Immunization against HTLV-I with chitosan and tri-methylchitosan nanoparticles loaded with recombinant env23 and env13 antigens of envelope protein gp46.

Science.gov (United States)

Amirnasr, Maryam; Fallah Tafti, Tannan; Sankian, Mojtaba; Rezaei, Abdorrahim; Tafaghodi, Mohsen

2016-08-01

To prevent the spread of HTLV-I (Human T-lymphotropic virus type 1), a safe and effective vaccine is required. To increase immune responses against the peptide antigens can be potentiated with polymer-based nanoparticles, like chitosan (CHT) and trimethylchitosan (TMC), as delivery system/adjuvant. CHT and TMC nanoparticles loaded with recombinant proteins (env23 & env13) of gp46 were prepared by direct coating of antigens with positively charged polymers. The size of CHT and TMC nanoparticles (NPs) loaded with each antigen was about 400 nm. The physical stability of NPs was followed for 4 weeks. Both formulations showed to be stable for about 15 days. The immunogenicity of NPs loaded with antigens was studied after nasal and subcutaneous immunization in mice. Three immunizations (7.5 μg antigen) were performed with 2 weeks intervals. Two weeks after the last booster dose, sera IgG subtypes were measured. After subcutaneous administration, for both nanoparticulate antigens, serum IgG1 and IgGtotal levels were higher than antigen solution (P nanoparticles showed good immunoadjuvant potential. Env23 antigen was a better candidate for vaccination against HTLV-I, as it induced higher cellular immune responses, compared with env13. Copyright © 2016 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Discusión: Explicaciones genéticas y psicológicas de la esquizofrenia.Genética de la esperanza

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Silvio Bolaños-Salvatierra

2003-01-01

Full Text Available En este documento se rebaten críticas hechas por Raventós y Jensen al artículo “Genética y comportamiento”. Cuatro temas fueron seleccionados: 1 se determina que los antipsicóticos aparecieron veinte años después de la concepción hereditaria de la esquizofrenia; 2 se considera que la discusión es altamente pertinente, para nada bizantina o irrelevante, debido que persisten prácticas epistémicas riesgosas en los investigadores genético-conductuales; 3 aunque ninguna conducta humana está exenta de influencia constitucional, el enfoque biologicista se ha propasado al pretender explicar genéticamente casi todo, desconfirmando solapadamente la importancia de la historia personal; y, 4 se plantea que la investigación biológica sobrevalora el peso de las anomalías genéticas frente a la historia social, por lo que solo aparenta cautela. Se propone investigar genéticamente la esperanza con el objetivo de saturar a la humanidad con ese tipo de explicaciones, para alcanzar más rápido una convivencia basada en la tolerancia y el respeto.

Genetic and physiological analysis of an envB spherelike mutant of Escherichia coli K-12 and characterization of its transductants

International Nuclear Information System (INIS)

Westling-Haggstrom, B.; Normark, S.

1975-01-01

The envB1 mutation mediating a distorted cell morphology of Escherichia coli K-12 was cotransducible with strA, aroE, aspB, and argG. The mapping data is consistent with a gene location for envB around 62.5 min. In partial diploids envB1 was recessive to its wild-type allele. The original envB mutant contained a second mutation in a locus denoted sloB close to strA. The following gene order is suggested: sloB-strA-aroE-envB-aspB-argG. The sloB1 mutation caused a marked reduction in the growth rate of both envB and envB + strains. Moreover, this mutation in the presence of envB1 appears to increase the ratio between deoxyribonucleic acid and protein in cells growing in rich medium. The phenotypic properties of envB1, sloB + , and envB + transductants were characterized. Cells with envB1, sloB + genotype were hypersensitive to several penicillins including the β-lactam compound, amidino penicillin. Penicillin hypersensitivity could not be explained by increased outer membrane penetrability. The original envB mutant (envB1, sloB1), as well as envB1, sloB1 or envB + , sloB1 transductants were resistant to amidino penicillin. Resistance was explained by the slow growth rate medicated by the sloB1 mutation. The similarity between envB cells and wild-type cells treated with sublethal concentrations of amidino penicillin was emphasized. (U.S.)

Microsatélites amplificados al azar (RAM en estudios de diversidad genética vegetal

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jaime Eduardo Muñoz Flórez

2008-12-01

Full Text Available Se revisó el uso e importancia, ventajas, desventajas y características de la técnica Microsatélites Amplificados al Azar (RAM en uchuva Physalis peruviana, mora Rubus spp, guayaba Psidium guajava y heliconias Heliconia spp. En mora se diferenciaron las especies R. glaucus, R. robustus y R. urticifolius, se detectaron duplicados y se encontró alta variabilidad genética en R. glaucus, la especie más importante. En uchuva se encontró alta diversidad y dos accesiones de fruto rojo que se diferenciaron genéticamente de las amarillas y una región geográfica con alta variabilidad. En guayaba los cebadores fueron altamente polimórficos y se encontró alta variabilidad en el Valle del Cauca. En heliconias y especies relacionadas se diferenciaron las familias del orden Zingiberales, algunos subgéneros y variaciones en la especie. La técnica es de bajo costo, utiliza un cebador, no requiere información previa, es altamente polimórfica y diferencia especies en los taxones evaluados.

Comportamiento productivo y reproductivo al parto y al destete en cerdas de siete líneas genéticas

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Carlos Alberto García-Munguía

2014-01-01

Full Text Available El objetivo del estudio fue evaluar los efectos de línea genética (LG, número de parto (NP y sala de parto (S en el tamaño de la camada nacida viva (TCNV, el número de lechones nacidos muertos por camada (LNM, e l tamaño de la camada al nacimiento (TCN y al destete (TCD, los pesos de la camada al nacimiento (PCN y al destete (PCD, el consumo diario de alimento de la cerda (CDA y las pérdidas de peso (PPL y grasa dorsal (PGD de la cerda en la lactancia. Además de los efectos fijos LG, NP y S, el modelo incluyó las covariables TCN para PCN y TCD para PCD. Se encontraron diferencias ( P< 0.0026 entre LG para TCN, TCNV, LNM y CDA. El NP sólo fue significativo ( P <0.0001 para CDA, S sólo lo fue ( P< 0.0380 para LNM. Las cerdas de tres o más partos tuvieron mayor CDA (4.5 ± 0.2 kg que las de primero o segundo partos (3.4 ± 0.2 kg. Se requiere reforzar la atención al parto y dura nte la lactancia para reducir la muerte de lechones al parto y en la lactancia; así como evitar que la cerda pierda d emasiado peso y grasa dorsal con el fin de reducir el deterioro del comportamiento productivo y reproductivo postd estete.

Molecular epidemiological analysis of paired pol/env sequences from Portuguese HIV type 1 patients.

Science.gov (United States)

Abecasis, Ana B; Martins, Andreia; Costa, Inês; Carvalho, Ana P; Diogo, Isabel; Gomes, Perpétua; Camacho, Ricardo J

2011-07-01

The advent of new therapeutic approaches targeting env and the search for efficient anti-HIV-1 vaccines make it necessary to identify the number of recombinant forms using genomic regions that were previously not frequently sequenced. In this study, we have subtyped paired pol and env sequences from HIV-1 strains infecting 152 patients being clinically followed in Portugal. The percentage of strains in which we found discordant subtypes in pol and env was 25.7%. When the subtype in pol and env was concordant (65.1%), the most prevalent subtypes were subtype B (40.8%), followed by subtype C (17.8%) and subtype G (5.3%). The most prevalent recombinant form was CRF14_BGpol/Genv (7.2%).

Rapid evolution of the env gene leader sequence in cats naturally infected with feline immunodeficiency virus

Science.gov (United States)

Hughes, Joseph; Biek, Roman; Litster, Annette; Willett, Brian J.; Hosie, Margaret J.

2015-01-01

Analysing the evolution of feline immunodeficiency virus (FIV) at the intra-host level is important in order to address whether the diversity and composition of viral quasispecies affect disease progression. We examined the intra-host diversity and the evolutionary rates of the entire env and structural fragments of the env sequences obtained from sequential blood samples in 43 naturally infected domestic cats that displayed different clinical outcomes. We observed in the majority of cats that FIV env showed very low levels of intra-host diversity. We estimated that env evolved at a rate of 1.16×10−3 substitutions per site per year and demonstrated that recombinant sequences evolved faster than non-recombinant sequences. It was evident that the V3–V5 fragment of FIV env displayed higher evolutionary rates in healthy cats than in those with terminal illness. Our study provided the first evidence that the leader sequence of env, rather than the V3–V5 sequence, had the highest intra-host diversity and the highest evolutionary rate of all env fragments, consistent with this region being under a strong selective pressure for genetic variation. Overall, FIV env displayed relatively low intra-host diversity and evolved slowly in naturally infected cats. The maximum evolutionary rate was observed in the leader sequence of env. Although genetic stability is not necessarily a prerequisite for clinical stability, the higher genetic stability of FIV compared with human immunodeficiency virus might explain why many naturally infected cats do not progress rapidly to AIDS. PMID:25535323

Interrelationships of VEL1 and ENV1 in light response and development in Trichoderma reesei.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Hoda Bazafkan

Full Text Available Sexual development is regulated by a complex regulatory mechanism in fungi. For Trichoderma reesei, the light response pathway was shown to impact sexual development, particularly through the photoreceptor ENVOY. Moreover, T. reesei communicates chemically with a potential mating partner in its vicinity, a response which is mediated by the velvet family protein VEL1 and its impact on secondary metabolism. We therefore studied the regulatory interactions of ENV1 and VEL1 with a focus on sexual development. Although individual mutants in both genes are female sterile under standard crossing conditions (light-dark cycles, an altered light regime enabled sexual development, which we found to be due to conditional female sterility of Δenv1, but not Δvel1. Phenotypes of growth and asexual sporulation as well as regulation of the peptide pheromone precursors of double mutants suggested that ENV1 and VEL1 balance positive and negative regulators of these functions. Additionally, VEL1 contributed to the strong deregulation of the pheromone system observed in env1 mutants. Female sterility of Δvel1 was rescued by deletion of env1 in darkness in MAT1-1, indicating a block of sexual development by ENV1 in darkness that is balanced by VEL1 in the wild-type. We conclude that ENV1 and VEL1 exert complementing functions in development of T. reesei. Our results further showed that the different developmental phenotypes of vel1/veA mutants in T. reesei and Aspergillus nidulans are not due to the presence or function of ENV1 in the VELVET regulatory pathway in T. reesei.

Estudio molecular del gen MLL en 30 pacientes con leucemias agudas Molecular study of MLL gen in 30 patients with acute leukemias

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Raquel Levón Herrera

2000-04-01

Full Text Available Los reordenamientos del gen MLL en la banda cromosómica 11q23 son frecuentes en leucemias agudas (LA en niños y en las LA secundarias desarrolladas después de la terapia con inhibidores de la enzima topoisomerasa II. En menor medida también se aprecia en adultos con LA. La presencia de estos reordenamientos se considera un indicador de mal pronóstico asociado con resultados clínicos desfavorables, por ello es muy importante realizar su determinación en las LA. En este trabajo mostramos los resultados preliminares de la introducción del estudio del gen MLL en nuestro país mediante la técnica de Southern. Analizamos ADN de 30 pacientes con LA, incluidos niños y adultos, que en el momento del estudio se encontraban al debut o en recaída. El estudio molecular se realizó con la sonda FA4, que es un inserto genómico del gen MLL. Sólo uno de los 30 pacientes mostró bandas de reordenamiento con 2 enzimas de restricción diferentes, el resto mostró el gen MLL en configuración germinal. Es interesante destacar que el paciente con el reordenamiento era un niño con leucemia mieloblástica aguda subtipo M5b, lo cual concuerda con la literatura, donde se describe que estos reordenamientos están estrechamente correlacionados con los subtipos mielomonocítico (M4 y monocítico (M5 de leucemia mieloide aguda (LMARearrangements of MLL gen in llq23 chromosomal band are frequents in childhood type of acute leukemia (AL and in secondary AL, developed after therapy with II topoisomerase enzyme. To a lesser extent also is seen in adults with AL. Presence of theses rearrangements is considered to be a worse prognosis indicator, associated with unfavourable clinical results, that is why it is very important to carry our its assessment in AL. In this paper authors present preliminary results from introduction of study on MLL gen in our country through Southern technique. DNA from 30 patients was analized, including children and adults, that at the

The impact of envelope glycoprotein cleavage on the antigenicity, infectivity, and neutralization sensitivity of Env-pseudotyped human immunodeficiency virus type 1 particles

International Nuclear Information System (INIS)

Herrera, Carolina; Klasse, Per Johan; Michael, Elizabeth; Kake, Shivani; Barnes, Kelly; Kibler, Christopher W.; Campbell-Gardener, Lila; Si, Zhihai; Sodroski, Joseph; Moore, John P.; Beddows, Simon

2005-01-01

Endoproteolytic processing of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) envelope (Env) glycoproteins is an obligate part of the biosynthetic pathway that generates functional, fusion-competent Env complexes, which are then incorporated into infectious virions. We have examined the influence of cleavage on Env-specific antibody reactivity, Env incorporation into pseudovirions, and the infectivity and neutralization sensitivity of Env-pseudotyped viruses. To do so, we have used both incompletely processed wild-type (Wt) Env and engineered, cleavage-defective Env mutants. We find that there is no simple association between antibody reactivity to cell surface-expressed Env, and the ability of the same antibody to neutralize virus pseudotyped with the same Env proteins. One explanation for the absence of such an association is the diverse array of Env species present on the surface of transiently transfected cells. We also confirm that cleavage-defective mutants are antigenically different from Wt Env. These findings have implications for the use of Env binding assays as predictors of neutralizing activity, and for the development of cleavage-defective Env trimers for use as subunit immunogens

Mejoramiento genético acelerado de angiospermas perennes vía inducción floral por sobre-expresión del gen FT

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Rafael Urrea López

2018-05-01

Full Text Available Los bosques y selvas enfrentan el reto de satisfacer la demanda por recursos de una población en crecimiento, así como la amenaza del rápido cambio climático que exacerba la magnitud y frecuencia de estreses bióticos y abióticos. Para ello, es urgente acelerar el mejoramiento genético de especies forestales. Sin embargo, sus largas etapas juveniles y asincronía floral retrasan peligrosamente este proceso. El presente ensayo explora los adelantos biotecnológicos en inducción floral y su potencial aplicación en especies forestales. Entre los genes identificados y caracterizados que participan en la ruta de señalización de la floración, especial atención se destina al gen FLOWERING LOCUS T, considerado un integrador de rutas de señalización altamente conservado entre las angiospermas, que, al sobre-expresarse por ingeniería genética, es capaz de inducir la floración de forma eficiente. Esta novedosa estrategia biotecnológica se ha utilizado, recientemente, para segregar genes de resistencia a enfermedades, en un menor tiempo, en germoplasma comercial de manzana y ciruela. Permite soslayar barreras naturales que por mucho tiempo han restringido a las especies forestales al mejoramiento por selección, principalmente. Entre sus ventajas está la de poder restringirla al proceso y no al producto, para acelerar las cruzas sexuales sin modificar genéticamente la progenie; se aleja así de la controversia alrededor de la liberación y consumo de organismos genéticamente modificados, y de los costos y trámites obligatorios para los OGM para monitoreo de posibles riesgos. Se proyecta como una tecnología que puede acelerar, significativamente, el mejoramiento de especies forestales.

From AWE-GEN to AWE-GEN-2d: a high spatial and temporal resolution weather generator

Science.gov (United States)

Peleg, Nadav; Fatichi, Simone; Paschalis, Athanasios; Molnar, Peter; Burlando, Paolo

2016-04-01

A new weather generator, AWE-GEN-2d (Advanced WEather GENerator for 2-Dimension grid) is developed following the philosophy of combining physical and stochastic approaches to simulate meteorological variables at high spatial and temporal resolution (e.g. 2 km x 2 km and 5 min for precipitation and cloud cover and 100 m x 100 m and 1 h for other variables variable (temperature, solar radiation, vapor pressure, atmospheric pressure and near-surface wind). The model is suitable to investigate the impacts of climate variability, temporal and spatial resolutions of forcing on hydrological, ecological, agricultural and geomorphological impacts studies. Using appropriate parameterization the model can be used in the context of climate change. Here we present the model technical structure of AWE-GEN-2d, which is a substantial evolution of four preceding models (i) the hourly-point scale Advanced WEather GENerator (AWE-GEN) presented by Fatichi et al. (2011, Adv. Water Resour.) (ii) the Space-Time Realizations of Areal Precipitation (STREAP) model introduced by Paschalis et al. (2013, Water Resour. Res.), (iii) the High-Resolution Synoptically conditioned Weather Generator developed by Peleg and Morin (2014, Water Resour. Res.), and (iv) the Wind-field Interpolation by Non Divergent Schemes presented by Burlando et al. (2007, Boundary-Layer Meteorol.). The AWE-GEN-2d is relatively parsimonious in terms of computational demand and allows generating many stochastic realizations of current and projected climates in an efficient way. An example of model application and testing is presented with reference to a case study in the Wallis region, a complex orography terrain in the Swiss Alps.

Molecular identification of erythrocytic necrosis virus (ENV) from the blood of Pacific herring (Clupea pallasii)

Science.gov (United States)

Emmenegger, Eveline J.; Glenn, Jolene A.; Winton, James R.; Batts, William N.; Gregg, Jacob L.; Hershberger, Paul K.

2014-01-01

Viral erythrocytic necrosis (VEN) is a condition affecting the red blood cells of more than 20 species of marine and anadromous fishes in the North Atlantic and North Pacific Oceans. Among populations of Pacific herring (Clupea pallasii) on the west coast of North America the disease causes anemia and elevated mortality in periodic epizootics. Presently, VEN is diagnosed by observation of typical cytoplasmic inclusion bodies in stained blood smears from infected fish. The causative agent, erythrocytic necrosis virus (ENV), is unculturable and a presumed iridovirus by electron microscopy. In vivo amplification of the virus in pathogen-free laboratory stocks of Pacific herring with subsequent virus concentration, purification, DNA extraction, and high-throughput sequencing were used to obtain genomic ENV sequences. Fragments with the highest sequence identity to the family Iridoviridae were used to design four sets of ENV-specific polymerase chain reaction (PCR) primers. Testing of blood and tissue samples from experimentally and wild infected Pacific herring as well as DNA extracted from other amphibian and piscine iridoviruses verified the assays were specific to ENV with a limit of detection of 0.0003 ng. Preliminary phylogenetic analyses of a 1448 bp fragment of the putative DNA polymerase gene supported inclusion of ENV in a proposed sixth genus of the family Iridoviridae that contains other erythrocytic viruses from ectothermic hosts. This study provides the first molecular evidence of ENV's inclusion within the Iridoviridae family and offers conventional PCR assays as a means of rapidly surveying the ENV-status of wild and propagated Pacific herring stocks.

Antigenic properties of a transport-competent influenza HA/HIV Env chimeric protein

International Nuclear Information System (INIS)

Ye Ling; Sun Yuliang; Lin Jianguo; Bu Zhigao; Wu Qingyang; Jiang, Shibo; Steinhauer, David A.; Compans, Richard W.; Yang Chinglai

2006-01-01

The transmembrane subunit (gp41) of the HIV Env glycoprotein contains conserved neutralizing epitopes which are not well-exposed in wild-type HIV Env proteins. To enhance the exposure of these epitopes, a chimeric protein, HA/gp41, in which the gp41 of HIV-1 89.6 envelope protein was fused to the C-terminus of the HA1 subunit of the influenza HA protein, was constructed. Characterization of protein expression showed that the HA/gp41 chimeric proteins were expressed on cell surfaces and formed trimeric oligomers, as found in the HIV Env as well as influenza HA proteins. In addition, the HA/gp41 chimeric protein expressed on the cell surface can also be cleaved into 2 subunits by trypsin treatment, similar to the influenza HA. Moreover, the HA/gp41 chimeric protein was found to maintain a pre-fusion conformation. Interestingly, the HA/gp41 chimeric proteins on cell surfaces exhibited increased reactivity to monoclonal antibodies against the HIV Env gp41 subunit compared with the HIV-1 envelope protein, including the two broadly neutralizing monoclonal antibodies 2F5 and 4E10. Immunization of mice with a DNA vaccine expressing the HA/gp41 chimeric protein induced antibodies against the HIV gp41 protein and these antibodies exhibit neutralizing activity against infection by an HIV SF162 pseudovirus. These results demonstrate that the construction of such chimeric proteins can provide enhanced exposure of conserved epitopes in the HIV Env gp41 and may represent a novel vaccine design strategy for inducing broadly neutralizing antibodies against HIV

Constitutive activation of a variant of the env-mpl oncogene product by disulfide-linked homodimerization.

OpenAIRE

Courtois, G; Bénit, L; Mikaeloff, Y; Pauchard, M; Charon, M; Varlet, P; Gisselbrecht, S

1995-01-01

The myeloproliferative leukemia retrovirus (MPLV) has the v-mpl cellular sequences transduced in frame with the deleted and rearranged Friend murine leukemia virus env gene. The resulting env-mpl fusion oncogene is responsible for an acute myeloproliferative disorder induced in mice by MPLV. v-mpl is a truncated form of the c-mpl gene which encodes the receptor for thrombopoietin. We investigated the contribution of the Env-Mpl extracellular domain in the constitutive activation of this trunc...

HIV-1 tat promotes integrin-mediated HIV transmission to dendritic cells by binding Env spikes and competes neutralization by anti-HIV antibodies.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Paolo Monini

Full Text Available Use of Env in HIV vaccine development has been disappointing. Here we show that, in the presence of a biologically active Tat subunit vaccine, a trimeric Env protein prevents in monkeys virus spread from the portal of entry to regional lymph nodes. This appears to be due to specific interactions between Tat and Env spikes that form a novel virus entry complex favoring R5 or X4 virus entry and productive infection of dendritic cells (DCs via an integrin-mediated pathway. These Tat effects do not require Tat-transactivation activity and are blocked by anti-integrin antibodies (Abs. Productive DC infection promoted by Tat is associated with a highly efficient virus transmission to T cells. In the Tat/Env complex the cysteine-rich region of Tat engages the Env V3 loop, whereas the Tat RGD sequence remains free and directs the virus to integrins present on DCs. V2 loop deletion, which unshields the CCR5 binding region of Env, increases Tat/Env complex stability. Of note, binding of Tat to Env abolishes neutralization of Env entry or infection of DCs by anti-HIV sera lacking anti-Tat Abs, which are seldom present in natural infection. This is reversed, and neutralization further enhanced, by HIV sera containing anti-Tat Abs such as those from asymptomatic or Tat-vaccinated patients, or by sera from the Tat/Env vaccinated monkeys. Thus, both anti-Tat and anti-Env Abs are required for efficient HIV neutralization. These data suggest that the Tat/Env interaction increases HIV acquisition and spreading, as a mechanism evolved by the virus to escape anti-Env neutralizing Abs. This may explain the low effectiveness of Env-based vaccines, which are also unlikely to elicit Abs against new Env epitopes exposed by the Tat/Env interaction. As Tat also binds Envs from different clades, new vaccine strategies should exploit the Tat/Env interaction for both preventative and therapeutic interventions.

Repeated Vaccination of Cows with HIV Env gp140 during Subsequent Pregnancies Elicits and Sustains an Enduring Strong Env-Binding and Neutralising Antibody Response.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Behnaz Heydarchi

Full Text Available An important feature of a potential vaccine against HIV is the production of broadly neutralising antibodies (BrNAbs capable of potentially blocking infectivity of a diverse array of HIV strains. BrNAbs naturally arise in some HIV infected individuals after several years of infection and their serum IgG can neutralise various HIV strains across different subtypes. We previously showed that vaccination of cows with HIV gp140 AD8 trimers resulted in a high titre of serum IgG against HIV envelope (Env that had strong BrNAb activity. These polyclonal BrNAbs concentrated into the colostrum during the late stage of pregnancy and can be harvested in vast quantities immediately after calving. In this study, we investigated the effect of prolonged HIV gp140 vaccination on bovine colostrum IgG HIV Env-binding and BrNAb activity over subsequent pregnancies. Repeated immunisation led to a maintained high titre of HIV Env specific IgG in the colostrum batches, but this did not increase through repeated cycles. Colostrum IgG from all batches also strongly competed with sCD4 binding to gp140 Env trimer and with human-derived monoclonal VRC01 and b12 BrNAbs that bind the CD4 binding site (CD4bs. Furthermore, competition neutralisation assays using RSC3 Env gp120 protein core and a derivative CD4bs mutant, RSC3 Δ371I/P363N, showed that CD4bs neutralising antibodies contribute to the neutralising activity of all batches of purified bovine colostrum IgG. This result indicates that the high IgG titre/avidity of anti-CD4bs antibodies with BrNAb activity was achieved during the first year of vaccination and was sustained throughout the years of repeated vaccinations in the cow tested. Although IgG of subsequent colostrum batches may have a higher avidity towards the CD4bs, the overall breadth in neutralisation was not enhanced. This implies that the boosting vaccinations over 4 years elicited a polyclonal antibody response that maintained the proportion of both

Antibody to gp41 MPER alters functional properties of HIV-1 Env without complete neutralization.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Arthur S Kim

2014-07-01

Full Text Available Human antibody 10E8 targets the conserved membrane proximal external region (MPER of envelope glycoprotein (Env subunit gp41 and neutralizes HIV-1 with exceptional potency. Remarkably, HIV-1 containing mutations that reportedly knockout 10E8 binding to linear MPER peptides are partially neutralized by 10E8, producing a local plateau in the dose response curve. Here, we found that virus partially neutralized by 10E8 becomes significantly less neutralization sensitive to various MPER antibodies and to soluble CD4 while becoming significantly more sensitive to antibodies and fusion inhibitors against the heptad repeats of gp41. Thus, 10E8 modulates sensitivity of Env to ligands both pre- and post-receptor engagement without complete neutralization. Partial neutralization by 10E8 was influenced at least in part by perturbing Env glycosylation. With unliganded Env, 10E8 bound with lower apparent affinity and lower subunit occupancy to MPER mutant compared to wild type trimers. However, 10E8 decreased functional stability of wild type Env while it had an opposite, stabilizing effect on MPER mutant Envs. Clade C isolates with natural MPER polymorphisms also showed partial neutralization by 10E8 with altered sensitivity to various gp41-targeted ligands. Our findings suggest a novel mechanism of virus neutralization by demonstrating how antibody binding to the base of a trimeric spike cross talks with adjacent subunits to modulate Env structure and function. The ability of an antibody to stabilize, destabilize, partially neutralize as well as alter neutralization sensitivity of a virion spike pre- and post-receptor engagement may have implications for immunotherapy and vaccine design.

HBV X Protein induces overexpression of HERV-W env through NF-κB in HepG2 cells.

Science.gov (United States)

Liu, Cong; Liu, Lijuan; Wang, Xiuling; Liu, Youyi; Wang, Miao; Zhu, Fan

2017-12-01

Human endogenous retrovirus W family (HERV-W) envelope (env) at chromosome 7 is highly expressed in the placenta and possesses fusogenic activity in trophoblast development. HERV-W env has been found to be overexpressed in some cancers and immune diseases. Viral transactivators can induce the overexpression of HERV-W env in human cell lines. Hepatitis B virus X protein (HBx) is believed to be a multifunctional oncogenic protein. Here, we reported that HBx could increase the promoter activity of HERV-W env and upregulate the mRNA levels of non-spliced and spliced HERV-W env and also its protein in human hepatoma HepG2 cells. Interestingly, we found that the inhibition of nuclear factor κB (NF-κB) using shRNA targeting NF-κB/p65 or PDTC (an inhibitor of NF-κB) could attenuate the upregulation of HERV-W env induced by HBx. These suggested that HBx might upregulate the expression of HERV-W env through NF-κB in HepG2 cells. This study might provide a new insight in HBV-associated liver diseases including HCC.

HIV-1 Env trimer opens through an asymmetric intermediate in which individual protomers adopt distinct conformations.

Science.gov (United States)

Ma, Xiaochu; Lu, Maolin; Gorman, Jason; Terry, Daniel S; Hong, Xinyu; Zhou, Zhou; Zhao, Hong; Altman, Roger B; Arthos, James; Blanchard, Scott C; Kwong, Peter D; Munro, James B; Mothes, Walther

2018-03-21

HIV-1 entry into cells requires binding of the viral envelope glycoprotein (Env) to receptor CD4 and coreceptor. Imaging of individual Env molecules on native virions shows Env trimers to be dynamic, spontaneously transitioning between three distinct well-populated conformational states: a pre-triggered Env (State 1), a default intermediate (State 2) and a three-CD4-bound conformation (State 3), which can be stabilized by binding of CD4 and coreceptor-surrogate antibody 17b. Here, using single-molecule Fluorescence Resonance Energy Transfer (smFRET), we show the default intermediate configuration to be asymmetric, with individual protomers adopting distinct conformations. During entry, this asymmetric intermediate forms when a single CD4 molecule engages the trimer. The trimer can then transition to State 3 by binding additional CD4 molecules and coreceptor.

Transhumanistas y Bioconservadores en torno al dopaje genético

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Raúl Francisco Sebastián Solanes

2013-04-01

Full Text Available En el presente texto proponemos una reflexión sobre uso de tecnologías genéticas que  aumentan el rendimiento deportivo como futuro campo de investigación de una Neuroética social. Este problema, que se ha dado en llamar “dopaje genético”, congrega a su alrededor un debate entre los partidarios del Bioconservadurismo y del Transhumanismo. Expondremos la concepción de dos importantes representantes del Transhumanismo (J. Savulescu y C. Tamburrini y de dos conocidos partidarios del Bioconservadurismo (M. Sandel y R. L. Simon, a fin de subrayar la importancia de este debate y las futuras implicaciones en la mejora del rendimiento físico, cognitivo y educacional a las que se deberá hacer frente desde el nivel socio-cultural de la Neuroética.

Consideraciones genéticas sobre las dislipidemias y la aterosclerosis

OpenAIRE

Julio César Fernández Travieso

2008-01-01

La interacción entre factores genéticos y ambientales explican muchos aspectos de la aterosclerosis y las variaciones genéticas constituyen marcadores de riesgo de la enfermedad coronaria (EC), la cual ocupa el primer lugar entre las causas de morbilidad y mortalidad a nivel mundial. La predisposición familiar a padecer EC, junto al avance vertiginoso en técnicas de análisis de ADN y la disponibilidad de secuencias del genoma humano, han orientado la investigación de alteraciones genéticas re...

Conservation of a proteinase cleavage site between an insect retrovirus (gypsy) Env protein and a baculovirus envelope fusion protein

International Nuclear Information System (INIS)

Pearson, Margot N.; Rohrmann, George F.

2004-01-01

The predicted Env protein of insect retroviruses (errantiviruses) is related to the envelope fusion protein of a major division of the Baculoviridae. The highest degree of homology is found in a region that contains a furin cleavage site in the baculovirus proteins and an adjacent sequence that has the properties of a fusion peptide. In this investigation, the homologous region in the Env protein of the gypsy retrovirus of Drosophila melanogaster (DmegypV) was investigated. Alteration of the predicted DmegypV Env proteinase cleavage site from RIAR to AIAR significantly reduced cleavage of Env in both Spodoptera frugiperda (Sf-9) and D. melanogaster (S2) cell lines. When the predicted DmegypV Env cleavage site RIAR was substituted for the cleavage sequence RRKR in the Lymantria dispar nucleopolyhedrovirus fusion protein (LD130) sequence, cleavage of the hybrid LD130 molecules still occurred, although at a reduced level. The conserved 21-amino acid sequence just downstream of the cleavage site, which is thought to be the fusion peptide in LD130, was also characterized. When this sequence from DmegypV Env was substituted for the homologous sequence in LD130, cleavage still occurred, but no fusion was observed in either cell type. In addition, although a DmegypV-Env-green fluorescent protein construct localized to cell membranes, no cell fusion was observed

Ensemble/Variational Estimation (EnVE) and its application to canonical turbulent flow realizations

Science.gov (United States)

Colburn, Christopher; Cessna, Joseph; Bewley, Thomas

2008-11-01

The recently-developed hybrid EnVE method for data assimilation incorporates successive adjoint optimizations to update the initial conditions of a flow model, over various horizons of interest, in order to reconcile this model with recent measurements. Such adjoint optimizations typically require the trajectory to be saved over the entire interval over which the optimization is performed; in high-dimensional systems, this can lead to significant storage problems, which can be partially alleviated via checkpointing. In the EnVE framework, this requirement is eliminated, and supplanted by a requirement to march the state of the system backward in time simultaneously with the adjoint. If the system is derived from a PDE with a diffusive component, this backward-in-time state march is ill conditioned, and requires regularization/smoothing to prevent errors from accumulating rapidly at the small scales. The present talk focuses on this peculiar requirement of the EnVE algorithm. As the forecasting problem may itself be considered as a smoothing problem, it is, in fact, expected to find a ``smoothing'' ingredient at the heart of an algorithm of this sort. Various strategies are proposed and tested for accomplishing the required smoothing in the EnVE setting, and are tested on both a chaotic 1D PDE (the Kuramoto-Sivashinsky equation) as well as our in-house spectral 3D DNS/LES code, diablo.

Characterization of BIV Env core: Implication for mechanism of BIV-mediated cell fusion

International Nuclear Information System (INIS)

Li Shu; Zhu Jieqing; Peng Yu; Cui Shanshan; Wang Chunping; Gao, George F.; Tien Po

2005-01-01

Entry of lentiviruses, such as human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) and simian immunodeficiency virus (SIV), requires folding of two heptad repeat regions (HR1 and HR2) of gp41 into a trimer-of-hairpins, which subsequently brings virus and cell membrane into fusion. This motif is a generalized feature of viral fusion proteins and has been exploited in generating antiviral fusion agents. In the present paper, we report structural characters of Env protein from another lentivirus, bovine immunodeficiency virus (BIV), which contributes to a good animal model of HIV. BIV HR1 and HR2 regions are predicted by two different programs and expressed separately or conjointly in Escherichia coli. Biochemical and biophysical analyses show that the predicted HRs of BIV Env can form a stable trimer-of-hairpins or six-helix bundle just like that formed by feline immunodeficiency virus Env. Cell fusion assay demonstrates that the HR2 peptide of BIV can efficiently inhibit the virus-mediated cell fusion

Microsatélites amplificados al azar (RAM en estudios de diversidad genética vegetal

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Muñoz Flórez Jaime Eduardo

2008-12-01

Full Text Available Se revisó el uso e importancia, ventajas, desventajas y características de la técnica Microsatélites Amplificados al Azar (RAM en uchuva Physalis peruviana, mora Rubus spp, guayaba Psidium guajava y heliconias Heliconia spp. En mora se diferenciaron las especies R. glaucus, R. robustus y R. urticifolius, se detectaron duplicados y se encontró alta variabilidad genética en R. glaucus, la especie más importante. En uchuva se encontró alta diversidad y dos accesiones de fruto rojo que se diferenciaron genéticamente de las amarillas y una región geográfica con alta variabilidad. En guayaba los cebadores fueron altamente polimórficos y se encontró alta variabilidad en el Valle del Cauca. En heliconias y especies relacionadas se diferenciaron las familias del orden Zingiberales, algunos subgéneros y variaciones en la especie. La técnica es de bajo costo, utiliza un cebador, no requiere información previa, es altamente polimórfica y diferencia especies en los taxones evaluados.

Desempenho de genótipos de aveia branca em resposta ao estresse por alumínio

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Solange Ferreira da Silveira Silveira

2013-01-01

Full Text Available A aveia branca (Avena sativa L. é uma cultura que tem um papel importante no sistema de produção de grãos e integração lavoura-pecuária, no entanto, em algumas regiões brasileiras, o pleno estabelecimento e desenvolvimento dessa cultura, bem como o aumento de produtividade são inviabilizados pelo excesso de alumínio (Al nos solos. A avaliação de caracteres de plântulas de aveia desenvolvidas sob cultivo hidropônico com adoção de solução nutritiva mínima pode ser eficiente para classificar genótipos sensíveis e tolerantes ao Al. Este trabalho objetivou avaliar o desempenho de 10 genótipos de aveia submetidos ao estresse por Al, baseando-se na análise da retomada do crescimento da raiz, com uso de solução mínima e identificando quais caracteres se mantêm correlacionados. Foram adotadas diferentes doses de Al (0, 3, 6, e 9 mg L-1 de Al. Com uso de solução mínima, a dose de 6 mg L-1 de Al é a mais adequada na diferenciação de genótipos sensíveis e tolerantes. Dentre os genótipos estudados, UFRGS 14, UFRGS 19 e URS Guapa são os mais tolerantes e UPFA 20, UPF 18 e IAC 7, os mais sensíveis ao Al. Com o objetivo de classificar genótipos de aveia entre sensíveis e tolerantes ao Al, nenhuma outra variável pode ser utilizada em substituição à retomada do crescimento da raiz.

DETEKSI GEN-GEN PENYANDI FAKTOR VIRULENSI PADA BAKTERI VIBRIO

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Ince Ayu Khairani Kadriah

2011-04-01

menggunakan isolat bakteri yang diisolasi dari budidaya udang windu di berbagai daerah di Sulawesi Selatan dan Jawa. Pada penelitian ini digunakan primer spesifik untuk mendeteksi gen-gen virulen toxR gene, hemolysin (vvh gene, dan GyrB gene dengan metode PCR. Dari 35 isolat yang diisolasi, 20 isolat terdeteksi memiliki gen virulensi dan 8 di antaranya memiliki dua gen virulen. Spesies bakteri yang memiliki gen virulen adalah: V.harveyi, V. parahaemolyticus, V. mimicus, dan V. campbelli

Selected HIV-1 Env trimeric formulations act as potent immunogens in a rabbit vaccination model.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Leo Heyndrickx

Full Text Available BACKGROUND: Ten to 30% of HIV-1 infected subjects develop broadly neutralizing antibodies (bNAbs during chronic infection. We hypothesized that immunizing rabbits with viral envelope glycoproteins (Envs from these patients may induce bNAbs, when formulated as a trimeric protein and in the presence of an adjuvant. METHODS: Based on in vitro neutralizing activity in serum, patients with bNAbs were selected for cloning of their HIV-1 Env. Seven stable soluble trimeric gp140 proteins were generated from sequences derived from four adults and two children infected with either clade A or B HIV-1. From one of the clade A Envs both the monomeric and trimeric Env were produced for comparison. Rabbits were immunized with soluble gp120 or trimeric gp140 proteins in combination with the adjuvant dimethyl dioctadecyl ammonium/trehalose dibehenate (CAF01. Env binding in rabbit immune serum was determined using ELISAs based on gp120-IIIB protein. Neutralizing activity of IgG purified from rabbit immune sera was measured with the pseudovirus-TZMbl assay and a PBMC-based neutralization assay for selected experiments. RESULTS: It was initially established that gp140 trimers induce better antibody responses over gp120 monomers and that the adjuvant CAF01 was necessary for such strong responses. Gp140 trimers, based on HIV-1 variants from patients with bNAbs, were able to elicit both gp120IIIB specific IgG and NAbs to Tier 1 viruses of different subtypes. Potency of NAbs closely correlated with titers, and an gp120-binding IgG titer above a threshold of 100,000 was predictive of neutralization capability. Finally, peptide inhibition experiments showed that a large fraction of the neutralizing IgG was directed against the gp120 V3 region. CONCLUSIONS: Our results indicate that the strategy of reverse immunology based on selected Env sequences is promising when immunogens are delivered as stabilized trimers in CAF01 adjuvant and that the rabbit is a valuable model

Selected HIV-1 Env trimeric formulations act as potent immunogens in a rabbit vaccination model.

Science.gov (United States)

Heyndrickx, Leo; Stewart-Jones, Guillaume; Jansson, Marianne; Schuitemaker, Hanneke; Bowles, Emma; Buonaguro, Luigi; Grevstad, Berit; Vinner, Lasse; Vereecken, Katleen; Parker, Joe; Ramaswamy, Meghna; Biswas, Priscilla; Vanham, Guido; Scarlatti, Gabriella; Fomsgaard, Anders

2013-01-01

Ten to 30% of HIV-1 infected subjects develop broadly neutralizing antibodies (bNAbs) during chronic infection. We hypothesized that immunizing rabbits with viral envelope glycoproteins (Envs) from these patients may induce bNAbs, when formulated as a trimeric protein and in the presence of an adjuvant. Based on in vitro neutralizing activity in serum, patients with bNAbs were selected for cloning of their HIV-1 Env. Seven stable soluble trimeric gp140 proteins were generated from sequences derived from four adults and two children infected with either clade A or B HIV-1. From one of the clade A Envs both the monomeric and trimeric Env were produced for comparison. Rabbits were immunized with soluble gp120 or trimeric gp140 proteins in combination with the adjuvant dimethyl dioctadecyl ammonium/trehalose dibehenate (CAF01). Env binding in rabbit immune serum was determined using ELISAs based on gp120-IIIB protein. Neutralizing activity of IgG purified from rabbit immune sera was measured with the pseudovirus-TZMbl assay and a PBMC-based neutralization assay for selected experiments. It was initially established that gp140 trimers induce better antibody responses over gp120 monomers and that the adjuvant CAF01 was necessary for such strong responses. Gp140 trimers, based on HIV-1 variants from patients with bNAbs, were able to elicit both gp120IIIB specific IgG and NAbs to Tier 1 viruses of different subtypes. Potency of NAbs closely correlated with titers, and an gp120-binding IgG titer above a threshold of 100,000 was predictive of neutralization capability. Finally, peptide inhibition experiments showed that a large fraction of the neutralizing IgG was directed against the gp120 V3 region. Our results indicate that the strategy of reverse immunology based on selected Env sequences is promising when immunogens are delivered as stabilized trimers in CAF01 adjuvant and that the rabbit is a valuable model for HIV vaccine studies.

Contribution of nonneutralizing vaccine-elicited antibody activities to improved protective efficacy in rhesus macaques immunized with Tat/Env compared with multigenic vaccines.

Science.gov (United States)

Florese, Ruth H; Demberg, Thorsten; Xiao, Peng; Kuller, LaRene; Larsen, Kay; Summers, L Ebonita; Venzon, David; Cafaro, Aurelio; Ensoli, Barbara; Robert-Guroff, Marjorie

2009-03-15

Previously, chronic-phase protection against SHIV(89.6P) challenge was significantly greater in macaques primed with replicating adenovirus type 5 host range mutant (Ad5hr) recombinants encoding HIVtat and env and boosted with Tat and Env protein compared with macaques primed with multigenic adenovirus recombinants (HIVtat, HIVenv, SIVgag, SIVnef) and boosted with Tat, Env, and Nef proteins. The greater protection was correlated with Tat- and Env-binding Abs. Because the macaques lacked SHIV(89.6P)-neutralizing activity prechallenge, we investigated whether Ab-dependent cellular cytotoxicity (ADCC) and Ab-dependent cell-mediated viral inhibition (ADCVI) might exert a protective effect. We clearly show that Tat can serve as an ADCC target, although the Tat-specific activity elicited did not correlate with better protection. However, Env-specific ADCC activity was consistently higher in the Tat/Env group, with sustained cell killing postchallenge exhibited at higher levels (p vaccine regimens.

Genética de la preeclampsia: una aproximación a los estudios de ligamiento genético.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Nora Alejandra Zuluaga

2004-06-01

Full Text Available La preeclampsia es considerada un problema de salud pública debido a su alta prevalencia. Muchas investigaciones coinciden en que su origen se relaciona con la interacción entre factores genéticos y ambientales. Por esta razón, múltiples estudios han explorado tales factores genéticos tratando de identificar regiones cromosómicas y genes candidatos cuyas variantes se relacionen con una mayor susceptibilidad a la enfermedad. Diversos estudios de asociación han identificado algunos genes de susceptibilidad a la preeclampsia, pero los resultados no se han replicado consistentemente en todas las poblaciones, quizá por su complejidad clínica y genética. El levantamiento de mapas de genes y regiones cromosómicas basado en análisis de ligamiento ha mostrado resultados interesantes con algunos marcadores en los cromosomas 2 y 4. En este sentido, hay muchas expectativas con respecto a los genes localizados en tales regiones candidatas, debido a que la identificación de los factores de riesgo genético podría ayudar al entendimiento de esta condición y en proveer claves para su prevención y tratamiento.

Inestabilidad cromosómica y desequilibrios genómicos en cáncer de vejiga

OpenAIRE

Del Rey Azpiri, Javier

2010-01-01

Los carcinomas uroteliales de vejiga, al igual que la mayoría de tumores sólidos, se caracterizan por la acumulación de múltiples desequilibrios genéticos. Con el fin de contribuir al conocimiento de las bases genéticas de la tumorogénesis urotelial, se estudió una serie de 180 tumores de vejiga mediante CGH convencional, observando que estos tumores mantienen un perfil característico de desequilibrios genómicos con ganancias en 1q, 8q, 11q, 16p, 17q, 18p, 19, 20q, Xq y pérdidas en 4q, 8p, 9p...

Differences in Env and Gag protein expression patterns and epitope availability in feline immunodeficiency virus infected PBMC compared to infected and transfected feline model cell lines.

Science.gov (United States)

Roukaerts, Inge D M; Grant, Chris K; Theuns, Sebastiaan; Christiaens, Isaura; Acar, Delphine D; Van Bockstael, Sebastiaan; Desmarets, Lowiese M B; Nauwynck, Hans J

2017-01-02

Env and Gag are key components of the FIV virion that are targeted to the plasma membrane for virion assembly. They are both important stimulators and targets of anti-FIV immunity. To investigate and compare the expression pattern and antigenic changes of Gag and Env in various research models, infected PBMC (the natural FIV host cells) and GFox, and transfected CrFK were stained over time with various Env and Gag specific MAbs. In FIV infected GFox and PBMC, Env showed changes in epitope availability for antibody binding during processing and trafficking, which was not seen in transfected CrFK. Interestingly, epitopes exposed on intracellular Env and Env present on the plasma membrane of CrFK and GFox seem to be hidden on plasma membrane expressed Env of FIV infected PBMC. A kinetic follow up of Gag and Env expression showed a polarization of both Gag and Env expression to specific sites at the plasma membrane of PBMC, but not in other cell lines. In conclusion, mature trimeric cell surface expressed Env might be antigenically distinct from intracellular monomeric Env in PBMC and might possibly be unrecognizable by feline humoral immunity. In addition, Env expression is restricted to a small area on the plasma membrane and co-localizes with a large moiety of Gag, which may represent a preferred FIV budding site, or initiation of virological synapses with direct cell-to-cell virus transmission. Copyright © 2016. Published by Elsevier B.V.

Aproximación genómica al diagnóstico genético de las distrofias hereditarias de retina y búsqueda de nuevos genes relacionados

OpenAIRE

González del Pozo, María

2014-01-01

Diagnosticar genéticamente a las familias afectas de alguna de las distrofias hereditarias de retina (DHR) es, desde el punto de vista del genetista, una tarea ardua y complicada, si atendemos a la gran cantidad de genes y mutaciones reportados hasta la fecha. La gran heterogeneidad clínica y genética que caracteriza a este conjunto de enfermedades, es sin duda el mayor impedimento para su resolución genética. En este escenario, el empleo de herramientas cada vez más poderosas es indispensabl...

HIV p24 as scaffold for presenting conformational HIV Env antigens.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Maria Tagliamonte

Full Text Available Heterologous protein scaffolds engrafted with structurally defined HIV Env epitopes recognized by broadly neutralizing monoclonal antibodies (MAbs represent a promising strategy to elicit broad neutralizing antibodies. In such regards, a protein scaffold based on the HIV p24 CA protein is a highly attractive approach, providing also Gag epitopes for eliciting HIV non-neutralizing protective antibodies and specific CD4(+ and CD8(+ T cell responses. In the present study, computational techniques were employed to verify the presence of acceptor sites for conformational HIV Env epitopes and, as proof of concept, the analysis of HIV p24 CA-based scaffolds using a complete V3 loop in a MAb-bound conformation is presented. The V3-p24 epitope-scaffold proteins show the formation of capsomers made of hexamers similarly to the p24 wild type protein. Moreover, the conformational V3 loop presented on p24 scaffold is recognized by a panel of anti-V3 MAbs. The results suggest that HIV p24 CA protein has suitable acceptor sites for engrafting foreign epitopes, without disrupting the formation of capsomer hexamer structures, and that the V3 epitope does retain its antibody-bound conformation. This strongly support the feasibility of developing a scaffolding strategy based on p24 CA proteins displaying conformational minimal structural, antigenic HIV Env epitopes.

Distributed Generation Market Demand Model (dGen): Documentation

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Sigrin, Benjamin [National Renewable Energy Lab. (NREL), Golden, CO (United States); Gleason, Michael [National Renewable Energy Lab. (NREL), Golden, CO (United States); Preus, Robert [National Renewable Energy Lab. (NREL), Golden, CO (United States); Baring-Gould, Ian [National Renewable Energy Lab. (NREL), Golden, CO (United States); Margolis, Robert [National Renewable Energy Lab. (NREL), Golden, CO (United States)

2016-02-01

The Distributed Generation Market Demand model (dGen) is a geospatially rich, bottom-up, market-penetration model that simulates the potential adoption of distributed energy resources (DERs) for residential, commercial, and industrial entities in the continental United States through 2050. The National Renewable Energy Laboratory (NREL) developed dGen to analyze the key factors that will affect future market demand for distributed solar, wind, storage, and other DER technologies in the United States. The new model builds off, extends, and replaces NREL's SolarDS model (Denholm et al. 2009a), which simulates the market penetration of distributed PV only. Unlike the SolarDS model, dGen can model various DER technologies under one platform--it currently can simulate the adoption of distributed solar (the dSolar module) and distributed wind (the dWind module) and link with the ReEDS capacity expansion model (Appendix C). The underlying algorithms and datasets in dGen, which improve the representation of customer decision making as well as the spatial resolution of analyses (Figure ES-1), also are improvements over SolarDS.

Hypothyroid Graves' disease complicated with elephantiasis nostras verrucosa (ENV): a case report and review of the literature.

Science.gov (United States)

Ukinç, Kubilay; Bayraktar, Miyase; Gedik, Arzu

2009-08-01

Thyroid dermopathy is not a frequent feature of hyperthyroid Graves' disease, being present in less than 5% of the patients. Graves' disease has been shown to exist in euthyroid or hypothyroid forms in untreated patients. Here, we describe a case of hypothyroid Graves' disease with elephantiasis nostras verrucosa (ENV), which is an extreme form of thyroid dermopathy (TD). A 58-year-old female patient was admitted to the emergency department with somnolence, hypothermia, and bradycardia. Her mental status gradually worsened, resulting in a deep coma. She was intubated and followed in the intensive care unit, as she needed mechanical ventilatory assistance due to respiratory failure. She also had bilateral non-pitting edema, a cobblestone-like appearance, and hyperkeratotic greenish-brown-colored lesions in the pretibial and dorsal regions of the feet that were compatible with ENV. Hypothyroid Graves' disease is a very rare condition among autoimmune thyroid disorders, and ENV is an extremely rare form of TD. Here, we present a patient with hypothyroid Graves' disease and ENV.

AquaEnv: an aquatic acid–base modelling environment in R

NARCIS (Netherlands)

Hofmann, A.F.; Soetaert, K.E.R.; Middelburg, J.J.; Meysman, F.J.R.

2010-01-01

AquaEnv is an integrated software package for aquatic chemical model generation focused on ocean acidification and antropogenic CO2 uptake. However, the package is not restricted to the carbon cycle or the oceans: it calculates, converts, and visualizes information necessary to describe pH, related

Convergent evolution of SIV env after independent inoculation of rhesus macaques with infectious proviral DNA

International Nuclear Information System (INIS)

Buckley, Kathleen A.; Li Peilin; Khimani, Anis H.; Hofmann-Lehmann, Regina; Liska, Vladimir; Anderson, Daniel C.; McClure, Harold M.; Ruprecht, Ruth M.

2003-01-01

The env gene of three simian immunodeficiency virus (SIV) variants developed convergent mutations during disease progression in six rhesus macaques. The monkeys had been inoculated with supercoiled plasmids encoding infectious proviruses of SIVmac239 (a pathogenic, wild-type strain), SIVΔ3 (the live attenuated vaccine strain derived from SIVmac239), or SIVΔ3+ (a pathogenic progeny virus that had evolved from SIVΔ3). All six monkeys developed immunodeficiency and progressed to fatal disease. Although many divergent mutations arose in env among the different hosts, three regions consistently mutated in all monkeys studied; these similar mutations developed independently even though the animals had received only a single infectious molecular clone rather than standard viral inocula that contain viral quasispecies. Together, these data indicate that the env genes of SIVmac239, SIVΔ3, and SIVΔ3+, in the context of different proviral backbones, evolve similarly in different hosts during disease progression

Aerobic Biodegradation of N-Nitrosodimethylamine by the Propanotroph Rhodococcus ruber ENV425▿

Science.gov (United States)

Fournier, Diane; Hawari, Jalal; Halasz, Annamaria; Streger, Sheryl H.; McClay, Kevin R.; Masuda, Hisako; Hatzinger, Paul B.

2009-01-01

The propanotroph Rhodococcus ruber ENV425 was observed to rapidly biodegrade N-nitrosodimethylamine (NDMA) after growth on propane, tryptic soy broth, or glucose. The key degradation intermediates were methylamine, nitric oxide, nitrite, nitrate, and formate. Small quantities of formaldehyde and dimethylamine were also detected. A denitrosation reaction, initiated by hydrogen atom abstraction from one of the two methyl groups, is hypothesized to result in the formation of n-methylformaldimine and nitric oxide, the former of which decomposes in water to methylamine and formaldehyde and the latter of which is then oxidized further to nitrite and then nitrate. Although the strain mineralized more than 60% of the carbon in [14C]NDMA to 14CO2, growth of strain ENV425 on NDMA as a sole carbon and energy source could not be confirmed. The bacterium was capable of utilizing NDMA, as well as the degradation intermediates methylamine and nitrate, as sources of nitrogen during growth on propane. In addition, ENV425 reduced environmentally relevant microgram/liter concentrations of NDMA to <2 ng/liter in batch cultures, suggesting that the bacterium may have applications for groundwater remediation. PMID:19542346

Human leukemia antigen-A*0201-restricted epitopes of human endogenous retrovirus W family envelope (HERV-W env) induce strong cytotoxic T lymphocyte responses.

Science.gov (United States)

Tu, Xiaoning; Li, Shan; Zhao, Lijuan; Xiao, Ran; Wang, Xiuling; Zhu, Fan

2017-08-01

Human endogenous retrovirus W family (HERV-W) envelope (env) has been reported to be related to several human diseases, including autoimmune disorders, and it could activate innate immunity. However, there are no reports investigating whether human leukemia antigen (HLA)-A*0201 + restriction is involved in the immune response caused by HERV-W env in neuropsychiatric diseases. In the present study, HERV-W env-derived epitopes presented by HLA-A*0201 are described with the potential for use in adoptive immunotherapy. Five peptides displaying HLA-A*0201-binding motifs were predicted using SYFEPITHI and BIMAS, and synthesized. A CCK-8 assay showed peptides W, Q and T promoted lymphocyte proliferation. Stimulation of peripheral blood mononuclear cells from HLA-A*0201 + donors with each of these peptides induced peptide-specific CD8 + T cells. High numbers of IFN-γ-secreting T cells were also detectable after several weekly stimulations with W, Q and T. Besides lysis of HERV-W env-loaded target cells, specific apoptosis was also observed. These data demonstrate that human T cells can be sensitized toward HERV-W env peptides (W, Q and T) and, moreover, pose a high killing potential toward HERV-W env-expressing U251 cells. In conclusion, peptides W Q and T, which are HERV-W env antigenic epitopes, have both antigenicity and immunogenicity, and can cause strong T cell immune responses. Our data strengthen the view that HERV-W env should be considered as an autoantigen that can induce autoimmunity in neuropsychiatric diseases, such as multiple sclerosis and schizophrenia. These data might provide an experimental foundation for a HERV-W env peptide vaccine and new insight into the treatment of neuropsychiatric diseases.

Taxonomic dissection of the genus Micrococcus: Kocuria gen. nov., Nesterenkonia gen. nov., Kytococcus gen. nov., Dermacoccus gen. nov., and Micrococcus Cohn 1872 gen. emend.

Science.gov (United States)

Stackebrandt, E; Koch, C; Gvozdiak, O; Schumann, P

1995-10-01

The results of a phylogenetic and chemotaxonomic analysis of the genus Micrococcus indicated that it is significantly heterogeneous. Except for Micrococcus lylae, no species groups phylogenetically with the type species of the genus, Micrococcus luteus. The other members of the genus form three separate phylogenetic lines which on the basis of chemotaxonomic properties can be assigned to four genera. These genera are the genus Kocuria gen. nov. for Micrococcus roseus, Micrococcus varians, and Micrococcus kristinae, described as Kocuria rosea comb. nov., Kocuria varians comb. nov., and Kocuria kristinae comb. nov., respectively; the genus Nesterenkonia gen. nov. for Micrococcus halobius, described as Nesterenkonia halobia comb. nov.; the genus Nesterenkonia gen. nov. for Micrococcus halobius, described as Nesterenkonia halobia comb. nov.; the genus Dermacoccus gen. nov. for Micrococcus nishinomiyaensis, described as Dermacoccus nishinomiyaensis comb. nov.; and the genus Kytocossus gen. nov. for Micrococcus sedentarius, described as Kytococcus sedentarius comb. nov. M. luteus and M. lylae, which are closely related phylogenetically but differ in some chemotaxonomic properties, are the only species that remain in the genus Micrococcus Cohn 1872. An emended description of the genus Micrococcus is given [corrected].

Enhanced cell surface expression, immunogenicity and genetic stability resulting from a spontaneous truncation of HIV Env expressed by a recombinant MVA

International Nuclear Information System (INIS)

Wyatt, Linda S.; Belyakov, Igor M.; Earl, Patricia L.; Berzofsky, Jay A.; Moss, Bernard

2008-01-01

During propagation of modified vaccinia virus Ankara (MVA) encoding HIV 89.6 Env, a few viral foci stained very prominently. Virus cloned from such foci replicated to higher titers than the parent and displayed enhanced genetic stability on passage. Sequence analysis showed a single nucleotide deletion in the 89.6 env gene of the mutant that caused a frame shift and truncation of 115 amino acids from the cytoplasmic domain. The truncated Env was more highly expressed on the cell surface, induced higher antibody responses than the full-length Env, reacted with HIV neutralizing monoclonal antibodies and mediated CD4/co-receptor-dependent fusion. Intramuscular (IM), intradermal (ID) needleless, and intrarectal (IR) catheter inoculations gave comparable serum IgG responses. However, intraoral (IO) needleless injector route gave the highest IgA in lung washings and IR gave the highest IgA and IgG responses in fecal extracts. Induction of CTL responses in the spleens of individual mice as assayed by intracellular cytokine staining was similar with both the full-length and truncated Env constructs. Induction of acute and memory CTL in the spleens of mice immunized with the truncated Env construct by ID, IO, and IR routes was comparable and higher than by the IM route, but only the IR route induced CTL in the gut-associated lymphoid tissue. Thus, truncation of Env enhanced genetic stability as well as serum and mucosal antibody responses, suggesting the desirability of a similar modification in MVA-based candidate HIV vaccines

Expression of feline immunodeficiency virus gag and env precursor proteins in Spodoptera frugiperda cells and their use in immunodiagnosis

NARCIS (Netherlands)

Horzinek, M.C.; Verschoor, E.J.; Vliet, A.L.W. van; Egberink, H.F.; Hesselink, W.; Ronde, A. de

1993-01-01

The gag and env genes of the feline immunodeficiency virus strain UT113 were cloned into a baculovirus transfer vector. The recombinant plasmids were used to create recombinant baculoviruses that expressed either the gag or the env precursor protein in insect cells (Sf9 cells). Leader sequence

Structural delineation of a quaternary, cleavage-dependent epitope at the gp41-gp120 interface on intact HIV-1 Env trimers.

Science.gov (United States)

Blattner, Claudia; Lee, Jeong Hyun; Sliepen, Kwinten; Derking, Ronald; Falkowska, Emilia; de la Peña, Alba Torrents; Cupo, Albert; Julien, Jean-Philippe; van Gils, Marit; Lee, Peter S; Peng, Wenjie; Paulson, James C; Poignard, Pascal; Burton, Dennis R; Moore, John P; Sanders, Rogier W; Wilson, Ian A; Ward, Andrew B

2014-05-15

All previously characterized broadly neutralizing antibodies to the HIV-1 envelope glycoprotein (Env) target one of four major sites of vulnerability. Here, we define and structurally characterize a unique epitope on Env that is recognized by a recently discovered family of human monoclonal antibodies (PGT151-PGT158). The PGT151 epitope is comprised of residues and glycans at the interface of gp41 and gp120 within a single protomer and glycans from both subunits of a second protomer and represents a neutralizing epitope that is dependent on both gp120 and gp41. Because PGT151 binds only to properly formed, cleaved trimers, this distinctive property, and its ability to stabilize Env trimers, has enabled the successful purification of mature, cleaved Env trimers from the cell surface as a complex with PGT151. Here we compare the structural and functional properties of membrane-extracted Env trimers from several clades with those of the soluble, cleaved SOSIP gp140 trimer. Copyright © 2014 Elsevier Inc. All rights reserved.

Variabilidad genética de la respuesta inflamatoria: I. Polimorfismo -511 C/T en el gen IL1β en diferentes subpoblaciones peruanas

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Óscar Acosta

2012-07-01

Full Text Available El polimorfismo -511 citosina/timina (-511 C/T en la región promotora del gen interleuquina 1 beta (IL1β estα implicado en la producciσn diferencial de la citoquina y por tanto puede estar asociado a la respuesta inmuno-inflamatoria en obesidad, dislipidemias, cardiopatías, cáncer, infecciones, y el tratamiento con nutrientes y fármacos. Objetivos: Establecer la distribución de frecuencias de los genotipos y alelos del polimorfismo -511 C/T del gen IL1β en diferentes subpoblaciones peruanas. Diseño: Estudio descriptivo, observacional, transversal. Instituciones: Centro de Investigación de Bioquímica y Nutrición e Instituto de Medicina Tropical D.A. Carrión, Facultad de Medicina, UNMSM y Centro de Genética y Biología Molecular, Facultad de Medicina, USMP, Lima, Perú. Participantes: Pobladores peruanos. Intervenciones: Extracción de ADN genómico a partir de muestras sanguíneas o epitelio bucal según metodología estándar, de 168 individuos de 9 grupos subpoblacionales: 23 mestizos de Lima, 33 amazónicos (20 de Pucallpa y 13 de Amazonas y 112 andinos (12 de Ancash, 10 de Cajamarca, 18 de Huarochirí-Lima, 25 de Puno-Taquile, 25 de Puno-Uros y 22 de Puno-Anapia. Análisis del polimorfismo -511 C/T mediante la técnica de PCR/RFLP, con primers específicos y digestión con la enzima de restricción AvaI, detectándose los fragmentos por electroforesis en geles de agarosa al 2% y tinción con bromuro de etidio. Principales medidas de resultados: Frecuencias genotípicas y alélicas del gen IL1β. Resultados: Se encontró las siguientes frecuencias genotípicas CC=0,024; CT=0,369 y TT=0,607, consistentes con el equilibrio de Hardy-Weinberg; y las frecuencias alélicas fueron alelo C=0,208 y aleloT= 0,792. La frecuencia del alelo T, considerado el mutante, fue muy alta en los Uros de Puno (0.940 y más baja en los mestizos de Lima (0.609. La comparación de las frecuencias genotípicas (TT versus CT+CC y alélicas (T versus C

Viability of thin wall tube forming of ATF FeCrAl

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Maloy, Stuart Andrew [Los Alamos National Lab. (LANL), Los Alamos, NM (United States); Aydogan, Eda [Los Alamos National Lab. (LANL), Los Alamos, NM (United States); Anderoglu, Osman [Los Alamos National Lab. (LANL), Los Alamos, NM (United States); Lavender, Curt [Pacific Northwest National Lab. (PNNL), Richland, WA (United States); Yamamoto, Yukinori [Oak Ridge National Lab. (ORNL), Oak Ridge, TN (United States)

2016-09-16

Fabrication of thin walled tubing of FeCrAl alloys is critical to its success as a candidate enhanced accident-tolerant fuel cladding material. Alloys that are being investigated are Generation I and Generation II FeCrAl alloys produced at ORNL and an ODS FeCrAl alloy, MA-956 produced by Special Metals. Gen I and Gen II FeCrAl alloys were provided by ORNL and MA-956 was provided by LANL (initially produced by Special Metals). Three tube development efforts were undertaken. ORNL led the FeCrAl Gen I and Gen II alloy development and tube processing studies through drawing tubes at Rhenium Corporation. LANL received alloys from ORNL and led tube processing studies through drawing tubes at Century Tubing. PNNL led the development of tube processing studies on MA-956 through pilger processing working with Sandvik Corporation. A summary of the recent progress on tube development is provided in the following report and a separate ORNL report: ORNL/TM-2015/478, “Development and Quality Assessments of Commercial Heat Production of ATF FeCrAl Tubes”.

Phylogenetic and structural diversity in the feline leukemia virus env gene.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Shinya Watanabe

Full Text Available Feline leukemia virus (FeLV belongs to the genus Gammaretrovirus, and causes a variety of neoplastic and non-neoplastic diseases in cats. Alteration of viral env sequences is thought to be associated with disease specificity, but the way in which genetic diversity of FeLV contributes to the generation of such variants in nature is poorly understood. We isolated FeLV env genes from naturally infected cats in Japan and analyzed the evolutionary dynamics of these genes. Phylogenetic reconstructions separated our FeLV samples into three distinct genetic clusters, termed Genotypes I, II, and III. Genotype I is a major genetic cluster and can be further classified into Clades 1-7 in Japan. Genotypes were correlated with geographical distribution; Genotypes I and II were distributed within Japan, whilst FeLV samples from outside Japan belonged to Genotype III. These results may be due to geographical isolation of FeLVs in Japan. The observed structural diversity of the FeLV env gene appears to be caused primarily by mutation, deletion, insertion and recombination, and these variants may be generated de novo in individual cats. FeLV interference assay revealed that FeLV genotypes did not correlate with known FeLV receptor subgroups. We have identified the genotypes which we consider to be reliable for evaluating phylogenetic relationships of FeLV, which embrace the high structural diversity observed in our sample. Overall, these findings extend our understanding of Gammaretrovirus evolutionary patterns in the field, and may provide a useful basis for assessing the emergence of novel strains and understanding the molecular mechanisms of FeLV transmission in cats.

A new therapeutic approach for type 1 diabetes: rationale for GNbAC1 an anti-HERV-W-Env monoclonal antibody.

Science.gov (United States)

Curtin, Francois; Bernard, Corinne; Levet, Sandrine; Perron, Hervé; Porchet, Hervé; Médina, Julie; Malpass, Sam; Lloyd, David; Simpson, Richard

2018-05-10

We describe a newly identified therapeutic target for type 1 diabetes: an envelope protein of endogenous retroviral origin called Human Endogenous Retrovirus W Envelope (HERV-W-Env). HERV-W-Env was found to be detected in the blood of around 60% of type 1 diabetes (T1D) patients and is expressed in acinar pancreatic cells of 75% of T1D patients at post-mortem examination. Preclinical experiments showed that this protein displays direct cytotoxicity on human β-islet cells. In vivo HERV-W-Env impairs the insulin and glucose metabolism in transgenic mice expressing HERV-W-Env. GNbAC1, an IgG4 monoclonal antibody has been developed to specifically target HERV-W-Env and to neutralize the effect of HERV-W-Env in vitro and in vivo. GNbAC1 is currently in clinical development for multiple sclerosis and more than 300 subjects have been administered with GNbAC1 so far. GNbAC1 is now tested in T1D in the RAINBOW-T1D study: a randomized placebo controlled study with the objective of showing the safety and pharmacodynamics response of GNbAC1 in patients suffering from T1D with a maximum duration of 4 years. GNbAC1 is tested versus placebo at the dose of 6 mg/kg in 60 patients during 6 repeated administrations during 6 months, a 6-month open-label extension will follow. The primary endpoint will assess safety and secondary endpoints the pharmacodynamic responses to GNbAC1. GNbAC1 targeting HERV-W-Env is currently in clinical development in T1D with the first safety and pharmacodynamic study. If the study results are positive, this may open the door to the development of an innovative non-immunomodulatory disease modifying treatment for T1D. This article is protected by copyright. All rights reserved. This article is protected by copyright. All rights reserved.

GenBank

OpenAIRE

Benson, Dennis A.; Karsch-Mizrachi, Ilene; Lipman, David J.; Ostell, James; Rapp, Barbara A.; Wheeler, David L.

2002-01-01

The GenBank sequence database incorporates publicly available DNA sequences of more than 105 000 different organisms, primarily through direct submission of sequence data from individual laboratories and large-scale sequencing projects. Most submissions are made using the BankIt (web) or Sequin programs and accession numbers are assigned by GenBank staff upon receipt. Data exchange with the EMBL Data Library and the DNA Data Bank of Japan helps ensure comprehensive worldwide coverage. GenBank...

