentes basados en sus genotipos; (2 si los genotipos observados se agrupan en grupos de población o continentales cuando el origen de la muestra se ignora. Usando varios métodos estadísticos, veremos que los errores de clasificación son por lo menos de un 30% para los polimorfismos autosomales bi-alélicos, y de un 27% para el cromosoma Y. Cuatro series de datos genéticos de todo el mundo sugieren la existencia de grupos de genotipos diferentes, pero que éstos cuatro grupos no coinciden el uno con el otro. Adicionalmente, estudios de bloques de ADN del genoma humano indican que la mayor parte de dichos bloques es compartida entre los continentes, con solamente un pequeño porcentaje siendo específico a ciertos continentes. Estos resultados no indican que haya una base clara para subdividir a los humanos en grupos biológicamente definidos. Este puede no ser un problema en áreas aplicadas de genéticas, dado que los métodos rápidos para obtener genotipos individuales

  12. A novel role of human holliday junction resolvase GEN1 in the maintenance of centrosome integrity.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Min Gao

    Full Text Available The maintenance of genomic stability requires accurate genome replication, repair of DNA damage, and the precise segregation of chromosomes in mitosis. GEN1 possesses Holliday junction resolvase activity in vitro and presumably functions in homology driven repair of DNA double strand breaks. However, little is currently known about the cellular functions of human GEN1. In the present study we demonstrate that GEN1 is a novel centrosome associated protein and we characterize the various phenotypes associated with GEN1 deficiency. We identify an N-terminal centrosome localization signal in GEN1, which is required and sufficient for centrosome localization. We report that GEN1 depletion results in aberrant centrosome numbers associated with the formation of multiple spindle poles in mitosis, an increased number of cells with multi-nuclei, increased apoptosis and an elevated level of spontaneous DNA damage. We find homologous recombination severely impaired in GEN1 deficient cells, suggesting that GEN1 functions as a Holliday junction resolvase in vivo as well as in vitro. Complementation of GEN1 depleted cells with various GEN1 constructs revealed that centrosome association but not catalytic activity of GEN1 is required for preventing centrosome hyper-amplification, formation of multiple mitotic spindles, and multi-nucleation. Our findings provide novel insight into the biological functions of GEN1 by uncovering an important role of GEN1 in the regulation of centrosome integrity.

  13. Differential evolutionary fate of an ancestral primate endogenous retrovirus envelope gene, the EnvV syncytin, captured for a function in placentation.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Cécile Esnault

    2013-03-01

    Full Text Available Syncytins are envelope genes of retroviral origin that have been co-opted for a role in placentation. They promote cell-cell fusion and are involved in the formation of a syncytium layer--the syncytiotrophoblast--at the materno-fetal interface. They were captured independently in eutherian mammals, and knockout mice demonstrated that they are absolutely required for placenta formation and embryo survival. Here we provide evidence that these "necessary" genes acquired "by chance" have a definite lifetime with diverse fates depending on the animal lineage, being both gained and lost in the course of evolution. Analysis of a retroviral envelope gene, the envV gene, present in primate genomes and belonging to the endogenous retrovirus type V (ERV-V provirus, shows that this captured gene, which entered the primate lineage >45 million years ago, behaves as a syncytin in Old World monkeys, but lost its canonical fusogenic activity in other primate lineages, including humans. In the Old World monkeys, we show--by in situ analyses and ex vivo assays--that envV is both specifically expressed at the level of the placental syncytiotrophoblast and fusogenic, and that it further displays signs of purifying selection based on analysis of non-synonymous to synonymous substitution rates. We further show that purifying selection still operates in the primate lineages where the gene is no longer fusogenic, indicating that degeneracy of this ancestral syncytin is a slow, lineage-dependent, and multi-step process, in which the fusogenic activity would be the first canonical property of this retroviral envelope gene to be lost.

  14. Valor genético estimado y qtl que afecta el porcentaje de sólidos totales en la raza bovina gyr

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ariosto Ardila Silva

    2010-12-01

    Full Text Available Además de todos los progresos que ha representado el mejoramiento genético animal clásico, este presenta algunas limitaciones como en algunos casos donde el fenotipo no se expresa en el individuo. Con el advenimiento de las enzimas de restricción, del secuenciamiento y de la amplificación del ADN, fue posible el uso de marcadores moleculares asociados con loci de características cuantitativas (QTL, como herramienta que auxilia y perfecciona el mejoramiento genético animal por medio de la selección asistida por marcadores (MAS, lo que aumenta el mérito genético para características de difícil medida, baja heredabilidad y limitadas por el sexo. La raza bovina gyr se caracteriza por su rusticidad y adaptación al trópico, y presenta una buena producción de leche para los países tropicales, por lo que es fundamental en la conformación de la raza gyrholando (5/8holstein y 3/8 gyr. El propósito del presente estudio fue complementar el análisis cuantitativo con la genética molecular, en el mejoramiento genético de la característica porcentaje de sólidos totales en la razagyr en Brasil. Catorce familias (toros gyr con 657 hijas fueron analizadas, siendo el promedio 0,095 % y la desviación estándar 0,1923 del valor genético estimadopara porcentaje de sólidos totales. Al utilizar 27 marcadores microsatélites en el análisis a travésde las 14 familias para porcentaje de sólidos totales en el cromosoma 6, un QTL fue identificado con P< 0,05 y F = 2,34 en la posición 58 cm, próximo al marcador MNB-208 (60,21 cm. Al emplear las familias3 y 4, las más significativas, el mismo QTL fue identificado con P < 0,01 y F = 7,61, pero en la posición 58 cm, próximo al marcador MNB-208.

  15. Viability of thin wall tube forming of ATF FeCrAl

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Maloy, Stuart Andrew [Los Alamos National Lab. (LANL), Los Alamos, NM (United States); Aydogan, Eda [Los Alamos National Lab. (LANL), Los Alamos, NM (United States); Anderoglu, Osman [Los Alamos National Lab. (LANL), Los Alamos, NM (United States); Lavender, Curt [Pacific Northwest National Lab. (PNNL), Richland, WA (United States); Yamamoto, Yukinori [Oak Ridge National Lab. (ORNL), Oak Ridge, TN (United States)

    2016-09-16

    Fabrication of thin walled tubing of FeCrAl alloys is critical to its success as a candidate enhanced accident tolerant fuel cladding material. Alloys that are being investigated are Generation I and Generation II FeCrAl alloys produced at ORNL and an ODS FeCrAl alloy, MA-956 produced by Special Metals. Gen I and Gen II FeCrAl alloys were provided by ORNL and MA-956 was provided by LANL (initially produced by Special Metals). Three tube development efforts were undertaken. ORNL led the FeCrAl Gen I and Gen II alloy development and tube processing studies through drawing tubes at Rhenium Corporation. LANL received alloys from ORNL and led tube processing studies through drawing tubes at Century Tubing. PNNL led the development of tube processing studies on MA-956 through pilger processing working with Sandvik Corporation. A summary of the recent progress on tube development is provided in the following report and a separate ORNL report: ORNL/TM-2015/478, “Development and Quality Assessments of Commercial Heat Production of ATF FeCrAl Tubes”.

  16. Prokaryotic expression, purification, and antiserum preparation of GAG and ENV proteins of human foamy virus%人泡沫病毒GAG、ENV蛋白的原核表达、抗血清制备及鉴定

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    卢飞; 孙燕; 李晶; 李治

    2012-01-01

    In order to detect the efficiency of human foamy virus infection on protein expression level, the recombinant prokaryotic expression vectors pET-32a-GAG and pET-32a-ENV were constructed successfully and transformed into E. coli BL21 Star (DE3), and the GAG, ENV fusion proteins were induced by IPTG and expressed at high level. Subsequently, the New Zealand rabbits were immunized with the fusion proteins for preparing the antiserums. Western Blot analysis showed that the antiserum could interact with GAG and ENV fusion proteins specifically. Based on the results from Western Blot and indirect immunofluotesent method, it is concluded that the antiserums were verified to interact with the natural GAG and ENV expressed from the viruses.%构建了HFV的GAG和ENV蛋白原核表达载体pET-32a-gag和pET-32a-env,转化E.coli BL21Star(DE3)后用IPTG诱导出高水平的GAG、ENV融合蛋白表达.以融合蛋白免疫新西兰兔制备了GAG和ENV抗血清.Western Blot检测表明,抗血清可以识别原核表达的GAG和ENV蛋白,说明抗血清具有较好的特异性.结合Western Blot和间接免疫荧光实验,表明抗血清可以检测到病毒表达的GAG和ENV蛋白.

  17. Algoritmos genéticos para planejamento em inteligencia artificial

    OpenAIRE

    Lecheta, Edson Martins

    2011-01-01

    Este trabalho apresenta uma revisão bibliográfica atualizada sobre duas grandes áreas da Inteligência Artificial: Planejamento e Algoritmos Genéticos. A pesquisa se estende pela criação de modelos genéticos implementados em um sistema planejador dedicado à resolução de uma conhecida classe de problemas de planejamento, usando bibliotecas de código de domínio público em ambas as áreas. Uma análise dos resultados motivou a remodelagem e nova implementação, alterando a plataforma e o sistema ope...

  18. Anemia Falciforme: Um Problema Nosso. Uma abordagem bioética sobre a nova genética

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Diniz Debora

    2003-01-01

    Full Text Available Este artigo analisa uma das ações educativas adotadas pelo Ministério da Saúde no campo das hemoglobinopatias: o folheto informativo Anemia Falciforme: Um Problema Nosso. O objetivo é discutir as premissas e os valores morais que se encontram associados a iniciativas no campo da educação genética, tendo as políticas públicas sobre anemia falciforme no Brasil como estudo de caso. A análise mostra que o conteúdo do folheto oscila entre políticas de prevenção para doenças e promoção de direitos fundamentais, uma característica da nova genética. Além disso, o excesso de informação biomédica especializada no folheto dificulta sua divulgação em massa. Os resultados encontrados foram discutidos à luz do debate bioético contemporâneo sobre a nova genética.

  19. Relaciones genéticas en localidades de Salta, Argentina: ¿qué reflejan las medidas de distancia?

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Albeza, María V.

    2010-01-01

    Full Text Available A partir de datos de once STRs autosómicos se calcularon diferentes coeficientes de distancia genética en cinco poblaciones de la provincia de Salta y se elaboraron los dendrogramas correspondientes. Cuando se incorporaron datos de la bibliografía, se amplió el análisis a 16 poblaciones (siete de la provincia y nueve de diferentes regiones del país, reduciéndose a 9 el número de loci comunes utilizados en la estimación de las diferentes medidas de distancia. Las representaciones gráficas no reflejaron las vinculaciones esperadas en función de sus proximidades geográficas, pues hubo una amplia gama de asociaciones, reflejando inconsistencias mutuas. De acuerdo al test de Mantel, no existe correlación con la matriz de distancia geográfica en cada caso (0,23 < r < 0,40 con niveles de significación que variaron entre 0,22 y 0,98, por lo que las distancias genéticas no tuvieron relación con la proximidad geográfica entre poblaciones. Tampoco existió correlación entre STRs y otros marcadores genéticos para localidades de la provincia (r = 0,10163; t = 2,3918, p = 0,9916

  20. Identificación de los polimorfismos G1 y G8 del gen GDF9 en ovinos criollos Araucanos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    E Paz

    2014-01-01

    Full Text Available En la especie ovina se han descrito una serie de polimorfismos en genes de efecto mayor relacionados con la actividad reproductiva. Las mutaciones ubicadas en el gen de efecto mayor GDF9 se han asociado con el incremento de la tasa ovulatoria y el tamaño de la camada. GDF9 es un factor celular secretado por el ovocito y es miembro de la familia de factores de crecimiento transformante (TGF-β localizado en el cromosoma 5 ovino. El objetivo de este trabajo fue identificar la presencia de los polimorfismos en los sitios G1 y G8 en el gen GDF9 en ovinos criollos Araucanos. Se extrajo el ADN de 100 muestras sanguíneas para posteriormente determinar la presencia de las mutaciones utilizando la técnica PCR-RFLP. Fue amplificada una región de 462 pb correspondiente al exón 1, la cuál fue digerida con la enzima de restricción HhaI, el siguiente fragmento amplificado fue de 139 pb correspondiente al exón 2, siendo digerido con la enzima Ddel. Se identificó la presencia del polimorfismo G1 con una frecuencia genotípica del 0,56 (genotipo GG, 0,44 (genotipo GA y una frecuencia alélica de 0,78 para el alelo (G y 0,22 para el alelo (A. No se detectó la presencia de polimorfismo G8. Este es el primer reporte de este polimorfismo en ovinos en Chile que podría servir como un marcador genético de prolificidad para la selección de ovinos criollos Araucanos.

  1. Ambiente genético del Gen blaCTX-M-12 en aislamientos hospitalarios de Klebsiella pneumoniae

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Yamile Adriana Celis Bustos

    2009-06-01

    Full Text Available The blaCTX-M-12 gene’s genetic environmnt in Klebsiella pneumoniae hospital isolates Resumen: En Colombia se han detectado genes del grupo CTX-M-1 con alta frecuencia en aislamientos de Klebsiella pneumoniae causantes de infección intrahospitalaria. El conocimiento de los factores genéticos que pueden favorecer la diseminación de estos genes entre especies bacterianas es un aspecto importante para el control de la resistencia. En este estudio se identificaron los plásmidos portadores del gen blaCTX-M-12 en 21 aislamientos clínicos de K. pneumoniae. Se evaluó por conjugación la transferencia de resistencia a antibióticos. Integrones, secuencias de inserción y otros elementos genéticos fueron detectados por amplificación del ADN plasmídico con la reacción en cadena de la polimerasa (PCR. Mediante análisis por PCR se determinó la relación entre el gen blaCTX-M-12 y los elementos genéticos detectados. En todos los aislamientos, el gen blaCTX-M-12 se encontró en plásmidos conjugativos de tamaños entre 65 y 106 kpb. La transferencia por conjugación de estos elementos móviles puede explicar la amplia diseminación de este gen entre enterobacterias causantes de infección nosocomial en hospitales de Bogotá, Colombia. El gen blaCTX-M-12 se encontró corriente abajo de ISEcp1, secuencia de inserción que se ha asociado con la movilización de determinantes genéticos de resistencia. Los promotores de ISEcp1, detectados por análisis de secuencia, pueden facilitar la expresión de la cefotaximasa codificada por este gen.Palabras clave: resistencia a antibióticos; elementos genéticos móviles; gen blaCTX-M-12; plásmidos conjugativos;  Klebsiella pneumoniae. Abstract: Genes from CTX-M-1 group have been detected with great frequency in Colombia in intrahospital infection-causing Klebsiella pneumoniae isolates. Knowledge regarding the genetic factors favouring such genes’ dissemination amongst bacterial species is an

  2. A Novel Role of Human Holliday Junction Resolvase GEN1 in the Maintenance of Centrosome Integrity

    DEFF Research Database (Denmark)

    Gao, M.; Danielsen, Jannie Michaela Rendtlew; Wei, L.-Z.;

    2012-01-01

    but not catalytic activity of GEN1 is required for preventing centrosome hyper-amplification, formation of multiple mitotic spindles, and multi-nucleation. Our findings provide novel insight into the biological functions of GEN1 by uncovering an important role of GEN1 in the regulation of centrosome integrity......The maintenance of genomic stability requires accurate genome replication, repair of DNA damage, and the precise segregation of chromosomes in mitosis. GEN1 possesses Holliday junction resolvase activity in vitro and presumably functions in homology driven repair of DNA double strand breaks....... However, little is currently known about the cellular functions of human GEN1. In the present study we demonstrate that GEN1 is a novel centrosome associated protein and we characterize the various phenotypes associated with GEN1 deficiency. We identify an N-terminal centrosome localization signal in GEN1...

  3. Disseny i implementació d'un robot 3R genèric

    OpenAIRE

    Ballbè Chaler, Marc

    2015-01-01

    Aquest projecte s'ha realitzat al laboratori del Institut de Robòtica i Informàtica Industrial ubicat en la Facultat de Matemàtiques i Estadística de la Universitat Politècnica de Catalunya. Els objectius d'aquest projecte han sigut diversos, encara que tots s'engloben en l'anàlisi genèrica d'un robot amb tres graus de llibertat de rotació i la implementació d'un prototip. Un dels objectius principals ha sigut la resolució de la cinemàtica directa i inversa d'un robot amb...

  4. A Virtual Reality Framework to Optimize Design, Operation and Refueling of GEN-IV Reactors.

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Rizwan-uddin; Nick Karancevic; Stefano Markidis; Joel Dixon; Cheng Luo; Jared Reynolds

    2008-04-23

    many GEN-IV candidate designs are currently under investigation. Technical issues related to material, safety and economics are being addressed at research laboratories, industry and in academia. After safety, economic feasibility is likely to be the most important crterion in the success of GEN-IV design(s). Lessons learned from the designers and operators of GEN-II (and GEN-III) reactors must play a vital role in achieving both safety and economic feasibility goals.

  5. A Virtual Reality Framework to Optimize Design, Operation and Refueling of GEN-IV Reactors

    International Nuclear Information System (INIS)

    Many GEN-IV candidate designs are currently under investigation. Technical issues related to material, safety and economics are being addressed at research laboratories, industry and in academia. After safety, economic feasibility is likely to be the most important criterion in the success of GEN-IV design(s). Lessons learned from the designers and operators of GEN-II (and GEN-III) reactors must play a vital role in achieving both safety and economic feasibility goals

  6. Analisis Kata Penghubung He (和), Gen ( 跟) Dan Yu (与) Dalam Kalimat Bahasa Mandarin

    OpenAIRE

    Tarigan, Cicilia Aprilina Kartika

    2013-01-01

    The tittle of this paper is “Analisis Kata Penghubung He, Gen, dan Yu dalam Kalimat Bahasa Mandarin. Researcher analyzes the use of Chinese cunjuctions, he, gen, yu in Chinese sentences. Actually he, gen and yu have the same meaning but differently in their own characteristics. The concepts of the thesis are The methodology on the thesis is descriptive method. The author analyze about characteristic and similarities and differences of cunjuctions, hen, gen, and yu. By this, author is try to ...

  7. Consecuencias genéticas de igualar las contribuciones familiares en programas de conservación

    OpenAIRE

    Sánchez Molano, Enrique

    2010-01-01

    En poblaciones en riesgo de extinción, puede ser necesario establecer un programa de conservación ex situ que, desde el punto de vista genético, permita controlar su estructura reproductiva para minimizar los efectos de la consanguinidad y la deriva. En tales programas, a menudo se recomienda igualar las contribuciones familiares al grupo reproductor (estrategia CI) para maximizar el censo efectivo. Este procedimiento causa una relajación parcial de la selección natural, impidiendo su acción ...

  8. GA-Ensemble : optimización de conjuntos de clasificadores mediante algoritmos genéticos

    OpenAIRE

    Ordóñez Morales, Francisco Javier

    2007-01-01

    El objetivo general de este Proyecto Fin de Carrera es desarrollar un algoritmo optimizado de generación de conjuntos de clasificadores heterogéneos basándose en el algoritmo GA-Stacking. Los objetivos específicos son: - Determinar los métodos de generación de clasificadores más adecuados al proceso de creación del conjunto de clasificadores. - Definir los parámetros adecuados de los algoritmos genéticos a utilizar para la generación del conjunto de clasificadores, haciendo ...

  9. Correlaciones fenotípicas, genéticas y ambientales en cucurbita moschata duch. ex poir

    OpenAIRE

    Baena García D.; Espitia Camacho M.; Vallejo Cabrera F. A.

    2006-01-01

    El estudio estimó las correlaciones fenotípicas, genéticas y ambientales entre doce caracteres agronómicos en dos dialélicos de zapallo (uno entre cinco variedades y otro entre cinco líneas S1, originadas de las anteriores). Se usó un diseño en bloques completos al azar con 15 tratamientos (5 progenitores + 10 cruzamientos F1) para cada dialélico y cinco repeticiones. Los resultados señalaron mayor estimación de las correlaciones (en magnitud y significancia estadística) a favor del dialélico...

  10. Genética molecular y biogerontología en la era postgenómica

    OpenAIRE

    Michán Aguirre Shaday

    2011-01-01

    RESUMEN La forma de estudiar la genética ha progresado notablemente en las últimas decadas. Sus orígenes se remontan al estudio de los caracteres hereditarios, seguido por el descubrimiento de los genes y los cromosomas hasta conocer la estructura del ADN. Este último evento impulsó el desarrollo de la tecnología del ADN recombinante y de la secuenciación masiva y automatizada, los cuales permitieron posteriormente determinar la anatomía de los genomas. Todos estos descubrimientos ...

  11. Variabilidade genética e herança da tolerância à toxicidade do alumínio em aveia

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    SÁNCHEZ-CHACÓN CARLOS DANILO

    2000-01-01

    Full Text Available Vinte e um genótipos de aveia (Avena sativa L. do programa de melhoramento da Universidade Federal do Rio Grande do Sul foram avaliados quanto à reação ao alumínio (Al tóxico em solução nutritiva. Os níveis de Al testados foram 5, 10, 15, 20 e 30 g kJ-1, e o recrescimento da raiz foi medido depois de 48 horas sob a ação do metal. A variabilidade fenotípica foi observada a partir de 10 g kJ-1; em 20 g kJ-1 foram discriminados genótipos tolerantes e sensíveis. As bases genéticas da tolerância ao Al foram estudadas nas gerações P1, P2, F1 e F2, em nove cruzamentos entre genótipos tolerantes x sensíveis. Foi observado nas populações segregantes que a tolerância foi condicionada por um gene, de efeito dominante. A herdabilidade no sentido amplo foi moderada a elevada, permitindo que a seleção de indivíduos homozigotos tolerantes possa ser realizada em gerações precoces, acompanhada de teste de progênie. Por ser um método de relativa facilidade e rapidez, a seleção de germoplasma tolerante ao Al pode ser parte integrante da rotina dos programas de melhoramento de aveia.

  12. Epidemiologia genética: epidemiologia, genética ou nenhuma das anteriores?

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Aguinaldo Gonçalves

    1990-12-01

    Full Text Available No esforço de contribuir para melhor entendimento da identidade da Epidemiologia Genética, são revistas sua concepção, campo de atuação, métodos e técnicas pertinentes e algumas instâncias de aplicação. Entendendo-a como a área de interesse dos fatores genéticos das doenças e suas interações ambientais, apresenta-se seu campo de atuação como constituído por dois segmentos: um descritivo, que lida com conhecimento da distribuição de tais afecções em famílias e populações, seu impacto a nível do coletivo e sua vigilância epidemiológica, bem como o estudo de seus determinantes; o segundo, caracterizado pela intervenção, refere-se às respectivas medidas preventivas. Em que pese possível limitação pela não-consideração de todas as situações existentes, particular atenção é destinada à revisão de métodos e técnicas que possam ser convergentemente aplicados, a partir de procedimentos genéticos e epidemiológicos. Entre eles, destacam-se como estudos de casos tanto metodologias laboratoriais (como os dermatóglifos quanto quantitativos, como cálculo de herdabilidade e análise multivariada. Alguns objetos de estudo são tomados como instância de aplicação, por contarem com investigações específicas em nosso meio: a hanseníase, o hidrargirismo e a esquizofrenia.In an attempt to contribute to a better undestanding of the identity of Genetic Epidemiology, we review its conception, its field of influence, its appropriate methods and techniques and, at last, some of its applications. Genetic Epidemiology involves the study of genetic factors acting on diseases and on their environmental interactions. These includes two major areas: a descriptive one, related to the distribution of such conditions in families and populations, to the epidemiologic surveillance and to the study of determinants; and another characterized by intervention, which is related to preventive measures. Because of the dificulty in

  13. Los usuarios ante los alimentos genéticamente modificados y su información en el etiquetado

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Miren Itxaso Sebastian-Ponce

    2014-02-01

    Full Text Available OBJETIVO : Analizar la opinión que los usuarios tienen sobre alimentos genéticamente modificados y su información en el etiquetado. MÉTODOS : Realizada revisión sistemática de la literatura científica sobre los alimentos transgénicos y el etiquetado a partir de la consulta de las bases de datos bibliográficas: Medline (vía PubMed, EMBASE, ISI-Web of Knowledge, Cochrane Library Plus, FSTA, LILACS, CINAHL y AGRICOLA. Los descriptores seleccionados fueron: «organisms, genetically modified » y «food labeling». La búsqueda se realizó desde la primera fecha disponible hasta junio de 2012, seleccionando los artículos pertinentes escritos en inglés, portugués y castellano. RESULTADOS : Se seleccionaron 40 artículos. En todos ellos, se debía haber realizado una intervención poblacional enfocada al conocimiento de los consumidores sobre los alimentos genéticamente modificados y su necesidad, o no, de incluir información en el etiquetado. El consumidor expresa su preferencia por el producto no-genéticamente modificado, y apunta que está dispuesto a pagar algo más por él, pero, en definitiva compra el artículo que está a mejor precio en un mercado que acoge las nuevas tecnologías. En 18 artículos la población se mostraba favorable a su etiquetado obligatorio y seis al etiquetado voluntario; siete trabajos demostraban el poco conocimiento de la población sobre los transgénicos y, en tres, la población subestimó la cantidad que consumía. En todo caso, se observó la influencia del precio del producto genéticamente modificado. CONCLUSIONES : La etiqueta debe ser homogénea y aclarar el grado de tolerancia en humanos de alimentos genéticamente modificados en comparación con los no modificados. Asimismo, debe dejar claro su composición, o no, de alimento genéticamente modificado y la forma de producción de estos artículos de consumo. La etiqueta también debe ir acompañada de un sello de certificación de una agencia

  14. Estructura genética del sistema de asimilación de nitrato y regulación global de la asimilación de nitrógeno en la cianobacteria synechococcus sp.