Análisis de segregantes agrupados (BSA para la detección de AFLPs ligados al gen de resistencia a PVX en Solanum commersonii

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Mónica Blanco

2005-01-01

Full Text Available Para identificar polimorfismos asociados al gen de resistencia al PVX en la papa silvestre Solanum commersonii, se realizó un análisis de segregantes agrupados (BSA asistido con AFLPs. Estos polimorfismos están basados en la localización de un locus relacionado con la resistencia al virus X de la papa (PVX. Inicialmente, mediante un análisis de ELISA, los individuos de una progenie F2 previamente inoculados con el PVX, fueron ubicados en 2 grupos, uno con los individuos resistentes y otro con los susceptibles. Posteriormente, para el BSA el ADN de todos los individuos resistentes fue mezclado, lo mismo el ADN de todos los individuos susceptibles. Ambos grupos de ADN fueron analizados independientemente, utilizando 64 diferentes combinaciones de AFLPs. El análisis de los geles resultó en la identificación de 22 combinaciones diferentes de AFLPs que generaron bandas relacionadas exclusivamente con el carácter de resistencia al PVX.

Biochem-Env, a plateform of environmental biochemistry for research

OpenAIRE

GRONDIN, VIRGINIE; Nelieu, Sylvie; Crouzet, Olivier; Hedde, Mickaël; Mougin, Christian

2016-01-01

As a service of the research infrastructure AnaEE-France (http://www.anaee-france.fr/fr/), the platform Biochem-Env (http://www.biochemenv.fr) offers skills and innovative analytical tools for biochemical characterizations of soils, sediments, and micro-macro-organisms living in terrestrial and aquatic ecosystems. The platform provides methods validated according to Quality Guidelines, i.e. to measure global soil enzymatic activities. Our robot-supported protocols allow great number of enzyme...

Reporte de familias con neurofibromatosis y otras enfermedades genéticas

OpenAIRE

Orraca Castillo, Miladys; Licourt Otero, Deysi; Sánchez Álvarez de La Campa, Ana Isabel

2011-01-01

La neurofibromatosis tipo 1, es una enfermedad genética que primariamente afecta el desarrollo y crecimiento celular del sistema nervioso, clínicamente se caracteriza por máculas café con leche, neurofibromas, pecas en regiones no expuestas al sol, nódulos de Lisch, lesiones óseas y glioma óptico. En el presente trabajo se describen dos familias, en las cuales algunos individuos padecen esta enfermedad y otros miembros de la misma familia muestran una diferente enfermedad genética. La coexist...

EnvMine: A text-mining system for the automatic extraction of contextual information

Directory of Open Access Journals (Sweden)

de Lorenzo Victor

2010-06-01

Full Text Available Abstract Background For ecological studies, it is crucial to count on adequate descriptions of the environments and samples being studied. Such a description must be done in terms of their physicochemical characteristics, allowing a direct comparison between different environments that would be difficult to do otherwise. Also the characterization must include the precise geographical location, to make possible the study of geographical distributions and biogeographical patterns. Currently, there is no schema for annotating these environmental features, and these data have to be extracted from textual sources (published articles. So far, this had to be performed by manual inspection of the corresponding documents. To facilitate this task, we have developed EnvMine, a set of text-mining tools devoted to retrieve contextual information (physicochemical variables and geographical locations from textual sources of any kind. Results EnvMine is capable of retrieving the physicochemical variables cited in the text, by means of the accurate identification of their associated units of measurement. In this task, the system achieves a recall (percentage of items retrieved of 92% with less than 1% error. Also a Bayesian classifier was tested for distinguishing parts of the text describing environmental characteristics from others dealing with, for instance, experimental settings. Regarding the identification of geographical locations, the system takes advantage of existing databases such as GeoNames to achieve 86% recall with 92% precision. The identification of a location includes also the determination of its exact coordinates (latitude and longitude, thus allowing the calculation of distance between the individual locations. Conclusion EnvMine is a very efficient method for extracting contextual information from different text sources, like published articles or web pages. This tool can help in determining the precise location and physicochemical

GenBank

Data.gov (United States)

U.S. Department of Health & Human Services — GenBank is the NIH genetic sequence database, an annotated collection of all publicly available DNA sequences. GenBank is designed to provide and encourage access...

Evaluación genética de los salmónidos asturianos como recurso natural

OpenAIRE

Abad García, David

2012-01-01

En este proyecto se analiza la estructura genética de los stocks utilizados para la repoblación de trucha común en el Principado de Asturias, pertenecientes a dos piscifactorías diferentes, con el fin de establecer si los repobladores cumplen con la normativa vigente sobre la liberación de individuos no autóctonos al medio natural, que está actualmente prohibida. Para ello se utiliza como marcador genético el gen del enzima lactato deshidrogenasa LDH-C, que permite diferenciar las poblaciones...

Justicia y genética: compensando las diferencias

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Alejandra Zúñiga-Fajuri

2013-01-01

Full Text Available Se analizan los dilemas morales asociados a los avances científicos que en la actualidad nos exigen repensar el concepto de igualdad equitativa de oportunidades. Asimismo, se pasa revista a la discusión filosófica en torno al origen de las desventajas sociales y genéticas que permiten las desigualdades sociales.

The conserved His8 of the Moloney murine leukemia virus Env SU subunit directs the activity of the SU-TM disulphide bond isomerase

International Nuclear Information System (INIS)

Li Kejun; Zhang, Shujing; Kronqvist, Malin; Ekstroem, Maria; Wallin, Michael; Garoff, Henrik

2007-01-01

Murine leukemia virus (MLV) fusion is controlled by isomerization of the disulphide bond between the receptor-binding surface (SU) and fusion-active transmembrane subunits of the Env-complex. The bond is in SU linked to a CXXC motif. This carries a free thiol that upon receptor binding can be activated (ionized) to attack the disulphide and rearrange it into a disulphide isomer within the motif. To find out whether His8 in the conserved SPHQ sequence of Env directs thiol activation, we analyzed its ionization in MLV vectors with wtEnv and Env with His8 deleted or substituted for Tyr or Arg, which partially or completely arrests fusion. The ionization was monitored by following the pH effect on isomerization in vitro by Ca 2+ depletion or in vivo by receptor binding. We found that wtEnv isomerized optimally at slightly basic pH whereas the partially active mutant required higher and the inactive mutants still higher pH. This suggests that His8 directs the ionization of the CXXC thiol

Algoritmos genéticos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

José Jesús Martínez Páez

1998-10-01

Full Text Available Esta técnica se basa en el concepto de evolución a través de selección de los mejores individuos, y de los operadores genéticos de selección, reproducción y mutación. Se trata entonces, de definir un espacio de soluciones para el problema que se quiere solucionar, en una cadena de bits. A esto se le conoce como la codificación del cromosoma, donde cada bit, denominado gen  tiene cierto significado especial. Inicialmente el algoritmo genera al azar muchas de estas cadenas o seres, es decir, una población, que luego confronta can un ambiente, que es el problema solucionar o función que se quiere optimizar. De esta confrontación  o evaluación a que se somete cada ser. Se obtiene información sobre cómo se comporto cada uno. A través de métodos aleatorios, pero con probabilidad de selección proporcional a su comportamiento, es decir, a mejor comportamiento mayor probabilidad, se selecciona una nueva población de seres supuestamente mejores que la generación anterior.

Justicia en salud y genética

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Maria Graciela De Ortuzar

2014-06-01

Full Text Available Las expectativas puestas en el conocimiento genético exceden el ámbito de la medicina tradiciona, debido a que la intervención directa en la lotería natural demandaría el replanteamiento de conceptos centrales de justicia en salud: necesidades médicas, enfermedad, normalidad, e igualdad de oportunidades en el acceso a la salud. El punto en debate es sí el replanteo de dichos conceptos conlleva un cambio radical en las teorías de justicia (libertariana y/o liberal, mostrando su obsolescencia, o sí simplemente se requiere ampliar dichos conceptos claves por fallas estructurales en las mismas teorías. Como hipótesis general considero que los supuestos cuestionamientos, lejos de socavar las bases de las teorías de justicia, sólo ponen en evidencia sus viejos problemas estructurales. Por razones expositivas, dividiré la presentación tres partes. En la Primera parte, analizo la teoría libertariana, estudiando las contradicciones del modelo a través del impacto de la información genética en el seguro privado de salud. En la Segunda Parte, desarrollo la propuesta alternativa liberal rawlsianadanielsiana del modelo de seguro público, evaluando las implicaciones de la genética a partir de la crítica de su concepto biológico de enfermedad y su restricción al acceso a la salud por necesidades naturales. En la Tercera parte presento un modelo integral de necesidades y capacidades básicas, comprendiendo la prevención, el tratamiento y el mejoramiento moralmente permisible (genético y no genético.Mi aporte principal consiste en la elaboración de este modelo normativo integral de necesidades y capacidades para la regulación conjunta de la información y terapia genética con los restantes problemas de salud.

Global panel of HIV-1 Env reference strains for standardized assessments of vaccine-elicited neutralizing antibodies.

Science.gov (United States)

deCamp, Allan; Hraber, Peter; Bailer, Robert T; Seaman, Michael S; Ochsenbauer, Christina; Kappes, John; Gottardo, Raphael; Edlefsen, Paul; Self, Steve; Tang, Haili; Greene, Kelli; Gao, Hongmei; Daniell, Xiaoju; Sarzotti-Kelsoe, Marcella; Gorny, Miroslaw K; Zolla-Pazner, Susan; LaBranche, Celia C; Mascola, John R; Korber, Bette T; Montefiori, David C

2014-03-01

Standardized assessments of HIV-1 vaccine-elicited neutralizing antibody responses are complicated by the genetic and antigenic variability of the viral envelope glycoproteins (Envs). To address these issues, suitable reference strains are needed that are representative of the global epidemic. Several panels have been recommended previously, but no clear answers have been available on how many and which strains are best suited for this purpose. We used a statistical model selection method to identify a global panel of reference Env clones from among 219 Env-pseudotyped viruses assayed in TZM-bl cells with sera from 205 HIV-1-infected individuals. The Envs and sera were sampled globally from diverse geographic locations and represented all major genetic subtypes and circulating recombinant forms of the virus. Assays with a panel size of only nine viruses adequately represented the spectrum of HIV-1 serum neutralizing activity seen with the larger panel of 219 viruses. An optimal panel of nine viruses was selected and augmented with three additional viruses for greater genetic and antigenic coverage. The spectrum of HIV-1 serum neutralizing activity seen with the final 12-virus panel closely approximated the activity seen with subtype-matched viruses. Moreover, the final panel was highly sensitive for detection of many of the known broadly neutralizing antibodies. For broader assay applications, all 12 Env clones were converted to infectious molecular clones using a proviral backbone carrying a Renilla luciferase reporter gene (Env.IMC.LucR viruses). This global panel should facilitate highly standardized assessments of vaccine-elicited neutralizing antibodies across multiple HIV-1 vaccine platforms in different parts of the world. An effective HIV-1 vaccine will need to overcome the extraordinary genetic variability of the virus, where most variation occurs in the viral envelope glycoproteins that are the sole targets for neutralizing antibodies. Efforts to elicit

Alteraciones genéticas cutáneas diagnosticadas en la infancia, Las Tunas 2010-2012

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Yordania Velázquez Ávila

2014-08-01

Full Text Available Las enfermedades genéticas y los defectos genéticos con afectación cutánea son causa frecuente de estigmatización de las personas que las padecen, afectando su adecuada inserción en la sociedad y con ello su calidad de vida. Se estableció una consulta especializada y multidisplinaria en el hospital pediátrico provincial “Mártires de Las Tunas”, fundamentalmente con especialistas de dermatología, genética y pediatría. Se realizó un estudio descriptivo, transversal y prospectivo, en el período del año 2010 al 2012, para caracterizar a estos pacientes. Las variables estudiadas relacionadas fueron el sexo, la edad biológica al diagnóstico, el municipio de procedencia y la mortalidad. Los resultados se expusieron en tablas de contingencia de N x N. Existió predominio de las genodermatosis, seguido de los defectos congénitos y pocas enfermedades genéticas con afectación cutánea, siendo estas últimas responsables de la mayoría de las muertes. Las genodermatosis más representadas fueron la ictiosis, las mastocitosis y las neurofibromatosis, la edad más frecuente al diagnóstico fue el grupo de los menores de dos años; prevaleció el sexo femenino. La mortalidad fue baja y los municipios más afectados por genodermatosis fueron Las Tunas, Majibacoa y Colombia

Diagnostico genético prenatal y aborto. Dos cuestiones de eugenesia y discriminación

OpenAIRE

Villela Cortés, Fabiola; Linares Salgado, Jorge E.

2012-01-01

Los avances en genética seguidos de las nuevas tecnologías en la detección temprana de afecciones genéticas conllevan dilemas bioéticos sobre el uso adecuado de estas técnicas, la información que se le da a la mujer embarazada y la decisión que ella tomará al recibirla. Detectar a tiempo anomalías genéticas permite, en algunas ocasiones, el inicio de un tratamiento adecuado que permita que el niño por nacer no desarrolle una enfermedad discapacitante, como el caso de la fenilcetonuria, o una ...

The conserved dileucine- and tyrosine-based motifs in MLV and MPMV envelope glycoproteins are both important to regulate a common Env intracellular trafficking

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Lopez-Vergès Sandra

2006-09-01

Full Text Available Abstract Background Retrovirus particles emerge from the assembly of two structural protein components, Gag that is translated as a soluble protein in the cytoplasm of the host cells, and Env, a type I transmembrane protein. Because both components are translated in different intracellular compartments, elucidating the mechanisms of retrovirus assembly thus requires the study of their intracellular trafficking. Results We used a CD25 (Tac chimera-based approach to study the trafficking of Moloney murine leukemia virus and Mason-Pfizer monkey virus Env proteins. We found that the cytoplasmic tails (CTs of both Env conserved two major signals that control a complex intracellular trafficking. A dileucine-based motif controls the sorting of the chimeras from the trans-Golgi network (TGN toward endosomal compartments. Env proteins then follow a retrograde transport to the TGN due to the action of a tyrosine-based motif. Mutation of either motif induces the mis-localization of the chimeric proteins and both motifs are found to mediate interactions of the viral CTs with clathrin adaptors. Conclusion This data reveals the unexpected complexity of the intracellular trafficking of retrovirus Env proteins that cycle between the TGN and endosomes. Given that Gag proteins hijack endosomal host proteins, our work suggests that the endosomal pathway may be used by retroviruses to ensure proper encountering of viral structural Gag and Env proteins in cells, an essential step of virus assembly.

La fábrica de la empatía. Del determinismo genético al origen social de la moral

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Hernández Castro, David

2016-06-01

Full Text Available Preston and De Waal have adopted a theoretical idea known as the “Perception-Action Model” (PAM, which suggests that empathy and morality have genetic and evolutionary roots. In this paper, the author proposes a critical reading of PAM and an alternative interpretation, “the empathy factory”, which reconsiders the “Perception-Action Hypothesis” and the discovery of mirror neurons in the light of Judith Butler’s concept of performativity and the social construction of emotions. The conclusion is that the origin of the moral impulse does not lie in genetic determinism but in social relationships, language and affective communication.Preston y De Waal han adoptado una idea teórica, el Mecanismo de Percepción-Acción (MPA, que sugiere que la empatía y la moral tienen raíces genéticas y evolutivas. En este artículo analizamos críticamente el MPA y proponemos una interpretación alternativa, la fábrica de la empatía, que reconsidera la “Hipótesis de la Percepción-Acción” y el descubrimiento de las neuronas espejo bajo la luz del concepto de performatividad de Judith Butler y la construcción social de las emociones. Frente al determinismo genético, nuestra investigación apunta a las relaciones sociales y el lenguaje.

Avian endogenous provirus (ev-3) env gene sequencing: implication for pathogenic retrovirus origination.

Science.gov (United States)

Tikhonenko, A T; Lomovskaya, O L

1990-02-01

The avian endogenous env gene product blocks the surface receptor and, as a result, cells become immune to related exogenous retroviruses. On the other hand, the same sequence can be included in the pathogenic retrovirus genome, as shown by oligonucleotide mapping. However, since the complete env gene sequence was not known, the comparison of genomic nucleotide sequences was not possible. Therefore an avian endogenous provirus with an intact env gene was cloned from a chicken gene bank and the regions coding for the C terminus of the gp85 and gp37 proteins were sequenced. Comparison of this sequence with those of other retroviruses proved that one of the pathogenic viruses associated with osteopetrosis is a cross between avian endogenous virus and Rous sarcoma virus. Retroviruses and, especially, endogenous retroviruses are traditionally of the most developed models of viral carcinogenesis. Many endogenous retroviruses are implicated in neoplastic transformation of the cell. For instance, endogenous mouse mammary tumor virus of some inbred lines appears to be the only causative agent in these mammary cancers. Other even nonpathogenic murine endogenous retroviruses are involved in the origination of MCF-type recombinant acute leukosis viruses. Some endogenous retroviruses are implicated in the transduction or activation of cellular protooncogenes. Our interest in endogenous viruses is based on their ability to make cells resistant to exogenous retroviruses. Expression of their major envelope glycoprotein leads to cellular surface receptor blockage and imparts immunity to infection by the related leukemia retroviruses. This problem is quite elaborated for chicken endogenous virus RAV-O (7-9).(ABSTRACT TRUNCATED AT 250 WORDS)

Cocirculation of Two env Molecular Variants, of Possible Recombinant Origin, in Gorilla and Chimpanzee Simian Foamy Virus Strains from Central Africa.

Science.gov (United States)

Richard, Léa; Rua, Réjane; Betsem, Edouard; Mouinga-Ondémé, Augustin; Kazanji, Mirdad; Leroy, Eric; Njouom, Richard; Buseyne, Florence; Afonso, Philippe V; Gessain, Antoine

2015-12-01

Simian foamy virus (SFV) is a ubiquitous retrovirus in nonhuman primates (NHPs) that can be transmitted to humans, mostly through severe bites. In the past few years, our laboratory has identified more than 50 hunters from central Africa infected with zoonotic SFVs. Analysis of the complete sequences of five SFVs obtained from these individuals revealed that env was the most variable gene. Furthermore, recombinant SFV strains, some of which involve sequences in the env gene, were recently identified. Here, we investigated the variability of the env genes of zoonotic SFV strains and searched for possible recombinants. We sequenced the complete env gene or its surface glycoprotein region (SU) from DNA amplified from the blood of (i) a series of 40 individuals from Cameroon or Gabon infected with a gorilla or chimpanzee foamy virus (FV) strain and (ii) 1 gorilla and 3 infected chimpanzees living in the same areas as these hunters. Phylogenetic analyses revealed the existence of two env variants among both the gorilla and chimpanzee FV strains that were present in zoonotic and NHP strains. These variants differ greatly (>30% variability) in a 753-bp-long region located in the receptor-binding domain of SU, whereas the rest of the gene is very conserved. Although the organizations of the Env protein sequences are similar, the potential glycosylation patterns differ between variants. Analysis of recombination suggests that the variants emerged through recombination between different strains, although all parental strains could not be identified. SFV infection in humans is a great example of a zoonotic retroviral infection that has not spread among human populations, in contrast to human immunodeficiency viruses (HIVs) and human T-lymphotropic viruses (HTLVs). Recombination was a major mechanism leading to the emergence of HIV. Here, we show that two SFV molecular envelope gene variants circulate among ape populations in Central Africa and that both can be transmitted to

Algoritmos genéticos locales

OpenAIRE

García-Martínez, Carlos; Lozano, Manuel

2007-01-01

Los Algoritmos Genéticos Locales son procedimientos que iterativamente re nan soluciones dadas. Su diferencia con procedimientos de mejora iterativa clásicos reside en el uso de operadores genéticos para realizar el re namiento. En este estudio presentamos un nuevo Algoritmo Genético Local Binario basado en un Algoritmo Genético Estacionario. Hemos comparado el Algoritmo Genético Local Binario con otros procedimientos de mejora iterativa de la literatura. Los res...

Variabilidad genética de poblaciones en cautiverio de Crocodylus moreletii (Crocodylia: Crocodylidae mediante el uso de marcadores microsatelitales

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Ricardo Serna-Lagunes

2012-03-01

Full Text Available Crocodylus moreletii representa un emblema para los ecosistemas tropicales de México pero actualmente está amenazada por extinción. Sorprendentemente, hay una falta de información de su constitución genética, que debe ser evaluada para un manejo apropiado ex situ y para toma de decisiones en la liberación de cocodrilos a su hábitat natural. El objetivo del estudio fue caracterizar y comparar la variabilidad genética de cuatro grupos poblacionales de C. moreletii (dos silvestres y dos nacidas ex situ. Mediante PCR se amplificaron siete loci de microsatélites polimórficos, sin embargo se encontró déficit de heterocigotos en las poblaciones (promedio H O=0.02 mermado por la presencia de alelos nulos. El AMOVA indicó que la mayor proporción de variabilidad genética se encuentra dentro de las poblaciones y una limitada diferenciación genética entre poblaciones (promedio F ST =0.03, probablemente debida al alto índice de endogamia (promedio F IS=0.97. Al comparar la variabilidad genética inter e intra especies de cocodrilianos, encontramos que en C. moreletii está muy por debajo de los reportados. Se concluye que la limitada variabilidad genética de las poblaciones nacidas ex situ probablemente se debe al efecto fundador derivado de la estructura social de sus progenitores, y de las poblaciones silvestres, por el efecto cuello de botella, inferido por el limitado tamaño efectivo de población que presentó históricamente en su distribución natural.

Human endogenous retrovirus W env increases nitric oxide production and enhances the migration ability of microglia by regulating the expression of inducible nitric oxide synthase.

Science.gov (United States)

Xiao, Ran; Li, Shan; Cao, Qian; Wang, Xiuling; Yan, Qiujin; Tu, Xiaoning; Zhu, Ying; Zhu, Fan

2017-06-01

Human endogenous retrovirus W env (HERV-W env) plays a critical role in many neuropsychological diseases such as schizophrenia and multiple sclerosis (MS). These diseases are accompanied by immunological reactions in the central nervous system (CNS). Microglia are important immunocytes in brain inflammation that can produce a gasotransmitter-nitric oxide (NO). NO not only plays a role in the function of neuronal cells but also participates in the pathogenesis of various neuropsychological diseases. In this study, we reported increased NO production in CHME-5 microglia cells after they were transfected with HERV-W env. Moreover, HERV-W env increased the expression and function of human inducible nitric oxide synthase (hiNOS) and enhanced the promoter activity of hiNOS. Microglial migration was also enhanced. These data revealed that HERV-W env might contribute to increase NO production and microglial migration ability in neuropsychological disorders by regulating the expression of inducible NOS. Results from this study might lead to the identification of novel targets for the treatment of neuropsychological diseases, including neuroinflammatory diseases, stroke, and neurodegenerative diseases.

Human Ubc9 is involved in intracellular HIV-1 Env stability after trafficking out of the trans-Golgi network in a Gag dependent manner.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Christopher R Bohl

Full Text Available The cellular E2 Sumo conjugase, Ubc9 interacts with HIV-1 Gag, and is important for the assembly of infectious HIV-1 virions. In the previous study we demonstrated that in the absence of Ubc9, a defect in virion assembly was associated with decreased levels of mature intracellular Envelope (Env that affected Env incorporation into virions and virion infectivity. We have further characterized the effect of Ubc9 knockdown on HIV Env processing and assembly. We found that gp160 stability in the endoplasmic reticulum (ER and its trafficking to the trans-Golgi network (TGN were unaffected, indicating that the decreased intracellular mature Env levels in Ubc9-depleted cells were due to a selective degradation of mature Env gp120 after cleavage from gp160 and trafficked out of the TGN. Decreased levels of Gag and mature Env were found to be associated with the plasma membrane and lipid rafts, which suggest that these viral proteins were not trafficked correctly to the assembly site. Intracellular gp120 were partially rescued when treated with a combination of lysosome inhibitors. Taken together our results suggest that in the absence of Ubc9, gp120 is preferentially degraded in the lysosomes likely before trafficking to assembly sites leading to the production of defective virions. This study provides further insight in the processing and packaging of the HIV-1 gp120 into mature HIV-1 virions.

Divergência genética entre genótipos de frangos tipo caipira

Directory of Open Access Journals (Sweden)

R. C. Veloso

2015-10-01

Full Text Available RESUMOObjetivou-se com este trabalho verificar a divergência genética entre sete genótipos de frangos tipo caipira da linhagem Redbro utilizando as características de desempenho por meio de técnicas de análise multivariada. Foram utilizados 840 pintos de um dia, machos, distribuídos em delineamento inteiramente ao acaso, dos seguintes genótipos: Caboclo, Carijó, Colorpak, Gigante Negro, Pesadão Vermelho, Pescoço Pelado e Tricolor. Após a consistência dos dados, foram avaliadas as seguintes variáveis: ganho em peso médio diário, consumo de ração médio diário e conversão alimentar, para os períodos: 1 a 28, 1 a 56, 1 a 70 e 1 a 84 dias de idade; peso corporal ao nascimento, aos 28, 56, 70 e aos 84 dias de idade. O desempenho dos genótipos foi avaliado por meio da análise de variância multivariada e da função discriminante linear de Fisher, usando os testes do maior autovalor de Roy e da união-interseção de Roy para as comparações múltiplas. O estudo da divergência genética foi feito por meio da análise por variáveis canônicas e pelo método de otimização de Tocher. Os genótipos Caboclo e Gigante Negro apresentaram médias canônicas diferentes dos demais genótipos. As duas primeiras variáveis canônicas explicaram 97,41% da variação entre os genótipos. A divergência genética entre os genótipos avaliados permitiu a formação de quatro grupos com os seguintes genótipos: grupo 1 - Colorpak; grupo 2 - Pesadão Vermelho e Pescoço Pelado; grupo 3 - Carijó e Tricolor; e grupo 4 - Caboclo e Gigante Negro.

Macrophage entry mediated by HIV Envs from brain and lymphoid tissues is determined by the capacity to use low CD4 levels and overall efficiency of fusion

International Nuclear Information System (INIS)

Thomas, Elaine R.; Dunfee, Rebecca L.; Stanton, Jennifer; Bogdan, Derek; Taylor, Joann; Kunstman, Kevin; Bell, Jeanne E.; Wolinsky, Steven M.; Gabuzda, Dana

2007-01-01

HIV infects macrophages and microglia in the central nervous system (CNS), which express lower levels of CD4 than CD4+ T cells in peripheral blood. To investigate mechanisms of HIV neurotropism, full-length env genes were cloned from autopsy brain and lymphoid tissues from 4 AIDS patients with HIV-associated dementia (HAD). Characterization of 55 functional Env clones demonstrated that Envs with reduced dependence on CD4 for fusion and viral entry are more frequent in brain compared to lymphoid tissue. Envs that mediated efficient entry into macrophages were frequent in brain but were also present in lymphoid tissue. For most Envs, entry into macrophages correlated with overall fusion activity at all levels of CD4 and CCR5. gp160 nucleotide sequences were compartmentalized in brain versus lymphoid tissue within each patient. Proline at position 308 in the V3 loop of gp120 was associated with brain compartmentalization in 3 patients, but mutagenesis studies suggested that P308 alone does not contribute to reduced CD4 dependence or macrophage-tropism. These results suggest that HIV adaptation to replicate in the CNS selects for Envs with reduced CD4 dependence and increased fusion activity. Macrophage-tropic Envs are frequent in brain but are also present in lymphoid tissues of AIDS patients with HAD, and entry into macrophages in the CNS and other tissues is dependent on the ability to use low receptor levels and overall efficiency of fusion

Production of Mucosally Transmissible SHIV Challenge Stocks from HIV-1 Circulating Recombinant Form 01_AE env Sequences.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Lawrence J Tartaglia

2016-02-01

Full Text Available Simian-human immunodeficiency virus (SHIV challenge stocks are critical for preclinical testing of vaccines, antibodies, and other interventions aimed to prevent HIV-1. A major unmet need for the field has been the lack of a SHIV challenge stock expressing circulating recombinant form 01_AE (CRF01_AE env sequences. We therefore sought to develop mucosally transmissible SHIV challenge stocks containing HIV-1 CRF01_AE env derived from acutely HIV-1 infected individuals from Thailand. SHIV-AE6, SHIV-AE6RM, and SHIV-AE16 contained env sequences that were >99% identical to the original HIV-1 isolate and did not require in vivo passaging. These viruses exhibited CCR5 tropism and displayed a tier 2 neutralization phenotype. These challenge stocks efficiently infected rhesus monkeys by the intrarectal route, replicated to high levels during acute infection, and established chronic viremia in a subset of animals. SHIV-AE16 was titrated for use in single, high dose as well as repetitive, low dose intrarectal challenge studies. These SHIV challenge stocks should facilitate the preclinical evaluation of vaccines, monoclonal antibodies, and other interventions targeted at preventing HIV-1 CRF01_AE infection.

Identificación de marcadores microsatelites para el estudio de la diversidad genética de Taenia solium

OpenAIRE

Eguiluz Moya, María Lisseth

2014-01-01

La diversidad genética en parásitos está orientada hacia el esclarecimiento de la epidemiología y transmisión de las enfermedades. Muchos aspectos de la variación genética de Taenia solium se mantienen aún desconocidos. El estudio de la variación genética de este parásito permitiría comprender las diferencias observadas en la infectividad, patogenicidad y respuesta al tratamiento contra la neurocisticercosis. El polimorfismo de los loci microsatélites es un método utilizado ampliamente para e...

Intención de compra de medicamentos genéricos por parte de los usuarios de Asturias

Directory of Open Access Journals (Sweden)

González Hernando Santiago

2003-01-01

Full Text Available Fundamento: Conocer las percepciones de los consumidores acerca del riesgo asociado al uso de medicamentos genéricos y los factores que más influyen en la intención de solicitar un genérico al médico (prescriptor y/o al farmacéutico, a fin de determinar posibles barreras o frenos a la aceptación de los mismos y obtener información que apoye la toma de decisiones de los gestores sanitarios. Métodos: Estudio sobre utilización de medicamentos centrado en la disposición de los pacientes a solicitar una EFG. En esta investigación transversal cuantitativa se entrevistó personalmente a 542 individuos, a la salida de un centro de salud o de un establecimiento de farmacia en Asturias. En el cuestionario se incluía una escala de medición del riesgo percibido en la compra de un medicamento con 15 atributos agrupados en cinco dimensiones. Asimismo se recogió información sobre la intención de consumir medicamentos genéricos y sobre las características demográficas y socioeconómicas de los entrevistados. Para el análisis de los resultados se aplicaron un análisis factorial confirmatorio, regresión múltiple y análisis univariable. El tratamiento de los datos se efectuó con los programas estadísticos EQS y SPSS. Resultados: Percepción media del riesgo (escalas de 1 a 7: funcional: 2,75; físico: 2,68; financiero: 2,19; psicológico: 1,99; social: 1,42. Factores influyentes sobre la intención de solicitar genéricos al médico: riesgo psicológico (p=0,000. Sobre la solicitud al farmacéutico: riesgo psicológico (p=0,000 y riesgo social (p=0,020. Conclusiones: Los agentes interesados en el desarrollo en el mercado de las EFG deben mantener sus esfuerzos de comunicación hacia la equiparación de los aspectos funcionales y financieros entre especialidades del fabricante y especialidades genéricas, pero no deben dejar de lado aspectos psicológicos y sociales del comportamiento de compra del consumidor.

Diversidad genética y estructura de la población de Vibrio choierae en Colombia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Riaño Pachón Diego Mauricio

2003-06-01

Full Text Available Se realizó la electroforesis en gel por campo pulsado (PFGE de los macrofragmentos de restricción de 34 aislamien­tos de Vibrio choierae pertenecientes a la epidemia de cólera que se presentó en Colombia entre 1991 y 1996, adicionalmente se analizaron 3 aislamientos de V. choierae no pertenecientes a esta epidemia y un aislamiento de V fluvialis. La diversidad genética observada para los 38 aislamientos tipificados fue de 0,95 valor muy similar al obtenido por Electroforesis de Enzimas Multilocus (MLEE. No se observó correlación entre las variables que carac­terizan a estos aislamientos (serotipo, origen [clínico o ambiental], departamento, tipo electroforético (MLEE y perfil de macrofragmentos de restricción (PFGE. No se obtuvo evidencia de desequilibrio de ligamiento al evaluar esta población con los marcadores genéticos PFGE y MLEE. Se sugiere que la población de Vibrio choierae en Colom­bia presenta una estructura genética sexual, hipótesis que está soportada por la falta de evidencia de desequilibrio de ligamiento y la ausencia de correlaciones entre las variables epidemiológicas, bioquímicas y moleculares a dispo­sición, y por el alto valor de diversidad genética obtenido, que puede ser el reflejo de la coexistencia de varias líneas de descendencia entre las cuales existe un alto flujo genético. Palabras clave: Vibrio choierae; Electroforesis en gel por campo pulsado; epidemiología molecular; genética de po­blaciones; desequilibrio de ligamiento.

Structure-Based Design of a Soluble Prefusion-Closed HIV-1 Env Trimer with Reduced CD4 Affinity and Improved Immunogenicity

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Chuang, Gwo-Yu; Geng, Hui; Pancera, Marie; Xu, Kai; Cheng, Cheng; Acharya, Priyamvada; Chambers, Michael; Druz, Aliaksandr; Tsybovsky, Yaroslav; Wanninger, Timothy G.; Yang, Yongping; Doria-Rose, Nicole A.; Georgiev, Ivelin S.; Gorman, Jason; Joyce, M.Gordon; O; Dell, Sijy; Zhou, Tongqing; McDermott, Adrian B.; Mascola, John R.; Kwong, Peter D. (NIH); (FNL)

2017-03-08

The HIV-1 envelope (Env) trimer is a target for vaccine design as well as a conformational machine that facilitates virus entry by transitioning between prefusion-closed, CD4-bound, and coreceptor-bound conformations by transitioning into a postfusion state. Vaccine designers have sought to restrict the conformation of the HIV-1 Env trimer to its prefusion-closed state as this state is recognized by most broadly neutralizing, but not nonneutralizing, antibodies. We previously identified a disulfide bond, I201C-A433C (DS), which stabilizes Env in the vaccine-desired prefusion-closed state. When placed into the context of BG505 SOSIP.664, a soluble Env trimer mimic developed by Sanders, Moore, and colleagues, the engineered DS-SOSIP trimer showed reduced conformational triggering by CD4. Here, we further stabilize DS-SOSIP through a combination of structure-based design and 96-well-based expression and antigenic assessment. From 103 designs, we identified one, named DS-SOSIP.4mut, with four additional mutations at the interface of potentially mobile domains of the prefusion-closed structure. We also determined the crystal structures of DS-SOSIP.4mut at 4.1-Å resolution and of an additional DS-SOSIP.6mut variant at 4.3-Å resolution, and these confirmed the formation of engineered disulfide bonds. Notably, DS-SOSIP.4mut elicited a higher ratio of tier 2 autologous titers versus tier 1 V3-sensitive titers than BG505 SOSIP.664. DS-SOSIP.4mut also showed reduced recognition of CD4 and increased thermostability. The improved antigenicity, thermostability, and immunogenicity of DS-SOSIP.4mut suggest utility as an immunogen or a serologic probe; moreover, the specific four alterations identified here, M154, M300, M302, and L320 (4mut), can also be transferred to other HIV-1 Env trimers of interest to improve their properties.

IMPORTANCEOne approach to elicit broadly neutralizing antibodies against HIV-1 is to stabilize the

Efecto sedante del midazolam genérico versus innovador en ratas Wistar

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Radamés Alemón-Medina

2015-11-01

Full Text Available Antecedentes: ocho de cada diez pacientes en Terapia Intensiva del Instituto Nacional de Pediatría no obtienen el mismo efecto ansiolítico y sedante con midazolam genérico (PiSA®, que con el innovador (Dormicum, Roche® a pesar de que su biodisponibilidad es de 100%.  Objetivo: determinar diferencias significativas en el efecto sedante del midazolam genérico y del innovador administrados parenteralmente.  Material y métodos: estudio aleatorizado cruzado en 24 ratas Wistar macho distribuidas en 4 grupos (n=6. A cada individuo se le administró una dosis de 0.5 mg/kg de peso vía intraperitoneal. Se determinaron los grados de sedación mediante la escala de Salamone. Se midió la concentración del fármaco en las ampolletas de ambas marcas por cromatografía líquida de alta resolución. Resultados: el efecto sedante del midazolam apareció al mismo tiempo y tuvo la misma duración, ndependientemente de la marca. El efecto tiende a ser más duradero con el innovador pero sin ser estadísticamente significativo (ANOVA, p ≤ 0.05. Asimismo, la mayoría de los animales llegaron al nivel 3 de sedación con ambas marcas.   Conclusión: tanto el midazolam innovador como el genérico tienen el mismo efecto sedante: aparece al mismo tiempo y tiene la misma duración.

Diagnóstico genético prenatal y aborto. Dos cuestiones de eugenesia y discriminación.

OpenAIRE

Villela Cortés, Fabiola; Linares Salgado, Jorge

2015-01-01

Los avances en genética seguidos de las nuevas tecnologías en la detección temprana de afecciones genéticas conllevan dilemas bioéticos sobre el uso adecuado de estas técnicas, la información que se le da a la mujer embarazada y la decisión que ella tomará al recibirla. Detectar a tiempo anomalías genéticas permite, en algunas ocasiones, el inicio de un tratamiento adecuado que permita que el niño por nacer no desarrolle una enfermedad discapacitante, como el caso de la fenilcetonuria,...

Diagnóstico genético prenatal y aborto. Dos cuestiones de eugenesia y discriminación

OpenAIRE

Villela Cortés, Fabiola; Linares Salgado, Jorge E.

2015-01-01

Los avances en genética seguidos de las nuevas tecnologías en la detección temprana de afecciones genéticas conllevan dilemas bioéticos sobre el uso adecuado de estas técnicas, la información que se le da a la mujer embarazada y la decisión que ella tomará al recibirla. Detectar a tiempo anomalías genéticas permite, en algunas ocasiones, el inicio de un tratamiento adecuado que permita que el niño por nacer no desarrolle una enfermedad discapacitante, como el caso de la fenilcetonuria, o una ...

GenBank

OpenAIRE

Benson, Dennis A.; Cavanaugh, Mark; Clark, Karen; Karsch-Mizrachi, Ilene; Lipman, David J.; Ostell, James; Sayers, Eric W.

2012-01-01

GenBank? (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) is a comprehensive database that contains publicly available nucleotide sequences for almost 260 000 formally described species. These sequences are obtained primarily through submissions from individual laboratories and batch submissions from large-scale sequencing projects, including whole-genome shotgun (WGS) and environmental sampling projects. Most submissions are made using the web-based BankIt or standalone Sequin programs, and GenBank staff assig...

Saber o no saber… Derecho e información genética

Directory of Open Access Journals (Sweden)

José Ignacio Solar Cayón

2013-12-01

Full Text Available El extraordinario desarrollo de las técnicas genéticas, con su formidable capacidad de afectación a la autonomía personal y de invasión de los derechos individuales, está teniendo un impacto profundo en el pensamiento jurídico, obligándonos a revisar algunos de los presupuestos en que se funda nuestra concepción de los derechos fundamentales. Así, el reconocimiento del derecho del individuo a no conocer sus datos genéticos parece desafiar nociones esenciales como las de autonomía y racionalidad del sujeto de derechos, vinculadas en el proyecto ilustrado de emancipación del individuo a la idea de pleno acceso al conocimiento. Sin embargo, la propia idea de “ignorancia” no resulta ajena al discurso de fundamentación de los derechos fundamentales, como prueba el papel esencial que el “velo de la ignorancia” desempeña en la revisión de la tradición liberal efectuada por John Rawls. A partir de la teoría de éste y de John Stuart Mill se indaga en los fundamentos filosóficos del derecho a no saber los datos genéticos y en sus límites, ante la existencia de posibles derechos de terceros a acceder a esa información. Asimismo, se pone de manifiesto el papel que en este nuevo contexto juega el Derecho como instancia administradora del conocimiento y de la ignorancia, ante la amenaza de un determinismo genético que parece poner en cuestión en última instancia la idea misma de libertad individual.

Reação de genótipos de soja ao alumínio em hidroponia e no solo

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Souza Luiz Augusto Copati

2001-01-01

Full Text Available O objetivo deste trabalho foi avaliar os genótipos de soja BR86-5974, BR86-7396, Dourados, Doko RC, EMGOPA 305, IAC-9, BR-9 (Savana, UFV-1, UFV-9 e UFV Araguaia em relação à tolerância ao alumínio (Al em hidroponia e em solo. Na solução com Al foi medido o comprimento radicular. Em solo com 49% de saturação de Al avaliou-se área foliar, altura de planta, altura de inserção da primeira vagem, produção de matéria seca, produção de grãos e índice de colheita. Os genótipos BR86-7396 e IAC-9 são os de maior tolerância ao Al, e UFV-1 mostrou o pior desempenho. Houve correlação significativa entre alongamento radicular e produção de grãos (r = 0,705, área foliar (r = 0,645 e produção de matéria seca (r = 0,634. Isto indica que experimentos em hidroponia e solo são igualmente eficientes na seleção de soja tolerante ao alumínio. A variabilidade detectada sugere que o conjunto de genótipos de soja possui ampla variabilidade genética, o que é desejável em programas de melhoramento com o objetivo de elevar estabilidade de produção no Cerrado.

GenBank

OpenAIRE

Benson, Dennis A.; Karsch-Mizrachi, Ilene; Lipman, David J.; Ostell, James; Sayers, Eric W.

2008-01-01

GenBank? is a comprehensive database that contains publicly available nucleotide sequences for more than 300 000 organisms named at the genus level or lower, obtained primarily through submissions from individual laboratories and batch submissions from large-scale sequencing projects. Most submissions are made using the web-based BankIt or standalone Sequin programs, and accession numbers are assigned by GenBank? staff upon receipt. Daily data exchange with the European Molecular Biology Labo...

Contribuciones de Sir Roland Fisher a la Estadística Genética

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jaime Cuadros

2004-11-01

Full Text Available Sir Ronald Fisher (18901962 fue profesor de genética y muchas de sus innovaciones estadísticas encontraron expresión en el desarrollo de metodología en estadística genética. Sin embargo, mientras sus contribuciones en estadística matemática son fácilmente identificadas, en genética de poblaciones compartió su supremacía con Sewall Wright (1889 1988 y J. S. S. Haldane (1892 1965. Este documento muestra algunas de las mejores contribuciones de Fisher a las bases de la estadística genética, y sus interacciones con Wright y Haldane, los cuales contribuyeron al desarrollo del tema. Con la tecnología moderna, tanto la metodología la estadística como la información genética están cambiando. No obstante, muchos de los trabajos de Fisher permanecen relevantes, y pueden aun servir como una base para investigaciones futuras en el análisis estadístico de datos de DNA. El trabajo de este autor refleja su visión del papel de Ia estadística en Ia inferencia científica expresada en 1949

La bioinformática al servicio de la genómica

OpenAIRE

Amigo Lechuga, Jorge

2013-01-01

Este trabajo de tesis aborda distintos ámbitos de aplicación de técnicas bioinformáticas a la resolución de problemas surgidos del manejo, análisis, almacenamiento y consulta de grandes volúmenes de datos genómicos. Los principales retos a los que esta tesis ha tratado de dar respuesta han sido los siguientes: - Procesar la información más básica de las tecnologías de genotipado de alto rendimiento, a fin de permitir obtener de manera rápida y sencilla una serie de parámetros y estadística...

GenBank

OpenAIRE

Benson, Dennis A.; Karsch-Mizrachi, Ilene; Lipman, David J.; Ostell, James; Wheeler, David L.

2006-01-01

GenBank (R) is a comprehensive database that contains publicly available nucleotide sequences for more than 240 000 named organisms, obtained primarily through submissions from individual laboratories and batch submissions from large-scale sequencing projects. Most submissions are made using the web-based BankIt or standalone Sequin programs and accession numbers are assigned by GenBank staff upon receipt. Daily data exchange with the EMBL Data Library in Europe and the DNA Data Bank of Japan...

Kommentarer til arbejdsdokument ENV/04/27. Dokument fra "Antibiotic resistance marker genes working group"

DEFF Research Database (Denmark)

Kjellsson, Gøsta

2012-01-01

"DMU har modtaget og vurderet det fremsendte dokument ENV/04/27 og bilag (mail fra Skov- og Naturstyrelsen d. 14-10-2004) om anvendelsen af antibiotikaresistensmarkører (ARM) hos GMO. Vi har tidligere flere gange kommenteret anvendelsen af antibiotikaresistens (se f.eks. brev til Skov- og Naturst...

Divergencia genética en poblaciones peruanas detectada a partir de las frecuencias haplotípicas del mtDNA y del gen nuclear MBL

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jesús H. Córdova

2011-01-01

Full Text Available Objetivos: Avanzar en el conocimiento del origen de las poblaciones peruanas estudiadas en un contexto filogeográfico. Diseño: Estudio genético poblacional. Instituciones: Laboratorio de Genética Humana, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, e Instituto de Genética y Biología Molecular, Facultad de Medicina, Universidad San Martín de Porras, Lima, Perú. Participantes: Siete poblaciones peruanas. Metodología: Análisis comparativo de los resultados a partir del estudio del mtDNA y el gen nuclear MBL de siete poblaciones peruanas, procesados de manera separada y luego combinados, utilizando el programa PHYLYP 3.65, para obtener valores FST de diferenciación genética y la construcción de árboles de distancias por aplicación del algorritmo UPGMA y el análisis subsecuente de los agrupamientos (clusters generados. Principales medidas de resultados: Árboles genéticos generados. Resultados: De manera separada, los árboles generados para cada marcador genético tuvieron topologías propias y diferentes entre sí. Procesados de manera combinada, el árbol resultante demostró que los mayores valores de diferenciación genética se hallaron en las Islas del Lago Titicaca (Puno, Perú conocidas -Taquile, Amantani y Anapia-, que fue calificada como muy alta, porque mostró valores de FST de 0.3113, 0.2949 y 0.3348 respecto de las poblaciones estudiadas, tanto fuera del Departamento de Puno -como Chachapoyas, Pucallpa y Chiclayo, respectivamente-, así como a la de los Uro del mismo Puno y del mismo Lago Titicaca (0.2837. Fuera de Puno, el par de poblaciones Chachapoyas-Pucallpa fue el menos divergente, al alcanzar entre ellas un valor de FST de 0.0108, calificándosele de pequeña. Conclusiones: El árbol obtenido del procesamiento de los marcadores vía una matriz combinada demostró que las poblaciones que habitan las islas de Taquile, Amantani y Anapia, divergen notablemente de las restantes cuatro

Sieve analysis of breakthrough HIV-1 sequences in HVTN 505 identifies vaccine pressure targeting the CD4 binding site of Env-gp120.

Science.gov (United States)

deCamp, Allan C; Rolland, Morgane; Edlefsen, Paul T; Sanders-Buell, Eric; Hall, Breana; Magaret, Craig A; Fiore-Gartland, Andrew J; Juraska, Michal; Carpp, Lindsay N; Karuna, Shelly T; Bose, Meera; LePore, Steven; Miller, Shana; O'Sullivan, Annemarie; Poltavee, Kultida; Bai, Hongjun; Dommaraju, Kalpana; Zhao, Hong; Wong, Kim; Chen, Lennie; Ahmed, Hasan; Goodman, Derrick; Tay, Matthew Z; Gottardo, Raphael; Koup, Richard A; Bailer, Robert; Mascola, John R; Graham, Barney S; Roederer, Mario; O'Connell, Robert J; Michael, Nelson L; Robb, Merlin L; Adams, Elizabeth; D'Souza, Patricia; Kublin, James; Corey, Lawrence; Geraghty, Daniel E; Frahm, Nicole; Tomaras, Georgia D; McElrath, M Juliana; Frenkel, Lisa; Styrchak, Sheila; Tovanabutra, Sodsai; Sobieszczyk, Magdalena E; Hammer, Scott M; Kim, Jerome H; Mullins, James I; Gilbert, Peter B

2017-01-01

Although the HVTN 505 DNA/recombinant adenovirus type 5 vector HIV-1 vaccine trial showed no overall efficacy, analysis of breakthrough HIV-1 sequences in participants can help determine whether vaccine-induced immune responses impacted viruses that caused infection. We analyzed 480 HIV-1 genomes sampled from 27 vaccine and 20 placebo recipients and found that intra-host HIV-1 diversity was significantly lower in vaccine recipients (P ≤ 0.04, Q-values ≤ 0.09) in Gag, Pol, Vif and envelope glycoprotein gp120 (Env-gp120). Furthermore, Env-gp120 sequences from vaccine recipients were significantly more distant from the subtype B vaccine insert than sequences from placebo recipients (P = 0.01, Q-value = 0.12). These vaccine effects were associated with signatures mapping to CD4 binding site and CD4-induced monoclonal antibody footprints. These results suggest either (i) no vaccine efficacy to block acquisition of any viral genotype but vaccine-accelerated Env evolution post-acquisition; or (ii) vaccine efficacy against HIV-1s with Env sequences closest to the vaccine insert combined with increased acquisition due to other factors, potentially including the vaccine vector.

Contribución de la genética moderna al desarrollo de la reprogramación celular

OpenAIRE

Lavaut-Sánchez, Kalia; Hernández-Ramírez, Porfirio

2010-01-01

El avance en el conocimiento de la genética y en especial de la biología molecular, dio paso a una nueva era: la genómica, y a nuevos conceptos como transcriptoma, proteoma, metaboloma, epigenoma, que permiten el estudio de la estructura, organización y función de todos los genes y sus productos, así como de los mecanismos implicados en la regulación de su expresión y el modo en que unos genes interactúan con otros. El uso de nuevas tecnologías en la investigación con células madre favoreció ...

Variabilidad genética en Prosopis ferox (Mimosaceae

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Alicia D. Burghardt

2004-01-01

Full Text Available Prosopis ferox (Mimosaceae es una especie arbustiva o arbórea espinosa que se distribuye desde el Sur de Bolivia hasta el noroeste de la Argentina. En la provincia de Jujuy se encuentra a grandes alturas (entre los 2400 y los 3700 m s.m.. Existe una gran variabilidad morfológica, especialmente en cuanto a las dimensiones del fruto y la cantidad de semillas por fruto, ambas características importantes debido al uso de esta planta como forraje. Con el objeto de verificar si existe además variabilidad genética, se realizó un estudio electroforético de proteínas seminales de árboles procedentes de distintas localidades de la provincia de Jujuy. Los patrones polipeptídicos obtenidos por SDS-PAGE presentaron en total 26 bandas. Cada población se caracterizó por sus patrones de presencia-ausencia de bandas, habiéndose encontrado variabilidad intrapoblacional (polimorfismo en algunas de ellas, siendo otras genéticamente homogéneas. Los índices polimórficos en poblaciones de P. ferox son comparables a los obtenidos previamente en P. ruscifolia. La variabilidad genética interpoblacional hallada por medio del estudio electroforético de las proteínas seminales hace suponer la existencia de ecotipos

Evolución genómica por diseño molecular de levaduras industriales

OpenAIRE

SANI, DANIELE

2013-01-01

En esta Tesis Doctoral se propone una alternativa a la coyuntura actual de rechazo social frente al uso de OMGs en la industria agroalimentaria, mediante la demostración y el desarrollo de un nuevo concepto sobre el uso de las técnicas de biología molecular en la obtención de levaduras modificadas genéticamente, el concepto de Evolución Genómica mediante Diseño Molecular. La idea básica de este nuevo concepto es simple y se basa en imitar a la propia naturaleza en su const...

GENÇ PARTİ'Yİ ANLAMAK (Parti, Lider ve Kitle Üzerine Bir Çalısma)

OpenAIRE

TÜRK, Hasan Bahadır

2007-01-01

Türk, Hasan Bahadır, Genç Parti’yi Anlamak: Parti, Lider ve Kitle Üzerine BirÇalısma, Doktora Tezi, Danısman: Doç.Dr. Aykut Çelebi, 399 s.ÖZETBu çalısmanın amacı; Genç Parti’nin temel yapısal özelliklerine ısık tutmaktır. Çalısma;Genç Parti’yi lider, kadro, parti tipolojisi, ideoloji ve söylem gibi parçalarındanhareketle analiz etmeye ve kitleyle kurdugu iliskiyi tartısmaya odaklanacaktır. Çalısma,üç ana bölümden olusmaktadır. lk iki bölümde Uzanlar’ın genel yapısı, yükselis veçöküs süreci Ge...

Divergência, variabilidade genética e desempenho agronômico em genótipos de couve.

OpenAIRE

Azevedo, Alcinei Mistico

2012-01-01

Embora haja grande variabilidade genética para a couve, são poucos trabalhos no Brasil que visão obter informações para programas de melhoramento genético nesta cultura. Assim, objetivou-se neste trabalho caracterizar 30 genótipos de couve a partir de caracteres morfo-agronômicos para estimar a divergência genética, a importância dos caracteres para a divergência, o desempenho agronômico, os parâmetros genéticos e a correlação entre as características avaliadas. O experimento foi conduzido na...

Selected HIV-1 Env trimeric formulations act as potent immunogens in a rabbit vaccination model

DEFF Research Database (Denmark)

Heyndrickx, Leo; Stewart-Jones, Guillaume; Jansson, Marianne Bendixen

2013-01-01

Ten to 30% of HIV-1 infected subjects develop broadly neutralizing antibodies (bNAbs) during chronic infection. We hypothesized that immunizing rabbits with viral envelope glycoproteins (Envs) from these patients may induce bNAbs, when formulated as a trimeric protein and in the presence of an ad...

Selected HIV-1 Env Trimeric Formulations Act as Potent Immunogens in a Rabbit Vaccination Model

NARCIS (Netherlands)

Heyndrickx, Leo; Stewart-Jones, Guillaume; Jansson, Marianne; Schuitemaker, Hanneke; Bowles, Emma; Buonaguro, Luigi; Grevstad, Berit; Vinner, Lasse; Vereecken, Katleen; Parker, Joe; Ramaswamy, Meghna; Biswas, Priscilla; Vanham, Guido; Scarlatti, Gabriella; Fomsgaard, Anders

2013-01-01

Ten to 30% of HIV-1 infected subjects develop broadly neutralizing antibodies (bNAbs) during chronic infection. We hypothesized that immunizing rabbits with viral envelope glycoproteins (Envs) from these patients may induce bNAbs, when formulated as a trimeric protein and in the presence of an

Market share scenarios for Gen-DIII and gen-IV reactors in Europe

International Nuclear Information System (INIS)

Roelofs, F.; Heek, A. V.; Durpel, L. V. D.

2008-01-01

Nuclear energy is back on the agenda worldwide in order to meet growing energy demand and especially the growth in electricity demand. Many objectives direct to an increased use of nuclear energy, i.e. minimising energy costs, reducing climate change effects and others. In the light of the potential renewed growth of nuclear energy, the public demands a clear view on what nuclear energy may contribute towards meeting these objectives and especially how nuclear energy may address some socio-political obstructions with respect to economics, radioactive waste, safety and proliferation of fissile materials. To address these questions, the future nuclear reactor park mix in Europe has been analysed applying an integrated dynamic process modelling technique. Various market share scenarios for nuclear energy are derived including sub-variants with regard to the intra-nuclear options. In the analyses, it is assumed that different types of new reactors may be built, taking into account the introduction date of considered Gen-Ill (i.e. EPR) and Gen-IV (i.e. SCWR, HTR, FR) reactors, and the economic evaluation of the complete fuel cycle. The assessment was undertaken using the DANESS code (Dynamic Analysis of Nuclear Energy System Strategies). The analyses show that given the considered realistic nuclear energy demand and given a limited number of available Gen-III and Gen-IV reactor types, the future European nuclear park will exist of combinations of Gen-III and Gen-IV reactors. This mix will always consist of a set of reactor types each having its specific strengths. The analyses also highlight the triggers influencing the choice between different nuclear energy deployment scenarios. (authors)

Perda auditiva genética Genetic hearing loss

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Ricardo Godinho

2003-01-01

Full Text Available O progresso das pesquisas relacionadas à perda auditiva genética tem provocado um importante avanço do entendimento dos mecanismos moleculares que governam o desenvolvimento, a função, a resposta ao trauma e o envelhecimento do ouvido interno. Em países desenvolvidos, mais de 50% dos casos de surdez na infância é causada por alterações genéticas e as perdas auditivas relacionadas à idade têm sido associadas com mecanismos genéticos. OBJETIVO: O objetivo desta revisão é relatar as informações mais recentes relacionadas às perdas audtivas de origem genética. FORAMA DE ESTUDO: Revisão sistemática. MATERIAL E MÉTODO: A revisão da literatura inclui artigos indexados à MEDLINE (Biblioteca Nacional de Saúde, NIH-USA e publicados nos últimos 3 anos, além das informações disponíveis na Hereditary Hearing Loss Home Page. CONCLUSÃO: Os recentes avanços no entendimento das perdas auditivas de origem genética têm favorecido a nossa compreensão da função auditiva e tornado o diagnóstico mais apurado. Possivelmente, no futuro, este conhecimento também proporcionará o desenvolvimento de novas terapias para o tratamento das causas genéticas das perdas auditivas.The progress in the research of genetic hearing loss has advanced our understanding of the molecular mechanisms that govern inner ear development, function and response to injury and aging. In the developed world, over 50% of childhood deafness is attributable to genetic causes and even age-related hearing loss has been associated with genetic mechanisms. AIM: The objective of this review is to summarize recent knowledge in genetic hearing loss. STUDY DESIGN: Sistematic review. MATERIAL AND METHODS: The literature review included articles indexed at MEDLINE (The National Library of Medicine, The National Institute of Health - USA focusing on publications from the past 3 years plus the information available at the Hereditary Hearing Loss Home Page. CONCLUSION

Genómica funcional de la elongación transcripcional

OpenAIRE

Rodríguez Gil, Alfonso

2008-01-01

Los principales objetivos de esta Tesis Doctoral son: Desarrollo de un nuevo método para el estudio de la distribución intragénica de la RNA polimerasa II a escala genómica. Aplicación del método desarrollado al estudio de mutantes afectados en la elongación transcripcional. Identificación de nuevos factores que afectan a la elongación transcripcional

20-25 Yaş Arası Sağlıklı Gençlerde Gri ve Beyaz Cevher Hacimlerinin İncelenmesi: Planimetrik Çalışma

OpenAIRE

ÇAMURDANOĞLU, Niyazi ACER - Tolga ERTEKİN - Ayşegül KÜ; ACER, Niyazi; ERTEKİN, Tolga; KÜÇÜK, Ayşegül; BABAOĞLU, Cumhur; ÇANKAYA, M. Niyazi; ÇAMURDANOĞLU, Mehmet

2015-01-01

Amaç: İnsan beyninde cinsiyete ilişkin varyasyonlar birçok araştırıcı tarafından incelenmiştir. Bu çalışmaların çoğunda erkek beyin hacminin bayanlardan daha büyük olduğu bildirilmektedir. Bu çalışmanın amacı MR görüntüleri üzerinde beyaz ve gri cevher ölçümleri planimterik yöntem ile değerlendirmektir. Gereç ve Yöntemler: Bu çalışmada beyaz ve gri cevher hacimleri 20-25 yaş arası sağlıklı gençlerde incelenmiştir. T2 ağırlıklı MR görüntüleri 12 kişi üzerinde elde edilmiş, kadın ve erkeklerde ...

Revising REACH guidance on information requirements and chemical safety assessment for engineered nanomaterials for aquatic ecotoxicity endpoints: recommendations from the EnvNano project

DEFF Research Database (Denmark)

Hansen, Steffen Foss; Sørensen, Sara Nørgaard; Skjolding, Lars Michael

2017-01-01

be made applicable to nanomaterials. European Research Council project EnvNano—Environmental Effects and Risk Evaluation of Engineered, which ran from 2011 to 2016, took another outset by assuming that: “The behaviour of nanoparticles in suspension is fundamentally different from that of chemicals......The European Chemical Agency (ECHA) is in the process of revising its guidance documents on how to address the challenges of ecotoxicological testing of nanomaterials. In these revisions, outset is taken in the hypothesis that ecotoxicological test methods, developed for soluble chemicals, can...... in solution”. The aim of this paper is to present the findings of the EnvNano project and through these provide the scientific background for specific recommendations on how ECHA guidance could be further improved. Key EnvNano findings such as the need to characterize dispersion and dissolution rates in stock...

Estimación mediante RAPD's de la diversidad genética en Guadua en el departamento del Cauca, Colombia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Palacio M. Juan Diego

2006-06-01

Full Text Available

Mediante RAPD's se analizaron 120 muestras foliares de 12 biotipos de Guadua angustifolia Kunth clasificados morfológicamente, procedentes de la cuenca del río Cauca, en el departamento del Cauca, Colombia, para determinar diversidad genética. El ADN se extrajo mediante el protocolo modificado de Dellaporta (1983. Se emplearon los cebadores; OPF-12, OPG-19, OPN-19 y OPP-16 con mayor número de bandas polimórficas. El índice de Shannon (HT = 0.4556 ± 0.1849 señaló diversidad genética total alta y diversidad entre los biotipos y al interior de ellos. El Índice de estructura genética (Gst = 0.5200 e Indice de migración efectiva (Nm = 0.4615 definieron biotipos bien diferenciados. El análisis de similaridad conformó tres grupos a un coeficiente de 0.64. El grupo G1 incluyó los biotipos Curvado, Rayada frecuente, Amarilla Playón, Rayada ancha, Rayada escasa, Convexa, Amarilla, Hembra, Verde irregular y algunos individuos de verde alta. El grupo G2, Verde alta y Macho. El grupo G3, Rayada negra. El estudio molecular agrupó los individuos de forma similar al estudio morfológico, con excepción de los individuos del biotipo Hembra.

Palabras claves: Guadua angustifolia, caracterización molecular, variación genética.

Selección de embriones humanos. Diagnóstico genético preimplantación

OpenAIRE

Natalia López Moratalla; Marta Lago Fernández Purón; Esteban Santiago

2011-01-01

La posibilidad de detectar defectos cromosómicos o genéticos en embriones in vitro, asociada a las técnicas de Reproducción Humana Asistida antes de su posible transferencia a útero para completar su desarrollo, se presentó como una alternativa al aborto eugenésico. Y una opción para mujeres de edad avanzada para procrear, de evitar embarazos de embriones con defectos cromosómicos. El diagnóstico genético previo a la implantación (DGP) y el cribado de los embriones in vitro (por las siglas en...

Estudio de bioequivalencia del ibuprofeno genérico 400mg tabletas

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Ofelia Villalva-Rojas

2007-10-01

Full Text Available Objetivo. Determinar la biodisponibilidad de dos formulaciones de ibuprofeno 400mg tabletas, para establecer si el medicamento multifuente (genérico es bioequivalente al de referencia (Motrin® 400mg. Materiales y métodos. Se diseñó un estudio abierto, randomizado, cruzado, dos periodos, con siete días de lavado, con 12 voluntarios sanos de ambos sexos, entre 21 y 48 años, quienes ingirieron una tableta del medicamento genérico o de referencia, según randomización, con 200mL de agua. Luego de ingerir el medicamento se colectó 4mL de sangre por voluntario para la cuantificación plasmática de ibuprofeno. Las muestras de plasma se analizaron por cromatografía líquida acoplada al espectrofotómetro de masas (LC-MS/MS con ionización electrospray ión negativo, aplicando monitoreo de reacción selectiva. La bioequivalencia se determinó con los parámetros farmacocinéticos de área bajo la curva AUC(0-t, AUC(0-∞ y concentración máxima (Cmax. Resultados. Según análisis estadístico, se encontraron: AUCmultifuente(0-t = 86,85 (μg*h/ mL, AUCRef.(0-t= 81,20 (μg*h/mL, AUCmultifuente(0-∞= 88,67 (μg*h/mL, AUCRef.(0-∞= 82,83(μg*h/mL, Cmαxmultifuente = 17,70 ug/mL, CmαxRef. =18,09 μg/mL, con rango de 0,93-1,24 para AUC(0-t, 0,93-1,24 para AUC(0-∞ y 0,81-1,19 para Cmax. Conclusión. Los valores encontrados de ibuprofeno están dentro de los requisitos de la OMS y la FDA, para establecer bioequivalencia (0,80-1,25, demostrándose que el ibuprofeno genérico es bioequivalente al de referencia en velocidad y cantidad de ibuprofeno absorbido en el organismo.

Down-regulation of human endogenous retrovirus type K (HERV-K) viral env RNA in pancreatic cancer cells decreases cell proliferation and tumor growth

Science.gov (United States)

Li, Ming; Radvanyi, Laszlo; Yin, Bingnan; Li, Jia; Chivukula, Raghavender; Lin, Kevin; Lu, Yue; Shen, JianJun; Chang, David Z.; Li, Donghui; Johanning, Gary L.; Wang-Johanning, Feng

2017-01-01

Purpose We investigated the role of the human endogenous retrovirus type K (HERV-K) envelope (env) gene in pancreatic cancer (PC). Experimental Design shRNA was employed to knockdown (KD) the expression of HERV-K in PC cells. Results HERV-K env expression was detected in seven PC cell lines and in 80% of PC patient biopsies, but not in two normal pancreatic cell lines or uninvolved normal tissues. A new HERV-K splice variant was discovered in several PC cell lines. RT activity and virus-like particles were observed in culture media supernatant obtained from Panc-1 and Panc-2 cells. HERV-K viral RNA levels and anti-HERV-K antibody titers were significantly higher in PC patient sera (N=106) than in normal donor sera (N=40). Importantly, the in vitro and in vivo growth rates of three PC cell lines were significantly reduced after HERV-K KD by shRNA targeting HERV-K env, and there was reduced metastasis to lung after treatment. RNA-seq results revealed changes in gene expression after HERV-K env KD, including RAS and TP53. Furthermore, downregulation of HERV-K Env protein expression by shRNA also resulted in decreased expression of RAS, p-ERK, p-RSK, and p-AKT in several PC cells or tumors. Conclusion These results demonstrate that HERV-K influences signal transduction via the RAS-ERK-RSK pathway in PC. Our data highlight the potentially important role of HERV-K in tumorigenesis and progression of PC, and indicate that HERV-K viral proteins may be attractive biomarkers and/or tumor-associated antigens, as well as potentially useful targets for detection, diagnosis and immunotherapy of PC. PMID:28679769

Métodos y usos agrícolas de la ingeniería genética aplicada al cultivo de arroz

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Cristina DiazGranados D.

2012-07-01

Full Text Available Methods and agricultural uses of genetic engineering applied to rice crop Resumen: En biotecnología de arroz se han logrado avances en transformación genética, con importantes resultados en el mejoramiento genético de variedades elite de las subespecies japónica e índica. Con el propósito de revisar los métodos y los usos agrícolas de la ingeniería genética aplicada al cultivo del arroz, se usaron varias palabras claves en idioma inglés en algunas de las bases de datos de revistas científicas indexadas, disponibles en el Sistema Nacional de Bibliotecas de la Universidad Nacional de Colombia (SINAB, seleccionando documentos publicados entre 2000 y 2011. La base de esta revisión inicial, se complementó con artículos publicados en fechas anteriores, que se consideraron relevantes, debido a que implicaban cambios metodológicos importantes. Desde que se logró producir la primera planta transgénica de arroz a finales de los 80´s, varios protocolos para la transferencia de genes se han empleado con éxito logrando la modificación genética de más de 60 cultivares de arroz. Para ello se han empleado sistemas de transformación tanto directos como indirectos.  Se han realizado modificaciones de rasgos importantes en el cultivo, tales como la resistencia a factores bióticos (insectos, hongos, bacterias, virus, nematodos, tolerancia a factores abióticos (salinidad, sequía, altas y bajas temperaturas, inmersión, y mejoramiento de características agronómicas (calidad nutricional, rendimiento, uso de nutrientes, tolerancia a herbicidas. Palabras claves: Arroz; cultivos transgénicos; factores bióticos; factores abióticos. Abstract: In rice biotechnology advances have been made in genetic transformation, with significant results in breeding elite varieties of japonica and indica subspecies. In order to review the methods and agricultural uses of genetic engineering applied to rice, calves were used several words in English in

Análisis de la Variabilidad Genética entre treinta accesiones de tarwi (Lupinus mutabilis Sweet usando marcadores moleculares ISSR

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Michelle C. Chirinos-Arias

2015-01-01

Full Text Available Con el fin de realizar el análisis de variabilidad genética inter-accesión de treinta accesiones de tarwi (L. mutabilis Sweet pertenecientes al Banco de Germoplasma del Instituto Nacional de Innovación Agraria (INIA. Se extrajo el ADN de 300 plantas, se construyeron bulks, se estandarizó el protocolo de amplificación de los marcadores moleculares Inter Simple Sequence Repeat (ISSR, de los cuales se eligió a los más polimórficos y nítidos para corrida en gel de acrilamida. Encontrándose 255 bandas con 8 iniciadores ISSR. El análisis de la variabilidad genética con estos iniciadores comprobó una alta variabilidad genética de las muestras en estudio. Observándose también un polimorfismo relativamente alto para una especie autógama como L. mutabilis. Finalmente los fenogramas mostraron una relación con la ubicación geográfica, posiblemente debido al flujo génico in situ debido al intercambio o venta de semillas en ferias o mercados aledaños a la zona de colecta.