    OpenAIRE

    Luque Romero, Ignacio

    1994-01-01

    Los objetivos de este trabajo han sido profundizar en el estudio de la estructura genética de los genes implicados en la asimilación de nitrato en Synechococcus sp. PCC 7942, y contribuir al esclarecimiento del mecanismo de regulación de dichos genes mediante la proteína NtcA.

  15. GenBank blastx search result: AK241192 [KOME

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available e for comparative gene identification transcript 94 (CGI-94), complete sequence. PRI 1e-114 1 ... ...3A3 gene for 60kDa splicing factor 3a subunit 3, the FHL3 gene for four and a half LIM domains 3 and the gen

  16. GenBank blastx search result: AK241821 [KOME

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available e for comparative gene identification transcript 94 (CGI-94), complete sequence. PRI 5e-40 1 ... ...3A3 gene for 60kDa splicing factor 3a subunit 3, the FHL3 gene for four and a half LIM domains 3 and the gen

  17. GenBank blastx search result: AK058467 [KOME

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available ome 1p34.2-36.11 Contains the 3' end of the KPNA6 gene for karyopherin alpha 6 (importin alpha 7), a novel g...ene (DKFZp451J0118), a novel gene (MGC1203) a novel gene, a novel gene (FLJ10547), a novel gene, a novel gen

  18. PowerGen plc report and accounts 1994

    International Nuclear Information System (INIS)

    The annual report and accounts of PowerGen plc for the year 1994 are presented. Financial highlights are quoted, followed by the Chairman's statement, reviews by the Chief Executive and Financial Directors, reports by the Auditors and Directors, balance sheets and details of the consolidated profit and loss account and principal accounting policies. A four year summary and shareholder information are included. (UK)

  19. GenBank blastn search result: AK064582 [KOME

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available AK064582 002-112-F03 AY007820.1 Daucus carota ATPase8 (ATP8) gene, ATP8-Sp1b allele, complete cds; chimeric... ATPase9 (ATP9) gene, ATP9-Sp3 allele, complete cds; and chimeric ATPase6 (ATP6) gen

  20. Meet Mr. and Mrs. Gen X: A New Parent Generation

    Science.gov (United States)

    Howe, Neil

    2010-01-01

    Slowly but surely, Generation Xers have been taking over from Baby Boomers as the majority of parents in elementary and secondary education. In the early 1990s, Gen Xers began joining parent-teacher associations in the nation's elementary schools. Around 2005, they became the majority of middle school parents. By the fall of 2008, they took over…

  1. El uso de alteraciones genéticas en la estratificación por riesgo del mieloma múltiple

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Esteban Braggio

    2013-08-01

    Full Text Available Los estudios genéticos han alcanzado un papel central en el estudio del mieloma múltiple (MM, al convertirse en un componente crítico en la estratificación basada en el riesgo de la enfermedad. Se han hecho grandes esfuerzos para identificar cambios genéticos que puedan predecir el resultado clínico e incluirlos en la práctica clínica diaria. La hibridización in situ fluorescente (FISH es todavía la técnica genética más utilizada en la práctica clínica, mayormente debido a su sencilla implementación y su simplicidad para el análisis de datos. El advenimiento de la genómica (hibridización genómica comparativa, secuenciación exónica o genómica completa y del transcriptoma de alta resolución (perfiles de expresión de genes - GEP y secuenciación de ARNm proveen un análisis exhaustivo de los ya definidos factores pronósticos genéticos y son herramientas útiles para la identificación de potenciales nuevos marcadores pronósticos de enfermedad en el clon tumoral de MM. Más aún, GEP ha sido exitosamente implementado en MM como una herramienta de estratificación de riesgo, siendo la de mayor poder de discriminación de resultados. De todas maneras, algunos aspectos técnicos y logísticos complejos (necesidad de una elevada purificación del clon tumoral, costo de los ensayos y complejidad en los análisis de los datos deben ser considerados antes de la incorporación definitiva de estas tecnologías de alto rendimiento dentro de los ensayos clínicos de rutina. Hasta entonces, FISH continúa siendo la herramienta estándar para la detección de anormalidades genéticas y de valoración pronóstico de enfermedad.

  2. El desarrollo de la investigación en genética en Colombia

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Carolina Isaza

    2008-06-01

    Full Text Available Durante la última década la genética y la biología molecular en Colombia han dado un gran salto en su desarrollo. Al revisar las convocatorias nacionales de salud que realiza anualmente el Ministerio de Protección Social a través de Colciencias es posible visualizarlo. Al dar una breve mirada a las cifras estadísticas desde el año 2000, encontramos que el país muestra un claro aumento de la capacidad científica y el recurso humano para investigación en salud, reflejado en el incremento del número de proyectos presentados en cada convocatoria y el aumento considerable en la inversión del país para financiar investigación en salud, llegando en el año 2008 a la cifra de 28,000 millones de pesos.En el año 2000 se presentaron para evaluación a Colciencias 133 proyectos y se aprobaron para ejecución solamente 43 por un monto de 1,585 millones de pesos, mientras que en el 2007 se presentaron 690 y aprobados 103 por un monto de 21,223 millones de pesos. Este año se han presentado 711 proyectos que se encuentran actualmente en evaluación y se dispone de 28,000 millones para financiación. Estas cifras muestran un incremento de siete veces en el número de propuestas y un crecimiento de cerca de 27 veces en el presupuesto durante los últimos 7 años. Es muy claro que los proyectos seleccionados son cada vez de mayor impacto para la salud de los colombianos y ahora entre 20% y 30% de las propuestas presentadas en la modalidad nacional, incluyen temas relacionados con genética o utilizan herramientas de biología molecular. Sin embargo, este porcentaje es mucho menor en la convocatoria regional, lo que muestra una concentración de científicos con preparación en genética y biología molecular en las principales ciuda-des del Colombia, que es lo que se ha denominado el triángulo de oro de la ciencia en Colombia (Medellín, Bogotá y Cali. Es interesante ver los desarrollos de la genética molecular para el estudio de las

  3. El desarrollo de la investigación en genética en Colombia.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Carolina Isaza

    2009-11-01

    Full Text Available Durante la última década la genética y la biología molecular en Colombia han dado un gran salto en su desarrollo. Al revisar las convocatorias nacionales de salud que realiza anualmente el Ministerio de Protección Social a través de Colciencias es posible visualizarlo. Al dar una breve mirada a las cifras estadísticas desde el año 2000, encontramos que el país muestra un claro aumento de la capacidad científica y el recurso humano para investigación en salud, reflejado en el incremento del número de proyectos presentados en cada convocatoria y el aumento considerable en la inversión del país para financiar investigación en salud, llegando en el año 2008 a la cifra de 28,000 millones de pesos. En el año 2000 se presentaron para evaluación a Colciencias 133 proyectos y se aprobaron para ejecución solamente 43 por un monto de 1,585 millones de pesos, mientras que en el 2007 se presentaron 690 y aprobados 103 por un monto de 21,223 millones de pesos. Este año se han presentado 711 proyectos que se encuentran actualmente en evaluación y se dispone de 28,000 millones para financiación. Estas cifras muestran un incremento de siete veces en el número de propuestas y un crecimiento de cerca de 27 veces en el presupuesto durante los últimos 7 años. Es muy claro que los proyectos seleccionados son cada vez de mayor impacto para la salud de los colombianos y ahora entre 20% y 30% de las propuestas presentadas en la modalidad nacional, incluyen temas relacionados con genética o utilizan herramientas de biología molecular. Sin embargo, este porcentaje es mucho menor en la convocatoria regional, lo que muestra una concentración de científicos con preparación en genética y biología molecular en las principales ciudades del Colombia, que es lo que se ha denominado el triángulo de oro de la ciencia en Colombia (Medellín, Bogotá y Cali. Es interesante ver los desarrollos de la genética molecular para el estudio de las

  4. Covariance of charged amino acids at positions 322 and 440 of HIV-1 Env contributes to coreceptor specificity of subtype B viruses, and can be used to improve the performance of V3 sequence-based coreceptor usage prediction algorithms.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Kieran Cashin

    Full Text Available The ability to determine coreceptor usage of patient-derived human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1 strains is clinically important, particularly for the administration of the CCR5 antagonist maraviroc. The envelope glycoprotein (Env determinants of coreceptor specificity lie primarily within the gp120 V3 loop region, although other Env determinants have been shown to influence gp120-coreceptor interactions. Here, we determined whether conserved amino acid alterations outside the V3 loop that contribute to coreceptor usage exist, and whether these alterations improve the performance of V3 sequence-based coreceptor usage prediction algorithms. We demonstrate a significant covariant association between charged amino acids at position 322 in V3 and position 440 in the C4 Env region that contributes to the specificity of HIV-1 subtype B strains for CCR5 or CXCR4. Specifically, positively charged Lys/Arg at position 322 and negatively charged Asp/Glu at position 440 occurred more frequently in CXCR4-using viruses, whereas negatively charged Asp/Glu at position 322 and positively charged Arg at position 440 occurred more frequently in R5 strains. In the context of CD4-bound gp120, structural models suggest that covariation of amino acids at Env positions 322 and 440 has the potential to alter electrostatic interactions that are formed between gp120 and charged amino acids in the CCR5 N-terminus. We further demonstrate that inclusion of a "440 rule" can improve the sensitivity of several V3 sequence-based genotypic algorithms for predicting coreceptor usage of subtype B HIV-1 strains, without compromising specificity, and significantly improves the AUROC of the geno2pheno algorithm when set to its recommended false positive rate of 5.75%. Together, our results provide further mechanistic insights into the intra-molecular interactions within Env that contribute to coreceptor specificity of subtype B HIV-1 strains, and demonstrate that incorporation

  5. Caracterização físico-química de frutos de genótipos de aceroleira (Malpighia emarginata D.C.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Maria Inês Sucupira Maciel

    2010-12-01

    Full Text Available No Brasil, a aceroleira, decorrente principalmente da propagação por sementes, tem dado origem a plantios comerciais cujos frutos apresentam parâmetros de qualidade diferenciados. Características físico-químicas de frutos de 18 genótipos de aceroleira (Malpighia emarginata DC. do Banco Ativo de Germoplasma da Universidade Federal Rural de Pernambuco - UFRPE foram avaliados. O rendimento em polpa variou de 41,06% (PL 40 a 72,54% (PL 43 e, com exceção do genótipo PL 37, os demais apresentaram frutos com teores de ácido ascórbico superiores a 1000 mg.100 g-1. O genótipo PL 39 destacou-se por apresentar o maior teor de ácido ascórbico (1667 mg.100 g-1, SST e flavonóis (15,04 mg.100 g-1, além de elevado teor de antocianinas, sendo, portanto, o mais promissor. Os frutos do genótipo PL 34 revelaram o maior valor de SST/ATT, indicando ser o mais doce

  6. DOE/NNSA perspective safeguard by design: GEN III/III+ light water reactors and beyond

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Pan, Paul Y [Los Alamos National Laboratory

    2010-12-10

    An overview of key issues relevant to safeguards by design (SBD) for GEN III/IV nuclear reactors is provided. Lessons learned from construction of typical GEN III+ water reactors with respect to SBD are highlighted. Details of SBD for safeguards guidance development for GEN III/III+ light water reactors are developed and reported. This paper also identifies technical challenges to extend SBD including proliferation resistance methodologies to other GEN III/III+ reactors (except HWRs) and GEN IV reactors because of their immaturity in designs.

  7. AL Amyloidosis

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Desport Estelle

    2012-08-01

    Full Text Available Abstract Definition of the disease AL amyloidosis results from extra-cellular deposition of fibril-forming monoclonal immunoglobulin (Ig light chains (LC (most commonly of lambda isotype usually secreted by a small plasma cell clone. Most patients have evidence of isolated monoclonal gammopathy or smoldering myeloma, and the occurrence of AL amyloidosis in patients with symptomatic multiple myeloma or other B-cell lymphoproliferative disorders is unusual. The key event in the development of AL amyloidosis is the change in the secondary or tertiary structure of an abnormal monoclonal LC, which results in instable conformation. This conformational change is responsible for abnormal folding of the LC, rich in β leaves, which assemble into monomers that stack together to form amyloid fibrils. Epidemiology AL amyloidosis is the most common type of systemic amyloidois in developed countries with an estimated incidence of 9 cases/million inhabitant/year. The average age of diagnosed patients is 65 years and less than 10% of patients are under 50. Clinical description The clinical presentation is protean, because of the wide number of tissues or organs that may be affected. The most common presenting symptoms are asthenia and dyspnoea, which are poorly specific and may account for delayed diagnosis. Renal manifestations are the most frequent, affecting two thirds of patients at presentation. They are characterized by heavy proteinuria, with nephrotic syndrome and impaired renal function in half of the patients. Heart involvement, which is present at diagnosis in more than 50% of patients, leading to restrictive cardiopathy, is the most serious complication and engages prognosis. Diagnostic methods The diagnosis relies on pathological examination of an involved site showing Congo red-positive amyloid deposits, with typical apple-green birefringence under polarized light, that stain positive with an anti-LC antibody by immunohistochemistry and

  8. Expresión transitoria del gen GUS en caña de azúcar usando Agrobacterium tumefaciens

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Martha Liliana Bonilla Betancourt

    2008-10-01

    Full Text Available En el estudio se desarrolló una metodología de transformación genética mediante Agrobacterium tumefaciens en cultivares colombianos de caña de azúcar. La transformación se evaluó mediante la expresión del gen GUS. Callos embriogénicos y explantes meristemáticos de los genotipos CC85-92, CC84-75 y CC87-505 se transformaron usando tres cepas (AGL-1, LBA4404 y EHA105 con el plásmido pCambia 1305.2 y dos (EHA105 y LBA4404 con pCambia 2301. Se usó el medio de infiltración (IM con acetosiringona y se evaluó el tiempo de cocultivo y la densidad óptica de la bacteria al momento de la inducción. Los genotipos mostraron respuesta diferencial con las combinaciones cepa-plásmido: obtuvieron mayor expresión del gen GUS cuando el genotipo CC85-92 se transformó con la cepa AGL-1-pCambia 1305.2. CC84-75 y CC87-505 mostraron mayor expresión cuando se transformaron con la cepa EHA105-pCambia 1305.2. Mayor eficiencia en la expresión se obtuvo cuando la bacteria se indujo en IM después de siete días de cocultivo y cuando la densidad óptica de la bacteria fue de 0.2(600nm al momento de la inducción. Se demostró superioridad de los explantes en la eficiencia de transformación.

  9. Diversidad genética en cerdos criollos mexicanos con genes candidatos asociados a características productivas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Alejandro Antonio González Sarabia

    2011-01-01

    Full Text Available El objetivo de este trabajo fue comparar la variabilidad, diversidad y distancias genéticas entre cerdos criollos, Pelón Mexicano (CPM y Cuinos (CC, con Yorkshire, cuanto a los genes candidatos CAST, DECR1, HAL, HFABP4, LEP, LIPE, MCR4, MYOG, RN y CHX, a través de analysis por PCR-RFLP. Se evaluaron 180 cerdos: 59 CPM, 65 CC y 56 Yorkshire. Se analizaron las frecuencias génicas y genotípicas, heterocigosidad, distancias genéticas y árboles filogenéticos entre grupos raciales. Para CAST, DECR1, HFABP4, LEP, MCR4 y CHX las frecuencias génicas y genotípicas fueron diferentes al comparar las tres razas. En LIPE, los CC fueron iguales a los Yorkshire; en cuanto a MYOG, los CPM fueron iguales a los Yorkshire. No hubo diferencias entre poblaciones criollas y Yorkshire en las frecuencias génicas y genotípicas para HAL y RN. Los cerdos Yorkshire presentaron mayor frecuencia en alelos favorables para CAST, LIPE, MCR4 y MYOG, menor frecuencia de DECR1, HFABP4, CHX, y moderada en LEP. La heterocigosidad promedio para todos los genes fue mayor en CPM (0,42±0,05 y similar en CC (0,33±0,06 y Yorkshire (0,35±0,05. Al calcular distancias genéticas con todos los genes, los CC se encuentran más distantes de los Yorkshire.

  10. Viral RNA levels and env variants in semen and tissues of mature male rhesus macaques infected with SIV by penile inoculation.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Francis Fieni

    Full Text Available HIV is shed in semen but the anatomic site of virus entry into the genital secretions is unknown. We determined viral RNA (vRNA levels and the envelope gene sequence in the SIVmac 251 viral populations in the genital tract and semen of 5 adult male rhesus monkeys (Macaca mulatta that were infected after experimental penile SIV infection. Paired blood and semen samples were collected from 1-9 weeks after infection and the monkeys were necropsied eleven weeks after infection. The axillary lymph nodes, testes, epididymis, prostate, and seminal vesicles were collected and vRNA levels and single-genome analysis of the SIVmac251 env variants was performed. At the time of semen collection, blood vRNA levels were between 3.09 and 7.85 log10 vRNA copies/ml plasma. SIV RNA was found in the axillary lymph nodes of all five monkeys and in 3 of 5 monkeys, all tissues examined were vRNA positive. In these 3 monkeys, vRNA levels (log10 SIVgag copies/ug of total tissue RNA in the axillary lymph node (6.48 ± 0.50 were significantly higher than in the genital tract tissues: testis (3.67 ± 2.16; p<0.05, epididymis (3.08 ± 1.19; p<0.0001, prostate (3.36 ± 1.30; p<0.01, and seminal vesicle (2.67 ± 1.50; p<0.0001. Comparison of the SIVmac251 env viral populations in blood plasma, systemic lymph node, and genital tract tissues was performed in two of the macaques. Visual inspection of the Neighbor-Joining phylograms revealed that in both animals, all the sequences were generally distributed evenly among all tissue compartments. Importantly, viral populations in the genital tissues were not distinct from those in the systemic tissues. Our findings demonstrate striking similarity in the viral populations in the blood and male genital tract tissues within 3 months of penile SIV transmission.

  11. Desarrollo de un sistema de expresión condicional del gen RHBDD2 para su sobreexpresión en un ratón transgénico

    OpenAIRE

    Lacunza, Ezequiel; Abba, Martin Carlos; Aldaz, C. Marcelo

    2011-01-01

    En estudios previos hemos identificado al gen RHBDD2 sobreexpresado en carcinomas invasores de mama. Hasta el momento se desconoce el rol funcional de dicha alteración aunque existen evidencias de que podría determinar un fenotipo favorable para las células tumorales. A fin de analizar in vivo las consecuencias biológicas de la sobreexpresión del gen RHBDD2, se llevó a cabo la construcción de un sistema de expresión condicional, para su inyección en células madres emb...

  12. Caracterización molecular, genética poblacional y relación biológica del nemertino Malacobdella arrokeana endocomensal de la almeja gigante Panopea abbreviata

    OpenAIRE

    Alfaya, José E. F.

    2014-01-01

    [ES] Malacobdella arrokeana Ivanov et al., 2002 es un nemertino que vive en la cavidad del manto de la almeja gigante Panopea abbreviata, ambas especies endemicas del Mar Argentino. Mediante la secuenciación y análisis del gen mitocondrial citocromo oxidasa I (COI), se corroboró que M arrokeana diverge genéticamente de M. grossa en un 11,6%, y 10,4% con respecto a M. japonica. Tanto M. arrokeana como P. abbreviata comparten el mismo nivel trófico y los mismos ítems alimentarios, compuestos en...

  13. Propuesta de consulta para desregulación de alimentos derivados de cultivos genéticamente mejorados, desarrollados en Costa Rica Request for consultation for deregulation of foods derived from genetically enhanced crops developed in Costa Rica

    OpenAIRE

    M-Eugenia Villalobos Hernández; Ana M Espinoza Esquivel

    2009-01-01

    Objetivo: Proponer un proceso de desregulación de alimentos derivados de cultivos genéticamente mejorados desarrollados en Costa Rica, plantea un trámite a la Consulta de desregulación de un nuevo alimento desarrollado por ingeniería genética, labor que le competerá al Ministerio de Salud principalmente. Material y Métodos: La propuesta incluye procedimientos de iniciar la Consulta, conformación del equipo de evaluadores, información que se solicita en el dossier sobre alimentos derivados de ...

  14. Estimación mediante RAPD's de la diversidad genética en Guadua en el departamento del Cauca, Colombia

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Palacio M. Juan Diego

    2006-06-01

    Full Text Available

    Mediante RAPD's se analizaron 120 muestras foliares de 12 biotipos de Guadua angustifolia Kunth clasificados morfológicamente, procedentes de la cuenca del río Cauca, en el departamento del Cauca, Colombia, para determinar diversidad genética. El ADN se extrajo mediante el protocolo modificado de Dellaporta (1983. Se emplearon los cebadores; OPF-12, OPG-19, OPN-19 y OPP-16 con mayor número de bandas polimórficas. El índice de Shannon (HT = 0.4556 ± 0.1849 señaló diversidad genética total alta y diversidad entre los biotipos y al interior de ellos. El Índice de estructura genética (Gst = 0.5200 e Indice de migración efectiva (Nm = 0.4615 definieron biotipos bien diferenciados. El análisis de similaridad conformó tres grupos a un coeficiente de 0.64. El grupo G1 incluyó los biotipos Curvado, Rayada frecuente, Amarilla Playón, Rayada ancha, Rayada escasa, Convexa, Amarilla, Hembra, Verde irregular y algunos individuos de verde alta. El grupo G2, Verde alta y Macho. El grupo G3, Rayada negra. El estudio molecular agrupó los individuos de forma similar al estudio morfológico, con excepción de los individuos del biotipo Hembra.

    Palabras claves: Guadua angustifolia, caracterización molecular, variación genética.