HIV-1 adaptation studies reveal a novel Env-mediated homeostasis mechanism for evading lethal hypermutation by APOBEC3G.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Terumasa Ikeda

2018-04-01

Full Text Available HIV-1 replication normally requires Vif-mediated neutralization of APOBEC3 antiviral enzymes. Viruses lacking Vif succumb to deamination-dependent and -independent restriction processes. Here, HIV-1 adaptation studies were leveraged to ask whether viruses with an irreparable vif deletion could develop resistance to restrictive levels of APOBEC3G. Several resistant viruses were recovered with multiple amino acid substitutions in Env, and these changes alone are sufficient to protect Vif-null viruses from APOBEC3G-dependent restriction in T cell lines. Env adaptations cause decreased fusogenicity, which results in higher levels of Gag-Pol packaging. Increased concentrations of packaged Pol in turn enable faster virus DNA replication and protection from APOBEC3G-mediated hypermutation of viral replication intermediates. Taken together, these studies reveal that a moderate decrease in one essential viral activity, namely Env-mediated fusogenicity, enables the virus to change other activities, here, Gag-Pol packaging during particle production, and thereby escape restriction by the antiviral factor APOBEC3G. We propose a new paradigm in which alterations in viral homeostasis, through compensatory small changes, constitute a general mechanism used by HIV-1 and other viral pathogens to escape innate antiviral responses and other inhibitions including antiviral drugs.

Biochem-Env, a platform of environmental biochemistry for research in ecology and ecotoxicology

OpenAIRE

Grondin, Virginie; Nelieu, Sylvie; Crouzet, Olivier; Hedde, Mickaël; Mougin, Christian

2016-01-01

The consortium AnaEE-France (http://www.anaee-s.fr) aims at understanding and predicting the biodiversity and ecosystems dynamics in a context of global change. It will allow improving the understanding of biotic processes/environment interactions, mobilizing experimental and modelling platforms devoted to the biology of continental ecosystems, both terrestrial and aquatic. In this context, the objectives of the platform Biochem-Env (http://www.biochemenv.fr) are to provide skills and innovat...

Acceso a recursos genéticos y distribución de beneficios en Colombia: desafíos del régimen normativo

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Luciana Carla Silvestri

2016-06-01

Full Text Available La investigación analiza los retos que presenta el régimen colombiano sobre acceso a recursos genéticos y distribución de beneficios mediante la utilización del método jurídico, con un enfoque descriptivo, comparativo y propositivo. El mecanismo de acceso y distribución de beneficios pretende desacelerar la pérdida de diversidad genética, entre otros fines. El marco legal se encuentra incompleto y no sistematizado. Asimismo, el procedimiento de acceso a recursos genéticos surge burocrático e ineficiente y obstaculiza así la investigación de la biodiversidad del país. Afortunadamente, la reciente simplificación del procedimiento para investigar recursos genéticos con fines no comerciales podría ayudar a resolver el mencionado problema para este tipo de proyectos. Además, la consulta previa articulada para el acceso a recursos genéticos ubicados en territorios de las comunidades indígenas y negras no garantiza la efectiva participación de aquellas. Por último, las medidas de cumplimiento establecidas, que circunscriben el control al acatamiento de la legislación colombiana y la de los países andinos, no satisfacen las disposiciones del Protocolo de Nagoya al respecto.

Prevalencia de bacterias Gram negativas portadoras del gen blaKPC en hospitales de Colombia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Robinson Pacheco

2014-04-01

Full Text Available Introducción. Las enzimas carbapenemasas de tipo KPC tienen gran capacidad de diseminación, son causantes de epidemias y se asocian a mayor mortalidad y estancia hospitalaria. En Colombia se han venido reportando cada vez más desde 2007, pero se desconoce la prevalencia hospitalaria. Objetivo. Estimar la prevalencia hospitalaria del gen blaKPC. Materiales y métodos. Se evaluó la presencia del gen blaKPC y su ‘clonalidad’ en aislamientos de enterobacterias y Pseudomonas aeruginosa de pacientes hospitalizados. Resultados. De los 424 aislamientos evaluados durante el periodo de estudio, 273 cumplieron con criterios de elegibilidad, 31,1 % fue positivo para el gen blaKPC y, al ajustar por ‘clonalidad’, la positividad fue de 12,8 %. El gen blaKPC se encontró con mayor frecuencia en Klebsiella pneumoniae seguido de P. aeruginosa y otras enterobacterias. A pesar de que la unidad de cuidados intensivos aportó el mayor número de aislamientos, no se encontró un patrón más prevalente del gen blaKPC en las ellas que en las otras salas. El aparato respiratorio fue el sitio anatómico de origen con la mayor prevalencia. No se presentó estacionalidad en la frecuencia de los aislamientos portadores del gen blaKPC. Conclusión. Este estudio reveló la alta prevalencia del gen blaKPC en diferentes microorganismos aislados en varias instituciones hospitalarias del país. La extraordinaria capacidad de propagación del gen blaKPC, las dificultades del diagnóstico y la limitada disponibilidad de antibióticos plantean la apremiante necesidad de fortalecer los sistemas de vigilancia epidemiológica y ajustar oportunamente las políticas institucionales de uso racional de antibióticos con el fin de contener su diseminación a otras instituciones de salud del país.

Gag- and env-specific serum antibodies in cats after natural and experimental infection with feline immunodeficiency virus.

NARCIS (Netherlands)

G.F. Rimmelzwaan (Guus); C.H.J. Siebelink (Kees); H. Broos; G.A. Drost; K. Weijer (Kees); R. van Herwijnen (Rob); A.D.M.E. Osterhaus (Albert)

1994-01-01

textabstractIn order to monitor the antibody response to feline immunodeficiency virus (FIV) in cats, following experimental and natural infection, enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs) were developed using recombinant env and gag proteins and p24-specific monoclonal antibodies. It was shown

Búsqueda de selección en el polimorfismo 677C>T (c.665C>T) del gen de la metilentetrahidrofolato reductasa (MTHFR) en una población Colombiana

OpenAIRE

Riaño Moreno, Julián Camilo

2014-01-01

Se realizó un estudio genético – poblacional en dos grupos etarios de población colombiana con la finalidad de evaluar las diferencias genéticas relacionadas con el polimorfismo MTHFR 677CT en busca de eventos genéticos que soporten la persistencia de este polimorfismo en la especie humana debido que este ha sido asociado con múltiples enfermedades. De esta manera se genotipificaron los individuos, se analizaron los genotipos, frecuencias alélicas y se realizaron diferentes pruebas genéticas...

Recuento histórico de la Bioética en la Genética Médica

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Rosa María González Salvat

2002-10-01

Full Text Available El trabajo presentado se enmarca en el campo de la bioética dentro de la Genética Médica. Se realiza una revisión de su desarrollo histórico relacionándolo con el surgimiento del asesoramiento genético y su aplicación en los diferentes niveles de atención al paciente.The present paper is within the field of bioethics corresponding to Medical Genetics. A review of its historical development is made, relating it to the appearance of the genetic counselling and to its application at the different health care levels.

Respuesta del Tumor Venéreo Transmisible Canino a Presentaciones de Vincristina de Patente y Genérica

OpenAIRE

Susana Miguel De la Cruz

2015-01-01

El objetivo del presente estudio fue comparar la respuesta de perros infectados naturalmente con el Tumor Venéreo Transmisible (TVTc) al tratamiento con vincristina comercial de patente y genérica. Se trabajó con 12 perros infectados naturalmente y con diagnóstico por citología y PCR. Los perros fueron asignados aleatoriamente a un tratamiento semanal con 0.025 mg/kg de vincristina de patente comercial o de tipo genérico, hasta que dos citologías consecutivas resultaran negativas. Se hicieron...

Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of the rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17 complexed with an immunodominant SIVmac239 Env epitope

International Nuclear Information System (INIS)

Gao, Feng; Bao, Jinku

2013-01-01

A primitive monoclinic crystal of the rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17 complexed with an SIVmac239 Env peptide was obtained and belonged to space group P2, with unit-cell parameters a = 68.3, b = 45.0, c = 81.5 Å, β = 96.5°. The crystal diffracted to 2.55 Å resolution. Long-term nonprogression during simian immunodeficiency virus (SIV) infection has been strongly associated with the major histocompatibility complex (MHC) class I allele Mamu-B*17. Here, a complex of rhesus macaque Mamu-B*17 with rhesus macaque β 2 -microglobulin (β 2 m) and an immunodominant peptide (SIVmac239 Env241–251; LRCNDTNYSGF; Env LF11) derived from the SIV Env protein was crystallized by the hanging-drop method using PEG 3350 as a precipitating agent. The crystals belonged to the primitive monoclinic space group P2, with unit-cell parameters a = 68.3, b = 45.0, c = 81.5 Å, β = 96.5°. Assuming the presence of one molecule in the asymmetric unit, the Matthews coefficient and solvent content were calculated to be 2.96 Å 3 Da −1 and 58.5%, respectively

Genética, performance física humana e doping genético: o senso comum versus a realidade científica

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Rodrigo Gonçalves Dias

2011-02-01

Full Text Available Atletas de elite são reconhecidos como fenômenos esportivos e o potencial para atingir níveis superiores de performance no esporte está parcialmente sob o controle de genes. A excelência atlética é essencialmente multifatorial e determinada por complexas interações entre fatores ambientais e genéticos. Existem aproximadamente 10 milhões de variantes genéticas dispersas por todo o genoma humano e uma parcela destas variantes têm demonstrado influenciar a responsividade ao treinamento físico. Os fenótipos de performance física humana parecem ser altamente poligênicos e alguns estudos têm comprovado a existência de raras combinações genotípicas em atletas. No entanto, os mecanismos pelos quais genes se interagem para amplificar a performance física são desconhecidos. O conhecimento sobre os genes que influenciam a treinabilidade somado ao potencial uso indevido dos avanços da terapia gênica, como a possível introdução de genes em células de atletas, fez surgir o termo doping genético, um novo e censurado método de amplificação da performance física, além dos limites fisiológicos. Aumentos na hipertrofia muscular esquelética e nos níveis de hematócrito estão sendo conseguidos através da manipulação da expressão de genes específicos, mas a grande parte das impressionáveis alterações foi obtida em experimentação com animais de laboratório. A compreensão dos resultados científicos envolvendo genética, performance física humana e doping genético é uma difícil tarefa. Com o propósito de evitar a contínua má interpretação e propagação de conceitos errôneos, esta revisão, intencionalmente, vem discutir as evidências científicas produzidas até o momento sobre o tema, permitindo a compreensão do atual "estado da arte"

GenLab, Laboratorio Virtual de Genética

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Fidel Ramírez

2000-07-01

Full Text Available GenLab es el nombre que tiene el software diseñado por nosotros, en el cual se modela el proceso meiótico y la fecundación en organismos diploides. El objetivo de esta aplicación es ilustrar el resultado de un cruce determinado, tratando de ser lo más ajustados a la realidad. La modelación de la reproducción sexual se realiza internamente y el GenLab se limita a presentar los resultados según el número de descendencia seleccionado para un cruce específico, esto significa que se puede escoger una gran cantidad de características para los parentales y se puede estudiar la frecuencia de estos en la descendencia. El modelo cuenta con base de datos donde están almacenados algunos de los locus de Drosophila melanogaster junto con su ubicación en centimorgans 1. EI propósito de este modelo es servir como herramienta pedagógica  y didáctica tanto en universidades como en colegios, facilitando el aprendizaje de algunos principios básicos de la genética, por lo cual puede ser usado si se cuenta con una conexión a Internet y un navegador visitando http://biologia.unal.edu.co/fidel.

Feocromocitoma-paraganglioma: del diagnóstico bioquímico al genético

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Marta Cano Megías

2016-09-01

Full Text Available Los feocromocitomas y paragangliomas son tumores derivados de células de la cresta neural, que pueden ser diagnosticados mediante la determinación bioquímica de metanefrinas y metoxitiramina. Los avances en la investigación genética han permitido identificar múltiples genes implicados en la fisiopatogenia de estos tumores, de forma que hasta el 35-45% podrían tener una mutación germinal subyacente. Estos genes tienen una firma biológica de transcripción característica y se pueden agrupar en 2 grandes grupos (o clusters, el grupo 1 (VHL y SHDx, con implicación de la vía de la angiogénesis e hipoxia; y el grupo 2 (MEN2 y NF1, implicados en la vía de señalización de la cinasa. A su vez estos genes se asocian a un fenotipo bioquímico (adrenérgicos y noradrenérgicos, y presentación clínica (localización, comportamiento biológico, edad de presentación… característicos en un número elevado de casos. Un diagnóstico precoz de estos tumores, acompañado de un correcto diagnóstico genético, debe ser una prioridad que permita un mejor tratamiento, la detección precoz de complicaciones, un correcto screening de familiares y de otros tumores relacionados, así como una mejoría en el pronóstico global de estos pacientes.

Gp120 stability on HIV-1 virions and Gag-Env pseudovirions is enhanced by an uncleaved Gag core

International Nuclear Information System (INIS)

Hammonds, Jason; Chen Xuemin; Ding Lingmei; Fouts, Timothy; De Vico, Anthony; Megede, Jan zur; Barnett, Susan; Spearman, Paul

2003-01-01

Human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) particles incorporate a trimeric envelope complex (Env) made of gp120 (SU) and gp41 (TM) heterodimers. It has been previously established that soluble CD4 (sCD4) interaction leads to shedding of gp120 from viral particles, and that gp120 may also be easily lost from virions during incubation or particle purification procedures. In the design of HIV particle or pseudovirion-based HIV vaccines, it may be important to develop strategies to maximize the gp120 content of particles. We analyzed the gp120 retention of HIV-1 laboratory-adapted isolates and primary isolates following incubation with sCD4 and variations in temperature. NL4-3 shed gp120 readily in a temperature- and sCD4-dependent manner. Surprisingly, inactivation of the viral protease led to markedly reduced shedding of gp120. Gp120 shedding was shown to vary markedly between HIV-1 strains, and was not strictly determined by whether the isolate was adapted to growth on immortalized T cell lines or was a primary isolate. Pseudovirions produced by expression of codon-optimized gag and env genes also demonstrated enhanced gp120 retention when an immature core structure was maintained. Pseudovirions of optimal stability were produced through a combination of an immature Gag protein core and a primary isolate Env. These results support the feasibility of utilizing pseudovirion particles as immunogens for the induction of humoral responses directed against native envelope structures

Seleção de genótipos parentais de acerola com base na divergência genética multivariada

Directory of Open Access Journals (Sweden)

CARPENTIERI-PÍPOLO VALÉRIA

2000-01-01

Full Text Available Este trabalho teve por objetivo identificar e selecionar genótipos parentais de acerola (Malpighia emarginata L. adequadas a programas de melhoramento genético. Nove caracteres quantitativos de maior importância agronômica foram usados para determinação da distância genética e formação de grupos similares de acessos. O agrupamento pelo método de Tocher, a partir das distâncias generalizadas de Mahalanobis, possibilitou a divisão de 14 genótipos em três grupos. Com base na divergência genética e no caráter agronômico-chave (teor de vitamina C, destacaram-se como mais promissores os cruzamentos dos genótipos: AM Mole pertencente ao grupo III, com os genótipos PR AM, N° 18, PR 17, PR 16, Eclipse, AM 22 e Dominga, todos pertencentes ao grupo I.

The streptomycin-treated mouse intestine selects Escherichia coli envZ missense mutants that interact with dense and diverse intestinal microbiota.

Science.gov (United States)

Leatham-Jensen, Mary P; Frimodt-Møller, Jakob; Adediran, Jimmy; Mokszycki, Matthew E; Banner, Megan E; Caughron, Joyce E; Krogfelt, Karen A; Conway, Tyrrell; Cohen, Paul S

2012-05-01

Previously, we reported that the streptomycin-treated mouse intestine selected nonmotile Escherichia coli MG1655 flhDC deletion mutants of E. coli MG1655 with improved colonizing ability that grow 15% faster in vitro in mouse cecal mucus and 15 to 30% faster on sugars present in mucus (M. P. Leatham et al., Infect. Immun. 73:8039-8049, 2005). Here, we report that the 10 to 20% remaining motile E. coli MG1655 are envZ missense mutants that are also better colonizers of the mouse intestine than E. coli MG1655. One of the flhDC mutants, E. coli MG1655 ΔflhD, and one of the envZ missense mutants, E. coli MG1655 mot-1, were studied further. E. coli MG1655 mot-1 is more resistant to bile salts and colicin V than E. coli MG1655 ΔflhD and grows ca. 15% slower in vitro in mouse cecal mucus and on several sugars present in mucus compared to E. coli MG1655 ΔflhD but grows 30% faster on galactose. Moreover, E. coli MG1655 mot-1 and E. coli MG1655 ΔflhD appear to colonize equally well in one intestinal niche, but E. coli MG1655 mot-1 appears to use galactose to colonize a second, smaller intestinal niche either not colonized or colonized poorly by E. coli MG1655 ΔflhD. Evidence is also presented that E. coli MG1655 is a minority member of mixed bacterial biofilms in the mucus layer of the streptomycin-treated mouse intestine. We offer a hypothesis, which we call the "Restaurant" hypothesis, that explains how nutrient acquisition in different biofilms comprised of different anaerobes can account for our results.

cGAS-Mediated Innate Immunity Spreads Intercellularly through HIV-1 Env-Induced Membrane Fusion Sites.

Science.gov (United States)

Xu, Shuting; Ducroux, Aurélie; Ponnurangam, Aparna; Vieyres, Gabrielle; Franz, Sergej; Müsken, Mathias; Zillinger, Thomas; Malassa, Angelina; Ewald, Ellen; Hornung, Veit; Barchet, Winfried; Häussler, Susanne; Pietschmann, Thomas; Goffinet, Christine

2016-10-12

Upon sensing cytoplasmic retroviral DNA in infected cells, cyclic GMP-AMP (cGAMP) synthase (cGAS) produces the cyclic dinucleotide cGAMP, which activates STING to trigger a type I interferon (IFN) response. We find that membrane fusion-inducing contact between donor cells expressing the HIV envelope (Env) and primary macrophages endogenously expressing the HIV receptor CD4 and coreceptor enable intercellular transfer of cGAMP. This cGAMP exchange results in STING-dependent antiviral IFN responses in target macrophages and protection from HIV infection. Furthermore, under conditions allowing cell-to-cell transmission of HIV-1, infected primary T cells, but not cell-free virions, deliver cGAMP to autologous macrophages through HIV-1 Env and CD4/coreceptor-mediated membrane fusion sites and induce a STING-dependent, but cGAS-independent, IFN response in target cells. Collectively, these findings identify an infection-specific mode of horizontal transfer of cGAMP between primary immune cells that may boost antiviral responses, particularly in infected tissues in which cell-to-cell transmission of virions exceeds cell-free infection. Copyright © 2016 Elsevier Inc. All rights reserved.

Fixations of the HIV-1 env gene refute neutralism: New evidence for pan-selective evolution

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Carlos Y Valenzuela

2010-01-01

Full Text Available We examined 103 nucleotide sequences of the HIV-1 env gene, sampled from 35 countries and tested: I the random (neutral distribution of the number of nucleotide changes; II the proportion of bases at molecular equilibrium; III the neutral expected homogeneity of the distribution of new fxated bases; IV the hypothesis of the neighbor infuence on the mutation rates in a site. The expected random number of fxations per site was estimated by Bose-Einstein statistics, and the expected frequencies of bases by matrices of mutation-fxation rates. The homogeneity of new fxations was analyzed using χ2 and trinomial tests for homogeneity. Fixations of the central base in trinucleotides were used to test the neighbor infuence on base substitutions. Neither the number of fxations nor the frequencies of bases ftted the expected neutral distribution. There was a highly signifcant heterogeneity in the distribution of new fxations, and several sites showed more transversions than transitions, showing that each nucleotide site has its own pattern of change. These three independent results make the neutral theory, the nearly neutral and the neighbor infuence hypotheses untenable and indicate that evolution of env is rather highly selective.

Generación de un modelo knock-out del gen SCN1A en Drosophila melanogaster para el estudio del síndrome de Dravet.

OpenAIRE

PLANELLS CÁRCEL, ANDRÉS

2017-01-01

[ES] El Síndrome de Dravet (SD) es una enfermedad rara infantil que se manifiesta en crisis epilépticas a temprana edad y provoca un deterioro cognitivo y conductual. Esta enfermedad es causada por mutaciones dominantes en el gen SCN1A. Este trabajo se centra en la generación de un modelo knock-out (KO) del gen paralytic en Drosophila melanogaster, homólogo al gen SCN1A en humanos, para su aplicación en el estudio del SD. A la vez se ha estudiado la conducta de cepas sensibles ...

Humoral immunity response to human endogenous retroviruses K/W differentiates between amyotrophic lateral sclerosis and other neurological diseases.

Science.gov (United States)

Arru, G; Mameli, G; Deiana, G A; Rassu, A L; Piredda, R; Sechi, E; Caggiu, E; Bo, M; Nako, E; Urso, D; Mariotto, S; Ferrari, S; Zanusso, G; Monaco, S; Sechi, G; Sechi, L A

2018-03-31

Human endogenous retroviruses (HERV) K/W seem to play a role in fostering and exacerbation of some neurological diseases, including amyotrophic lateral sclerosis (ALS). Given these findings, the immunity response against HERV-K and HERV-W envelope surface (env-su) glycoprotein antigens in serum and cerebrospinal fluid (CSF) was investigated for ALS, multiple sclerosis (MS) and Alzheimer's disease patients and in healthy controls. Four antigenic peptides derived respectively from HERV-K and HERV-W env-su proteins were studied in 21 definite or probable ALS patients, 26 possible or definite relapsing-remitting MS patients, 18 patients with Alzheimer's disease and 39 healthy controls. An indirect enzyme-linked immunosorbent assay was set up to detect specific antibodies (Abs) against env-su peptides. Amongst the measured levels of Abs against the four different HERV-K peptide fragments, only HERV-K env-su 19-37 was significantly elevated in ALS compared to other groups, both in serum and CSF. Instead, amongst the Abs levels directed against the four different HERV-W peptide fragments, only HERV-W env-su 93-108 and HERV-W env-su 248-262 were significantly elevated, in the serum and CSF of the MS group compared to other groups. In ALS patients, the HERV-K env-su 19-37 Abs levels were significantly correlated with clinical measures of disease severity, both in serum and CSF. Increased circulating levels of Abs directed against the HERV-W env-su 93-108 and HERV-W env-su 248-262 peptide fragments could serve as possible biomarkers in patients with MS. Similarly, increased circulating levels of Abs directed against the HERV-K env-su 19-37 peptide fragment could serve as a possible early novel biomarker in patients with ALS. © 2018 EAN.

Picarola margalefii, gen. et sp. nov., a new planktonic coccolithophore from NW Mediterranean waters

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Lluïsa Cros

2004-04-01

Full Text Available A coccolithophore which is referred to a new genus Picarola gen. nov. and described as a new species Picarola margalefii sp. nov., has been observed from the NW Mediterranean. The description of the new species is based on Scanning Electronic Microscopy (SEM observations. The coccoliths of Picarola margalefii sp. nov. are muroliths that have a narrow high rim and a central area with a cross and an elongate four-sided central process. Energy dispersive X-ray microanalyses confirmed their calcareous nature. The relation between the new genus and the genera Papposphaera Tangen, Vexillarius Jordan et Chamberlain, and Turrilithus Jordan et al., is discussed. The coccolithophore Picarola margalefii gen. et sp. nov., is dedicated to Dr. Ramon Margalef.

Diagnóstico prenatal de mosaicismo 45,X/46,XX con presencia del gen SRY. Presentación de un caso

OpenAIRE

Pedro Alí Díaz-Véliz Jiménez; María Antonia Ocaña Gil; Leydi María Sosa Águila; Belkis Vidal Hernández

2013-01-01

El cariotipo más frecuente del Síndrome de Turner es 45,X, aunque también puede presentarse como mosaico 45,X/46,XX. En el Centro Provincial de Genética Médica de Cienfuegos se le realizó la amniocentesis a una gestante de 42 años de edad, detectándose un mosaico de Síndrome de Turner (45,X/46,XX). Por ultrasonido se diagnosticó un varón, por lo que se envió una muestra de líquido amniótico al Centro Nacional de Genética Médica para corroborarlo y se indicó realizar estudio del gen SRY, cuyo ...

FutureGen Project Report

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Cabe, Jim; Elliott, Mike

2010-09-30

This report summarizes the comprehensive siting, permitting, engineering, design, and costing activities completed by the FutureGen Industrial Alliance, the Department of Energy, and associated supporting subcontractors to develop a first of a kind near zero emissions integrated gasification combined cycle power plant and carbon capture and storage project (IGCC-CCS). With the goal to design, build, and reliably operate the first IGCC-CCS facility, FutureGen would have been the lowest emitting pulverized coal power plant in the world, while providing a timely and relevant basis for coal combustion power plants deploying carbon capture in the future. The content of this report summarizes key findings and results of applicable project evaluations; modeling, design, and engineering assessments; cost estimate reports; and schedule and risk mitigation from initiation of the FutureGen project through final flow sheet analyses including capital and operating reports completed under DOE award DE-FE0000587. This project report necessarily builds upon previously completed siting, design, and development work executed under DOE award DE-FC26- 06NT4207 which included the siting process; environmental permitting, compliance, and mitigation under the National Environmental Policy Act; and development of conceptual and design basis documentation for the FutureGen plant. For completeness, the report includes as attachments the siting and design basis documents, as well as the source documentation for the following: • Site evaluation and selection process and environmental characterization • Underground Injection Control (UIC) Permit Application including well design and subsurface modeling • FutureGen IGCC-CCS Design Basis Document • Process evaluations and technology selection via Illinois Clean Coal Review Board Technical Report • Process flow diagrams and heat/material balance for slurry-fed gasifier configuration • Process flow diagrams and heat/material balance

Anemia Falciforme: Um Problema Nosso. Uma abordagem bioética sobre a nova genética

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Diniz Debora

2003-01-01

Full Text Available Este artigo analisa uma das ações educativas adotadas pelo Ministério da Saúde no campo das hemoglobinopatias: o folheto informativo Anemia Falciforme: Um Problema Nosso. O objetivo é discutir as premissas e os valores morais que se encontram associados a iniciativas no campo da educação genética, tendo as políticas públicas sobre anemia falciforme no Brasil como estudo de caso. A análise mostra que o conteúdo do folheto oscila entre políticas de prevenção para doenças e promoção de direitos fundamentais, uma característica da nova genética. Além disso, o excesso de informação biomédica especializada no folheto dificulta sua divulgação em massa. Os resultados encontrados foram discutidos à luz do debate bioético contemporâneo sobre a nova genética.

Aspectos genético-quantitativos da qualidade da carne em frangos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Gaya Leila de Genova

2006-01-01

Full Text Available O estudo dos parâmetros genéticos das características de qualidade de carne de aves permite à industria avícola se adequar às exigências da indústria processadora, aumentando sua eficiência, e melhorando a aceitação da carne de frango pelo mercado consumidor. Além disso, por meio do estudo destes parâmetros, valiosas informações sobre a caracterização do fenômeno denominado PSE, que representa a carne pálida, flácida e exsudativa, podem ser obtidas, uma vez que são escassos os estudos a esse respeito em frangos. O conhecimento do comportamento genético e da relação entre os atributos da carne e outras características de interesse em frangos de corte pode favorecer o estabelecimento mais preciso e adequado das estratégias utilizadas nos programas de seleção.

Riesgos sobre la salud de los alimentos modificados genéticamente: una revision bibliografica

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Roig José L. Domingo

2000-01-01

Full Text Available A lo largo de 1999, se ha venido intensificando el debate sobre la seguridad de los alimentos modificados genéticamente, una importante y compleja área de investigación científica, la cual demanda unos estándares rigurosos. Diversos grupos, incluyendo asociaciones de consumidores y Organizaciones no Gubernamentales (ONGs han sugerido que todos los alimentos modificados genéticamente deberían ser sometidos a estudios a largo plazo con animales antes de su aprobación para el consumo humano. El principal objetivo de la presente revisión ha sido conocer cual es el estado actual de la cuestión en lo referente a los potenciales efectos adversos sobre la salud de los alimentos modificados genéticamente. Dos bases de datos, Medline y Toxline, así como una serie de direcciones de internet, han sido empleadas para la obtención de bibliografía. Aunque son numerosos los comentarios, noticias generales y cartas al Editor aparecidos en prestigiosas revistas, los artículos referentes a estudios experimentales sobre la seguridad de los alimentos modificados genéticamente son, sorprendentemente, muy escasos. Si se han obtenido resultados procedentes de la evaluación toxicológica de estos alimentos, no han sido publicados en revistas científicas y, por lo tanto, no han podido ser debidamente juzgados o contrastados.

Epidemiología genética de la artritis reumatoide: ¿qué esperar de América Latina?

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Angélica María Delgado-Vega

2006-12-01

Full Text Available La artritis reumatoide es una enfermedad sistémica autoinmune, crónica, que afecta principalmente las articulaciones que tienen movimiento. La enfermedad es mucho más frecuente en mujeres y su prevalencia en la población latinoamericana es cercana al 0,5%. La existencia de agregación familiar (ls= 2-17 indica su carácter hereditario. Sin embargo, la herencia de la artritis reumatoide es poligénica y no sigue un patrón mendeliano. La importancia de encontrar factores genéticos asociados con la artritis reumatoide radica en la contribución a la comprensión de los mecanismos patogénicos de la enfermedad, su posible aplicación clínica como marcadores de riesgo, diagnóstico, pronóstico, e incluso, blanco terapéutico. Mapeos genéticos llevados a cabo en diversas poblaciones en busca de loci y genes candidatos han identificado la región HLA como aquella con mayor evidencia de ligamento. Sin embargo, su fracción etiológica corresponde sólo a un tercio de la susceptibilidad genética de la enfermedad. Esto indica que genes diferentes al HLA también están implicados en la susceptibilidad a desarrollar artritis reumatoide. En Latinoamérica, los alelos HLA-RB1*0404 y TNF -308A han sido asociados de manera uniforme con la artritis reumatoide. En el presente artículo se revisan los factores genéticos de la artritis reumatoide en el marco de una aproximación lógica y ordenada establecida por la epidemiología genética, y se ofrecen algunas recomendaciones para futuros estudios en poblaciones latinoamericanas.

Distribución de tres polimorfismos del gen TSLP en población afrodescendiente de San Basilio de Palenque, Colombia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Luis Fang

2013-06-01

Full Text Available Introducción. La linfopoyetina tímica del estroma (Thymic Stromal Lymphopoietin, TSLP se ha vinculado como un gen de propensión al desarrollo de enfermedades alérgicas. Se sabe que la población de Cartagena es una mezcla triétnica, en la cual el componente de herencia africana se asoció con el riesgo de asma y altos niveles séricos de IgE total. Este componente provino de esclavos africanos que lograron organizarse en “palenques”, uno de ellos es San Basilio de Palenque, en la Costa Caribe colombiana. Objetivo. Determinar la distribución de los polimorfismos de nucleótido simple (Single Nucleotide Polymorphism, SNP rs1837253, rs17551370 y rs2289276 del gen TSLP en individuos afrodescendientes de San Basilio de Palenque. Materiales y métodos. Mediante PCR en tiempo real y sondas TaqMan SNP Genotyping™ segenotipificaron estos SNP en 80 individuos afrodescendientes entre los 5 y 18 años de edad. Resultados. El alelo de menor frecuencia para el polimorfismo rs1837253 fue el alelo T (41,9 %, para el rs17551370, el alelo A (14,3 %, y para el rs2289276, el alelo T (22,5 %. La distribución de los polimorfismos rs17551370 y rs2289276 se mantuvo en equilibrio genético de Hardy-Weinberg. Las frecuencias alélicas de cada SNP no mostraron diferencias significativas con las reportadas para poblaciones africanas. Conclusiones. Los tres polimorfismos analizados en el gen TSLP estuvieron presentes en la muestra de población de San Basilio de Palenque y su distribución es similar a la reportada para poblaciones africanas y para poblaciones americanas de ancestro africano. doi: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v33i2.655

Intragenic HIV-1 env sequences that enhance gag expression

International Nuclear Information System (INIS)

Suptawiwat, Ornpreya; Sutthent, Ruengpung; Lee, T.-H.; Auewarakul, Prasert

2003-01-01

Expression of HIV-1 genes is regulated at multiple levels including the complex RNA splicing and transport mechanisms. Multiple cis-acting elements involved in these regulations have been previously identified in various regions of HIV-1 genome. Here we show that another cis-acting element was present in HIV-1 env region. This element enhanced the expression of Gag when inserted together with Rev response element (RRE) into a truncated HIV-1 genome in the presence of Rev. The enhancing activity was mapped to a 263-bp fragment in the gp41 region downstream to RRE. RNA analysis showed that it might function by promoting RNA stability and Rev-dependent RNA export. The enhancement was specific to Rev-dependent expression, since it did not enhance Gag expression driven by Sam68, a cellular protein that has been shown to be able to substitute for Rev in RNA export function

Loci asociados con enfermedades genéticas y calidad de carne en bovinos Charolais Mexicanos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Ana María Sifuentes Rincón

2015-01-01

Full Text Available Se determinaron las frecuencias alélicas y genotípicas de ocho marcadores localizados en los genes calpaína (CAPN, 4 751 y 316, calpastatina (CASTT1 y tiroglobulina (TG5, asociados a calidad de carne, y en los genes, m iost atina (MSTN, Q204X, arginino succinato sintasa (ASS, monofosfato sintasa (UMPS y miofosforilasa (PYGM, asocia dos a enfermedade s genéticas de ganado bovino. Se muestrearon 493 animales Charolais de registro de dos hatos ubicado s en Sonora (n=157 y tres en Nuevo León (n=336. No se encontraron portadores de los alelos T-ASS y T-UM PS, pero sí portadores del alelo Q204X del gen MSTN en frecuencias de  1 % en las poblaciones de Sonora y de 8.6 a 14.4 % en las de Nuevo León. Además, se identificaron portadores del marcador del gen PYGM, en frecuencias del 6.5 y de 1.0 % para un hato de Sonora y otro de Nuevo León, respectivamente. El análisis de diferenciación génica p areado entre las poblaciones y con los cuatro loci mostró que hay diferencias altamente significativas dentro de pobl aciones del noroeste ( P <0.0001 y entre éstas y las del noreste ( P <0.001, la cual es explicada principalmente por los loci CAPN-316 y TG5. De acuerdo a los resultados obtenidos se recomienda el monitoreo del marcador del gen PYGM y del ale lo Q204X del gen MSTN, así como también implementar estrategias para confirmar la utilidad de los marcadores asociado s a calidad y productividad como herramienta para complementar los progra mas de mejoramiento genético.

Polimorfismo Val108/158Met en el gen dopaminérgico catecol-o-metil transferasa (COMT en una población mixta peruana y su importancia para los estudios neuropsiquiátricos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Doris Huerta

2007-12-01

Full Text Available Introducción: El gen dopaminérgico catecol-o-metil transferasa (COMT, tiene un polimorfismo funcional Val108/158Met que da lugar a variantes de la enzima que cataliza la o-metilación de las catecolaminas activas, participando en el metabolismo de las drogas y neurotransmisores, como la L-dopa, norepinefrina, epinefrina y dopamina y, por consiguiente, puede asociarse a condiciones neuropsiquiátricas. Objetivos: Determinar las frecuencias genotípicas y alélicas del polimorfismo Val108/158Met del gen COMT en sujetos saludables de una población mixta peruana y establecer las implicancias para el estudio genético de enfermedades y otras condiciones neuropsiquiátricas. Diseño: Estudio descriptivo, observacional, transversal. Lugar: Centro de Investigación de Bioquímica y Nutrición ‘Alberto Guzmán Barrón’. Facultad de Medicina, Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Participantes: Ciento seis personas, hombres y mujeres, clínicamente saludables, sin enfermedades neurológicas ni mentales u otra patología similar, voluntarios con consentimiento informado, sin relación de parentesco, todos residentes en Lima, cuyas edades fluctuaban entre los 18 y 50 años. Intervenciones: Extracción del ADN genómico a partir de células de epitelio bucal, según metodología estándar. Amplificación mediante la PCR con primers específicos y digestión con la enzima de restricción NlaIII. Detección de fragmentos de restricción de longitud polimórfica (RFLP por electroforesis en gel de poliacrilamida al 6%, teñido con nitrato de plata. Principales medidas de resultados: Frecuencias genotípicas y alélicas del gen COMT en población mixta peruana. Resultados: Se encontró las frecuencias genotípicas Met/Met=0,0661, Val/Met=0,5094 y Val/Val=0,4245, siendo la distribución consistente con el equilibrio de Hardy-Weinberg (X² =3,0317, g.l.=1, p >0,05. Las frecuencias alélicas encontradas fueron alelo Val=0,68 y el alelo Met=0

¿Al final, TLC con o sin biopiratería?

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Martha Isabel Gómez Lee

2006-01-01

Full Text Available El problema está en que en Colombia los temas de acceso a los recursos genéticos, los derechos de propiedad intelectual (DPI y la protección del conocimiento tradicional (CT no han recibido la importancia que se merecen. No ha habido un debate abierto acerca del papel que juegan estos temas en el desarrollo de un país megadiverso y una nación multiétnica y pluricultural, como es Colombia. Sin embargo, el gobierno colombiano decidió negociar un TLC indefinido que define la política comercial al respecto para Colombia. En febrero de 2006, se cerraron las negociaciones del TLC en términos similares a Perú. Ese país aceptó las patentes de genes aislados y de plantas conforme a los intereses de Estados Unidos. Colombia tiene cuatro grupos étnicos: 84 pueblos indígenas que hablan 64 lenguas, los afrocolombianos, los raizales del Archipiélago de San Andrés y Providencia y los rom. La constitución de 1991 garantiza y protege los recursos genéticos, la diversidad étnica y cultural y los derechos humanos. Las posiciones y propuestas oficiales sobre acceso a recursos genéticos, biodiversidad y protección del CT que presentó el gobierno colombiano en el TLC, no fueron concertadas previamente con los grupos étnicos colombianos. El Estado tiene que consultarlos, para determinar su posición respecto al acceso a los recursos genéticos, la protección al CT y los DPI

Pré-melhoramento do camucamuzeiro: estudo de parâmetros genéticos e dissimilaridade

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Walnice Maria Oliveira do Nascimento

2014-08-01

Full Text Available O camucamuzeiro pertence à família Myrtaceae e é espécie em processo de domesticação, encontrada na forma extrativa, a partir de plantas crescendo naturalmente nas margens dos rios e lagos, ou cultivadas em pequenas áreas de terra firme. As estimativas e a compreensão dos parâmetros genéticos desta espécie são importantes para o conhecimento da estrutura genética das populações e para a inferência da diversidade genética presente, além de proporcionar subsídios para predizer os ganhos genéticos e o possível sucesso no programa de melhoramento dessa cultura. Neste sentido, o objetivo deste trabalho foi estimar parâmetros genéticos e a dissimilaridade genética, em acessos existentes no Banco Ativo de Germoplasma de camucamuzeiro, da Embrapa Amazônia Oriental. Para o estudo, foram analisados 46 progênies, colhidos 40 frutos por planta matriz em completo estádio de maturação (frutos com epicarpo totalmente roxo, sendo avaliados sete caracteres morfoagronômicos: peso de fruto (g, PFR, comprimento de fruto (cm, CFR, diâmetro de fruto (cm, DFR, peso da casca (g, PCS, espessura da casca (cm, ECS, número de sementes (n, NSE, peso de sementes (g, PSE. Por meio do Programa Genes, estimaram-se os componentes de variância, herdabilidade e a variabilidade. A importância relativa de caracteres e dissimilaridades entre as progênies, bem como as correlações genéticas entres os caracteres avaliados também foram estudadas. Verificou-se que há dissimilaridade entre os acessos do BAG de camucamuzeiro e que, por causa das correlações significativas entre as variáveis, podem-se adotar métodos de seleção indireta como ferramenta auxiliar no processo de domesticação e melhoramento desta espécie.

Position-specific automated processing of V3 env ultra-deep pyrosequencing data for predicting HIV-1 tropism.

Science.gov (United States)

Jeanne, Nicolas; Saliou, Adrien; Carcenac, Romain; Lefebvre, Caroline; Dubois, Martine; Cazabat, Michelle; Nicot, Florence; Loiseau, Claire; Raymond, Stéphanie; Izopet, Jacques; Delobel, Pierre

2015-11-20

HIV-1 coreceptor usage must be accurately determined before starting CCR5 antagonist-based treatment as the presence of undetected minor CXCR4-using variants can cause subsequent virological failure. Ultra-deep pyrosequencing of HIV-1 V3 env allows to detect low levels of CXCR4-using variants that current genotypic approaches miss. However, the computation of the mass of sequence data and the need to identify true minor variants while excluding artifactual sequences generated during amplification and ultra-deep pyrosequencing is rate-limiting. Arbitrary fixed cut-offs below which minor variants are discarded are currently used but the errors generated during ultra-deep pyrosequencing are sequence-dependant rather than random. We have developed an automated processing of HIV-1 V3 env ultra-deep pyrosequencing data that uses biological filters to discard artifactual or non-functional V3 sequences followed by statistical filters to determine position-specific sensitivity thresholds, rather than arbitrary fixed cut-offs. It allows to retain authentic sequences with point mutations at V3 positions of interest and discard artifactual ones with accurate sensitivity thresholds.

Desafios futuros: de uma análise da genética e biotecnologia na imprensa portuguesa durante o biénio 1994/5 para novas tecnologias nas sociedades actuais

OpenAIRE

Lima,Maria Alexandra V. Abreu

2006-01-01

Este estudo analisa na imprensa Portuguesa a frequência e o conteúdo de notícias sobre genoma, genética e biotecnologia sobretudo nos domínios agrícola e da medicina/saúde humana. Discutem-se os resultados com base em estudos sobre genética e biotecnologia na imprensa Internacional, Brasileira e Portuguesa (Gutteling et al., 2002; Tognolli, 2003; Garcia, 2004) e aspectos da opinião pública e amplificação social do risco (Frewer et al. 2002), tirando-se conclusões sobre desafios com interesse ...

Variabilidad genética del robalo común Centropomus undecimalis (Perciformes: Centropomidae en ambiente marino y ribereño interconectados

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Ulises Hernández-Vidal

2014-08-01

Full Text Available El robalo común Centropomus undecimalis habita en áreas ribereñas y marinas del sur del Golfo de México donde es sujeto a explotación intensiva. Aunque la identificación de las poblaciones de peces representa una valiosa herramienta para el manejo de las poblaciones silvestres, no hay información disponible para identificar genéticamente las poblaciones de peces de esta especie en la región. El objetivo de este estudio fue determinar la relación genética entre C. undecimalis capturado en ambiente marino y dulceacuícola del Golfo de México y río San Pedro. Muestras de tejido muscular de 79 individuos fueron obtenidas en áreas separadas por más de 300km. El genotipo de cada individuo fue determinado usando siete pares de cebadores microsatélites. Cinco cebadores amplificaron eficientemente presentando entre seis y 28 alelos por locus. Altos niveles de heterocigosidad se observaron en las muestras de ambos ambientes. Se observó desviación del equilibrio HW debido a exceso de heterocigotos. Los valores de diferenciación genética indican ausencia de estructuración poblacional F ST (0.0075 y R ST (0.016, p=0.051 y similitud en las frecuencias alélicas definidas por el índice de Nei (0.805. Los datos mostraron elevado flujo genético debido al número de migrantes (Nm=18.7. Estos resultados sugieren que los individuos en estos ambientes provienen de la misma población genética. La información obtenida en este estudio, por lo tanto contribuirá con elementos que pueden ser considerados en el desarrollo de programas de manejo y protección de las poblaciones de peces silvestres.

Kontrolle der Expression des UNUSUAL FLORAL ORGANS (UFO) Gens in Arabidopsis thaliana

OpenAIRE

Hobe, Martin

2004-01-01

Die vorliegende Arbeit befaßt sich mit der Kontrolle des Expressionsmusters des UNUSUAL FLORAL ORGANS (UFO) Gens von Arabidopsis thaliana. UFO wird im Sproß- und Blütenmeristemen aller Entwicklungsstadien der Pflanze exprimiert. In Blütenmeristemen agiert UFO als Kofaktor von LEAFY (LFY) bei der Aktivierung der Organidentitätsgene des zweiten und dritten Wirtels. UFO stellt also einen generellen Faktor der Musterbildung in Meristemen dar. Um regulatorische Gene, die die Expression von UFO bee...

Detección de interacciones genéticas asociadas a enfermedades complejas. Aplicación al cáncer de vejiga

OpenAIRE

Urrea Gales, Víctor

2009-01-01

El proyecto en el que he participado se engloba dentro del Estudio Español de Cáncer de Vejiga/EPICURO, que comenzó en 1997 con el propósito de avanzar en el conocimiento de este cáncer respecto a las causas genéticas y ambientales, prevención, prognosis y tratamiento, y que aglutina esfuerzos de distintos grupos de nvestigación. El proyecto está coordinado por Núria Malats, jefa del Grupo de Epidemiología Genética y Molecular del CNIO (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas)...

Aceptación de los fármacos genéricos en equipos de atención primaria: efecto de una intervención educativa y de los precios de referencia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Vallès J.A.

2002-01-01

Full Text Available Objetivo: Analizar la aceptación de los pacientes de la sustitución de marcas de fantasía por genéricos en el marco de la prescripción crónica. Métodos: Estudio prospectivo, multicéntrico, de utilización de medicamentos. De los 31 centros incluidos en el estudio, ocho fueron aleatorizados al grupo intervención y 23 al grupo control. Durante un año los pacientes del grupo intervención que acudieron a recoger las recetas de la medicación crónica fueron informados de forma verbal y escrita sobre las ventajas e inconvenientes de los fármacos genéricos y los de marca de fantasía. Se registraron los pacientes que recibían fármacos susceptibles de ser prescritos como genéricos, los motivos de no aceptación del cambio y las variables relacionadas (edad, sexo, nivel de estudios, centro, médico de cabecera, tipo de fármaco y número total de fármacos crónicos. Cada 2 meses se obtuvo el porcentaje de genéricos prescritos respecto al total de prescripción. Resultados: Fueron informados 4.620 pacientes de los que el 98,9% aceptó el cambio. El centro de atención primaria, el tipo de fármaco, la influencia médica y la satisfacción del paciente con el fármaco se asociaron significativamente con el grado de aceptación de los genéricos. En el grupo intervenido, el porcentaje de envases genéricos respecto al total de envases prescritos alcanzó un 5,9 frente a un 2,8% de los controles no incentivados. Tras finalizar la intervención y antes de la aplicación de los precios de referencia, los porcentajes fueron del 6,7 y el 3,9%, mientras que justo tras su aplicación, los porcentajes fueron del 8,6 y el 6,3%, respectivamente. Conclusiones: Una intervención educativa directa sobre el paciente es efectiva para cambiar de marca de fantasía a genérico. La motivación y el conocimiento sobre los medicamentos genéricos por parte del médico de cabecera son factores influyentes sobre su uso. La aplicación de los precios de

Recommendations and Requirements for GenCade Simluations

Science.gov (United States)

2014-08-01

will report whether or not GenCade is enabled. If GenCade is disabled , the user will need a new license that includes GenCade...any depth but usually are not deeper than the seaward edge of the surf - zone. In the same way that some shorelines are less desirable for use in...Conference, 1919–1937. ASCE. Wang, P., N. C. Kraus, and R. A. Davis. 1998. Total rate of longshore sediment transport in the surf zone: Field

ESTIMACIÓN DE PARÁMETROS GENÉTICOS PARA PESO AL DESTETE EN GANADO BLANCO OREJINEGRO (BON EN EL NOROCCIDENTE COLOMBIANO

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jhon Cañas Á

2008-04-01

Full Text Available Objetivo. Estimar los componentes de varianza genético aditivo directo y materno para peso al destete en ganado criollo Blanco Orejinegro (BON. Materiales y métodos. Se utilizaron 356 registros entre los años 1988 al 2007, del núcleo de animales BON puro de la hacienda Vegas de la Clara de la Universidad de Antioquia. El análisis fue realizado utilizando un modelo animal incluyendo los efectos fijos de sexo y época de destete, y como covariable la edad al destete y los efectos aleatorios genético directo, genético materno, ambiente permanente y residual. Resultados. El peso promedio al destete fue de 196.3 ± 31.4 kg, a una edad promedio de 271.8 ± 13.5 días. Se encontraron 21 animales endogámicos con un coeficiente de endogamia de 24.5%. La heredabilidad directa y materna fueron de 0.63 ± 0.36 y 0.22 ± 0.19 con una correlación entre el efecto directo y el materno de -0.78 ± 0.21. Conclusión. De acuerdo a los resultados, existe variabilidad genética en el núcleo BON para esta característica.

Medicina Genómica Aspectos éticos, legales y sociales del Genoma Humano

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Rodolfo E. Ávila

2011-01-01

Full Text Available La Medicina Genómica es el uso de la inf ormación de los genomas y sus deriv ados (ARN, proteínas y met abolitos que permite guiar la toma de decisiones médicas, es un c omponente clave de la medicina personalizada. La Medicina Genómica permite conocer la cartografía del genoma hum ano y proporciona una valiosa información a tener en cuenta a la hora de detect ar genes implicados en ciert as enfermedades. Esto conlleva a que en la actualidad nos centremos más en la predicción de patologías que en l a prevención, por lo que la tendencia es que en el futuro la Medicina Genómica acabe desbancando a la Medicina P reventiva. El Proyecto Genoma Humano presenta diversas aplicaciones que, al no tener una clara cobert ura legal, traen consigo un nuevo paradigma con problemas éticos, sociales y legales que la comunidad científica trat a de resolver para compaginar los aspectos morales con el progreso en la investigación. El objetivo del presente trabajo es describir brevemente los aspectos éticos, legales y sociales del Genoma Humano.

Unleashing Gen Y: Marketing Mars to Millennials

Science.gov (United States)

Leahy, Bart D.; Hidalgo, Loretta; Kloberdanz, Cassie

2007-01-01

Space advocates need to engage Generation Y (born 1977-1999).This outreach is necessary to recruit the next generation of scientists and engineers to explore Mars. Space advocates in the non-profit, private, and government sectors need to use a combination of technical communication, marketing, and politics, to develop messages that resonate with Gen Y. Until now, space messages have been generated by and for college-educated white males; Gen Y is much more diverse, including as much as one third minorities. Young women, too, need to be reached. My research has shown that messages emphasizing technology, fun, humor, and opportunity are the best means of reaching the Gen Y audience of 60 million (US population is 300 million). The important things space advocates must avoid are talking down to this generation, making false promises, or expecting them to "wait their turn" before they can participate. This is the MTV generation! We need to find ways of engaging Gen Y now to build a future where human beings can live and work on the planet Mars. In addition to the messages themselves, advocates need to keep up with Gen Y' s social networking and use of iPods, cell phones, and the Internet. NASA and space advocacy groups can use these tools for "viral marketing," where young people share targeted space-related information via cell phones or the Internet because they like it. Overall, Gen Y is a socially dynamic and media-savvy group; advocates' space messages need to be sincere, creative, and placed in locations where Gen Y lives. Mars messages must be memorable!

Reactivity of some mammalian sera with the bovine leukaemia virus env gene polypeptide expressed in Escherichia coli

International Nuclear Information System (INIS)

Slavikova, K.; Zajac, V.

1989-01-01

Sera from bovine leukaemia virus (BLV)-infected cattle and sheep were tested by radioimmunoassay and Western blot for their reactivity with 60,000 protein coded by the env gene of BLV and expressed in Escherichia coli. This protein, antigenically similar to BLV protein, reacted with antibodies against BLV antigens in the sera tested. (author). 3 figs., 1 tab., 13 refs

Detection of the human endogenous retrovirus ERV3-encoded Env-protein in human tissues using antibody-based proteomics.

Science.gov (United States)

Fei, Chen; Atterby, Christina; Edqvist, Per-Henrik; Pontén, Fredrik; Zhang, Wei Wei; Larsson, Erik; Ryan, Frank P

2014-01-01

There is growing evidence to suggest that human endogenous retroviruses (HERVs) have contributed to human evolution, being expressed in development, normal physiology and disease. A key difficulty in the scientific evaluation of this potential viral contribution is the accurate demonstration of virally expressed protein in specific human cells and tissues. In this study, we have adopted the endogenous retrovirus, ERV3, as our test model in developing a reliable high-capacity methodology for the expression of such endogenous retrovirus-coded protein. Two affinity-purified polyclonal antibodies to ERV3 Env-encoded protein were generated to detect the corresponding protein expression pattern in specific human cells, tissues and organs. Sampling included normal tissues from 144 individuals ranging from childhood to old age. This included more than forty different tissues and organs and some 216 different cancer tissues representing the twenty commonest forms of human cancer. The Rudbeck Laboratory, Uppsala University and Uppsala University Hospital, Uppsala, Sweden. The potential expression at likely physiological level of the ERV3Env encoded protein in a wide range of human cells, tissues and organs. We found that ERV3 encoded Env protein is expressed at substantive levels in placenta, testis, adrenal gland, corpus luteum, Fallopian tubes, sebaceous glands, astrocytes, bronchial epithelium and the ducts of the salivary glands. Substantive expression was also seen in a variety of epithelial cells as well as cells known to undergo fusion in inflammation and in normal physiology, including fused macrophages, myocardium and striated muscle. This contrasted strongly with the low levels expressed in other tissues types. These findings suggest that this virus plays a significant role in human physiology and may also play a possible role in disease. This technique can now be extended to the study of other HERV genomes within the human chromosomes that may have contributed to

Modelo poblacional con algoritmos genéticos

OpenAIRE

Veliz Quintero, Eduardo; Rodriguez Ojeda, Luis

2009-01-01

Para el desarrollo de este trabajo, “MODELO POBLACIONAL CON ALGORITMOS GENÉTICOS”, he investigado la rama de la inteligencia artificial, como son los algoritmos genéticos. Primero presento en forma general los aspectos que envuelven los algoritmos genéticos, parto de la necesidad de optimizar, así como su historia y posibles aplicaciones y luego he cubierto detalladamente todo lo que pude investigar sobre la teoría de los algoritmos genéticos, sus fundamentos matemáticos, tipos de algoritmos ...

El nuevo paradigma genético y la naturaleza humana: Una perspectiva desde la bioética reflexiva y secular

OpenAIRE

Orlando, Mejía

2005-01-01

La genética se ha convertido en el área científica con mayores implicaciones bioéticas y sociales, debido al poder de transformación que tiene sobre lo que se ha considerado, hasta ahora, como la naturaleza humana. En este trabajo se propone analizar la relación entre el nuevo paradigma genético, la noción histórica de la esencia humana y los contemporáneos modelos antropocéntrico y evolutivo de la naturaleza humana. Utilizando elementos conceptuales que correspondan a una bioética reflexiva,...

Optimización topológica mediante algoritmos genéticos, estrategias evolutivas y el método de Baluja

OpenAIRE

Estupiñan, J.; Oñate, E.; Suárez, B.

1998-01-01

El trabajo presenta la aplicación de varios mdtodos evolutivos al campo de la optimización topológica de estructuras. El trabajo desarrollado se basa en la búsqueda de una distribución de material dentro de un dominio específico y bajo unas condiciones de contorno concretas. Los algoritmos evolutivos obedecen a las leyes de superviviencia del mejor dotado de Darwiri y a su base genético molecular: mutación y recombinación del material genético. Los métodos evolutivos (ME) que se presentan ...

Factors Influencing Retention of Gen Y and Non-Gen Y Teachers Working at International Schools in Asia

Science.gov (United States)

Fong, Hoi Wah Benny

2018-01-01

Quantitative studies on international-school teacher retention are few, especially studies that differentiate between Gen Y and non-Gen Y teachers. This article reports on the findings of a study that examined the relationship of job satisfaction factors to the likelihood of contract renewal by international-school teachers. Results from the study…

El uso de alteraciones genéticas en la estratificación por riesgo del mieloma múltiple

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Esteban Braggio

2013-08-01

Full Text Available Los estudios genéticos han alcanzado un papel central en el estudio del mieloma múltiple (MM, al convertirse en un componente crítico en la estratificación basada en el riesgo de la enfermedad. Se han hecho grandes esfuerzos para identificar cambios genéticos que puedan predecir el resultado clínico e incluirlos en la práctica clínica diaria. La hibridización in situ fluorescente (FISH es todavía la técnica genética más utilizada en la práctica clínica, mayormente debido a su sencilla implementación y su simplicidad para el análisis de datos. El advenimiento de la genómica (hibridización genómica comparativa, secuenciación exónica o genómica completa y del transcriptoma de alta resolución (perfiles de expresión de genes - GEP y secuenciación de ARNm proveen un análisis exhaustivo de los ya definidos factores pronósticos genéticos y son herramientas útiles para la identificación de potenciales nuevos marcadores pronósticos de enfermedad en el clon tumoral de MM. Más aún, GEP ha sido exitosamente implementado en MM como una herramienta de estratificación de riesgo, siendo la de mayor poder de discriminación de resultados. De todas maneras, algunos aspectos técnicos y logísticos complejos (necesidad de una elevada purificación del clon tumoral, costo de los ensayos y complejidad en los análisis de los datos deben ser considerados antes de la incorporación definitiva de estas tecnologías de alto rendimiento dentro de los ensayos clínicos de rutina. Hasta entonces, FISH continúa siendo la herramienta estándar para la detección de anormalidades genéticas y de valoración pronóstico de enfermedad.

Metode Transfer Asam Nukleat sebagai Dasar Terapi Gen

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Novi Silvia Hardiany

2017-01-01

Full Text Available Kemajuan ilmu biologi molekuler memberikan manfaat dalam bidang kedokteran untuk mengembangkanterapi gen. Tujuan terapi gen adalah untuk memperbaiki kerusakan gen atau mengganti gen yang rusakdengan gen yang normal. Pemindahan gen dilakukan dengan teknik transfeksi. Transfeksi merupakanproses pemindahan asam nukleat baik menggunakan vektor virus (transduksi atau menggunakan metodenonviral yaitu zat kimia, lipid dan metode fisik. Vektor virus yang digunakan pada transduksi adalahretrovirus, adenovirus, adeno-associated virus (AAV dan herpes simplex virus (HSV. Keberhasilantransfeksi ditentukan oleh berbagai faktor yang dapat dapat dinilai dengan menggunakan reporter sepertigreen fluorescence protein (GFP. Kata Kunci: terapi gen, transfeksi non viral, transduksi, vektor virus   Methods of Nucleic Acid Transfer as Basic Gene Therapy Abstract The advancement of molecular biology provides benefit in the field of medicine to develop genetherapy. The aim of gene therapy is to repair the genetic damage or to replace damaged gene with thenormal gene. Delivery of gene is carried out by transfection technique, a technique to transfer nucleic acidinto eukaryote cells either using viral vectors (known as transduction, and also using non viral methodsuch as chemical substance, lipid and physical method. Some of the viral vectors used in the transductionare retrovirus, adenovirus, Adeno-associated virus (AAV and Herpes Simplex Virus (HSV. The success oftransfection is determined by various factors which can be assessed using several reporters such as GreenFluorescence Protein (GFP. Key words: gene therapy, non viral transfection, transduction, viral vector. Normal 0 false false false IN X-NONE X-NONE

La nutrición molecular y sus aportes al estudio de la obesidad

OpenAIRE

Quintero de Rivas, Yurimay del Valle; Bastardo de Castañeda, Gladys; Angarita R., Coromoto E.

2015-01-01

Esta revisión destaca los aportes más importantes de la genómica nutricional y su vínculo con los problemas nutricionales como la obesidad. Las líneas de investigación más actuales en este campo, señalan a la nutrigenética, la cual estudia el efecto de las variaciones genéticas en la interacción entre dieta y enfermedad, y a la nutrigenómica, que se apoya de la genómica funcional, la bioinformática y la biología molecular, como las actuales tendencias que darán origen al desarrollo d...

Polymorphisms in the HIV-1 gp41 env gene, natural resistance to enfuvirtide (T-20) and pol resistance among pregnant Brazilian women.

Science.gov (United States)

Reis, Mônica Nogueira da Guarda; de Alcântara, Keila Correa; Cardoso, Ludimila Paula Vaz; Stefani, Mariane Martins Araújo

2014-01-01

The selective pressure of antiretroviral drugs (ARVs) targeting HIV-1 pol can promote drug resistance mutations in other genomic regions, such as env. Drug resistance among women should be monitored to avoid horizontal and mother-to-child transmission. To describe natural resistance to T-20 (enfuvirtide), gp41 env polymorphisms, mutations in pol and HIV-1 subtypes, 124 pregnant women were recruited. For 98 patients, the gp41 env, protease (PR) and reverse transcriptase (RT) fragments were sequenced. The patients were ARV naïve (n = 30), taking mother-to-child transmission prophylaxis (n = 50), or being treated with highly active ARV therapy/HAART (n = 18). The Stanford and IAS/USA databases and other sources were used to analyze PR/RT, gp41 env resistance mutations. The HIV-1 genetic diversity was analyzed by REGA/phylogenetic analyses. The patients' median age was 25 years (range, 16-42), 18.4% had AIDS. The frequency of natural resistance to T-20 (N42D, L44M, and R46M-low-impact mutations) was 6.1% (6/98); 20.4% (20/98) had compensatory mutations in HR2. The prevalence of transmitted drug resistance in the pol was 13.3% (4/30), and the prevalence of secondary drug resistance was 33.3% (6/18). Two patients were infected with multidrug resistant/MDR viruses. The analysis of HIV-1 subtypes (PR/RT/gp41) revealed that 61.2% (60/98) were subtype B, 12.2% (12/98) were subtype C, 4.1% (4/98) were subtype F1, and 22.4% (22/98) were possible recombinants (BF1 = 20.4%; BC = 2%). Natural resistance to T-20 was not associated with pol resistance or previous ARV use. The high rate of secondary resistance, including MDR, indicates that the number of women that may need T-20 salvage therapy may be higher than anticipated. © 2013 Wiley Periodicals, Inc.

Necesidad de estudio genético para el diagnóstico de algunos casos de acidosis tubular renal distal

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Manuel Heras Benito

2016-09-01

Full Text Available Describimos el caso de una mujer joven, que fue diagnosticada de insuficiencia renal avanzada, con un hallazgo casual de una nefrocalcinosis sin una etiología clara, al haberse encontrado asintomática a lo largo de su vida. El estudio genético por paneles de genes conocidos asociados a enfermedad tubulointersticial permitió descubrir una acidosis tubular renal distal autosómica dominante, asociada a una mutación de novo en el exón 14 del gen SLC4A1, que hubiera sido imposible diagnosticar clínicamente por lo avanzado de la enfermedad renal cuando fue descubierta.

Una mirada al albinismo óculo-cutáneo: reporte de mutaciones en el gen TYR en cinco individuos colombianos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Diana Sanabria

2012-06-01

Full Text Available Introducción. El albinismo óculo-cutáneo es un trastorno hereditario autosómico recesivo relacionado con la pigmentación. Sus manifestaciones clínicas incluyen hipopigmentación en piel, cabello y ojos, hipoplasia en la fóvea y disminución de la agudeza visual. A nivel mundial, hasta el momento, se han reportado, aproximadamente, 230 mutaciones en el gen TYR que causan albinismo óculo-cutáneo de tipo 1. Este gen codifica para la tirosinasa, enzima principal de la biosíntesis de melanina. Objetivos. Identificar las mutaciones en el gen TYR responsables del albinismo óculo-cutáneo de tipo 1 en cinco individuos colombianos; cuatro de ellos pertenecen a una misma familia y el otro individuo es un caso aislado no relacionado con la familia. Asimismo, se pretende evaluar un sistema oftálmico que permite corregir problemas de refracción, y disminuir el nistagmo y la fotofobia en uno de los casos. Materiales y métodos. Se hizo la secuenciación de los cinco exones del gen TYR en los cinco individuos de estudio y se buscaron portadores en la familia. Se llevó a cabo la evaluación clínica oftalmológica y la implementación del sistema correctivo en uno de los pacientes. Resultados. Se encontraron las mutaciones G47D y 1379delTT en la familia, y en el caso aislado, las mutaciones G47D y D42N. Con la implementación del sistema óculo-visual se logró incrementar la agudeza visual y disminuir el nistagmo.Conclusiones. Por ser el primer estudio en albinismo de este carácter en el país, estos resultados marcan una pauta para estudios posteriores de tamización molecular de albinismo en población colombiana.   doi: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v32i2.638

Diversidad genética y filogenia molecular de poblaciones de Mauritia flexuosa L.f. “aguaje” de la Amazonía Peruana

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jorge Angulo-Quintanilla

2014-07-01

Full Text Available Mauritia flexuosa es una especie vegetal amazónica que forma extensas poblaciones denominadas “aguajales”. Como los pobladores amazónicos emplean varios órganos de M. flexuosa para suplir sus necesidades y con fines comerciales, se está ejerciendo un gran impacto negativo sobre esta especie. A pesar de ello, a la fecha no se conoce la diversidad genética de esta especie en la Amazonía peruana. Consecuentemente, los planes de manejo para la especie serían limitados sin este tipo de información. Por tanto, el objetivo de esta investigación fue determinar la diversidad genética y filogenia molecular de poblaciones de M. flexuosa aledañas a la carretera Iquitos-Nauta. Las hojas se colectaron en seis zonas contiguas a la carretera Iquitos–Nauta. El ADN purificado con protocolos estándares fue amplificado mediante la técnica de ADN Polimórfico Amplificado al Azar (RAPD con dos cebadores aleatorios.  En total se generaron 28 amplicones RAPD (26 polimórficos y 2 monomórficos. Dentro de los aguajales la diversidad genética fue tres veces mayor (75±19 % que la diversidad genética entre las seis poblaciones de M. flexuosa (25±19 %. La diferenciación genética entre las poblaciones varió de 0,0 a 0,6. Los aguajales que se agruparon en clados en el dendrograma por su mayor similitud genética tuvieron proximidad geográfica. La similitud genética entre las poblaciones de M. flexuosa depende de la distancia geográfica, de tal manera que las poblaciones con más similitud genética están más próximas entre sí que las que tienen menos similitud genética.

Diversidad genética y filogenia molecular de poblaciones de Mauritia flexuosa L.f. “aguaje” de la Amazonía Peruana

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jorge Angulo Quintanilla

2014-06-01

Full Text Available Mauritia flexuosa es una especie vegetal amazónica que forma extensas poblaciones denominadas “aguajales”. Como los pobladores amazónicos emplean varios órganos de M. flexuosa para suplir sus necesidades y con fines comerciales, se está ejerciendo un gran impacto negativo sobre esta especie. A pesar de ello, a la fecha no se conoce la diversidad genética de esta especie en la Amazonía peruana. Consecuentemente, los planes de manejo para la especie serían limitados sin este tipo de información. Por tanto, el objetivo de esta investigación fue determinar la diversidad genética y filogenia molecular de poblaciones de M. flexuosa aledañas a la carretera Iquitos-Nauta. Las hojas se colectaron en seis zonas contiguas a la carretera Iquitos–Nauta. El ADN purificado con protocolos estándares fue amplificado mediante la técnica de ADN Polimórfico Amplificado al Azar (RAPD con dos cebadores aleatorios.  En total se generaron 28 amplicones RAPD (26 polimórficos y 2 monomórficos. Dentro de los aguajales la diversidad genética fue tres veces mayor (75±19 % que la diversidad genética entre las seis poblaciones de M. flexuosa (25±19 %. La diferenciación genética entre las poblaciones varió de 0,0 a 0,6. Los aguajales que se agruparon en clados en el dendrograma por su mayor similitud genética tuvieron proximidad geográfica. La similitud genética entre las poblaciones de M. flexuosa depende de la distancia geográfica, de tal manera que las poblaciones con más similitud genética están más próximas entre sí que las que tienen menos similitud genética.

Features of the Env leader protein and the N-terminal Gag domain of feline foamy virus important for virus morphogenesis

International Nuclear Information System (INIS)

Geiselhart, Verena; Schwantes, Astrid; Bastone, Patrizia; Frech, Matthias; Loechelt, Martin

2003-01-01

Previous studies have shown that foamy virus (FV) particle budding, especially the involvement of the viral Env glycoprotein, is different from that of other (ortho) retroviruses: the N-terminal Env leader protein Elp is a constituent of released FV particles. A defined sequence in Elp required for particle budding binds to the MA domain of Gag. To extend these findings, we show that feline FV Elp is a membrane-anchored protein with the N-terminus located inside the particle. Thus, the internal/cytoplasmic domain of Elp has the correct topology for interacting with Gag during budding. In addition to Elp, an Elp-related protein of about 9 kDa was shown to be virion associated and is probably generated by cellular signal peptidases. Besides the function of Elp binding, the N-terminal domain of Gag was shown to be required for proper localization of feline FV Gag to the cytoplasm and the perinuclear/nuclear region

Characterization of Romboutsia ilealis gen. nov., sp. nov., isolated from the gastro-intestinal tract of a rat, and proposal for the reclassification of five closely related members of the genus Clostridium into the genera Romboutsia gen. nov., Intestinibacter gen. nov., Terrisporobacter gen. nov. and Asaccharospora gen. nov.

Science.gov (United States)

Gerritsen, Jacoline; Fuentes, Susana; Grievink, Wieke; van Niftrik, Laura; Tindall, Brian J; Timmerman, Harro M; Rijkers, Ger T; Smidt, Hauke

2014-05-01

A Gram-positive staining, rod-shaped, non-motile, spore-forming obligately anaerobic bacterium, designated CRIBT, was isolated from the gastro-intestinal tract of a rat and characterized. The major cellular fatty acids of strain CRIBT were saturated and unsaturated straight-chain C12-C19 fatty acids, with C16:0 being the predominant fatty acid. The polar lipid profile comprised six glycolipids, four phospholipids and one lipid that did not stain with any of the specific spray reagents used. The only quinone was MK-6. The predominating cell-wall sugars were glucose and galactose. The peptidoglycan type of strain CRIBT was A1σ lanthionine-direct. The genomic DNA G+C content of strain CRIBT was 28.1 mol%. On the basis of 16S rRNA gene sequence similarity, strain CRIBT was most closely related to a number of species of the genus Clostridium, including Clostridium lituseburense (97.2%), Clostridium glycolicum (96.2%), Clostridium mayombei (96.2%), Clostridium bartlettii (96.0%) and Clostridium irregulare (95.5%). All these species show very low 16S rRNA gene sequence similarity (genus Clostridium. DNA-DNA hybridization with closely related reference strains indicated reassociation values below 32%. On the basis of phenotypic and genetic studies, a novel genus, Romboutsia gen. nov., is proposed. The novel isolate CRIBT (=DSM 25109T=NIZO 4048T) is proposed as the type strain of the type species, Romboutsia ilealis gen. nov., sp. nov., of the proposed novel genus. It is proposed that C. lituseburense is transferred to this genus as Romboutsia lituseburensis comb. nov. Furthermore, the reclassification into novel genera is proposed for C. bartlettii, as Intestinibacter bartlettii gen. nov., comb. nov. (type species of the genus), C. glycolicum, as Terrisporobacter glycolicus gen. nov., comb. nov. (type species of the genus), C. mayombei, as Terrisporobacter mayombei gen. nov., comb. nov., and C. irregulare, as Asaccharospora irregularis gen. nov., comb. nov. (type species

Nociones de bioquímica y genética útiles para los profesionales de la información del sector de la salud

OpenAIRE

Cañedo Andalia, Rubén; Guerrero Pupo, Julio C

2005-01-01

Con el objetivo de contribuir a la creación de una cultura básica sobre ciertos temas esenciales para la labor de los profesionales de la información en los nuevos entornos de la medicina moderna, se tratan algunos conceptos y definiciones esenciales útiles para comprender los avances de la bioquímica y la genética modernas. La introducción de estas nociones en el vocabulario de uso frecuente de estos profesionales facilitará su acercamiento al entorno genómico de la nueva medicina clínica. ...

Rnas inhibidores frente al virus de la inmunodeficiencia humana

OpenAIRE

Sánchez Luque, Francisco José

2013-01-01

En la presente tesis se describe la generaci??n de peque??as mol??culas de RNA con funci??n inhibidora frente al Virus de la Inmunodeficiencia Humana de Tipo 1 (VIH-1). Este virus es el agente causal del S??ndrome de Inmunodeficiencia Adquirida y perteneciente al g??nero Lentivirus de la familia Retroviridae. El virus presenta una alternancia en cuanto al tipo de material gen??tico en su ciclo de vida, siendo RNA en las part??culas virales y DNA en el provirus (durante la fase de latencia o e...

J3Gen: A PRNG for Low-Cost Passive RFID

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jordi Herrera-Joancomartí

2013-03-01

Full Text Available Pseudorandom number generation (PRNG is the main security tool in low-cost passive radio-frequency identification (RFID technologies, such as EPC Gen2. We present a lightweight PRNG design for low-cost passive RFID tags, named J3Gen. J3Gen is based on a linear feedback shift register (LFSR configured with multiple feedback polynomials. The polynomials are alternated during the generation of sequences via a physical source of randomness. J3Gen successfully handles the inherent linearity of LFSR based PRNGs and satisfies the statistical requirements imposed by the EPC Gen2 standard. A hardware implementation of J3Gen is presented and evaluated with regard to different design parameters, defining the key-equivalence security and nonlinearity of the design. The results of a SPICE simulation confirm the power-consumption suitability of the proposal.

Modelo origen destino para estimar el flujo de tráfico usando algoritmos genéticos

OpenAIRE

Aldás S., Milton R.; Flores C., Marco J.; Universidad de Cuenca; Dirección de Investigación de la Universidad de Cuenca; DIUC

2014-01-01

En este trabajo se ha desarrollado un nuevo método basado en Inteligencia Artificial para resolver un problema del matriz origen-destino (O-D) aplicado al caso de una red de tráfico vehicular en la ciudad de Ambato. El método implementado, basado en algoritmos genéticos (AG), resuelve el problema de minimización asociado al problema de matriz O-D. Para validar la técnica, se ha utilizado una red vial correspondiente a la zona del Mercado Modelo en la ciudad de Ambato, que es una zona de alta ...

O impacto da genética na asma infantil

OpenAIRE

Pinto,Leonardo A.; Stein,Renato T.; Kabesch,Michael

2008-01-01

OBJETIVO: Apresentar os resultados dos estudos mais importantes e recentes sobre a genética da asma. Estes dados devem auxiliar os clínicos gerais a compreender o impacto da genética sobre este distúrbio complexo e como os genes e polimorfismos influenciam a asma e a atopia. FONTES DOS DADOS: Os dados foram coletados do banco de dados MEDLINE. Os estudos de associação genética foram selecionados do Genetic Association Database, um repositório de estudos de associação genética de doenças e dis...

Caracterização físico-química de frutos de genótipos de aceroleira (Malpighia emarginata D.C.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Maria Inês Sucupira Maciel

2010-12-01

Full Text Available No Brasil, a aceroleira, decorrente principalmente da propagação por sementes, tem dado origem a plantios comerciais cujos frutos apresentam parâmetros de qualidade diferenciados. Características físico-químicas de frutos de 18 genótipos de aceroleira (Malpighia emarginata DC. do Banco Ativo de Germoplasma da Universidade Federal Rural de Pernambuco - UFRPE foram avaliados. O rendimento em polpa variou de 41,06% (PL 40 a 72,54% (PL 43 e, com exceção do genótipo PL 37, os demais apresentaram frutos com teores de ácido ascórbico superiores a 1000 mg.100 g-1. O genótipo PL 39 destacou-se por apresentar o maior teor de ácido ascórbico (1667 mg.100 g-1, SST e flavonóis (15,04 mg.100 g-1, além de elevado teor de antocianinas, sendo, portanto, o mais promissor. Os frutos do genótipo PL 34 revelaram o maior valor de SST/ATT, indicando ser o mais doce

Pre-existing neutralizing antibody mitigates B cell dysregulation and enhances the Env-specific antibody response in SHIV-infected rhesus macaques.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Juan Pablo Jaworski

Full Text Available Our central hypothesis is that protection against HIV infection will be powerfully influenced by the magnitude and quality of the B cell response. Although sterilizing immunity, mediated by pre-formed abundant and potent antibodies is the ultimate goal for B cell-targeted HIV vaccine strategies, scenarios that fall short of this may still confer beneficial defenses against viremia and disease progression. We evaluated the impact of sub-sterilizing pre-existing neutralizing antibody on the B cell response to SHIV infection. Adult male rhesus macaques received passive transfer of a sub-sterilizing amount of polyclonal neutralizing immunoglobulin (Ig purified from previously infected animals (SHIVIG or control Ig prior to intra-rectal challenge with SHIVSF162P4 and extensive longitudinal sampling was performed. SHIVIG treated animals exhibited significantly reduced viral load and increased de novo Env-specific plasma antibody. Dysregulation of the B cell profile was grossly apparent soon after infection in untreated animals; exemplified by a ≈50% decrease in total B cells in the blood evident 2-3 weeks post-infection which was not apparent in SHIVIG treated animals. IgD+CD5+CD21+ B cells phenotypically similar to marginal zone-like B cells were highly sensitive to SHIV infection, becoming significantly decreased as early as 3 days post-infection in control animals, while being maintained in SHIVIG treated animals, and were highly correlated with the induction of Env-specific plasma antibody. These results suggest that B cell dysregulation during the early stages of infection likely contributes to suboptimal Env-specific B cell and antibody responses, and strategies that limit this dysregulation may enhance the host's ability to eliminate HIV.

Parámetros genéticos y tendencias genéticas para características de comportamiento en ganaderías de lida mexicanas

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Joel Domínguez-Viveros

2014-01-01

Full Text Available Los objetivos del presente estudio fueron: estimar componentes de varianza; calcular heredabilidades (h2 y correlaciones genéticas (rg; predecir valores genéticos (VG, y analizar las tendencias a través del tiempo. Se analizó la información de comportamiento en cuatro ganaderías de lidia mexicanas: Los Encinos (ENC, Montecristo (MCR, San José (SJO y Fernando de la Mora (FMO. La información analizada correspondió a las notas de tienta al caballo (TC, tienta a pie (TP, lidia a caballo (LC y lidia a pie (LP. El número de observaciones osciló de 154 a 2,369 y el número de animales en los pedigríes varió de 3,246 a 8,962; se realizó un análisis multivariado con el software MTDFREML. Las heredabilidades obtenidas fueron de 0.09±0.05 a 0.47±0.22, y un promedio de 0.28±0.09; la h2 promedio por características fue de 0.33±0.06 para TC y TP, 0.23±0.14 para LC y 0.27±0.12 para LP. Todas las rg fueron positivas y superiores a 0.50; con excepción en TP y LP (0.44±0.38 en FMO y TC y LP (0.28±0.14 en MCR. La rg promedio dentro de ganadería fue de 0.71±0.14 en MCR, 0.77±0.35 en FMO, 0.78±0.18 en ENC y 0.85±0.31 en SJO. Las tendencias de los VG fueron positivas y diferentes de cero (P0.05. La ganancia por año, como parte porcentual de la media, osciló de 0.19 % en LC de FMO a 1.5 % en TP de ENC. Las estimaciones de heredabilidad y la variabilidad de los valores genéticos sugieren su utilidad en programas de selección, favoreciendo un mayor progreso genético.

Thaumetopoea pityocampa i nematodes entomopatògens : un mètode alternatiu de control biològic de la plaga

OpenAIRE

Franquet Barrera, Laura; García del Pino, Fernando; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Ciències

2009-01-01

L’objectiu principal d’aquesta investigació és determinar la viabilitat dels nematodes entomopatògens per controlar les plagues de Thaumetopoea pityocampa, tenint en compte que presenten tot un seguit de característiques que els fan adequats per al control de diferents plagues d’insectes.

Comparación de metodologías moleculares para identificar el gen de la kappa caseína en ganado Holstein

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Carlos Solarte P.

2012-04-01

Full Text Available Objetivo. Comparar las metodologías moleculares, PCR-RFLPs y PCR-SSCP, para identificar las variantes alélicas del gen de la kappa caseína (CSN3 en bovinos Holstein del trópico alto de Nariño-Colombia. Materiales y métodos. Se escogieron al azar 50 vacas Holstein y mediante punción en la vena coxígea media se tomaron muestras de 5cc de sangre, que se almacenaron y preservaron en tarjetas FTA® para su posterior análisis en el laboratorio. El ADN se amplificó por PCR utilizando cebadores específicos. Los cambios en la conformación de cadena sencilla (SSCP fueron visualizados en geles de poliacrilamida al 12%; mientras que los RFLPs se obtuvieron por digestión con tres enzimas de restricción y se visualizaron en geles de agarosa al 4%. Resultados. La metodología PCR-RFLPs fue útil para detectar mutaciones puntuales y por lo tanto se identificó un mayor número de alelos, lo que contribuye a una mejor estimación de las medidas de diversidad genética en poblaciones seleccionadas, ya que evita problemas de sobreestimación de los valores en las frecuencias alélicas. Por su parte, la técnica PCR-SSCP resultó más sencilla y económica, ideal para investigaciones en las que no existe información previa sobre los genotipos de las poblaciones bovinas y en estudios con bajos presupuestos. Conclusiones. Las dos metodologías evaluadas son herramientas moleculares que contribuyen a la orientación de los procesos de selección en los bovinos para leche, ya que identifican los alelos del gen CSN3. La diferencia radica en el costo de las mismas y en el número de variantes identificadas.

Diversidad genética de Dioscorea trifida “sachapapa” de cinco cuencas hidrográficas de la amazonía peruana

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jhonatan Pérez Arévalo

2013-12-01

Full Text Available Dioscorea trifida “sachapapa” es una de las especies promisorias amazónicas que podemos considerarla huérfana de la ciencia, por las escasas investigaciones que hay sobre esta especie. El objetivo de esta investigación fue determinar la diversidad genética intra e interpoblacional de D. trifida de cinco cuencas hidrográficas de la amazonía peruana. Las hojas fueron colectadas de una colección de germoplasma y purificó el ADN con métodos estándares. El polimorfismo genético se evaluó con la técnica RAPD y los parámetros de genética poblacional fueron estimados con el programa POPGENE. Los análisis espectrofotométrico (A260/A280=1,7±0,1 y electroforético (bandas de ADN íntegras mostraron que el ADN purificado fue de alta calidad. Asimismo, la cantidad obtenida fue apropiada para estudios de diversidad genética (rendimiento promedio = 582±248 mg ADN/mg hojas. La diversidad genética intrapoblacional más alta se encontró en la cuenca del Itaya (h = 0,24±0,11 y la más baja en la cuenca del Marañón (h = 0,10±0,04. Adicionalmente, la diversidad genética interpoblacional más alta se registró entre las poblaciones de Itaya vs Ucayali (GST = 1,00, mientras que la más baja entre las poblaciones de Nanay vs Tapiche (GST = 0,07. En conclusión, D. trifida muestra variación en su diversidad genética intra e interpoblacional en las cinco cuencas hidrográficas de la amazonía peruana, siendo la cuenca del Itaya la que presenta mayor diversidad genética intrapoblacional y las poblaciones de Itaya vs Ucayali las que presentan mayor diversidad genética interpoblacional, que en parte se atribuyen al flujo de genes diferencial entre las poblaciones analizadas.

U.S. Near-Zero Emissions Program: CCS - Clean Coal R&D, FutureGen, & Demonstrations

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

K Der, Victor [Department of Energy (United States)

2008-07-15

In this paper a projection of the CO{sub 2} emissions in the United States is shown; the technical challenges in the capture and sequestration of the CO{sub 2}; what is understood by carbon sequestration; the three elements of the capture and CO{sub 2} storage that are: capture, transport, and storage; the FutureGen project; plants of coal combustion with sequestration, and at the end an initiative for the generation with clean coal is presented. [Spanish] En esta ponencia se muestra una proyeccion de las emisiones de CO{sub 2} en los Estados Unidos; los retos tecnicos en la captura y secuestro de CO{sub 2}; que entendemos por secuestro de carbono; los tres elementos de la captura y almacenamiento de CO{sub 2} que son captura, transporte y almacenamiento; el proyecto FutureGen; plantas de combustion de carbon con secuestro, y al final se presenta una iniciativa para la generacion con carbon limpio.

Genética e hanseníase

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Bernardo Beiguelman

Full Text Available As diferentes linhas de pesquisa utilizadas para investigar a importância dos fatores hereditários humanos na determinação da resistência/suscetibilidade à infecção pelo Mycobacterium leprae foram discutidas no presente trabalho. Uma síntese dessas abordagens permitiu analisar os resultados das investigações sobre associação da hanseníase com polimorfismos genéticos, distribuição familial da hanseníase, prevalência da hanseníase e distância genética, concordância da hanseníase em gêmeos e estudos genéticos sobre a reação de Mitsuda.

Polimorfismos del gen ApoE en individuos con síndrome de Down y sus progenitores en una población colombiana

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Lucero Rengifo

2012-06-01

Full Text Available Introducción. Los polimorfismos en el gen ApoE se han examinado en el síndrome de Down debido a la relación existente de la isoforma E4 con la demencia de tipo Alzheimer que aparece en los individuos con síndrome de Down. Objetivos. Determinar los polimorfismos en el gen ApoE en individuos con síndrome de Down y sus progenitores, y buscar su asociación. Materiales y métodos. Mediante PCR-RFLP, se analizaron los polimorfismos del gen ApoE en 134 individuos jóvenes con síndrome de Down, 87 madres y 54 padres del eje cafetero, y se compararon con una población control de 525 individuos sanos. Resultados. El alelo APOEε3 y el genotipo ε3/ε3 fueron los más frecuentes en todas las poblaciones. La frecuencia alélica de APOEε2 es muy baja y ε2/ε2 está ausente en las poblaciones con síndrome de Down y sus progenitores. El alelo APOEε4 fue más frecuente en individuos con síndrome de Down que en el resto de poblaciones analizadas. Al comparar las frecuencias alélicas y genotípicas entre las poblaciones con síndrome de Down y los progenitores con la población control, mediante la χ2 de Pearson y los odds ratios por la prueba exacta de Fisher, no se encontraron diferencias estadísticamente significativas. Conclusiones. No se encontró asociación entre los polimorfismos del gen ApoE y el síndrome de Down. Es posible que el tamaño de la muestra o las influencias étnicas hubieran afectado estos resultados. Es necesario hacer otros estudios en poblaciones colombianas y evaluar la asociación con otros genes que se encuentran relacionados con la enfermedad de Alzheimer.   doi: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v32i2.427

Genet and tic vari d seed iability yield t oc y and h traits i cciden ...

African Journals Online (AJOL)

SAM

between two variables; δ2x is the genotypic or phenotypic variance of the variable x, δ2y is the genotypic or phenotypic variance of the variable yield y. .... var = genotypic variance; Env var = environmental variance; PCV = phenotypic coefficient of variability; GCV = genotypic coefficient of variability; Gen adv% = genetic ...

Variabilidad genética de Aedes aegypti en algunas áreas del Perú usando Single Stranded Conformational Polymorphism (SSCP

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Nélida Leiva G

2004-07-01

Full Text Available Aedes aegypti es el vector responsable de la transmisión del virus del dengue, su distribución geográfica se ha ampliado rápidamente debido principalmente a la intervención de los seres humanos. Objetivo: Analizar la variabilidad genética de este mosquito mediante la comparación del Segundo Espaciador Transcrito Interno (ITS 2 perteneciente al ADN ribosomal (rADN. Materiales y Métodos: Se analizaron muestras de ocho localidades (Jaén, Tingo María, Iquitos, Lambayeque, el distrito de El Rimac, Sullana y Zarumilla y uno de la provincia de Huaquillas (Ecuador. El análisis de la variabilidad se determinó usando la técnica conocida como SSCP (Single Stranded Conformation Polymorphism. Resultados: El estudio muestra que existe variabilidad genética entre las poblaciones analizadas, principalmente entre las muestras localizadas en la costa del Perú (Zarumilla, El Rímac, Sullana y Huaquillas y las muestras del nororiente (Tingo María, Iquitos, Jaén y Lambayeque Conclusión: Se determinaron dos variantes genéticas entre las poblaciones de Aedes aegypti: Costeña y Nororiental, que probablemente provienen de dos ancestros diferentes y cuyo ancestro común sufrió de aislamiento por distancia. Se observó que no existe relación entre las distancias genéticas y las distancias geográficas indicando que la migración de estas poblaciones es el resultado de la intervención de los seres humanos que diseminan al vector y no por la migración activa del mosquito. Se plantea el papel de la Cordillera de los Andes en la migración y separación de las poblaciones de Aedes.

Divergence and genetic variability among superior rubber tree genotypes Divergência e variabilidade genética de genótipos superiores de seringueira

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Lígia Regina Lima Gouvêa

2010-02-01

Full Text Available The objective of this work was to estimate the genetic variability and divergence among 22 superior rubber tree (Hevea sp. genotypes of the IAC 400 series. Univariate and multivariate analyses were performed using eight quantitative traits (descriptors, including yield. In the univariate analyses, the estimated parameters were: genetic and environmental variances; genetic and environmental coefficients of variation; and the variation index. The Mahalanobis generalized distance, the Tocher agglomerative method and canonical variables were used for the multivariate analyses. In the univariate analyses, variability was verified among the genotypes for all the variables evaluated. The Tocher method grouped the genotypes into 11 clusters of dissimilarity. The first four canonical variables explained 87.93% of the cumulative variation. The highest genetic variability was found in rubber yield-related traits, which contributed the most to the genetic divergence. The most divergent pairs of genotypes are suggested for crossbreeding. The genotypes evaluated are suitable for breeding and may be used to continue the IAC rubber tree breeding program.O objetivo deste trabalho foi estimar a divergência e a variabilidade genética entre 22 genótipos superiores de seringueira (Hevea sp. da série IAC 400. Análises univariadas e multivariadas foram realizadas com oito caracteres quantitativos (descritores, incluindo produtividade. Na análise univariada, os parâmetros estimados foram: variâncias genética e ambiental, coeficientes de variação genética e ambiental, e índice de variação. A distância generalizada de Mahalanobis, o método aglomerativo de Tocher e variáveis canônicas foram utilizados nas análises multivariadas. Nas análises univariadas, verificou-se variabilidade entre os genótipos para todas as variáveis avaliadas. O método de Tocher agrupou os genótipos em 11 grupos de dissimilaridade. As quatro primeiras variáveis can

Gradiente de riesgo genético HLA-DQ para diabetes tipo 1 y enfermedad celíaca en el noroeste de México

OpenAIRE

Mejía-León, M.E.; Ruiz-Dyck, K.M.; Calderón de la Barca, A.M.

2015-01-01

Antecedentes: La diabetes tipo 1 (DT1) y la enfermedad celíaca (EC) son 2 enfermedades autoinmunes frecuentes en la infancia y comparten su predisposición genética (HLA-DQ2 y DQ8). La prevalencia de ambas se ha incrementado en el mundo. En el estado de Sonora (15 habitantes/km2), se desconoce información sobre su riesgo genético o la distribución de los alelos asociados en la población general. Objetivo: Comparar la frecuencia alélica HLA-DQ de una muestra representativa de recién nacidos ...

Next Gen One Portal Usability Evaluation

Science.gov (United States)

Cross, E. V., III; Perera, J. S.; Hanson, A. M.; English, K.; Vu, L.; Amonette, W.

2018-01-01

Each exercise device on the International Space Station (ISS) has a unique, customized software system interface with unique layouts / hierarchy, and operational principles that require significant crew training. Furthermore, the software programs are not adaptable and provide no real-time feedback or motivation to enhance the exercise experience and/or prevent injuries. Additionally, the graphical user interfaces (GUI) of these systems present information through multiple layers resulting in difficulty navigating to the desired screens and functions. These limitations of current exercise device GUI's lead to increased crew time spent on initiating, loading, performing exercises, logging data and exiting the system. To address these limitations a Next Generation One Portal (NextGen One Portal) Crew Countermeasure System (CMS) was developed, which utilizes the latest industry guidelines in GUI designs to provide an intuitive ease of use approach (i.e., 80% of the functionality gained within 5-10 minutes of initial use without/limited formal training required). This is accomplished by providing a consistent interface using common software to reduce crew training, increase efficiency & user satisfaction while also reducing development & maintenance costs. Results from the usability evaluations showed the NextGen One Portal UI having greater efficiency, learnability, memorability, usability and overall user experience than the current Advanced Resistive Exercise Device (ARED) UI used by astronauts on ISS. Specifically, the design of the One-Portal UI as an app interface similar to those found on the Apple and Google's App Store, assisted many of the participants in grasping the concepts of the interface with minimum training. Although the NextGen One-Portal UI was shown to be an overall better interface, observations by the test facilitators noted specific exercise tasks appeared to have a significant impact on the NextGen One-Portal UI efficiency. Future updates to

Emprego de modelos gráficos na seleção de genitores de milho para hibridização e mapeamento genético

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Vieira Eduardo Alano

2005-01-01

Full Text Available A dissimilaridade genética estimada por meio de marcadores moleculares, quando acompanhada de informações fenotípicas, é importante para a seleção de genótipos para o melhoramento e o mapeamento genético. Desta forma, os objetivos deste estudo foram: i estimar a dissimilaridade genética entre 30 linhagens de milho contrastantes para a tolerância ao encharcamento; ii selecionar genitores para mapeamento e melhoramento genético; iii comparar diferentes métodos de visualização gráfica das distâncias. Foram utilizados 21 iniciadores de RAPD. A dissimilaridade genética foi estimada por meio do complemento do coeficiente de similaridade de Dice, posteriormente foi construído um dendrograma pelo método de agrupamento da distância média e calculado o coeficiente de correlação cofenética entre a matriz de dissimilaridade e o dendrograma gerado. O complemento da matriz de similaridade foi submetido também à análise de componentes principais e de escala multidimensional. Para ambas as análises, foi testada a eficiência das projeções, por meio da correlação entre as distâncias originais e as representadas nos gráficos. As técnicas de agrupamento não revelaram um bom ajuste entre as distâncias apresentadas graficamente e a matriz original de distâncias, com correlações de 0,70, 0,53 e 0,75 para o dendrograma, componentes principais e análise de escala multidimensional, respectivamente. Dentre as técnicas de agrupamento empregadas, a que atendeu de forma mais precisa aos objetivos do trabalho foi a análise multidimensional, uma vez que esta, além de apresentar a maior correlação com a matriz original de distâncias, preservou as distâncias entre todos os pares de genótipos. Além disso, esta técnica é a mais indicada quando o objetivo do trabalho é a definição de cruzamentos, pois ela permite uma observação mais fácil das distâncias entre todos os pares de genótipos.

Polimorfismo genético relacionado con la probabilidad de desarrollar asma ocupacional en trabajadores expuestos a isocianatos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Gaetano Pepe Betancourt

2014-03-01

Full Text Available Introducción: El desarrollo tecnológico ha traído como consecuencia el uso de sustancias químicas potencialmente perjudiciales para la salud de los trabajadores. Particularmente el uso de isocianatos ha resultado en una mayor morbilidad de patología respiratoria, especialmente el asma. Considerando que no todos los trabajadores expuestos desarrollan la enfermedad se ha propuesto un modelo de interacción gen-medioambiental, el cual trata de explicar la predisposición genética que tienen algunos individuos a desarrollar asma ocupacional y otros no. Objetivo: Conocer la evidencia científica relacionada con el polimorfismo genético y la susceptibilidad que tienen los trabajadores expuestos a isocianatos a desarrollar asma ocupacional. Metodología: Se realizó una revisión sistemática mediante una búsqueda bibliográfica utilizando las bases de datos PubMedline, así como en los repositorios Dialnet y ELSEVIER. Se extrajeron los artículos relacionados al objetivo de esta revisión, no se aplicaron filtros de temporalidad, utilizándose los siguientes descriptores: MeSH Major Topic, MeSH Terms. El periodo de búsqueda fue desde el 20 de noviembre de 2013 y finalizó el 15 de diciembre de 2013. El nivel de evidencia se estableció de acuerdo a los criterios GRADE. Resultados: Se analizaron a texto completo 42 artículos, la evidencia científica se sustentó en 11 estudios de casos-controles. Dada la complejidad del polimorfismo genético asociado con la expresión fenotípica de la enfermedad, como limitación de los estudios, los autores coinciden que el tamaño muestral no es suficientemente grande, sin embargo después de ajustar los factores de confusión los artículos encontrados tuvieron un nivel de evidencia B de GRADE. Conclusión: La genética tiene una influencia significativa en el asma ocupacional inducida por isocianatos. El peso de la susceptibilidad genética y de la interacción gen-medioambiente aún no se han

Salud pública, genética y ética

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Kottow Miguel H

2002-01-01

Full Text Available La investigación genética ha tenido una enorme expansión en recientes décadas, con repercusiones terapéuticas aún inciertas. El análisis bioético tradicional de las complejas prácticas genéticas ha sido insuficiente por sostenerse en la ética de la investigación y en la bioética de corte principialista. Los problemas éticos más importantes de la genética son de orden colectivo y deben ser abordados por una reflexión ético-social cuyo enfoque es más amplio que la agenda interpersonal del principialismo. Temas como exploraciones genéticas, cuestiones patrimoniales, manipulación génica y asignación de recursos, deben todos ser sometidos a un pensamiento inspirado en los requerimientos de la ciudadanía, en el bien común y en la definición del rol del Estado en fiscalizar actividades genéticas y en proteger a la población. El objetivo del estudio es mostrar cómo el amplio campo de la ética y de la genética tiene una mayor relevancia en el campo social que en el clínico. El objetivo del trabajo es señalar que la bioética principialista ha enfatizado los problemas éticos individuales que nacen con la intervención genética, a costa de marginar sus importantes repercusiones sociales.

Salud pública, genética y ética

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Miguel H Kottow

2002-10-01

Full Text Available La investigación genética ha tenido una enorme expansión en recientes décadas, con repercusiones terapéuticas aún inciertas. El análisis bioético tradicional de las complejas prácticas genéticas ha sido insuficiente por sostenerse en la ética de la investigación y en la bioética de corte principialista. Los problemas éticos más importantes de la genética son de orden colectivo y deben ser abordados por una reflexión ético-social cuyo enfoque es más amplio que la agenda interpersonal del principialismo. Temas como exploraciones genéticas, cuestiones patrimoniales, manipulación génica y asignación de recursos, deben todos ser sometidos a un pensamiento inspirado en los requerimientos de la ciudadanía, en el bien común y en la definición del rol del Estado en fiscalizar actividades genéticas y en proteger a la población. El objetivo del estudio es mostrar cómo el amplio campo de la ética y de la genética tiene una mayor relevancia en el campo social que en el clínico. El objetivo del trabajo es señalar que la bioética principialista ha enfatizado los problemas éticos individuales que nacen con la intervención genética, a costa de marginar sus importantes repercusiones sociales.

Estrategias genómicas y moleculares para el control de la babesiosis bovina

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Juan Joel Mosqueda Gualito

2012-01-01

Full Text Available El control de la babesiosis bovina en muchas partes del mundo está restringido al tratamiento quimioterapéutico y al control de la población de garrapatas con agentes acaricidas. No hay programas de control basados en estudios de inmunidad de hato, control integral de la garrapata y las enfermedades que transmite, ni vacunas contra la babesiosis disponibles comercialmente. Para poder desarrollar estas herramientas es necesario utilizar tecnologías que incluyan conocimientos de genómica, proteómica y bioinformática, apoyadas en la investigación de genes con potencial diagnóstico o vacunal. El estudio de la función de los genes, y de la conservación o variabilidad son indispensables para determinar su utilidad. Es necesario, primero identificar los genes con potencial a incluirse en el desarrollo de estas herramientas, y después, evaluar su variabilidad o conservación en distintas poblaciones de parásitos. En segundo término, es necesario seleccionar regiones específicas de estos genes, que cumplan la función deseada, ya sean regiones conservadas o diferentes entre cepas. Finalmente, es necesario utilizar el método adecuado de evaluación de estos candidatos para el desarrollo de métodos de control adecuados. A pesar de que hay ciertos avances en el estudio de genes de B. bovis, hay prácticamente nula información respecto a B. bigemina. Es necesario aprovechar las nuevas estrategias genómicas y de bioinformática para identificar nuevos genes con potencial diagnóstico y de vacunación. El desarrollo de la ganadería mexicana está supeditado al establecimiento e implementación de estas herramientas.

FRECUENCIAS ALELICAS Y GENOTIPICAS DEL GEN KAPPA CASEINA EN BOVINOS DE DOBLE PROPOSITO

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Nohémi Gabriela Cortes López

2012-01-01

Full Text Available En este trabajo, las frecuencias alélicas (A y B del gen CAS se determinaron como criterio de selección en la calidad de la leche en el ganado bovino de doble propósito. Se tomaron muestras sanguíneas de 200 hembras bovinas y se colocaron en tubos que contenían EDTA. Se amplifico el marcador MB002 a partir de material genético extraído. Los RFLP se realizaron con la enzima de restricción Hinf I para el diagnóstico de los alelos A y B en CASκ. Las frecuencias genotípicas obtenidas correspondían a 0.34, 0.01 y 0.65 para los alelos AA, BB y AB, respectivamente. Las frecuencias alélicas fueron de 0.67 y 0.33 para los alelos A y B, respectivamente. Además, se registró una heterocigosidad promedio de 0.6481. La población es estudio no se encuentra en equilibrio Hardy Weinberg, el valor ji cuadrada fue de 2 = 14.8 con 2 grados de libertad (P < 0.005. Basado en la frecuencia alélica de CAS  B (0.34 observada en este estudio, el ganado de doble propósito puede ser una opción viable para aumentar la calidad de la leche si se utilizan sementales con el genotipo BB para el cruce. De esta manera, los alelos B asociados a la calidad de la leche pueden mejorarse en pocas generaciones.

Optimal trading strategy for GenCo in LMP-based and bilateral ...

African Journals Online (AJOL)

cboonchu

GenCo) ... In Li and Shahidehpour (2005), a game-based bidding strategy for GenCos with ..... With the different demands, dispatched levels of GenCos vary as shown in Table 6. .... optimisation, AI applications to power systems, and power system ...

História da genética no Brasil: um olhar a partir do Museu da Genética da Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Vanderlei Sebastiao de Souza

2013-06-01

Full Text Available Aborda o contexto de criação do Museu da Genética, em 2011 no Departamento de Genética na Universidade Federal do Rio Grande do Sul, em Porto Alegre, e apresenta sua estrutura e conteúdo. Argumenta-se que os materiais disponibilizados no Museu da Genética constituem uma rica fonte para pesquisas sobre a história da genética no Brasil (e da genética de populações humanas em particular a partir da segunda metade do século XX, tema ainda pouco investigado, apesar da proeminência dessa área do conhecimento no Brasil.

Manipulación genética de seres humanos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Manuel Santos Alcántara

2006-08-01

Full Text Available El gran avance que ha tenido la Genética en los últimos años y, particularmente, aquello relacionado con el desciframiento del genoma humano, ha traído a la discusión pública la posibilidad concreta de manipular genéticamente a los seres humanos. El mejoramiento o perfeccionamiento genético de los seres humanos, denominado eugenesia, actualmente se ha convertido técnicamente en una realidad, motivando una profunda reflexión de tipo ético. La pregunta básica es la siguiente: aquello que es técnicamente posible de realizar ¿es ético hacerlo? ¿Tienen derecho los padres a acceder a la tecnología genética para mejorar las características de sus hijos? En este artículo se revisan las bases científicas del mejoramiento genético de los seres humanos, y se plantean los cuestionamientos éticos más relevantes derivados de esta manipulación.

Programa nacional de prevención y consejería genética del retinoblastoma mediante detección de mutaciones en el gen RB.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

H. Frayle

2001-07-01

una la doble mutación inactivante del gen Rb, exclusivamente somática en los esporádicos y germinal más somática en los hereditarios. Esta investigacin tuvo como objetivo caracterizar las mutaciones en el gen Rb mediante secuenciación directa y evaluar su utilidad en la consejería genética.

Programa nacional de prevención y consejería genética del retinoblastoma mediante detección de mutaciones en el gen rb.

OpenAIRE

Frayle, H.; Guevara, G.

2011-01-01

El retinoblastoma es un raro tumor ocular que se diagnostica en los niños, 40% de los casos se consideran hereditarios y 60% esporádicos. El modelo genético propuesto por Knudson involucra
una la doble mutación inactivante del gen Rb, exclusivamente somática en los esporádicos y germinal más somática en los hereditarios. Esta investigacin tuvo como objetivo caracterizar las mutaciones en el gen Rb mediante secuenciación directa y evaluar su utilidad en la consejería genética....

Composición genética de una población del suroccidente de Colombia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Liliana Córdoba

2012-01-01

Full Text Available La población actual del departamento del Cauca es el resultado de la mezcla de tres poblaciones parentales (europea, amerindia y africana. En este estudio se determinó la composición genética de 306 residentes del departamento mediante la utilización de 34 variantes autosómicas, 9 variantes en el cromosoma X, 6 en el ADNmt y 8 en el cromosoma Y. Los análisis de las variantes autosómicas y del cromosoma X revelaron que la población europea y la amerindia han contribuido en mayor proporción al actual acervo genético de la población estudiada. Los resultados de las variantes en el ADNmt y del cromosoma Y sugieren un fuerte sesgo sexual (flujo génico asimétrico en el proceso de mezcla, en el que los cruces interétnicos fueron principalmente entre los colonizadores europeos y las mujeres nativas.

Predisposição genética, hereditariedade e reabsorções radiculares em Ortodontia: cuidados com interpretações precipitadas: uma análise crítica do trabalho de Al-Qawasmi et al Genetics predisposition, heredity and radicular resorption, in Orthodontics: cares with precipitated interpretations and a critical analysis of Al-Qawasmi´s work

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Alberto Consolaro

2004-05-01

Full Text Available O trabalho de Al-Qawasmi et al.¹, publicado em março de 2003 pelo American Journal of Orthodontics and Dentofacial Orthopedics, procurou estabelecer uma predisposição genética para justificar as reabsorções dentárias em Ortodontia, mas apresentou algumas limitações metodológicas e equívocos na interpretação de seus resultados. A análise criteriosa deste artigo ressalta que, na maioria, estas limitações foram mencionadas e reconhecidas pelos autores na discussão do trabalho, mas o seu resumo e título foram muito taxativos e conclusivos. A linguagem de estudos genéticos nem sempre é familiar a todos os clínicos e isto também requer uma análise esclarecedora à luz de uma visão mais aplicada ao cotidiano ortodôntico. Referenciar ou citar este trabalho de Al-Qawasmi et al.¹, para afirmar de forma taxativa que se demonstrou a natureza hereditária das reabsorções dentárias em Ortodontia, pode denotar falta de conhecimento sobre o assunto ou uma leitura ou compreensão apenas do seu título. Ou ainda, a citação deste trabalho como prova definitiva de associação entre hereditariedade e reabsorções dentárias em Ortodontia pode traduzir também o desejo de excluir da prática clínica a responsabilidade de planejar de forma individualizada e detalhada cada tratamento com base no conhecimento das possibilidades e limitações técnicas oferecidas pela ciência ortodôntica, bem como nas suas bases biológicas, por exemplo, valorizando a morfologia radicular e da crista óssea alveolar e o papel dos cementoblastos na proteção da superfície radicular.The study published in the American Journal of Orthodontics and Dentofacial Orthopedics last March by Al-Qawasmi et al. tried to implicate dental resorption during orthodontic treatment to genetic predisposition. The methodology used, however, presents limitations and interpretative mistakes of the results. When analyzing the article sensibly, one is able to find that

Frecuencia de mutaciones en el gen de la usherina (USH2A) en 26 individuos colombianos con síndrome de Usher, tipo II

OpenAIRE

López, Greizy; Gelvez, Nancy Yaneth; Tamayo, Martalucía

2011-01-01

Introducción. El síndrome de Usher se caracteriza por hipoacusia neurosensorial congénita, retinitis pigmentaria y disfunción vestibular. Es la causa más frecuente de sordo-ceguera en el mundo. Se divide en tres tipos clínicos y doce subtipos genéticos. El tipo II es la forma más común y cerca de 80 % de los casos corresponden al subtipo 2 del síndrome de Usher. Objetivo. Establecer la frecuencia de mutaciones en la isoforma corta del gen USH2A en individuos colombianos con síndrome de Usher,...

Frecuencia de mutaciones en el gen de la usherina (USH2A) en 26 individuos colombianos con síndrome de Usher, tipo II

OpenAIRE

Greizy López; Nancy Yaneth Gelvez; Martalucía Tamayo

2011-01-01

Introducción. El síndrome de Usher se caracteriza por hipoacusia neurosensorial congénita, retinitis pigmentaria y disfunción vestibular. Es la causa más frecuente de sordo-ceguera en el mundo. Se divide en tres tipos clínicos y doce subtipos genéticos. El tipo II es la forma más común y cerca de 80 % de los casos corresponden al subtipo 2 del síndrome de Usher. Objetivo. Establecer la frecuencia de mutaciones en la isoforma corta del gen USH2A en individuos colombianos con síndrome de Ush...

Tipificación de marcadores genéticos sanguíneos en raza Hereford

OpenAIRE

Quinteros, Indalecio Rodolfo; Tejedor, Eugenio Daniel; Poli, Mario Andrés; Antonini de Ruiz, Alicia Graciela

1981-01-01

El paso inicial de esta investigación ha sido tipificar al Bovino Hereford de Argentina para definirlo mediante la metodología de la Inmunogenética. Se buscaron "expresiones" propias y coincidencias con los "marcadores genéticos sanguíneos" descubiertos en esta raza por otros países. Su gran adaptabilidad a "hábitats" diferentes induce a mantener intacto su germoplasma y enriquecerlo con el agregado de nuevos genes. No obstante su homogeneidad racial, el Hereford Argentino presenta destacado ...

GenBank.

OpenAIRE

Benson, D; Lipman, D J; Ostell, J

1993-01-01

The GenBank sequence database has undergone an expansion in data coverage, annotation content and the development of new services for the scientific community. In addition to nucleotide sequences, data from the major protein sequence and structural databases, and from U.S. and European patents is now included in an integrated system. MEDLINE abstracts from published articles describing the sequences provide an important new source of biological annotation for sequence entries. In addition to ...

Gen IV Materials Handbook Implementation Plan

International Nuclear Information System (INIS)

Rittenhouse, P.; Ren, W.

2005-01-01

A Gen IV Materials Handbook is being developed to provide an authoritative single source of highly qualified structural materials information and materials properties data for use in design and analyses of all Generation IV Reactor Systems. The Handbook will be responsive to the needs expressed by all of the principal government, national laboratory, and private company stakeholders of Gen IV Reactor Systems. The Gen IV Materials Handbook Implementation Plan provided here addresses the purpose, rationale, attributes, and benefits of the Handbook and will detail its content, format, quality assurance, applicability, and access. Structural materials, both metallic and ceramic, for all Gen IV reactor types currently supported by the Department of Energy (DOE) will be included in the Gen IV Materials Handbook. However, initial emphasis will be on materials for the Very High Temperature Reactor (VHTR). Descriptive information (e.g., chemical composition and applicable technical specifications and codes) will be provided for each material along with an extensive presentation of mechanical and physical property data including consideration of temperature, irradiation, environment, etc. effects on properties. Access to the Gen IV Materials Handbook will be internet-based with appropriate levels of control. Information and data in the Handbook will be configured to allow search by material classes, specific materials, specific information or property class, specific property, data parameters, and individual data points identified with materials parameters, test conditions, and data source. Details on all of these as well as proposed applicability and consideration of data quality classes are provided in the Implementation Plan. Website development for the Handbook is divided into six phases including (1) detailed product analysis and specification, (2) simulation and design, (3) implementation and testing, (4) product release, (5) project/product evaluation, and (6) product

Aplicación móvil para la enseñanza de genética

OpenAIRE

Calvo Ramón, María Teresa; Díaz Márquez, Gian Marco; Sanz Cepeda, Ana

2016-01-01

El presente trabajo tiene su origen en la necesidad de herramientas de apoyo al aprendizaje para los alumnos en las clases de Genética de la Facultad de Biología de la Universidad Complutense de Madrid. En esta asignatura, el equipo docente ha desarrollado aplicaciones para dispositivos móviles destinadas a los alumnos. Las aplicaciones les permiten trabajar con materiales relacionados con aspectos clave de la asignatura. Estas aplicaciones contienen apartados de teoría y ejercicios. Los ejer...

Algoritmos para genómica comparativa

OpenAIRE

Figueiras, Vasco da Rocha

2010-01-01

Com o surgimento da Genómica e da Proteómica, a Bioinformática conduziu a alguns dos avanços científicos mais relevantes do século XX. A Unidade de Investigação e Desenvolvimento do Biocant, parque biotecnológico de Cantanhede, assume actualmente o papel de motor no desenvolvimento da Genómica. O Biocant possui um importante sequenciador de larga escala que permite armazenar um elevado número de genomas, nomeadamente, genomas de bactérias. O estudo proposto reflecte a necessidade do Bio...

Trifurcatia flabellata n. gen. n. sp., a putative monocotyledon angiosperm from the Lower Cretaceous Crato Formation (Brazil

Directory of Open Access Journals (Sweden)

B. Mohr

2002-01-01

Full Text Available The Lower Cretaceous Crato Formation (northeast Brazil contains plant remains, here described as Trifurcatia flabellata n. gen. and n. sp., consisting of shoot fragments with jointed trifurcate axes, each axis bearing a single amplexicaul serrate leaf at the apex. The leaves show a flabellate acrodromous to parallelodromous venation pattern, with several primary, secondary and higher order cross-veins. This very unique fossil taxon shares many characters with monocots. However, this fossil taxon exhibits additional features which point to a partly reduced, and specialized plant, which probably enabled this plant to grow in (seasonally dry, even salty environments. In der unterkretazischen Cratoformation (Nordostbrasilien sind Pflanzenfossilien erhalten, die hier als Trifurcatia flabellata n. gen. n. sp. beschrieben werden. Sie bestehen aus trifurcaten Achsen, mit einem apikalen amplexicaulen fächerförmigen serraten Blatt. Diese Blätter zeigen eine flabellate bis acrodrome-paralellodrome Aderung mit Haupt- und Nebenadern und transversale Adern 3. Ordnung. Diese Merkmale sind typisch für Monocotyledone. Allerdings weist dieses Taxon einige Merkmale auf, die weder bei rezenten noch fossilen Monocotyledonen beobachtet werden. Sie müssen als besondere Anpassungen an einen (saisonal trockenen und vielleicht übersalzenen Lebensraum dieser Pflanze interpretiert werden. doi:10.1002/mmng.20020050121

Fowlpoxvirus recombinants coding for the CIITA gene increase the expression of endogenous MHC-II and Fowlpox Gag/Pro and Env SIV transgenes.

Science.gov (United States)

Bissa, Massimiliano; Forlani, Greta; Zanotto, Carlo; Tosi, Giovanna; De Giuli Morghen, Carlo; Accolla, Roberto S; Radaelli, Antonia

2018-01-01

A complete eradication of an HIV infection has never been achieved by vaccination and the search for new immunogens that can induce long-lasting protective responses is ongoing. Avipoxvirus recombinants are host-restricted for replication to avian species and they do not have the undesired side effects induced by vaccinia recombinants. In particular, Fowlpox (FP) recombinants can express transgenes over long periods and can induce protective immunity in mammals, mainly due to CD4-dependent CD8+ T cells. In this context, the class II transactivator (CIITA) has a pivotal role in triggering the adaptive immune response through induction of the expression of class-II major histocompatibility complex molecule (MHC-II), that can present antigens to CD4+ T helper cells. Here, we report on construction of novel FPgp and FPenv recombinants that express the highly immunogenic SIV Gag-pro and Env structural antigens. Several FP-based recombinants, with single or dual genes, were also developed that express CIITA, driven from H6 or SP promoters. These recombinants were used to infect CEF and Vero cells in vitro and determine transgene expression, which was evaluated by real-time PCR and Western blotting. Subcellular localisation of the different proteins was evaluated by confocal microscopy, whereas HLA-DR or MHC-II expression was measured by flow cytometry. Fowlpox recombinants were also used to infect syngeneic T/SA tumour cells, then injected into Balb/c mice to elicit MHC-II immune response and define the presentation of the SIV transgene products in the presence or absence of FPCIITA. Antibodies to Env were measured by ELISA. Our data show that the H6 promoter was more efficient than SP to drive CIITA expression and that CIITA can enhance the levels of the gag/pro and env gene products only when infection is performed by FP single recombinants. Also, CIITA expression is higher when carried by FP single recombinants than when combined with FPgp or FPenv constructs and can

Medicamentos genéricos y de marca-Calidad e intercambiabilidad

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Rua F.

2012-03-01

Full Text Available El interés por los medicamentos genéricos procede de la necesidad de los sistemas sanitarios de reducir la factura sanitaria sin merma de los objetivos de salud. Su expansión y uso requieren la aceptación de la población y de los profesionales. También requieren que se despejen algunas dudas sobre su verdadera equivalencia respecto a los medicamentos originales. Desde su introducción en el mercado farmacéutico existe el debate de si son correctamente investigados y de alta calidad. No son infrecuentes los conceptos equivocados entre los profesionales sobre los genéricos, en especial, el supuesto hecho de que pueden llegar a contener hasta un 20% menos de concentración en principio activo. Estas creencias erróneas sugieren una situación de desventaja en la eficacia y la tolerabilidad de los medicamentos genéricos comparados con sus equivalentes de marca, disminuyendo la credibilidad de los mismos. Así, en una encuesta realizada en 2008 los farmacéuticos opinaron que los genéricos y las marcas son diferentes en eficacia (26%, equivalencia (28% y, sobre todo, en la calidad del excipiente (46%, aumentando la percepción de que los genéricos son diferentes en función del laboratorio que los fabrica (52,8%. En este artículo, con el fin de ampliar los conocimientos sobre medicamentos genéricos, solucionar dudas y proporcionar información, objetiva, clara y rigurosa, se revisan los posibles prejuicios sobre genéricos y se exponen las evidencias que existen en torno a los mismos, como los requisitos de bioequivalencia de los productos genéricos, analizando si ésta corrobora adecuadamente la equivalencia terapéutica y de intercambio.

Université de Genève

CERN Multimedia

2008-01-01

Ecole de physique - Département de physique nucléaire et corspusculaire 24, quai Ernest-Ansermet 1211 GENÈVE 4 Tél: (022) 379 62 73 - Fax: (022) 379 69 92 Lundi 1er décembre 2008 PARTICLE PHYSICS SEMINAR at 17.00 hrs – Stückelberg Auditorium Superconducting Interfaces between Insulating Oxide Prof. Jean-Marc TRISCONE / Université de Genève At interfaces between complex oxides, electronic systems with unusual properties can be generated. A striking example is the interface between LaAlO3 and SrTiO3, two good insulating perovskite oxides, which was found in 2004 to be conducting with a high mobility. We recently discovered that the ground state of this system is a superconducting condensate, with a critical temperature of about 200 mK. The characteristics observed for the superconducting transitions are consistent with a two-dimensional superconducting sheet as thin as a few nanometers. Recent field effect experiments revealed the sensitivity of the normal and superconducting states to the carrier d...

Université de Genève

CERN Multimedia

2008-01-01

Ecole de physique - Département de physique nucléaire et corspusculaire 24, quai Ernest-Ansermet - 1211 GENÈVE 4 Tél: (022) 379 62 73 - Fax: (022) 379 69 92 Lundi 1er décembre 2008 PARTICLE PHYSICS SEMINAR at 17.00 hrs – Stückelberg Auditorium Superconducting Interfaces between Insulating Oxide Prof. Jean-Marc TRISCONE / Université de Genève At interfaces between complex oxides, electronic systems with unusual properties can be generated. A striking example is the interface between LaAlO3 and SrTiO3, two good insulating perovskite oxides, which was found in 2004 to be conducting with a high mobility. We recently discovered that the ground state of this system is a superconducting condensate, with a critical temperature of about 200 mK. The characteristics observed for the superconducting transitions are consistent with a two-dimensional superconducting sheet as thin as a few nanometers. Recent field effect experiments revealed the sensitivity of the normal and superconducting states to the carrier ...

Sobre el significado del descubrimiento del gen FOXP2

OpenAIRE

Longa Martínez, Víctor Manuel

2006-01-01

El reciente descubrimiento del gen FOXP2 ha ofrecido la primera evidencia clara de la base genética del lenguaje, mostrando una correlación inequívoca desde la perspectiva genética entre una versión mutada de F0XP2 y los trastornos lingüísticos de diferente tipo sufridos por una familia inglesa, conocida como KE. El objetivo central del presente trabajo es discutir diferentes aspectos relacionados con tal descubrimiento; especialmente, la discusión del significado de FOXP2 con ...

Revision of Corallinaceae (Corallinales, Rhodophyta): recognizing Dawsoniolithon gen. nov., Parvicellularium gen. nov. and Chamberlainoideae subfam. nov. containing Chamberlainium gen. nov. and Pneophyllum.

Science.gov (United States)

Caragnano, Annalisa; Foetisch, Alexandra; Maneveldt, Gavin W; Millet, Laurent; Liu, Li-Chia; Lin, Showe-Mei; Rodondi, Graziella; Payri, Claude E

2018-03-25

A multi-gene (SSU, LSU, psbA and COI) molecular phylogeny of the family Corallinaceae (excluding the subfamilies Lithophylloideae and Corallinoideae) showed a paraphyletic grouping of six monophyletic clades. Pneophyllum and Spongites were reassessed and recircumscribed using DNA sequence data integrated with morpho-anatomical comparisons of type material and recently collected specimens. We propose Chamberlainoideae subfam. nov., including the type genus Chamberlainium gen. nov., with C. tumidum comb. nov. as the generitype, and Pneophyllum. Chamberlainium is established to include several taxa previously ascribed to Spongites, the generitype of which currently resides in Neogoniolithoideae. Additionally we propose two new genera, Dawsoniolithon gen. nov. (Metagoniolithoideae), with D. conicum comb. nov. as the generitype and Parvicellularium gen. nov. (subfamily incertae sedis), with P. leonardi sp. nov. as the generitype. Chamberlainoideae has no diagnostic morpho-anatomical features that enable one to assign specimens to it without DNA sequence data, and it is the first subfamily to possess both Type 1 (Chamberlainium) and Type 2 (Pneophyllum) tetra/bisporangial conceptacle roof development. Two characters distinguish Chamberlainium from Spongites: tetra/biasporangial conceptacle chamber diameter (300 μm in Spongites) and tetra/bisporangial conceptacle roof thickness (8 cells in Spongites). Two characters also distinguish Pneophyllum from Dawsoniolithon: tetra/bisporangial conceptacle roof thickness (8 cells in Dawsoniolithon) and thallus construction (dimerous in Pneophyllum vs. monomerous in Dawsoniolithon). This article is protected by copyright. All rights reserved. This article is protected by copyright. All rights reserved.

Modelo para la determinación de los marcadores genéticos de la respuesta inmunitaria en poblaciones colombianas

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Edmond J. Yunis

1988-08-01

Full Text Available

Basados en nuestra experiencia, es posible estudiar factores genéticos del complejo mayor de histocompatibilidad (CMH en varias enfermedades inmunológicas, o también factores genéticos que influyen en la falta de respuesta inmunitaria a vacunas como la hepatitis B. Los alelos de diferentes loci del CMH sirven por sí mismos para identificar riesgos para enfermedades o falta de respuesta a vacunas. El bloque de genes del CMH, que pueden existir al nivel de la población, en desequilibrio de enlace genético, es un mayor marcador para estudiar la susceptibilidad genética a enfermedades como las atopías así como también la falta de respuesta a vacunas. Nosotros proponemos que un estudio inmunogenético de poblaciones colombianas, podría utilizarse como control para identificar susceptibilidad genética para el desarrollo de atopías a los ácaros del polvo y a los hongos (mohos, que son alergenos comunes en Colombia. También, la existencia de una gran susceptibilidad para la hepatitis delta en la región norte de Colombia, indica que un estudio inmunogenético de identificación de haplotipos colombianos asociados con la falta de respuesta a la vacuna contra la hepatitis B serían muy útiles.

La identificación de individuos que no responden a vacunas comunes, sugeriría que ellos son más susceptibles a adquirir la hepatitis. En consecuencia, será necesario desarrollar otras vacunas con diferentes ntígenos para proteger a esa población.

Absence of A3Z3-Related Hypermutations in the env and vif Proviral Genes in FIV Naturally Infected Cats

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Lucía Cano-Ortiz

2018-05-01

Full Text Available Apolipoprotein B mRNA-editing enzyme catalytic polypeptide-like 3 (APOBEC3; A3 proteins comprise an important family of restriction factors that produce hypermutations on proviral DNA and are able to limit virus replication. Vif, an accessory protein present in almost all lentiviruses, counteracts the antiviral A3 activity. Seven haplotypes of APOBEC3Z3 (A3Z3 were described in domestic cats (hap I–VII, and in-vitro studies have demonstrated that these proteins reduce infectivity of vif-defective feline immunodeficiency virus (FIV. Moreover, hap V is resistant to vif-mediated degradation. However, studies on the effect of A3Z3 in FIV-infected cats have not been developed. Here, the correlation between APOBEC A3Z3 haplotypes in domestic cats and the frequency of hypermutations in the FIV vif and env genes were assessed in a retrospective cohort study with 30 blood samples collected between 2012 and 2016 from naturally FIV-infected cats in Brazil. The vif and env sequences were analyzed and displayed low or undetectable levels of hypermutations, and could not be associated with any specific A3Z3 haplotype.

Biometria e armazenamento de sementes de genótipos de cacaueiro

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Lucimara Ribeiro Venial

2017-03-01

Full Text Available Genótipos de Theobroma cacao L. devem ser melhor estudados, para se identificar aqueles que produzem sementes mais desenvolvidas e viáveis após o armazenamento. Objetivou-se com este trabalho estudar a biometria e dois tempos de armazenamento de sementes de genótipos de cacaueiro. A biometria foi avaliada em oito genótipos de cacaueiro (tratamentos. Foram instalados testes de germinação em delineamento inteiramente ao acaso, no esquema fatorial 8 x 2 (genótipos: CCN51, PH16, CEPEC2002, Ipiranga, SJ02, PS1319, TSH1188 e Comum x dois períodos de armazenamento: 0 e dois dias. O genótipo TSH1188 apresentou maior comprimento, relação comprimento/largura, espessura e massa de 100 sementes. A absorção de água das sementes recém-colhidas dos genótipos é lenta, justificada pelos altos teores de água, o que não caracteriza padrão-trifásico. Os teores de água reduziram em média 2,3 vezes nas sementes armazenadas em relação às recém-colhidas. A germinação das sementes recém-colhidas dos genótipos foi de 100%. Após o armazenamento, as sementes do PS1319 apresentaram a menor redução da germinação (39%, enquanto as dos PH16, CEPEC2002 e SJ02 reduziram 96%. A velocidade de germinação foi maior e o tempo médio menor que dois dias nas sementes recém-colhidas do PS1319, indicando serem mais tolerante à dessecação. Sugere-se o uso dos genótipos TSH1188 e PS1319 em programas de melhoramento genético.

Enfermedades genéticas más frecuentes en pacientes atendidos en consulta de genética clínica

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Elibett Carcasés Carcasés

2015-02-01

Full Text Available La estimación de la prevalencia de las enfermedades genéticas se dificulta, entre otras causas, por su rareza. Se realizó un estudio descriptivo retrospectivo, para identificar las enfermedades genéticas de mayor prevalencia en pacientes atendidos por este programa en el Centro Provincial de Genética Médica de Las Tunas, Cuba; desde el año 1989 hasta julio de 2014. Se revisaron todas las historias clínicas. Predominó el origen monogénico (69 %, siendo los síndromes dismórficos los más numerosos y diversos, entre ellos los neurocutáneos, que representaron el 35 %. La enfermedad genética monogénica con mayor número de casos fue la Neurofibromatosis I con el 14,4 % y el 22,2 % de las enfermedades eran de origen monogénico y dismórfico. La Trisomía 21 representó el 77 % de la causa cromosómica. En el origen multifactorial prevalecieron los defectos congénitos mayores, entre ellos los defectos reductivos de miembros (27 %

Vaccine-Induced Plasma IgA Specific for the C1 Region of the HIV-1 Envelope Blocks Binding and Effector Function of IgG

Science.gov (United States)

2013-05-28

vaccines containing ALVAC-HIV (vCP1521) (Sanofi Pasteur ) and AIDSVAX B/E (Global Solutions for Infectious Diseases, South San Francisco, CA). Peripheral...Renilla luciferase reporter gene and preserves all viral ORFs (30). The Env-IMC-LucR viruses were subtype A/E NL-LucR.T2A-AE.CM235-ecto (IMCCM235; GenBank

EPCGen2 Pseudorandom Number Generators: Analysis of J3Gen

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Alberto Peinado

2014-04-01

Full Text Available This paper analyzes the cryptographic security of J3Gen, a promising pseudo random number generator for low-cost passive Radio Frequency Identification (RFID tags. Although J3Gen has been shown to fulfill the randomness criteria set by the EPCglobal Gen2 standard and is intended for security applications, we describe here two cryptanalytic attacks that question its security claims: (i a probabilistic attack based on solving linear equation systems; and (ii a deterministic attack based on the decimation of the output sequence. Numerical results, supported by simulations, show that for the specific recommended values of the configurable parameters, a low number of intercepted output bits are enough to break J3Gen. We then make some recommendations that address these issues.

Introducing AstroGen: The Astronomy Genealogy Project

OpenAIRE

Tenn, Joseph S.

2016-01-01

The Astronomy Genealogy Project ("AstroGen"), a project of the Historical Astronomy Division of the American Astronomical Society (AAS), will soon appear on the AAS website. Ultimately, it will list the world's astronomers with their highest degrees, theses for those who wrote them, academic advisors (supervisors), universities, and links to the astronomers or their obituaries, their theses when on-line, and more. At present the AstroGen team is working on those who earned doctorates with ast...

Genética humana e sociedade

OpenAIRE

Rosa, Vivian Leyser da

2000-01-01

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Educação. Análise do campo de estudos sobre o entendimento público da ciência, distinguindo os modelos de deficit cognitivo e interativo, bem como suas implicações na esfera educacional. Estudo do panorama dos avanços atuais da genética humana, do ponto de vista científico, ético e social. Análise de aspectos relativos ao ensino de genética humana nos cursos de graduação da área da saúde, em nove Universidades...

Manipulación genética de seres humanos

OpenAIRE

Manuel Santos Alcántara

2006-01-01

El gran avance que ha tenido la Genética en los últimos años y, particularmente, aquello relacionado con el desciframiento del genoma humano, ha traído a la discusión pública la posibilidad concreta de manipular genéticamente a los seres humanos. El mejoramiento o perfeccionamiento genético de los seres humanos, denominado eugenesia, actualmente se ha convertido técnicamente en una realidad, motivando una profunda reflexión de tipo ético. La pregunta básica es la siguiente: aquello que es téc...

Frecuencia de mutaciones en el gen de la usherina (USH2A en 26 individuos colombianos con síndrome de Usher, tipo II

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Greizy López

2011-04-01

Conclusiones. Se logró establecer que, al menos, 38 % de la población analizada con síndrome de Usher, tipo II, presenta alguna mutación en la isoforma corta del gen de la usherina. El diagnóstico molecular se logró establecer en el 23 %.

Differences in Allelic Frequency and CDRH3 Region Limit the Engagement of HIV Env Immunogens by Putative VRC01 Neutralizing Antibody Precursors

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Christina Yacoob

2016-11-01

Full Text Available Elicitation of broadly neutralizing antibodies remains a long-standing goal of HIV vaccine research. Although such antibodies can arise during HIV-1 infection, gaps in our knowledge of their germline, pre-immune precursor forms, as well as on their interaction with viral Env, limit our ability to elicit them through vaccination. Studies of broadly neutralizing antibodies from the VRC01-class provide insight into progenitor B cell receptors (BCRs that could develop into this class of antibodies. Here, we employed high-throughput heavy chain variable region (VH/light chain variable region (VL deep sequencing, combined with biophysical, structural, and modeling antibody analyses, to interrogate circulating potential VRC01-progenitor BCRs in healthy individuals. Our study reveals that not all humans are equally predisposed to generate VRC01-class antibodies, not all predicted progenitor VRC01-expressing B cells can bind to Env, and the CDRH3 region of germline VRC01 antibodies influence their ability to recognize HIV-1. These findings will be critical to the design of optimized immunogens that should consider CDRH3 interactions.

Análisis de la diversidad genética de 21 aislamientos del hongo Moniliophthora roreri basado en marcadores RAPD

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Boris Gutarra Castillo

2013-12-01

Full Text Available Objetivos: Estudiar la diversidad genética de 21 aislamientos del hongo que afecta al cultivo del cacao, Moniliophthora roreri, en tres zonas cacaoteras del Perú (Tocache, Mariscal Cáceres y Leoncio Prado. Métodos: Se utilizó 14 iniciadores RAPD (random amplified polymorphic DNA polimórficos y una pareja de oligonucleótidos, los que fueron empleados bajo condiciones de amplificación estandarizadas. Con los datos obtenidos se construyó un dendograma utilizando el coeficiente de Jaccard y el algoritmo UPGMA (Unweighted Pair-Group Method using Arithmetic Average. La estructura genética fue estimada en función del análisis molecular de variancia (AMOVA y la diversidad mediante los índices de Shannon y Nei. Resultados: Fueron conseguidas 59 bandas RAPD con un 73% de polimorfismo. El dendograma obtenido a un índice de similitud de 0,70, claramente dividió los individuos en tres grupos. El análisis de la diversidad genética mostró altos valores en las zonas estudiadas de acuerdo con el índice de Shannon (0,3936 y de Nei (0,2622, con mayor riqueza en Leoncio Prado. Estas zonas presentan alta variabilidad, y según el AMOVA realizado: 88% entre accesiones por zona y solo 12% entre zonas. Conclusiones: Existe más de un grupo genético de Moniliophthora roreri en la Amazonía del Perú. Estos grupos, provenientes del Ecuador, pudieron haber ingresado por el intercambio de semillas y/o de forma natural por medio de los ríos en común y estarían originando nuevos grupos genéticos locales.

Microsatélites amplificados al azar (RAM en estudios de diversidad genética vegetal Random amplified microsatellites (RAM´s in plant genetic diversity studies

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jaime Eduardo Muñoz Flórez

2008-12-01

Full Text Available Se revisó el uso e importancia, ventajas, desventajas y características de la técnica Microsatélites Amplificados al Azar (RAM en uchuva Physalis peruviana, mora Rubus spp, guayaba Psidium guajava y heliconias Heliconia spp. En mora se diferenciaron las especies R. glaucus, R. robustus y R. urticifolius, se detectaron duplicados y se encontró alta variabilidad genética en R. glaucus, la especie más importante. En uchuva se encontró alta diversidad y dos accesiones de fruto rojo que se diferenciaron genéticamente de las amarillas y una región geográfica con alta variabilidad. En guayaba los cebadores fueron altamente polimórficos y se encontró alta variabilidad en el Valle del Cauca. En heliconias y especies relacionadas se diferenciaron las familias del orden Zingiberales, algunos subgéneros y variaciones en la especie. La técnica es de bajo costo, utiliza un cebador, no requiere información previa, es altamente polimórfica y diferencia especies en los taxones evaluados.The use and importance, advantages, disadvantages and features of the Random Amplified Microsatellites RAMs technique, were reviewed in Cape gooseberry Physalis peruviana, blackberry Rubus spp, guava Psidium guajava and heliconias Heliconia spp. In blackberry, we differentiated the species R. glaucus, R. robustus y R. urticifolius, detected duplicated accessions and found high genetic diversity in R. glaucus, the most important specie. In cape gooseberry we found high diversity and two red fruit accessions genetically differentiated from the yellow fruit ones and a geographical region with high variability. In guava, primers were highly polymorphic and found high variability in Valle del Cauca region. In Heliconia and related species we differentiated families belonging to Zingiberal order, between some sub genera and variation among specie. The technique has low cost of implementation, use a single primer, do not require previous information, is highly

Avances en investigación de la discapacidad intelectual de origen genético: tratamientos experimentales en el síndrome X frágil

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Yolanda de Diego Otero

2017-06-01

Full Text Available De Diego Otero, Y. et al. (2017: “Avances en investigación de la discapacidad intelectual de origen genético: tratamientos experimentales en el síndrome X frágil”. Revista Española de Discapacidad, 5 (I: 217-227.

Detección de Leishmania spp. en base al gen que codifica la proteína HSP20

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Ana M Montalvo

Full Text Available Objetivos. Explorar una nueva diana para el diagnóstico molecular de Leishmania. Materiales y métodos. Se evaluó la utilidad del gen que codifica la proteína de choque térmico de 20kDa (hsp20 para la detección de Leishmania por medio de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR.Se normalizó la PCR y se determinaron los parámetros analíticos, así como la validez y seguridad diagnóstica y la concordancia con la PCR-18S. Se evaluó la PCR-hsp20 con ADN obtenido de un grupo de muestras clínicas de distinta procedencia. Resultados. Los parámetros analíticos resultaron adecuados. La sensibilidad obtenida fue de 86% y la especificidad del 100%, la concordancia con el método de referencia resultó buena (κ = 0,731, lo que apoya su posible uso para el diagnóstico. La posibilidad de identificación posterior de la especie mediante secuenciación del producto amplificado le confiere una ventaja adicional. Conclusiones. Se demuestra la utilidad de este gen como una nueva diana para la detección del género Leishmania. Debido a su potencial, se recomienda mejorar la sensibilidad del procedimiento y realizar su evaluación en diversas regiones endémicas.