  15. NULIFE ASSOCIATION: An opportunity to face Gen II/Gen III challenges through cooperative research

    International Nuclear Information System (INIS)

    Excellence in roughly two years. It shall act as a facilitator to cooperative research. It shall: - Trigger innovation and promote new ideas; - Implement support to all Plant Life Management (PLIM) related issues. - Support the launching of new R and D projects; - Find and link funding partners and find R and D capabilities from the NULIFE competence pool; - Support project consortium agreement and management; - Support integration and harmonisation. Strategic research planning was started together with business plan and has been strongly related to the preparation of the First Chapter of the Strategic Research Agenda (SRA) of the Sustainable Nuclear Energy Technology Platform (SNE-TP). Many NULIFE organisations and members participate actively in the SNE-TP: - Governing Board: Chair, CEA, VTT, E.ON, EDF, Vattenfall, AREVA, SCK-CEN, TECNATOM, PSI, NRG,...; Executive Committee: Chair VTT; - Strategic Research Agenda Group: Chair of subgroup Gen2/Gen3, EDF; - Deployment Strategy Group: EDF. The First Chapter of the SNE-TP SRA defines the strategic targets in Long Term Operation (LTO), Performance improvement and External factors. In the Long Term Operation area, Safety justification, Ageing mechanisms of Systems-Structures-Components, Ageing monitoring and Prevention and mitigation of ageing are important subjects. In addition the SRA considers some cross-cutting areas like structural materials, prenormative research, codes and standards, modelling, simulation and methods. NULIFE is seen as a key instrument in implementing PLIM related topics of the SNE-TP strategy. The on-going and near future actions are on one side the preparation of road maps and specific short, medium and long term research topics to deploy the SRA, and on the other side to facilitate the launching of R and D projects on needs already shared by several stakeholders. Three projects are under construction on civil work, thermo-hydraulic code benchmark and warm pre-stress effect. Each project is supported

  16. Trifurcatia flabellata n. gen. n. sp., a putative monocotyledon angiosperm from the Lower Cretaceous Crato Formation (Brazil

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    B. Mohr

    2002-01-01

    Full Text Available The Lower Cretaceous Crato Formation (northeast Brazil contains plant remains, here described as Trifurcatia flabellata n. gen. and n. sp., consisting of shoot fragments with jointed trifurcate axes, each axis bearing a single amplexicaul serrate leaf at the apex. The leaves show a flabellate acrodromous to parallelodromous venation pattern, with several primary, secondary and higher order cross-veins. This very unique fossil taxon shares many characters with monocots. However, this fossil taxon exhibits additional features which point to a partly reduced, and specialized plant, which probably enabled this plant to grow in (seasonally dry, even salty environments. In der unterkretazischen Cratoformation (Nordostbrasilien sind Pflanzenfossilien erhalten, die hier als Trifurcatia flabellata n. gen. n. sp. beschrieben werden. Sie bestehen aus trifurcaten Achsen, mit einem apikalen amplexicaulen fächerförmigen serraten Blatt. Diese Blätter zeigen eine flabellate bis acrodrome-paralellodrome Aderung mit Haupt- und Nebenadern und transversale Adern 3. Ordnung. Diese Merkmale sind typisch für Monocotyledone. Allerdings weist dieses Taxon einige Merkmale auf, die weder bei rezenten noch fossilen Monocotyledonen beobachtet werden. Sie müssen als besondere Anpassungen an einen (saisonal trockenen und vielleicht übersalzenen Lebensraum dieser Pflanze interpretiert werden. doi:10.1002/mmng.20020050121

  17. Complete epitopes for vaccine design derived from a crystal structure of the broadly neutralizing antibodies PGT128 and 8ANC195 in complex with an HIV-1 Env trimer.

    Science.gov (United States)

    Kong, Leopold; Torrents de la Peña, Alba; Deller, Marc C; Garces, Fernando; Sliepen, Kwinten; Hua, Yuanzi; Stanfield, Robyn L; Sanders, Rogier W; Wilson, Ian A

    2015-10-01

    The HIV-1 envelope gp160 glycoprotein (Env) is a trimer of gp120 and gp41 heterodimers that mediates cell entry and is the primary target of the humoral immune response. Broadly neutralizing antibodies (bNAbs) to HIV-1 have revealed multiple epitopes or sites of vulnerability, but mapping of most of these sites is incomplete owing to a paucity of structural information on the full epitope in the context of the Env trimer. Here, a crystal structure of the soluble BG505 SOSIP gp140 trimer at 4.6 Å resolution with the bNAbs 8ANC195 and PGT128 reveals additional interactions in comparison to previous antibody-gp120 structures. For 8ANC195, in addition to previously documented interactions with gp120, a substantial interface with gp41 is now elucidated that includes extensive interactions with the N637 glycan. Surprisingly, removal of the N637 glycan did not impact 8ANC195 affinity, suggesting that the antibody has evolved to accommodate this glycan without loss of binding energy. PGT128 indirectly affects the N262 glycan by a domino effect, in which PGT128 binds to the N301 glycan, which in turn interacts with and repositions the N262 glycan, thereby illustrating the important role of neighboring glycans on epitope conformation and stability. Comparisons with other Env trimer and gp120 structures support an induced conformation for glycan N262, suggesting that the glycan shield is allosterically modified upon PGT128 binding. These complete epitopes of two broadly neutralizing antibodies on the Env trimer can now be exploited for HIV-1 vaccine design. PMID:26457433

  18. Bromatological characterization of maize genotypes for silage=Caracterização bromatológica de genótipos de milho para silagem

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Patricia Bertoncelli

    2012-10-01

    realizada quando as plantas apresentavam estádio pastoso a farináceo, ensiladas em microssilos de PVC de 100 mm, e desensilados após 60 dias. Verificou-se que as diferentes bases genéticas, bem como genótipos de diferentes texturas não influenciam na indicação de genótipos de milho. Os genótipos de milho do ciclo precoce-normal comportam-se de maneira similar para a maioria das características avaliadas, exceto para o diâmetro de colmo e matéria seca do colmo. Além disso, os genótipos de milho têm características indicadas para a produção de silagem de qualidade.

  19. HIV-1 Env DNA vaccine plus protein boost delivered by EP expands B- and T-cell responses and neutralizing phenotype in vivo.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Kar Muthumani

    Full Text Available An effective HIV vaccine will most likely require the induction of strong T-cell responses, broadly neutralizing antibodies (bNAbs, and the elicitation of antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC. Previously, we demonstrated the induction of strong HIV/SIV cellular immune responses in macaques and humans using synthetic consensus DNA immunogens delivered via adaptive electroporation (EP. However, the ability of this improved DNA approach to prime for relevant antibody responses has not been previously studied. Here, we investigate the immunogenicity of consensus DNA constructs encoding gp140 sequences from HIV-1 subtypes A, B, C and D in a DNA prime-protein boost vaccine regimen. Mice and guinea pigs were primed with single- and multi-clade DNA via EP and boosted with recombinant gp120 protein. Sera were analyzed for gp120 binding and induction of neutralizing antibody activity. Immunization with recombinant Env protein alone induced low-titer binding antibodies with limited neutralization breath. In contrast, the synthetic DNA prime-protein boost protocol induced significantly higher antibody binding titers. Furthermore, sera from DNA prime-protein boost groups were able to neutralize a broader range of viruses in a panel of tier 1 clade B viruses as well as multiple tier 1 clade A and clade C viruses. Further investigation of synthetic DNA prime plus adaptive EP plus protein boost appears warranted.

  20. Phylogenetic analysis of env, gag, and tat genes of HIV type 1 detected among the injecting drug users in West Bengal, India.

    Science.gov (United States)

    Mullick, Ranajoy; Sengupta, Satarupa; Sarkar, Kamalesh; Saha, M K; Chakrabarti, Sekhar

    2006-12-01

    A recent occurrence of HIV-1 seropositivity among a group of injecting drug users (IDUs) in Darjeeling, a hilly district in northern West Bengal, revealed overall 11.8% HIV seroprevalence. Our study based on env (C2-V3), gag (p24-p7), and tat (exon-1) genomic regions of HIV-1 detected among this population showed that Darjeeling IDU sequences belonged to subtype C. Interestingly, the IDU sequences from Darjeeling were again found to be closer to the C strains from Manipur, a northeastern state in India, which is linked to the Golden Triangle via the Manipur-Myanmar border, rather than the IDU C sequences from Nepal, a neighboring country of India. The outgroup reference strains from different sites of IDU-driven epidemics in the world like Russia, Vietnam, Thailand, and Spain belonged to the nonsubtype C group and formed separate clusters from the subtype C cluster in our analysis. These results indicate a rapid spread of HIV-1 by possible drug trafficking along international boundaries, which might also help in the invasion of HIV-1 among IDUs of Darjeeling through the Manipur-Myanmar border of India. PMID:17209773

  1. Paring Down HIV Env: Design and Crystal Structure of a Stabilized Inner Domain of HIV-1 gp120 Displaying a Major ADCC Target of the A32 Region.

    Science.gov (United States)

    Tolbert, William D; Gohain, Neelakshi; Veillette, Maxime; Chapleau, Jean-Philippe; Orlandi, Chiara; Visciano, Maria L; Ebadi, Maryam; DeVico, Anthony L; Fouts, Timothy R; Finzi, Andrés; Lewis, George K; Pazgier, Marzena

    2016-05-01

    Evidence supports a role of antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC) toward transitional epitopes in the first and second constant (C1-C2) regions of gp120 (A32-like epitopes) in preventing HIV-1 infection and in vaccine-induced protection. Here, we describe the first successful attempt at isolating the inner domain (ID) of gp120 as an independent molecule that encapsulates the A32-like region within a minimal structural unit of the HIV-1 Env. Through structure-based design, we developed ID2, which consists of the ID expressed independently of the outer domain and stabilized in the CD4-bound conformation by an inter-layer disulfide bond. ID2 expresses C1-C2 epitopes in the context of CD4-triggered full-length gp120 but without any known neutralizing epitope present. Thus, ID2 represents a novel probe for the analysis and/or selective induction of antibody responses to the A32 epitope region. We also present the crystal structure of ID2 complexed with mAb A32, which defines its epitope. PMID:27041594

  2. Variabilidad genética del crecimiento en progenies selectas de Pinus radiata.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Freddy Mora

    2010-08-01

    Full Text Available Heredabilidad en sentido estricto (h2, correlación genética intra-clase (Γ2IC y componentes de varianza para la altura, diámetro a la altura del pecho (DAP y volumen del fuste, a los siete años de edad después de la plantación, fueron analizados en dos ensayos de progenie de Pinus radiata establecidos en el sur de Chile, en orden a examinar la variabilidad genética del crecimiento en una generación avanzada de la especie. Estos ensayos incluyeron árboles provenientes de propagación vegetativa y generativa. Las heredabilidades fueron estimadas para los árboles originados de semillas, y mostraron los siguientes valores: altura, 0.08-0.13; diámetro a la altura del pecho, 0-0.13; volumen del fuste, 0-0.09. Los valores de la correlación genética intra-clase, estimados para el grupo de árboles originados de propagación vegetativa, fueron moderados a bajos (Γ2IC: altura, 0.1-0.11; diámetro a la altura del pecho, 0.01-0.05; volumen del fuste, 0.03-0.06. No obstante la presencia de heredabilidades y correlaciones moderadas para algunas características y, la variación relativamente limitada entre grupos de árboles reflejan la fuerte selección realizada a las progenies. En general, los árboles provenientes de estacas presentaron una tendencia a la menor variación intra-genotípica, y evidenciaron magnitudes relativas de las varianzas debida al grupo (σ2G mayores a las varianzas familiares (σ2F, en cuatro de seis caracteres evaluados, indicando una tendencia a la mayor homogeneidad en el crecimiento, característica común de la propagación vegetativa.

  3. Variabilidad genética del crecimiento en progenies selectas de Pinus radiata

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Freddy Mora

    2006-01-01

    Full Text Available Heredabilidad en sentido estricto (h2, correlación genética intra-clase (Γ2 IC y componentes de varianza para la altura, diámetro a la altura del pecho (DAP y volumen del fuste, a los siete años de edad después de la plantación, fueron analizados en dos ensayos de progenie de Pinus radiata establecidos en el sur de Chile, en orden a examinar la variabilidad genética del crecimiento en una generación avanzada de la especie. Estos ensayos incluyeron árboles provenientes de propagación vegetativa y generativa. Las heredabilidades fueron estimadas para los árboles originados de semillas, y mostraron los siguientes valores: altura, 0.08-0.13; diámetro a la altura del pecho, 0-0.13; volumen del fuste, 0-0.09. Los valores de la correlación genética intra-clase, estimados para el grupo de árboles originados de propagación vegetativa, fueron moderados a bajos (Γ2 IC: altura, 0.1-0.11; diámetro a la altura del pecho, 0.01-0.05; volumen del fuste, 0.03-0.06. No obstante la presencia de heredabilidades y correlaciones moderadas para algunas características y, la variación relativamente limitada entre grupos de árboles reflejan la fuerte selección realizada a las progenies. En general, los árboles provenientes de estacas presentaron una tendencia a la menor variación intra-genotípica, y evidenciaron magnitudes relativas de las varianzas debida al grupo (σ2 G mayores a las varianzas familiares (σ2 F, en cuatro de seis caracteres evaluados, indicando una tendencia a la mayor homogeneidad en el crecimiento, característica común de la propagación vegetativa.

  4. GenGIS: A geospatial information system for genomic data

    OpenAIRE

    Donovan H. Parks; Porter, Michael; Churcher, Sylvia; Wang, Suwen; Blouin, Christian; Whalley, Jacqueline; Brooks,Stephen; Robert G Beiko

    2009-01-01

    The increasing availability of genetic sequence data associated with explicit geographic and ecological information is offering new opportunities to study the processes that shape biodiversity. The generation and testing of hypotheses using these data sets requires effective tools for mathematical and visual analysis that can integrate digital maps, ecological data, and large genetic, genomic, or metagenomic data sets. GenGIS is a free and open-source software package that supports the integr...

  5. Luminescence of MBE SimGen strained monolayer superlattices

    International Nuclear Information System (INIS)

    This paper reports on SimGen strained monolayer superlattices (SMS) that have been fabricated by molecular beam epitaxy (MBE) and characterized using photoluminescence (PL). Symmetrically strained structures with different periodicities have been grown on top of a Si1-xGex alloy buffer layer. Luminescence features below (above) the Si(Ge) energy bandgap have been observed and attributed to either dislocations in the buffer layer or to energy band transitions in the SMS

  6. Análisis de la diversidad genética de 21 aislamientos del hongo Moniliophthora roreri basado en marcadores RAPD

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Boris Gutarra Castillo

    2013-12-01

    Full Text Available Objetivos: Estudiar la diversidad genética de 21 aislamientos del hongo que afecta al cultivo del cacao, Moniliophthora roreri, en tres zonas cacaoteras del Perú (Tocache, Mariscal Cáceres y Leoncio Prado. Métodos: Se utilizó 14 iniciadores RAPD (random amplified polymorphic DNA polimórficos y una pareja de oligonucleótidos, los que fueron empleados bajo condiciones de amplificación estandarizadas. Con los datos obtenidos se construyó un dendograma utilizando el coeficiente de Jaccard y el algoritmo UPGMA (Unweighted Pair-Group Method using Arithmetic Average. La estructura genética fue estimada en función del análisis molecular de variancia (AMOVA y la diversidad mediante los índices de Shannon y Nei. Resultados: Fueron conseguidas 59 bandas RAPD con un 73% de polimorfismo. El dendograma obtenido a un índice de similitud de 0,70, claramente dividió los individuos en tres grupos. El análisis de la diversidad genética mostró altos valores en las zonas estudiadas de acuerdo con el índice de Shannon (0,3936 y de Nei (0,2622, con mayor riqueza en Leoncio Prado. Estas zonas presentan alta variabilidad, y según el AMOVA realizado: 88% entre accesiones por zona y solo 12% entre zonas. Conclusiones: Existe más de un grupo genético de Moniliophthora roreri en la Amazonía del Perú. Estos grupos, provenientes del Ecuador, pudieron haber ingresado por el intercambio de semillas y/o de forma natural por medio de los ríos en común y estarían originando nuevos grupos genéticos locales.

  7. Dissimilaridade genética em variedades de Artemisia annua L. embasada em caracteres agronômicos, fisiológicos e fitoquímicos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    C.O. Bolina

    2014-01-01

    Full Text Available O presente estudo objetivou estimar a variabilidade genética existente entre caracteres agronômicos, fisiológicos e fitoquímicos em variedades de A. annua. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado e os tratamentos foram as variedades Artemis, 2/39x5x3M, e 2/39x1V de A. annua, submetidas a avaliações agronômicas, fisiológicas e fitoquímicas. Para a realização das estimativas de distância genética foram geradas matrizes de dissimilaridade utilizando a distância Euclidiana e os métodos de agrupamento de Tocher e UPGMA. Além disso, avaliou-se a importância relativa dos caracteres para divergência genética pelo método de Singh. As análises foram realizadas pelo software Genes e os dendrogramas obtidos pelo NTSYS. A presença de variabilidade genética dentro das variedades permitiu a identificação de acessos dissimilares e com média elevada para as características estudadas. O número de ramificações, concentração intracelular de CO2, e o rendimento de óleo essencial foram os caracteres que mais contribuíram para a dissimilaridade genética de A. annua. Os acessos B24, C5 e C32 foram os mais promissores dentro das variedades e devem ser conservados para futuras hibridações, sendo que as hibridações mais promissoras na obtenção de populações segregantes desejadas são B24 x C5, B24 x C32 e C5 x C32.

  8. Saúde coletiva, nova genética e a eugenia de mercado Collective health, the new genetics, and market eugenics

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Maria Helena Cabral de Almeida Cardoso

    2003-04-01

    Full Text Available Com os constantes avanços das técnicas de manipulação genética, o campo da saúde coletiva passou a lidar com a possibilidade de surgimento de uma ênfase genômica reducionista, para além das influências sócio-culturais. Nestas circunstâncias, o foco principal das intervenções em saúde coletiva voltar-se-ia para a abordagem genômica de "indivíduos" e suas "famílias" em detrimento de seu consagrado objeto - "populações". Assim, seria deslocada a prioridade central dos esforços (e recursos para reduzir o adoecimento em função das desigualdades sócio-econômicas. Ao lado dos benefícios dos conhecimentos genéticos, há a possibilidade de surgimento de novas práticas eugênicas a partir da disponibilização de testagens genéticas no mercado, com vistas à aquisição pelos indivíduos interessados, desde que estes sejam capazes de atuarem como respectivos agentes de consumo.Due to constant advances in genetic manipulation, the field of public health is faced with the possible emergence of a reductionist genomic emphasis, beyond socio-cultural influences. Under such circumstances, the main focus of public health interventions would shift towards a genomic approach to "individuals" and their "families", to the detriment of their consecrated object - "populations", thereby moving away from the current central priority of efforts (and resources aimed at reducing ill-health due to socioeconomic inequalities. Even admitting the benefits of genetic knowledge, a new eugenic practice may emerge from the availability of genetic tests on the marketplace aimed at individuals that can afford to consume them.

  9. Variabilidad genética de Moniliophthora perniciosa (Stahel Aime y Phillips-Mora, comb. nov. (Agaricales - Marasmiaceae en variedades de cacao (Theobroma cacao L.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Osorio Solano Carolina

    2012-11-01

    Full Text Available

    Moniliophthora perniciosa, agente causante de la 'escoba de bruja' en cacao (Theobroma cacao, presen- ta una elevada variabilidad genética y discrepancias en su taxonomía y es una de las enfermedades más importantes en plantaciones cacaoteras que ocasiona pérdidas económicas a nivel mundial cer- canas a 70%, y de 40% a nivel nacional. La caracterización de la diversidad genética de los biotipos es importante para la ejecución de proyectos encaminados al manejo de este patógeno y el desarrollo de materiales resistentes de cacao. En este estudio se analizaron 12 aislamientos del hongo obtenidos de diferentes materiales de cacao. Cada una de las muestras se evaluó con marcadores moleculares que tienen como blanco una región del ADN ribosomal (ADNr nuclear conocida como ITS (Internal Trans- cribed Spacer, una región intergénica (IGS-1 y cinco secuencias simples repetidas (SSR. El marcador IGS-1 permitió la determinación del biotipo C, no obstante se encontró una variabilidad genética evi- dente dentro de este biotipo, aún no registrada. El análisis de la diversidad genética de M. perniciosa por medio de marcadores microsatélite arrojó un valor total de 0.4260, una heterocigosidad total de

    0.6143 y un Indice de información polimórfica (PIC de 0.3407, valores considerados de rango medio a

    alto para los aislamientos estudiados y que estiman la variabilidad genética presente en M. perniciosa.

  10. Variabilidad genética de Moniliophthora perniciosa (Stahel Aime y Phillips-Mora, comb. nov. (Agaricales - Marasmiaceae en variedades de cacao (Theobroma cacao L.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Carolina Osorio-Solano

    2012-04-01

    Full Text Available Moniliophthora perniciosa, agente causante de la ‘escoba de bruja’ en cacao (Theobroma cacao, presenta una elevada variabilidad genética y discrepancias en su taxonomía y es una de las enfermedades más importantes en plantaciones cacaoteras que ocasiona pérdidas económicas a nivel mundial cercanas a 70%, y de 40% a nivel nacional. La caracterización de la diversidad genética de los biotipos es importante para la ejecución de proyectos encaminados al manejo de este patógeno y el desarrollo de materiales resistentes de cacao. En este estudio se analizaron 12 aislamientos del hongo obtenidos de diferentes materiales de cacao. Cada una de las muestras se evaluó con marcadores moleculares que tienen como blanco una región del ADN ribosomal (ADNr nuclear conocida como ITS (Internal Transcribed Spacer, una región intergénica (IGS-1 y cinco secuencias simples repetidas (SSR. El marcador IGS-1 permitió la determinación del biotipo C, no obstante se encontró una variabilidad genética evidente dentro de este biotipo, aún no registrada. El análisis de la diversidad genética de M. perniciosa por medio de marcadores microsatélite arrojó un valor total de 0.4260, una heterocigosidad total de 0.6143 y un índice de información polimórfica (PIC de 0.3407, valores considerados de rango medio a alto para los aislamientos estudiados y que estiman la variabilidad genética presente en M. perniciosa.

  11. The GenABEL Project for statistical genomics.

    Science.gov (United States)

    Karssen, Lennart C; van Duijn, Cornelia M; Aulchenko, Yurii S

    2016-01-01

    Development of free/libre open source software is usually done by a community of people with an interest in the tool. For scientific software, however, this is less often the case. Most scientific software is written by only a few authors, often a student working on a thesis. Once the paper describing the tool has been published, the tool is no longer developed further and is left to its own device. Here we describe the broad, multidisciplinary community we formed around a set of tools for statistical genomics. The GenABEL project for statistical omics actively promotes open interdisciplinary development of statistical methodology and its implementation in efficient and user-friendly software under an open source licence. The software tools developed withing the project collectively make up the GenABEL suite, which currently consists of eleven tools. The open framework of the project actively encourages involvement of the community in all stages, from formulation of methodological ideas to application of software to specific data sets. A web forum is used to channel user questions and discussions, further promoting the use of the GenABEL suite. Developer discussions take place on a dedicated mailing list, and development is further supported by robust development practices including use of public version control, code review and continuous integration. Use of this open science model attracts contributions from users and developers outside the "core team", facilitating agile statistical omics methodology development and fast dissemination.

  12. The GenABEL Project for statistical genomics

    Science.gov (United States)

    Karssen, Lennart C.; van Duijn, Cornelia M.; Aulchenko, Yurii S.

    2016-01-01

    Development of free/libre open source software is usually done by a community of people with an interest in the tool. For scientific software, however, this is less often the case. Most scientific software is written by only a few authors, often a student working on a thesis. Once the paper describing the tool has been published, the tool is no longer developed further and is left to its own device. Here we describe the broad, multidisciplinary community we formed around a set of tools for statistical genomics. The GenABEL project for statistical omics actively promotes open interdisciplinary development of statistical methodology and its implementation in efficient and user-friendly software under an open source licence. The software tools developed withing the project collectively make up the GenABEL suite, which currently consists of eleven tools. The open framework of the project actively encourages involvement of the community in all stages, from formulation of methodological ideas to application of software to specific data sets. A web forum is used to channel user questions and discussions, further promoting the use of the GenABEL suite. Developer discussions take place on a dedicated mailing list, and development is further supported by robust development practices including use of public version control, code review and continuous integration. Use of this open science model attracts contributions from users and developers outside the “core team”, facilitating agile statistical omics methodology development and fast dissemination. PMID:27347381

  13. SALOME PLATFORM and TetGen for Polyhedral Mesh Generation

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    Lee, Sang Yong; Park, Chan Eok; Kim, Shin Whan [KEPCO E and C Company, Inc., Daejeon (Korea, Republic of)

    2014-05-15

    SPACE and CUPID use the unstructured mesh and they also require reliable mesh generation system. The combination of CAD system and mesh generation system is necessary to cope with a large number of cells and the complex fluid system with structural materials inside. In the past, a CAD system Pro/Engineer and mesh generator Pointwise were evaluated for this application. But, the cost of those commercial CAD and mesh generator is sometimes a great burden. Therefore, efforts have been made to set up a mesh generation system with open source programs. The evaluation of the TetGen has been made in focusing the application for the polyhedral mesh generation. In this paper, SALOME will be evaluated for the efforts in conjunction with TetGen. In section 2, review will be made on the CAD and mesh generation capability of SALOME. SALOME and TetGen codes are being integrated to construct robust polyhedral mesh generator. Edge removal on the flat surface and vertex reattachment to the solid are two challenging tasks. It is worthwhile to point out that the Python script capability of the SALOME should be fully utilized for the future investigation.