Diversidad genética, entre y dentro de los mayores grupos humanos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Barbujani, G.

2003-01-01

Full Text Available Varios estudios están de acuerdo cuando reportan que cerca del 85% de la diversidad del ADN autosomal y de los loci de las proteínas se debe a diferencias entre individuos dentro de la misma población, mientras que las diferencias entre los grupos de diferentes continentes son responsables de solamente 10% de la variación genética total. Estos resultados están en conflicto con nociones populares de razas humanas claramente distintas y relativamente homogéneas, y nos hacen cuestionar la utilidad de clasificaciones étnicas en diagnósticos médicos, en el campo forense y en genética farmacológica. Nuevos datos obtenidos de inserciones polimórficas de Alu y del cromosoma Y confirman los resultados previos, aunque indican una diversidad mayor en algunos (pero no todos los loci del cromosoma Y. Estos datos nos permiten investigar dos preguntas: (1 si las diferencias continentales, aunque pequeñas, son suficientemente grandes como para asignar a individuos a sus continentes basados en sus genotipos; (2 si los genotipos observados se agrupan en grupos de población o continentales cuando el origen de la muestra se ignora. Usando varios métodos estadísticos, veremos que los errores de clasificación son por lo menos de un 30% para los polimorfismos autosomales bi-alélicos, y de un 27% para el cromosoma Y. Cuatro series de datos genéticos de todo el mundo sugieren la existencia de grupos de genotipos diferentes, pero que éstos cuatro grupos no coinciden el uno con el otro. Adicionalmente, estudios de bloques de ADN del genoma humano indican que la mayor parte de dichos bloques es compartida entre los continentes, con solamente un pequeño porcentaje siendo específico a ciertos continentes. Estos resultados no indican que haya una base clara para subdividir a los humanos en grupos biológicamente definidos. Este puede no ser un problema en áreas aplicadas de genéticas, dado que los métodos rápidos para obtener genotipos individuales

Genética em transtornos alimentares: ampliando os horizontes de pesquisa

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Pinheiro Andréa Poyastro

2006-01-01

Full Text Available OBJETIVO: Revisar a literatura atual concernente à pesquisa genética em transtornos do comportamento alimentar e discutir questões relevantes ao desenvolvimento de um projeto de pesquisa genética nessa área no Brasil. MÉTODO: A revisão realizada utilizou a base de dados Medline, no período de 1984 a maio de 2005, com os seguintes termos de busca: "anorexia nervosa", "bulimia nervosa", "eating disorders", "binge eating disorder", "family studies", "twin studies", "molecular genetics studies". RESULTADOS: Os dados atuais apontam para uma contribuição relevante dos fatores genéticos na suscetibilidade à anorexia e à bulimia nervosa. A pesquisa genética com populações miscigenadas deve levar em consideração o tamanho da amostra, a densidade de genotipagem e a estratificação populacional. Através de "admixture mapping" é possível estimar a estrutura genética destas populações e localizar genes relacionados à variação étnica de doenças ou traços de interesse. CONCLUSÕES: O desenvolvimento de uma grande iniciativa de colaboração em genética de transtornos alimentares no Brasil e na América Latina viabilizará estudar os fatores genéticos em transtornos do comportamento alimentar no contexto de grupos inter-étnicos, e integrar uma nova perspectiva biológica à etiologia destes distúrbios.

Resistência genética em genótipos de feijoeiro a Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens Genetic resistance to Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens in bean genotypes

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Valmir Luiz de Souza

2006-09-01

Full Text Available Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff agente causal da murcha-de-curtobacterium em feijoeiro (Phaseolus vulgaris, é um patógeno vascular de difícil controle. A doença foi detectada pela primeira vez no Brasil na safra das águas de 1995, no Estado de São Paulo. Por se tratar de uma doença de difícil controle, a resistência genética tem sido a melhor opção. O objetivo deste trabalho foi avaliar a reação de genótipos de feijoeiro à murcha-de-curtobacterium, frente a 333 acessos pertencentes ao banco de germoplasma de feijoeiro do Instituto Agronômico de Campinas (IAC. Oportunamente, foram selecionados genótipos de feijoeiro altamente resistentes e suscetíveis, com a finalidade de comparar a colonização de Cff no vaso do xilema a partir da visualização sob microscopia eletrônica de varredura. Os resultados da triagem da resistência genética em genótipos de feijoeiro indicaram a existência de variabilidade genética nas amostras dos 333 genótipos avaliados, ao isolado de Cff Feij 2634. Os materiais foram classificados em 4 grupos de resistência: 29 genótipos (8,7% comportaram-se como altamente resistentes, 13 genótipos (3,9% como resistentes, 18 genótipos (5% como moderadamente resistentes e 273 genótipos (81% suscetíveis. A partir dos resultados obtidos, cerca de 18% dos genótipos de feijoeiros, desde altamente resistentes à moderadamente resistentes, poderão ser úteis para o programa de melhoramento genético como fonte de genes para resistência a Cff. Através da microscopia eletrônica de varredura, foram observadas em genótipos altamente resistentes, várias aglutinações da bactéria envolvidas por filamentos e estruturas rendilhadas sob pontuações da parede do vaso do xilema, não verificados em genótipos suscetíveis, o que sugere a ativação de mecanismos de defesa estruturais e bioquímicos nas plantas resistentes.Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff, the causal

Characterization of the env gene and long terminal repeat of molecularly cloned Friend mink cell focus-inducing virus DNA.

OpenAIRE

Adachi, A; Sakai, K; Kitamura, N; Nakanishi, S; Niwa, O; Matsuyama, M; Ishimoto, A

1984-01-01

The highly oncogenic erythroleukemia-inducing Friend mink cell focus-inducing (MCF) virus was molecularly cloned in phage lambda gtWES.lambda B, and the DNA sequences of the env gene and the long terminal repeat were determined. The nucleotide sequences of Friend MCF virus and Friend spleen focus-forming virus were quite homologous, supporting the hypothesis that Friend spleen focus-forming virus might be generated via Friend MCF virus from an ecotropic Friend virus mainly by some deletions. ...

Asociación entre el polimorfismo genético de la apolipoproteína E (ApoE y la enfermedad de Parkinson

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Victoria Marca

2013-07-01

Full Text Available Introducción: En nuestro país, con el incremento en la esperanza de vida, existe una tendencia creciente de enfermedades neurodegenerativas, por lo que se hace necesario realizar estudios sobre factores de riesgo genético en personas afectadas con la enfermedad de Parkinson (EP, entre ellos el gen de la apolipoproteína E (ApoE, ya que esta asociación es desconocida en nuestra población. Objetivo: Determinar la asociación del polimorfismo en el gen ApoE con la EP. Diseño: Estudio asociativo, observacional tipo casos y controles. Lugar: Instituto Nacional de Ciencias Neurológicas, Lima, Perú. Participantes: Personas de ambos sexos, 163 pacientes con la EP y 176 controles. Intervenciones: Extracción de ADN genómico según metodología estándar. Análisis del gen APOE mediante técnica PCR-RFLP. Principales medidas de resultados: Frecuencias genotípicas y alélicas del gen ApoE en los casos y controles, medidas de asociación y de riesgo. Resultados: No se encontró diferencias significativas entre el grupo control y los pacientes según genotipo de ApoE. La frecuencia del alelo ε4 fue similar en pacientes y en controles. El odds ratio para el alelo ε4 de la ApoE fue 1,0852 (IC 95%: 0,5812 a 2,0266. La edad de inicio de la EP no tuvo relaciσn con los genotipos ApoE. Conclusiones: El alelo ε4 de la ApoE no podrνa ser considerado un factor de riesgo para la EP, y los genotipos de la ApoE no se asociaron con la edad de inicio en esta muestra evaluada.

Surveillance technology for HIV-1 subtype C in Ethiopia: an env-based NASBA molecular beacon assay to discriminate between subcluster C and C'

NARCIS (Netherlands)

Ayele, Workenesh; Baar, Michel P. de; Goudsmit, Jaap; Kliphuis, Aletta; Tilahun, Tesfaye; Dorigo-Zetsma, Wendelien; Wolday, Dawit; Abebe, Almaz; Mengistu, Yohannes; Pollakis, Georgios

2005-01-01

Forty-nine samples with known C2V3 sequences were used for the evaluation of an env-based molecular beacon assay to distinguish between the two genetic subclusters C and C' which characterize the HIV-1 epidemic in Ethiopia. Two subcluster C and two subcluster C' beacons targeting two different loci

Parámetros genéticos para la persistencia de la lactación en vacas Siboney usando modelos de regresión aleatoria

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Dianelys González-Peña Fundora

2011-01-01

Full Text Available Con el objetivo de estimar los valores de heredabilidad y las correlaciones genéticas entre cinco medidas de persistencia usando un modelo de regresión aleatoria con polinomios de Legendre, se analizaron 17,034 registros de producción de leche del día del control de 2,086 vacas Siboney de Cuba (primera lactancia que parieron entre 1995 y 2003 en 50 hatos. Los estimados de heredabilidad para la persistencia de la lactación variaron de 0.18±0.02 a 0.29±0.02. Las correlaciones genéticas entre las diferentes medidas de persistencia oscilaron de -0.71 a 0.95. Las correlaciones genéticas entre la producción de leche en los distintos días del control, así como la producción acumulada hasta los 305 días de lactación (PL305 y las distintas medidas de persistencia tomaron valores de -0.06 hasta 0.11. Basado en los niveles de heredabilidad y en las correlaciones genéticas de las medidas de persistencia con la PL305, se concluye que es factible efectuar la selección conjunta para la PL305 y persistencia de la lactación en el ganado Siboney utilizando la diferencia en el área bajo la curva entre el tercio final de la lactación (día 201 al 300 y el tercio inicial del día 1 al 100, (sumatoria de la contribución de cada día, en el periodo de los 61 a 280 días de lactación, como una desviación de la producción en el día 60 como medidas de persistencia.

Towards an International Culture: Gen Y Students and SNS?

Science.gov (United States)

Lichy, Jessica

2012-01-01

This article reports the findings of a small-scale investigation into the Internet user behaviour of generation Y (Gen Y) students, with particular reference to social networking sites. The study adds to the literature on cross-cultural Internet user behaviour with specific reference to Gen Y and social networking. It compares how a cohort of…

Covariance of charged amino acids at positions 322 and 440 of HIV-1 Env contributes to coreceptor specificity of subtype B viruses, and can be used to improve the performance of V3 sequence-based coreceptor usage prediction algorithms.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Kieran Cashin

Full Text Available The ability to determine coreceptor usage of patient-derived human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1 strains is clinically important, particularly for the administration of the CCR5 antagonist maraviroc. The envelope glycoprotein (Env determinants of coreceptor specificity lie primarily within the gp120 V3 loop region, although other Env determinants have been shown to influence gp120-coreceptor interactions. Here, we determined whether conserved amino acid alterations outside the V3 loop that contribute to coreceptor usage exist, and whether these alterations improve the performance of V3 sequence-based coreceptor usage prediction algorithms. We demonstrate a significant covariant association between charged amino acids at position 322 in V3 and position 440 in the C4 Env region that contributes to the specificity of HIV-1 subtype B strains for CCR5 or CXCR4. Specifically, positively charged Lys/Arg at position 322 and negatively charged Asp/Glu at position 440 occurred more frequently in CXCR4-using viruses, whereas negatively charged Asp/Glu at position 322 and positively charged Arg at position 440 occurred more frequently in R5 strains. In the context of CD4-bound gp120, structural models suggest that covariation of amino acids at Env positions 322 and 440 has the potential to alter electrostatic interactions that are formed between gp120 and charged amino acids in the CCR5 N-terminus. We further demonstrate that inclusion of a "440 rule" can improve the sensitivity of several V3 sequence-based genotypic algorithms for predicting coreceptor usage of subtype B HIV-1 strains, without compromising specificity, and significantly improves the AUROC of the geno2pheno algorithm when set to its recommended false positive rate of 5.75%. Together, our results provide further mechanistic insights into the intra-molecular interactions within Env that contribute to coreceptor specificity of subtype B HIV-1 strains, and demonstrate that incorporation

Introducing AstroGen: the Astronomy Genealogy Project

Science.gov (United States)

Tenn, Joseph S.

2016-12-01

The Astronomy Genealogy Project (AstroGen), a project of the Historical Astronomy Division of the American Astronomical Society (AAS), will soon appear on the AAS website. Ultimately, it will list the world's astronomers with their highest degrees, theses for those who wrote them, academic advisors (supervisors), universities, and links to the astronomers or their obituaries, their theses when online, and more. At present the AstroGen team is working on those who earned doctorates with astronomy-related theses. We show what can be learned already, with just ten countries essentially completed.

An electronic flight bag for NextGen avionics

Science.gov (United States)

Zelazo, D. Eyton

2012-06-01

The introduction of the Next Generation Air Transportation System (NextGen) initiative by the Federal Aviation Administration (FAA) will impose new requirements for cockpit avionics. A similar program is also taking place in Europe by the European Organisation for the Safety of Air Navigation (Eurocontrol) called the Single European Sky Air Traffic Management Research (SESAR) initiative. NextGen will require aircraft to utilize Automatic Dependent Surveillance-Broadcast (ADS-B) in/out technology, requiring substantial changes to existing cockpit display systems. There are two ways that aircraft operators can upgrade their aircraft in order to utilize ADS-B technology. The first is to replace existing primary flight displays with new displays that are ADS-B compatible. The second, less costly approach is to install an advanced Class 3 Electronic Flight Bag (EFB) system. The installation of Class 3 EFBs in the cockpit will allow aircraft operators to utilize ADS-B technology in a lesser amount of time with a decreased cost of implementation and will provide additional benefits to the operator. This paper describes a Class 3 EFB, the NexisTM Flight-Intelligence System, which has been designed to allow users a direct interface with NextGen avionics sensors while additionally providing the pilot with all the necessary information to meet NextGen requirements.

[Functional analysis of Grp and Iris, the gag and env domesticated errantivirus genes, in the Drosophila melanogaster genome].

Science.gov (United States)

Makhnovskii, P A; Kuzmin, I V; Nefedova, L N; Kima, A I

2016-01-01

Drosophila melanogaster is the only invertebrate that contains endogenous retroviruses, which are called errantiviruses. Two domesticated genes, Grp and Iris, which originate from errantivirus gag and env, respectively, have been found in the D. melanogaster genome. The functions performed by the genes in Drosophila are still unclear. To identify the functions of domesticated gag and env in the D. melanogaster genome, expression of Iris and Grp was studied in strains differing by the presence or absence of the functional gypsy errantivirus. In addition, the expression levels were measured after injection of gram-positive and gram-negative bacteria, which activate different immune response pathways, and exposure to various abiotic stress factors. The presence of functional D. melanogaster retrovirus gypsy was found to increase the Grp expression level in somatic tissues of the carcass, while exerting no effect on the Iris expression level. Activation of the immune response in D. melanogaster by bacteria Bacillus cereus increased the Grp expression level and did not affect Iris expression. As for the effects of abiotic stress factors (oxidative stress, starvation, and heat and cold stress), the Grp expression level increased in response to starvation in D. melanogaster females, and the Iris expression level was downregulated in heat shock and oxidative stress. Based on the findings, Grp was assumed to play a direct role in the immune response in D. melanogaster; Iris is not involved in immune responses, but and apparently performs a cell function that is inhibited in stress.

Efectividad de los medicamentos antirretrovirales genéricos en el tratamiento de los pacientes adultos infectados con VIH en Medellín, Colombia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Fabián Alberto Jaimes Barragán

2008-02-01

Full Text Available

Pese al uso generalizado de medicamentos antirretrovirales genéricos para VIH/SIDA persiste el debate sobre la efectividad de este tipo de medicaciones comparadas con sus contrapartes originales. Se revisaron las historias clínicas de 170 pacientes con diagnóstico de VIH/SIDA, desde 1998 a 2006, de la base de datos sistematizada de una entidad privada, quienes tuvieron indicaciones para iniciar la terapia antirretroviral. La población en estudio fue dividida en grupos que recibieron medicamentos antirretrovirales originales o genéricos en su totalidad o mezcla de los mismos (grupo mixto. El objetivo primario fue evaluar la efectividad de las distintas terapias como medida de supresión virológica e inmunológica en los pacientes con VIH/SIDA; el objetivo secundario fue determinar la probabilidad de permanecer libre de eventos definitorios de SIDA y mortalidad general. Casi la totalidad de los pacientes recibieron terapia antirretroviral altamente activa (HAART como primer esquema de terapia (n =167; 98,2% y en el 100% en los siguientes esquemas. El promedio de edad al empezar la terapia fue de 38,8 años con un rango entre 21-78 años, 89,4% (n = 152 eran hombres y la principal causa del diagnóstico fue la presencia de infecciones oportunistas en el 41,8% de los casos (n = 71. Al inicio de la terapia, 59,4% de la población (n = 101 tenía un estadio inmunológico 3 y el 47,1% (n = 80 un estadio clínico C. Con respecto a la marca del tratamiento, 64,7% (n = 110 de la cohorte inició la terapia con medicación comercial, 23,5% (n = 40 con genéricos y 11,8% (n = 20 con medicación mixta. Ciento veinte pacientes (70,6% tuvieron buena adhesión al tratamiento. El seguimiento longitudinal de los datos para el recuento de CD4 en los 18 meses iniciales postratamiento permitió analizar un promedio de 2,5 mediciones por paciente. Comparado con el grupo de tratamiento

Conceptos básicos de programación genética

Directory of Open Access Journals (Sweden)

José Jesús Martínez Páez

2001-04-01

Full Text Available La Programación Genética, PG, es un retoño de los Algoritmos Genéticos, en la cual los cromosomas que sufren la adaptación son en sí mismos programas de computador. Se usan operadores genéticos  especializados que generalizan la recombinación sexual y la mutación, para los programas de computador estructurados en árbol que están bajo adaptación.

Saúde coletiva, nova genética e a eugenia de mercado Collective health, the new genetics, and market eugenics

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Maria Helena Cabral de Almeida Cardoso

2003-04-01

Full Text Available Com os constantes avanços das técnicas de manipulação genética, o campo da saúde coletiva passou a lidar com a possibilidade de surgimento de uma ênfase genômica reducionista, para além das influências sócio-culturais. Nestas circunstâncias, o foco principal das intervenções em saúde coletiva voltar-se-ia para a abordagem genômica de "indivíduos" e suas "famílias" em detrimento de seu consagrado objeto - "populações". Assim, seria deslocada a prioridade central dos esforços (e recursos para reduzir o adoecimento em função das desigualdades sócio-econômicas. Ao lado dos benefícios dos conhecimentos genéticos, há a possibilidade de surgimento de novas práticas eugênicas a partir da disponibilização de testagens genéticas no mercado, com vistas à aquisição pelos indivíduos interessados, desde que estes sejam capazes de atuarem como respectivos agentes de consumo.Due to constant advances in genetic manipulation, the field of public health is faced with the possible emergence of a reductionist genomic emphasis, beyond socio-cultural influences. Under such circumstances, the main focus of public health interventions would shift towards a genomic approach to "individuals" and their "families", to the detriment of their consecrated object - "populations", thereby moving away from the current central priority of efforts (and resources aimed at reducing ill-health due to socioeconomic inequalities. Even admitting the benefits of genetic knowledge, a new eugenic practice may emerge from the availability of genetic tests on the marketplace aimed at individuals that can afford to consume them.

ABCB1-Gen-Polymorphismus in einer polnischen Kohorte ist mit Risiko für bullöses Pemphigoid assoziiert.

Science.gov (United States)

Rychlik-Sych, Mariola; Barańska, Małgorzata; Dudarewicz, Michał; Skrętkowicz, Jadwiga; Żebrowska, Agnieszka; Owczarek, Jacek; Waszczykowska, Elżbieta

2017-05-01

Polymorphismen im ABCB1-Gen, das für das P-Glykoprotein kodiert, können die intrazelluläre Konzentration von Xenobiotika beeinflussen und so zur Entwicklung von Autoimmunerkrankungen, einschließlich des bullösen Pemphigoids (BP), beitragen. In der vorliegenden Studie sollte untersucht werden, ob in einer polnischen Kohorte die C3435T- und G2677T/A-Polymorphismen im ABCB1-Gen mit dem Risiko für ein BP assoziiert sind. Die Studie umfasste 71 Patienten mit BP und 156 gesunde Probanden. Der C3435T-Polymorphismus wurde mittels PCR-RFLP bestimmt und der G2677T/A-Polymorphismus mittels Allel-spezifischer PCR. Es gab zwar keine Korrelation zwischen dem C3435-Polymorphismus und dem BP-Risiko, aber wir konnten eine derartige Assoziation hinsichtlich des G2677T/A-Polymorphismus nachweisen. Das relative Risiko eines BP war bei Personen mit dem 2677TA-Genotyp um mehr als den Faktor fünf erhöht (OR = 5,52; p = 0,0063) und bei Trägern des 2677TT-Genotyps mehr als verdoppelt (OR = 2,40; p = 0,0076). Mit 2,40 (p = 0,000018) war die OR bei Trägern des 2677T-Allels ebenfalls erhöht. Die höhere Prävalenz des 2677GG-Genotyps und des 2677G-Allels bei der Kontrollgruppe sowie eine OR < 1,0 (0,22 beziehungsweise 0,33) legen eine Schutzfunktion des 2677G-Allels hinsichtlich der Ausbildung eines BP nahe. Die Ergebnisse der vorliegenden Studie zeigen, dass der G2677T/A-Polymorphismus im ABCB1-Gen das Risiko für die Entstehung eines BP beeinflussen könnte. © 2017 Deutsche Dermatologische Gesellschaft (DDG). Published by John Wiley & Sons Ltd.

Evaluación del potencial de mejoramiento genético en el crecimiento en altura de Acacia mangium Willd.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Iván Javier Pastrana-Vargas

2012-04-01

Full Text Available En el periodo 2009-2010, en Ayapel, Planeta Rica y Tierralta, departamento de Córdoba (Colombia se evaluó el desempeño en crecimiento en altura total de 90 familias de polinización abierta de Acacia mangium. En estos municipios el clima se clasifica, de acuerdo con Holdridge, como bosque seco tropical (Bs-T, excepto Tierralta que es bosque húmedo tropical (Bh-T. Durante el primer año de crecimiento, las plantas en cada familia fueron evaluadas en ensayos de progenie mediante un diseño experimental de bloques completos al azar, con seis bloques en cada una de las tres localidades. La parcela o unidad experimental consistió en seis plantas de polinización abierta por familia, distribuidas aleatoriamente en tres parejas espacialmente separadas dentro de cada bloque. La predicción de parámetros genéticos individuales y de familias se efectuó por medio del procedimiento BLUP y los componentes de varianza por medio del procedimiento REML utilizando el software SELEGEN. Las estimaciones de heredabilidad variaron entre <1 y 13%, y entre 6 y 68%, para heredabilidad individual en sentido estricto (h²a y heredabilidad media de familias (h²mp, respectivamente. El ranking genético en altura de las 15 mejores familias indica que las de mayor crecimiento fueron también las más estables y de mayor adaptabilidad a los ambientes. Los resultados sugieren un alto potencial de mejoramiento al nivel de familia en crecimiento y productividad de plantaciones de A. mangium en el departamento de Córdoba, Colombia. Son necesarios nuevos estudios a fin de lograr una mejor selección genética.

El polimorfismo (CAGn del gen ATXN2, nuevo marcador de susceptibilidad para diabetes mellitus tipo 2

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Luis J. Flores-Alvarado

Full Text Available RESUMEN Objetivo Estimar si hay asociación del repetido (CAGn del gen ATXN2 en población mexicana con diabetes mellitus (DM tipo 2. Métodos Estudio epidemiológico de casos y controles. Se incluyeron personas sanas y personas diabéticas. La detección de la expansión (CAGn se realizó por reacción en cadena de la polimerasa (PCR-punto final. Los productos de PCR se analizaron mediante electroforesis (PAGE al 8% y tinción con nitrato de plata. Resultados La distribución de alelos del trinucleótido (CAGn en la población analizada resultó similar a la reportada en el centro del país. El alelo más frecuente es el de 22 repetidos; sin embargo, hay asociación con los portadores de los repetidos largos dentro del rango normal con diabetes. Conclusiones Los resultados sugieren que el repetido (CAGn del gen de ATXN2 podría ser un factor causal de DM tipo 2.

Dos aspectos a considerar en la adopción de embriones en el Estado de Querétaro: el derecho del menor a conocer su origen genético y la prohibición implícita de los diagnósticos genéticos preimplantacional y prenatal

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Miguel Ángel León Ortiz

2017-01-01

Full Text Available La donación de embriones supernumerarios en la implementación de procedimientos de reproducción asistida de naturaleza heteróloga, es una constante en las normativas vigentes en esta materia. En México, el Estado de Querétaro regula de forma particular este acto jurídico, importante en las relaciones sostenidas en el derecho de familia actual, poniendo al alcance de parejas infértiles la posibilidad de acudir a la adopción de embriones supernumerarios. En este trabajo, se analizan dos aspectos esenciales: el derecho del menor a conocer su origen genético y la prohibición implícita de los diagnósticos genéticos preimplantacional y prenatal, de donde resultan efectos jurídicos diversos.

Pautas éticas para la investigación genética en Antropología Biológica

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Caratini, Alicia Liliana

2007-01-01

Full Text Available El abordaje de la ética de la investigación en el área de la genética de poblaciones es de orden colectivo en un contexto de multiculturalidad, haciendose imprescindible el respeto a las pautas culturales y a las formas de organización social de los grupos involucrados: poblaciones originarias y/o cosmopolitas. Lo importante es que los acuerdos alcanzados cobijen sin discriminación a cada uno de los actores que desarrollan el proceso de investigación tanto a los investigadores como a las poblaciones–sujetos. Todas las pautas éticas se hallan enmarcadas por los principios que fijan los convenios Internacionales como el Código de Nuremberg (1947, Declaración de Helsinki (1964 y las sucesivas revisiones, las normas internacionales de CIOMS (1991-1993 la Declaración internacional sobre los datos genéticos Humanos, UNESCO (2003, y las legislaciones regionales y locales. Los procedimientos deben cumplir sintéticamente los siguientes pasos: 1 Recolección de los datos genéticos, se debe tener el consentimiento, previo, libre e informado de las poblaciones-sujetos; 2 confidencialidad de los datos identitarios; 3 el derecho a ser informado, las poblaciones involucradas deben tener acceso a los resultados de la investigación; 4 se debe observar en la cooperación e intercambio internacional el respeto mutuo de acuerdo al art.18 de la Declaración sobre los datos genéticos Humanos (UNESCO 2003. El cumplimiento de las pautas éticas debe estar supervisado por Comités de Etica interdisciplinarios en los organismos de financiamiento de los proyectos.

CLONACIÓN Y FILOGENIA MOLECULAR DE UN SEGMENTO DEL GEN CODANTE DE LA ACTINA DE MYRCIARIA DUBIA “CAMU-CAMU”: UN CANDIDATO PARA GEN DE REFERENCIA

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Juan Carlos Castro Gómez

2012-12-01

Full Text Available Myrciaria dubia “camu-camu” es un frutal amazónico caracterizado por su amplia variación de vitamina C. Pero los estudios genético moleculares que puedan explicar esta variación son limitados. Por ello nuestro objetivo fue realizar la clonación y filogenia molecular de un segmento del gen codante de la actina de M. dubia. Las muestras fueron obtenidas de la colección de germoplasma del INIA. Luego, el ARN fue purificado y mediante RT-PCR con cebadores degenerados se amplificó un segmento del gen. En base a la secuencia obtenida se diseñaron cebadores específicos para PCR en tiempo real. Los resultados muestran que se ha aislado, clonado y secuenciado un segmento del gen codante de actina de M. dubia y detectado su expresión en hojas, pulpa y cáscara de M. dubia. Así, con el soporte de herramientas bioinformáticas y uso de técnicas de biología molecular hemos aislado, clonado y secuenciado un segmento del gen codante de la actina de M. dubia. Asimismo, los análisis realizados muestran que el gen se expresa y presenta niveles similares de expresión en hojas, pulpa y cáscara de M. dubia. Sin embargo, es necesario realizar más experimentos a fin de verificar su estabilidad de expresión.

Safety Design Criteria (SDC) for Gen-IV Sodium-cooled Fast Reactor

International Nuclear Information System (INIS)

Nakai, Ryodai

2013-01-01

SDC Development Background & Objectives: • Safety Design Criteria (SDC) Development for Gen-IV SFR: – Proposed at the GIF Policy Group (PG) meeting in October 2010 –SDC “harmonization” is increasingly important for: • Realization of enhanced safety designs meeting to Gen-IV safety goals and safety approach common to SFR systems; • Preparation for the forthcoming licensing in the near future; • Because Gen-IV SFR are progressing into conceptual design stage. • The SDC is the Reference criteria: – Of the designs of safety-related Structures, Systems & Components that are specific to the SFR system; – For clarifying the requisites systematically & comprehensively; – When the technology developers apply the basic safety approach and use the codes & standards for conceptual design of the Gen-IV SFR system

Genética e hanseníase

OpenAIRE

Beiguelman Bernardo

2002-01-01

As diferentes linhas de pesquisa utilizadas para investigar a importância dos fatores hereditários humanos na determinação da resistência/suscetibilidade à infecção pelo Mycobacterium leprae foram discutidas no presente trabalho. Uma síntese dessas abordagens permitiu analisar os resultados das investigações sobre associação da hanseníase com polimorfismos genéticos, distribuição familial da hanseníase, prevalência da hanseníase e distância genética, concordância da hanseníase em gêmeos e est...

Analisis Mutasi Gen Protein X Virus Hbv Pada Penderita Hepatitis B Akut Di Manado

OpenAIRE

Fatimawali; Kepel, Billy

2014-01-01

Faktor-faktor yang mempengaruhi perkembangan hepatitis B kronis menjadi kanker hati antara lain mutasi pada gen x. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi gen protein x virus HBV dan menganalisis apakah terjadi mutasi gen yang terkait dengan munculnya tumor ganas sirosis hati (HCC). Penelitian ini menggunakan primer untuk proses nested PCR yang telah dirancang sebelumnya. Proses nested PCR terhadap 10 sampel DNA HBV pasien dilakukan untuk mengamplifikasi fragmen DNA gen x dilanjutkan ...

Cross-Neutralizing Antibodies in HIV-1 Individuals Infected by Subtypes B, F1, C or the B/Bbr Variant in Relation to the Genetics and Biochemical Characteristics of the env Gene.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Dalziza Victalina de Almeida

Full Text Available Various HIV-1 env genetic and biochemical features impact the elicitation of cross-reactive neutralizing antibodies in natural infections. Thus, we aimed to investigate cross-neutralizing antibodies in individuals infected with HIV-1 env subtypes B, F1, C or the B/Bbr variant as well as env characteristics. Therefore, plasma samples from Brazilian chronically HIV-1 infected individuals were submitted to the TZM-bl neutralization assay. We also analyzed putative N-glycosylation sites (PNGLs and the size of gp120 variable domains in the context of HIV-1 subtypes prevalent in Brazil. We observed a greater breadth and potency of the anti-Env neutralizing response in individuals infected with the F1 or B HIV-1 subtypes compared with the C subtype and the variant B/Bbr. We observed greater V1 B/Bbr and smaller V4 F1 than those of other subtypes (p<0.005, however neither was there a correlation verified between the variable region length and neutralization potency, nor between PNLG and HIV-1 subtypes. The enrichment of W at top of V3 loop in weak neutralizing response viruses and the P in viruses with higher neutralization susceptibility was statistically significant (p = 0.013. Some other signatures sites were associated to HIV-1 subtype-specific F1 and B/Bbr samples might influence in the distinct neutralizing response. These results indicate that a single amino acid substitution may lead to a distinct conformational exposure or load in the association domain of the trimer of gp120 and interfere with the induction power of the neutralizing response, which affects the sensitivity of the neutralizing antibody and has significant implications for vaccine design.

Caracterización clínico genética del síndrome Prader Willi

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Anitery Travieso Tellez

2014-12-01

Full Text Available Introducción: el síndrome Prader Willi es un desorden genético causado por la pérdida de genes contenidos en la región 15q11-q13 del cromosoma paterno. Objetivo: describir las características clínicas y genéticas de los pacientes con síndrome Prader Willi. Material y método: se realizó un estudio descriptivo, de corte transversal, con el universo de 15 pacientes con sospecha de síndrome Prader Willi remitidos a consulta provincial de Genética Clínica durante el año 2013. Se consideraron como variables clínicas los criterios diagnósticos según Holms, y como variables genéticas los resultados de los estudios cromosómicos y moleculares. Resultados: predominó el sexo femenino en un 66.7%. Las edades estuvieron entre los tres y los 41 años. Los criterios mayores más frecuentes resultaron la obesidad troncular y el retraso del neurodesarrollo en el 100% de los pacientes. Los criterios menores más identificados fueron los disturbios del sueño y las dificultades del lenguaje con un 66.7% cada uno. En ninguno de los casos se detectaron anomalías cromosómicas por cariotipificación. Tres pacientes (60% presentaron la deleción a nivel de la región 15q11-q13 identificada por la técnica de hibridación in sito con fluorescencia. Conclusiones: la definición del diagnóstico en la provincia resulta demorada. Se requiere de reevaluación según los criterios clínicos en las diferentes etapas de la vida para diagnóstico de certeza. La presencia de hipotonía neonatal y dificultades en la alimentación son elementos asociados al diagnóstico por deleción 15q11-q13.

Criterios para el diagnóstico clínico de algunos síndromes genéticos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Noel Taboada Lugo

2003-04-01

Full Text Available Hasta mediados del pasado siglo se conocía muy poco acerca de las enfermedades genéticas, aparte de su mera existencia. Si bien a título aislado muchas de ellas son entidades clínicas poco frecuentes, al sumar unos 30 000 síndromes, constituyen una afección pediátrica no desdeñable, y a pesar de su complejidad, el pediatra puede abordar con facilidad el reto de su diagnóstico, como base para solicitar los exámenes complementarios pertinentes o bien la interconsulta con otras especialidades, a la que no debería recurrir "de entrada" ante la presencia de un niño con un posible síndrome "raro". Fue el propósito de este trabajo propiciar a pediatras y personal médico en general los criterios clínicos para llegar al diagnóstico de algunos síndromes genéticos, los que han sido elaborados luego de una exhaustiva delineación clínica de éstos. Fueron reflejados los criterios establecidos para el diagnóstico clínico de 9 síndromes genéticos.Very little was known up to the middle of the last century about genetic diseases, but just its mere existance. Considered isolatedly, many of them are uncommon clinical entities, but as there are 30 000 syndromes at present, they are a pediatric affection that cannot be disdained. In spite of their complexity, the pediatrician can easily face the challenge of making the diagnosis as a basis to order the complementary tests, or to have an interconsultation with other specialists, which should not be done when he sees a child with a "rare" syndrome for the first time. This paper was aimed at giving pediatricians and medical personnel in general the clinical criteria resulting from an exhaustive clinical analysis that allow to diagnose some genetic syndromes. The criteria established for the clinical diagnosis of 9 genetic syndromes were included.

Craniostenose em gêmeos: estudo genético

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Walter Carlos Pereira

1968-09-01

Full Text Available É relatada a ocorrência de formas clínicas diversas de craniostenose em gêmeos de sexo diferente. A menina apresentava obliteração completa da sutura coronaria e dos dois terços anteriores da sutura sagital; no menino a sutura sagital era a única afetada. O estudo genético mostrou que a craniostenose independe de aberrações cromossômicas, indicando ser transmitida por gens recessivos raros de natureza autossômica.

A Virtual Reality Framework to Optimize Design, Operation and Refueling of GEN-IV Reactors

International Nuclear Information System (INIS)

Rizwan-uddin; Nick Karancevic; Stefano Markidis; Joel Dixon; Cheng Luo; Jared Reynolds

2008-01-01

Many GEN-IV candidate designs are currently under investigation. Technical issues related to material, safety and economics are being addressed at research laboratories, industry and in academia. After safety, economic feasibility is likely to be the most important criterion in the success of GEN-IV design(s). Lessons learned from the designers and operators of GEN-II (and GEN-III) reactors must play a vital role in achieving both safety and economic feasibility goals

A Virtual Reality Framework to Optimize Design, Operation and Refueling of GEN-IV Reactors.

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Rizwan-uddin; Nick Karancevic; Stefano Markidis; Joel Dixon; Cheng Luo; Jared Reynolds

2008-04-23

many GEN-IV candidate designs are currently under investigation. Technical issues related to material, safety and economics are being addressed at research laboratories, industry and in academia. After safety, economic feasibility is likely to be the most important crterion in the success of GEN-IV design(s). Lessons learned from the designers and operators of GEN-II (and GEN-III) reactors must play a vital role in achieving both safety and economic feasibility goals.

Vom Zurechtlegen der Niederlage als Grundlage: Kritik der (Rechts‐Grundlagenforschung

Directory of Open Access Journals (Sweden)

David R. Wenger

2006-06-01

Full Text Available Philosophie als Magd des Rechts (Ancilla Iuris ist eine ambivalente Gestalt. Indem sie etwa die Rechtsdogmatik nach allen Regeln ihrer Kunst dekonstruiert und deren unbewusste oder gar mutwillig verheimlichte Grundlagen bloßlegt, legt sie diese zugleich auch selber fest. Es hat also jede so genannte Grundlagenforschung auch ihre eigenen festen Stellungen und Standpunkte, die sie allerdings nicht sehen kann, weil sie auf ihnen steht. Gegenstrebig fügen sich in ihr Kritik und Dogmatik; sie sind sich als Befragung und Begründung entgegengesetzt und schlagen ineinander um: das ist die Dialektik der Sache.

Estudios genéticos en las comunidades indígenas del nororiente colombiano

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Humberto Ossa

1994-01-01

Full Text Available Se presentan las frecuencias génicas de los grupos sanguíneos ABO, Rh, Kell, Duffy, Kidd, Diego y MNSs en las siete comunidades que viven en el nororiente columbiano (wayrl, Barf, Arhuaco, Yuco, Kogi, Arsario y Chimila. Además se presenta el índice de mezcla racial, con excepción de los Arsario, y algunos aspectos iniciales de las distancias genéticas, con excepción de los Arsario y los Chimila, sobre la base de cinco loci informativos. Las frecuencias génicas fueron obtenidas a partir de los genotipos deducidos a través de los arboles familiares. Geográficamente el nororiente colombiano se encuentra conformado por los departamentos de la Guajira, Magdalena, Cesar y Norte de Santander. En la península de la Guajira viven los Wayu; en la Sierra Nevada de Santa Marta habitan los Kogi, los Arhuaco y los Arsario, todos descendientes de los primitivos Taironas. En la Serranía del Perija encontramos los Yuco al norte y los Barf al sur y en el departamento del Magdalena encontramos los Chimila. Estos grupos indígenas fueron estudiados para siete sistemas genéticos polimórficos que comprenden 23 alelos y 18 especificidades serológicas: ABO(tres alelos,Rh (seisalelos, Kell (dos alelos,Duffy (tres alelos, Kidd (tres alelos,Diego (dos alelos y MNSs (cuatro alelos. EI estudio se adelanto utilizando anticuerpos policlonales y monoclonales y las técnicas de tipificación convencionales. Se realizaron quince visitas a las siete comunidades y se recolectaron 473 muestras sanguíneas distribuidas en 63 familias de dos, tres y cuatro generaciones. Se presentan los resultados para frecuencias de fenotipos y genotipos en las poblaciones estudiadas y los resultados del análisis del equilibrio de Hardy-Weinberg.

Transformação genética em espécies florestais.

OpenAIRE

Claudia Studart-Guimarães; Cristiano Lacorte; Ana Cristina Miranda Brasileiro

2010-01-01

A transformação genética, que compreende a introdução de genes exógenos de forma controlada no genoma de uma célula vegetal e posterior regeneração da planta transgênica, tem contribuído com os programas de melhoramento genético de plantas pela obtenção de genótipos com novas características de interesse. O melhoramento de espécies florestais é limitado por características intrínsecas a tais espécies, como a altura dos indivíduos e o ciclo longo de vida. A transformação genética constitui, po...

“Eugenesia, normatividad jurídica y sociedad tecnológica. Retos bioéticos de la nueva genética”

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Javier Blazquez

2009-07-01

Full Text Available Las posibilidades que ofrece la investigación y experimentación genética son de gran relevancia. Así como los retos y desafíos de carácter jurídico que plantean. Retos que interpelan y demandan una regulación que evite que el caudal y potencial de la investigación pueda llegar a desbordarse. Otra cosa es ponderar y crear normas capaces de optimizar al máximo los recursos que aporta la tecnociencia y la experimentación genética, haciéndolos compatibles con el respeto a los Derechos Humanos concernidos. Ese es uno de los objetivos del Convenio de Biomedicina del Consejo de Europa así como de la Ley 14/2007 de 3 de julio,  de Investigación  Biomédica.

Preserving Accuracy in GenBank

DEFF Research Database (Denmark)

Bidartondo, M.I.; Bruns, T. D.; Blackwell, M.

2008-01-01

GenBank, the public repository for nucleotide and protein sequences, is a critical resource for molecular biology, evolutionary biology, and ecology. While some attention has been drawn to sequence errors (1), common annotation errors also reduce the value of this database. In fact, for organisms...

GenMAPP 2: new features and resources for pathway analysis

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Dahlquist Kam D

2007-06-01

Full Text Available Abstract Background Microarray technologies have evolved rapidly, enabling biologists to quantify genome-wide levels of gene expression, alternative splicing, and sequence variations for a variety of species. Analyzing and displaying these data present a significant challenge. Pathway-based approaches for analyzing microarray data have proven useful for presenting data and for generating testable hypotheses. Results To address the growing needs of the microarray community we have released version 2 of Gene Map Annotator and Pathway Profiler (GenMAPP, a new GenMAPP database schema, and integrated resources for pathway analysis. We have redesigned the GenMAPP database to support multiple gene annotations and species as well as custom species database creation for a potentially unlimited number of species. We have expanded our pathway resources by utilizing homology information to translate pathway content between species and extending existing pathways with data derived from conserved protein interactions and coexpression. We have implemented a new mode of data visualization to support analysis of complex data, including time-course, single nucleotide polymorphism (SNP, and splicing. GenMAPP version 2 also offers innovative ways to display and share data by incorporating HTML export of analyses for entire sets of pathways as organized web pages. Conclusion GenMAPP version 2 provides a means to rapidly interrogate complex experimental data for pathway-level changes in a diverse range of organisms.

Progresso genético da produtividade de café beneficiado com a seleção de clones de cafeeiro 'Conilon'

Directory of Open Access Journals (Sweden)

André Rostand Ramalho

2016-09-01

Full Text Available RESUMO A espécie Coffea canephora Pierre ex Froehner possui ampla distribuição geográfica, com ocorrência em regiões tropicais de diversos continentes. Aproximadamente 30% da produção brasileira de café é proveniente do cultivo dessa espécie, sendo que o Estado de Rondónia se destaca como seu segundo maior produtor. Este trabalho teve como objetivo estimar os parâmetros genéticos com a seleção de clones de C. canephora, da variedade botânica 'Conilon', visando caracterizar a variabilidade genética e estimar o progresso genético da produtividade de café beneficiado. A análise de variância da produção de café beneficiado evidenciou que a fonte de variação "clones" foi significativa nas safras avaliadas, de acordo com o teste F a 1% de significância. A predominância do componente genético na expressão dessa característica, associado a uma boa precisão experimental, indica a possibilidade de obtenção de ganhos com a seleção de plantas. O progresso genético da produção de café beneficiado com o plantio dos clones selecionados foi de 57,85%, que equivale a um aumento na média em quatro anos de 44,75 sacas ha-1, para 70,64 sacas ha-1. Além do incremento na produtividade de grãos, os clones de ciclo intermediário selecionados favorecem a concentração da colheita e a redução dos custos operacionais.

Update History of This Database - GenLibi | LSDB Archive [Life Science Database Archive metadata

Lifescience Database Archive (English)

Full Text Available switchLanguage; BLAST Search Image Search Home About Archive Update History Data ...List Contact us GenLibi Update History of This Database Date Update contents 2014/03/25 GenLibi English archi...base Description Download License Update History of This Database Site Policy | Contact Us Update History of This Database - GenLibi | LSDB Archive ... ...ve site is opened. 2007/03/01 GenLibi ( http://gene.biosciencedbc.jp/ ) is opened. About This Database Data

Sistema inmune y genética: un abordaje diferente a la diversidad de anticuerpos.

OpenAIRE

Matta Camacho, Nubia Estela

2011-01-01

RESUMEN Es común encontrar en los libros de inmunología o de genética un capítulo con el título de “sistema inmune y genética”, sin embargo su asociación se centra en cómo la generación de anticuerpos rompió el paradigma “un gen, una proteína”, pues en el caso de la producción de anticuerpos, un gen produce millones de proteínas. El sistema inmune tiene muchos vínculos con la genética y la herencia; esta asociación se da porque cualquier sustancia o compuesto que produzca un organi...

Reflexiones sobre la atención a personas con defectos genéticos en el nivel primario de salud

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Elena del Monte Sotolongo

2000-01-01

Full Text Available El rápido desarrollo de la Genética Molecular ha evidenciado la necesidad que tienen los profesionales de la salud de profundizar y actualizar los conocimientos de Genética Médica para así poder llevar a cabo una labor educativa eficiente, encaminada al control y prevención de estas enfermedades. El Médico de la Familia por su posición privilegiada en la atención primaria juega un rol fundamental en el manejo y su detección precoz.The fast development of Molecular Genetics has showed the need for the health care system professionals to update and enhance their knowledge of Medical Genetics in order to be able to undertake an efficient educational work, aimed to the prevention and control of these diseases. The family doctor due to his privileged position in primary care plays a key role in early detection and treatment.

Diagnóstico genético preimplantacional: análisis de aneuploidías únicas

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Paul W. López

2013-01-01

Full Text Available Introducción: De las causas más conocidas en cuanto a la falta del éxito en el embarazo con tratamientos de reproducción asistida son aquellas relacionadas a las aneuploidías cromosómicas presentes en los embriones. El diagnóstico genético preimplantacional (PGD es una técnica empleada en reproducción asistida para detectar estas anomalías, seleccionando aquellos que sean cromosómicamente normales, para luego transferirlos al útero de la paciente. Los embriones con aneuploidías únicas podrían tener la capacidad de sobrevivir y lograr la implantación, y por lo tanto, sin diagnóstico previo, estas podrían pasar desapercibidas. Objetivos: Determinar la incidencia de aneuploidías únicas en embriones de buena calidad embrionaria en el día 3 de desarrollo hasta blastocisto. Diseño: Estadístico y experimental. Instituciones: Reprogenetics Latinoamérica y Centro de Reproducción asistida, de la Clínica Concebir. Material Biológico: Muestras de biopsia embrionaria. Metodología: Análisis comparativo de resultados a partir de la evaluación de cada muestra obtenida por biopsia en el día tercero y día quinto de desarrollo embrionario, realizando el PGD por hibridación in situ (FISH y genómica comparada (aCGH, respectivamente. Resultados: El 62,9% de embriones que presentaron monosomías únicas al tercer día de desarrollo embrionario resultaron ser de 8 células. Pero cuando se evaluó por aCGH en día cinco, 42,3% resultó anormal, y de estos 37,5% perteneció al estadio de 8 células. El índice de monosomías únicas en blastocisto resultó ser 57,9% de un total de 84,2% de aneuploidías únicas. Conclusiones: Los embriones de 8 células en el tercer día de desarrollo embrionario son los más probables de llegar al estadio de blastocisto, así como presentar aneuploidías únicas.

KARAKTERISTIK SEKUEN cDNA PENGKODE GEN ANTI VIRUS DARI UDANG WINDU, Penaeus monodon

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Andi Parenrengi

2016-11-01

Full Text Available Transgenesis pada ikan merupakan sebuah teknik modern yang berpotensi besar dalam menghasilkan organisme yang memiliki karakter lebih baik melalui rekombinan DNA gen target termasuk gen anti virus dalam peningkatan resistensi pada udang. Gen anti virus PmAV (Penaeus monodon Anti Viral gene merupakan salah satu gen pengkode anti virus yang berasal dari spesies krustase. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui karakteristik gen anti virus yang diisolasi dari udang windu, Penaeus monodon. Isolasi gen anti virus menggunakan metode Polymerase Chain Reaction (PCR dan selanjutnya dipurifikasi untuk sekuensing. Data yang dihasilkan dianalisis dengan program Genetyx Versi 7 dan basic local alignment search tool (BLAST. Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen anti virus PmAV yang berhasil diisolasi dari cDNA udang windu dengan panjang sekuen 520 bp yang mengkodekan 170 asam amino. BLAST-N menunjukkan tingkat similaritas yang sangat tinggi (100% dengan gen anti virus yang ada di GeneBank. Komposisi asam amino penyusun gen anti virus yang paling besar adalah serin (10,00%, sedangkan yang terkecil adalah asam amino prolin dan lisin masing-masing 1,76%. Analisis sekuen gen dan deduksi asam amino (BLAST-P memperlihatkan adanya C-type lectin-like domain (CTLD yang memiliki kemiripan dengan gen C-type lectin yang diisolasi dari beberapa spesies krustase. Transgenic fish technology is a potential modern technique in producing better character organism through DNA recombinant of target genes including anti viral gene for improvement of shrimp immunity. PmAV (Penaeus monodon Anti Viral gene is one of anti viral genes isolated from crustacean species. The research was conducted to analyze the characteristics anti viral gene isolated from tiger prawn, Penaeus monodon. Anti viral gene was isolated using Polymerase Chain Reaction (PCR technique and then purified for sequencing. Data obtained were analyzed using Genetyx Version 7 software and basic local alignment

Origem da síndrome metabólica: aspectos genético-evolutivos e nutricionais = Origin of the metabolic syndrome: genetic, evolutionary and nutritional aspects

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Gottlieb, Maria Gabriela Valle

2008-01-01

Conclusões: a programação genética fetal pode ser afetada pela nutrição materna, o que pode levar a distúrbios no metabolismo energético. Além disso, uma vida sedentária, aliada a alta ingestão calórica, pode desencadear a Síndrome Metabólica

Drosophila: um importante modelo biológico para a pesquisa e o ensino de Genética

OpenAIRE

Rocha, Luana Diniz Linhares e Souza; Universidade Federal de Goiás; Faria, Joana Cristina Neves de Menezes; Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Goiás; Cruz, Aline Helena da Silva; Universidade de São Paulo; Reis, Angela Adamski da Silva; Universidade Federal de Goiás; Santos, Rodrigo da Silva; Universidade de São Paulo

2013-01-01

Uma das maiores dificuldades enfrentadas pelos professores de biologia é organizar o conteúdo a ser ministrado de maneira a garantir a eficiência do processo de ensino-aprendizagem. Nesse sentido, as Drosophilas têm sido aliadas dos professores durante aulas teóricas e práticas não só de zoologia, mas também de genética e ecologia, além de serem modelos utilizados intensamente na pesquisa, o que permite aos professores uma complementação das aulas com debates de atualidades científicas utiliz...

Ekspresi Gen CYP19 Aromatase, Estrogen, Androgen pada penderita Periodontitis Agresif

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Dahlia Herawati

2016-11-01

Full Text Available Kepadatan tulang tubuh ditentukan oleh gen CYP19 aromatase, hormon estrogen dan androgen. Pada periodontitis agresif terjadi perkembangan cepat kerusakan tulang alveolar, dan kerusakan tulang alveoler tersebut tidak diimbangioleh regenerasi tulang. Tujuan penelitian ini adalah menunjukkan ekspresi gen CYP19 aromatase, estrogen, androgen pada penderita periodontitis agresif agar dapat untuk menjadi pertimbangan pada saat melakukan perawatan periodontal. Metode penelitian, pemeriksaan ekspresi gen aromatse CYP19 berasal dari spesimen tulang alveolar menggunakan imunohistokimia, pengukuran hormon estrogen dan androgen dari serum menggunakan Vidas: Elfa. Hasil penelitian ekspresi gene CYP19 aromatase pada periodontitis agresif menunjukkan gambaran lebih rendah densitasnya dibandingkan pada nonperiodontitis. Estrogen dan androgen pad aperiodontitis agresif ada kecenderungan lebih rendah dibandingkan pada nonperiodontitis. Kesimpulan regenerasi tulang alveoler pad a periodontitis agresif terhambat karena sedikitnya gen CYP19 aromatase dan hormon estrogen dan androgen yang berperan pada pembentukan tulang alveoler kurang memadai.

Síndrome frágil X: Mutaciones dinámicas y su repercusión en otras enfermedades genéticas

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Aracely Lantigua Cruz

1997-04-01

Full Text Available En este artículo se presenta una revisión actualizada del síndrome frágil X, tanto en sus aspectos clínicos como genéticos. Se hace referencia al impacto que los mecanismos de esta peculiar mutación, han tenido en la explicación de fenómenos genéticos como la anticipación, característicos de varias enfermedades fundamentalmente neuromusculares y neurodegenerativas. Finalmente, se hace referencia al enfoque actual del diagnóstico del síndrome frágil X tanto clínico como citogenético y molecular, y a su repercusión en el diagnóstico prenatal.In this article, it is presented an updated review of the fragile X syndrome, both of their clinical and genetics aspects. It also refers to the impact the mechanisms of this peculiar mutation have had on the explanation of genetic phenomena such as the anticipation, which are characteristic of various diseases, mainly neuromuscular and neurodegenerative diseases. Finally, it deals with the present approach not only of the clinical diagnosis of the fragile X syndrome, but also of the cytogenetic and mollecular one and with its repercussion on the prenatal diagnosis.

Fatores genéticos associados ao câncer de mama masculino: uma revisão de literatura

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Nathalia Maria Tomaz Silveira

2016-10-01

Full Text Available O câncer de mama masculino é um quadro neoplásico raro, abrange 1% dos casos de câncer de mama no mundo todo, 1% dos tumores malignos em homens e apresenta incidência anual de 1 por 100.000. Reuniram-se informações acerca da atualidade de estudos relacionados ao caráter genético na patologia abordada, cujo objetivo foi analisar aspectos da predisposição e associação, utilizando 15 artigos originais indexados no período entre janeiro de 2011 a fevereiro de 2016, escritos em inglês e espanhol, com delineamento experimental ou observacional, utilizando os descritores câncer de mama masculino, tratamento do câncer, câncer de mama e fator genético do câncer de mama, assim como suas traduções em inglês male breast cancer, cancer treatment, breast cancer e genetic factors. Discutiu-se principalmente a influência genética na ocorrência do câncer de mama masculino, como alterações em genes supressores BRCA, relações com o ponto de checagem CHECK2, histórico familiar e ligações com a síndrome de Klinefelter, entre outros fatores. Aspectos ambientais também são sugeridos por parte da literatura na manifestação clínica da neoplasia, porém com menores ênfases conclusivas. Apesar da literatura sobre o tema ainda necessitar de crescimento e aprofundamento, observaram-se reafirmações científicas sobre a importância da influência genética, sobretudo do BRCA 2, além de confirmações quanto a multifatoriedade da neoplasia.

La genética de las poblaciones centroamericanas

OpenAIRE

Barrantes, Ramiro

2005-01-01

Las poblaciones centroamericanas no han sido objeto de muchos estudios genéticos con la excepción de análisis esporádicos de la variación entre y dentro de los grupos amerindios y de origen africano ubicados en el área. No obstante, en los últimos 15 años se efectuaron investigaciones sistemáticas en este sentido incluyendo poblaciones mestizas, particularmente las de Costa Rica y Panamá. En los amerindios se efectuaron estudios detallados de su estructura genética y las relaciones filogenéti...

Trazabilidad genética en ganado bovino: Estudio comparativo de la eficacia de microsatélites y SNPs.

OpenAIRE

Sanz Fernández, Arianne; Rodellar Penella, Clementina; Zaragoza Fernández, María Pilar

2011-01-01

La crisis de confianza de los consumidores relacionada con la producción animal y la producción de carne, ha supuesto una creciente sensibilización de todos los sectores en los temas relacionados con la seguridad alimentaria. En este sentido la trazabilidad se ha convertido en una herramienta fundamental al servicio de la calidad alimentaria. En la presente memoria se propone el establecimiento de un sistema de trazabilidad genética basado en marcadores de ADN. Se ha realizado un estudio comp...

Traffic Generator (TrafficGen) Version 1.4.2: Users Guide

Science.gov (United States)

2016-06-01

the network with Transmission Control Protocol and User Datagram Protocol Internet Protocol traffic. Each node generating network traffic in an...TrafficGen Graphical User Interface (GUI) 3 3.1 Anatomy of the User Interface 3 3.2 Scenario Configuration and MGEN Files 4 4. Working with...for public release; distribution is unlimited. vi List of Figures Fig. 1 TrafficGen user interface

Rendimento de grãos e qualidade tecnológica de genótipos de trigo em três zonas tritícolas do Estado de São Paulo no biênio 1994-95

Directory of Open Access Journals (Sweden)

FELICIO JOÃO CARLOS

2000-01-01

Full Text Available Foram avaliados o rendimento de grãos, a estabilidade e adaptabilidade ambiental, a tolerância ao alumínio tóxico e a qualidade tecnológica da farinha de vinte genótipos de trigo em três regiões tritícolas do Estado de São Paulo (Zonas A e B, sequeiro; Zona H, com irrigação por aspersão, no biênio 1994-95. Os resultados mostraram que: (a os genótipos tiveram comportamento regional diferenciado quanto ao rendimento de grãos; (b os genótipos IAC 289, IAC 340 e BR 18 mostraram-se, em média os mais produtivos, não diferindo do 'IAC 304', 'OCEPAR 14', 'IAC 350', 'Panda', 'IAC 60' e 'IAC 348'; (c os genótipos apresentaram, em geral, boa estabilidade produtiva nas diferentes condições ambientais; (d os genótipos IAC 289, IAC 340 e IAC 304 foram responsivos à melhoria ambiental e 'IAC 227', adaptado a ambientes desfavoráveis; (e os genótipos IAC 24, IAC 120, IAC 227, OCEPAR 14, IAC 348, Panda, BR 18, IAC 319, IAC 346, IAPAR 60, IAC 332 e IAC 347 foram tolerantes à toxicidade de Al3+; (f a farinha dos diferentes genótipos apresentou baixa atividade amilásica; (g os genótipos IAC 340, IAC 227, IAC 319 e IAC 60 propiciaram farinha com baixos valores de W (energia de deformação da massa e baixa estabilidade, características próprias de farinha de glúten fraco. Os demais genótipos revelaram característica de glúten forte.

TRANSFER GEN ANTIVIRUS PADA EMBRIO UDANG WINDU, Penaeus monodon DALAM BERBAGAI KONSENTRASI DEOXYRIBO NUCLEIC ACID

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Andi Parenrengi

2011-12-01

Full Text Available Teknologi transgenesis khususnya rekayasa genetik untuk menghasilkan udang windu resisten penyakit merupakan salah satu strategi yang dapat dilakukan dalam upaya pemecahan masalah penyakit yang menimpa budidaya udang windu. Teknologi transgenesis khususnya transfer gen antivirus pada udang windu telah berhasil dilakukan melalui teknik transfeksi. Meskipun demikian optimalisasi komponen teknologi tersebut masih perlu dilakukan. Konsentrasi DNA gen merupakan salah satu komponen teknologi transgenesis yang harus dioptimalkan untuk mendapatkan efisiensi dalam transfer gen. Penelitian bertujuan untuk mengetahui konsentrasi DNA gen antivirus yang optimal sebagai bahan transfer gen ke embrio menggunakan metode transfeksi. Embrio udang windu yang diperoleh dari hasil pemijahan induk asal Aceh, dikoleksi 5-10 menit setelah memijah dengan kepadatan 625 telur/2 mL. Transfeksi dilakukan dengan menggunakan media larutan transfeksi jetPEI dengan konsentrasi DNA gen antivirus sebagai perlakuan, yakni: 5, 10, dan 15 µg serta kontrol positif (tanpa plasmid DNA dan negatif (tanpa plasmid DNA dan larutan transfeksi, masing-masing 3 ulangan. Embrio hasil transfeksi ditetaskan pada stoples berisi air laut sebanyak 2 L yang diletakkan pada waterbath. Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen antivirus telah berhasil diintroduksi ke embrio udang windu. Hasil analisis ragam menunjukkan bahwa perbedaan konsentrasi DNA (5-15 µg tidak berpengaruh nyata (P>0,05 terhadap daya tetas embrio udang windu. Analisis ekspresi gen pada larva udang windu juga menunjukkan adanya aktivitas ekspresi gen antivirus pada semua perlakuan konsentrasi DNA, di mana ekspresi gen antivirus pada larva transgenik lebih tinggi dibandingkan dengan kontrol (tanpa transfeksi. Sintasan pasca-larva PL-1 yang didapatkan pada penelitian ini adalah 12,0%; 10,0%; 10,6%; 12,3%; dan 14,2% masing-masing untuk perlakuan konsentrasi plasmid DNA 5 µg, 10 µg, 15 µg, kontrol positif dan negatif, di mana

Consideraciones glotológicas en torno al femenino genérico

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Javier San Julián Solana

2017-12-01

Al concebir este recurso como una vía de ocultación de la mujer y como el vehículo de una ambigüedad intrínseca, dicho movimiento ideológico ha lanzado propuestas encaminadas a evitar su uso. Destacan los desdoblamientos de género (a veces sintetizados en la escritura mediante barras, arrobas u otros símbolos y la utilización de sustantivos colectivos o expresiones afines.

AKINESIA/HIPOKINESIA FETAL: UNA VENTANA AL MOVIMIENTO FETAL DURANTE EL DESARROLLO. ORIENTACIÓN CLÍNICA, ETIOLOGÍA Y DIAGNÓSTICO

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Dra. Claudia Castiglioni

2016-07-01

Full Text Available El desarrollo normal del esqueleto requiere de la existencia de movimientos fetales normales en frecuencia e intensidad. Cualquier restricción al desplazamiento normal en el feto en desarrollo, ya sea por factores intrínsecos o extrínsecos como los producidos por trastornos de las motoneuronas, músculos, sistema nervioso central, tejido conectivo, ambiente uterino, toxinas exógenas, afectará al feto. En esta revisión se resumen las manifestaciones clínicas, el abordaje diagnóstico y las diversas etiologías subyacentes a las contracturas articulares múltiples en el feto, haciendo hincapié en el espectro cada vez mayor de enfermedades genéticas específicamente en el campo neuromuscular. Los avances experimentados en las imágenes prenatales y las nuevas herramientas de genética molecular han permitido alcanzar un diagnóstico etiológico en un número cada vez mayor de pacientes, otorgar un mejor asesoramiento genético a la familia así como preparar las condiciones de tratamiento más favorables para el recién nacido.

Aconselhamento genético Genetic counseling

Directory of Open Access Journals (Sweden)

João Monteiro de Pina-Neto

2008-08-01

Full Text Available OBJETIVO: Esta revisão sobre aconselhamento genético (AG teve o objetivo de mostrar os conceitos atuais e os princípios filosóficos e éticos aceitos na grande maioria dos países e recomendados pela Organização Mundial da Saúde, as fases do processo, seus resultados e o impacto psicológico de uma doença genética em uma família. FONTES DOS DADOS: Os conceitos apresentados são baseados em uma síntese histórica da literatura sobre AG desde a década de 1930 até o momento atual, sendo que os artigos citados representam os principais trabalhos publicados e que hoje fundamentam a teoria e a prática do AG. SÍNTESE DOS DADOS: O AG modernamente é definido como um processo de comunicação que trata dos problemas humanos relacionados à ocorrência de uma doença genética em uma família. É fundamental que os profissionais da saúde conheçam os aspectos psicológicos desencadeados pela doença genética e como estes aspectos podem ser manejados. Vivemos ainda na genética humana e médica uma fase de predomínio dos aspectos técnicos e científicos e de pouca ênfase no estudo das reações emocionais e dos processos de adaptação das pessoas a estas doenças, o que leva ao baixo entendimento dos clientes sobre os fatos ocorridos, com conseqüências negativas sobre a vida familiar e para a sociedade. CONCLUSÕES: Conclui-se pela necessidade de que as famílias com doenças genéticas sejam encaminhadas para AG e que os profissionais desta área invistam mais na humanização do atendimento, desenvolvendo mais as técnicas do AG psicológico não-diretivo.OBJECTIVE: The objective of this review of genetic counseling (GC is to describe the current concepts and philosophical and ethical principles accepted by the great majority of countries and recommended by the World Health Organization, the stages of the process, its results and the psychological impact that a genetic disease has on a family. SOURCES: The concepts presented are

Estudio de la variabilidad genética en camélidos bolivianos

OpenAIRE

Barreta Pinto, Julia

2013-01-01

El estudio de los camélidos sudamericanos es de gran interés en los países andinoscomo Perú, Bolivia, Chile, Argentina, debido a su importante valor económico y suimportancia en el mantenimiento y desarrollo de las poblaciones rurales en dichos países. Dada la falta de estudios genéticos centrados en las poblaciones de camélidos quehabitan en Bolivia, y la necesidad de realizar una valoración de la diversidad genética deestas poblaciones, la presente Tesis doctoral ha abordado el estudio gené...

Kdz. Ereğlisi - Kocaman Orman İşletme Şefliğinde Gerçekleştirilen Kayın (Fagus orientalis Lipsky.) Yapay Gençleştirme Çalışmalarının Değerlendirilmesi

OpenAIRE

TUNÇTANER, Prof. Dr. Korhan; ÖZEL, Arş. Gör. Halil Barış; UZUNER, Orm.Yük. Müh. Tuğba

2006-01-01

Bu çalışmada, Kdz. Ereğli-Kocaman Orman İşletme Şefliğinin bazı bölmelerinde, değişik yıllarda gerçekleştirilen Kayın yapay gençleştirme çalışmalarının başarı durumu değerlendirilmiştir. Yapılan ölçüm ve tespitler sonucunda, farklı yaşlarda bulunan Kayın bireylerinin gelişimlerinin genel olarak tatmin edici düzeyde olduğu, ancak sayılarının çok yetersiz olduğu belirlenmiştir. Diğer taraftan, Kayın bireylerinin mevcut gövde düzgünlüklerinin ve tepe formlarının iyi durumda olduğu söylenebilir. ...

ASN’s actions in GEN IV reactors and Sodium Fast Reactors (SFR)

International Nuclear Information System (INIS)

Belot, Clotilde

2013-01-01

The ASN is involved in 3 actions concerning GEN IV: • Overview of nuclear reactor GEN IV systems; • Specific analysis about transmutation; • Prototype reactor ASTRID (SFR). Furthermore theses actions are in the beginning (no conclusions or results available)

Limited SHIV env diversification in macaques failing oral antiretroviral pre-exposure prophylaxis.

Science.gov (United States)

Zheng, Qi; Ruone, Susan; Switzer, William M; Heneine, Walid; García-Lerma, J Gerardo

2012-05-09

Pre-exposure prophylaxis (PrEP) with daily Truvada [a combination of emtricitabine (FTC) and tenofovir disoproxil fumarate (TDF)] is a novel HIV prevention strategy recently found to prevent HIV transmission among men who have sex with men and heterosexual couples. Acute infection in adherent persons who fail PrEP will inevitably occur under concurrent antiretroviral therapy, thus raising questions regarding the potential impact of PrEP on early viral dynamics. We investigated viral evolution dynamics in a macaque model of PrEP consisting of repeated rectal exposures to SHIV162P3 in the presence of PrEP. Four macaques were infected during daily or intermittent PrEP with FTC or FTC/TDF, and five were untreated controls. SHIV env sequence evolution was monitored by single genome amplification with phylogenetic and sequence analysis. Mean nucleotide divergence from transmitted founder viruses calculated 17 weeks (range = 12-20) post peak viremia was significantly lower in PrEP failures than in control animals (7.2 × 10-3 compared to 1.6 × 10-2 nucleotide substitutions per site per year, respectively, p diversification during early infection might enhance immune control by slowing the selection of escape mutants.

SIPSMetGen: It's Not Just For Aircraft Data and ECS Anymore.

Science.gov (United States)

Schwab, M.