  14. Cosmosperma polyloba gen. et sp. nov., a seed plant from the Upper Devonian of South China

    Science.gov (United States)

    Wang, Deming; Liu, Le; Meng, Meicen; Xue, Jinzhuang; Liu, Tuo; Guo, Yun

    2014-08-01

    Seed plants with ovules were abundant in the Late Devonian of Euramerica and they contribute significantly to our understanding of their early history. However, coeval ovules have been scarce in other regions of the world. Specimens of the seed plant Cosmosperma polyloba gen. et sp. nov. Wang et al. were recently obtained from the Upper Devonian (Famennian) Wutong Formation, at Fanwan Village, Changxing County, Zhejiang Province, China. This new seed plant has cupulate ovules, the uniovulate cupules with up to 16 distal segments and with minute spines on the outer surface, synangiate pollen organs bearing six to eight microsporangia fused only at the base, and planate and highly dissected pinnules in alternate arrangement. It differs from other Devonian seed plants mainly in the organization and position of the uniovulate and ornamented cupule, and in the highly dissected pinnules. Cosmosperma Wang et al. represents the first Devonian ovules recovered from China or eastern Asia and further illustrates the diversity of early spermatophytes. As for the Late Devonian seed plants, it is suggested that the pollen organs are synangiate and simple in organization, and the branches and leaves are generally planate.

  15. Pantanalinema gen. nov. and Alkalinema gen. nov.: novel pseudanabaenacean genera (Cyanobacteria) isolated from saline-alkaline lakes.

    Science.gov (United States)

    Vieira Vaz, Marcelo Gomes Marçal; Genuário, Diego Bonaldo; Andreote, Ana Paula Dini; Malone, Camila Francieli Silva; Sant'Anna, Célia Leite; Barbiero, Laurent; Fiore, Marli Fátima

    2015-01-01

    The genus Leptolyngbya Anagnostidis & Komárek (1988) was described from a set of strains identified as 'LPP-group B'. The morphology within this group is not particularly informative and underestimates the group's genetic diversity. In the present study, two new pseudanabaenacean genera related to Leptolyngbya morphotypes, Pantanalinema gen. nov. and Alkalinema gen. nov., are described under the provisions of the International Code of Nomenclature for Algae, Fungi and Plants, based on a polyphasic approach. Pantanalinema gen. nov. (type species Pantanalinema rosaneae sp. nov.) has sheaths and trichomes with slight gliding motility, which distinguish this genus from Alkalinema gen. nov. (type species Alkalinema pantanalense sp. nov.), which possesses trichomes arranged in an ornate (interwoven) pattern. 16S rRNA gene sequences of strains of Pantanalinema and Alkalinema exhibited low identity to each other (≤91.6 %) and to other sequences from known pseudanabaenacean genera (≤94.3 and 93.7 %, respectively). In a phylogenetic reconstruction, six sequences from strains of Pantanalinema and four from strains of Alkalinema formed two separate and robust clades (99 % bootstrap value), with the genera Oculatella and Phormidesmis, respectively, as the closest related groups. 16S-23S rRNA intergenic spacer sequences and secondary structures of strains of Pantanalinema and Alkalinema did not correspond to any previous descriptions. The strains of Pantanalinema and Alkalinema were able to survive and produce biomass at a range of pH (pH 4-11) and were also able to alter the culture medium to pH values ranging from pH 8.4 to 9.9. These data indicate that cyanobacterial communities in underexplored environments, such as the Pantanal wetlands, are promising sources of novel taxa. PMID:25351877

  16. Detección de una mutación puntual en el gen receptor Ryanodina (Ryr 1 en cerdos criollos colombianos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Darwin Y Hernández

    2008-12-01

    Full Text Available El síndrome de estrés porcino (PSS es una enfermedad hereditaria monogénica recesiva relacionada con el gen receptor ryanodina (Ryr1. Utilizando PCR-SSCP y PCR-RFLP se tipificaron genéticamente 14 individuos de cerdos comerciales con el rasgo sindactilia (Casco de Mula-CM, 21 San Pedreños -SP y 100 Zungos- ZN. Las razas CM y SP tuvieron las mismas frecuencias alélicas (F(H = 0.79 y F(h = 0.21, mientras que en los cerdos ZN no se encontró el alelo recesivo (h. La heterocigosidad (He fue de 0.28% para los cerdos CM y 0.23% para los SP. La He para la muestra poblacional fue de 0.066.

  17. Entrenamiento y evaluación de una competencia genérica para los títulos de grado universitarios

    OpenAIRE

    Rodríguez, Margarita; Gutiérrez, Juan J.; Beltrán, Juan F.; Conradi, Mercedes

    2011-01-01

    Este trabajo surge ante la necesidad de entrenar y evaluar una competencia genérica en la materia de Zoología del Grado de Biología “Solidez en los conocimientos básicos de la profesión”. Consideramos que es fundamental que los estudiantes adquieran conocimientos suficientes para valorar la importancia de los aspectos genéricos que poseen los animales tales como, morfología, anatomía, histología, fisiología, embriología, etología y ecología. Al ser una asignatura difícil y poco atractiva para...

  18. A Frequency Diverse Gen2 RFID System with Isolated Continuous Wave Emitters

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Hsin-Chin Liu

    2007-09-01

    Full Text Available The “Gen2” specification for UHF passive RFID systems released by EPCglobal has become an intense research interest. A Gen2 tag derives its power from the RF wave emitted by a Gen2 RFID reader and responds its modulated backscatter signals to the reader. Due to the large propagation loss, the accessible range of a Gen2 tag is hence limited. Moreover, the readability of a Gen2 tag is often influenced by the multipath fading problem. In order to mitigate the problems, a multi-carrier UHF passive RFID system utilizing the frequency diverse backscatter ability of a Gen2 tag is proposed in a prior work. In this work, a thorough analysis of the system is given. Especially, the appropriate powers of the transceiver and CWEs are derived to make the system more feasible in practical applications.

  19. Búsqueda de genes de resistencia al pasador del fruto en poblaciones segregantes de tomate

    OpenAIRE

    Diana Milena Rodríguez Mora; Jhon Fredy Betancur-Pérez; Franco Alirio Vallejo Cabrera; Juan Carlos Vaca-Vaca; Karina López-López

    2010-01-01

    Las estrategias de mejoramiento genético para encontrar resistencia al pasador del fruto, Neoleucinodes elegantalis, en tomate, Solanum lycopersicum L. se han basado en métodos tradicionales de introgresión genética por medio de retrocruzamiento. Sin embargo este proceso es largo y dispendioso. Debido a esta problemática, se utilizó la técnica molecular cDNA-AFLP para identificar genes involucrados en la resistencia a esta plaga en poblacione...

  20. Fusion of the upstream vpu sequences to the env of simian human immunodeficiency virus (SHIVKU-1bMC33) results in the synthesis of two envelope precursor proteins, increased numbers of virus particles associated with the cell surface and is pathogenic for pig-tailed macaques

    International Nuclear Information System (INIS)

    Previous studies have shown that the gene coding for the Vpu protein of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) is 5' to the env gene, is in a different reading frame, and overlaps the env by 90 nucleotides. In this study, we examined the processing of the Env protein as well as the maturation and infectivity of a virus (SHIVVpenv) in which a single nucleotide was removed at the vpu-env junction, fusing the first 162 bases of vpu to the env ORF. Pulse-chase analysis revealed that SHIVVpenv-infected cells gave rise to two precursor glycoprotein species (gp160 and gp175). Immune precipitation results also revealed that an anti-Vpu serum could immune precipitate the gp175 precursor, suggesting that the amino-terminal Vpu sequence was fused to the Env protein. Growth curves revealed that the SHIVVpenv-inoculated cultures released approximately three times more p27 into the culture medium than parental SHIVKU-1bMC33. Electron microscopy revealed that while both viruses matured at the cell plasma membrane, significantly higher quantities of virus particles were cell associated on SHIVVpenv-infected cells compared to cultures inoculated with parental SHIVKU-1bMC33. Furthermore, virus was observed maturing into intracellular vesicles of SHIVVpenv-infected cells. To assess the pathogenicity of SHIVVpenv, three pig-tailed macaques were inoculated with the SHIVVpenv and monitored for 6 months for CD4+ T cell levels, viral loads, and the stability of the deletion at the vpu-env junction. Our results indicated that SHIVVpenv caused a severe CD4+ T cell loss in all three macaques within weeks of inoculation. Sequence analysis of the vpu gene analyzed from sequential PBMC samples derived from macaques revealed that this mutation was stable during the period of rapid CD4+ T cell loss. Sequence analysis showed that with increasing time of infection, the one base pair deletion was repaired in all three macaques inoculated with SHIVVpenv with the reversion occurring at 10

  1. Crucigrama de conceptos generales de Genética. Nivel semi-avanzado.

    OpenAIRE

    Cross, Ismael; Rebordinos, Laureana

    2012-01-01

    El archivo es un ejercicio desarrollado con JCross en Hotpotatoes para que los alumnos prueben e identifiquen su nivel con respecto a cuestiones de Genética, conceptos, técnicas, características del ADN, etc. El ejercicio permite obtener pistas para completar el crucigrama y de esta manera finalizar el mismo habiendo asimilado o aprendido conceptos ya sabidos o nuevos de Genética. El crucigrama contiene cerca de 40 definiciones de Genética.

  2. Hist??ria natural de les malalties gen??tiques mendelianes i complexes

    OpenAIRE

    Lao Grueso, Oscar, 1976-

    2004-01-01

    Las enfermedades gen??ticas se clasifican t??picamente en dos grandes grupos: las enfermedades mendelianas y las enfermedades complejas. Mientras que las enfermedades mendelianas se caracterizan por ser de baja frecuencia en la poblaci??n y estar causadas por mutaciones en un gen particular, las enfermedades complejas son el principal problema sanitario en los pa??ses desarrollados y se encuentran producidas por la interacci??n de factores ambientales y factores gen??ticos. En este caso no se...

  3. Análisis molecular del gen TPSAB1, un gen polimórfico

    OpenAIRE

    Hernández Hernández, Laura

    2013-01-01

    [ES]Introducción: La triptasa es una serin-proteasa relacionada con la tripsina. El término triptasa comprende al menos cuatro proteasas diferentes: α, ß, γ y δ, que presentan diferencias en cuanto a sus propiedades enzimáticas. Las funciones de esta proteína no han sido completamente dilucidadas, aunque se ha implicado en fenómenos inflamatorios, protección contra la infección y otros fenómenos inmunológicos. La estructura de esta proteína es tetramérica y los genes que las codifican se encu...

  4. El envío de indios americanos a la Península Ibérica: aspectos legales (1492-1542

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Esteban MIRA CABALLOS

    2009-12-01

    Full Text Available RESUMEN: En este presente artículo ofrecemos por primera vez una sistematización sobre la legislación existente en torno a la trata de indios americanos con destino a los mercados esclavistas de la Península Ibérica. Se trata sin duda de un trabajo sumamente novedoso que aporta nueva luz a un aspecto de la Historia Moderna de España que ha pasado casi desapercibido hasta la fecha para la historiografía más reciente. La conclusión principal que se puede extraer de este trabajo es la negativa de la Corona -salvo en los dubitativos momentos iniciales- a que se trajesen indios esclavos a la Península. No obstante, esta legislación prohibitiva sólo sirvió para que los envíos se ralentizaran sin erradicar totalmente una trata que siempre encontró las formas de continuar de una manera más o menos fraudulenta.ABSTRACT: For the first time the present article offers us a systematization about the existing laws concerning the American indians trade with the Iberian Peninsula slaves markets. Undoubtledly, it consists of an extremely original work which casts light on one aspect of the Spanish early modern history that has gone unnoticed to the recent historiography. The main conclusion to be drawn from this work is the Crown's denial for the Indian slaves to be brought, except for the doubts arisen at the beginning. This prohibitive laws only served to slow down the slave shipment without eradicate this practice that always founds to continue new forms, more or less fraudulent.

  5. Evaluation of moisture and heat transport in the fast-response building-resolving urban transport code QUIC EnvSim

    Science.gov (United States)

    Briggs, Kevin A.

    QUIC EnvSim (QES) is a complete building-resolving urban microclimate modeling system developed to rapidly compute mass, momentum, and heat transport for the design of sustainable cities. One of the more computationally intensive components of this type of modeling system is the transport and dispersion of scalars. In this paper, we describe and evaluate QESTransport, a Reynolds-averaged Navier-Stokes (RANS) scalar transport model. QESTransport makes use of light-weight methods and modeling techniques. It is parallelized for Graphics Processing Units (GPUs), utilizing NVIDIA's OptiX application programming interfaces (APIs). QESTransport is coupled with the well-validated QUIC Dispersion Modeling system. To couple the models, a new methodology was implemented to efficiently prescribe surface flux boundary conditions on both vertical walls and flat surfaces. In addition, a new internal boundary layer parameterization was introduced into QUIC to enable the representation of momentum advection across changing surface conditions. QESTransport is validated against the following three experimental test cases designed to evaluate the model's performance under idealized conditions: (i) flow over a step change in moisture, roughness, and temperature, (ii) flow over an isolated heated building, and (iii) flow through an array of heated buildings. For all three cases, the model is compared against published simulation results. QESTransport produces velocity, temperature, and moisture fields that are comparable to much more complex numerical models for each case. The code execution time performance is evaluated and demonstrates linear scaling on a single GPU for problem sizes up to 4.5 x 4.5 km at 5 m grid resolution, and is found to produce results at much better than real time for a 1.2 x 1.2 km section of downtown Salt Lake City, Utah.

  6. Seleção de genótipos parentais de acerola com base na divergência genética multivariada

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    CARPENTIERI-PÍPOLO VALÉRIA

    2000-01-01

    Full Text Available Este trabalho teve por objetivo identificar e selecionar genótipos parentais de acerola (Malpighia emarginata L. adequadas a programas de melhoramento genético. Nove caracteres quantitativos de maior importância agronômica foram usados para determinação da distância genética e formação de grupos similares de acessos. O agrupamento pelo método de Tocher, a partir das distâncias generalizadas de Mahalanobis, possibilitou a divisão de 14 genótipos em três grupos. Com base na divergência genética e no caráter agronômico-chave (teor de vitamina C, destacaram-se como mais promissores os cruzamentos dos genótipos: AM Mole pertencente ao grupo III, com os genótipos PR AM, N° 18, PR 17, PR 16, Eclipse, AM 22 e Dominga, todos pertencentes ao grupo I.

  7. Construction of DNA vaccine expressing codon-modified HIV-1 consensus env gene derived from subtype CRF01_AE infected individuals in China%HIV-1中国流行株CRF01_AE env基因改造及其重组DNA疫苗的构建

    Institute of Scientific and Technical Information of China (English)

    陈丹瑛; 汪孟冉; 何小周; 叶景荣; 余双庆; 李秦剑; 徐柯; 曾毅; 冯霞

    2014-01-01

    Objective To construct a DNA vaccine containing codon-modified HIV-1 consensus env gene which will be a candidate vaccine in multiple vector-based therapeutic AIDS vaccine strategy.Methods HIV-1 CRF01_AE env genes were amplified using subtype-specific primmer sets and cloned to pcDNA 3.1.The consensus sequence was acquired by alignment of all the env sequences with software.Then codons of the consensus env sequence were modified according to mammalian codon usage.The modified env gene mod.AE env was cloned into pVR vector to get DNA vaccine pVR-mod.AE env.The expression level of wild type and codon-modified env gene was analyzed by Western Blot assay.Results Phylogenetic analysis of the full-length env nucleotide sequences confirmed that all 32 isolates were grouped within CRF01_AE.The DNA vaccine expressing the codon-modified consensus env gene derived from these 32 sequences was constructed successfully.The codon modification increased the expression level of Env protein significantly.Conclusion The codon modification of CRF01_AE env gene and construction of DNA vaccine expressing this gene was successful.%目的 构建表达含有密码子优化的HIV-1 CRF01_AE亚型env基因的DNA疫苗,为多载体艾滋病治疗性疫苗的应用提供候选疫苗.方法 对HIV-1感染者血液样本进行型别分析,分型得到的AE亚型标本采用亚型特异性引物克隆env基因,通过序列比对获得其共有序列,对该序列按照哺乳动物密码子使用的偏嗜性进行优化,将人工合成的优化基因克隆至pVR载体,构建DNA疫苗.通过Western Blot方法比较优化前后env基因的表达.结果 成功获得32条具有完整的开放性阅读框的env克隆,型别分析确认均为CRF01_AE亚型.成功对其共有序列进行了优化、合成并构建了DNA疫苗pVR-mod.AE env,该疫苗与野生型的env基因(wt.AE env)相比可以高水平表达env基因,且不依赖Rev的存在.结论 对HIV-1中国流行株CRF01_AE env基因的优化改

  8. Een Orobanche als graanadventief

    NARCIS (Netherlands)

    Land, van der J.

    1964-01-01

    An Orobanche growing on Matricaria matricarioides (Less.) Porter was collected near a grain warehouse at Rotterdam harbour in 1935. The specimen was originally identified as O. minor Sm., but upon closer examination it appeared to be O. cernua Loefl. This is the first time that a species of this gen

  9. Reflexos da interação genótipo X ambiente e suas implicações nos ganhos de seleção em genótipos de feijão (Phaseolus vulgaris L. Reflexes of the interaction genotype X environment and their implications in the gains of selection in genotypes of bean (Phaseolus vulgaris L.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Jefferson Luís Meirelles Coimbra

    1999-09-01

    Full Text Available A importância das leguminosas de grãos na alimentação humana, principalmente do feijão preto (Phaseolus vulgaris, tem estimulado os melhoristas a selecionar genótipos com alto potencial de rendimento de grãos e com adaptabilidade às diferentes condições de cultivo do sul do Brasil. O presente trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar os reflexos da interação genótipo x ambiente e suas implicações nos ganhos genéticos com diferentes critérios de seleção. Os resultados revelaram que o componente da interação genótipo x ambiente superestima a predição dos parâmetros genéticos, como por exemplo a variância genética e a herdabilidade. As diferenças observadas entre estas estimativas parecem ocorrer devido à alta percentagem da parte complexa da interação. Além disto, os ganhos genéticos obtidos com a seleção direta foram sempre superiores à resposta indireta. Comparativamente, o par de ambientes 1x3 revelou uma resposta correlacionada inferior e de sinal contrário às demais estimativas para os outros pares de ambientes estudados neste trabalho. O primeiro ambiente foi o que mais acumulou a interação genótipo x ambiente. Portanto, pode ser concluído que o componente da interação tem grande relevância nas estimativas dos ganhos genéticos, evidenciando que essa influência deva ser considerada na seleção e na recomendação de genótipos específicos nos programas de melhoramento genético da cultura do feijoeiro.The importance of grains of legume plants for human feeding, specially black beans (Phaseolus vulgaris L., has stimulated the breeders to select genotypes with high grains yield potential and wide adaptability to different conditions of cultivation in southern Brazil. The present work aimed at evaluating the reflexes of the genotype x environment interaction and its implications in the genetic gains of different selection approaches. The results revealed that the component of the

  10. Distancias genéticas en poblaciones del NOA

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Acreche, Noemí

    1996-01-01

    Full Text Available La mayor parte de los trabajos realizados en nuestro país sobre polimorfismos hematológicos, abordan la necesaria descripción de las poblaciones. Se pone de relieve la importancia de encarar estudios, en base a la valiosa información publicada, que vinculen los grupos con técnicas que permitan realizar nuevas inferencias sobre sus relaciones. Conocidas en gran medida en cuanto a sus manifestaciones culturales, pueden aportar desde lo genético a la comprensión de los procesos microevolutivos ocurridos en una región. Para el NOA, se ha considerado la presencia de comunidades aborígenes incluídas en cuatro familias lingüísticas. Se tendrán en cuenta estos complejos como representativos de afinidades que se establecen a partir de estrechas relaciones entre las etnias, no sólo por la lengua, sino también por las características de sus sistemas productivos, religiosidad y organización. En base a las frecuencias génicas publicadas correspondientes a los siguientes alelos: I*A, I*B, I*O; M, N, S, s; Dia , Dib; P1, P2; C, c; D, d, E, e; Le, le; Fya, Fyb; Jka, Jkb; K y k se construyeron tablas de frecuencias. Se estimaron los coeficientes de distancias genéticas que fueron analizados y posteriormente incluídos en la construcción de un fenograma de los grupos de estudio, mediante agrupaciones (Sahn Cluster secuenciales, aglomerativas, jerárquicas y anidadas. De acuerdo a la información recopilada de las frecuencias de los 25 alelos estudiados en trece poblaciones de aborígenes del NOA y Paraguay, las distancias genéticas obtenidas reflejan los caracteres lingüístico-culturales.

  11. Caracterização bromatológica e agronômica de genótipos de milho para produção de silagem

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    V.C. Vieira

    2013-06-01

    Full Text Available O objetivo deste trabalho foi avaliar as características bromatológicas e agronômicas dos genótipos de milho para a produção de silagem dos cultivares do Ensaio Centro Superprecoce da Rede Nacional de Genótipos de Milho, bem como avaliar se a base genética (híbridos simples, duplos, tripos, intervarietais e variedades cultivadas ou a dureza dos grãos (duro, semiduro e dentado mole alteram a indicação de cultivares de milho para silagem. O experimento foi realizado na área experimental da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (campus Dois Vizinhos. Os trinta e dois genótipos avaliados foram colhidos quando os grãos encontravam-se no estádio pastoso a farináceo, ensilados em microssilos de PVC e desensilados após 53 dias. Avaliou-se a relação entre as bases genéticas, a dureza do grão e as características individuais dos genótipos quanto à aptidão para a produção de silagem. Não se verificaram diferenças significativas entre os contrastes formados entre as bases genéticas, bem como a dureza dos grãos, para os caracteres estudados. Porém, foi possível identificar genótipos superiores para a produção de silagem pela produção de matéria seca pelos genótipos AS 1555 YG, AS 1572 YG, 30A37, 30A77, 20A78, Dx 908, Dx 603, 2A550, 2B433, AL2007A, Embrapa 1F640, PRE 22T10, PREXT0109, PRE 22D11, DKB330 YG (Test.

  12. Cleaning the GenBank Arabidopsis thaliana data set

    DEFF Research Database (Denmark)

    Korning, Peter G.; Hebsgaard, Stefan M.; Rouze, Pierre;

    1996-01-01

    extracted a data set from the A. thaliana entries in GenBank. A number of simple `sanity' checks, based on the nature of the data, revealed an alarmingly high error rate. More than 15% of the most important entries extracted did contain erroneous information. In addition, a number of entries had directly......Data driven computational biology relies on the large quantities of genomic data stored in international sequence data banks. However, the possibilities are drastically impaired if the stored data is unreliable. During a project aiming to predict splice sites in the dicot Arabidopsis thaliana, we...

  13. TrayGen: Arranging objects for exhibition and packaging

    KAUST Repository

    Yang, Yongliang

    2013-10-01

    We present a framework, called TrayGen, to generate tray designs for the exhibition and packaging of a collection of objects. Based on principles from shape perception and visual merchandising, we abstract a number of design guidelines on how to organize the objects on the tray for the exhibition of their individual features and mutual relationships. Our framework realizes these guidelines by analyzing geometric shapes of the objects and optimizing their arrangement. We demonstrate that the resultant tray designs not only save space, but also highlight the characteristic of each object and the inter-relations between objects. © 2013 The Eurographics Association and John Wiley & Sons Ltd.

  14. Diversidad genética y contenido de carotenos totales en accesiones de yuca (Manihot esculenta Crantz

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ana Cruz Morillo C.

    2011-04-01

    Full Text Available La yuca (Manihot esculenta Crantz es un arbusto perenne cultivado en África, América Latina y el Sureste asiático, cuya raíz constituye una fuente importante de energía en la dieta humana en países tropicales. Los carotenoides son pigmentos naturales que se encuentran ampliamente distribuidos en la naturaleza. Se reconoce que aproximadamente cincuenta de ellos tienen actividad provitamina A, siendo b-caroteno el de mayor eficiencia para su conversión en vitamina A. El estudio de la variabilidad genética es un procedimiento útil para fortificar, enriquecer o incrementar el contenido de nutrientes de los alimentos o cultivos, entre ellos los carotenos en raíz de yuca mediante procesos de selección y recombinación en programas de mejoramiento que permitan identificar genotipos superiores. En el presente estudio, a partir de la evaluación de la diversidad genética, se generó un dendrograma de accesiones de yuca en el cual se formaron seis grupos con 68% de similitud. La heterocigosidad promedio observada fue de Ht = 0.559. Los análisis de regresión y correlación entre el contenido de carotenos totales y los datos moleculares mostraron que los marcadores que se encuentran correlacionados con altos contenidos de carotenos pertenecen al grupo de ligamiento D del mapa molecular de yuca.

  15. U.S. Near-Zero Emissions Program: CCS - Clean Coal R&D, FutureGen, & Demonstrations

    Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

    K Der, Victor [Department of Energy (United States)

    2008-07-15

    In this paper a projection of the CO{sub 2} emissions in the United States is shown; the technical challenges in the capture and sequestration of the CO{sub 2}; what is understood by carbon sequestration; the three elements of the capture and CO{sub 2} storage that are: capture, transport, and storage; the FutureGen project; plants of coal combustion with sequestration, and at the end an initiative for the generation with clean coal is presented. [Spanish] En esta ponencia se muestra una proyeccion de las emisiones de CO{sub 2} en los Estados Unidos; los retos tecnicos en la captura y secuestro de CO{sub 2}; que entendemos por secuestro de carbono; los tres elementos de la captura y almacenamiento de CO{sub 2} que son captura, transporte y almacenamiento; el proyecto FutureGen; plantas de combustion de carbon con secuestro, y al final se presenta una iniciativa para la generacion con carbon limpio.

  16. Modelos de argumentación en ciencias: una aplicación a la genética

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Dora Cardona Rivas

    2009-01-01

    Full Text Available 1. Objetivo: Caracterizar los modelos argumentativos que utilizan estudiantes de biología en la solución de problemas de genética, desde las categorías modelo conceptual, estructura argumentativa y comportamiento discursivo. 2. Materiales y Métodos. Realizamos un estudio cualitativo, con metodología de tipo descriptiva, en el que analizamos las respuestas escritas y orales de 4 estudiantes. Como instrumentos para la recolección de la información diseñamos 7 problemas en cuya solución estaban implicados los modelos de herencia de Lamarck y de Mendel. Para el análisis de la información aplicamos los procedimientos del análisis de discurso y el análisis de contenido a los textos escritos y orales. 3. Resultados. En el momento de resolver problemas, las estudiantes con las que realizamos el estudio emplearon estructuras argumentativas restringidas, un comportamiento discursivo que se caracteriza por el uso frecuente de conectores de posibilidad y deícticos, y el uso de modelos de herencia que han precedido al modelo molecular. Los modelos argumentativos caracterizados se constituyen en la base para intervenciones didácticas en el campo de la Enseñanza de la Genética.

  17. Ambiente genético del gen blactx-m-12 en aislamientos hospitalarios de klebsiella pneumoniae

    OpenAIRE

    Celis Bustos, Yamile Adriana; Pulido Manrique, Ingrid Yamile; Valenzuela de Silva, Emilia María; Reguero Reza, María Teresa; Mantilla Anaya, José Ramón

    2009-01-01

    The blaCTX-M-12 gene’s genetic environmnt in Klebsiella pneumoniae hospital isolates Resumen: En Colombia se han detectado genes del grupo CTX-M-1 con alta frecuencia en aislamientos de Klebsiella pneumoniae causantes de infección intrahospitalaria. El conocimiento de los factores genéticos que pueden favorecer la diseminación de estos genes entre especies bacterianas es un aspecto importante para el control de la resistencia. En este estudio se identificaron los plásmidos portadores del ge...

  18. Ambiente genético del Gen blaCTX-M-12 en aislamientos hospitalarios de Klebsiella pneumoniae

    OpenAIRE

    Yamile Adriana Celis Bustos; Ingrid Yamile Pulido Manrique; Emilia María Valenzuela de Silva; María Teresa Reguero Reza; José Ramón Mantilla Anaya

    2009-01-01

    The blaCTX-M-12 gene’s genetic environmnt in Klebsiella pneumoniae hospital isolates Resumen: En Colombia se han detectado genes del grupo CTX-M-1 con alta frecuencia en aislamientos de Klebsiella pneumoniae causantes de infección intrahospitalaria. El conocimiento de los factores genéticos que pueden favorecer la diseminación de estos genes entre especies bacterianas es un aspecto importante para el control de la resistencia. En este estudio se identificaron los plásmidos portadores del ge...

  19. Moureanthidium, gen.n. de Dianthidiini do Brasil (Hymenoptera, Megachilidae Moureanthidium, gen.n. de Dianthidiini from Brazil (Hymenoptera, Megachiliiae

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Danúncia Urban

    1995-01-01

    Full Text Available Moureanthidium, gen.n. is proposed for Dianthidium subarenarium Schwarz, 1933 and to include four new species of Anthidiine bees from Brazil, Moureanthidium paranaense, sp.n from Ponta Grossa, Paraná, Moureanthidium capixaba, sp.n. from Santa Teresa, Espírito Santo, Moureanthidium bahianum, sp.n. from Vitória da Conquista, Bahia and Moureanthidium catarinense, sp.n. from Seara, Santa Catarina. The males are characterized by the border of the seventh tergum strongly reflexed, densely hairy and with a pair of lateral projections and the third sternite with two spines or little projections at the middle, near the apex.

  20. Next gen wavelets down-sampling preserving statistics

    Science.gov (United States)

    Szu, Harold; Miao, Lidan; Chanyagon, Pornchai; Cader, Masud

    2007-04-01

    We extend the 2 nd Gen Discrete Wavelet Transform (DWT) of Swelden to the Next Generations (NG) Digital Wavelet Transform (DWT) preserving the statistical salient features. The lossless NG DWT accomplishes the data compression of "wellness baseline profiles (WBP)" of aging population at homes. For medical monitoring system at home fronts we translate the military experience to dual usage of veterans & civilian alike with the following three requirements: (i) Data Compression: The necessary down sampling reduces the immense amount of data of individual WBP from hours to days and to weeks for primary caretakers in terms of moments, e.g. mean value, variance, etc., without the artifacts caused by FFT arbitrary windowing. (ii) Lossless: our new NG_DWT must preserve the original data sets. (iii) Phase Transition: NG_DWT must capture the critical phase transition of the wellness toward the sickness with simultaneous display of local statistical moments. According to the Nyquist sampling theory, assuming a band-limited wellness physiology, we must sample the WBP at least twice per day since it is changing diurnally and seasonally. Since NG_DWT, like the 2 nd Gen, is lossless, we can reconstruct the original time series for the physicians' second looks. This technique of NG_DWT can also help stock market day-traders monitoring the volatility of multiple portfolios without artificial horizon artifacts.

  1. Métodos de análisis genéticos, espaciales y de conectividad en genética del paisaje

    OpenAIRE

    Tania Garrido-Garduño; Ella Vázquez-Domínguez

    2013-01-01

    La genética del paisaje tiene como objetivo evaluar la interacción de características del paisaje (es decir, montañas, corredores) y variables ambientales como temperatura o humedad con procesos microevolutivos como flujo genético, deriva génica o selección. Para ello, la genética del paisaje se apoya en métodos de análisis de otras disciplinas como genética de poblaciones, ecología del paisaje y estadística espacial, y cuenta además con métodos propios. En este trabajo explicamos qué es la g...

  2. Genética de poplaciones de Atta sexdens rubropilosa (Hymenoptera: Formicidae POPULATION GENETICS OF Atta sexdens rubropilosa (HYMENOPTERA: FORMICIDAE

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    LIRIANA BELIZÁRIO CANTAGALLI

    2013-04-01

    Full Text Available La variabilidad genética de las hormigas Atta sexdens rubropilosa colectadas en cinco lugares distintos de Brasil fueron evaluados por la técnica PCR-RAPD. Un total de 15 primers produjeron 148 fragmentos, de los cuales 123 fueron polimórficos, lo que corresponden al 83,11 %. La estimación de la diversidad genética por el índice de Shannon fue 0,3836 y el desviación estándar fue de ± 0,2335. Estos valores demuestran una alta diversidad genética. El valor de G ST fue 0,2372 y ΦPT = 0,184 lo que indica que las poblaciones están moderadamente diferenciadas y que el 82 % de la variación obtenida se produce dentro de las poblaciones. Aunque la prueba de Mantel ha demostrado una correlación entre la distancia genética y geográfica se observó que Ivatuba e Itambé (33,8 km tiene una pequeña distancia geográfica y la mayor distancia genética. La distancia inferior genética fue estimada para Maringá e Ivatuba pero estas localidades cuentan con una distancia geográfica pequeña (42,3 km, lo que indica que no hay barreras para el apareamiento entre los reproductores en estas poblaciones. El alto valor de polimorfismo (83,11 % y la capacidad de emparejamiento entre las poblaciones presentes en las regiones estudiadas, indican que esta especie de hormiga cortadora está bien adaptada a la región, y deben ser desarrollados programas integrados de control si se convierten en plagas.The genetic variability of Atta sexdens rubropilosa leaf-cutting ants collected from five brazilian localities was evaluated with PCR-RAPD technique. We used 15 primers producing 148 fragments of which 123 (83.11 % contained polymorphisms. The estimated Shannon index was 0.3836 ± 0.2335 showing that these ants possess high genetic diversity. The G ST value was 0.2372 and ΦPT = 0.184, indicating that the analyzed populations are moderately differentiated and 82 % of the variation obtained occur within populations. Although Mantel's test had shown correlation

  3. Interação genótipo-ambiente em cruzamentos de bovinos de corte Genotype by environment interaction on crossbreed beef cattle

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Rodrigo de Almeida Teixeira

    2006-08-01

    Full Text Available Dados de rebanhos bovinos comerciais foram analisados com o objetivo de estimar as interações dos efeitos genéticos com o ambiente que podem influenciar a avaliação de características de crescimento em rebanhos de animais puros e cruzados. O conjunto de dados analisado foi obtido a partir de animais das raças Hereford, Nelore e seus cruzamentos. As características em estudo foram os pesos à desmama e ao sobreano dos animais. As análises estatísticas foram realizadas pelo método dos quadrados mínimos e o modelo proposto incluiu os efeitos de região, grupo de contemporâneos dentro de região, mês de nascimento e sexo do bezerro, os efeitos lineares e quadráticos para a idade do bezerro e idade da vaca ao parto, ambas analisadas dentro de sexo, e os efeitos de grupo genético e da interação grupo genético × região. De modo geral, o desempenho de todos os grupos genéticos foi influenciado pelo efeito de região. Além disso, observou-se tendência de que o aumento da proporção de genes zebuínos promoveu diminuição na diferença de desempenho entre as regiões. Todos os genótipos foram beneficiados no ambiente menos restritivo, o que indica a existência de interação genótipo-ambiente e comprova a importância de que sistemas de cruzamento sejam realizados de forma a manter a adaptação das matrizes e de seus produtos.Data from Hereford and Nelore breeds and their crosses were used to estimate the effect of genotype and environment interaction on weaning and yearling weights. The statistical analyses were performed by the least-squares method using models that included region, contemporary group within region, month of birth and sex of the calf, linear and quadratic effects of age of the calf and age of the cow, both nested within sex, and the genetic group and genetic group × region interaction effects. In general, genetic groups were influenced by the region effect. Differences in performance between regions

  4. Interação genótipo x ambiente em genótipos de feijão-caupi semiprostrado via modelos mistos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Francisco Eduardo Torres

    2015-01-01

    Full Text Available A metodologia de modelos mistos (REML/BLUP tem sido empregada para estudar os efeitos da interação genótipo x ambiente (G x E em várias culturas, como: arroz, feijão, cana-de-açúcar, cajueiro e eucalipto, porém ainda não foi aplicada em feijão-caupi. Assim, o objetivo deste trabalho foi selecionar simultaneamente genótipos de feijão-caupi semiprostrado cultivados no Estado do Mato Grosso do Sul, via modelos mistos, que reúnam alta adaptabilidade, estabilidade e produtividade de grãos. Foram conduzidos quatro ensaios de valor de cultivo e uso com genótipos de genótipos de feijão-caupi nos anos de 2005 e 2006 em Aquidauana, Chapadão do Sul e Dourados. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos completos casualizados, com 20 genótipos e 4 repetições. Os parâmetros genéticos foram estimados pela metodologia REML/BLUP, e a seleção baseou-se no método da média harmônica do desempenho relativo dos valores genéticos (MHPRVG, em três estratégias: seleção com base no valor genético predito, tendo-se considerado o desempenho médio dos genótipos em todos os ambientes (sem efeito de interação ou o desempenho em cada ambiente (com efeito da interação; e seleção simultânea quanto à produtividade de grãos, estabilidade e adaptabilidade. Os genótipos BRS Paraguaçu, MNC99-542F-5 e MNC99-508G-1 podem ser cultivados em vários ambientes, pois reúnem alta produtividade de grãos, adaptabilidade e estabilidade. A herdabilidade da média dos genótipos apresentou magnitude variando de moderada a alta, fato que indica excelentes possibilidades para a seleção, permitindo acurácia seletiva de 82%.

  5. Caracterización genética de restos antiguos de poblaciones indígenas de Colombia, mediante diez loci con repeticiones cortas en tandem (STR's

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Alape J.

    2001-06-01

    Full Text Available En nuestros días interactúan lo ancestral y lo moderno, la eliminación y la conservación, lo antro-pológico y lo molecular, la acumulación de paradigmas o la postulación de hipótesis y el quehacercientífico; estamos en un momento de grandes y aceleradas transformaciones y búsquedas de locultural, lo genético y por qué no decirlo, lo social y económico. Todo ello incide significati-vamente en el medio natural y encontramos que al plantearse una diversidad genética, aparececierto tipo de preguntas encaminadas a dilucidar los procesos y transformaciones evolutivas quehan dado origen y distribución a las diferentes especies remanentes hoy sobre la tierra. Para darrespuesta a todo esto, es necesario implementar metodologías como los estudios de genéticamolecular con individuos vivos o recurriendo a los restos óseos o de tejidos que aún se conservan.

  6. Pseudolimia n. gen., a new monotypic genus for Limia heterandria Regan, 1913 (Teleostei: Poeciliidae)

    NARCIS (Netherlands)

    Poeser, Fred N.

    2002-01-01

    A new genus, Pseudolimia n. gen. is established for the South American Limia heterandria Regan, 1913. It is compared in an anatomical analysis with several nominal taxa of the tribe Poeciliini. Based on number and shape of the gonapophyses, Pseudolimia n. gen. is assigned to the tribe Poeciliini.

  7. Update History of This Database - GenLibi | LSDB Archive [Life Science Database Archive metadata

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available [ Credits ] BLAST Search Image Search Home About Archive Update History Contact us GenLibi Update... History of This Database Date Update contents 2014/03/25 GenLibi English archive site is open...base Database Description Download License Update History of This Database Site Policy | Contact Us Update

  8. Composición Musical a Través del Uso de Algoritmos Genéticos

    OpenAIRE

    Ezequiel Moldaver; Hernán Merlino; Enrique Fernández

    2014-01-01

    Este trabajo se enfocará en el uso de los algoritmos genéticos (AAGG) con el fin de mezclar armonías y melodías de forma que se genere una composición musical de buen sonido para el oído, lo que significa que el contexto de cada nota respaldará la sonoridad de la misma provocando que no se genere un efecto disonante de forma permanente, que se genere una disonancia momentánea es permisible ya que es parte de la misma música generar tensión a través de pequeños intervalos poco agradables al oí...

  9. Genética y Conducta en el Síndrome de Déficit Atencional e Hiperactividad:

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Francisco Aboitiz

    2006-07-01

    Full Text Available El síndrome de déficit atencional e hiperactividad es una condición de alta prevalencia entre niños y adultos, que puede afectar seriamente el desempeño escolar y laboral. En este artículo revisamos los aspectos genéticos de este síndrome y los interpretamos en función de una falla en el sistema de señalización dopaminérgica, que se caracteriza por un bajo coeficiente señal/ruido y una excesiva recaptación presináptica del neurotransmisor liberado.

  10. Composición Musical a Través del Uso de Algoritmos Genéticos

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ezequiel Moldaver

    2014-06-01

    Full Text Available Este trabajo se enfocará en el uso de los algoritmos genéticos (AAGG con el fin de mezclar armonías y melodías de forma que se genere una composición musical de buen sonido para el oído, lo que significa que el contexto de cada nota respaldará la sonoridad de la misma provocando que no se genere un efecto disonante de forma permanente, que se genere una disonancia momentánea es permisible ya que es parte de la misma música generar tensión a través de pequeños intervalos poco agradables al oído.

  11. Hacia una definición del arte genético y transgénico

    OpenAIRE

    Matewecki, Natalia

    2006-01-01

    Este trabajo se presenta como una introducción al proyecto de investigación en curso de la Beca de Perfeccionamiento en Investigación, Desarrollo Científico, Tecnológico y Artístico de la Universidad Nacional de La Plata. El arte genético y el arte transgénico plantean un trabajo multidisciplinario en el que participan artistas y científicos a la vez. Definir cada una de estas prácticas artísticas permitirá conocer y comprender las relaciones entre el arte y la ciencia en la actualidad, así c...

  12. Identificación genética de subpoblaciones de aedes aegypti en Cartagena de Indias – Colombia

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Malambo Dacia

    2011-09-01

    Full Text Available INTRODUCCIÓN: el mosquito Aedes aegypti es el principal vector de la fiebre Dengue (FD en ambientes urbanos y suburbanos enpaíses tropicales y subtropicales. Se estima que la FD infecta 50 millones de personas anualmente y más de quinientas milcontraen su forma más grave (PAHO 2008; Romano, 2010. En Colombia se notificaron 127.292 casos, 8.919 de dengue grave y 138muertes. El estudio de la variabilidad genética de una población de Ae. Aegypti permite identificar sub-poblaciones a través delespacio geográfico. Tal variación genética se ha relacionado con una expresión heterogénea en la capacidad vectorial del insectofrente a la FD debido a procesos de selección sobre serotipos virales circulantes aun a escala local.OBJETIVO: describir la variabilidad genética de Ae. Aegypti en Cartagena de Indias.MÉTODOS: estudio de corte transversal mediante un muestreo aleatorio por conglomerados que incluyó las 15 comunasadministrativas del distrito. 6300 viviendas fueron inspeccionadas mediante el protocolo de vigilancia entomológica dirigido alarvas de Ae. Aegypti. La implementación de las pruebas moleculares se realizó sobre 260 insectos de 36 sitios geográficosseleccionados al azar. La extracción del DNA genómico fue realizado mediante el método CTAB. La prueba RAPD PCR empleó losoligonucleótidos iniciadores: TTGCACCAACAGTCAATGTCTTCAGGTTC, CGTCTCAGTGATCCGGGGG y CGCCACAAGGGCCATGAACAG. Se realizó una electroforesis a los productos de amplificación RAPDs en un gel de agarosa al 1%, el cual fue conbromuro de etídio y fotodocumentado bajo luz UV. Las bandas obtenidas fueron asimiladas en una matriz binaria. Fueronutilizadas 1000 réplicas para obtener una matriz de distancia utilizando el paquete PHYLIP. El análisis filogenéticos se realizómediante el método de Neighbor-Joining y la visualización del árbol de consenso mediante el programa Tree view.RESULTADOS: 1361 viviendas fueron positivas a larvas del mosquito. Los perfiles

  13. Typical technology of mechanics on Gen-III passive NPPs and Gen-IV advanced supercritical light water reactors

    International Nuclear Information System (INIS)

    Full text: Technical requirements for Gen-III advanced nuclear power plants, which take passive reactors as the main body, were originally brought forward in American 'Advanced Light Water Reactor Utility Requirement Document' (ALWR-URD) in early 1990's. The primary characteristic of passive nuclear power plant is large amount of simplification to the original active safety systems, replacing or supplementing them with passive safety systems, which enhances safety and economy. However, the replacement of active safety systems by passive safety systems also brings about some mechanics that compel attention, typically, such as load-carrying capability evaluation for steel containment, in-vessel retention (IVR) of molten core debris, seismic design without OBE, thermo-hydraulic issues concerning with coupling between two-phase fluid and solid, etc. At the beginning of this century, six typical Gen-IV advanced reactor types (Sodium Cooled Fast Reactor, Supercritical Water-Cooled Reactor, etc.) were put forward. Among these types of reactors, Supercritical Water-Cooled Reactor adopts supercritical water as coolant and operates above the thermodynamic critical point of water by increasing temperature and pressure of the coolant, which makes the plant economic and efficient. However, this type of reactor also brings about some mechanical difficulties (e.g. pressure fluctuation caused by the supercritical fluid in the core, creep of materials working at high temperature, etc.) for the design of facility and components. In this paper, the issues mentioned above are outlined for further consideration. (author)

  14. Balanceo óptimo de la carga de artículos en máquinas inyectoras monocolor, usando Algoritmos Genéticos

    OpenAIRE

    Klenzi, Raúl O.; Fernández, Gustavo

    1999-01-01

    En el presente trabajo se pretende aplicar una alternativa derivada de la Inteligencia Artificial que son los Algoritmos Genéticos excelente metodología de exploración y explotación de grandes espacios de búsquedas. En éste caso concreto se los· utilizará como optimizadores, característica que los destaca sobre otras estrategias de optimización.- Se pretende minimizar la diferencia entre puntas de cuatro máquinas inyectoras de suelas en una fábrica de zapatillas, tarea ésta, que al moment...

  15. Molekularbiologische Analyse von Her2/neu-Nanostrukturen in unterschiedlichen Brustkrebszelllinien auf Gen- und Proteinebene basierend auf hochaufgelösten fluoreszenzmikroskopischen Darstellungen

    OpenAIRE

    Müller, Patrick

    2011-01-01

    Untersuchungen zur Her2/neu-Amplifikation und -Expression, die im Zusammenhang mit der Entstehung von Brustkrebs und seiner Diagnostik stehen, sind für eine zusätzliche Verfeinerung der Diagnoseparameter und damit einer Verbesserung der Therapieansätze von enormer Bedeutung. In dieser Arbeit wurden durch hochauflösende lichtmikroskopische Verfahren grundlegende Untersuchungen zu Her2/neu sowohl auf Gen-, als auch auf Proteinebene durchgeführt, um neue und unterstützende Ansätze für einen bess...

  16. Capítulo III: caracterización y evaluación de recursos genéticos del género Lycopersicon

    OpenAIRE

    Sierra Tulio Alberto; Osorio Erika Rocío; Vallejo Cabrera Franco Alirio

    1994-01-01

    Con el fin de determinar el potencial genético de 118 introducciones del género Lycopersicon se realizó la caracterización y evaluación, en el Centro Experimental de la Universidad Nacional Sede Palmira, utilizando los descriptores recomendados por el IBPGR (1981). Se utilizó el diseño experimental de Bloques al azar con dos repeticiones. La parcela experimental estuvo constituida por seis plantas. Se estudiaron nueve caracteres relacionados con la planta, diez caracteres relacionado...

  17. Parámetros genéticos del crecimiento y la reproducción en ganado cebú

    OpenAIRE

    Mario Pino Pérez de Utrera; Danilo Guerra Iglesias; Dianelys González-Peña

    2009-01-01

    Con el propósito de conocer las correlaciones genéticas entre los rasgos de crecimiento en toros y las características reproductivas en vacas cebú de Cuba, se utilizaron 9490 registros de toros que terminaron la prueba de comportamiento en pastoreo, a los cuales se les registró el peso final (PF) a los 18 meses de edad; así mismo se emplearon 13.575 registros de sus medio hermanas, a las que se les registró la edad a la primera inseminación (EPI), la edad al primer parto (EPP) y los servicios...

  18. Síndrome de Down hereditario poco común debido a la translocación robertsoniana 15/21: asesoramiento genético y reproductivo

    OpenAIRE

    Azevedo Moreira, L.M.; Damasceno Espirito Santo, L.; Fernandes Lacerda Carvalho, A.

    2013-01-01

    Los portadores de un reordenamiento que afecta al cromosoma 21 tienen un riesgo potencial de concepciones genéticamente desequilibradas que pueden dar origen a niños con síndrome de Down (SD). Los riesgos reproductivos de las parejas portadoras de una translocación robertsoniana equilibrada dependen de los cromosomas reordenados y del sexo del portador. Este artículo tiene como objetivo analizar la tendencia de segregación y reproductiva de una rara translocación 15/21 en cinco generaciones d...