2015-12-01

The SIPSMetGen utility, developed for the NASA EOSDIS project, under the EED contract, simplified the creation of file level metadata for the ECS System. The utility has been enhanced for ease of use, efficiency, speed and increased flexibility. The SIPSMetGen utility was originally created as a means of generating file level spatial metadata for Operation IceBridge. The first version created only ODL metadata, specific for ingest into ECS. The core strength of the utility was, and continues to be, its ability to take complex shapes and patterns of data collection point clouds from aircraft flights and simplify them to a relatively simple concave hull geo-polygon. It has been found to be a useful and easy to use tool for creating file level metadata for many other missions, both aircraft and satellite. While the original version was useful it had its limitations. In 2014 Raytheon was tasked to make enhancements to SIPSMetGen, this resulted a new version of SIPSMetGen which can create ISO Compliant XML metadata; provides optimization and streamlining of the algorithm for creating the spatial metadata; a quicker runtime with more consistent results; a utility that can be configured to run multi-threaded on systems with multiple processors. The utility comes with a java based graphical user interface to aid in configuration and running of the utility. The enhanced SIPSMetGen allows more diverse data sets to be archived with file level metadata. The advantage of archiving data with file level metadata is that it makes it easier for data users, and scientists to find relevant data. File level metadata unlocks the power of existing archives and metadata repositories such as ECS and CMR and search and discovery utilities like Reverb and Earth Data Search. Current missions now using SIPSMetGen include: Aquarius, Measures, ARISE, and Nimbus.

Criterios para el diagnóstico clínico de algunos síndromes genéticos

OpenAIRE

Noel Taboada Lugo; Roberto Lardoeyt Ferrer

2003-01-01

Hasta mediados del pasado siglo se conocía muy poco acerca de las enfermedades genéticas, aparte de su mera existencia. Si bien a título aislado muchas de ellas son entidades clínicas poco frecuentes, al sumar unos 30 000 síndromes, constituyen una afección pediátrica no desdeñable, y a pesar de su complejidad, el pediatra puede abordar con facilidad el reto de su diagnóstico, como base para solicitar los exámenes complementarios pertinentes o bien la interconsulta con otras especialidades, a...

O futuro da epidemiologia genética de características complexas

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Feitosa Mary F.

2002-01-01

Full Text Available A epidemiologia genética evoluiu de um enfoque em estudos sobre doenças mendelianas raras para a análise genética de características complexas. Com o advento de informações sobre a completa seqüência de genes ao longo do genoma humano e de outros organismos, o interesse da epidemiologia genética em desvendar a natureza dos fatores que influenciam essas características se tornou primordial. São apresentados os principais métodos empregados no estudo de doenças complexas bem como suas principais vantagens e desvantagens. Discute-se a importância na determinação da amostra e o uso de fenótipos e marcadores genéticos apropriados. Como exemplo das estratégias citadas tomamos o estudo de índice de massa corporal (BMI para ilustrar um fator genético principal localizado no cromossomo 7. Em uma discussão sobre tendências no estudo de ligação, embora reconhecendo que famílias e genealogias continuarão sendo o foco principal das amostras, discute-se alguns novos e eficientes tipos de amostragem (como por exemplo, controles não-relacionados em que amostras de conjunto de DNA serão universalmente empregadas. O reconhecimento da heterogeneidade genética entre estudos e sua interpretação será uma das mais importantes características no futuro das análises de características complexas.

Reclassification of Geobacillus pallidus (Scholz et al. 1988) Banat et al. 2004 as Aeribacillus pallidus gen. nov., comb. nov.

Science.gov (United States)

Miñana-Galbis, David; Pinzón, Dora L; Lorén, J Gaspar; Manresa, Angels; Oliart-Ros, Rosa M

2010-07-01

Although Anoxybacillus and Geobacillus, two genera of thermophilic bacteria close to the genus Bacillus, have only been described recently, the number of species in these genera has increased rapidly. Four thermophilic, lipolytic strains (DR01, DR02, DR03 and DR04) isolated from a hot spring in Veracruz (Mexico), which could not be identified phenotypically, were subjected to 16S rRNA gene sequence analysis. Three strains were identified as belonging to the genus Anoxybacillus, but strain DR03 was identified as Geobacillus pallidus. This result led us to perform a phylogenetic analysis of the genera Anoxybacillus and Geobacillus based on 16S rRNA gene sequences from all the type strains of these genera. Phylogenetic trees showed three major clusters, Anoxybacillus-Geobacillus tepidamans, Geobacillus sensu stricto and Geobacillus pallidus, while the 16S rRNA gene sequences of G. pallidus (DR03 and the type strain) showed low similarity to sequences of Anoxybacillus (92.5-95.1 %) and Geobacillus (92.8-94.5 %) species, as well as to Bacillus subtilis (92.2-92.4 %). In addition, G. pallidus could be differentiated from Anoxybacillus and Geobacillus on the basis of DNA G+C content and fatty acid and polar lipid profiles. From these results, it is proposed that Geobacillus pallidus should be classified in a novel genus, for which we propose the name Aeribacillus, as Aeribacillus pallidus gen. nov., comb. nov. The type strain of Aeribacillus pallidus is H12(T) (=ATCC 51176(T) =DSM 3670(T) =LMG 19006(T)).

Consejería genética y diagnóstico prenatal: recomendaciones y futuras perspectivas para Colombia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Dora Lucía Vallejo-Ardila

2014-12-01

Full Text Available Introducción: En el ámbito mundial la prevalencia de malformaciones congénitas en recién nacidos oscila entre 3 al 5%; en Colombia en 2007, se convirtió por primera vez en la causa más frecuente de mortalidad infantil. El objetivo de esta revisión de la literatura es describir la importancia de implementar protocolos diagnósticos y de consejería genética prenatal en Colombia. Metodología: Se realizó la búsqueda de la literatura en las bases de datos MEDLINE/PubMed, OVID, SciELO, Sciencedirect y ProQuest, utilizando términos MeSH como: “genetic counselling and congenital anomalies”, “prenatal diagnosis”, “genetic services”, “ECLAMC” y “Genetics in Latin America” para delimitar la búsqueda de artículos de revisión, y estudios descriptivos observacionales, que permitieran hacer un seguimiento detallado sobre los avances realizados los últimos diez años sobre consejería genética y diagnóstico prenatal en Colombia. Resultados: Es necesario implementar el uso racional de algoritmos diagnósticos y un mejor plan de control prenatal por parte del personal médico considerando la importancia de indagar por antecedentes de exposición a agentes teratogénicos, antecedente familiares positivos para malformaciones congénitas y estimar el riesgo de recurrencia, para lograr remitir al especialista de manera oportuna y éste pueda realizar su intervención precoz. Conclusiones: El diagnóstico prenatal implica correlacionar hallazgos ultrasonográficos con marcadores séricos para evaluar la necesidad de pruebas invasivas según la priorización del riesgo de anomalías congénitas. Esto debe hacerse en coordinación con un servicio multidisciplinario de  consejería genética que incluya: neonatología, perinatología, pediatría, ginecología, obstetricia, psiquiatría, trabajo social y  psicología.

HIV-1 Env and Nef Cooperatively Contribute to Plasmacytoid Dendritic Cell Activation via CD4-Dependent Mechanisms.

Science.gov (United States)

Reszka-Blanco, Natalia J; Sivaraman, Vijay; Zhang, Liguo; Su, Lishan

2015-08-01

Plasmacytoid dendritic cells (pDCs) are the major source of type I IFN (IFN-I) in response to human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection. pDCs are rapidly activated during HIV-1 infection and are implicated in reducing the early viral load, as well as contributing to HIV-1-induced pathogenesis. However, most cell-free HIV-1 isolates are inefficient in activating human pDCs, and the mechanisms of HIV-1 recognition by pDCs and pDC activation are not clearly defined. In this study, we report that two genetically similar HIV-1 variants (R3A and R3B) isolated from a rapid progressor differentially activated pDCs to produce alpha interferon (IFN-α). The highly pathogenic R3A efficiently activated pDCs to induce robust IFN-α production, while the less pathogenic R3B did not. The viral determinant for efficient pDC activation was mapped to the V1V2 region of R3A Env, which also correlated with enhanced CD4 binding activity. Furthermore, we showed that the Nef protein was also required for the activation of pDCs by R3A. Analysis of a panel of R3A Nef functional mutants demonstrated that Nef domains involved in CD4 downregulation were necessary for R3A to activate pDCs. Our data indicate that R3A-induced pDC activation depends on (i) the high affinity of R3A Env for binding the CD4 receptor and (ii) Nef activity, which is involved in CD4 downregulation. Our findings provide new insights into the mechanism by which HIV-1 induces IFN-α in pDCs, which contributes to pathogenesis. Plasmacytoid dendritic cells (pDCs) are the major type I interferon (IFN-I)-producing cells, and IFN-I actually contributes to pathogenesis during chronic viral infections. How HIV-1 activates pDCs and the roles of pDCs/IFN-I in HIV-1 pathogenesis remain unclear. We report here that the highly pathogenic HIV R3A efficiently activated pDCs to induce IFN-α production, while most HIV-1 isolates are inefficient in activating pDCs. We have discovered that R3A-induced pDC activation depends on

Microsatélites, distancias genéticas y estructura de poblaciones nativas sudamericanas

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Demarchi, Darío Alfredo

2009-01-01

Full Text Available En este trabajo se investigaron las relaciones genéticas entre 17 poblaciones nativas sudamericanas en relación a 15 microsatélites (STRs autosómicos, utilizando 3 distancias genéticas- DST, DAy (δu2-que se ajustan a diferentes postulados teóricos. A través de diferentes técnicas de análisis (escalamiento multidimensional, correlación y correlación parcial de matrices se puso a prueba si las distancias genéticas reflejaban las relaciones interpoblacionales esperadas a partir de la distribución geográfica o de relaciones lingüísticas entre las poblaciones. Además, se estimó en que grado las distintas medidas de distancias genéticas eran influenciadas por la diversidad (He de cada población. Los mapas genéticos muestran, principalmente para DST y DA, que las poblaciones aisladas y con bajo tamaño efectivo (Ne aparecen como outliers, mientras que las poblaciones con alto Ne y mayor flujo génico ocupan una posición central a bajos valores de distancia unas de otras y sin un patrón definido de agrupamiento. La falta de asociación entre distancias genéticas y lingüísticas o geográficas y por otra parte, la alta correlación negativa entre He y distancias génicas promedio por población confiman ese patrón, demostrando que la mayor parte de la variación interpoblacional puede ser explicada en función del grado de diversidad intrapoblacional. Es decir, las distancias genéticas no reflejan relaciones filogenéticas, lingüísticas o geográficas, sino más bien eventos demográficos recientes tales como cuellos de botella genético, efecto fundador o migración externa masiva. Este hecho puede ser comprobado por medio de otra metodología analítica, el modelo de Harpending y Ward.

Diversidade e estrutura genética de populações de Varronia curassavica Jacq. em restingas da Ilha de Santa Catarina

Directory of Open Access Journals (Sweden)

M.P. HOELTGEBAUM

2015-01-01

Full Text Available RESUMO Varronia curassavica Jacq. (Boraginaceae está presente na vegetação de restinga e apresenta relevantes propriedades medicinais. A espécie é explorada especialmente por comunidades locais e pela indústria farmacêutica, porém, carece de informações ecológicas e genéticas a seu respeito. Nesse contexto, o estudo foi conduzido com o objetivo de caracterizar a diversidade genética de três populações de V. curassavica em áreas de restinga na Ilha de Santa Catarina. Foram coletadas folhas de 50 indivíduos adultos em cada uma das três áreas de estudo e as frequências alélicas das populações foram obtidas a partir de 14 locos alozímicos. Foram encontrados 25 alelos distintos nas três populações, sendo dois alelos exclusivos. As populações apresentaram diversidade genética média de 0,111 e índice de fixação médio de -0,060 (-0,273 até 0,222. Os níveis de diversidade são intermediários, semelhantes aos exibidos por espécies da mesma família ou de características ecológicas semelhantes. Os índices de fixação foram todos significativos e discrepantes entre as populações, sendo que duas delas apresentaram excesso de heterozigotos. A divergência genética interpopulacional foi significativa e igual a 0,079, considerada moderada e sugerindo efeitos de subdivisão populacional. Os níveis de diversidade genética encontrados e a redução populacional causada pela redução e fragmentação dos habitats em que a espécie ocorre sugerem medidas de conservação ex situ e demandam maior rigor na proteção legal de áreas de proteção permanente.

Safer Systems: A NextGen Aviation Safety Strategic Goal

Science.gov (United States)

Darr, Stephen T.; Ricks, Wendell R.; Lemos, Katherine A.

2008-01-01

The Joint Planning and Development Office (JPDO), is charged by Congress with developing the concepts and plans for the Next Generation Air Transportation System (NextGen). The National Aviation Safety Strategic Plan (NASSP), developed by the Safety Working Group of the JPDO, focuses on establishing the goals, objectives, and strategies needed to realize the safety objectives of the NextGen Integrated Plan. The three goal areas of the NASSP are Safer Practices, Safer Systems, and Safer Worldwide. Safer Practices emphasizes an integrated, systematic approach to safety risk management through implementation of formalized Safety Management Systems (SMS) that incorporate safety data analysis processes, and the enhancement of methods for ensuring safety is an inherent characteristic of NextGen. Safer Systems emphasizes implementation of safety-enhancing technologies, which will improve safety for human-centered interfaces and enhance the safety of airborne and ground-based systems. Safer Worldwide encourages coordinating the adoption of the safer practices and safer systems technologies, policies and procedures worldwide, such that the maximum level of safety is achieved across air transportation system boundaries. This paper introduces the NASSP and its development, and focuses on the Safer Systems elements of the NASSP, which incorporates three objectives for NextGen systems: 1) provide risk reducing system interfaces, 2) provide safety enhancements for airborne systems, and 3) provide safety enhancements for ground-based systems. The goal of this paper is to expose avionics and air traffic management system developers to NASSP objectives and Safer Systems strategies.

Genetic similarity between coriander genotypes using ISSR markers Similaridade genética entre genótipos de coentro por marcadores ISSR

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Roberto de A Melo

2011-12-01

Full Text Available With the development of new cultivars, a precise genetic characterization is essential for improvement programs or for cultivar registration and protection. Molecular markers have been complementing the traditional morphological and agronomic characterization techniques because they are virtually unlimited, cover the whole genome and are not environmentally influenced. Genetic characterization constitutes the basis for studies involving estimates of genetic similarity. Therefore, the objective of the present study was to evaluate the genetic similarity between ten coriander genotypes (nine cultivars and one line using ISSR markers. The cultivars used were: Americano, Asteca, Palmeira, Português, Santo, Supéria, Tabocas, Tapacurá, Verdão and the experimental line HTV-9299. The genetic similarity between the cultivars was estimated using 227 banded regions of ISSR molecular markers. The UBC 897 oligonucleotide generated the highest number of fragments (16, resulting in a higher polymorphism. The results indicate that the twenty-nine oligonucleotides chosen were satisfactory for detecting polymorphism. Based on the grouping analysis determined from the similarity data, there were two groups and two sub-groups. The calculated similarity for the genotypes varied from 52 to 75%. The lowest similarity was observed between Português and Verdão, at 52%. The highest similarity was found between Português and Palmeira, at 75%. The ISSR is efficient for identifying DNA polymorphism in coriander.Com o surgimento de novas cultivares, uma caracterização genética precisa é essencial, visando à utilização em programas de melhoramento ou para fins de registros e ou proteção de cultivares. Marcadores moleculares vêm complementando a caracterização morfológica e agronômica tradicional, uma vez que são virtualmente ilimitados, cobrem todo o genoma e não são influenciados pelo ambiente. A caracterização genética constitui a base para

Predicción científica y prescripción en mejora genética vegetal en cuanto Ciencia Aplicada de Diseño: El caso de la mejora de frutales del género Prunus

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Pedro Martínez-Gómez

2017-01-01

Full Text Available La mejora genética vegetal tiene una doble índole científica: Ciencia Empírica de la Naturaleza y Ciencia Aplicada de Diseño. En este contexto el presente trabajo pretende indagar en la predicción científica como rasgo esencial de esta disciplina en cuanto Ciencia Aplicada de Diseño con especial referencia la mejora de frutales de hueso (del género Prunus. En mejora genética vegetal podemos hablar de tres niveles de conocimiento asociados a la biología molecular (nivel micro, la constitución genética de un individuo (nivel meso y al fenotipo o aspecto global de la nueva variedad (nivel macro, que afectan tanto a los tipos de predicción como a las metodologías a aplicar. La predicción constituye el objetivo principal de la mejora genética como Ciencia de Diseño. Es clave tener un conocimiento del futuro posible para poder hacer un nuevo diseño que estará completo al cabo de algunos años, más de 12 años en el caso de los frutales de hueso que es el objeto de este trabajo. Asimismo, es necesario tener en cuenta en el desarrollo de esta predicción científica aplicada a la mejora de Prunus diversas variables internas (la naturaleza genética del material vegetal de partida, las metodologías disponibles, etc. y externas (la aceptación social, los factores medioambientales, los estreses bióticos y abióticos, etc. a la hora de llevar a cabo esta predicción. El grado de conocimiento de estas variables determinará la calidad de la predicción en el diseño de nuevas variedades de Prunus.

El papel de la genética en la aparición y desarrollo de la periodontitis: II: Polimorfismos asociados a la enfermedad periodontal The role of genetics in the development and progression of periodontitis: II: Polymorphism associated to periodontal disease

OpenAIRE

D. Rodrigo-Gómez; A. Oteo-Calatayud; A. Alonso-Rosado; A. Bascones-Martínez

2008-01-01

La periodontitis es una enfermedad multifactorial que resulta de la interacción de bacterias periodontopatógenas con los mecanismos de respuesta inmune del huésped y que se caracteriza por una reacción inflamatoria que afecta al aparato de inserción del diente. Las enfermedades multifactoriales habitualmente envuelven complejas interacciones de muchos genes y factores ambientales. El tipo de variaciones genéticas involucradas en este tipo de enfermedades se denominan polimorfismos genéticos, ...

Variabilidade genética de Eugenia uniflora L. em remanescentes florestais em diferentes estádios sucessionais

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Roberto Valmorbida Aguiar

2013-04-01

Full Text Available A compreensão da diversidade genética fornece elementos básicos sobre a dinâmica e funcionamento de populações, auxiliando na conservação e uso sustentável das espécies. Supõe-se que populações sucessionais precoces poderiam ser geneticamente mais diferenciadas do que populações sucessionais mais tardias. Visando testar esta hipótese, o presente trabalho teve como objetivo analisar a variabilidade genética de populações de Eugenia uniflora L. em manchas florestais em diferentes estádios sucessionais. Foram selecionadas duas áreas em diferentes estádios de sucessão, sendo a primeira em estádio inicial e a segunda em estádio avançado. A área de estudo apresenta um remanescente florestal em transição de Floresta Ombrófila Mista e Floresta Estacional Semidecídua. Por meio da técnica de RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA e análise multivariada, a diversidade gênica esperada e a porcentagem de loci polimórficos foram estimadas, além da similaridade genética entre as populações de cada mancha florestal e a diversidade de cada área por meio do índice de diversidade de Simpson. Os resultados indicaram 79% de loci polimórficos para a área em estádio avançado e 70% para a área em estádio inicial de sucessão. A similaridade genética entre pares de indivíduos variou entre 0,55 e 0,86 na área em estádio inicial de sucessão e entre 0,45 e 0,78 para a área em estádio avançado. Não houve diferenças significativas entre a diversidade das duas áreas (P = 89. Um escalonamento multidimensional não-métrico indicou menor distância genética entre os indivíduos da área em estádio inicial. Da mesma forma, uma análise de similaridade - ANOSIM indicou separação entre os indivíduos das duas áreas.

Ambulatório de genética médica na Apae: experiência no ensino médico de graduação

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Débora Gusmão Melo

Full Text Available Este trabalho relata uma experiência de ensino cujo objetivo foi oferecer formação significativa e integradora na área de genética médica aos graduandos de medicina do Centro Universitário Barão de Mauá. Para isto, em 2005, foi estruturado um ambulatório de genética médica na Associação de Pais e Amigos dos Excepcionais (Apae do município de Jardinópolis (SP, como parte do estágio de internato em Saúde Coletiva e Medicina da Família e Comunidade, realizado nos serviços de saúde desse município. Desde então, os estudantes do sexto ano do curso médico avaliaram 140 pacientes, estabelecendo o grau de comprometimento intelectual, a etiologia da deficiência mental e oferecendo aconselhamento genético não-diretivo às famílias, sob orientação dos professores. A diversificação do cenário de ensino e aprendizagem aproximou os alunos da realidade dos pacientes com deficiência mental no País. Além disto, os estudantes puderam se apropriar de alguns fundamentos teóricos da genética médica a partir da constatação de suas implicações na prática clínica, tornando a aprendizagem significativa. Com esta experiência espera-se ter contribuído para a formação de médicos mais competentes na área da genética médica e saúde coletiva, e dispostos a trabalhar de forma integrada e integradora com a comunidade.

Crystal Structure of a Eukaryotic GEN1 Resolving Enzyme Bound to DNA

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Yijin Liu

2015-12-01

Full Text Available We present the crystal structure of the junction-resolving enzyme GEN1 bound to DNA at 2.5 Å resolution. The structure of the GEN1 protein reveals it to have an elaborated FEN-XPG family fold that is modified for its role in four-way junction resolution. The functional unit in the crystal is a monomer of active GEN1 bound to the product of resolution cleavage, with an extensive DNA binding interface for both helical arms. Within the crystal lattice, a GEN1 dimer interface juxtaposes two products, whereby they can be reconnected into a four-way junction, the structure of which agrees with that determined in solution. The reconnection requires some opening of the DNA structure at the center, in agreement with permanganate probing and 2-aminopurine fluorescence. The structure shows that a relaxation of the DNA structure accompanies cleavage, suggesting how second-strand cleavage is accelerated to ensure productive resolution of the junction.

Composición Musical a Través del Uso de Algoritmos Genéticos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Ezequiel Moldaver

2014-06-01

Full Text Available Este trabajo se enfocará en el uso de los algoritmos genéticos (AAGG con el fin de mezclar armonías y melodías de forma que se genere una composición musical de buen sonido para el oído, lo que significa que el contexto de cada nota respaldará la sonoridad de la misma provocando que no se genere un efecto disonante de forma permanente, que se genere una disonancia momentánea es permisible ya que es parte de la misma música generar tensión a través de pequeños intervalos poco agradables al oído.

GenMapDB: a database of mapped human BAC clones

OpenAIRE

Morley, Michael; Arcaro, Melissa; Burdick, Joshua; Yonescu, Raluca; Reid, Thomas; Kirsch, Ilan R.; Cheung, Vivian G.

2001-01-01

GenMapDB (http://genomics.med.upenn.edu/genmapdb) is a repository of human bacterial artificial chromosome (BAC) clones mapped by our laboratory to sequence-tagged site markers. Currently, GenMapDB contains over 3000 mapped clones that span 19 chromosomes, chromosomes 2, 4, 5, 9–22, X and Y. This database provides positional information about human BAC clones from the RPCI-11 human male BAC library. It also contains restriction fragment analysis data and end sequen...

Description of Guyruita gen. nov. and two new species (Ischnocolinae, Theraphosidae Descrição de Guyruita gen. nov. e duas novas espécies (Ischnocolinae, Theraphosidae

Directory of Open Access Journals (Sweden)

José P.L. Guadanucci

2007-12-01

Full Text Available The genus Guyruita gen. nov. and two new species from Brazil are described. Holothele waikoshiemi (Bertani & Araújo, 2005 from Venezuela is transferred here to the new genus. Guyruita gen. nov. differs from the remaining Ischnocolinae by the following features: labium densely occupied by a lot of cuspules (more than 100, intercheliceral intumescence absent, posterior sternal sigilla remote from margin, tarsal claws without teeth, tarsal scopula I-II undivided (tarsus II with a line of sparse setae, which does not divide the scopula, III-IV divided.É descrito o gênero Guyruita gen. nov. e duas espécies novas do Brasil. Holothele waikoshiemi (Bertani & Araújo, 2005 da Venezuela é transferido para o novo gênero. Guyruita gen. nov. difere dos outros Ischnocolinae pelas seguintes caracterísicas: lábio densamente ocupado por muitas cúspides (mais de 100, tumescência interqueliceral ausente, sigilla esternal posterior distante da margem, unhas tarsais sem dentes, escópula tarsal I e II inteiras (tarso II com uma fileira de cerdas esparsas, as quais não dividem a escópula, III e IV divididas.

A Novel Role of Human Holliday Junction Resolvase GEN1 in the Maintenance of Centrosome Integrity

DEFF Research Database (Denmark)

Gao, M.; Danielsen, Jannie Michaela Rendtlew; Wei, L.-Z.

2012-01-01

but not catalytic activity of GEN1 is required for preventing centrosome hyper-amplification, formation of multiple mitotic spindles, and multi-nucleation. Our findings provide novel insight into the biological functions of GEN1 by uncovering an important role of GEN1 in the regulation of centrosome integrity....

Androesterilidad genético citoplasmática en sorgo : empleo de los citoplasmas A2 yA3

OpenAIRE

Shaw, María; Shaw, Carlos Eduardo; Goldemberg, José B.

1988-01-01

p.117-122 En la producción de híbridos de sorgo, el uso continuo de un mismo citoplasma (Milo), ocasiona reducción de la variabilidad genética, pues todas las madres de los híbiridos comerciales deben poseer dicho citoplasma. Se ha confirmado la existencia de citoplasmas diferentes al Milo (A1) como proniotores de androesterilidad en sorgo (denominados A2 y A3). Fin este trabajo se evaluó la reacción de diez lineas puras de sorgo, usadas comunmente en la producción de híbridos comerciales,...

Criminología biológica: Una mirada desde la genética forense/Biological criminology: a view from the forensic genetics

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Rosa Elizabeth Carrera Palao

2017-01-01

Full Text Available El presente artículo tiene como objeto establecer el estado del arte en neurobiología en torno a la predisposición genética que determina la conducta agresiva, en el ámbito de las neurociencias, y etiopatogenia de la anatomía patológica en los trastornos de personalidad antisocial, que caracteriza la conducta violenta del comportamiento delictivo, de interés a la criminología biológica. Aplicando el método de búsqueda selectiva no sistemática de información relevante de investigaciones científicas reportadas en genética de la conducta y epigenética. Se reportan contribuciones genéticas implicadas en la conducta agresiva, violenta, antisocial, y la interacción de factores genéticos con los ambientales. Se desconoce con exactitud los mecanismos como factores genéticos contribuyen a estas conductas. El maltrato o abuso físico, sexual o psicológico, y respuesta al estrés, son factores ambientales, que tienen efecto sobre la expresión de genes específicos y, consecuentemente, en la conducta agresiva. Los principales hallazgos son: menor tamaño craneal y volumen encefálico, asimetría del lóbulo frontal, descenso de actividad de la corteza prefrontal con disminución del flujo sanguíneo, alteración de memoria, atención y concentración, menor volumen del hipocampo y amígdala, incremento de concentración de dopamina, adrenalina, noradrenalina y cortisol; niveles alterados de serotonina en corteza prefrontal, niveles altos de testosterona, niveles bajos de colesterol, efectos de drogas, dietas, cobre, zinc, traumatismos, contaminación ambiental y toxinas. La neurogenética ha reportado dos genes que codifican enzimas principales del metabolismo de serotonina en el cerebro (triptófano-hidroxilasa y MAO-A y el receptor 5-HT1A, forman parte del complejo grupo de genes que modulan la conducta agresiva.

Environmental Information for the U.S. Next Generation Air Transportation System (NextGen)

Science.gov (United States)

Murray, J.; Miner, C.; Pace, D.; Minnis, P.; Mecikalski, J.; Feltz, W.; Johnson, D.; Iskendarian, H.; Haynes, J.

2009-09-01

It is estimated that weather is responsible for approximately 70% of all air traffic delays and cancellations in the United States. Annually, this produces an overall economic loss of nearly 40B. The FAA and NASA have determined that weather impacts and other environmental constraints on the U.S. National Airspace System (NAS) will increase to the point of system unsustainability unless the NAS is radically transformed. A Next Generation Air Transportation System (NextGen) is planned to accommodate the anticipated demand for increased system capacity and the super-density operations that this transformation will entail. The heart of the environmental information component that is being developed for NextGen will be a 4-dimensional data cube which will include a single authoritative source comprising probabilistic weather information for NextGen Air Traffic Management (ATM) systems. Aviation weather constraints and safety hazards typically comprise meso-scale, storm-scale and microscale observables that can significantly impact both terminal and enroute aviation operations. With these operational impacts in mind, functional and performance requirements for the NextGen weather system were established which require significant improvements in observation and forecasting capabilities. This will include satellite observations from geostationary and/or polar-orbiting hyperspectral sounders, multi-spectral imagers, lightning mappers, space weather monitors and other environmental observing systems. It will also require improved in situ and remotely sensed observations from ground-based and airborne systems. These observations will be used to better understand and to develop forecasting applications for convective weather, in-flight icing, turbulence, ceilings and visibility, volcanic ash, space weather and the environmental impacts of aviation. Cutting-edge collaborative research efforts and results from NASA, NOAA and the FAA which address these phenomena are summarized

The GenABEL Project for statistical genomics.

Science.gov (United States)

Karssen, Lennart C; van Duijn, Cornelia M; Aulchenko, Yurii S

2016-01-01

Development of free/libre open source software is usually done by a community of people with an interest in the tool. For scientific software, however, this is less often the case. Most scientific software is written by only a few authors, often a student working on a thesis. Once the paper describing the tool has been published, the tool is no longer developed further and is left to its own device. Here we describe the broad, multidisciplinary community we formed around a set of tools for statistical genomics. The GenABEL project for statistical omics actively promotes open interdisciplinary development of statistical methodology and its implementation in efficient and user-friendly software under an open source licence. The software tools developed withing the project collectively make up the GenABEL suite, which currently consists of eleven tools. The open framework of the project actively encourages involvement of the community in all stages, from formulation of methodological ideas to application of software to specific data sets. A web forum is used to channel user questions and discussions, further promoting the use of the GenABEL suite. Developer discussions take place on a dedicated mailing list, and development is further supported by robust development practices including use of public version control, code review and continuous integration. Use of this open science model attracts contributions from users and developers outside the "core team", facilitating agile statistical omics methodology development and fast dissemination.

Genes and proteins of Escherichia coli (GenProtEc).

Science.gov (United States)

Riley, M; Space, D B

1996-01-01

GenProtEc is a database of Escherichia coli genes and their gene products, classified by type of function and physiological role and with citations to the literature for each. Also present are data on sequence similarities among E.coli proteins with PAM values, percent identity of amino acids, length of alignment and percent aligned. The database is available as a PKZip file by ftp from mbl.edu/pub/ecoli.exe. The program runs under MS-DOS on IMB-compatible machines. GenProtEc can also be accessed through the World Wide Web at URL http://mbl.edu/html/ecoli.html.

Validación de la entrevista diagnóstica para estudios genéticos (DIGS en Colombia.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Carlos Alberto Palacio

2004-03-01

Full Text Available Objetivo: validar la entrevista diagnóstica para estudios genéticos (DIGS 3.0 en Colombia. Métodos: se hicieron dos traducciones del inglés al español del DIGS y se hizo traducción en sentido inverso (al inglés de cada una. Un comité de revisión verificó la equivalencia translingüística y transcultural. Se evaluó la confiabilidad examen-reexamen e interevaluador del DIGS 3.0 en 65 y 91 pacientes, respectivamente, mediante el cálculo de kappa de Cohen. Resultados: el DIGS 3.0 mostró ser comprensible, con validez de apariencia y de contenido. La confiabilidad interevaluador fue excelente para esquizofrenia (k=0,81, IC95%: 0,68-0,93, trastorno bipolar (k=0,87, IC95%: 0,75-0,99, trastorno depresivo mayor (k=0,86, IC95%: 0,7- 1 y ausencia de trastorno psiquiátrico (k=0,88, IC95%: 0,71-1; fue buena para otro diagnóstico psiquiátrico (k=0,65, IC95%: 0,41-0,89 y pobre para trastorno esquizoafectivo (k=0,37, IC95%: -0,02-0,76. La confiabilidad examen-reexamen fue excelente para todos los diagnósticos (k>0,8, excepto para otro diagnóstico psiquiátrico (k=0,64, IC95%: 0,31-0,96, donde fue buena. Conclusiones: la versión en español del DIGS para Colombia mostró comprensibilidad, validez de apariencia y de contenido, y confiabilidad examen-reexamen e interevaluador. Es una herramienta útil para estudios genéticos en esquizofrenia y en trastornos afectivos.

Reflexo da interação genótipo x ambiente sobre o melhoramento genético de feijão

OpenAIRE

Pereira, Thayse Cristine Vieira; Schmit, Rodolfo; Haveroth, Eduardo José; Melo, Rita Carolina de; Coimbra, Jefferson Luís Meirelles; Guidolin, Altamir Frederico; Backes, Rogério Luiz

2015-01-01

RESUMO: O objetivo foi avaliar os componentes da variância fenotípica e estimar a influência da interação genótipo*ambiente no rendimento de grãos em feijão. Os componentes da variância fenotípica foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita e do melhor preditor linear não viesado (REML/BLUP), juntamente com o espaço de inferência específico. As avaliações foram realizadas nas safras agrícolas de 2006/07 a 2011/12 no município de Lages/SC. Durante o período, 104 genótipos fo...

ANALISIS SEKUEN GEN GLUTATION PEROKSIDASE (GPX1 SEBAGAI DETEKSI STRES OKSIDATIF AKIBAT INFEKSI MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Ari Yuniastuti

2013-02-01

Full Text Available Glutation merupakan antioksidan yang berperan dalam fungsi imun, dan diekspresikan secara genetik oleh urutan gen yang membentuk protein enzim Glutation Peroxidase (GPx1. Bila ekspresi gen berubah maka terjadi perubahan fungsi glutation dan kerentanan terhadap stress oksidatif. Metode yang digunakan adalah Kasus-kontrol. Sampel yang digunakan adalah sampel darah. Kelompok kasus adalah sampel darah pasien tuberkulosis paru sedangkan kelompok kontrol adalah sampel darah orang sehat. Pemeriksaan gen Glutation peroxidase (GPx1 menggunakan metode Polymerase Chain Reaction (PCR untuk melihat pita DNA pada pasien tuberkulosis par serta elektroforesis produk PCR-RFLP gen GPx1 kelompok sampel tuberkulosis. Hasil penelitian menunjukkan bahwa tidak terdapat hubungan yang bermakna antara polimorfisme gen GPx1 (p=0,365 pasein tuberkulois dengan individu sehat, sehingga tidak dapat digunakan sebagai alat deteksi kerentanan terhadap stress oksidatif pada pasien tuberkulosis. Perlu penelitian lanjutan yang menggunakan sampel lebih besar dan populasi etnik yang berbeda.

Detección de una mutación puntual en el gen receptor Ryanodina (Ryr 1 en cerdos criollos colombianos

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Muñoz Flórez Jaime Eduardo

2008-12-01

Full Text Available El síndrome de estrés porcino (PSS es una enfermedad hereditaria monogénica recesiva relacionada con el gen receptor ryanodina (Ryr1. Utilizando PCR-SSCP y PCR-RFLP se tipificaron genéticamente 14 individuos de cerdos comerciales con el rasgo sindactilia (Casco de Mula-CM, 21 San Pedreños -SP y 100 Zungos- ZN. Las razas CM y SP tuvieron las mismas frecuencias alélicas (F(H = 0.79 y F(h = 0.21, mientras que en los cerdos ZN no se encontró el alelo recesivo (h. La heterocigosidad (He fue de 0.28% para los cerdos CM y 0.23% para los SP. La He para la muestra poblacional fue de 0.066.

Polimorfismos del gen BoLA-DRB3.2* en ganado criollo colombiano

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Darwin Hernández H.

2013-10-01

Full Text Available Objetivo. Caracterizar el polimorfismo del gen BoLA-DRB3.2* en las razas bovinas criollas y colombianas. Materiales y métodos. En 360 muestras de ADN de ocho razas bovinas criollas (Blanco Orejinegro, Casanareño, Costeño con Cuernos, Chino Santandereano, Caqueteño, Hartón del Valle, Romosinuano y San Martinero, dos razas sintéticas Colombianas (Lucerna y Velásquez y dos razas foráneas (Brahman y Holstein se evaluó el polimorfismo del gen BoLA-DRB3.2 mediante técnicas moleculares (PCR-RFLP; se calculó el número promedio de alelos (NPA, las frecuencias, la heterocigocidad esperada (He y observada (Ho, el equilibrio de Hardy-Weinberg, la estructura genética y los valores de FST y FIS. Resultados. El NPA fue 14.6 ± 3.8 siendo Caqueteño la raza con mayor NPA (25 y el menor el Chino Santandereano (10. Se encontraron 41 alelos BoLA-DRB3.2* los más frecuentes fueron *28, *37, *24, *23, *20, *27, *8, *16, *39 (0.17, 0.11, 0.10, 0.09, 0.09, 0.07, 0.07 y 0.06 respectivamente. Se encontró alta diversidad genética (He = 0.878 con mayor valor en Caqueteño (0.96 y menor en San Martinero (0.81. Todas las razas se encontraron en equilibrio de Hardy-Weinberg, se encontraron valores altamente significativos de diferenciación genética (FST= 0.044 y de coeficiente de endogamia (FIS = 0.249. Conclusiones. El ganado criollo colombiano posee alto polimorfismo del gen BoLA-DRB3.2* representado en los altos valores de NPA y diversidad génetica.

Una interesante aproximación histórica al estudio del péndulo compuesto

OpenAIRE

Camargo, C.; Páez, R.

2012-01-01

Este artículo presenta una adaptación de la versión que hace E. Mach de la solución de Huy gens al problema de hallar el período de oscilación de un péndulo compuesto por varias partículas colocadas en linea, un problema de interés histórico y didáctico. Se propone también una solución intuitiva, que surge de consideraciones semejantes, al problema de hallar el periodo de oscilación de un aro.

Variabilidade genética da produção anual da seringueira: estimativas de parâmetros genéticos e estudo de interação genótipo x ambiente Genetic variability of rubber tree annual yielding: estimates of genetic parameters and study of genotype x environment interaction

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Paulo de Souza Gonçalves

1990-01-01

Full Text Available Selecionaram-se dezenove genótipos de seringueira (Hevea brasiliensis Muell. Arg. considerados como os melhores em vigor e produção em uma população de pés francos estabelecidos no campo de ensaios da Estação Experimental de Pindorama, com o objetivo de estudar a variabilidade genética e ambiental e a interação genótipo x ambiente sobre a produção durante cinco anos. Com base na análise da variância anual e conjunta, estimaram-se parâmetros genéticos para produção, na tentativa de quantificar o ganho genético com a seleção, e as correlações genéticas e fenotfpicas das produções ano a ano. Os resultados das análises da variância dentro de anos mostraram efeitos significativos para genótipos, sendo os efeitos da interação genótipo x ambiente altamente significativos. As estimativas de herdabilídade, no sentido amplo, ao nível de médias de parcelas, foram altas, com amplitude de 0,57 a 0,77, respectivamente, para o segundo e quinto ano de produção. As maiores percentagens de ganho genético foram obtidas no primeiro e quinto ano de produção, 39,03 e 27,57 respectivamente. Correlações genéticas e fenotípicas entre anos de sangria foram altas e significativas. Os altos valores de herdabilidade e ganho genético para o primeiro ano de sangria indicam que a seleção massal conduzida nesta fase proporciona, efetivamente, maior ganho na seleção.Nineteen rubber trees (Hevea brasiliensis Muell. Arg. considered as the best in growth and yield performance, were selected from a mature seedling population in the experimental field at the Pindorama Experiment Station of the "Instituto Agronômico de Campinas", São Paulo State, Brazil. Studies were carried out aiming to assess the annual environmental influence on genetic variation in five years of yielding. Components of variance were estimated from these analyses in an attempt to quantify genotype x environment interactions. The results of the analysis of

Aplicabilidad de estrategias genéricas de diseño pasivo en edificaciones bajo la influencia del cambio climático en Concepción y Santiago, Chile

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Carlos Rubio-Bellido

2015-12-01

Full Text Available Las estrategias de diseño pasivo en arquitectura y el comportamiento energético de la edificación normalmente se cuantifican en base a archivos climáticos que, por lo general, no consideran las predicciones del clima. Este artículo profundiza en la generación de datos climáticos futuros y su influencia en el confort higrotérmico, así como en las estrategias de diseño arquitectónico genéricas de adaptación desde el punto de vista pasivo. Con ese fin, se han generado determinados escenarios climáticos para Concepción y Santiago, dos de las conurbaciones urbanas más pobladas de Chile, para los años 2020, 2050 y 2080. Las predicciones se han realizado para el escenario más extendido de emisiones de Gases de Efecto Invernadero GEIA 2 “medium-high”, según el Intergovernmental Panel on Climate Change IPCC. Los niveles de confort se han examinado desde una perspectiva adaptativa, considerando estrategias de diseño genéricas, ambos modelos recogidos en la ASHRAE. Al analizar los pronósticos climáticos con los modelos de confort, se obtienen resultados para una mejor comprensión del grado de adaptación del usuario y la arquitectura al posible clima futuro. Esta investigación genera estrategias genéricas para optimizar el diseño de construcciones en Chile.

Uros, genética, indígenas y colonos. A propósito de la Neolitización de Europa

OpenAIRE

Alday, Alfonso .; Carretero, José Miguel; Anderung, Cecilia .; Götherström, Anders .

2012-01-01

Las analíticas genéticas realizadas sobre los uros (Bos primigenius) del yacimiento de Mendandia (Treviño), han ofrecido un resultado sorprendente: uno de los individuos pertenece al haplotypo T3, generalmente asociado a animales domésticos (Bos taurus). La datación de la muestra (7265 ± 70 BP; Ua 34366) es acorde con las otras conocidas de su nivel, el III-superior, incidiendo en la antigüedad de su Neolítico. El dato es la excusa para reflexionar sobre el proceso neolitizador y adentrarnos ...

Aspectos biológicos, morfológicos y genéticos de Hypothenemus obscurus e Hypothenemus hampei (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae)

OpenAIRE

CONSTANTINO, LUIS M.; NAVARRO, LUCIO; BERRIO, ALEJANDRO; ACEVEDO, FLOR E.; RUBIO, DAVID; BENAVIDES, PABLO

2011-01-01

Existen dos especies de Hypothenemus en Colombia de importancia económica: H. hampei y H. obscurus. La primera es la plaga más destructiva del café, mientras que la segunda ataca varias especies, incluyendo macadamia y café. El objetivo de esta investigación fue comparar estas dos especies, biológica, morfológica y genéticamente, con el fin de establecer diferencias que expliquen la adaptación de la broca al café. Los insectos fueron criados en dieta artificial de café y macadamia para estudi...

BÚSQUEDA DE LA MUTACIÓN Phe-809 EN EL GEN DEL SUSTRATO DEL RECEPTOR DE INSULINA -1 (IRS-1 EN RATAS DIABÉTICAS eSS

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Stella Maris Daniele

2010-01-01

Full Text Available El gen del sustrato del receptor de insulina IRS-1 juega un rol clave en la transducción de señales de insulina en músculo esquelético. Diversos polimorfismos del gen IRS-1 han sido reportados en estados de insulinorresistencia como obesidad y diabetes tipo 2.Las ratas eSS desarrollan espontáneamente diabetes tipo 2 magra, con insulinoresistencia caracterizada por hiperglucemia e hiperinsulinemia. Durante el segundo año existe disminución progresiva de la insulinemia y agravamiento del síndrome. Nuestro propósito fue buscar la mutación Phe-809 en el gen IRS-1, que implica sustitución del aminoácido Ser por Phe en el codon 809; dicho sitio se halla conservado en la rata. Esta variante fue identificada en pacientes diabéticos tipo 2. El gen del IRS-1 consta de un solo exón.Se analizó un fragmento de 281pb del gen IRS-1, que posee 90% de homología con el mismo fragmento en humanos. Se purificó ADN de leucocitos de un pool de sangre de ratas machos eSS y controles Wistar. Se cuantificó y amplificó por PCR utilizando un par de primers para amplificar ese mismo fragmento en el gen IRS-1 en humanos. Se usó sangre humana como control de amplificación. Se empleó el método de Sanger en la secuenciación del fragmento obtenido por PCR, previa extracción del mismo de un gel de agarosa al 2%. Se observó que la rata eSS y las controles mantuvieron la lectura esperada para ese fragmento, no encontrándose la mutación investigada. Se descarta la mutación Phe-809 como origen de la insulinoresistencia de la rata eSS.

Avaliação genética de touros usando produção em lactações completas ou parciais projetadas: 3. Confiabilidade e ganhos genéticos

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Melo Cláudio Manoel Rodrigues de

2000-01-01

Full Text Available Para estudar a viabilidade de se usarem produções em lactações parciais, projetadas, na avaliação do mérito genético de touros, foram utilizadas 4595 lactações de 2254 vacas, filhas de 145 touros de 1618 matrizes, distribuídas em 18 rebanhos, com partos entre 1980 e 1997. A partir de 91, 151, 211 ou 241 dias de lactação, projetaram-se 10, 30, 50 ou 70% das lactações, para a duração da lactação observada e para 305 dias. As estimativas dos parâmetros genéticos foram obtidas pelo sistema MTDFREML. Incluíram-se no modelo, independente da característica, efeitos fixos de rebanho-ano, época de parto e idade da vaca ao parto, com termos linear e quadrático, considerando-se efeitos aleatórios de animal, efeito permanente de ambiente e erro. A média das confiabilidades, obtida por meio das produções estimadas (PE, variou de 0,60 a 0,67, utilizando-se P305 igual a 0,60. O ganho genético anual pela seleção dos touros utilizando as PE foi, em média, 24,27% maior que o ganho genético anual da P305, quando as lactações foram projetadas para a duração da lactação observada, e 25,65% superior, quando as lactações foram projetadas para P305. As confiabilidades obtidas, bem como os ganhos genéticos anuais estimados nas avaliações genéticas, usando as PE, foram semelhantes àquelas obtidas para a produção de leite até 305 dias.

CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE AISLADOS DE Sclerotium cepivorum MEDIANTE ANÁLISIS DEL POLIMORFISMO DE LOS FRAGMENTOS AMPLIFICADOS AL AZAR CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE AISLADOS DE Sclerotium cepivorum MEDIANTE ANÁLISIS DEL POLIMORFISMO DE LOS FRAGMENTOS AMPLIFICADOS AL AZAR

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Francisco Luna Martínez

2012-02-01

Full Text Available Sclerotium cepivorum is the etiologic agent of garlic "white rot". Knowledge of genetic variability of the fungus may help to design efficient strategies for its control. For this study, 47 isolates obtained from Aguascalientes, Guanajuato and Zacatecas as well as 7 reference strains were used. Morphological characterization was that established for this organism. PCR amplification of ribosomal 18S gene generated a DNA fragment of a size close to 2.2 Kb in all isolates and reference strains, as compared to that of 1.8 Kb amplified in control fungi. Variability was analyzed by Random Amplified Polymorphism Distance (RAPD. Isolates exhibited a similar gene pattern with an average dissimilitud of 9.4%. Some of the bands identified here can be useful as molecular markers in identification studies of this plant pathogen. Dendogram analysis of data revealed a tendency of isolates to group according to their geographic procedence.Sclerotium cepivorum es el agente causal de la "pudrición blanca" del ajo. El conocer su variabilidad genética permitirá buscar estrategias de control mas eficientes. Se utilizaron 47 aislados de S. cepivorum provenientes de Aguascalientes, Guanajuato, Zacatecas y 7 cepas de referencia. El análisis morfológico correspondió al establecido para este hongo. Se amplificó el gen ribosomal 18S dando un tamaño cercano a 2.2 kb en todos los aislados y cepas de S. cepivorum, en los hongos control fue de aproximadamente 18 kb. El grado de variabilidad se analizó por medio del Polimorfismo de los Fragmentos Amplificados al Azar (RAPD. Los aislados de S. cepivorum dieron un patrón génico similar, pero muy diferente al que muestran los otros hongos fitopatógenos. La disimilitud genética promedio fue de 9.4%. Se proponen algunas bandas como marcadores moleculares para identificar al fitopatógeno. En el dendograma se aprecia que hay tendencia de los aislados a agruparse según el estado de donde provienen.

Caracterização e estimativa da variabilidade genética de genótipos de cebola Characterization and estimation of genetic variability of onion genotypes

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Gerson Henrique Wamser

2012-06-01

Full Text Available Este trabalho teve como objetivo caracterizar genótipos de cebola cultivados em Santa Catarina e estimar a variabilidade genética existente entre os mesmos. Para isto foram avaliados quinze genótipos de cebola em dois ambientes, Ituporanga e Lages. O delineamento utilizado foi de blocos casualizados, com três repetições em cada ambiente. Foram avaliados o comprimento do pseudocaule; número de folhas por pseudocaule; diâmetro do pseudocaule; diâmetro do bulbo; altura do bulbo; peso do bulbo; relação altura:diâmetro do bulbo; produção total de bulbos; formato do bulbo; porcentagem de florescimento e porcentagem de bulbos podres. Os dados foram submetidos à análise de variância multivariada. Houve efeito significativo para a interação genótipos x ambientes, fato que causou diferenças nos valores de dissimilaridade em cada local. Foi elaborada uma matriz de dissimilaridade utilizando a distância de Mahalanobis. Os caracteres morfológicos e agronômicos utilizados foram suficientes para caracterizar os genótipos, indicando que os programas de melhoramento dispõem de uma ampla base genética para o desenvolvimento de novas cultivares.This study aimed to characterize onion genotypes grown in Santa Catarina state, Brazil and to estimate their genetic variability. Fifteen onion genotypes were evaluated in two locations, Ituporanga and Lages. The experimental design was of randomized blocks with three replications in each environment. We evaluated the length of the pseudostem, number of leaves per pseudostem, stem diameter, bulb diameter, height of the bulb, bulb weight, height:diameter ratio; total production of bulbs, bulb shape, flowering percentage and percentage of rotten bulbs. The data were subjected to multivariate analysis of variance. The results showed significant effects for genotype-environment interaction, fact that was reflected in the values of dissimilarity in each location. A matrix of dissimilarity was prepared

Regulación de la acción de la Aldosterona al nivel del receptor mineralocorticoide

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Roberto Franco Saenz

2001-08-01

Full Text Available

Se revisan nuevos conceptos acerca de la secreción de aldosterona y de la interacción de la aldosterona con el receptor mineralocorticoide así como el papel de la enzima 11b-hidroxisteroid dehidrogenasa tipo 2 (11b-HSD-2 en la protección del receptor mineralocorticoides contra la acción de los glucocorticoides endógenos. Alteraciónes en la actividad de esta enzima causan hipertensión arterial en humanos y animales de experimentación. En vista del papel crítico que esta enzima juega en la reabsorción de sodio y el volumen sanguíneo en este estudio se investiga la regulación del gen de la 11b-HSD-2 en el riñón de la rata Dahl, un modelo experimental de hipertensión genética sensible al sodio dietético y se muestra que el sodio dietético aumenta la expresión del gen en el riñón de estas ratas.

Introducción
La aldosterona es una hormona mineralocorticoide producida por las células glomerulosas de la corteza adrenal. La aldosterona actúa en el riñón, en el túbulo convoluto distal causando retención de sodio y eliminación de potasio y iones de hidrógeno. La aldosterona juega un papel principal en el mantenimiento del volumen sanguíneo y de la presión arterial. En este manuscrito se revisan nuevos conceptos en la regulación de la secreción de aldosterona y el papel de la enzima 11b-hidroxisteroid dehydrogenasa (11b-HSD en la acción de la aldosterona y en la protección del receptor mineralocorticoide contra los glucocorticoides.

También se reportan estudios de la regulación del gen de la 11b-HSD-2 en el riñón de la rata Dahl, un modelo experimental de hipertensión genética con sensibilidad al sodio dietético.

GeoBoost: accelerating research involving the geospatial metadata of virus GenBank records.

Science.gov (United States)

Tahsin, Tasnia; Weissenbacher, Davy; O'Connor, Karen; Magge, Arjun; Scotch, Matthew; Gonzalez-Hernandez, Graciela

2018-05-01

GeoBoost is a command-line software package developed to address sparse or incomplete metadata in GenBank sequence records that relate to the location of the infected host (LOIH) of viruses. Given a set of GenBank accession numbers corresponding to virus GenBank records, GeoBoost extracts, integrates and normalizes geographic information reflecting the LOIH of the viruses using integrated information from GenBank metadata and related full-text publications. In addition, to facilitate probabilistic geospatial modeling, GeoBoost assigns probability scores for each possible LOIH. Binaries and resources required for running GeoBoost are packed into a single zipped file and freely available for download at https://tinyurl.com/geoboost. A video tutorial is included to help users quickly and easily install and run the software. The software is implemented in Java 1.8, and supported on MS Windows and Linux platforms. gragon@upenn.edu. Supplementary data are available at Bioinformatics online.

Veinte años del Régimen Andino de Acceso a Recursos Genéticos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Mónica Ribadeneira Sarmiento

2017-05-01

Full Text Available El artículo buscar contribuir al conocimiento del régimen legal andino de acceso a recursos genéticos, cuyo instrumento central es la Decisión Andina 391, promulgada en 1996. Se analiza la norma y se presentan sus más evidentes virtudes y limitaciones. Se incluye información sobre la evolución nacional de la decisión en cada uno de los países andinos. El artículo contiene un apartado referido al futuro de la norma en el actual escenario de reingeniería del Sistema Andino de Integración (SAI. Se han consultado documentos, fuentes oficiales, artículos de expertos y entrevistas. El artículo se estructura de la siguiente manera: los orígenes de la norma; el análisis y contenido de la norma andina; el proceso de reglamentación en los países andinos; las virtudes y limitaciones; la coyuntura y el futuro, y, por último, las conclusiones.

Análisis de las mutaciones más frecuentes del gen BRCA1 (185delAG y 5382insC en mujeres con cáncer de mama en Bucaramanga, Colombia

Directory of Open Access Journals (Sweden)

María Carolina Sanabria

2009-03-01

Conclusión. Se requieren más estudios en la región que abarquen la tamización de la totalidad del gen BRCA1, para hacer una mayor contribución al conocimiento de la epidemiología molecular del cáncer de mama en Bucaramanga, Santander, Colombia.

The Development of the Genital Psoriasis Sexual Frequency Questionnaire (GenPs-SFQ) to Assess the Impact of Genital Psoriasis on Sexual Health.

Science.gov (United States)

Gottlieb, Alice B; Kirby, Brian; Ryan, Caitriona; Naegeli, April N; Burge, Russel; Potts Bleakman, Alison; Anatchkova, Milena D; Cather, Jennifer

2018-03-01

Patient-reported outcome measures (PROs) exist for psoriasis but not genital psoriasis (GenPs). This cross-sectional, qualitative study in patients with moderate-to-severe GenPs was conducted to support development of a PRO for measuring the impact of GenPs on sexual activity and to establish content validity. The impacts of GenPs were identified in a literature review. Findings from the literature review were discussed with clinicians, and then patients with GenPs were interviewed. From the literature review, 52 articles, 44 abstracts, and 41 clinical trials met predefined search criteria. Of these, 11 concepts emerged as having theoretical support for use as measurable impacts of psoriasis symptoms on patients; these concepts included sexual functioning and general health-related quality of life (HRQoL). These concepts were confirmed and expanded upon by two clinicians who routinely care for patients with GenPs. Interviews were then conducted with GenPs patients (n = 20) to discuss the impact of GenPs on their HRQoL. Eighty percent of patients reported that GenPs impacted sexual frequency. The two-item GenPs Sexual Frequency Questionnaire (GenPs-SFQ) was developed to assess limitations on sexual activity frequency because of GenPs. Cognitive debriefing with an additional 50 patients with GenPs confirmed the utility and understandability of the GenPs-SFQ. The GenPs-SFQ may have utility in clinical trials involving GenPs patients and in routine clinical practice. Eli Lilly and Company. Plain language summary available for this article.

Discusión: Explicaciones genéticas y psicológicas de la esquizofrenia. Bases genéticas de la esquizofrenia: "Nurture vrs Nature

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Henriette Raventós-Vorst

2003-01-01

Full Text Available El presente artículo revisa la evidencia científica que muestra la heredabilidad de la esquizofrenia, su forma de herencia compleja y la posible heterogeneidad genética y ambiental. Se presentan las regiones cromosómicas que han sido ligadas a la enfermedad y algunos de los genes candidatos. El objetivo es presentar los resultados más importantes en el campo de la investigación genética de la enfermedad. Aunque se acepta que factores ambientales deben estar presentes en la etiopatogenia de la enfermedad, no se profundiza en ellos. Finalmente, se comenta el modelo lamarquiano sugerido por el Prof.. Bolaños. El fin es transmitir que en la actualidad no hay contradicción entre el modelo biologista o psicológico que explicaban esta enfermedad. La concepción moderna une ambos modelos: se considera una enfermedad del neurodesarrollo en la que participan factores genéticos, factores epigenéticos y noxas ambientales, incluyendo los factores psicosociales.

SALOME PLATFORM and TetGen for Polyhedral Mesh Generation

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Lee, Sang Yong; Park, Chan Eok; Kim, Shin Whan [KEPCO E and C Company, Inc., Daejeon (Korea, Republic of)

2014-05-15

SPACE and CUPID use the unstructured mesh and they also require reliable mesh generation system. The combination of CAD system and mesh generation system is necessary to cope with a large number of cells and the complex fluid system with structural materials inside. In the past, a CAD system Pro/Engineer and mesh generator Pointwise were evaluated for this application. But, the cost of those commercial CAD and mesh generator is sometimes a great burden. Therefore, efforts have been made to set up a mesh generation system with open source programs. The evaluation of the TetGen has been made in focusing the application for the polyhedral mesh generation. In this paper, SALOME will be evaluated for the efforts in conjunction with TetGen. In section 2, review will be made on the CAD and mesh generation capability of SALOME. SALOME and TetGen codes are being integrated to construct robust polyhedral mesh generator. Edge removal on the flat surface and vertex reattachment to the solid are two challenging tasks. It is worthwhile to point out that the Python script capability of the SALOME should be fully utilized for the future investigation.

Los límites entre la histología y la bioquímica: observando al núcleo celular

OpenAIRE

Rojas-Lemus, Marcela; Milán-Chávez, Rebeca

2016-01-01

Resumen Biología Celular e Histología Médica y Bioquímica son materias básicas que se encuentran en el currículo del estudiante del primer año de medicina. Cada materia aborda aspectos distintos sobre el material genético y sobre el organelo que lo contiene; en Bioquímica se revisan los aspectos metabólicos del ácido desoxirribonucleico (DNA) y en Biología Celular e Histología Médica se estudia al núcleo desde el punto de vista morfológico y tintorial. Aunque es claro que el material genético...

Genes and proteins of Escherichia coli K-12 (GenProtEC).

Science.gov (United States)

Riley, M

1997-01-01

GenProtEC is a database of Escherichia coli genes and their gene products, classified by type of function and physiological role and with citations to the literature for each. Also present are data on sequence similarities amongE.coliproteins with PAM values, percent identity of amino acids, length of alignment and percent aligned. GenProtEC can also be accessed through the World Wide Web at URL http://mbl.edu/html/ecoli.html .

Improvement of Steam Generator Reliability for GEN-IV SFR

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Kim, Seong O; Kim Se Yun; Kim, Seok Hoon; Eoh, Jae Hyuk; Lee, Hyeong Yeon; Choi, Byung Seon

2005-11-15

The R and D items performed in this study were selected from the R and D task of ' Reliability improvement of Steam Generator' of GEN-IV SFR Component Design and BOP. Since this project deals with one of the most important issues for a GEN-IV SFR system, it needs to enhance the domestic technical backgrounds associated with the corresponding R and D items even for a very short period by 2005. This study provides the R and D results for i) Development of assessment methodology for dissimilar metal weld and ii) Development of multi-dimensional simulation methodology for a SWR event in a SFR steam generator.

Improvement of Steam Generator Reliability for GEN-IV SFR

International Nuclear Information System (INIS)

Kim, Seong O; Kim Se Yun; Kim, Seok Hoon; Eoh, Jae Hyuk; Lee, Hyeong Yeon; Choi, Byung Seon

2005-11-01

The R and D items performed in this study were selected from the R and D task of ' Reliability improvement of Steam Generator' of GEN-IV SFR Component Design and BOP. Since this project deals with one of the most important issues for a GEN-IV SFR system, it needs to enhance the domestic technical backgrounds associated with the corresponding R and D items even for a very short period by 2005. This study provides the R and D results for i) Development of assessment methodology for dissimilar metal weld and ii) Development of multi-dimensional simulation methodology for a SWR event in a SFR steam generator

Epidemiologia genética: epidemiologia, genética ou nenhuma das anteriores?

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Aguinaldo Gonçalves

1990-12-01

Full Text Available No esforço de contribuir para melhor entendimento da identidade da Epidemiologia Genética, são revistas sua concepção, campo de atuação, métodos e técnicas pertinentes e algumas instâncias de aplicação. Entendendo-a como a área de interesse dos fatores genéticos das doenças e suas interações ambientais, apresenta-se seu campo de atuação como constituído por dois segmentos: um descritivo, que lida com conhecimento da distribuição de tais afecções em famílias e populações, seu impacto a nível do coletivo e sua vigilância epidemiológica, bem como o estudo de seus determinantes; o segundo, caracterizado pela intervenção, refere-se às respectivas medidas preventivas. Em que pese possível limitação pela não-consideração de todas as situações existentes, particular atenção é destinada à revisão de métodos e técnicas que possam ser convergentemente aplicados, a partir de procedimentos genéticos e epidemiológicos. Entre eles, destacam-se como estudos de casos tanto metodologias laboratoriais (como os dermatóglifos quanto quantitativos, como cálculo de herdabilidade e análise multivariada. Alguns objetos de estudo são tomados como instância de aplicação, por contarem com investigações específicas em nosso meio: a hanseníase, o hidrargirismo e a esquizofrenia.In an attempt to contribute to a better undestanding of the identity of Genetic Epidemiology, we review its conception, its field of influence, its appropriate methods and techniques and, at last, some of its applications. Genetic Epidemiology involves the study of genetic factors acting on diseases and on their environmental interactions. These includes two major areas: a descriptive one, related to the distribution of such conditions in families and populations, to the epidemiologic surveillance and to the study of determinants; and another characterized by intervention, which is related to preventive measures. Because of the dificulty in

GenRGenS: Software for Generating Random Genomic Sequences and Structures

OpenAIRE

Ponty , Yann; Termier , Michel; Denise , Alain

2006-01-01

International audience; GenRGenS is a software tool dedicated to randomly generating genomic sequences and structures. It handles several classes of models useful for sequence analysis, such as Markov chains, hidden Markov models, weighted context-free grammars, regular expressions and PROSITE expressions. GenRGenS is the only program that can handle weighted context-free grammars, thus allowing the user to model and to generate structured objects (such as RNA secondary structures) of any giv...

Control Adaptativo Fraccionario Optimizado por Algoritmos Genéticos, Aplicado a Reguladores Automáticos de Voltaje

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Marco E. Ortiz-Quisbert

2016-10-01

Full Text Available Resumen: En este trabajo se presenta la técnica del control adaptable de orden fraccionario por modelo de referencia (CAOFMR, aplicada a los reguladores automáticos de voltaje (RAV. El artículo se enfoca en el ajuste de las ganancias adaptables y los órdenes de derivación de las leyes de ajuste del controlador CAOFMR, determinados por la minimización de una función criterio definida para el modelo simplificado del RAV, mediante la utilización de la técnica de optimización de algoritmos genéticos (AG. En base a un criterio de evaluación propuesto por otros autores, se realizan comparaciones, por medio de simulaciones, de la técnica de control propuesta con los resultados obtenidos por la técnica de control PID de orden entero (OEPID (Zamani et al., 2009. Se muestra que el controlador CAOFMR con parámetros optimizados por AG, entrega mejores resultados en términos de robustez frente a variaciones en los parámetros del sistema controlado y mejoras en relación a la velocidad de convergencia hacia las señales de referencia del sistema RAV. Abstract: The technique Fractional Order Model Reference Adaptive Control (FOMRAC applied to an Automatic Voltage Regulator (AVR is presented in this paper. The work is focused on tuning the adaptive gains and the derivation order of the adaptive laws of the FOMRAC, determined through the minimization of a criterion function defined for the simplified model of the AVR, by means of the genetic algorithm (GA optimization technique. Based on the criterion function proposed by other authors a simulated comparative study is performed, comparing the proposed methodology with the integer order PID control reported in (Zamani et al., 2009. It is shown that the FOMRAC with parameters optimized by GA provides better results in terms of robustness under parameters variations of the system under control and improvements in the convergence speed of the control error. Palabras clave: Control Adaptativo de

Diversidade genética entre progênies e matrizes de rambutan

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Renata Aparecida de Andrade

2012-06-01

Full Text Available O rambutan é uma frutífera exótica que apresenta alto potencial de mercado, e suas mudas podem ser obtidas por sementes ou vegetativamente. A produção de mudas via sementes é rotineiramente feita no Estado de São Paulo, tendo-se alta variabilidade no pomar, além de demorar mais tempo para entrar em produção. Embora caracteres morfológicos sejam amplamente usados na diferenciação de variedades, as técnicas moleculares permitem a comparação e a identificação genética dos materiais. Diante disso, o presente trabalho foi realizado, comparando progênies e plantas-matrizes de rambutan, por fAFLP. As análises foram realizadas no Laboratório de Bioquímica de Microrganismos e Plantas, do Departamento de Tecnologia - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias - UNESP - Câmpus de Jaboticabal-SP, utilizando 06 plantas de rambutan, denominadas: A; B; C; D; E e F. Foram coletadas folhas de 15 plântulas oriundas de cada planta-matriz e realizou-se a extração de DNA, sendo as amostras quantificadas em biofotômetro, e os marcadores fAFLP, obtidos de acordo com o protocolo AFLP Plant Mapping Protocol (Applied Biosystems, utilizando as combinações de pares de primers: ACG/CAC; ACT/CAT; ACA/CTT e ACC/CTT. Pode ser concluído que o uso de marcadores moleculares é eficiente na distinção de materiais e na obtenção de distância genética; não é recomendada a obtenção de mudas via sementes quando a finalidade é a de instalação de pomar comercial.

Frecuencia de algunas enfermedades genéticas en Neuropediatría

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Tatiana Zaldívar Vaillant

2012-12-01

Full Text Available Introducción: las enfermedades neurológicas en Pediatría son diversas y obedecen a un gran número de causas: infecciosas, genéticas, metabólicas y degenerativas, entre otras. El diagnóstico genético, dentro del método clínico en Neurología, está relacionado con el diagnóstico etiológico. Existen muy pocas publicaciones que reflejen la frecuencia de las enfermedades neurogenéticas como grupo etiológico. Objetivo: describir la frecuencia de algunas enfermedades neuropediátricas en la Consulta de Neurogenética del Instituto de Neurología y Neurocirugía. Métodos: se realizó una investigación descriptiva y prospectiva en el periodo 2008-2010. Se clasificó a los pacientes por grupos etarios, y se calculó el porcentaje de frecuencia para la atrofia muscular espinal de la infancia, la distrofia muscular tipo Duchenne/Becker, las lesiones estáticas del sistema nervioso central de causa prenatal genética, y para la clasificación de los grupos según tipo de herencia. Resultados: el universo de estudio estuvo conformado por 161 pacientes, 72,6 % del sexo masculino, para una razón de la variable sexo de 2,5. Los escolares fueron mayoría (37,8 %, y la edad promedio 5 años. La distrofia muscular tipo Duchenne fue la enfermedad más frecuente (24,8 %. El 41,40 % clasificó en la herencia autosómica recesiva. Los resultados coinciden con lo reportado en la literatura. Conclusiones: las enfermedades neuromusculares hereditarias, y las lesiones estáticas del sistema nervioso central de causa prenatal genética, son las más frecuentes de solicitud de asesoramiento genético en un servicio de Neurogenética.