  19. Agenesia dental: Epidemiología, clínica y genética en pacientes antioqueños

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    J. Echeverri Escobar

    2013-06-01

    Full Text Available Introducción: La odontogénesis es un proceso molecular complejo, susceptible a errores durante las etapas del desarrollo, que puede generar alteraciones, como agenesias dentales. Metodología: Se realizó una descripción epidemiológica de la agenesia dental en 814 pacientes de la Facultad de Odontología de la Universidad de Antioquía entre 2006 y 2008, con base en la historia clínica y radiografías panorámicas. Se evaluó clínica y genéticamente una familia con agenesia dental no sindrómica, se determinó el tipo de segregación y patrón de herencia con el fin de identificar la implicación de los genes MSX1 y PAX9 en la agenesia. Se realizó la Reacción de Polimerización en Cadena (PCR, genotipificación y análisis de ligamiento. Se seleccionaron los marcadores D4S2285 y D4S432 (MSX1 y D14S288 y D14S70 (PAX9 por su alto índice de heterocigocidad. Resultados: El análisis epidemiológico reveló mayor prevalencia de agenesias en la dentición permanente, en el sexo femenino, y los dientes más afectados fueron los tercero molares seguidos de los incisivos laterales superiores. Los resultados genéticos indicaron un posible ligamiento entre el gen MSX1 (LOD 0,97 con la agenesia dental y a su vez se identificó una posible asociación al azar del gen PAX9 (LOD -0,28 en la familia estudiada.

  20. Interacciones genéticas y epigenéticas relacionadas con fisuras de labio y paladar no sindrómicas

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    L.R. Tirado Amador

    2016-02-01

    Full Text Available En la actualidad, las fisuras de labio y fisuras de paladar no sindrómicas constituyen una de las alteraciones del crecimiento y desarrollo facial con alta prevalencia que ocasiona preocupación a nivel mundial porque generan efectos a nivel fisiológico al repercutir en la deglución, fonación, así como en la autopercepción y aceptación del individuo en lo relacionado con la socialización, ocasionando que el tratamiento de dicha alteración requiera de la utilización de un equipo interdisciplinario con el fin de lograr mejoría satisfaciendo las necesidades del individuo afectado. Con respecto a la etiología de este defecto del desarrollo, en la literatura se ha atribuido a diversos factores genéticos así como a factores ambientales, convergiendo hacia el modelo de interacción multifactorial en el que los genes emiten respuesta ante los estímulos que provienen del ambiente, lo que repercute en la expresión a nivel fenotípico. Aunque existen reportes de los cambios genéticos que pueden estar asociados con las alteraciones en el desarrollo labial y cierre palatino, existe gran tendencia a considerar la presencia de mutaciones; sin embargo en ocasiones se omite o resta cierta importancia a los efectos que derivan de las alteraciones en la expresión de la información genética como resultado de la exposición a ciertos factores ambientales. Por lo cual, en la presente revisión, los autores pretenden describir algunos factores genéticos y epigenéticos que intervienen en la aparición de las fisuras labiales y palatinas no sindrómicas.

  1. Pautas éticas para la investigación genética en Antropología Biológica

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Caratini, Alicia Liliana

    2007-01-01

    Full Text Available El abordaje de la ética de la investigación en el área de la genética de poblaciones es de orden colectivo en un contexto de multiculturalidad, haciendose imprescindible el respeto a las pautas culturales y a las formas de organización social de los grupos involucrados: poblaciones originarias y/o cosmopolitas. Lo importante es que los acuerdos alcanzados cobijen sin discriminación a cada uno de los actores que desarrollan el proceso de investigación tanto a los investigadores como a las poblaciones–sujetos. Todas las pautas éticas se hallan enmarcadas por los principios que fijan los convenios Internacionales como el Código de Nuremberg (1947, Declaración de Helsinki (1964 y las sucesivas revisiones, las normas internacionales de CIOMS (1991-1993 la Declaración internacional sobre los datos genéticos Humanos, UNESCO (2003, y las legislaciones regionales y locales. Los procedimientos deben cumplir sintéticamente los siguientes pasos: 1 Recolección de los datos genéticos, se debe tener el consentimiento, previo, libre e informado de las poblaciones-sujetos; 2 confidencialidad de los datos identitarios; 3 el derecho a ser informado, las poblaciones involucradas deben tener acceso a los resultados de la investigación; 4 se debe observar en la cooperación e intercambio internacional el respeto mutuo de acuerdo al art.18 de la Declaración sobre los datos genéticos Humanos (UNESCO 2003. El cumplimiento de las pautas éticas debe estar supervisado por Comités de Etica interdisciplinarios en los organismos de financiamiento de los proyectos.

  2. Parámetros genéticos del crecimiento y la reproducción en ganado cebú

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Mario Pino Pérez de Utrera

    2009-06-01

    Full Text Available Con el propósito de conocer las correlaciones genéticas entre los rasgos de crecimiento en toros y las características reproductivas en vacas cebú de Cuba, se utilizaron 9490 registros de toros que terminaron la prueba de comportamiento en pastoreo, a los cuales se les registró el peso final (PF a los 18 meses de edad; así mismo se emplearon 13.575 registros de sus medio hermanas, a las que se les registró la edad a la primera inseminación (EPI, la edad al primer parto (EPP y los servicios por gestación (SXG. Los datos fueron colectados en cinco centros genéticos entre 1988 y 2001. Todos los animales eran hijos de 267 toros. Los valores promedios encontrados fueron 343,3 kg, 26,5 meses, 37,7 meses y 1,76 para PF, EPI, EPP y SXG, respectivamente. Los índices de herencia (h2 fueron 0,245, 0,054, 0,091 y 0,021 para PF, EPI, EPP y SXG, respectivamente. Las correlaciones genéticas entre PF y los rasgos reproductivos oscilaron entre -0,216 y -0,340. Entre los caracteres reproductivos, las correlaciones genéticas fueron de 0,544 a 0,982. Se concluyó que los valores de h2 estimados para el ganado cebú en Cuba están dentro del rango publicado en la literatura internacional y que la selección continuada para el incremento del peso corporal a los 18 meses de edad en los toros no afectaría negativamente la eficiencia reproductiva en las vacas.

  3. Genética da resistência à ferrugem-da-folha em aveia

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Cruz Renata Pereira da

    2001-01-01

    Full Text Available A ferrugem-da-folha (Puccinia coronata f. sp. avenae é a principal doença da cultura da aveia (Avena sativa L., e o uso de cultivares resistentes é o método de controle mais importante. Este trabalho teve por objetivo determinar o controle genético da resistência à ferrugem-da-folha em aveia e identificar fontes de genes diferentes para resistência a esta doença. Foram utilizados três genótipos resistentes (UFRGS 15, UFRGS 881920 e UFRGS 86A1194-2, três genótipos suscetíveis (UFRGS 7, UFRGS 8 e UFRGS 14 e a geração segregante F3 proveniente dos cruzamentos entre estes genótipos. As plantas foram avaliadas individualmente quanto à presença ou ausência da ferrugem-da-folha, sendo os dados destas leituras utilizados numa análise genética em que a hipótese de um ou dois genes de resistência foi testada pelo qui-quadrado. Os resultados evidenciaram um gene dominante de resistência no genótipo UFRGS 881920 e dois genes complementares no genótipo UFRGS 15 quando estes foram cruzados com os suscetíveis. A análise genética feita não permitiu determinar se estes dois genótipos são ou não a mesma fonte genética de resistência.

  4. Polimorfisme Gen Apolipoprotein E Pada Penderita Sindrom Down Trisomi 21

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Malinda Meinapuri

    2013-01-01

    Full Text Available AbstrakLatar Belakang: Sindrom Down merupakan suatu kelainan kromosom yang ditandai dengan adanya baik seluruhnya (trisomi 21 maupun sebagian (translokasi suatu salinan tambahan kromosom ke 21. Apolipoprotein E (APOE merupakan suatu bentuk protein polimorfik yang disandikan oleh suatu gen yang berlokasi pada lengan panjang kromosom 19 pada posisi 13.2 (19q13.2. Polimorfism gen APOE berkaitan dengan meningkatnya frekuensi alel ε4 yang berakibat terjadinya hambatan dalam percabangan dan pertumbuhan neuron. Dimungkinkan, penderita Sindrom Down Trisomi 21 memiliki gen APOE yang berbeda dengan kontrol sebagai faktor yang dapat mengakibatkan penuaan dini otak. Metode : Penelitian ini merupakan penelitian kasus kontrol untuk mengamati perbedaan distribusi dan frekuensi alel dan genotip gen APOE pada penderita Sindrom Down trisomi 21 dibandingkan dengan kontrol. Kasus Sindrom Down dan kontrol diambil dari data sekunder yang tersimpan di Center for Biomedical Research (CEBIOR Semarang Indonesia. Ekstraksi DNA dilakukan dengan menggunakan metode yang terdapat di (CEBIOR Semarang Indonesia. Kegiatan selanjutnya adalah pemeriksaan polimorfisme gen Apolipoprotein E dengan mengunakan teknik PCR dan RFLP. Hasil : Sebanyak 33 sampel dari penderita Sindrom Down, 18 laki-laki dan 15 perempuan dan 33 sampel kontrol, 18 laki-laki dan 15 perempuan. Baik sampel Sindrom Down maupun kontrol memiliki frekuensi alel ε3 paling tinggi dibandingkan dengan alel ε2 dan ε4. Pada Sindrom Down didapatkan alel ε4 4 sampel (6,1% dan alel ε2 8 sampel (12,1%. Baik sampel Sindrom Down maupun kontrol memiliki genotip ε3/ε3 paling tinggi dibandingkan dengan genotip gen APOE lainnya. Pada Sindrom Down didapatkan genotip ε2/ε4 4 sampel (12,1% dan genotip ε2/ε2 2 sampel (6,1%. Simpulan : Terdapat perbedaan distribusi alel dan genotip gen APOE pada penderita Sindrom Down trisomi 21 dibandingkan dengan kelompok kontrol. Diperlukan analisis sampel yang lebih banyak untuk

  5. Alteraciones del gen c-Myc en la oncogénesis = c-Myc gene alterations in oncogenesis

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Ospina Pérez, Mariano

    2011-12-01

    Full Text Available La familia de protooncogenes MYC (c-Myc, N-Myc y L-Myc se relaciona con el origen de diversas neoplasias en seres humanos. Estos genes actúan como factores de transcripción y participan en la regulación del ciclo celular, la proliferación y diferenciación celulares, la apoptosis y la inmortalización. Los genes MYC se expresan en diferentes tejidos y responden a diversas señales internas y externas; codifican para la síntesis de factores de transcripción que se unen al ADN para regular la expresión de múltiples genes. El gen más ampliamente estudiado de esta familia es c-Myc, que se expresa en las células con mayor tasa de proli­feración. C-Myc se encuentra alterado en un gran número de tumores sólidos, leucemias y linfomas. Las alteraciones de c-Myc encontradas con mayor frecuencia en células cancero­sas son las amplificaciones, translocaciones, mutaciones y reordenamientos cromosómicos que involucran el locus de este gen y conducen a que se desregule su expresión en diversas neoplasias humanas. La amplificación de c-Myc es una alteración común en los cánceres de mama, pulmón, ovario y próstata, así como en leucemias y linfomas, mientras que la pérdida de su regulación es común en el cáncer de colon, en tumores ginecológicos y melanoma. En neoplasias con defectos de c-Myc los estudios actuales están dirigidos al desarrollo de nuevas estrategias terapéuticas.

  6. Estudio electroforético de germoplasma de fríjol (phaseolus vulgaris l.) en centros secundarios de diversidad genética: el caso de áfrica sur-oriental

    OpenAIRE

    Triana E., Mónica; Roca, William M.

    2012-01-01

    Se analizaron 238 muestras de Phaseolus vulgaris L. de Malawi, Zambia, Tanzania, Uganda, Rhodesia y Zimbabwe por sus tipos de faseolina, utilizando la electroforesis SDS-PAGE. Al ubicar las variedades dentro de los centros de origen en las Américas, se encontró que el 69% eran del tipo ''T'', indicando un origen en el sur de los Andes. En el estudio se discuten aspectos evolutivos de diversidad genética en un centro secundario.

  7. Avances del mejoramiento genético participativo del frijol en Cuba

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Rodobaldo Ortiz-P\\u00E9rez

    2006-01-01

    Full Text Available Las actividades de Fitomejoramiento Participativo fueron conducidas con agricultores del municipio de San Antonio de los Baños de la provincia La Habana y campesinos de la comunidad la Palma de la provincia de Pinar del Río durante 2001 al 2004. En la fase de diagnóstico en las áreas de intervención del proyecto, más del 80 % de los agricultores no utilizaban la semilla del sistema formal; por lo tanto, las variedades obtenidas por los programas de mejoramiento no llegaban a la mayoría de los agricultores. Se buscó un mecanismo alternativo para introducir diversidad genética a las localidades mediante las ferias de diversidad, cuyo objetivo principal ha estado dirigido a facilitar el flujo de semilla de los institutos de investigaciones hacia el agricultor y viceversa. Posterior al desarrollo de las ferias de diversidad se continúa con la experimentación campesina en fincas y cooperativas, desarrollándose una amplia red experimental difícil de lograrse sin la participación de los productores. La experimentación campesina, el aumento de la eficiencia en la finca, incluyendo el aumento del rendimiento de sus parcelas, el aumento de la diversidad por el uso de mayor número de variedades, y una mayor proporción de área dedicada a estas variedades; todo lo cual redunda en un mejoramiento de la vida del campesino y su familia

  8. 77 FR 52352 - Notice of Intent To Prepare an Environmental Impact Statement for the Rio Mesa Gen-Tie Project...

    Science.gov (United States)

    2012-08-29

    ... Gen-Tie Project and Possible Land Use Plan Amendment, Riverside County, CA AGENCY: Bureau of Land..., California, intends to prepare an Environmental Impact Statement (EIS) for the Rio Mesa Gen- Tie Project. The... Gen-Tie Project by any of the following methods: Web site: http://www.blm.gov/ca/st/en.html ;...

  9. Consejería genética y diagnóstico prenatal: recomendaciones y futuras perspectivas para Colombia

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Dora Lucía Vallejo-Ardila

    2016-08-01

    Full Text Available Introducción: En el ámbito mundial la prevalencia de malformaciones congénitas en recién nacidos oscila entre 3 al 5%; en Colombia en 2007, se convirtió por primera vez en la causa más frecuente de mortalidad infantil. El objetivo de esta revisión de la literatura es describir la importancia de implementar protocolos diagnósticos y de consejería genética prenatal en Colombia. Metodología: Se realizó la búsqueda de la literatura en las bases de datos MEDLINE/PubMed, OVID, SciELO, Sciencedirect y ProQuest, utilizando términos MeSH como: “genetic counselling and congenital anomalies”, “prenatal diagnosis”, “genetic services”, “ECLAMC” y “Genetics in Latin America” para delimitar la búsqueda de artículos de revisión, y estudios descriptivos observacionales, que permitieran hacer un seguimiento detallado sobre los avances realizados los últimos diez años sobre consejería genética y diagnóstico prenatal en Colombia. Resultados: Es necesario implementar el uso racional de algoritmos diagnósticos y un mejor plan de control prenatal por parte del personal médico considerando la importancia de indagar por antecedentes de exposición a agentes teratogénicos, antecedente familiares positivos para malformaciones congénitas y estimar el riesgo de recurrencia, para lograr remitir al especialista de manera oportuna y éste pueda realizar su intervención precoz. Conclusiones: El diagnóstico prenatal implica correlacionar hallazgos ultrasonográficos con marcadores séricos para evaluar la necesidad de pruebas invasivas según la priorización del riesgo de anomalías congénitas. Esto debe hacerse en coordinación con un servicio multidisciplinario de  consejería genética que incluya: neonatología, perinatología, pediatría, ginecología, obstetricia, psiquiatría, trabajo social y  psicología.

  10. Desarrollo de vacunas antipertúsicas via genómica-proteómica

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Celso Pérez-Bolaños

    2013-01-01

    Full Text Available Las vacunas convencionales se basan en la aplicación de diversos métodos bioquímicos, microbiológicos e inmunológicos sobre los agentes causales de las enfermedades. A pesar del éxito alcanzado en el control y prevención vacunal de muchas patologías infecciosas, en otros casos los resultados no han sido fructíferos, de modo que se impone explorar nuevos enfoques y posibilidades. El desarrollo y auge de la biología molecular representa una revolución en el diseño de nuevas vacunas contra una gran variedad de microorganismos patógenos, causantes de enfermedades que afectan al hombre y a los animales. A partir del conocimiento de las secuencias genómicas completas de esos microorganismos, en combinación con nuevas tecnologías avanzadas tales como la bioinformática, los micromatrices de ADN y la proteómica, ha sido posible identificar nuevos antígenos importantes para el desarrollo de nuevos preparados vacunales. La combinación genómica-proteómica ha reportado grandes avances en el descubrimiento de sitios "diana" de vacunas contra bacterias patógenas. La vacuna ideal debe ser patógeno - específica y portadora de antígenos conservados en todas las cepas, de modo que posea una cobertura universal, con el mínimo número de antígenos. Apoyándose en estos conocimientos es posible predecir a priori todos los antígenos in silico, sin necesidad de crecer el microorganismo in vitro. Este nuevo enfoque ha sido aplicado con éxito en la identificación de nuevos antígenos que pueden ser evaluados de manera perspectiva para fines vacunales en Bordetella pertussis, lo que evidentemente representa un serio esfuerzo a escala global para enfrentar la resurgencia de la tosferina o pertussis.

  11. Polimorfismo y divergencia en genes implicados en la resistencia al frío en "Drosophila".

    OpenAIRE

    Arboleda Bustos, Carlos Eduardo

    2008-01-01

    El objetivo principal de la tesis doctoral es analizar la evolución molecular de genes implicados en la tolerancia y aclimatación al frío en Drosophila, ya que estos genes son buenos candidatos de haber sufrido cambios adaptativos. Los genes elegidos fueron Frost(Fst) y Drosophila cold acclimation gene(Dca) que en D. melanogaster se sobreexpresan tras someter a los individuos a un estrés por frío. Posteriormente, el estudio se amplió al gen CG6296, que al igual que Fst codifica una proteína c...

  12. Decay heat removal in GEN IV gas cooled fast reactors

    International Nuclear Information System (INIS)

    The safety goal of the current designs of advanced high-temperature thermal gas-cooled reactors (HTRs) is that no core meltdown would occur in a depressurization event with a combination of concurrent safety system failures. This study focused on the analysis of passive decay heat removal (DHR) in a GEN IV direct-cycle gas-cooled fast reactor (GFR) which is based on the technology developments of the HTRs. Given the different criteria and design characteristics of the GFR, an approach different from that taken for the HTRs for passive DHR would have to be explored. Different design options based on maintaining core flow were evaluated by performing transient analysis of a depressurization accident using the system code RELAP5-3D. The study also reviewed the conceptual design of autonomous systems for shutdown decay heat removal and recommends that future work in this area should be focused on the potential for Brayton cycle DHRs.

  13. Genética de las epilepsias Genetics of epilepsy

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Gustavo A. Charria-Ortiz

    2007-01-01

    Full Text Available En años recientes se ha podido definir con gran exactitud la existencia de alteraciones genéticas específicas en una gran variedad de síndromes epilépticos tradicionales. Es decir, por vez primera se ha podido relacionar de manera contundente y predecible la presencia de alteraciones genómicas y/o proteómicas con síndromes epilépticos antes considerados como "idiopáticos". La gran mayoría de dichos defectos han sido encontrados en genes codificadores para canales iónicos y/o receptores de membrana, lo cual en cierto modo confirma la ya antes postulada relevancia que estas estructuras tienen en la actividad electroquímica espontánea neuronal cuyo desajuste conllevaría a ciertas formas de epilepsia. Esta revisión se centra en los aspectos genéticos y clínicos de dichas condiciones y alteraciones. También se revisarán brevemente los estudios más relevantes de la literatura médica según los cuales -aun a pesar de no haberse definido con la misma exactitud el tipo de anomalías etiológicas- puede tranquilamente inferirse el gran componente genético que parece subyacer a la etiología de las epilepsias. Por ultimo se enfatizará en que a pesar de dichos descubrimientos, su aplicación en la práctica clínica diaria aun es muy limitada, no solo por la relativa rareza de algunos de tales síndromes neurológicos sino también por la poca relevancia que hasta ahora ellos han tenido en el manejo médico rutinario de la mayoría de los pacientes. Las posibilidades inmediatas de tales avances -incluida la farmacogenómica-, así como los posibles conflictos éticos en que se podría incurrir serán también brevemente discutidos.In the last few years, the presence of specific genetic abnormalities leading to some of the classical epileptic syndromes has been clearly elucidated. This means that for the first time, it has become possible to create a strong relationship between the presence of specific genomic and/or proteomic

  14. GenASiS: General Astrophysical Simulation System. I. Fundamentals

    CERN Document Server

    Cardall, Christian Y; Endeve, Eirik; Mezzacappa, Anthony

    2012-01-01

    GenASiS (General Astrophysical Simulation System) is a new code being developed initially and primarily, though by no means exclusively, for the simulation of core-collapse supernovae on the world's leading capability supercomputers. Using the features of Fortran 2003 that allow for object-oriented programming, its classes are grouped into three major divisions: (1) Basics, which contains some basic utilitarian functionality for large-scale simulations on distributed-memory supercomputers; (2) Mathematics, which includes generic mathematical constructs and solvers that are as agnostic as possible with regard to the specifics of any particular system; and (3) Physics, which sets up physical spaces associated with various theories of spacetime (including gravity), defines various forms of stress-energy, and combines these into `universes.' To provide a foundation for subsequent papers focusing on the implementation of various pieces of physics needed for the simulation of core-collapse supernovae and other astr...

  15. How Gen Y and Boomers will reshape your agenda.

    Science.gov (United States)

    Hewlett, Sylvia Ann; Sherbin, Laura; Sumberg, Karen

    2009-01-01

    When it comes to workplace preferences, Generation Y workers closely resemble Baby Boomers. Because these two huge cohorts now coexist in the workforce, their shared values will hold sway in the companies that hire them. The authors, from the Center for Work-Life Policy, conducted two large-scale surveys that reveal those values. Gen Ys and Boomers are eager to contribute to positive social change, and they seek out workplaces where they can do that. They expect flexibility and the option to work remotely, but they also want to connect deeply with colleagues. They believe in employer loyalty but desire to embark on learning odysseys. Innovative firms are responding by crafting reward packages that benefit both generations of workers--and their employers.

  16. Developing new nuclear curricula for GEN IV needs

    International Nuclear Information System (INIS)

    States who wish to start and develop a nuclear program must take into consideration a strong proven strategy for developing a sustainable program. A complete nuclear research program must include: a good national strategy and support on the topic; strong research laboratories supported by good personnel; education component to provide sustainable and qualified workforce; national/international interest from stakeholders and governments and a well informed society. New demonstrators are foreseen for the next period to be built in Europe and skilled supporting personnel is strongly needed. Current situation in nuclear higher education with perspective will be analysed. EURATOM strongly supports development of multidisciplinary co-operational projects in order to built such novel initiatives. An example of such program supported by European Commission, ARCADIA, will be given. The project is based on the cooperation of a large number of participants all over Europe and the main purpose is to develop a road-map for Gen IV reactor. (authors)

  17. Commissioning and Performance Analysis of WhisperGen Stirling Engine

    Science.gov (United States)

    Pradip, Prashant Kaliram

    Stirling engine based cogeneration systems have potential to reduce energy consumption and greenhouse gas emission, due to their high cogeneration efficiency and emission control due to steady external combustion. To date, most studies on this unit have focused on performance based on both experimentation and computer models, and lack experimental data for diversified operating ranges. This thesis starts with the commissioning of a WhisperGen Stirling engine with components and instrumentation to evaluate power and thermal performance of the system. Next, a parametric study on primary engine variables, including air, diesel, and coolant flowrate and temperature were carried out to further understand their effect on engine power and efficiency. Then, this trend was validated with the thermodynamic model developed for the energy analysis of a Stirling cycle. Finally, the energy balance of the Stirling engine was compared without and with heat recovery from the engine block and the combustion chamber exhaust.

  18. Festival du rire de Genève

    CERN Multimedia

    Staff Association

    2015-01-01

    Connaissez-vous le Festival du rire de Genève ? La deuxième édition aura lieu du 25 au 28 mars 2015 au Casino-Théâtre à Carouge. Côté programmation, Marc Donnet-Monay ouvre les festivités avant trois autres soirées de folie et d’humour que nous vous laissons le soin de découvrir dans le programme : http://www.rire-geneve.ch/#programme. Réduction de 30% sur l’achat de places pour les membres du personnel du CERN. Pour cela, il suffit de se rendre sur la billetterie en ligne de notre site : www.rire-geneve.ch et d’utiliser le code promotionnel. Contacter le secrétariat de l’Association du personnel (Staff.Association@cern.ch) pour connaitre ce code promotionnel.

  19. Genética do autismo Genetics of autism

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Gianna Carvalheira

    2004-12-01

    Full Text Available O autismo é uma doença neuropsiquiátrica com profundas conseqüências sociofamilares. Inúmeros trabalhos investigaram pacientes e famílias com metodologia genético-clínica, citogenética e biologia molecular. Os resultados destes trabalhos apontam para um modelo multiloci com interação epistática associado à etiologia do autismo.Autism is a neuropsychiatric disorder with profound family and social consequences. An extraordinary number of genetical-clinical, cytogenetics and molecular studies were done in recent years. A multiloci epistatic model involved in the causation of autism have emerged from these studies.

  20. Big Bang à Genève - French version only

    CERN Document Server

    2005-01-01

    C'est la dernière conférence du cycle organisé par la section de physique de l'Université de Genève à l'occasion de l'Année internationale de la physique. Pour le bouquet final, la section de physique a choisi le grand boum du Big Bang. Intitulée « Big Bang à Genève », la conférence donnée par Laurent Chevalier de l'institut français CEA Saclay évoquera les expériences qui se préparent au CERN avec le LHC. Leur but est de reproduire et d'analyser les conditions qui prévalaient à l'origine de l'Univers, juste après le Big Bang. L'exposé décrira de façon simple les techniques utilisées pour cette exploration, qui démarrera en 2007. Laurent Chevalier se demandera avec le public quels phénomènes nouveaux les physiciens espèrent découvrir dans ce monde inexploré. Comme les précédentes, la conférence débutera par une démonstration de détection de rayons cosmiques dans l'auditoire et l'utilisation de ces signaux pour créer une « musique cosmique », en collaboration avec le Pr...

  1. Progresso genético em arroz de várzea úmida no Estado do Amapá Genetic progress in lowland rice in the State of Amapá, Brazil

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    ANDRÉ LUIZ ATROCH

    2000-04-01

    Full Text Available Este trabalho teve como objetivo quantificar o progresso genético do arroz de várzea úmida no Estado do Amapá, no período de 1991 a 1996. A eficiência do programa de avaliação e seleção de linhagens de arroz foi estudada, utilizando-se os dados das produtividades de grãos obtidos nos Ensaios Comparativos Avançados, da rede de ensaios coordenada pela Embrapa-Centro Nacional de Pesquisa de Arroz e Feijão. Para estimativa do ganho genético foram utilizadas as metodologias de Vencovsky et al. (1986 e de Fernandes (1988. O ganho genético foi de 78,9 kg ha-1 (2,45% ao ano, sendo 63,21% dos progressos brutos devidos ao melhoramento genético, pelo primeiro método. No segundo método, o ganho genético foi de 96,93 kg ha-1 (3,02% ao ano, sendo 67,85% dos progressos brutos devidos ao melhoramento genético. Os ganhos genéticos obtidos com ambas metodologias evidenciam que os esforços empreendidos na busca de cultivares adaptadas e produtivas têm produzido resultados expressivos.This paper had the objective of quantifying the genetic progress of lowland rice in the state of Amapá, Brazil, in the 1991-1996 period. The efficiency of the rice lineages evaluation and selection program was studied, using grain yield data, obtained in the Advanced Yield Trials, of the Embrapa-Centro Nacional de Pesquisa de Arroz e Feijão network. To estimate the genetic gain the methodologies of Vencovsky et al. (1986 and Fernandes (1988 were used. The genetic gain obtained was of 2.45%/ year (78.9 kg ha-1, being 63.21% of the whole progresses due to the genetic breeding, for the first method. In the second method, the genetic gain was of 3.02%/year (96.93 kg ha-1, being 67.85% of the whole progresses due to the genetic breeding. The genetic gains obtained in both methodologies evidence that the efforts undertaken in the search of adapted and productive cultivars have been producing expressive results.

  2. Operette als Vorhang : Benjamin beobachtet Karl Kraus' Offenbach-Vorlesungen

    OpenAIRE

    Nöther, Matthias

    2013-01-01

    Walter Benjamin hörte Karl Kraus als Vorleser bei einem von dessen Berliner Gastvorträgen im Jahr 1928. Unmittelbar danach hielt Benjamin dieses Erlebnis in dem knappen Bericht "Karl Kraus liest Offenbach" fest. Der Bericht ging später in den Essay "Karl Kraus: Allmensch – Dämon – Unmensch" ein, der in drei Teilen 1931 in der Frankfurter Zeitung erstveröffentlicht wurde. [...] Mit seinem Wissen um das performative Gesamtwerk von Kraus wusste Benjamin auch um das besondere Setting der Offenbac...

  3. Efectividad de los medicamentos antirretrovirales genéricos en el tratamiento de los pacientes adultos infectados con VIH en Medellín, Colombia

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Fabián Alberto Jaimes Barragán

    2008-02-01

    Full Text Available

    Pese al uso generalizado de medicamentos antirretrovirales genéricos para VIH/SIDA persiste el debate sobre la efectividad de este tipo de medicaciones comparadas con sus contrapartes originales. Se revisaron las historias clínicas de 170 pacientes con diagnóstico de VIH/SIDA, desde 1998 a 2006, de la base de datos sistematizada de una entidad privada, quienes tuvieron indicaciones para iniciar la terapia antirretroviral. La población en estudio fue dividida en grupos que recibieron medicamentos antirretrovirales originales o genéricos en su totalidad o mezcla de los mismos (grupo mixto. El objetivo primario fue evaluar la efectividad de las distintas terapias como medida de supresión virológica e inmunológica en los pacientes con VIH/SIDA; el objetivo secundario fue determinar la probabilidad de permanecer libre de eventos definitorios de SIDA y mortalidad general. Casi la totalidad de los pacientes recibieron terapia antirretroviral altamente activa (HAART como primer esquema de terapia (n =167; 98,2% y en el 100% en los siguientes esquemas. El promedio de edad al empezar la terapia fue de 38,8 años con un rango entre 21-78 años, 89,4% (n = 152 eran hombres y la principal causa del diagnóstico fue la presencia de infecciones oportunistas en el 41,8% de los casos (n = 71. Al inicio de la terapia, 59,4% de la población (n = 101 tenía un estadio inmunológico 3 y el 47,1% (n = 80 un estadio clínico C. Con respecto a la marca del tratamiento, 64,7% (n = 110 de la cohorte inició la terapia con medicación comercial, 23,5% (n = 40 con genéricos y 11,8% (n = 20 con medicación mixta. Ciento veinte pacientes (70,6% tuvieron buena adhesión al tratamiento. El seguimiento longitudinal de los datos para el recuento de CD4 en los 18 meses iniciales postratamiento permitió analizar un promedio de 2,5 mediciones por paciente. Comparado con el grupo de tratamiento

  4. Factors genètics de la leishmaniosi canina: caracterització del Nramp1 com a gen candidat

    OpenAIRE

    Altet i Sanahujes, Laura

    2003-01-01

    Descripció del recurs: el 22 d'octubre de 2003 L'objectiu d'aquesta tesi és la recerca de gens candidats de resistència o susceptibilitat a leishmaniosi canina. Aquesta malaltia, que és endèmica en l'area mediterranea, és una zoonosi causada pel paràsit Leishmania infantum, on el gos és el principal reservori. A més, està guanyant molta importància en l'home, ja que ha esdevingut una de les coinfeccions principals en malalts del virus de la SIDA. El món dels gossos aporta un material molt ...

  5. Mejoramiento genético para tolerancia a altas temperaturas y resistencia a mosaico dorado en frijol común

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Juan Carlos Rosas

    2000-01-01

    Full Text Available Mejoramiento genético para tolerancia a altas temperaturas y resistencia a mosaico dorado en frijol común. Entre 1994-95 se identificaron fuentes de frijol tolerantes a altas temperaturas mediante la evaluación de germoplasma y líneas mejoradas en Choluteca y Nacaome (≤ 50 msnm, en la región Sur de Honduras. La tolerancia al calor de los mejores genotipos fue confirmada en Geneva, Nueva York, EE.UU., bajo condiciones de invernadero con temperatura controlada (35/27 oC día/noche. Posteriormente, se realizaron cruzamientos para desarrollar líneas de grano rojo-pequeño tolerantes al calor y resistentes al VMDF y a otros factores limitantes. Las poblaciones segregantes F2-F5 fueron evaluadas por caracteres múltiples incluyendo VMDF, bacteriosis, baja fertilidad, roya, valor agronómico y valor comercial del grano. En 1998, 217 líneas F6 y F7 fueron evaluadas en el distrito de riego Lempa-Acahuapa (20 msnm, región Pacífica de El Salvador, por tolerancia a altas temperaturas y al VMDF. Estas mismas líneas se evaluaron en la localidad de Liberia, en la región Noroeste de Costa Rica, por tolerancia a altas temperaturas; y en El Zamorano, Honduras por resistencia a bacteriosis, mancha angular y roya. Se logró identificar un grupo de líneas que superaron a los testigos comerciales bajo condiciones de altas temperaturas en El Salvador y Costa Rica. Algunas de las líneas seleccionadas presentaron alta resistencia al VMDF en El Salvador, resistencia moderada a mustia en Costa Rica, y excelente comportamiento agronómico y valor comercial del grano

  6. Aceptación de los fármacos genéricos en equipos de atención primaria: efecto de una intervención educativa y de los precios de referencia

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Vallès J.A.

    2002-01-01

    Full Text Available Objetivo: Analizar la aceptación de los pacientes de la sustitución de marcas de fantasía por genéricos en el marco de la prescripción crónica. Métodos: Estudio prospectivo, multicéntrico, de utilización de medicamentos. De los 31 centros incluidos en el estudio, ocho fueron aleatorizados al grupo intervención y 23 al grupo control. Durante un año los pacientes del grupo intervención que acudieron a recoger las recetas de la medicación crónica fueron informados de forma verbal y escrita sobre las ventajas e inconvenientes de los fármacos genéricos y los de marca de fantasía. Se registraron los pacientes que recibían fármacos susceptibles de ser prescritos como genéricos, los motivos de no aceptación del cambio y las variables relacionadas (edad, sexo, nivel de estudios, centro, médico de cabecera, tipo de fármaco y número total de fármacos crónicos. Cada 2 meses se obtuvo el porcentaje de genéricos prescritos respecto al total de prescripción. Resultados: Fueron informados 4.620 pacientes de los que el 98,9% aceptó el cambio. El centro de atención primaria, el tipo de fármaco, la influencia médica y la satisfacción del paciente con el fármaco se asociaron significativamente con el grado de aceptación de los genéricos. En el grupo intervenido, el porcentaje de envases genéricos respecto al total de envases prescritos alcanzó un 5,9 frente a un 2,8% de los controles no incentivados. Tras finalizar la intervención y antes de la aplicación de los precios de referencia, los porcentajes fueron del 6,7 y el 3,9%, mientras que justo tras su aplicación, los porcentajes fueron del 8,6 y el 6,3%, respectivamente. Conclusiones: Una intervención educativa directa sobre el paciente es efectiva para cambiar de marca de fantasía a genérico. La motivación y el conocimiento sobre los medicamentos genéricos por parte del médico de cabecera son factores influyentes sobre su uso. La aplicación de los precios de

  7. Genética y Probabilidad : pruebas de paternidad y portadores de enfermedades

    OpenAIRE

    Delgado de la Torre, Rosario

    2006-01-01

    La genética de poblaciones estudia la distribución de los genes en las poblaciones, así como los factores que mantienen o cambian la constitución genética de las mismas, de una generación a otra. Una población se define como un conjunto de individuos capaces de reproducirse entre sí, que coexisten geográfica y temporalmente, y constituyen una unidad evolutiva. El estudio de la genética de poblaciones es muy importante desde el punto de vista sanitario, ya que la mayoría de las enfermedades ti...

  8. Història natural de les malalties genètiques mendelianes i complexes

    OpenAIRE

    Lao Grueso, Oscar, 1976-

    2004-01-01

    Las enfermedades genéticas se clasifican típicamente en dos grandes grupos: las enfermedades mendelianas y las enfermedades complejas. Mientras que las enfermedades mendelianas se caracterizan por ser de baja frecuencia en la población y estar causadas por mutaciones en un gen particular, las enfermedades complejas son el principal problema sanitario en los países desarrollados y se encuentran producidas por la interacción de factores ambientales y factores genéticos. En este caso no se puede...

  9. gSeaGen: a GENIE-based code for neutrino telescopes

    CERN Document Server

    Distefano, Carla

    2016-01-01

    The gSeaGen code is a GENIE based application to generate neutrino-induced events in an underwater neutrino detector. The gSeaGen code is able to generate events induced by all neutrino flavours, taking into account topological differences between track-type and shower-like events. The neutrino interaction is simulated taking into account the density and the composition of the media surrounding the detector. The main features of gSeaGen will be presented together with some examples of its application within ANTARES and KM3NeT.

  10. Variabilidade genética de Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae Variabilidade genética de Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Andreia K. Nakatani

    2009-06-01

    Full Text Available A mancha bacteriana, causada por Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae, é uma das mais importantes doenças do maracujazeiro, podendo limitar a produção dessa frutífera em algumas regiões do País. O uso de resistência genética e controle químico, juntamente com o emprego de medidas de exclusão, são as práticas de controle da doença mais recomendadas. Para o desenvolvimento de variedades resistentes é necessário conhecer tanto a variabilidade genética do hospedeiro quanto do patógeno. Nesse trabalho foi estudada a variabilidade de cinqüenta isolados patogênicos de Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae, coletados em quatro diferentes locais no estado de São Paulo. No estudo da variabilidade genética foram usados dados de marcadores moleculares RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA, os quais foram usados para o cálculo do coeficiente de similaridade de Dice entre os isolados, análise de variância molecular (AMOVA entre e dentro das populações e agrupamento dos isolados pelo método UPGMA. Para análise da agressividade foram usados cinco isolados, mais divergentes, baseado no dendrograma. O coeficiente de similaridade variou entre 0,6887 e 0,9688. Na análise de agrupamento, os isolados foram separados em sete grupos e não houve relação evidente entre local de coleta com a composição dos grupos. Na análise da variância molecular (AMOVA verificou-se que a maior parte da variabilidade genética está dentro das populações (89,4% e apenas 10,6%, entre populações. Os resultados da análise de agrupamento e da AMOVA indicam que existe grande fluxo gênico entre isolados bacterianos nas regiões analisadas. No teste de patogenicidade verificou-se diferença significativa de agressividade entre os isolados. Os resultados demonstram a importância do conhecimento da variabilidade genética e da agressividade na seleção dos isolados para serem utilizados em testes de resistência genética no desenvolvimento de

  11. Evaluación del potencial de mejoramiento genético en el crecimiento en altura de Acacia mangium Willd.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Pastrana Vargas Iván Javier

    2012-11-01

    Full Text Available

    En el periodo 2009-2010, en Ayapel, Planeta Rica y Tierralta, departamento de Córdoba (Colombia se evaluó el desempeño en crecimiento en altura total de 90 familias de polinización abierta de Acacia mangium. En estos municipios el clima se clasifica, de acuerdo con Holdridge, como bosque seco tro- pical (Bs-T, excepto Tierralta que es bosque húmedo tropical (Bh-T. Durante el primer año de creci- miento, las plantas en cada familia fueron evaluadas en ensayos de progenie mediante un diseño expe- rimental de bloques completos al azar, con seis bloques en cada una de las tres localidades. La parcela o unidad experimental consistió en seis plantas de polinización abierta por familia, distribuidas aleato- riamente en tres parejas espacialmente separadas dentro de cada bloque. La predicción de parámetros genéticos individuales y de familias se efectuó por medio del procedimiento BLUP y los componentes de varianza por medio del procedimiento REML utilizando el software SELEGEN. Las estimaciones de he- redabilidad variaron entre <1 y 13%, y entre 6 y 68%, para heredabilidad individual en sentido estricto (h2a y heredabilidad media de familias (h2mp, respectivamente. El ranking genético en altura de las

    15 mejores familias indica que las de mayor crecimiento fueron también las más estables y de mayor adaptabilidad a los ambientes. Los resultados sugieren un alto potencial de mejoramiento al nivel de familia en crecimiento y productividad de plantaciones de A. mangium en el departamento de Córdoba,

    #olombia. $on necesarios nuevos estudios a fin de lograr una me%or selección genética

  12. Evaluación del potencial de mejoramiento genético en el crecimiento en altura de Acacia mangium Willd.

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Iván Javier Pastrana-Vargas

    2012-04-01

    Full Text Available En el periodo 2009-2010, en Ayapel, Planeta Rica y Tierralta, departamento de Córdoba (Colombia se evaluó el desempeño en crecimiento en altura total de 90 familias de polinización abierta de Acacia mangium. En estos municipios el clima se clasifica, de acuerdo con Holdridge, como bosque seco tropical (Bs-T, excepto Tierralta que es bosque húmedo tropical (Bh-T. Durante el primer año de crecimiento, las plantas en cada familia fueron evaluadas en ensayos de progenie mediante un diseño experimental de bloques completos al azar, con seis bloques en cada una de las tres localidades. La parcela o unidad experimental consistió en seis plantas de polinización abierta por familia, distribuidas aleatoriamente en tres parejas espacialmente separadas dentro de cada bloque. La predicción de parámetros genéticos individuales y de familias se efectuó por medio del procedimiento BLUP y los componentes de varianza por medio del procedimiento REML utilizando el software SELEGEN. Las estimaciones de heredabilidad variaron entre <1 y 13%, y entre 6 y 68%, para heredabilidad individual en sentido estricto (h²a y heredabilidad media de familias (h²mp, respectivamente. El ranking genético en altura de las 15 mejores familias indica que las de mayor crecimiento fueron también las más estables y de mayor adaptabilidad a los ambientes. Los resultados sugieren un alto potencial de mejoramiento al nivel de familia en crecimiento y productividad de plantaciones de A. mangium en el departamento de Córdoba, Colombia. Son necesarios nuevos estudios a fin de lograr una mejor selección genética.

  13. Ataxias cerebelares hereditárias: do martelo ao gen Hereditary cerebellar ataxias from neurological hammer to genetics

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Walter Oleschko Arruda

    1997-09-01

    Full Text Available As heredoataxias constituem grupo complexo de doenças neurodegenerativas hereditárias, para o qual várias formas de classificação clínica e patológica foram propostas com sucesso variável. O desenvolvimento das técnicas de biologia molecular trouxe informações importantes que têm permitido caracterizar geneticamente as ataxias cerebelares hereditárias. O reconhecimento das doenças causadas por expansões de trinucleotídeos abre novo capítulo para a pesquisa sobre outros mecanismos de doenças, como na ataxia de Friedreich e nas várias formas de ataxia cerebelar autossômica dominante(SCAl a SCA7, das quais a doença de Machado-Joseph / SCA3 parece ser a mais comum no nosso meio. A deficiência familial de vitamina E (cromossomo 8q leva a quadro semelhante ao da ataxia de Friedreich (cromossomo 9p, mas responde à reposição oral de tocoferol. Formas familiais de ataxia periódica com (cromossomo 12p ou sem (cromossomo 19p mioquimia foram caracterizadas, a primeira resultado de mutações dos gens de canais de potássio. Os portadores do gen da ataxia-teleangiectasia (cromossomo 1 lq representam 1-3% da população e são suscetíveis aos efeitos oncogênicos da radiação iônica. Sem olvidar da importância da avaliação clínica neurológica, a avaliação genética laboratorial passa a ser valiosa ferramenta para o diagnóstico e aconselhamento genético, além do melhor entendimento da patogênese dessas doenças.The hereditary ataxias comprise a complex group of neurological disorders involving the cerebellum and its connections. Several classifications based on clinical and/or pathological data have been only partially successful. Recent progress in molecular genetics has identified the genic loci of hereditary ataxias and has allowed a more precise diagnosis of distinct genetic diseases. Trinucleotide repeat expansions has been recognized as a mechanism of disease in some autosomal dominant spinocerebellar ataxias (ADCA

  14. Gen quimérico que utiliza el gen o cDNA de la 3-hidroxi-3-metilglutaril-CoA sintasa mitocondrial y animal transgénico no humano que expresa dicho gen quimérico para su utilización en el desarrollo de aproximaciones terapéuticas para diabetes mellitus.

    OpenAIRE

    Bosch i Tubert, Fàtima; Valera Abril, Alfons

    2001-01-01

    Gen quimérico que utiliza el gen o cDNA de la 3-hidroxi-3- metilglutaril-CoA sintasa mitocondrial y animal transgénico no humano que expresa dicho gen quimérico para su utilización en el desarrollo de aproximaciones terapéuticas para diabetes mellitus. El gen quimérico está dirigido por un promotor o fusión de promotores, los cuales preferentemente son regulables y activados por el proceso diabético. Preferentemente se obtiene por la fusión del gen de la 3-hidroxi-3-metilglutaril-CoA sintasa ...

  15. Factores genéticos que inciden en la resistencia a enfermedades infecciosas en salmónidos y su aplicación en programas de mejoramiento Genetic factors involved in resistance to infectious diseases in salmonids and their application in breeding programmes

    OpenAIRE

    JM Yáñez; Martínez, V.

    2010-01-01

    El control de las enfermedades infecciosas es fundamental en el éxito del cultivo del salmón. El mejoramiento genético de la resistencia a enfermedades puede otorgar una opción factible y sustentable para el control de éstas. La Selección Asistida por Marcadores Moleculares (MAS) o Genes (GAS) se proyecta como una valiosa alternativa al mejoramiento convencional de la resistencia. Sin embargo, para implementar esta metodología es necesario el conocimiento previo de los factores genéticos invo...

  16. Influencia de la sustitución de medicamentos de marca por genéricos en el cumplimiento terapéutico de la hipertensión arterial y la dislipidemia Influence of substitution of brand name for generic drugs on therapeutic compliance in hypertension and dyslipidemia

    OpenAIRE

    Antoni Sicras Mainar; Ruth Navarro Artieda

    2010-01-01

    Objetivo: Determinar el cumplimiento terapéutico al sustituir amlodipino y simvastatina de marca por genéricos (especialidad farmacéutica genérica [EFG]), y conocer la opinión de médicos y pacientes sobre ello. Pacientes y métodos: Diseño observacional con grupo control, realizado mediante revisión de los registros de seis centros de atención primaria. Pacientes >40 años de edad que iniciaron tratamiento con marca (periodo inicial) y posteriormente se cambió por una EFG (periodo final). Subgr...

  17. El papel de la genética en la aparición y desarrollo de la periodontitis: II: Polimorfismos asociados a la enfermedad periodontal The role of genetics in the development and progression of periodontitis: II: Polymorphism associated to periodontal disease

    OpenAIRE

    D. Rodrigo-Gómez; A Oteo-Calatayud; A Alonso-Rosado; A Bascones-Martínez

    2008-01-01

    La periodontitis es una enfermedad multifactorial que resulta de la interacción de bacterias periodontopatógenas con los mecanismos de respuesta inmune del huésped y que se caracteriza por una reacción inflamatoria que afecta al aparato de inserción del diente. Las enfermedades multifactoriales habitualmente envuelven complejas interacciones de muchos genes y factores ambientales. El tipo de variaciones genéticas involucradas en este tipo de enfermedades se denominan polimorfismos genéticos, ...