Variabilidad genética en géneros de ciervos neotropicales (Mammalia: Cervidae según loci microsatelitales

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Manuel Ruiz-García

2009-09-01

Full Text Available Los programas de conservación de especies se apoyan fuertemente en estudios de genética poblacional. En el presente estudio, reportamos diversos análisis genéticopoblacionales en ocho especies de cérvidos neotropicales (Mazama americana, M. gouzaoubira, M. rufina, Odocoileus virginianus, Hippocamelus antisensis, Pudu mephistopholes, Ozotoceros bezoarticus y Blastoceros dichotomus y, adicionalmente, en varias especies de cérvidos europeos y asiáticos (Cervus elaphus, C. nippon, Capreolus capreolus, C. pygargus and Dama dama. Una de esas especies europeas, la población de Cervus elaphus en Escocia, fue tomada como una población con un grado muy elevado de diversidad genética ya que proviene del cruce de diferentes grupos de ciervos rojos procedentes de diversas subespecies de la Europa continental. Desde una perspectiva de una diversidad genética depauperada, se tomó el nivel encontrado en una población de ciervos sika (Cervus nippon en Escocia, que prácticamente no mostró variabilidad a nivel molecular. Respecto a esos dos casos que consideramos como de elevada y escasa variabilidad genética, encontramos que las poblaciones analizadas de Mazama americana, M. gouzaoubira y Odocoileus virginianus estuvieron cerca del límite máximo encontrado para el ciervo rojo escocés (H=0.64, 0.70 y 0.61, respectivamente, mientras que M. rufina mostró el más bajo grado de variabilidad genética de las especies neotropicales, cercano al extremo mínimo presentado por C. nippon. Algunas de las muestras de Mazama y de Odocoileus, tomadas a nivel macrogeográfico, mostraron un exceso de homocigotos debido, probablemente, a la existencia de efecto Wahlund (efecto de subdivisión. Ninguna de las especies analizadas parece haber atravesado un cuello de botella reciente.Genetic variability in Neotropical deer genera (Mammalia: Cervidae according to DNA microsatellite loci. Species conservation programs are highly based on analyses of population

Reflexos da interação genótipo X ambiente e suas implicações nos ganhos de seleção em genótipos de feijão (Phaseolus vulgaris L. Reflexes of the interaction genotype X environment and their implications in the gains of selection in genotypes of bean (Phaseolus vulgaris L.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jefferson Luís Meirelles Coimbra

1999-09-01

Full Text Available A importância das leguminosas de grãos na alimentação humana, principalmente do feijão preto (Phaseolus vulgaris, tem estimulado os melhoristas a selecionar genótipos com alto potencial de rendimento de grãos e com adaptabilidade às diferentes condições de cultivo do sul do Brasil. O presente trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar os reflexos da interação genótipo x ambiente e suas implicações nos ganhos genéticos com diferentes critérios de seleção. Os resultados revelaram que o componente da interação genótipo x ambiente superestima a predição dos parâmetros genéticos, como por exemplo a variância genética e a herdabilidade. As diferenças observadas entre estas estimativas parecem ocorrer devido à alta percentagem da parte complexa da interação. Além disto, os ganhos genéticos obtidos com a seleção direta foram sempre superiores à resposta indireta. Comparativamente, o par de ambientes 1x3 revelou uma resposta correlacionada inferior e de sinal contrário às demais estimativas para os outros pares de ambientes estudados neste trabalho. O primeiro ambiente foi o que mais acumulou a interação genótipo x ambiente. Portanto, pode ser concluído que o componente da interação tem grande relevância nas estimativas dos ganhos genéticos, evidenciando que essa influência deva ser considerada na seleção e na recomendação de genótipos específicos nos programas de melhoramento genético da cultura do feijoeiro.The importance of grains of legume plants for human feeding, specially black beans (Phaseolus vulgaris L., has stimulated the breeders to select genotypes with high grains yield potential and wide adaptability to different conditions of cultivation in southern Brazil. The present work aimed at evaluating the reflexes of the genotype x environment interaction and its implications in the genetic gains of different selection approaches. The results revealed that the component of the

StateGEN/StateNET - A structured method to perform route comparisons

International Nuclear Information System (INIS)

Cashwell, J.W.; Erickson, C.M.

1989-01-01

StateGEN/StateNET is a modeling structure and routing algorithm designed expressly to address the needs of state and local governments to perform analyses of routing alternatives. StateGEN/StateNET is designed to permit the user to construct a network and assign attributes of interest to the network on a personal computer (PC). The completed network is then transferred via a modem to the TRANSNET system and the preferred route is determined based upon attribute weights assigned by the user. This modeling structure permits the state or local government to perform a routing analysis, such as that required by the US Department of Transportation (DOT) for Highway Route-Controlled Quantity shipments of radioactive materials, with a minimum of resources. StateGEN/StateNET provides a computerized version of the DOT guidelines or allows the user to structure their own network parameters. Sandia National Laboratories (SNL) is the Department of Energy (DOE) lead organization for transportation research and development. The DOE Office of Defense Programs has been the prime sponsor of development of models and associated databases used to analyze the impacts of the transportation of radioactive materials. The routing algorithms used in StateGEN/StateNET were based on the existing models on TRANSNET, a system which was developed to enable outside users to access analytical codes and associated data developed for the DOE

StateGEN/StateNET--A structured method to perform route comparisons

International Nuclear Information System (INIS)

Cashwell, J.W.; Erickson, C.M.

1989-01-01

StateGEN/StateNET is a modelling structure and routing algorithm designed expressly to address the needs of state and local governments to perform analyses of routing alternatives. StateGEN/StateNET is designed to permit the user to construct a network and assign attributes of interest to the network on a personal computer (PC). The completed network is then transferred via a modem to the TRANSNET system (Cashwell, 1989) and the preferred route is determined based upon attribute weights assigned by the user. This modelling structure permits the state or local to perform a routing analysis, such as that required by the US Department of Transportation (DOT) for Highway Route-Controlled Quantity shipments of radioactive materials, with a minimum of resources. StateGEN/StateNET provides a computerized version of the DOT guidelines (Cashwell, 1989) or allows the user to structure their own network parameters. Sandia national Laboratories (SNL) is the Department of Energy's (DOE) lead organization for transportation research and development. The DOE Office of Defense Programs has been the prime sponsor of development of models and associated databases used to analyze the impacts of the transportation of radioactive materials. The routing algorithms used in StateGEN/StateNET were based on the existing models on TRANSNET, a system which was developed to enable outside users to access analytical codes and associated data developed for the DOE. 2 refs

Selección genética de plantas elites de palma aceitera, utilizando software SELEGEN REML/BLUP

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Carlos Oliva

2014-01-01

Full Text Available La palma aceitera es uno de cultivos de la Amazonía Peruana, que genera en los inversionistas mayor interés,que ha permitido instalar al menos 70 mil ha. Al Perú ha ingresado semillas de palma aceitera de alto valorgenético, por su resistencia a enfermedad, plagas y alto rendimiento, pero durante el tiempo ha experimentadovariabilidad en los diferentes ecosistemas del país.Este trabajo tuvo por objetivo la selección genéticacomputarizada para la selección de plantas elites de alto rendimiento de racimos de fruta fresca (RFF depalma aceitera. Para realizar el análisis genético computarizado, se dispuso del software SELEGEN Rml/Blup,que es un programa diseñado para el análisis y la selección. Benin y Costa deMarfil son las que tienen mejorpromedio, cuyo valor mínimo es de 22,1 kg/planta y el valor máximo corresponde de 375,9 kg/planta. Elhibrido 2301 tiene los mejores promedios de rendimiento, seguido por el híbrido 2401, cuyo valores derendimiento extremosmáximo superior a 340 kg/planta. El primer año, el rendimiento promedio fue de 46,62kg/planta y para el tercer año de producción el promedio pasó a 142,82 kg/pl. La repetibilidad individual pararendimiento de RFF kg/planta en ambos grupos 2007 y 2008 fue de 0,10 y la repetibilidad del promedio decosechas fue de 0,87 y 0,82 para los grupos 2007 y 2008, respectivamente. Esto propició una exactitudselectiva de 0,93 para el grupo 2007 y de 0,90 para el grupo del 2008.

Revalidacion de Bombax Ceiba L. como especie típica del genero Bombax L. y descripcion de Pseudobombax gen. nov

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Dugand Armando

1943-04-01

Full Text Available En este trabajo se determina por razones históricas que Bombax Ceiba L. es la especie típica del genero Bombax L. y se tipifica dicha especie a su vez sobre Bombax quinatum Jacq. Refútase así la recomendación de B. malabaricum DC. como lectotipo de Bombax. Se propone una nueva definición, sensu maxime strictissimo, de Bombax L. y de B. Ceiba L. fundada en B. quinatum Jacq.; se mencionan los sinónimos conocidos y los ejemplares botánicos examinados. Esta tipificación causa una completa alteración del concepto genérico de Bombax por cuanto B. quinatum ha sido considerado generalmente como representativo de un género intermedio (Bombacopsis Pittier cuya definición sistemática resulta ahora justamente aplicable al genera linneano. Por consiguiente es necesario hacer un ajuste nomenclatural y se propone una nueva denominación genérica (Pseudobombax Dugand que abarca, por lo pronto, tres especies: septenatum Jacq. (como tipo , ellipticum HBK. y Palmeri S. Wats., antes considerados como verdaderos Bombax. La preparación de este estudio fue realizada en su mayor parte compilando numerosos datos históricos en las bibliotecas del Arnold Arboretum y del Gray Herbarium, merced a las prerrogativas que me fueron generosamente concedidas por la Universidad de Harvard al designarme Research Fellow del Arnold Arboretum durante la visita que hice recientemente a varias instituciones botanicas de los Estados Unidos como invitado del Comité de Relaciones Artísticas e Intelectuales Inter-Americanas.

Ganho de seleção no melhoramento genético intrapopulacional do maracujazeiro-amarelo

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Willian Krause

2012-01-01

Full Text Available O objetivo deste trabalho foi estimar o ganho de seleção associado a características agronômicas de importância no melhoramento intrapopulacional do maracujazeiro-amarelo. O experimento foi realizado em campo, no Município de Terra Nova do Norte, MT, com a avaliação de 111 famílias de irmãos completos (FIC e seis cultivares comerciais, utilizadas como testemunhas. Utilizou-se o delineamento de blocos ao acaso, com três repetições e quatro plantas por parcela. Foram avaliadas as seguintes características: produtividade, comprimento, diâmetro e peso médio dos frutos, percentagem e peso de polpa, espessura de casca e teor de sólidos solúveis. Para verificar a existência de variabilidade genética entre os genótipos, estimaram-se os parâmetros genéticos da população com base na média das famílias. Os 30 genótipos com o menor valor da soma de postos, de acordo com o índice de seleção de Mulamba & Mock, foram selecionados para estimar os ganhos genéticos. Observaram-se altos valores médios para as características e parâmetros genéticos avaliados nas 26 FIC e nas quatro testemunhas selecionadas. O uso do índice de seleção proporciona ganhos genéticos positivos em produtividade, percentagem e peso de polpa, comprimento, diâmetro e peso de frutos, e espessura de casca.

Coeficiente de repetibilidade e parâmetros genéticos em capim-elefante

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Marcelo Cavalcante

2012-04-01

Full Text Available O objetivo deste trabalho foi determinar os coeficientes de repetibilidade de caracteres morfofisiológicos em genótipos de capim-elefante (Pennisetum spp., a partir de dados obtidos durante seis ciclos de avaliação. Foram estimados: número mínimo de medições e parâmetros genéticos. Utilizou-se o delineamento experimental de blocos ao acaso, em arranjo de parcelas subdivididas, com quatro níveis de N (controle, 30, 60 e 90 kg ha‑1 por corte e 16 genótipos de Pennisetum (11 híbridos interespecíficos e cinco cultivares. Os ciclos consistiram de avaliações em 2010 (21/4, 19/7 e 28/9 e 2011 (6/1, 7/4 e 3/8. Os coeficientes de repetibilidade foram de média‑alta magnitude para todas as variáveis, o que indica que houve regularidade entre as medidas repetidas. Para as variáveis massa de forragem, altura da planta, comprimento e largura da folha, diâmetro do colmo, clorose e índice de área foliar, três ciclos de avaliação são suficientes para obter R² de 90%, pela análise de componentes principais. Para o comprimento do entrenó, o mínimo de sete avaliações é necessário para predizer o valor real dos genótipos. Os parâmetros genéticos das variáveis massa de forragem, comprimento e largura da folha, diâmetro do colmo e clorose foliar são de alta magnitude, o que favorece a seleção de genótipos superiores de Pennisetum.

Teleport Generation 3 (Teleport Gen 3)

Science.gov (United States)

2016-03-01

for high- throughput multi-band and multimedia connectivity from deployed locations to DISN and DoD Information Network (DoDIN) information sources and...2016 Major Automated Information System Annual Report Teleport Generation 3 (Teleport Gen 3) Defense Acquisition Management Information Retrieval...Program Information 4 Responsible Office 4 References 4 Program Description 5 Business Case 6 Program Status 8 Schedule 9

Divergência entre genótipos de soja, cultivados em várzea irrigada

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Elonha Rodrigues dos Santos

2011-12-01

Full Text Available A divergência genética é um dos mais importantes parâmetros avaliados por melhoristas de plantas, na fase inicial de um programa de melhoramento genético. Diante disso, objetivou-se com este trabalho avaliar, por meio de técnicas multivariadas, a divergência genética entre 48 genótipos de soja, cultivados em várzea irrigada no Estado do Tocantins, com o intuito de identificar as combinações mais promissoras para produzir recombinações superiores, tanto destinados a produção de óleo e farelo, como do grupo especial, destinados ao consumo humano. O experimento foi conduzido no município de Formoso do Araguaia, TO, em cultivo de várzea irrigada na entressafra de 2010. O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso, com quatro repetições. Verificou-se variabilidade entre os genótipos testados. Os resultados dos métodos de agrupamento de Tocher, UPGMA e Variáveis Canônicas foram concordantes entre si e detectaram quatro grupos distintos. As seguintes hibridações são promissoras para produção de grãos de soja destinados a óleo e farelo: M-Soy 8766, M-Soy 9144, A 7002 e M-Soy 9056 com Amaralina e cruzamentos entre M-Soy 8766, M-Soy 9144 e Amaralina com BRSMG 790A, BRS 257, BRS 216 e BRS 213 e são indicados visando a genótipos de soja especiais para alimentação humana.

Variabilidad genética de poblaciones en cautiverio de Crocodylus moreletii (Crocodylia: Crocodylidae mediante el uso de marcadores microsatelitales Genetic variability in captive populations of Crocodylus moreletii (Crocodylia: Crocodylidae using microsatellites markers

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Ricardo Serna-Lagunes

2012-03-01

Full Text Available Crocodylus moreletii representa un emblema para los ecosistemas tropicales de México pero actualmente está amenazada por extinción. Sorprendentemente, hay una falta de información de su constitución genética, que debe ser evaluada para un manejo apropiado ex situ y para toma de decisiones en la liberación de cocodrilos a su hábitat natural. El objetivo del estudio fue caracterizar y comparar la variabilidad genética de cuatro grupos poblacionales de C. moreletii (dos silvestres y dos nacidas ex situ. Mediante PCR se amplificaron siete loci de microsatélites polimórficos, sin embargo se encontró déficit de heterocigotos en las poblaciones (promedio H O=0.02 mermado por la presencia de alelos nulos. El AMOVA indicó que la mayor proporción de variabilidad genética se encuentra dentro de las poblaciones y una limitada diferenciación genética entre poblaciones (promedio F ST =0.03, probablemente debida al alto índice de endogamia (promedio F IS=0.97. Al comparar la variabilidad genética inter e intra especies de cocodrilianos, encontramos que en C. moreletii está muy por debajo de los reportados. Se concluye que la limitada variabilidad genética de las poblaciones nacidas ex situ probablemente se debe al efecto fundador derivado de la estructura social de sus progenitores, y de las poblaciones silvestres, por el efecto cuello de botella, inferido por el limitado tamaño efectivo de población que presentó históricamente en su distribución natural.Genetic variability in captive populations of Crocodylus moreletii (Crocodylia: Crocodylidae using microsatellites markers. Crocodylus moreletii, an extinction threatened species, represents an emblem for tropical ecosystems in Mexico. Surprisingly, there is a lack of information about their genetic constitution, which should be evaluated for a proper management ex situ and for making decisions on the release of crocodiles into natural habitats. The aim of this study was to

Análisis genético molecular del Oso Andino ( Tremarctos ornatus en el norte de los andes (Venezuela, Colombia, Ecuador: Una visión global

Directory of Open Access Journals (Sweden)

M. Ruiz-García

2001-07-01

G10B, G10C y G10X. Un exhaustivo análisis genético poblacional permitió determinar los siguientes aspectos fundamentales: (1 No existencia de equilibrio Hardy-Weinberg ni en el conjunto global de muestras ni en el conjunto particular de muestras para cada uno de esos países, al utilizar los tests exactos con cadenas de Markov y con el método de Fisher.

Caracteres clínico-patológicos y perfil genético en el carcinoma colorrectal

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Florencia Perazzo

2013-10-01

Full Text Available El cáncer colorrectal es el tercer cáncer más frecuente en hombres y el segundo más frecuente en mujeres, con una incidencia mundial aproximada de 1.2 millones de casos nuevos por año. Nuestro objetivo primario fue estudiar la relación existente entre las características clínico-histológicas en individuos con cáncer colorrectal y el estado mutacional de los codones 12 y 13 del gen KRAS (7 mutaciones validadas, con el fin de hallar un marcador histopatológico para los tumores mutados. El objetivo secundario fue determinar cuántos pacientes tenían mutaciones adicionales en los codones 15 y 61 del gen KRAS y 600 del gen BRAF que podrían modificar el fenotipo tumoral. Fueron seleccionados 60 individuos con cáncer colorrectal (30 wild-type y 30 con mutaciones validadas en los codones 12 y 13 del gen KRAS. Se amplificaron y secuenciaron del gen KRAS los exones 2 y 3, y del gen BRAF el exón 15. La información recolectada se examinó mediante un análisis descriptivo, análisis univariado y/o análisis multivariado, según correspondiese. En conclusión, no se encontró relación entre las características clínico-histológicas de los tumores de individuos con diagnóstico de cáncer colorrectal y el estado mutacional de los codones 12 y 13 del gen KRAS. No hallamos un marcador histopatológico para los tumores mutados. En pacientes con adenocarcinomas colorrectales avanzados y KRAS wild-type resulta de interés considerar el estudio del codón 600 del gen BRAF.

Alimentos Transgénicos : Organismos Genéticamente Modificados (OGM)

OpenAIRE

Martín López, Jimena

2016-01-01

Los alimentos transgénicos son aquellos que proceden de un organismo modificado genéticamente. La introducción de este tipo de productos en nuestra dieta es un tema que genera controversia ya que en muchos casos no se conoce con exactitud los efectos que esta modificación puede tener en el ser humano. A lo largo de las páginas de este trabajo se explica la historia de la aparición de estos organismos gracias a procedimientos de ingeniería genética, en los que se modifican fragmentos de su ADN...

Las variantes genéticas asociadas con niveles de hemoglobina fetal señalan diversos orígenes étnicos en pacientes colombianos con anemia falciforme

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Cristian Fong

2015-09-01

Full Text Available Introducción. La hemoglobina fetal es un importante factor modulador de la gravedad de la anemia falciforme, cuya expresión está muy condicionada por el factor genético. Los loci asociados con el incremento de la hemoglobina fetal pueden presentar frecuencias alélicas específicas para cada población. Objetivo. Investigar la presencia y el efecto de las variantes genéticas rs11886868, rs9399137, rs4895441 y rs7482144 asociadas con la persistencia de hemoglobina fetal, en 60 pacientes colombianos con anemia falciforme. Materiales y métodos. Se hizo la genotipificación de los polimorfismos de nucleótido simple (Single Nucleotide Polymorphisms, SNP mediante la técnica de polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (Restriction Fragment Length Polymorphisms, RFLP y el procedimiento TaqMan. La hemoglobina fetal (HbF se cuantificó utilizando la técnica de desnaturalización alcalina de la oxihemoglobina. Las frecuencias genotípicas se compararon con las reportadas en poblaciones de referencia global. Resultados. Se observaron variantes genéticas ya reportadas para aumento de HbF en los cuatro SNP. La asociación genética entre los SNP y el incremento de la HbF no alcanzó significancia estadística. La frecuencia de estos alelos reflejó la siguiente composición específica en esta muestra de pacientes colombianos: una gran prevalencia de rs7482144-‘A’, lo que indica que el origen de la mutación para la anemia falciforme es África occidental, y una gran frecuencia de rs4895441-‘G’ y rs11886868-‘C’, lo que denota la influencia significativa del origen genético amerindio. Conclusión. Los resultados evidenciaron que la población con anemia falciforme de Colombia no tiene un único origen genético, sino que existen dos (africano y amerindio. Esta situación genética única ofrece la oportunidad de llevar a cabo un estudio más amplio de estos loci a nivel molecular. Se espera que el estudio de pacientes

Composición de leche de vacas Criollo, Guzerat y sus cruzas F1 y su relación con el peso al destete de las crías

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Guillermo Martínez Velázquez

2010-01-01

Full Text Available Se utilizaron 619 registros productivos generados entre 2001 y 2003 por vacas Guzerat (G, Criollo (C, Guzerat x Criollo (GC y Criollo x Guzerat (CG. Las variables estudiadas fueron porcentaje de grasa (%G, proteína (%P, lactosa (%L y sólidos no grasos (%SNG contenidos en la leche y kilogramos de grasa (GP, proteína (PP, lactosa (LP y sólidos no grasos (SNGP producidos por lactancia. También se evaluaron peso al nacer (PN y peso al destete ajustado a 210 días de edad (PA210 y se estimaron efectos genéticos directos, maternos, de heterosis y la relación entre componentes de la leche y PA210. Para %G, %P, %L, %SNG, GP, PP, LP y SNGP los modelos incluyeron los efectos fijos de grupo genético de la vaca (GEN, número de parto (NP, año de parto (A, época de parto (E, días posparto (D e interacciones de dos factores (F. Para PN y PA210 los modelos incluyeron GEN, NP, A, E y F. Se estimaron correlaciones residuales entre componentes de la leche y PA210. Heterosis fue importante (P<0.05 para GP (5.07+1.9 kg, PP (4.97+1.5 kg, LP (7.04+2.1 kg, SNGP (13.48+3.8 kg, PN (-1.30+0.6 kg y PA210 (12.65+4.2 kg. Los efectos genéticos directos para LP, SNGP, PN y PA210 fueron favorables (P<0.05 a G en 11.08+3.7, 16.98+6.6, 3.80+1.1 y 37.60+7.6 kg. Se detectaron correlaciones importantes (P<0.05 de PA210 con GP (0.16, LP (0.21 y SNGP (0.19. Las correlaciones sugieren que la cantidad de componentes en la leche fue importante para determinar el peso al destete de los becerros.

Crescimento de genótipos de frangos tipo caipira

Directory of Open Access Journals (Sweden)

R. C. Veloso

2015-10-01

Full Text Available RESUMOObjetivou-se com este trabalho comparar o padrão de crescimento, mediante ajustes das respectivas curvas de crescimento por modelos não lineares, bem como estudar o desenvolvimento de cortes de carcaça em relação ao peso da carcaça em diferentes genótipos de frangos tipo caipira. Foram utilizados 840 pintos de um dia, machos, distribuídos em delineamento inteiramente ao acaso, dos seguintes genótipos da linhagem Redbro: Caboclo, Carijó, Colorpak, Gigante Negro, Pesadão Vermelho, Pescoço Pelado e Tricolor. As aves foram alojadas em 28 boxes, sendo 30 aves/boxe, em galpão de alvenaria com acesso a um piquete de 45m², com quatro repetições. O peso corporal individual dos frangos foi medido ao nascer, aos 14, 28, 42, 56, 70 e 84 dias de idade. Para a determinação das curvas de crescimento do peso corporal das aves, os dados coletados foram avaliados por meio dos modelos não lineares: Brody, Gompertz, Logístico, Richards e von Bertalanffy. Foi empregado o PROC NLIN do SAS, utilizando-se o método interativo de Gauss-Newton. Os critérios usados para escolha do modelo de melhor ajuste da curva de crescimento foram o coeficiente de determinação, o desvio padrão assintótico, o desvio médio absoluto dos resíduos e o índice assintótico. As análises para obtenção dos coeficientes alométricos foram realizadas por meio do PROC GLM do SAS para os genótipos Carijó, Colorpak, Pesadão Vermelho, Pescoço Pelado e Tricolor. Foram avaliados os pesos da carcaça, do peito, das coxas, das sobrecoxas, das pernas e das asas das aves abatidas aos 85 dias de idade. Apenas as equações propostas por Gompertz, von Bertalanffy e Logístico atingiram a convergência, e o modelo proposto por von Bertalanffy foi o mais adequado para descrever o crescimento dos genótipos de frangos caipiras. Todos os cortes avaliados apresentaram crescimento tardio em relação ao peso da carcaça em genótipos de frangos tipo caipira.

Polimorfismo en el gen COMT en una muestra de gestantes normales y con restricción del crecimiento intrauterino en un hospital de Lima

OpenAIRE

José Pacheco-Romero; Doris Huerta; Oscar Acosta; Santiago Cabrera

2013-01-01

Antecedentes: Los procesos fisiopatológicos que ocurren a nivel celular y molecular en la restricción de crecimiento intrauterino (RCIU) son aún desconocidos. La catecol-O-metiltransferasa (COMT) es una enzima de fase II que inactiva los catecol estrógenos al transferir un grupo metílico. Se conoce un polimorfismo funcional Val158 Met en el gen COMT como un marcador susceptible para diversas enfermedades maternoperinatales, existiendo estudios que sugieren que el alelo que codifica una COMT d...

Transformação genética em espécies florestais.

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Claudia Studart-Guimarães

2010-08-01

Full Text Available A transformação genética, que compreende a introdução de genes exógenos de forma controlada no genoma de uma célula vegetal e posterior regeneração da planta transgênica, tem contribuído com os programas de melhoramento genético de plantas pela obtenção de genótipos com novas características de interesse. O melhoramento de espécies florestais é limitado por características intrínsecas a tais espécies, como a altura dos indivíduos e o ciclo longo de vida. A transformação genética constitui, portanto, uma alternativa para a obtenção de espécies florestais com características desejáveis em um menor espaço de tempo. Plantas transgênicas com resistência a determinadas pragas, com melhor qualidade de madeira, maior produção de biomassa, tolerância a herbicidas, entre outras características de interesse, já foram obtidas para diferentes espécies florestais de importância econômica como álamo, eucalipto e pinheiros em geral. Este trabalho mostra a importância da transformação genética, associada a outras técnicas biotecnológicas no melhoramento de espécies florestais, as técnicas de transformação mais utilizadas e as características que já foram introduzidas nessas espécies pela transformação.

Polimorfismos en el gen promotor de IL-10 en una muestra de pacientes colombianos con lepra

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Nora Cardona-Castro

2012-03-01

Conclusiones. El haplotipo que encontramos asociado con lepra, -1082A-819C-592C/-1082A-819C-592C, se ha relacionado con baja producción de IL-10. Funcionalmente, esta baja producción de IL-10 puede tener consecuencias en la respuesta inmunitaria, además de implicaciones clínicas. Se han reportado diferentes haplotipos de IL-10 como marcadores de vulnerabilidad y resistencia de lepra en otras poblaciones, lo cual sugiere que las diferencias en la distribución de diversos polimorfismos del gen de IL-10 entre grupos étnicos, es un factor importante al determinar la asociación entre enfermedad y genes.   DOI: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v32i1.386

Inventering av Suldalslågen. Produksjonspotensial for sjøvandrende laksefisk

OpenAIRE

Foldvik, Anders; Pettersen, Oskar

2017-01-01

Foldvik, A. & Pettersen, O. 2017. Inventering av Suldalslågen. Produksjonspotensial for sjøvandrende laksefisk. - NINA Kortrapport 75, 18 s. Reguleringen av Suldalslågen til kraftproduksjon har hatt negative effekter for habitat for laksefisk, blant annet i form av sedimentering og begroing av substratet. Disse prosessene har blitt forsøkt motvirket ved å ha en serie med spyleflommer på over 200 m3/s om høsten. På oppdrag fra Statkraft inverterte NINA oppvekst- og gyteforhold for laks i Su...

Clinical and ethical implications of genetic counselling in familial adenomatous polyposis Implicaciones clínicas y éticas del consejo genético en la poliposis adenomatosa familiar

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A. Fernández-Suárez

2005-09-01

écnicas de secuenciación que detectan mutaciones en la línea germinal del gen APC (adenomatous poliposis coli. El abordaje del diagnóstico genético en familias con PAF seguidas previamente en la consulta de digestivo, ha permitido poner de manifiesto tanto las ventajas como los inconvenientes de esta forma de acercarnos a la enfermedad y a los pacientes. La revelación de los resultados de la prueba genética comporta importantes problemas en la práctica clínica, que afectan tanto al ámbito sanitario, como al ético y legal, además de las implicaciones familiares, laborales y sociales que el conocimiento del status genético puede tener para el paciente. El análisis genético es poco frecuente en la práctica clínica habitual, lo que conlleva errores tanto en la interpretación de los resultados obtenidos como durante el proceso del consejo genético. Son necesarias unidades multidisciplinares especializadas en el manejo de pacientes con PAF, en las cuales se realice un análisis y un consejo genético adecuado, permitiendo así una atención personalizada. La creación de registros de PAF y la protocolización de este proceso sanitario debería optimizar el manejo de estos pacientes y sus familias.

TrayGen: Arranging objects for exhibition and packaging

KAUST Repository

Yang, Yongliang; Huang, Qixing

2013-01-01

We present a framework, called TrayGen, to generate tray designs for the exhibition and packaging of a collection of objects. Based on principles from shape perception and visual merchandising, we abstract a number of design guidelines on how

A 48-plex autosomal SNP GenPlex™ assay for human individualization and relationship testing

DEFF Research Database (Denmark)

Tomas Mas, Carmen; Børsting, Claus; Morling, Niels

2012-01-01

SNPs are being increasingly used by forensic laboratories. Different platforms have been developed for SNP typing. We describe the GenPlex™ HID system protocol, a new SNP-typing platform developed by Applied Biosystems where 48 of the 52 SNPforID SNPs and amelogenin are included. The GenPlex™ HID...

Desafios para a universalização da genética clínica: o caso brasileiro Challenges for the universalization of clinical genetics: the Brazilian case

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Maria Concepción Novoa

2011-01-01

Full Text Available Este artigo aborda as dificuldades de inserir a genética médica como parte do Sistema Único de Saúde (SUS no Brasil. Em 2009, foi instituída no Brasil a Política Nacional de Atenção Integral em Genética Médica, cujo pilar central seria o aconselhamento genético. Porém, são problemas estratégicos para a implementação dessa política a falta de programas de formação em aconselhamento genético, o desconhecimento acerca de quantos profissionais existem para prestar esse aconselhamento e o provável baixo número de profissionais disponíveis. É desejável uma atuação conjunta dos Ministérios da Saúde e da Educação para ampliar a educação em genética e a formação em aconselhamento genético para todas as profissões no campo da saúde. Além disso, é essencial a inclusão da genética em programas como o Saúde da Família, que permitirá um mapeamento da incidência das doenças genéticas no país e a implementação de aconselhamento genético apesar do grande território e da heterogeneidade populacional do Brasil. Finalmente, a inserção da genética médica no SUS depende do engajamento de profissionais médicos e não médicos no trabalho em equipes horizontais, com alteração da tradicional hierarquia da atenção à saúde.The present article deals with the difficulties of introducing medical genetics as part of the Brazilian public Unified Health System (SUS. A national policy of comprehensive care in medical genetics was established in 2009, having genetic counseling as a central pillar. However, there are strategic limitations to the implementation of this policy: a dearth of genetic counseling training programs, the lack of knowledge concerning the number of professionals available to provide genetic counseling, and the likely low number of professionals available for the job. A joint effort by the ministries of health and education is desirable to foster genetics and genetic counseling training for all

Evaluación de la presencia del gen mer A implicado en la detoxificación de mercurio a partir de actinomicetos nativos del humedal de La Conejera

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Rueda Carolina

2009-07-01

Full Text Available Se aislaron diez cepas de actinomicetos nativos del humedal La Conejera a partir de muestras de sedimento y agua, con el fin de determinar la capacidad de resistencia y detoxificación de mercurio, evaluando la presencia del gen mer A involucrado en el proceso. La prueba de resistencia fue realizada mediante un test de sensibilidad tomando concentraciones desde 3,68x10-3 mM hasta 10 mM de HgCl2. Se realizaron curvas de crecimiento de 192 h para las cepas resistentes al mercurio, en un medio suplementado con 0,01 mM y 0,05 mM de HgCl2, realizando una fermentación discontinua y midiendo el crecimiento por la técnica de peso seco. A partir de estos resultados se determinó un tiempo de adaptación de 24 h y una producción máxima de biomasa de 2,72 g·L-1 a la hora 72. Paralelamente, se realizó la secuenciación de los genes de resistencia al mercurio de Streptomyces lividans 1326, por medio del diseño de los oligonucleótidos capaces de amplificar el extremos 3’ del gen mer A, codificador de la enzima mercurio reductasa. Se optimizaron las condiciones de amplificación por PCR para obtener un producto amplificado de 686 pb aproximadamente. Finalmente, se realizó una electroforesis en campo pulsado comprobando la presencia de plásmidos en la cepa KH7 con tamaños aproximados de 50, 90 y 300 Kb, no integrados al cromosoma y posiblemente asociados a la resistencia presentada frente al metal.

TidGen Power System Commercialization Project

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Sauer, Christopher R. [President & CEO; McEntee, Jarlath [VP Engineering & CTO

2013-12-30

ORPC Maine, LLC, a wholly-owned subsidiary of Ocean Renewable Power Company, LLC (collectively ORPC), submits this Final Technical Report for the TidGen® Power System Commercialization Project (Project), partially funded by the U.S. Department of Energy (DE-EE0003647). The Project was built and operated in compliance with the Federal Energy Regulatory Commission (FERC) pilot project license (P-12711) and other permits and approvals needed for the Project. This report documents the methodologies, activities and results of the various phases of the Project, including design, engineering, procurement, assembly, installation, operation, licensing, environmental monitoring, retrieval, maintenance and repair. The Project represents a significant achievement for the renewable energy portfolio of the U.S. in general, and for the U.S. marine hydrokinetic (MHK) industry in particular. The stated Project goal was to advance, demonstrate and accelerate deployment and commercialization of ORPC’s tidal-current based hydrokinetic power generation system, including the energy extraction and conversion technology, associated power electronics, and interconnection equipment capable of reliably delivering electricity to the domestic power grid. ORPC achieved this goal by designing, building and operating the TidGen® Power System in 2012 and becoming the first federally licensed hydrokinetic tidal energy project to deliver electricity to a power grid under a power purchase agreement in North America. Located in Cobscook Bay between Eastport and Lubec, Maine, the TidGen® Power System was connected to the Bangor Hydro Electric utility grid at an on-shore station in North Lubec on September 13, 2012. ORPC obtained a FERC pilot project license for the Project on February 12, 2012 and the first Maine Department of Environmental Protection General Permit issued for a tidal energy project on January 31, 2012. In addition, ORPC entered into a 20-year agreement with Bangor Hydro Electric

Polimorfismos del gen ob en bovinos de raza holstein en la Comarca Lagunera, México

OpenAIRE

Sarai S. Mendoza-Retana; Miguel A. Gallegos-Robles; Uriel González-Salas; José L. García-Hernández; Manuel Fortis-Hernández; Cirilo Vázquez-Vázquez; Héctor I. Trejo-Escareño

2017-01-01

La Comarca Lagunera es la cuenca lechera más importante de México. En la actualidad se están utilizando diversas técnicas que permiten evaluar genéticamente el animal a una edad temprana, permitiendo seleccionar futuros reproductores con características deseables. Entre los genes relacionados con la producción de leche, se encuentran el gen Ob también llamado gen Leptina el cual actúa sobre el sistema nervioso central y tejidos periféricos jugando un papel muy importante ...

Obacunone Represses Salmonella Pathogenicity Islands 1 and 2 in an envZ-Dependent Fashion

Science.gov (United States)

Vikram, Amit; Jayaprakasha, Guddadarangavvanahally K.; Jesudhasan, Palmy R.

2012-01-01

Obacunone belongs to a class of unique triterpenoids called limonoids, present in Citrus species. Previous studies from our laboratory suggested that obacunone possesses antivirulence activity and demonstrates inhibition of cell-cell signaling in Vibrio harveyi and Escherichia coli O157:H7. The present work sought to determine the effect of obacunone on the food-borne pathogen Salmonella enterica serovar Typhimurium LT2 by using a cDNA microarray. Transcriptomic studies indicated that obacunone represses Salmonella pathogenicity island 1 (SPI1), the maltose transporter, and the hydrogenase operon. Furthermore, phenotypic data for the Caco-2 infection assay and maltose utilization were in agreement with microarray data suggesting repression of SPI1 and maltose transport. Further studies demonstrated that repression of SPI1 was plausibly mediated through hilA. Additionally, obacunone seems to repress SPI2 under SPI2-inducing conditions as well as in Caco-2 infection models. Furthermore, obacunone seems to repress hilA in an EnvZ-dependent fashion. Altogether, the results of the study seems to suggest that obacunone exerts an antivirulence effect on S. Typhimurium and may serve as a lead compound for development of antivirulence strategies for S. Typhimurium. PMID:22843534

Ideas Previas Acerca de “Evolución y Su Relación con la Genética” en Estudiantes de Grado Noveno del Colegio Nicolás Esquerra

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Sergio Alejandro Peláez Plazas

2015-12-01

Full Text Available Como primera experiencia didáctica, en este trabajo se muestran las ideas previas que construyen 10  estudiantes de noveno grado del colegio Nacional Nicolás Esguerra acerca del proceso de evolución, las cuales se encuentran relacionadas con algunos conceptos que aborda la genética. Los datos fueron recogidos por medio de una encuesta de pregunta abierta y un dibujo en base al método cualitativo, con el fin de conocer la comprensión que los estudiantes tienen acerca de la evolución y  los conceptos mencionados en sus explicaciones, entre los cuales se encontraron: adaptación, ADN y código genético,  relacionando en estos el tiempo como factor de cambio. Estas ideas se organizaron en tres categorías  (Comprensión de Procesos evolutivos basados en variabilidad y selección natural e Ideas relacionadas al catastrofismo como factor promotor de especiación. Entre estas, la mayoría de los alumnos hace alusión a cambios en el ciclo de vida y desarrollo, y no como un proceso a nivel histórico y constante en las poblaciones. En cuanto a la comprensión del ADN, el gen y su relación con las especies, no hay claridad con respecto a la expresión de caracteres desde  la información que se expresa en las proteínas. Por consiguiente, se infiere que las ideas encontradas están poco articuladas  ya que ellos no las logran conectar de forma apropiada en sus respuestas.

Polimorfismo genético de beta-lactoglobulina y alphalactoalbúmina en el ganado criollo colombiano, mediante PCR-SSCP

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jaime A Rosero-Alpala

2011-12-01

Full Text Available La población de ganado criollo colombiano ha venido presentando una inquietante disminución al pasar de 23.415 ejemplares en 1999 a 20.102 en 2003. A pesar de los esfuerzos por recuperar las razas criollas el panorama para su conservación es incierto, por tanto la búsqueda de caracteres deseables puede contribuir a su valoración y conservación. Los genes relacionados con el mejoramiento de la calidad de la leche producida por estas razas se consideran de gran importancia en la industria láctea, por tal razón y con el objetivo de caracterizar los genes beta-lactoglobulina y alpha-lactoalbúmina se analizaron 30 muestras de sangre de cada una de las razas criollas (Blanco Orejinegro, Caqueteño, Casanareño, Costeño con cuernos, Chino Santandereano, Hartón del Valle, Romosinuano y Sanmartinero, dos razas sintéticas colombianas (Lucerna y Velásquez y dos razas foráneas (Holstein y Brahman. Se amplificaron fragmentos de 262pb para beta-lactoglobulina (b-LG y de 166 pb para alpha-lactoalbúmina (a-LA que se genotipificaron mediante PCR-SSCP. El promedio de la frecuencia para b-LG A y b-LG B fue de 0.46 ± 0.020 y de 0.53 ± 0.020, respectivamente, y de 0.35 ± 0.019 para a-LA A y 0.64 ± 0.019 para a-LA B. El promedio de diversidad genética (He para b-LG fue 0.498 y de 0.455 para a-LA. Los ganados criollos representan una base genética valiosa, como alternativa para mejorar genéticamente los hatos destinados a la producción de leche con mejores características en calidad para la industria láctea.

Incidência de tripes em genótipos de cebola

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Paulo Antonio de Souza Gonçalves

2017-05-01

Full Text Available Os objetivos deste estudo foram avaliar a incidência de tripes em genótipos de cebola, verificar sua correlação com o teor de clorofila, arquitetura e coloração foliar, e produtividade. O experimento foi conduzido na Epagri, Estação Experimental de Ituporanga, SC, Brasil, na safra de 2015. O número de genótipos comerciais ou em desenvolvimento avaliados foi 48, sendo doze híbridos e 36 de polinização livre. A incidência de tripes foi semelhante na maioria dos genótipos. As exceções foram os híbridos precoces Roxa 10039 e 10160, que apresentaram menores notas de incidência que RDW Luthy e Conesul. A arquitetura foliar mais aberta associada com a cor verde clara favoreceu uma menor incidência de tripes. Os cultivares de polinização livre e com origem no programa de melhoramento da Epagri (Superprecoce-Agroecológica, Bola Precoce-Agroecológica, Juporanga-Agroecológica, Valessul, Bola Suprema e Crioula Alto Vale foram os mais produtivos.

Avances del mejoramiento genético participativo del frijol en Cuba

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Rodobaldo Ortiz-P\\u00E9rez

2006-01-01

Full Text Available Las actividades de Fitomejoramiento Participativo fueron conducidas con agricultores del municipio de San Antonio de los Baños de la provincia La Habana y campesinos de la comunidad la Palma de la provincia de Pinar del Río durante 2001 al 2004. En la fase de diagnóstico en las áreas de intervención del proyecto, más del 80 % de los agricultores no utilizaban la semilla del sistema formal; por lo tanto, las variedades obtenidas por los programas de mejoramiento no llegaban a la mayoría de los agricultores. Se buscó un mecanismo alternativo para introducir diversidad genética a las localidades mediante las ferias de diversidad, cuyo objetivo principal ha estado dirigido a facilitar el flujo de semilla de los institutos de investigaciones hacia el agricultor y viceversa. Posterior al desarrollo de las ferias de diversidad se continúa con la experimentación campesina en fincas y cooperativas, desarrollándose una amplia red experimental difícil de lograrse sin la participación de los productores. La experimentación campesina, el aumento de la eficiencia en la finca, incluyendo el aumento del rendimiento de sus parcelas, el aumento de la diversidad por el uso de mayor número de variedades, y una mayor proporción de área dedicada a estas variedades; todo lo cual redunda en un mejoramiento de la vida del campesino y su familia

Caracterização de genótipos de cebola com a utilização de marcadores moleculares RAPD

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Gerson Henrique Wamser

Full Text Available A divergência genética foi avaliada entre quinze genótipos de cebola cultivados em Santa Catarina, com a utilização de marcadores moleculares RAPD. Onze oligonucleotídeos iniciadores da série Operon Technologies foram utilizados e produziram 35 marcadores, destes, 28 foram polimórficos. Os produtos da amplificação foram visualizados em gel de agarose 1,4%, corado com brometo de etídeo. Uma matriz de similaridade utilizando-se o coeficiente de Jaccard foi construída a partir dos dados moleculares. Um dendrograma foi gerado para melhor visualização da similaridade genética através do método de agrupamento UPGMA. Três grupos foram formados utilizando o coeficiente de similaridade 0,6 como ponto de corte. O primeiro grupo reuniu os genótipos Super Superprecoce e Gauchinha. O segundo grupo reuniu doze genótipos. Dentro desse grupo, os genótipos Bella Vista e Bella Dura foram os que apresentaram o maior coeficiente de similaridade, em torno de 0,89. Bela Vista e Superprecoce, Catarina e o híbrido Bella Vista, com coeficiente de similaridade de 0,88 entre os pares. O terceiro grupo apresentou apenas o genótipo Crioula Roxa, que obteve o menor valor (0,31 para o coeficiente de similaridade. Tendo em vista os resultados obtidos, cruzamentos entre os genótipos do primeiro e segundo grupo e destes com o genótipo Crioula Roxa, podem ser melhores por apresentarem maior divergência entre si. A técnica de RAPD mostrou-se eficaz na caracterização molecular dos genótipos de cebola, evidenciando que existe variabilidade entre os genótipos estudados.

InGen Inconsistencies: The "Dinosaurs" Of Jurassic Park May Not Be What The Corporation Claims

Science.gov (United States)

Haupt, R. J.; Traer, M. M.

2017-12-01

InGen has made and continues to make dubious claims about proprietary technology developed to clone non-avian dinosaurs for exhibition within their "Jurassic Park." Notably, there are several inconsistencies between their claims for how their technology works and what has been observed within the park. Here we investigate several of these inconsistencies in the hopes that it will push for increased transparency between corporations and academia. First, we highlight a disconnect between supposedly Jurassic amber used for dinosaur DNA extraction and the overwhelming presence of Late Cretaceous dinosaurs within the park. Further, InGen's mining operations only publicly operate in Jurassic-aged formations of the Dominican Republic, which clashes with the presence of Velociraptor and Gallimimus, known only from Mongolia. Second, the park contains seemingly full-grown adult specimens despite InGen's claims that they first successfully cloned a prehistoric animal in 1984, though there is no publicly available information as to what animal this was. That the park was nearly ready to open by 1993 precludes the presence of fully mature dinosaurs and suggests that InGen might be misrepresenting their technologies. Third, we must point out that fossil DNA denatures to the point of uselessness within thousands, not millions, of years. Additionally, the use of anuran DNA to fill in gaps from fossil dinosaurian DNA is a dubious choice given that more closely related organisms are available. Either there is an unexplained reason for this choice, or little attention has been paid to dinosaurian phylogeny by InGen geneticists. Finally, rumors of a secret InGen project to produce a dinosaur not currently known to paleontologists suggests one of two things: they were able to find DNA from a dinosaur previously unknown in the fossil record, which is highly plausible if their techniques are valid, or that InGen is able to artificially manipulate DNA to a degree far beyond what other

Overview of materials R and D for fusion and Gen-4

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Kohyama, A. [Kyoto Univ., lnstitute of Advanced Energy (Japan); Tavassoli, F.; Carre, F.; Billot, P. [CEA Saclay, 91 - Gif sur Yvette (France); Zinide, S. [Oak Ridge National Laboratory, Materials Science and Technology Div., AK TN (United States)

2007-07-01

Full text of publication follows: In view of the growing need for energy, the risk of exhaustion of fossil fuel and the problem of global warming, the nuclear energy is receiving added attention as a realistic and viable advanced solution. International collaborations on Generation IV (Gen-IV) fission reactors and on ITER and DEMO fusion reactors are developing. This is particularly the case in the sector of materials, where they hold the key to success of these systems. The international community has recognized and planned its materials R and D work for Fusion and Gen-IV reactors with the following considerations: 1- The time allotted to materials R and D is short and may not allow development of totally new materials. 2- Activities required, to cover existing materials variations and service conditions necessary for reactor design, are very time consuming. 3- The work to be done must build upon the existing knowledge of materials and avoid duplications. Although ITER for fusion and Generation four International Forum (GIF) for Gen-IV are important international collaborative programs, they are insufficient to meet all the national energy policies of the participating countries. This paper provides an overview of the materials R and D carried out for fusion and Gen-IV reactors at international and national levels. Materials programs discussed include both cross-cutting and reactor specific actions, where major tasks can be defined as: + Cross-cutting materials tasks: - materials for high temperature service; - materials with neutron damage tolerance; - materials behavior analysis and modeling; - high temperature design methodology. + Reactor specific materials tasks: - very high temperature alloys; - carbon, high temperature ceramics and their composites; - materials compatibilities. Starting with a brief introduction of materials R and D strategies, ITER and Broader Approach (BA), overall activities for fusion and GIF for Gen-IV will be reviewed. Domestic

Gridded precipitation dataset for the Rhine basin made with the genRE interpolation method

NARCIS (Netherlands)

Osnabrugge, van B.; Uijlenhoet, R.

2017-01-01

A high resolution (1.2x1.2km) gridded precipitation dataset with hourly time step that covers the whole Rhine basin for the period 1997-2015. Made from gauge data with the genRE interpolation scheme. See "genRE: A method to extend gridded precipitation climatology datasets in near real-time for

GenSVM: a generalized multiclass support vector machine

NARCIS (Netherlands)

G.J.J. van den Burg (Gertjan); P.J.F. Groenen (Patrick)

2016-01-01

textabstractTraditional extensions of the binary support vector machine (SVM) to multiclass problems are either heuristics or require solving a large dual optimization problem. Here, a generalized multiclass SVM is proposed called GenSVM. In this method classification boundaries for a K-class

Análisis genético del virus peruano de la fiebre amarilla

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Carlos Yábar V

2002-01-01

Full Text Available Objetivo: Determinar las variantes genéticas de aislamientos del virus peruano de la Fiebre Amarilla (FA. Materiales y métodos: la región carboxiterminal del gen de la envoltura (E de cinco aislamientos de FA obtenidas de pacientes provenientes de Ayacucho 1978 (PER1, Junín 1995 (PER2, Cerro de Pasco (PER3, Cusco (1998 y San Martín (1999 fue amplificada por PCR, secuenciada y analizada con programas software de ADN. Resultados: el índice de similaridad de la secuencia de nucleótidos entre los cinco aislamientos reveló valores oscilantes entre 94,3% y 99,3%, mientras que la secuencia de aminoácidos presentó valores entre 97,6% y 99,7% de similaridad. El análisis filogenético demostró una distancia genética entre 0,40 y 6,50 mediante la secuencia de nucleótidos y a través de la secuencia de aminoácidos se observó un rango de 0,30 y 4,29. Sin embargo, las secuencias correspondientes a los sitios de glicosilación y a los epítopes de reconocimiento humoral fueron conservadas entre los cinco aislamientos, con excepción de algunos aislamientos de referencia reportados por otros autores. Conclusiones: los virus de FA peruanos forman un grupo filogenético distinto a otros virus de FA sudamericanos, basados en el análisis genéticos del gen E.

Next-Gen³: Sequencing, Modeling, and Advanced Biofuels - Final Technical Report

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Zengler, Karsten [Univ. of California, San Diego, CA (United States). Dept. of Pediatrics; Palsson, Bernhard [Univ. of California, San Diego, CA (United States). Dept. of Bioengineering; Lewis, Nathan [Univ. of California, San Diego, CA (United States). Dept. of Pediatrics

2017-12-27

Successful, scalable implementation of biofuels is dependent on the efficient and near complete utilization of diverse biomass sources. One approach is to utilize the large recalcitrant biomass fraction (or any organic waste stream) through the thermochemical conversion of organic compounds to syngas, a mixture of carbon monoxide (CO), carbon dioxide (CO₂), and hydrogen (H₂), which can subsequently be metabolized by acetogenic microorganisms to produce next-gen biofuels. The goal of this proposal was to advance the development of the acetogen Clostridium ljungdahlii as a chassis organism for next-gen biofuel production from cheap, renewable sources and to detail the interconnectivity of metabolism, energy conservation, and regulation of acetogens using next-gen sequencing and next-gen modeling. To achieve this goal we determined optimization of carbon and energy utilization through differential translational efficiency in C. ljungdahlii. Furthermore, we reconstructed a next-generation model of all major cellular processes, such as macromolecular synthesis and transcriptional regulation and deployed this model to predicting proteome allocation, overflow metabolism, and metal requirements in this model acetogen. In addition we explored the evolutionary significance of tRNA operon structure using the next-gen model and determined the optimal operon structure for bioproduction. Our study substantially enhanced the knowledgebaase for chemolithoautotrophs and their potential for advanced biofuel production. It provides next-generation modeling capability, offer innovative tools for genome-scale engineering, and provide novel methods to utilize next-generation models for the design of tunable systems that produce commodity chemicals from inexpensive sources.

Genome-scale data suggest reclassifications in the Leisingera-Phaeobacter cluster including proposals for Sedimentitalea gen. nov. and Pseudophaeobacter gen. nov.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Sven eBreider

2014-08-01

Full Text Available Earlier phylogenetic analyses of the marine Rhodobacteraceae (class Alphaproteobacteria genera Leisingera and Phaeobacter indicated that neither genus might be monophyletic. We here used phylogenetic reconstruction from genome-scale data, MALDI-TOF mass-spectrometry analysis and a re-assessment of the phenotypic data from the literature to settle this matter, aiming at a reclassification of the two genera. Neither Phaeobacter nor Leisingera formed a clade in any of the phylogenetic analyses conducted. Rather, smaller monophyletic assemblages emerged, which were phenotypically more homogeneous, too. We thus propose the reclassification of Leisingera nanhaiensis as the type species of a new genus as Sedimentitalea nanhaiensis gen. nov., comb. nov., the reclassification of Phaeobacter arcticus and Phaeobacter leonis as Pseudophaeobacter arcticus gen. nov., comb. nov. and Pseudophaeobacter leonis comb. nov., and the reclassification of Phaeobacter aquaemixtae, Phaeobacter caeruleus and Phaeobacter daeponensis as Leisingera aquaemixtae comb. nov., Leisingera caerulea comb. nov. and Leisingera daeponensis comb. nov. The genera Phaeobacter and Leisingera are accordingly emended.

Key Factors for the Linkage Strategy between R and D and Commercialization for Gen-ΙV

International Nuclear Information System (INIS)

Lee, Kyoungmi; Hong, Jung Suk

2013-01-01

The Fukushima nuclear disaster has leaded to enhance the safety and the cost-effectiveness of technology for the future so that advanced countries such as United Sates and France have concerned about a next generation nuclear power plant, Gen-IV(Generation-IV Reactor). Considering various characteristics of nuclear R and D, it is necessary to have more elaborated strategies for the effective development of the next generation of nuclear technology. In this study, we suggest 5 key factors for the successful commercialization of Gen-IV by analyzing the distinct characteristics of nuclear R and D with Gen-IV and CSF(Critical Success Factor)s of several cases in these field and conducting the FGI(Focus Group Interview). Considering these results, we could find and suggest some important points for further strategy for Gen-IV. That is, following five key factors for the linkage improvement between R and D and commercialization of Gen-IV should be considered: the participation of nuclear power plant operators from the beginning, the establishment of consistent and comprehensive plan/roadmap/detailed strategy, the technology development based on global energy issues and international cooperation, the stable and clear funding plans for long-term projects, the cooperation of relative ministries. Gen-IV system is getting a positive response in that it accompanies long-term R and D plans in Korea. We think that the standard of Gen-IV would lead the next generation of nuclear industry if the proper strategy for the cooperation between the private sector and the regulation from the beginning. Moreover, we expect that this study will facilitate its development process from R and D to commercialization

Key Factors for the Linkage Strategy between R and D and Commercialization for Gen-ΙV

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

Lee, Kyoungmi; Hong, Jung Suk [Korean Institute of S and T Evaluation and Planning, Seoul (Korea, Republic of)

2013-05-15

The Fukushima nuclear disaster has leaded to enhance the safety and the cost-effectiveness of technology for the future so that advanced countries such as United Sates and France have concerned about a next generation nuclear power plant, Gen-IV(Generation-IV Reactor). Considering various characteristics of nuclear R and D, it is necessary to have more elaborated strategies for the effective development of the next generation of nuclear technology. In this study, we suggest 5 key factors for the successful commercialization of Gen-IV by analyzing the distinct characteristics of nuclear R and D with Gen-IV and CSF(Critical Success Factor)s of several cases in these field and conducting the FGI(Focus Group Interview). Considering these results, we could find and suggest some important points for further strategy for Gen-IV. That is, following five key factors for the linkage improvement between R and D and commercialization of Gen-IV should be considered: the participation of nuclear power plant operators from the beginning, the establishment of consistent and comprehensive plan/roadmap/detailed strategy, the technology development based on global energy issues and international cooperation, the stable and clear funding plans for long-term projects, the cooperation of relative ministries. Gen-IV system is getting a positive response in that it accompanies long-term R and D plans in Korea. We think that the standard of Gen-IV would lead the next generation of nuclear industry if the proper strategy for the cooperation between the private sector and the regulation from the beginning. Moreover, we expect that this study will facilitate its development process from R and D to commercialization.

Estructura genética del copépodo Acartia lilljeborgii en la costa del estado de Yucatán, México

OpenAIRE

Jorge Tello-Cetina; Lucia Gómez-Victoria; Roberto Zamora-Bustillos; Gerardo Rivera-Muñoz; Sara Solis-Pereira; Herbert Loria-Sunza

2013-01-01

Se determinó la estructura genética poblacional y sus implicancias dentro de la cadena trófica del copépodo Acartia lilljeborgii en la costa de Yucatán, mediante el uso de isoenzimas y su posterior determinación por electroforesis. Nueve sistemas se expresaron con un máximo de 30 loci. El polimorfismo y heterocigosis de las poblaciones estudiadas, al ser comparados con otras especies de copépodos, resultaron ser bajos y de los cuatro loci que presentaron variación, solo los loci EST2 y PGM1 s...

Targeted NextGen Capabilities for 2025

Science.gov (United States)

2011-11-01

increased arrival capacity to single runways by reducing longitudinal wake separation standards for Instrument Flight Rules ( IFR ) operations under certain...b. ABSTRACT unclassified c. THIS PAGE unclassified Standard Form 298 (Rev. 8-98) Prescribed by ANSI Std Z39-18 Targeted NextGen Capabilities...The examples cited are not intended to cover every aircraft and every flight. In some instances, the available capabilities for 2025 will not be

PowerGen plc report and accounts 1995

Energy Technology Data Exchange (ETDEWEB)

NONE

1995-12-31

Detailed financial results are presented for the United Kingdom power generation company PowerGen for the year ended 2 April 1995. A review is given of operating and financial performance. Significant reductions in operating costs and improvements in productivity have been achieved. Diversity of fuels and plant portfolio has been enhanced by building 3000 MW of gas fired CCGT plant. Investment in coal import facilities has increased access to international coal markets. Environmental performance has improved with further reductions in SO{sub 2}, NO{sub x} and CO{sub 2} emissions. Overseas projects include construction of 990 MW CCGT power station in Portugal and a contract to build the 1200 MW Paiton 2 coal-fired power station in Indonesia. Investment in lignite mining and power generation assets of MIBRAG in Germany is contributing to profits. PowerGen`s five year contract for coal supply was assigned to RJB Mining (UK) Ltd. during the year. Stocks of coal fell during the year and further reductions are expected during 1995/96.

Interação genótipo-ambiente em cruzamentos de bovinos de corte Genotype by environment interaction on crossbreed beef cattle

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Rodrigo de Almeida Teixeira

2006-08-01

Full Text Available Dados de rebanhos bovinos comerciais foram analisados com o objetivo de estimar as interações dos efeitos genéticos com o ambiente que podem influenciar a avaliação de características de crescimento em rebanhos de animais puros e cruzados. O conjunto de dados analisado foi obtido a partir de animais das raças Hereford, Nelore e seus cruzamentos. As características em estudo foram os pesos à desmama e ao sobreano dos animais. As análises estatísticas foram realizadas pelo método dos quadrados mínimos e o modelo proposto incluiu os efeitos de região, grupo de contemporâneos dentro de região, mês de nascimento e sexo do bezerro, os efeitos lineares e quadráticos para a idade do bezerro e idade da vaca ao parto, ambas analisadas dentro de sexo, e os efeitos de grupo genético e da interação grupo genético × região. De modo geral, o desempenho de todos os grupos genéticos foi influenciado pelo efeito de região. Além disso, observou-se tendência de que o aumento da proporção de genes zebuínos promoveu diminuição na diferença de desempenho entre as regiões. Todos os genótipos foram beneficiados no ambiente menos restritivo, o que indica a existência de interação genótipo-ambiente e comprova a importância de que sistemas de cruzamento sejam realizados de forma a manter a adaptação das matrizes e de seus produtos.Data from Hereford and Nelore breeds and their crosses were used to estimate the effect of genotype and environment interaction on weaning and yearling weights. The statistical analyses were performed by the least-squares method using models that included region, contemporary group within region, month of birth and sex of the calf, linear and quadratic effects of age of the calf and age of the cow, both nested within sex, and the genetic group and genetic group × region interaction effects. In general, genetic groups were influenced by the region effect. Differences in performance between regions

GenExp: an interactive web-based genomic DAS client with client-side data rendering.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Bernat Gel Moreno

Full Text Available BACKGROUND: The Distributed Annotation System (DAS offers a standard protocol for sharing and integrating annotations on biological sequences. There are more than 1000 DAS sources available and the number is steadily increasing. Clients are an essential part of the DAS system and integrate data from several independent sources in order to create a useful representation to the user. While web-based DAS clients exist, most of them do not have direct interaction capabilities such as dragging and zooming with the mouse. RESULTS: Here we present GenExp, a web based and fully interactive visual DAS client. GenExp is a genome oriented DAS client capable of creating informative representations of genomic data zooming out from base level to complete chromosomes. It proposes a novel approach to genomic data rendering and uses the latest HTML5 web technologies to create the data representation inside the client browser. Thanks to client-side rendering most position changes do not need a network request to the server and so responses to zooming and panning are almost immediate. In GenExp it is possible to explore the genome intuitively moving it with the mouse just like geographical map applications. Additionally, in GenExp it is possible to have more than one data viewer at the same time and to save the current state of the application to revisit it later on. CONCLUSIONS: GenExp is a new interactive web-based client for DAS and addresses some of the short-comings of the existing clients. It uses client-side data rendering techniques resulting in easier genome browsing and exploration. GenExp is open source under the GPL license and it is freely available at http://gralggen.lsi.upc.edu/recerca/genexp.

Identificación de la secuencia del gen de la subunidad catalítica de la telomerasa en Plasmodium falciparum.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Claudia Consuelo Rubiano

2005-03-01

Full Text Available lntroducción. La enzima telomerasa participa en la regulación de la longitud de los telómeros al sintetizar nuevas repeticiones teloméricas que compensan las pérdidas en cada ronda de replicación del ADN. Por esta razón, el bloqueo de su actividad se plantea como un posible blanco de acción para detener el crecimiento de células con altas tasas de crecimiento. Tal es el caso de Plasmodium falciparum, parásito causante de la forma más grave de paludismo humano, en el cual se sabe que hay actividad de telomerasa pero no se tiene información sobre la enzima misma. Metodología. Para hacer un acercamiento al estudio de la telomerasa en P. falciparum, se realizó un alineamiento múltiple de las secuencias de la subunidad catalítica de la telomerasa disponibles en bases de datos y se obtuvo una secuencia consenso, la cual se comparó con las secuencias generadas en el proyecto de genoma de P. falciparum. Se encontró una secuencia que podría corresponder a parte del gen de la telomerasa de P. falciparum. Para comprobarlo, se diseñaron iniciadores que se utilizaron en ensayos de amplificación sobre el ADN y el ARN del parásito. Resultados. Se amplificaron fragmentos de ADN correspondientes a motivos conservados en las telomerasas y se detectó la presencia del ARNm mediante trascripción reversa y PCR sobre el ADNc generado. De esta manera, al combinar la utilización de herramientas de bioinformática y su posterior comprobación mediante técnicas de biología molecular, se obtuvo la secuencia del gen de la subunidad catalítica de la telomerasa en P. falciparum y se comprobó su presencia y trascripción en el parásito

Human-Automation Cooperation for Separation Assurance in Future NextGen Environments

Science.gov (United States)

Mercer, Joey; Homola, Jeffrey; Cabrall, Christopher; Martin, Lynne; Morey, Susan; Gomez, Ashley; Prevot, Thomas

2014-01-01

A 2012 Human-In-The-Loop air traffic control simulation investigated a gradual paradigm-shift in the allocation of functions between operators and automation. Air traffic controllers staffed five adjacent high-altitude en route sectors, and during the course of a two-week experiment, worked traffic under different function-allocation approaches aligned with four increasingly mature NextGen operational environments. These NextGen time-frames ranged from near current-day operations to nearly fully-automated control, in which the ground systems automation was responsible for detecting conflicts, issuing strategic and tactical resolutions, and alerting the controller to exceptional circumstances. Results indicate that overall performance was best in the most automated NextGen environment. Safe operations were achieved in this environment for twice todays peak airspace capacity, while being rated by the controllers as highly acceptable. However, results show that sector operations were not always safe; separation violations did in fact occur. This paper will describe in detail the simulation conducted, as well discuss important results and their implications.

Análisis de la diversidad genética de una población de caballos Criollo Argentino mediante polimorfismos de nucleótido simple de los genes IL12B y TNF-α

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Claudia Corbi Botto

2016-12-01

Full Text Available La caracterización de una población es el primer paso en el camino hacia su conservación y utilización. La raza Criollo Argentino es una de las referentes de la especie equina en Argentina y, por lo tanto, un patrimonio ganadero local que representa un recurso único en cuanto a la identidad y al sistema productivo del país. El objetivo de este trabajo fue analizar una población de caballos Criollo Argentino del norte de Argentina por medio de la caracterización de la variabilidad genética de cuatro marcadores moleculares del tipo single nucleotide polymorphism (SNP localizados en los genes que codifican para las citoquinas IL-12B y TNF-α. Se recolectaron muestras de 50 caballos Criollo Argentino y se extrajo ADN genómico que se utilizó para tipificar mediante PCR-Pirosecuenciación®, tres SNPs en el promotor del gen TNF-α y uno localizado en el exón 5 del gen IL-12B. Se estimaron frecuencias génicas y genotípicas, equilibrio de Hardy-Weinberg y diversidad genética. En IL-12B se detectaron dos alelos, mientras que en TNF-α se observaron 4 haplotipos, entre ellos uno no descripto hasta el momento en equinos. Los resultados muestran que la heterocigosis esperada fue superior en TNF-α (He=0,764 y la población se encuentra en equilibrio para el locus IL-12B (p-valor ≥0,05. Se destaca la importancia del caballo Criollo Argentino como acervo génico para el estudio de características genéticas y enfermedades de la especie equina.

Description of Sharon gen. nov. for the Chilean species Asaphes amoenus Philippi, 1861 (Coleoptera: Elateridae

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Elizabeth T. Arias-Bohart

2015-10-01

Full Text Available Sharon gen. nov. is here described to include Asaphes? amoenus Philippi, 1861 comb. nov. from Chile. A redescription of the species is based on the female holotype and material from different geographic locations. Candèze (1891 placed Asaphes amoenus and Parasaphes elegans in the suprageneric group Asaphites. We discuss differences between Sharon gen. nov. and Hemicrepidius Germar, 1839, where Asaphes amoenus was later placed by Blackwelder (1944. Based on morphological characters, Sharon gen. nov. appears to be related to Parasaphes Candèze, 1881, Wynarka Calder, 1986, and Tasmanelater Calder, 1996, all from Australia, suggesting Gondwanan relationships.

Actividad del Sistema Renina-Angiotensina en relación con sus polimorfismos genéticos

OpenAIRE

Morcillo Hidalgo, Luis

2015-01-01

La realización del presente estudio sobre sujetos jóvenes y sanos no hipertensos tiene dos objetivos primordiales: El primero es analizar la relación de los polimorfismos de los genes del Sistema Renina-Angiotensina, el M235T del gen del angiotensinógeno, el Inserción/Delección del gen de la ECA y el A1166C del gen del receptor AT1 para la angiotensina II, con los niveles en plasma de angiotensina I, angiotensina II y angiotensina-(1-7), todas sustancias peptídicas activas del sistema E...

Tolerância de genótipos de trigo comum, trigo duro e triticale à toxicidade de alumínio em soluções nutritivas Tolerance of bread wheat, durum wheat and triticale genotypes to aluminum toxicity in nutrient solution

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Carlos Eduardo de Oliveira Camargo

2006-01-01

Full Text Available Foi estudado o comportamento diferencial de 12 genótipos de trigo comum (Triticum aestivum L., um genótipo de trigo duro (Triticum durum L., e um de triticale (Triticosecale sp em soluções nutritivas de tratamento contendo duas concentrações salinas (1/5 e 1/10 da completa e seis concentrações de alumínio ( 0, 2, 4, 6, 8 e 10 mg L-1, à temperatura de 25 ± 1ºC e pH 4,0. Foram utilizadas dez plântulas por parcela e quatro repetições. A tolerância foi medida pela capacidade de as raízes primárias continuarem a crescer em solução sem alumínio, após permanecer 48 horas em solução nutritiva completa, contendo uma concentração conhecida de alumínio combinada com cada uma das concentrações salinas. Os genótipos de trigo comum IAC-289, IAC-350 e IAC-370 e a cultivar controle Anahuac, e os genótipos de trigo duro IAC-1003 e de triticale IAC-5 foram os mais sensíveis a níveis crescentes de Al3+nas soluções nutritivas de tratamento e, portanto, somente seriam indicados para cultivo em solos corrigidos. Os genótipos de trigo comum IAC-24 e IAC-378 e a cultivar controle BH-1146 destacaram-se pela tolerância à toxicidade de Al3+, com potencial para uso em solos ácidos e como fontes genéticas de tolerância nos futuros cruzamentos. Os sintomas de toxicidade de alumínio foram maiores com a elevação da concentração de alumínio e da diminuição das concentrações de sais da solução nutritiva para todos os genótipos estudados.Twelve bread wheat (Triticum aestivum L., one durum wheat (Triticum durum L. and one triticale (Triticosecale sp genotypes were studied in nutrient solutions with a high salt concentration in experiment 1 and a weak salt concentration in experiment 2, for aluminum tolerance at six levels: 0, 2, 4, 6, 8 and 10 mg L-1, under temperature 25 ± 1ºC and pH 4,0. Four replications were used per experiment. Aluminum tolerance was evaluated by measuring root growth in an aluminum-free complete

Propuesta de Flipped Classroom para el desarrollo de las competencias genéricas en estudiantes de ingeniería

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Agustín Lagunes Dominguez Luis

2017-02-01

Full Text Available Este artículo trata sobre la importancia de las competencias en los estudiantes de pregrado, define las competencias, muestra sus ventajas, indica su clasificación y, sobre todo, describe las principales competencias genéricas deseables según la Agencia Nacional de Evaluación de la Calidad y Acreditación (ANECA. Posterior a esto, se trata el Flipped Classroom, su definición, sus principios, algunas recomendaciones para su implementación y se muestran sus tres principales ventajas. El principal aporte de este trabajo es una propuesta que tiene como base al Flipped Classroom y como pilares a las actividades preclase y las actividades en clase, donde estas acciones deben tener una fuerte conexión que les permita trabajar coordinadamente, integrado en la planeación estratégica didáctica para desarrollar las competencias. Dentro de las principales conclusiones se tienen es que el Flipped Classroom es ideal para desarrollar las competencias genéricas deseables, tanto las instrumentales, personales y las sistemáticas. Otra conclusión es que no hay modelo pedagógico o propuesta didáctica que tenga éxito sin el trabajo arduo del profesor.

GenGIS 2: geospatial analysis of traditional and genetic biodiversity, with new gradient algorithms and an extensible plugin framework.

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Donovan H Parks

Full Text Available GenGIS is free and open source software designed to integrate biodiversity data with a digital map and information about geography and habitat. While originally developed with microbial community analyses and phylogeography in mind, GenGIS has been applied to a wide range of datasets. A key feature of GenGIS is the ability to test geographic axes that can correspond to routes of migration or gradients that influence community similarity. Here we introduce GenGIS version 2, which extends the linear gradient tests introduced in the first version to allow comprehensive testing of all possible linear geographic axes. GenGIS v2 also includes a new plugin framework that supports the development and use of graphically driven analysis packages: initial plugins include implementations of linear regression and the Mantel test, calculations of alpha-diversity (e.g., Shannon Index for all samples, and geographic visualizations of dissimilarity matrices. We have also implemented a recently published method for biomonitoring reference condition analysis (RCA, which compares observed species richness and diversity to predicted values to determine whether a given site has been impacted. The newest version of GenGIS supports vector data in addition to raster files. We demonstrate the new features of GenGIS by performing a full gradient analysis of an Australian kangaroo apple data set, by using plugins and embedded statistical commands to analyze human microbiome sample data, and by applying RCA to a set of samples from Atlantic Canada. GenGIS release versions, tutorials and documentation are freely available at http://kiwi.cs.dal.ca/GenGIS, and source code is available at https://github.com/beiko-lab/gengis.

Comparación reproductiva de vacas holstein, bon y f1 bon x holstein en el centro paysandú, 2. Edad al primer parto, intervalo entre partos, días abiertos y servicios por concepción.

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Quijano B Jorge H

2003-06-01

Full Text Available Se estimaron los porcentajes de heterosis para edad al primer parto, intervalo entre partos, días abiertos y servicios por concepción, en vacas F1 (BON x HOLSTEIN del Centro Paysandú, propiedad de la Universidad Nacional de Colombia, ubicado en la zona ecológica de bosque muy húmedo montano bajo (bmh-MB y situado a 2600 m.s.n.m. con una temperatura promedio de 12,5C, en el corregimiento de Santa Elena, Municipio de Medellín. El modelo usado incluyó los efectos de: Grupo Genético, año de parto, edad al parto sobre las variables edad al primer parto, intervalo entre partos, días abiertos y servicios por concepción. El efecto del grupo genético fue altamente significativo (P0,05, -7,9 (P0,05 para edad al primer parto, intervalo entre partos, días abiertos y servicios por concepción respectivamente.

Application of part-whole training methods to evaluate when to introduce NextGen air traffic management tools to students.

Science.gov (United States)

Vu, Kim-Phuong L; Kiken, Ariana; Chiappe, Dan; Strybel, Thomas Z; Battiste, Vernol

2013-01-01

The Next Generation Air Transportation System (NextGen) will use advanced technologies and new concepts of operation to accommodate projected increases in air travel over the next few decades. Use of NextGen tools requires air traffic controllers (ATCos) to use different procedures than those required to manage NextGen-unequipped aircraft, and ATCos will need to integrate the 2 skill sets when managing a sector consisting of NextGen-equipped and unequipped aircraft. The goal of the present study was to determine the effectiveness of 2 procedures in the training of student controllers to manage both equipage types. We applied a variant of the part-whole training paradigm in the present study. Using a quasi-experimental design, we trained students from 2 different labs of an internship course to manage air traffic with potential NextGen tools concurrent with their traditional training (whole-task group) or after they had time to learn traditional air traffic management skills (part-whole group). Participants were then tested in their ability to manage a simulated sector consisting of different percentages of NextGen-equipped and unequipped aircraft at the mid-term and after the final week of their internship. Results showed that it is better to train students in manual ATCo skills before introducing NextGen tools, unless the students are of higher aptitude. For more skilled students, simultaneously introducing NextGen and manual tools into their curriculum had little negative impact.

Genética molecular de caracteres cuantitativos en cruzamientos dialélicos de tomate

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Guillermo Raúl Pratta

2011-05-01

Full Text Available El objetivo de este trabajo fue evaluar marcadores moleculares y caracteres cuantitativos en un cruzamiento dialélico completo sin recíprocos, entre cinco líneas recombinantes de tomate y sus híbridos. Se obtuvieron perfiles de AFLP ("amplified fragment length polymorphism" y de polipéptidos del pericarpio en cuatro estados de madurez del fruto de 15 genotipos. Se evaluaron, entre otros: peso, acidez titulable, pH, vida poscosecha y firmeza. Se calculó el porcentaje de polimorfismo para los marcadores moleculares y el porcentaje de variabilidad genética para los caracteres cuantitativos en el grupo de líneas recombinantes, el de híbridos y el conjunto de genotipos. Se realizaron análisis de agrupamiento con cada nivel de variación genética. Para AFLP, el porcentaje de polimorfismo varió entre 34 y 54% y, para los perfiles polipeptídicos, entre 40 y 78%. Mayor polimorfismo fue observado en el grupo de híbridos. La variabilidad genética fue de 100% para acidez y 34% para firmeza, con los mayores valores en los parentales. La similitud genética varió entre los genotipos según el nivel de variación genética; pero la consistencia en el agrupamiento de algunas líneas recombinantes y sus híbridos fue conservada, lo que evidenció asociaciones entre los datos moleculares y fenotípicos.

Estimación de parámetros genéticos para características productivas y reproductivas en los sistemas doble propósito del trópico bajo colombiano

Directory of Open Access Journals (Sweden)

A. P. Galeano

2010-01-01

Full Text Available Con el objetivo de estimar los componentes de varianza, las heredabilidades, repetibilidades y correlaciones genéticas y fenotípicas para la producción de leche por lactancia (PL, el peso al destete (PD, el intervalo entre partos (IEP y el Índice de Vaca (IV, de las hembras bovinas manejadas en los sistemas de producción de doble propósito del trópico bajo colombiano, se analizaron los registros productivos y reproductivos de 1.687 vacas registradas en la Asociación Colombiana de Criadores de Ganado en Doble Propósito (Asodoble, durante el periodo comprendido entre 1998 y 2007. Se empleó un modelo animal mixto que incluyó los efectos fijos del grupo contemporáneo (finca-sexo-época-año, la composición racial, y la duración de la lactancia como covariable; así como los efectos genéticos aleatorios del animal, el medio ambiente permanente y el residual. Las heredabilidades estimadas para IEP (0,04 y PD (0,11 fueron bajas, y moderadas para PL (0,35 e IV (0,24, respectivamente. La repetibilidad estimada para IEP fue baja (0,08, y para PL (0,41 e IV (0,31 moderada; en el caso de PD este valor fue igual a la heredabilidad (0,11. Las correlaciones genéticas y fenotípicas obtenidas entre PL y PD con respecto a IEP fueron positivas, y se determinó una asociación genética negativa entre PL y PD. Los resultados demostraron que el IV es un buen indicador, desde el punto de vista genético, de la eficiencia productiva y reproductiva de los animales manejados en estos sistemas productivos.

Estimación de parámetros genéticos para características productivas y reproductivas en los sistemas doble propósito del trópico bajo colombiano

Directory of Open Access Journals (Sweden)

A. P. Galeano

2010-06-01

Full Text Available Con el objetivo de estimar los componentes de varianza, las heredabilidades, repetibilidadesy correlaciones genéticas y fenotípicas para la producción de leche por lactancia(PL, el peso al destete (PD, el intervalo entre partos (IEP y el Índice de Vaca (IV,de las hembras bovinas manejadas en los sistemas de producción de doble propósitodel trópico bajo colombiano, se analizaron los registros productivos y reproductivosde 1.687 vacas registradas en la Asociación Colombiana de Criadores de Ganado enDoble Propósito (Asodoble, durante el periodo comprendido entre 1998 y 2007. Seempleó un modelo animal mixto que incluyó los efectos fijos del grupo contemporáneo(finca-sexo-época-año, la composición racial, y la duración de la lactancia comocovariable; así como los efectos genéticos aleatorios del animal, el medio ambientepermanente y el residual. Las heredabilidades estimadas para IEP (0,04 y PD (0,11fueron bajas, y moderadas para PL (0,35 e IV (0,24, respectivamente. La repetibilidadestimada para IEP fue baja (0,08, y para PL (0,41 e IV (0,31 moderada; en el casode PD este valor fue igual a la heredabilidad (0,11. Las correlaciones genéticas y fenotípicasobtenidas entre PL y PD con respecto a IEP fueron positivas, y se determinóuna asociación genética negativa entre PL y PD. Los resultados demostraron que el IVes un buen indicador, desde el punto de vista genético, de la eficiencia productiva yreproductiva de los animales manejados en estos sistemas productivos.

Clasificador genérico de objetos en imágenes AVHRR

OpenAIRE

Pascual Ramírez, Fermín; Paz Pellat, Fernando; Martínez Menes, Mario; Palacios Vélez, Enrique; Mejía Sáenz, Enrique; Rubio Granados, Erasmo

2010-01-01

El presente artículo describe un algoritmo para llevar a cabo una clasificación genérica de objetos utilizando imágenes del sensor advanced very high resolution radiometer (AVHRR), basado en la firma espectral de los objetos genéricos (suelo, mezcla suelo-vegetación, cuerpos de agua, nubes, etc.). Debido a las particularidades de las bandas disponibles en el sensor AVHRR, se presenta un algoritmo específico utilizando la banda 3a (B3a) y otro utilizando la banda 3b (B3b) de este sensor. Los a...

Diversidad genética y contenido de carotenos totales en accesiones de yuca (Manihot esculenta Crantz

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Ana Cruz Morillo C.

2011-04-01

Full Text Available La yuca (Manihot esculenta Crantz es un arbusto perenne cultivado en África, América Latina y el Sureste asiático, cuya raíz constituye una fuente importante de energía en la dieta humana en países tropicales. Los carotenoides son pigmentos naturales que se encuentran ampliamente distribuidos en la naturaleza. Se reconoce que aproximadamente cincuenta de ellos tienen actividad provitamina A, siendo b-caroteno el de mayor eficiencia para su conversión en vitamina A. El estudio de la variabilidad genética es un procedimiento útil para fortificar, enriquecer o incrementar el contenido de nutrientes de los alimentos o cultivos, entre ellos los carotenos en raíz de yuca mediante procesos de selección y recombinación en programas de mejoramiento que permitan identificar genotipos superiores. En el presente estudio, a partir de la evaluación de la diversidad genética, se generó un dendrograma de accesiones de yuca en el cual se formaron seis grupos con 68% de similitud. La heterocigosidad promedio observada fue de Ht = 0.559. Los análisis de regresión y correlación entre el contenido de carotenos totales y los datos moleculares mostraron que los marcadores que se encuentran correlacionados con altos contenidos de carotenos pertenecen al grupo de ligamiento D del mapa molecular de yuca.

GenBank blastn search result: AK064582 [KOME

Lifescience Database Archive (English)

Full Text Available AK064582 002-112-F03 AY007820.1 Daucus carota ATPase8 (ATP8) gene, ATP8-Sp1b allele, complete cds; chimeric... ATPase9 (ATP9) gene, ATP9-Sp3 allele, complete cds; and chimeric ATPase6 (ATP6) gen

GEN1 from a thermophilic fungus is functionally closely similar to non-eukaryotic junction-resolving enzymes.

Science.gov (United States)

Freeman, Alasdair D J; Liu, Yijin; Déclais, Anne-Cécile; Gartner, Anton; Lilley, David M J

2014-12-12

Processing of Holliday junctions is essential in recombination. We have identified the gene for the junction-resolving enzyme GEN1 from the thermophilic fungus Chaetomium thermophilum and expressed the N-terminal 487-amino-acid section. The protein is a nuclease that is highly selective for four-way DNA junctions, cleaving 1nt 3' to the point of strand exchange on two strands symmetrically disposed about a diagonal axis. CtGEN1 binds to DNA junctions as a discrete homodimer with nanomolar affinity. Analysis of the kinetics of cruciform cleavage shows that cleavage of the second strand occurs an order of magnitude faster than the first cleavage so as to generate a productive resolution event. All these properties are closely similar to those described for bacterial, phage and mitochondrial junction-resolving enzymes. CtGEN1 is also similar in properties to the human enzyme but lacks the problems with aggregation that currently prevent detailed analysis of the latter protein. CtGEN1 is thus an excellent enzyme with which to engage in biophysical and structural analysis of eukaryotic GEN1. Copyright © 2014. Published by Elsevier Ltd.

Asesoría genética sobre cáncer en el Perú Genetic counseling about cancer in Peru

OpenAIRE

Javier E. Manrique; Yasser Sullcahuamán-Allende; Abel Limache-García

2013-01-01

El cáncer es una enfermedad genética producto de alteraciones en la secuencia o expresión del ADN. Estas alteraciones, según su origen, nos permiten clasificar el cáncer como esporádico y hereditario o familiar. En base a los registros de cáncer, en el Perú se espera que del 5 al 30% de todos los pacientes con cáncer, que equivale aproximadamente entre 2000 a 12 000 personas, presentarían cáncer del tipo familiar o hereditario, lo que representaría un similar número de familias con un riesgo ...

Análisis de la variabilidad genética de la colección colombiana de musáceas usando marcadores isoenzimáticos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Giraldo Martha C.

2011-06-01

Full Text Available La Colección Colombiana de Musãceas (CCM es la ünica a nivel mundial %ue representa un alto valor por ser la %ue posee introducciones andinas de altura (& 1( m.s.n.m.. La caracterización de este germoplasma puede generar valor agregado para su utilización en procesos de selección clonal - para el mejoramiento genético de la especie, mediante el uso de materiales diploides con características transmisibles de importancia. Por esta razón, 33 clones de la CCM conservadas in vitro, fueron evaluadas bio%uimicamente mediante 1 enzimas, de las cuales cuatro 4ueron polimór7cas: glutamato o=aloacetil transaminasa (GOT, a13-esterasa (a13HIJL, pero=idasa (PMQ - dia4orasa (DVWP. La enzima GYL 4ue la mãs discriminante entre grupos genómicos particulares. PMQ, DVWP - a13HIJL permitieron evaluar la variabilidad al interior de cada grupo. Il estudio 4acilita el entendimiento de la estructura genética de los genotipos de plátano y banano cultivados en Colombia. .

Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Itamara Bomfim Gois

2014-08-01

Full Text Available Os estudos de diversidade genética em populações naturais são imprescindíveis para a elaboração de estratégias de conservação. Assim, este trabalho foi realizado com o objetivo de caracterizar geneticamente, por meio de marcadores Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD, populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., localizadas na região do Baixo São Francisco sergipano. Foram empregados 20 oligonucleotídeos e, a partir do polimorfismo observado, foram estimadas a porcentagem de polimorfismo, a variabilidade genética e a similaridade genética (Sgij, por meio do coeficiente de Jaccard. O teste de Mantel foi realizado para avaliar a correlação entre a similaridade genética e a distância geográfica; sendo o fluxo gênico também estimado. O polimorfismo observado nas populações de Z. joazeiro variou de 58,1 a 66,5% e a similaridade genética, de 44 a 54%. A similaridade genética não está correlacionada com a distância geográfica, e os valores observados para o índice de diversidade genética de Nei, para o índice de Shannon e para os parâmetros HS, HT e GST foram considerados altos e semelhantes aos encontrados em outras espécies arbóreas. A porcentagem de locos polimórficos foi considerada baixa. Maior identidade genética foi encontrada entre as populações de Canindé do São Francisco e Santana do São Francisco; e a maior distância genética entre as populações de Canhoba e Canindé do São Francisco. O fluxo gênico foi maior que 1. Com base nos resultados, pode-se afirmar que há alta variabilidade genética entre as populações e que estas podem estar geneticamente estruturadas.

Genética Molecular das Epidermólises Bolhosas Molecular Genetics of Epidermolysis Bullosa

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Hiram Larangeira de Almeida Jr

2002-10-01

Full Text Available O estudo das alterações moleculares das epidermólises bolhosas tem contribuído para que se compreenda melhor essas enfermidades. Na epidermólise bolhosa simples a maioria dos casos está associada com alteração nas citoqueratinas basais 5 (gen KRT5 e 14 (gen KRT14, o que modifica o citoesqueleto na camada basal da epiderme, levando à degeneração dessa camada, formando bolha intra-epidérmica. Mutações na plectina (gen PLEC1, componente da placa interna do hemidesmossoma, levam também à clivagem intra-epidérmica. Na epidermólise bolhosa juncional vários gens estão envolvidos, em decorrência da complexidade da zona da membrana basal, todos levando ao descolamento dos queratinócitos basais na lâmina lúcida, pela disfunção da aderência entre esses e a lâmina densa. Alterações na laminina 5 (gens LAMA3, LAMB3 e LAMC2, integrina alfa6beta4 (gens ITGA6 e ITGB4 e colágeno XVII (gen COL17A1 foram descritas. Por fim, na epidermólise bolhosa distrófica apenas um gen está mutado, alterando o colágeno VII (gen COL7A1, principal componente das fibrilas ancorantes, produzindo clivagem abaixo da lâmina densa, variando fenotipicamente de acordo com a conseqüência da mutação. Outra aplicação importante dessas informações refere-se ao diagnóstico pré-natal, com a perspectiva no futuro da terapia gênica.New data regarding the molecular aspects of the heterogeneous group of epidermolysis bullosa has brought some important information about its pathogenesis. In epidermolysis bullosa simplex the majority of mutations are localized in the genes of the basal cytokeratin 5 (gene KRT5 and 14 (gene KRT14, cytolysis at this layer with intraepidermal blister is seen under light microscopy. Mutations of plectin (gene PLEC1, a protein found in the inner hemidesmosomal plaque, leads also to intraepidermal blisters. In junctional epidermolysis bullosa many proteins from the basal membrane zone are involved, such as laminin 5 (genes

GenColors-based comparative genome databases for small eukaryotic genomes.

Science.gov (United States)

Felder, Marius; Romualdi, Alessandro; Petzold, Andreas; Platzer, Matthias; Sühnel, Jürgen; Glöckner, Gernot

2013-01-01

Many sequence data repositories can give a quick and easily accessible overview on genomes and their annotations. Less widespread is the possibility to compare related genomes with each other in a common database environment. We have previously described the GenColors database system (http://gencolors.fli-leibniz.de) and its applications to a number of bacterial genomes such as Borrelia, Legionella, Leptospira and Treponema. This system has an emphasis on genome comparison. It combines data from related genomes and provides the user with an extensive set of visualization and analysis tools. Eukaryote genomes are normally larger than prokaryote genomes and thus pose additional challenges for such a system. We have, therefore, adapted GenColors to also handle larger datasets of small eukaryotic genomes and to display eukaryotic gene structures. Further recent developments include whole genome views, genome list options and, for bacterial genome browsers, the display of horizontal gene transfer predictions. Two new GenColors-based databases for two fungal species (http://fgb.fli-leibniz.de) and for four social amoebas (http://sacgb.fli-leibniz.de) were set up. Both new resources open up a single entry point for related genomes for the amoebozoa and fungal research communities and other interested users. Comparative genomics approaches are greatly facilitated by these resources.

O papel de marcadores moleculares na genética forense

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Daniele Decanine

2016-07-01

Full Text Available O objetivo desse trabalho foi apresentar uma revisão bibliográfica sobre as tecnologias utilizadas na Genética Forense, enfatizando o uso de marcadores moleculares para a identificação humana. Apresento aqui alguns exemplos do potencial da Biologia Molecular para auxiliar na investigação criminal, bem como na definição de parentesco (maternidade e paternidade. A utilização desses marcadores é atualmente a peça fundamental para os testes de DNA forense. Estes sistemas são, na sua maioria, baseados na análise de painéis de sequências microssatélites específicas (STRs. Foi possível discorrer sobre o uso forense do DNA, sobre a presença de regiões hipervariáveis no material genético, o papel de marcadores moleculares, bem como abordar técnicas de análise de DNA e suas aplicações. A busca por novas metodologias se faz importante para reduzir os custos e impulsionar uma nova cultura genética na Ciência Forense, as quais terão impacto no futuro do DNA forense com a expansão da Biologia Molecular.

GEN IV reactors: Where we are, where we should go

International Nuclear Information System (INIS)

Locatelli, G.; Mancini, M.; Todeschini, N.

2012-01-01

GEN IV power plants represent the mid-long term option of the nuclear sector. International literature proposes many papers and reports dealing with these reactors, but there is an evident difference of type and shape of information making impossible each kind of detailed comparison. Moreover, authors are often strongly involved in some particular design; this creates many difficulties in their super-partes position. Therefore it is necessary to put order in the most relevant information to understand strengths and weaknesses of each design and derive an overview useful for technicians and policy makers. This paper presents the state-of the art for GEN IV nuclear reactors providing a comprehensive literature review of the different designs with a relate taxonomy. It presents the more relevant references, data, advantages, disadvantages and barriers to the adoptions. In order to promote an efficient and wide adoption of GEN IV reactors the paper provides the pre-conditions that must be accomplished, enabling factors promoting the implementation and barriers limiting the extent and intensity of its implementation. It concludes outlying the state of the art of the most important R and D areas and the future achievements that must be accomplished for a wide adoption of these technologies. (authors)

Un método de transformación genética de maíz para conferirle resistencia ulterior a enfermedades virales

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Marta Valdez

2004-09-01

Full Text Available Se desarrolló un sistema de transformación genética para dos variedades costarricenses de maíz: CR-7 y Diamantes 8843, que permita la transferencia ulterior de genes de origen viral a su genoma, y conferirles resistencia a la enfermedad ocasionada por el virus del rayado fino del maíz (MRFV. El método se basa en el bombardeo de microproyectiles en callos organogénicos derivados de ápices de jóvenes vitrogerminaciones. Por otro lado, se elaboró la construcción molecular pRFcp-bar que contiene el gen de la cubierta proteica del MRFV y el gen marcador bar. Para la selección visual del material transformado, se utilizo también el plásmido pDM803 que contiene el gen reportero uidA (GUS. Los resultados indican que los dos aceleradores de partículas evaluados: el PIG ("Particle Inflow Gun" y el Bio-Rad™ son igualmente eficientes para transferir genes foráneos al genoma del maíz.A method for genetic transformation of maize for resistance to viral diseases. A system for the genetic transformation of maize was developed for two Costa Rican varieties: CR-7 and Diamantes 8843, that can allow the subsequent transfer of viral-derived genes in order to confer resistance to the disease caused by maize rayado fino virus (MRFV. The method is based on particle bombardment of organogenic calli derived from shoot tips. On the other hand, the molecular construction pRFcp-bar, containing the coat protein gene of MRFV and the marker gene bar, was elaborated. For the visual selection of the transformed material was used also the plasmid pDM803 that contains the reporter gene uidA (GUS.The results indicate that devices evaluated: the PIG (" Particle Inflow Gun " and the Bio-Rad ™ are both enough efficient to transfer foreign genes to the genome of the maize. Rev. Biol. Trop. 52(3: 787-793. Epub 2004 Dic 15.

Caracterización clínico genética del síndrome Prader Willi

OpenAIRE

Travieso Tellez, Anitery; Menéndez García, Reinaldo; Licourt Otero, Deysi

2014-01-01

Introducción: el síndrome Prader Willi es un desorden genético causado por la pérdida de genes contenidos en la región 15q11-q13 del cromosoma paterno. Objetivo: describir las características clínicas y genéticas de los pacientes con síndrome Prader Willi. Material y método: se realizó un estudio descriptivo, de corte transversal, con el universo de 15 pacientes con sospecha de síndrome Prader Willi remitidos a consulta provincial de Genética Clínica durante el año 2013. Se consideraron como ...

Reclassification of rhizosphere bacteria including strains causing corky root of lettuce and proposal of Rhizorhapis suberifaciens gen. nov., comb. nov., Sphingobium mellinum sp. nov., Sphingobium xanthum sp. nov. and Rhizorhabdus argentea gen. nov., sp. nov.

Science.gov (United States)

Francis, Isolde M; Jochimsen, Kenneth N; De Vos, Paul; van Bruggen, Ariena H C

2014-04-01

The genus Rhizorhapis gen. nov. (to replace the illegitimate genus name Rhizomonas) is proposed for strains of Gram-negative bacteria causing corky root of lettuce, a widespread and important lettuce disease worldwide. Only one species of the genus Rhizomonas was described, Rhizomonas suberifaciens, which was subsequently reclassified as Sphingomonas suberifaciens based on 16S rRNA gene sequences and the presence of sphingoglycolipid in the cell envelope. However, the genus Sphingomonas is so diverse that further reclassification was deemed necessary. Twenty new Rhizorhapis gen. nov.- and Sphingomonas-like isolates were obtained from lettuce or sow thistle roots, or from soil using lettuce seedlings as bait. These and previously reported isolates were characterized in a polyphasic study including 16S rRNA gene sequencing, DNA-DNA hybridization, DNA G+C content, whole-cell fatty acid composition, morphology, substrate oxidation, temperature and pH sensitivity, and pathogenicity to lettuce. The isolates causing lettuce corky root belonged to the genera Rhizorhapis gen. nov., Sphingobium, Sphingopyxis and Rhizorhabdus gen. nov. More specifically, we propose to reclassify Rhizomonas suberifaciens as Rhizorhapis suberifaciens gen. nov., comb. nov. (type strain, CA1(T) = LMG 17323(T) = ATCC 49355(T)), and also propose the novel species Sphingobium xanthum sp. nov., Sphingobium mellinum sp. nov. and Rhizorhabdus argentea gen. nov., sp. nov. with the type strains NL9(T) ( = LMG 12560(T) = ATCC 51296(T)), WI4(T) ( = LMG 11032(T) = ATCC 51292(T)) and SP1(T) ( = LMG 12581(T) = ATCC 51289(T)), respectively. Several strains isolated from lettuce roots belonged to the genus Sphingomonas, but none of them were pathogenic.

Saúde pública e ética na era da medicina genômica: rastreamentos genéticos Public health and ethics in the age of genomic medicine: genetic screening

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Flavia Miranda Gomes de Constantino Bandeira

2006-03-01

Full Text Available O presente artigo tem como objetivo contextualizar o campo da saúde pública diante dos grandes avanços da biotecnologia e genética aplicada, destacando elementos para a problematização do tema tais como benefícios e questões éticas relacionados aos rastreamentos genéticos. O Projeto Genoma Humano gerou várias expectativas, dentre elas, a possibilidade de rastrear genes associados a doenças e comportamentos, e mais ainda, de intervir geneticamente no ser humano, levantando preocupações relativas ao renascimento da eugenia, ao aconselhamento genético, e ao uso da informação genética como critério de acesso aos planos de saúde e postos de trabalho. Uma discussão de todos esses tópicos é essencial para que a saúde pública seja beneficiada com as informações obtidas através da análise genômica das populações.This article has the objective to bring the field of public health into context in the face of the great advances of biotechnology and applied genetics, focusing on issues related to the theme such as benefits and ethics concerning genetic screening. The Human Genome Project has generated many expectations among which the possibility of screening genes associated to diseases and behaviors, moreover, the possibility of genetic interventions on humans, creating concerns related to the resurgence of Eugenia, of genetic counseling and the use of genetic information as a standard for access to healthcare clinics and jobs. The discussion of all these issues is essential to benefit public health with information obtained through population genomic analysis.

Identification and Characterization of Key Human Performance Issues and Research in the Next Generation Air Transportation System (NextGen)

Science.gov (United States)

Lee, Paul U.; Sheridan, Tom; Poage, james L.; Martin, Lynne Hazel; Jobe, Kimberly K.

2010-01-01

This report identifies key human-performance-related issues associated with Next Generation Air Transportation System (NextGen) research in the NASA NextGen-Airspace Project. Four Research Focus Areas (RFAs) in the NextGen-Airspace Project - namely Separation Assurance (SA), Airspace Super Density Operations (ASDO), Traffic Flow Management (TFM), and Dynamic Airspace Configuration (DAC) - were examined closely. In the course of the research, it was determined that the identified human performance issues needed to be analyzed in the context of NextGen operations rather than through basic human factors research. The main gaps in human factors research in NextGen were found in the need for accurate identification of key human-systems related issues within the context of specific NextGen concepts and better design of the operational requirements for those concepts. By focusing on human-system related issues for individual concepts, key human performance issues for the four RFAs were identified and described in this report. In addition, mixed equipage airspace with components of two RFAs were characterized to illustrate potential human performance issues that arise from the integration of multiple concepts.

PowerGen plc report and accounts 1994

International Nuclear Information System (INIS)

1994-01-01

The annual report and accounts of PowerGen plc for the year 1994 are presented. Financial highlights are quoted, followed by the Chairman's statement, reviews by the Chief Executive and Financial Directors, reports by the Auditors and Directors, balance sheets and details of the consolidated profit and loss account and principal accounting policies. A four year summary and shareholder information are included. (UK)

HUBUNGAN ANTARA PERTUMBUHAN DENGAN KEBERADAAN GEN TAHAN PENYAKIT MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX (MHC PADA IKAN MAS (Cyprinus carpio

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Erma Primanita Hayuningtyas

2016-04-01

Full Text Available Wabah penyakit koi herpes virus (KHV di Indonesia yang terjadi sejak tahun 2002 merupakan salah satu faktor yang memicu kemerosotan produksi ikan mas budidaya. Pembentukan strain unggul ikan mas tahan KHV dapat menjadi solusi bagi permasalahan tersebut. Pemilihan genotip ikan mas tahan KHV dengan marka molekuler gen major histocompatibility complex class II (MHC-II, khususnya pada alel Cyca DAB 1*05 akan membantu dalam kegiatan seleksi. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan gen MHC-II pada populasi dasar G0 ikan mas strain Rajadanu dan hubungannya dengan pertumbuhan (bobot. Metode deteksi keberadaan gen MHC-II pada dua kelompok ikan dengan ukuran berbeda dilakukan dengan teknik PCR. Hubungan antara pertumbuhan ikan mas dengan persentase kemunculan gen MHC-II dianalisis dengan menggunakan program SPSS (Statistical Package for the Social Sciences, sehingga diperoleh korelasi di antara keduanya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa hubungan antara pertumbuhan dengan persentase keberadaan gen MHC-II berkorelasi negatif dengan nilai R = -0,742. Hal ini mengindikasikan bahwa semakin cepat pertumbuhan populasi ikan mas maka semakin sedikit persentase individu yang mempunyai gen MHC-II pada setiap populasi ikan mas. Sehingga populasi ikan mas yang pertumbuhannya lambat memiliki tingkat persentase positif MHC-II lebih tinggi (85,71%-100% dibandingkan populasi ikan mas yang pertumbuhannya cepat (42,86%-85,71%.

Aproximación a un estudio jurídico y ético de la medicina genética predictiva

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Aitziber Emaldi Cirión

2017-01-01

Full Text Available Constantemente, los avances en el ámbito de la reproducción plantean cuestiones bioéticas y en ocasiones, también jurídicas de gran relevancia. Así es, los diagnósticos genéticos predictivos cada vez más preciosos nos obligan a tomar decisiones tales como: la de tener un hijo con una discapacidad o anomalía, proceder a un aborto, etc. En este trabajo de investigación, se analizarán los aspectos éticos en conflicto, teniendo presente la regulación jurídica que existe al respecto de estas prácticas cada vez más cotidianas.

Validation of an automated system for aliquoting of HIV-1 Env-pseudotyped virus stocks.

Science.gov (United States)

Schultz, Anke; Germann, Anja; Fuss, Martina; Sarzotti-Kelsoe, Marcella; Ozaki, Daniel A; Montefiori, David C; Zimmermann, Heiko; von Briesen, Hagen

2018-01-01

The standardized assessments of HIV-specific immune responses are of main interest in the preclinical and clinical stage of HIV-1 vaccine development. In this regard, HIV-1 Env-pseudotyped viruses play a central role for the evaluation of neutralizing antibody profiles and are produced according to Good Clinical Laboratory Practice- (GCLP-) compliant manual and automated procedures. To further improve and complete the automated production cycle an automated system for aliquoting HIV-1 pseudovirus stocks has been implemented. The automation platform consists of a modified Tecan-based system including a robot platform for handling racks containing 48 cryovials, a Decapper, a tubing pump and a safety device consisting of ultrasound sensors for online liquid level detection of each individual cryovial. With the aim to aliquot the HIV-1 pseudoviruses in an automated manner under GCLP-compliant conditions a validation plan was developed where the acceptance criteria-accuracy, precision as well as the specificity and robustness-were defined and summarized. By passing the validation experiments described in this article the automated system for aliquoting has been successfully validated. This allows the standardized and operator independent distribution of small-scale and bulk amounts of HIV-1 pseudovirus stocks with a precise and reproducible outcome to support upcoming clinical vaccine trials.

LA QUIMIOPREVENCIÓN PARA PACIENTES CON MUTACIONES HEREDITARIAS DE PREDISPOSICIÓN AL CÁNCER

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Dra. Christina Adaniel

2017-07-01

Full Text Available Mientras buscamos maneras de prevenir el cáncer, la quimioprevención ha evolucionado como una herramienta para la reducción de riesgo. El uso de drogas u otras substancias que previenen o atrasan el inicio de cáncer en individuos sanos ha sido objeto de intensa investigación durante las últimas dos décadas. Aquellos individuos quienes en teoría deben beneficiarse más incluyen los con mutaciones genéticas germinales que confieren una predisposición al cáncer. Desafortunadamente, este grupo de individuos ha sido sub representado en los estudios clínicos y, por lo tanto, la evidencia para la quimioprevención en este grupo es limitada. Se presenta una revisión de la literatura sobre la quimioprevención primaria para el cáncer de colon, mama, ovario, y próstata en los portadores de mutaciones genéticas hereditarias.

Não é ficção científica, é ciência : a genética e a biotecnologia em revista

OpenAIRE

Daniela Ripoll

2001-01-01

A mídia tem-se ocupado com frequência, nos últimos anos, das "novidades" da genética e da biotecnologia. Textos de revistas, jornais, cartoons, fumes de Hollywood, propagandas de empresas e laboratórios, novelas de TV, talk shows, catálogos de venda de organismos, no telejornal noturno, em reportagens especiais, manchetes: a genética, a biotecnologia, a engenharia genética, a biologia molecular e as novas" genética molecular e genômica parecem ocupar uma posição de visibilidade e destaque sej...

A Universal Approach to Optimize the Folding and Stability of Prefusion-Closed HIV-1 Envelope Trimers

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Lucy Rutten

2018-04-01

Full Text Available Summary: The heavily glycosylated native-like envelope (Env trimer of HIV-1 is expected to have low immunogenicity, whereas misfolded forms are often highly immunogenic. High-quality correctly folded Envs may therefore be critical for developing a vaccine that induces broadly neutralizing antibodies. Moreover, the high variability of Env may require immunizations with multiple Envs. Here, we report a universal strategy that provides for correctly folded Env trimers of high quality and yield through a repair-and-stabilize approach. In the repair stage, we utilized a consensus strategy that substituted rare strain-specific residues with more prevalent ones. The stabilization stage involved structure-based design and experimental assessment confirmed by crystallographic feedback. Regions important for the refolding of Env were targeted for stabilization. Notably, the α9-helix and an intersubunit β sheet proved to be critical for trimer stability. Our approach provides a means to produce prefusion-closed Env trimers from diverse HIV-1 strains, a substantial advance for vaccine development. : Rutten et al. describe a universal repair and stabilize approach that corrects rare mutations and stabilizes refolding regions to obtain high-quality HIV Envs with high yields. The crystal structure shows how the optimization of the trimer interface between α9, α6, and the intersubunit β-sheet stabilizes the membrane-proximal base. Keywords: envelope protein, chronic, ConC_base, HIV, SOSIP, stabilization, transmitted/founder, vaccine, X-ray structure, hybrid sheet

Correlaciones fenotípicas, genéticas y ambientales en Cucurbita moschata Duch. Ex Poir

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Baena García D.

2005-03-01

Full Text Available El estudio estimó las correlaciones fenotípicas, genéticas y ambientales entre doce caracteres agronómicos en dos dialélicos de zapallo (uno entre cinco variedades y otro entre cinco líneas S1, originadas de las anteriores. Se usó un diseño en bloques completos al azar con 15 tratamientos (5 progenitores + 10 cruzamientos F1 para cada dialélico y cinco repeticiones. Los resultados señalaron mayor estimación de las correlaciones (en magnitud y significancia estadística a favor del dialélico de líneas S1. Las correlaciones genéticas fueron superiores a las fenotípicas y las ambientales. La producción por planta (PFP presentó las correlaciones parciales fenotípicas y genéticas más altas con el peso por fruto (PPF y el número de frutos por planta (NFP (rPF y rPG > 0.80. El PPF y NFP pueden usarse como criterios de selección para la obtención de cultivares de altos rendimientos en C. moschata. ABSTRACT Phenotypic, genotypic and environmental correlations in Cucurbita moschata Duch. Ex Poir. The study evaluated phenotypic, genotypic and environmental correlations among 12 agronomy characters, in two set diallelic from five parents each one. The first set from five open pollinated varieties and the second one from five self-pollinated lines S1, obtained from the previous varieties. The two experiments were in completely randomized blocks with five replications. A higher estimation of correlation (in magnitude and statistical significance was observed in favor of the S1 lines diallelic. The genetic correlations were higher than the phenotypic and environmental correlations. The plant yield (PFP showed the highest partial phenotypic and genetic correlations with the fruit weight (PPF and fruits per plant (NFP (rPF and rPG > 0.80. It is suggested to use the PPF and NFP as selection criteria for breeding of C. moschata for development of high yield cultivars. Key words: Calabaza (cucurbita, genetic correlation, agronomic

Manipulación genética y el estudio del parásito protozoario Leishmania.

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Tania M. Cortázar

2004-12-01

Full Text Available Durante los últimos 15 años se ha dado paso al entendimiento de muchos aspectos de la genómica funcional de Leishmania gracias a los avances en la metodología de transfección de ADN dentro de la célula de este protozoario, la eliminación y la complementación de genes por medio de recombinación homóloga y las estrategias para la selección de células transfectadas. Estos acercamientos tienen el potencial de brindar información sobre la expresión génica y la función de las proteínas en el contexto del parásito intacto. Dado que el genoma de Leishmania muestra una carencia acentuada de los factores conocidos de iniciación de la transcripción y que la expresión génica está regulada casi completamente a nivel postranscripcional (a través del empalme de los ARNm y los mecanismos que involucran el procesamiento diferencial de la región no traducida 3' del ARNm (3?UTR, la transfección génica representa una herramienta útil para la identificación y el análisis funcional de los genes de interés así como de los mecanismos que dirigen su regulación. El desarrollo de los sistemas de manipulación genética también ha abierto nuevos horizontes para la identificación de genes esenciales involucrados en la virulencia, la supervivencia intracelular y la resistencia a drogas de Leishmania, así como para la validación de proteínas específicas del parásito como nuevos blancos quimio e inmunoterapéuticos. En esta revisión presentamos los avances más recientes en el campo de la manipulación genética en Leishmania, los cuales permiten análisis estructurales, funcionales y de fenotipo, por medio de la eliminación y complementación génica a través de la transfección transitoria o permanente de genes en este parásito.

HIV-specific humoral and cellular immunity in rabbits vaccinated with recombinant human immunodeficiency virus-like gag-env particles

International Nuclear Information System (INIS)

Haffar, O.K.; Smithgall, M.D.; Moran, P.A.; Travis, B.M.; Zarling, J.M.; Hu, S.L.

1991-01-01

Recombinant human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1)-like gag-env particles produced in mammalian cells were inoculated into two New Zealand white rabbits. In parallel, two control rabbits were inoculated with the homologous HIV-1 virions inactivated by ultraviolet light (uv) and psoralen treatments. The humoral and cellular immune responses to HIV-1 were evaluated for both groups of animals. Recombinant particles elicited humoral immunity that was specific for all the viral structural proteins. The antibodies recognized both denatured and nondenatured proteins. Moreover, the sera neutralized the in vitro infectivity of the homologous virus in CEM cells. Importantly, the recombinant particles also generated a T helper response by priming with the HIV proteins. Similar results were observed with inactivated virus immunization. Therefore, the authors results suggest that the recombinant HIV-like particles elicit functional humoral immunity as well as cellular immunity and represent a novel vaccine candidate for AIDS

Protofenómeno urbano. Rudimentos analíticos para una aproximación fenoménica al estudio de la percepción de personas en el espacio urbano

OpenAIRE

Claudio Araneda

2011-01-01

Goethe- padre la protofenomenologia, eslabón perdido de la fenomenología y genio tutelar de esta investigaciónafirmaba que "las hipótesis no son sino canciones de cuna con las cuales el profesor envía a sus alumnos a dormir." (Del Solar, 1993). En efecto, para Goethe lo gravitante en ciencia fue siempre, por sobre todo, el establecimiento de un lazo reverente y contemplativo con un objeto de estudio claramente diferenciado. Por esta vía- que al tiempo que erradica toda especulación, hace de l...

Aspectos genéticos y neuroendocrinos en el trastorno del espectro autista

OpenAIRE

Oviedo, Norma; Manuel-Apolinar, Leticia; de la Chesnaye, Elsa; Guerra-Araiza, Christian

2015-01-01

El autismo, hoy en día definido como trastornos del espectro autista, fue descrito inicialmente en 1943. Se caracteriza por alteraciones en la comunicación, la interacción social y un espectro restringido de intereses del paciente. Generalmente se identifica en etapas tempranas del desarrollo a partir de los 18 meses de edad. Actualmente el autismo se considera un desorden neurológico con un espectro que abarca diferentes grados que se asocian con factores genéticos, no genéticos y del medio ...

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Lifescience Database Archive (English)

Full Text Available switchLanguage; BLAST Search Image Search Home About Archive Update History Data ...nse Update History of This Database Site Policy | Contact Us License - GenLibi | LSDB Archive ...

Heterogeneidad clínica y genética en pacientes con retinosis pigmentaria en Pinar del Río. Importancia del asesoramiento genético

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Nercy Rodríguez Garcia

2013-12-01

Full Text Available Introducción: la retinosis pigmentaria (RP es una degeneración progresiva, crónica y de carácter hereditario de la retina, que conduce a discapacidad visual o ceguera sin un tratamiento adecuado. Objetivo: determinar la variabilidad de la expresión clínica en la presentación de la retinosis pigmentaria, así como el tipo de herencia con que se transmite en los enfermos y familias de los individuos ingresados en el servicio provincial de la enfermedad en Pinar del Río, lo que permitirá aplicar una estrategia para el asesoramiento genético individual y familiar. Material y Método: se realizó una investigación descriptiva, retrospectiva y transversal, teniendo como universo y muestra a los 259 pacientes con diagnóstico del padecimiento, registrados en el servicio provincial, de enero a septiembre del año 2012. Resultados: predominó el sexo masculino con 154 pacientes y el grupo de edades entre 40 y 59 años de edad con un 46,71 %. De acuerdo a la clasificación cubana, prevalece el debut precoz, el estadio I, la herencia autosómica recesiva y la forma típica de presentación. Resaltan el síndrome de Usher como entidad asociada y en 99 familias se determinó que la enfermedad sigue un patrón de herencia autosómico recesivo, en 38 de las cuales existe consanguinidad. Las limitaciones de estos enfermos obligan a suministrarles una información adecuada y precisa mediante los servicios de asesoramiento genético. Conclusiones: la gran heterogeneidad clínica y genética de la enfermedad ha generado que la estrategia de asesoramiento genético incluya la personalización del proceso de acuerdo a cada paciente y familia y se le brinde mayor importancia a los grupos de apoyo mutuo.

MitoGen: A Framework for Generating 3D Synthetic Time-Lapse Sequences of Cell Populations in Fluorescence Microscopy.

Science.gov (United States)

Svoboda, David; Ulman, Vladimir

2017-01-01

The proper analysis of biological microscopy images is an important and complex task. Therefore, it requires verification of all steps involved in the process, including image segmentation and tracking algorithms. It is generally better to verify algorithms with computer-generated ground truth datasets, which, compared to manually annotated data, nowadays have reached high quality and can be produced in large quantities even for 3D time-lapse image sequences. Here, we propose a novel framework, called MitoGen, which is capable of generating ground truth datasets with fully 3D time-lapse sequences of synthetic fluorescence-stained cell populations. MitoGen shows biologically justified cell motility, shape and texture changes as well as cell divisions. Standard fluorescence microscopy phenomena such as photobleaching, blur with real point spread function (PSF), and several types of noise, are simulated to obtain realistic images. The MitoGen framework is scalable in both space and time. MitoGen generates visually plausible data that shows good agreement with real data in terms of image descriptors and mean square displacement (MSD) trajectory analysis. Additionally, it is also shown in this paper that four publicly available segmentation and tracking algorithms exhibit similar performance on both real and MitoGen-generated data. The implementation of MitoGen is freely available.

Búsqueda de genes de resistencia al pasador del fruto en poblaciones segregantes de tomate

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Diana Milena Rodríguez Mora

2010-07-01

Full Text Available Las estrategias de mejoramiento genético para encontrar resistencia al pasador del fruto, Neoleucinodes elegantalis, en tomate, Solanum lycopersicum L. se han basado en métodos tradicionales de introgresión genética por medio de retrocruzamiento. Sin embargo este proceso es largo y dispendioso. Debido a esta problemática, se utilizó la técnica molecular cDNA-AFLP para identificar genes involucrados en la resistencia a esta plaga en poblaciones segregantes de tomate, con el fin de identificar marcadores moleculares que puedan ser utilizados en futuros programas de fitomejoramiento. Los materiales de tomate evaluados fueron Unapal-Maravilla (susceptible, S. habrochaites var. glabratum, accesión PI 134418 (resistente y tres retrocruzamientos obtenidos del cruzamiento interespecífico entre ambas especies. De estos materiales vegetales se extrajo el RNA total y se sintetizó el cDNA, el cual se utilizó como material de inicio de la técnica cDNA-AFLP. A partir del preamplificado de cDNA se evaluaron diferentes combinaciones de primers: +1+1, +3+3 y sus derivados. La combinación que presentó mejores amplificados fue la +1+1, para un total de 37 bandas polimórficas. De estas bandas, 9 fragmentos tipo EST (Expressed Sequence Target fueron recuperados, siendo candidatos a explicar la resistencia al pasador del fruto en tomate.

Measuring Gen-Y Customer Experience in the Banking Sector

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Kyguolienė Asta

2017-12-01

Full Text Available The article analyses customer experience as the subject of marketing research and presents methods for assessing customer experience. The results of empirical research revealing the Gen-Y customer experience in using the Lithuanian commercial banks’ services are presented.

Minería de textos: la nueva generación de análisis de literatura científica en biología molecular y genómica 10.5007/1518-2924.2008v13n25p1

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Carmen Gálvez

2008-01-01

Full Text Available Una vez descifrado la secuencia del genoma humano, el paradigma de investigación ha cambiado dando paso a la descripción de las funciones de los genes y a futuros avances en la lucha contra enfermedades. Este nuevo contexto ha despertado el interés de la Bioinformática, que combina métodos de las Ciencias de la Vida con las Ciencias de la Información haciendo posible el acceso a la gran cantidad de información biológica almacenada en las bases de datos, y de la Genómica, dedicada al estudio de las interacciones de los genes y su influencia en el desarrollo de enfermedades. En este contexto, la minería de textos surge como un instrumento emergente para el análisis de la literatura científica. Una tarea habitual de la minería de textos en Biología Molecular y Genómica es el reconocimiento de entidades biológicas, tales como genes, proteínas y enfermedades. El paso siguiente en el proceso de minería lo constituye la identificación entre entidades biológicas, tales como el tipo de interacción entre gen-gen, gen-enfermedad, gen-proteína, para interpretar funciones biológicas, o formular hipótesis de investigación. El objetivo de este trabajo es examinar el auge y las limitaciones la nueva generación de herramientas de análisis de la información en lenguaje natural, almacenada en bases de datos bibliográficas, como PubMed o MEDLINE.

Optimization of random amplified polymorphic DNA techniques for use in genetic studies of Cuban triatominae Optimización de la técnica de ADN polimórfico amplificado al azar (RAPD para su utilización en la caracterización genética de triatomíneos cubanos

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jorge Fraga

2005-10-01

Full Text Available Random amplified polymorphic DNA (RAPD technique is a simple and reliable method to detect DNA polymorphism. Several factors can affect the amplification profiles, thereby causing false bands and non-reproducibility of assay. In this study, we analyzed the effect of changing the concentration of primer, magnesium chloride, template DNA and Taq DNA polymerase with the objective of determining their optimum concentration for the standardization of RAPD technique for genetic studies of Cuban Triatominae. Reproducible amplification patterns were obtained using 5 pmoL of primer, 2.5 mM of MgCl2, 25 ng of template DNA and 2 U of Taq DNA polymerase in 25 µL of the reaction. A panel of five random primers was used to evaluate the genetic variability of T. flavida. Three of these (OPA-1, OPA-2 and OPA-4 generated reproducible and distinguishable fingerprinting patterns of Triatominae. Numerical analysis of 52 RAPD amplified bands generated for all five primers was carried out with unweighted pair group method analysis (UPGMA. Jaccard's Similarity Coefficient data were used to construct a dendrogram. Two groups could be distinguished by RAPD data and these groups coincided with geographic origin, i.e. the populations captured in areas from east and west of Guanahacabibes, Pinar del Río. T. flavida present low interpopulation variability that could result in greater susceptibility to pesticides in control programs. The RAPD protocol and the selected primers are useful for molecular characterization of Cuban Triatominae.La técnica de ADN polimórfico amplificado al azar (RAPD es un método simple para detectar el polimorfismo genético del ADN. Diferentes factores afectan los perfiles de amplificación lo que se manifiesta en la presencia de bandas falsas y en la reproducibilidad del ensayo. En nuestro trabajo analizamos los cambios de la concentración de cebador, ADN molde, cloruro de magnesio y de Taq ADN polimerasa con el objetivo de determinar su

Divergência genética entre cinco genótipos de melão rendilhado Genetic divergence among five muskmelon cultivars

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Adriana Antonieta do Nascimento Rizzo

2002-06-01

Full Text Available Estimou-se a divergência genética entre cinco genótipos de melão rendilhado (Cucumis melo var. reticulatus Naud. (JAB-20, JAB-21, JAB-22, JAB-23 e 'Bônus nº 2' e determinou-se qual a contribuição relativa das 16 características avaliadas [nº médio de flores masculinas, hermafroditas/planta; produção total de frutos/m², peso médio dos frutos comerciáveis; diâmetro médio transversal e longitudinal do fruto (DMTF e DMLF; diâmetro médio transversal da inserção do pedúculo (DMTP; espessura média do mesocarpo e epicarpo (EMM e EME; diâmetro médio longitudinal e transversal do lóculo (DMTL e DMLL; proporção da cavidade (PC; desprendimento de sementes (DS; teor de sólidos solúveis totais (SST, pH e acidez titulável (AT] na divergência gen��tica. Obtiveram-se dois grupos de similaridade: I- JAB-20, JAB-21 e 'Bônus nº2' e II- JAB-22 e JAB-23. As características DMLF, DMTP, DMLL, DS e SST foram as que mais contribuíram para a divergência genética entre os genótipos.The genetic divergence of five cultivars of muskmelon was estimated (Cucumis melo var. reticulatus Naud (JAB-20, JAB-21, JAB-22, JAB-23 and 'Bônus nº2' and the relative contribution of each 16 characteristics were determined (number of male flowers per plant; total production of fruit, weight of fruits; longitudinal and transversal diameters of fruits; thickness and color of flesh and skin; longitudinal and transversal loculos diameter of fruits; seed loosing; netting thickness; and % total solvers solids, pH and total acidity in genetic divergence. Two groups of similarity were formed between the genitors by the values of D², one of then was constituted of the JAB-20 and JAB-21 and 'Bônus nº 2' genotypes, and another of the JAB-22 and JAB-23. The characteristics of longitudinal loculos diameters, longitudinal diameter of fruits, transversal diameter of peduncle insertion, % total solvers solids and seed loosing contributed to for genetic

Salud pública, genética y ética Public health, genetics and ethics

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Miguel H Kottow

2002-10-01

Full Text Available La investigación genética ha tenido una enorme expansión en recientes décadas, con repercusiones terapéuticas aún inciertas. El análisis bioético tradicional de las complejas prácticas genéticas ha sido insuficiente por sostenerse en la ética de la investigación y en la bioética de corte principialista. Los problemas éticos más importantes de la genética son de orden colectivo y deben ser abordados por una reflexión ético-social cuyo enfoque es más amplio que la agenda interpersonal del principialismo. Temas como exploraciones genéticas, cuestiones patrimoniales, manipulación génica y asignación de recursos, deben todos ser sometidos a un pensamiento inspirado en los requerimientos de la ciudadanía, en el bien común y en la definición del rol del Estado en fiscalizar actividades genéticas y en proteger a la población. El objetivo del estudio es mostrar cómo el amplio campo de la ética y de la genética tiene una mayor relevancia en el campo social que en el clínico. El objetivo del trabajo es señalar que la bioética principialista ha enfatizado los problemas éticos individuales que nacen con la intervención genética, a costa de marginar sus importantes repercusiones sociales.Genetics research has shown enormous developments in recent decades, although as yet with only limited clinical application. Bioethical analysis has been unable to deal with the vast problems of genetics because emphasis has been put on the principlism applied to both clinical and research bioethics. Genetics nevertheless poses its most complex moral dilemmas at the public level, where a social brand of ethics ought to supersede the essentially interpersonal perspective of principlism. A more social understanding of ethics in genetics is required to unravel issues such as research and clinical explorations, ownership and patents, genetic manipulation, and allocation of resources. All these issues require reflection based on the

Polimorfismo en el gen COMT en una muestra de gestantes normales y con restricción del crecimiento intrauterino en un hospital de Lima

Directory of Open Access Journals (Sweden)

José Pacheco-Romero

2013-04-01

Full Text Available Antecedentes: Los procesos fisiopatológicos que ocurren a nivel celular y molecular en la restricción de crecimiento intrauterino (RCIU son aún desconocidos. La catecol-O-metiltransferasa (COMT es una enzima de fase II que inactiva los catecol estrógenos al transferir un grupo metílico. Se conoce un polimorfismo funcional Val158 Met en el gen COMT como un marcador susceptible para diversas enfermedades maternoperinatales, existiendo estudios que sugieren que el alelo que codifica una COMT de baja actividad puede ser un marcador susceptible para RCIU. Por lo tanto, el estudio del polimorfismo COMT ofrece una nueva estrategia para la evaluación de marcadores genéticos que pueden ser utilizados para la detección de ciertas alteraciones asociadas al embarazo. Objetivos: Establecer la asociación entre el polimorfismo Val158Met catecol-O-metiltransferasa (COMT y la restricción de crecimiento intrauterino. Institución: Facultad de Medicina, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Perú. Diseño: Estudio tipo relacional (asociativo, con diseño observacional, tipo caso-control (no experimental. Materiales: Muestra de sangre materna de parturientas. Métodos: Durante el año 2011, se obtuvo 81 muestras para genotipaje del gen COMT. De ellas, 26 (32,1% correspondieron a parturientas con RCIU (casos y 55 (67,9% a muestras de madres de hijos sin RCIU (controles. La distribución de los genotipos fue evaluada usando la prueba de chi cuadrado. Se comprobó la distribución proporcional de los genotipos en los grupos con RCIU y sin RCIU con la hipótesis nula de Hardy-Weinberg. Las madres participantes firmaron un consentimiento informado. Principales medidas de resultados: Asociación entre los genotipos COMT y la RCIU, y entre los alelos COMT Val/Met y la RCIU. Resultados: Las distribuciones de los genotipos en los grupos con RCIU y sin RCIU estuvieron de acuerdo a la hipótesis nula de Hardy-Weinberg. Al relacionar los genotipos COMT Val

Desafios futuros: de uma análise da genética e biotecnologia na imprensa portuguesa durante o biénio 1994/5 para novas tecnologias nas sociedades actuais Future challenges: from an analysis of genetics and biotechnology in Portuguese press during 1994/5 to new technologies in actual societies

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Maria Alexandra V. Abreu Lima

2006-12-01

Full Text Available Este estudo analisa na imprensa Portuguesa a frequência e o conteúdo de notícias sobre genoma, genética e biotecnologia sobretudo nos domínios agrícola e da medicina/saúde humana. Discutem-se os resultados com base em estudos sobre genética e biotecnologia na imprensa Internacional, Brasileira e Portuguesa (Gutteling et al., 2002; Tognolli, 2003; Garcia, 2004 e aspectos da opinião pública e amplificação social do risco (Frewer et al. 2002, tirando-se conclusões sobre desafios com interesse para o actual evoluir na sociedade de novas tecnologias como a nanotecnologia.This study analyses the frequency and content of news about genome, genetics and biotechnology mainly on agricultural and medicine/human health domains in the Portuguese press. Results are discussed considering studies about genetics and biotechnology in International, Brazilian and Portuguese press (Gutteling et al., 2002; Tognolli, 2003; Garcia, 2004 and issues of public opinion and social amplification of risk (Frewer et al. 2002. This allows to reach conclusions about challenges with interest to the present evolution on society of new technologies such as nanotechnology.

Combinations of mutations in envZ, ftsI, mrdA, acrB and acrR can cause high-level carbapenem resistance in Escherichia coli

DEFF Research Database (Denmark)

Adler, Marlen; Anjum, Mehreen; Andersson, Dan I.

2016-01-01

of meropenem or ertapenem for similar to 60 generations. Isolated clones were whole-genome sequenced, and the order in which the identified mutations arose was determined in the passaged populations. Key mutations were reconstructed, and bacterial growth rates of populations and isolated clones and resistance...... levels to 23 antibiotics were measured. High-level resistance to carbapenems resulted from a combination of downstream effects of envZ mutation and target mutations in AcrAB-TolC-mediated drug export, together with PBP genes [mrdA (PBP2) after meropenem exposure or ftsI (PBP3) after ertapenem exposure...

Características morfométricas, genéticas, alimenticias y vectoriales de Panstrongylus herreri procedentes de Jaén (Cajamarca y Cajaruro (Amazonas, Perú

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Jenny Ancca

2008-01-01

Full Text Available Objetivo. Comparar las características morfológicas, alimenticias y genéticas de dos poblaciones de Panstrongylus herreri, de los distritos de Jaén (Cajamarca y Cajaruro (Amazonas. Materiales y métodos. Se colectó especímenes adultos de P. herreri, 42 (Jaén y 68 (Cajaruro. Se utilizó la morfometría geométrica para evaluar el dimorfismo sexual de tamaño y conformación. El perfil genómico se realizó por amplificación del espaciador interno transcrito del ADNr (ITS-2. La amplificación del espaciador intergénico del gen mini-exón, permitió la caracterización molecular de los trypanosomas aislados. Se utilizó la prueba de precipitina para conocer las fuentes de alimentación de los vectores y así poder asociarlos a posibles reservorios del parásito. Resultados. El análisis morfométrico demostró que el dimorfismo sexual de tamaño fue similar (p>0,05; no ocurrió lo mismo con el dimorfismo de la conformación; asimismo no se encontró diferencias de tamaño al comparar por separado hembras y machos de Jaén y Cajaruro. Por ITS-2, se evaluó cinco especímenes de cada distrito, en ellos se observó una banda de 960 pb aproximadamente. Sólo en Cajaruro se encontraron triatominos parasitados, que fue caracterizado como Trypanosoma cruzi TCI (350 pb. Se identificó al cobayo como la fuente de alimento más frecuente. Conclusiones. Ambas poblaciones de P. herreri por morfometría geométrica e ITS-2, no evidenció diferencias, indicando que se trataría de una misma población y por consiguiente de la misma procedencia. La sangre de cobayo fue la más frecuente fuente de alimento, pudiendo ser el principal reservorio para la enfermedad de Chagas en esta zona del Perú.

Genetic diversity in maize genotypes with and without a topdressing of nitrogen fertilizer = Divergência genética de genótipos de milho com e sem adubação nitrogenada em cobertura

Directory of Open Access Journals (Sweden)

Karen Cristina Leite Silva

2015-06-01

Full Text Available The use of genetic diversity as a basis for identifying combinations which are superior to the parents, with a greater heterozygosity, is important in view of the difficulty when selecting promising genotypes for a breeding program. Given the above, the aim of this work was to evaluate genetic diversity in maize genotypes with and without a topdressing of nitrogen fertiliser, using characteristics of the growth stage of the crop. Two field experiments were carried out in Gurupi, in the south of the state of Tocantins, Brazil (TO, one with and another without a topdressing of N fertilizer (1 - no N topdressing, 2 - 150 kg N ha-1. The treatments consisted of 12 genotypes (six open-pollinated populations, and six S5 strains. In applying the technique of clustering to the genotypes, the Generalised Mahalanobis Distance (D2 was adopted as dissimilarity measure. To establish similar groups, the agglomerative hierarchical method of optimisation proposed by Tocher was applied. In addition, Singh’s criterion was used to quantify the relative contribution to genetic divergence of the characteristics under evaluation. The characteristics, Chlorophyll-a and total chlorophyll, displayed the greatest contribution to genetic divergence, when there was no topdressing of nitrogen fertiliser and with the use of 150 kg N ha-1 respectively. A topdressing of nitrogen influenced both the vegetative development of the genotypes, and the expression of their genetic variability. = A utilização da divergência genética como base para a identificação de combinações superiores aos progenitores, apresentando maior heterozigose, faz-se importante diante da dificuldade de escolha de genótipos promissores em um programa de melhoramento. Com base no exposto, objetivou-se com este trabalho avaliar a divergência genética de genótipos de milho com e sem adubação nitrogenada em cobertura, utilizando características do estágio vegetativo da cultura, no sul do Estado

Aplicación de la biotecnología en los recursos genéticos forestales

Directory of Open Access Journals (Sweden)

R. Martínez

2003-01-01

Full Text Available A medida que aumenta la población y sus demandas de productos forestales, las tierras disponibles para la producción disminuyen, por lo que se necesitan esfuerzos coordinados para conseguir la sostenibilidad de la producción forestal. Aunque los sistemas tradicionales de silvicultura y mejoramiento genético continúan siendo importantes en las actividades forestales actuales, los programas convencionales de mejoramiento genético se ven limitados por el largo ciclo de desarrollo de los árboles forestales y la dificultad para distinguir siempre entre la expresión genotípica y los efectos ambientales. La biotecnología ofrece nuevas técnicas que complementan a las metodologías tradicionales del mejoramiento genético forestal. Los avances importantes de la técnica de cultivo de tejidos vegetales y la biología molecular que han tenido lugar en las dos últimas décadas se encuentran en la base del desarrollo de campos como la crioconservación y la regeneración masiva de plantas (expresión de la totipotencia celular, los marcadores de ADN, la genómica de árboles y la transformación genética. En el ámbito de los recursos genéticos, los marcadores de ADN permiten caracterizar la naturaleza, amplitud y distribución de la variabilidad genética de especies vegetales, y por tanto, facilitan la toma de decisiones sobre qué y cómo preservar. La crioconservación y la regeneración de plantas in vitro se están utilizando para conservar y micropropagar material vegetal específico, a fin de llevar a cabo la conservación ex situ y permitir el desarrollo de la silvicultura clonal. En este trabajo se realiza una revisión de las aplicaciones de estos campos a las especies forestales. En este contexto se aporta información sobre la actividad de la biotecnología forestal en las diferentes áreas de investigación.

TopoGen: A Network Topology Generation Architecture with application to automating simulations of Software Defined Networks

CERN Document Server

Laurito, Andres; The ATLAS collaboration

2017-01-01

Simulation is an important tool to validate the performance impact of control decisions in Software Defined Networks (SDN). Yet, the manual modeling of complex topologies that may change often during a design process can be a tedious error-prone task. We present TopoGen, a general purpose architecture and tool for systematic translation and generation of network topologies. TopoGen can be used to generate network simulation models automatically by querying information available at diverse sources, notably SDN controllers. The DEVS modeling and simulation framework facilitates a systematic translation of structured knowledge about a network topology into a formal modular and hierarchical coupling of preexisting or new models of network entities (physical or logical). TopoGen can be flexibly extended with new parsers and generators to grow its scope of applicability. This permits to design arbitrary workflows of topology transformations. We tested TopoGen in a network engineering project for the ATLAS detector ...

TopoGen: A Network Topology Generation Architecture with application to automating simulations of Software Defined Networks

CERN Document Server

Laurito, Andres; The ATLAS collaboration

2018-01-01

Simulation is an important tool to validate the performance impact of control decisions in Software Defined Networks (SDN). Yet, the manual modeling of complex topologies that may change often during a design process can be a tedious error-prone task. We present TopoGen, a general purpose architecture and tool for systematic translation and generation of network topologies. TopoGen can be used to generate network simulation models automatically by querying information available at diverse sources, notably SDN controllers. The DEVS modeling and simulation framework facilitates a systematic translation of structured knowledge about a network topology into a formal modular and hierarchical coupling of preexisting or new models of network entities (physical or logical). TopoGen can be flexibly extended with new parsers and generators to grow its scope of applicability. This permits to design arbitrary workflows of topology transformations. We tested TopoGen in a network engineering project for the ATLAS detector ...

PanCoreGen - Profiling, detecting, annotating protein-coding genes in microbial genomes.

Science.gov (United States)

Paul, Sandip; Bhardwaj, Archana; Bag, Sumit K; Sokurenko, Evgeni V; Chattopadhyay, Sujay

2015-12-01

A large amount of genomic data, especially from multiple isolates of a single species, has opened new vistas for microbial genomics analysis. Analyzing the pan-genome (i.e. the sum of genetic repertoire) of microbial species is crucial in understanding the dynamics of molecular evolution, where virulence evolution is of major interest. Here we present PanCoreGen - a standalone application for pan- and core-genomic profiling of microbial protein-coding genes. PanCoreGen overcomes key limitations of the existing pan-genomic analysis tools, and develops an integrated annotation-structure for a species-specific pan-genomic profile. It provides important new features for annotating draft genomes/contigs and detecting unidentified genes in annotated genomes. It also generates user-defined group-specific datasets within the pan-genome. Interestingly, analyzing an example-set of Salmonella genomes, we detect potential footprints of adaptive convergence of horizontally transferred genes in two human-restricted pathogenic serovars - Typhi and Paratyphi A. Overall, PanCoreGen represents a state-of-the-art tool for microbial phylogenomics and pathogenomics study. Copyright © 2015 Elsevier Inc. All rights reserved.

Exosomes carring gag/env of ALV-J possess negative effect on immunocytes.

Science.gov (United States)

Wang, Guihua; Wang, Zhenzhen; Zhuang, Pingping; Zhao, Xiaomin; Cheng, Ziqiang

2017-11-01

J subgroup avian leukosis virus (ALV-J) is an exogenous retrovirus of avian. A key feature of ALV-J infection is leading to severe immunosuppressive characteristic of diseases. Viral components of retrovirus were reported closely associated with immunosuppression, and several similarities between exosomes and retrovirus preparations have lead to the hypotheses of retrovirus hijacker exosomes pathway. In this study, we purified exosomes from DF-1 cells infected and uninfected by ALV-J. Electron microscopy and mass spectrometry (MS) analysis showed that ALV-J not only increased the production of exosomes from ALV-J infected DF-1 cells (Exo-J) but also stimulated some proteins expression, especially ALV-J components secreted in exosomes. Immunosuppressive domain peptide (ISD) of envelope subunit transmembrane (TM) and gag of ALV-J were secreted in Exo-J. It has been reported that HIV gag was budded from endosome-like domains of the T cell plasma membrane. But env protein was first detected in exosomes from retrovirus infected cells. We found that Exo-J caused negative effects on splenocytes in a dose-dependant manner by flow cytometric analysis. And low dose of Exo-J activated immune activity of splenocytes, while high dose possessed immunosuppressive properties. Interestingly, Exo-J has no significant effects on the immunosuppression induced by ALV-J, and the immunosuppressive effects induced by Exo-J lower than that by ALV-J. Taken together, our data indicated that Exo-J supplied a microenvironment for the replication and transformation of ALV-J. Copyright © 2017. Published by Elsevier Ltd.

Medicina genómica aplicada a la salud pública An overview in genomic medicine and public health