  18. El papel de la genética en la aparición y desarrollo de la periodontitis: I: evidencias científicas de la asociación entre periodontitis y genética The role of genetics in the development and progression of periodontits: I: evidence of the association between periodontitis and genetics

    OpenAIRE

    D. Rodrigo-Gómez; A Oteo-Calatayud; A Alonso-Rosado; A Bascones-Martinez

    2007-01-01

    La periodontitis es una enfermedad multifactorial que se caracteriza por una reacción inflamatoria que afecta al aparato de inserción del diente. Esta inflamación es consecuencia de la interacción de ciertas bacterias con los mecanismos de respuesta inmune del huésped. Mientras que la infección es un requisito necesario para la aparición de la periodontitis, su curso y severidad depende de un número variable de determinantes ambientales, conductuales y genéticos. Se ha constatado que los indi...

  19. Diversidad genética en variedades de caña de azúcar azúcar (Saccharum spp. usando marcadores moleculares

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Riascos John J.

    2003-06-01

    Full Text Available Debido a que el conocimiento de la diversidad genética existente en las variedades modernas de caña de azúcar es de vital importancia para los procesos de mejoramiento, el presente estudio examinó 33 variedades usadas por los mejoradores en CENICAÑA, y cinco clones de Saccharum officinarum mediante la técnica de los microsatélites. Se evaluaron 63 iniciadores los cuales produjeron 263 fragmentos polimórficos. Los patrones electroforéticos generados mediante esta técnica fueron analizados usando los paquetes estadísticos SAS (Análisis de Correspondencia Múltiple y NTSYS-pc (dendrograma y matriz de distancias genéticas. Los alelos generados por cada iniciador oscilaron entre 1 y 16 (media de 5. Las agrupaciones generadas mediante estos análisis lograron diferenciar las variedades cultivadas de caña de los clones de S. officinarum, y a su vez determinaron que la similitud promedio de todos los individuos fue 0.664. El análisis de diversidad genética mostró un grupo bastante diverso (Ht: 0.973 y logro identificar 38 genotipos en toda la población. Dentro de los resultados más sobresalientes se destaca la ubicación de la variedad CC 91-1880 muy cerca de las variedades Q provenientes de Australia, proponiendo a esta variedad como un buen candidato para ser analizado por los mejoradores. Los resultados de este trabajo son muy importantes, pues deja claro que a pesar de la homogeneidad genética presente en las variedades modernas de caña de azúcar, existen variantes alélicas que podrían ser utilizadas en los nuevos proyectos de mejoramiento de CENICAÑA. Palabras clave: Caña de azúcar, diversidad genética, microsatélites, marcadores moleculares, Saccharum officinarum.

  20. Untersuchung von CdTe als Sensormaterial für die spektroskopische Röntgenbildgebung

    OpenAIRE

    Guni, Ewald

    2012-01-01

    Detektorkonzepte mit photonenzählender Ausleseelektronik gewinnen zunehmend an Bedeutung in der medizinischen Bildgebung. Materialien mit hohem Absorptionsvermögen, wie CdTe, sind dabei die bevorzugten Sensormaterialien. Ziel dieser Arbeit war es, CdTe als Sensormaterial in Verbindung mit dem photonenzählenden Auslesechip Medipix2-MXR, im Hinblick auf die Eignung zur spektroskopischen Röntgenbildgebung, zu untersuchen. Das Augenmerk richtete sich dabei auf den Nachweis von Kontrastmitteln in ...

  1. Aspectos genéticos da obesidade Genetics of obesity

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Iva Marques-Lopes

    2004-09-01

    Full Text Available A obesidade definida como a acumulação excessiva de gordura corporal deriva de um desequilíbrio crônico entre a energia ingerida e a energia gasta. Neste desequilíbrio podem estar implicados diversos fatores relacionados com o estilo de vida (dieta e exercício físico, alterações neuro-endócrinas, juntamente com um componente hereditário. O componente genético constitui um fator determinante de algumas doenças congênitas e um elemento de risco para diversas doenças crônicas como diabetes, osteoporose, hipertensão, câncer, obesidade, entre outras. O aumento da prevalência da obesidade em quase todos os países durante os últimos anos, parece indicar que existe uma predisposição ou susceptibilidade genética para a obesidade, sobre a qual atuam os fatores ambientais relacionados com os estilos de vida, em que se incluem principalmente os hábitos alimentares e a atividade física. A utilização de modelos animais de obesidade, a transferência génica e os estudos de associação e ligamento, permitiram a identificação de vários genes implicados na obesidade.Obesity, defined as an excessive body fat accumulation, is caused by a chronic imbalance between energy intake and energy expenditure. Several factors have been associated with this energy imbalance, such as life style (diet and physical activity, neuroendocrine disorders, together with the genetic background. The genetic background is a major determinant factor of some congenital diseases and a risk factor for some chronic disorders, such as diabetes, osteoporosis, hypertension, cancer, obesity, and others. The increased prevalence of obesity in most countries during the last years, seems to indicate that there is a genetic predisposition or susceptibility to be obese which is increased by environmental and life style factors, mainly by food habits and physical in activity. The use of obesity animal models, genetic transfer and the association and linkage studies

  2. A Software-Assurance Design Approach for NextGen Enabling Technologies Project

    Data.gov (United States)

    National Aeronautics and Space Administration — The Next Generation Air Transportation System (NextGen) brings significant advancements to the current management of the National Airspace (NAS). These fundamental...

  3. GenASiS: General Astrophysical Simulation System. II. Nonrelativistic Hydrodynamics

    CERN Document Server

    Cardall, Christian Y; Endeve, Eirik; Mezzacappa, Anthony

    2012-01-01

    In this paper, the second in a series, we document the algorithms and solvers for compressible nonrelativistic hydrodynamics implemented in GenASiS (General Astrophysical Simulation System)---a new code being developed initially and primarily, though by no means exclusively, for the simulation of core-collapse supernovae. In the Mathematics division of GenASiS we introduce Solvers, which includes finite-volume updates for generic hyperbolic BalanceEquations and ordinary differential equation integration Steps. We also introduce the Physics division of GenASiS; this extends the Manifolds division of Mathematics into physical Spaces, defines StressEnergies, and combines these into Universes. We benchmark the hydrodynamics capabilities of GenASiS against many standard test problems; the results illustrate the basic competence of our implementation, demonstrate the manifest superiority of the HLLC over the HLL Riemann solver in a number of interesting cases, and provide preliminary indications of the code's abili...

  4. CLONACIÓN Y FILOGENIA MOLECULAR DE UN SEGMENTO DEL GEN CODANTE DE LA ACTINA DE MYRCIARIA DUBIA “CAMU-CAMU”: UN CANDIDATO PARA GEN DE REFERENCIA

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Juan Castro Gómez

    2012-12-01

    Full Text Available Myrciaria dubia “camu-camu” es un frutal amazónico caracterizado por su amplia variación de vitamina C. Pero los estudios genético moleculares que puedan explicar esta variación son limitados. Por ello nuestro objetivo fue realizar la clonación y filogenia molecular de un segmento del gen codante de la actina de M. dubia. Las muestras fueron obtenidas de la colección de germoplasma del INIA. Luego, el ARN fue purificado y mediante RT-PCR con cebadores degenerados se amplificó un segmento del gen. En base a la secuencia obtenida se diseñaron cebadores específicos para PCR en tiempo real. Los resultados muestran que se ha aislado, clonado y secuenciado un segmento del gen codante de actina de M. dubia y detectado su expresión en hojas, pulpa y cáscara de M. dubia. Así, con el soporte de herramientas bioinformáticas y uso de técnicas de biología molecular hemos aislado, clonado y secuenciado un segmento del gen codante de la actina de M. dubia. Asimismo, los análisis realizados muestran que el gen se expresa y presenta niveles similares de expresión en hojas, pulpa y cáscara de M. dubia. Sin embargo, es necesario realizar más experimentos a fin de verificar su estabilidad de expresión.

  5. Optimització de l’avaluació genètica de la raça bovina Bruna dels Pirineus

    OpenAIRE

    Fina i Pla, Marta

    2013-01-01

    La raça bovina Bruna dels Pirineus és una raça càrnia autòctona de les àrees muntanyoses de Catalunya. Els treballs que conformen la present tesi doctoral pretenen optimitzar l’avaluació genètica que actualment es duu a terme en aquesta raça. Les anàlisis s'han realitzat a partir de 8.130 registres de pes al naixement i 1.245 registres de pes al deslletament de vedells nascuts entre els anys 1986 i 2010, i procedents de 12 i dos explotacions, respectivament. En aquest sentit, el primer dels t...

  6. Revision of the East Mediterranean Orthomus (Coleoptera, Carabidae, Pterostichini, with description of Parorthomus gen. n. socotranus sp. n. from Socotra Island and key to the Old World genera of subtribe Euchroina

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Borislav Gueorguiev

    2014-07-01

    Full Text Available The East Mediterranean species of Orthomus Chaudoir, 1838 are revised. The type series of Feronia longula Reiche & Saulcy, 1855, F. berytensis Reiche & Saulcy, 1855, F. proelonga Reiche & Saulcy, 1855, Orthomus longior Chaudoir, 1873, O. sidonicus Chaudoir, 1873, and O. berytensis akbensis Mateu, 1955 were studied and lectotypes for the first four are designated. Also, the following nomenclatural acts are proposed: Feronia proelonga Reiche & Saulcy, 1855, syn. n. of Orthomus berytensis (Reiche & Saulcy, 1855; Feronia elongata Chaudoir, 1859, syn. n. of Orthomus berytensis (Reiche & Saulcy, 1855; Orthomus sidonicus Chaudoir, 1873, syn. n. of Orthomus longior Chaudoir, 1873; Orthomus velocissimus andalusiacus Mateu, 1957, syn. n. of Orthomus velocissimus akbensis Mateu, 1955, new assignment for Orthomus berytensis akbensis Mateu, 1955. As a result, three species of the genus inhabit the East Mediterranean biogeographical region: O. berytensis, O. longior, and O. longulus. A key to these three species is given. O. longior is recorded for Turkey and Syria for the first time. In addition, a new synonymy of two West Mediterranean taxa is proposed: O. szekessyi (Jedlička, 1956, syn. n. of O. balearicus Piochard de la Brûlerie, 1868, and a new genus and a species are described: Parorthomus gen. n. socotranus sp.n. (type locality: Republic of Yemen, Socotra Archipelago, Socotra Island, Fimihin env., 530 m.a.s.l.. Illustrations of the species dealt with here are provided including external characters, habitus, mentum and submentum, and genitalia are provided.Nine genera of the “African Series” of subtribe Euchroina Chaudoir, 1874 are keyed for the first time. Checklists of the species of Orthomus and of the Old World euchroine genera are given.

  7. Anomalías y displasias dentarias de origen genético-hereditario Inherited dental abnormalities and dysplasias

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    J. Martín-González

    2012-12-01

    Full Text Available Las alteraciones del desarrollo embriológico de la dentición provocan anomalías y displasias dentarias. Los factores etiopatogénicos implicados en las alteraciones del desarrollo dentario son básicamente dos: genéticos y ambientales. Según la fase del desarrollo en que afecten al órgano del esmalte y a los tejidos dentarios, aparecerán diferentes anomalías y/o displasias dentales. El control genético del desarrollo dentario se lleva a cabo mediante dos procesos: a control de la histogénesis del esmalte y la dentina, y b la especificación del tipo, tamaño y posición de cada diente. La mutación de los genes implicados en la amelogénesis (AMELX, ENAM, MMP20 y KLK4 o en la dentinogénesis (DSPP produce alteraciones del desarrollo dentario aisladas o no sindrómicas. Por el contrario, las mutaciones de los genes reguladores morfogenéticos involucrados en la determinación de la posición y el desarrollo precoz de los órganos dentarios (genes homeobox, además de alterar la morfodiferenciación dentaria, tienen efectos pleiotrópicos y afectan a otros órganos, provocando síndromes hereditarios en los que uno de sus rasgos es la alteración dentaria. En este artículo se revisan las principales anomalías y displasias dentarias de causa genético-hereditaria.Alterations of the embryologic development of the dentition cause dental anomalies and dysplasias. The causing factors involved in the disturbances of tooth development are basically two: genetic and environmental factors. Depending on the phase of tooth development when the factors act, they will appear different dental anomalies and dysplasias. Genetic control of tooth development is carried out through two processes: a control of amelogenesis and dentinogenesis,and b the specification of the type, size and position of each tooth. Mutation of genes involved in amelogenesis (AMELX, ENAM, MMP20 and KLK4 and dentinogenesis (DSPP produces non-syndromic alterations of tooth

  8. Correlaciones fenotípicas, genéticas y ambientales en Cucurbita moschata Duch. Ex Poir

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Baena García D.

    2005-03-01

    Full Text Available El estudio estimó las correlaciones fenotípicas, genéticas y ambientales entre doce caracteres agronómicos en dos dialélicos de zapallo (uno entre cinco variedades y otro entre cinco líneas S1, originadas de las anteriores. Se usó un diseño en bloques completos al azar con 15 tratamientos (5 progenitores + 10 cruzamientos F1 para cada dialélico y cinco repeticiones. Los resultados señalaron mayor estimación de las correlaciones (en magnitud y significancia estadística a favor del dialélico de líneas S1. Las correlaciones genéticas fueron superiores a las fenotípicas y las ambientales. La producción por planta (PFP presentó las correlaciones parciales fenotípicas y genéticas más altas con el peso por fruto (PPF y el número de frutos por planta (NFP (rPF y rPG > 0.80. El PPF y NFP pueden usarse como criterios de selección para la obtención de cultivares de altos rendimientos en C. moschata. ABSTRACT Phenotypic, genotypic and environmental correlations in Cucurbita moschata Duch. Ex Poir. The study evaluated phenotypic, genotypic and environmental correlations among 12 agronomy characters, in two set diallelic from five parents each one. The first set from five open pollinated varieties and the second one from five self-pollinated lines S1, obtained from the previous varieties. The two experiments were in completely randomized blocks with five replications. A higher estimation of correlation (in magnitude and statistical significance was observed in favor of the S1 lines diallelic. The genetic correlations were higher than the phenotypic and environmental correlations. The plant yield (PFP showed the highest partial phenotypic and genetic correlations with the fruit weight (PPF and fruits per plant (NFP (rPF and rPG > 0.80. It is suggested to use the PPF and NFP as selection criteria for breeding of C. moschata for development of high yield cultivars. Key words: Calabaza (cucurbita, genetic correlation, agronomic

  9. GenMapDB: a database of mapped human BAC clones

    OpenAIRE

    Morley, Michael; Arcaro, Melissa; Burdick, Joshua; Yonescu, Raluca; Reid, Thomas; Kirsch, Ilan R.; Cheung, Vivian G.

    2001-01-01

    GenMapDB (http://genomics.med.upenn.edu/genmapdb) is a repository of human bacterial artificial chromosome (BAC) clones mapped by our laboratory to sequence-tagged site markers. Currently, GenMapDB contains over 3000 mapped clones that span 19 chromosomes, chromosomes 2, 4, 5, 9–22, X and Y. This database provides positional information about human BAC clones from the RPCI-11 human male BAC library. It also contains restriction fragment analysis data and end sequen...

  10. Cap a una ètica per a la genètica: fonamentació

    OpenAIRE

    Román Maestre, Begoña

    2002-01-01

    Voldria iniciar aquest article, plantejant dues qüestions bàsiques: perquè cal preguntar quina ètica per a la genètica, i perquè la genètica requereix d'una tal ètica. Pel que fa a la primera qüestió, quina ètica, cal aclarir que ha de ser una....

  11. GenBank blastx search result - KOME | LSDB Archive [Life Science Database Archive metadata

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available tents Results of blastx searches against GenBank amino acid sequences Data file File name: kome_genbank_blas...view/kome_genbank_blastx_search_result#en Data acquisition method Performed blastx searches against Genbank ...amino acid sequences. Data analysis method Performed homology searches against se...quences obtained from NCBI GenBank Release 150.0 (15/08/2005) using the blastx program (blast2.2.12). Sequences useed in the searche

  12. GenBank blastn search result - KOME | LSDB Archive [Life Science Database Archive metadata

    Lifescience Database Archive (English)

    Full Text Available tents Results of blastn searches against GenBank nucleotide sequences Data file File name: kome_genbank_blas...view/kome_genbank_blastn_search_result#en Data acquisition method Performed blastn searches against Genbank ...nucleotide sequences. Data analysis method Performed homology searches against se...quences obtained from NCBI GenBank Release 150.0 (15/08/2005) using the blastn program (blast2.2.12). Sequences used in the searche

  13. GenMiner: mining non-redundant association rules from integrated gene expression data and annotations

    OpenAIRE

    Martinez, Ricardo; Pasquier, Nicolas; Pasquier, Claude

    2008-01-01

    International audience GenMiner is an implementation of association rule discovery dedicated to the analysis of genomic data. It allows the analysis of datasets integrating multiple sources of biological data represented as both discrete values, such as gene annotations, and continuous values, such as gene expression measures. GenMiner implements the new NorDi (normal discretization) algorithm for normalizing and discretizing continuous values and takes advantage of the JClose algorithm to...

  14. A 48-plex autosomal SNP GenPlex™ assay for human individualization and relationship testing

    DEFF Research Database (Denmark)

    Tomas Mas, Carmen; Børsting, Claus; Morling, Niels

    2012-01-01

    SNPs are being increasingly used by forensic laboratories. Different platforms have been developed for SNP typing. We describe the GenPlex™ HID system protocol, a new SNP-typing platform developed by Applied Biosystems where 48 of the 52 SNPforID SNPs and amelogenin are included. The GenPlex™ HID...... system protocol has been successfully tested by a number of forensic laboratories using both ordinary and forensic samples....

  15. Crucigrama de conceptos generales de Genética. Nivel básico.

    OpenAIRE

    Cross, Ismael; Rebordinos, Laureana

    2012-01-01

    El archivo es un ejercicio desarrollado con JCross en Hotpotatoes para que los alumnos prueben e identifiquen su nivel de base con respecto a cuestiones básicas de Genética, conceptos, técnicas, características del ADN, etc. El ejercicio permite obtener pistas para completar el crucigrama y de esta manera finalizar el mismo habiendo asimilado o aprendido conceptos ya sabidos o nuevos de Genética.

  16. Micro-Trottoir à Genève à propos du CERN et du LHC

    CERN Multimedia

    CERN Video Productions

    2009-01-01

    Questions : Qu'est-ce-que le LHC? Quelle est la fonction du LHC? Qu'est-ce-que le CERN? D'après vous, les recherches engendrées pour le LHC peuvent-elles ?tre bénéfiques, utiles pour la société? Où a été inventé le Web? Lieux : Forum Meyrin Université de Genève Genève Centre

  17. GenBank and PubMed: How connected are they?

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    Sarkar Indra

    2009-06-01

    Full Text Available Abstract Background GenBank(R is a public repository of all publicly available molecular sequence data from a range of sources. In addition to relevant metadata (e.g., sequence description, source organism and taxonomy, publication information is recorded in the GenBank data file. The identification of literature associated with a given molecular sequence may be an essential first step in developing research hypotheses. Although many of the publications associated with GenBank records may not be linked into or part of complementary literature databases (e.g., PubMed, GenBank records associated with literature indexed in Medline are identifiable as they contain PubMed identifiers (PMIDs. Results Here we show that an analysis of 87,116,501 GenBank sequence files reveals that 42% are associated with a publication or patent. Of these, 71% are associated with PMIDs, and can therefore be linked to a citation record in the PubMed database. The remaining (29% of publication-associated GenBank entries either do not have PMIDs or cite a publication that is not currently indexed by PubMed. We also identify the journal titles that are linked through citations in the GenBank files to the largest number of sequences. Conclusion Our analysis suggests that GenBank contains molecular sequences from a range of disciplines beyond biomedicine, the initial scope of PubMed. The findings thus suggest opportunities to develop mechanisms for integrating biological knowledge beyond the biomedical field.

  18. CLONACIÓN Y FILOGENIA MOLECULAR DE UN SEGMENTO DEL GEN CODANTE DE LA ACTINA DE MYRCIARIA DUBIA “CAMU-CAMU”: UN CANDIDATO PARA GEN DE REFERENCIA

    OpenAIRE

    Juan Castro Gómez; Marianela Cobos Ruiz; Alina Egoavil Reátegui; Roberson Ramírez Saavedra; Sixto Imán Correa; Pedro Adrianzen Julca; Jorge Marapara del Águila

    2012-01-01

    Myrciaria dubia “camu-camu” es un frutal amazónico caracterizado por su amplia variación de vitamina C. Pero los estudios genético moleculares que puedan explicar esta variación son limitados. Por ello nuestro objetivo fue realizar la clonación y filogenia molecular de un segmento del gen codante de la actina de M. dubia. Las muestras fueron obtenidas de la colección de germoplasma del INIA. Luego, el ARN fue purificado y mediante RT-PCR con cebadores degenerados se amplificó un segmento del ...

  19. Dissimilaridade genética de girassol por meio de caracteres quantitativos Agronomic performance and genetic dissimilarity sunflower

    Directory of Open Access Journals (Sweden)

    João Paulo Gonsiorkiewicz Rigon

    2012-11-01

    Full Text Available Objetivou-se com este estudo avaliar, por meio de caracteres quantitativos, a dissimilaridade genética entre cultivares de girassol em diferentes localidades, além da concordância entre os métodos, visando à extração de linhagens para possíveis cruzamentos. Foram cultivados oito híbridos de girassol em duas localidades no noroeste do Rio Grande do Sul, com solo predominantemente do tipo Latossolo Vermelho distrófico. Foram utilizados métodos multivariados para determinar a divergência genética, utilizando a distância generalizada de Mahalanobis. Apesar dos rendimentos distintos entre locais e cultivares, os métodos de agrupamento tiveram concordância entre si. Para obtenção de populações segregantes, a cultivar 'Olisun 5', independente da localidade, demonstrou-se com maior potencial de hibridação, tendo as maiores contribuições por meio do número de aquênios por capítulo e altura de inserção do capítulo.The aim of this study to evaluate by means of quantitative traits, the genetic dissimilarity among sunflower cultivars in different locations, in addition to the agreement between the methods in order to extract lines for future crosses. There were eight sunflower hybrids grown in two locations in northwestern Rio Grande do Sul, mainly with soil type Oxisol. Multivariate methods were used to determine the genetic diversity, using the Mahalanobis distance. Although the different yield between locations and cultivars, methods of grouping agreed among them selves. To obtain segregating populations, regardless of location, the cultivate 'Olisun 5', demonstrated greater potential for hybridization, with major contributions through number of achenes per chapter and height of the insertion section.

  20. Pseudogracilibacillus auburnensis gen. nov., sp. nov., isolated from the rhizosphere of Zea mays.

    Science.gov (United States)

    Glaeser, Stefanie P; McInroy, John A; Busse, Hans-Jürgen; Kämpfer, Peter

    2014-07-01

    A Gram-positive-staining, aerobic, endospore-forming bacterium, strain P-207(T), was isolated from a rhizosphere soil sample in Auburn, AL, USA. On the basis of 16S rRNA gene sequence comparisons, strain P-207(T) was grouped in the vicinity of representatives of the genera Virgibacillus, Ornithinibacillus, Cerasibacillus, Lentibacillus and Oceanobacillus, but could not be assigned clearly to any of these genera. The highest similarity was found to the sequence of Virgibacillus carmonensis LMG 20964(T) (94.4%); however, the 16S rRNA gene sequence similarity to the type strain of the type species of Virgibacillus, Virgibacillus pantothenticus, was only 92.9%. The quinone system of strain P-207(T) consisted predominantly of menaquinone MK-7. The polar lipid profile exhibited the major lipids diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol and phosphatidylethanolamine and moderate to minor amounts of several unidentified phospholipids, glycolipids and phosphoglycolipids, an aminophospholipid and an aminolipid. The diagnostic diamino acid of the peptidoglycan was meso-diaminopimelic acid and the polyamine pattern contained predominantly spermidine and spermine. The major fatty acids were anteiso-C15 : 0, anteiso-C17 : 0, iso-C16 : 0 and iso-C15 : 0. The G+C content of the genomic DNA was 34 mol%. Because of the low sequence similarity of strain P-207(T) to all representatives of Virgibacillus, Ornithinibacillus, Cerasibacillus, Lentibacillus and Oceanobacillus, which was always <95%, and its unique lipid pattern, we propose that strain P-207(T) represents a novel species in a new genus, for which the name Pseudogracilibacillus auburnensis gen. nov., sp. nov. is proposed. The type strain of Pseudogracilibacillus auburnensis is P-207(T) ( = CCM 8509(T)  =  LMG 28212(T) = CIP 110797(T)). PMID:24801155